AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280008248.01

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MsG0280008248.01.T01 AT2G44880 25.545 321 210 12 129 438 13 315 2.47e-22 101
MsG0280008248.01.T01 AT2G44880 34.297 519 326 7 1 517 88 593 3.07e-102 320
MsG0280008248.01.T01 AT2G44880 23.773 387 250 7 83 434 67 443 2.70e-31 128
MsG0280008248.01.T01 AT2G44880 25.545 321 210 12 129 438 12 314 2.65e-22 100
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MsG0280008248.01.T01 AT5G50390 23.473 311 187 9 1 298 285 557 4.52e-13 72.4
MsG0280008248.01.T01 AT1G59720 36.689 447 270 5 85 519 102 547 8.50e-99 312
MsG0280008248.01.T01 AT1G59720 34.551 301 180 6 29 318 149 443 3.79e-53 191
MsG0280008248.01.T01 AT1G59720 28.618 304 174 7 169 432 84 384 3.44e-25 110
MsG0280008248.01.T01 AT3G13770 33.954 483 283 3 40 521 61 508 2.44e-98 309
MsG0280008248.01.T01 AT3G13770 31.757 296 187 4 111 402 34 318 1.54e-39 152
MsG0280008248.01.T01 AT3G13770 30.403 273 159 5 29 301 151 392 3.77e-34 136
MsG0280008248.01.T01 AT3G13770 26.344 186 121 4 16 190 239 419 7.77e-13 71.6
MsG0280008248.01.T01 AT3G04750 33.582 536 312 10 18 515 120 649 3.08e-98 311
MsG0280008248.01.T01 AT3G04750 30.211 331 194 6 16 309 217 547 6.71e-45 168
MsG0280008248.01.T01 AT5G13230 33.861 505 331 2 15 519 231 732 3.33e-98 315
MsG0280008248.01.T01 AT5G13230 28.536 403 279 6 13 414 130 524 3.05e-52 190
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MsG0280008248.01.T01 AT1G71490 27.381 252 177 3 104 351 10 259 6.03e-22 100
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MsG0280008248.01.T01 AT1G05750 25.263 285 163 7 19 295 194 436 8.00e-19 89.7
MsG0280008248.01.T01 AT4G16835 36.475 488 289 7 15 499 80 549 8.87e-94 299
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MsG0280008248.01.T01 AT1G69350 33.435 329 214 4 29 356 200 524 5.25e-60 212
MsG0280008248.01.T01 AT1G69350 27.626 438 275 9 37 438 7 438 4.79e-44 167
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MsG0280008248.01.T01 AT4G32430 30.591 474 271 8 9 438 152 611 1.34e-59 210
MsG0280008248.01.T01 AT4G32430 28.338 367 241 7 4 359 39 394 7.32e-40 154
MsG0280008248.01.T01 AT4G32430 29.630 270 179 6 84 349 26 288 4.18e-29 122
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MsG0280008248.01.T01 AT2G42920 32.008 503 300 6 41 508 35 530 6.97e-90 286
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MsG0280008248.01.T01 AT5G52630 34.426 305 190 4 14 313 99 398 3.48e-49 179
MsG0280008248.01.T01 AT2G46050 34.685 444 275 5 41 479 152 585 3.66e-84 272
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MsG0280008248.01.T01 AT2G46050 29.570 186 120 4 16 196 327 506 7.57e-15 77.8
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MsG0280008248.01.T01 AT2G39620 33.333 333 217 3 15 347 185 512 9.36e-51 186
MsG0280008248.01.T01 AT2G39620 30.649 385 256 6 29 411 98 473 1.45e-50 186
MsG0280008248.01.T01 AT2G39620 32.070 343 225 5 70 411 37 372 5.15e-50 184
MsG0280008248.01.T01 AT2G02750 32.510 486 284 7 30 477 131 610 1.52e-83 271
MsG0280008248.01.T01 AT2G02750 35.440 364 223 7 29 390 29 382 1.42e-67 229
MsG0280008248.01.T01 AT2G02750 28.571 182 126 3 16 194 353 533 2.39e-18 89.0
MsG0280008248.01.T01 AT4G14170 34.184 392 255 2 88 479 89 477 6.87e-83 266
MsG0280008248.01.T01 AT4G14170 32.647 340 216 5 29 363 132 463 1.29e-44 164
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MsG0280008248.01.T01 AT1G53600 22.482 427 252 9 70 430 54 467 9.71e-23 102
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MsG0280008248.01.T01 AT4G08210 30.426 470 320 4 13 479 220 685 6.02e-76 253
MsG0280008248.01.T01 AT4G08210 25.826 484 289 11 41 474 15 478 3.01e-40 155
MsG0280008248.01.T01 AT4G08210 25.658 456 266 7 30 417 106 556 3.95e-33 134
MsG0280008248.01.T01 AT4G08210 26.923 156 112 2 237 392 8 161 1.86e-13 73.6
MsG0280008248.01.T01 AT1G09190 32.319 427 255 4 85 479 55 479 2.56e-75 246
MsG0280008248.01.T01 AT1G09190 29.971 347 198 8 13 319 83 424 2.57e-43 160
MsG0280008248.01.T01 AT3G18970 37.288 413 232 9 88 479 66 472 3.25e-75 245
MsG0280008248.01.T01 AT3G18970 34.386 285 174 6 30 301 107 391 6.07e-40 151
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MsG0280008248.01.T01 AT1G22830 27.311 238 170 2 115 351 64 299 1.20e-23 105
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MsG0280008248.01.T01 AT5G08490 25.789 380 232 12 110 445 1 374 2.76e-25 110
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MsG0280008248.01.T01 AT5G08490 26.039 457 268 10 29 415 222 678 3.63e-38 149
MsG0280008248.01.T01 AT5G08490 25.789 380 232 12 110 445 1 374 2.76e-25 110
