AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380013759.01

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MsG0380013759.01.T01 AT3G53240 32.407 216 107 6 489 695 78 263 1.06e-15 82.0
MsG0380013759.01.T01 AT3G53240 28.976 742 428 19 79 763 215 914 4.47e-59 216
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MsG0380013759.01.T01 AT1G74170 29.452 730 434 19 80 763 328 1022 1.66e-58 216
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MsG0380013759.01.T01 AT1G74170 29.345 702 362 20 187 763 262 954 4.89e-57 211
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MsG0380013759.01.T01 AT5G27060 27.650 868 434 26 34 718 38 894 3.02e-56 209
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MsG0380013759.01.T01 AT1G55610 27.491 833 501 29 10 765 7 813 4.05e-54 203
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MsG0380013759.01.T01 AT5G49290 28.552 718 381 27 29 664 8 675 3.04e-42 166
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MsG0380013759.01.T01 AT5G49290 31.441 458 240 14 255 664 1 432 4.72e-33 136
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MsG0380013759.01.T01 AT1G74180 26.509 762 420 24 34 694 27 749 9.34e-40 158
MsG0380013759.01.T01 AT2G32660 28.763 744 421 26 30 714 19 712 6.46e-52 194
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MsG0380013759.01.T01 AT1G58190 32.265 499 302 15 198 680 5 483 1.36e-37 151
MsG0380013759.01.T01 AT5G40170 26.641 777 436 21 48 749 61 778 9.36e-52 194
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MsG0380013759.01.T01 AT1G17230 26.642 822 489 23 4 763 1 770 1.49e-51 194
MsG0380013759.01.T01 AT1G17230 26.642 822 489 23 4 763 1 770 1.70e-51 195
MsG0380013759.01.T01 AT1G58190 27.891 735 441 20 80 763 235 931 1.97e-51 194
MsG0380013759.01.T01 AT1G58190 29.690 677 399 22 29 680 32 656 1.64e-41 164
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MsG0380013759.01.T01 AT1G58190 27.891 735 441 20 80 763 324 1020 2.12e-51 194
MsG0380013759.01.T01 AT1G58190 29.268 738 415 24 32 680 26 745 2.10e-45 176
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MsG0380013759.01.T01 AT4G13810 25.865 549 304 17 69 554 28 536 8.97e-23 103
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MsG0380013759.01.T01 AT1G58190 28.373 719 459 22 80 763 226 923 1.26e-50 192
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MsG0380013759.01.T01 AT1G17750 31.023 303 165 6 447 705 105 407 7.34e-23 105
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MsG0380013759.01.T01 AT2G25470 29.024 379 173 13 377 680 214 571 1.33e-14 78.6
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MsG0380013759.01.T01 AT1G28440 29.565 690 386 18 37 717 18 616 1.86e-48 185
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MsG0380013759.01.T01 AT5G07280 29.434 530 252 11 207 717 401 827 2.86e-43 170
MsG0380013759.01.T01 AT5G07280 27.763 371 175 11 382 680 21 370 1.51e-18 91.7
MsG0380013759.01.T01 AT5G07280 33.136 169 109 2 155 320 621 788 1.55e-15 81.6
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MsG0380013759.01.T01 AT2G15080 28.611 727 395 24 79 718 233 922 4.48e-48 184
MsG0380013759.01.T01 AT2G15080 27.474 677 392 23 58 681 63 693 1.89e-38 154
MsG0380013759.01.T01 AT4G28650 26.813 731 429 16 35 754 27 662 5.08e-48 184
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MsG0380013759.01.T01 AT3G49670 25.158 632 369 17 41 634 30 595 2.64e-31 132
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MsG0380013759.01.T01 AT1G74360 27.664 535 285 17 258 772 89 541 5.62e-30 128
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MsG0380013759.01.T01 AT3G47580 28.617 622 335 17 205 755 88 671 1.32e-44 174
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MsG0380013759.01.T01 AT5G48940 30.056 539 304 14 179 680 102 604 2.40e-44 173
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MsG0380013759.01.T01 AT5G65700 26.677 671 387 12 50 707 41 619 2.73e-44 172
MsG0380013759.01.T01 AT2G24130 29.102 512 311 8 237 701 71 577 3.73e-44 172
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MsG0380013759.01.T01 AT4G20270 28.811 597 358 14 148 711 72 634 4.42e-44 172
MsG0380013759.01.T01 AT2G24130 29.102 512 311 8 237 701 86 592 4.82e-44 172
MsG0380013759.01.T01 AT2G24130 28.291 509 266 19 64 480 67 568 1.62e-20 97.8
MsG0380013759.01.T01 AT5G63930 27.838 740 410 20 38 707 30 715 6.01e-44 172
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MsG0380013759.01.T01 AT5G49290 33.772 228 125 9 465 677 105 321 1.25e-18 91.3
MsG0380013759.01.T01 AT1G73066 30.471 594 372 19 32 608 24 593 1.94e-42 164
MsG0380013759.01.T01 AT1G73066 28.516 512 345 8 179 680 93 593 5.27e-40 156
MsG0380013759.01.T01 AT1G73066 27.545 501 309 14 231 680 72 569 4.16e-38 151
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MsG0380013759.01.T01 AT1G73066 31.900 279 166 6 426 681 102 379 3.55e-25 111
MsG0380013759.01.T01 AT1G73066 26.304 441 251 10 281 707 74 454 7.54e-22 101
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MsG0380013759.01.T01 AT5G63930 29.143 525 298 13 183 692 9 474 8.57e-37 149
