AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280010269.01

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MsG0280010269.01.T01 AT1G76370 45.161 310 152 4 5 308 53 350 1.55e-80 251
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MsG0280010269.01.T01 AT5G16900 45.485 299 156 4 15 311 554 847 2.35e-78 258
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MsG0280010269.01.T01 AT5G01950 45.763 295 149 3 22 311 612 900 1.16e-75 252
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MsG0280010269.01.T01 AT5G13160 44.710 293 150 5 24 308 74 362 2.34e-73 235
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MsG0280010269.01.T01 AT5G02070 40.532 301 169 3 22 312 349 649 2.99e-72 238
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MsG0280010269.01.T01 AT4G35600 40.129 309 171 5 11 308 62 367 6.85e-72 231
MsG0280010269.01.T01 AT1G51790 40.584 308 175 4 9 313 601 903 7.05e-72 241
MsG0280010269.01.T01 AT2G37050 45.847 301 152 7 24 318 593 888 7.34e-72 241
MsG0280010269.01.T01 AT2G19230 43.051 295 165 2 22 316 557 848 8.09e-72 241
MsG0280010269.01.T01 AT3G24540 43.945 289 155 3 24 307 171 457 8.24e-72 232
MsG0280010269.01.T01 AT1G51890 42.222 315 154 4 22 313 558 867 8.78e-72 241
MsG0280010269.01.T01 AT3G24550 41.503 306 174 2 24 325 268 572 1.02e-71 236
MsG0280010269.01.T01 AT1G07570 40.741 324 177 5 14 324 47 368 1.15e-71 229
MsG0280010269.01.T01 AT1G07570 40.741 324 177 5 14 324 47 368 1.15e-71 229
MsG0280010269.01.T01 AT1G07570 40.741 324 177 5 14 324 47 368 1.15e-71 229
MsG0280010269.01.T01 AT3G55450 40.854 328 169 8 4 315 69 387 1.38e-71 230
MsG0280010269.01.T01 AT2G18470 43.197 294 159 4 24 312 272 562 2.26e-71 235
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MsG0280010269.01.T01 AT2G19230 43.051 295 165 2 22 316 558 849 2.70e-71 241
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MsG0280010269.01.T01 AT1G07570 40.741 324 177 5 14 324 58 379 3.60e-71 229
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MsG0280010269.01.T01 AT1G07550 41.290 310 175 5 6 314 532 835 2.91e-66 225
MsG0280010269.01.T01 AT1G07870 41.237 291 163 4 24 308 91 379 3.15e-66 219
MsG0280010269.01.T01 AT4G32710 39.339 333 193 3 23 346 376 708 3.41e-66 223
MsG0280010269.01.T01 AT1G26150 45.238 252 127 4 13 257 401 648 4.29e-66 221
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MsG0280010269.01.T01 AT1G56130 40.176 341 199 3 23 360 681 1019 5.74e-66 226
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MsG0280010269.01.T01 AT1G21240 41.924 291 162 5 45 332 163 449 6.34e-66 217
MsG0280010269.01.T01 AT1G05700 41.017 295 169 4 23 316 559 849 6.63e-66 224
MsG0280010269.01.T01 AT1G53430 42.466 292 165 2 24 313 657 947 7.23e-66 226
MsG0280010269.01.T01 AT1G09440 39.100 289 173 2 21 307 142 429 7.48e-66 216
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MsG0280010269.01.T01 AT5G18500 40.138 289 170 2 21 307 151 438 8.43e-66 216