MsG0280008248.01.T01 AT1G23450 28.814 295 204 5 67 359 47 337 5.88e-35 135
MsG0280008248.01.T01 AT1G23450 28.000 275 195 3 16 288 97 370 6.47e-31 124
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MsG0280008248.01.T01 AT2G41720 23.529 425 263 11 10 414 262 644 4.49e-20 94.7
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MsG0280008248.01.T01 AT1G74900 21.270 315 230 6 10 310 105 415 3.41e-13 72.0
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MsG0280008248.01.T01 AT1G13800 21.512 344 214 9 28 363 562 857 2.95e-15 79.3
MsG0280008248.01.T01 AT1G13800 21.330 436 269 13 56 432 207 627 3.13e-11 66.6
MsG0280008248.01.T01 AT3G16890 23.729 413 284 14 16 407 106 508 4.20e-15 78.6
MsG0280008248.01.T01 AT3G16890 23.729 413 284 14 16 407 235 637 5.35e-15 78.6
MsG0280008248.01.T01 AT2G35130 21.818 330 240 6 67 381 287 613 9.70e-15 77.4
MsG0280008248.01.T01 AT2G35130 22.778 360 256 8 94 438 174 526 6.57e-13 71.6
MsG0280008248.01.T01 AT2G35130 27.632 228 146 6 35 246 354 578 1.93e-12 70.1
MsG0280008248.01.T01 AT2G35130 22.689 238 175 3 14 243 304 540 3.68e-11 66.2
MsG0280008248.01.T01 AT5G61990 23.494 332 229 9 17 326 613 941 1.14e-14 77.8
MsG0280008248.01.T01 AT5G61990 19.652 402 301 9 16 402 262 656 5.93e-14 75.5
MsG0280008248.01.T01 AT5G61990 20.370 486 295 12 17 414 403 884 2.45e-13 73.6
MsG0280008248.01.T01 AT1G63630 23.913 230 164 5 198 419 25 251 1.26e-14 74.7
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MsG0280008248.01.T01 AT4G20090 22.970 431 286 8 58 476 73 469 1.31e-14 77.0
MsG0280008248.01.T01 AT4G20090 21.709 433 304 13 25 432 181 603 5.96e-14 75.1
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MsG0280008248.01.T01 AT2G35130 22.778 360 256 8 94 438 152 504 1.21e-12 70.9
MsG0280008248.01.T01 AT2G35130 27.632 228 146 6 35 246 332 556 1.95e-12 70.1
MsG0280008248.01.T01 AT2G35130 22.689 238 175 3 14 243 282 518 3.71e-11 66.2
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MsG0280008248.01.T01 AT1G22960 23.398 359 256 8 85 428 362 716 1.43e-14 77.0
MsG0280008248.01.T01 AT1G22960 23.571 280 190 6 68 329 411 684 3.27e-13 72.8
MsG0280008248.01.T01 AT1G22960 20.213 470 350 11 18 470 225 686 5.51e-13 72.0
MsG0280008248.01.T01 AT5G61400 20.588 408 263 11 18 411 256 616 1.74e-14 76.6
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MsG0280008248.01.T01 AT2G26790 23.625 491 323 21 7 470 192 657 1.28e-13 74.3
MsG0280008248.01.T01 AT2G26790 24.843 318 221 8 103 411 359 667 2.29e-14 76.6
MsG0280008248.01.T01 AT2G26790 23.625 491 323 21 7 470 192 657 1.28e-13 74.3
MsG0280008248.01.T01 AT5G46100 25.292 257 173 8 217 457 104 357 4.21e-14 75.1
MsG0280008248.01.T01 AT5G46100 22.819 298 213 8 116 399 140 434 8.43e-11 64.7
MsG0280008248.01.T01 AT1G55890 24.268 239 167 7 170 398 111 345 4.41e-14 74.7
MsG0280008248.01.T01 AT4G16390 22.876 306 188 6 175 434 182 485 4.75e-14 75.5
MsG0280008248.01.T01 AT3G09060 20.290 414 281 7 18 385 136 546 5.39e-14 75.1
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MsG0280008248.01.T01 AT3G09060 20.423 284 215 4 126 401 177 457 6.31e-12 68.6
MsG0280008248.01.T01 AT3G09060 25.651 269 180 9 204 455 83 348 3.27e-11 66.2
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MsG0280008248.01.T01 AT3G09060 21.563 371 229 8 102 419 83 444 5.78e-14 75.1
MsG0280008248.01.T01 AT3G09060 20.423 284 215 4 126 401 177 457 6.31e-12 68.6
MsG0280008248.01.T01 AT3G09060 25.651 269 180 9 204 455 83 348 3.27e-11 66.2
MsG0280008248.01.T01 AT3G06430 22.523 333 210 7 115 402 106 435 9.25e-14 73.9
MsG0280008248.01.T01 AT2G19280 25.368 272 188 6 85 344 392 660 1.40e-13 73.9
MsG0280008248.01.T01 AT2G19280 21.321 333 243 7 96 416 305 630 7.31e-13 71.6
MsG0280008248.01.T01 AT2G19280 25.368 272 188 6 85 344 392 660 1.40e-13 73.9
MsG0280008248.01.T01 AT2G19280 21.321 333 243 7 96 416 305 630 7.31e-13 71.6
MsG0280008248.01.T01 AT2G19280 25.368 272 188 6 85 344 392 660 1.40e-13 73.9
MsG0280008248.01.T01 AT2G19280 21.321 333 243 7 96 416 305 630 7.31e-13 71.6
MsG0280008248.01.T01 AT2G19280 25.368 272 188 6 85 344 392 660 1.40e-13 73.9
MsG0280008248.01.T01 AT2G19280 21.321 333 243 7 96 416 305 630 7.31e-13 71.6
MsG0280008248.01.T01 AT2G17670 22.378 286 198 7 127 397 153 429 2.11e-13 72.8
MsG0280008248.01.T01 AT4G39620 23.460 341 226 12 115 433 115 442 2.91e-13 72.4
MsG0280008248.01.T01 AT5G46580 25.105 239 142 4 198 399 220 458 3.00e-13 72.8
MsG0280008248.01.T01 AT5G08310 21.003 319 221 9 65 363 438 745 3.01e-13 73.2
MsG0280008248.01.T01 AT5G08310 25.446 224 156 5 200 415 475 695 1.31e-11 67.8
MsG0280008248.01.T01 AT5G08310 21.003 319 221 9 65 363 438 745 3.01e-13 73.2
