AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380013770.01

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MsG0380013770.01.T01 AT4G36180 27.961 304 162 5 478 730 93 390 1.00e-18 92.0
MsG0380013770.01.T01 AT4G36180 28.030 264 152 5 118 355 433 684 1.37e-12 72.4
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MsG0380013770.01.T01 AT1G17230 27.604 797 468 23 66 798 20 771 8.19e-54 202
MsG0380013770.01.T01 AT3G05360 29.692 714 413 23 69 735 37 708 2.43e-53 199
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MsG0380013770.01.T01 AT1G74180 27.668 759 448 20 99 797 248 965 7.42e-50 190
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MsG0380013770.01.T01 AT2G15080 27.591 685 380 24 93 715 63 693 4.28e-39 157
MsG0380013770.01.T01 AT1G58190 27.151 744 447 22 115 803 226 929 4.93e-49 187
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MsG0380013770.01.T01 AT5G48940 29.000 500 287 13 240 726 104 548 3.47e-38 154
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MsG0380013770.01.T01 AT5G07280 30.077 522 244 11 242 744 401 820 7.98e-45 175
MsG0380013770.01.T01 AT5G07280 28.333 360 186 10 417 714 21 370 2.24e-21 100
MsG0380013770.01.T01 AT5G07280 33.136 169 109 2 190 355 621 788 6.52e-16 83.2
MsG0380013770.01.T01 AT2G33060 27.507 738 424 19 103 774 61 753 6.76e-47 180
MsG0380013770.01.T01 AT1G35710 31.687 587 320 19 208 726 66 639 7.11e-47 181
MsG0380013770.01.T01 AT1G35710 28.553 767 423 28 73 755 33 758 2.97e-46 179
MsG0380013770.01.T01 AT5G62230 30.798 526 298 10 243 735 72 564 7.14e-47 181
MsG0380013770.01.T01 AT5G62230 30.292 548 331 15 66 588 22 543 2.65e-38 154
MsG0380013770.01.T01 AT5G65700 29.412 578 299 16 244 741 71 619 9.72e-47 181
MsG0380013770.01.T01 AT5G65700 29.412 578 299 16 244 741 71 619 9.72e-47 181
MsG0380013770.01.T01 AT2G33170 28.125 736 421 21 73 741 36 730 1.05e-46 181
MsG0380013770.01.T01 AT2G33170 28.125 736 421 21 73 741 36 730 1.05e-46 181
MsG0380013770.01.T01 AT5G63930 28.223 737 410 21 73 741 30 715 2.16e-46 180
MsG0380013770.01.T01 AT5G51350 28.237 556 292 13 220 743 103 583 2.42e-46 179
MsG0380013770.01.T01 AT5G51350 25.610 574 336 15 66 588 21 554 2.31e-32 135
MsG0380013770.01.T01 AT5G51350 26.569 478 259 13 272 735 81 480 5.14e-27 118
MsG0380013770.01.T01 AT5G51350 31.212 330 183 8 413 716 77 388 1.30e-25 114
MsG0380013770.01.T01 AT5G51350 28.079 203 141 3 514 714 43 242 3.14e-13 74.3
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MsG0380013770.01.T01 AT1G73080 28.873 710 417 20 90 734 50 736 5.86e-45 175
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MsG0380013770.01.T01 AT2G24130 28.544 522 302 9 272 736 71 578 2.06e-44 173
MsG0380013770.01.T01 AT2G24130 25.714 560 253 19 99 546 52 560 4.24e-22 102
MsG0380013770.01.T01 AT1G72180 29.550 555 334 14 73 588 34 570 3.63e-44 172
MsG0380013770.01.T01 AT1G72180 28.543 501 308 13 244 730 76 540 2.64e-42 167
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MsG0380013770.01.T01 AT5G07180 29.946 551 315 16 73 588 31 545 1.44e-37 152
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MsG0380013770.01.T01 AT2G33080 27.108 332 150 12 463 714 107 426 3.12e-15 80.5
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MsG0380013770.01.T01 AT5G01890 29.225 568 291 12 216 748 90 581 2.33e-43 170
MsG0380013770.01.T01 AT5G01890 29.055 561 306 15 77 589 31 547 7.57e-43 168
