AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380012961.01

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MsG0380012961.01.T01 AT1G59780 26.764 751 444 29 33 743 156 840 1.42e-44 174
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MsG0380012961.01.T01 AT1G10920 27.986 561 330 19 26 541 31 562 2.59e-40 159
MsG0380012961.01.T01 AT1G10920 27.986 561 330 19 26 541 31 562 2.59e-40 159
MsG0380012961.01.T01 AT1G10920 27.986 561 330 19 26 541 31 562 2.59e-40 159
MsG0380012961.01.T01 AT5G43470 27.493 742 424 31 64 753 187 866 3.66e-40 160
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MsG0380012961.01.T01 AT5G43470 27.493 742 424 31 64 753 187 866 3.66e-40 160
MsG0380012961.01.T01 AT5G43470 27.493 742 424 31 64 753 187 866 3.66e-40 160
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MsG0380012961.01.T01 AT5G48620 26.938 761 461 31 33 753 161 866 2.94e-38 154
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MsG0380012961.01.T01 AT5G48620 26.938 761 461 31 33 753 161 866 2.94e-38 154
MsG0380012961.01.T01 AT5G48620 26.938 761 461 31 33 753 161 866 2.94e-38 154
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MsG0380012961.01.T01 AT1G58410 27.222 540 345 19 33 541 158 680 4.02e-38 154
MsG0380012961.01.T01 AT1G53350 29.401 551 316 19 33 541 159 678 5.24e-38 153
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MsG0380012961.01.T01 AT1G12220 25.794 756 463 24 25 743 145 839 3.87e-37 150
MsG0380012961.01.T01 AT4G27190 28.733 529 285 16 49 538 150 625 4.71e-37 150
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MsG0380012961.01.T01 AT1G12210 25.300 751 480 25 34 756 112 809 8.07e-34 140
MsG0380012961.01.T01 AT1G61300 26.138 769 443 34 38 758 43 734 1.17e-32 136
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MsG0380012961.01.T01 AT5G05400 24.932 738 450 31 37 717 156 846 1.02e-31 133
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MsG0380012961.01.T01 AT5G05400 24.684 713 439 29 62 717 6 677 1.37e-31 132
MsG0380012961.01.T01 AT1G12290 25.100 498 316 13 7 475 132 601 4.63e-31 131
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MsG0380012961.01.T01 AT5G43740 25.269 744 466 29 52 752 161 857 4.97e-31 131
MsG0380012961.01.T01 AT1G12290 25.100 498 316 13 7 475 90 559 5.06e-31 131
MsG0380012961.01.T01 AT1G12290 25.100 498 316 13 7 475 90 559 5.06e-31 131
MsG0380012961.01.T01 AT1G12290 25.100 498 316 13 7 475 90 559 5.06e-31 131
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MsG0380012961.01.T01 AT1G61190 27.409 467 294 16 38 479 155 601 6.77e-31 130
MsG0380012961.01.T01 AT1G61190 27.409 467 294 16 38 479 155 601 8.88e-31 130
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MsG0380012961.01.T01 AT1G61180 26.004 523 298 18 38 538 154 609 4.44e-30 128
MsG0380012961.01.T01 AT5G47260 24.357 739 412 28 62 743 169 817 2.78e-29 125
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MsG0380012961.01.T01 AT1G63350 26.476 559 363 20 10 539 124 663 7.81e-29 124
MsG0380012961.01.T01 AT1G63350 26.476 559 363 20 10 539 124 663 7.81e-29 124
MsG0380012961.01.T01 AT1G58410 25.094 534 332 18 33 541 158 648 1.90e-28 123
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MsG0380012961.01.T01 AT5G43730 27.634 503 313 21 69 540 179 661 2.84e-28 122
MsG0380012961.01.T01 AT5G43730 27.634 503 313 21 69 540 179 661 2.84e-28 122
MsG0380012961.01.T01 AT5G43730 27.634 503 313 21 69 540 179 661 2.84e-28 122
MsG0380012961.01.T01 AT5G43730 27.634 503 313 21 69 540 179 661 2.84e-28 122
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MsG0380012961.01.T01 AT1G10920 26.521 411 240 13 174 541 1 392 1.54e-23 106
MsG0380012961.01.T01 AT1G12280 25.000 452 284 13 64 499 140 552 2.30e-20 97.4
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MsG0380012961.01.T01 AT5G41740 23.629 529 347 18 46 540 184 689 7.19e-18 89.4
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MsG0380012961.01.T01 AT5G11250 23.586 725 421 35 37 682 154 824 5.68e-16 83.2
MsG0380012961.01.T01 AT5G48770 21.722 511 351 15 57 538 203 693 1.79e-14 78.6
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MsG0380012961.01.T01 AT5G41750 24.248 532 321 26 46 540 194 680 2.58e-14 77.8
MsG0380012961.01.T01 AT1G52660 27.228 202 141 3 63 260 161 360 6.47e-14 74.7
MsG0380012961.01.T01 AT1G52660 27.228 202 141 3 63 260 161 360 6.79e-14 74.7
MsG0380012961.01.T01 AT1G63880 22.430 535 331 22 61 544 207 708 1.17e-13 75.9
MsG0380012961.01.T01 AT1G63880 22.430 535 331 22 61 544 207 708 1.32e-13 75.5
MsG0380012961.01.T01 AT3G15700 28.079 203 138 4 63 260 161 360 5.64e-13 72.0
MsG0380012961.01.T01 AT3G15700 28.079 203 138 4 63 260 161 360 7.19e-13 71.6
MsG0380012961.01.T01 AT5G18360 21.575 584 377 19 7 540 155 707 4.01e-12 70.9
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MsG0380012961.01.T01 AT5G45210 22.941 510 342 20 48 540 180 655 5.41e-12 70.1
MsG0380012961.01.T01 AT3G44480 22.371 523 329 21 61 528 292 792 1.48e-11 68.9
MsG0380012961.01.T01 AT3G44480 22.371 523 329 21 61 528 292 792 1.48e-11 68.9
MsG0380012961.01.T01 AT3G44480 22.371 523 329 21 61 528 292 792 1.73e-11 68.9
MsG0380012961.01.T01 AT3G44480 22.371 523 329 21 61 528 292 792 1.88e-11 68.6
MsG0380012961.01.T01 AT3G44480 22.371 523 329 21 61 528 292 792 1.88e-11 68.6
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MsG0380012961.01.T02 AT3G14470 38.453 918 509 16 5 876 2 909 0.0 627
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MsG0380012961.01.T02 AT5G43470 25.885 904 527 36 41 868 30 866 6.59e-43 169
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MsG0380012961.01.T02 AT1G58410 26.003 673 421 23 41 656 28 680 9.52e-42 166
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MsG0380012961.01.T02 AT1G10920 27.986 561 330 19 141 656 31 562 2.98e-40 160
