AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280006897.01

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MsG0280006897.01.T01 AT4G39400 31.250 352 189 10 46 347 395 743 3.16e-25 110
MsG0280006897.01.T01 AT4G39400 30.000 320 171 8 30 324 453 744 6.91e-22 100
MsG0280006897.01.T01 AT4G39400 30.495 364 211 13 26 378 108 440 3.59e-20 94.7
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MsG0280006897.01.T01 AT5G01890 32.645 242 160 3 140 379 70 310 1.48e-25 111
MsG0280006897.01.T01 AT5G01890 30.928 194 129 2 187 377 69 260 9.07e-15 77.8
MsG0280006897.01.T01 AT3G12610 38.342 193 118 1 180 371 104 296 4.67e-36 137
MsG0280006897.01.T01 AT3G12610 30.645 248 169 3 126 371 98 344 1.93e-24 105
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MsG0280006897.01.T01 AT2G01950 33.333 318 208 3 30 343 241 558 5.24e-33 134
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MsG0280006897.01.T01 AT2G01950 29.810 369 230 9 8 352 365 728 4.37e-27 115
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MsG0280006897.01.T01 AT1G62950 28.125 416 239 9 66 430 97 503 2.28e-26 113
MsG0280006897.01.T01 AT1G62950 28.144 334 200 9 24 324 149 475 2.46e-23 104
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MsG0280006897.01.T01 AT1G28440 30.220 364 246 6 31 391 219 577 5.26e-29 121
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MsG0280006897.01.T01 AT1G28440 29.612 206 144 1 174 378 48 253 7.14e-17 84.3
MsG0280006897.01.T01 AT1G28440 30.612 196 131 3 194 385 41 235 7.36e-13 71.6
MsG0280006897.01.T01 AT5G65700 33.036 336 217 7 43 374 192 523 1.84e-33 135
MsG0280006897.01.T01 AT5G65700 29.360 344 240 3 30 371 106 448 7.60e-31 127
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MsG0280006897.01.T01 AT4G04220 33.333 162 107 1 217 377 88 249 1.02e-12 71.2
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MsG0280006897.01.T01 AT3G47090 33.182 220 116 7 28 245 421 611 5.58e-18 87.8
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MsG0280006897.01.T01 AT1G74360 30.034 293 195 6 41 329 206 492 3.44e-25 110
MsG0280006897.01.T01 AT1G74360 28.863 343 202 8 94 409 92 419 2.01e-23 104
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MsG0280006897.01.T01 AT3G20820 29.167 240 162 7 53 288 115 350 1.88e-19 90.1
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MsG0280006897.01.T01 AT3G20820 29.902 204 115 5 26 228 160 336 3.72e-12 68.2
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MsG0280006897.01.T01 AT1G33590 34.483 203 131 2 178 378 128 330 1.14e-22 101
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MsG0280006897.01.T01 AT2G32660 31.269 323 163 10 121 391 119 434 1.90e-20 95.1
MsG0280006897.01.T01 AT2G32660 28.226 248 150 4 31 276 458 679 1.19e-16 83.6
MsG0280006897.01.T01 AT2G32660 30.252 238 136 7 162 371 86 321 6.00e-12 68.6