MsG0280008248.01.T01 AT5G08310 25.446 224 156 5 200 415 475 695 1.31e-11 67.8
MsG0280008248.01.T01 AT4G39620 23.460 341 226 12 115 433 115 442 4.04e-13 72.4
MsG0280008248.01.T01 AT1G10910 23.448 290 208 7 84 363 153 438 6.11e-13 71.6

Find 128 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 186 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GTTATTAGGTATTAAGTTTA+AGG 0.156888 2:+27986636 None:intergenic
AGTATTGGGGCTCTGGATTT+GGG 0.168580 2:-27985190 MsG0280008248.01.T01:CDS
CAGTATTGGGGCTCTGGATT+TGG 0.204148 2:-27985191 MsG0280008248.01.T01:CDS
GATATGATGAGCACATTATT+TGG 0.214712 2:-27984845 MsG0280008248.01.T01:CDS
GCGGTCAGGGTAACTTTATT+TGG 0.234335 2:+27985232 None:intergenic
TGTCTGCATGTGCCAGTATT+GGG 0.254841 2:-27985204 MsG0280008248.01.T01:CDS
CATCGCGTGCGCAAGTTTAG+AGG 0.264474 2:-27986593 MsG0280008248.01.T01:CDS
GGTAGGTTGAGGGAGGAGTC+AGG 0.268315 2:-27986346 MsG0280008248.01.T01:CDS
GAGTTGGATCCTTCAAATTC+TGG 0.276194 2:-27984629 MsG0280008248.01.T01:CDS
CTTGGTGCGTGTGGGGAGTT+GGG 0.278549 2:-27986289 MsG0280008248.01.T01:CDS
TCGTGGAATTCGTTGTTGTC+TGG 0.298190 2:-27986412 MsG0280008248.01.T01:CDS
CATTACAGATATGCTCAAAA+TGG 0.298586 2:-27985310 MsG0280008248.01.T01:intron
ATGAGTTTGGTGAGTGTTCT+TGG 0.300986 2:-27986307 MsG0280008248.01.T01:CDS
TCTTGGTGCGTGTGGGGAGT+TGG 0.301154 2:-27986290 MsG0280008248.01.T01:CDS
TACTTTAGATGTGGTGAAAA+TGG 0.304321 2:-27986481 MsG0280008248.01.T01:CDS
GGGATTTGGAATTGGGGAGG+TGG 0.322507 2:-27986267 MsG0280008248.01.T01:CDS
AACGGAAAAGTGAAGTTATT+AGG 0.347302 2:+27986622 None:intergenic
AGTTTAAGGCTTTCATTTGA+TGG 0.348371 2:+27986650 None:intergenic
GCTTGGTTGATGAGGGATAT+AGG 0.354732 2:-27984874 MsG0280008248.01.T01:CDS
TGCTTGTGTGCATGCAGGCT+TGG 0.362994 2:-27984891 MsG0280008248.01.T01:CDS
AATTGAGCATTACTCTTGTA+TGG 0.366839 2:-27984810 MsG0280008248.01.T01:CDS
ATGAAGGTTAATTCGTATAT+CGG 0.371015 2:-27986217 MsG0280008248.01.T01:CDS
CTTTCTGCTTGTGTGCATGC+AGG 0.373275 2:-27984896 MsG0280008248.01.T01:CDS
CTGTCTGCATGTGCCAGTAT+TGG 0.374496 2:-27985205 MsG0280008248.01.T01:CDS
GCTCTATGAAGAGCTCAAAA+AGG 0.375708 2:-27984405 MsG0280008248.01.T01:CDS
TCATCATACGGTGAATTCTA+TGG 0.377345 2:-27986512 MsG0280008248.01.T01:CDS
GGATTTGGAATTGGGGAGGT+GGG 0.383680 2:-27986266 MsG0280008248.01.T01:CDS
TTTGGAATTGGGGAGGTGGG+TGG 0.386285 2:-27986263 MsG0280008248.01.T01:CDS
AGGGAGGCGGTGGAGGTGTT+TGG 0.387994 2:-27986367 MsG0280008248.01.T01:CDS
TGAAATTACTGAGAAGGATT+TGG 0.388976 2:-27986437 MsG0280008248.01.T01:CDS
GCACCTAATGTAACGTTGTC+TGG 0.389190 2:+27984719 None:intergenic
CAAATCCAGAGCCCCAATAC+TGG 0.390724 2:+27985192 None:intergenic
GTGAGTTGGTTTCGGCTAGA+AGG 0.407049 2:-27986162 MsG0280008248.01.T01:CDS
GTATGCCAAGTGTGGAAGTT+TGG 0.407314 2:-27985092 MsG0280008248.01.T01:CDS
TGGAGGTGTTTGGTAGGTTG+AGG 0.408542 2:-27986357 MsG0280008248.01.T01:CDS
GTTGTCTGGGTATGCGAAGA+TGG 0.412439 2:-27986398 MsG0280008248.01.T01:CDS
GGAGGTGTTTGGTAGGTTGA+GGG 0.421689 2:-27986356 MsG0280008248.01.T01:CDS
GTAGGTTGAGGGAGGAGTCA+GGG 0.422598 2:-27986345 MsG0280008248.01.T01:CDS
AAACCAGACAACGTTACATT+AGG 0.425374 2:-27984722 MsG0280008248.01.T01:CDS
CGTGGAATTCGTTGTTGTCT+GGG 0.427639 2:-27986411 MsG0280008248.01.T01:CDS
AAACCTCGCAATGAGCCAAC+CGG 0.428114 2:+27986557 None:intergenic
GAATTGGGGAGGTGGGTGGA+AGG 0.428904 2:-27986259 MsG0280008248.01.T01:CDS
GATACAAATGTTATATCATT+CGG 0.435734 2:+27984923 None:intergenic
ATACAAATGTTATATCATTC+GGG 0.436307 2:+27984924 None:intergenic
TCGGCTAGAAGGATATTTGA+TGG 0.442678 2:-27986151 MsG0280008248.01.T01:CDS
AAACAGTGATAGTGCTTCCT+TGG 0.449560 2:+27984979 None:intergenic
CTAAAACTCCTGGTTGTAGC+TGG 0.449864 2:-27984514 MsG0280008248.01.T01:CDS
TCAGCCGGATGAGATGAGTT+TGG 0.450830 2:-27986320 MsG0280008248.01.T01:CDS
ATCTTTATTTCATCGTATGA+AGG 0.451637 2:-27985269 MsG0280008248.01.T01:CDS
AGAGCATTGATGAGAGAGAA+GGG 0.457526 2:-27984542 MsG0280008248.01.T01:CDS
GGTGTTTGGTAGGTTGAGGG+AGG 0.458847 2:-27986353 MsG0280008248.01.T01:CDS
AATTGGGGAGGTGGGTGGAA+GGG 0.462382 2:-27986258 MsG0280008248.01.T01:CDS
AGGCTTTCATTTGATGGTAA+AGG 0.466187 2:+27986656 None:intergenic
TAAGTGTGGTGAGTTGGTTT+CGG 0.471998 2:-27986170 MsG0280008248.01.T01:CDS
ATATAGTTTCCAGAATTTGA+AGG 0.473259 2:+27984620 None:intergenic
ATGTGCCAGTATTGGGGCTC+TGG 0.475263 2:-27985197 MsG0280008248.01.T01:CDS
CGGTCATCTATACGAAGCTT+GGG 0.477459 2:-27984768 MsG0280008248.01.T01:CDS
CCGGTCATCTATACGAAGCT+TGG 0.478968 2:-27984769 MsG0280008248.01.T01:CDS
GATGAGCACATTATTTGGAT+TGG 0.479245 2:-27984840 MsG0280008248.01.T01:CDS
ATCTCTGCTCTTGCTTCTCA+TGG 0.480196 2:-27985007 MsG0280008248.01.T01:CDS
TTGGTGCGTGTGGGGAGTTG+GGG 0.482737 2:-27986288 MsG0280008248.01.T01:CDS