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MsG0380012961.01.T02 AT1G63350 25.613 652 431 23 36 654 33 663 2.10e-29 126
MsG0380012961.01.T02 AT1G63350 25.613 652 431 23 36 654 33 663 2.26e-29 126
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MsG0380012961.01.T02 AT5G43730 27.634 503 313 21 184 655 179 661 3.01e-28 123
MsG0380012961.01.T02 AT5G43730 27.634 503 313 21 184 655 179 661 3.01e-28 123
MsG0380012961.01.T02 AT5G43730 27.634 503 313 21 184 655 179 661 3.01e-28 123
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MsG0380012961.01.T02 AT1G10920 26.521 411 240 13 289 656 1 392 2.25e-23 106
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MsG0380012961.01.T02 AT1G12280 23.180 522 339 15 109 614 77 552 2.65e-20 97.4
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MsG0380012961.01.T02 AT5G41740 23.629 529 347 18 161 655 184 689 1.52e-17 88.6
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MsG0380012961.01.T02 AT5G11250 22.880 861 509 38 152 933 236 1020 3.60e-16 84.3
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MsG0380012961.01.T02 AT5G41750 24.248 532 321 26 161 655 194 680 4.25e-14 77.4
MsG0380012961.01.T02 AT1G52660 27.228 202 141 3 178 375 161 360 7.48e-14 75.1
MsG0380012961.01.T02 AT1G52660 27.228 202 141 3 178 375 161 360 7.57e-14 75.1
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MsG0380012961.01.T02 AT1G63880 22.430 535 331 22 176 659 207 708 2.13e-13 75.1
MsG0380012961.01.T02 AT3G15700 28.079 203 138 4 178 375 161 360 7.85e-13 71.6
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MsG0380012961.01.T02 AT3G44480 22.029 631 379 25 68 643 220 792 1.69e-11 69.3
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MsG0380012961.01.T02 AT3G44480 22.029 631 379 25 68 643 220 792 1.74e-11 68.9
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MsG0380012961.01.T03 AT3G14460 36.909 783 463 9 2 761 125 899 5.83e-155 491
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MsG0380012961.01.T03 AT1G58400 26.708 805 478 26 34 797 161 894 9.86e-55 205
MsG0380012961.01.T03 AT3G50950 29.580 666 385 24 28 652 151 773 1.95e-53 201
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MsG0380012961.01.T03 AT1G58848 27.250 811 470 30 33 785 159 907 1.97e-52 199
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MsG0380012961.01.T03 AT1G58848 27.250 811 470 30 33 785 159 907 1.97e-52 199
MsG0380012961.01.T03 AT1G58390 26.918 743 466 25 34 743 160 858 1.05e-48 187
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MsG0380012961.01.T03 AT1G58400 25.963 805 474 27 34 797 161 884 1.35e-48 186
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MsG0380012961.01.T03 AT1G59620 26.640 747 455 29 33 753 23 702 1.50e-42 166
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MsG0380012961.01.T03 AT1G50180 29.303 488 298 15 32 493 159 625 6.22e-41 162
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MsG0380012961.01.T03 AT1G10920 28.191 564 325 20 26 541 31 562 2.24e-40 160
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MsG0380012961.01.T03 AT5G43470 27.493 742 424 31 64 753 187 866 4.53e-40 160
MsG0380012961.01.T03 AT5G43470 27.493 742 424 31 64 753 187 866 4.53e-40 160
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MsG0380012961.01.T03 AT1G53350 29.401 551 316 19 33 541 159 678 4.21e-38 154
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MsG0380012961.01.T03 AT1G58410 27.222 540 345 19 33 541 158 680 4.28e-38 154
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MsG0380012961.01.T03 AT5G48620 26.938 761 461 31 33 753 161 866 6.12e-38 153
MsG0380012961.01.T03 AT5G48620 26.938 761 461 31 33 753 161 866 6.12e-38 153
MsG0380012961.01.T03 AT5G48620 26.938 761 461 31 33 753 161 866 6.12e-38 153
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MsG0380012961.01.T03 AT5G63020 25.370 540 341 20 30 544 136 638 4.01e-36 147
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MsG0380012961.01.T03 AT5G05400 24.684 713 439 29 62 717 6 677 1.77e-31 132
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MsG0380012961.01.T03 AT1G12290 25.100 498 316 13 7 475 90 559 3.47e-31 132
MsG0380012961.01.T03 AT1G12290 25.100 498 316 13 7 475 132 601 4.24e-31 131
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MsG0380012961.01.T03 AT5G43740 25.269 744 466 29 52 752 161 857 4.31e-31 131
MsG0380012961.01.T03 AT1G61190 27.409 467 294 16 38 479 155 601 9.11e-31 130
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MsG0380012961.01.T03 AT1G61190 27.409 467 294 16 38 479 155 601 9.64e-31 130
MsG0380012961.01.T03 AT1G61300 25.165 759 438 33 38 758 43 709 1.01e-30 130
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MsG0380012961.01.T03 AT1G63360 24.892 695 451 24 75 743 150 799 1.86e-30 129
MsG0380012961.01.T03 AT4G26090 24.422 778 512 28 37 778 155 892 2.65e-30 129
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MsG0380012961.01.T03 AT1G61180 26.004 523 298 18 38 538 154 609 5.04e-30 128
MsG0380012961.01.T03 AT1G12280 27.133 457 301 13 64 499 178 623 5.65e-30 128
MsG0380012961.01.T03 AT5G47260 24.357 739 412 28 62 743 169 817 3.02e-29 125
MsG0380012961.01.T03 AT1G63350 26.476 559 363 20 10 539 124 663 5.68e-29 125
MsG0380012961.01.T03 AT1G63350 26.476 559 363 20 10 539 124 663 5.68e-29 125
MsG0380012961.01.T03 AT1G61190 26.201 458 286 14 38 479 155 576 6.12e-29 124
MsG0380012961.01.T03 AT1G63350 26.429 560 364 20 10 540 124 664 7.15e-29 124
MsG0380012961.01.T03 AT1G63350 26.476 559 363 20 10 539 124 663 8.82e-29 124
MsG0380012961.01.T03 AT1G58410 25.281 534 331 19 33 541 158 648 1.72e-28 123
MsG0380012961.01.T03 AT5G43730 27.634 503 313 21 69 540 179 661 2.59e-28 122
MsG0380012961.01.T03 AT5G43730 27.634 503 313 21 69 540 179 661 2.59e-28 122
