AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280009033.01

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MsG0280009033.01.T01 AT3G24240 31.579 665 355 12 380 968 83 723 1.12e-65 241
MsG0280009033.01.T01 AT3G24240 31.333 600 375 16 116 690 97 684 9.33e-54 205
MsG0280009033.01.T01 AT3G24240 32.530 581 363 14 90 666 144 699 2.91e-49 191
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MsG0280009033.01.T01 AT1G75640 30.317 663 378 9 122 710 66 718 1.85e-55 210
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MsG0280009033.01.T01 AT4G28650 30.669 613 357 16 17 612 30 591 8.58e-49 189
MsG0280009033.01.T01 AT1G17250 31.307 658 419 15 365 1000 107 753 5.37e-61 223
MsG0280009033.01.T01 AT1G17250 25.762 656 364 22 13 568 52 684 1.03e-25 114
MsG0280009033.01.T01 AT1G17250 33.681 288 154 9 647 920 101 365 2.17e-23 107
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MsG0280009033.01.T01 AT2G32660 27.576 689 385 18 9 611 19 679 1.08e-38 155
MsG0280009033.01.T01 AT1G72300 30.710 648 396 16 337 966 104 716 4.20e-60 224
MsG0280009033.01.T01 AT1G72300 28.901 564 332 14 276 780 93 646 4.83e-44 174
MsG0280009033.01.T01 AT1G72300 27.365 687 346 22 13 610 48 670 1.13e-31 134
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MsG0280009033.01.T01 AT2G41820 30.488 492 274 8 250 734 61 491 6.43e-48 185
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MsG0280009033.01.T01 AT2G41820 30.469 384 205 5 575 958 68 389 1.16e-31 134
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MsG0280009033.01.T01 AT3G47570 30.017 573 326 7 424 942 64 615 1.14e-54 207
MsG0280009033.01.T01 AT3G47570 31.646 632 360 16 15 635 23 593 2.93e-52 199
MsG0280009033.01.T01 AT3G47570 30.603 232 141 3 711 942 63 274 9.38e-17 86.3
MsG0280009033.01.T01 AT3G47570 30.126 239 123 10 110 343 395 594 1.89e-11 68.9
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MsG0280009033.01.T01 AT1G09970 32.573 482 307 9 257 731 77 547 1.01e-47 185
MsG0280009033.01.T01 AT1G09970 29.215 599 357 14 19 610 32 570 6.85e-38 154
MsG0280009033.01.T01 AT1G09970 30.000 260 137 5 663 920 69 285 8.08e-15 80.1
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MsG0280009033.01.T01 AT5G49290 30.335 478 273 19 101 569 261 687 1.23e-20 98.6
MsG0280009033.01.T01 AT2G15042 33.143 350 222 9 648 992 59 401 6.04e-44 166
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MsG0280009033.01.T01 AT2G15042 31.068 309 160 8 274 563 52 326 2.00e-27 117
MsG0280009033.01.T01 AT2G15042 28.986 276 156 8 229 467 54 326 8.90e-19 90.9
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MsG0280009033.01.T01 AT4G13820 27.926 752 436 30 3 700 19 718 2.30e-38 154
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MsG0280009033.01.T01 AT1G34420 31.568 472 288 9 344 791 102 562 8.22e-42 166
MsG0280009033.01.T01 AT1G34420 33.072 511 287 17 153 635 92 575 2.74e-36 149
MsG0280009033.01.T01 AT1G34420 34.307 411 231 11 521 923 106 485 4.02e-30 129
MsG0280009033.01.T01 AT1G34420 31.785 409 230 9 522 919 87 457 7.43e-28 122
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MsG0280009033.01.T01 AT3G02130 29.514 576 347 15 355 919 124 651 4.85e-38 155
MsG0280009033.01.T01 AT3G02130 27.653 622 343 16 226 757 142 746 2.83e-35 146
MsG0280009033.01.T01 AT3G02130 25.557 763 421 27 15 687 44 749 2.14e-29 127
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MsG0280009033.01.T01 AT5G66330 32.353 272 171 6 374 636 71 338 8.94e-27 114
MsG0280009033.01.T01 AT5G66330 29.836 305 190 7 230 521 82 375 3.22e-21 98.2
MsG0280009033.01.T01 AT5G66330 28.667 300 164 6 667 939 81 357 3.58e-17 85.9
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MsG0280009033.01.T01 AT1G33670 30.110 362 208 10 616 944 101 450 6.70e-29 122
MsG0280009033.01.T01 AT1G33670 28.788 330 176 12 598 873 108 432 1.69e-23 105
MsG0280009033.01.T01 AT1G33670 30.029 343 193 13 287 599 116 441 2.36e-19 92.8
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MsG0280009033.01.T01 AT2G19780 28.295 258 138 5 639 895 106 317 3.79e-17 85.5
MsG0280009033.01.T01 AT2G19780 28.090 267 145 5 620 885 111 331 8.68e-17 84.3
MsG0280009033.01.T01 AT2G19780 31.915 235 137 5 686 919 105 317 9.60e-16 81.3
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MsG0280009033.01.T01 AT1G67510 34.595 185 119 2 383 565 77 261 2.01e-17 88.2
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MsG0280009033.01.T01 AT1G27180 25.249 503 337 14 394 895 672 1136 2.00e-17 88.6
MsG0280009033.01.T01 AT1G27180 25.562 489 328 13 271 748 698 1161 2.73e-16 85.1
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MsG0280009033.01.T01 AT3G17640 28.638 213 115 8 380 566 116 317 9.30e-12 68.6
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MsG0280009033.01.T01 AT4G23740 38.760 129 76 3 438 564 80 207 3.55e-12 70.9
MsG0280009033.01.T01 AT4G23740 40.769 130 72 5 534 660 80 207 2.91e-11 68.2
MsG0280009033.01.T01 AT5G35390 34.959 123 73 3 827 948 118 234 4.27e-12 70.9
MsG0280009033.01.T01 AT1G63430 37.838 111 69 0 402 512 69 179 4.55e-12 70.5
MsG0280009033.01.T01 AT1G63430 29.630 189 99 3 481 667 76 232 6.58e-12 70.1
MsG0280009033.01.T01 AT1G63430 35.294 119 76 1 661 779 64 181 2.26e-11 68.6
MsG0280009033.01.T01 AT1G63430 31.646 158 90 1 382 521 73 230 4.60e-11 67.4
MsG0280009033.01.T01 AT1G63430 37.838 111 69 0 402 512 69 179 4.55e-12 70.5
MsG0280009033.01.T01 AT1G63430 29.630 189 99 3 481 667 76 232 6.58e-12 70.1
MsG0280009033.01.T01 AT1G63430 35.294 119 76 1 661 779 64 181 2.26e-11 68.6
MsG0280009033.01.T01 AT1G63430 31.646 158 90 1 382 521 73 230 4.60e-11 67.4
MsG0280009033.01.T01 AT1G63430 37.838 111 69 0 402 512 69 179 5.36e-12 70.5
MsG0280009033.01.T01 AT1G63430 29.630 189 99 3 481 667 76 232 7.68e-12 70.1
MsG0280009033.01.T01 AT1G63430 35.294 119 76 1 661 779 64 181 2.32e-11 68.6
MsG0280009033.01.T01 AT1G63430 31.646 158 90 1 382 521 73 230 5.10e-11 67.4
MsG0280009033.01.T01 AT3G49750 42.424 99 57 0 818 916 85 183 6.92e-12 65.9