ATGCAGACAGAACTGCGGTC+AGG 0.486629 2:+27985218 None:intergenic
CAACTGCGTGAATTTCTCTC+TGG 0.496099 2:-27984476 MsG0280008248.01.T01:CDS
CGTGAATTTCTCTCTGGTGA+TGG 0.499349 2:-27984470 MsG0280008248.01.T01:CDS
TATACAGATGCTACTAGAGT+TGG 0.501348 2:-27984645 MsG0280008248.01.T01:CDS
GAGAGCATTGATGAGAGAGA+AGG 0.503998 2:-27984543 MsG0280008248.01.T01:CDS
TGTTGTGGAGCGTGGTATGA+AGG 0.505837 2:-27986233 MsG0280008248.01.T01:CDS
TATATGAAAATTTGAACATG+TGG 0.507184 2:-27984583 MsG0280008248.01.T01:CDS
TCATTTGATGGTAAAGGTGA+AGG 0.511905 2:+27986662 None:intergenic
GTAGTCATGCCATGTGGTAG+TGG 0.512307 2:+27986693 None:intergenic
GAAGGGTTTGTTGTGGAGCG+TGG 0.514676 2:-27986241 MsG0280008248.01.T01:CDS
GTTTGATGAAATTACTGAGA+AGG 0.518726 2:-27986443 MsG0280008248.01.T01:CDS
CTCACCAAACTCATCTCATC+CGG 0.520802 2:+27986316 None:intergenic
TGGTGCGTGTGGGGAGTTGG+GGG 0.521836 2:-27986287 MsG0280008248.01.T01:CDS
GGCCCGGTTGGCTCATTGCG+AGG 0.524689 2:-27986560 MsG0280008248.01.T01:CDS
GTGAGTGTTCTTGGTGCGTG+TGG 0.530199 2:-27986298 MsG0280008248.01.T01:CDS
TTGTCTGGGTATGCGAAGAT+GGG 0.531478 2:-27986397 MsG0280008248.01.T01:CDS
GGTAAAGGTGAAGGGTGAGA+GGG 0.533995 2:+27986671 None:intergenic
GTGGGTGGAAGGGTTTGTTG+TGG 0.538209 2:-27986248 MsG0280008248.01.T01:CDS
TGAGTGTTCTTGGTGCGTGT+GGG 0.538583 2:-27986297 MsG0280008248.01.T01:CDS
TAGAGGAAATTCGAGTGGCC+CGG 0.539076 2:-27986576 MsG0280008248.01.T01:CDS
AGGCGGTGGAGGTGTTTGGT+AGG 0.540751 2:-27986363 MsG0280008248.01.T01:CDS
CATTTGATGGTAAAGGTGAA+GGG 0.541279 2:+27986663 None:intergenic
GTATTGGGGCTCTGGATTTG+GGG 0.545929 2:-27985189 MsG0280008248.01.T01:CDS
GCATGCAGGCTTGGTTGATG+AGG 0.547799 2:-27984882 MsG0280008248.01.T01:CDS
AACCTCGCAATGAGCCAACC+GGG 0.550078 2:+27986558 None:intergenic
AAGGGTGTCACTAAAACTCC+TGG 0.554309 2:-27984524 MsG0280008248.01.T01:CDS
GTATAGTAAGTGTGGTGAGT+TGG 0.554931 2:-27986176 MsG0280008248.01.T01:CDS
CAGATATGCTCAAAATGGAA+TGG 0.559570 2:-27985305 MsG0280008248.01.T01:CDS
GTCTGCATGTGCCAGTATTG+GGG 0.561675 2:-27985203 MsG0280008248.01.T01:CDS
GGAGGAGTCAGGGTTTCAGC+CGG 0.565546 2:-27986335 MsG0280008248.01.T01:CDS
ACTCTCCAAACTTCCACACT+TGG 0.565622 2:+27985087 None:intergenic
TCTGGATTTGGGGAAACAGA+TGG 0.566561 2:-27985179 MsG0280008248.01.T01:CDS
TGGTAAAGGTGAAGGGTGAG+AGG 0.569649 2:+27986670 None:intergenic
GCGCACGCGATGAAAACAAA+CGG 0.570857 2:+27986604 None:intergenic
CCAAGCTTCGTATAGATGAC+CGG 0.577098 2:+27984769 None:intergenic
TGCAGACAGAACTGCGGTCA+GGG 0.578167 2:+27985219 None:intergenic
TTTCATCGTATGAAGGAGAG+TGG 0.584644 2:-27985262 MsG0280008248.01.T01:CDS
GGTTGTAGCTGGATTGAAGT+TGG 0.585090 2:-27984503 MsG0280008248.01.T01:CDS
GATGAATATGCAACACAAAG+AGG 0.586432 2:-27985157 MsG0280008248.01.T01:CDS
TGAAAATGGAGTTGCGCGTA+AGG 0.590293 2:-27986467 MsG0280008248.01.T01:CDS
AAATGTTATATCATTCGGGC+GGG 0.593523 2:+27984928 None:intergenic
GGAAATTCGAGTGGCCCGGT+TGG 0.595494 2:-27986572 MsG0280008248.01.T01:CDS
TGCTTCTCATGGTAAAGCCA+AGG 0.597006 2:-27984996 MsG0280008248.01.T01:CDS
GCCATGTGGTAGTGGTGGCA+CGG 0.598962 2:+27986701 None:intergenic
ACGTATATCTATAGAGTCGA+GGG 0.599308 2:+27984442 None:intergenic
CTGAGAAGGATTTGGTGTCG+TGG 0.599787 2:-27986429 MsG0280008248.01.T01:CDS
GTCATGCCATGTGGTAGTGG+TGG 0.599807 2:+27986696 None:intergenic
GTTGGATAATGATCATCATA+CGG 0.604167 2:-27986524 MsG0280008248.01.T01:CDS
ATTAGTATGTATAGTAAGTG+TGG 0.605117 2:-27986184 MsG0280008248.01.T01:CDS
CTTTACATAGTGCATGTCAA+AGG 0.605307 2:-27984697 MsG0280008248.01.T01:CDS
ATATGAAAATTTGAACATGT+GGG 0.605370 2:-27984582 MsG0280008248.01.T01:CDS
ACTTCAATCCAGCTACAACC+AGG 0.610160 2:+27984506 None:intergenic
TACGTATATCTATAGAGTCG+AGG 0.613813 2:+27984441 None:intergenic
CATGCAGGCTTGGTTGATGA+GGG 0.621857 2:-27984881 MsG0280008248.01.T01:CDS
CAAGTGATAAAATCTCTACT+CGG 0.621983 2:+27986124 None:intergenic
GAGTGTTCTTGGTGCGTGTG+GGG 0.624387 2:-27986296 MsG0280008248.01.T01:CDS
GTTTGAGCGCATGTCAGATG+AGG 0.625334 2:-27984960 MsG0280008248.01.T01:CDS
ATCGACATGTATGCCAAGTG+TGG 0.645290 2:-27985100 MsG0280008248.01.T01:CDS
AAGTTTAGAGGAAATTCGAG+TGG 0.656518 2:-27986581 MsG0280008248.01.T01:CDS
GTTACGATGTACTTTAGATG+TGG 0.657403 2:-27986490 MsG0280008248.01.T01:CDS
CAAATGTTATATCATTCGGG+CGG 0.668026 2:+27984927 None:intergenic
TCCGTGCCACCACTACCACA+TGG 0.671641 2:-27986702 MsG0280008248.01.T01:CDS
TTTGAGCGCATGTCAGATGA+GGG 0.678480 2:-27984959 MsG0280008248.01.T01:CDS
GAGCGCATGTCAGATGAGGG+TGG 0.703294 2:-27984956 MsG0280008248.01.T01:CDS
ACATGTGGGATGATGCAGCA+AGG 0.714361 2:-27984568 MsG0280008248.01.T01:CDS
GAGAGGGTAGTCATGCCATG+TGG 0.727176 2:+27986687 None:intergenic