MsG0380012961.01.T03 AT5G43730 27.634 503 313 21 69 540 179 661 2.59e-28 122
MsG0380012961.01.T03 AT5G43730 27.634 503 313 21 69 540 179 661 2.59e-28 122
MsG0380012961.01.T03 AT5G43730 27.634 503 313 21 69 540 179 661 2.59e-28 122
MsG0380012961.01.T03 AT1G62630 24.265 680 441 20 92 743 203 836 5.34e-28 122
MsG0380012961.01.T03 AT1G51480 25.646 503 324 16 69 540 180 663 1.14e-27 120
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MsG0380012961.01.T03 AT1G15890 26.752 314 209 8 69 370 21 325 1.20e-26 117
MsG0380012961.01.T03 AT1G15890 27.097 310 205 8 69 366 181 481 1.75e-26 117
MsG0380012961.01.T03 AT1G10920 26.521 411 240 13 174 541 1 392 1.31e-23 106
MsG0380012961.01.T03 AT1G10920 26.521 411 240 13 174 541 1 392 1.31e-23 106
MsG0380012961.01.T03 AT1G12280 25.000 452 284 13 64 499 140 552 2.63e-20 97.1
MsG0380012961.01.T03 AT5G41740 23.629 529 347 18 46 540 32 537 5.55e-18 89.7
MsG0380012961.01.T03 AT5G41740 23.629 529 347 18 46 540 184 689 9.15e-18 89.4
MsG0380012961.01.T03 AT5G41740 23.629 529 347 18 46 540 184 689 9.16e-18 89.4
MsG0380012961.01.T03 AT5G11250 22.880 861 509 38 37 818 154 938 1.75e-16 85.1
MsG0380012961.01.T03 AT5G11250 22.880 861 509 38 37 818 154 938 1.75e-16 85.1
MsG0380012961.01.T03 AT5G11250 22.880 861 509 38 37 818 236 1020 2.82e-16 84.3
MsG0380012961.01.T03 AT5G48770 21.545 492 346 14 57 519 203 683 1.35e-14 79.0
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MsG0380012961.01.T03 AT5G41750 24.248 532 321 26 46 540 194 680 3.19e-14 77.8
MsG0380012961.01.T03 AT5G41750 24.248 532 321 26 46 540 194 680 3.19e-14 77.8
MsG0380012961.01.T03 AT1G52660 27.228 202 141 3 63 260 161 360 6.49e-14 75.1
MsG0380012961.01.T03 AT1G52660 27.228 202 141 3 63 260 161 360 7.58e-14 74.7
MsG0380012961.01.T03 AT1G63880 22.430 535 331 22 61 544 207 708 1.32e-13 75.5
MsG0380012961.01.T03 AT1G63880 22.430 535 331 22 61 544 207 708 1.71e-13 75.1
MsG0380012961.01.T03 AT3G15700 28.079 203 138 4 63 260 161 360 5.91e-13 72.0
MsG0380012961.01.T03 AT3G15700 28.079 203 138 4 63 260 161 360 8.46e-13 71.6
MsG0380012961.01.T03 AT5G18360 21.575 584 377 19 7 540 155 707 3.77e-12 70.9
MsG0380012961.01.T03 AT5G45210 22.941 510 342 20 48 540 199 674 4.21e-12 70.5
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MsG0380012961.01.T03 AT5G45210 22.941 510 342 20 48 540 208 683 5.26e-12 70.1
MsG0380012961.01.T03 AT3G44480 22.371 523 329 21 61 528 292 792 1.61e-11 68.9
MsG0380012961.01.T03 AT3G44480 22.371 523 329 21 61 528 292 792 1.61e-11 68.9
MsG0380012961.01.T03 AT3G44480 22.371 523 329 21 61 528 292 792 1.65e-11 68.9
MsG0380012961.01.T03 AT3G44480 22.371 523 329 21 61 528 292 792 2.10e-11 68.6
MsG0380012961.01.T03 AT3G44480 22.371 523 329 21 61 528 292 792 2.10e-11 68.6
MsG0380012961.01.T03 AT5G41550 21.201 533 354 20 48 540 196 702 4.02e-11 67.8
MsG0380012961.01.T03 AT5G66900 22.642 636 348 27 64 601 237 826 5.20e-11 67.0
MsG0380012961.01.T03 AT5G66900 22.642 636 348 27 64 601 189 778 5.89e-11 67.0

Find 167 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 213 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATCACGCCATTGCTTGATTT+TGG 0.114915 3:-27756506 None:intergenic
AAATCAATTTCTTCCTATTA+AGG 0.119242 3:-27757557 None:intergenic
CTGCAGGTTGCAACAATATT+TGG 0.152424 3:+27759052 MsG0380012961.01.T03:CDS
TTAATTACTCCGTTGTTTAA+TGG 0.153824 3:+27757132 MsG0380012961.01.T03:CDS
ATCATTTGATTGTTCAATTA+AGG 0.177235 3:-27757676 None:intergenic
TGCCAATTGCTTCTAGGTTT+GGG 0.192191 3:-27757308 None:intergenic
TCTTCATGCCAATTGCTTCT+AGG 0.193159 3:-27757314 None:intergenic
ATTTGATACCTTCAATTAAA+AGG 0.202677 3:+27757952 MsG0380012961.01.T03:CDS
ACCAACTTATTAATTGAATT+TGG 0.221718 3:-27758017 None:intergenic
GATCTAGCAACAATTGTATC+TGG 0.235108 3:+27757741 MsG0380012961.01.T03:CDS
CAAAGGGATATCCCCTTAAT+AGG 0.253499 3:+27757544 MsG0380012961.01.T03:CDS
TATTATGCCTTCTTTGCTTC+TGG 0.264076 3:+27757464 MsG0380012961.01.T03:CDS
ATGCCAATTGCTTCTAGGTT+TGG 0.268096 3:-27757309 None:intergenic
TTTCCAAGCAACGACAATTC+AGG 0.272288 3:-27759013 None:intergenic
TCGGCAATTGAATGAGTTTC+CGG 0.296916 3:-27758139 None:intergenic
AGGAAGAGTTAAAGTGTAGA+AGG 0.300108 3:+27757055 MsG0380012961.01.T03:CDS
AATTTCTTCAAGTTTATTGA+TGG 0.317598 3:-27758497 None:intergenic
AGAGGTTCTAATTTATGAAT+AGG 0.318626 3:-27757222 None:intergenic
GCAATACTCACAAGATTTGA+TGG 0.320091 3:-27758597 None:intergenic
AATCAATTTCTTCCTATTAA+GGG 0.320306 3:-27757556 None:intergenic
AGGCTTCCTCGAACATTCTA+TGG 0.321093 3:+27757596 MsG0380012961.01.T03:CDS
TTAGACTTGTTTACGATGAT+AGG 0.333585 3:+27756887 MsG0380012961.01.T03:CDS
GTTTCCTACCCATTGGTTCT+AGG 0.334627 3:+27757892 MsG0380012961.01.T03:CDS
TCTCTTGAAACTCACCGTTT+TGG 0.349024 3:+27756420 MsG0380012961.01.T02:CDS
GTCTTAAAACTTTGGTGCTT+AGG 0.350326 3:+27758840 MsG0380012961.01.T03:CDS
TTGAGCAGTTAGAAGTATAC+TGG 0.351431 3:+27758420 MsG0380012961.01.T03:CDS
ACTCCGTTGTTTAATGGAAA+TGG 0.367854 3:+27757138 MsG0380012961.01.T03:CDS
TAAAGGTCACATGTTGTATC+TGG 0.367876 3:-27758086 None:intergenic
ATCTCCGAGCAATGTTGTTT+CGG 0.381734 3:-27756311 None:intergenic
CTATTAAGGGGATATCCCTT+TGG 0.385798 3:-27757543 None:intergenic
TCTTAAAACTTTGGTGCTTA+GGG 0.386032 3:+27758841 MsG0380012961.01.T03:CDS
TTATGATTCGCTTCGATGTA+AGG 0.386420 3:+27756579 MsG0380012961.01.T02:CDS
ACTTTGGTGTAGTCATTTGC+CGG 0.391276 3:+27758925 MsG0380012961.01.T03:CDS
ACCAAATTCAATTAATAAGT+TGG 0.397753 3:+27758016 MsG0380012961.01.T03:CDS
GGGAAAAGTTGTTGCAGGAT+TGG 0.398056 3:+27757762 MsG0380012961.01.T03:CDS
AGTTTGGGTTCGTGTGTTAG+AGG 0.399711 3:+27756936 MsG0380012961.01.T03:CDS
TATCTGGGAAAAGTTGTTGC+AGG 0.402391 3:+27757757 MsG0380012961.01.T03:CDS
GAAGGCATAATATTATCATT+TGG 0.411889 3:-27757453 None:intergenic
TCCCCTGAATTGTCGTTGCT+TGG 0.412338 3:+27759010 MsG0380012961.01.T03:CDS
CTCCACTTGTCTTCAACACT+TGG 0.415775 3:+27759114 MsG0380012961.01.T03:CDS
