AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280008793.01

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MsG0280008793.01.T01 AT1G17750 29.228 479 289 13 188 625 226 695 4.09e-28 123
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MsG0280008793.01.T01 AT4G08850 27.752 645 399 12 150 790 82 663 3.25e-51 197
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MsG0280008793.01.T01 AT3G23120 30.946 391 250 9 625 1002 82 465 1.83e-31 133
MsG0280008793.01.T01 AT1G07390 28.179 983 550 28 198 1104 6 908 1.30e-66 243
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MsG0280008793.01.T01 AT5G20480 28.691 596 317 13 151 693 61 601 4.35e-42 168
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MsG0280008793.01.T01 AT1G28440 33.160 576 354 13 333 891 58 619 5.66e-53 202
MsG0280008793.01.T01 AT1G28440 28.475 590 332 15 151 700 48 587 4.40e-34 142
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MsG0280008793.01.T01 AT5G51350 28.205 546 308 12 528 1035 88 587 5.12e-40 160
MsG0280008793.01.T01 AT5G51350 29.724 434 269 14 578 1001 76 483 9.28e-34 141
MsG0280008793.01.T01 AT5G51350 29.825 399 240 10 374 767 192 555 8.55e-31 131
MsG0280008793.01.T01 AT5G51350 33.224 304 176 9 726 1023 77 359 7.46e-27 119
MsG0280008793.01.T01 AT5G51350 28.895 353 201 5 657 1003 80 388 1.28e-26 118
MsG0280008793.01.T01 AT5G51350 26.582 553 331 16 139 643 50 575 4.27e-24 110
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MsG0280008793.01.T01 AT5G07180 31.413 538 310 16 148 673 58 548 6.21e-40 161
MsG0280008793.01.T01 AT5G07180 32.857 280 174 7 744 1011 68 345 3.65e-22 103
MsG0280008793.01.T01 AT2G32660 32.198 587 339 20 535 1079 4 573 7.34e-53 196
MsG0280008793.01.T01 AT2G32660 29.320 515 268 17 207 646 3 496 4.43e-25 112
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MsG0280008793.01.T01 AT3G47110 29.385 439 251 8 600 1002 76 491 1.37e-26 118
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MsG0280008793.01.T01 AT5G66330 29.573 328 190 8 487 813 82 369 2.65e-25 110
MsG0280008793.01.T01 AT5G66330 27.333 300 167 5 750 1021 81 357 8.07e-15 78.6
MsG0280008793.01.T01 AT5G66330 31.387 274 168 8 383 649 80 340 3.68e-13 73.6
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Find 216 sgRNAs with CRISPR-Local

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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GTGAGGTTTCCAAGGTTATT+TGG 0.168944 2:+38643711 None:intergenic
AGCAACAACTTTACTTATTC+AGG 0.175057 2:-38645667 MsG0280008793.01.T01:CDS
TTGGATTTGCTACTGGCTTT+TGG 0.183119 2:-38641274 MsG0280008793.01.T01:CDS
GAACAGATTCAATGTTGTTT+TGG 0.211682 2:+38643208 None:intergenic
TCCACACATCAAGTTGTTAT+TGG 0.213081 2:-38644068 MsG0280008793.01.T01:CDS
GATGATTGTGTGACAGATTT+AGG 0.218221 2:+38641633 None:intergenic
CAACAAAATCATTGGTGATT+TGG 0.218494 2:-38645603 MsG0280008793.01.T01:CDS
CTTGGAAACAACCTCATAAA+TGG 0.227147 2:-38642331 MsG0280008793.01.T01:CDS
AATCTATCTCACTTACTTCT+TGG 0.227537 2:-38642349 MsG0280008793.01.T01:CDS
CCTTTCCAACAACATGTTAA+TGG 0.231412 2:-38641900 MsG0280008793.01.T01:CDS
CTCATGTCCCCTATAGTTAT+TGG 0.232817 2:+38641596 None:intergenic
GCAGTTTGTGAGCAATATTT+TGG 0.237649 2:+38642374 None:intergenic
ATAAGTAAAGTTGTTGCTTT+AGG 0.240372 2:+38645672 None:intergenic
AACTGGTTTCCTTGTGGAAT+TGG 0.251304 2:+38641458 None:intergenic
TTTGTATATGACAAAGTCTT+TGG 0.264747 2:-38645708 MsG0280008793.01.T01:CDS
ATGATTGTCACTGTTCATTT+TGG 0.265409 2:+38643497 None:intergenic
GTAAGAAGAGTTATTCCTTT+AGG 0.265783 2:+38641668 None:intergenic
CATCACTCAGGTAAAGGTTT+TGG 0.267846 2:+38643607 None:intergenic
TCCAAACTCCCTAGGAAAAC+TGG 0.267882 2:-38642806 MsG0280008793.01.T01:CDS
CATGAGGTCACTTGAATCTT+TGG 0.269115 2:-38641579 MsG0280008793.01.T01:CDS
AGACTTGTCTCAAAACAATT+TGG 0.270654 2:-38642479 MsG0280008793.01.T01:CDS
GCACAATTGCCTAACCAAAA+TGG 0.272291 2:+38643327 None:intergenic
GTATCAATTCAGTTCCATTT+TGG 0.272677 2:-38643341 MsG0280008793.01.T01:CDS
TTAGGCAATTGTGCTAAATT+AGG 0.273061 2:-38643318 MsG0280008793.01.T01:CDS
TTGTCCTACAACAATCTTTC+CGG 0.275255 2:-38641482 MsG0280008793.01.T01:CDS
GGTAAAATTCCAATAACTAT+AGG 0.282949 2:-38641605 MsG0280008793.01.T01:CDS
CGGTCCAAATTGACCTAGTC+TGG 0.290090 2:+38644214 None:intergenic
GGGAAATTTCCTGATAGTTT+TGG 0.290577 2:-38642526 MsG0280008793.01.T01:CDS
GGGTCTCTTCCTAACTGTTT+TGG 0.300606 2:-38642670 MsG0280008793.01.T01:CDS
CAGATAATTTGTTTGATGAT+AGG 0.301899 2:+38642188 None:intergenic
GTAAAATTCCAATAACTATA+GGG 0.303914 2:-38641604 MsG0280008793.01.T01:CDS
TGAGGTTTCCAAGGTTATTT+GGG 0.305708 2:+38643712 None:intergenic
AGAGTTATTCCTTTAGGAAT+AGG 0.310001 2:+38641674 None:intergenic
CTCAATTATTTGGACCTTAG+TGG 0.313538 2:-38643831 MsG0280008793.01.T01:CDS
CAACTGTTAATCTTAGATAT+TGG 0.323349 2:-38642064 MsG0280008793.01.T01:CDS
CTATCATCAAACAAATTATC+TGG 0.327926 2:-38642187 MsG0280008793.01.T01:CDS
GATTGTTGTAGGACAAGTTT+AGG 0.335118 2:+38641489 None:intergenic
CTACCAGTTTCTATAAATTC+AGG 0.335236 2:-38641824 MsG0280008793.01.T01:CDS
TGAGTTAAATTCCAACAATC+AGG 0.345894 2:+38642229 None:intergenic
ATCATGTTTCACTAATCAAC+AGG 0.345926 2:+38641116 None:intergenic
CCTGCAAATAATCAACTTGA+TGG 0.346268 2:-38643429 MsG0280008793.01.T01:CDS
GGCTCTCTAACAACAATTAT+AGG 0.346883 2:-38643114 MsG0280008793.01.T01:CDS
TCTCCTGAATTTATAGAAAC+TGG 0.347082 2:+38641821 None:intergenic
TTGGGATCATACCACTCAAT+TGG 0.348726 2:+38643730 None:intergenic
GATCGTCATGGAGCTACTTA+TGG 0.352310 2:-38645630 MsG0280008793.01.T01:CDS
TGCTTTAAATTCTTCAATGA+TGG 0.357394 2:+38642085 None:intergenic
CCATCAAGTTGATTATTTGC+AGG 0.358516 2:+38643429 None:intergenic
CTTTCAGACAACAAATTTGT+TGG 0.363305 2:-38642259 MsG0280008793.01.T01:CDS
GGGGAAGTGACCCAGTGATA+TGG 0.365724 2:+38642395 None:intergenic
GTGACTTAGAAAAGTTAAAC+TGG 0.366370 2:+38641511 None:intergenic
TACACTCTGATGATGTCAAT+TGG 0.369512 2:-38643650 MsG0280008793.01.T01:CDS
TATCTAATAACAACTTGATT+GGG 0.369548 2:-38642762 MsG0280008793.01.T01:CDS
ATGATGATGGTAAACATGAT+AGG 0.372508 2:-38641331 MsG0280008793.01.T01:CDS
AAGAAGTAAGTGAGATAGAT+TGG 0.372786 2:+38642351 None:intergenic
CTGTCACACAATCATCTATC+AGG 0.375217 2:-38641626 MsG0280008793.01.T01:CDS
AAATTGATAAACTTTGGTAT+TGG 0.376319 2:+38643789 None:intergenic
GTTGCGGCAACTTGAAAATC+TGG 0.376713 2:-38642941 MsG0280008793.01.T01:CDS
GATGTCAGCGAGAGCATTAA+AGG 0.378154 2:-38641770 MsG0280008793.01.T01:CDS
CTTTCCAACAACATGTTAAT+GGG 0.380865 2:-38641899 MsG0280008793.01.T01:CDS
ATATCTAATAACAACTTGAT+TGG 0.381140 2:-38642763 MsG0280008793.01.T01:CDS
TAGAGGGTTTGCAAATTTGA+TGG 0.382866 2:+38642571 None:intergenic
TTGTTGCCAACATAAATAGA+TGG 0.383075 2:+38641419 None:intergenic
AATCCATGCTACCCACAAAA+AGG 0.383944 2:-38643939 MsG0280008793.01.T01:CDS
TTCATAAAATTGATAAACTT+TGG 0.385166 2:+38643783 None:intergenic
ATTCACATAGGCTAGTGAAT+TGG 0.387363 2:+38642429 None:intergenic
TAGGTCAATTTGGACCGAAC+TGG 0.392618 2:-38644208 MsG0280008793.01.T01:CDS
GGTACAATCCCACAAAATAT+TGG 0.394529 2:-38642598 MsG0280008793.01.T01:CDS
TCTGATGGTGTGGTGTTGTT+TGG 0.397767 2:-38645546 MsG0280008793.01.T01:CDS
TGACCCAGTGATATGGTTAT+TGG 0.399495 2:+38642402 None:intergenic
AGAACATTGAGGTGCGTCTT+GGG 0.403161 2:-38645580 MsG0280008793.01.T01:CDS
ATGGAGTTCAACAAAATCAT+TGG 0.408165 2:-38645611 MsG0280008793.01.T01:CDS
TTTGGGAAAATTGTCAAACT+TGG 0.410099 2:-38642869 MsG0280008793.01.T01:CDS
CTGAACAACAATAATTTGAC+TGG 0.410229 2:-38642691 MsG0280008793.01.T01:CDS
GAATCTGTTCCATTGTGGTT+AGG 0.410256 2:-38643195 MsG0280008793.01.T01:CDS
TTCACATAGGCTAGTGAATT+GGG 0.410619 2:+38642430 None:intergenic
TTCCTTGAACCATTGCTGTA+AGG 0.413058 2:+38641852 None:intergenic
AATTTGCAATCAGGATGTAT+TGG 0.413093 2:-38643024 MsG0280008793.01.T01:CDS
TGGTCCGGAAAGATTGTTGT+AGG 0.417408 2:+38641478 None:intergenic
TCTCTTTAATGCAAATTCTC+AGG 0.417874 2:-38641994 MsG0280008793.01.T01:CDS