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MsG0280006897.01.T01 AT2G27060 28.571 252 147 7 128 374 62 285 4.12e-14 75.5
MsG0280006897.01.T01 AT2G27060 30.435 368 225 13 43 392 118 472 6.51e-24 106
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MsG0280006897.01.T01 AT5G66330 34.583 240 141 6 140 371 82 313 1.43e-21 97.1
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MsG0280006897.01.T01 AT5G66330 31.933 238 131 8 43 253 106 339 3.34e-14 74.7
MsG0280006897.01.T01 AT5G66330 30.909 165 107 2 213 371 53 216 6.84e-12 67.8
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MsG0280006897.01.T01 AT5G01950 31.783 258 168 7 93 347 82 334 3.51e-18 88.6
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MsG0280006897.01.T01 AT2G01210 33.537 164 107 2 210 371 88 251 2.20e-11 66.6
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MsG0280006897.01.T01 AT3G02880 33.784 148 94 3 140 286 67 211 1.34e-11 67.4
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MsG0280006897.01.T01 AT3G03770 33.755 237 127 6 43 278 131 338 3.72e-11 66.2
MsG0280006897.01.T01 AT3G03770 28.311 219 128 4 182 375 125 339 2.00e-12 70.1
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MsG0280006897.01.T01 AT3G25560 34.579 107 70 0 198 304 93 199 6.27e-11 65.1
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MsG0280006897.01.T01 AT3G19020 26.556 241 171 5 140 378 122 358 2.44e-12 70.1
MsG0280006897.01.T01 AT3G19020 28.358 201 139 4 26 225 177 373 4.00e-12 69.3
MsG0280006897.01.T01 AT1G60630 35.115 131 83 1 145 275 68 196 2.57e-12 69.7
MsG0280006897.01.T01 AT5G24100 32.308 195 104 4 186 380 72 238 2.93e-12 69.3
MsG0280006897.01.T01 AT1G53730 33.333 186 93 5 140 323 73 229 3.00e-12 69.3
MsG0280006897.01.T01 AT1G53730 34.810 158 97 5 46 202 76 228 4.20e-11 65.9
MsG0280006897.01.T01 AT1G53730 33.333 186 93 5 140 323 73 229 3.34e-12 69.3
MsG0280006897.01.T01 AT1G53730 34.810 158 97 5 46 202 76 228 4.39e-11 65.9
MsG0280006897.01.T01 AT3G08680 33.333 153 94 4 234 385 67 212 3.90e-12 68.9
MsG0280006897.01.T01 AT3G08680 35.417 144 87 3 208 350 65 203 5.11e-12 68.6
MsG0280006897.01.T01 AT3G08680 33.333 153 94 4 234 385 67 212 3.90e-12 68.9
MsG0280006897.01.T01 AT3G08680 35.417 144 87 3 208 350 65 203 5.11e-12 68.6
MsG0280006897.01.T01 AT1G28340 40.909 88 52 0 263 350 426 513 4.22e-12 68.9
MsG0280006897.01.T01 AT2G42290 33.813 139 91 1 187 324 68 206 4.51e-12 68.9
MsG0280006897.01.T01 AT2G42290 32.867 143 95 1 206 347 63 205 8.47e-12 68.2
MsG0280006897.01.T01 AT4G03390 31.053 190 103 4 134 323 70 231 6.07e-12 68.6
MsG0280006897.01.T01 AT4G03390 31.053 190 103 4 134 323 70 231 6.07e-12 68.6
MsG0280006897.01.T01 AT5G45800 31.053 190 119 7 115 298 56 239 6.66e-12 68.2
MsG0280006897.01.T01 AT5G45800 31.053 190 119 7 115 298 56 239 7.71e-12 68.2