ATGATTTGTCAAATGCTTCA+AGG 0.416152 3:+27756652 MsG0380012961.01.T03:CDS
ACAATTGGCCCAGAGTTCTA+TGG 0.418600 3:+27758692 MsG0380012961.01.T03:CDS
GAAGATTTGCTCGATGAAAT+CGG 0.421152 3:+27756556 MsG0380012961.01.T02:CDS
CCTGTCATGCCATAGAACTC+TGG 0.423795 3:-27758701 None:intergenic
TATTAGCTATACAAAGATAA+AGG 0.425393 3:+27758199 MsG0380012961.01.T03:CDS
AATTTAATAGTATGCCTAGT+TGG 0.431540 3:+27758774 MsG0380012961.01.T03:CDS
CTGGTGGGCAAGCACGAAGT+TGG 0.433652 3:+27758275 MsG0380012961.01.T03:CDS
AAATTGAGCATTGACTTCTA+TGG 0.434896 3:+27758515 MsG0380012961.01.T03:CDS
CCAGAGTTCTATGGCATGAC+AGG 0.435351 3:+27758701 MsG0380012961.01.T03:CDS
ATCTCCAATTCTTTGAGAAA+AGG 0.436057 3:-27758647 None:intergenic
GTGGAGCTCATAAACATGTT+AGG 0.436081 3:-27759097 None:intergenic
TCTTTGTATAGCTAATATCT+AGG 0.439923 3:-27758193 None:intergenic
CTCACTGCATTTCTAGCAAA+TGG 0.440824 3:+27759157 MsG0380012961.01.T03:CDS
GAGATGGAAATGGTTGGAAC+GGG 0.442664 3:-27758739 None:intergenic
TAGAGAAAATTACAATACTT+TGG 0.448224 3:+27758909 MsG0380012961.01.T03:CDS
GGAATGATAATTATCGTGAT+TGG 0.451900 3:+27757103 MsG0380012961.01.T03:CDS
GATTTCATCGAGCAAATCTT+CGG 0.453588 3:-27756554 None:intergenic
ACTTTATAATTGCATCTCTA+CGG 0.453748 3:+27756987 MsG0380012961.01.T03:CDS
CTCTATCAGATGAAGATTGT+TGG 0.454074 3:+27757241 MsG0380012961.01.T03:CDS
TGGTGGGCAAGCACGAAGTT+GGG 0.455886 3:+27758276 MsG0380012961.01.T03:CDS
CTATCTTGAATAGCGACATA+TGG 0.456488 3:+27757424 MsG0380012961.01.T03:CDS
AGGAAACTTGCTGCCTCTGA+AGG 0.462311 3:-27758810 None:intergenic
ATTGAATAACTGTTTCTGTT+CGG 0.463980 3:-27756482 None:intergenic
TTCCAAGCAACGACAATTCA+GGG 0.464183 3:-27759012 None:intergenic
CTGTTCGGCATCGCGAAGAA+TGG 0.468379 3:-27756467 None:intergenic
CAAGCATTTGATTTCAGTGC+GGG 0.470126 3:-27758063 None:intergenic
ATCAATTTCTTCCTATTAAG+GGG 0.474514 3:-27757555 None:intergenic
GTATGCCTAGTTGGAGAGAA+TGG 0.481460 3:+27758783 MsG0380012961.01.T03:CDS
AGCTTCTCAAGAGATGGAAA+TGG 0.481677 3:-27758749 None:intergenic
GCCAATTGCTTCTAGGTTTG+GGG 0.483924 3:-27757307 None:intergenic
TTCCAACCATAGAATGTTCG+AGG 0.489874 3:-27757602 None:intergenic
AATTCTAGCTTCTCAAGAGA+TGG 0.491061 3:-27758755 None:intergenic
TTAAAGTTTGCAAATAGTAA+AGG 0.492864 3:-27758103 None:intergenic
GGGTTAAGTATCAGAGAGCT+TGG 0.494808 3:+27758296 MsG0380012961.01.T03:CDS
TCCCCAAACCTAGAAGCAAT+TGG 0.495829 3:+27757306 MsG0380012961.01.T03:CDS
ATGAGTAGAGTGGAAACAAT+TGG 0.496215 3:+27758677 MsG0380012961.01.T03:CDS
TTAAGAATAACTTCATCTGT+TGG 0.497210 3:-27758464 None:intergenic
CTGTCATGCCATAGAACTCT+GGG 0.502003 3:-27758700 None:intergenic
GTGTACTTTGCGCTTTAAGT+TGG 0.505683 3:-27758396 None:intergenic
CTTTATAATTGCATCTCTAC+GGG 0.506374 3:+27756988 MsG0380012961.01.T03:CDS
TTGGGAAGTTTCCTAACCTA+CGG 0.507288 3:+27758315 MsG0380012961.01.T03:CDS
ACATTCTAGTGAAATCTCCT+TGG 0.509243 3:-27759235 None:intergenic
TGGGAAGTTTCCTAACCTAC+GGG 0.510303 3:+27758316 MsG0380012961.01.T03:CDS
GAACAATCTCCCAACCAACT+TGG 0.510344 3:-27758551 None:intergenic
TAATAAGTCTTCAACGGTTG+CGG 0.510803 3:-27756344 None:intergenic
TTGCGAAGTTTCCTACCCAT+TGG 0.512272 3:+27757885 MsG0380012961.01.T03:CDS
CAACAATCTTCATCTGATAG+AGG 0.512423 3:-27757240 None:intergenic
ACTTCGTTGCAGTCACAATC+CGG 0.518984 3:+27759187 MsG0380012961.01.T03:CDS
TGTTTGTGTTGGATGACGTA+TGG 0.519504 3:+27757082 MsG0380012961.01.T03:CDS
AGTTGTTGCAGGATTGGATC+TGG 0.520694 3:+27757768 MsG0380012961.01.T03:CDS
TCTCTACGGGAACTTACGTT+GGG 0.521919 3:+27757001 MsG0380012961.01.T03:CDS
ATCTAGCAACAATTGTATCT+GGG 0.522318 3:+27757742 MsG0380012961.01.T03:CDS
ATTAACTTTCCAACATGCAT+CGG 0.522423 3:-27758158 None:intergenic
ACACGCCTCACTCACATCAA+TGG 0.527169 3:-27758369 None:intergenic
CTCAAAGAATTGGAGATCGA+TGG 0.528009 3:+27758653 MsG0380012961.01.T03:CDS
TGATTATCCATGTCATCTGC+AGG 0.531687 3:+27759036 MsG0380012961.01.T03:CDS
TAATGGAAATGGTGGAAGTA+AGG 0.532559 3:+27757149 MsG0380012961.01.T03:CDS
ATCCAAGTGTTGAAGACAAG+TGG 0.537284 3:-27759116 None:intergenic
GGTTAAGTATCAGAGAGCTT+GGG 0.538481 3:+27758297 MsG0380012961.01.T03:CDS
GATCGATGGTATGAGTAGAG+TGG 0.538987 3:+27758667 MsG0380012961.01.T03:CDS
TTCCTCGAACATTCTATGGT+TGG 0.540095 3:+27757600 MsG0380012961.01.T03:CDS
TCTAGTCTGACAAGTTGCAT+TGG 0.542707 3:-27758227 None:intergenic
ATCTCTACGGGAACTTACGT+TGG 0.543074 3:+27757000 MsG0380012961.01.T03:CDS
TTGAGCATTGACTTCTATGG+TGG 0.543554 3:+27758518 MsG0380012961.01.T03:CDS
TGATATGCCAGAAGCAAAGA+AGG 0.546913 3:-27757471 None:intergenic
TTCTTGCCACCTAGAACCAA+TGG 0.549315 3:-27757901 None:intergenic
AAAGATCTGAATCATCTTCG+AGG 0.558095 3:+27757024 MsG0380012961.01.T03:CDS
GAAATCCATTCTCTCCAACT+AGG 0.559242 3:-27758788 None:intergenic
AGAGATGGAAATGGTTGGAA+CGG 0.559951 3:-27758740 None:intergenic
CTACACTATCTACTCTGCAT+TGG 0.561046 3:+27758948 MsG0380012961.01.T03:CDS
GTGAATGAATCTGTTATAGT+TGG 0.561876 3:+27756745 MsG0380012961.01.T03:CDS
AGTATACTTCTAACTGCTCA+AGG 0.566222 3:-27758418 None:intergenic
GTGAAGCTTTGTCTCCAAAA+CGG 0.566972 3:-27756434 None:intergenic
AAGCATGCATTTAGAAGTGG+TGG 0.567834 3:+27757276 MsG0380012961.01.T03:CDS
GAAATCTCCTTGGAAGTGCA+AGG 0.567999 3:-27759225 None:intergenic
TGCAGAGTAGATAGTGTAGC+CGG 0.568679 3:-27758944 None:intergenic
ATTCAATTGCCGATGCATGT+TGG 0.573267 3:+27758149 MsG0380012961.01.T03:CDS
TCTTTAGATTTGATGTGTCG+AGG 0.574218 3:+27758986 MsG0380012961.01.T03:CDS
TCTATGGAAGGAAGTTGACT+AGG 0.575195 3:-27758890 None:intergenic
TTTGTGTAATAAGTCTTCAA+CGG 0.576881 3:-27756350 None:intergenic
TGCTAGAAATGCAGTGAGAG+AGG 0.577048 3:-27759152 None:intergenic
TAGGGATTGTACTGAACTGA+GGG 0.578510 3:+27758859 MsG0380012961.01.T03:CDS
TCTCAAGAGATGGAAATGGT+TGG 0.580789 3:-27758745 None:intergenic
AAATCTCCTTGGAAGTGCAA+GGG 0.585897 3:-27759224 None:intergenic
TCTTGCCACCTAGAACCAAT+GGG 0.589673 3:-27757900 None:intergenic
CCGTTGTTTAATGGAAATGG+TGG 0.591188 3:+27757141 MsG0380012961.01.T03:CDS
