AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280007000.01

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MsG0280007000.01.T01 AT1G62680 25.692 253 144 6 135 352 62 305 8.76e-17 82.0
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MsG0280007000.01.T01 AT1G05600 22.333 300 182 6 52 345 10 264 3.94e-12 67.8
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MsG0280007000.01.T01 AT3G53170 24.138 290 194 7 70 350 77 349 2.23e-12 68.2
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MsG0280007000.01.T01 AT5G62370 20.690 261 197 3 92 352 482 732 7.19e-12 67.4
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MsG0280007000.01.T01 AT5G06400 21.691 272 196 8 67 335 169 426 8.71e-12 67.0
MsG0280007000.01.T01 AT5G06400 24.571 175 129 1 183 357 205 376 5.63e-11 64.7
MsG0280007000.01.T01 AT4G34830 21.277 235 160 5 132 356 445 664 9.33e-12 67.0
MsG0280007000.01.T01 AT4G34830 22.945 292 198 7 74 350 443 722 2.56e-11 65.9
MsG0280007000.01.T01 AT2G17670 24.419 172 123 2 150 321 185 349 1.15e-11 65.9
MsG0280007000.01.T01 AT3G09650 23.039 204 147 3 151 352 444 639 1.28e-11 66.6
MsG0280007000.01.T01 AT1G02420 21.724 290 204 5 63 329 84 373 1.40e-11 65.9
MsG0280007000.01.T01 AT1G80880 29.771 131 91 1 201 330 257 387 1.67e-11 65.9
MsG0280007000.01.T01 AT1G80880 29.771 131 91 1 201 330 257 387 1.67e-11 65.9
MsG0280007000.01.T01 AT1G80880 29.771 131 91 1 201 330 257 387 1.67e-11 65.9
MsG0280007000.01.T01 AT2G41720 21.678 286 210 5 68 350 124 398 1.70e-11 66.2
MsG0280007000.01.T01 AT5G46680 20.884 249 179 5 88 332 49 283 1.84e-11 65.5
MsG0280007000.01.T01 AT5G46680 22.568 257 152 5 94 349 20 230 5.43e-11 64.3
MsG0280007000.01.T01 AT2G19280 22.727 264 194 4 90 353 411 664 1.90e-11 65.9
MsG0280007000.01.T01 AT2G19280 22.727 264 194 4 90 353 411 664 1.90e-11 65.9
MsG0280007000.01.T01 AT2G19280 22.727 264 194 4 90 353 411 664 1.90e-11 65.9
MsG0280007000.01.T01 AT2G19280 22.727 264 194 4 90 353 411 664 1.90e-11 65.9
MsG0280007000.01.T01 AT2G41720 21.678 286 210 5 68 350 124 398 2.15e-11 65.9
MsG0280007000.01.T01 AT1G77405 27.632 152 93 3 214 348 173 324 2.97e-11 65.1
MsG0280007000.01.T01 AT1G77405 23.457 324 213 10 48 352 92 399 3.46e-11 64.7
MsG0280007000.01.T01 AT1G73710 23.693 287 202 8 70 353 534 806 3.26e-11 65.5
MsG0280007000.01.T01 AT4G39620 22.373 295 207 7 71 358 117 396 3.32e-11 64.7
MsG0280007000.01.T01 AT2G35130 20.199 302 199 4 83 350 186 479 3.58e-11 65.1
MsG0280007000.01.T01 AT1G09410 28.662 157 92 6 184 338 65 203 4.69e-11 64.7
MsG0280007000.01.T01 AT4G39620 22.373 295 207 7 71 358 117 396 5.22e-11 64.3

