AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180004925.01

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MsG0180004925.01.T01 AT1G56720 42.617 298 162 3 277 571 167 458 6.19e-76 251
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MsG0180004925.01.T01 AT2G42960 42.857 294 159 3 277 567 171 458 5.40e-75 249
MsG0180004925.01.T01 AT2G42960 42.857 294 159 3 277 567 171 458 5.40e-75 249
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MsG0180004925.01.T01 AT1G68690 41.916 334 172 8 238 565 334 651 2.07e-71 245
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MsG0180004925.01.T01 AT4G00960 39.159 309 177 6 274 577 41 343 5.00e-69 229
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MsG0180004925.01.T01 AT1G29740 43.945 289 154 4 277 563 665 947 3.18e-68 241
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MsG0180004925.01.T01 AT1G14370 40.952 315 160 6 266 564 63 367 5.99e-68 228
MsG0180004925.01.T01 AT3G55450 42.042 333 165 10 266 580 38 360 7.48e-68 227
MsG0180004925.01.T01 AT3G55450 42.042 333 165 10 266 580 75 397 9.28e-68 228
MsG0180004925.01.T01 AT3G04690 37.940 369 209 4 211 564 425 788 2.71e-67 236
MsG0180004925.01.T01 AT3G14840 42.321 293 156 4 277 564 660 944 2.74e-67 238
MsG0180004925.01.T01 AT4G21400 35.789 380 227 9 204 577 280 648 3.43e-67 233
MsG0180004925.01.T01 AT3G13690 38.674 362 203 8 277 628 399 751 3.67e-67 234
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MsG0180004925.01.T01 AT3G13690 38.674 362 203 8 277 628 399 751 3.67e-67 234
MsG0180004925.01.T01 AT1G26150 42.712 295 156 5 277 565 418 705 4.81e-67 234
MsG0180004925.01.T01 AT2G13790 38.571 350 186 8 225 566 243 571 5.38e-67 231
MsG0180004925.01.T01 AT5G56890 42.857 294 156 5 277 564 711 998 6.38e-67 238
MsG0180004925.01.T01 AT5G28680 42.414 290 161 2 276 564 508 792 6.64e-67 235
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MsG0180004925.01.T01 AT5G03140 40.523 306 166 7 276 574 361 657 7.85e-67 232
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MsG0180004925.01.T01 AT2G07180 42.617 298 156 5 277 565 78 369 1.70e-66 225
MsG0180004925.01.T01 AT1G61420 36.269 386 222 10 207 586 269 636 2.32e-66 230
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MsG0180004925.01.T01 AT1G07570 38.286 350 196 6 240 575 19 362 2.89e-65 221
MsG0180004925.01.T01 AT1G07570 38.286 350 196 6 240 575 30 373 3.38e-65 221
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MsG0180004925.01.T01 AT5G63710 39.865 296 167 5 274 564 239 528 3.67e-65 225
MsG0180004925.01.T01 AT4G39110 42.708 288 160 1 277 564 514 796 3.82e-65 230
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MsG0180004925.01.T01 AT5G65240 38.162 359 200 7 212 564 217 559 1.39e-64 225
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MsG0180004925.01.T01 AT4G23310 36.476 403 235 9 192 584 409 800 1.78e-64 228
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MsG0180004925.01.T01 AT5G47850 36.554 383 215 7 205 565 355 731 4.49e-64 226
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MsG0180004925.01.T01 AT2G18470 43.046 302 152 6 277 569 272 562 4.91e-64 223
MsG0180004925.01.T01 AT1G49730 29.097 598 346 16 20 563 55 628 5.42e-64 224
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MsG0180004925.01.T01 AT4G00330 38.742 302 172 4 270 563 100 396 7.53e-64 217
MsG0180004925.01.T01 AT5G13160 38.205 390 202 12 264 644 65 424 8.20e-64 218
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MsG0180004925.01.T01 AT1G61430 34.748 377 226 6 212 586 400 758 1.18e-63 225
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MsG0180004925.01.T01 AT4G23130 40.523 306 172 5 275 575 330 630 1.43e-63 223
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MsG0180004925.01.T01 AT3G45860 36.364 352 207 6 230 577 299 637 2.39e-63 222
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MsG0180004925.01.T01 AT1G61490 36.082 388 227 9 207 592 393 761 2.51e-63 224
MsG0180004925.01.T01 AT2G13800 40.268 298 164 5 276 566 145 435 2.64e-63 218
MsG0180004925.01.T01 AT2G13800 40.268 298 164 5 276 566 145 435 2.64e-63 218
MsG0180004925.01.T01 AT5G62710 39.590 293 167 4 277 566 266 551 3.29e-63 219
MsG0180004925.01.T01 AT1G70740 35.588 340 192 5 254 575 19 349 3.64e-63 215
MsG0180004925.01.T01 AT1G51850 37.709 358 209 8 207 560 477 824 3.67e-63 225
MsG0180004925.01.T01 AT1G61490 36.082 388 227 9 207 592 419 787 3.74e-63 224
MsG0180004925.01.T01 AT1G61490 36.082 388 227 9 207 592 419 787 3.74e-63 224
MsG0180004925.01.T01 AT1G61490 36.082 388 227 9 207 592 419 787 3.74e-63 224
MsG0180004925.01.T01 AT1G61490 36.082 388 227 9 207 592 419 787 3.74e-63 224
MsG0180004925.01.T01 AT4G05200 35.753 372 216 7 210 576 277 630 4.32e-63 221
MsG0180004925.01.T01 AT2G14440 36.585 369 201 9 195 559 489 828 4.35e-63 224
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MsG0180004925.01.T01 AT2G14510 36.856 369 200 9 195 559 496 835 4.67e-63 224
MsG0180004925.01.T01 AT5G62710 39.590 293 167 4 277 566 300 585 4.86e-63 220
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MsG0180004925.01.T01 AT1G79620 36.885 366 196 7 214 564 590 935 7.21e-63 225
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MsG0180004925.01.T01 AT4G23320 36.164 365 206 8 217 577 127 468 1.22e-62 216
MsG0180004925.01.T01 AT4G23290 36.752 351 207 6 275 621 306 645 1.23e-62 219
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MsG0180004925.01.T01 AT4G23320 36.164 365 206 8 217 577 148 489 1.81e-62 216