ATGGCCGAAACAACATTGCT+CGG 0.593423 3:+27756307 MsG0380012961.01.T02:CDS
CCAATAGCTGCTAAAACAGT+CGG 0.598680 3:+27757360 MsG0380012961.01.T03:CDS
CAGAGTTCTATGGCATGACA+GGG 0.600088 3:+27758702 MsG0380012961.01.T03:CDS
GATTGTGACTGCAACGAAGT+GGG 0.603233 3:-27759184 None:intergenic
TCTAAGCATGCATTTAGAAG+TGG 0.605815 3:+27757273 MsG0380012961.01.T03:CDS
TCAATCCCAAAATCAAGCAA+TGG 0.610216 3:+27756500 MsG0380012961.01.T02:CDS
ACTCACAAGATTTGATGGAA+AGG 0.611901 3:-27758592 None:intergenic
TGAGCATTGACTTCTATGGT+GGG 0.616884 3:+27758519 MsG0380012961.01.T03:CDS
AATCTCCTTGGAAGTGCAAG+GGG 0.619630 3:-27759223 None:intergenic
AAAGGTAGTTGTCCTAGTGG+AGG 0.620996 3:-27758629 None:intergenic
AAGGTAGAGAATACACAACC+TGG 0.621236 3:+27756598 MsG0380012961.01.T02:CDS
TGAGCAGTTAGAAGTATACT+GGG 0.621760 3:+27758421 MsG0380012961.01.T03:CDS
TCCTACCCATTGGTTCTAGG+TGG 0.622333 3:+27757895 MsG0380012961.01.T03:CDS
AATATGTTAATGTGTGAGAG+TGG 0.633515 3:+27756796 MsG0380012961.01.T03:CDS
GTTGCAACCTGCAGATGACA+TGG 0.633525 3:-27759043 None:intergenic
TCCAAGCAACGACAATTCAG+GGG 0.635686 3:-27759011 None:intergenic
AGAAAAGGTAGTTGTCCTAG+TGG 0.636075 3:-27758632 None:intergenic
GGATTGTGACTGCAACGAAG+TGG 0.636328 3:-27759185 None:intergenic
CAAAGGTAGATGCGAATGTG+TGG 0.639490 3:+27757397 MsG0380012961.01.T03:CDS
ATGAAGATTGCAAGAAAGTG+CGG 0.640872 3:+27757330 MsG0380012961.01.T03:CDS
CCACCATTTCCATTAAACAA+CGG 0.641874 3:-27757141 None:intergenic
TGCATAACACTTCCTCCACT+AGG 0.643802 3:+27758617 MsG0380012961.01.T03:CDS
AGAGAATGGATTTCCTTCAG+AGG 0.646489 3:+27758797 MsG0380012961.01.T03:CDS
ATAGCTGCTAAAACAGTCGG+AGG 0.647151 3:+27757363 MsG0380012961.01.T03:CDS
GAGTTCTATGGCATGACAGG+GGG 0.651639 3:+27758704 MsG0380012961.01.T03:CDS
GATGCAATTATAAAGTGCTG+TGG 0.657118 3:-27756980 None:intergenic
TTAATAAGTTGGTGCAACTG+CGG 0.657528 3:+27758027 MsG0380012961.01.T03:CDS
TTAGGGATTGTACTGAACTG+AGG 0.660575 3:+27758858 MsG0380012961.01.T03:CDS
TAGCTGCTAAAACAGTCGGA+GGG 0.667762 3:+27757364 MsG0380012961.01.T03:CDS
TGTTGCAGGATTGGATCTGG+TGG 0.673938 3:+27757771 MsG0380012961.01.T03:CDS
AGATGGAAATGGTTGGAACG+GGG 0.688069 3:-27758738 None:intergenic
AGTGATGTTATAATTTGACA+AGG 0.689014 3:-27757988 None:intergenic
CAAATCTAAAGATTTAACTG+AGG 0.689613 3:-27758975 None:intergenic
ATCTCCTTGGAAGTGCAAGG+GGG 0.692295 3:-27759222 None:intergenic
GCCACCTAGAACCAATGGGT+AGG 0.692426 3:-27757896 None:intergenic
GCAAGCATTTGATTTCAGTG+CGG 0.697796 3:-27758064 None:intergenic
AGAGTTCTATGGCATGACAG+GGG 0.699520 3:+27758703 MsG0380012961.01.T03:CDS
TAATGCCATTGATGTGAGTG+AGG 0.704963 3:+27758364 MsG0380012961.01.T03:CDS
AAGATTGCAAGAAAGTGCGG+CGG 0.709840 3:+27757333 MsG0380012961.01.T03:CDS
GGGAAGTTTCCTAACCTACG+GGG 0.750083 3:+27758317 MsG0380012961.01.T03:CDS
AGGGATTGTACTGAACTGAG+GGG 0.803938 3:+27758860 MsG0380012961.01.T03:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAATCAATTTCTTCCTATTA+AGG - Chr3:27757560-27757579 None:intergenic 20.0%
!! AATCAATTTCTTCCTATTAA+GGG - Chr3:27757559-27757578 None:intergenic 20.0%
!! ACCAAATTCAATTAATAAGT+TGG + Chr3:27758016-27758035 MsG0380012961.01.T03:CDS 20.0%
!! ACCAACTTATTAATTGAATT+TGG - Chr3:27758020-27758039 None:intergenic 20.0%
!! ATCATTTGATTGTTCAATTA+AGG - Chr3:27757679-27757698 None:intergenic 20.0%
!! ATTTGATACCTTCAATTAAA+AGG + Chr3:27757952-27757971 MsG0380012961.01.T03:CDS 20.0%
!! TAGAGAAAATTACAATACTT+TGG + Chr3:27758909-27758928 MsG0380012961.01.T03:CDS 20.0%
!! TATTAGCTATACAAAGATAA+AGG + Chr3:27758199-27758218 MsG0380012961.01.T03:CDS 20.0%
!! TTAAAGTTTGCAAATAGTAA+AGG - Chr3:27758106-27758125 None:intergenic 20.0%
!!! AAACATATTTTCAAATGAGA+AGG - Chr3:27757504-27757523 None:intergenic 20.0%
!!! AAGTATTGTAATTTTCTCTA+TGG - Chr3:27758909-27758928 None:intergenic 20.0%
!!! AATTTCTTCAAGTTTATTGA+TGG - Chr3:27758500-27758519 None:intergenic 20.0%
!!! AGTATTTTGATTTGAAAGTT+TGG + Chr3:27756920-27756939 MsG0380012961.01.T03:CDS 20.0%
!!! GGTAATTTTTATAAGAAGTT+AGG + Chr3:27756817-27756836 MsG0380012961.01.T03:CDS 20.0%
!!! GTATTTTGATTTGAAAGTTT+GGG + Chr3:27756921-27756940 MsG0380012961.01.T03:CDS 20.0%
!!! TGCAAACTTTAATTTTATCA+GGG + Chr3:27758114-27758133 MsG0380012961.01.T03:CDS 20.0%
!!! TTGCAAACTTTAATTTTATC+AGG + Chr3:27758113-27758132 MsG0380012961.01.T03:CDS 20.0%
! AATTTAATAGTATGCCTAGT+TGG + Chr3:27758774-27758793 MsG0380012961.01.T03:CDS 25.0%
! ACTTTATAATTGCATCTCTA+CGG + Chr3:27756987-27757006 MsG0380012961.01.T03:CDS 25.0%
! AGTGATGTTATAATTTGACA+AGG - Chr3:27757991-27758010 None:intergenic 25.0%
! ATCAATTTCTTCCTATTAAG+GGG - Chr3:27757558-27757577 None:intergenic 25.0%
! CAAATCTAAAGATTTAACTG+AGG - Chr3:27758978-27758997 None:intergenic 25.0%
! TCTTTGTATAGCTAATATCT+AGG - Chr3:27758196-27758215 None:intergenic 25.0%
! TTAAGAATAACTTCATCTGT+TGG - Chr3:27758467-27758486 None:intergenic 25.0%
! TTAATTACTCCGTTGTTTAA+TGG + Chr3:27757132-27757151 MsG0380012961.01.T03:CDS 25.0%
! TTTGTGTAATAAGTCTTCAA+CGG - Chr3:27756353-27756372 None:intergenic 25.0%
!! AGAGGTTCTAATTTATGAAT+AGG - Chr3:27757225-27757244 None:intergenic 25.0%
!! ATTGTAATTTTCTCTATGGA+AGG - Chr3:27758905-27758924 None:intergenic 25.0%
!! GAAGGCATAATATTATCATT+TGG - Chr3:27757456-27757475 None:intergenic 25.0%
!!! ATTGAATAACTGTTTCTGTT+CGG - Chr3:27756485-27756504 None:intergenic 25.0%
AATATGTTAATGTGTGAGAG+TGG + Chr3:27756796-27756815 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
ATCTAGCAACAATTGTATCT+GGG + Chr3:27757742-27757761 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
ATTAACTTTCCAACATGCAT+CGG - Chr3:27758161-27758180 None:intergenic 30.0%
CTTTATAATTGCATCTCTAC+GGG + Chr3:27756988-27757007 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
GAAAAACAGTTAGTGTTTGA+AGG - Chr3:27758256-27758275 None:intergenic 30.0%
GGAATGATAATTATCGTGAT+TGG + Chr3:27757103-27757122 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