MsG0380013759.01.T01 AT5G63930 28.750 480 295 14 237 680 14 482 5.21e-36 147
MsG0380013759.01.T01 AT2G25440 28.918 536 337 14 229 741 132 646 2.30e-42 164
MsG0380013759.01.T01 AT2G25440 22.222 468 271 16 79 528 203 595 2.63e-11 67.8
MsG0380013759.01.T01 AT1G34110 30.492 528 277 10 206 700 211 681 2.34e-42 167
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MsG0380013759.01.T01 AT1G34110 29.630 486 252 10 242 681 101 542 8.23e-33 137
MsG0380013759.01.T01 AT1G34110 30.905 398 238 10 179 566 280 650 3.26e-24 109
MsG0380013759.01.T01 AT1G34110 30.492 528 277 10 206 700 211 681 3.13e-42 166
MsG0380013759.01.T01 AT1G34110 31.356 472 276 12 246 680 129 589 8.32e-35 143
MsG0380013759.01.T01 AT1G34110 29.630 486 252 10 242 681 101 542 1.19e-32 136
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MsG0380013759.01.T01 AT5G56040 29.764 467 234 13 179 635 285 667 3.34e-31 132
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MsG0380013759.01.T01 AT1G66830 29.545 264 133 9 258 515 68 284 4.27e-12 70.1
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MsG0380013759.01.T01 AT2G26380 30.504 377 211 18 366 707 118 478 1.29e-25 111
MsG0380013759.01.T01 AT2G26380 26.253 499 266 16 26 484 20 456 1.56e-22 102
MsG0380013759.01.T01 AT2G26380 32.738 168 101 3 516 680 108 266 3.90e-14 76.3
MsG0380013759.01.T01 AT2G26380 25.505 396 188 14 234 612 154 459 5.46e-11 66.2
MsG0380013759.01.T01 AT3G56100 28.344 314 197 7 447 753 106 398 2.12e-25 111
MsG0380013759.01.T01 AT3G56100 25.072 347 191 9 9 330 29 331 1.61e-12 71.2
MsG0380013759.01.T01 AT3G02130 25.031 803 441 27 26 720 34 783 3.26e-25 112
MsG0380013759.01.T01 AT3G02130 25.031 803 441 27 26 720 17 766 3.31e-25 112
MsG0380013759.01.T01 AT1G33590 31.269 323 182 12 412 707 166 475 9.39e-25 108
MsG0380013759.01.T01 AT1G33590 26.931 479 287 19 26 484 18 453 1.06e-21 99.8
MsG0380013759.01.T01 AT1G33590 30.736 231 124 4 455 681 115 313 7.66e-20 94.0
MsG0380013759.01.T01 AT1G33590 31.269 323 182 12 412 707 201 510 1.11e-24 109
MsG0380013759.01.T01 AT1G33590 26.931 479 287 20 26 484 53 488 2.46e-21 99.0
MsG0380013759.01.T01 AT1G33590 30.736 231 124 4 455 681 150 348 8.39e-20 94.4
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MsG0380013759.01.T01 AT3G14840 26.493 268 157 7 431 692 144 377 1.48e-11 68.9
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MsG0380013759.01.T01 AT4G34220 37.288 177 99 7 442 616 103 269 5.90e-14 76.3
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MsG0380013759.01.T01 AT1G31420 33.929 112 73 1 209 320 76 186 5.92e-11 66.2
MsG0380013759.01.T01 AT1G31420 30.000 170 105 3 594 753 101 266 8.79e-13 72.4
MsG0380013759.01.T01 AT1G31420 33.929 112 73 1 209 320 76 186 6.12e-11 66.2
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MsG0380013759.01.T01 AT4G23740 30.667 150 102 1 207 356 68 215 9.81e-11 65.9
MsG0380013759.01.T01 AT5G21090 35.000 180 109 6 531 705 9 185 1.39e-12 68.2
MsG0380013759.01.T01 AT5G21090 37.500 112 69 1 209 320 72 182 2.62e-12 67.4
MsG0380013759.01.T01 AT3G17840 29.327 208 104 6 594 763 98 300 1.66e-12 71.6
MsG0380013759.01.T01 AT3G02880 32.370 173 90 4 594 740 93 264 1.77e-12 71.2
MsG0380013759.01.T01 AT3G28450 31.548 168 93 4 584 750 99 245 3.55e-12 70.5
MsG0380013759.01.T01 AT1G48480 26.220 328 134 10 459 763 61 303 3.79e-12 70.5
MsG0380013759.01.T01 AT4G18760 27.344 256 141 8 532 754 186 429 4.69e-12 69.3
MsG0380013759.01.T01 AT1G10850 33.077 130 64 2 594 701 98 226 4.71e-12 70.1
MsG0380013759.01.T01 AT3G25560 37.037 108 63 3 594 700 108 211 5.51e-12 69.7
MsG0380013759.01.T01 AT3G43740 40.594 101 56 1 224 320 58 158 5.96e-12 66.2
MsG0380013759.01.T01 AT3G43740 37.500 112 69 1 209 320 72 182 1.92e-11 65.1
MsG0380013759.01.T01 AT3G43740 35.338 133 73 4 570 701 60 180 2.82e-11 64.3
MsG0380013759.01.T01 AT3G42880 28.235 170 118 2 594 762 117 283 7.81e-12 69.3
MsG0380013759.01.T01 AT3G42880 30.151 199 124 6 120 306 18 213 4.81e-11 66.6
MsG0380013759.01.T01 AT5G24100 30.952 126 87 0 207 332 72 197 8.98e-12 68.9
MsG0380013759.01.T01 AT5G24100 39.175 97 57 1 459 553 90 186 4.66e-11 66.6
MsG0380013759.01.T01 AT5G65240 35.664 143 87 1 189 326 40 182 1.17e-11 68.6
MsG0380013759.01.T01 AT5G65240 38.983 118 72 0 209 326 65 182 1.23e-11 68.6
MsG0380013759.01.T01 AT5G58150 28.509 228 141 4 476 681 123 350 1.35e-11 68.6
MsG0380013759.01.T01 AT1G68400 33.113 151 76 3 594 722 94 241 1.39e-11 68.6
MsG0380013759.01.T01 AT5G67200 28.972 214 100 7 594 756 100 312 1.53e-11 68.6
MsG0380013759.01.T01 AT5G45780 32.584 178 96 5 595 750 83 258 1.59e-11 68.2
MsG0380013759.01.T01 AT5G45780 32.584 178 96 5 595 750 40 215 2.03e-11 67.8
MsG0380013759.01.T01 AT1G60630 33.333 135 67 3 594 706 89 222 2.10e-11 67.8
MsG0380013759.01.T01 AT5G63710 33.884 121 77 2 595 714 61 179 2.13e-11 67.8
MsG0380013759.01.T01 AT5G63710 39.640 111 58 2 208 318 58 159 6.73e-11 66.2
MsG0380013759.01.T01 AT5G63710 33.884 121 77 2 595 714 61 179 2.13e-11 67.8
MsG0380013759.01.T01 AT5G63710 39.640 111 58 2 208 318 58 159 6.73e-11 66.2