MsG0280009033.01.T01 AT5G65240 33.696 184 112 5 362 540 23 201 1.07e-11 69.3
MsG0280009033.01.T01 AT5G24100 34.395 157 93 5 635 786 63 214 1.18e-11 69.3
MsG0280009033.01.T01 AT5G24100 28.655 171 116 3 328 497 49 214 1.89e-11 68.6
MsG0280009033.01.T01 AT5G45800 29.245 212 99 7 710 918 76 239 1.18e-11 68.9
MsG0280009033.01.T01 AT5G45800 32.195 205 110 5 428 631 57 233 3.76e-11 67.4
MsG0280009033.01.T01 AT5G45800 28.627 255 146 6 376 626 78 300 4.48e-11 67.0
MsG0280009033.01.T01 AT4G33430 30.918 207 106 5 372 541 24 230 1.24e-11 69.3
MsG0280009033.01.T01 AT5G65240 33.696 184 112 5 362 540 23 201 1.29e-11 69.3
MsG0280009033.01.T01 AT2G36570 37.313 134 78 4 827 960 111 238 1.33e-11 69.3
MsG0280009033.01.T01 AT4G16162 30.827 133 91 1 435 567 36 167 1.46e-11 64.7
MsG0280009033.01.T01 AT4G16162 30.345 145 96 2 371 515 24 163 3.20e-11 63.5
MsG0280009033.01.T01 AT4G16162 30.827 133 91 1 435 567 36 167 1.46e-11 64.7
MsG0280009033.01.T01 AT4G16162 30.345 145 96 2 371 515 24 163 3.20e-11 63.5
MsG0280009033.01.T01 AT1G10850 36.806 144 80 5 423 563 70 205 1.78e-11 68.9
MsG0280009033.01.T01 AT4G31250 31.210 157 102 4 456 610 59 211 2.19e-11 68.6
MsG0280009033.01.T01 AT4G31250 29.651 172 114 3 593 763 74 239 8.56e-11 66.6
MsG0280009033.01.T01 AT4G16162 35.652 115 72 2 369 483 19 131 2.22e-11 63.5
MsG0280009033.01.T01 AT3G42880 32.544 169 103 4 593 760 66 224 2.28e-11 68.2
MsG0280009033.01.T01 AT3G42880 31.288 163 88 3 398 560 87 225 9.79e-11 66.2
MsG0280009033.01.T01 AT5G45800 27.236 246 124 9 710 949 76 272 2.69e-11 68.2
MsG0280009033.01.T01 AT3G25510 27.848 395 254 9 397 789 453 818 2.99e-11 68.6
MsG0280009033.01.T01 AT3G25510 27.848 395 254 9 397 789 453 818 2.99e-11 68.6
MsG0280009033.01.T01 AT1G68400 37.908 153 66 6 837 967 98 243 4.80e-11 67.4
MsG0280009033.01.T01 AT3G20190 35.075 134 83 3 605 737 106 236 8.30e-11 66.6

Find 200 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 243 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTCTCTCAGGGTCAACTTTC+AGG 0.141808 2:-43815796 MsG0280009033.01.T01:CDS
AATGATTGTGTGACAGATTT+AGG 0.202249 2:+43815875 None:intergenic
ATTTGGAATGGAGTCATTTA+TGG 0.202452 2:+43816563 None:intergenic
TTGTCCTACAACAACCTTTC+AGG 0.206903 2:-43815724 MsG0280009033.01.T01:CDS
TTGGATTTGCTACAGGCTTT+TGG 0.208556 2:-43815519 MsG0280009033.01.T01:CDS
GTGAGGTTTCCAAGGTTATT+TGG 0.210709 2:+43818028 None:intergenic
CTTTCAGTGAACAAATTAAT+TGG 0.213420 2:-43816504 MsG0280009033.01.T01:CDS
GATAGAGAAGGATGGATTTC+TGG 0.214240 2:+43818184 None:intergenic
ATTCTAACTGATTCATAAAA+TGG 0.220358 2:+43818089 None:intergenic
AATCTTACTCACTTGCTTCT+TGG 0.220679 2:-43816594 MsG0280009033.01.T01:CDS
GCACAATTACTCAACCAAAT+TGG 0.226950 2:+43817647 None:intergenic
CTTACTTTAATTTCATTGAT+AGG 0.244114 2:-43815453 MsG0280009033.01.T01:CDS
AACTGGTTTCCTTGTGGAAT+TGG 0.251304 2:+43815700 None:intergenic
CATCACTCAGGTAAAGGTTT+TGG 0.267846 2:+43817924 None:intergenic
TCCAAACTCCCTAGGAAAAC+TGG 0.267882 2:-43817123 MsG0280009033.01.T01:CDS
AAATTGAATCTGTTCCATTA+TGG 0.268029 2:-43817520 MsG0280009033.01.T01:CDS
AATTTCAGCTTTGCAAATCT+TGG 0.270353 2:-43816166 MsG0280009033.01.T01:CDS
TCTCCCTAATGCAGATTCTA+AGG 0.282834 2:-43816236 MsG0280009033.01.T01:CDS
TTAACCTTAGAATCTGCATT+AGG 0.284171 2:+43816232 None:intergenic
CTATCAAATAACCACTTGTT+TGG 0.289555 2:-43817080 MsG0280009033.01.T01:CDS
GGGAAATTTCCTGATAGTTT+TGG 0.290577 2:-43816771 MsG0280009033.01.T01:CDS
CTAAACAATAATAATTTAAC+TGG 0.292133 2:-43817008 MsG0280009033.01.T01:CDS
AGACTTGTCTCTCAACAATT+TGG 0.292446 2:-43816724 MsG0280009033.01.T01:CDS
TACAAGAAATTTGAAATTAG+TGG 0.303300 2:-43815974 MsG0280009033.01.T01:CDS
TATCAAATAACCACTTGTTT+GGG 0.305346 2:-43817079 MsG0280009033.01.T01:CDS
TGAGGTTTCCAAGGTTATTT+GGG 0.305708 2:+43818029 None:intergenic
GTTGGGGCAACTTGAAAATA+TGG 0.308538 2:-43817258 MsG0280009033.01.T01:CDS
CTTAGTTATTTAGACCTTAG+TGG 0.317297 2:-43818148 MsG0280009033.01.T01:CDS
TATTGTACCTCAATATTTCA+TGG 0.317868 2:-43817478 MsG0280009033.01.T01:CDS
CTTTCATCGAACAAATTATC+AGG 0.319201 2:-43816432 MsG0280009033.01.T01:CDS
CAACTGTTAATCTTAGATAT+TGG 0.321251 2:-43816306 MsG0280009033.01.T01:CDS
AAGGAAATGACTGTTGTAAA+TGG 0.322481 2:-43818333 MsG0280009033.01.T01:CDS
CACATATTTCCTAGCATTGT+TGG 0.332714 2:+43817425 None:intergenic
TGTCGACTCACTGGGGTCTA+AGG 0.333278 2:+43816056 None:intergenic
CGGGAAGTGACCCAGTGATA+TGG 0.334445 2:+43816640 None:intergenic
ATGAATTGTCCAATACAATT+AGG 0.343026 2:+43816978 None:intergenic
TTGAATAATAACAATCTTCA+TGG 0.346707 2:-43816360 MsG0280009033.01.T01:CDS
TCACTCAATCTTGCAGATAA+TGG 0.352846 2:-43817755 MsG0280009033.01.T01:CDS
AGAGTTATTTCTCTAGGAAT+AGG 0.355312 2:+43815916 None:intergenic
AAACTTGACTCTCTTTATCT+TGG 0.357405 2:-43817623 MsG0280009033.01.T01:CDS
ATGATGATGGTAAGCATGAT+AGG 0.359967 2:-43815576 MsG0280009033.01.T01:CDS
ATGCAATGGATCTGCTTTAG+AGG 0.362162 2:-43817327 MsG0280009033.01.T01:CDS
CTTCTCTTCCTTTAATGACC+TGG 0.362271 2:+43816004 None:intergenic
GATCAGCTGCCAACATGGTT+GGG 0.365322 2:-43817275 MsG0280009033.01.T01:CDS
TGAGTTGAATTCCAACAATC+AGG 0.365465 2:+43816474 None:intergenic
CTTGGAAGCAATGCTCTTAA+CGG 0.366161 2:-43817605 MsG0280009033.01.T01:CDS
TACACTCTGATGATGTCAAT+TGG 0.369512 2:-43817967 MsG0280009033.01.T01:CDS
GGATATCTTCCTAATTGTAT+TGG 0.372631 2:-43816987 MsG0280009033.01.T01:CDS
CAAACAAGTGGTTATTTGAT+AGG 0.373962 2:+43817081 None:intergenic
CTTGCAGATAATGGACTTGA+TGG 0.374558 2:-43817746 MsG0280009033.01.T01:CDS
TCTAGTAGCCATTCATCATT+TGG 0.381346 2:-43818436 MsG0280009033.01.T01:CDS
TTGTTGCCAACATAAATAGA+TGG 0.383075 2:+43815661 None:intergenic
ATTCACATAGGCTAGTGAAT+TGG 0.387363 2:+43816674 None:intergenic
TGAATCGTTGGACCTCTCTC+AGG 0.387734 2:-43815809 MsG0280009033.01.T01:CDS
TTGGGATGATACCACTCAAA+TGG 0.391415 2:+43818047 None:intergenic
CTGATCATTGAAATTGTTGT+TGG 0.392123 2:+43817292 None:intergenic
AAGAAGCAAGTGAGTAAGAT+TGG 0.395349 2:+43816596 None:intergenic