Find 102 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 117 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GGCGAGGACTTCTTCAATTA+AGG 0.243679 2:+9259956 None:intergenic
GGGAGGGTGGAACAGGGGTT+TGG 0.277600 2:-9259528 MsG0280007000.01.T01:CDS
GGAGGGTGGAACAGGGGTTT+GGG 0.286393 2:-9259527 MsG0280007000.01.T01:CDS
AAAGTATACGTTTCAAGATT+AGG 0.291586 2:+9259810 None:intergenic
TGAGAAAGGGAGGGTGGAAC+AGG 0.299623 2:-9259535 MsG0280007000.01.T01:CDS
GACTTCTTCAATTAAGGTTT+CGG 0.314995 2:+9259962 None:intergenic
TTGATATGTTGGGGAATTCT+AGG 0.334707 2:-9259392 MsG0280007000.01.T01:CDS
TGGAAGTTGATGAGGCCATT+AGG 0.339055 2:-9259632 MsG0280007000.01.T01:CDS
CAATTAAGGTTTCGGCTTGT+TGG 0.341606 2:+9259970 None:intergenic
ATGATTTGCAGTTTGTTTGC+AGG 0.347158 2:-9259230 MsG0280007000.01.T01:CDS
GGAAGTTGATGAGGCCATTA+GGG 0.356213 2:-9259631 MsG0280007000.01.T01:CDS
TAAAGCTTATGCTAAGTGTT+TGG 0.356221 2:-9259652 MsG0280007000.01.T01:CDS
TGAGGTTATGTTTGATATGT+TGG 0.359676 2:-9259403 MsG0280007000.01.T01:CDS
GAATGTAAGAAGAGGGATAT+TGG 0.378456 2:-9259285 MsG0280007000.01.T01:CDS
GGAAATGAGGGTCAAATGTT+TGG 0.381517 2:-9259496 MsG0280007000.01.T01:CDS
AACATCGGTTGGAGTGAAAC+CGG 0.394672 2:+9260130 None:intergenic
GGATGGAGTTGTTGTTGGGA+TGG 0.397449 2:+9260202 None:intergenic
TGGAGTTGTTGTTGGGATGG+TGG 0.411229 2:+9260205 None:intergenic
GCTAAGGGGTTGTGTGAGAA+AGG 0.419231 2:-9259549 MsG0280007000.01.T01:CDS
AGGTTTCGGCTTGTTGGTAA+TGG 0.420620 2:+9259976 None:intergenic
GGGTTTGAGGTGGTTGATCC+AGG 0.420657 2:+9260151 None:intergenic
GAGGTTATGTTTGATATGTT+GGG 0.425212 2:-9259402 MsG0280007000.01.T01:CDS
AGTTAAGGAAGTGTGTTTGT+AGG 0.431978 2:+9260034 None:intergenic
AAAATGTCAAGAGCGAGGTC+TGG 0.432659 2:+9260080 None:intergenic
GAGCGAGGTCTGGGTCAGAT+TGG 0.437854 2:+9260090 None:intergenic
GGTGGCGAGGTGGGTGATGA+TGG 0.454259 2:+9260004 None:intergenic
AGCGAGGTCTGGGTCAGATT+GGG 0.458383 2:+9260091 None:intergenic
TAGTTATAGTTATATTGCTA+AGG 0.474064 2:-9259565 MsG0280007000.01.T01:CDS
GCGGTTGAAGAGGAACTTGC+GGG 0.474485 2:+9259878 None:intergenic
ACGAAGCAGATGAAGGCAAT+TGG 0.475149 2:-9259711 MsG0280007000.01.T01:CDS
TGGGTCAGATTGGGAGGTGA+GGG 0.475172 2:+9260100 None:intergenic
ATGTTTATTTACGTTCAGTA+AGG 0.478323 2:-9259740 MsG0280007000.01.T01:CDS
AGGGGTTGTGTGAGAAAGGG+AGG 0.487063 2:-9259545 MsG0280007000.01.T01:CDS
ACTTGCGGGAGCAGCAGAAA+CGG 0.488284 2:+9259892 None:intergenic
TTGGAGTGAAACCGGGTTTG+AGG 0.489259 2:+9260138 None:intergenic
ATGGCGAGAGGTGGCGAGGT+GGG 0.490716 2:+9259995 None:intergenic
AGTTATAGTTATATTGCTAA+GGG 0.493181 2:-9259564 MsG0280007000.01.T01:CDS