MsG0380013759.01.T01 AT3G03770 29.167 264 167 5 456 710 119 371 2.26e-11 68.2
MsG0380013759.01.T01 AT3G03770 29.167 264 167 5 456 710 119 371 2.26e-11 68.2
MsG0380013759.01.T01 AT3G03770 29.167 264 167 5 456 710 119 371 2.26e-11 68.2
MsG0380013759.01.T01 AT5G05160 30.303 198 100 5 594 756 101 295 2.29e-11 67.8
MsG0380013759.01.T01 AT5G63710 33.884 121 77 2 595 714 96 214 2.42e-11 67.8
MsG0380013759.01.T01 AT5G63710 39.640 111 58 2 208 318 93 194 7.76e-11 66.2
MsG0380013759.01.T01 AT4G18640 38.843 121 71 2 589 707 68 187 2.54e-11 67.8
MsG0380013759.01.T01 AT5G63710 33.884 121 77 2 595 714 97 215 2.69e-11 67.4
MsG0380013759.01.T01 AT5G63710 39.640 111 58 2 208 318 94 195 7.70e-11 66.2
MsG0380013759.01.T01 AT2G36570 37.069 116 70 3 594 708 114 227 3.62e-11 67.4
MsG0380013759.01.T01 AT4G16162 35.172 145 74 6 240 375 35 168 4.37e-11 62.8
MsG0380013759.01.T01 AT4G16162 35.172 145 74 6 240 375 35 168 4.37e-11 62.8
MsG0380013759.01.T01 AT1G60800 30.968 155 78 4 595 724 78 228 4.57e-11 67.0
MsG0380013759.01.T01 AT1G60800 30.968 155 78 4 595 724 11 161 4.74e-11 66.6
MsG0380013759.01.T01 AT2G13790 35.461 141 72 5 570 706 65 190 4.95e-11 66.6
MsG0380013759.01.T01 AT5G43020 31.944 144 71 3 594 715 103 241 5.09e-11 66.6
MsG0380013759.01.T01 AT1G27190 40.171 117 67 2 594 709 99 213 7.00e-11 66.2
MsG0380013759.01.T01 AT2G13800 40.000 120 67 2 218 332 52 171 7.31e-11 66.2
MsG0380013759.01.T01 AT2G13800 40.000 120 67 2 218 332 52 171 7.31e-11 66.2
MsG0380013759.01.T01 AT4G31250 33.333 135 69 2 594 707 102 236 7.42e-11 66.2
MsG0380013759.01.T01 AT5G48380 34.783 115 74 1 596 709 105 219 7.75e-11 66.2
MsG0380013759.01.T01 AT5G20690 30.464 151 100 2 160 306 69 218 8.89e-11 65.9
MsG0380013759.01.T01 AT1G34210 36.585 123 76 2 205 326 70 191 9.95e-11 65.9
MsG0380013759.01.T01 AT1G34210 36.585 123 76 2 205 326 70 191 9.95e-11 65.9

Find 145 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 174 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTTGCACATAACAAACTTTC+TGG 0.196090 3:+45265568 MsG0380013759.01.T01:CDS
CTGGAACTGATCCTTGTATT+TGG 0.205406 3:-45264739 None:intergenic
GATTTGTATTTCTCAATAAA+AGG 0.228553 3:-45265012 None:intergenic
GTGGTTCTATGTTTCTTATT+AGG 0.239521 3:+45266175 MsG0380013759.01.T01:CDS
AGAGGAACTCCGCATAATTT+AGG 0.245785 3:-45266030 None:intergenic
AGAGATCAAGGTGTTGAATA+TGG 0.263382 3:-45264781 None:intergenic
TATATCCAAGATGGAAAGTT+TGG 0.279994 3:-45265040 None:intergenic
GCCAATGGATAAGGAAATTA+AGG 0.286514 3:-45264855 None:intergenic
CTATCTCTATGTTACTTTGA+TGG 0.292372 3:+45266230 MsG0380013759.01.T01:CDS
ACATATCACCAATGGCTTCT+TGG 0.295232 3:+45265257 MsG0380013759.01.T01:CDS
GAACCCAATCCAAATCAAAT+TGG 0.310778 3:-45264970 None:intergenic
CATATCACCAATGGCTTCTT+GGG 0.322224 3:+45265258 MsG0380013759.01.T01:CDS
TTTGGTTATAAGAGAGATAA+AGG 0.322650 3:-45264721 None:intergenic
TGAATCTAAAGTAGAGAGTT+TGG 0.331703 3:-45264918 None:intergenic
CAACAGATGGGAAGTTGTTC+AGG 0.334977 3:-45264523 None:intergenic
TATTCCAATTTGATTTGGAT+TGG 0.336058 3:+45264966 MsG0380013759.01.T01:CDS
TCATGAATCTGTGGAGTAAT+AGG 0.338172 3:+45265350 MsG0380013759.01.T01:CDS
GAAGCCATTGGTGATATGTT+TGG 0.338643 3:-45265253 None:intergenic
CAGGGCATCAATGATAGTTT+TGG 0.345728 3:+45264080 MsG0380013759.01.T01:CDS
GGATCAGTTCCAGTAGAAAT+AGG 0.354255 3:+45264749 MsG0380013759.01.T01:CDS
CTGTGGAGTAATAGGTTGTC+TGG 0.356064 3:+45265358 MsG0380013759.01.T01:CDS
ATCATTGATGCCCTGTTTGA+AGG 0.365060 3:-45264072 None:intergenic
TAAATTCAAATATCTCAAAA+AGG 0.371249 3:-45265929 None:intergenic
CTATTCATGAATATCCTTCC+TGG 0.372484 3:+45265632 MsG0380013759.01.T01:CDS
ATCTCACCTATCTTGACCTT+CGG 0.372981 3:+45264639 MsG0380013759.01.T01:CDS
AAGTGCCATTGGAATTGTTT+CGG 0.375915 3:+45265758 MsG0380013759.01.T01:CDS
ATTCCAATTTGATTTGGATT+GGG 0.376326 3:+45264967 MsG0380013759.01.T01:CDS
AAGCCATTGGTGATATGTTT+GGG 0.376599 3:-45265252 None:intergenic
GACACTATTAACCTTCAAAC+AGG 0.378834 3:+45264061 MsG0380013759.01.T01:CDS
CTTTCAGCCAATAGCTTGTC+TGG 0.380266 3:+45265733 MsG0380013759.01.T01:CDS
TCTCACCTATCTTGACCTTC+GGG 0.381298 3:+45264640 MsG0380013759.01.T01:CDS
AAAAGGTAAGAGAGTTGAAA+AGG 0.388851 3:-45264995 None:intergenic
TTGTCTTACAACTCCTTCTC+AGG 0.391480 3:+45265286 MsG0380013759.01.T01:CDS
CAGGATCAATTCCACATAGT+TGG 0.392506 3:+45265305 MsG0380013759.01.T01:CDS
TTCACCTCTCATTTACCAAA+TGG 0.394132 3:+45264596 MsG0380013759.01.T01:CDS
CTATGTTTCTTATTAGGAAA+TGG 0.394599 3:+45266181 MsG0380013759.01.T01:CDS
ACTTGAGTTTCTCAGTTACT+TGG 0.399041 3:+45264241 MsG0380013759.01.T01:CDS
TTTGAAGTTGCGTTCCGATC+GGG 0.401989 3:-45265978 None:intergenic
AAGGCCCAAACTTTCCATCT+TGG 0.406398 3:+45265035 MsG0380013759.01.T01:CDS
CACTTTGCCAGACAAGCTAT+TGG 0.413456 3:-45265740 None:intergenic
CAATAGTTCGCCTTTCTCCT+TGG 0.414409 3:-45265708 None:intergenic
ATTATTAGCGCCAATGGATA+AGG 0.417145 3:-45264864 None:intergenic
TCCTTAATTTCCTTATCCAT+TGG 0.420376 3:+45264854 MsG0380013759.01.T01:CDS
ACGCGGAACAATTTAGTGTA+AGG 0.421947 3:-45265195 None:intergenic
ATTCACTATTTGAAGCCAAT+TGG 0.422316 3:-45264459 None:intergenic