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MsG0280010269.01.T01 AT1G21590 38.028 284 173 2 22 303 355 637 8.66e-62 211
MsG0280010269.01.T01 AT5G45780 42.123 292 155 6 24 307 245 530 9.81e-62 208
MsG0280010269.01.T01 AT2G47060 40.614 293 164 4 23 307 60 350 1.14e-61 202
MsG0280010269.01.T01 AT2G47060 40.614 293 164 4 23 307 60 350 1.14e-61 202
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MsG0280010269.01.T01 AT4G35030 35.439 285 181 2 22 303 90 374 5.81e-57 192
MsG0280010269.01.T01 AT4G35030 35.439 285 181 2 22 303 90 374 5.81e-57 192
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MsG0280010269.01.T01 AT5G03140 40.206 291 159 8 22 303 360 644 1.03e-56 197
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MsG0280010269.01.T01 AT1G48210 42.424 231 125 2 28 251 60 289 1.12e-56 188
MsG0280010269.01.T01 AT5G24080 38.811 286 170 3 24 307 393 675 1.12e-56 197
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MsG0280010269.01.T01 AT5G62230 33.994 353 200 6 25 372 637 961 1.19e-56 199
MsG0280010269.01.T01 AT4G39400 41.522 289 157 8 22 303 869 1152 1.19e-56 200
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MsG0280010269.01.T01 AT2G35620 38.732 284 171 3 24 307 292 572 1.22e-56 195
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MsG0280010269.01.T01 AT2G37710 38.411 302 169 6 24 316 335 628 1.23e-56 196
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MsG0280010269.01.T01 AT2G43230 36.842 304 183 3 28 323 103 405 1.40e-56 190
MsG0280010269.01.T01 AT5G11020 38.489 278 166 3 31 306 102 376 1.52e-56 190
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MsG0280010269.01.T01 AT2G43230 36.842 304 183 3 28 323 137 439 1.63e-56 191
MsG0280010269.01.T01 AT5G11020 38.489 278 166 3 31 306 98 372 1.73e-56 190
MsG0280010269.01.T01 AT5G65600 44.700 217 118 2 22 237 336 551 1.76e-56 196
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MsG0280010269.01.T01 AT4G23150 37.000 300 180 4 26 323 326 618 2.36e-56 195
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MsG0280010269.01.T01 AT3G45410 36.644 292 177 3 24 312 330 616 3.23e-56 195
MsG0280010269.01.T01 AT5G24080 38.811 286 170 3 24 307 520 802 3.34e-56 197
MsG0280010269.01.T01 AT5G60300 37.755 294 179 4 24 316 332 622 3.49e-56 196
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MsG0280010269.01.T01 AT1G31420 37.676 284 175 2 24 307 294 575 3.86e-56 194
MsG0280010269.01.T01 AT4G11900 37.282 287 175 3 23 306 455 739 3.93e-56 196
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MsG0280010269.01.T01 AT4G11480 40.000 285 163 7 24 303 309 590 4.04e-56 194
MsG0280010269.01.T01 AT4G11480 40.000 285 163 7 24 303 312 593 4.63e-56 194
MsG0280010269.01.T01 AT4G11900 37.282 287 175 3 23 306 524 808 4.76e-56 197
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MsG0280010269.01.T01 AT1G61420 36.304 303 183 4 23 323 331 625 5.20e-56 194
MsG0280010269.01.T01 AT4G11480 39.249 293 162 7 24 303 309 598 5.40e-56 194