TGAGGTGCGTCTTGGGGATG+CGG 0.421248 2:-38645573 MsG0280008793.01.T01:CDS
AAAAGTTGACCAAAACTATC+AGG 0.421856 2:+38642517 None:intergenic
GTAGCACTTGGATTTGCTAC+TGG 0.425043 2:-38641281 MsG0280008793.01.T01:CDS
ATGTATTGGATATGATTTAG+AGG 0.426151 2:-38643010 MsG0280008793.01.T01:CDS
TTATACAAGAAATCTGAAAC+TGG 0.431063 2:-38641735 MsG0280008793.01.T01:CDS
AAAGATTTGTTGACCCAGTT+CGG 0.432815 2:+38644194 None:intergenic
CTTTGTCATGTTAATGATAG+AGG 0.434767 2:-38641368 MsG0280008793.01.T01:CDS
AATTGAAATTGTTTCCACTA+AGG 0.435408 2:+38643817 None:intergenic
TTGCAAGGTTAAAGAAAAGA+TGG 0.436588 2:-38641148 MsG0280008793.01.T01:CDS
TGGGGATGCGGGTGCTCTGA+TGG 0.445345 2:-38645561 MsG0280008793.01.T01:CDS
TGTCAGGAACTATACCTTCA+TGG 0.445625 2:-38642030 MsG0280008793.01.T01:CDS
TGAGCCCATTAACATGTTGT+TGG 0.445664 2:+38641895 None:intergenic
GGCTCAATCCCTGACTGCAT+TGG 0.447462 2:-38641878 MsG0280008793.01.T01:CDS
GGAGTTATTCCGAGCTCGTT+TGG 0.449176 2:-38642166 MsG0280008793.01.T01:CDS
CAACAAATTTGTTGTCTGAA+AGG 0.450836 2:+38642260 None:intergenic
GTTAAACTGGACATGGTGTA+TGG 0.451663 2:+38641524 None:intergenic
ACACTCTGATGATGTCAATT+GGG 0.452421 2:-38643649 MsG0280008793.01.T01:CDS
AAATTAGGTTATCTTTCTCT+TGG 0.453431 2:-38643303 MsG0280008793.01.T01:CDS
TGGGATCATACCACTCAATT+GGG 0.454628 2:+38643731 None:intergenic
CTTGGTAACAATCACTTGAA+TGG 0.454638 2:-38642835 MsG0280008793.01.T01:CDS
GTTTCCTTGTGGAATTGGTC+CGG 0.455350 2:+38641463 None:intergenic
TTGGCAACATTCCTGATTGT+TGG 0.458449 2:-38642240 MsG0280008793.01.T01:CDS
GACATCGATGTGGGCAAAGT+TGG 0.458595 2:-38645735 None:intergenic
CAGTCATTTCCTTTCTGTTG+CGG 0.458725 2:+38644026 None:intergenic
CTCGTCGGTAATTTGCAATC+AGG 0.459393 2:-38643033 MsG0280008793.01.T01:CDS
TTGGAATGGAACCATTTATG+AGG 0.459926 2:+38642320 None:intergenic
GATGGTGTGGTGTTGTTTGG+AGG 0.460120 2:-38645543 MsG0280008793.01.T01:CDS
ATGATAGGGTTGAGAAATTG+TGG 0.460994 2:-38641316 MsG0280008793.01.T01:CDS
GTAAGGTTTCCAATGCAGTC+AGG 0.462543 2:+38641869 None:intergenic
ATGTTGTGAAAATTGACCTT+AGG 0.466510 2:-38643962 MsG0280008793.01.T01:CDS
GTCAAATTTCTAAGTGGTGA+TGG 0.473285 2:+38643255 None:intergenic
TTGAGTGGACCTATTCCTAA+AGG 0.479828 2:-38641683 MsG0280008793.01.T01:CDS
AACGATCCATCTATTTATGT+TGG 0.481322 2:-38641425 MsG0280008793.01.T01:CDS
GTTAATGATAGAGGTGAAAG+TGG 0.484208 2:-38641359 MsG0280008793.01.T01:CDS
TGTTGTTGAAGAAGGGTTGG+AGG 0.484513 2:-38641235 MsG0280008793.01.T01:CDS
ATGGAATCATGTAAATCATA+TGG 0.486856 2:-38643139 MsG0280008793.01.T01:CDS
GAGAACATTGAGGTGCGTCT+TGG 0.488329 2:-38645581 MsG0280008793.01.T01:CDS
AGATTTGCAAAGCTGAAAGT+TGG 0.489706 2:+38641927 None:intergenic
TTGAATAATAATAGTCTGCA+TGG 0.491543 2:-38642115 MsG0280008793.01.T01:CDS
CTCACCAATAACCATATCAC+TGG 0.491584 2:-38642406 MsG0280008793.01.T01:CDS
TCTGTTCCATTGTGGTTAGG+AGG 0.496759 2:-38643192 MsG0280008793.01.T01:CDS
AACCTTACAGCAATGGTTCA+AGG 0.497806 2:-38641854 MsG0280008793.01.T01:CDS
ATTGAAACTGAGATCAAGAA+AGG 0.497927 2:+38643680 None:intergenic
AACTTGGAATATGTAATCCT+TGG 0.498437 2:-38642853 MsG0280008793.01.T01:CDS
TGGTGTTGTTTGGAGGATGA+AGG 0.500797 2:-38645536 MsG0280008793.01.T01:intron
TCAATGATCAGCTGCCAACT+TGG 0.501710 2:-38642963 MsG0280008793.01.T01:CDS
ATTGGGAATTAGCGAGAGAA+AGG 0.503357 2:+38643748 None:intergenic
GTTTGGTCACCTTTCTACTC+TGG 0.505477 2:-38642149 MsG0280008793.01.T01:CDS
TTTGCACAATGAATTTGGAA+TGG 0.506007 2:+38642306 None:intergenic
AGAAGTAAGTGAGATAGATT+GGG 0.506708 2:+38642352 None:intergenic
ATCAGCTGCCAACTTGGTTG+CGG 0.508664 2:-38642957 MsG0280008793.01.T01:CDS
GAGGTGCGTCTTGGGGATGC+GGG 0.512216 2:-38645572 MsG0280008793.01.T01:CDS
ACAAATTTGTGAGGTTTCCA+AGG 0.514125 2:+38643703 None:intergenic
GTGGGTAGCATGGATTCCTA+AGG 0.514492 2:+38643946 None:intergenic
ATGCGGGTGCTCTGATGGTG+TGG 0.518724 2:-38645556 MsG0280008793.01.T01:CDS
CCAAACTCCCTAGGAAAACT+GGG 0.521412 2:-38642805 MsG0280008793.01.T01:CDS
CAACTTGATGTGTGGAGCAA+GGG 0.521570 2:+38644075 None:intergenic
ATTGGAGAGAATCAAATGTC+AGG 0.521686 2:-38642046 MsG0280008793.01.T01:CDS
TGCAACTTATACCTTTCCAT+TGG 0.523072 2:+38644000 None:intergenic
CTGTTCCATTGTGGTTAGGA+GGG 0.525217 2:-38643191 MsG0280008793.01.T01:CDS
TGAATAATAATAGTCTGCAT+GGG 0.527355 2:-38642114 MsG0280008793.01.T01:CDS
TCATCGAATCCGCAACAGAA+AGG 0.528743 2:-38644035 MsG0280008793.01.T01:CDS
CATTCAAGTGATTGTTACCA+AGG 0.533407 2:+38642836 None:intergenic
CCTTTGGAATACAGTTTGCA+AGG 0.534142 2:-38641163 MsG0280008793.01.T01:CDS
GGATCTATTCCAAACTCCCT+AGG 0.540845 2:-38642814 MsG0280008793.01.T01:CDS
AGGTTAAAGAAAAGATGGAC+AGG 0.544531 2:-38641143 MsG0280008793.01.T01:CDS
ACTCTTCTTACAGATTTACA+AGG 0.544805 2:-38641656 MsG0280008793.01.T01:CDS
CTTGGAAGTAATGCTCTCAA+TGG 0.545338 2:-38643285 MsG0280008793.01.T01:CDS
GTCACCTTTCTACTCTGGTG+TGG 0.552907 2:-38642144 MsG0280008793.01.T01:CDS
CCATTAACATGTTGTTGGAA+AGG 0.554919 2:+38641900 None:intergenic
AGGTCAATTTGGACCGAACT+GGG 0.560807 2:-38644207 MsG0280008793.01.T01:CDS
GGTCCAAATTGACCTAGTCT+GGG 0.564997 2:+38644215 None:intergenic
GGTATGATCCCAAATAACCT+TGG 0.566308 2:-38643720 MsG0280008793.01.T01:CDS
TTGTCTCAAAACAATTTGGA+AGG 0.566547 2:-38642475 MsG0280008793.01.T01:CDS
AACTCTATTTCTAACAAGGA+AGG 0.566977 2:+38643537 None:intergenic
GAGACAAGTCTAAATTGCGC+AGG 0.567026 2:+38642491 None:intergenic
AAGGAAATGACTGTTGCCAA+TGG 0.567286 2:-38644016 MsG0280008793.01.T01:CDS
ATCTAATAACAACTTGATTG+GGG 0.569136 2:-38642761 MsG0280008793.01.T01:CDS
ACAACTTGATGTGTGGAGCA+AGG 0.571103 2:+38644074 None:intergenic
GTGTCAGAAAACTCTCTGAA+TGG 0.571418 2:-38642619 MsG0280008793.01.T01:CDS
AAAGAAGTCAAATTTCTAAG+TGG 0.572091 2:+38643249 None:intergenic
TGACAAAGTCTTTGGCTCGT+CGG 0.573425 2:-38645700 MsG0280008793.01.T01:CDS
TTATGTACCTCAGTCTAGCA+TGG 0.573719 2:-38643158 MsG0280008793.01.T01:CDS
TAAGGTTTCCAATGCAGTCA+GGG 0.574225 2:+38641870 None:intergenic
GAAAGGTGACCAAACGAGCT+CGG 0.575024 2:+38642157 None:intergenic
GTTATTGGTGAGATTCACAT+AGG 0.575980 2:+38642417 None:intergenic
GGAACTATACCTTCATGGAT+AGG 0.578386 2:-38642025 MsG0280008793.01.T01:CDS
TTAAGACAAAATAAGTTCCA+AGG 0.578822 2:-38641971 MsG0280008793.01.T01:CDS
AAAATGTCGCCTATCCATGA+AGG 0.579482 2:+38642016 None:intergenic
GCAACCACACCAGAGTAGAA+AGG 0.579682 2:+38642140 None:intergenic
TAAAATTCCAATAACTATAG+GGG 0.580595 2:-38641603 MsG0280008793.01.T01:CDS
ACAAGTGCTGTTATACTACA+AGG 0.581325 2:+38642733 None:intergenic
ACCAATAACAACTTGATGTG+TGG 0.581626 2:+38644067 None:intergenic
CAAGAAAGGACAAATTTGTG+AGG 0.581761 2:+38643694 None:intergenic
TCAAGTTGCCGCAACCAAGT+TGG 0.582231 2:+38642949 None:intergenic
ACAACTTTACTTATTCAGGA+TGG 0.584726 2:-38645663 MsG0280008793.01.T01:CDS
CTTAAAGGAGATGCGCTCGT+CGG 0.585545 2:-38643048 MsG0280008793.01.T01:CDS
CATTGGAAACCTTACAGCAA+TGG 0.589124 2:-38641861 MsG0280008793.01.T01:CDS
CTCGCTAATTCCCAATTGAG+TGG 0.590501 2:-38643741 MsG0280008793.01.T01:CDS
ACTGGGAAATCTAATCCACT+TGG 0.591601 2:-38642788 MsG0280008793.01.T01:CDS
CCTTGCAAACTGTATTCCAA+AGG 0.592193 2:+38641163 None:intergenic
TGAACTGTGAAAGAGAAGGA+TGG 0.593609 2:+38643859 None:intergenic
TCTGAAACTGGTGGCCAATG+TGG 0.594039 2:-38641723 MsG0280008793.01.T01:CDS
GAATCATGTAAATCATATGG+AGG 0.594917 2:-38643136 MsG0280008793.01.T01:CDS
GGTAAAGTTAAAGATCGTCA+TGG 0.599781 2:-38645642 MsG0280008793.01.T01:CDS
TGATGATGGTAAACATGATA+GGG 0.600935 2:-38641330 MsG0280008793.01.T01:CDS
ACATTGAATCTGTTCCATTG+TGG 0.601928 2:-38643200 MsG0280008793.01.T01:CDS
ACATGACAAAGTTTCGACAA+TGG 0.602405 2:+38641380 None:intergenic
GATCAACTCTATTTCTAACA+AGG 0.607080 2:+38643533 None:intergenic
TGGTGATTTGGAGAACATTG+AGG 0.618262 2:-38645591 MsG0280008793.01.T01:CDS
GAACATTGAGGTGCGTCTTG+GGG 0.620129 2:-38645579 MsG0280008793.01.T01:CDS
AATGACTGTTGCCAATGGAA+AGG 0.620694 2:-38644011 MsG0280008793.01.T01:CDS
TGAACAACAATAATTTGACT+GGG 0.624226 2:-38642690 MsG0280008793.01.T01:CDS
TCATCATATAGTGGAACGGA+GGG 0.625857 2:-38644249 MsG0280008793.01.T01:intron