MsG0380013770.01.T01 AT5G01890 30.501 459 258 12 266 714 67 474 5.15e-35 144
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MsG0380013770.01.T01 AT1G34110 31.635 471 275 13 281 714 129 589 2.14e-36 148
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MsG0380013770.01.T01 AT5G07180 28.810 479 250 15 118 588 54 449 1.31e-25 114
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MsG0380013770.01.T01 AT5G56040 27.650 434 226 10 293 716 73 428 6.57e-25 112
MsG0380013770.01.T01 AT3G23010 27.167 600 347 20 217 774 39 590 2.76e-42 164
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MsG0380013770.01.T01 AT5G49290 26.184 760 416 29 106 797 240 922 1.39e-35 145
MsG0380013770.01.T01 AT5G49290 31.760 233 135 8 492 711 86 307 7.28e-17 85.9
MsG0380013770.01.T01 AT5G49290 28.331 713 388 27 64 698 8 675 6.76e-41 162
MsG0380013770.01.T01 AT5G49290 26.184 760 416 29 106 797 240 922 1.39e-35 145
MsG0380013770.01.T01 AT5G49290 31.760 233 135 8 492 711 86 307 7.28e-17 85.9
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MsG0380013770.01.T01 AT1G73066 26.389 432 261 9 316 741 74 454 9.09e-25 110
MsG0380013770.01.T01 AT1G73066 26.498 434 240 9 110 542 238 593 1.35e-18 90.9
MsG0380013770.01.T01 AT1G73066 25.000 340 199 7 419 714 27 354 1.88e-17 87.4
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MsG0380013770.01.T01 AT4G13820 28.486 502 322 19 266 745 81 567 6.50e-24 108
MsG0380013770.01.T01 AT2G02220 25.902 610 338 15 264 774 73 667 1.45e-40 161
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MsG0380013770.01.T01 AT2G25440 28.200 539 336 15 264 775 132 646 2.65e-40 159
MsG0380013770.01.T01 AT2G25440 27.701 509 271 18 114 589 135 579 1.62e-21 100
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MsG0380013770.01.T01 AT2G41820 29.078 423 281 9 191 601 62 477 2.90e-32 135
MsG0380013770.01.T01 AT2G41820 28.838 482 313 15 73 543 27 489 4.11e-32 134
MsG0380013770.01.T01 AT5G25930 28.827 503 296 15 244 714 65 537 1.08e-39 159
MsG0380013770.01.T01 AT5G25930 29.706 579 338 20 73 595 26 591 2.57e-37 151
MsG0380013770.01.T01 AT5G25930 26.629 537 325 13 233 735 103 604 2.75e-32 135
MsG0380013770.01.T01 AT5G25930 26.914 431 256 11 292 714 64 443 3.66e-23 106
MsG0380013770.01.T01 AT5G23400 28.219 567 326 17 67 589 29 558 1.71e-39 155
MsG0380013770.01.T01 AT5G23400 29.339 484 302 16 279 741 120 584 5.29e-36 144
MsG0380013770.01.T01 AT2G15042 29.143 350 221 6 444 779 66 402 4.29e-39 150
MsG0380013770.01.T01 AT2G15042 28.767 292 174 10 321 595 59 333 2.11e-17 86.3
MsG0380013770.01.T01 AT5G49290 28.488 681 370 26 90 698 12 647 1.50e-38 155
MsG0380013770.01.T01 AT5G49290 26.184 760 416 29 106 797 212 894 6.62e-36 146
MsG0380013770.01.T01 AT5G49290 31.760 233 135 8 492 711 58 279 4.81e-17 86.7
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MsG0380013770.01.T01 AT5G06940 27.043 514 283 15 269 747 77 533 1.20e-29 127
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MsG0380013770.01.T01 AT1G09970 27.299 348 203 9 204 546 272 574 9.19e-16 82.4
MsG0380013770.01.T01 AT1G09970 26.070 257 169 4 118 357 248 500 1.14e-13 75.9
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MsG0380013770.01.T01 AT1G33590 31.148 244 154 5 478 715 115 350 6.81e-22 100
MsG0380013770.01.T01 AT1G33590 28.125 320 196 14 58 351 55 366 1.75e-15 80.9