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MsG0180004925.01.T01 AT2G13800 40.268 298 164 5 276 566 262 552 1.82e-62 218
MsG0180004925.01.T01 AT1G51830 36.975 357 210 8 207 560 315 659 2.20e-62 220
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MsG0180004925.01.T01 AT1G61400 34.204 383 224 6 212 584 434 798 2.61e-62 222
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MsG0180004925.01.T01 AT5G59700 37.158 366 218 5 205 564 394 753 4.98e-62 221
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MsG0180004925.01.T01 AT3G09830 36.340 377 220 10 195 563 1 365 1.06e-61 211
MsG0180004925.01.T01 AT3G09830 36.340 377 220 10 195 563 1 365 1.06e-61 211
MsG0180004925.01.T01 AT1G61390 35.584 385 222 9 209 586 277 642 1.29e-61 217
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MsG0180004925.01.T01 AT5G18610 41.892 296 154 6 277 563 71 357 1.97e-61 213
MsG0180004925.01.T01 AT5G11020 36.957 368 203 10 216 574 68 415 2.00e-61 211
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MsG0180004925.01.T01 AT1G06700 41.275 298 159 6 277 564 56 347 2.55e-61 208
MsG0180004925.01.T01 AT3G28690 37.994 329 182 7 250 564 87 407 2.61e-61 212
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MsG0180004925.01.T01 AT1G06840 36.548 394 220 10 187 571 530 902 3.20e-61 220
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MsG0180004925.01.T01 AT1G24030 39.932 293 159 7 282 564 1 286 9.88e-61 205
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MsG0180004925.01.T01 AT2G30740 40.940 298 160 6 277 564 59 350 1.09e-60 207
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MsG0180004925.01.T01 AT4G13190 39.726 292 166 5 277 563 59 345 7.57e-60 205
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MsG0180004925.01.T01 AT5G35960 41.034 290 158 6 277 564 122 400 1.44e-59 206
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MsG0180004925.01.T01 AT5G40380 36.939 379 211 11 211 582 250 607 3.87e-59 210
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MsG0180004925.01.T01 AT1G11280 33.777 376 215 10 209 569 428 784 7.60e-59 212
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MsG0180004925.01.T01 AT3G59350 40.940 298 160 6 277 564 101 392 1.17e-58 203
MsG0180004925.01.T01 AT2G30730 39.262 298 165 6 277 564 45 336 1.17e-58 201
MsG0180004925.01.T01 AT4G11470 36.145 332 199 6 275 601 330 653 1.24e-58 209
MsG0180004925.01.T01 AT5G01950 39.933 298 156 4 277 565 614 897 1.27e-58 213
MsG0180004925.01.T01 AT5G01950 39.933 298 156 4 277 565 614 897 1.27e-58 213
MsG0180004925.01.T01 AT5G01950 39.933 298 156 4 277 565 614 897 1.27e-58 213
MsG0180004925.01.T01 AT5G01950 39.933 298 156 4 277 565 614 897 1.27e-58 213
MsG0180004925.01.T01 AT1G29730 45.923 233 120 2 277 508 661 888 1.30e-58 213
MsG0180004925.01.T01 AT2G19230 34.746 354 202 6 212 564 515 840 1.43e-58 213
MsG0180004925.01.T01 AT1G51890 35.310 371 223 8 205 573 491 846 1.46e-58 212
MsG0180004925.01.T01 AT5G10530 37.377 305 180 7 276 576 322 619 1.47e-58 208
MsG0180004925.01.T01 AT5G65530 37.500 304 174 6 277 575 132 424 1.58e-58 204
MsG0180004925.01.T01 AT5G01950 39.597 298 162 3 277 565 614 902 1.67e-58 213
MsG0180004925.01.T01 AT3G05140 39.474 304 172 5 269 570 171 464 1.88e-58 205
MsG0180004925.01.T01 AT2G19230 35.311 354 199 7 212 564 515 839 2.23e-58 211
MsG0180004925.01.T01 AT2G04300 39.721 287 162 5 276 560 571 848 2.25e-58 211
MsG0180004925.01.T01 AT1G51800 37.249 349 206 7 215 560 513 851 2.35e-58 211
MsG0180004925.01.T01 AT2G04300 39.721 287 162 5 276 560 530 807 2.37e-58 211
MsG0180004925.01.T01 AT4G23190 34.959 369 211 9 215 575 213 560 2.50e-58 206
MsG0180004925.01.T01 AT4G23190 34.959 369 211 9 215 575 213 560 2.50e-58 206
MsG0180004925.01.T01 AT2G37710 37.838 296 177 3 276 569 334 624 2.90e-58 208
MsG0180004925.01.T01 AT1G21590 36.634 303 183 4 271 570 351 647 3.05e-58 209
MsG0180004925.01.T01 AT4G20450 40.893 291 159 6 277 564 581 861 3.09e-58 211
MsG0180004925.01.T01 AT2G19130 40.132 304 169 6 273 571 479 774 3.25e-58 210
MsG0180004925.01.T01 AT5G65600 36.508 315 184 7 276 580 337 645 3.44e-58 208
MsG0180004925.01.T01 AT4G00960 44.248 226 117 4 274 495 41 261 3.68e-58 197
MsG0180004925.01.T01 AT1G70530 40.753 292 152 7 204 492 249 522 4.40e-58 205
MsG0180004925.01.T01 AT5G35580 38.436 307 174 5 277 574 64 364 4.82e-58 203
MsG0180004925.01.T01 AT4G11480 36.364 330 201 5 275 601 307 630 4.87e-58 207
MsG0180004925.01.T01 AT5G35580 38.436 307 174 5 277 574 76 376 5.15e-58 204
MsG0180004925.01.T01 AT4G11480 36.364 330 201 5 275 601 310 633 5.71e-58 207
MsG0180004925.01.T01 AT1G11350 34.146 369 229 6 215 577 436 796 6.03e-58 209
MsG0180004925.01.T01 AT4G23190 34.959 369 211 9 215 575 291 638 6.51e-58 207
MsG0180004925.01.T01 AT1G61440 33.085 402 224 7 212 586 417 800 6.64e-58 209
MsG0180004925.01.T01 AT1G69270 37.755 294 172 3 275 564 247 533 6.87e-58 204
MsG0180004925.01.T01 AT5G24010 39.203 301 177 2 275 574 475 770 8.56e-58 209
MsG0180004925.01.T01 AT5G16500 39.482 309 171 7 277 574 62 365 8.58e-58 206
MsG0180004925.01.T01 AT5G03320 37.461 323 187 6 255 563 41 362 9.83e-58 201
MsG0180004925.01.T01 AT5G03320 37.461 323 187 6 255 563 41 362 9.83e-58 201
MsG0180004925.01.T01 AT3G46330 38.408 289 164 7 276 560 531 809 1.00e-57 209
MsG0180004925.01.T01 AT3G46330 38.408 289 164 7 276 560 555 833 1.06e-57 209
MsG0180004925.01.T01 AT1G48210 38.644 295 165 6 279 564 58 345 1.10e-57 199