CATCATTAAGACTTTCCTCT+TGG 0.396796 2:-43818357 MsG0280009033.01.T01:CDS
TTCAATGTTTGTCGACTCAC+TGG 0.399588 2:+43816047 None:intergenic
TAACCTTAGAATCTGCATTA+GGG 0.402764 2:+43816233 None:intergenic
TGATAATCTACTCCTCTTTG+TGG 0.404007 2:+43818244 None:intergenic
GGCACAATCCCACAAAATAT+TGG 0.405947 2:-43816843 MsG0280009033.01.T01:CDS
GAATCTGTTCCATTATGGTT+AGG 0.410128 2:-43817515 MsG0280009033.01.T01:CDS
TTCACATAGGCTAGTGAATT+GGG 0.410619 2:+43816675 None:intergenic
TTGGCAACATTCCTGATTGT+TGG 0.410936 2:-43816485 MsG0280009033.01.T01:CDS
ATAAGTTGCAGCAACATTAC+AGG 0.411979 2:-43818304 MsG0280009033.01.T01:CDS
TCTAACCCACCTAACCATAA+TGG 0.415361 2:+43817506 None:intergenic
AAGATAAAGAGAGTCAAGTT+TGG 0.419419 2:+43817625 None:intergenic
TTTAGATTTCTCAAGAATGA+TGG 0.420813 2:+43816330 None:intergenic
AAAAGTTGACCAAAACTATC+AGG 0.421856 2:+43816762 None:intergenic
CAGGATAAAGAAAAGATGTA+TGG 0.427363 2:-43815422 MsG0280009033.01.T01:CDS
TGGTCCTGAAAGGTTGTTGT+AGG 0.427465 2:+43815720 None:intergenic
GATGTCAGCCAGGTCATTAA+AGG 0.429958 2:-43816012 MsG0280009033.01.T01:CDS
TTGGTATAGAACCCTCAATA+TGG 0.430432 2:+43817444 None:intergenic
AAATGGATAAAAGTTGGTAT+TGG 0.430643 2:+43818106 None:intergenic
TTTGGGAAAATTGTCAAACT+TGG 0.432194 2:-43817186 MsG0280009033.01.T01:CDS
AATTGAAATTGTTTCCACTA+AGG 0.433236 2:+43818134 None:intergenic
GTTAAATTAGACATGGTGTA+TGG 0.435909 2:+43815766 None:intergenic
GTCAAATTTCTAAGAGCTGA+TGG 0.440688 2:+43817575 None:intergenic
TTTCTAAAAGCATTCAGATC+TGG 0.445069 2:+43817722 None:intergenic
TGTCAGGAACTATACCTTCA+TGG 0.445625 2:-43816272 MsG0280009033.01.T01:CDS
GATAATCTACTCCTCTTTGT+GGG 0.446153 2:+43818245 None:intergenic
TTGTCTGGAAACAGACTTCA+AGG 0.448539 2:-43817383 MsG0280009033.01.T01:CDS
TTCATAAAATGGATAAAAGT+TGG 0.449029 2:+43818100 None:intergenic
ACACTCTGATGATGTCAATT+GGG 0.452421 2:-43817966 MsG0280009033.01.T01:CDS
GGTCAATCCCACACTGCGTT+GGG 0.452806 2:-43816119 MsG0280009033.01.T01:CDS
GAGAGCACAAAATTTATTCA+AGG 0.454397 2:-43817891 MsG0280009033.01.T01:CDS
GTAGCAATTGGATTTGCTAC+AGG 0.455403 2:-43815526 MsG0280009033.01.T01:CDS
CTTGCTAACAATCACTTGAA+TGG 0.461661 2:-43817152 MsG0280009033.01.T01:CDS
TCTGTTCCATTATGGTTAGG+TGG 0.467893 2:-43817512 MsG0280009033.01.T01:CDS
TCATGTTTCACTAATCAATA+CGG 0.470688 2:+43815395 None:intergenic
ACTCCTCTTTGTGGGTAGCA+TGG 0.472793 2:+43818253 None:intergenic
TCAATGTTTGTCGACTCACT+GGG 0.473002 2:+43816048 None:intergenic
ATGTTGTCAAAATTGACCTT+AGG 0.473330 2:-43818279 MsG0280009033.01.T01:CDS
TGAATAATAACAATCTTCAT+GGG 0.473849 2:-43816359 MsG0280009033.01.T01:CDS
GTGAGAAGAGTTATTTCTCT+AGG 0.474162 2:+43815910 None:intergenic
GTCAGCTTTCAACTTTGCTA+TGG 0.474722 2:-43816389 MsG0280009033.01.T01:CDS
TGACCCCATCAACATGTTGT+TGG 0.475315 2:+43816137 None:intergenic
TCTATCCAACAACATGTTGA+TGG 0.476950 2:-43816142 MsG0280009033.01.T01:CDS
AACTAAAACTATTGTTAGAA+AGG 0.477153 2:+43817675 None:intergenic
AATGATCCATCTATTTATGT+TGG 0.479064 2:-43815667 MsG0280009033.01.T01:CDS
AATTCTAATTCTAGCAAAGA+AGG 0.480897 2:+43817854 None:intergenic
CTGTCACACAATCATTTGTC+AGG 0.481359 2:-43815868 MsG0280009033.01.T01:CDS
CATTCAAGTGATTGTTAGCA+AGG 0.482674 2:+43817153 None:intergenic
TGATCAGCTGCCAACATGGT+TGG 0.482858 2:-43817276 MsG0280009033.01.T01:CDS
CTTCTGTCACTAGATTTGTC+TGG 0.485423 2:-43817398 MsG0280009033.01.T01:CDS
GAAAGCTGACCGAACGAGCT+TGG 0.487445 2:+43816402 None:intergenic
TTACTTTAATTTCATTGATA+GGG 0.487970 2:-43815452 MsG0280009033.01.T01:CDS
CATGATTCCATGAAATATTG+AGG 0.490584 2:+43817471 None:intergenic
TTGATCATGACTGTGCATCT+TGG 0.492446 2:+43817814 None:intergenic
ACTAATTGCTCAAGACTCCT+AGG 0.493412 2:+43816906 None:intergenic
TGGGATGATACCACTCAAAT+GGG 0.496059 2:+43818048 None:intergenic
GTGAAATTCCTACAGCCATA+GGG 0.498025 2:-43815846 MsG0280009033.01.T01:CDS
CTCACCAACAACCATATCAC+TGG 0.499919 2:-43816651 MsG0280009033.01.T01:CDS
CTGTTCCATTATGGTTAGGT+GGG 0.502075 2:-43817511 MsG0280009033.01.T01:CDS
CAATTAATTTGTTCACTGAA+AGG 0.503091 2:+43816505 None:intergenic
AATGGGAATCAGAGATAGAA+AGG 0.505145 2:+43818065 None:intergenic
ATCTCTGATTCCCATTTGAG+TGG 0.506280 2:-43818058 MsG0280009033.01.T01:CDS
GTTGGCAACAAATATCTTTG+TGG 0.508069 2:-43815649 MsG0280009033.01.T01:CDS
ACTGGGAAATTTAATCCACT+TGG 0.508266 2:-43817105 MsG0280009033.01.T01:CDS
GAATCATGTGAACCATATTG+AGG 0.508599 2:-43817456 MsG0280009033.01.T01:CDS
AGAAGCAAGTGAGTAAGATT+GGG 0.511321 2:+43816597 None:intergenic
CTTGTGGAATTGGTCCTGAA+AGG 0.512688 2:+43815710 None:intergenic
ATCAGCTGCCAACATGGTTG+GGG 0.518329 2:-43817274 MsG0280009033.01.T01:CDS
CTTAGTCAAAATAAATTGCA+AGG 0.519434 2:-43816792 MsG0280009033.01.T01:CDS
TTTGCAGATTGAATTTGGAA+TGG 0.520898 2:+43816551 None:intergenic
GTGGGTAGCATGGATTCCTA+AGG 0.521203 2:+43818263 None:intergenic
TTAAGACTTTCCTCTTGGAA+AGG 0.521358 2:-43818352 MsG0280009033.01.T01:CDS
GGTGTTATTCCAAGCTCGTT+CGG 0.521393 2:-43816411 MsG0280009033.01.T01:CDS
CCAAACTCCCTAGGAAAACT+GGG 0.521412 2:-43817122 MsG0280009033.01.T01:CDS
ATTGGAGAGAATCAAATGTC+AGG 0.521686 2:-43816288 MsG0280009033.01.T01:CDS
CATGACGTCACTTGAATCGT+TGG 0.527119 2:-43815821 MsG0280009033.01.T01:CDS
CTATCCAACAACATGTTGAT+GGG 0.528188 2:-43816141 MsG0280009033.01.T01:CDS
ATCAAATAACCACTTGTTTG+GGG 0.529627 2:-43817078 MsG0280009033.01.T01:CDS
AAGTGACGTCATGTCCCCTA+TGG 0.530521 2:+43815831 None:intergenic
GTTGATAATAGAGATGAAAG+TGG 0.531497 2:-43815601 MsG0280009033.01.T01:CDS
TATATAAAAGTTGATAGAGA+AGG 0.539494 2:+43818172 None:intergenic
GGTGAAATTCCTACAGCCAT+AGG 0.539549 2:-43815847 MsG0280009033.01.T01:CDS
GTGAGTCGACAAACATTGAA+TGG 0.541115 2:-43816044 MsG0280009033.01.T01:CDS
CTATGCAACCAAATGATGAA+TGG 0.544148 2:+43818428 None:intergenic
TTGTCTCTCAACAATTTGGA+AGG 0.546197 2:-43816720 MsG0280009033.01.T01:CDS
GGTATCATCCCAAATAACCT+TGG 0.546539 2:-43818037 MsG0280009033.01.T01:CDS
TGACCCAGTGATATGGTTGT+TGG 0.548174 2:+43816647 None:intergenic
TTGCAATCTGCAAGATGCAA+TGG 0.549873 2:-43817341 MsG0280009033.01.T01:CDS
ATGATTAGAAGAAATAATCA+AGG 0.552591 2:+43816944 None:intergenic