GGCACATGCAGACAGAACTG+CGG 0.742158 2:+27985213 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATATAGTATTTACATATATA+TGG - Chr2:27985614-27985633 MsG0280008248.01.T01:intron 10.0%
!!! ATCAAATTAATTACTTATTT+TGG - Chr2:27985123-27985142 MsG0280008248.01.T01:CDS 10.0%
!! GTTTATAAAATTGAAACTAT+TGG + Chr2:27985486-27985505 None:intergenic 15.0%
!! TATGTAAATACTATATACAA+TGG + Chr2:27985610-27985629 None:intergenic 15.0%
!! AACAATATGAAAATGAACAA+AGG + Chr2:27985675-27985694 None:intergenic 20.0%
!! ATACAAATGTTATATCATTC+GGG + Chr2:27986161-27986180 None:intergenic 20.0%
!! ATATGAAAATTTGAACATGT+GGG - Chr2:27986500-27986519 MsG0280008248.01.T01:CDS 20.0%
!! CATATATATGGATATGTATA+TGG - Chr2:27985626-27985645 MsG0280008248.01.T01:intron 20.0%
!! GATACAAATGTTATATCATT+CGG + Chr2:27986162-27986181 None:intergenic 20.0%
!! GATCAAATAAATCTACTTTA+AGG + Chr2:27985106-27985125 None:intergenic 20.0%
!! GTTATTAGGTATTAAGTTTA+AGG + Chr2:27984449-27984468 None:intergenic 20.0%
!! TATATGAAAATTTGAACATG+TGG - Chr2:27986499-27986518 MsG0280008248.01.T01:CDS 20.0%
!! TATGTGACTTTATCTTAAAT+TGG - Chr2:27985699-27985718 MsG0280008248.01.T01:intron 20.0%
!! TTAAAAAAACTTGAGATTGT+AGG + Chr2:27985729-27985748 None:intergenic 20.0%
!! TTAGGTATAACTTATATTTC+AGG - Chr2:27985161-27985180 MsG0280008248.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAATTACTTATTTTGGACTT+GGG - Chr2:27985130-27985149 MsG0280008248.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTAATTACTTATTTTGGACT+TGG - Chr2:27985129-27985148 MsG0280008248.01.T01:CDS 20.0%
! ACAGAATACAGTAATTAACT+TGG + Chr2:27985572-27985591 None:intergenic 25.0%
! AGGAAGAAAAATGTAGATAT+AGG - Chr2:27986405-27986424 MsG0280008248.01.T01:CDS 25.0%
! ATATAGTTTCCAGAATTTGA+AGG + Chr2:27986465-27986484 None:intergenic 25.0%
! ATGAAGGTTAATTCGTATAT+CGG - Chr2:27984865-27984884 MsG0280008248.01.T01:CDS 25.0%
! ATTACTTACGTTATCTTCTA+AGG + Chr2:27985299-27985318 None:intergenic 25.0%
! ATTAGTATGTATAGTAAGTG+TGG - Chr2:27984898-27984917 MsG0280008248.01.T01:CDS 25.0%
! TACGTAGTAAATTTGCAATT+TGG + Chr2:27985526-27985545 None:intergenic 25.0%
! TTTATATGATTTCTCCTCAA+CGG + Chr2:27985327-27985346 None:intergenic 25.0%
!! ATCTTTATTTCATCGTATGA+AGG - Chr2:27985813-27985832 MsG0280008248.01.T01:intron 25.0%
!! ATTATGTTTGTCCTTTGTTT+AGG - Chr2:27985059-27985078 MsG0280008248.01.T01:CDS 25.0%
!! TTATGTTTGTCCTTTGTTTA+GGG - Chr2:27985060-27985079 MsG0280008248.01.T01:CDS 25.0%
!!! AATTACTTATTTTGGACTTG+GGG - Chr2:27985131-27985150 MsG0280008248.01.T01:CDS 25.0%
AACGGAAAAGTGAAGTTATT+AGG + Chr2:27984463-27984482 None:intergenic 30.0%
AATTGAGCATTACTCTTGTA+TGG - Chr2:27986272-27986291 MsG0280008248.01.T01:CDS 30.0%
ATATGAGCAACACACTTTAT+AGG + Chr2:27985380-27985399 None:intergenic 30.0%
ATCTACTGAAGTCAAAATGT+AGG + Chr2:27985417-27985436 None:intergenic 30.0%
ATGGTTGAATAGAAATCACA+TGG - Chr2:27985232-27985251 MsG0280008248.01.T01:CDS 30.0%
CAAGTGATAAAATCTCTACT+CGG + Chr2:27984961-27984980 None:intergenic 30.0%
CATTACAGATATGCTCAAAA+TGG - Chr2:27985772-27985791 MsG0280008248.01.T01:intron 30.0%
CTATTGGAAGAAATATCAGA+TGG + Chr2:27985470-27985489 None:intergenic 30.0%
GATATGATGAGCACATTATT+TGG - Chr2:27986237-27986256 MsG0280008248.01.T01:CDS 30.0%
GTTGGATAATGATCATCATA+CGG - Chr2:27984558-27984577 MsG0280008248.01.T01:CDS 30.0%
GTTTGATGAAATTACTGAGA+AGG - Chr2:27984639-27984658 MsG0280008248.01.T01:CDS 30.0%
TACTTTAGATGTGGTGAAAA+TGG - Chr2:27984601-27984620 MsG0280008248.01.T01:CDS 30.0%
TATGGATATGTATATGGAGT+TGG - Chr2:27985632-27985651 MsG0280008248.01.T01:intron 30.0%
TGAAATTACTGAGAAGGATT+TGG - Chr2:27984645-27984664 MsG0280008248.01.T01:CDS 30.0%
TTTATAAACGCAGTGAATCT+GGG - Chr2:27985497-27985516 MsG0280008248.01.T01:intron 30.0%
! AGTTTAAGGCTTTCATTTGA+TGG + Chr2:27984435-27984454 None:intergenic 30.0%
! ATTGCGAGGTTTTTAAACTT+GGG - Chr2:27984536-27984555 MsG0280008248.01.T01:CDS 30.0%
! CAAGAGTAATGCTCAATTTT+TGG + Chr2:27986270-27986289 None:intergenic 30.0%
! TTTTATAAACGCAGTGAATC+TGG - Chr2:27985496-27985515 MsG0280008248.01.T01:intron 30.0%
!!! ATTACTTATTTTGGACTTGG+GGG - Chr2:27985132-27985151 MsG0280008248.01.T01:CDS 30.0%
!!! TCCATGAAGCATCATTTTTT+CGG + Chr2:27986047-27986066 None:intergenic 30.0%
AAACCAGACAACGTTACATT+AGG - Chr2:27986360-27986379 MsG0280008248.01.T01:CDS 35.0%
AAATGTTATATCATTCGGGC+GGG + Chr2:27986157-27986176 None:intergenic 35.0%
AAGTTTAGAGGAAATTCGAG+TGG - Chr2:27984501-27984520 MsG0280008248.01.T01:CDS 35.0%
ACGTATATCTATAGAGTCGA+GGG + Chr2:27986643-27986662 None:intergenic 35.0%
ATGAAGAGCTCAAAAAGGAA+GGG - Chr2:27986682-27986701 MsG0280008248.01.T01:CDS 35.0%
CAAATGTTATATCATTCGGG+CGG + Chr2:27986158-27986177 None:intergenic 35.0%
CAGATATGCTCAAAATGGAA+TGG - Chr2:27985777-27985796 MsG0280008248.01.T01:intron 35.0%