GTGAATGAATCTGTTATAGT+TGG + Chr3:27756745-27756764 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
! ACTACCTTTTCTCAAAGAAT+TGG + Chr3:27758643-27758662 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
! AGATTGTTCGTTTTCTAACA+TGG + Chr3:27758565-27758584 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
! ATCTCCAATTCTTTGAGAAA+AGG - Chr3:27758650-27758669 None:intergenic 30.0%
! ATGATTTGTCAAATGCTTCA+AGG + Chr3:27756652-27756671 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
! TATTGCTCGATTTTTCCAAA+GGG + Chr3:27757528-27757547 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
! TTAGACTTGTTTACGATGAT+AGG + Chr3:27756887-27756906 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
! TTTTCCTCGTCTTAAAACTT+TGG + Chr3:27758832-27758851 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
! TTTTTCTCTGTCAAATTCAG+TGG + Chr3:27756723-27756742 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
!! AAATTGAGCATTGACTTCTA+TGG + Chr3:27758515-27758534 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
!! GAAATTGATTTTGTTGTGGA+TGG + Chr3:27757569-27757588 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
!! GGAAGAAATTGATTTTGTTG+TGG + Chr3:27757565-27757584 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
!! GTTCAACAAATCGATTTTCT+TGG + Chr3:27756679-27756698 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
!! TAGAAGGTTTTTGTTTGTGT+TGG + Chr3:27757071-27757090 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
!! TCAAACACTAACTGTTTTTC+TGG + Chr3:27758256-27758275 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
!! TCTTAAAACTTTGGTGCTTA+GGG + Chr3:27758841-27758860 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
!!! AAAGTTTTAAGACGAGGAAA+AGG - Chr3:27758833-27758852 None:intergenic 30.0%
!!! ATAAGTTTTCCAAGTTGGTT+GGG + Chr3:27758542-27758561 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
!!! TTAGGTGTGATTGTTGTTTT+AGG + Chr3:27756835-27756854 MsG0380012961.01.T03:CDS 30.0%
AAAGATCTGAATCATCTTCG+AGG + Chr3:27757024-27757043 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
ACTCACAAGATTTGATGGAA+AGG - Chr3:27758595-27758614 None:intergenic 35.0%
ACTCCGTTGTTTAATGGAAA+TGG + Chr3:27757138-27757157 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
AGGAAGAGTTAAAGTGTAGA+AGG + Chr3:27757055-27757074 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
AGTATACTTCTAACTGCTCA+AGG - Chr3:27758421-27758440 None:intergenic 35.0%
ATGAAGATTGCAAGAAAGTG+CGG + Chr3:27757330-27757349 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
ATGAGTAGAGTGGAAACAAT+TGG + Chr3:27758677-27758696 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
CAACAATCTTCATCTGATAG+AGG - Chr3:27757243-27757262 None:intergenic 35.0%
CCACCATTTCCATTAAACAA+CGG - Chr3:27757144-27757163 None:intergenic 35.0%
CTATCTTGAATAGCGACATA+TGG + Chr3:27757424-27757443 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
CTCTATCAGATGAAGATTGT+TGG + Chr3:27757241-27757260 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
GATCTAGCAACAATTGTATC+TGG + Chr3:27757741-27757760 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
GATTTCATCGAGCAAATCTT+CGG - Chr3:27756557-27756576 None:intergenic 35.0%
GCAATACTCACAAGATTTGA+TGG - Chr3:27758600-27758619 None:intergenic 35.0%
TAAAGGTCACATGTTGTATC+TGG - Chr3:27758089-27758108 None:intergenic 35.0%
TAATAAGTCTTCAACGGTTG+CGG - Chr3:27756347-27756366 None:intergenic 35.0%
TATGGTTGGAAAAACAGTAG+AGG + Chr3:27757614-27757633 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
TATTATGCCTTCTTTGCTTC+TGG + Chr3:27757464-27757483 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
TCAATCCCAAAATCAAGCAA+TGG + Chr3:27756500-27756519 MsG0380012961.01.T02:CDS 35.0%
TCTAAGCATGCATTTAGAAG+TGG + Chr3:27757273-27757292 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
TCTTTAGATTTGATGTGTCG+AGG + Chr3:27758986-27759005 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
TTATGATTCGCTTCGATGTA+AGG + Chr3:27756579-27756598 MsG0380012961.01.T02:CDS 35.0%
! CTATTGCTCGATTTTTCCAA+AGG + Chr3:27757527-27757546 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
! CTTTGGAAAAATCGAGCAAT+AGG - Chr3:27757529-27757548 None:intergenic 35.0%
! GAAGATTTGCTCGATGAAAT+CGG + Chr3:27756556-27756575 MsG0380012961.01.T02:CDS 35.0%
! TAATGGAAATGGTGGAAGTA+AGG + Chr3:27757149-27757168 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
! TGAGCAGTTAGAAGTATACT+GGG + Chr3:27758421-27758440 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
! TTGAACATCGAATCTTTTCC+AGG - Chr3:27756619-27756638 None:intergenic 35.0%
! TTGAGCAGTTAGAAGTATAC+TGG + Chr3:27758420-27758439 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
!! AACACTAACTGTTTTTCTGG+TGG + Chr3:27758259-27758278 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
!! AATTCTAGCTTCTCAAGAGA+TGG - Chr3:27758758-27758777 None:intergenic 35.0%
!! ACACGCAACCTTTTAATTGA+AGG - Chr3:27757963-27757982 None:intergenic 35.0%
!! ACACTAACTGTTTTTCTGGT+GGG + Chr3:27758260-27758279 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
!! CTTTAATTTTATCAGGGTGC+CGG + Chr3:27758120-27758139 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
!! GATGCAATTATAAAGTGCTG+TGG - Chr3:27756983-27757002 None:intergenic 35.0%
!! GTCTTAAAACTTTGGTGCTT+AGG + Chr3:27758840-27758859 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
!! TTAATAAGTTGGTGCAACTG+CGG + Chr3:27758027-27758046 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
!!! ATTGTTGTTTTAGGTGATGG+AGG + Chr3:27756844-27756863 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
!!! GATAAGTTTTCCAAGTTGGT+TGG + Chr3:27758541-27758560 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
!!! GTGATTGTTGTTTTAGGTGA+TGG + Chr3:27756841-27756860 MsG0380012961.01.T03:CDS 35.0%
AAGCATGCATTTAGAAGTGG+TGG + Chr3:27757276-27757295 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
