AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280008805.01

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MsG0280008805.01.T01 AT5G27060 28.176 866 447 27 44 784 40 855 9.78e-50 191
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MsG0280008805.01.T01 AT3G25020 28.437 851 398 28 44 784 40 789 4.04e-40 161
MsG0280008805.01.T01 AT3G49670 33.725 596 352 11 397 975 51 620 1.55e-65 240
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MsG0280008805.01.T01 AT2G24130 30.849 577 310 15 153 718 82 580 4.95e-40 161
MsG0280008805.01.T01 AT2G24130 32.234 546 319 15 70 597 67 579 1.07e-37 154
MsG0280008805.01.T01 AT3G47580 32.007 553 345 9 426 969 86 616 5.26e-52 199
MsG0280008805.01.T01 AT3G47580 33.206 524 299 13 251 736 85 595 1.10e-49 192
MsG0280008805.01.T01 AT3G47580 29.319 631 374 16 43 637 23 617 9.84e-41 163
MsG0280008805.01.T01 AT3G47580 28.302 477 304 4 473 948 85 524 4.02e-40 161
MsG0280008805.01.T01 AT3G47580 28.846 416 268 8 541 948 81 476 1.42e-32 137
MsG0280008805.01.T01 AT5G51350 32.860 493 312 9 324 808 73 554 1.94e-51 196
MsG0280008805.01.T01 AT5G51350 30.435 483 296 11 525 971 100 578 6.70e-39 157
MsG0280008805.01.T01 AT5G51350 29.745 353 199 4 602 949 80 388 1.45e-28 124
MsG0280008805.01.T01 AT5G51350 33.922 283 162 7 671 948 77 339 8.82e-27 118
MsG0280008805.01.T01 AT5G51350 24.779 565 309 16 40 520 23 555 2.83e-23 107
MsG0280008805.01.T01 AT5G51350 24.941 425 272 11 123 543 173 554 3.40e-20 97.4
MsG0280008805.01.T01 AT3G47110 31.796 607 335 9 374 947 73 633 1.52e-50 194
MsG0280008805.01.T01 AT3G47110 33.793 580 350 9 398 969 78 631 3.23e-49 190
MsG0280008805.01.T01 AT3G47110 32.169 544 296 14 254 736 103 634 2.86e-38 155
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MsG0280008805.01.T01 AT3G47110 29.104 402 273 6 121 520 243 634 1.10e-24 112
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MsG0280008805.01.T01 AT2G27060 30.824 558 303 24 47 575 25 528 2.38e-36 149
MsG0280008805.01.T01 AT2G27060 28.767 438 251 12 408 790 95 526 2.68e-31 133
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MsG0280008805.01.T01 AT2G27060 28.767 438 251 12 408 790 2 433 3.64e-31 132
MsG0280008805.01.T01 AT2G27060 30.090 442 281 15 282 711 2 427 2.66e-29 126
MsG0280008805.01.T01 AT2G27060 29.864 442 244 15 261 647 5 435 3.64e-25 113
MsG0280008805.01.T01 AT3G02130 28.212 716 343 21 383 984 124 782 1.08e-37 154
MsG0280008805.01.T01 AT3G02130 25.714 805 430 26 45 785 46 746 1.13e-31 134
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MsG0280008805.01.T01 AT1G56140 30.796 289 189 5 664 947 95 377 1.02e-26 118
MsG0280008805.01.T01 AT1G56140 29.514 288 154 6 300 543 95 377 1.21e-19 95.9
MsG0280008805.01.T01 AT1G56140 31.047 277 176 5 294 567 113 377 1.70e-19 95.1
MsG0280008805.01.T01 AT1G56140 27.393 303 151 4 623 902 124 380 1.38e-17 89.0
MsG0280008805.01.T01 AT1G56140 28.571 273 155 7 254 522 144 380 5.83e-17 87.0
MsG0280008805.01.T01 AT1G56140 27.891 294 167 10 102 391 122 374 2.19e-12 72.0
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MsG0280008805.01.T01 AT1G29730 35.622 233 141 5 408 637 124 350 3.19e-24 110
MsG0280008805.01.T01 AT1G29730 31.650 297 178 7 647 943 99 370 1.06e-21 102
MsG0280008805.01.T01 AT1G29730 33.577 274 156 11 271 538 116 369 3.78e-21 100
MsG0280008805.01.T01 AT1G29730 31.930 285 155 5 356 610 94 369 4.00e-20 97.1
MsG0280008805.01.T01 AT1G29730 29.021 286 156 6 692 954 96 357 5.11e-15 80.5
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MsG0280008805.01.T01 AT2G15320 29.119 261 160 4 408 643 78 338 3.66e-21 97.4
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MsG0280008805.01.T01 AT1G56120 26.606 327 194 11 70 391 65 350 1.69e-12 72.4
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MsG0280008805.01.T01 AT3G59510 32.353 306 169 8 366 640 76 374 3.18e-23 104
MsG0280008805.01.T01 AT3G59510 29.630 297 200 5 509 803 102 391 3.66e-21 98.2
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MsG0280008805.01.T01 AT1G69550 28.873 568 358 14 223 759 660 1212 3.72e-23 107
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MsG0280008805.01.T01 AT1G64210 25.095 263 141 5 689 948 58 267 1.22e-11 69.3
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MsG0280008805.01.T01 AT1G31420 38.532 109 67 0 461 569 81 189 4.00e-11 67.4
MsG0280008805.01.T01 AT1G31420 34.545 110 72 0 411 520 79 188 6.20e-11 67.0
MsG0280008805.01.T01 AT1G31420 35.897 117 75 0 475 591 71 187 1.63e-13 75.1
MsG0280008805.01.T01 AT1G31420 36.667 120 75 1 689 808 69 187 4.17e-13 73.9
MsG0280008805.01.T01 AT1G31420 34.167 120 79 0 424 543 68 187 9.62e-13 72.8
MsG0280008805.01.T01 AT1G31420 33.939 165 102 4 863 1021 103 266 3.85e-12 70.9
MsG0280008805.01.T01 AT1G31420 32.450 151 90 3 495 633 61 211 6.91e-12 70.1
MsG0280008805.01.T01 AT1G31420 38.532 109 67 0 461 569 81 189 4.00e-11 67.4
MsG0280008805.01.T01 AT1G31420 34.545 110 72 0 411 520 79 188 6.20e-11 67.0
MsG0280008805.01.T01 AT4G03390 30.714 140 95 1 449 588 69 206 6.25e-13 73.6
MsG0280008805.01.T01 AT4G03390 30.714 140 95 1 449 588 69 206 6.25e-13 73.6
MsG0280008805.01.T01 AT5G58300 40.000 125 71 3 471 595 105 225 7.23e-13 73.2
MsG0280008805.01.T01 AT5G58300 30.366 191 103 4 356 546 64 224 3.48e-12 71.2
MsG0280008805.01.T01 AT5G58300 40.000 125 71 3 471 595 105 225 7.23e-13 73.2
MsG0280008805.01.T01 AT5G58300 30.366 191 103 4 356 546 64 224 3.48e-12 71.2
MsG0280008805.01.T01 AT5G58300 40.000 125 71 3 471 595 105 225 7.23e-13 73.2
MsG0280008805.01.T01 AT5G58300 30.366 191 103 4 356 546 64 224 3.48e-12 71.2
MsG0280008805.01.T01 AT1G54470 31.905 210 114 5 544 749 227 411 7.54e-13 72.4
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MsG0280008805.01.T01 AT3G02880 35.333 150 90 4 667 814 62 206 1.62e-12 72.0
MsG0280008805.01.T01 AT2G26730 33.333 147 94 2 404 549 64 207 1.02e-12 72.8
MsG0280008805.01.T01 AT2G26730 33.537 164 100 3 417 574 48 208 5.06e-12 70.5
MsG0280008805.01.T01 AT2G26730 35.616 146 88 3 454 597 66 207 8.06e-11 66.6
MsG0280008805.01.T01 AT1G60800 33.544 158 90 4 843 990 83 235 1.06e-12 72.8
MsG0280008805.01.T01 AT1G60800 33.544 158 90 4 843 990 16 168 1.24e-12 72.4
MsG0280008805.01.T01 AT5G63710 40.984 122 67 2 430 551 57 173 1.34e-12 72.4
MsG0280008805.01.T01 AT5G63710 40.984 122 67 2 430 551 57 173 1.34e-12 72.4
MsG0280008805.01.T01 AT1G53730 34.228 149 94 2 406 554 96 240 1.44e-12 72.4
MsG0280008805.01.T01 AT1G53730 34.247 146 92 3 596 741 94 235 6.02e-11 67.0
MsG0280008805.01.T01 AT1G53730 34.228 149 94 2 406 554 96 240 1.47e-12 72.4
MsG0280008805.01.T01 AT1G53730 34.247 146 92 3 596 741 94 235 6.18e-11 67.0
MsG0280008805.01.T01 AT5G63710 40.984 122 67 2 430 551 92 208 1.53e-12 72.0
MsG0280008805.01.T01 AT5G63710 40.984 122 67 2 430 551 93 209 1.73e-12 72.0
MsG0280008805.01.T01 AT4G23740 38.760 129 76 3 466 592 80 207 1.87e-12 72.0
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MsG0280008805.01.T01 AT4G23740 38.760 129 76 3 466 592 80 207 1.87e-12 72.0
MsG0280008805.01.T01 AT4G23740 39.695 131 74 5 561 688 79 207 6.76e-11 67.0
MsG0280008805.01.T01 AT5G65240 34.239 184 111 5 390 568 23 201 2.12e-12 71.6
MsG0280008805.01.T01 AT5G65240 34.239 184 111 5 390 568 23 201 2.73e-12 71.2
MsG0280008805.01.T01 AT5G16590 29.167 168 109 2 389 549 39 203 3.07e-12 71.2
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MsG0280008805.01.T01 AT3G25510 26.452 465 306 13 425 885 453 885 3.87e-12 71.2
MsG0280008805.01.T01 AT1G48480 30.769 156 104 2 397 551 63 215 5.30e-12 70.5
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MsG0280008805.01.T01 AT1G63430 37.838 111 69 0 430 540 69 179 7.05e-12 70.1