GGAACTATTCCAAACTCCCT+AGG 0.553443 2:-43817131 MsG0280009033.01.T01:CDS
AATCATGTGAACCATATTGA+GGG 0.554710 2:-43817455 MsG0280009033.01.T01:CDS
GGTTCTATACCAACAATGCT+AGG 0.559326 2:-43817434 MsG0280009033.01.T01:CDS
AGGATAAAGAAAAGATGTAT+GGG 0.560709 2:-43815421 MsG0280009033.01.T01:CDS
TAAAAGTTGATAGAGAAGGA+TGG 0.561350 2:+43818176 None:intergenic
CATGCTCTTGTAGCACTCAA+AGG 0.562430 2:-43818394 MsG0280009033.01.T01:CDS
GGGTCAATCCCACACTGCGT+TGG 0.565613 2:-43816120 MsG0280009033.01.T01:CDS
AAAACTTGAATTAAGTGTGA+GGG 0.567765 2:+43817232 None:intergenic
GGAACTATACCTTCATGGAT+AGG 0.570375 2:-43816267 MsG0280009033.01.T01:CDS
AATGACTGTTGTAAATGGAA+AGG 0.570615 2:-43818328 MsG0280009033.01.T01:CDS
TTACAGCAATGATTCAAGGA+TGG 0.573038 2:-43816092 MsG0280009033.01.T01:CDS
GTGTCAGAAAACTCTCTGAA+TGG 0.575582 2:-43816864 MsG0280009033.01.T01:CDS
GTTGTTTGATAAATCCACAT+TGG 0.576150 2:+43815951 None:intergenic
GAGACAAGTCTAAATTGCGC+AGG 0.576823 2:+43816736 None:intergenic
TTCTAGCAAAGAAGGAAGCA+TGG 0.577865 2:+43817862 None:intergenic
ACAAGTGCTGTTATACTACA+AGG 0.583497 2:+43817050 None:intergenic
TTATCAAACAACAATTTGAG+TGG 0.583575 2:-43815940 MsG0280009033.01.T01:CDS
TCAAATAACCACTTGTTTGG+GGG 0.584356 2:-43817077 MsG0280009033.01.T01:CDS
CTTGTTGAAGAAGGGTCGGA+GGG 0.585471 2:-43815479 MsG0280009033.01.T01:CDS
TTAAGTCAAAACAAGTTCCA+AGG 0.590398 2:-43816213 MsG0280009033.01.T01:CDS
TTTGAAATTAGTGGCCAATG+TGG 0.590793 2:-43815965 MsG0280009033.01.T01:CDS
TAAAATTCCCAACGCAGTGT+GGG 0.590861 2:+43816112 None:intergenic
TTAGTCAAAATAAATTGCAA+GGG 0.592263 2:-43816791 MsG0280009033.01.T01:CDS
AAAATGTCACCTATCCATGA+AGG 0.592613 2:+43816258 None:intergenic
GTTGTTGGTGAGATTCACAT+AGG 0.596468 2:+43816662 None:intergenic
GAATCGTTGGACCTCTCTCA+GGG 0.601124 2:-43815808 MsG0280009033.01.T01:CDS
ACAGTCATTTCCTTTCCAAG+AGG 0.603673 2:+43818342 None:intergenic
CTGAAAGTTGACCCTGAGAG+AGG 0.610369 2:+43815797 None:intergenic
GGAAAGGTCAAGCAATGTCA+AGG 0.612768 2:+43817550 None:intergenic
TCAAGTTGCCCCAACCATGT+TGG 0.616192 2:+43817266 None:intergenic
TCAATGATCAGCTGCCAACA+TGG 0.617081 2:-43817280 MsG0280009033.01.T01:CDS
GATGTGATGGAATGTTACCT+TGG 0.617351 2:+43816196 None:intergenic
CTTCAAGGAGATGCACTCAT+CGG 0.621081 2:-43817368 MsG0280009033.01.T01:CDS
CTGGGGTCTAAGGAAACAGA+TGG 0.621292 2:+43816066 None:intergenic
GTACGAACAAGATGTCAGCC+AGG 0.623434 2:-43816022 MsG0280009033.01.T01:CDS
TGATGATGGTAAGCATGATA+GGG 0.623883 2:-43815575 MsG0280009033.01.T01:CDS
TCTTGTTGAAGAAGGGTCGG+AGG 0.624434 2:-43815480 MsG0280009033.01.T01:CDS
TTGGTTGCATAGAACAAGAG+AGG 0.627395 2:-43818417 MsG0280009033.01.T01:CDS
GAATAATAACAATCTTCATG+GGG 0.628681 2:-43816358 MsG0280009033.01.T01:CDS
TCATTGATAGGGTAGTGCGC+AGG 0.634051 2:-43815441 MsG0280009033.01.T01:CDS
ACTCTTCTCACTGCTTTACG+TGG 0.635162 2:-43815898 MsG0280009033.01.T01:CDS
GATGAAAGTGGAGATGATGA+TGG 0.640922 2:-43815589 MsG0280009033.01.T01:CDS
ATGATAGGGCTGAGAAACTG+TGG 0.646913 2:-43815561 MsG0280009033.01.T01:CDS
TGAAATTCCTACAGCCATAG+GGG 0.648001 2:-43815845 MsG0280009033.01.T01:CDS
CTTTCAGGACCAATTCCACA+AGG 0.649800 2:-43815709 MsG0280009033.01.T01:CDS
AATCCATGCTACCCACAAAG+AGG 0.651566 2:-43818256 MsG0280009033.01.T01:CDS
GTCATGTCCCCTATGGCTGT+AGG 0.652186 2:+43815838 None:intergenic
GTAAAATTCCCAACGCAGTG+TGG 0.652293 2:+43816111 None:intergenic
TTTCATCTCTATTATCAACA+TGG 0.653208 2:+43815605 None:intergenic
TCACCAACAACCATATCACT+GGG 0.659050 2:-43816650 MsG0280009033.01.T01:CDS
GGTTATTTGATAGGTCCAAG+TGG 0.664414 2:+43817090 None:intergenic
TATCCAACAACATGTTGATG+GGG 0.667795 2:-43816140 MsG0280009033.01.T01:CDS
CAATGTTTGTCGACTCACTG+GGG 0.675539 2:+43816049 None:intergenic
TAGAAAAGTTAAATTAGACA+TGG 0.678801 2:+43815759 None:intergenic
ACATGGCAACGATTCAACAA+TGG 0.687962 2:+43815622 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! CTAAACAATAATAATTTAAC+TGG - Chr2:43816845-43816864 MsG0280009033.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATTTCTTCTAATCATTTTTA+TGG - Chr2:43816917-43816936 MsG0280009033.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTACTTTAATTTCATTGATA+GGG - Chr2:43818401-43818420 MsG0280009033.01.T01:CDS 15.0%
!! AACTAAAACTATTGTTAGAA+AGG + Chr2:43816181-43816200 None:intergenic 20.0%
!! ATGATTAGAAGAAATAATCA+AGG + Chr2:43816912-43816931 None:intergenic 20.0%
!! GATCATTAAATGTTAAAAAC+TGG + Chr2:43818173-43818192 None:intergenic 20.0%
!! TAGAAAAGTTAAATTAGACA+TGG + Chr2:43818097-43818116 None:intergenic 20.0%
!! TGAATAATAACAATCTTCAT+GGG - Chr2:43817494-43817513 MsG0280009033.01.T01:CDS 20.0%
!! TTAGTCAAAATAAATTGCAA+GGG - Chr2:43817062-43817081 MsG0280009033.01.T01:CDS 20.0%
!! TTCATAAAATGGATAAAAGT+TGG + Chr2:43815756-43815775 None:intergenic 20.0%
!! TTGAATAATAACAATCTTCA+TGG - Chr2:43817493-43817512 MsG0280009033.01.T01:CDS 20.0%
!!! AACAGATTCAATTTTGTTTT+GGG + Chr2:43816327-43816346 None:intergenic 20.0%
!!! ATTCTAACTGATTCATAAAA+TGG + Chr2:43815767-43815786 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTATTTTGACTAAGATAG+AGG + Chr2:43817057-43817076 None:intergenic 20.0%
!!! CTTACTTTAATTTCATTGAT+AGG - Chr2:43818400-43818419 MsG0280009033.01.T01:CDS 20.0%
!!! TACAAGAAATTTGAAATTAG+TGG - Chr2:43817879-43817898 MsG0280009033.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATATAAAAGTTGATAGAGA+AGG + Chr2:43815684-43815703 None:intergenic 20.0%
!!! TTTATTTTGACTAAGATAGA+GGG + Chr2:43817056-43817075 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTATTTTGTTGTAGCAAT+TGG - Chr2:43818315-43818334 MsG0280009033.01.T01:CDS 20.0%
! AAAAACTTGAATTAAGTGTG+AGG + Chr2:43816625-43816644 None:intergenic 25.0%
! AAAACTTGAATTAAGTGTGA+GGG + Chr2:43816624-43816643 None:intergenic 25.0%
! AAATTGAATCTGTTCCATTA+TGG - Chr2:43816333-43816352 MsG0280009033.01.T01:CDS 25.0%
! AATGATCCATCTATTTATGT+TGG - Chr2:43818186-43818205 MsG0280009033.01.T01:CDS 25.0%
! AATTCTAATTCTAGCAAAGA+AGG + Chr2:43816002-43816021 None:intergenic 25.0%
! AATTGAAATTGTTTCCACTA+AGG + Chr2:43815722-43815741 None:intergenic 25.0%