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MsG0280010269.01.T01 AT1G11330 37.895 285 176 1 23 306 511 795 8.39e-56 196
MsG0280010269.01.T01 AT3G26700 35.294 323 200 5 2 320 45 362 8.57e-56 187
MsG0280010269.01.T01 AT3G26700 35.294 323 200 5 2 320 45 362 8.57e-56 187
MsG0280010269.01.T01 AT3G26700 35.294 323 200 5 2 320 45 362 8.57e-56 187

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TGGTTTCGGTAGGGTTTATA+AGG 0.239893 2:+67047027 MsG0280010269.01.T01:CDS
TGCTGCCTTCTAAAGTATTC+TGG 0.244278 2:-67047508 None:intergenic
GTACCAATGTAGCTGTTAAA+AGG 0.256870 2:+67047065 MsG0280010269.01.T01:CDS
ATCGAGTGCAGGACCGGTTT+TGG 0.269062 2:-67047437 None:intergenic
TTCATTTCTTCGACGAATCT+TGG 0.282683 2:+67046932 MsG0280010269.01.T01:CDS
TTTGATGAGAAGCTTCTTCT+TGG 0.285146 2:+67046998 MsG0280010269.01.T01:CDS
GCAAGACCTTGTTCGGATCT+TGG 0.296780 2:-67047094 None:intergenic
CGTCATCTTGTGTCTCTAAT+TGG 0.305890 2:+67047160 MsG0280010269.01.T01:CDS
AGCCGTTGTTTCCACGATAA+AGG 0.307463 2:-67047274 None:intergenic
GAGAAGTGCTTGGCCGAGTA+TGG 0.312968 2:+67047748 MsG0280010269.01.T01:CDS
CTGCTTCGCTTAAGAAGTTC+GGG 0.323346 2:+67047716 MsG0280010269.01.T01:CDS
CTTCTTGGTGTTGGTGGTTT+CGG 0.323362 2:+67047013 MsG0280010269.01.T01:CDS
TTGTTGCGTCTAGGATTTCT+TGG 0.327377 2:-67046970 None:intergenic
TTGATCCAGAATACTTTAGA+AGG 0.353342 2:+67047503 MsG0280010269.01.T01:CDS
TCAGTGCTGACGAGGTTTCT+TGG 0.363304 2:-67047828 None:intergenic
ACAGCGGTTAAAGGTAGTTT+TGG 0.365637 2:+67047475 MsG0280010269.01.T01:CDS
TGGTTCGTGCTGTTGTCTTC+CGG 0.378514 2:-67047856 None:intergenic
AACAGCACGAACCACATTAC+TGG 0.378985 2:+67047865 MsG0280010269.01.T01:CDS
AAATCAGATGTTTATTCATT+CGG 0.386535 2:+67047541 MsG0280010269.01.T01:CDS
GAATTCAGCAAGACCTTGTT+CGG 0.391638 2:-67047101 None:intergenic
CCTGCTTCGCTTAAGAAGTT+CGG 0.391796 2:+67047715 MsG0280010269.01.T01:CDS
TAGCCGAGTGGGCGATGAAC+TGG 0.393567 2:+67047635 MsG0280010269.01.T01:CDS
CATGTTAGCACAGCGGTTAA+AGG 0.398261 2:+67047466 MsG0280010269.01.T01:CDS
GACTTTGGCCTCTCCAAAAC+CGG 0.406080 2:+67047424 MsG0280010269.01.T01:CDS
GTCTATGAATACATGGCTAA+TGG 0.409816 2:+67047214 MsG0280010269.01.T01:CDS
ACCTGTTCTCTAGGAAGGAC+AGG 0.423693 2:-67047607 None:intergenic
CCCTGTCCTTCCTAGAGAAC+AGG 0.425409 2:+67047606 MsG0280010269.01.T01:CDS
TCATGGATCAACAGCTTGTC+GGG 0.426995 2:+67047683 MsG0280010269.01.T01:CDS
CCGAACTTCTTAAGCGAAGC+AGG 0.431418 2:-67047715 None:intergenic
TACCAATGTAGCTGTTAAAA+GGG 0.433139 2:+67047066 MsG0280010269.01.T01:CDS
AAGCTTCTTCTTGGTGTTGG+TGG 0.436194 2:+67047007 MsG0280010269.01.T01:CDS
AAGTGCAGTGTTCTCTCAAT+TGG 0.439267 2:+67047984 MsG0280010269.01.T01:CDS
GTTGCTAAAGTTGCTGACTT+TGG 0.447951 2:+67047409 MsG0280010269.01.T01:CDS
TTGGTGTTGGTGGTTTCGGT+AGG 0.450950 2:+67047017 MsG0280010269.01.T01:CDS
GAGAAGCTTCTTCTTGGTGT+TGG 0.464809 2:+67047004 MsG0280010269.01.T01:CDS
CTCGTCAGCACTGATGGAAC+CGG 0.483234 2:+67047837 MsG0280010269.01.T01:CDS