MsG0180004925.01.T01 AT1G48210 38.644 295 165 6 279 564 58 345 1.10e-57 199
MsG0180004925.01.T01 AT1G48210 38.644 295 165 6 279 564 58 345 1.10e-57 199
MsG0180004925.01.T01 AT1G48210 38.644 295 165 6 279 564 58 345 1.10e-57 199
MsG0180004925.01.T01 AT1G61610 34.211 380 234 7 207 577 436 808 1.13e-57 209
MsG0180004925.01.T01 AT3G59350 45.679 243 116 6 277 509 101 337 1.14e-57 199
MsG0180004925.01.T01 AT1G21590 36.634 303 183 4 271 570 391 687 1.17e-57 208
MsG0180004925.01.T01 AT3G21340 35.484 372 219 9 197 560 500 858 1.52e-57 209
MsG0180004925.01.T01 AT5G49760 43.836 292 152 5 277 564 619 902 1.55e-57 209
MsG0180004925.01.T01 AT1G29730 45.726 234 120 3 277 508 628 856 1.69e-57 209
MsG0180004925.01.T01 AT5G49770 43.333 300 154 6 277 570 622 911 1.73e-57 209
MsG0180004925.01.T01 AT5G62230 37.027 370 197 9 211 573 533 873 1.78e-57 209
MsG0180004925.01.T01 AT5G62230 37.027 370 197 9 211 573 581 921 1.80e-57 209
MsG0180004925.01.T01 AT4G04960 38.926 298 167 7 276 566 334 623 1.81e-57 206
MsG0180004925.01.T01 AT2G19210 36.827 353 196 10 215 564 519 847 1.84e-57 209
MsG0180004925.01.T01 AT1G78530 39.344 305 163 7 209 509 2 288 2.07e-57 196
MsG0180004925.01.T01 AT3G46370 37.979 287 167 5 276 560 476 753 2.40e-57 207
MsG0180004925.01.T01 AT3G46370 37.979 287 167 5 276 560 476 753 2.40e-57 207
MsG0180004925.01.T01 AT1G65790 37.458 299 175 5 285 577 515 807 2.83e-57 208
MsG0180004925.01.T01 AT2G29000 39.175 291 166 5 276 564 554 835 3.09e-57 208
MsG0180004925.01.T01 AT4G29450 37.748 302 168 4 276 564 555 849 3.22e-57 208
MsG0180004925.01.T01 AT4G29180 37.458 299 166 4 276 560 556 847 3.79e-57 208
MsG0180004925.01.T01 AT4G29180 37.458 299 166 4 276 560 553 844 3.89e-57 208
MsG0180004925.01.T01 AT5G57670 36.949 295 173 4 277 568 255 539 3.93e-57 203
MsG0180004925.01.T01 AT2G28250 39.016 305 168 8 274 565 195 494 4.18e-57 202
MsG0180004925.01.T01 AT2G28250 39.016 305 168 8 274 565 195 494 4.18e-57 202
MsG0180004925.01.T01 AT2G28250 39.016 305 168 8 274 565 195 494 4.18e-57 202
MsG0180004925.01.T01 AT2G28250 39.016 305 168 8 274 565 195 494 4.18e-57 202
MsG0180004925.01.T01 AT2G28250 39.016 305 168 8 274 565 195 494 4.18e-57 202
MsG0180004925.01.T01 AT2G28250 39.016 305 168 8 274 565 195 494 4.18e-57 202
MsG0180004925.01.T01 AT4G29180 37.458 299 166 4 276 560 554 845 5.13e-57 207
MsG0180004925.01.T01 AT4G21230 36.977 311 184 5 271 575 315 619 7.70e-57 204
MsG0180004925.01.T01 AT1G49100 36.034 358 206 8 207 560 509 847 7.82e-57 207
MsG0180004925.01.T01 AT1G11340 33.766 385 231 11 203 577 428 798 8.90e-57 206
MsG0180004925.01.T01 AT1G66880 37.778 315 180 6 261 568 320 625 9.19e-57 204

Find 183 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 199 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GGTGAGTCGGGTTCGGTTTC+TGG 0.012700 1:+84478766 MsG0180004925.01.T01:CDS
TTTCATAGGGATAATATAAT+TGG 0.111121 1:+84478862 MsG0180004925.01.T01:CDS
TACTAGGGTTGCTGGAACTA+TGG 0.158226 1:+84479350 MsG0180004925.01.T01:CDS
TGTCGATAGTTATAGGGTTT+TGG 0.233347 1:+84478683 MsG0180004925.01.T01:CDS
GAGAGATCTGTTAGCGGTTT+TGG 0.236456 1:+84479759 MsG0180004925.01.T01:CDS
GAAGCTAAGGTTGCCGATTT+TGG 0.238546 1:+84479288 MsG0180004925.01.T01:CDS
CTTTGTACTACTAGTTTATC+TGG 0.244875 1:+84478448 MsG0180004925.01.T01:CDS
GCCATTCTTCTAATCATTCT+AGG 0.249093 1:+84479859 MsG0180004925.01.T01:CDS
TAAAGCTAATAATATACTTT+TGG 0.252193 1:+84479254 MsG0180004925.01.T01:CDS
GATCATTTGTTTGAATCTAA+TGG 0.274592 1:+84479126 MsG0180004925.01.T01:CDS
GGATTATCTTATTTGCATTA+TGG 0.277251 1:+84479201 MsG0180004925.01.T01:CDS
AACCTTCTGCTTTGACTGAT+TGG 0.277948 1:+84479499 MsG0180004925.01.T01:CDS
AGGTGGCTCTGCCGCCGCTT+AGG 0.278255 1:-84478093 None:intergenic
CTGCTTTGACTGATTGGGCT+TGG 0.296974 1:+84479505 MsG0180004925.01.T01:CDS
TCGGGTTCGGTTTCTGGGTT+GGG 0.310913 1:+84478772 MsG0180004925.01.T01:CDS
CCTTCTCTTGGTCAACCTAT+TGG 0.317793 1:+84478475 MsG0180004925.01.T01:CDS
ACCTTCTGCTTTGACTGATT+GGG 0.320910 1:+84479500 MsG0180004925.01.T01:CDS
CGGCCAATTCCTCTTGTTGC+GGG 0.323356 1:+84479723 MsG0180004925.01.T01:CDS
GACTGATTGGGCTTGGTCAT+TGG 0.332058 1:+84479512 MsG0180004925.01.T01:CDS
AAATTTAATGATAAGGCAAT+TGG 0.332066 1:+84478715 MsG0180004925.01.T01:CDS
TAGTGCGACAACGCGGTTAG+AGG 0.338238 1:+84479053 MsG0180004925.01.T01:CDS
GGTTTCTGGGTTGGGTTCAA+TGG 0.351700 1:+84478780 MsG0180004925.01.T01:CDS
GGTTATGGGAATGTGTATAA+AGG 0.355220 1:+84478892 MsG0180004925.01.T01:CDS
TCAATCGTTCACGTTAGAAA+TGG 0.355653 1:+84479812 MsG0180004925.01.T01:CDS
ATCATTTGTTTGAATCTAAT+GGG 0.358520 1:+84479127 MsG0180004925.01.T01:CDS
GTGAGTCGGGTTCGGTTTCT+GGG 0.360774 1:+84478767 MsG0180004925.01.T01:CDS
CTTGTGAGATCCATTCAGTT+TGG 0.367017 1:-84478312 None:intergenic
ACTTGATCTGAACCTTGTTC+TGG 0.368499 1:-84479576 None:intergenic
ATAATAGTACTACTTTGATT+AGG 0.375802 1:+84478803 MsG0180004925.01.T01:CDS
CTCAACCTGCTATCATTCAT+AGG 0.381161 1:+84479226 MsG0180004925.01.T01:CDS
CTCCCCGCAACAAGAGGAAT+TGG 0.381466 1:-84479726 None:intergenic
AGGAGTGATGTGTTTAGTTT+TGG 0.384668 1:+84479417 MsG0180004925.01.T01:CDS
CATATGAGTACTAGGGTTGC+TGG 0.384964 1:+84479342 MsG0180004925.01.T01:CDS
TTATCTGGTTTACCTTCTCT+TGG 0.385302 1:+84478463 MsG0180004925.01.T01:CDS
TTCATAGGGATAATATAATT+GGG 0.386818 1:+84478863 MsG0180004925.01.T01:CDS
ATTGTGTTGTCGATAGTTAT+AGG 0.388521 1:+84478676 MsG0180004925.01.T01:CDS
TTGTGTTGTCGATAGTTATA+GGG 0.391443 1:+84478677 MsG0180004925.01.T01:CDS
GTCGGGTTCGGTTTCTGGGT+TGG 0.391811 1:+84478771 MsG0180004925.01.T01:CDS