AATGGAGGCATGCGTACTTT+CGG 0.430186 3:+45266199 MsG0380013759.01.T01:CDS
ATAAGAGAGTCGTTGTATCT+AGG 0.435773 3:+45266114 MsG0380013759.01.T01:CDS
ACAGTTGAGTTGTTTACAAA+AGG 0.438860 3:+45265664 MsG0380013759.01.T01:CDS
TTCATGCCTCCAATCGTCTT+CGG 0.439836 3:-45265835 None:intergenic
CACTGTGTGATTGCTGCAAA+TGG 0.443409 3:-45264012 None:intergenic
TTATTGAGAAATACAAATCA+AGG 0.447115 3:+45265016 MsG0380013759.01.T01:CDS
TCACCTCTCATTTACCAAAT+GGG 0.449389 3:+45264597 MsG0380013759.01.T01:CDS
CAATTGCAGATCTTGAACTT+AGG 0.454070 3:+45265412 MsG0380013759.01.T01:CDS
GCAAGTTGGCCTATTTCTAC+TGG 0.457076 3:-45264758 None:intergenic
AACCAAGATTATCCATGTGC+AGG 0.457296 3:-45264373 None:intergenic
CAGTGGAATTGAACTTCATA+AGG 0.458839 3:+45264433 MsG0380013759.01.T01:CDS
AACTTCATAAGGAAACCAAT+TGG 0.465600 3:+45264444 MsG0380013759.01.T01:CDS
ACTGAGGTTGAGATATTTCA+AGG 0.467814 3:-45264414 None:intergenic
CTTTGAAGTTGCGTTCCGAT+CGG 0.469329 3:-45265979 None:intergenic
GTCAAGATAGGTGAGATCTT+TGG 0.470137 3:-45264633 None:intergenic
GAGAGGTTTCCTAGAGTTGA+AGG 0.470533 3:-45264830 None:intergenic
TTTGACAAAATAAGTACATC+GGG 0.471518 3:-45265145 None:intergenic
ACCCTGCACATGGATAATCT+TGG 0.471692 3:+45264371 MsG0380013759.01.T01:CDS
TTGGATCATAATAATTTCAC+AGG 0.473448 3:+45265223 MsG0380013759.01.T01:CDS
CTGAGAGATAATAAATTTGA+AGG 0.473677 3:+45265496 MsG0380013759.01.T01:CDS
GGATCTATTCCTTCAACTCT+AGG 0.478153 3:+45264821 MsG0380013759.01.T01:CDS
TTCAAGTTCTTCCAACTATG+TGG 0.478919 3:-45265316 None:intergenic
CTTGTCTGGCAAAGTGCCAT+TGG 0.480244 3:+45265747 MsG0380013759.01.T01:CDS
ATATCCAAGATGGAAAGTTT+GGG 0.489624 3:-45265039 None:intergenic
ATTGGCGCTAATAATTTCTC+TGG 0.492054 3:+45264872 MsG0380013759.01.T01:CDS
AAGGAATAGATCCTTGTAGT+TGG 0.492058 3:-45264811 None:intergenic
GCTTCCCCGAAGGTCAAGAT+AGG 0.494234 3:-45264645 None:intergenic
TGAAGGTTTAGCAAGCTTGA+AGG 0.498997 3:-45264686 None:intergenic
GAGATCAAGGTGTTGAATAT+GGG 0.499174 3:-45264780 None:intergenic
ATGTGTGATGTTGTGTTGAA+TGG 0.504176 3:-45264303 None:intergenic
CTCCACAGATTCATGACTCT+CGG 0.505334 3:-45265343 None:intergenic
CTCTCTTATAACCAAATACA+AGG 0.507674 3:+45264728 MsG0380013759.01.T01:CDS
TAAACAACTCAACTGTGGTA+TGG 0.511776 3:-45265657 None:intergenic
TATCTAGACTTATCGAGCTC+GGG 0.511904 3:+45265082 MsG0380013759.01.T01:CDS
TGATATTTGTGAAGTAAGAA+TGG 0.512591 3:-45263946 None:intergenic
TCCGTGGTACAATTATTAAG+AGG 0.516507 3:-45266048 None:intergenic
TTCTGTGTATATATCCAAGA+TGG 0.519216 3:-45265049 None:intergenic
TTTAATGCATCGAGCTACAT+TGG 0.520337 3:+45266003 MsG0380013759.01.T01:CDS
ATATCTAGACTTATCGAGCT+CGG 0.523226 3:+45265081 MsG0380013759.01.T01:CDS
TTGTATCTAGGCATGGGAGT+TGG 0.524139 3:+45266126 MsG0380013759.01.T01:CDS
AACTGTAATTCTAACAATGA+AGG 0.525097 3:-45264488 None:intergenic
AGAGAAATTATTAGCGCCAA+TGG 0.525877 3:-45264870 None:intergenic
TGTGGAGTAATAGGTTGTCT+GGG 0.528061 3:+45265359 MsG0380013759.01.T01:CDS
CTCTCTGAAAACCAACTACA+AGG 0.528193 3:+45264800 MsG0380013759.01.T01:CDS
TAAGAGAGATTAAAGAGTTG+TGG 0.528678 3:-45265529 None:intergenic
ATGGGAGTTGGATTTGCAGT+AGG 0.533730 3:+45266138 MsG0380013759.01.T01:CDS
CAGACAAGCTATTGGCTGAA+AGG 0.534722 3:-45265732 None:intergenic
AGATATTTCAAGGAAGAATG+TGG 0.539918 3:-45264404 None:intergenic
AAAGATTGTTGTGTTTGGGA+AGG 0.540944 3:+45264128 MsG0380013759.01.T01:CDS
CAGAAAGTTTGTTATGTGCA+AGG 0.543133 3:-45265567 None:intergenic
AGGTAAGAGAGTTGAAAAGG+AGG 0.543361 3:-45264992 None:intergenic
GTTTGACAAAATAAGTACAT+CGG 0.550091 3:-45265146 None:intergenic
CTCAACTGTGGTATGGAACC+AGG 0.553635 3:-45265650 None:intergenic
AAATTCAAATACTCAACAGA+TGG 0.559127 3:-45264536 None:intergenic
GAGAGATTAAAGAGTTGTGG+TGG 0.559579 3:-45265526 None:intergenic
CTTCGAGAATCCAAGGAGAA+AGG 0.559875 3:+45265698 MsG0380013759.01.T01:CDS
GGTGTTGAATATGGGCAAGT+TGG 0.560288 3:-45264772 None:intergenic
GTCAAGTTGTAGACACACTT+TGG 0.567150 3:-45265598 None:intergenic
TGTGCAGGGTATAACTGTTG+AGG 0.568363 3:-45264358 None:intergenic
TGCACATGGATAATCTTGGT+TGG 0.571989 3:+45264375 MsG0380013759.01.T01:CDS
GTGCAGGGTATAACTGTTGA+GGG 0.573076 3:-45264357 None:intergenic
GGAACAATACCGAAGACGAT+TGG 0.575595 3:+45265826 MsG0380013759.01.T01:CDS
AGAGTCGTTGTATCTAGGCA+TGG 0.577465 3:+45266119 MsG0380013759.01.T01:CDS
GTGATGTTGTGTTGAATGGA+TGG 0.578419 3:-45264299 None:intergenic
GAGTCGTTGTATCTAGGCAT+GGG 0.581831 3:+45266120 MsG0380013759.01.T01:CDS
GATCATAATAATTTCACAGG+AGG 0.583404 3:+45265226 MsG0380013759.01.T01:CDS
ACCAAGATTATCCATGTGCA+GGG 0.583732 3:-45264372 None:intergenic
TGTTTGTAATATTGTCGCAA+AGG 0.584260 3:-45264154 None:intergenic
ACAATACCGAAGACGATTGG+AGG 0.584656 3:+45265829 MsG0380013759.01.T01:CDS
AAATCAACCCAAGAAGCCAT+TGG 0.592132 3:-45265265 None:intergenic
ATAAGGAAATTAAGGATGAG+AGG 0.592417 3:-45264847 None:intergenic
TGTTTCTTATTAGGAAATGG+AGG 0.594389 3:+45266184 MsG0380013759.01.T01:CDS
GAGTACACTTCGAGAATCCA+AGG 0.594848 3:+45265691 MsG0380013759.01.T01:CDS
CTTCGGGGAAGCAATATACA+TGG 0.596656 3:+45264656 MsG0380013759.01.T01:CDS
TTCAAGTTAGAGAAGTACAA+TGG 0.600675 3:-45265388 None:intergenic
ATGTGGAATTGATCCTGAGA+AGG 0.606373 3:-45265299 None:intergenic