TGATTTGCAGTTTGTTTGCA+GGG 0.495084 2:-9259229 MsG0280007000.01.T01:CDS
TCTTACTTATAAGACAGTAT+TGG 0.495318 2:-9259358 MsG0280007000.01.T01:CDS
GTCTTATAAGTAAGACAATC+CGG 0.497925 2:+9259366 None:intergenic
AAATGTCAAGAGCGAGGTCT+GGG 0.498592 2:+9260081 None:intergenic
GAAGGCAATTGGTGTTATAC+CGG 0.513767 2:-9259700 MsG0280007000.01.T01:CDS
ATATTCAAAACAAAAGTATC+CGG 0.514524 2:+9259681 None:intergenic
GTCTTTAACGAAGCAGATGA+AGG 0.517839 2:-9259718 MsG0280007000.01.T01:CDS
GAGAAAGGGAGGGTGGAACA+GGG 0.522583 2:-9259534 MsG0280007000.01.T01:CDS
CAGATTGGGAGGTGAGGGCA+TGG 0.526048 2:+9260105 None:intergenic
GATGATGGTGTGGTAAGTTA+AGG 0.529139 2:+9260019 None:intergenic
GGGATATTGGTATGAATGAG+AGG 0.533316 2:-9259272 MsG0280007000.01.T01:CDS
GTTGGGGAATTCTAGGTCGC+CGG 0.536757 2:-9259385 MsG0280007000.01.T01:CDS
GAGGTTTGAGGATGCTATTG+AGG 0.541855 2:-9259421 MsG0280007000.01.T01:CDS
ACATCGGTTGGAGTGAAACC+GGG 0.542259 2:+9260131 None:intergenic
CTAAGGGGTTGTGTGAGAAA+GGG 0.542575 2:-9259548 MsG0280007000.01.T01:CDS
TTTGTAGTCTTGCGTTGGAA+CGG 0.542892 2:-9259443 MsG0280007000.01.T01:CDS
CTGGGTCAGATTGGGAGGTG+AGG 0.545512 2:+9260099 None:intergenic
GTGTTTGTAGGAACGTTGTT+GGG 0.545940 2:+9260046 None:intergenic
CATTATGTTGTACACGTCGA+AGG 0.546422 2:+9259854 None:intergenic
CGGAGGATGGTGTTGAAAAG+AGG 0.549926 2:+9259912 None:intergenic
GTTGTGTGAGAAAGGGAGGG+TGG 0.552019 2:-9259541 MsG0280007000.01.T01:CDS
TGTGTTTGTAGGAACGTTGT+TGG 0.554021 2:+9260045 None:intergenic
CGTCGAAGGCGCGGTTGAAG+AGG 0.557679 2:+9259868 None:intergenic
GGCTTGTTGGTAATGGCGAG+AGG 0.561177 2:+9259983 None:intergenic
TATTGTTTGTAGTCTTGCGT+TGG 0.562221 2:-9259448 MsG0280007000.01.T01:CDS
AGGGCATGGTTAACATCGGT+TGG 0.562462 2:+9260119 None:intergenic
TGCGTTGGAACGGAGGTTTG+AGG 0.564426 2:-9259433 MsG0280007000.01.T01:CDS
GCTGGATGAATGTAAGAAGA+GGG 0.564777 2:-9259292 MsG0280007000.01.T01:CDS
AGAAAGGGAGGGTGGAACAG+GGG 0.565073 2:-9259533 MsG0280007000.01.T01:CDS
CGAGGTGGGTGATGATGGTG+TGG 0.566377 2:+9260009 None:intergenic
AGGATTGTGTCGCGAAGGGA+GGG 0.567395 2:-9259334 MsG0280007000.01.T01:CDS
AATGGCGAGAGGTGGCGAGG+TGG 0.571502 2:+9259994 None:intergenic
TGCTGGATGAATGTAAGAAG+AGG 0.573320 2:-9259293 MsG0280007000.01.T01:CDS
AACGTTGTTGGGATGTCCAA+CGG 0.575203 2:+9260057 None:intergenic
TTGGAAGGATTGTGTCGCGA+AGG 0.586016 2:-9259339 MsG0280007000.01.T01:CDS
TGTTGTACACGTCGAAGGCG+CGG 0.588585 2:+9259859 None:intergenic
AAGGATTGTGTCGCGAAGGG+AGG 0.592221 2:-9259335 MsG0280007000.01.T01:CDS
GTAGTCTTGCGTTGGAACGG+AGG 0.592987 2:-9259440 MsG0280007000.01.T01:CDS
TGGGTTCACACGCGCCGGCG+AGG 0.593008 2:+9259940 None:intergenic