GAAAGTGGAGACGATGATGA+TGG 0.628352 2:-38641344 MsG0280008793.01.T01:CDS
CTATAAATTCAGGAGAGCCG+AGG 0.635928 2:-38641814 MsG0280008793.01.T01:CDS
GTCCAAATTGACCTAGTCTG+GGG 0.638258 2:+38644216 None:intergenic
CAATAACTATAGGGGACATG+AGG 0.640252 2:-38641595 MsG0280008793.01.T01:CDS
AATCATGTAAATCATATGGA+GGG 0.646076 2:-38643135 MsG0280008793.01.T01:CDS
GAATAATAATAGTCTGCATG+GGG 0.647871 2:-38642113 MsG0280008793.01.T01:CDS
CTTTCCGGACCAATTCCACA+AGG 0.648722 2:-38641467 MsG0280008793.01.T01:CDS
TACAAGAAATCTGAAACTGG+TGG 0.648835 2:-38641732 MsG0280008793.01.T01:CDS
TCATACCATTCAAAATACCT+CGG 0.651165 2:+38641797 None:intergenic
TAGAAAAGTTAAACTGGACA+TGG 0.652945 2:+38641517 None:intergenic
TCCAAATTGACCTAGTCTGG+GGG 0.656677 2:+38644217 None:intergenic
TCTAATAACAACTTGATTGG+GGG 0.658654 2:-38642760 MsG0280008793.01.T01:CDS
CATGATTCCATGCTAGACTG+AGG 0.662031 2:+38643151 None:intergenic
TTACTCATCATATAGTGGAA+CGG 0.664958 2:-38644253 MsG0280008793.01.T01:intron
TGTTATTAGATATGTCCAAG+TGG 0.665378 2:+38642773 None:intergenic
CTCATCATATAGTGGAACGG+AGG 0.674027 2:-38644250 MsG0280008793.01.T01:intron
TCACCAATAACCATATCACT+GGG 0.674603 2:-38642405 MsG0280008793.01.T01:CDS
TCATGTTTCACTAATCAACA+GGG 0.680317 2:+38641117 None:intergenic
TATTTGAACTGTGAAAGAGA+AGG 0.681941 2:+38643855 None:intergenic
TCTAACCCTCCTAACCACAA+TGG 0.713684 2:+38643186 None:intergenic
GTTGGCAACAAATATCTCTG+TGG 0.758578 2:-38641407 MsG0280008793.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTCATAAAATTGATAAACTT+TGG + Chr2:38643075-38643094 None:intergenic 15.0%
!!! AATTATTTTTACTAAGATAG+AGG + Chr2:38644304-38644323 None:intergenic 15.0%
!!! ATTATTTTTACTAAGATAGA+GGG + Chr2:38644303-38644322 None:intergenic 15.0%
!!! GTTACTTTTACTATAAATAT+AGG - Chr2:38642346-38642365 MsG0280008793.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTAGTAAAAATAATTTGCAA+GGG - Chr2:38644309-38644328 MsG0280008793.01.T01:intron 15.0%
!! AAATTGATAAACTTTGGTAT+TGG + Chr2:38643069-38643088 None:intergenic 20.0%
!! ATATCTAATAACAACTTGAT+TGG - Chr2:38644092-38644111 MsG0280008793.01.T01:CDS 20.0%
!! GTAAAATTCCAATAACTATA+GGG - Chr2:38645251-38645270 MsG0280008793.01.T01:intron 20.0%
!! GTTCAAATATCTCAATTATT+TGG - Chr2:38643014-38643033 MsG0280008793.01.T01:CDS 20.0%
!! TAAAATTCCAATAACTATAG+GGG - Chr2:38645252-38645271 MsG0280008793.01.T01:intron 20.0%
!! TATCTAATAACAACTTGATT+GGG - Chr2:38644093-38644112 MsG0280008793.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTTTCAGAAACGTATTTT+TGG - Chr2:38642297-38642316 MsG0280008793.01.T01:CDS 20.0%
!!! CTTAGTAAAAATAATTTGCA+AGG - Chr2:38644308-38644327 MsG0280008793.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTATTTTGCACAATGAATT+TGG + Chr2:38644557-38644576 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTCAAACAATAATTTGAG+TGG - Chr2:38645157-38645176 MsG0280008793.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTTCAGAAACGTATTTTT+GGG - Chr2:38642298-38642317 MsG0280008793.01.T01:CDS 20.0%
! AAAGAAGTCAAATTTCTAAG+TGG + Chr2:38643609-38643628 None:intergenic 25.0%
! AAATTAGGTTATCTTTCTCT+TGG - Chr2:38643552-38643571 MsG0280008793.01.T01:CDS 25.0%
! AATCATGTAAATCATATGGA+GGG - Chr2:38643720-38643739 MsG0280008793.01.T01:CDS 25.0%
! AATTGAAATTGTTTCCACTA+AGG + Chr2:38643041-38643060 None:intergenic 25.0%
! ATCTAATAACAACTTGATTG+GGG - Chr2:38644094-38644113 MsG0280008793.01.T01:CDS 25.0%
! ATGGAATCATGTAAATCATA+TGG - Chr2:38643716-38643735 MsG0280008793.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTATTGGATATGATTTAG+AGG - Chr2:38643845-38643864 MsG0280008793.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGTTTGAAAAATCCACAT+TGG + Chr2:38645149-38645168 None:intergenic 25.0%
! CAACTGTTAATCTTAGATAT+TGG - Chr2:38644791-38644810 MsG0280008793.01.T01:intron 25.0%
! CTATCATCAAACAAATTATC+TGG - Chr2:38644668-38644687 MsG0280008793.01.T01:intron 25.0%
! GGTAAAATTCCAATAACTAT+AGG - Chr2:38645250-38645269 MsG0280008793.01.T01:intron 25.0%
! GTTCTATTCACTTTGATTAT+TGG - Chr2:38642745-38642764 MsG0280008793.01.T01:CDS 25.0%
! TGAACAACAATAATTTGACT+GGG - Chr2:38644165-38644184 MsG0280008793.01.T01:CDS 25.0%
! TGAATAATAATAGTCTGCAT+GGG - Chr2:38644741-38644760 MsG0280008793.01.T01:intron 25.0%
! TTAAGACAAAATAAGTTCCA+AGG - Chr2:38644884-38644903 MsG0280008793.01.T01:intron 25.0%
! TTGAATAATAATAGTCTGCA+TGG - Chr2:38644740-38644759 MsG0280008793.01.T01:intron 25.0%
! TTTGTATATGACAAAGTCTT+TGG - Chr2:38641147-38641166 MsG0280008793.01.T01:CDS 25.0%
!! GACAATTTTCCCAAAATTTT+TGG + Chr2:38643981-38644000 None:intergenic 25.0%
!! TGCTTTAAATTCTTCAATGA+TGG + Chr2:38644773-38644792 None:intergenic 25.0%
!!! AACAGATTCAATGTTGTTTT+GGG + Chr2:38643649-38643668 None:intergenic 25.0%
!!! AGTGTAAACTTTGAGATATA+GGG - Chr2:38642378-38642397 MsG0280008793.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATAAGTAAAGTTGTTGCTTT+AGG + Chr2:38641186-38641205 None:intergenic 25.0%
!!! CAGATAATTTGTTTGATGAT+AGG + Chr2:38644670-38644689 None:intergenic 25.0%
!!! CAGATTTGGTACAATTTTAT+GGG - Chr2:38642322-38642341 MsG0280008793.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTCCCAAAATTTTTGGAAT+AGG + Chr2:38643975-38643994 None:intergenic 25.0%
AAAAACTTGAATCAAGTGTG+AGG + Chr2:38643944-38643963 None:intergenic 30.0%
AAAAATCTAGTGTCACAAGA+TGG + Chr2:38643776-38643795 None:intergenic 30.0%
AAAAGTTGACCAAAACTATC+AGG + Chr2:38644341-38644360 None:intergenic 30.0%
AAAATAACAGCACGCAAAAT+CGG + Chr2:38642282-38642301 None:intergenic 30.0%
AACGATCCATCTATTTATGT+TGG - Chr2:38645430-38645449 MsG0280008793.01.T01:intron 30.0%
AACTTGGAATATGTAATCCT+TGG - Chr2:38644002-38644021 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
AAGAAGTAAGTGAGATAGAT+TGG + Chr2:38644507-38644526 None:intergenic 30.0%
AATCTATCTCACTTACTTCT+TGG - Chr2:38644506-38644525 MsG0280008793.01.T01:intron 30.0%
AATTTGCAATCAGGATGTAT+TGG - Chr2:38643831-38643850 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
ACAACTTTACTTATTCAGGA+TGG - Chr2:38641192-38641211 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
ACTCTTCTTACAGATTTACA+AGG - Chr2:38645199-38645218 MsG0280008793.01.T01:intron 30.0%
AGAAGTAAGTGAGATAGATT+GGG + Chr2:38644506-38644525 None:intergenic 30.0%
AGACTTGTCTCAAAACAATT+TGG - Chr2:38644376-38644395 MsG0280008793.01.T01:intron 30.0%
AGCAACAACTTTACTTATTC+AGG - Chr2:38641188-38641207 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
ATGGAGTTCAACAAAATCAT+TGG - Chr2:38641244-38641263 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
ATGTTGTGAAAATTGACCTT+AGG - Chr2:38642893-38642912 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
ATTGAAACTGAGATCAAGAA+AGG + Chr2:38643178-38643197 None:intergenic 30.0%
CAAAAAATAGATGTGACCTT+TGG - Chr2:38645676-38645695 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
CCATAAAATTGTACCAAATC+TGG + Chr2:38642324-38642343 None:intergenic 30.0%
CTACCAGTTTCTATAAATTC+AGG - Chr2:38645031-38645050 MsG0280008793.01.T01:intron 30.0%
CTGAACAACAATAATTTGAC+TGG - Chr2:38644164-38644183 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
CTTTCAGACAACAAATTTGT+TGG - Chr2:38644596-38644615 MsG0280008793.01.T01:intron 30.0%
CTTTCCAACAACATGTTAAT+GGG - Chr2:38644956-38644975 MsG0280008793.01.T01:intron 30.0%
CTTTGTCATGTTAATGATAG+AGG - Chr2:38645487-38645506 MsG0280008793.01.T01:intron 30.0%
GAATAATAATAGTCTGCATG+GGG - Chr2:38644742-38644761 MsG0280008793.01.T01:intron 30.0%
GAATCATGTAAATCATATGG+AGG - Chr2:38643719-38643738 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
GATCGTTAAGTGTTAAAAAC+TGG + Chr2:38645417-38645436 None:intergenic 30.0%
GTAAGAAGAGTTATTCCTTT+AGG + Chr2:38645190-38645209 None:intergenic 30.0%
GTGACTTAGAAAAGTTAAAC+TGG + Chr2:38645347-38645366 None:intergenic 30.0%
TAACGTTACTCATCATATAG+TGG - Chr2:38642597-38642616 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