TGAGAGATAATAAATTTGAA+GGG 0.608304 3:+45265497 MsG0380013759.01.T01:CDS
CATGTATATTGCTTCCCCGA+AGG 0.613523 3:-45264655 None:intergenic
AATTCAAATACTCAACAGAT+GGG 0.615335 3:-45264535 None:intergenic
CAACAGTTATACCCTGCACA+TGG 0.616149 3:+45264361 MsG0380013759.01.T01:CDS
AACCGAGAGTCATGAATCTG+TGG 0.625294 3:+45265341 MsG0380013759.01.T01:CDS
AAACCCATTTGGTAAATGAG+AGG 0.628216 3:-45264600 None:intergenic
TCCTCTTAATAATTGTACCA+CGG 0.628373 3:+45266047 MsG0380013759.01.T01:CDS
TTGAAATATCTCAACCTCAG+TGG 0.628514 3:+45264416 MsG0380013759.01.T01:CDS
GCAGGGTATAACTGTTGAGG+GGG 0.638958 3:-45264355 None:intergenic
ATTGGCAATCCTAAATTATG+CGG 0.649708 3:+45266021 MsG0380013759.01.T01:CDS
ACTCCCAAACATATCACCAA+TGG 0.654288 3:+45265249 MsG0380013759.01.T01:CDS
TGTCTACAACTTGACTGAGA+TGG 0.656884 3:+45265606 MsG0380013759.01.T01:CDS
ACTAGCCGAAACAATTCCAA+TGG 0.662226 3:-45265763 None:intergenic
TGCAGGGTATAACTGTTGAG+GGG 0.672913 3:-45264356 None:intergenic
CAGGGTATAACTGTTGAGGG+GGG 0.680388 3:-45264354 None:intergenic
GTGGAGTAATAGGTTGTCTG+GGG 0.681768 3:+45265360 MsG0380013759.01.T01:CDS
CTCACCTATCTTGACCTTCG+GGG 0.687922 3:+45264641 MsG0380013759.01.T01:CDS
ACTGTGGTATGGAACCAGGA+AGG 0.695480 3:-45265646 None:intergenic
TTTGACGGAAGAATCCCGAT+CGG 0.704007 3:+45265964 MsG0380013759.01.T01:CDS
GATGTCACAAAACTTACGAG+TGG 0.711669 3:+45265468 MsG0380013759.01.T01:CDS
ACACTATTAACCTTCAAACA+GGG 0.715547 3:+45264062 MsG0380013759.01.T01:CDS
TATGAAGTTCAATTCCACTG+AGG 0.716098 3:-45264430 None:intergenic
CATTTGCAGCAATCACACAG+TGG 0.748041 3:+45264013 MsG0380013759.01.T01:CDS
GTTAGGAGAGACATGCCCTG+AGG 0.761623 3:-45265907 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TTATCATATAATAATTTTGA+CGG + Chr3:45265949-45265968 MsG0380013759.01.T01:CDS 10.0%
!! TAAATTCAAATATCTCAAAA+AGG - Chr3:45265932-45265951 None:intergenic 15.0%
!! GATTTGTATTTCTCAATAAA+AGG - Chr3:45265015-45265034 None:intergenic 20.0%
!! TGAGAGATAATAAATTTGAA+GGG + Chr3:45265497-45265516 MsG0380013759.01.T01:CDS 20.0%
!! TTATTGAGAAATACAAATCA+AGG + Chr3:45265016-45265035 MsG0380013759.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTATCTCACAATAATTTTGT+TGG + Chr3:45265805-45265824 MsG0380013759.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTGTATTCCAATTTGATT+TGG + Chr3:45264961-45264980 MsG0380013759.01.T01:CDS 20.0%
! AAATTCAAATACTCAACAGA+TGG - Chr3:45264539-45264558 None:intergenic 25.0%
! AACTGTAATTCTAACAATGA+AGG - Chr3:45264491-45264510 None:intergenic 25.0%
! AATTCAAATACTCAACAGAT+GGG - Chr3:45264538-45264557 None:intergenic 25.0%
! AGAAAAAGATTGTTGTGTTT+GGG + Chr3:45264124-45264143 MsG0380013759.01.T01:CDS 25.0%
! ATTATGATCCAAAAATAACG+CGG - Chr3:45265215-45265234 None:intergenic 25.0%
! CTATGTTTCTTATTAGGAAA+TGG + Chr3:45266181-45266200 MsG0380013759.01.T01:CDS 25.0%
! CTGAGAGATAATAAATTTGA+AGG + Chr3:45265496-45265515 MsG0380013759.01.T01:CDS 25.0%
! GTTTGACAAAATAAGTACAT+CGG - Chr3:45265149-45265168 None:intergenic 25.0%
! TCAAATATCTCAAAAAGGTT+AGG - Chr3:45265927-45265946 None:intergenic 25.0%
! TGATATTTGTGAAGTAAGAA+TGG - Chr3:45263949-45263968 None:intergenic 25.0%
! TTGGATCATAATAATTTCAC+AGG + Chr3:45265223-45265242 MsG0380013759.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGACAAAATAAGTACATC+GGG - Chr3:45265148-45265167 None:intergenic 25.0%
! TTTGGTTATAAGAGAGATAA+AGG - Chr3:45264724-45264743 None:intergenic 25.0%
!! TCTCTACAACAATCATTTTA+CGG + Chr3:45264193-45264212 MsG0380013759.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTCCAATTTGATTTGGATT+GGG + Chr3:45264967-45264986 MsG0380013759.01.T01:CDS 25.0%
!!! CTCTCTAATAACAAGTTTTT+TGG + Chr3:45265877-45265896 MsG0380013759.01.T01:CDS 25.0%
!!! TATTCCAATTTGATTTGGAT+TGG + Chr3:45264966-45264985 MsG0380013759.01.T01:CDS 25.0%
AAAAGGTAAGAGAGTTGAAA+AGG - Chr3:45264998-45265017 None:intergenic 30.0%
AACTTCATAAGGAAACCAAT+TGG + Chr3:45264444-45264463 MsG0380013759.01.T01:CDS 30.0%
ACACTATTAACCTTCAAACA+GGG + Chr3:45264062-45264081 MsG0380013759.01.T01:CDS 30.0%
AGATATTTCAAGGAAGAATG+TGG - Chr3:45264407-45264426 None:intergenic 30.0%
ATAAGGAAATTAAGGATGAG+AGG - Chr3:45264850-45264869 None:intergenic 30.0%
ATATCCAAGATGGAAAGTTT+GGG - Chr3:45265042-45265061 None:intergenic 30.0%
ATTGGCAATCCTAAATTATG+CGG + Chr3:45266021-45266040 MsG0380013759.01.T01:CDS 30.0%
CAGAAAAAGATTGTTGTGTT+TGG + Chr3:45264123-45264142 MsG0380013759.01.T01:CDS 30.0%
CTCTCTTATAACCAAATACA+AGG + Chr3:45264728-45264747 MsG0380013759.01.T01:CDS 30.0%
GATCATAATAATTTCACAGG+AGG + Chr3:45265226-45265245 MsG0380013759.01.T01:CDS 30.0%
GTGAGATTAAAAAACCCATT+TGG - Chr3:45264614-45264633 None:intergenic 30.0%
TAAGAGAGATTAAAGAGTTG+TGG - Chr3:45265532-45265551 None:intergenic 30.0%
TATATCCAAGATGGAAAGTT+TGG - Chr3:45265043-45265062 None:intergenic 30.0%
TCCTCTTAATAATTGTACCA+CGG + Chr3:45266047-45266066 MsG0380013759.01.T01:CDS 30.0%
TCCTTAATTTCCTTATCCAT+TGG + Chr3:45264854-45264873 MsG0380013759.01.T01:CDS 30.0%
TGTTTCTTATTAGGAAATGG+AGG + Chr3:45266184-45266203 MsG0380013759.01.T01:CDS 30.0%
TGTTTGTAATATTGTCGCAA+AGG - Chr3:45264157-45264176 None:intergenic 30.0%