AGAAACCTCGTCAGCACTGA+TGG 0.483749 2:+67047831 MsG0280010269.01.T01:CDS
GGCGATGAACTGGCAGAAGA+AGG 0.486953 2:+67047645 MsG0280010269.01.T01:CDS
CCCCTCAGGAGTCATTTGTA+TGG 0.501181 2:+67047238 MsG0280010269.01.T01:CDS
ATCATGGATCAACAGCTTGT+CGG 0.501243 2:+67047682 MsG0280010269.01.T01:CDS
CGCCTTTATCGTGGAAACAA+CGG 0.502083 2:+67047272 MsG0280010269.01.T01:CDS
GGTTTCGGTAGGGTTTATAA+GGG 0.505840 2:+67047028 MsG0280010269.01.T01:CDS
CAAATTTATTTGTTGCGTCT+AGG 0.506874 2:-67046979 None:intergenic
TGTTTGTCGTCTTTACATCT+CGG 0.514452 2:-67047366 None:intergenic
ATAACATCTCGATTTCAGTT+CGG 0.515479 2:-67047123 None:intergenic
GCTATATTAACCTGTTCTCT+AGG 0.516282 2:-67047616 None:intergenic
TGGAGTGGATAGGCCATCCA+TGG 0.520754 2:+67047768 MsG0280010269.01.T01:CDS
AGTCTGATCGAGTGCAGGAC+CGG 0.526448 2:-67047443 None:intergenic
AACAGTGTAAGTATGGTTGA+TGG 0.526739 2:+67047919 MsG0280010269.01.T01:CDS
GATTCTTGTCTATGAATACA+TGG 0.528711 2:+67047207 MsG0280010269.01.T01:CDS
TGGTGTTGGTGGTTTCGGTA+GGG 0.533139 2:+67047018 MsG0280010269.01.T01:CDS
GGAGACCGCGGAGAAGTGCT+TGG 0.535575 2:+67047738 MsG0280010269.01.T01:CDS
GGGAATGCTTGATCAAATCA+TGG 0.537291 2:+67047666 MsG0280010269.01.T01:CDS
TATAAGGGAATCCTCGATGA+TGG 0.547949 2:+67047043 MsG0280010269.01.T01:CDS
ACATGAGTCTGATCGAGTGC+AGG 0.554654 2:-67047448 None:intergenic
AATTATACTTTGAGATGCAC+CGG 0.558808 2:-67047341 None:intergenic
CTGCCAGTTCATCGCCCACT+CGG 0.560643 2:-67047638 None:intergenic
GGATCAACAGCTTGTCGGGA+AGG 0.562124 2:+67047687 MsG0280010269.01.T01:CDS
TATTAACCTGTTCTCTAGGA+AGG 0.563885 2:-67047612 None:intergenic
CGGTTCCATCAGTGCTGACG+AGG 0.566922 2:-67047836 None:intergenic
CAGATCTACCGCCTTTATCG+TGG 0.567572 2:+67047263 MsG0280010269.01.T01:CDS
TCCATACAAATGACTCCTGA+GGG 0.576678 2:-67047239 None:intergenic
CAACGGCTTGATATTTGCAT+CGG 0.577306 2:+67047289 MsG0280010269.01.T01:CDS
GGAAGTGCTATGCACAAGAC+CGG 0.577879 2:+67047576 MsG0280010269.01.T01:CDS
TGGCCTATCCACTCCATACT+CGG 0.578377 2:-67047761 None:intergenic
ATTCCATAAAACATCTCCCA+TGG 0.580341 2:-67047785 None:intergenic
ACATGGCTAATGGTCCCCTC+AGG 0.580801 2:+67047224 MsG0280010269.01.T01:CDS
CATAAAACATCTCCCATGGA+TGG 0.595095 2:-67047781 None:intergenic
TTTCTTCGACGAATCTTGGA+CGG 0.595503 2:+67046936 MsG0280010269.01.T01:CDS
GCGATGAACTGGCAGAAGAA+GGG 0.595536 2:+67047646 MsG0280010269.01.T01:CDS
TAATTGGTTACTGCGATGAA+AGG 0.595686 2:+67047176 MsG0280010269.01.T01:CDS
CCTGTTCTCTAGGAAGGACA+GGG 0.603819 2:-67047606 None:intergenic
TGGCCGAGTATGGAGTGGAT+AGG 0.606568 2:+67047758 MsG0280010269.01.T01:CDS
TACTTTGAGATGCACCGGTG+TGG 0.613154 2:-67047336 None:intergenic
ACAGGTTAATATAGCCGAGT+GGG 0.614298 2:+67047624 MsG0280010269.01.T01:CDS
ACCAATGTAGCTGTTAAAAG+GGG 0.620479 2:+67047067 MsG0280010269.01.T01:CDS
TCAACTGAATTCCAGTAATG+TGG 0.622250 2:-67047876 None:intergenic
ATTTGCATCGGAGCAGCAAG+AGG 0.626479 2:+67047301 MsG0280010269.01.T01:CDS
TTCCATACAAATGACTCCTG+AGG 0.632364 2:-67047240 None:intergenic