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MsG0380013770.01.T01 AT1G33590 31.148 244 154 5 478 715 113 348 6.31e-22 100
MsG0380013770.01.T01 AT1G33590 28.125 320 196 14 58 351 53 364 1.83e-15 80.5
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MsG0380013770.01.T01 AT1G33600 30.588 340 161 12 460 741 154 476 8.82e-27 115
MsG0380013770.01.T01 AT1G33600 27.551 490 259 18 66 519 25 454 3.45e-23 104
MsG0380013770.01.T01 AT1G33600 30.263 228 126 3 490 714 115 312 7.78e-19 90.9
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MsG0380013770.01.T01 AT3G02130 26.413 761 433 29 71 748 27 743 1.46e-25 114
MsG0380013770.01.T01 AT1G80080 33.333 234 124 3 484 715 166 369 6.10e-25 110
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MsG0380013770.01.T01 AT1G80080 30.890 191 99 3 544 733 156 314 4.14e-14 76.3
MsG0380013770.01.T01 AT1G80080 35.294 153 95 3 223 374 188 337 1.82e-12 71.2
MsG0380013770.01.T01 AT1G33610 28.686 373 218 13 403 741 118 476 9.95e-25 108
MsG0380013770.01.T01 AT1G33610 32.456 228 121 4 490 714 116 313 8.58e-22 100
MsG0380013770.01.T01 AT1G33610 24.699 498 299 16 58 542 19 453 1.06e-21 99.8
MsG0380013770.01.T01 AT1G33610 31.200 250 153 7 465 705 112 351 5.04e-18 88.6
MsG0380013770.01.T01 AT1G33610 28.326 233 133 4 488 716 89 291 1.85e-14 77.4
MsG0380013770.01.T01 AT2G33030 37.222 180 106 4 606 779 15 193 2.13e-24 102
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MsG0380013770.01.T01 AT1G29750 29.333 300 157 10 212 496 118 377 6.89e-15 79.7
MsG0380013770.01.T01 AT1G29750 29.964 277 162 10 462 714 107 375 1.36e-18 91.7
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MsG0380013770.01.T01 AT4G03010 28.571 238 133 7 489 690 85 321 5.03e-15 78.6
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MsG0380013770.01.T01 AT5G06860 24.540 326 181 12 69 390 25 289 8.93e-16 80.1
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MsG0380013770.01.T01 AT1G56130 27.004 237 139 4 481 714 3 208 3.73e-13 73.9
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MsG0380013770.01.T01 AT4G23740 34.118 170 79 4 561 729 82 219 9.47e-14 75.5
MsG0380013770.01.T01 AT4G23740 30.667 150 102 1 242 391 68 215 4.61e-11 67.0
MsG0380013770.01.T01 AT3G03770 27.972 286 187 5 491 767 119 394 1.18e-13 75.5
MsG0380013770.01.T01 AT3G03770 27.972 286 187 5 491 767 119 394 1.18e-13 75.5
MsG0380013770.01.T01 AT3G03770 27.972 286 187 5 491 767 119 394 1.18e-13 75.5
MsG0380013770.01.T01 AT1G28340 38.182 110 66 1 630 737 426 535 1.21e-13 75.1
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MsG0380013770.01.T01 AT4G30520 39.048 105 62 1 487 589 87 191 3.29e-12 70.5
MsG0380013770.01.T01 AT3G28450 31.548 168 93 4 618 784 99 245 3.46e-13 73.6
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MsG0380013770.01.T01 AT3G25560 29.448 163 81 3 572 734 82 210 3.72e-13 73.6
MsG0380013770.01.T01 AT3G25560 37.864 103 62 1 489 589 93 195 1.18e-11 68.9
MsG0380013770.01.T01 AT5G45800 28.500 200 132 5 532 728 62 253 3.98e-13 73.2
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MsG0380013770.01.T01 AT1G53440 27.542 236 161 6 482 714 117 345 9.84e-12 69.3
MsG0380013770.01.T01 AT1G53440 25.735 272 180 7 447 709 104 362 2.27e-11 68.2
MsG0380013770.01.T01 AT1G53440 26.642 274 139 7 491 735 102 342 3.72e-11 67.4
MsG0380013770.01.T01 AT5G21090 37.500 112 69 1 244 355 72 182 6.60e-13 69.3
MsG0380013770.01.T01 AT5G21090 31.214 173 115 3 566 735 9 180 8.54e-12 65.9