TCGCGAAGGGAGGGTTGATG+AGG 0.594208 2:-9259325 MsG0280007000.01.T01:CDS
TGGATCAACCACCTCAAACC+CGG 0.595420 2:-9260149 MsG0280007000.01.T01:CDS
GGAGCAGCAGAAACGGAGGA+TGG 0.601280 2:+9259899 None:intergenic
ACTTATAAGACAGTATTGGA+AGG 0.602327 2:-9259354 MsG0280007000.01.T01:CDS
ATCACATAAGTACTTGTACT+CGG 0.608656 2:+9259471 None:intergenic
GAGGTCTGGGTCAGATTGGG+AGG 0.610686 2:+9260094 None:intergenic
GGTGTTGAAAAGAGGCAGTG+TGG 0.611606 2:+9259920 None:intergenic
CAGTGTGGGTTCACACGCGC+CGG 0.611789 2:+9259935 None:intergenic
GAGTGAAACCGGGTTTGAGG+TGG 0.614565 2:+9260141 None:intergenic
TGGAAGGATTGTGTCGCGAA+GGG 0.617431 2:-9259338 MsG0280007000.01.T01:CDS
CGCGGTTGAAGAGGAACTTG+CGG 0.619527 2:+9259877 None:intergenic
AGGTTATGTTTGATATGTTG+GGG 0.624608 2:-9259401 MsG0280007000.01.T01:CDS
GTTATAGTTATATTGCTAAG+GGG 0.630746 2:-9259563 MsG0280007000.01.T01:CDS
GGGGTTGTGTGAGAAAGGGA+GGG 0.631582 2:-9259544 MsG0280007000.01.T01:CDS
TTGTTGGTAATGGCGAGAGG+TGG 0.632597 2:+9259986 None:intergenic
GTGTTGAAAAGAGGCAGTGT+GGG 0.638141 2:+9259921 None:intergenic
GGTAATGGCGAGAGGTGGCG+AGG 0.643277 2:+9259991 None:intergenic
GGTGGAATAGAATAGAGAGG+TGG 0.644637 2:+9260223 None:intergenic
AATGATGATATTGATGCCCA+TGG 0.647289 2:+9260280 None:intergenic
TGCGGGAGCAGCAGAAACGG+AGG 0.651877 2:+9259895 None:intergenic
TTAATTGAAGAAGTCCTCGC+CGG 0.658381 2:-9259954 MsG0280007000.01.T01:CDS
AACGGAAAATGTCAAGAGCG+AGG 0.659854 2:+9260075 None:intergenic
TAAGTGTTTGGAAGTTGATG+AGG 0.666776 2:-9259640 MsG0280007000.01.T01:CDS
GATGGTGGAATAGAATAGAG+AGG 0.670695 2:+9260220 None:intergenic
AATGGGGTTGTATAATTGTG+AGG 0.681938 2:-9259598 MsG0280007000.01.T01:CDS
GGTGAGGGCATGGTTAACAT+CGG 0.705277 2:+9260115 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AGTTATAGTTATATTGCTAA+GGG - Chr2:9259938-9259957 MsG0280007000.01.T01:CDS 20.0%
!! TAGTTATAGTTATATTGCTA+AGG - Chr2:9259937-9259956 MsG0280007000.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATATTCAAAACAAAAGTATC+CGG + Chr2:9259824-9259843 None:intergenic 20.0%
! AAAGTATACGTTTCAAGATT+AGG + Chr2:9259695-9259714 None:intergenic 25.0%
! ATGTTTATTTACGTTCAGTA+AGG - Chr2:9259762-9259781 MsG0280007000.01.T01:CDS 25.0%
! GTTATAGTTATATTGCTAAG+GGG - Chr2:9259939-9259958 MsG0280007000.01.T01:CDS 25.0%
! TCTTACTTATAAGACAGTAT+TGG - Chr2:9260144-9260163 MsG0280007000.01.T01:CDS 25.0%
AGGTTATGTTTGATATGTTG+GGG - Chr2:9260101-9260120 MsG0280007000.01.T01:CDS 30.0%
ATCACATAAGTACTTGTACT+CGG + Chr2:9260034-9260053 None:intergenic 30.0%
GACTTCTTCAATTAAGGTTT+CGG + Chr2:9259543-9259562 None:intergenic 30.0%