TTCTGTGTATATATCCAAGA+TGG - Chr3:45265052-45265071 None:intergenic 30.0%
! AAAGGTCTGTCAAATTTTGA+AGG - Chr3:45264706-45264725 None:intergenic 30.0%
! ACAGTTGAGTTGTTTACAAA+AGG + Chr3:45265664-45265683 MsG0380013759.01.T01:CDS 30.0%
! ATTCACTATTTGAAGCCAAT+TGG - Chr3:45264462-45264481 None:intergenic 30.0%
! CTCTACAACAATCATTTTAC+GGG + Chr3:45264194-45264213 MsG0380013759.01.T01:CDS 30.0%
! GTGGTTCTATGTTTCTTATT+AGG + Chr3:45266175-45266194 MsG0380013759.01.T01:CDS 30.0%
! TCTTCATTCTCTGCATTTTT+AGG - Chr3:45266084-45266103 None:intergenic 30.0%
! TGAATCTAAAGTAGAGAGTT+TGG - Chr3:45264921-45264940 None:intergenic 30.0%
! TTCAAGTTAGAGAAGTACAA+TGG - Chr3:45265391-45265410 None:intergenic 30.0%
! TTTTGTAAACAACTCAACTG+TGG - Chr3:45265665-45265684 None:intergenic 30.0%
!! AAATTGTTCCGCGTTATTTT+TGG + Chr3:45265204-45265223 MsG0380013759.01.T01:CDS 30.0%
!! AAGTTTTGTGACATCTTGAT+TGG - Chr3:45265463-45265482 None:intergenic 30.0%
!! CTATCTCTATGTTACTTTGA+TGG + Chr3:45266230-45266249 MsG0380013759.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTTTGGTGAAATTCCTCA+GGG + Chr3:45265892-45265911 MsG0380013759.01.T01:CDS 30.0%
AAACCCATTTGGTAAATGAG+AGG - Chr3:45264603-45264622 None:intergenic 35.0%
AAAGATTGTTGTGTTTGGGA+AGG + Chr3:45264128-45264147 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
AAGGAATAGATCCTTGTAGT+TGG - Chr3:45264814-45264833 None:intergenic 35.0%
ACTGAGGTTGAGATATTTCA+AGG - Chr3:45264417-45264436 None:intergenic 35.0%
ACTTGAGTTTCTCAGTTACT+TGG + Chr3:45264241-45264260 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
AGAGAAATTATTAGCGCCAA+TGG - Chr3:45264873-45264892 None:intergenic 35.0%
ATAAGAGAGTCGTTGTATCT+AGG + Chr3:45266114-45266133 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
ATATCTAGACTTATCGAGCT+CGG + Chr3:45265081-45265100 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
ATGTGTGATGTTGTGTTGAA+TGG - Chr3:45264306-45264325 None:intergenic 35.0%
ATTATTAGCGCCAATGGATA+AGG - Chr3:45264867-45264886 None:intergenic 35.0%
ATTGGCGCTAATAATTTCTC+TGG + Chr3:45264872-45264891 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
CAATTGCAGATCTTGAACTT+AGG + Chr3:45265412-45265431 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
CAGTGGAATTGAACTTCATA+AGG + Chr3:45264433-45264452 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
CTATTCATGAATATCCTTCC+TGG + Chr3:45265632-45265651 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
CTTGCACATAACAAACTTTC+TGG + Chr3:45265568-45265587 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
GAACCCAATCCAAATCAAAT+TGG - Chr3:45264973-45264992 None:intergenic 35.0%
GACACTATTAACCTTCAAAC+AGG + Chr3:45264061-45264080 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
GCCAATGGATAAGGAAATTA+AGG - Chr3:45264858-45264877 None:intergenic 35.0%
TAAACAACTCAACTGTGGTA+TGG - Chr3:45265660-45265679 None:intergenic 35.0%
TATGAAGTTCAATTCCACTG+AGG - Chr3:45264433-45264452 None:intergenic 35.0%
TCACCTCTCATTTACCAAAT+GGG + Chr3:45264597-45264616 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
TCATGAATCTGTGGAGTAAT+AGG + Chr3:45265350-45265369 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
TCCGTGGTACAATTATTAAG+AGG - Chr3:45266051-45266070 None:intergenic 35.0%
TTCACCTCTCATTTACCAAA+TGG + Chr3:45264596-45264615 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
TTGAAATATCTCAACCTCAG+TGG + Chr3:45264416-45264435 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
TTTAATGCATCGAGCTACAT+TGG + Chr3:45266003-45266022 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
! AAGCCATTGGTGATATGTTT+GGG - Chr3:45265255-45265274 None:intergenic 35.0%
! AAGTGCCATTGGAATTGTTT+CGG + Chr3:45265758-45265777 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
! GATTGGAGGCATGAAAAATA+TGG + Chr3:45265843-45265862 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
! TGGATTTGCAGTAGGTTTTT+GGG + Chr3:45266146-45266165 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
! TTCAAGTTCTTCCAACTATG+TGG - Chr3:45265319-45265338 None:intergenic 35.0%
! TTGGATTTGCAGTAGGTTTT+TGG + Chr3:45266145-45266164 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
!! AGAGATCAAGGTGTTGAATA+TGG - Chr3:45264784-45264803 None:intergenic 35.0%
!! CAGAAAGTTTGTTATGTGCA+AGG - Chr3:45265570-45265589 None:intergenic 35.0%
!! GAGATCAAGGTGTTGAATAT+GGG - Chr3:45264783-45264802 None:intergenic 35.0%
!! GTTTTGGTCTGATATCAACA+TGG + Chr3:45264096-45264115 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTAGGATTTTCTTCTTCCG+TGG - Chr3:45266067-45266086 None:intergenic 35.0%
!!! GTTTTTTGGTGAAATTCCTC+AGG + Chr3:45265891-45265910 MsG0380013759.01.T01:CDS 35.0%
AAATCAACCCAAGAAGCCAT+TGG - Chr3:45265268-45265287 None:intergenic 40.0%
AACCAAGATTATCCATGTGC+AGG - Chr3:45264376-45264395 None:intergenic 40.0%
ACATATCACCAATGGCTTCT+TGG + Chr3:45265257-45265276 MsG0380013759.01.T01:CDS 40.0%
ACCAAGATTATCCATGTGCA+GGG - Chr3:45264375-45264394 None:intergenic 40.0%
ACGCGGAACAATTTAGTGTA+AGG - Chr3:45265198-45265217 None:intergenic 40.0%
ACTAGCCGAAACAATTCCAA+TGG - Chr3:45265766-45265785 None:intergenic 40.0%