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MsG0380013770.01.T01 AT2G02780 26.950 282 153 7 499 760 103 351 8.00e-13 72.4
MsG0380013770.01.T01 AT1G31420 30.000 170 105 3 628 787 101 266 8.53e-13 72.4
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MsG0380013770.01.T01 AT1G31420 30.000 170 105 3 628 787 101 266 9.08e-13 72.4
MsG0380013770.01.T01 AT1G31420 33.929 112 73 1 244 355 76 186 7.68e-11 66.2
MsG0380013770.01.T01 AT1G31420 30.000 170 105 3 628 787 101 266 9.08e-13 72.4
MsG0380013770.01.T01 AT1G31420 33.929 112 73 1 244 355 76 186 7.68e-11 66.2
MsG0380013770.01.T01 AT2G02780 28.049 246 131 5 499 731 103 315 9.25e-13 72.4
MsG0380013770.01.T01 AT5G45800 28.500 200 132 5 532 728 62 253 9.73e-13 72.4
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MsG0380013770.01.T01 AT5G62710 38.596 114 69 1 622 735 56 168 1.02e-11 68.9
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MsG0380013770.01.T01 AT5G58300 35.664 143 66 4 628 748 115 253 7.38e-12 69.7
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MsG0380013770.01.T01 AT5G63710 28.342 187 128 3 629 814 61 242 1.03e-11 68.9
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MsG0380013770.01.T01 AT2G13800 40.000 125 70 2 249 368 48 172 1.52e-11 68.6
MsG0380013770.01.T01 AT1G68400 34.437 151 74 3 628 756 94 241 1.92e-11 68.2
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MsG0380013770.01.T01 AT3G25560 28.659 164 82 4 572 734 82 211 2.72e-11 67.8
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MsG0380013770.01.T01 AT1G34210 36.585 123 76 2 240 361 70 191 2.91e-11 67.4
MsG0380013770.01.T01 AT4G03390 27.660 188 103 4 513 699 86 241 3.01e-11 67.8
MsG0380013770.01.T01 AT4G03390 27.660 188 103 4 513 699 86 241 3.01e-11 67.8
MsG0380013770.01.T01 AT4G16162 35.862 145 73 7 275 410 35 168 4.71e-11 62.8
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MsG0380013770.01.T01 AT4G31250 33.333 138 71 2 625 741 99 236 6.05e-11 66.6
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MsG0380013770.01.T01 AT1G53730 29.167 192 124 4 209 399 62 242 9.02e-11 66.2

Find 156 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 331 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TGGGATTTGCAGTAGGTTTC+TGG 0.004389 3:+45437874 MsG0380013770.01.T01:CDS
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GATGTTCTTGATCAATTTCT+TGG 0.207122 3:-45432935 None:intergenic
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ATAAGAGAGTCATTGTATTT+AGG 0.246266 3:+45437843 MsG0380013770.01.T01:CDS
AGAGATCAAGGTGTTGAATA+TGG 0.263382 3:-45436513 None:intergenic
CTTGCACATAACAAACTTTC+CGG 0.270125 3:+45437300 MsG0380013770.01.T01:CDS
TATATCCAAGATGGAAAGTT+TGG 0.279994 3:-45436772 None:intergenic
GCCAATGGATAAGGAAATTA+AGG 0.286514 3:-45436587 None:intergenic
TCTTCATTCTCTGCATTTCC+AGG 0.295104 3:-45437810 None:intergenic
ACATATCACCAATGGCTTCT+TGG 0.295232 3:+45436989 MsG0380013770.01.T01:CDS
TAAATCTAAAGTAGAGAGTT+TGG 0.309749 3:-45436650 None:intergenic
GAACCCAATCCAAATCAAAT+TGG 0.310778 3:-45436702 None:intergenic
TCATGAACCTCTGGCGTAAT+AGG 0.314144 3:+45437082 MsG0380013770.01.T01:CDS
CATATCACCAATGGCTTCTT+GGG 0.322224 3:+45436990 MsG0380013770.01.T01:CDS
TTTGGTTATAAGAGAGATAA+AGG 0.322650 3:-45436453 None:intergenic
AGAGGAGCTCCACATAGTTT+AGG 0.326482 3:-45437759 None:intergenic
TAAATTCAAATAACCCAAAA+AGG 0.329074 3:-45437658 None:intergenic