MsG0280006897.01.T01 AT1G69990 34.615 156 96 3 174 323 24 179 8.17e-12 67.8
MsG0280006897.01.T01 AT1G69990 37.405 131 78 2 226 355 57 184 2.18e-11 66.6
MsG0280006897.01.T01 AT1G68400 37.241 145 84 3 166 310 94 231 8.52e-12 68.2
MsG0280006897.01.T01 AT1G60800 35.938 128 81 1 255 382 4 130 9.08e-12 67.8
MsG0280006897.01.T01 AT3G28450 37.168 113 70 1 212 323 80 192 1.21e-11 67.4
MsG0280006897.01.T01 AT1G60800 35.938 128 81 1 255 382 71 197 1.25e-11 67.4
MsG0280006897.01.T01 AT3G24660 35.669 157 90 5 222 371 111 263 2.66e-11 66.6
MsG0280006897.01.T01 AT3G19230 36.842 114 68 2 252 365 396 505 4.94e-11 65.5
MsG0280006897.01.T01 AT5G65240 40.952 105 62 0 220 324 74 178 6.03e-11 65.1
MsG0280006897.01.T01 AT5G48380 33.636 110 72 1 119 227 81 190 6.17e-11 65.1
MsG0280006897.01.T01 AT5G65240 40.952 105 62 0 220 324 74 178 7.43e-11 65.1
MsG0280006897.01.T01 AT5G67200 35.878 131 82 1 145 275 79 207 9.75e-11 64.7

Find 85 sgRNAs with CRISPR-Local

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CCTAATTTCCCTTGGCTATT+TGG 0.067056 2:-7735219 MsG0280006897.01.T01:CDS
AACTTTCAAACATGGTTTAT+TGG 0.173746 2:-7735732 MsG0280006897.01.T01:CDS
CAAACTTAACAAGATTAAAT+TGG 0.211219 2:-7735439 MsG0280006897.01.T01:CDS
AAGGATAAAATTCAGTATTA+TGG 0.263727 2:-7734786 MsG0280006897.01.T01:CDS
TAAGAATATATCATTTAAAA+TGG 0.268974 2:-7734865 MsG0280006897.01.T01:CDS
CCAAATAGCCAAGGGAAATT+AGG 0.281947 2:+7735219 None:intergenic
CTTTCTGAAAACAATCTATC+AGG 0.297207 2:-7735194 MsG0280006897.01.T01:CDS
ATTAGGTTGCAAAGCTCATT+TGG 0.298748 2:+7735236 None:intergenic
CCTCAAAACTATTCTTAGAT+AGG 0.301253 2:+7735627 None:intergenic
CTTTCTCATAACAAGCTATC+AGG 0.314326 2:-7735845 MsG0280006897.01.T01:CDS
ACTAGAACATGTCAGAATTA+TGG 0.323601 2:-7734931 MsG0280006897.01.T01:CDS
GTGAATCTTCCAATCCATAT+TGG 0.324548 2:+7735308 None:intergenic
GAAATTGCTTTCTAAATTCA+AGG 0.333949 2:-7735925 MsG0280006897.01.T01:CDS
ATTGGACATATCAAACAATA+TGG 0.335129 2:-7735345 MsG0280006897.01.T01:CDS
CTTGTTAAGTTTGAAAGTAA+TGG 0.346272 2:+7735449 None:intergenic
TCTTGTTATTTGATATTTGT+AGG 0.353744 2:+7735708 None:intergenic
CAGTCTCAATGAGGTCAAAT+TGG 0.368713 2:+7735508 None:intergenic
TCACACACATAGATAGGAAT+TGG 0.388716 2:+7734954 None:intergenic
ATATCAAACAATATGGTATC+AGG 0.395959 2:-7735338 MsG0280006897.01.T01:CDS
TTTCTAAATTCAAGGAGAAA+TGG 0.404710 2:-7735917 MsG0280006897.01.T01:CDS
CTCTCCAGAGAAGTTGTTGT+TGG 0.406936 2:+7735550 None:intergenic
CTGAACAATAACTCCTTTAG+TGG 0.416963 2:-7735410 MsG0280006897.01.T01:CDS
AATGCAAACAATAAGGACTA+TGG 0.418617 2:-7735579 MsG0280006897.01.T01:CDS
AAAATGTGGAAGGTATTTCC+AGG 0.422464 2:+7734714 None:intergenic
AGGTTTACATAATAAAGAAT+TGG 0.424876 2:+7735647 None:intergenic
AATAAACCATGTTTGAAAGT+TGG 0.425793 2:+7735734 None:intergenic
TTGTCCAACAACAACTTCTC+TGG 0.426270 2:-7735554 MsG0280006897.01.T01:CDS