MsG0280008805.01.T01 AT1G63430 31.915 188 102 5 689 876 64 225 8.02e-12 70.1
MsG0280008805.01.T01 AT1G63430 32.278 158 89 1 410 549 73 230 1.99e-11 68.6
MsG0280008805.01.T01 AT1G63430 29.101 189 100 3 509 695 76 232 2.90e-11 68.2
MsG0280008805.01.T01 AT4G16162 39.175 97 58 1 415 511 36 131 7.55e-12 64.7
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MsG0280008805.01.T01 AT1G63430 29.101 189 100 3 509 695 76 232 3.32e-11 67.8
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MsG0280008805.01.T01 AT5G24100 28.655 171 116 3 356 525 49 214 8.13e-11 66.6
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MsG0280008805.01.T01 AT5G45800 28.685 251 143 7 408 654 82 300 1.54e-11 68.6
MsG0280008805.01.T01 AT5G45800 31.604 212 134 7 456 661 57 263 4.88e-11 67.0
MsG0280008805.01.T01 AT5G45800 28.302 212 101 6 738 946 76 239 5.28e-11 67.0
MsG0280008805.01.T01 AT4G31250 31.210 157 102 4 484 638 59 211 1.55e-11 68.9
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MsG0280008805.01.T01 AT5G10290 41.111 90 53 0 859 948 71 160 1.57e-11 68.9
MsG0280008805.01.T01 AT5G10290 35.795 176 98 5 376 546 21 186 3.53e-11 67.8
MsG0280008805.01.T01 AT4G16162 31.783 129 87 1 415 543 36 163 1.62e-11 64.7
MsG0280008805.01.T01 AT4G16162 31.343 134 89 3 463 595 36 167 8.81e-11 62.4
MsG0280008805.01.T01 AT4G16162 31.783 129 87 1 415 543 36 163 1.62e-11 64.7
MsG0280008805.01.T01 AT4G16162 31.343 134 89 3 463 595 36 167 8.81e-11 62.4
MsG0280008805.01.T01 AT5G65830 36.641 131 78 2 846 971 92 222 1.65e-11 66.6
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MsG0280008805.01.T01 AT5G45800 32.093 215 134 8 456 663 57 266 9.57e-11 66.6
MsG0280008805.01.T01 AT5G45800 28.302 212 101 6 738 946 76 239 9.90e-11 66.2
MsG0280008805.01.T01 AT3G28450 40.833 120 60 4 862 975 106 220 4.18e-11 67.4
MsG0280008805.01.T01 AT5G35390 30.588 170 103 6 855 1019 118 277 4.76e-11 67.4
MsG0280008805.01.T01 AT1G10850 36.111 144 81 5 451 591 70 205 9.45e-11 66.6

Find 208 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 509 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GCAATCTATGAGCAATATTT+TGG 0.119601 2:-39003211 None:intergenic
TTCTCTCAGGGTCAACTTTC+AGG 0.129277 2:+39004034 MsG0280008805.01.T01:CDS
GAAAGAGAAGGATGGATTTC+TGG 0.168033 2:-39001646 None:intergenic
TTTGAAATTTGTGGCCAATT+TGG 0.173132 2:+39003865 MsG0280008805.01.T01:CDS
TTGGATTTGCTACTGGCTTT+TGG 0.191316 2:+39004308 MsG0280008805.01.T01:CDS
GTCAGAAGAGTTATTTCTTT+TGG 0.194530 2:-39003920 None:intergenic
AATGATTGTGTGACAGATTT+AGG 0.202249 2:-39003955 None:intergenic
TTGTCCTACAACAACCTTTC+AGG 0.206903 2:+39004106 MsG0280008805.01.T01:CDS
GTGAGGTTTCCAAGGTTATT+TGG 0.210709 2:-39001802 None:intergenic
CTTTCAGTGAACAAATTAAT+TGG 0.215859 2:+39003326 MsG0280008805.01.T01:CDS
ATTCTAACTGATTCATAAAA+TGG 0.220358 2:-39001741 None:intergenic
GCACAATTACTCAACCAAAT+TGG 0.226950 2:-39002183 None:intergenic
AATCTTACTCACTTGCTTCT+TGG 0.228167 2:+39003236 MsG0280008805.01.T01:CDS
CTTACTTTAATTTCATTGAT+AGG 0.244114 2:+39004374 MsG0280008805.01.T01:CDS
AACTGGTTTCCTTGTGGAAT+TGG 0.254920 2:-39004130 None:intergenic
CATCACTCAGGTAAAGCTTT+TGG 0.259165 2:-39001906 None:intergenic
TCCAAACTCCCTAGGAAAAC+TGG 0.267882 2:+39002707 MsG0280008805.01.T01:CDS
AAATTGAATCTGTTCCATTA+TGG 0.268029 2:+39002310 MsG0280008805.01.T01:CDS
TTAACCTTAGAATCTGCATT+AGG 0.277550 2:-39003598 None:intergenic
ACTTTCAGCTTTGCAAATCT+TGG 0.280553 2:+39003664 MsG0280008805.01.T01:CDS
TCTCCCTAATGCAGATTCTA+AGG 0.282834 2:+39003594 MsG0280008805.01.T01:CDS
TACACTCTGATGATGTCTAT+TGG 0.288666 2:+39001863 MsG0280008805.01.T01:CDS
TATCTAATAACCACTTGTTT+GGG 0.289694 2:+39002751 MsG0280008805.01.T01:CDS
GGGAAATTTCCTGATAGTTT+TGG 0.290577 2:+39003059 MsG0280008805.01.T01:CDS
CTGAACAATAATAATTTAAC+TGG 0.292133 2:+39002822 MsG0280008805.01.T01:CDS
AGACTTGTCTCTCAACAATT+TGG 0.292446 2:+39003106 MsG0280008805.01.T01:CDS
CTATCTAATAACCACTTGTT+TGG 0.304987 2:+39002750 MsG0280008805.01.T01:CDS
TGAGGTTTCCAAGGTTATTT+GGG 0.305708 2:-39001801 None:intergenic
GTTGGGGCAACTTGAAAATA+TGG 0.308538 2:+39002572 MsG0280008805.01.T01:CDS
CTTAGTTATTTAGACCTTAG+TGG 0.317297 2:+39001682 MsG0280008805.01.T01:CDS
CTTTCATCGAACAAATTATC+AGG 0.319201 2:+39003398 MsG0280008805.01.T01:CDS
ACACTCTGATGATGTCTATT+GGG 0.324100 2:+39001864 MsG0280008805.01.T01:CDS
CACATATTTCCTAGCATTGT+TGG 0.332714 2:-39002405 None:intergenic
TCACTCAATCTTGCAGATAA+TGG 0.333326 2:+39002075 MsG0280008805.01.T01:CDS
GTTGTTTGATAAATCCAAAT+TGG 0.338068 2:-39003879 None:intergenic
TTGAATAATAACAATCTTCA+TGG 0.346707 2:+39003470 MsG0280008805.01.T01:CDS
ATGAATTGTCCAATACAATT+AGG 0.350058 2:-39002852 None:intergenic
GGTACAATCCCACAAAATAT+TGG 0.353537 2:+39002987 MsG0280008805.01.T01:CDS
AAACTTGACTCTCTTTATCT+TGG 0.357405 2:+39002207 MsG0280008805.01.T01:CDS
CTTCTCTTCCTTTAATGACC+TGG 0.362271 2:-39003826 None:intergenic
TGAGTTGAATTCCAACAATC+AGG 0.365465 2:-39003356 None:intergenic
CTTGGAAGCAATGCTCTTAA+CGG 0.366161 2:+39002225 MsG0280008805.01.T01:CDS
GGATATCTTCCTAATTGTAT+TGG 0.372631 2:+39002843 MsG0280008805.01.T01:CDS
CTTGCAGATAATGGACTTGA+TGG 0.374558 2:+39002084 MsG0280008805.01.T01:CDS
TTTAAATTTCTCAAGAATGA+TGG 0.385717 2:-39003500 None:intergenic
ATTCACATAGGCTAGTGAAT+TGG 0.387363 2:-39003156 None:intergenic
GATCAGCTGCCTACATGGTT+GGG 0.388804 2:+39002555 MsG0280008805.01.T01:CDS
TGATAATCGTCTCCTCTTTG+TGG 0.389408 2:-39001586 None:intergenic
TAACCTTAGAATCTGCATTA+GGG 0.390136 2:-39003597 None:intergenic
TTGGGATGATACCACTCAAA+TGG 0.391415 2:-39001783 None:intergenic
CTGATCATTGAAATTGTTGT+TGG 0.392123 2:-39002538 None:intergenic
CATCATTAAGACTTTCCTCT+TGG 0.396892 2:+39001473 MsG0280008805.01.T01:CDS
TGAATCGTTGGACTTCTCTC+AGG 0.403485 2:+39004021 MsG0280008805.01.T01:CDS
AAGAAGCAAGTGAGTAAGAT+TGG 0.405021 2:-39003234 None:intergenic
TTCAATATATGTCGACTCAC+TGG 0.407470 2:-39003783 None:intergenic
TTTGGGAAAATTGTCAAACT+TGG 0.410099 2:+39002644 MsG0280008805.01.T01:CDS
GAATCTGTTCCATTATGGTT+AGG 0.410128 2:+39002315 MsG0280008805.01.T01:CDS
TTCACATAGGCTAGTGAATT+GGG 0.410619 2:-39003155 None:intergenic
TTGGCAACATTCCTGATTGT+TGG 0.410936 2:+39003345 MsG0280008805.01.T01:CDS
ATGACAGGGCTGAGAAACTA+TGG 0.415140 2:+39004266 MsG0280008805.01.T01:CDS
TCTAACCCACCTAACCATAA+TGG 0.415361 2:-39002324 None:intergenic
AAGATAAAGAGAGTCAAGTT+TGG 0.419419 2:-39002205 None:intergenic
AAAAGTTGACCAAAACTATC+AGG 0.421856 2:-39003068 None:intergenic
CAGGATAAAGAAAAGATGTA+TGG 0.427363 2:+39004405 MsG0280008805.01.T01:CDS
TGGTCCTGAAAGGTTGTTGT+AGG 0.427465 2:-39004110 None:intergenic
CAAACAAGTGGTTATTAGAT+AGG 0.429919 2:-39002749 None:intergenic
GATGTCAGCCAGGTCATTAA+AGG 0.429958 2:+39003818 MsG0280008805.01.T01:CDS
TTGGTATAGAACCCTCAATA+TGG 0.430432 2:-39002386 None:intergenic
AAATGGATAAAAGTTGGTAT+TGG 0.430643 2:-39001724 None:intergenic
GGGGTAGTGACCCAGTGATA+TGG 0.431523 2:-39003190 None:intergenic
TGACCCAGTGATATGGTTAT+TGG 0.432707 2:-39003183 None:intergenic
AATTGAAATTGTTTCCACTA+AGG 0.433236 2:-39001696 None:intergenic
TTGATGATGGTAAGCATGAC+AGG 0.433926 2:+39004251 MsG0280008805.01.T01:CDS
GTAGCAATTGGATTTGCTAC+TGG 0.435496 2:+39004301 MsG0280008805.01.T01:CDS
GATAATCGTCTCCTCTTTGT+GGG 0.435930 2:-39001585 None:intergenic
GTCAAATTTCTAAGAGCTGA+TGG 0.440688 2:-39002255 None:intergenic
TTTCTAAAAGCATTCAGATC+TGG 0.445069 2:-39002108 None:intergenic
TTGTCTGGAAACAGACTTCA+AGG 0.448539 2:+39002447 MsG0280008805.01.T01:CDS
TTCATAAAATGGATAAAAGT+TGG 0.449029 2:-39001730 None:intergenic
ATGCAACGGATCTGGTTTAG+AGG 0.449888 2:+39002503 MsG0280008805.01.T01:CDS
GGTCAATCCCACACTGCGTT+GGG 0.452806 2:+39003711 MsG0280008805.01.T01:CDS