CAACAGATGGGAAGTTGTTC+AGG 0.334977 3:-45436255 None:intergenic
TATTCCAATTTGATTTGGAT+TGG 0.336058 3:+45436698 MsG0380013770.01.T01:CDS
GAAGCCATTGGTGATATGTT+TGG 0.338643 3:-45436985 None:intergenic
GGGATTTGCAGTAGGTTTCT+GGG 0.342749 3:+45437875 MsG0380013770.01.T01:CDS
CAGGGCATCAATGATAGTTT+TGG 0.345728 3:+45435812 MsG0380013770.01.T01:CDS
CTCTGGCGTAATAGGTTGTA+TGG 0.353399 3:+45437090 MsG0380013770.01.T01:CDS
GGATCAGTTCCAGTAGAAAT+AGG 0.354255 3:+45436481 MsG0380013770.01.T01:CDS
CTTTCAGCCAATAGCTTGTC+TGG 0.356011 3:+45437462 MsG0380013770.01.T01:CDS
ATCATTGATGCCCTGTTTGA+AGG 0.365060 3:-45435804 None:intergenic
AAATGCCATTGGAATTGTTT+CGG 0.371177 3:+45437487 MsG0380013770.01.T01:CDS
ATCTCACCTATCTTGACCTT+CGG 0.372981 3:+45436371 MsG0380013770.01.T01:CDS
ATTCCAATTTGATTTGGATT+GGG 0.376326 3:+45436699 MsG0380013770.01.T01:CDS
AAGCCATTGGTGATATGTTT+GGG 0.376599 3:-45436984 None:intergenic
GACACTATTAACCTTCAAAC+AGG 0.378834 3:+45435793 MsG0380013770.01.T01:CDS
TCTCACCTATCTTGACCTTC+GGG 0.381298 3:+45436372 MsG0380013770.01.T01:CDS
AAAAGGTAAGAGAGTTGAAA+AGG 0.388851 3:-45436727 None:intergenic
TTGTCTTACAACTCCTTCTC+AGG 0.391480 3:+45437018 MsG0380013770.01.T01:CDS
CAGGATCAATTCCACATAGT+TGG 0.392506 3:+45437037 MsG0380013770.01.T01:CDS
TTCACCTCTCATTTACCAAA+TGG 0.394132 3:+45436328 MsG0380013770.01.T01:CDS
CTATGTTTCTTATTAGGAAA+TGG 0.394599 3:+45437910 MsG0380013770.01.T01:CDS
CAGTATTGGAACCACCAGTT+TGG 0.395193 3:+45435404 MsG0380013770.01.T01:CDS
AACTAGCAGGAGCTCAGTTT+CGG 0.396674 3:-45438013 None:intergenic
ACTTGAGTTTCTCAGTTACT+TGG 0.399041 3:+45435973 MsG0380013770.01.T01:CDS
AAAACGAATCACGGTGAAAC+AGG 0.405946 3:+45432985 MsG0380013770.01.T01:CDS
AAGGCCCAAACTTTCCATCT+TGG 0.406398 3:+45436767 MsG0380013770.01.T01:CDS
TGTCTACAACTTGACTGATA+TGG 0.413425 3:+45437338 MsG0380013770.01.T01:CDS
CATTTCTCCAGACAAGCTAT+TGG 0.415959 3:-45437469 None:intergenic
GAGTCATTGTATTTAGGAAT+GGG 0.416034 3:+45437849 MsG0380013770.01.T01:CDS
ATTATTAGCGCCAATGGATA+AGG 0.417145 3:-45436596 None:intergenic
TCCTTAATTTCCTTATCCAT+TGG 0.420376 3:+45436586 MsG0380013770.01.T01:CDS
ACTCGGAACAATTTAGTGTA+AGG 0.421947 3:-45436927 None:intergenic
AGAGTCATTGTATTTAGGAA+TGG 0.422161 3:+45437848 MsG0380013770.01.T01:CDS
ATTCACTATTTGAAGCCAAT+TGG 0.422316 3:-45436191 None:intergenic
TTCATGCCTCCAATCTTGTT+CGG 0.429526 3:-45437564 None:intergenic
ACAATTGAGTTGTTTACAAA+AGG 0.429802 3:+45437393 MsG0380013770.01.T01:CDS
AGTATTGGAACCACCAGTTT+GGG 0.436522 3:+45435405 MsG0380013770.01.T01:CDS
TCGTAGGCATGCACCCAAAC+TGG 0.438727 3:-45435418 None:intergenic
TTTGAAGTTGTGTTCCGATC+GGG 0.441900 3:-45437707 None:intergenic
TTGAGAGCTAATAAATTTGA+AGG 0.446217 3:+45437228 MsG0380013770.01.T01:CDS
TTATTGAGAAATACAAATCA+AGG 0.447115 3:+45436748 MsG0380013770.01.T01:CDS
TCACCTCTCATTTACCAAAT+GGG 0.449389 3:+45436329 MsG0380013770.01.T01:CDS
TCCGTTGTACAGTTATTAAG+AGG 0.450013 3:-45437777 None:intergenic
TGTTCGGTGGAGAGAATCAT+TGG 0.455802 3:-45432871 None:intergenic
GCAAGTTGGCCTATTTCTAC+TGG 0.457076 3:-45436490 None:intergenic
AACCAAGATTATCCATGTGC+AGG 0.457296 3:-45436105 None:intergenic
CAGTGGAATTGAACTTCATA+AGG 0.458839 3:+45436165 MsG0380013770.01.T01:CDS
AACTTCATAAGGAAACCAAT+TGG 0.465600 3:+45436176 MsG0380013770.01.T01:CDS
ACTGAGGTTGAGATATTTCA+AGG 0.467814 3:-45436146 None:intergenic
AACTGAGAGTCATGAACCTC+TGG 0.469415 3:+45437073 MsG0380013770.01.T01:CDS