TATCAGGCAGGATTCCAATA+TGG 0.429415 2:-7735322 MsG0280006897.01.T01:CDS
CTGATAGCTTGTTATGAGAA+AGG 0.431713 2:+7735846 None:intergenic
TTAGGTTGCAAAGCTCATTT+GGG 0.438563 2:+7735237 None:intergenic
CTTGAACTTAATGACTGGAT+TGG 0.441645 2:-7734576 MsG0280006897.01.T01:CDS
TTGGTGAAATGCAAACAATA+AGG 0.444851 2:-7735586 MsG0280006897.01.T01:CDS
ATATTCCACAGTGGATCAAC+AGG 0.447218 2:-7735025 MsG0280006897.01.T01:CDS
TATTGTTTGCATTTCACCAA+TGG 0.447552 2:+7735589 None:intergenic
TCTAGTTCACACACATAGAT+AGG 0.454836 2:+7734948 None:intergenic
AGGTCAAATTGGAGATCAAA+TGG 0.455463 2:+7735519 None:intergenic
CTATCTCACAATTGTTTCCA+TGG 0.455505 2:-7735479 MsG0280006897.01.T01:CDS
CTGGCATGGAATAAATTAAC+CGG 0.458545 2:-7734978 MsG0280006897.01.T01:CDS
TTTAGTGGAGTAATTGAAGA+TGG 0.464729 2:-7735395 MsG0280006897.01.T01:CDS
CAAATATCAAATAACAAGAT+TGG 0.465946 2:-7735704 MsG0280006897.01.T01:CDS
CTTGCAAAATAACACAAAGT+TGG 0.471676 2:-7735804 MsG0280006897.01.T01:CDS
GGTCAACTACAAGAGAATAT+AGG 0.477006 2:-7735680 MsG0280006897.01.T01:CDS
CTTTGCAACCTAATTTCCCT+TGG 0.477499 2:-7735227 MsG0280006897.01.T01:CDS
AACAACTTCTCTGGAGAGCT+TGG 0.477597 2:-7735545 MsG0280006897.01.T01:CDS
ATCATGTATCTATCAGCAAT+AGG 0.488593 2:+7734663 None:intergenic
AATGATATATTCTTAATGCA+TGG 0.497479 2:+7734873 None:intergenic
TTGATGAACAATTCATTCAA+AGG 0.498465 2:-7735770 MsG0280006897.01.T01:CDS
AAGAGTTATTATCTCTTACA+AGG 0.500725 2:-7734606 MsG0280006897.01.T01:CDS
AAGAACTTGAACTTAATGAC+TGG 0.509140 2:-7734581 MsG0280006897.01.T01:CDS
TGCATTTCACCAATGGATGA+TGG 0.509835 2:+7735596 None:intergenic
GGCAGGATTCCAATATGGAT+TGG 0.510234 2:-7735317 MsG0280006897.01.T01:CDS
ATCTTCAATTACTCCACTAA+AGG 0.510294 2:+7735397 None:intergenic
TGAAATGTTGGGTGCCATGA+TGG 0.513296 2:+7735967 None:intergenic
GATGATATTTGGTTCACCCC+TGG 0.530434 2:-7734732 MsG0280006897.01.T01:CDS
GGAATTCTTCCATCATCCAT+TGG 0.534690 2:-7735605 MsG0280006897.01.T01:CDS
TGCTGGTAAAGTAGAAAACT+AGG 0.534929 2:+7735887 None:intergenic
AAGAGGAGTTATAGAAAATG+TGG 0.547725 2:+7734700 None:intergenic
CAGAAAGATCCAAATAGCCA+AGG 0.551644 2:+7735210 None:intergenic
GAGTTTCAAACTACTGCAGT+AGG 0.561428 2:-7734840 MsG0280006897.01.T01:CDS
GCAGAATGATAATGACTCAA+AGG 0.564205 2:-7734805 MsG0280006897.01.T01:CDS
GAGCTTCCAACTTTCAAACA+TGG 0.565646 2:-7735740 MsG0280006897.01.T01:CDS
AGAGTTATTATCTCTTACAA+GGG 0.568466 2:-7734605 MsG0280006897.01.T01:CDS
ATATCAAATAACAAGATTGG+TGG 0.571049 2:-7735701 MsG0280006897.01.T01:CDS
AAAGTAATGGAACAAGTCCA+TGG 0.571666 2:+7735462 None:intergenic
TTGTCAAAGAATCAGTTACA+AGG 0.573158 2:-7735266 MsG0280006897.01.T01:CDS
CAAGTAGTTGTAGATCATGC+TGG 0.575912 2:+7735870 None:intergenic
TTTCTCATAACAAGCTATCA+GGG 0.577520 2:-7735844 MsG0280006897.01.T01:CDS
GGAGTTATAGAAAATGTGGA+AGG 0.578419 2:+7734704 None:intergenic
TTGACGTTATTAAAGCAATG+AGG 0.580471 2:+7735164 None:intergenic
AAGCATGTGGTATATTACCT+TGG 0.587068 2:+7735105 None:intergenic