TGTCGGGAACTATACCTTCA+TGG 0.453109 2:+39003558 MsG0280008805.01.T01:CDS
CTTGCTAACAATCACTTGAA+TGG 0.461661 2:+39002678 MsG0280008805.01.T01:CDS
GAGGGCACAAAATTTATTGA+AGG 0.464318 2:+39001939 MsG0280008805.01.T01:CDS
TCTGTTCCATTATGGTTAGG+TGG 0.467893 2:+39002318 MsG0280008805.01.T01:CDS
TCATGTTTCACTAATCAATA+CGG 0.470688 2:-39004432 None:intergenic
ATGTTATCAAAATTGACCTT+AGG 0.470902 2:+39001551 MsG0280008805.01.T01:CDS
TCTGCAAGATGCAACGGATC+TGG 0.472252 2:+39002495 MsG0280008805.01.T01:CDS
GGTAAAATTCCTACAGCCAT+AGG 0.472929 2:+39003983 MsG0280008805.01.T01:CDS
TGAATAATAACAATCTTCAT+GGG 0.473849 2:+39003471 MsG0280008805.01.T01:CDS
GTCAGCTTTCAACTTTGCTA+TGG 0.474722 2:+39003441 MsG0280008805.01.T01:CDS
TGACCCCATCAACATGTTGT+TGG 0.475315 2:-39003693 None:intergenic
ATCATTAAGACTTTCCTCTT+GGG 0.475524 2:+39001474 MsG0280008805.01.T01:CDS
TCTATCCAACAACATGTTGA+TGG 0.476950 2:+39003688 MsG0280008805.01.T01:CDS
TTGGAATGGAGTCATTTATG+AGG 0.478677 2:-39003265 None:intergenic
AATGATCCATCTATTTATGT+TGG 0.479064 2:+39004163 MsG0280008805.01.T01:CDS
AACCTTGATGTGTCAGAAAA+CGG 0.479163 2:+39002957 MsG0280008805.01.T01:CDS
CTGTCACACAATCATTTGTC+AGG 0.479478 2:+39003962 MsG0280008805.01.T01:CDS
AATTCTAATTCTAGCAAAGA+AGG 0.480897 2:-39001976 None:intergenic
CATTCAAGTGATTGTTAGCA+AGG 0.482674 2:-39002677 None:intergenic
CTTCTGTCACTAGATTTGTC+TGG 0.485423 2:+39002432 MsG0280008805.01.T01:CDS
TTGTTGCCAACATAAATAGA+TGG 0.486116 2:-39004169 None:intergenic
AAGTAAAACTATTGTTAGAA+AGG 0.486395 2:-39002155 None:intergenic
GAAAGCTGACCGAACGAGCT+TGG 0.487445 2:-39003428 None:intergenic
TTACTTTAATTTCATTGATA+GGG 0.487970 2:+39004375 MsG0280008805.01.T01:CDS
CTCACCAATAACCATATCAC+TGG 0.491584 2:+39003179 MsG0280008805.01.T01:CDS
TGATCAGCTGCCTACATGGT+TGG 0.492379 2:+39002554 MsG0280008805.01.T01:CDS
ACTAATTGCTCAAGACTCCT+AGG 0.493412 2:-39002924 None:intergenic
AAGGAAATGACTGTTGCAAA+TGG 0.496037 2:+39001497 MsG0280008805.01.T01:CDS
TGGGATGATACCACTCAAAT+GGG 0.496059 2:-39001782 None:intergenic
ATTGAAACTGAGATCAAGAA+AGG 0.497927 2:-39001833 None:intergenic
CATGAAGTTACTTGAATCGT+TGG 0.500555 2:+39004009 MsG0280008805.01.T01:CDS
CAACTGTTAATCTTAGACAT+TGG 0.500654 2:+39003524 MsG0280008805.01.T01:CDS
CTGTTCCATTATGGTTAGGT+GGG 0.502075 2:+39002319 MsG0280008805.01.T01:CDS
GTAAAATTCCTACAGCCATA+GGG 0.502238 2:+39003984 MsG0280008805.01.T01:CDS
CAATTAATTTGTTCACTGAA+AGG 0.503091 2:-39003325 None:intergenic
GTGAGTCGACATATATTGAA+TGG 0.503939 2:+39003786 MsG0280008805.01.T01:CDS
AATGGGAATCAGAGATAGAA+AGG 0.505145 2:-39001765 None:intergenic
ATCTCTGATTCCCATTTGAG+TGG 0.506280 2:+39001772 MsG0280008805.01.T01:CDS
GAATCATGTGAACCATATTG+AGG 0.508599 2:+39002374 MsG0280008805.01.T01:CDS
AGAAGCAAGTGAGTAAGATT+GGG 0.511321 2:-39003233 None:intergenic
TCTCCTCTTTGTGGGTAGCA+TGG 0.511458 2:-39001577 None:intergenic
TAAAATTTGAAAGAGAAGGA+TGG 0.511613 2:-39001654 None:intergenic
CTTGTGGAATTGGTCCTGAA+AGG 0.512688 2:-39004120 None:intergenic
TCAATGATCAGCTGCCTACA+TGG 0.516682 2:+39002550 MsG0280008805.01.T01:CDS
CTTAGTCAAAATAAATTGCA+AGG 0.519434 2:+39003038 MsG0280008805.01.T01:CDS
ATGATCATGACTGTGCATCT+TGG 0.519446 2:-39002016 None:intergenic
AAGTAACTTCATGTCCCCTA+TGG 0.519737 2:-39003999 None:intergenic
TTTGCAGATTGAATTTGGAA+TGG 0.520898 2:-39003279 None:intergenic
GTGGGTAGCATGGATTCCTA+AGG 0.521203 2:-39001567 None:intergenic
GGTGTTATTCCAAGCTCGTT+CGG 0.521393 2:+39003419 MsG0280008805.01.T01:CDS
CCAAACTCCCTAGGAAAACT+GGG 0.521412 2:+39002708 MsG0280008805.01.T01:CDS
TATATAAAATTTGAAAGAGA+AGG 0.526500 2:-39001658 None:intergenic
CTATCCAACAACATGTTGAT+GGG 0.528188 2:+39003689 MsG0280008805.01.T01:CDS
TTATCAAACAACAATTTGAG+TGG 0.530916 2:+39003890 MsG0280008805.01.T01:CDS
AAAGAAATAACTCTTCTGAC+TGG 0.537929 2:+39003923 MsG0280008805.01.T01:CDS
TTAAGACTTTCCTCTTGGGA+AGG 0.539491 2:+39001478 MsG0280008805.01.T01:CDS
ATTGGAGAGAATCAAATGTC+GGG 0.544504 2:+39003542 MsG0280008805.01.T01:CDS
GGTATCATCCCAAATAACCT+TGG 0.546539 2:+39001793 MsG0280008805.01.T01:CDS
TGTCGACTCACTGGGTGCTA+AGG 0.547600 2:-39003774 None:intergenic
ATGATTAGAAGAAATAATCA+AGG 0.552591 2:-39002886 None:intergenic
GGAACTATTCCAAACTCCCT+AGG 0.553443 2:+39002699 MsG0280008805.01.T01:CDS
ATCAGCTGCCTACATGGTTG+GGG 0.553792 2:+39002556 MsG0280008805.01.T01:CDS
GAAAGTTTGCAAAGATGTGA+TGG 0.554185 2:-39003647 None:intergenic
AATCATGTGAACCATATTGA+GGG 0.554710 2:+39002375 MsG0280008805.01.T01:CDS
TCAATATATGTCGACTCACT+GGG 0.557682 2:-39003782 None:intergenic
GGTTCTATACCAACAATGCT+AGG 0.559326 2:+39002396 MsG0280008805.01.T01:CDS
AGGATAAAGAAAAGATGTAT+GGG 0.560709 2:+39004406 MsG0280008805.01.T01:CDS
GTTGATAATAGAGATGAAAG+TGG 0.562415 2:+39004226 MsG0280008805.01.T01:CDS
TATGTTGGCAACAATCTTTG+TGG 0.562753 2:+39004178 MsG0280008805.01.T01:CDS
GTGTCAGAAAACGGTCTGAA+TGG 0.565384 2:+39002966 MsG0280008805.01.T01:CDS
GGGTCAATCCCACACTGCGT+TGG 0.565613 2:+39003710 MsG0280008805.01.T01:CDS
TTGTCTCTCAACAATTTGGA+AGG 0.567327 2:+39003110 MsG0280008805.01.T01:CDS
CATTGGAGAGAATCAAATGT+CGG 0.568385 2:+39003541 MsG0280008805.01.T01:CDS
TTACAGCAATGATTCAAGGA+TGG 0.573038 2:+39003738 MsG0280008805.01.T01:CDS
ATCTAATAACCACTTGTTTG+GGG 0.575578 2:+39002752 MsG0280008805.01.T01:CDS
GTTATTGGTGAGATTCACAT+AGG 0.575980 2:-39003168 None:intergenic
GAGACAAGTCTAAATTGCGC+AGG 0.576823 2:-39003094 None:intergenic
TTCTAGCAAAGAAGGAAGCA+TGG 0.577865 2:-39001968 None:intergenic
CATGATTCCATGAAATGTTG+AGG 0.578751 2:-39002359 None:intergenic
GAATCGTTGGACTTCTCTCA+GGG 0.580141 2:+39004022 MsG0280008805.01.T01:CDS
GGAACTATACCTTCATGGAT+AGG 0.581107 2:+39003563 MsG0280008805.01.T01:CDS
ACAAGTGCTGTTATACTACA+AGG 0.583497 2:-39002780 None:intergenic
CTTGTTGAAGAAGGGTCGGA+GGG 0.585471 2:+39004348 MsG0280008805.01.T01:CDS
TAAAATTCCCAACGCAGTGT+GGG 0.590861 2:-39003718 None:intergenic
TTAGTCAAAATAAATTGCAA+GGG 0.592263 2:+39003039 MsG0280008805.01.T01:CDS
AAAATGTCACCTATCCATGA+AGG 0.592613 2:-39003572 None:intergenic
TCAAGTTGCCCCAACCATGT+AGG 0.593409 2:-39002564 None:intergenic
TCTAATAACCACTTGTTTGG+GGG 0.595833 2:+39002753 MsG0280008805.01.T01:CDS
ATAAGTTGCAGCAACATCAC+AGG 0.596127 2:+39001526 MsG0280008805.01.T01:CDS
TTAAGACAAAACAAGTTCCA+AGG 0.597429 2:+39003617 MsG0280008805.01.T01:CDS
AATGACTGTTGCAAATGGAA+AGG 0.598156 2:+39001502 MsG0280008805.01.T01:CDS
GATGAAAGTGGAGTTGATGA+TGG 0.599654 2:+39004238 MsG0280008805.01.T01:CDS
ACTGGGAAATCTAACCCACT+TGG 0.603051 2:+39002725 MsG0280008805.01.T01:CDS
ATCAAATCATGGTCTTGTCG+AGG 0.607754 2:+38998252 None:intergenic
TTACAATCTGCAAGATGCAA+CGG 0.608456 2:+39002489 MsG0280008805.01.T01:CDS
GGAAAGGTCAAGCAATGTCA+AGG 0.612768 2:-39002280 None:intergenic
TACTTGCAAAGACACTATAA+CGG 0.615514 2:+38998356 MsG0280008805.01.T01:CDS
AAAACTTGAATAAAGTGTGA+GGG 0.616853 2:-39002598 None:intergenic
GATGTGATGGAATGTTACCT+TGG 0.617351 2:-39003634 None:intergenic
CTGGGTGCTAAGGAAACAGA+TGG 0.618852 2:-39003764 None:intergenic
CTTCAAGGAGATGCACTCAT+CGG 0.621081 2:+39002462 MsG0280008805.01.T01:CDS
GTATGAACAAGATGTCAGCC+AGG 0.621852 2:+39003808 MsG0280008805.01.T01:CDS
TCTTGTTGAAGAAGGGTCGG+AGG 0.624434 2:+39004347 MsG0280008805.01.T01:CDS
TTGGTTGCATAGAACAAGAG+AGG 0.627395 2:+39001413 MsG0280008805.01.T01:intron
GTTGTTGCGGTGTTTCACGA+TGG 0.627646 2:+38998308 MsG0280008805.01.T01:CDS
GAATAATAACAATCTTCATG+GGG 0.628681 2:+39003472 MsG0280008805.01.T01:CDS
GTTATTAGATAGGTCCAAGT+GGG 0.629138 2:-39002739 None:intergenic
TTGCAAGTACACATTGGTGA+AGG 0.630106 2:-38998342 None:intergenic
TAAAATTCCTACAGCCATAG+GGG 0.633334 2:+39003985 MsG0280008805.01.T01:CDS
TCATTGATAGGGTAGTGCGC+AGG 0.634051 2:+39004386 MsG0280008805.01.T01:CDS
ACAGTCATTTCCTTCCCAAG+AGG 0.634143 2:-39001488 None:intergenic
GTTAAACTAGACATGGTGTG+TGG 0.637440 2:-39004064 None:intergenic