TAGAAAAGTTAAACTGGACA+TGG + Chr2:38645341-38645360 None:intergenic 30.0%
TATTTGAACTGTGAAAGAGA+AGG + Chr2:38643003-38643022 None:intergenic 30.0%
TCATACCATTCAAAATACCT+CGG + Chr2:38645061-38645080 None:intergenic 30.0%
TCTAATAACAACTTGATTGG+GGG - Chr2:38644095-38644114 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
TCTCCTGAATTTATAGAAAC+TGG + Chr2:38645037-38645056 None:intergenic 30.0%
TCTCTTTAATGCAAATTCTC+AGG - Chr2:38644861-38644880 MsG0280008793.01.T01:intron 30.0%
TGAGTTAAATTCCAACAATC+AGG + Chr2:38644629-38644648 None:intergenic 30.0%
TGTTATTAGATATGTCCAAG+TGG + Chr2:38644085-38644104 None:intergenic 30.0%
TTAGGCAATTGTGCTAAATT+AGG - Chr2:38643537-38643556 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
TTGCAAGGTTAAAGAAAAGA+TGG - Chr2:38645707-38645726 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
TTGTCTCAAAACAATTTGGA+AGG - Chr2:38644380-38644399 MsG0280008793.01.T01:intron 30.0%
TTGTGAAAGTGACTCAAAAT+TGG - Chr2:38642120-38642139 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
TTGTTGCCAACATAAATAGA+TGG + Chr2:38645439-38645458 None:intergenic 30.0%
TTTGCACAATGAATTTGGAA+TGG + Chr2:38644552-38644571 None:intergenic 30.0%
TTTGGGAAAATTGTCAAACT+TGG - Chr2:38643986-38644005 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
! ACAACTTTTCCAAAACAGTT+AGG + Chr2:38644197-38644216 None:intergenic 30.0%
! AGAGTTATTCCTTTAGGAAT+AGG + Chr2:38645184-38645203 None:intergenic 30.0%
! AGTTTGTGAGCAATATTTTG+GGG + Chr2:38644482-38644501 None:intergenic 30.0%
! ATGATTGTCACTGTTCATTT+TGG + Chr2:38643361-38643380 None:intergenic 30.0%
! ATGGTTGACCAATATTTTGT+GGG + Chr2:38644268-38644287 None:intergenic 30.0%
! CAACAAAATCATTGGTGATT+TGG - Chr2:38641252-38641271 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
! CAGTTTGTGAGCAATATTTT+GGG + Chr2:38644483-38644502 None:intergenic 30.0%
! CTTTCAGCAAACATCAATTT+TGG + Chr2:38642156-38642175 None:intergenic 30.0%
! GATAATCTTCTCCTTTTTGT+GGG + Chr2:38642930-38642949 None:intergenic 30.0%
! GCTAGTTACACAAATTTTTC+TGG - Chr2:38643387-38643406 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
! GGTCCTATTCCAAAAATTTT+GGG - Chr2:38643969-38643988 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
! GTATCAATTCAGTTCCATTT+TGG - Chr2:38643514-38643533 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
! TGATAATCTTCTCCTTTTTG+TGG + Chr2:38642931-38642950 None:intergenic 30.0%
! TGGTCCTATTCCAAAAATTT+TGG - Chr2:38643968-38643987 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
! TGTTTGCTGAAAGTACAAAT+CGG - Chr2:38642163-38642182 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
! TTACTCATCATATAGTGGAA+CGG - Chr2:38642602-38642621 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
! TTGTTTAGAGTTTGTCTCTT+TGG - Chr2:38642443-38642462 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
!! AACTCTATTTCTAACAAGGA+AGG + Chr2:38643321-38643340 None:intergenic 30.0%
!! ACACTAGATTTTTCTGGAAA+TGG - Chr2:38643783-38643802 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
!! ATGATGATGGTAAACATGAT+AGG - Chr2:38645524-38645543 MsG0280008793.01.T01:intron 30.0%
!! CAACAAATTTGTTGTCTGAA+AGG + Chr2:38644598-38644617 None:intergenic 30.0%
!! CAATTTGGAAGGCATATTTT+CGG - Chr2:38644391-38644410 MsG0280008793.01.T01:intron 30.0%
!! CAGTGTAAACTTTGAGATAT+AGG - Chr2:38642377-38642396 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
!! CCAGATTTGGTACAATTTTA+TGG - Chr2:38642321-38642340 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
!! GAAATTGTGGTTTTACTTTG+TGG - Chr2:38645552-38645571 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
!! GAACAGATTCAATGTTGTTT+TGG + Chr2:38643650-38643669 None:intergenic 30.0%
!! GATCAACTCTATTTCTAACA+AGG + Chr2:38643325-38643344 None:intergenic 30.0%
!! GTGTAAACTTTGAGATATAG+GGG - Chr2:38642379-38642398 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
!! TGATGATGGTAAACATGATA+GGG - Chr2:38645525-38645544 MsG0280008793.01.T01:intron 30.0%
!! TGTAAACTTTGAGATATAGG+GGG - Chr2:38642380-38642399 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGAAGCTTATTTTCTGAGA+AGG + Chr2:38642965-38642984 None:intergenic 30.0%
!! TTTTCTGGAAATGGACTTAA+AGG - Chr2:38643792-38643811 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
!!! AAATTTTTGGAATAGGACCA+TGG + Chr2:38643968-38643987 None:intergenic 30.0%
!!! AATTCAGTTCCATTTTGGTT+AGG - Chr2:38643519-38643538 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATTCAATGTTGTTTTGGGAA+AGG + Chr2:38643644-38643663 None:intergenic 30.0%
!!! CTTGATTCAAGTTTTTTCCA+TGG - Chr2:38643948-38643967 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
!!! TCGCTGTTTTTTTCTACTTT+TGG - Chr2:38642707-38642726 MsG0280008793.01.T01:CDS 30.0%
AAATAACAGCACGCAAAATC+GGG + Chr2:38642281-38642300 None:intergenic 35.0%
AAGAATACTCATGATCAGTC+TGG - Chr2:38641434-38641453 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
AATCCTAATAGTGTTTCCCA+AGG + Chr2:38642498-38642517 None:intergenic 35.0%
AATGGGCATCATCACTAATT+TGG - Chr2:38642080-38642099 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
ACAAATTTGTGAGGTTTCCA+AGG + Chr2:38643155-38643174 None:intergenic 35.0%
ACATGACAAAGTTTCGACAA+TGG + Chr2:38645478-38645497 None:intergenic 35.0%
ACATTGAATCTGTTCCATTG+TGG - Chr2:38643655-38643674 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
ACCAATAACAACTTGATGTG+TGG + Chr2:38642791-38642810 None:intergenic 35.0%
ACTATTAGGATTGAGTCTCT+TGG - Chr2:38642506-38642525 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
AGAAAGGCAACAACAAAACT+AGG - Chr2:38642418-38642437 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
AGATTTGCAAAGCTGAAAGT+TGG + Chr2:38644931-38644950 None:intergenic 35.0%
AGGTTAAAGAAAAGATGGAC+AGG - Chr2:38645712-38645731 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
AGTGACTCAAAATTGGAGTT+TGG - Chr2:38642127-38642146 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
ATGATAGGGTTGAGAAATTG+TGG - Chr2:38645539-38645558 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
ATGTACGCATTTACTAGTTG+AGG - Chr2:38641526-38641545 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
ATTCACATAGGCTAGTGAAT+TGG + Chr2:38644429-38644448 None:intergenic 35.0%
ATTGGAGAGAATCAAATGTC+AGG - Chr2:38644809-38644828 MsG0280008793.01.T01:intron 35.0%
CAAGAAAGGACAAATTTGTG+AGG + Chr2:38643164-38643183 None:intergenic 35.0%
CATTCAAGTGATTGTTACCA+AGG + Chr2:38644022-38644041 None:intergenic 35.0%
CCATTAACATGTTGTTGGAA+AGG + Chr2:38644958-38644977 None:intergenic 35.0%
CCTGCAAATAATCAACTTGA+TGG - Chr2:38643426-38643445 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
CCTTTCCAACAACATGTTAA+TGG - Chr2:38644955-38644974 MsG0280008793.01.T01:intron 35.0%
CTCAATTATTTGGACCTTAG+TGG - Chr2:38643024-38643043 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
CTTGGAAACAACCTCATAAA+TGG - Chr2:38644524-38644543 MsG0280008793.01.T01:intron 35.0%
GAAAAACATCACTCAGGTAA+AGG + Chr2:38643257-38643276 None:intergenic 35.0%
GAAAGGCAACAACAAAACTA+GGG - Chr2:38642419-38642438 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
GAGTAACGTTACAAAAGAGA+TGG + Chr2:38642588-38642607 None:intergenic 35.0%
GATGATTGTGTGACAGATTT+AGG + Chr2:38645225-38645244 None:intergenic 35.0%
GATTGTTGTAGGACAAGTTT+AGG + Chr2:38645369-38645388 None:intergenic 35.0%
GGCTCTCTAACAACAATTAT+AGG - Chr2:38643741-38643760 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
GGTAAAGTTAAAGATCGTCA+TGG - Chr2:38641213-38641232 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
GGTACAATCCCACAAAATAT+TGG - Chr2:38644257-38644276 MsG0280008793.01.T01:intron 35.0%
GTCAAATTTCTAAGTGGTGA+TGG + Chr2:38643603-38643622 None:intergenic 35.0%
GTTAATGATAGAGGTGAAAG+TGG - Chr2:38645496-38645515 MsG0280008793.01.T01:intron 35.0%
GTTATTGGTGAGATTCACAT+AGG + Chr2:38644441-38644460 None:intergenic 35.0%
TAGAGGGTTTGCAAATTTGA+TGG + Chr2:38644287-38644306 None:intergenic 35.0%