! AGGATAAAGAAAAGATGTAT+GGG - Chr2:43818432-43818451 MsG0280009033.01.T01:CDS 25.0%
! ATGAATTGTCCAATACAATT+AGG + Chr2:43816878-43816897 None:intergenic 25.0%
! CAACTGTTAATCTTAGATAT+TGG - Chr2:43817547-43817566 MsG0280009033.01.T01:CDS 25.0%
! CTTAGTCAAAATAAATTGCA+AGG - Chr2:43817061-43817080 MsG0280009033.01.T01:CDS 25.0%
! CTTTCAGTGAACAAATTAAT+TGG - Chr2:43817349-43817368 MsG0280009033.01.T01:CDS 25.0%
! GAATAATAACAATCTTCATG+GGG - Chr2:43817495-43817514 MsG0280009033.01.T01:CDS 25.0%
! TATCAAATAACCACTTGTTT+GGG - Chr2:43816774-43816793 MsG0280009033.01.T01:CDS 25.0%
! TATTGTACCTCAATATTTCA+TGG - Chr2:43816375-43816394 MsG0280009033.01.T01:CDS 25.0%
! TTATCAAACAACAATTTGAG+TGG - Chr2:43817913-43817932 MsG0280009033.01.T01:CDS 25.0%
! TTTAGATTTCTCAAGAATGA+TGG + Chr2:43817526-43817545 None:intergenic 25.0%
! TTTCATCTCTATTATCAACA+TGG + Chr2:43818251-43818270 None:intergenic 25.0%
!! AATCTATGAGCAATATTTTC+GGG + Chr2:43817235-43817254 None:intergenic 25.0%
!! AATTTTACAGCAATGATTCA+AGG - Chr2:43817757-43817776 MsG0280009033.01.T01:CDS 25.0%
!! CAATCTATGAGCAATATTTT+CGG + Chr2:43817236-43817255 None:intergenic 25.0%
!! GACAATTTTCCCAAAAATTT+TGG + Chr2:43816662-43816681 None:intergenic 25.0%
!! TTGATTTTGCAGATTGAATT+TGG + Chr2:43817310-43817329 None:intergenic 25.0%
!!! AAATGGATAAAAGTTGGTAT+TGG + Chr2:43815750-43815769 None:intergenic 25.0%
!!! ATTCAATTTTGTTTTGGGAA+AGG + Chr2:43816322-43816341 None:intergenic 25.0%
!!! CAATTAATTTGTTCACTGAA+AGG + Chr2:43817351-43817370 None:intergenic 25.0%
!!! CTTAATTCAAGTTTTTTCCA+TGG - Chr2:43816629-43816648 MsG0280009033.01.T01:CDS 25.0%
!!! GAACAGATTCAATTTTGTTT+TGG + Chr2:43816328-43816347 None:intergenic 25.0%
!!! TTCAAGCTTATTTTTTGAGA+AGG + Chr2:43815646-43815665 None:intergenic 25.0%
!!! TTTCCCAAAAATTTTGGAAT+AGG + Chr2:43816656-43816675 None:intergenic 25.0%
AAAAGTTGACCAAAACTATC+AGG + Chr2:43817094-43817113 None:intergenic 30.0%
AAACTTGACTCTCTTTATCT+TGG - Chr2:43816230-43816249 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
AAGATAAAGAGAGTCAAGTT+TGG + Chr2:43816231-43816250 None:intergenic 30.0%
AAGGAAATGACTGTTGTAAA+TGG - Chr2:43815520-43815539 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
AATCATGTGAACCATATTGA+GGG - Chr2:43816398-43816417 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
AATGACTGTTGTAAATGGAA+AGG - Chr2:43815525-43815544 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
AATGATTGTGTGACAGATTT+AGG + Chr2:43817981-43818000 None:intergenic 30.0%
AATTTCAGCTTTGCAAATCT+TGG - Chr2:43817687-43817706 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
ATCAAATAACCACTTGTTTG+GGG - Chr2:43816775-43816794 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
ATGTTGTCAAAATTGACCTT+AGG - Chr2:43815574-43815593 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
CAAACAAGTGGTTATTTGAT+AGG + Chr2:43816775-43816794 None:intergenic 30.0%
CAGGATAAAGAAAAGATGTA+TGG - Chr2:43818431-43818450 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
CATGATTCCATGAAATATTG+AGG + Chr2:43816385-43816404 None:intergenic 30.0%
CTATCAAATAACCACTTGTT+TGG - Chr2:43816773-43816792 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
CTGATCATTGAAATTGTTGT+TGG + Chr2:43816564-43816583 None:intergenic 30.0%
CTTAGTTATTTAGACCTTAG+TGG - Chr2:43815705-43815724 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
CTTTCATCGAACAAATTATC+AGG - Chr2:43817421-43817440 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
GGATATCTTCCTAATTGTAT+TGG - Chr2:43816866-43816885 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
GTTAAATTAGACATGGTGTA+TGG + Chr2:43818090-43818109 None:intergenic 30.0%
GTTGTTTGATAAATCCACAT+TGG + Chr2:43817905-43817924 None:intergenic 30.0%
TAACCTTAGAATCTGCATTA+GGG + Chr2:43817623-43817642 None:intergenic 30.0%
TTAACCTTAGAATCTGCATT+AGG + Chr2:43817624-43817643 None:intergenic 30.0%
TTAAGTCAAAACAAGTTCCA+AGG - Chr2:43817640-43817659 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
TTGTTGCCAACATAAATAGA+TGG + Chr2:43818195-43818214 None:intergenic 30.0%
TTTGCAGATTGAATTTGGAA+TGG + Chr2:43817305-43817324 None:intergenic 30.0%
TTTGGGAAAATTGTCAAACT+TGG - Chr2:43816667-43816686 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
! AAAGTCGACCAATATTTTGT+GGG + Chr2:43817021-43817040 None:intergenic 30.0%
! ATTTGGAATGGAGTCATTTA+TGG + Chr2:43817293-43817312 None:intergenic 30.0%
! GAAATTTTGCAAAGATGTGA+TGG + Chr2:43817673-43817692 None:intergenic 30.0%
! GAGAGCACAAAATTTATTCA+AGG - Chr2:43815962-43815981 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
! GGTCCTATTCCAAAATTTTT+GGG - Chr2:43816650-43816669 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
! TAAATTTCCCAGTTTTCCTA+GGG + Chr2:43816741-43816760 None:intergenic 30.0%
! TGGTCCTATTCCAAAATTTT+TGG - Chr2:43816649-43816668 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
! TTAAATTTCCCAGTTTTCCT+AGG + Chr2:43816742-43816761 None:intergenic 30.0%
!! AGAGTTATTTCTCTAGGAAT+AGG + Chr2:43817940-43817959 None:intergenic 30.0%
!! CAAGAAAGTACAATTTTGTG+AGG + Chr2:43815845-43815864 None:intergenic 30.0%
!! GTTGATAATAGAGATGAAAG+TGG - Chr2:43818252-43818271 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
!! TAAAAGTTGATAGAGAAGGA+TGG + Chr2:43815680-43815699 None:intergenic 30.0%
!! TTTCTAAAAGCATTCAGATC+TGG + Chr2:43816134-43816153 None:intergenic 30.0%
!!! AAAATTTTGGAATAGGACCA+TGG + Chr2:43816649-43816668 None:intergenic 30.0%
!!! ATTTTTATGGTGTCATTCCT+AGG - Chr2:43816930-43816949 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTTTTAGTTCAGTTCCAATT+TGG - Chr2:43816192-43816211 MsG0280009033.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTTTGAGAAGGAACAGTT+TGG + Chr2:43815636-43815655 None:intergenic 30.0%
AAAATGTCACCTATCCATGA+AGG + Chr2:43817598-43817617 None:intergenic 35.0%
AAGAAGCAAGTGAGTAAGAT+TGG + Chr2:43817260-43817279 None:intergenic 35.0%
AATCTTACTCACTTGCTTCT+TGG - Chr2:43817259-43817278 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