AAGGTAGAGAATACACAACC+TGG + Chr3:27756598-27756617 MsG0380012961.01.T02:CDS 40.0%
ACGTAATGAAAAAGTCGCAG+AGG + Chr3:27757185-27757204 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
AGAAAAGGTAGTTGTCCTAG+TGG - Chr3:27758635-27758654 None:intergenic 40.0%
AGAGATGGAAATGGTTGGAA+CGG - Chr3:27758743-27758762 None:intergenic 40.0%
AGCTTCTCAAGAGATGGAAA+TGG - Chr3:27758752-27758771 None:intergenic 40.0%
ATGCCAATTGCTTCTAGGTT+TGG - Chr3:27757312-27757331 None:intergenic 40.0%
ATTCAATTGCCGATGCATGT+TGG + Chr3:27758149-27758168 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
CAAAGGGATATCCCCTTAAT+AGG + Chr3:27757544-27757563 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
CCAATAGCTGCTAAAACAGT+CGG + Chr3:27757360-27757379 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
CCGTTGTTTAATGGAAATGG+TGG + Chr3:27757141-27757160 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
CTACACTATCTACTCTGCAT+TGG + Chr3:27758948-27758967 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
CTATTAAGGGGATATCCCTT+TGG - Chr3:27757546-27757565 None:intergenic 40.0%
CTCAAAGAATTGGAGATCGA+TGG + Chr3:27758653-27758672 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
CTGCAGGTTGCAACAATATT+TGG + Chr3:27759052-27759071 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
GAAATCCATTCTCTCCAACT+AGG - Chr3:27758791-27758810 None:intergenic 40.0%
GGAAAAACAGTAGAGGAAGT+TGG + Chr3:27757621-27757640 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
GGTTAAGTATCAGAGAGCTT+GGG + Chr3:27758297-27758316 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
GTGGAGCTCATAAACATGTT+AGG - Chr3:27759100-27759119 None:intergenic 40.0%
TAATGCCATTGATGTGAGTG+AGG + Chr3:27758364-27758383 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
TAGGGATTGTACTGAACTGA+GGG + Chr3:27758859-27758878 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
TATCTGGGAAAAGTTGTTGC+AGG + Chr3:27757757-27757776 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
TCGGCAATTGAATGAGTTTC+CGG - Chr3:27758142-27758161 None:intergenic 40.0%
TCTAGTCTGACAAGTTGCAT+TGG - Chr3:27758230-27758249 None:intergenic 40.0%
TCTATGGAAGGAAGTTGACT+AGG - Chr3:27758893-27758912 None:intergenic 40.0%
TCTCAAGAGATGGAAATGGT+TGG - Chr3:27758748-27758767 None:intergenic 40.0%
TCTTCATGCCAATTGCTTCT+AGG - Chr3:27757317-27757336 None:intergenic 40.0%
TGATATGCCAGAAGCAAAGA+AGG - Chr3:27757474-27757493 None:intergenic 40.0%
TGATTATCCATGTCATCTGC+AGG + Chr3:27759036-27759055 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
TGCCAATTGCTTCTAGGTTT+GGG - Chr3:27757311-27757330 None:intergenic 40.0%
TGTTTGTGTTGGATGACGTA+TGG + Chr3:27757082-27757101 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
TTAGGGATTGTACTGAACTG+AGG + Chr3:27758858-27758877 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
TTCCAACCATAGAATGTTCG+AGG - Chr3:27757605-27757624 None:intergenic 40.0%
TTCCAAGCAACGACAATTCA+GGG - Chr3:27759015-27759034 None:intergenic 40.0%
TTCCTCGAACATTCTATGGT+TGG + Chr3:27757600-27757619 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
TTGGGAAGTTTCCTAACCTA+CGG + Chr3:27758315-27758334 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
TTTCCAAGCAACGACAATTC+AGG - Chr3:27759016-27759035 None:intergenic 40.0%
! AAATCTCCTTGGAAGTGCAA+GGG - Chr3:27759227-27759246 None:intergenic 40.0%
! ACTTTGGTGTAGTCATTTGC+CGG + Chr3:27758925-27758944 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
! AGAGAATGGATTTCCTTCAG+AGG + Chr3:27758797-27758816 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
! ATCACGCCATTGCTTGATTT+TGG - Chr3:27756509-27756528 None:intergenic 40.0%
! ATCTCCGAGCAATGTTGTTT+CGG - Chr3:27756314-27756333 None:intergenic 40.0%
! CAAGCATTTGATTTCAGTGC+GGG - Chr3:27758066-27758085 None:intergenic 40.0%
! GCAAGCATTTGATTTCAGTG+CGG - Chr3:27758067-27758086 None:intergenic 40.0%
! GTGAAGCTTTGTCTCCAAAA+CGG - Chr3:27756437-27756456 None:intergenic 40.0%
! GTGGGATAAGTTTTCCAAGT+TGG + Chr3:27758537-27758556 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
! GTGTACTTTGCGCTTTAAGT+TGG - Chr3:27758399-27758418 None:intergenic 40.0%
! TCACGCCATTGCTTGATTTT+GGG - Chr3:27756508-27756527 None:intergenic 40.0%
! TCTCTTGAAACTCACCGTTT+TGG + Chr3:27756420-27756439 MsG0380012961.01.T02:CDS 40.0%
!! ATCCAAGTGTTGAAGACAAG+TGG - Chr3:27759119-27759138 None:intergenic 40.0%
!! ATTTTGTTGTGGATGGCAGA+AGG + Chr3:27757576-27757595 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
!! CTCACTGCATTTCTAGCAAA+TGG + Chr3:27759157-27759176 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
!! TCATCTTCGAGGTCGTTTTA+AGG + Chr3:27757035-27757054 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
!! TGAGCATTGACTTCTATGGT+GGG + Chr3:27758519-27758538 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
!! TTGAGCATTGACTTCTATGG+TGG + Chr3:27758518-27758537 MsG0380012961.01.T03:CDS 40.0%
!!! AGCACCAAAGTTTTAAGACG+AGG - Chr3:27758839-27758858 None:intergenic 40.0%
AAAGGTAGTTGTCCTAGTGG+AGG - Chr3:27758632-27758651 None:intergenic 45.0%
ACAATTGGCCCAGAGTTCTA+TGG + Chr3:27758692-27758711 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
ACTTCGTTGCAGTCACAATC+CGG + Chr3:27759187-27759206 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
AGAGTTCTATGGCATGACAG+GGG + Chr3:27758703-27758722 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
AGATGGAAATGGTTGGAACG+GGG - Chr3:27758741-27758760 None:intergenic 45.0%
AGGCTTCCTCGAACATTCTA+TGG + Chr3:27757596-27757615 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
AGGGATTGTACTGAACTGAG+GGG + Chr3:27758860-27758879 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
AGTTGTTGCAGGATTGGATC+TGG + Chr3:27757768-27757787 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
ATAGCTGCTAAAACAGTCGG+AGG + Chr3:27757363-27757382 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