TCACCAATAACCATATCACT+GGG - Chr2:38644450-38644469 MsG0280008793.01.T01:intron 35.0%
TGAGGTTTCCAAGGTTATTT+GGG + Chr2:38643146-38643165 None:intergenic 35.0%
TGCAACTTATACCTTTCCAT+TGG + Chr2:38642858-38642877 None:intergenic 35.0%
TGTTGAAGAGGTTATGGTAA+AGG - Chr2:38641902-38641921 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
TTCAAGGTTGAAGACATAGT+GGG - Chr2:38641503-38641522 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
TTCACATAGGCTAGTGAATT+GGG + Chr2:38644428-38644447 None:intergenic 35.0%
TTGGAATGGAACCATTTATG+AGG + Chr2:38644538-38644557 None:intergenic 35.0%
TTGTCCTACAACAATCTTTC+CGG - Chr2:38645373-38645392 MsG0280008793.01.T01:intron 35.0%
TTTCAAGGTTGAAGACATAG+TGG - Chr2:38641502-38641521 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
! ACAAGTGCTGTTATACTACA+AGG + Chr2:38644125-38644144 None:intergenic 35.0%
! ACACTCTGATGATGTCAATT+GGG - Chr2:38643206-38643225 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
! ACCTGAGTGATGTTTTTCTT+GGG - Chr2:38643259-38643278 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
! ATTACTCTAAAAGAAGGCCA+AGG - Chr2:38641643-38641662 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
! CAGTTTGGTACTGGAAAAAT+CGG - Chr2:38642232-38642251 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
! CTAACTACGCTAGGTATTTT+AGG + Chr2:38641749-38641768 None:intergenic 35.0%
! CTTGGTAACAATCACTTGAA+TGG - Chr2:38644020-38644039 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
! CTTGTGACACTAGATTTTTC+TGG - Chr2:38643777-38643796 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
! GATGGTTGACCAATATTTTG+TGG + Chr2:38644269-38644288 None:intergenic 35.0%
! GCAGTTTGTGAGCAATATTT+TGG + Chr2:38644484-38644503 None:intergenic 35.0%
! GGGAAATTTCCTGATAGTTT+TGG - Chr2:38644329-38644348 MsG0280008793.01.T01:intron 35.0%
! GTTAAAAACTGGTTTCCTTG+TGG + Chr2:38645406-38645425 None:intergenic 35.0%
! GTTTGCTGAAAGTACAAATC+GGG - Chr2:38642164-38642183 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
! TACACTCTGATGATGTCAAT+TGG - Chr2:38643205-38643224 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
! TACCTGAGTGATGTTTTTCT+TGG - Chr2:38643258-38643277 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
! TAGATTTCCCAGTTTTCCTA+GGG + Chr2:38644060-38644079 None:intergenic 35.0%
! TCATCACTAATTTGGAGTCA+AGG - Chr2:38642088-38642107 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
! TCCACACATCAAGTTGTTAT+TGG - Chr2:38642787-38642806 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
! TGGATTACTCTAAAAGCCAA+GGG - Chr2:38641835-38641854 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
! TTACTCTAAAAGAAGGCCAA+GGG - Chr2:38641644-38641663 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
! TTAGATTTCCCAGTTTTCCT+AGG + Chr2:38644061-38644080 None:intergenic 35.0%
! TTTGCTGAAAGTACAAATCG+GGG - Chr2:38642165-38642184 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTACTTTGTGGTAGCACT+TGG - Chr2:38645562-38645581 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTCTCACTGTCAACTTTC+AGG - Chr2:38645301-38645320 MsG0280008793.01.T01:intron 35.0%
!! AAAGATTTGTTGACCCAGTT+CGG + Chr2:38642664-38642683 None:intergenic 35.0%
!! AGCAAGGTGTTGATGTTAAA+TGG - Chr2:38642062-38642081 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
!! CCATCAAGTTGATTATTTGC+AGG + Chr2:38643429-38643448 None:intergenic 35.0%
!! GAAAGTTGGCAAAGTTTTGA+TGG + Chr2:38644917-38644936 None:intergenic 35.0%
!! GCAAGGTGTTGATGTTAAAT+GGG - Chr2:38642063-38642082 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
!! GTCTCTTTGGAACAAAACTA+GGG - Chr2:38642456-38642475 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTTTGATGGAATGTTACCT+TGG + Chr2:38644904-38644923 None:intergenic 35.0%
!! TGTCTCTTTGGAACAAAACT+AGG - Chr2:38642455-38642474 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACTGGCTTTTGGGTTTTTAT+TGG - Chr2:38645592-38645611 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
!!! GGAGTTTTGTTGTTGAAGAA+GGG - Chr2:38645613-38645632 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGGAGTTTTGTTGTTGAAGA+AGG - Chr2:38645612-38645631 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTTGTTGTTGAAGAAGGGT+TGG - Chr2:38645617-38645636 MsG0280008793.01.T01:CDS 35.0%
AAAATGTCGCCTATCCATGA+AGG + Chr2:38644842-38644861 None:intergenic 40.0%
AACCTTACAGCAATGGTTCA+AGG - Chr2:38645001-38645020 MsG0280008793.01.T01:intron 40.0%
AAGGAAATGACTGTTGCCAA+TGG - Chr2:38642839-38642858 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
AAGTAGATCTTCAAGGAAGC+GGG - Chr2:38641869-38641888 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
AATCCATGCTACCCACAAAA+AGG - Chr2:38642916-38642935 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
AATGACTGTTGCCAATGGAA+AGG - Chr2:38642844-38642863 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
ACTGGGAAATCTAATCCACT+TGG - Chr2:38644067-38644086 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
AGGATTGAGTCTCTTGGTTA+CGG - Chr2:38642512-38642531 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
ATGTCATGGTGAATGCTTGT+GGG - Chr2:38641719-38641738 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
ATTGGGAATTAGCGAGAGAA+AGG + Chr2:38643110-38643129 None:intergenic 40.0%
CAAGTAGATCTTCAAGGAAG+CGG - Chr2:38641868-38641887 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
CAATAACTATAGGGGACATG+AGG - Chr2:38645260-38645279 MsG0280008793.01.T01:intron 40.0%
CAGTCATTTCCTTTCTGTTG+CGG + Chr2:38642832-38642851 None:intergenic 40.0%
CATGAGGTCACTTGAATCTT+TGG - Chr2:38645276-38645295 MsG0280008793.01.T01:intron 40.0%
CATTGGAAACCTTACAGCAA+TGG - Chr2:38644994-38645013 MsG0280008793.01.T01:intron 40.0%
CCTTGCAAACTGTATTCCAA+AGG + Chr2:38645695-38645714 None:intergenic 40.0%
CTCACCAATAACCATATCAC+TGG - Chr2:38644449-38644468 MsG0280008793.01.T01:intron 40.0%
CTCATGTCCCCTATAGTTAT+TGG + Chr2:38645262-38645281 None:intergenic 40.0%
CTGTCACACAATCATCTATC+AGG - Chr2:38645229-38645248 MsG0280008793.01.T01:intron 40.0%
CTTGGAAGTAATGCTCTCAA+TGG - Chr2:38643570-38643589 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
GAATCTGTTCCATTGTGGTT+AGG - Chr2:38643660-38643679 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
GACTCAAAATTGGAGTTTGG+AGG - Chr2:38642130-38642149 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
GCACAATTGCCTAACCAAAA+TGG + Chr2:38643531-38643550 None:intergenic 40.0%
GCTGAAACAAGGGTTTAGAA+AGG - Chr2:38642402-38642421 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
GGAACAAAACTAGGGTTTGT+GGG - Chr2:38642464-38642483 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
GGAACTATACCTTCATGGAT+AGG - Chr2:38644830-38644849 MsG0280008793.01.T01:intron 40.0%
GGTATGATCCCAAATAACCT+TGG - Chr2:38643135-38643154 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
GTGAGGTTTCCAAGGTTATT+TGG + Chr2:38643147-38643166 None:intergenic 40.0%
GTGGAACTACCTAAAATTCC+TGG - Chr2:38641928-38641947 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
GTGTCAGAAAACTCTCTGAA+TGG - Chr2:38644236-38644255 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
GTTAAACTGGACATGGTGTA+TGG + Chr2:38645334-38645353 None:intergenic 40.0%
GTTGGCAACAAATATCTCTG+TGG - Chr2:38645448-38645467 MsG0280008793.01.T01:intron 40.0%
TAAGGTTTCCAATGCAGTCA+GGG + Chr2:38644988-38645007 None:intergenic 40.0%
TACTCATGATCTACCTGTTG+AGG - Chr2:38641474-38641493 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
TATATGGATAGCACAGCTTG+CGG - Chr2:38641619-38641638 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
TCACCTTGGGAAACACTATT+AGG - Chr2:38642492-38642511 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
TCCCAAGAAAAACATCACTC+AGG + Chr2:38643263-38643282 None:intergenic 40.0%
TCTAAAAGCCAAGGGTGATT+GGG - Chr2:38641843-38641862 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
TGAACTGTGAAAGAGAAGGA+TGG + Chr2:38642999-38643018 None:intergenic 40.0%