GAGGTTATGTTTGATATGTT+GGG - Chr2:9260100-9260119 MsG0280007000.01.T01:CDS 30.0%
GTCTTATAAGTAAGACAATC+CGG + Chr2:9260139-9260158 None:intergenic 30.0%
TAAAGCTTATGCTAAGTGTT+TGG - Chr2:9259850-9259869 MsG0280007000.01.T01:CDS 30.0%
TGAGGTTATGTTTGATATGT+TGG - Chr2:9260099-9260118 MsG0280007000.01.T01:CDS 30.0%
! ACTTATAAGACAGTATTGGA+AGG - Chr2:9260148-9260167 MsG0280007000.01.T01:CDS 30.0%
! ATTAGGGTTTTTCGTGAAAT+GGG - Chr2:9259887-9259906 MsG0280007000.01.T01:CDS 30.0%
! TCGAAAAACAATTTGAAACC+TGG - Chr2:9259333-9259352 MsG0280007000.01.T01:CDS 30.0%
!! TGGGTTTTATAAGGAAATGA+GGG - Chr2:9259994-9260013 MsG0280007000.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGGGTTTTATAAGGAAATG+AGG - Chr2:9259993-9260012 MsG0280007000.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTTTCAAATTGTTTTTCGAG+TGG + Chr2:9259332-9259351 None:intergenic 30.0%
AATGGGGTTGTATAATTGTG+AGG - Chr2:9259904-9259923 MsG0280007000.01.T01:CDS 35.0%
CATTTCACGAAAAACCCTAA+TGG + Chr2:9259888-9259907 None:intergenic 35.0%
GAATGTAAGAAGAGGGATAT+TGG - Chr2:9260217-9260236 MsG0280007000.01.T01:CDS 35.0%
TTGATATGTTGGGGAATTCT+AGG - Chr2:9260110-9260129 MsG0280007000.01.T01:CDS 35.0%
! AGTTAAGGAAGTGTGTTTGT+AGG + Chr2:9259471-9259490 None:intergenic 35.0%
! ATGATTTGCAGTTTGTTTGC+AGG - Chr2:9260272-9260291 MsG0280007000.01.T01:CDS 35.0%
! CATTAGGGTTTTTCGTGAAA+TGG - Chr2:9259886-9259905 MsG0280007000.01.T01:CDS 35.0%
! TATTGTTTGTAGTCTTGCGT+TGG - Chr2:9260054-9260073 MsG0280007000.01.T01:CDS 35.0%
! TGATTTGCAGTTTGTTTGCA+GGG - Chr2:9260273-9260292 MsG0280007000.01.T01:CDS 35.0%
! TTAGGGTTTTTCGTGAAATG+GGG - Chr2:9259888-9259907 MsG0280007000.01.T01:CDS 35.0%
!! TAAGTGTTTGGAAGTTGATG+AGG - Chr2:9259862-9259881 MsG0280007000.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTTCAACTCACTTTTACGT+AGG - Chr2:9259717-9259736 MsG0280007000.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTGGATGGAGTTGTTGTT+GGG + Chr2:9259307-9259326 None:intergenic 35.0%
!!! TTGTTTTTCGAGTGGTGTTT+TGG + Chr2:9259324-9259343 None:intergenic 35.0%
CATTATGTTGTACACGTCGA+AGG + Chr2:9259651-9259670 None:intergenic 40.0%
GCTGGATGAATGTAAGAAGA+GGG - Chr2:9260210-9260229 MsG0280007000.01.T01:CDS 40.0%
GGAAATGAGGGTCAAATGTT+TGG - Chr2:9260006-9260025 MsG0280007000.01.T01:CDS 40.0%
GGGATATTGGTATGAATGAG+AGG - Chr2:9260230-9260249 MsG0280007000.01.T01:CDS 40.0%
GTCTTTAACGAAGCAGATGA+AGG - Chr2:9259784-9259803 MsG0280007000.01.T01:CDS 40.0%
GTGTTTGTAGGAACGTTGTT+GGG + Chr2:9259459-9259478 None:intergenic 40.0%
TGCTGGATGAATGTAAGAAG+AGG - Chr2:9260209-9260228 MsG0280007000.01.T01:CDS 40.0%