GGAGTGGATAGGCCATCCAT+GGG 0.638079 2:+67047769 MsG0280010269.01.T01:CDS
TGATGGAGGCAACTCTGTCA+CGG 0.638415 2:+67047936 MsG0280010269.01.T01:CDS
GGAAATCCAAGATCCGAACA+AGG 0.640664 2:+67047088 MsG0280010269.01.T01:CDS
GTGCTTGGCCGAGTATGGAG+TGG 0.642834 2:+67047753 MsG0280010269.01.T01:CDS
GGAAGGACAGGGTTCAACGC+CGG 0.645594 2:-67047595 None:intergenic
TCGACAACTTCACAGAAGAG+TGG 0.649041 2:+67046896 MsG0280010269.01.T01:CDS
AGTGTAAGTATGGTTGATGG+AGG 0.651328 2:+67047922 MsG0280010269.01.T01:CDS
TAAGAAGTTCGGGGAGACCG+CGG 0.658596 2:+67047726 MsG0280010269.01.T01:CDS
CGTTGTTTCCACGATAAAGG+CGG 0.660027 2:-67047271 None:intergenic
TGCTTCGCTTAAGAAGTTCG+GGG 0.662921 2:+67047717 MsG0280010269.01.T01:CDS
ACAACTTCACAGAAGAGTGG+AGG 0.682376 2:+67046899 MsG0280010269.01.T01:CDS
CTCGGCCAAGCACTTCTCCG+CGG 0.689415 2:-67047743 None:intergenic
AACAGGTTAATATAGCCGAG+TGG 0.693103 2:+67047623 MsG0280010269.01.T01:CDS
GGTCTTCATTATCTCCACAC+CGG 0.711790 2:+67047322 MsG0280010269.01.T01:CDS
TCTCAATTGGTAAATCCACG+TGG 0.722563 2:+67047997 MsG0280010269.01.T01:CDS
AAAATAACTCATCTTCCACG+TGG 0.724697 2:-67048012 None:intergenic
TTAGAGACACAAGATGACGA+TGG 0.726645 2:-67047156 None:intergenic
CCATACAAATGACTCCTGAG+GGG 0.776785 2:-67047238 None:intergenic
CTACATTGGTACCATCATCG+AGG 0.787174 2:-67047054 None:intergenic
TCAGACTCATGTTAGCACAG+CGG 0.804684 2:+67047459 MsG0280010269.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAATCAGATGTTTATTCATT+CGG + Chr2:67047541-67047560 MsG0280010269.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTGATAACAGTGTAAGTA+TGG + Chr2:67047912-67047931 MsG0280010269.01.T01:CDS 25.0%
ATAACATCTCGATTTCAGTT+CGG - Chr2:67047126-67047145 None:intergenic 30.0%
GATTCTTGTCTATGAATACA+TGG + Chr2:67047207-67047226 MsG0280010269.01.T01:CDS 30.0%
TACCAATGTAGCTGTTAAAA+GGG + Chr2:67047066-67047085 MsG0280010269.01.T01:CDS 30.0%
TTGATCCAGAATACTTTAGA+AGG + Chr2:67047503-67047522 MsG0280010269.01.T01:CDS 30.0%
! CAAATTTATTTGTTGCGTCT+AGG - Chr2:67046982-67047001 None:intergenic 30.0%
!! AATTATACTTTGAGATGCAC+CGG - Chr2:67047344-67047363 None:intergenic 30.0%
!!! TTCATTCGGAGTAGTTTTAA+TGG + Chr2:67047555-67047574 MsG0280010269.01.T01:CDS 30.0%
AACAGTGTAAGTATGGTTGA+TGG + Chr2:67047919-67047938 MsG0280010269.01.T01:CDS 35.0%
ACCAATGTAGCTGTTAAAAG+GGG + Chr2:67047067-67047086 MsG0280010269.01.T01:CDS 35.0%
ATTCCATAAAACATCTCCCA+TGG - Chr2:67047788-67047807 None:intergenic 35.0%
GCTATATTAACCTGTTCTCT+AGG - Chr2:67047619-67047638 None:intergenic 35.0%
GTACCAATGTAGCTGTTAAA+AGG + Chr2:67047065-67047084 MsG0280010269.01.T01:CDS 35.0%
GTCTATGAATACATGGCTAA+TGG + Chr2:67047214-67047233 MsG0280010269.01.T01:CDS 35.0%
TAATTGGTTACTGCGATGAA+AGG + Chr2:67047176-67047195 MsG0280010269.01.T01:CDS 35.0%
TCAACTGAATTCCAGTAATG+TGG - Chr2:67047879-67047898 None:intergenic 35.0%
TGTTTGTCGTCTTTACATCT+CGG - Chr2:67047369-67047388 None:intergenic 35.0%
TTCATTTCTTCGACGAATCT+TGG + Chr2:67046932-67046951 MsG0280010269.01.T01:CDS 35.0%