TGACCCAGTGATATGGTTAT+TGG + Chr2:38644456-38644475 None:intergenic 40.0%
TGAGCCCATTAACATGTTGT+TGG + Chr2:38644963-38644982 None:intergenic 40.0%
TGGAACAAAACTAGGGTTTG+TGG - Chr2:38642463-38642482 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
TGGGAACAAGTAGATCTTCA+AGG - Chr2:38641862-38641881 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
TGGGATCATACCACTCAATT+GGG + Chr2:38643127-38643146 None:intergenic 40.0%
TGTAAACTTGTGGAGCTACT+TGG - Chr2:38642015-38642034 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
TGTCAGGAACTATACCTTCA+TGG - Chr2:38644825-38644844 MsG0280008793.01.T01:intron 40.0%
TTAAACACTCAACATCAGCC+TGG - Chr2:38641399-38641418 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
TTATGTACCTCAGTCTAGCA+TGG - Chr2:38643697-38643716 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
TTCCTTGAACCATTGCTGTA+AGG + Chr2:38645006-38645025 None:intergenic 40.0%
TTGAGTGGACCTATTCCTAA+AGG - Chr2:38645172-38645191 MsG0280008793.01.T01:intron 40.0%
TTGGCAACATTCCTGATTGT+TGG - Chr2:38644615-38644634 MsG0280008793.01.T01:intron 40.0%
TTGGGATCATACCACTCAAT+TGG + Chr2:38643128-38643147 None:intergenic 40.0%
! AACTGGTTTCCTTGTGGAAT+TGG + Chr2:38645400-38645419 None:intergenic 40.0%
! CATCACTCAGGTAAAGGTTT+TGG + Chr2:38643251-38643270 None:intergenic 40.0%
! GAGTGATGTTTTTCTTGGGA+GGG - Chr2:38643263-38643282 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
! GTGGATTACTCTAAAAGCCA+AGG - Chr2:38641834-38641853 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
! TCACTAATTTGGAGTCAAGG+TGG - Chr2:38642091-38642110 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
! TCATCATATAGTGGAACGGA+GGG - Chr2:38642606-38642625 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
! TGAGTGATGTTTTTCTTGGG+AGG - Chr2:38643262-38643281 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
! TGCGGGATTACTCTAAAAGA+AGG - Chr2:38641637-38641656 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
! TGGTGATTTGGAGAACATTG+AGG - Chr2:38641264-38641283 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
!! CCTTTGGAATACAGTTTGCA+AGG - Chr2:38645692-38645711 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTGTGGGTTGATTCACCTT+GGG - Chr2:38642479-38642498 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
!!! ACGTATTTTTGGGCCAGATT+TGG - Chr2:38642308-38642327 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
!!! TGGATTTGCTACTGGCTTTT+GGG - Chr2:38645582-38645601 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
!!! TTGGATTTGCTACTGGCTTT+TGG - Chr2:38645581-38645600 MsG0280008793.01.T01:CDS 40.0%
AAAAGAAGGCCAAGGGTGAT+TGG - Chr2:38641651-38641670 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
AAGGAGACCTTCAAGGAAAC+GGG - Chr2:38641678-38641697 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
ACAACTTGATGTGTGGAGCA+AGG + Chr2:38642784-38642803 None:intergenic 45.0%
ACCTTGAGATTGATGCCTAG+TGG - Chr2:38641353-38641372 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
AGAACATTGAGGTGCGTCTT+GGG - Chr2:38641275-38641294 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
AGATATAGGGGGCTGAAACA+AGG - Chr2:38642391-38642410 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
AGGTCAATTTGGACCGAACT+GGG - Chr2:38642648-38642667 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
ATATGGATAGCACAGCTTGC+GGG - Chr2:38641620-38641639 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
CAACTTGATGTGTGGAGCAA+GGG + Chr2:38642783-38642802 None:intergenic 45.0%
CAAGGAGACCTTCAAGGAAA+CGG - Chr2:38641677-38641696 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
CACCATGACATCTTCAACAC+AGG + Chr2:38641710-38641729 None:intergenic 45.0%
CATGATTCCATGCTAGACTG+AGG + Chr2:38643707-38643726 None:intergenic 45.0%
CCAAACTCCCTAGGAAAACT+GGG - Chr2:38644050-38644069 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
CCTAAAATTCCTGGCGTAGT+TGG - Chr2:38641937-38641956 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
CCTAGCGTAGTTAGACTACA+AGG - Chr2:38641755-38641774 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
CCTTGAAAATCCACCTCAAC+AGG + Chr2:38641490-38641509 None:intergenic 45.0%
CCTTGTAGTCTAACTACGCT+AGG + Chr2:38641758-38641777 None:intergenic 45.0%
CTATAAATTCAGGAGAGCCG+AGG - Chr2:38645041-38645060 MsG0280008793.01.T01:intron 45.0%
CTCCAAAGACAGCCAAAATC+GGG + Chr2:38642212-38642231 None:intergenic 45.0%
CTCCATAGTCGTACCATTAC+CGG + Chr2:38641587-38641606 None:intergenic 45.0%
CTCGCTAATTCCCAATTGAG+TGG - Chr2:38643114-38643133 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
CTGTTCCATTGTGGTTAGGA+GGG - Chr2:38643664-38643683 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
GAAAGTGGAGACGATGATGA+TGG - Chr2:38645511-38645530 MsG0280008793.01.T01:intron 45.0%
GACTGCAAGTATCTTCGAGA+AGG - Chr2:38641959-38641978 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
GAGACAAGTCTAAATTGCGC+AGG + Chr2:38644367-38644386 None:intergenic 45.0%
GAGGTTAGGGTGTAAACTTG+TGG - Chr2:38642005-38642024 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
GAGGTTATGGTAAAGGCTTG+TGG - Chr2:38641909-38641928 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
GATATAGGGGGCTGAAACAA+GGG - Chr2:38642392-38642411 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
GATCGTCATGGAGCTACTTA+TGG - Chr2:38641225-38641244 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
GATGTCATGGTGAATGCTTG+TGG - Chr2:38641718-38641737 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
GCTCCAAAGACAGCCAAAAT+CGG + Chr2:38642213-38642232 None:intergenic 45.0%
GCTGGGATTTGGGTAGAATT+AGG - Chr2:38642541-38642560 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
GGATCTATTCCAAACTCCCT+AGG - Chr2:38644041-38644060 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
GGATTGAGTCTCTTGGTTAC+GGG - Chr2:38642513-38642532 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
GGATTTGGGTAGAATTAGGC+GGG - Chr2:38642545-38642564 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
GGGATTTGGGTAGAATTAGG+CGG - Chr2:38642544-38642563 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
GGTCCAAATTGACCTAGTCT+GGG + Chr2:38642643-38642662 None:intergenic 45.0%
GTAAGGTTTCCAATGCAGTC+AGG + Chr2:38644989-38645008 None:intergenic 45.0%
GTCCAAATTGACCTAGTCTG+GGG + Chr2:38642642-38642661 None:intergenic 45.0%
GTCCTGTGTTGAAGATGTCA+TGG - Chr2:38641705-38641724 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
GTCTCGTGTTGAAGAGGTTA+TGG - Chr2:38641896-38641915 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
GTTGCGGCAACTTGAAAATC+TGG - Chr2:38643914-38643933 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
GTTTCCTTGTGGAATTGGTC+CGG + Chr2:38645395-38645414 None:intergenic 45.0%
GTTTGGTCACCTTTCTACTC+TGG - Chr2:38644706-38644725 MsG0280008793.01.T01:intron 45.0%
TACTCATGATCAGTCTGGAG+AGG - Chr2:38641439-38641458 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
TACTTGTTCCCAATCACCCT+TGG + Chr2:38641854-38641873 None:intergenic 45.0%
TAGGTCAATTTGGACCGAAC+TGG - Chr2:38642647-38642666 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
TCAATGATCAGCTGCCAACT+TGG - Chr2:38643892-38643911 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
TCATCGAATCCGCAACAGAA+AGG - Chr2:38642820-38642839 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
TCATGATCTACCTGTTGAGG+TGG - Chr2:38641477-38641496 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
TCCAAACTCCCTAGGAAAAC+TGG - Chr2:38644049-38644068 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
TCCAAATTGACCTAGTCTGG+GGG + Chr2:38642641-38642660 None:intergenic 45.0%
TCCACTAGGCATCAATCTCA+AGG + Chr2:38641357-38641376 None:intergenic 45.0%
TCTAACCCTCCTAACCACAA+TGG + Chr2:38643672-38643691 None:intergenic 45.0%
TCTGTTCCATTGTGGTTAGG+AGG - Chr2:38643663-38643682 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
TGCAAGTATCTTCGAGAAGG+CGG - Chr2:38641962-38641981 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