CACATAGATAGGAATTGGAC+CGG 0.591559 2:+7734959 None:intergenic
TTGCAAAAGAATGCTCTCCA+AGG 0.597172 2:-7735122 MsG0280006897.01.T01:CDS
AAATGTGGAAGGTATTTCCA+GGG 0.602923 2:+7734715 None:intergenic
TGTATCTATCAGCAATAGGA+TGG 0.604115 2:+7734667 None:intergenic
CAAACAATATGGTATCAGGC+AGG 0.612985 2:-7735334 MsG0280006897.01.T01:CDS
TTTCAAACTACTGCAGTAGG+AGG 0.620294 2:-7734837 MsG0280006897.01.T01:CDS
AGAAAGATCCAAATAGCCAA+GGG 0.623633 2:+7735211 None:intergenic
GTTAGTTGAGACAAAGCATG+TGG 0.627587 2:+7735092 None:intergenic
GAAACTGAAGAAGTCCATCA+TGG 0.635919 2:-7735981 MsG0280006897.01.T01:CDS
AATTAGCATCACTTGACCTG+AGG 0.674209 2:-7735067 MsG0280006897.01.T01:CDS
AGGATGGTTCAAGCTCAAAG+AGG 0.683268 2:+7734683 None:intergenic
TAGTCTCAGCAGTCTCAATG+AGG 0.683636 2:+7735499 None:intergenic
GAGAGCCTGTTGATCCACTG+TGG 0.690026 2:+7735020 None:intergenic
GATATATTCTTAATGCATGG+AGG 0.694734 2:+7734876 None:intergenic
AATGTGGAAGGTATTTCCAG+GGG 0.728946 2:+7734716 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TAAGAATATATCATTTAAAA+TGG - Chr2:7735684-7735703 MsG0280006897.01.T01:CDS 10.0%
!! AAGGATAAAATTCAGTATTA+TGG - Chr2:7735763-7735782 MsG0280006897.01.T01:CDS 20.0%
!! AATGATATATTCTTAATGCA+TGG + Chr2:7735679-7735698 None:intergenic 20.0%
!! AGGTTTACATAATAAAGAAT+TGG + Chr2:7734905-7734924 None:intergenic 20.0%
!! CAAACTTAACAAGATTAAAT+TGG - Chr2:7735110-7735129 MsG0280006897.01.T01:CDS 20.0%
!! CAAATATCAAATAACAAGAT+TGG - Chr2:7734845-7734864 MsG0280006897.01.T01:CDS 20.0%
!!! AACATCATACATTTTTTTAG+TGG - Chr2:7735795-7735814 MsG0280006897.01.T01:CDS 20.0%
!!! AGAACTTTTAATTGAAATGT+TGG + Chr2:7734597-7734616 None:intergenic 20.0%
!!! GAACTTTTAATTGAAATGTT+GGG + Chr2:7734596-7734615 None:intergenic 20.0%
!!! TCTTGTTATTTGATATTTGT+AGG + Chr2:7734844-7734863 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTTTTAGTGGATGATATT+TGG - Chr2:7735806-7735825 MsG0280006897.01.T01:CDS 20.0%
! AACTTTCAAACATGGTTTAT+TGG - Chr2:7734817-7734836 MsG0280006897.01.T01:CDS 25.0%
! AAGAGTTATTATCTCTTACA+AGG - Chr2:7735943-7735962 MsG0280006897.01.T01:CDS 25.0%
! AATAAACCATGTTTGAAAGT+TGG + Chr2:7734818-7734837 None:intergenic 25.0%
! AGAGTTATTATCTCTTACAA+GGG - Chr2:7735944-7735963 MsG0280006897.01.T01:CDS 25.0%
! ATATCAAACAATATGGTATC+AGG - Chr2:7735211-7735230 MsG0280006897.01.T01:CDS 25.0%
! ATATCAAATAACAAGATTGG+TGG - Chr2:7734848-7734867 MsG0280006897.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGGACATATCAAACAATA+TGG - Chr2:7735204-7735223 MsG0280006897.01.T01:CDS 25.0%
! CTTGTTAAGTTTGAAAGTAA+TGG + Chr2:7735103-7735122 None:intergenic 25.0%
! GAAATTGCTTTCTAAATTCA+AGG - Chr2:7734624-7734643 MsG0280006897.01.T01:CDS 25.0%
! TTGATGAACAATTCATTCAA+AGG - Chr2:7734779-7734798 MsG0280006897.01.T01:CDS 25.0%
! TTTCTAAATTCAAGGAGAAA+TGG - Chr2:7734632-7734651 MsG0280006897.01.T01:CDS 25.0%