GTGAGTTATCTTGAATTGAT+TGG 0.393674 1:-84478417 None:intergenic
CGCCGCTTAGGGTGGTTAAG+AGG 0.394771 1:-84478081 None:intergenic
GGTGGCTCTGCCGCCGCTTA+GGG 0.398008 1:-84478092 None:intergenic
GCATTGGATGTTATTGAAGA+TGG 0.405463 1:+84479549 MsG0180004925.01.T01:CDS
AAACTTTGCAAGTCCAAAAT+CGG 0.407026 1:-84479301 None:intergenic
TTAACAACCTGATCCATTGT+TGG 0.409237 1:-84479657 None:intergenic
TTTACTTCAGGAGGTTCATC+TGG 0.410983 1:+84478604 MsG0180004925.01.T01:CDS
AATTTAATGATAAGGCAATT+GGG 0.419128 1:+84478716 MsG0180004925.01.T01:CDS
TTGAGGTTATTGCTAGTGTT+AGG 0.421630 1:+84478998 MsG0180004925.01.T01:CDS
GGAGAGCTTGCCGGACGAAC+TGG 0.423377 1:-84478150 None:intergenic
GGACAAGGCGGAGAGCTTGC+CGG 0.424796 1:-84478159 None:intergenic
TAATATCGGTGAGTCGGGTT+CGG 0.427213 1:+84478759 MsG0180004925.01.T01:CDS
TTATAGGAAATTTAATGATA+AGG 0.434979 1:+84478708 MsG0180004925.01.T01:CDS
GAATGACTCATATGAGTACT+AGG 0.435406 1:+84479334 MsG0180004925.01.T01:CDS
GCTCCTGAGTATGCTTTGTA+TGG 0.436582 1:+84479381 MsG0180004925.01.T01:CDS
TTCAACATTCGTTCTTCTTG+TGG 0.439036 1:+84478286 MsG0180004925.01.T01:CDS
GAATTAGTGCCCTCGATACC+TGG 0.443743 1:+84479699 MsG0180004925.01.T01:CDS
CTTGTGGCTTCCAAACTGAA+TGG 0.445504 1:+84478302 MsG0180004925.01.T01:CDS
GCTTGGTCATTGGTTAGAAC+GGG 0.447039 1:+84479522 MsG0180004925.01.T01:CDS
CGGAGTGGGAAGTTGTTAAG+AGG 0.448050 1:-84478036 None:intergenic
AAGGATCATGGTGCTAATAT+CGG 0.451882 1:+84478745 MsG0180004925.01.T01:CDS
CAATCGTTCACGTTAGAAAT+GGG 0.452831 1:+84479813 MsG0180004925.01.T01:CDS
TGAGTTATTGAGTGGAAGAA+AGG 0.456613 1:+84479452 MsG0180004925.01.T01:CDS
CAACACCATGCCAGTTCGTC+CGG 0.457515 1:+84478140 MsG0180004925.01.T01:CDS
GGTAATTTATCTGATTGTAC+TGG 0.460342 1:+84478496 MsG0180004925.01.T01:CDS
GGATGATAAGTTTGAAGCTA+AGG 0.460717 1:+84479275 MsG0180004925.01.T01:CDS
TTCAATTGATGATATTAAGA+AGG 0.462189 1:+84478828 MsG0180004925.01.T01:CDS
CAATCAGATAAATTACCAAT+AGG 0.464062 1:-84478490 None:intergenic
CCCTAGAATGATTAGAAGAA+TGG 0.464254 1:-84479860 None:intergenic
GCATGGTGTGGAGGAGTTTG+AGG 0.467767 1:-84478221 None:intergenic
TTTAAGAATTGTTCTGCTGC+TGG 0.468490 1:+84478952 MsG0180004925.01.T01:CDS
AGAAATGGGTAGTGAACAAA+TGG 0.468817 1:+84479827 MsG0180004925.01.T01:CDS
GGGATAATATAATTGGGAAA+GGG 0.471416 1:+84478869 MsG0180004925.01.T01:CDS
GGTGCTAATATCGGTGAGTC+GGG 0.472922 1:+84478754 MsG0180004925.01.T01:CDS
ACTAGGGTTGCTGGAACTAT+GGG 0.477886 1:+84479351 MsG0180004925.01.T01:CDS
CAAACTCCTCCACACCATGC+TGG 0.478563 1:+84478224 MsG0180004925.01.T01:CDS
TGCTAGGCCAACAATGGATC+AGG 0.480226 1:+84479650 MsG0180004925.01.T01:CDS
TAGTTTCACTCATGAGGTTG+AGG 0.482430 1:+84478981 MsG0180004925.01.T01:CDS
GGTTAGAACGGGAAAGGCAT+TGG 0.483979 1:+84479533 MsG0180004925.01.T01:CDS
ATTTAATGATAAGGCAATTG+GGG 0.484007 1:+84478717 MsG0180004925.01.T01:CDS
GCTCGTCAGAAGATTGCTCT+TGG 0.486045 1:+84479168 MsG0180004925.01.T01:CDS
ACGGCCAATTCCTCTTGTTG+CGG 0.488718 1:+84479722 MsG0180004925.01.T01:CDS
CCATTCTTCTAATCATTCTA+GGG 0.491481 1:+84479860 MsG0180004925.01.T01:CDS
CAATTTGGACCGTCTGATCC+TGG 0.492560 1:+84478553 MsG0180004925.01.T01:CDS
GGCTTGGTCATTGGTTAGAA+CGG 0.496228 1:+84479521 MsG0180004925.01.T01:CDS
TGTTGAAGGCTGGTGCGAAT+TGG 0.496736 1:-84478270 None:intergenic
CGAATTGGTTGATGTAGGAT+TGG 0.499622 1:-84478255 None:intergenic
ACAAGAGGAATTGGCCGTCC+AGG 0.502086 1:-84479717 None:intergenic
ACAAGAAGAACGAATGTTGA+AGG 0.503950 1:-84478284 None:intergenic
GGCTCTGCCGCCGCTTAGGG+TGG 0.504697 1:-84478089 None:intergenic
TATAAAGGGTTGTTGAATGA+TGG 0.508125 1:+84478907 MsG0180004925.01.T01:CDS
AAAGCTGCAGCATAAATTGA+AGG 0.509906 1:-84478523 None:intergenic
GCTCTTCAAACGAACGAAGA+TGG 0.510625 1:+84479474 MsG0180004925.01.T01:CDS
GCCGCTTAGGGTGGTTAAGA+GGG 0.513436 1:-84478080 None:intergenic
AAACTCCTCCACACCATGCT+GGG 0.513464 1:+84478225 MsG0180004925.01.T01:CDS
GTTATGGGAATGTGTATAAA+GGG 0.513732 1:+84478893 MsG0180004925.01.T01:CDS
GTCAATCTTGTTGCTTTGAG+AGG 0.515250 1:+84479024 MsG0180004925.01.T01:CDS
GGATCAGGTTGTTAAAATGA+TGG 0.515786 1:+84479665 MsG0180004925.01.T01:CDS
CATGGTGTGGAGGAGTTTGA+GGG 0.515937 1:-84478220 None:intergenic
CTCATATGAGTCATTCCCTC+AGG 0.519576 1:-84479327 None:intergenic
CTAATGGGGTGAAACTTAGT+TGG 0.520517 1:+84479142 MsG0180004925.01.T01:CDS
GAGAGGACACGTGGCGGAGT+GGG 0.523058 1:-84478050 None:intergenic
CATTGGATGTTATTGAAGAT+GGG 0.523598 1:+84479550 MsG0180004925.01.T01:CDS
AATCACAAACAATAATCCTC+TGG 0.523694 1:-84479080 None:intergenic
TGTATGGACAATTAACAGAA+AGG 0.528224 1:+84479397 MsG0180004925.01.T01:CDS
GAAGGAAGATGGTGACTTTG+AGG 0.529005 1:-84478113 None:intergenic
ATTGGGGATGGTAAGGATCA+TGG 0.531101 1:+84478733 MsG0180004925.01.T01:CDS
AATGATAAGGCAATTGGGGA+TGG 0.531225 1:+84478721 MsG0180004925.01.T01:CDS
GGGTGGTGAAGATGAGGACG+AGG 0.532066 1:-84478015 None:intergenic
TGCGGCGGAGGTAGTCGGAT+TGG 0.533525 1:-84478180 None:intergenic
TAAGGCAATTGGGGATGGTA+AGG 0.533818 1:+84478726 MsG0180004925.01.T01:CDS
GGTGTTGAGGTGAAGGAAGA+TGG 0.533876 1:-84478124 None:intergenic
TGGTGCTAATATCGGTGAGT+CGG 0.535269 1:+84478753 MsG0180004925.01.T01:CDS
CAATTCCTCTTGTTGCGGGG+AGG 0.536923 1:+84479727 MsG0180004925.01.T01:CDS
GATTGCTCTTGGAACTGCTA+GGG 0.537194 1:+84479179 MsG0180004925.01.T01:CDS
TGGGGTGAAACTTAGTTGGC+CGG 0.539912 1:+84479146 MsG0180004925.01.T01:CDS
ATGAAAGAAGCTCTGCCTCT+AGG 0.544459 1:+84479883 MsG0180004925.01.T01:CDS
GTCATTGGTTAGAACGGGAA+AGG 0.545109 1:+84479527 MsG0180004925.01.T01:CDS
AGGGATAATATAATTGGGAA+AGG 0.547349 1:+84478868 MsG0180004925.01.T01:CDS