TGCTATCCATATAGCACCCA+AGG + Chr2:38641612-38641631 None:intergenic 45.0%
TGGTCCGGAAAGATTGTTGT+AGG + Chr2:38645380-38645399 None:intergenic 45.0%
TGTTGTTGAAGAAGGGTTGG+AGG - Chr2:38645620-38645639 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
TTGGAGGATGAAGGTGATGT+TGG - Chr2:38641328-38641347 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
! CCAACTACGCCAGGAATTTT+AGG + Chr2:38641940-38641959 None:intergenic 45.0%
! CTCATCATATAGTGGAACGG+AGG - Chr2:38642605-38642624 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
! CTCGTCGGTAATTTGCAATC+AGG - Chr2:38643822-38643841 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
! CTCTAAAAGCCAAGGGTGAT+TGG - Chr2:38641842-38641861 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
! GGGTCTCTTCCTAACTGTTT+TGG - Chr2:38644185-38644204 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
! TCTCCTTTTTGTGGGTAGCA+TGG + Chr2:38642922-38642941 None:intergenic 45.0%
! TGACAAAGTCTTTGGCTCGT+CGG - Chr2:38641155-38641174 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
!! ACTTGGTGTAGTGGGAACAA+GGG - Chr2:38642032-38642051 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
!! CCTGTTGAGGTGGATTTTCA+AGG - Chr2:38641487-38641506 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
!! GAGAGCCGAGGTATTTTGAA+TGG - Chr2:38645053-38645072 MsG0280008793.01.T01:intron 45.0%
!! GATGTCAGCGAGAGCATTAA+AGG - Chr2:38645085-38645104 MsG0280008793.01.T01:intron 45.0%
!! GTAGCACTTGGATTTGCTAC+TGG - Chr2:38645574-38645593 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
!! GTTTGTGGGTTGATTCACCT+TGG - Chr2:38642478-38642497 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
!! TACTTGGTGTAGTGGGAACA+AGG - Chr2:38642031-38642050 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
!! TCTGATGGTGTGGTGTTGTT+TGG - Chr2:38641309-38641328 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
!! TCTTTGGAGCAGTTTGGTAC+TGG - Chr2:38642223-38642242 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
!! TGGTGTTGTTTGGAGGATGA+AGG - Chr2:38641319-38641338 MsG0280008793.01.T01:CDS 45.0%
AAGACATTCCGAGGGCTGAA+GGG - Chr2:38641794-38641813 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
AATGTCTTCCGCCTTCTCGA+AGG + Chr2:38641782-38641801 None:intergenic 50.0%
ACCCTAACCTCTTCAGCCAT+CGG + Chr2:38641996-38642015 None:intergenic 50.0%
AGACATTCCGATGGCTGAAG+AGG - Chr2:38641986-38642005 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
AGTCTCTTGGTTACGGGAAG+AGG - Chr2:38642519-38642538 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
ATCAGCTGCCAACTTGGTTG+CGG - Chr2:38643898-38643917 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
CGCCCGAATGGTAAAAATCG+GGG - Chr2:38642255-38642274 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
CGGTCCAAATTGACCTAGTC+TGG + Chr2:38642644-38642663 None:intergenic 50.0%
CTTAAAGGAGATGCGCTCGT+CGG - Chr2:38643807-38643826 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
CTTTCCGGACCAATTCCACA+AGG - Chr2:38645388-38645407 MsG0280008793.01.T01:intron 50.0%
GAAAGGTGACCAAACGAGCT+CGG + Chr2:38644701-38644720 None:intergenic 50.0%
GAACAAGGGAAAGAGCAGCA+AGG - Chr2:38642046-38642065 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
GAACATTGAGGTGCGTCTTG+GGG - Chr2:38641276-38641295 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
GACATCTCCCGTTTCCTTGA+AGG + Chr2:38641688-38641707 None:intergenic 50.0%
GACTACAAGGACCTTCGAGA+AGG - Chr2:38641768-38641787 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
GAGAACATTGAGGTGCGTCT+TGG - Chr2:38641274-38641293 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
GAGATTGATGCCTAGTGGAG+CGG - Chr2:38641358-38641377 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
GCAACCACACCAGAGTAGAA+AGG + Chr2:38644718-38644737 None:intergenic 50.0%
GCGCCCGAATGGTAAAAATC+GGG - Chr2:38642254-38642273 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
GGAGATGTCTCGTGTTGAAG+AGG - Chr2:38641890-38641909 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
GGAGTTATTCCGAGCTCGTT+TGG - Chr2:38644689-38644708 MsG0280008793.01.T01:intron 50.0%
GGAGTTGAACACACCGGTAA+TGG - Chr2:38641571-38641590 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
GGCGCCCGAATGGTAAAAAT+CGG - Chr2:38642253-38642272 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
GTACGACTATGGAGGACCTT+GGG - Chr2:38641593-38641612 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
GTCACCTTTCTACTCTGGTG+TGG - Chr2:38644711-38644730 MsG0280008793.01.T01:intron 50.0%
GTGGGTAGCATGGATTCCTA+AGG + Chr2:38642912-38642931 None:intergenic 50.0%
TACAAGGACCTTCGAGAAGG+CGG - Chr2:38641771-38641790 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
TCATGATCAGTCTGGAGAGG+CGG - Chr2:38641442-38641461 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
TCCCCCAGACTAGGTCAATT+TGG - Chr2:38642637-38642656 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
TCCGATGGCTGAAGAGGTTA+GGG - Chr2:38641992-38642011 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
TCCTTGCATCCAATCACCCT+TGG + Chr2:38641663-38641682 None:intergenic 50.0%
TGAGGTGGAGTTGAACACAC+CGG - Chr2:38641565-38641584 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
TGGATGCAAGGAGACCTTCA+AGG - Chr2:38641671-38641690 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
TTCCGATGGCTGAAGAGGTT+AGG - Chr2:38641991-38642010 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
! CAAAAATCGGGGCCCGATTT+TGG - Chr2:38642197-38642216 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
! CACCGGTAATGGTACGACTA+TGG - Chr2:38641582-38641601 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
! CCCAGTTTTCCTAGGGAGTT+TGG + Chr2:38644053-38644072 None:intergenic 50.0%
! CGGTAATGGTACGACTATGG+AGG - Chr2:38641585-38641604 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
! GGATGGGAGGTGTATACTTG+TGG - Chr2:38641815-38641834 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
! GGCCCCGATTTTTACCATTC+GGG + Chr2:38642260-38642279 None:intergenic 50.0%
! GGGCCCCGATTTTTACCATT+CGG + Chr2:38642261-38642280 None:intergenic 50.0%
! TCAAGTTGCCGCAACCAAGT+TGG + Chr2:38643909-38643928 None:intergenic 50.0%
! TCTGAAACTGGTGGCCAATG+TGG - Chr2:38645132-38645151 MsG0280008793.01.T01:intron 50.0%
!! GATGGTGTGGTGTTGTTTGG+AGG - Chr2:38641312-38641331 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
!! GTGGAGCTACTTGGTGTAGT+GGG - Chr2:38642024-38642043 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
!! TGGCTGTCTTTGGAGCAGTT+TGG - Chr2:38642217-38642236 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
!! TGTGGAGCTACTTGGTGTAG+TGG - Chr2:38642023-38642042 MsG0280008793.01.T01:CDS 50.0%
ACGGGAAGAGGCTGGGATTT+GGG - Chr2:38642531-38642550 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
ACTTGCAGTCCAACTACGCC+AGG + Chr2:38641949-38641968 None:intergenic 55.0%
AGAAGGCGGAAGACATTCCG+AGG - Chr2:38641785-38641804 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
AGAGTACGCTCAGCATGAGG+TGG - Chr2:38641550-38641569 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
AGTACAAATCGGGGCCCGAA+TGG - Chr2:38642174-38642193 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
ATTCCGAGGGCTGAAGGGAT+GGG - Chr2:38641799-38641818 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
ATTCTTACCACCGCCTCTCC+AGG + Chr2:38641420-38641439 None:intergenic 55.0%
CACTCAACATCAGCCTGGAG+AGG - Chr2:38641404-38641423 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
CTTGGTTACGGGAAGAGGCT+GGG - Chr2:38642524-38642543 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
GAAGACATTCCGAGGGCTGA+AGG - Chr2:38641793-38641812 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
GAAGGCGGAAGACATTCCGA+GGG - Chr2:38641786-38641805 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
GAAGGCGGAAGACATTCCGA+TGG - Chr2:38641786-38641805 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