!!! CAATTCTTCTTTGTTTTCAT+TGG - Chr2:7735186-7735205 MsG0280006897.01.T01:CDS 25.0%
!!! CTATCTAAGAATAGTTTTGA+GGG - Chr2:7734923-7734942 MsG0280006897.01.T01:CDS 25.0%
AAGAACTTGAACTTAATGAC+TGG - Chr2:7735968-7735987 MsG0280006897.01.T01:CDS 30.0%
AAGAGGAGTTATAGAAAATG+TGG + Chr2:7735852-7735871 None:intergenic 30.0%
AATGCAAACAATAAGGACTA+TGG - Chr2:7734970-7734989 MsG0280006897.01.T01:CDS 30.0%
ACTAGAACATGTCAGAATTA+TGG - Chr2:7735618-7735637 MsG0280006897.01.T01:CDS 30.0%
ATCATGTATCTATCAGCAAT+AGG + Chr2:7735889-7735908 None:intergenic 30.0%
ATCTTCAATTACTCCACTAA+AGG + Chr2:7735155-7735174 None:intergenic 30.0%
CCTCAAAACTATTCTTAGAT+AGG + Chr2:7734925-7734944 None:intergenic 30.0%
CTTGCAAAATAACACAAAGT+TGG - Chr2:7734745-7734764 MsG0280006897.01.T01:CDS 30.0%
GATATATTCTTAATGCATGG+AGG + Chr2:7735676-7735695 None:intergenic 30.0%
TATTGTTTGCATTTCACCAA+TGG + Chr2:7734963-7734982 None:intergenic 30.0%
TTGACGTTATTAAAGCAATG+AGG + Chr2:7735388-7735407 None:intergenic 30.0%
TTGGTGAAATGCAAACAATA+AGG - Chr2:7734963-7734982 MsG0280006897.01.T01:CDS 30.0%
TTGTCAAAGAATCAGTTACA+AGG - Chr2:7735283-7735302 MsG0280006897.01.T01:CDS 30.0%
TTTAGTGGAGTAATTGAAGA+TGG - Chr2:7735154-7735173 MsG0280006897.01.T01:CDS 30.0%
TTTCTCATAACAAGCTATCA+GGG - Chr2:7734705-7734724 MsG0280006897.01.T01:CDS 30.0%
! CTTTCTGAAAACAATCTATC+AGG - Chr2:7735355-7735374 MsG0280006897.01.T01:CDS 30.0%
!! CCTATCTAAGAATAGTTTTG+AGG - Chr2:7734922-7734941 MsG0280006897.01.T01:CDS 30.0%
!! TTATTTTGCAAGATCCAAGA+GGG + Chr2:7734737-7734756 None:intergenic 30.0%
!! TTTTTGGAAATATTCCACAG+TGG - Chr2:7735515-7735534 MsG0280006897.01.T01:CDS 30.0%
AAGCATGTGGTATATTACCT+TGG + Chr2:7735447-7735466 None:intergenic 35.0%
AGAAAGATCCAAATAGCCAA+GGG + Chr2:7735341-7735360 None:intergenic 35.0%
AGGTCAAATTGGAGATCAAA+TGG + Chr2:7735033-7735052 None:intergenic 35.0%
CAAAAAAACTGTTGTTCCTC+AGG + Chr2:7735501-7735520 None:intergenic 35.0%
CTATCTCACAATTGTTTCCA+TGG - Chr2:7735070-7735089 MsG0280006897.01.T01:CDS 35.0%
CTGAACAATAACTCCTTTAG+TGG - Chr2:7735139-7735158 MsG0280006897.01.T01:CDS 35.0%
CTGGCATGGAATAAATTAAC+CGG - Chr2:7735571-7735590 MsG0280006897.01.T01:CDS 35.0%
CTTGAACTTAATGACTGGAT+TGG - Chr2:7735973-7735992 MsG0280006897.01.T01:CDS 35.0%
CTTTCTCATAACAAGCTATC+AGG - Chr2:7734704-7734723 MsG0280006897.01.T01:CDS 35.0%
GGAGTTATAGAAAATGTGGA+AGG + Chr2:7735848-7735867 None:intergenic 35.0%
GGTCAACTACAAGAGAATAT+AGG - Chr2:7734869-7734888 MsG0280006897.01.T01:CDS 35.0%
GTGAATCTTCCAATCCATAT+TGG + Chr2:7735244-7735263 None:intergenic 35.0%
TCACACACATAGATAGGAAT+TGG + Chr2:7735598-7735617 None:intergenic 35.0%
TGCTGGTAAAGTAGAAAACT+AGG + Chr2:7734665-7734684 None:intergenic 35.0%
TGTATCTATCAGCAATAGGA+TGG + Chr2:7735885-7735904 None:intergenic 35.0%
! AAAGTAATGGAACAAGTCCA+TGG + Chr2:7735090-7735109 None:intergenic 35.0%