TGTGTTTGTAGGAACGTTGT+TGG + Chr2:9259460-9259479 None:intergenic 40.0%
TTAATTGAAGAAGTCCTCGC+CGG - Chr2:9259548-9259567 MsG0280007000.01.T01:CDS 40.0%
! CAATTAAGGTTTCGGCTTGT+TGG + Chr2:9259535-9259554 None:intergenic 40.0%
! GATGATGGTGTGGTAAGTTA+AGG + Chr2:9259486-9259505 None:intergenic 40.0%
! TGATGAGGCTTTTGAATTGC+TGG - Chr2:9260192-9260211 MsG0280007000.01.T01:CDS 40.0%
! TTTGTAGTCTTGCGTTGGAA+CGG - Chr2:9260059-9260078 MsG0280007000.01.T01:CDS 40.0%
!! ACAGGGGTTTGGGTTTTATA+AGG - Chr2:9259985-9260004 MsG0280007000.01.T01:CDS 40.0%
!! GAAGGCAATTGGTGTTATAC+CGG - Chr2:9259802-9259821 MsG0280007000.01.T01:CDS 40.0%
!! GATGGTGGAATAGAATAGAG+AGG + Chr2:9259285-9259304 None:intergenic 40.0%
!! GTTTTGGATGGAGTTGTTGT+TGG + Chr2:9259308-9259327 None:intergenic 40.0%
!!! TTTTCGAGTGGTGTTTTGGA+TGG + Chr2:9259320-9259339 None:intergenic 40.0%
AAAATGTCAAGAGCGAGGTC+TGG + Chr2:9259425-9259444 None:intergenic 45.0%
AAATGTCAAGAGCGAGGTCT+GGG + Chr2:9259424-9259443 None:intergenic 45.0%
AACGGAAAATGTCAAGAGCG+AGG + Chr2:9259430-9259449 None:intergenic 45.0%
AACGTTGTTGGGATGTCCAA+CGG + Chr2:9259448-9259467 None:intergenic 45.0%
ACGAAGCAGATGAAGGCAAT+TGG - Chr2:9259791-9259810 MsG0280007000.01.T01:CDS 45.0%
CTAAGGGGTTGTGTGAGAAA+GGG - Chr2:9259954-9259973 MsG0280007000.01.T01:CDS 45.0%
GAGGTTTGAGGATGCTATTG+AGG - Chr2:9260081-9260100 MsG0280007000.01.T01:CDS 45.0%
GGCGAGGACTTCTTCAATTA+AGG + Chr2:9259549-9259568 None:intergenic 45.0%
GGTGGAATAGAATAGAGAGG+TGG + Chr2:9259282-9259301 None:intergenic 45.0%
GTGTTGAAAAGAGGCAGTGT+GGG + Chr2:9259584-9259603 None:intergenic 45.0%
! AACATCGGTTGGAGTGAAAC+CGG + Chr2:9259375-9259394 None:intergenic 45.0%
! TCGCTCTTGACATTTTCCGT+TGG - Chr2:9259429-9259448 MsG0280007000.01.T01:CDS 45.0%
!! AGGTTTCGGCTTGTTGGTAA+TGG + Chr2:9259529-9259548 None:intergenic 45.0%
!! GGAAGTTGATGAGGCCATTA+GGG - Chr2:9259871-9259890 MsG0280007000.01.T01:CDS 45.0%
!! TGGAAGTTGATGAGGCCATT+AGG - Chr2:9259870-9259889 MsG0280007000.01.T01:CDS 45.0%
AGGGCATGGTTAACATCGGT+TGG + Chr2:9259386-9259405 None:intergenic 50.0%
GCTAAGGGGTTGTGTGAGAA+AGG - Chr2:9259953-9259972 MsG0280007000.01.T01:CDS 50.0%
TGGAAGGATTGTGTCGCGAA+GGG - Chr2:9260164-9260183 MsG0280007000.01.T01:CDS 50.0%
TGGATCAACCACCTCAAACC+CGG - Chr2:9259353-9259372 MsG0280007000.01.T01:CDS 50.0%
TTGGAAGGATTGTGTCGCGA+AGG - Chr2:9260163-9260182 MsG0280007000.01.T01:CDS 50.0%
TTGGAGTGAAACCGGGTTTG+AGG + Chr2:9259367-9259386 None:intergenic 50.0%
! ACATCGGTTGGAGTGAAACC+GGG + Chr2:9259374-9259393 None:intergenic 50.0%
! CGGAGGATGGTGTTGAAAAG+AGG + Chr2:9259593-9259612 None:intergenic 50.0%