GCCAAGGGTGATTGGATGCA+AGG - Chr2:38641659-38641678 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
GGCCCGAATGGCAAAAATCG+GGG - Chr2:38642186-38642205 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
GGCTCAATCCCTGACTGCAT+TGG - Chr2:38644977-38644996 MsG0280008793.01.T01:intron 55.0%
GGGCCCGAATGGCAAAAATC+GGG - Chr2:38642185-38642204 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
GGGGAAGTGACCCAGTGATA+TGG + Chr2:38644463-38644482 None:intergenic 55.0%
GGGGCCCGAATGGCAAAAAT+CGG - Chr2:38642184-38642203 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
GGTACGACTATGGAGGACCT+TGG - Chr2:38641592-38641611 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
GGTAGAGTACGCTCAGCATG+AGG - Chr2:38641547-38641566 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
TACGGGAAGAGGCTGGGATT+TGG - Chr2:38642530-38642549 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
TCAACATCAGCCTGGAGAGG+CGG - Chr2:38641407-38641426 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
TCTTGGTTACGGGAAGAGGC+TGG - Chr2:38642523-38642542 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
TGGAAAAATCGGCGCCCGAA+TGG - Chr2:38642243-38642262 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
! GGAGGACCTTGGGTGCTATA+TGG - Chr2:38641603-38641622 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
! GGCCCCGATTTTTGCCATTC+GGG + Chr2:38642191-38642210 None:intergenic 55.0%
! GGGCCCCGATTTTTGCCATT+CGG + Chr2:38642192-38642211 None:intergenic 55.0%
!!! GGCCCGATTTTGGCTGTCTT+TGG - Chr2:38642207-38642226 MsG0280008793.01.T01:CDS 55.0%
CAGACGATCACCGCTCCACT+AGG + Chr2:38641371-38641390 None:intergenic 60.0%
CATTCCGAGGGCTGAAGGGA+TGG - Chr2:38641798-38641817 MsG0280008793.01.T01:CDS 60.0%
CTAGTGGAGCGGTGATCGTC+TGG - Chr2:38641369-38641388 MsG0280008793.01.T01:CDS 60.0%
TGAGGTGCGTCTTGGGGATG+CGG - Chr2:38641282-38641301 MsG0280008793.01.T01:CDS 60.0%
TGATCAGTCTGGAGAGGCGG+AGG - Chr2:38641445-38641464 MsG0280008793.01.T01:CDS 60.0%
! ATGCGGGTGCTCTGATGGTG+TGG - Chr2:38641299-38641318 MsG0280008793.01.T01:CDS 60.0%
ACATCAGCCTGGAGAGGCGG+TGG - Chr2:38641410-38641429 MsG0280008793.01.T01:CDS 65.0%
CCTCCCATCCCTTCAGCCCT+CGG + Chr2:38641805-38641824 None:intergenic 65.0%
GAGGTGCGTCTTGGGGATGC+GGG - Chr2:38641283-38641302 MsG0280008793.01.T01:CDS 65.0%
GCTGCTCTCTCCCCCAGACT+AGG - Chr2:38642628-38642647 MsG0280008793.01.T01:CDS 65.0%
TGGGGATGCGGGTGCTCTGA+TGG - Chr2:38641294-38641313 MsG0280008793.01.T01:CDS 65.0%
CCGAGGGCTGAAGGGATGGG+AGG - Chr2:38641802-38641821 MsG0280008793.01.T01:CDS 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 38641127 38645750 38641127 ID=MsG0280008793.01;Name=MsG0280008793.01
Chr2 mRNA 38641127 38645750 38641127 ID=MsG0280008793.01.T01;Parent=MsG0280008793.01;Name=MsG0280008793.01.T01;_AED=0.34;_eAED=0.34;_QI=0|0|0|1|0|0|2|0|1115
Chr2 exon 38645537 38645750 38645537 ID=MsG0280008793.01.T01:exon:57987;Parent=MsG0280008793.01.T01
Chr2 exon 38641127 38644260 38641127 ID=MsG0280008793.01.T01:exon:57986;Parent=MsG0280008793.01.T01
Chr2 CDS 38645537 38645750 38645537 ID=MsG0280008793.01.T01:cds;Parent=MsG0280008793.01.T01
Chr2 CDS 38641127 38644260 38641127 ID=MsG0280008793.01.T01:cds;Parent=MsG0280008793.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280008793.01.T01

ATGTGGGCAAAGTTGGAATCTTTGTATATGACAAAGTCTTTGGCTCGTCGGCAATTCCTAAAGCAACAACTTTACTTATTCAGGATGGTAAAGTTAAAGATCGTCATGGAGCTACTTATGGAGTTCAACAAAATCATTGGTGATTTGGAGAACATTGAGGTGCGTCTTGGGGATGCGGGTGCTCTGATGGTGTGGTGTTGTTTGGAGGATGAAGTGGAACGGAGGGCTGCTCTCTCCCCCAGACTAGGTCAATTTGGACCGAACTGGGTCAACAAATCTTTTGTGTTCTCTCTTTTCTTTTCTCTCGCTGTTTTTTTCTACTTTTGGCTTGTGATTATAACTGTTCTATTCACTTTGATTATTGGTTGCTTTATTATCCCTTGCTCCACACATCAAGTTGTTATTGGTGTGAGTTTTTCATCGAATCCGCAACAGAAAGGAAATGACTGTTGCCAATGGAAAGGTATAAGTTGCAGCAACATCATCGAACATGTTGTGAAAATTGACCTTAGGAATCCATGCTACCCACAAAAAGGAGAAGATTATCAATCAAACTGTTCCTTCTCAGAAAATAAGCTTCAAGCTCATTATATCCATCCTTCTCTTTCACAGTTCAAATATCTCAATTATTTGGACCTTAGTGGAAACAATTTCAATTCAAGTCCAATACCAAAGTTTATCAATTTTATGAATCAGTTAAAATTCCTTTCTCTCGCTAATTCCCAATTGAGTGGTATGATCCCAAATAACCTTGGAAACCTCACAAATTTGTCCTTTCTTGATCTCAGTTTCAATTCTTATTTACACTCTGATGATGTCAATTGGGTTTCAAAACTTTCATTGCTCCAAAACCTTTACCTGAGTGATGTTTTTCTTGGGAGGGCGCACAATTTATTCATGATACTTAACATGATTCCTTCCTTGTTAGAAATAGAGTTGATCAACTGCAGCTTAACCAAAATGAACAGTGACAATCATCAACTTGCTAGTTACACAAATTTTTCTGGTATTGAGTCACTCAATCCTGCAAATAATCAACTTGATGGTTCAGATCTGAATGTTTTTAGAAACATAAGTTCTTCAGTTAAATTTATTGACATTTCTAACAACAGTATCAATTCAGTTCCATTTTGGTTAGGCAATTGTGCTAAATTAGGTTATCTTTCTCTTGGAAGTAATGCTCTCAATGGCTCACTTCCATCACCACTTAGAAATTTGACTTCTTTGACATTGCTCGACCTTTCCCAAAACAACATTGAATCTGTTCCATTGTGGTTAGGAGGGTTAGAGCGTCTTATGTACCTCAGTCTAGCATGGAATCATGTAAATCATATGGAGGGCTCTCTAACAACAATTATAGGAAATATGTGCCATCTTGTGACACTAGATTTTTCTGGAAATGGACTTAAAGGAGATGCGCTCGTCGGTAATTTGCAATCAGGATGTATTGGATATGATTTAGAGGAACTCGATTTGACTAACAACAATTTCAATGATCAGCTGCCAACTTGGTTGCGGCAACTTGAAAATCTGGTAATCCTCACACTTGATTCAAGTTTTTTCCATGGTCCTATTCCAAAAATTTTGGGAAAATTGTCAAACTTGGAATATGTAATCCTTGGTAACAATCACTTGAATGGATCTATTCCAAACTCCCTAGGAAAACTGGGAAATCTAATCCACTTGGACATATCTAATAACAACTTGATTGGGGGTCTTCCTTGTAGTATAACAGCACTTGTCAGTCTAAAATATTTGATTCTGAACAACAATAATTTGACTGGGTCTCTTCCTAACTGTTTTGGAAAAGTTGTCAGTCTAGAAAGCTTTGATGTGTCAGAAAACTCTCTGAATGGTACAATCCCACAAAATATTGGTCAACCATCAAATTTGCAAACCCTCTATCTTAGTAAAAATAATTTGCAAGGGAAATTTCCTGATAGTTTTGGTCAACTTTTGAACCTGCGCAATTTAGACTTGTCTCAAAACAATTTGGAAGGCATATTTTCGGAAATAAAATTTCCCAATTCACTAGCCTATGTGAATCTCACCAATAACCATATCACTGGGTCACTTCCCCAAAATATTGCTCACAAACTGCCCAATCTATCTCACTTACTTCTTGGAAACAACCTCATAAATGGTTCCATTCCAAATTCATTGTGCAAAATAAACTCTTTGTACACTCTTGACCTTTCAGACAACAAATTTGTTGGCAACATTCCTGATTGTTGGAATTTAACTCAAAGATTGAATGATATAAACCTATCATCAAACAAATTATCTGGAGTTATTCCGAGCTCGTTTGGTCACCTTTCTACTCTGGTGTGGTTGCATTTGAATAATAATAGTCTGCATGGGGACTTTCCATCATTGAAGAATTTAAAGCAACTGTTAATCTTAGATATTGGAGAGAATCAAATGTCAGGAACTATACCTTCATGGATAGGCGACATTTTCTCTTTAATGCAAATTCTCAGGTTAAGACAAAATAAGTTCCAAGGTAACATTCCATCAAAACTTTGCCAACTTTCAGCTTTGCAAATCTTAGACCTTTCCAACAACATGTTAATGGGCTCAATCCCTGACTGCATTGGAAACCTTACAGCAATGGTTCAAGGAAAGAAACTACCAGTTTCTATAAATTCAGGAGAGCCGAGGTATTTTGAATGGTATGAACAAGATGTCAGCGAGAGCATTAAAGGAACAGAATATCATTATACAAGAAATCTGAAACTGGTGGCCAATGTGGATTTTTCAAACAATAATTTGAGTGGACCTATTCCTAAAGGAATAACTCTTCTTACAGATTTACAAGGCCTAAATCTGTCACACAATCATCTATCAGGTAAAATTCCAATAACTATAGGGGACATGAGGTCACTTGAATCTTTGGACTTTTCTCACTGTCAACTTTCAGGCACAATTCCATACACCATGTCCAGTTTAACTTTTCTAAGTCACCTAAACTTGTCCTACAACAATCTTTCCGGACCAATTCCACAAGGAAACCAGTTTTTAACACTTAACGATCCATCTATTTATGTTGGCAACAAATATCTCTGTGGTGAACCATTGTCGAAACTTTGTCATGTTAATGATAGAGGTGAAAGTGGAGACGATGATGATGGTAAACATGATAGGGTTGAGAAATTGTGGTTTTACTTTGTGGTAGCACTTGGATTTGCTACTGGCTTTTGGGTTTTTATTGGAGTTTTGTTGTTGAAGAAGGGTTGGAGGCGTGCTTATTTTAAATACATTGATGAAGTTGTACAAAAAATAGATGTGACCTTTGGAATACAGTTTGCAAGGTTAAAGAAAAGATGGACAGGAAACCCTGTTGATTAG
Protein sequence

>MsG0280008793.01.T01

MWAKLESLYMTKSLARRQFLKQQLYLFRMVKLKIVMELLMEFNKIIGDLENIEVRLGDAGALMVWCCLEDEVERRAALSPRLGQFGPNWVNKSFVFSLFFSLAVFFYFWLVIITVLFTLIIGCFIIPCSTHQVVIGVSFSSNPQQKGNDCCQWKGISCSNIIEHVVKIDLRNPCYPQKGEDYQSNCSFSENKLQAHYIHPSLSQFKYLNYLDLSGNNFNSSPIPKFINFMNQLKFLSLANSQLSGMIPNNLGNLTNLSFLDLSFNSYLHSDDVNWVSKLSLLQNLYLSDVFLGRAHNLFMILNMIPSLLEIELINCSLTKMNSDNHQLASYTNFSGIESLNPANNQLDGSDLNVFRNISSSVKFIDISNNSINSVPFWLGNCAKLGYLSLGSNALNGSLPSPLRNLTSLTLLDLSQNNIESVPLWLGGLERLMYLSLAWNHVNHMEGSLTTIIGNMCHLVTLDFSGNGLKGDALVGNLQSGCIGYDLEELDLTNNNFNDQLPTWLRQLENLVILTLDSSFFHGPIPKILGKLSNLEYVILGNNHLNGSIPNSLGKLGNLIHLDISNNNLIGGLPCSITALVSLKYLILNNNNLTGSLPNCFGKVVSLESFDVSENSLNGTIPQNIGQPSNLQTLYLSKNNLQGKFPDSFGQLLNLRNLDLSQNNLEGIFSEIKFPNSLAYVNLTNNHITGSLPQNIAHKLPNLSHLLLGNNLINGSIPNSLCKINSLYTLDLSDNKFVGNIPDCWNLTQRLNDINLSSNKLSGVIPSSFGHLSTLVWLHLNNNSLHGDFPSLKNLKQLLILDIGENQMSGTIPSWIGDIFSLMQILRLRQNKFQGNIPSKLCQLSALQILDLSNNMLMGSIPDCIGNLTAMVQGKKLPVSINSGEPRYFEWYEQDVSESIKGTEYHYTRNLKLVANVDFSNNNLSGPIPKGITLLTDLQGLNLSHNHLSGKIPITIGDMRSLESLDFSHCQLSGTIPYTMSSLTFLSHLNLSYNNLSGPIPQGNQFLTLNDPSIYVGNKYLCGEPLSKLCHVNDRGESGDDDDGKHDRVEKLWFYFVVALGFATGFWVFIGVLLLKKGWRRAYFKYIDEVVQKIDVTFGIQFARLKKRWTGNPVD*