TTCATGTCCCCTATGGCTGT+AGG 0.639622 2:-39003992 None:intergenic
CTTTCAGGACCAATTCCACA+AGG 0.649800 2:+39004121 MsG0280008805.01.T01:CDS
ACGAAAGTACTAGTCAGAAG+AGG 0.650656 2:+38998276 MsG0280008805.01.T01:CDS
AATCCATGCTACCCACAAAG+AGG 0.651155 2:+39001574 MsG0280008805.01.T01:CDS
TAGAAAAGTTAAACTAGACA+TGG 0.651658 2:-39004071 None:intergenic
GTAAAATTCCCAACGCAGTG+TGG 0.652293 2:-39003719 None:intergenic
TTTCATCTCTATTATCAACA+TGG 0.653208 2:-39004222 None:intergenic
GTGTCTTTGCAAGTACACAT+TGG 0.654400 2:-38998348 None:intergenic
TATCCAACAACATGTTGATG+GGG 0.667795 2:+39003690 MsG0280008805.01.T01:CDS
TCACCAATAACCATATCACT+GGG 0.674603 2:+39003180 MsG0280008805.01.T01:CDS
ACTCTTCTGACTGGTTTACG+AGG 0.678365 2:+39003932 MsG0280008805.01.T01:CDS
GGTTATTAGATAGGTCCAAG+TGG 0.687337 2:-39002740 None:intergenic
ACATGGCAACGATTCAACAA+TGG 0.687962 2:-39004205 None:intergenic
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CRISPR-GE

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!! GATAACTTTTGATTCGAGAT+CGG + Chr2:39000115-39000134 MsG0280008805.01.T01:intron 30.0%
!! GTAGGACTTTTTAATTCCTT+TGG - Chr2:39001113-39001132 None:intergenic 30.0%
!! GTTGATAATAGAGATGAAAG+TGG + Chr2:39004226-39004245 MsG0280008805.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGTTACTTTAGTGTGGTTT+GGG + Chr2:38999408-38999427 MsG0280008805.01.T01:intron 30.0%
!! TTTCTAAAAGCATTCAGATC+TGG - Chr2:39002111-39002130 None:intergenic 30.0%
!!! AAATTTTTGGAATAGGACCA+TGG - Chr2:39002626-39002645 None:intergenic 30.0%
!!! ATTTGACCTATGTTGGTTTT+TGG + Chr2:39000147-39000166 MsG0280008805.01.T01:intron 30.0%
!!! ATTTTTATGGTGTCATTCCT+AGG + Chr2:39002907-39002926 MsG0280008805.01.T01:CDS 30.0%
!!! GGGTATTTTTAGAAAGACAA+TGG + Chr2:38999428-38999447 MsG0280008805.01.T01:intron 30.0%
!!! GTCAGAAGAGTTATTTCTTT+TGG - Chr2:39003923-39003942 None:intergenic 30.0%
!!! GTTTACAGTGCTTGTTTTTT+TGG + Chr2:39000346-39000365 MsG0280008805.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTGACCTATGTTGGTTTTT+GGG + Chr2:39000148-39000167 MsG0280008805.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTTGGAGTTTGTTTTAGG+TGG + Chr2:39000362-39000381 MsG0280008805.01.T01:intron 30.0%
AAAATGTCACCTATCCATGA+AGG - Chr2:39003575-39003594 None:intergenic 35.0%
AACCTTGATGTGTCAGAAAA+CGG + Chr2:39002957-39002976 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAGCAAGTGAGTAAGAT+TGG - Chr2:39003237-39003256 None:intergenic 35.0%
AAGGAAATGACTGTTGCAAA+TGG + Chr2:39001497-39001516 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
AATATGTAAGACGAAGGACA+TGG - Chr2:38999945-38999964 None:intergenic 35.0%
AATCTTACTCACTTGCTTCT+TGG + Chr2:39003236-39003255 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
AATGACTGTTGCAAATGGAA+AGG + Chr2:39001502-39001521 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
AATGGGAATCAGAGATAGAA+AGG - Chr2:39001768-39001787 None:intergenic 35.0%
ACAATATTACGCAGAAGTAG+GGG - Chr2:38999005-38999024 None:intergenic 35.0%
ACTTTCAGCTTTGCAAATCT+TGG + Chr2:39003664-39003683 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
AGAAAGTTTGTGTGAAATGC+TGG - Chr2:38998591-38998610 None:intergenic 35.0%
AGAAGCAACCTTTGTTACAT+GGG + Chr2:38999788-38999807 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
AGAAGCAAGTGAGTAAGATT+GGG - Chr2:39003236-39003255 None:intergenic 35.0%
AGACTTGTCTCTCAACAATT+TGG + Chr2:39003106-39003125 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
ATTAATATATGCGCAACGGA+CGG + Chr2:38999665-38999684 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
ATTCACATAGGCTAGTGAAT+TGG - Chr2:39003159-39003178 None:intergenic 35.0%
ATTGGAGAGAATCAAATGTC+GGG + Chr2:39003542-39003561 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
CACATATTTCCTAGCATTGT+TGG - Chr2:39002408-39002427 None:intergenic 35.0%
CATCATTAAGACTTTCCTCT+TGG + Chr2:39001473-39001492 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
CATGAAGTTACTTGAATCGT+TGG + Chr2:39004009-39004028 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
CATGATTCCATGAAATGTTG+AGG - Chr2:39002362-39002381 None:intergenic 35.0%
CATTCAAGTGATTGTTAGCA+AGG - Chr2:39002680-39002699 None:intergenic 35.0%
CATTGGAGAGAATCAAATGT+CGG + Chr2:39003541-39003560 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
CGGAGCTAGAAATAAATTTG+GGG + Chr2:38999159-38999178 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
CTAGAAATAAATTTGGGGGT+GGG + Chr2:38999164-38999183 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
CTATCCAACAACATGTTGAT+GGG + Chr2:39003689-39003708 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
CTATGCAACCAAATGATGAA+TGG - Chr2:39001405-39001424 None:intergenic 35.0%
CTTGCTAACAATCACTTGAA+TGG + Chr2:39002678-39002697 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
CTTTAACACAACTTGACCAA+AGG + Chr2:39000687-39000706 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
GAAAGTTTGCAAAGATGTGA+TGG - Chr2:39003650-39003669 None:intergenic 35.0%
GAAAGTTTGTGTGAAATGCT+GGG - Chr2:38998590-38998609 None:intergenic 35.0%
GAACAATATTACGCAGAAGT+AGG - Chr2:38999007-38999026 None:intergenic 35.0%
GAATCATGTGAACCATATTG+AGG + Chr2:39002374-39002393 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
GAATCTGTTCCATTATGGTT+AGG + Chr2:39002315-39002334 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
GCACAATTACTCAACCAAAT+TGG - Chr2:39002186-39002205 None:intergenic 35.0%
GCGGAGCTAGAAATAAATTT+GGG + Chr2:38999158-38999177 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
GGAGCTAGAAATAAATTTGG+GGG + Chr2:38999160-38999179 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
GGTACAATCCCACAAAATAT+TGG + Chr2:39002987-39003006 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
GTAAAATTCCTACAGCCATA+GGG + Chr2:39003984-39004003 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
GTAACAAAGGTTGCTTCTAA+AGG - Chr2:38999786-38999805 None:intergenic 35.0%
GTCAGTTATTTGACCTATGT+TGG + Chr2:39000140-39000159 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
GTGAGTCGACATATATTGAA+TGG + Chr2:39003786-39003805 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
GTTATTAGATAGGTCCAAGT+GGG - Chr2:39002742-39002761 None:intergenic 35.0%
GTTATTGGTGAGATTCACAT+AGG - Chr2:39003171-39003190 None:intergenic 35.0%
TAAAATTCCTACAGCCATAG+GGG + Chr2:39003985-39004004 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
TAGAAGCAACCTTTGTTACA+TGG + Chr2:38999787-38999806 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
TATCCAACAACATGTTGATG+GGG + Chr2:39003690-39003709 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
TATGTTGGCAACAATCTTTG+TGG + Chr2:39004178-39004197 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
TCACCAATAACCATATCACT+GGG + Chr2:39003180-39003199 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
TCACTCAATCTTGCAGATAA+TGG + Chr2:39002075-39002094 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
TCTAATAACCACTTGTTTGG+GGG + Chr2:39002753-39002772 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
TCTAGTAGCCATTCATCATT+TGG + Chr2:39001394-39001413 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
TCTATCCAACAACATGTTGA+TGG + Chr2:39003688-39003707 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
TGAGGTTTCCAAGGTTATTT+GGG - Chr2:39001804-39001823 None:intergenic 35.0%
TGGACGAAACAAGATACAAA+TGG - Chr2:39000456-39000475 None:intergenic 35.0%
TGTCTTGAGGATATGATCTT+AGG + Chr2:38998885-38998904 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
TTACAATCTGCAAGATGCAA+CGG + Chr2:39002489-39002508 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
TTACAGCAATGATTCAAGGA+TGG + Chr2:39003738-39003757 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