! GGATGGAGTTGTTGTTGGGA+TGG + Chr2:9259303-9259322 None:intergenic 50.0%
! GGTGAGGGCATGGTTAACAT+CGG + Chr2:9259390-9259409 None:intergenic 50.0%
! GGTGTTGAAAAGAGGCAGTG+TGG + Chr2:9259585-9259604 None:intergenic 50.0%
! TGGAGTTGTTGTTGGGATGG+TGG + Chr2:9259300-9259319 None:intergenic 50.0%
!! TTGTTGGTAATGGCGAGAGG+TGG + Chr2:9259519-9259538 None:intergenic 50.0%
AAGGATTGTGTCGCGAAGGG+AGG - Chr2:9260167-9260186 MsG0280007000.01.T01:CDS 55.0%
ACTTGCGGGAGCAGCAGAAA+CGG + Chr2:9259613-9259632 None:intergenic 55.0%
AGAAAGGGAGGGTGGAACAG+GGG - Chr2:9259969-9259988 MsG0280007000.01.T01:CDS 55.0%
AGCGAGGTCTGGGTCAGATT+GGG + Chr2:9259414-9259433 None:intergenic 55.0%
AGGATTGTGTCGCGAAGGGA+GGG - Chr2:9260168-9260187 MsG0280007000.01.T01:CDS 55.0%
AGGGGTTGTGTGAGAAAGGG+AGG - Chr2:9259957-9259976 MsG0280007000.01.T01:CDS 55.0%
CGCGGTTGAAGAGGAACTTG+CGG + Chr2:9259628-9259647 None:intergenic 55.0%
GAGAAAGGGAGGGTGGAACA+GGG - Chr2:9259968-9259987 MsG0280007000.01.T01:CDS 55.0%
GAGTGAAACCGGGTTTGAGG+TGG + Chr2:9259364-9259383 None:intergenic 55.0%
GCGGTTGAAGAGGAACTTGC+GGG + Chr2:9259627-9259646 None:intergenic 55.0%
GGGGTTGTGTGAGAAAGGGA+GGG - Chr2:9259958-9259977 MsG0280007000.01.T01:CDS 55.0%
GTTGGGGAATTCTAGGTCGC+CGG - Chr2:9260117-9260136 MsG0280007000.01.T01:CDS 55.0%
GTTGTGTGAGAAAGGGAGGG+TGG - Chr2:9259961-9259980 MsG0280007000.01.T01:CDS 55.0%
TGAGAAAGGGAGGGTGGAAC+AGG - Chr2:9259967-9259986 MsG0280007000.01.T01:CDS 55.0%
TGCGTTGGAACGGAGGTTTG+AGG - Chr2:9260069-9260088 MsG0280007000.01.T01:CDS 55.0%
TGGGTCAGATTGGGAGGTGA+GGG + Chr2:9259405-9259424 None:intergenic 55.0%
TGTTGTACACGTCGAAGGCG+CGG + Chr2:9259646-9259665 None:intergenic 55.0%
! GGGTTTGAGGTGGTTGATCC+AGG + Chr2:9259354-9259373 None:intergenic 55.0%
! GTAGTCTTGCGTTGGAACGG+AGG - Chr2:9260062-9260081 MsG0280007000.01.T01:CDS 55.0%
!! GGCTTGTTGGTAATGGCGAG+AGG + Chr2:9259522-9259541 None:intergenic 55.0%
CAGATTGGGAGGTGAGGGCA+TGG + Chr2:9259400-9259419 None:intergenic 60.0%
CTGGGTCAGATTGGGAGGTG+AGG + Chr2:9259406-9259425 None:intergenic 60.0%
GAGCGAGGTCTGGGTCAGAT+TGG + Chr2:9259415-9259434 None:intergenic 60.0%
GAGGTCTGGGTCAGATTGGG+AGG + Chr2:9259411-9259430 None:intergenic 60.0%
GGAGCAGCAGAAACGGAGGA+TGG + Chr2:9259606-9259625 None:intergenic 60.0%
GGAGGGTGGAACAGGGGTTT+GGG - Chr2:9259975-9259994 MsG0280007000.01.T01:CDS 60.0%
!! CGAGGTGGGTGATGATGGTG+TGG + Chr2:9259496-9259515 None:intergenic 60.0%
!! TCGCGAAGGGAGGGTTGATG+AGG - Chr2:9260177-9260196 MsG0280007000.01.T01:CDS 60.0%
AATGGCGAGAGGTGGCGAGG+TGG + Chr2:9259511-9259530 None:intergenic 65.0%
ATGGCGAGAGGTGGCGAGGT+GGG + Chr2:9259510-9259529 None:intergenic 65.0%