TTTGATGAGAAGCTTCTTCT+TGG + Chr2:67046998-67047017 MsG0280010269.01.T01:CDS 35.0%
! TATTAACCTGTTCTCTAGGA+AGG - Chr2:67047615-67047634 None:intergenic 35.0%
AACAGGTTAATATAGCCGAG+TGG + Chr2:67047623-67047642 MsG0280010269.01.T01:CDS 40.0%
AAGTGCAGTGTTCTCTCAAT+TGG + Chr2:67047984-67048003 MsG0280010269.01.T01:CDS 40.0%
ACAGGTTAATATAGCCGAGT+GGG + Chr2:67047624-67047643 MsG0280010269.01.T01:CDS 40.0%
ATCATGGATCAACAGCTTGT+CGG + Chr2:67047682-67047701 MsG0280010269.01.T01:CDS 40.0%
CAACGGCTTGATATTTGCAT+CGG + Chr2:67047289-67047308 MsG0280010269.01.T01:CDS 40.0%
CATAAAACATCTCCCATGGA+TGG - Chr2:67047784-67047803 None:intergenic 40.0%
CGTCATCTTGTGTCTCTAAT+TGG + Chr2:67047160-67047179 MsG0280010269.01.T01:CDS 40.0%
GAATTCAGCAAGACCTTGTT+CGG - Chr2:67047104-67047123 None:intergenic 40.0%
GGGAATGCTTGATCAAATCA+TGG + Chr2:67047666-67047685 MsG0280010269.01.T01:CDS 40.0%
GGTTTCGGTAGGGTTTATAA+GGG + Chr2:67047028-67047047 MsG0280010269.01.T01:CDS 40.0%
TATAAGGGAATCCTCGATGA+TGG + Chr2:67047043-67047062 MsG0280010269.01.T01:CDS 40.0%
TCCATACAAATGACTCCTGA+GGG - Chr2:67047242-67047261 None:intergenic 40.0%
TCTCAATTGGTAAATCCACG+TGG + Chr2:67047997-67048016 MsG0280010269.01.T01:CDS 40.0%
TGGTTTCGGTAGGGTTTATA+AGG + Chr2:67047027-67047046 MsG0280010269.01.T01:CDS 40.0%
TTAGAGACACAAGATGACGA+TGG - Chr2:67047159-67047178 None:intergenic 40.0%
TTCCATACAAATGACTCCTG+AGG - Chr2:67047243-67047262 None:intergenic 40.0%
TTTCTTCGACGAATCTTGGA+CGG + Chr2:67046936-67046955 MsG0280010269.01.T01:CDS 40.0%
! ACAGCGGTTAAAGGTAGTTT+TGG + Chr2:67047475-67047494 MsG0280010269.01.T01:CDS 40.0%
! CATCCATGGGAGATGTTTTA+TGG + Chr2:67047782-67047801 MsG0280010269.01.T01:CDS 40.0%
! TCCCCTTTTAACAGCTACAT+TGG - Chr2:67047071-67047090 None:intergenic 40.0%
! TTGTTGCGTCTAGGATTTCT+TGG - Chr2:67046973-67046992 None:intergenic 40.0%
!! AGTGTAAGTATGGTTGATGG+AGG + Chr2:67047922-67047941 MsG0280010269.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGCTAAAGTTGCTGACTT+TGG + Chr2:67047409-67047428 MsG0280010269.01.T01:CDS 40.0%
!! TGCTGCCTTCTAAAGTATTC+TGG - Chr2:67047511-67047530 None:intergenic 40.0%
AACAGCACGAACCACATTAC+TGG + Chr2:67047865-67047884 MsG0280010269.01.T01:CDS 45.0%
ACAACTTCACAGAAGAGTGG+AGG + Chr2:67046899-67046918 MsG0280010269.01.T01:CDS 45.0%
CATGTTAGCACAGCGGTTAA+AGG + Chr2:67047466-67047485 MsG0280010269.01.T01:CDS 45.0%
CCATACAAATGACTCCTGAG+GGG - Chr2:67047241-67047260 None:intergenic 45.0%
CCTGCTTCGCTTAAGAAGTT+CGG + Chr2:67047715-67047734 MsG0280010269.01.T01:CDS 45.0%
CGCCTTTATCGTGGAAACAA+CGG + Chr2:67047272-67047291 MsG0280010269.01.T01:CDS 45.0%
CTACATTGGTACCATCATCG+AGG - Chr2:67047057-67047076 None:intergenic 45.0%
CTGCTTCGCTTAAGAAGTTC+GGG + Chr2:67047716-67047735 MsG0280010269.01.T01:CDS 45.0%
GGAAATCCAAGATCCGAACA+AGG + Chr2:67047088-67047107 MsG0280010269.01.T01:CDS 45.0%
GGTCTTCATTATCTCCACAC+CGG + Chr2:67047322-67047341 MsG0280010269.01.T01:CDS 45.0%
TCAGACTCATGTTAGCACAG+CGG + Chr2:67047459-67047478 MsG0280010269.01.T01:CDS 45.0%