ACTCCCAAACATATCACCAA+TGG + Chr3:45265249-45265268 MsG0380013759.01.T01:CDS 40.0%
AGAGGAACTCCGCATAATTT+AGG - Chr3:45266033-45266052 None:intergenic 40.0%
AGGTAAGAGAGTTGAAAAGG+AGG - Chr3:45264995-45265014 None:intergenic 40.0%
ATCATTGATGCCCTGTTTGA+AGG - Chr3:45264075-45264094 None:intergenic 40.0%
ATCTCACCTATCTTGACCTT+CGG + Chr3:45264639-45264658 MsG0380013759.01.T01:CDS 40.0%
ATGTGGAATTGATCCTGAGA+AGG - Chr3:45265302-45265321 None:intergenic 40.0%
CAGGATCAATTCCACATAGT+TGG + Chr3:45265305-45265324 MsG0380013759.01.T01:CDS 40.0%
CATATCACCAATGGCTTCTT+GGG + Chr3:45265258-45265277 MsG0380013759.01.T01:CDS 40.0%
CTGGAACTGATCCTTGTATT+TGG - Chr3:45264742-45264761 None:intergenic 40.0%
GAGAGATTAAAGAGTTGTGG+TGG - Chr3:45265529-45265548 None:intergenic 40.0%
GATGTCACAAAACTTACGAG+TGG + Chr3:45265468-45265487 MsG0380013759.01.T01:CDS 40.0%
GGATCAGTTCCAGTAGAAAT+AGG + Chr3:45264749-45264768 MsG0380013759.01.T01:CDS 40.0%
GGATCTATTCCTTCAACTCT+AGG + Chr3:45264821-45264840 MsG0380013759.01.T01:CDS 40.0%
GTCAAGATAGGTGAGATCTT+TGG - Chr3:45264636-45264655 None:intergenic 40.0%
GTGATGTTGTGTTGAATGGA+TGG - Chr3:45264302-45264321 None:intergenic 40.0%
TATCTAGACTTATCGAGCTC+GGG + Chr3:45265082-45265101 MsG0380013759.01.T01:CDS 40.0%
TGAAGGTTTAGCAAGCTTGA+AGG - Chr3:45264689-45264708 None:intergenic 40.0%
TGCACATGGATAATCTTGGT+TGG + Chr3:45264375-45264394 MsG0380013759.01.T01:CDS 40.0%
TGTCTACAACTTGACTGAGA+TGG + Chr3:45265606-45265625 MsG0380013759.01.T01:CDS 40.0%
TGTGGAGTAATAGGTTGTCT+GGG + Chr3:45265359-45265378 MsG0380013759.01.T01:CDS 40.0%
TTGTCTTACAACTCCTTCTC+AGG + Chr3:45265286-45265305 MsG0380013759.01.T01:CDS 40.0%
! CTCTCTGAAAACCAACTACA+AGG + Chr3:45264800-45264819 MsG0380013759.01.T01:CDS 40.0%
! GAAGCCATTGGTGATATGTT+TGG - Chr3:45265256-45265275 None:intergenic 40.0%
! GGATTTGCAGTAGGTTTTTG+GGG + Chr3:45266147-45266166 MsG0380013759.01.T01:CDS 40.0%
! GTCAAGTTGTAGACACACTT+TGG - Chr3:45265601-45265620 None:intergenic 40.0%
!! CAGGGCATCAATGATAGTTT+TGG + Chr3:45264080-45264099 MsG0380013759.01.T01:CDS 40.0%
!! GATTGCTGCAAATGGTTTTG+TGG - Chr3:45264007-45264026 None:intergenic 40.0%
!! GATTTGCAGTAGGTTTTTGG+GGG + Chr3:45266148-45266167 MsG0380013759.01.T01:CDS 40.0%
!!! GTTGGTTTTCAGAGAGATCA+AGG - Chr3:45264796-45264815 None:intergenic 40.0%
AACCGAGAGTCATGAATCTG+TGG + Chr3:45265341-45265360 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
AAGGCCCAAACTTTCCATCT+TGG + Chr3:45265035-45265054 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
ACAATACCGAAGACGATTGG+AGG + Chr3:45265829-45265848 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
ACCCTGCACATGGATAATCT+TGG + Chr3:45264371-45264390 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
AGAGTCGTTGTATCTAGGCA+TGG + Chr3:45266119-45266138 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
ATGGGAGTTGGATTTGCAGT+AGG + Chr3:45266138-45266157 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
CAACAGATGGGAAGTTGTTC+AGG - Chr3:45264526-45264545 None:intergenic 45.0%
CAACAGTTATACCCTGCACA+TGG + Chr3:45264361-45264380 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
CAATAGTTCGCCTTTCTCCT+TGG - Chr3:45265711-45265730 None:intergenic 45.0%
CACTGTGTGATTGCTGCAAA+TGG - Chr3:45264015-45264034 None:intergenic 45.0%
CACTTTGCCAGACAAGCTAT+TGG - Chr3:45265743-45265762 None:intergenic 45.0%
CATGTATATTGCTTCCCCGA+AGG - Chr3:45264658-45264677 None:intergenic 45.0%
CATTTGCAGCAATCACACAG+TGG + Chr3:45264013-45264032 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
CTCCACAGATTCATGACTCT+CGG - Chr3:45265346-45265365 None:intergenic 45.0%
CTGTGGAGTAATAGGTTGTC+TGG + Chr3:45265358-45265377 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
CTTCGAGAATCCAAGGAGAA+AGG + Chr3:45265698-45265717 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
CTTCGGGGAAGCAATATACA+TGG + Chr3:45264656-45264675 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
GAGAGGTTTCCTAGAGTTGA+AGG - Chr3:45264833-45264852 None:intergenic 45.0%
GAGTACACTTCGAGAATCCA+AGG + Chr3:45265691-45265710 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
GAGTCGTTGTATCTAGGCAT+GGG + Chr3:45266120-45266139 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
GGAACAATACCGAAGACGAT+TGG + Chr3:45265826-45265845 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
GTGCAGGGTATAACTGTTGA+GGG - Chr3:45264360-45264379 None:intergenic 45.0%
GTGGAGTAATAGGTTGTCTG+GGG + Chr3:45265360-45265379 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
TCTCACCTATCTTGACCTTC+GGG + Chr3:45264640-45264659 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
TGCAGGGTATAACTGTTGAG+GGG - Chr3:45264359-45264378 None:intergenic 45.0%
TGTGCAGGGTATAACTGTTG+AGG - Chr3:45264361-45264380 None:intergenic 45.0%
TTCATGCCTCCAATCGTCTT+CGG - Chr3:45265838-45265857 None:intergenic 45.0%
TTGTATCTAGGCATGGGAGT+TGG + Chr3:45266126-45266145 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
TTTGACGGAAGAATCCCGAT+CGG + Chr3:45265964-45265983 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
! AATGGAGGCATGCGTACTTT+CGG + Chr3:45266199-45266218 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