GTCAAGATAGGTGAGATCTT+TGG 0.470137 3:-45436365 None:intergenic
GAGAGGTTTCCTAGAGTTGA+AGG 0.470533 3:-45436562 None:intergenic
TTTGACAAAATAAGTACATC+GGG 0.471518 3:-45436877 None:intergenic
ACCCTGCACATGGATAATCT+TGG 0.471692 3:+45436103 MsG0380013770.01.T01:CDS
TTGGATCATAATAATTTCAC+AGG 0.473448 3:+45436955 MsG0380013770.01.T01:CDS
TTGTGACATCTTGATTGGTA+TGG 0.475261 3:-45437187 None:intergenic
GGATCTATTCCTTCAACTCT+AGG 0.478153 3:+45436553 MsG0380013770.01.T01:CDS
GACACACTTTGGCATAGAAC+CGG 0.480664 3:-45437319 None:intergenic
GCAGGAATGGATAGCAGTAT+TGG 0.483849 3:+45435390 MsG0380013770.01.T01:intron
ACAACGGAAGAAGAAAATCC+TGG 0.484629 3:+45437792 MsG0380013770.01.T01:CDS
ATATCCAAGATGGAAAGTTT+GGG 0.489624 3:-45436771 None:intergenic
ATTGGCGCTAATAATTTCTC+TGG 0.492054 3:+45436604 MsG0380013770.01.T01:CDS
AAGGAATAGATCCTTGTAGT+TGG 0.492058 3:-45436543 None:intergenic
GCTTCCCCGAAGGTCAAGAT+AGG 0.494234 3:-45436377 None:intergenic
TGAAGGTTTAGCAAGCTTGA+AGG 0.498997 3:-45436418 None:intergenic
GAGATCAAGGTGTTGAATAT+GGG 0.499174 3:-45436512 None:intergenic
ATTGATCAAGAACATCAAAT+CGG 0.500441 3:+45432942 MsG0380013770.01.T01:CDS
ATGTGTGATGTTGTGTTGAA+TGG 0.504176 3:-45436035 None:intergenic
CTCTCTTATAACCAAATACA+AGG 0.507674 3:+45436460 MsG0380013770.01.T01:CDS
GGAACAATACCGAACAAGAT+TGG 0.508200 3:+45437555 MsG0380013770.01.T01:CDS
CTTTGAAGTTGTGTTCCGAT+CGG 0.508559 3:-45437708 None:intergenic
TATCTAGACTTATCGAGCTC+GGG 0.511904 3:+45436814 MsG0380013770.01.T01:CDS
ATGGGAGTGGGATTTGCAGT+AGG 0.513712 3:+45437867 MsG0380013770.01.T01:CDS
TTCTGTGTATATATCCAAGA+TGG 0.519216 3:-45436781 None:intergenic
TTTAATGCATCGAGCTACAT+TGG 0.520337 3:+45437732 MsG0380013770.01.T01:CDS
CTTTCTGTTAGTTGATAGAG+TGG 0.520885 3:+45437944 MsG0380013770.01.T01:CDS
GGATTTGCAGTAGGTTTCTG+GGG 0.521637 3:+45437876 MsG0380013770.01.T01:CDS
ATATCTAGACTTATCGAGCT+CGG 0.523226 3:+45436813 MsG0380013770.01.T01:CDS
CAATAGTTCGCCTTTCTCGT+TGG 0.524418 3:-45437437 None:intergenic
AACTGTAATTCTAACAATGA+AGG 0.525097 3:-45436220 None:intergenic
CAGACAAGCTATTGGCTGAA+AGG 0.525405 3:-45437461 None:intergenic
AGAGAAATTATTAGCGCCAA+TGG 0.525877 3:-45436602 None:intergenic
TCTGGCGTAATAGGTTGTAT+GGG 0.526107 3:+45437091 MsG0380013770.01.T01:CDS
CTCTCTGAAAACCAACTACA+AGG 0.528193 3:+45436532 MsG0380013770.01.T01:CDS
AGATATTTCAAGGAAGAATG+TGG 0.539918 3:-45436136 None:intergenic
AAAGATTGTTGTGTTTGGGA+AGG 0.540944 3:+45435860 MsG0380013770.01.T01:CDS
AGGTAAGAGAGTTGAAAAGG+AGG 0.543361 3:-45436724 None:intergenic
TCAATTGTGGTAAAATACAT+AGG 0.549951 3:-45437378 None:intergenic
GTTTGACAAAATAAGTACAT+CGG 0.550091 3:-45436878 None:intergenic
TAAGAGAGATTGAATAGTTG+TGG 0.553599 3:-45437261 None:intergenic
CGTTATGTGTAGTTTGTCGT+AGG 0.557078 3:-45435434 None:intergenic
AAATTCAAATACTCAACAGA+TGG 0.559127 3:-45436268 None:intergenic
CGGAAAGTTTGTTATGTGCA+AGG 0.559771 3:-45437299 None:intergenic
GGTGTTGAATATGGGCAAGT+TGG 0.560288 3:-45436504 None:intergenic
GTCAAGTTGTAGACACACTT+TGG 0.565896 3:-45437330 None:intergenic
ATTGTATTTAGGAATGGGAG+TGG 0.566785 3:+45437854 MsG0380013770.01.T01:CDS
TGTGCAGGGTATAACTGTTG+AGG 0.568363 3:-45436090 None:intergenic
TGCACATGGATAATCTTGGT+TGG 0.571989 3:+45436107 MsG0380013770.01.T01:CDS
GTGCAGGGTATAACTGTTGA+GGG 0.573076 3:-45436089 None:intergenic
TTGTATTTAGGAATGGGAGT+GGG 0.574423 3:+45437855 MsG0380013770.01.T01:CDS
GTGATGTTGTGTTGAATGGA+TGG 0.578419 3:-45436031 None:intergenic