TTCACATAGGCTAGTGAATT+GGG - Chr2:39003158-39003177 None:intergenic 35.0%
TTGAGTGGTTTAGGTGTTTA+CGG + Chr2:38999847-38999866 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
TTGGAATGGAGTCATTTATG+AGG - Chr2:39003268-39003287 None:intergenic 35.0%
TTGGTATAGAACCCTCAATA+TGG - Chr2:39002389-39002408 None:intergenic 35.0%
TTGTCTCTCAACAATTTGGA+AGG + Chr2:39003110-39003129 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
! AAAAGTTTAGGACCTCCATT+GGG + Chr2:38998782-38998801 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
! ACAAGTGCTGTTATACTACA+AGG - Chr2:39002783-39002802 None:intergenic 35.0%
! ACAATTTTGTGAGGTTTCCA+AGG - Chr2:39001813-39001832 None:intergenic 35.0%
! ACACTCTGATGATGTCTATT+GGG + Chr2:39001864-39001883 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
! ACCTGAGTGATGTTTTTCTT+GGG + Chr2:39001917-39001936 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
! CAAGAAAGGACAATTTTGTG+AGG - Chr2:39001822-39001841 None:intergenic 35.0%
! CTTTTTACCGACATCTTACT+AGG + Chr2:38998838-38998857 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
! GAGGGCACAAAATTTATTGA+AGG + Chr2:39001939-39001958 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
! GGAGTTTTCTTGTTGAAGAA+GGG + Chr2:39004340-39004359 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
! GGGAAATTTCCTGATAGTTT+TGG + Chr2:39003059-39003078 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
! TAAAAGTTTAGGACCTCCAT+TGG + Chr2:38998781-38998800 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
! TACACTCTGATGATGTCTAT+TGG + Chr2:39001863-39001882 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
! TACCTGAGTGATGTTTTTCT+TGG + Chr2:39001916-39001935 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
! TAGATTTCCCAGTTTTCCTA+GGG - Chr2:39002718-39002737 None:intergenic 35.0%
! TGAGTTGAATTCCAACAATC+AGG - Chr2:39003359-39003378 None:intergenic 35.0%
! TGGAGTTTTCTTGTTGAAGA+AGG + Chr2:39004339-39004358 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
! TTAGATTTCCCAGTTTTCCT+AGG - Chr2:39002719-39002738 None:intergenic 35.0%
! TTTTCTTGTTGAAGAAGGGT+CGG + Chr2:39004344-39004363 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
!! GCTGCGATTTTTATTTGACT+TGG + Chr2:39000023-39000042 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
!! GTTGTTACTTTAGTGTGGTT+TGG + Chr2:38999407-38999426 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
!! TCAATATATGTCGACTCACT+GGG - Chr2:39003785-39003804 None:intergenic 35.0%
!! TCTTGTTTGTGCTTTTTGAG+TGG + Chr2:38999832-38999851 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
!! TTCAATATATGTCGACTCAC+TGG - Chr2:39003786-39003805 None:intergenic 35.0%
!! TTTTAGGTGGTGATGTGTTT+TGG + Chr2:39000375-39000394 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
!!! ACTGGCTTTTGGGTTTTTAT+TGG + Chr2:39004319-39004338 MsG0280008805.01.T01:CDS 35.0%
!!! ATTTTGATGGTGTTCTTCGT+GGG + Chr2:39000290-39000309 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
!!! GGTCCTAAACTTTTAAGACT+TGG - Chr2:38998776-38998795 None:intergenic 35.0%
!!! GTCTGGGAGTTTTATTTTGA+TGG + Chr2:39000277-39000296 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
!!! GTGTTATTTTGCCAAGTTAG+TGG - Chr2:39001257-39001276 None:intergenic 35.0%
!!! GTTTATCTCCAGGGTTTTTT+AGG + Chr2:39000401-39000420 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
!!! TATTTTGATGGTGTTCTTCG+TGG + Chr2:39000289-39000308 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
!!! TTGTGCTTTTTGAGTGGTTT+AGG + Chr2:38999838-38999857 MsG0280008805.01.T01:intron 35.0%
AACATGGACCCATGTAACAA+AGG - Chr2:38999799-38999818 None:intergenic 40.0%
AAGTAACTTCATGTCCCCTA+TGG - Chr2:39004002-39004021 None:intergenic 40.0%
AATGAAGCAAAGCTGCAAGT+CGG - Chr2:39001291-39001310 None:intergenic 40.0%
ACAACCGGTGGTCTATAAAT+AGG - Chr2:38998437-38998456 None:intergenic 40.0%
ACATGGCAACGATTCAACAA+TGG - Chr2:39004208-39004227 None:intergenic 40.0%
ACATGGCTCATTGACACAAA+AGG + Chr2:39000724-39000743 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
ACTAATTGCTCAAGACTCCT+AGG - Chr2:39002927-39002946 None:intergenic 40.0%
AGCGGTTAAGGTTAAGTATG+TGG - Chr2:38999576-38999595 None:intergenic 40.0%
AGGGAAATACAACACGAACA+TGG + Chr2:39000707-39000726 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
AGGTGTTTACGGAGTTTGTA+GGG + Chr2:38999858-38999877 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
ATAAGTTGCAGCAACATCAC+AGG + Chr2:39001526-39001545 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
ATCTCTGATTCCCATTTGAG+TGG + Chr2:39001772-39001791 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
ATGATCATGACTGTGCATCT+TGG - Chr2:39002019-39002038 None:intergenic 40.0%
CAAAGCCCAAAAACCAACAT+AGG - Chr2:39000156-39000175 None:intergenic 40.0%
CAACCGGTGGTCTATAAATA+GGG - Chr2:38998436-38998455 None:intergenic 40.0%
CATAACCACCTAAAAAACCC+TGG - Chr2:39000412-39000431 None:intergenic 40.0%
CATACTTAACCTTAACCGCT+AGG + Chr2:38999576-38999595 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
CTATAACGGTCAAGTCAGTA+AGG + Chr2:38998370-38998389 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
CTCACCAATAACCATATCAC+TGG + Chr2:39003179-39003198 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
CTGTCACACAATCATTTGTC+AGG + Chr2:39003962-39003981 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
CTGTTCCATTATGGTTAGGT+GGG + Chr2:39002319-39002338 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
CTTCTCTTCCTTTAATGACC+TGG - Chr2:39003829-39003848 None:intergenic 40.0%
CTTCTGTCACTAGATTTGTC+TGG + Chr2:39002432-39002451 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
CTTGGAAGCAATGCTCTTAA+CGG + Chr2:39002225-39002244 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
GATAATCGTCTCCTCTTTGT+GGG - Chr2:39001588-39001607 None:intergenic 40.0%
GCACACAATATGTAAGACGA+AGG - Chr2:38999951-38999970 None:intergenic 40.0%
GCTAGAAATAAATTTGGGGG+TGG + Chr2:38999163-38999182 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
GCTTAGACCTAGTAAGATGT+CGG - Chr2:38998848-38998867 None:intergenic 40.0%
GGAACTATACCTTCATGGAT+AGG + Chr2:39003563-39003582 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
GGCGGAGCTAGAAATAAATT+TGG + Chr2:38999157-38999176 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
GGTAAAATTCCTACAGCCAT+AGG + Chr2:39003983-39004002 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
GGTATCATCCCAAATAACCT+TGG + Chr2:39001793-39001812 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
GGTTAAGTATGTGGATCTGA+TGG - Chr2:38999567-38999586 None:intergenic 40.0%
GGTTATTAGATAGGTCCAAG+TGG - Chr2:39002743-39002762 None:intergenic 40.0%
GGTTCTATACCAACAATGCT+AGG + Chr2:39002396-39002415 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
GTCAGCTTTCAACTTTGCTA+TGG + Chr2:39003441-39003460 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
GTGAGGTTTCCAAGGTTATT+TGG - Chr2:39001805-39001824 None:intergenic 40.0%
GTGTCTTTGCAAGTACACAT+TGG - Chr2:38998351-38998370 None:intergenic 40.0%
GTTAAACTAGACATGGTGTG+TGG - Chr2:39004067-39004086 None:intergenic 40.0%
GTTCGTGTTGTATTTCCCTT+TGG - Chr2:39000706-39000725 None:intergenic 40.0%
GTTGGGGCAACTTGAAAATA+TGG + Chr2:39002572-39002591 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
TAAAATTCCCAACGCAGTGT+GGG - Chr2:39003721-39003740 None:intergenic 40.0%
TAGGTGTTTACGGAGTTTGT+AGG + Chr2:38999857-38999876 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
TATGGTGTACCGTCTATATG+CGG + Chr2:39000428-39000447 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
TCCCAAGAAAAACATCACTC+AGG - Chr2:39001921-39001940 None:intergenic 40.0%
TCGTCTTACATATTGTGTGC+TGG + Chr2:38999951-38999970 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