CTTTACATAGTGCATGTCAA+AGG - Chr2:27986385-27986404 MsG0280008248.01.T01:CDS 35.0%
GATGAATATGCAACACAAAG+AGG - Chr2:27985925-27985944 MsG0280008248.01.T01:intron 35.0%
GATGAGCACATTATTTGGAT+TGG - Chr2:27986242-27986261 MsG0280008248.01.T01:CDS 35.0%
GTTACGATGTACTTTAGATG+TGG - Chr2:27984592-27984611 MsG0280008248.01.T01:CDS 35.0%
TAACTCTCATCCCTAAACAA+AGG + Chr2:27985073-27985092 None:intergenic 35.0%
TACGTATATCTATAGAGTCG+AGG + Chr2:27986644-27986663 None:intergenic 35.0%
TATACAGATGCTACTAGAGT+TGG - Chr2:27986437-27986456 MsG0280008248.01.T01:CDS 35.0%
TATGAAGAGCTCAAAAAGGA+AGG - Chr2:27986681-27986700 MsG0280008248.01.T01:CDS 35.0%
TCATCATACGGTGAATTCTA+TGG - Chr2:27984570-27984589 MsG0280008248.01.T01:CDS 35.0%
! AGGCTTTCATTTGATGGTAA+AGG + Chr2:27984429-27984448 None:intergenic 35.0%
! CATTGCGAGGTTTTTAAACT+TGG - Chr2:27984535-27984554 MsG0280008248.01.T01:CDS 35.0%
! CATTTGATGGTAAAGGTGAA+GGG + Chr2:27984422-27984441 None:intergenic 35.0%
! CGAGTAGAGATTTTATCACT+TGG - Chr2:27984959-27984978 MsG0280008248.01.T01:CDS 35.0%
! TCATTTGATGGTAAAGGTGA+AGG + Chr2:27984423-27984442 None:intergenic 35.0%
!!! CATGAAGCATCATTTTTTCG+GGG + Chr2:27986045-27986064 None:intergenic 35.0%
!!! CATTTTGACTTCAGTAGATC+AGG - Chr2:27985418-27985437 MsG0280008248.01.T01:intron 35.0%
!!! CCATGAAGCATCATTTTTTC+GGG + Chr2:27986046-27986065 None:intergenic 35.0%
CCCGAAAAAATGATGCTTCA+TGG - Chr2:27986043-27986062 MsG0280008248.01.T01:intron 40.0%
GAGTTGGATCCTTCAAATTC+TGG - Chr2:27986453-27986472 MsG0280008248.01.T01:CDS 40.0%
GCTCTATGAAGAGCTCAAAA+AGG - Chr2:27986677-27986696 MsG0280008248.01.T01:CDS 40.0%
GTAAGTAATCTCAACCGTTG+AGG - Chr2:27985310-27985329 MsG0280008248.01.T01:intron 40.0%
GTATAGTAAGTGTGGTGAGT+TGG - Chr2:27984906-27984925 MsG0280008248.01.T01:CDS 40.0%
TCACACAAAATCATTGCACG+TGG - Chr2:27985200-27985219 MsG0280008248.01.T01:CDS 40.0%
TCGGCTAGAAGGATATTTGA+TGG - Chr2:27984931-27984950 MsG0280008248.01.T01:CDS 40.0%
TTTCATCGTATGAAGGAGAG+TGG - Chr2:27985820-27985839 MsG0280008248.01.T01:intron 40.0%
! AAACAGTGATAGTGCTTCCT+TGG + Chr2:27986106-27986125 None:intergenic 40.0%
! ATGAGTTTGGTGAGTGTTCT+TGG - Chr2:27984775-27984794 MsG0280008248.01.T01:CDS 40.0%
! CGAGGTTTTTAAACTTGGGT+TGG - Chr2:27984540-27984559 MsG0280008248.01.T01:CDS 40.0%
!! AGAGCATTGATGAGAGAGAA+GGG - Chr2:27986540-27986559 MsG0280008248.01.T01:CDS 40.0%
!! TAAGTGTGGTGAGTTGGTTT+CGG - Chr2:27984912-27984931 MsG0280008248.01.T01:CDS 40.0%
!!! GTAACGTTGTCTGGTTTTTC+AGG + Chr2:27986357-27986376 None:intergenic 40.0%
ACTCTCCAAACTTCCACACT+TGG + Chr2:27985998-27986017 None:intergenic 45.0%
ACTTCAATCCAGCTACAACC+AGG + Chr2:27986579-27986598 None:intergenic 45.0%
ATCGACATGTATGCCAAGTG+TGG - Chr2:27985982-27986001 MsG0280008248.01.T01:intron 45.0%
ATCTCTGCTCTTGCTTCTCA+TGG - Chr2:27986075-27986094 MsG0280008248.01.T01:intron 45.0%
CAACTGCGTGAATTTCTCTC+TGG - Chr2:27986606-27986625 MsG0280008248.01.T01:CDS 45.0%
CCAAGCTTCGTATAGATGAC+CGG + Chr2:27986316-27986335 None:intergenic 45.0%
CGGTCATCTATACGAAGCTT+GGG - Chr2:27986314-27986333 MsG0280008248.01.T01:CDS 45.0%
CGTGAATTTCTCTCTGGTGA+TGG - Chr2:27986612-27986631 MsG0280008248.01.T01:CDS 45.0%
CGTGGAATTCGTTGTTGTCT+GGG - Chr2:27984671-27984690 MsG0280008248.01.T01:CDS 45.0%
CTAAAACTCCTGGTTGTAGC+TGG - Chr2:27986568-27986587 MsG0280008248.01.T01:CDS 45.0%
CTCACCAAACTCATCTCATC+CGG + Chr2:27984769-27984788 None:intergenic 45.0%
GCACCTAATGTAACGTTGTC+TGG + Chr2:27986366-27986385 None:intergenic 45.0%
GCGGTCAGGGTAACTTTATT+TGG + Chr2:27985853-27985872 None:intergenic 45.0%
GGTTGTAGCTGGATTGAAGT+TGG - Chr2:27986579-27986598 MsG0280008248.01.T01:CDS 45.0%
GTATGCCAAGTGTGGAAGTT+TGG - Chr2:27985990-27986009 MsG0280008248.01.T01:intron 45.0%
TCGTGGAATTCGTTGTTGTC+TGG - Chr2:27984670-27984689 MsG0280008248.01.T01:CDS 45.0%
TCTGGATTTGGGGAAACAGA+TGG - Chr2:27985903-27985922 MsG0280008248.01.T01:intron 45.0%
TGAAAATGGAGTTGCGCGTA+AGG - Chr2:27984615-27984634 MsG0280008248.01.T01:CDS 45.0%
TGCTTCTCATGGTAAAGCCA+AGG - Chr2:27986086-27986105 MsG0280008248.01.T01:intron 45.0%
TGTCTGCATGTGCCAGTATT+GGG - Chr2:27985878-27985897 MsG0280008248.01.T01:intron 45.0%
TTGCACGTGGTTCGTTTAGA+TGG - Chr2:27985213-27985232 MsG0280008248.01.T01:CDS 45.0%
TTGTCTGGGTATGCGAAGAT+GGG - Chr2:27984685-27984704 MsG0280008248.01.T01:CDS 45.0%
TTTGAGCGCATGTCAGATGA+GGG - Chr2:27986123-27986142 MsG0280008248.01.T01:CDS 45.0%
! AGTTGGGGGATTTGGAATTG+GGG - Chr2:27984809-27984828 MsG0280008248.01.T01:CDS 45.0%
! GAGTTGGGGGATTTGGAATT+GGG - Chr2:27984808-27984827 MsG0280008248.01.T01:CDS 45.0%
!! AAGGGTGTCACTAAAACTCC+TGG - Chr2:27986558-27986577 MsG0280008248.01.T01:CDS 45.0%