TGAGAGCTAATAAATTTGAA+GGG 0.579708 3:+45437229 MsG0380013770.01.T01:CDS
CTTGTCTGGAGAAATGCCAT+TGG 0.581431 3:+45437476 MsG0380013770.01.T01:CDS
GATCATAATAATTTCACAGG+AGG 0.583404 3:+45436958 MsG0380013770.01.T01:CDS
ACCAAGATTATCCATGTGCA+GGG 0.583732 3:-45436104 None:intergenic
TGTTTGTAATATTGTCGCAA+AGG 0.584260 3:-45435886 None:intergenic
AAATCAACCCAAGAAGCCAT+TGG 0.592132 3:-45436997 None:intergenic
ATAAGGAAATTAAGGATGAG+AGG 0.592417 3:-45436579 None:intergenic
TGTTTCTTATTAGGAAATGG+AGG 0.594389 3:+45437913 MsG0380013770.01.T01:CDS
CTTCGGGGAAGCAATATACA+TGG 0.596656 3:+45436388 MsG0380013770.01.T01:CDS
CTACGACAAACTACACATAA+CGG 0.598821 3:+45435435 MsG0380013770.01.T01:CDS
ATTGGCAATCCTAAACTATG+TGG 0.599053 3:+45437750 MsG0380013770.01.T01:CDS
GAGAGATTGAATAGTTGTGG+TGG 0.600582 3:-45437258 None:intergenic
TTCAAGTTAGAGAAGTACAA+TGG 0.600675 3:-45437120 None:intergenic
GATGTCACAAAACTTACAAG+TGG 0.603585 3:+45437200 MsG0380013770.01.T01:CDS
ATGTGGAATTGATCCTGAGA+AGG 0.606373 3:-45437031 None:intergenic
CATGTATATTGCTTCCCCGA+AGG 0.613523 3:-45436387 None:intergenic
TTTCTGTTAGTTGATAGAGT+GGG 0.614386 3:+45437945 MsG0380013770.01.T01:CDS
AATTCAAATACTCAACAGAT+GGG 0.615335 3:-45436267 None:intergenic
CAACAGTTATACCCTGCACA+TGG 0.616149 3:+45436093 MsG0380013770.01.T01:CDS
GATTTGCAGTAGGTTTCTGG+GGG 0.617730 3:+45437877 MsG0380013770.01.T01:CDS
AAACCCATTTGGTAAATGAG+AGG 0.628216 3:-45436332 None:intergenic
TTGAAATATCTCAACCTCAG+TGG 0.628514 3:+45436148 MsG0380013770.01.T01:CDS
ACAATACCGAACAAGATTGG+AGG 0.635753 3:+45437558 MsG0380013770.01.T01:CDS
ACAAGCCGAAACAATTCCAA+TGG 0.636598 3:-45437492 None:intergenic
GCAGGGTATAACTGTTGAGG+GGG 0.638958 3:-45436087 None:intergenic
CTGGCGTAATAGGTTGTATG+GGG 0.650007 3:+45437092 MsG0380013770.01.T01:CDS
ACTCCCAAACATATCACCAA+TGG 0.654288 3:+45436981 MsG0380013770.01.T01:CDS
TCCTCTTAATAACTGTACAA+CGG 0.657489 3:+45437776 MsG0380013770.01.T01:CDS
TAGGCATGCACCCAAACTGG+TGG 0.668594 3:-45435415 None:intergenic
TGCAGGGTATAACTGTTGAG+GGG 0.672913 3:-45436088 None:intergenic
CAGGGTATAACTGTTGAGGG+GGG 0.680388 3:-45436086 None:intergenic
CTCACCTATCTTGACCTTCG+GGG 0.687922 3:+45436373 MsG0380013770.01.T01:CDS
GTTAAAAGAGACATGTCCTG+AGG 0.690830 3:-45437636 None:intergenic
CATACAACCTATTACGCCAG+AGG 0.696329 3:-45437089 None:intergenic
TTTGACGGAAGAATCCCGAT+CGG 0.704007 3:+45437693 MsG0380013770.01.T01:CDS
ACACTATTAACCTTCAAACA+GGG 0.715547 3:+45435794 MsG0380013770.01.T01:CDS
TATGAAGTTCAATTCCACTG+AGG 0.716098 3:-45436162 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTGTAAAAAAAATAAATCAT+TGG - Chr3:45434598-45434617 None:intergenic 10.0%
!!! ATCTAAACAAATTTTTTTAT+AGG - Chr3:45434868-45434887 None:intergenic 10.0%
!!! ATCTAAATTATTTTTTTTAC+GGG + Chr3:45435072-45435091 MsG0380013770.01.T01:intron 10.0%
!!! ATTACTTTTTTATTAGTTTA+AGG + Chr3:45434793-45434812 MsG0380013770.01.T01:intron 10.0%
!!! TTACTTTTTTATTAGTTTAA+GGG + Chr3:45434794-45434813 MsG0380013770.01.T01:intron 10.0%
!!! TTATCATATAATAATTTTGA+CGG + Chr3:45437678-45437697 MsG0380013770.01.T01:CDS 10.0%
!! AAATATTAATTTATGCAGTA+TGG + Chr3:45435151-45435170 MsG0380013770.01.T01:intron 15.0%
!! AATACTAGAAAGAAATTATT+AGG + Chr3:45434224-45434243 MsG0380013770.01.T01:intron 15.0%
!! AATTCAAAATCAACTTTATT+AGG + Chr3:45434118-45434137 MsG0380013770.01.T01:intron 15.0%
!! GAAAAAAATAATATAACTAG+TGG - Chr3:45434382-45434401 None:intergenic 15.0%