TCTAACCCACCTAACCATAA+TGG - Chr2:39002327-39002346 None:intergenic 40.0%
TCTCCCTAATGCAGATTCTA+AGG + Chr2:39003594-39003613 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
TCTGTTCCATTATGGTTAGG+TGG + Chr2:39002318-39002337 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
TGACCCAGTGATATGGTTAT+TGG - Chr2:39003186-39003205 None:intergenic 40.0%
TGATAATCGTCTCCTCTTTG+TGG - Chr2:39001589-39001608 None:intergenic 40.0%
TGGGATGATACCACTCAAAT+GGG - Chr2:39001785-39001804 None:intergenic 40.0%
TTAAGACTTTCCTCTTGGGA+AGG + Chr2:39001478-39001497 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
TTCAATAAGCACGGCTTAGT+TGG - Chr2:38999039-38999058 None:intergenic 40.0%
TTCTAGCAAAGAAGGAAGCA+TGG - Chr2:39001971-39001990 None:intergenic 40.0%
TTGCAAGTACACATTGGTGA+AGG - Chr2:38998345-38998364 None:intergenic 40.0%
TTGGCAACATTCCTGATTGT+TGG + Chr2:39003345-39003364 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
TTGGGATGATACCACTCAAA+TGG - Chr2:39001786-39001805 None:intergenic 40.0%
TTGGTTGCATAGAACAAGAG+AGG + Chr2:39001413-39001432 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
TTGTCCTACAACAACCTTTC+AGG + Chr2:39004106-39004125 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
TTGTCTGGAAACAGACTTCA+AGG + Chr2:39002447-39002466 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
! AAAGTTTAGGACCTCCATTG+GGG + Chr2:38998783-38998802 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
! AACTGGTTTCCTTGTGGAAT+TGG - Chr2:39004133-39004152 None:intergenic 40.0%
! ATAGACCACCGGTTGTATAA+AGG + Chr2:38998441-38998460 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
! CAAGCTCTTTTAGCACTCAA+AGG + Chr2:39001436-39001455 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
! CATCACTCAGGTAAAGCTTT+TGG - Chr2:39001909-39001928 None:intergenic 40.0%
! CGAGAGTGTGTATCTTACTT+TGG + Chr2:38998399-38998418 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
! CTGACACATCAAGGTTTTCT+AGG - Chr2:39002953-39002972 None:intergenic 40.0%
! GAAAGAGAAGGATGGATTTC+TGG - Chr2:39001649-39001668 None:intergenic 40.0%
! GAGTGATGTTTTTCTTGGGA+GGG + Chr2:39001921-39001940 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
! GATGGTCTTAGCGTACTATT+TGG + Chr2:38998805-38998824 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
! GATGTGATGGAATGTTACCT+TGG - Chr2:39003637-39003656 None:intergenic 40.0%
! GTCAAAAACTGGTTTCCTTG+TGG - Chr2:39004139-39004158 None:intergenic 40.0%
! TAGACCACCGGTTGTATAAA+GGG + Chr2:38998442-38998461 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
! TGAGTGATGTTTTTCTTGGG+AGG + Chr2:39001920-39001939 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
! TGATGATGTGTTAGTGTGGT+TGG + Chr2:38999721-38999740 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
! TTGGGGTCTTATAAGACTCA+AGG - Chr2:38998719-38998738 None:intergenic 40.0%
!! ACGAAAGTACTAGTCAGAAG+AGG + Chr2:38998276-38998295 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTGTTTAGCTTGTCCTAGC+GGG - Chr2:38999644-38999663 None:intergenic 40.0%
!! CTTGCAGATAATGGACTTGA+TGG + Chr2:39002084-39002103 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
!! GATGAAAGTGGAGTTGATGA+TGG + Chr2:39004238-39004257 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
!! GATTGTTTAGCTTGTCCTAG+CGG - Chr2:38999645-38999664 None:intergenic 40.0%
!! GTAGCAATTGGATTTGCTAC+TGG + Chr2:39004301-39004320 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
!! TGATGATGGTAAGCATGACA+GGG + Chr2:39004252-39004271 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
!! TGTGGTTGGTGTTTTAAGTG+AGG + Chr2:38999735-38999754 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
!! TTGATGATGGTAAGCATGAC+AGG + Chr2:39004251-39004270 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGGTTTTTCTCTGGTGTAC+CGG + Chr2:39000047-39000066 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
!!! AAGGGCATCTCGTGTTATTT+TGG - Chr2:39000968-39000987 None:intergenic 40.0%
!!! ATTGTGTGCTGGTTTTCGAT+GGG + Chr2:38999962-38999981 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
!!! CAGGGTTTTTTAGGTGGTTA+TGG + Chr2:39000410-39000429 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
!!! GACTTGGTTTGGTTTTTCTC+TGG + Chr2:39000039-39000058 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
!!! TATCTCCAGGGTTTTTTAGG+TGG + Chr2:39000404-39000423 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
!!! TATTGTGTGCTGGTTTTCGA+TGG + Chr2:38999961-38999980 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
!!! TGGATTTGCTACTGGCTTTT+GGG + Chr2:39004309-39004328 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
!!! TTGGATTTGCTACTGGCTTT+TGG + Chr2:39004308-39004327 MsG0280008805.01.T01:CDS 40.0%
!!! TTTTGGTGGGTTTATCTCCA+GGG + Chr2:39000392-39000411 MsG0280008805.01.T01:intron 40.0%
AATCCATGCTACCCACAAAG+AGG + Chr2:39001574-39001593 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
ACAGTCATTTCCTTCCCAAG+AGG - Chr2:39001491-39001510 None:intergenic 45.0%
ACTGGGAAATCTAACCCACT+TGG + Chr2:39002725-39002744 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
ACTTGGTAGACATACAGTGG+CGG + Chr2:38999139-38999158 MsG0280008805.01.T01:intron 45.0%
AGAACCCTTTATACAACCGG+TGG - Chr2:38998449-38998468 None:intergenic 45.0%
AGAGCTAGAGACGACAAACA+TGG - Chr2:38999815-38999834 None:intergenic 45.0%
ATGAAGCAAAGCTGCAAGTC+GGG - Chr2:39001290-39001309 None:intergenic 45.0%
ATGACAGGGCTGAGAAACTA+TGG + Chr2:39004266-39004285 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
CCAAACTCCCTAGGAAAACT+GGG + Chr2:39002708-39002727 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
CCACTGTATGTCTACCAAGT+AGG - Chr2:38999139-38999158 None:intergenic 45.0%
CCTACTTGGTAGACATACAG+TGG + Chr2:38999136-38999155 MsG0280008805.01.T01:intron 45.0%
CTTCAAGGAGATGCACTCAT+CGG + Chr2:39002462-39002481 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
CTTGTGGAATTGGTCCTGAA+AGG - Chr2:39004123-39004142 None:intergenic 45.0%
CTTTCAGGACCAATTCCACA+AGG + Chr2:39004121-39004140 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
GAATCGTTGGACTTCTCTCA+GGG + Chr2:39004022-39004041 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
GAGACAAGTCTAAATTGCGC+AGG - Chr2:39003097-39003116 None:intergenic 45.0%
GATCTCGAAGCCAAATGAAC+CGG - Chr2:38999988-39000007 None:intergenic 45.0%
GATGTCAGCCAGGTCATTAA+AGG + Chr2:39003818-39003837 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
GCACCCTATTTATAGACCAC+CGG + Chr2:38998430-38998449 MsG0280008805.01.T01:intron 45.0%
GGAAAGGTCAAGCAATGTCA+AGG - Chr2:39002283-39002302 None:intergenic 45.0%
GGAACTATTCCAAACTCCCT+AGG + Chr2:39002699-39002718 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
GTAAAATTCCCAACGCAGTG+TGG - Chr2:39003722-39003741 None:intergenic 45.0%
GTATGAACAAGATGTCAGCC+AGG + Chr2:39003808-39003827 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
GTGATAGCTGCATGATCCTT+CGG + Chr2:39000214-39000233 MsG0280008805.01.T01:intron 45.0%
GTGTCAGAAAACGGTCTGAA+TGG + Chr2:39002966-39002985 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
GTGTGAAATGCTGGGTTTGA+GGG - Chr2:38998582-38998601 None:intergenic 45.0%
GTTAGGTGCTCTTCGTTATG+TGG + Chr2:39000236-39000255 MsG0280008805.01.T01:intron 45.0%
TAGAAAGACAATGGGTGCAC+TGG + Chr2:38999437-38999456 MsG0280008805.01.T01:intron 45.0%
TCAATGATCAGCTGCCTACA+TGG + Chr2:39002550-39002569 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
TCCAAACTCCCTAGGAAAAC+TGG + Chr2:39002707-39002726 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
TGAATCGTTGGACTTCTCTC+AGG + Chr2:39004021-39004040 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
TGACCCCATCAACATGTTGT+TGG - Chr2:39003696-39003715 None:intergenic 45.0%