TCATGGATCAACAGCTTGTC+GGG + Chr2:67047683-67047702 MsG0280010269.01.T01:CDS 45.0%
TCGACAACTTCACAGAAGAG+TGG + Chr2:67046896-67046915 MsG0280010269.01.T01:CDS 45.0%
TGCTTCGCTTAAGAAGTTCG+GGG + Chr2:67047717-67047736 MsG0280010269.01.T01:CDS 45.0%
! AGCCGTTGTTTCCACGATAA+AGG - Chr2:67047277-67047296 None:intergenic 45.0%
! CGTTGTTTCCACGATAAAGG+CGG - Chr2:67047274-67047293 None:intergenic 45.0%
! GAGAAGCTTCTTCTTGGTGT+TGG + Chr2:67047004-67047023 MsG0280010269.01.T01:CDS 45.0%
!! AAGCTTCTTCTTGGTGTTGG+TGG + Chr2:67047007-67047026 MsG0280010269.01.T01:CDS 45.0%
!! CTTCTTGGTGTTGGTGGTTT+CGG + Chr2:67047013-67047032 MsG0280010269.01.T01:CDS 45.0%
ACATGAGTCTGATCGAGTGC+AGG - Chr2:67047451-67047470 None:intergenic 50.0%
ATTTGCATCGGAGCAGCAAG+AGG + Chr2:67047301-67047320 MsG0280010269.01.T01:CDS 50.0%
CAGATCTACCGCCTTTATCG+TGG + Chr2:67047263-67047282 MsG0280010269.01.T01:CDS 50.0%
CCCCTCAGGAGTCATTTGTA+TGG + Chr2:67047238-67047257 MsG0280010269.01.T01:CDS 50.0%
CCGAACTTCTTAAGCGAAGC+AGG - Chr2:67047718-67047737 None:intergenic 50.0%
GACTTTGGCCTCTCCAAAAC+CGG + Chr2:67047424-67047443 MsG0280010269.01.T01:CDS 50.0%
GCAAGACCTTGTTCGGATCT+TGG - Chr2:67047097-67047116 None:intergenic 50.0%
GCGATGAACTGGCAGAAGAA+GGG + Chr2:67047646-67047665 MsG0280010269.01.T01:CDS 50.0%
TGATGGAGGCAACTCTGTCA+CGG + Chr2:67047936-67047955 MsG0280010269.01.T01:CDS 50.0%
TGGCCTATCCACTCCATACT+CGG - Chr2:67047764-67047783 None:intergenic 50.0%
! ACCTGTTCTCTAGGAAGGAC+AGG - Chr2:67047610-67047629 None:intergenic 50.0%
! AGAAACCTCGTCAGCACTGA+TGG + Chr2:67047831-67047850 MsG0280010269.01.T01:CDS 50.0%
! CCTGTTCTCTAGGAAGGACA+GGG - Chr2:67047609-67047628 None:intergenic 50.0%
! TGGTTCGTGCTGTTGTCTTC+CGG - Chr2:67047859-67047878 None:intergenic 50.0%
!! GGAAGTGCTATGCACAAGAC+CGG + Chr2:67047576-67047595 MsG0280010269.01.T01:CDS 50.0%
!! TACTTTGAGATGCACCGGTG+TGG - Chr2:67047339-67047358 None:intergenic 50.0%
!! TCAGTGCTGACGAGGTTTCT+TGG - Chr2:67047831-67047850 None:intergenic 50.0%
!! TGGTGTTGGTGGTTTCGGTA+GGG + Chr2:67047018-67047037 MsG0280010269.01.T01:CDS 50.0%
!! TTGGTGTTGGTGGTTTCGGT+AGG + Chr2:67047017-67047036 MsG0280010269.01.T01:CDS 50.0%
ACATGGCTAATGGTCCCCTC+AGG + Chr2:67047224-67047243 MsG0280010269.01.T01:CDS 55.0%
AGTCTGATCGAGTGCAGGAC+CGG - Chr2:67047446-67047465 None:intergenic 55.0%
CCCTGTCCTTCCTAGAGAAC+AGG + Chr2:67047606-67047625 MsG0280010269.01.T01:CDS 55.0%
GGAGTGGATAGGCCATCCAT+GGG + Chr2:67047769-67047788 MsG0280010269.01.T01:CDS 55.0%
GGATCAACAGCTTGTCGGGA+AGG + Chr2:67047687-67047706 MsG0280010269.01.T01:CDS 55.0%
GGCGATGAACTGGCAGAAGA+AGG + Chr2:67047645-67047664 MsG0280010269.01.T01:CDS 55.0%
TAAGAAGTTCGGGGAGACCG+CGG + Chr2:67047726-67047745 MsG0280010269.01.T01:CDS 55.0%
TGGAGTGGATAGGCCATCCA+TGG + Chr2:67047768-67047787 MsG0280010269.01.T01:CDS 55.0%
TGGCCGAGTATGGAGTGGAT+AGG + Chr2:67047758-67047777 MsG0280010269.01.T01:CDS 55.0%
!! ATCGAGTGCAGGACCGGTTT+TGG - Chr2:67047440-67047459 None:intergenic 55.0%