! AGACTTGAGAGTTCTTTTAC+TGG - Chr2:7735552-7735571 MsG0280006897.01.T01:CDS 35.0%
! ATTAGGTTGCAAAGCTCATT+TGG + Chr2:7735316-7735335 None:intergenic 35.0%
! GCAGAATGATAATGACTCAA+AGG - Chr2:7735744-7735763 MsG0280006897.01.T01:CDS 35.0%
! TCTAGTTCACACACATAGAT+AGG + Chr2:7735604-7735623 None:intergenic 35.0%
! TTAGGTTGCAAAGCTCATTT+GGG + Chr2:7735315-7735334 None:intergenic 35.0%
!! AAAATGTGGAAGGTATTTCC+AGG + Chr2:7735838-7735857 None:intergenic 35.0%
!! AAATGTGGAAGGTATTTCCA+GGG + Chr2:7735837-7735856 None:intergenic 35.0%
!! CTGATAGCTTGTTATGAGAA+AGG + Chr2:7734706-7734725 None:intergenic 35.0%
!! GTTATTTTGCAAGATCCAAG+AGG + Chr2:7734738-7734757 None:intergenic 35.0%
!!! CTGAGGAACAACAGTTTTTT+TGG - Chr2:7735499-7735518 MsG0280006897.01.T01:CDS 35.0%
AATTAGCATCACTTGACCTG+AGG - Chr2:7735482-7735501 MsG0280006897.01.T01:CDS 40.0%
ATATTCCACAGTGGATCAAC+AGG - Chr2:7735524-7735543 MsG0280006897.01.T01:CDS 40.0%
CAAACAATATGGTATCAGGC+AGG - Chr2:7735215-7735234 MsG0280006897.01.T01:CDS 40.0%
CAAGTAGTTGTAGATCATGC+TGG + Chr2:7734682-7734701 None:intergenic 40.0%
CACATAGATAGGAATTGGAC+CGG + Chr2:7735593-7735612 None:intergenic 40.0%
CAGAAAGATCCAAATAGCCA+AGG + Chr2:7735342-7735361 None:intergenic 40.0%
CAGTCTCAATGAGGTCAAAT+TGG + Chr2:7735044-7735063 None:intergenic 40.0%
CCAAATAGCCAAGGGAAATT+AGG + Chr2:7735333-7735352 None:intergenic 40.0%
CCTAATTTCCCTTGGCTATT+TGG - Chr2:7735330-7735349 MsG0280006897.01.T01:CDS 40.0%
CTTTGCAACCTAATTTCCCT+TGG - Chr2:7735322-7735341 MsG0280006897.01.T01:CDS 40.0%
GAAACTGAAGAAGTCCATCA+TGG - Chr2:7734568-7734587 MsG0280006897.01.T01:CDS 40.0%
GAGCTTCCAACTTTCAAACA+TGG - Chr2:7734809-7734828 MsG0280006897.01.T01:CDS 40.0%
GAGTTTCAAACTACTGCAGT+AGG - Chr2:7735709-7735728 MsG0280006897.01.T01:CDS 40.0%
GGAATTCTTCCATCATCCAT+TGG - Chr2:7734944-7734963 MsG0280006897.01.T01:CDS 40.0%
GTTAGTTGAGACAAAGCATG+TGG + Chr2:7735460-7735479 None:intergenic 40.0%
TATCAGGCAGGATTCCAATA+TGG - Chr2:7735227-7735246 MsG0280006897.01.T01:CDS 40.0%
TGCATTTCACCAATGGATGA+TGG + Chr2:7734956-7734975 None:intergenic 40.0%
TTGCAAAAGAATGCTCTCCA+AGG - Chr2:7735427-7735446 MsG0280006897.01.T01:CDS 40.0%
TTGTCCAACAACAACTTCTC+TGG - Chr2:7734995-7735014 MsG0280006897.01.T01:CDS 40.0%
TTTCAAACTACTGCAGTAGG+AGG - Chr2:7735712-7735731 MsG0280006897.01.T01:CDS 40.0%
! TATCAGGGAATTTTCCCTCT+TGG - Chr2:7734720-7734739 MsG0280006897.01.T01:CDS 40.0%
! TGAGAGTTCTTTTACTGGCA+TGG - Chr2:7735557-7735576 MsG0280006897.01.T01:CDS 40.0%
!! AATGTGGAAGGTATTTCCAG+GGG + Chr2:7735836-7735855 None:intergenic 40.0%
AGGATGGTTCAAGCTCAAAG+AGG + Chr2:7735869-7735888 None:intergenic 45.0%
CTCTCCAGAGAAGTTGTTGT+TGG + Chr2:7735002-7735021 None:intergenic 45.0%
GGCAGGATTCCAATATGGAT+TGG - Chr2:7735232-7735251 MsG0280006897.01.T01:CDS 45.0%
TAGTCTCAGCAGTCTCAATG+AGG + Chr2:7735053-7735072 None:intergenic 45.0%