ATCTCTACGGGAACTTACGT+TGG + Chr3:27757000-27757019 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
ATGGCCGAAACAACATTGCT+CGG + Chr3:27756307-27756326 MsG0380012961.01.T02:CDS 45.0%
CAAAGGTAGATGCGAATGTG+TGG + Chr3:27757397-27757416 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
CAGAGTTCTATGGCATGACA+GGG + Chr3:27758702-27758721 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
CTCCACTTGTCTTCAACACT+TGG + Chr3:27759114-27759133 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
CTGTCATGCCATAGAACTCT+GGG - Chr3:27758703-27758722 None:intergenic 45.0%
GAACAATCTCCCAACCAACT+TGG - Chr3:27758554-27758573 None:intergenic 45.0%
GAGATGGAAATGGTTGGAAC+GGG - Chr3:27758742-27758761 None:intergenic 45.0%
GATCGATGGTATGAGTAGAG+TGG + Chr3:27758667-27758686 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
GATTGTGACTGCAACGAAGT+GGG - Chr3:27759187-27759206 None:intergenic 45.0%
GCCAATTGCTTCTAGGTTTG+GGG - Chr3:27757310-27757329 None:intergenic 45.0%
GGGAAAAGTTGTTGCAGGAT+TGG + Chr3:27757762-27757781 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
GGGTTAAGTATCAGAGAGCT+TGG + Chr3:27758296-27758315 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
GTATGCCTAGTTGGAGAGAA+TGG + Chr3:27758783-27758802 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
TAGCTGCTAAAACAGTCGGA+GGG + Chr3:27757364-27757383 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
TCCAAGCAACGACAATTCAG+GGG - Chr3:27759014-27759033 None:intergenic 45.0%
TCCCCAAACCTAGAAGCAAT+TGG + Chr3:27757306-27757325 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
TCTCTACGGGAACTTACGTT+GGG + Chr3:27757001-27757020 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
TCTTGCCACCTAGAACCAAT+GGG - Chr3:27757903-27757922 None:intergenic 45.0%
TGCAGAGTAGATAGTGTAGC+CGG - Chr3:27758947-27758966 None:intergenic 45.0%
TGCATAACACTTCCTCCACT+AGG + Chr3:27758617-27758636 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
TGCTAGAAATGCAGTGAGAG+AGG - Chr3:27759155-27759174 None:intergenic 45.0%
TGGGAAGTTTCCTAACCTAC+GGG + Chr3:27758316-27758335 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
TTCTTGCCACCTAGAACCAA+TGG - Chr3:27757904-27757923 None:intergenic 45.0%
TTGCGAAGTTTCCTACCCAT+TGG + Chr3:27757885-27757904 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
! AAGATTGCAAGAAAGTGCGG+CGG + Chr3:27757333-27757352 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
! AATCTCCTTGGAAGTGCAAG+GGG - Chr3:27759226-27759245 None:intergenic 45.0%
! AGTTTGGGTTCGTGTGTTAG+AGG + Chr3:27756936-27756955 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
! GAAATCTCCTTGGAAGTGCA+AGG - Chr3:27759228-27759247 None:intergenic 45.0%
!! GTTTCCTACCCATTGGTTCT+AGG + Chr3:27757892-27757911 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
!!! CCGACTGTTTTAGCAGCTAT+TGG - Chr3:27757363-27757382 None:intergenic 45.0%
!!! GTTTTAGGTGATGGAGGTGT+TGG + Chr3:27756850-27756869 MsG0380012961.01.T03:CDS 45.0%
AAGGGGGACTGAACTACTTC+CGG - Chr3:27759209-27759228 None:intergenic 50.0%
ACACGCCTCACTCACATCAA+TGG - Chr3:27758372-27758391 None:intergenic 50.0%
CCAGAGTTCTATGGCATGAC+AGG + Chr3:27758701-27758720 MsG0380012961.01.T03:CDS 50.0%
CCTGTCATGCCATAGAACTC+TGG - Chr3:27758704-27758723 None:intergenic 50.0%
GAGTTCTATGGCATGACAGG+GGG + Chr3:27758704-27758723 MsG0380012961.01.T03:CDS 50.0%
GGATTGTGACTGCAACGAAG+TGG - Chr3:27759188-27759207 None:intergenic 50.0%
GGGAAGTTTCCTAACCTACG+GGG + Chr3:27758317-27758336 MsG0380012961.01.T03:CDS 50.0%
GTTGCAACCTGCAGATGACA+TGG - Chr3:27759046-27759065 None:intergenic 50.0%
TCCCCTGAATTGTCGTTGCT+TGG + Chr3:27759010-27759029 MsG0380012961.01.T03:CDS 50.0%
TGTTGCAGGATTGGATCTGG+TGG + Chr3:27757771-27757790 MsG0380012961.01.T03:CDS 50.0%
! ATCTCCTTGGAAGTGCAAGG+GGG - Chr3:27759225-27759244 None:intergenic 50.0%
! CAGAGTTTTCCCCGTAGGTT+AGG - Chr3:27758329-27758348 None:intergenic 50.0%
! TGATGCAGAGTTTTCCCCGT+AGG - Chr3:27758334-27758353 None:intergenic 50.0%
!! AGGAAACTTGCTGCCTCTGA+AGG - Chr3:27758813-27758832 None:intergenic 50.0%
!! TCCTACCCATTGGTTCTAGG+TGG + Chr3:27757895-27757914 MsG0380012961.01.T03:CDS 50.0%
!!! CGGAGGGCTTTTGAGTTCAA+AGG + Chr3:27757380-27757399 MsG0380012961.01.T03:CDS 50.0%
CTGTTCGGCATCGCGAAGAA+TGG - Chr3:27756470-27756489 None:intergenic 55.0%
GCCACCTAGAACCAATGGGT+AGG - Chr3:27757899-27757918 None:intergenic 55.0%
! TGGTGGGCAAGCACGAAGTT+GGG + Chr3:27758276-27758295 MsG0380012961.01.T03:CDS 55.0%
CAGTCCCCCTTGCACTTCCA+AGG + Chr3:27759218-27759237 MsG0380012961.01.T03:CDS 60.0%
! CTGGTGGGCAAGCACGAAGT+TGG + Chr3:27758275-27758294 MsG0380012961.01.T03:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 27756307 27759252 27756307 ID=MsG0380012961.01;Name=MsG0380012961.01
Chr3 mRNA 27756652 27759252 27756652 ID=MsG0380012961.01.T01;Parent=MsG0380012961.01;Name=MsG0380012961.01.T01;_AED=0.10;_eAED=0.10;_QI=0|0|0|1|0|0|2|0|848
Chr3 exon 27759101 27759252 27759101 ID=MsG0380012961.01.T01:exon:7338;Parent=MsG0380012961.01.T01
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Chr3 mRNA 27756307 27759252 27756307 ID=MsG0380012961.01.T02;Parent=MsG0380012961.01;Name=MsG0380012961.01.T02;_AED=0.04;_eAED=0.04;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|981
Chr3 exon 27756307 27759252 27756307 ID=MsG0380012961.01.T02:exon:7339;Parent=MsG0380012961.01.T02
Chr3 CDS 27756307 27759252 27756307 ID=MsG0380012961.01.T02:cds;Parent=MsG0380012961.01.T02
Chr3 mRNA 27756652 27759252 27756652 ID=MsG0380012961.01.T03;Parent=MsG0380012961.01;Name=MsG0380012961.01.T03;_AED=0.09;_eAED=0.09;_QI=0|-1|0|1|-1|0|1|0|866
Chr3 exon 27756652 27759252 27756652 ID=MsG0380012961.01.T03:exon:7340;Parent=MsG0380012961.01.T03
Chr3 CDS 27756652 27759252 27756652 ID=MsG0380012961.01.T03:cds;Parent=MsG0380012961.01.T03
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