!! CTCGTCAGCACTGATGGAAC+CGG + Chr2:67047837-67047856 MsG0280010269.01.T01:CDS 55.0%
!! GAGAAGTGCTTGGCCGAGTA+TGG + Chr2:67047748-67047767 MsG0280010269.01.T01:CDS 55.0%
CTGCCAGTTCATCGCCCACT+CGG - Chr2:67047641-67047660 None:intergenic 60.0%
GGAAGGACAGGGTTCAACGC+CGG - Chr2:67047598-67047617 None:intergenic 60.0%
GTGCTTGGCCGAGTATGGAG+TGG + Chr2:67047753-67047772 MsG0280010269.01.T01:CDS 60.0%
TAGCCGAGTGGGCGATGAAC+TGG + Chr2:67047635-67047654 MsG0280010269.01.T01:CDS 60.0%
!! CGGTTCCATCAGTGCTGACG+AGG - Chr2:67047839-67047858 None:intergenic 60.0%
!!! GTGCAGGACCGGTTTTGGAG+AGG - Chr2:67047435-67047454 None:intergenic 60.0%
CTCGGCCAAGCACTTCTCCG+CGG - Chr2:67047746-67047765 None:intergenic 65.0%
!! GGAGACCGCGGAGAAGTGCT+TGG + Chr2:67047738-67047757 MsG0280010269.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 67046893 67048026 67046893 ID=MsG0280010269.01;Name=MsG0280010269.01
Chr2 mRNA 67046893 67048026 67046893 ID=MsG0280010269.01.T01;Parent=MsG0280010269.01;Name=MsG0280010269.01.T01;_AED=0.42;_eAED=0.42;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|377
Chr2 exon 67046893 67048026 67046893 ID=MsG0280010269.01.T01:exon:14371;Parent=MsG0280010269.01.T01
Chr2 CDS 67046893 67048026 67046893 ID=MsG0280010269.01.T01:cds;Parent=MsG0280010269.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280010269.01.T01

ATGTCGACAACTTCACAGAAGAGTGGAGGAACTGCAAGCTTCATTTCTTCGACGAATCTTGGACGGTTCTTCACTTTCCAAGAAATCCTAGACGCAACAAATAAATTTGATGAGAAGCTTCTTCTTGGTGTTGGTGGTTTCGGTAGGGTTTATAAGGGAATCCTCGATGATGGTACCAATGTAGCTGTTAAAAGGGGAAATCCAAGATCCGAACAAGGTCTTGCTGAATTCCGAACTGAAATCGAGATGTTATCAAAGCTTCGCCATCGTCATCTTGTGTCTCTAATTGGTTACTGCGATGAAAGGTCAGAAATGATTCTTGTCTATGAATACATGGCTAATGGTCCCCTCAGGAGTCATTTGTATGGAACAGATCTACCGCCTTTATCGTGGAAACAACGGCTTGATATTTGCATCGGAGCAGCAAGAGGTCTTCATTATCTCCACACCGGTGCATCTCAAAGTATAATTCACCGAGATGTAAAGACGACAAACATTCTTTTAGATGATAACTTTGTTGCTAAAGTTGCTGACTTTGGCCTCTCCAAAACCGGTCCTGCACTCGATCAGACTCATGTTAGCACAGCGGTTAAAGGTAGTTTTGGTTATCTTGATCCAGAATACTTTAGAAGGCAGCAACTCACAGAGAAATCAGATGTTTATTCATTCGGAGTAGTTTTAATGGAAGTGCTATGCACAAGACCGGCGTTGAACCCTGTCCTTCCTAGAGAACAGGTTAATATAGCCGAGTGGGCGATGAACTGGCAGAAGAAGGGAATGCTTGATCAAATCATGGATCAACAGCTTGTCGGGAAGGTCAATCCTGCTTCGCTTAAGAAGTTCGGGGAGACCGCGGAGAAGTGCTTGGCCGAGTATGGAGTGGATAGGCCATCCATGGGAGATGTTTTATGGAATCTTGAATATGCTTTGCAGCTCCAAGAAACCTCGTCAGCACTGATGGAACCGGAAGACAACAGCACGAACCACATTACTGGAATTCAGTTGACACGTCTTGAGAATTTTGATAACAGTGTAAGTATGGTTGATGGAGGCAACTCTGTCACGGATGATGACGCAGAAGACGCTGCTACAAGTGCAGTGTTCTCTCAATTGGTAAATCCACGTGGAAGATGA
Protein sequence

>MsG0280010269.01.T01

MSTTSQKSGGTASFISSTNLGRFFTFQEILDATNKFDEKLLLGVGGFGRVYKGILDDGTNVAVKRGNPRSEQGLAEFRTEIEMLSKLRHRHLVSLIGYCDERSEMILVYEYMANGPLRSHLYGTDLPPLSWKQRLDICIGAARGLHYLHTGASQSIIHRDVKTTNILLDDNFVAKVADFGLSKTGPALDQTHVSTAVKGSFGYLDPEYFRRQQLTEKSDVYSFGVVLMEVLCTRPALNPVLPREQVNIAEWAMNWQKKGMLDQIMDQQLVGKVNPASLKKFGETAEKCLAEYGVDRPSMGDVLWNLEYALQLQETSSALMEPEDNSTNHITGIQLTRLENFDNSVSMVDGGNSVTDDDAEDAATSAVFSQLVNPRGR*