GTCGGTGCGGCGGAGGTAGT+CGG 0.548595 1:-84478185 None:intergenic
GGATAATATAATTGGGAAAG+GGG 0.549037 1:+84478870 MsG0180004925.01.T01:CDS
GGTGTGGAGGAGTTTGAGGG+AGG 0.551861 1:-84478217 None:intergenic
GGTCAGCTCTCTAGTCCGAC+AGG 0.552947 1:+84479786 MsG0180004925.01.T01:CDS
GAAGAACGAATGTTGAAGGC+TGG 0.554363 1:-84478280 None:intergenic
TGAAAGAGTCGGTGCGGCGG+AGG 0.554736 1:-84478192 None:intergenic
CTGGCATGGTGTTGAGGTGA+AGG 0.555652 1:-84478131 None:intergenic
TCAACCTGCTATCATTCATA+GGG 0.555918 1:+84479227 MsG0180004925.01.T01:CDS
CTCATCCACAGTTATATGCT+AGG 0.557751 1:+84479634 MsG0180004925.01.T01:CDS
AGTGCGACAACGCGGTTAGA+GGG 0.559845 1:+84479054 MsG0180004925.01.T01:CDS
ATATCCCTATGAATGATAGC+AGG 0.562281 1:-84479231 None:intergenic
GGAGGTAGTCGGATTGGACA+AGG 0.562550 1:-84478174 None:intergenic
TCAAGCCTCCCCGCAACAAG+AGG 0.566705 1:-84479732 None:intergenic
AGAGCAATCTTCTGACGAGC+CGG 0.566725 1:-84479165 None:intergenic
GTTAAGAGGGTGAAGTTGAG+AGG 0.568828 1:-84478067 None:intergenic
GACGAACTGGCATGGTGTTG+AGG 0.571188 1:-84478137 None:intergenic
GATATTGAGAGATCTGTTAG+CGG 0.571654 1:+84479753 MsG0180004925.01.T01:CDS
ATTGCTCTTGGAACTGCTAG+GGG 0.573247 1:+84479180 MsG0180004925.01.T01:CDS
TTAAGAGGGTGGTGAAGATG+AGG 0.577011 1:-84478021 None:intergenic
CTTGCAAAGTTTAATCCTGA+GGG 0.577493 1:+84479312 MsG0180004925.01.T01:CDS
GTTCGGATTTGGATCAATGA+CGG 0.578982 1:+84479913 MsG0180004925.01.T01:CDS
GCTTGCCGGACGAACTGGCA+TGG 0.579266 1:-84478145 None:intergenic
GGCCAATTCCTCTTGTTGCG+GGG 0.583243 1:+84479724 MsG0180004925.01.T01:CDS
GGATGAAAGAGTCGGTGCGG+CGG 0.585043 1:-84478195 None:intergenic
GTGTGGAGGAGTTTGAGGGA+GGG 0.586920 1:-84478216 None:intergenic
AATAAACACTTAACAGTACC+AGG 0.591065 1:-84478571 None:intergenic
GTGGGAAGTTGTTAAGAGGG+TGG 0.592435 1:-84478032 None:intergenic
GGAGTGGGAAGTTGTTAAGA+GGG 0.593667 1:-84478035 None:intergenic
CAAACTGAATGGATCTCACA+AGG 0.594330 1:+84478313 MsG0180004925.01.T01:CDS
GCCCAATCAGTCAAAGCAGA+AGG 0.597680 1:-84479501 None:intergenic
TGATACTAGTTTCACTCATG+AGG 0.599808 1:+84478975 MsG0180004925.01.T01:CDS
AGATTGCTCTTGGAACTGCT+AGG 0.602857 1:+84479178 MsG0180004925.01.T01:CDS
AATTGGCCGTCCAGGTATCG+AGG 0.606516 1:-84479709 None:intergenic
GTTATATGCTAGGCCAACAA+TGG 0.608703 1:+84479644 MsG0180004925.01.T01:CDS
TGTCCATACAAAGCATACTC+AGG 0.612039 1:-84479384 None:intergenic
AGAGTCCCAGCATGGTGTGG+AGG 0.612674 1:-84478230 None:intergenic
GAAAGAGTCCCAGCATGGTG+TGG 0.612841 1:-84478233 None:intergenic
CCAATAGGTTGACCAAGAGA+AGG 0.616757 1:-84478475 None:intergenic
CTAGTAGTACAAAGAGCACA+AGG 0.617035 1:-84478439 None:intergenic
ACTTGCAAAGTTTAATCCTG+AGG 0.618439 1:+84479311 MsG0180004925.01.T01:CDS
GTGCTTCTTGAGTTATTGAG+TGG 0.618758 1:+84479444 MsG0180004925.01.T01:CDS
AATGACTCATATGAGTACTA+GGG 0.620752 1:+84479335 MsG0180004925.01.T01:CDS
TGAGAGGACACGTGGCGGAG+TGG 0.630400 1:-84478051 None:intergenic
TGGTGCGAATTGGTTGATGT+AGG 0.632306 1:-84478260 None:intergenic
ATTGGCCGTCCAGGTATCGA+GGG 0.639102 1:-84479708 None:intergenic
GATAATATAATTGGGAAAGG+GGG 0.643226 1:+84478871 MsG0180004925.01.T01:CDS
TGTCGGACTAGAGAGCTGAC+CGG 0.646544 1:-84479784 None:intergenic
GAAGATGGGATGCCAGAACA+AGG 0.648399 1:+84479564 MsG0180004925.01.T01:CDS
TGAGGGAGGGATGAAAGAGT+CGG 0.653414 1:-84478203 None:intergenic
GATTGGAAAGAGTCCCAGCA+TGG 0.660156 1:-84478238 None:intergenic
CTCTTAACCACCCTAAGCGG+CGG 0.668126 1:+84478082 MsG0180004925.01.T01:CDS
TAGTGCCCTCGATACCTGGA+CGG 0.670441 1:+84479703 MsG0180004925.01.T01:CDS
TCATTTGTTTGAATCTAATG+GGG 0.671242 1:+84479128 MsG0180004925.01.T01:CDS
TTAACAGTACCAGGATCAGA+CGG 0.679003 1:-84478562 None:intergenic
CTAGGGTTGCTGGAACTATG+GGG 0.688495 1:+84479352 MsG0180004925.01.T01:CDS
GGTGAAGTTGAGAGGACACG+TGG 0.688703 1:-84478059 None:intergenic
CGCGGTTAGAGGGTTACCAG+AGG 0.692715 1:+84479064 MsG0180004925.01.T01:CDS
ACCCTCTTAACCACCCTAAG+CGG 0.698299 1:+84478079 MsG0180004925.01.T01:CDS
GTTATTGTAGTGCGACAACG+CGG 0.708680 1:+84479046 MsG0180004925.01.T01:CDS
GTGAACGATTGATAACCTGT+CGG 0.709653 1:-84479801 None:intergenic
GAGGGATGAAAGAGTCGGTG+CGG 0.711361 1:-84478198 None:intergenic
GGAAGATGGTGACTTTGAGG+TGG 0.718819 1:-84478110 None:intergenic
GAAGTTGAGAGGACACGTGG+CGG 0.719861 1:-84478056 None:intergenic
ATCCGAACTCAAAATCCTAG+AGG 0.728897 1:-84479898 None:intergenic
GTTGGCCTAGCATATAACTG+TGG 0.766762 1:-84479639 None:intergenic
GGTAGTCGGATTGGACAAGG+CGG 0.770655 1:-84478171 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTATAGGAAATTTAATGATA+AGG + Chr1:84478708-84478727 MsG0180004925.01.T01:CDS 15.0%
!!! TAAAGCTAATAATATACTTT+TGG + Chr1:84479254-84479273 MsG0180004925.01.T01:CDS 15.0%
!! AAATTTAATGATAAGGCAAT+TGG + Chr1:84478715-84478734 MsG0180004925.01.T01:CDS 20.0%
!! AATTTAATGATAAGGCAATT+GGG + Chr1:84478716-84478735 MsG0180004925.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAATAGTACTACTTTGATT+AGG + Chr1:84478803-84478822 MsG0180004925.01.T01:CDS 20.0%
!! ATCATTTGTTTGAATCTAAT+GGG + Chr1:84479127-84479146 MsG0180004925.01.T01:CDS 20.0%
!! TTCATAGGGATAATATAATT+GGG + Chr1:84478863-84478882 MsG0180004925.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTCATAGGGATAATATAAT+TGG + Chr1:84478862-84478881 MsG0180004925.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTGTGATTTGATGAAAAAT+GGG + Chr1:84479094-84479113 MsG0180004925.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATATTTTGAATAGTGGATTT+AGG - Chr1:84478382-84478401 None:intergenic 20.0%
!!! TTCAATTGATGATATTAAGA+AGG + Chr1:84478828-84478847 MsG0180004925.01.T01:CDS 20.0%