AATGGGAATCAGAGATAGAA+AGG + Chr2:43815791-43815810 None:intergenic 35.0%
ACTGGGAAATTTAATCCACT+TGG - Chr2:43816748-43816767 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
AGAAGCAAGTGAGTAAGATT+GGG + Chr2:43817259-43817278 None:intergenic 35.0%
AGACTTGTCTCTCAACAATT+TGG - Chr2:43817129-43817148 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
ATAAGTTGCAGCAACATTAC+AGG - Chr2:43815549-43815568 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
ATTCACATAGGCTAGTGAAT+TGG + Chr2:43817182-43817201 None:intergenic 35.0%
ATTGGAGAGAATCAAATGTC+AGG - Chr2:43817565-43817584 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
CACATATTTCCTAGCATTGT+TGG + Chr2:43816431-43816450 None:intergenic 35.0%
CATCATTAAGACTTTCCTCT+TGG - Chr2:43815496-43815515 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
CATTCAAGTGATTGTTAGCA+AGG + Chr2:43816703-43816722 None:intergenic 35.0%
CTATCCAACAACATGTTGAT+GGG - Chr2:43817712-43817731 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
CTATGCAACCAAATGATGAA+TGG + Chr2:43815428-43815447 None:intergenic 35.0%
CTTGCTAACAATCACTTGAA+TGG - Chr2:43816701-43816720 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
GAAAAACATCACTCAGGTAA+AGG + Chr2:43815938-43815957 None:intergenic 35.0%
GAATCATGTGAACCATATTG+AGG - Chr2:43816397-43816416 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
GAATCTGTTCCATTATGGTT+AGG - Chr2:43816338-43816357 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
GATAATCTACTCCTCTTTGT+GGG + Chr2:43815611-43815630 None:intergenic 35.0%
GCACAATTACTCAACCAAAT+TGG + Chr2:43816209-43816228 None:intergenic 35.0%
GTTGGCAACAAATATCTTTG+TGG - Chr2:43818204-43818223 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
TATCCAACAACATGTTGATG+GGG - Chr2:43817713-43817732 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
TCAAATAACCACTTGTTTGG+GGG - Chr2:43816776-43816795 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
TCACTCAATCTTGCAGATAA+TGG - Chr2:43816098-43816117 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
TCTAGTAGCCATTCATCATT+TGG - Chr2:43815417-43815436 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
TCTATCCAACAACATGTTGA+TGG - Chr2:43817711-43817730 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
TGAGGTTTCCAAGGTTATTT+GGG + Chr2:43815827-43815846 None:intergenic 35.0%
TGATAATCTACTCCTCTTTG+TGG + Chr2:43815612-43815631 None:intergenic 35.0%
TTAAGACTTTCCTCTTGGAA+AGG - Chr2:43815501-43815520 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
TTACAGCAATGATTCAAGGA+TGG - Chr2:43817761-43817780 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
TTCACATAGGCTAGTGAATT+GGG + Chr2:43817181-43817200 None:intergenic 35.0%
TTGGTATAGAACCCTCAATA+TGG + Chr2:43816412-43816431 None:intergenic 35.0%
TTGTCTCTCAACAATTTGGA+AGG - Chr2:43817133-43817152 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
! ACAAGTGCTGTTATACTACA+AGG + Chr2:43816806-43816825 None:intergenic 35.0%
! ACAATTTTGTGAGGTTTCCA+AGG + Chr2:43815836-43815855 None:intergenic 35.0%
! ACACTCTGATGATGTCAATT+GGG - Chr2:43815887-43815906 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
! ACCTGAGTGATGTTTTTCTT+GGG - Chr2:43815940-43815959 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
! GAAAGTCGACCAATATTTTG+TGG + Chr2:43817022-43817041 None:intergenic 35.0%
! GGAGTTTTCTTGTTGAAGAA+GGG - Chr2:43818366-43818385 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
! GGGAAATTTCCTGATAGTTT+TGG - Chr2:43817082-43817101 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
! GTCAAATTTCTAAGAGCTGA+TGG + Chr2:43816281-43816300 None:intergenic 35.0%
! GTTAAAAACTGGTTTCCTTG+TGG + Chr2:43818162-43818181 None:intergenic 35.0%
! TACACTCTGATGATGTCAAT+TGG - Chr2:43815886-43815905 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
! TACCTGAGTGATGTTTTTCT+TGG - Chr2:43815939-43815958 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
! TGAGTTGAATTCCAACAATC+AGG + Chr2:43817382-43817401 None:intergenic 35.0%
! TGGAGTTTTCTTGTTGAAGA+AGG - Chr2:43818365-43818384 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGAAATTAGTGGCCAATG+TGG - Chr2:43817888-43817907 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTCTTGTTGAAGAAGGGT+CGG - Chr2:43818370-43818389 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
!! ATGATGATGGTAAGCATGAT+AGG - Chr2:43818277-43818296 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
!! GTGAGAAGAGTTATTTCTCT+AGG + Chr2:43817946-43817965 None:intergenic 35.0%
!! TGATGATGGTAAGCATGATA+GGG - Chr2:43818278-43818297 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACAGGCTTTTGGGTTTTTAT+TGG - Chr2:43818345-43818364 MsG0280009033.01.T01:CDS 35.0%
!!! CTGACACATCAAGGTTTTTT+AGG + Chr2:43816976-43816995 None:intergenic 35.0%
ACAGTCATTTCCTTTCCAAG+AGG + Chr2:43815514-43815533 None:intergenic 40.0%
ACATGGCAACGATTCAACAA+TGG + Chr2:43818234-43818253 None:intergenic 40.0%
ACTAATTGCTCAAGACTCCT+AGG + Chr2:43816950-43816969 None:intergenic 40.0%
ATCTCTGATTCCCATTTGAG+TGG - Chr2:43815795-43815814 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
ATGCAATGGATCTGCTTTAG+AGG - Chr2:43816526-43816545 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
CTGTCACACAATCATTTGTC+AGG - Chr2:43817985-43818004 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
CTGTTCCATTATGGTTAGGT+GGG - Chr2:43816342-43816361 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
CTTCTCTTCCTTTAATGACC+TGG + Chr2:43817852-43817871 None:intergenic 40.0%
CTTCTGTCACTAGATTTGTC+TGG - Chr2:43816455-43816474 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
CTTGGAAGCAATGCTCTTAA+CGG - Chr2:43816248-43816267 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
GATGAAAGTGGAGATGATGA+TGG - Chr2:43818264-43818283 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
GGAACTATACCTTCATGGAT+AGG - Chr2:43817586-43817605 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
GGCACAATCCCACAAAATAT+TGG - Chr2:43817010-43817029 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