CAGTGTGGGTTCACACGCGC+CGG + Chr2:9259570-9259589 None:intergenic 65.0%
GGGAGGGTGGAACAGGGGTT+TGG - Chr2:9259974-9259993 MsG0280007000.01.T01:CDS 65.0%
GGTGGCGAGGTGGGTGATGA+TGG + Chr2:9259501-9259520 None:intergenic 65.0%
TGCGGGAGCAGCAGAAACGG+AGG + Chr2:9259610-9259629 None:intergenic 65.0%
! CGTCGAAGGCGCGGTTGAAG+AGG + Chr2:9259637-9259656 None:intergenic 65.0%
! GGTAATGGCGAGAGGTGGCG+AGG + Chr2:9259514-9259533 None:intergenic 65.0%
! TGGGTTCACACGCGCCGGCG+AGG + Chr2:9259565-9259584 None:intergenic 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 9259224 9260300 9259224 ID=MsG0280007000.01;Name=MsG0280007000.01
Chr2 mRNA 9259224 9260300 9259224 ID=MsG0280007000.01.T01;Parent=MsG0280007000.01;Name=MsG0280007000.01.T01;_AED=0.25;_eAED=0.25;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|358
Chr2 exon 9259224 9260300 9259224 ID=MsG0280007000.01.T01:exon:5082;Parent=MsG0280007000.01.T01
Chr2 CDS 9259224 9260300 9259224 ID=MsG0280007000.01.T01:cds;Parent=MsG0280007000.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280007000.01.T01

ATGGGCATCAATATCATCATTGCAAAACGCTTGTTCAATTTACGTGCTGTTTATTCCACCTCTCTATTCTATTCCACCATCCCAACAACAACTCCATCCAAAACACCACTCGAAAAACAATTTGAAACCTGGATCAACCACCTCAAACCCGGTTTCACTCCAACCGATGTTAACCATGCCCTCACCTCCCAATCTGACCCAGACCTCGCTCTTGACATTTTCCGTTGGACATCCCAACAACGTTCCTACAAACACACTTCCTTAACTTACCACACCATCATCACCCACCTCGCCACCTCTCGCCATTACCAACAAGCCGAAACCTTAATTGAAGAAGTCCTCGCCGGCGCGTGTGAACCCACACTGCCTCTTTTCAACACCATCCTCCGTTTCTGCTGCTCCCGCAAGTTCCTCTTCAACCGCGCCTTCGACGTGTACAACATAATGCTAAACTCACAAGATGCTAAACCTAATCTTGAAACGTATACTTTATTGTTCAACTCACTTTTACGTAGGTTTAATAAGTTAAATGTTTGTTATGTTTATTTACGTTCAGTAAGGTCTTTAACGAAGCAGATGAAGGCAATTGGTGTTATACCGGATACTTTTGTTTTGAATATGATTATTAAAGCTTATGCTAAGTGTTTGGAAGTTGATGAGGCCATTAGGGTTTTTCGTGAAATGGGGTTGTATAATTGTGAGGCGAATGCTTATAGTTATAGTTATATTGCTAAGGGGTTGTGTGAGAAAGGGAGGGTGGAACAGGGGTTTGGGTTTTATAAGGAAATGAGGGTCAAATGTTTGGTTCCGAGTACAAGTACTTATGTGATTATTGTTTGTAGTCTTGCGTTGGAACGGAGGTTTGAGGATGCTATTGAGGTTATGTTTGATATGTTGGGGAATTCTAGGTCGCCGGATTGTCTTACTTATAAGACAGTATTGGAAGGATTGTGTCGCGAAGGGAGGGTTGATGAGGCTTTTGAATTGCTGGATGAATGTAAGAAGAGGGATATTGGTATGAATGAGAGGATGTACAAGACTCTGTTCAATGATTTGCAGTTTGTTTGCAGGGACTAG
Protein sequence

>MsG0280007000.01.T01

MGINIIIAKRLFNLRAVYSTSLFYSTIPTTTPSKTPLEKQFETWINHLKPGFTPTDVNHALTSQSDPDLALDIFRWTSQQRSYKHTSLTYHTIITHLATSRHYQQAETLIEEVLAGACEPTLPLFNTILRFCCSRKFLFNRAFDVYNIMLNSQDAKPNLETYTLLFNSLLRRFNKLNVCYVYLRSVRSLTKQMKAIGVIPDTFVLNMIIKAYAKCLEVDEAIRVFREMGLYNCEANAYSYSYIAKGLCEKGRVEQGFGFYKEMRVKCLVPSTSTYVIIVCSLALERRFEDAIEVMFDMLGNSRSPDCLTYKTVLEGLCREGRVDEAFELLDECKKRDIGMNERMYKTLFNDLQFVCRD*