! ATTTAATGATAAGGCAATTG+GGG + Chr1:84478717-84478736 MsG0180004925.01.T01:CDS 25.0%
! CAATCAGATAAATTACCAAT+AGG - Chr1:84478493-84478512 None:intergenic 25.0%
! GATCATTTGTTTGAATCTAA+TGG + Chr1:84479126-84479145 MsG0180004925.01.T01:CDS 25.0%
! GTTTGTGATTTGATGAAAAA+TGG + Chr1:84479093-84479112 MsG0180004925.01.T01:CDS 25.0%
! TCATTTGTTTGAATCTAATG+GGG + Chr1:84479128-84479147 MsG0180004925.01.T01:CDS 25.0%
!! GGATTATCTTATTTGCATTA+TGG + Chr1:84479201-84479220 MsG0180004925.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTCAACTTGATTTTACTTC+AGG + Chr1:84478592-84478611 MsG0180004925.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGATTGCATATTTTGAATAG+TGG - Chr1:84478389-84478408 None:intergenic 25.0%
AAACTTTGCAAGTCCAAAAT+CGG - Chr1:84479304-84479323 None:intergenic 30.0%
AATAAACACTTAACAGTACC+AGG - Chr1:84478574-84478593 None:intergenic 30.0%
AATCACAAACAATAATCCTC+TGG - Chr1:84479083-84479102 None:intergenic 30.0%
AATGACTCATATGAGTACTA+GGG + Chr1:84479335-84479354 MsG0180004925.01.T01:CDS 30.0%
AGGGATAATATAATTGGGAA+AGG + Chr1:84478868-84478887 MsG0180004925.01.T01:CDS 30.0%
ATTGTGTTGTCGATAGTTAT+AGG + Chr1:84478676-84478695 MsG0180004925.01.T01:CDS 30.0%
CATTGGATGTTATTGAAGAT+GGG + Chr1:84479550-84479569 MsG0180004925.01.T01:CDS 30.0%
CCATTCTTCTAATCATTCTA+GGG + Chr1:84479860-84479879 MsG0180004925.01.T01:CDS 30.0%
GATAATATAATTGGGAAAGG+GGG + Chr1:84478871-84478890 MsG0180004925.01.T01:CDS 30.0%
GGATAATATAATTGGGAAAG+GGG + Chr1:84478870-84478889 MsG0180004925.01.T01:CDS 30.0%
GGGATAATATAATTGGGAAA+GGG + Chr1:84478869-84478888 MsG0180004925.01.T01:CDS 30.0%
GGTAATTTATCTGATTGTAC+TGG + Chr1:84478496-84478515 MsG0180004925.01.T01:CDS 30.0%
GTGAGTTATCTTGAATTGAT+TGG - Chr1:84478420-84478439 None:intergenic 30.0%
GTTATGGGAATGTGTATAAA+GGG + Chr1:84478893-84478912 MsG0180004925.01.T01:CDS 30.0%
TATAAAGGGTTGTTGAATGA+TGG + Chr1:84478907-84478926 MsG0180004925.01.T01:CDS 30.0%
TGTATGGACAATTAACAGAA+AGG + Chr1:84479397-84479416 MsG0180004925.01.T01:CDS 30.0%
TTGTGTTGTCGATAGTTATA+GGG + Chr1:84478677-84478696 MsG0180004925.01.T01:CDS 30.0%
! CTTTGTACTACTAGTTTATC+TGG + Chr1:84478448-84478467 MsG0180004925.01.T01:CDS 30.0%
AAAGCTGCAGCATAAATTGA+AGG - Chr1:84478526-84478545 None:intergenic 35.0%
ACAAGAAGAACGAATGTTGA+AGG - Chr1:84478287-84478306 None:intergenic 35.0%
ACTTGCAAAGTTTAATCCTG+AGG + Chr1:84479311-84479330 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
AGAAATGGGTAGTGAACAAA+TGG + Chr1:84479827-84479846 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
ATATCCCTATGAATGATAGC+AGG - Chr1:84479234-84479253 None:intergenic 35.0%
CAATCGTTCACGTTAGAAAT+GGG + Chr1:84479813-84479832 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
CCCTAGAATGATTAGAAGAA+TGG - Chr1:84479863-84479882 None:intergenic 35.0%
CTTGCAAAGTTTAATCCTGA+GGG + Chr1:84479312-84479331 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
GAATGACTCATATGAGTACT+AGG + Chr1:84479334-84479353 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
GATATTGAGAGATCTGTTAG+CGG + Chr1:84479753-84479772 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
GCATTGGATGTTATTGAAGA+TGG + Chr1:84479549-84479568 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
GCCATTCTTCTAATCATTCT+AGG + Chr1:84479859-84479878 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
GGTTATGGGAATGTGTATAA+AGG + Chr1:84478892-84478911 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
TCAACCTGCTATCATTCATA+GGG + Chr1:84479227-84479246 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
TCAATCGTTCACGTTAGAAA+TGG + Chr1:84479812-84479831 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
TGAGTTATTGAGTGGAAGAA+AGG + Chr1:84479452-84479471 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
TTAACAACCTGATCCATTGT+TGG - Chr1:84479660-84479679 None:intergenic 35.0%
TTCAACATTCGTTCTTCTTG+TGG + Chr1:84478286-84478305 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
TTGAGGTTATTGCTAGTGTT+AGG + Chr1:84478998-84479017 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
TTTAAGAATTGTTCTGCTGC+TGG + Chr1:84478952-84478971 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
! AAGGATCATGGTGCTAATAT+CGG + Chr1:84478745-84478764 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
! AGGCGACAAAGAATTTTCAT+AGG + Chr1:84478848-84478867 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
! CAACTTGATTTTACTTCAGG+AGG + Chr1:84478595-84478614 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
! GCAGCTTTTGCAAATCAATT+TGG + Chr1:84478538-84478557 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
! GGATCAGGTTGTTAAAATGA+TGG + Chr1:84479665-84479684 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
! GGATGATAAGTTTGAAGCTA+AGG + Chr1:84479275-84479294 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
! GGCGACAAAGAATTTTCATA+GGG + Chr1:84478849-84478868 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
! GTCGATAGTTATAGGGTTTT+GGG + Chr1:84478684-84478703 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
! TGATACTAGTTTCACTCATG+AGG + Chr1:84478975-84478994 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
! TGTCGATAGTTATAGGGTTT+TGG + Chr1:84478683-84478702 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
! TTATCTGGTTTACCTTCTCT+TGG + Chr1:84478463-84478482 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
!! AGGAGTGATGTGTTTAGTTT+TGG + Chr1:84479417-84479436 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
!!! GAAGTGAAGTTGCTTTTAAG+AGG + Chr1:84478929-84478948 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