GGTATCATCCCAAATAACCT+TGG - Chr2:43815816-43815835 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
GGTTATTTGATAGGTCCAAG+TGG + Chr2:43816766-43816785 None:intergenic 40.0%
GGTTCTATACCAACAATGCT+AGG - Chr2:43816419-43816438 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
GTCAGCTTTCAACTTTGCTA+TGG - Chr2:43817464-43817483 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
GTGAAATTCCTACAGCCATA+GGG - Chr2:43818007-43818026 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
GTGAGGTTTCCAAGGTTATT+TGG + Chr2:43815828-43815847 None:intergenic 40.0%
GTGAGTCGACAAACATTGAA+TGG - Chr2:43817809-43817828 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
GTGTCAGAAAACTCTCTGAA+TGG - Chr2:43816989-43817008 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
GTTGGGGCAACTTGAAAATA+TGG - Chr2:43816595-43816614 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
TAAAATTCCCAACGCAGTGT+GGG + Chr2:43817744-43817763 None:intergenic 40.0%
TCACCAACAACCATATCACT+GGG - Chr2:43817203-43817222 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
TCCCAAGAAAAACATCACTC+AGG + Chr2:43815944-43815963 None:intergenic 40.0%
TCTAACCCACCTAACCATAA+TGG + Chr2:43816350-43816369 None:intergenic 40.0%
TCTCCCTAATGCAGATTCTA+AGG - Chr2:43817617-43817636 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
TCTGTTCCATTATGGTTAGG+TGG - Chr2:43816341-43816360 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
TGAAATTCCTACAGCCATAG+GGG - Chr2:43818008-43818027 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
TGGGATGATACCACTCAAAT+GGG + Chr2:43815808-43815827 None:intergenic 40.0%
TGTCAGGAACTATACCTTCA+TGG - Chr2:43817581-43817600 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
TTCTAGCAAAGAAGGAAGCA+TGG + Chr2:43815994-43816013 None:intergenic 40.0%
TTGATCATGACTGTGCATCT+TGG + Chr2:43816042-43816061 None:intergenic 40.0%
TTGCAATCTGCAAGATGCAA+TGG - Chr2:43816512-43816531 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
TTGGCAACATTCCTGATTGT+TGG - Chr2:43817368-43817387 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
TTGGGATGATACCACTCAAA+TGG + Chr2:43815809-43815828 None:intergenic 40.0%
TTGGTTGCATAGAACAAGAG+AGG - Chr2:43815436-43815455 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
TTGTCCTACAACAACCTTTC+AGG - Chr2:43818129-43818148 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
TTGTCTGGAAACAGACTTCA+AGG - Chr2:43816470-43816489 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
! AACTGGTTTCCTTGTGGAAT+TGG + Chr2:43818156-43818175 None:intergenic 40.0%
! CATCACTCAGGTAAAGGTTT+TGG + Chr2:43815932-43815951 None:intergenic 40.0%
! GAGAGTTTTCTGACACATCA+AGG + Chr2:43816985-43817004 None:intergenic 40.0%
! GATAGAGAAGGATGGATTTC+TGG + Chr2:43815672-43815691 None:intergenic 40.0%
! GATGTGATGGAATGTTACCT+TGG + Chr2:43817660-43817679 None:intergenic 40.0%
! GTTGTTGGTGAGATTCACAT+AGG + Chr2:43817194-43817213 None:intergenic 40.0%
!! CTTGCAGATAATGGACTTGA+TGG - Chr2:43816107-43816126 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
!! GTAGCAATTGGATTTGCTAC+AGG - Chr2:43818327-43818346 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
!! TCAATGTTTGTCGACTCACT+GGG + Chr2:43817808-43817827 None:intergenic 40.0%
!! TTCAATGTTTGTCGACTCAC+TGG + Chr2:43817809-43817828 None:intergenic 40.0%
!!! TGGATTTGCTACAGGCTTTT+GGG - Chr2:43818335-43818354 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
!!! TTGGATTTGCTACAGGCTTT+TGG - Chr2:43818334-43818353 MsG0280009033.01.T01:CDS 40.0%
AATCCATGCTACCCACAAAG+AGG - Chr2:43815597-43815616 MsG0280009033.01.T01:CDS 45.0%
ACTCTTCTCACTGCTTTACG+TGG - Chr2:43817955-43817974 MsG0280009033.01.T01:CDS 45.0%
ATGATAGGGCTGAGAAACTG+TGG - Chr2:43818292-43818311 MsG0280009033.01.T01:CDS 45.0%
CATGACGTCACTTGAATCGT+TGG - Chr2:43818032-43818051 MsG0280009033.01.T01:CDS 45.0%
CATGCTCTTGTAGCACTCAA+AGG - Chr2:43815459-43815478 MsG0280009033.01.T01:CDS 45.0%
CCAAACTCCCTAGGAAAACT+GGG - Chr2:43816731-43816750 MsG0280009033.01.T01:CDS 45.0%
CTCACCAACAACCATATCAC+TGG - Chr2:43817202-43817221 MsG0280009033.01.T01:CDS 45.0%
CTTCAAGGAGATGCACTCAT+CGG - Chr2:43816485-43816504 MsG0280009033.01.T01:CDS 45.0%
CTTGTGGAATTGGTCCTGAA+AGG + Chr2:43818146-43818165 None:intergenic 45.0%
CTTTCAGGACCAATTCCACA+AGG - Chr2:43818144-43818163 MsG0280009033.01.T01:CDS 45.0%
GAGACAAGTCTAAATTGCGC+AGG + Chr2:43817120-43817139 None:intergenic 45.0%
GATGTCAGCCAGGTCATTAA+AGG - Chr2:43817841-43817860 MsG0280009033.01.T01:CDS 45.0%
GGAAAGGTCAAGCAATGTCA+AGG + Chr2:43816306-43816325 None:intergenic 45.0%
GGAACTATTCCAAACTCCCT+AGG - Chr2:43816722-43816741 MsG0280009033.01.T01:CDS 45.0%
GGTGAAATTCCTACAGCCAT+AGG - Chr2:43818006-43818025 MsG0280009033.01.T01:CDS 45.0%
GTAAAATTCCCAACGCAGTG+TGG + Chr2:43817745-43817764 None:intergenic 45.0%
TCAATGATCAGCTGCCAACA+TGG - Chr2:43816573-43816592 MsG0280009033.01.T01:CDS 45.0%
TCCAAACTCCCTAGGAAAAC+TGG - Chr2:43816730-43816749 MsG0280009033.01.T01:CDS 45.0%
TGACCCAGTGATATGGTTGT+TGG + Chr2:43817209-43817228 None:intergenic 45.0%
TGACCCCATCAACATGTTGT+TGG + Chr2:43817719-43817738 None:intergenic 45.0%
TGGTCCTGAAAGGTTGTTGT+AGG + Chr2:43818136-43818155 None:intergenic 45.0%
!! CAATGTTTGTCGACTCACTG+GGG + Chr2:43817807-43817826 None:intergenic 45.0%
!! GGTGTTATTCCAAGCTCGTT+CGG - Chr2:43817442-43817461 MsG0280009033.01.T01:CDS 45.0%
AAGGAAGACCCCCAAACAAG+TGG + Chr2:43816787-43816806 None:intergenic 50.0%
AAGTGACGTCATGTCCCCTA+TGG + Chr2:43818025-43818044 None:intergenic 50.0%
ACTCCTCTTTGTGGGTAGCA+TGG + Chr2:43815603-43815622 None:intergenic 50.0%
ATCAGCTGCCAACATGGTTG+GGG - Chr2:43816579-43816598 MsG0280009033.01.T01:CDS 50.0%
CTCTCTCAGGGTCAACTTTC+AGG - Chr2:43818057-43818076 MsG0280009033.01.T01:CDS 50.0%
CTGAAAGTTGACCCTGAGAG+AGG + Chr2:43818059-43818078 None:intergenic 50.0%
CTGGGGTCTAAGGAAACAGA+TGG + Chr2:43817790-43817809 None:intergenic 50.0%
CTTGTTGAAGAAGGGTCGGA+GGG - Chr2:43818374-43818393 MsG0280009033.01.T01:CDS 50.0%
GAATCGTTGGACCTCTCTCA+GGG - Chr2:43818045-43818064 MsG0280009033.01.T01:CDS 50.0%