! AACAACTTCTCTGGAGAGCT+TGG - Chr2:7735004-7735023 MsG0280006897.01.T01:CDS 45.0%
! GATGATATTTGGTTCACCCC+TGG - Chr2:7735817-7735836 MsG0280006897.01.T01:CDS 45.0%
! TGAAATGTTGGGTGCCATGA+TGG + Chr2:7734585-7734604 None:intergenic 45.0%
GAGAGCCTGTTGATCCACTG+TGG + Chr2:7735532-7735551 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 7734563 7736008 7734563 ID=MsG0280006897.01;Name=MsG0280006897.01
Chr2 mRNA 7734563 7736008 7734563 ID=MsG0280006897.01.T01;Parent=MsG0280006897.01;Name=MsG0280006897.01.T01;_AED=0.27;_eAED=0.27;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|481
Chr2 exon 7734563 7736008 7734563 ID=MsG0280006897.01.T01:exon:2253;Parent=MsG0280006897.01.T01
Chr2 CDS 7734563 7736008 7734563 ID=MsG0280006897.01.T01:cds;Parent=MsG0280006897.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280006897.01.T01

ATGTGGAAACTGAAGAAGTCCATCATGGCACCCAACATTTCAATTAAAAGTTCTCAACTTAGAAATTGCTTTCTAAATTCAAGGAGAAATGGAACTTTTCCTAGTTTTCTACTTTACCAGCATGATCTACAACTACTTGACCTTTCTCATAACAAGCTATCAGGGAATTTTCCCTCTTGGATCTTGCAAAATAACACAAAGTTGGAGACTTTGTATTTGATGAACAATTCATTCAAAGGAACTCTTGAGCTTCCAACTTTCAAACATGGTTTATTGGACCTACAAATATCAAATAACAAGATTGGTGGTCAACTACAAGAGAATATAGGTAAGATATTTCCAATTCTTTATTATGTAAACCTATCTAAGAATAGTTTTGAGGGAATTCTTCCATCATCCATTGGTGAAATGCAAACAATAAGGACTATGGACTTGTCCAACAACAACTTCTCTGGAGAGCTTGGTAGCCATTTGATCTCCAATTTGACCTCATTGAGACTGCTGAGACTATCTCACAATTGTTTCCATGGACTTGTTCCATTACTTTCAAACTTAACAAGATTAAATTGGTTGTATCTGAACAATAACTCCTTTAGTGGAGTAATTGAAGATGGAGTGTCAAACAATTCTTCTTTGTTTTCATTGGACATATCAAACAATATGGTATCAGGCAGGATTCCAATATGGATTGGAAGATTCACAAAACTAAGTGTACTTTCATTGTCAAAGAATCAGTTACAAGGTGAAATCCCAAATGAGCTTTGCAACCTAATTTCCCTTGGCTATTTGGATCTTTCTGAAAACAATCTATCAGGTTTTTTACCTCATTGCTTTAATAACGTCAAATATATGAAGTTCTTATACTTGCAAAAGAATGCTCTCCAAGGTAATATACCACATGCTTTGTCTCAACTAACAAAATTAGCATCACTTGACCTGAGGAACAACAGTTTTTTTGGAAATATTCCACAGTGGATCAACAGGCTCTCAGACTTGAGAGTTCTTTTACTGGCATGGAATAAATTAACCGGTCCAATTCCTATCTATGTGTGTGAACTAGAACATGTCAGAATTATGGATCTCTCACATAATTTGATTAATGAAACAATACCTCCATGCATTAAGAATATATCATTTAAAATGGTAGAGTTTCAAACTACTGCAGTAGGAGGAACAGCAGTGCAGAATGATAATGACTCAAAGGATAAAATTCAGTATTATGGAAATACTGCAACATCATACATTTTTTTAGTGGATGATATTTGGTTCACCCCTGGAAATACCTTCCACATTTTCTATAACTCCTCTTTGAGCTTGAACCATCCTATTGCTGATAGATACATGATATCTTATGAAATAGTAGAGATTGAATTCAGAACAAAGAGTTATTATCTCTTACAAGGGAAAGAACTTGAACTTAATGACTGGATTGGATTTATCAAGTAA
Protein sequence

>MsG0280006897.01.T01

MWKLKKSIMAPNISIKSSQLRNCFLNSRRNGTFPSFLLYQHDLQLLDLSHNKLSGNFPSWILQNNTKLETLYLMNNSFKGTLELPTFKHGLLDLQISNNKIGGQLQENIGKIFPILYYVNLSKNSFEGILPSSIGEMQTIRTMDLSNNNFSGELGSHLISNLTSLRLLRLSHNCFHGLVPLLSNLTRLNWLYLNNNSFSGVIEDGVSNNSSLFSLDISNNMVSGRIPIWIGRFTKLSVLSLSKNQLQGEIPNELCNLISLGYLDLSENNLSGFLPHCFNNVKYMKFLYLQKNALQGNIPHALSQLTKLASLDLRNNSFFGNIPQWINRLSDLRVLLLAWNKLTGPIPIYVCELEHVRIMDLSHNLINETIPPCIKNISFKMVEFQTTAVGGTAVQNDNDSKDKIQYYGNTATSYIFLVDDIWFTPGNTFHIFYNSSLSLNHPIADRYMISYEIVEIEFRTKSYYLLQGKELELNDWIGFIK*