!!! TAGGATTTTGAGTTCGGATT+TGG + Chr1:84479902-84479921 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTATAGGGTTTTGGGCTTAT+AGG + Chr1:84478692-84478711 MsG0180004925.01.T01:CDS 35.0%
AACCTTCTGCTTTGACTGAT+TGG + Chr1:84479499-84479518 MsG0180004925.01.T01:CDS 40.0%
AATGATAAGGCAATTGGGGA+TGG + Chr1:84478721-84478740 MsG0180004925.01.T01:CDS 40.0%
ACCTTCTGCTTTGACTGATT+GGG + Chr1:84479500-84479519 MsG0180004925.01.T01:CDS 40.0%
ACTTGATCTGAACCTTGTTC+TGG - Chr1:84479579-84479598 None:intergenic 40.0%
ATAATTGGGAAAGGGGGTTA+TGG + Chr1:84478877-84478896 MsG0180004925.01.T01:CDS 40.0%
ATCCGAACTCAAAATCCTAG+AGG - Chr1:84479901-84479920 None:intergenic 40.0%
CAAACTGAATGGATCTCACA+AGG + Chr1:84478313-84478332 MsG0180004925.01.T01:CDS 40.0%
CTAATGGGGTGAAACTTAGT+TGG + Chr1:84479142-84479161 MsG0180004925.01.T01:CDS 40.0%
CTCAACCTGCTATCATTCAT+AGG + Chr1:84479226-84479245 MsG0180004925.01.T01:CDS 40.0%
CTCATCCACAGTTATATGCT+AGG + Chr1:84479634-84479653 MsG0180004925.01.T01:CDS 40.0%
CTTGTGAGATCCATTCAGTT+TGG - Chr1:84478315-84478334 None:intergenic 40.0%
GTGCTTCTTGAGTTATTGAG+TGG + Chr1:84479444-84479463 MsG0180004925.01.T01:CDS 40.0%
GTTATATGCTAGGCCAACAA+TGG + Chr1:84479644-84479663 MsG0180004925.01.T01:CDS 40.0%
TAATTGGGAAAGGGGGTTAT+GGG + Chr1:84478878-84478897 MsG0180004925.01.T01:CDS 40.0%
TAGTTTCACTCATGAGGTTG+AGG + Chr1:84478981-84479000 MsG0180004925.01.T01:CDS 40.0%
TGTCCATACAAAGCATACTC+AGG - Chr1:84479387-84479406 None:intergenic 40.0%
TTAACAGTACCAGGATCAGA+CGG - Chr1:84478565-84478584 None:intergenic 40.0%
TTTACTTCAGGAGGTTCATC+TGG + Chr1:84478604-84478623 MsG0180004925.01.T01:CDS 40.0%
! CGAATTGGTTGATGTAGGAT+TGG - Chr1:84478258-84478277 None:intergenic 40.0%
! CTAGTAGTACAAAGAGCACA+AGG - Chr1:84478442-84478461 None:intergenic 40.0%
! GTGAACGATTGATAACCTGT+CGG - Chr1:84479804-84479823 None:intergenic 40.0%
!! GTCAATCTTGTTGCTTTGAG+AGG + Chr1:84479024-84479043 MsG0180004925.01.T01:CDS 40.0%
!!! TGCCTCTAGGATTTTGAGTT+CGG + Chr1:84479896-84479915 MsG0180004925.01.T01:CDS 40.0%
ACTAGGGTTGCTGGAACTAT+GGG + Chr1:84479351-84479370 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
AGATTGCTCTTGGAACTGCT+AGG + Chr1:84479178-84479197 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
ATGAAAGAAGCTCTGCCTCT+AGG + Chr1:84479883-84479902 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
ATTGCTCTTGGAACTGCTAG+GGG + Chr1:84479180-84479199 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
ATTGGGGATGGTAAGGATCA+TGG + Chr1:84478733-84478752 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
CATATGAGTACTAGGGTTGC+TGG + Chr1:84479342-84479361 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
CCTTCTCTTGGTCAACCTAT+TGG + Chr1:84478475-84478494 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
CTCATATGAGTCATTCCCTC+AGG - Chr1:84479330-84479349 None:intergenic 45.0%
CTTGTGGCTTCCAAACTGAA+TGG + Chr1:84478302-84478321 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
GAAGAACGAATGTTGAAGGC+TGG - Chr1:84478283-84478302 None:intergenic 45.0%
GAAGGAAGATGGTGACTTTG+AGG - Chr1:84478116-84478135 None:intergenic 45.0%
GATTGCTCTTGGAACTGCTA+GGG + Chr1:84479179-84479198 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
GCTCCTGAGTATGCTTTGTA+TGG + Chr1:84479381-84479400 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
GCTCTTCAAACGAACGAAGA+TGG + Chr1:84479474-84479493 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
GGAGTGGGAAGTTGTTAAGA+GGG - Chr1:84478038-84478057 None:intergenic 45.0%
GTTAAGAGGGTGAAGTTGAG+AGG - Chr1:84478070-84478089 None:intergenic 45.0%
GTTATTGTAGTGCGACAACG+CGG + Chr1:84479046-84479065 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
TAAGGCAATTGGGGATGGTA+AGG + Chr1:84478726-84478745 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
TAATATCGGTGAGTCGGGTT+CGG + Chr1:84478759-84478778 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
TACTAGGGTTGCTGGAACTA+TGG + Chr1:84479350-84479369 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
TTAAGAGGGTGGTGAAGATG+AGG - Chr1:84478024-84478043 None:intergenic 45.0%
! CCAATAGGTTGACCAAGAGA+AGG - Chr1:84478478-84478497 None:intergenic 45.0%
! GAGAGATCTGTTAGCGGTTT+TGG + Chr1:84479759-84479778 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
! GCTTGGTCATTGGTTAGAAC+GGG + Chr1:84479522-84479541 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
! GGCTTGGTCATTGGTTAGAA+CGG + Chr1:84479521-84479540 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
! GTCATTGGTTAGAACGGGAA+AGG + Chr1:84479527-84479546 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
! GTTGGCCTAGCATATAACTG+TGG - Chr1:84479642-84479661 None:intergenic 45.0%
! TGGTGCGAATTGGTTGATGT+AGG - Chr1:84478263-84478282 None:intergenic 45.0%
! TGGTGCTAATATCGGTGAGT+CGG + Chr1:84478753-84478772 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
!!! GAAGCTAAGGTTGCCGATTT+TGG + Chr1:84479288-84479307 MsG0180004925.01.T01:CDS 45.0%
AAACTCCTCCACACCATGCT+GGG + Chr1:84478225-84478244 MsG0180004925.01.T01:CDS 50.0%
ACCCTCTTAACCACCCTAAG+CGG + Chr1:84478079-84478098 MsG0180004925.01.T01:CDS 50.0%
ACGGCCAATTCCTCTTGTTG+CGG + Chr1:84479722-84479741 MsG0180004925.01.T01:CDS 50.0%
AGAGCAATCTTCTGACGAGC+CGG - Chr1:84479168-84479187 None:intergenic 50.0%
CAATTTGGACCGTCTGATCC+TGG + Chr1:84478553-84478572 MsG0180004925.01.T01:CDS 50.0%
CATGGTGTGGAGGAGTTTGA+GGG - Chr1:84478223-84478242 None:intergenic 50.0%
CGGAGTGGGAAGTTGTTAAG+AGG - Chr1:84478039-84478058 None:intergenic 50.0%