GATCAGCTGCCAACATGGTT+GGG - Chr2:43816578-43816597 MsG0280009033.01.T01:CDS 50.0%
GTACGAACAAGATGTCAGCC+AGG - Chr2:43817831-43817850 MsG0280009033.01.T01:CDS 50.0%
GTGGGTAGCATGGATTCCTA+AGG + Chr2:43815593-43815612 None:intergenic 50.0%
TCATTGATAGGGTAGTGCGC+AGG - Chr2:43818412-43818431 MsG0280009033.01.T01:CDS 50.0%
TCTTGTTGAAGAAGGGTCGG+AGG - Chr2:43818373-43818392 MsG0280009033.01.T01:CDS 50.0%
TGAATCGTTGGACCTCTCTC+AGG - Chr2:43818044-43818063 MsG0280009033.01.T01:CDS 50.0%
TGATCAGCTGCCAACATGGT+TGG - Chr2:43816577-43816596 MsG0280009033.01.T01:CDS 50.0%
! CCCAGTTTTCCTAGGGAGTT+TGG + Chr2:43816734-43816753 None:intergenic 50.0%
! TCAAGTTGCCCCAACCATGT+TGG + Chr2:43816590-43816609 None:intergenic 50.0%
CGGGAAGTGACCCAGTGATA+TGG + Chr2:43817216-43817235 None:intergenic 55.0%
GAAAGCTGACCGAACGAGCT+TGG + Chr2:43817454-43817473 None:intergenic 55.0%
GGTCAATCCCACACTGCGTT+GGG - Chr2:43817734-43817753 MsG0280009033.01.T01:CDS 55.0%
GTCATGTCCCCTATGGCTGT+AGG + Chr2:43818018-43818037 None:intergenic 55.0%
!! TGTCGACTCACTGGGGTCTA+AGG + Chr2:43817800-43817819 None:intergenic 55.0%
GGGTCAATCCCACACTGCGT+TGG - Chr2:43817733-43817752 MsG0280009033.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 43815405 43818470 43815405 ID=MsG0280009033.01;Name=MsG0280009033.01
Chr2 mRNA 43815405 43818470 43815405 ID=MsG0280009033.01.T01;Parent=MsG0280009033.01;Name=MsG0280009033.01.T01;_AED=0.17;_eAED=0.17;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|1021
Chr2 exon 43815405 43818470 43815405 ID=MsG0280009033.01.T01:exon:17120;Parent=MsG0280009033.01.T01
Chr2 CDS 43815405 43818470 43815405 ID=MsG0280009033.01.T01:cds;Parent=MsG0280009033.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280009033.01.T01

ATGTTACTATGTTCTAGTAGCCATTCATCATTTGGTTGCATAGAACAAGAGAGGCATGCTCTTGTAGCACTCAAAGGAAGCTTTAATGATACATCATTAAGACTTTCCTCTTGGAAAGGAAATGACTGTTGTAAATGGAAAGGTATAAGTTGCAGCAACATTACAGGACATGTTGTCAAAATTGACCTTAGGAATCCATGCTACCCACAAAGAGGAGTAGATTATCAACCAAACTGTTCCTTCTCAAAAAATAAGCTTGAAGCTCCAGAAATCCATCCTTCTCTATCAACTTTTATATATCTTAGTTATTTAGACCTTAGTGGAAACAATTTCAATTCAAGTCCAATACCAACTTTTATCCATTTTATGAATCAGTTAGAATTCCTTTCTATCTCTGATTCCCATTTGAGTGGTATCATCCCAAATAACCTTGGAAACCTCACAAAATTGTACTTTCTTGATCTCAGTTTCAATTCTTATTTACACTCTGATGATGTCAATTGGGTTTCAAAACTTTCATTGCTCCAAAACCTTTACCTGAGTGATGTTTTTCTTGGGAGAGCACAAAATTTATTCAAGGTAATTACCATGCTTCCTTCTTTGCTAGAATTAGAATTGATGAACTGCAGCATAACCAAGATGCACAGTCATGATCAACAACTTGTTAGTTTCACAAATTTTTCTAGTATTGAGTCACTCAATCTTGCAGATAATGGACTTGATGGTCCAGATCTGAATGCTTTTAGAAACATGACTTCACTTGAAACTATTGACCTTTCTAACAATAGTTTTAGTTCAGTTCCAATTTGGTTGAGTAATTGTGCCAAACTTGACTCTCTTTATCTTGGAAGCAATGCTCTTAACGGTTCAGTTCCATCAGCTCTTAGAAATTTGACTTCCTTGACATTGCTTGACCTTTCCCAAAACAAAATTGAATCTGTTCCATTATGGTTAGGTGGGTTAGAGAGTCTATTGTACCTCAATATTTCATGGAATCATGTGAACCATATTGAGGGTTCTATACCAACAATGCTAGGAAATATGTGTCAGCTTCTGTCACTAGATTTGTCTGGAAACAGACTTCAAGGAGATGCACTCATCGGTAATTTGCAATCTGCAAGATGCAATGGATCTGCTTTAGAGGAACTTGACATGACCAACAACAATTTCAATGATCAGCTGCCAACATGGTTGGGGCAACTTGAAAATATGGTAACCCTCACACTTAATTCAAGTTTTTTCCATGGTCCTATTCCAAAATTTTTGGGAAAATTGTCAAACTTGGAATATTTAATCCTTGCTAACAATCACTTGAATGGAACTATTCCAAACTCCCTAGGAAAACTGGGAAATTTAATCCACTTGGACCTATCAAATAACCACTTGTTTGGGGGTCTTCCTTGTAGTATAACAGCACTTGTCAATCTAAAGTATTTGATTCTAAACAATAATAATTTAACTGGATATCTTCCTAATTGTATTGGACAATTCATCAGACTAAACACCTTGATTATTTCTTCTAATCATTTTTATGGTGTCATTCCTAGGAGTCTTGAGCAATTAGTCAGCCTAAAAAACCTTGATGTGTCAGAAAACTCTCTGAATGGCACAATCCCACAAAATATTGGTCGACTTTCAAATTTGCAAACCCTCTATCTTAGTCAAAATAAATTGCAAGGGAAATTTCCTGATAGTTTTGGTCAACTTTTGAACCTGCGCAATTTAGACTTGTCTCTCAACAATTTGGAAGGAATATTTTCTGAAATAAAATTTCCCAATTCACTAGCCTATGTGAATCTCACCAACAACCATATCACTGGGTCACTTCCCGAAAATATTGCTCATAGATTGCCCAATCTTACTCACTTGCTTCTTGGAAACAACTCCATAAATGACTCCATTCCAAATTCAATCTGCAAAATCAACTCTTTGTACAATCTTGACCTTTCAGTGAACAAATTAATTGGCAACATTCCTGATTGTTGGAATTCAACTCAAAGATTGAACGAGATAAATCTTTCATCGAACAAATTATCAGGTGTTATTCCAAGCTCGTTCGGTCAGCTTTCAACTTTGCTATGGCTGCATTTGAATAATAACAATCTTCATGGGGAGTTTCCATCATTCTTGAGAAATCTAAAACAACTGTTAATCTTAGATATTGGAGAGAATCAAATGTCAGGAACTATACCTTCATGGATAGGTGACATTTTCTCCCTAATGCAGATTCTAAGGTTAAGTCAAAACAAGTTCCAAGGTAACATTCCATCACATCTTTGCAAAATTTCAGCTTTGCAAATCTTGGATCTATCCAACAACATGTTGATGGGGTCAATCCCACACTGCGTTGGGAATTTTACAGCAATGATTCAAGGATGGAAACCATCTGTTTCCTTAGACCCCAGTGAGTCGACAAACATTGAATGGTACGAACAAGATGTCAGCCAGGTCATTAAAGGAAGAGAAGATCATTATACAAGAAATTTGAAATTAGTGGCCAATGTGGATTTATCAAACAACAATTTGAGTGGTCCTATTCCTAGAGAAATAACTCTTCTCACTGCTTTACGTGGCCTAAATCTGTCACACAATCATTTGTCAGGTGAAATTCCTACAGCCATAGGGGACATGACGTCACTTGAATCGTTGGACCTCTCTCAGGGTCAACTTTCAGGCTCAATTCCATACACCATGTCTAATTTAACTTTTCTATCTGCACTAAACTTGTCCTACAACAACCTTTCAGGACCAATTCCACAAGGAAACCAGTTTTTAACATTTAATGATCCATCTATTTATGTTGGCAACAAATATCTTTGTGGTGCACCATTGTTGAATCGTTGCCATGTTGATAATAGAGATGAAAGTGGAGATGATGATGGTAAGCATGATAGGGCTGAGAAACTGTGGTTTTATTTTGTTGTAGCAATTGGATTTGCTACAGGCTTTTGGGTTTTTATTGGAGTTTTCTTGTTGAAGAAGGGTCGGAGGGATGCTTACTTTAATTTCATTGATAGGGTAGTGCGCAGGATAAAGAAAAGATGTATGGGAAACCGTATTGATTAG
Protein sequence

>MsG0280009033.01.T01

MLLCSSSHSSFGCIEQERHALVALKGSFNDTSLRLSSWKGNDCCKWKGISCSNITGHVVKIDLRNPCYPQRGVDYQPNCSFSKNKLEAPEIHPSLSTFIYLSYLDLSGNNFNSSPIPTFIHFMNQLEFLSISDSHLSGIIPNNLGNLTKLYFLDLSFNSYLHSDDVNWVSKLSLLQNLYLSDVFLGRAQNLFKVITMLPSLLELELMNCSITKMHSHDQQLVSFTNFSSIESLNLADNGLDGPDLNAFRNMTSLETIDLSNNSFSSVPIWLSNCAKLDSLYLGSNALNGSVPSALRNLTSLTLLDLSQNKIESVPLWLGGLESLLYLNISWNHVNHIEGSIPTMLGNMCQLLSLDLSGNRLQGDALIGNLQSARCNGSALEELDMTNNNFNDQLPTWLGQLENMVTLTLNSSFFHGPIPKFLGKLSNLEYLILANNHLNGTIPNSLGKLGNLIHLDLSNNHLFGGLPCSITALVNLKYLILNNNNLTGYLPNCIGQFIRLNTLIISSNHFYGVIPRSLEQLVSLKNLDVSENSLNGTIPQNIGRLSNLQTLYLSQNKLQGKFPDSFGQLLNLRNLDLSLNNLEGIFSEIKFPNSLAYVNLTNNHITGSLPENIAHRLPNLTHLLLGNNSINDSIPNSICKINSLYNLDLSVNKLIGNIPDCWNSTQRLNEINLSSNKLSGVIPSSFGQLSTLLWLHLNNNNLHGEFPSFLRNLKQLLILDIGENQMSGTIPSWIGDIFSLMQILRLSQNKFQGNIPSHLCKISALQILDLSNNMLMGSIPHCVGNFTAMIQGWKPSVSLDPSESTNIEWYEQDVSQVIKGREDHYTRNLKLVANVDLSNNNLSGPIPREITLLTALRGLNLSHNHLSGEIPTAIGDMTSLESLDLSQGQLSGSIPYTMSNLTFLSALNLSYNNLSGPIPQGNQFLTFNDPSIYVGNKYLCGAPLLNRCHVDNRDESGDDDGKHDRAEKLWFYFVVAIGFATGFWVFIGVFLLKKGRRDAYFNFIDRVVRRIKKRCMGNRID*