TGATTGTTGTCTACCACTGG+CGG - Chr2:39000648-39000667 None:intergenic 45.0%
TGGTCCTGAAAGGTTGTTGT+AGG - Chr2:39004113-39004132 None:intergenic 45.0%
TGTCGGGAACTATACCTTCA+TGG + Chr2:39003558-39003577 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
TGTGTGAAATGCTGGGTTTG+AGG - Chr2:38998583-38998602 None:intergenic 45.0%
TTCTCTCAGGGTCAACTTTC+AGG + Chr2:39004034-39004053 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
TTTGTGTTGTGCTCTTTCGG+TGG + Chr2:39000172-39000191 MsG0280008805.01.T01:intron 45.0%
! ATGCAACGGATCTGGTTTAG+AGG + Chr2:39002503-39002522 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
! GACCGTTTTCTGACACATCA+AGG - Chr2:39002962-39002981 None:intergenic 45.0%
! GGCTTTGTGTTGTGCTCTTT+CGG + Chr2:39000169-39000188 MsG0280008805.01.T01:intron 45.0%
! TGGTTTTTCTCTGGTGTACC+GGG + Chr2:39000048-39000067 MsG0280008805.01.T01:intron 45.0%
!! ACTCTTCTGACTGGTTTACG+AGG + Chr2:39003932-39003951 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
!! CAAATGGTGCCGCATATAGA+CGG - Chr2:39000440-39000459 None:intergenic 45.0%
!! GGTGTTATTCCAAGCTCGTT+CGG + Chr2:39003419-39003438 MsG0280008805.01.T01:CDS 45.0%
!! GGTGTTTTAAGTGAGGAGGT+GGG + Chr2:38999742-38999761 MsG0280008805.01.T01:intron 45.0%
!! GGTTGGTGTTTTAAGTGAGG+AGG + Chr2:38999738-38999757 MsG0280008805.01.T01:intron 45.0%
!! TAGGTGGTGATGTGTTTTGG+TGG + Chr2:39000378-39000397 MsG0280008805.01.T01:intron 45.0%
!! TGGTGTTTTAAGTGAGGAGG+TGG + Chr2:38999741-38999760 MsG0280008805.01.T01:intron 45.0%
!! TTAGCTTGTCCTAGCGGTTA+AGG - Chr2:38999588-38999607 None:intergenic 45.0%
!!! AGGTGGTGATGTGTTTTGGT+GGG + Chr2:39000379-39000398 MsG0280008805.01.T01:intron 45.0%
!!! GTTTTGGTGGGTTTATCTCC+AGG + Chr2:39000391-39000410 MsG0280008805.01.T01:intron 45.0%
!! AAAAAAAAAAAAAAAAAAGT+AGG - Chr2:39001062-39001081 None:intergenic 5.0%
!!! ATTATTTTTTTTTTTTTTGA+GGG + Chr2:39000916-39000935 MsG0280008805.01.T01:intron 5.0%
!!! GAATAATTTTTTTTAAAAAA+AGG + Chr2:38999485-38999504 MsG0280008805.01.T01:intron 5.0%
!!! TATTATTTTTTTTTTTTTTG+AGG + Chr2:39000915-39000934 MsG0280008805.01.T01:intron 5.0%
!!! TCTTTTTTAAATTTAAAATA+TGG - Chr2:38999327-38999346 None:intergenic 5.0%
!!! TTTTTAATATGAAATTATTT+TGG + Chr2:38998663-38998682 MsG0280008805.01.T01:intron 5.0%
AAAAGTCGGGTGGGCACAAA+TGG - Chr2:39001019-39001038 None:intergenic 50.0%
AAAGTCGGGTGGGCACAAAT+GGG - Chr2:39001018-39001037 None:intergenic 50.0%
AAGGAAGACCCCCAAACAAG+TGG - Chr2:39002764-39002783 None:intergenic 50.0%
AGCTGCATGATCCTTCGGTT+AGG + Chr2:39000219-39000238 MsG0280008805.01.T01:intron 50.0%
ATCAGCTGCCTACATGGTTG+GGG + Chr2:39002556-39002575 MsG0280008805.01.T01:CDS 50.0%
CTAGTTGTCGCCTACCAAGT+AGG - Chr2:39001131-39001150 None:intergenic 50.0%
CTGGGTGCTAAGGAAACAGA+TGG - Chr2:39003767-39003786 None:intergenic 50.0%
CTTGTTGAAGAAGGGTCGGA+GGG + Chr2:39004348-39004367 MsG0280008805.01.T01:CDS 50.0%
GAGGTGCAAAGCAGTTGTTG+CGG + Chr2:38998295-38998314 MsG0280008805.01.T01:CDS 50.0%
GATCAGCTGCCTACATGGTT+GGG + Chr2:39002555-39002574 MsG0280008805.01.T01:CDS 50.0%
GCTGGGTTTGAGGGCTTAAT+TGG - Chr2:38998573-38998592 None:intergenic 50.0%
GGGCAAGTATGTGGATCTGA+TGG - Chr2:38999624-38999643 None:intergenic 50.0%
GTGCTCTTCGTTATGTGGCT+CGG + Chr2:39000241-39000260 MsG0280008805.01.T01:intron 50.0%
GTGGGTAGCATGGATTCCTA+AGG - Chr2:39001570-39001589 None:intergenic 50.0%
GTTGTGCTCTTTCGGTGGAT+CGG + Chr2:39000177-39000196 MsG0280008805.01.T01:intron 50.0%
GTTGTTGCGGTGTTTCACGA+TGG + Chr2:38998308-38998327 MsG0280008805.01.T01:CDS 50.0%
TACGCTAAGACCATCCCCAA+TGG - Chr2:38998800-38998819 None:intergenic 50.0%
TCATTGATAGGGTAGTGCGC+AGG + Chr2:39004386-39004405 MsG0280008805.01.T01:CDS 50.0%
TCTCCTCTTTGTGGGTAGCA+TGG - Chr2:39001580-39001599 None:intergenic 50.0%
TCTGCAAGATGCAACGGATC+TGG + Chr2:39002495-39002514 MsG0280008805.01.T01:CDS 50.0%
TCTTGTTGAAGAAGGGTCGG+AGG + Chr2:39004347-39004366 MsG0280008805.01.T01:CDS 50.0%
TGATCAGCTGCCTACATGGT+TGG + Chr2:39002554-39002573 MsG0280008805.01.T01:CDS 50.0%
TTCATGTCCCCTATGGCTGT+AGG - Chr2:39003995-39004014 None:intergenic 50.0%
TTGGCTTCGAGATCGAGAGT+CGG + Chr2:38999994-39000013 MsG0280008805.01.T01:intron 50.0%
! CCCAGTTTTCCTAGGGAGTT+TGG - Chr2:39002711-39002730 None:intergenic 50.0%
! CGCTGATTGTTGTCTACCAC+TGG - Chr2:39000651-39000670 None:intergenic 50.0%
! GGGGTGATGATGTGTTAGTG+TGG + Chr2:38999717-38999736 MsG0280008805.01.T01:intron 50.0%
! GGTTTTTCTCTGGTGTACCG+GGG + Chr2:39000049-39000068 MsG0280008805.01.T01:intron 50.0%
! GTTTTTCTCTGGTGTACCGG+GGG + Chr2:39000050-39000069 MsG0280008805.01.T01:intron 50.0%
! TCAAGTTGCCCCAACCATGT+AGG - Chr2:39002567-39002586 None:intergenic 50.0%
! TTCGTTATGTGGCTCGGCTT+GGG + Chr2:39000247-39000266 MsG0280008805.01.T01:intron 50.0%
! TTTAGGACCTCCATTGGGGA+TGG + Chr2:38998787-38998806 MsG0280008805.01.T01:intron 50.0%
! TTTCGATGGGCCGGTTCATT+TGG + Chr2:38999975-38999994 MsG0280008805.01.T01:intron 50.0%
!! AACGAAGAGCACCTAACCGA+AGG - Chr2:39000233-39000252 None:intergenic 50.0%
!! AGACAATGGGTGCACTGGTT+CGG + Chr2:38999442-38999461 MsG0280008805.01.T01:intron 50.0%
!! TCGTGCTTAGCTTGTCCTAG+CGG - Chr2:38999594-38999613 None:intergenic 50.0%
!! TGAGTAGTGACGATGGGTTG+TGG + Chr2:39000313-39000332 MsG0280008805.01.T01:intron 50.0%
!! TGCACTGGTTCGGTTCTCTT+TGG + Chr2:38999452-38999471 MsG0280008805.01.T01:intron 50.0%
!! TTTTCAGGGGGTGGTTTAGG+AGG + Chr2:38999692-38999711 MsG0280008805.01.T01:intron 50.0%
!!! AACGGACGGAGCTTTTTCAG+GGG + Chr2:38999679-38999698 MsG0280008805.01.T01:intron 50.0%
!!! CAACGGACGGAGCTTTTTCA+GGG + Chr2:38999678-38999697 MsG0280008805.01.T01:intron 50.0%
!!! GCTTTTTCAGGGGGTGGTTT+AGG + Chr2:38999689-38999708 MsG0280008805.01.T01:intron 50.0%
AAGCAAAGCTGCAAGTCGGG+TGG - Chr2:39001287-39001306 None:intergenic 55.0%
AAGTCGGGTGGGCACAAATG+GGG - Chr2:39001017-39001036 None:intergenic 55.0%
AGCAAAGCTGCAAGTCGGGT+GGG - Chr2:39001286-39001305 None:intergenic 55.0%
CGAGGGGTTCCCTGCTAATT+TGG + Chr2:39000073-39000092 MsG0280008805.01.T01:intron 55.0%
CGTCCATACCTTGCGTCTTG+CGG + Chr2:39000470-39000489 MsG0280008805.01.T01:intron 55.0%
CGTGGGTGAGTAGTGACGAT+GGG + Chr2:39000307-39000326 MsG0280008805.01.T01:intron 55.0%
GAAAGCTGACCGAACGAGCT+TGG - Chr2:39003431-39003450 None:intergenic 55.0%
GATCCACATACTTGCCCGCT+AGG + Chr2:38999627-38999646 MsG0280008805.01.T01:intron 55.0%
GCTAAGACCATCCCCAATGG+AGG - Chr2:38998797-38998816 None:intergenic 55.0%
GGGGTAGTGACCCAGTGATA+TGG - Chr2:39003193-39003212 None:intergenic 55.0%
GGTAGGCGACAACTAGCCAA+AGG + Chr2:39001135-39001154 MsG0280008805.01.T01:intron 55.0%
GGTCAATCCCACACTGCGTT+GGG + Chr2:39003711-39003730 MsG0280008805.01.T01:CDS 55.0%
GTCCATACCTTGCGTCTTGC+GGG + Chr2:39000471-39000490 MsG0280008805.01.T01:intron 55.0%
TCCATACCTTGCGTCTTGCG+GGG + Chr2:39000472-39000491 MsG0280008805.01.T01:intron 55.0%
TCGTGGGTGAGTAGTGACGA+TGG + Chr2:39000306-39000325 MsG0280008805.01.T01:intron 55.0%
TGAGGAGGTGGGTGCTTGTT+GGG + Chr2:38999753-38999772 MsG0280008805.01.T01:intron 55.0%
TGGCTTCGAGATCGAGAGTC+GGG + Chr2:38999995-39000014 MsG0280008805.01.T01:intron 55.0%
! CTTCGTTATGTGGCTCGGCT+TGG + Chr2:39000246-39000265 MsG0280008805.01.T01:intron 55.0%
! TGTCCTAGCGGGCAAGTATG+TGG - Chr2:38999633-38999652 None:intergenic 55.0%
!! GCAACGGACGGAGCTTTTTC+AGG + Chr2:38999677-38999696 MsG0280008805.01.T01:intron 55.0%
!! GTAGTGACGATGGGTTGTGG+TGG + Chr2:39000316-39000335 MsG0280008805.01.T01:intron 55.0%
!! TGTCGACTCACTGGGTGCTA+AGG - Chr2:39003777-39003796 None:intergenic 55.0%
!!! ACGGACGGAGCTTTTTCAGG+GGG + Chr2:38999680-38999699 MsG0280008805.01.T01:intron 55.0%
!!! TGTGCTGGTTTTCGATGGGC+CGG + Chr2:38999966-38999985 MsG0280008805.01.T01:intron 55.0%