CTAGGGTTGCTGGAACTATG+GGG + Chr1:84479352-84479371 MsG0180004925.01.T01:CDS 50.0%
CTGCTTTGACTGATTGGGCT+TGG + Chr1:84479505-84479524 MsG0180004925.01.T01:CDS 50.0%
GAAGATGGGATGCCAGAACA+AGG + Chr1:84479564-84479583 MsG0180004925.01.T01:CDS 50.0%
GAATTAGTGCCCTCGATACC+TGG + Chr1:84479699-84479718 MsG0180004925.01.T01:CDS 50.0%
GATTGGAAAGAGTCCCAGCA+TGG - Chr1:84478241-84478260 None:intergenic 50.0%
GCCCAATCAGTCAAAGCAGA+AGG - Chr1:84479504-84479523 None:intergenic 50.0%
GCTCGTCAGAAGATTGCTCT+TGG + Chr1:84479168-84479187 MsG0180004925.01.T01:CDS 50.0%
GGTGCTAATATCGGTGAGTC+GGG + Chr1:84478754-84478773 MsG0180004925.01.T01:CDS 50.0%
GTGGGAAGTTGTTAAGAGGG+TGG - Chr1:84478035-84478054 None:intergenic 50.0%
TGAGGGAGGGATGAAAGAGT+CGG - Chr1:84478206-84478225 None:intergenic 50.0%
TGCTAGGCCAACAATGGATC+AGG + Chr1:84479650-84479669 MsG0180004925.01.T01:CDS 50.0%
TGGGGTGAAACTTAGTTGGC+CGG + Chr1:84479146-84479165 MsG0180004925.01.T01:CDS 50.0%
TGTTGAAGGCTGGTGCGAAT+TGG - Chr1:84478273-84478292 None:intergenic 50.0%
! GACTGATTGGGCTTGGTCAT+TGG + Chr1:84479512-84479531 MsG0180004925.01.T01:CDS 50.0%
! GGAAGATGGTGACTTTGAGG+TGG - Chr1:84478113-84478132 None:intergenic 50.0%
! GGTGTTGAGGTGAAGGAAGA+TGG - Chr1:84478127-84478146 None:intergenic 50.0%
! GGTTAGAACGGGAAAGGCAT+TGG + Chr1:84479533-84479552 MsG0180004925.01.T01:CDS 50.0%
! GGTTTCTGGGTTGGGTTCAA+TGG + Chr1:84478780-84478799 MsG0180004925.01.T01:CDS 50.0%
!!! TCTGTTAGCGGTTTTGGCTC+CGG + Chr1:84479765-84479784 MsG0180004925.01.T01:CDS 50.0%
ACAAGAGGAATTGGCCGTCC+AGG - Chr1:84479720-84479739 None:intergenic 55.0%
AGTGCGACAACGCGGTTAGA+GGG + Chr1:84479054-84479073 MsG0180004925.01.T01:CDS 55.0%
CAAACTCCTCCACACCATGC+TGG + Chr1:84478224-84478243 MsG0180004925.01.T01:CDS 55.0%
CAACACCATGCCAGTTCGTC+CGG + Chr1:84478140-84478159 MsG0180004925.01.T01:CDS 55.0%
CAATTCCTCTTGTTGCGGGG+AGG + Chr1:84479727-84479746 MsG0180004925.01.T01:CDS 55.0%
CGGCCAATTCCTCTTGTTGC+GGG + Chr1:84479723-84479742 MsG0180004925.01.T01:CDS 55.0%
CTCCCCGCAACAAGAGGAAT+TGG - Chr1:84479729-84479748 None:intergenic 55.0%
CTCTTAACCACCCTAAGCGG+CGG + Chr1:84478082-84478101 MsG0180004925.01.T01:CDS 55.0%
GAAAGAGTCCCAGCATGGTG+TGG - Chr1:84478236-84478255 None:intergenic 55.0%
GAAGTTGAGAGGACACGTGG+CGG - Chr1:84478059-84478078 None:intergenic 55.0%
GAGGGATGAAAGAGTCGGTG+CGG - Chr1:84478201-84478220 None:intergenic 55.0%
GCATGGTGTGGAGGAGTTTG+AGG - Chr1:84478224-84478243 None:intergenic 55.0%
GCCGCTTAGGGTGGTTAAGA+GGG - Chr1:84478083-84478102 None:intergenic 55.0%
GGCCAATTCCTCTTGTTGCG+GGG + Chr1:84479724-84479743 MsG0180004925.01.T01:CDS 55.0%
GGTGAAGTTGAGAGGACACG+TGG - Chr1:84478062-84478081 None:intergenic 55.0%
GTGTGGAGGAGTTTGAGGGA+GGG - Chr1:84478219-84478238 None:intergenic 55.0%
TAGTGCCCTCGATACCTGGA+CGG + Chr1:84479703-84479722 MsG0180004925.01.T01:CDS 55.0%
TAGTGCGACAACGCGGTTAG+AGG + Chr1:84479053-84479072 MsG0180004925.01.T01:CDS 55.0%
! AATTGGCCGTCCAGGTATCG+AGG - Chr1:84479712-84479731 None:intergenic 55.0%
! CTGGCATGGTGTTGAGGTGA+AGG - Chr1:84478134-84478153 None:intergenic 55.0%
! GACGAACTGGCATGGTGTTG+AGG - Chr1:84478140-84478159 None:intergenic 55.0%
! GGAGGTAGTCGGATTGGACA+AGG - Chr1:84478177-84478196 None:intergenic 55.0%
! GGTAGTCGGATTGGACAAGG+CGG - Chr1:84478174-84478193 None:intergenic 55.0%
! GTGAGTCGGGTTCGGTTTCT+GGG + Chr1:84478767-84478786 MsG0180004925.01.T01:CDS 55.0%
! TCGGGTTCGGTTTCTGGGTT+GGG + Chr1:84478772-84478791 MsG0180004925.01.T01:CDS 55.0%
! TGTCGGACTAGAGAGCTGAC+CGG - Chr1:84479787-84479806 None:intergenic 55.0%
!! ATTGGCCGTCCAGGTATCGA+GGG - Chr1:84479711-84479730 None:intergenic 55.0%
AGAGTCCCAGCATGGTGTGG+AGG - Chr1:84478233-84478252 None:intergenic 60.0%
CGCCGCTTAGGGTGGTTAAG+AGG - Chr1:84478084-84478103 None:intergenic 60.0%
CGCGGTTAGAGGGTTACCAG+AGG + Chr1:84479064-84479083 MsG0180004925.01.T01:CDS 60.0%
GGATGAAAGAGTCGGTGCGG+CGG - Chr1:84478198-84478217 None:intergenic 60.0%
GGGTGGTGAAGATGAGGACG+AGG - Chr1:84478018-84478037 None:intergenic 60.0%
GGTCAGCTCTCTAGTCCGAC+AGG + Chr1:84479786-84479805 MsG0180004925.01.T01:CDS 60.0%
GGTGTGGAGGAGTTTGAGGG+AGG - Chr1:84478220-84478239 None:intergenic 60.0%
TCAAGCCTCCCCGCAACAAG+AGG - Chr1:84479735-84479754 None:intergenic 60.0%
! GGTGAGTCGGGTTCGGTTTC+TGG + Chr1:84478766-84478785 MsG0180004925.01.T01:CDS 60.0%
! GTCGGGTTCGGTTTCTGGGT+TGG + Chr1:84478771-84478790 MsG0180004925.01.T01:CDS 60.0%
GCTTGCCGGACGAACTGGCA+TGG - Chr1:84478148-84478167 None:intergenic 65.0%
GGACAAGGCGGAGAGCTTGC+CGG - Chr1:84478162-84478181 None:intergenic 65.0%
GGAGAGCTTGCCGGACGAAC+TGG - Chr1:84478153-84478172 None:intergenic 65.0%
TGAAAGAGTCGGTGCGGCGG+AGG - Chr1:84478195-84478214 None:intergenic 65.0%
TGCGGCGGAGGTAGTCGGAT+TGG - Chr1:84478183-84478202 None:intergenic 65.0%
! GAGAGGACACGTGGCGGAGT+GGG - Chr1:84478053-84478072 None:intergenic 65.0%
! TGAGAGGACACGTGGCGGAG+TGG - Chr1:84478054-84478073 None:intergenic 65.0%
GTCGGTGCGGCGGAGGTAGT+CGG - Chr1:84478188-84478207 None:intergenic 70.0%
! AGGTGGCTCTGCCGCCGCTT+AGG - Chr1:84478096-84478115 None:intergenic 70.0%
! GGTGGCTCTGCCGCCGCTTA+GGG - Chr1:84478095-84478114 None:intergenic 70.0%
GGCTCTGCCGCCGCTTAGGG+TGG - Chr1:84478092-84478111 None:intergenic 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
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Gene Sequence

>MsG0180004925.01.T01

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Protein sequence

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