! CAGACAAGCTATTGGCTGAA+AGG - Chr3:45265735-45265754 None:intergenic 45.0%
! CTTTCAGCCAATAGCTTGTC+TGG + Chr3:45265733-45265752 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
! GGTGTTGAATATGGGCAAGT+TGG - Chr3:45264775-45264794 None:intergenic 45.0%
! TTTGAAGTTGCGTTCCGATC+GGG - Chr3:45265981-45266000 None:intergenic 45.0%
!! CTTTGAAGTTGCGTTCCGAT+CGG - Chr3:45265982-45266001 None:intergenic 45.0%
!! GCAAGTTGGCCTATTTCTAC+TGG - Chr3:45264761-45264780 None:intergenic 45.0%
!! GTAGGTTTTTGGGGGATTTG+TGG + Chr3:45266156-45266175 MsG0380013759.01.T01:CDS 45.0%
ACTGTGGTATGGAACCAGGA+AGG - Chr3:45265649-45265668 None:intergenic 50.0%
CAGGGTATAACTGTTGAGGG+GGG - Chr3:45264357-45264376 None:intergenic 50.0%
CTCAACTGTGGTATGGAACC+AGG - Chr3:45265653-45265672 None:intergenic 50.0%
CTCACCTATCTTGACCTTCG+GGG + Chr3:45264641-45264660 MsG0380013759.01.T01:CDS 50.0%
GCAGGGTATAACTGTTGAGG+GGG - Chr3:45264358-45264377 None:intergenic 50.0%
TGTTGAGGGGGGATAAGTCA+AGG - Chr3:45264346-45264365 None:intergenic 50.0%
! CTTGTCTGGCAAAGTGCCAT+TGG + Chr3:45265747-45265766 MsG0380013759.01.T01:CDS 50.0%
GCTTCCCCGAAGGTCAAGAT+AGG - Chr3:45264648-45264667 None:intergenic 55.0%
GTTAGGAGAGACATGCCCTG+AGG - Chr3:45265910-45265929 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 45263942 45266281 45263942 ID=MsG0380013759.01;Name=MsG0380013759.01
Chr3 mRNA 45263942 45266281 45263942 ID=MsG0380013759.01.T01;Parent=MsG0380013759.01;Name=MsG0380013759.01.T01;_AED=0.50;_eAED=0.50;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|779
Chr3 exon 45263942 45266281 45263942 ID=MsG0380013759.01.T01:exon:4689;Parent=MsG0380013759.01.T01
Chr3 CDS 45263942 45266281 45263942 ID=MsG0380013759.01.T01:cds;Parent=MsG0380013759.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380013759.01.T01

ATGACCATTCTTACTTCACAAATATCACTTCTTTTGCTTCTACTTTTATCTACAACAACATTCCACAAAACCATTTGCAGCAATCACACAGTGGTTCGATGCAATGAGAAAGATCGCGAGACACTATTAACCTTCAAACAGGGCATCAATGATAGTTTTGGTCTGATATCAACATGGTCAACAGAAAAAGATTGTTGTGTTTGGGAAGGAGTCCTTTGCGACAATATTACAAACAGAGTTACAGACGTTGATCTCTACAACAATCATTTTACGGGTGAGATGAATCTTTGTATTTTAGAACTTGAGTTTCTCAGTTACTTGGATTTGAGAGATAATGAATTTGATGTGATAAGAATTCCATCCATTCAACACAACATCACACATTCATCTAAACTTGTGTACCTTGACTTATCCCCCCTCAACAGTTATACCCTGCACATGGATAATCTTGGTTGGCTTTCTCCACATTCTTCCTTGAAATATCTCAACCTCAGTGGAATTGAACTTCATAAGGAAACCAATTGGCTTCAAATAGTGAATAAACTTCCTTCATTGTTAGAATTACAGTTGAGTGAATGTAACCTGAACAACTTCCCATCTGTTGAGTATTTGAATTTGTCTTCAATTGTAACTCTTGATCTTTCTTTAAACAACTTCACCTCTCATTTACCAAATGGGTTTTTTAATCTCACCAAAGATCTCACCTATCTTGACCTTCGGGGAAGCAATATACATGGTGAGATACCTTCAAGCTTGCTAAACCTTCAAAATTTGACAGACCTTTATCTCTCTTATAACCAAATACAAGGATCAGTTCCAGTAGAAATAGGCCAACTTGCCCATATTCAACACCTTGATCTCTCTGAAAACCAACTACAAGGATCTATTCCTTCAACTCTAGGAAACCTCTCATCCTTAATTTCCTTATCCATTGGCGCTAATAATTTCTCTGGTGAAATTTCAAATTTAACTTTTTCCAAACTCTCTACTTTAGATTCACTAGTCATGAGTAATTCAAGTTTTGTATTCCAATTTGATTTGGATTGGGTTCCTCCTTTTCAACTCTCTTACCTTTTATTGAGAAATACAAATCAAGGCCCAAACTTTCCATCTTGGATATATACACAGAAGTCACTGTCATATCTAGACTTATCGAGCTCGGGAATTTCATCTATAGAGTTCTCAAGACTTATAGAAAGAATACCCGATGTACTTATTTTGTCAAACAATTCGATTGCTGAAGACATATCTAACCTTACACTAAATTGTTCCGCGTTATTTTTGGATCATAATAATTTCACAGGAGGACTCCCAAACATATCACCAATGGCTTCTTGGGTTGATTTGTCTTACAACTCCTTCTCAGGATCAATTCCACATAGTTGGAAGAACTTGAAAGAACCGAGAGTCATGAATCTGTGGAGTAATAGGTTGTCTGGGGAACTTCCATTGTACTTCTCTAACTTGAAACAATTGCAGATCTTGAACTTAGGAGAAAATGAATTTTCTGAAACTATACCAATCAAGATGTCACAAAACTTACGAGTGGTCATACTGAGAGATAATAAATTTGAAGGGACTATTCCACCACAACTCTTTAATCTCTCTTATTTGATTTACTTAGACCTTGCACATAACAAACTTTCTGGTTCTATGCCAAAGTGTGTCTACAACTTGACTGAGATGGTCACTATTCATGAATATCCTTCCTGGTTCCATACCACAGTTGAGTTGTTTACAAAAGGTCAAGAGTACACTTCGAGAATCCAAGGAGAAAGGCGAACTATTGACCTTTCAGCCAATAGCTTGTCTGGCAAAGTGCCATTGGAATTGTTTCGGCTAGTTCAAGTTCAAACATTAAACTTATCTCACAATAATTTTGTTGGAACAATACCGAAGACGATTGGAGGCATGAAAAATATGGAATCTCTTGATCTCTCTAATAACAAGTTTTTTGGTGAAATTCCTCAGGGCATGTCTCTCCTAACCTTTTTGAGATATTTGAATTTATCATATAATAATTTTGACGGAAGAATCCCGATCGGAACGCAACTTCAAAGTTTTAATGCATCGAGCTACATTGGCAATCCTAAATTATGCGGAGTTCCTCTTAATAATTGTACCACGGAAGAAGAAAATCCTAAAAATGCAGAGAATGAAGATGATGAATCTATAAGAGAGTCGTTGTATCTAGGCATGGGAGTTGGATTTGCAGTAGGTTTTTGGGGGATTTGTGGTTCTATGTTTCTTATTAGGAAATGGAGGCATGCGTACTTTCGGTTAGTTGACTATCTCTATGTTACTTTGATGGTAAAGTTAAATAGCTTTCGTAGAAGTTGA
Protein sequence

>MsG0380013759.01.T01

MTILTSQISLLLLLLLSTTTFHKTICSNHTVVRCNEKDRETLLTFKQGINDSFGLISTWSTEKDCCVWEGVLCDNITNRVTDVDLYNNHFTGEMNLCILELEFLSYLDLRDNEFDVIRIPSIQHNITHSSKLVYLDLSPLNSYTLHMDNLGWLSPHSSLKYLNLSGIELHKETNWLQIVNKLPSLLELQLSECNLNNFPSVEYLNLSSIVTLDLSLNNFTSHLPNGFFNLTKDLTYLDLRGSNIHGEIPSSLLNLQNLTDLYLSYNQIQGSVPVEIGQLAHIQHLDLSENQLQGSIPSTLGNLSSLISLSIGANNFSGEISNLTFSKLSTLDSLVMSNSSFVFQFDLDWVPPFQLSYLLLRNTNQGPNFPSWIYTQKSLSYLDLSSSGISSIEFSRLIERIPDVLILSNNSIAEDISNLTLNCSALFLDHNNFTGGLPNISPMASWVDLSYNSFSGSIPHSWKNLKEPRVMNLWSNRLSGELPLYFSNLKQLQILNLGENEFSETIPIKMSQNLRVVILRDNKFEGTIPPQLFNLSYLIYLDLAHNKLSGSMPKCVYNLTEMVTIHEYPSWFHTTVELFTKGQEYTSRIQGERRTIDLSANSLSGKVPLELFRLVQVQTLNLSHNNFVGTIPKTIGGMKNMESLDLSNNKFFGEIPQGMSLLTFLRYLNLSYNNFDGRIPIGTQLQSFNASSYIGNPKLCGVPLNNCTTEEENPKNAENEDDESIRESLYLGMGVGFAVGFWGICGSMFLIRKWRHAYFRLVDYLYVTLMVKLNSFRRS*