AGCCACTCATGGGTCAGGGT+GGG - Chr2:39000625-39000644 None:intergenic 60.0%
AGGGGGTGGTTTAGGAGGTG+GGG + Chr2:38999697-38999716 MsG0280008805.01.T01:intron 60.0%
CAGGGGGTGGTTTAGGAGGT+GGG + Chr2:38999696-38999715 MsG0280008805.01.T01:intron 60.0%
GCAAAGCTGCAAGTCGGGTG+GGG - Chr2:39001285-39001304 None:intergenic 60.0%
GGCTTCGAGATCGAGAGTCG+GGG + Chr2:38999996-39000015 MsG0280008805.01.T01:intron 60.0%
GGGTCAATCCCACACTGCGT+TGG + Chr2:39003710-39003729 MsG0280008805.01.T01:CDS 60.0%
GTGAGGAGGTGGGTGCTTGT+TGG + Chr2:38999752-38999771 MsG0280008805.01.T01:intron 60.0%
GTGCTCTTTCGGTGGATCGG+AGG + Chr2:39000180-39000199 MsG0280008805.01.T01:intron 60.0%
TCAGGGGGTGGTTTAGGAGG+TGG + Chr2:38999695-38999714 MsG0280008805.01.T01:intron 60.0%
TCCCCGCAAGACGCAAGGTA+TGG - Chr2:39000476-39000495 None:intergenic 60.0%
! GAGGAGGTGGGTGCTTGTTG+GGG + Chr2:38999754-38999773 MsG0280008805.01.T01:intron 60.0%
!!! GACGGAGCTTTTTCAGGGGG+TGG + Chr2:38999683-38999702 MsG0280008805.01.T01:intron 60.0%
AAGCTGCAAGTCGGGTGGGG+TGG - Chr2:39001282-39001301 None:intergenic 65.0%
ACCACTGGCGGAGCCACTCA+TGG - Chr2:39000636-39000655 None:intergenic 65.0%
CCACTGGCGGAGCCACTCAT+GGG - Chr2:39000635-39000654 None:intergenic 65.0%
CGTCATCCCCGCAAGACGCA+AGG - Chr2:39000481-39000500 None:intergenic 65.0%
GAGCCACTCATGGGTCAGGG+TGG - Chr2:39000626-39000645 None:intergenic 65.0%
GCGGAGCCACTCATGGGTCA+GGG - Chr2:39000629-39000648 None:intergenic 65.0%
GGGGGTGGTTTAGGAGGTGG+GGG + Chr2:38999698-38999717 MsG0280008805.01.T01:intron 65.0%
!! ATGTGGCTCGGCTTGGGCGT+TGG + Chr2:39000253-39000272 MsG0280008805.01.T01:intron 65.0%
!! TGTGGCTCGGCTTGGGCGTT+GGG + Chr2:39000254-39000273 MsG0280008805.01.T01:intron 65.0%
CCCATGAGTGGCTCCGCCAG+TGG + Chr2:39000632-39000651 MsG0280008805.01.T01:intron 70.0%
CTCTGGTGTACCGGGGGCGA+GGG + Chr2:39000056-39000075 MsG0280008805.01.T01:intron 70.0%
GGCCCACCCTGACCCATGAG+TGG + Chr2:39000620-39000639 MsG0280008805.01.T01:intron 70.0%
GGCGGAGCCACTCATGGGTC+AGG - Chr2:39000630-39000649 None:intergenic 70.0%
TCGGTGGATCGGAGGTCGCG+AGG + Chr2:39000188-39000207 MsG0280008805.01.T01:intron 70.0%
TCTCTGGTGTACCGGGGGCG+AGG + Chr2:39000055-39000074 MsG0280008805.01.T01:intron 70.0%
TCTGGTGTACCGGGGGCGAG+GGG + Chr2:39000057-39000076 MsG0280008805.01.T01:intron 70.0%
!! CGGCTTGGGCGTTGGGGTCT+GGG + Chr2:39000261-39000280 MsG0280008805.01.T01:intron 70.0%
!! GTGGCTCGGCTTGGGCGTTG+GGG + Chr2:39000255-39000274 MsG0280008805.01.T01:intron 70.0%
!! TCGGCTTGGGCGTTGGGGTC+TGG + Chr2:39000260-39000279 MsG0280008805.01.T01:intron 70.0%
AGCAGGGAACCCCTCGCCCC+CGG - Chr2:39000069-39000088 None:intergenic 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 38998260 39004444 38998260 ID=MsG0280008805.01;Name=MsG0280008805.01
Chr2 mRNA 38998260 39004444 38998260 ID=MsG0280008805.01.T01;Parent=MsG0280008805.01;Name=MsG0280008805.01.T01;_AED=0.14;_eAED=0.14;_QI=0|0|0|0.5|1|1|2|0|1048
Chr2 exon 38998260 38998386 38998260 ID=MsG0280008805.01.T01:exon:20825;Parent=MsG0280008805.01.T01
Chr2 exon 39001425 39004444 39001425 ID=MsG0280008805.01.T01:exon:20826;Parent=MsG0280008805.01.T01
Chr2 CDS 38998260 38998386 38998260 ID=MsG0280008805.01.T01:cds;Parent=MsG0280008805.01.T01
Chr2 CDS 39001425 39004444 39001425 ID=MsG0280008805.01.T01:cds;Parent=MsG0280008805.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280008805.01.T01

ATGGTCTTGTCGAGGAACGAAAGTACTAGTCAGAAGAGGTGCAAAGCAGTTGTTGCGGTGTTTCACGATGGTTCACGATTGTCCTTCACCAATGTGTACTTGCAAAGACACTATAACGGTCAAGTCAAACAAGAGAGGCAAGCTCTTTTAGCACTCAAAGGAAGCTTTAATGATACATCATTAAGACTTTCCTCTTGGGAAGGAAATGACTGTTGCAAATGGAAAGGTATAAGTTGCAGCAACATCACAGGACATGTTATCAAAATTGACCTTAGGAATCCATGCTACCCACAAAGAGGAGACGATTATCAATCAAACTGTTCCTTCTCAAAAAATAAGCTTGAAGCTCCAGAAATCCATCCTTCTCTTTCAAATTTTATATATCTTAGTTATTTAGACCTTAGTGGAAACAATTTCAATTCAAGTCCAATACCAACTTTTATCCATTTTATGAATCAGTTAGAATTCCTTTCTATCTCTGATTCCCATTTGAGTGGTATCATCCCAAATAACCTTGGAAACCTCACAAAATTGTCCTTTCTTGATCTCAGTTTCAATTCTTATTTACACTCTGATGATGTCTATTGGGTTTCAAAACTTTCATTGCTCCAAAAGCTTTACCTGAGTGATGTTTTTCTTGGGAGGGCACAAAATTTATTGAAGGTAATTACCATGCTTCCTTCTTTGCTAGAATTAGAATTGATGAACTGCAGCATAACCAAGATGCACAGTCATGATCATCAACTTGTTAGTTACACAAATTTTTCTGGTATTGTGTCACTCAATCTTGCAGATAATGGACTTGATGGTCCAGATCTGAATGCTTTTAGAAACATGACTTCACTTGAAACTATTGACCTTTCTAACAATAGTTTTACTTCAGTTCCAATTTGGTTGAGTAATTGTGCCAAACTTGACTCTCTTTATCTTGGAAGCAATGCTCTTAACGGTTCAGTTCCATCAGCTCTTAGAAATTTGACTTCCTTGACATTGCTTGACCTTTCCCAAAACAAAATTGAATCTGTTCCATTATGGTTAGGTGGGTTAGAGAGTCTTTTGTACCTCAACATTTCATGGAATCATGTGAACCATATTGAGGGTTCTATACCAACAATGCTAGGAAATATGTGTCAGCTTCTGTCACTAGATTTGTCTGGAAACAGACTTCAAGGAGATGCACTCATCGGTAATTTACAATCTGCAAGATGCAACGGATCTGGTTTAGAGGAACTTGACATGACCAACAACAATTTCAATGATCAGCTGCCTACATGGTTGGGGCAACTTGAAAATATGGTAACCCTCACACTTTATTCAAGTTTTTTCCATGGTCCTATTCCAAAAATTTTGGGAAAATTGTCAAACTTGGAATATTTAATCCTTGCTAACAATCACTTGAATGGAACTATTCCAAACTCCCTAGGAAAACTGGGAAATCTAACCCACTTGGACCTATCTAATAACCACTTGTTTGGGGGTCTTCCTTGTAGTATAACAGCACTTGTCAATCTAAAGTATTTGATTCTGAACAATAATAATTTAACTGGATATCTTCCTAATTGTATTGGACAATTCATCAGTCTAAACACCTTGATTATTTCTTCTAATCATTTTTATGGTGTCATTCCTAGGAGTCTTGAGCAATTAGTCAGCCTAGAAAACCTTGATGTGTCAGAAAACGGTCTGAATGGTACAATCCCACAAAATATTGGTAAACTTTCAAATTTGCAAACCCTCTATCTTAGTCAAAATAAATTGCAAGGGAAATTTCCTGATAGTTTTGGTCAACTTTTGAACCTGCGCAATTTAGACTTGTCTCTCAACAATTTGGAAGGCATATTTTCTGAAATAAAATTTCCCAATTCACTAGCCTATGTGAATCTCACCAATAACCATATCACTGGGTCACTACCCCAAAATATTGCTCATAGATTGCCCAATCTTACTCACTTGCTTCTTGGACACAACCTCATAAATGACTCCATTCCAAATTCAATCTGCAAAATCAACTCTCTGTACAATCTCGACCTTTCAGTGAACAAATTAATTGGCAACATTCCTGATTGTTGGAATTCAACTCAAAGATTGAACGAGATAAATCTTTCATCGAACAAATTATCAGGTGTTATTCCAAGCTCGTTCGGTCAGCTTTCAACTTTGCTATGGCTGCATTTGAATAATAACAATCTTCATGGGGAGTTTCCATCATTCTTGAGAAATTTAAAACAACTGTTAATCTTAGACATTGGAGAGAATCAAATGTCGGGAACTATACCTTCATGGATAGGTGACATTTTCTCCCTAATGCAGATTCTAAGGTTAAGACAAAACAAGTTCCAAGGTAACATTCCATCACATCTTTGCAAACTTTCAGCTTTGCAAATCTTGGATCTATCCAACAACATGTTGATGGGGTCAATCCCACACTGCGTTGGGAATTTTACAGCAATGATTCAAGGATGGAAACCATCTGTTTCCTTAGCACCCAGTGAGTCGACATATATTGAATGGTATGAACAAGATGTCAGCCAGGTCATTAAAGGAAGAGAAGATCATTATACAAAAAATTTGAAATTTGTGGCCAATTTGGATTTATCAAACAACAATTTGAGTGGACCTATTCCAAAAGAAATAACTCTTCTGACTGGTTTACGAGGCCTAAATCTGTCACACAATCATTTGTCAGGTAAAATTCCTACAGCCATAGGGGACATGAAGTTACTTGAATCGTTGGACTTCTCTCAGGGTCAACTTTCAGGCTCAATTCCACACACCATGTCTAGTTTAACTTTTCTATCTGTACTAAACTTGTCCTACAACAACCTTTCAGGACCAATTCCACAAGGAAACCAGTTTTTGACATTTAATGATCCATCTATTTATGTTGGCAACAATCTTTGTGGTGCACCATTGTTGAATCGTTGCCATGTTGATAATAGAGATGAAAGTGGAGTTGATGATGGTAAGCATGACAGGGCTGAGAAACTATGGTTTTATTTTGTTGTAGCAATTGGATTTGCTACTGGCTTTTGGGTTTTTATTGGAGTTTTCTTGTTGAAGAAGGGTCGGAGGGATGCTTACTTTAATTTCATTGATAGGGTAGTGCGCAGGATAAAGAAAAGATGTATGGGAAACCGTATTGATTAG
Protein sequence

>MsG0280008805.01.T01

MVLSRNESTSQKRCKAVVAVFHDGSRLSFTNVYLQRHYNGQVKQERQALLALKGSFNDTSLRLSSWEGNDCCKWKGISCSNITGHVIKIDLRNPCYPQRGDDYQSNCSFSKNKLEAPEIHPSLSNFIYLSYLDLSGNNFNSSPIPTFIHFMNQLEFLSISDSHLSGIIPNNLGNLTKLSFLDLSFNSYLHSDDVYWVSKLSLLQKLYLSDVFLGRAQNLLKVITMLPSLLELELMNCSITKMHSHDHQLVSYTNFSGIVSLNLADNGLDGPDLNAFRNMTSLETIDLSNNSFTSVPIWLSNCAKLDSLYLGSNALNGSVPSALRNLTSLTLLDLSQNKIESVPLWLGGLESLLYLNISWNHVNHIEGSIPTMLGNMCQLLSLDLSGNRLQGDALIGNLQSARCNGSGLEELDMTNNNFNDQLPTWLGQLENMVTLTLYSSFFHGPIPKILGKLSNLEYLILANNHLNGTIPNSLGKLGNLTHLDLSNNHLFGGLPCSITALVNLKYLILNNNNLTGYLPNCIGQFISLNTLIISSNHFYGVIPRSLEQLVSLENLDVSENGLNGTIPQNIGKLSNLQTLYLSQNKLQGKFPDSFGQLLNLRNLDLSLNNLEGIFSEIKFPNSLAYVNLTNNHITGSLPQNIAHRLPNLTHLLLGHNLINDSIPNSICKINSLYNLDLSVNKLIGNIPDCWNSTQRLNEINLSSNKLSGVIPSSFGQLSTLLWLHLNNNNLHGEFPSFLRNLKQLLILDIGENQMSGTIPSWIGDIFSLMQILRLRQNKFQGNIPSHLCKLSALQILDLSNNMLMGSIPHCVGNFTAMIQGWKPSVSLAPSESTYIEWYEQDVSQVIKGREDHYTKNLKFVANLDLSNNNLSGPIPKEITLLTGLRGLNLSHNHLSGKIPTAIGDMKLLESLDFSQGQLSGSIPHTMSSLTFLSVLNLSYNNLSGPIPQGNQFLTFNDPSIYVGNNLCGAPLLNRCHVDNRDESGVDDGKHDRAEKLWFYFVVAIGFATGFWVFIGVFLLKKGRRDAYFNFIDRVVRRIKKRCMGNRID*