!! AGTATTGGGGCTCTGGATTT+GGG - Chr2:27985892-27985911 MsG0280008248.01.T01:intron 45.0%
!! GAGAGCATTGATGAGAGAGA+AGG - Chr2:27986539-27986558 MsG0280008248.01.T01:CDS 45.0%
!! GCTTGGTTGATGAGGGATAT+AGG - Chr2:27986208-27986227 MsG0280008248.01.T01:CDS 45.0%
AAACCTCGCAATGAGCCAAC+CGG + Chr2:27984528-27984547 None:intergenic 50.0%
ACATGTGGGATGATGCAGCA+AGG - Chr2:27986514-27986533 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
CAAATCCAGAGCCCCAATAC+TGG + Chr2:27985893-27985912 None:intergenic 50.0%
CCGGTCATCTATACGAAGCT+TGG - Chr2:27986313-27986332 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
CTGTCTGCATGTGCCAGTAT+TGG - Chr2:27985877-27985896 MsG0280008248.01.T01:intron 50.0%
CTTTCTGCTTGTGTGCATGC+AGG - Chr2:27986186-27986205 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
GCGCACGCGATGAAAACAAA+CGG + Chr2:27984481-27984500 None:intergenic 50.0%
GGTAAAGGTGAAGGGTGAGA+GGG + Chr2:27984414-27984433 None:intergenic 50.0%
GTAGTCATGCCATGTGGTAG+TGG + Chr2:27984392-27984411 None:intergenic 50.0%
GTCTGCATGTGCCAGTATTG+GGG - Chr2:27985879-27985898 MsG0280008248.01.T01:intron 50.0%
GTTGTCTGGGTATGCGAAGA+TGG - Chr2:27984684-27984703 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
GTTTGAGCGCATGTCAGATG+AGG - Chr2:27986122-27986141 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
TAGAGGAAATTCGAGTGGCC+CGG - Chr2:27984506-27984525 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
TCAGCCGGATGAGATGAGTT+TGG - Chr2:27984762-27984781 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
TGGTAAAGGTGAAGGGTGAG+AGG + Chr2:27984415-27984434 None:intergenic 50.0%
TGTTGTGGAGCGTGGTATGA+AGG - Chr2:27984849-27984868 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
! GGAGTTGGGGGATTTGGAAT+TGG - Chr2:27984807-27984826 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
! GGATTTGGAATTGGGGAGGT+GGG - Chr2:27984816-27984835 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
! GTCGATCTTTTGTCACGTGC+CGG - Chr2:27986294-27986313 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
! TGAGTGTTCTTGGTGCGTGT+GGG - Chr2:27984785-27984804 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
!! ATGCGAAGATGGGTTTTGCG+AGG - Chr2:27984695-27984714 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
!! CAGTATTGGGGCTCTGGATT+TGG - Chr2:27985891-27985910 MsG0280008248.01.T01:intron 50.0%
!! CATGCAGGCTTGGTTGATGA+GGG - Chr2:27986201-27986220 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
!! CTGAGAAGGATTTGGTGTCG+TGG - Chr2:27984653-27984672 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
!! GGAGGTGTTTGGTAGGTTGA+GGG - Chr2:27984726-27984745 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
!! GTATTGGGGCTCTGGATTTG+GGG - Chr2:27985893-27985912 MsG0280008248.01.T01:intron 50.0%
!! GTGAGTTGGTTTCGGCTAGA+AGG - Chr2:27984920-27984939 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
!! TGCGAAGATGGGTTTTGCGA+GGG - Chr2:27984696-27984715 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
!! TGGACTTGGGGGACTAGTTT+AGG - Chr2:27985143-27985162 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
!! TGGAGGTGTTTGGTAGGTTG+AGG - Chr2:27984725-27984744 MsG0280008248.01.T01:CDS 50.0%
AACCTCGCAATGAGCCAACC+GGG + Chr2:27984527-27984546 None:intergenic 55.0%
AATTGGGGAGGTGGGTGGAA+GGG - Chr2:27984824-27984843 MsG0280008248.01.T01:CDS 55.0%
ATGCAGACAGAACTGCGGTC+AGG + Chr2:27985867-27985886 None:intergenic 55.0%
CATCGCGTGCGCAAGTTTAG+AGG - Chr2:27984489-27984508 MsG0280008248.01.T01:CDS 55.0%
GAGAGGGTAGTCATGCCATG+TGG + Chr2:27984398-27984417 None:intergenic 55.0%
GGCACATGCAGACAGAACTG+CGG + Chr2:27985872-27985891 None:intergenic 55.0%
TGCAGACAGAACTGCGGTCA+GGG + Chr2:27985866-27985885 None:intergenic 55.0%
TGCTTGTGTGCATGCAGGCT+TGG - Chr2:27986191-27986210 MsG0280008248.01.T01:CDS 55.0%
! ATGTGCCAGTATTGGGGCTC+TGG - Chr2:27985885-27985904 MsG0280008248.01.T01:intron 55.0%
! GAGTGTTCTTGGTGCGTGTG+GGG - Chr2:27984786-27984805 MsG0280008248.01.T01:CDS 55.0%
! GCATGCAGGCTTGGTTGATG+AGG - Chr2:27986200-27986219 MsG0280008248.01.T01:CDS 55.0%
! GGGATTTGGAATTGGGGAGG+TGG - Chr2:27984815-27984834 MsG0280008248.01.T01:CDS 55.0%
! GGTGTTTGGTAGGTTGAGGG+AGG - Chr2:27984729-27984748 MsG0280008248.01.T01:CDS 55.0%
! GTAGGTTGAGGGAGGAGTCA+GGG - Chr2:27984737-27984756 MsG0280008248.01.T01:CDS 55.0%
! GTGAGTGTTCTTGGTGCGTG+TGG - Chr2:27984784-27984803 MsG0280008248.01.T01:CDS 55.0%
! TGGGGGATTTGGAATTGGGG+AGG - Chr2:27984812-27984831 MsG0280008248.01.T01:CDS 55.0%
! TTTGGAATTGGGGAGGTGGG+TGG - Chr2:27984819-27984838 MsG0280008248.01.T01:CDS 55.0%
!! GAAGATGGGTTTTGCGAGGG+AGG - Chr2:27984699-27984718 MsG0280008248.01.T01:CDS 55.0%
!! GAAGGGTTTGTTGTGGAGCG+TGG - Chr2:27984841-27984860 MsG0280008248.01.T01:CDS 55.0%
!! GTCATGCCATGTGGTAGTGG+TGG + Chr2:27984389-27984408 None:intergenic 55.0%
!! GTGGGTGGAAGGGTTTGTTG+TGG - Chr2:27984834-27984853 MsG0280008248.01.T01:CDS 55.0%
GAATTGGGGAGGTGGGTGGA+AGG - Chr2:27984823-27984842 MsG0280008248.01.T01:CDS 60.0%
GAGCGCATGTCAGATGAGGG+TGG - Chr2:27986126-27986145 MsG0280008248.01.T01:CDS 60.0%
GGAAATTCGAGTGGCCCGGT+TGG - Chr2:27984510-27984529 MsG0280008248.01.T01:CDS 60.0%
GGAGGAGTCAGGGTTTCAGC+CGG - Chr2:27984747-27984766 MsG0280008248.01.T01:CDS 60.0%
GTGTGGGGAGTTGGGGGATT+TGG - Chr2:27984801-27984820 MsG0280008248.01.T01:CDS 60.0%
TCCGTGCCACCACTACCACA+TGG - Chr2:27984380-27984399 MsG0280008248.01.T01:CDS 60.0%
TTGGTGCGTGTGGGGAGTTG+GGG - Chr2:27984794-27984813 MsG0280008248.01.T01:CDS 60.0%
! CTTGGTGCGTGTGGGGAGTT+GGG - Chr2:27984793-27984812 MsG0280008248.01.T01:CDS 60.0%
! GGTAGGTTGAGGGAGGAGTC+AGG - Chr2:27984736-27984755 MsG0280008248.01.T01:CDS 60.0%
! TCTTGGTGCGTGTGGGGAGT+TGG - Chr2:27984792-27984811 MsG0280008248.01.T01:CDS 60.0%
!! AGGCGGTGGAGGTGTTTGGT+AGG - Chr2:27984719-27984738 MsG0280008248.01.T01:CDS 60.0%
!! GATGGGTTTTGCGAGGGAGG+CGG - Chr2:27984702-27984721 MsG0280008248.01.T01:CDS 60.0%
!! GCCATGTGGTAGTGGTGGCA+CGG + Chr2:27984384-27984403 None:intergenic 60.0%
TGGTGCGTGTGGGGAGTTGG+GGG - Chr2:27984795-27984814 MsG0280008248.01.T01:CDS 65.0%
! TTTTGCGAGGGAGGCGGTGG+AGG - Chr2:27984708-27984727 MsG0280008248.01.T01:CDS 65.0%
!! AGGGAGGCGGTGGAGGTGTT+TGG - Chr2:27984715-27984734 MsG0280008248.01.T01:CDS 65.0%
! GGCCCGGTTGGCTCATTGCG+AGG - Chr2:27984522-27984541 MsG0280008248.01.T01:CDS 70.0%
! GGGTTTTGCGAGGGAGGCGG+TGG - Chr2:27984705-27984724 MsG0280008248.01.T01:CDS 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 27984376 27986728 27984376 ID=MsG0280008248.01;Name=MsG0280008248.01
Chr2 mRNA 27984376 27986728 27984376 ID=MsG0280008248.01.T01;Parent=MsG0280008248.01;Name=MsG0280008248.01.T01;_AED=0.25;_eAED=0.25;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|523
Chr2 exon 27986106 27986728 27986106 ID=MsG0280008248.01.T01:exon:14357;Parent=MsG0280008248.01.T01
Chr2 exon 27984376 27985324 27984376 ID=MsG0280008248.01.T01:exon:14356;Parent=MsG0280008248.01.T01
Chr2 CDS 27986106 27986728 27986106 ID=MsG0280008248.01.T01:cds;Parent=MsG0280008248.01.T01
Chr2 CDS 27984376 27985324 27984376 ID=MsG0280008248.01.T01:cds;Parent=MsG0280008248.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280008248.01.T01

ATGCTCCGTGCCACCACTACCACATGGCATGACTACCCTCTCACCCTTCACCTTTACCATCAAATGAAAGCCTTAAACTTAATACCTAATAACTTCACTTTTCCGTTTGTTTTCATCGCGTGCGCAAGTTTAGAGGAAATTCGAGTGGCCCGGTTGGCTCATTGCGAGGTTTTTAAACTTGGGTTGGATAATGATCATCATACGGTGAATTCTATGGTTACGATGTACTTTAGATGTGGTGAAAATGGAGTTGCGCGTAAGGTGTTTGATGAAATTACTGAGAAGGATTTGGTGTCGTGGAATTCGTTGTTGTCTGGGTATGCGAAGATGGGTTTTGCGAGGGAGGCGGTGGAGGTGTTTGGTAGGTTGAGGGAGGAGTCAGGGTTTCAGCCGGATGAGATGAGTTTGGTGAGTGTTCTTGGTGCGTGTGGGGAGTTGGGGGATTTGGAATTGGGGAGGTGGGTGGAAGGGTTTGTTGTGGAGCGTGGTATGAAGGTTAATTCGTATATCGGTTCTGCTTTGATTAGTATGTATAGTAAGTGTGGTGAGTTGGTTTCGGCTAGAAGGATATTTGATGGCATGCCGAGTAGAGATTTTATCACTTGGAATGCAGCTATATCAGCATATGCTCAAAATGGAATGGCAGATGAAGCAATATCTTTATTTCATCGTATGAAGGAGAGTGGTGTTGATCCAAATAAAGTTACCCTGACCGCAGTTCTGTCTGCATGTGCCAGTATTGGGGCTCTGGATTTGGGGAAACAGATGGATGAATATGCAACACAAAGAGGATTACAGCATGATATTTTTGTAGCTACTGCATTGATCGACATGTATGCCAAGTGTGGAAGTTTGGAGAGTGCACAGCGAGTTTTCAACGACATGCCCCGAAAAAATGATGCTTCATGGAATGCAATGATCTCTGCTCTTGCTTCTCATGGTAAAGCCAAGGAAGCACTATCACTGTTTGAGCGCATGTCAGATGAGGGTGGTAGTGCCCGCCCGAATGATATAACATTTGTATCGTTGCTTTCTGCTTGTGTGCATGCAGGCTTGGTTGATGAGGGATATAGGTTGTTTGATATGATGAGCACATTATTTGGATTGGTACCAAAAATTGAGCATTACTCTTGTATGGTCGATCTTTTGTCACGTGCCGGTCATCTATACGAAGCTTGGGATCTCATTGAGAAAATGCCTGAAAAACCAGACAACGTTACATTAGGTGCTTTACATAGTGCATGTCAAAGGAAGAAAAATGTAGATATAGGTGAACGAGTTATACAGATGCTACTAGAGTTGGATCCTTCAAATTCTGGAAACTATATCATCTCATCTAAAATATATGAAAATTTGAACATGTGGGATGATGCAGCAAGGATGAGAGCATTGATGAGAGAGAAGGGTGTCACTAAAACTCCTGGTTGTAGCTGGATTGAAGTTGGTAATCAACTGCGTGAATTTCTCTCTGGTGATGGCTTAACCCTCGACTCTATAGATATACGTAACATAATAGATTTGCTCTATGAAGAGCTCAAAAAGGAAGGGTATGTCCCAAAAATTGTTGAATAG
Protein sequence

>MsG0280008248.01.T01

MLRATTTTWHDYPLTLHLYHQMKALNLIPNNFTFPFVFIACASLEEIRVARLAHCEVFKLGLDNDHHTVNSMVTMYFRCGENGVARKVFDEITEKDLVSWNSLLSGYAKMGFAREAVEVFGRLREESGFQPDEMSLVSVLGACGELGDLELGRWVEGFVVERGMKVNSYIGSALISMYSKCGELVSARRIFDGMPSRDFITWNAAISAYAQNGMADEAISLFHRMKESGVDPNKVTLTAVLSACASIGALDLGKQMDEYATQRGLQHDIFVATALIDMYAKCGSLESAQRVFNDMPRKNDASWNAMISALASHGKAKEALSLFERMSDEGGSARPNDITFVSLLSACVHAGLVDEGYRLFDMMSTLFGLVPKIEHYSCMVDLLSRAGHLYEAWDLIEKMPEKPDNVTLGALHSACQRKKNVDIGERVIQMLLELDPSNSGNYIISSKIYENLNMWDDAARMRALMREKGVTKTPGCSWIEVGNQLREFLSGDGLTLDSIDIRNIIDLLYEELKKEGYVPKIVE*