!! TTACAAAAAATGTTCAATAT+GGG + Chr3:45434612-45434631 MsG0380013770.01.T01:intron 15.0%
!! TTTACAAAAAATGTTCAATA+TGG + Chr3:45434611-45434630 MsG0380013770.01.T01:intron 15.0%
!!! AAACAAATTTTTTTATAGGA+GGG - Chr3:45434864-45434883 None:intergenic 15.0%
!!! AAATTATGTTTTATTTTAGG+TGG - Chr3:45434671-45434690 None:intergenic 15.0%
!!! ATAATTAACATTTTGTAATG+TGG + Chr3:45435365-45435384 MsG0380013770.01.T01:intron 15.0%
!!! TAAACAAATTTTTTTATAGG+AGG - Chr3:45434865-45434884 None:intergenic 15.0%
!!! TATTTAATTTCCATTCTAAT+TGG - Chr3:45434208-45434227 None:intergenic 15.0%
!!! TCTAAATTATTTTTTTTACG+GGG + Chr3:45435073-45435092 MsG0380013770.01.T01:intron 15.0%
!!! TCTTTTGTTAATTACTAATT+TGG + Chr3:45434278-45434297 MsG0380013770.01.T01:intron 15.0%
!! AATTTCACAATTGAAATTGA+CGG - Chr3:45433048-45433067 None:intergenic 20.0%
!! ATTATGATCCAAAAATAACT+CGG - Chr3:45436947-45436966 None:intergenic 20.0%
!! GAAACTAATAGTTAGTTATA+TGG + Chr3:45433824-45433843 MsG0380013770.01.T01:intron 20.0%
!! GATTTGTATTTCTCAATAAA+AGG - Chr3:45436747-45436766 None:intergenic 20.0%
!! TAAATTCAAATAACCCAAAA+AGG - Chr3:45437661-45437680 None:intergenic 20.0%
!! TATGTAATATTAACGATTTC+CGG + Chr3:45434834-45434853 MsG0380013770.01.T01:intron 20.0%
!! TTATTGAGAAATACAAATCA+AGG + Chr3:45436748-45436767 MsG0380013770.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTCAATTGTGAAATTGAAT+CGG + Chr3:45433052-45433071 MsG0380013770.01.T01:intron 20.0%
!!! AAACTTAATGAAGTCTTTTA+TGG + Chr3:45434644-45434663 MsG0380013770.01.T01:intron 20.0%
!!! AATTTGAAGATTTTTGGTTT+TGG + Chr3:45434899-45434918 MsG0380013770.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTTGAAGACTTTTTGATTT+TGG - Chr3:45435040-45435059 None:intergenic 20.0%
!!! CAAAAAACTTGTTATTAGAA+AGG - Chr3:45437608-45437627 None:intergenic 20.0%
!!! CTAAATTATTTTTTTTACGG+GGG + Chr3:45435074-45435093 MsG0380013770.01.T01:intron 20.0%
!!! CTTTCTAATAACAAGTTTTT+TGG + Chr3:45437606-45437625 MsG0380013770.01.T01:CDS 20.0%
!!! TCAAAGTCTTACTTTTAATT+TGG + Chr3:45435483-45435502 MsG0380013770.01.T01:intron 20.0%
!!! TCTTCATTTTGCAATTATTA+AGG - Chr3:45433797-45433816 None:intergenic 20.0%
!!! TTATCTCACAATAATTTTGT+TGG + Chr3:45437534-45437553 MsG0380013770.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTGTATTCCAATTTGATT+TGG + Chr3:45436693-45436712 MsG0380013770.01.T01:CDS 20.0%
! AAAAAAGTAGCCAATTAGAA+TGG + Chr3:45434195-45434214 MsG0380013770.01.T01:intron 25.0%
! AAACAATGAATAAGAAAGGA+AGG + Chr3:45433451-45433470 MsG0380013770.01.T01:intron 25.0%
! AAATCTTCAAATTACAGAGT+TGG - Chr3:45434892-45434911 None:intergenic 25.0%
! AAATTCAAATACTCAACAGA+TGG - Chr3:45436271-45436290 None:intergenic 25.0%
! AAATTCTCTCAAATTACAGA+GGG + Chr3:45434975-45434994 MsG0380013770.01.T01:intron 25.0%
! AACTGTAATTCTAACAATGA+AGG - Chr3:45436223-45436242 None:intergenic 25.0%
! AATTCAAATACTCAACAGAT+GGG - Chr3:45436270-45436289 None:intergenic 25.0%
! ACAAAAATGACAATATGACA+GGG + Chr3:45434943-45434962 MsG0380013770.01.T01:intron 25.0%
! ACAATGTATAGAAATGTAAC+TGG + Chr3:45434752-45434771 MsG0380013770.01.T01:intron 25.0%
! AGAAAAAGATTGTTGTGTTT+GGG + Chr3:45435856-45435875 MsG0380013770.01.T01:CDS 25.0%
! AGAAGAAGATCTAATTCAAA+TGG - Chr3:45435632-45435651 None:intergenic 25.0%
! ATAAGAGAGTCATTGTATTT+AGG + Chr3:45437843-45437862 MsG0380013770.01.T01:CDS 25.0%
! ATATAAGTGATGAAACCAAA+TGG - Chr3:45434327-45434346 None:intergenic 25.0%
! ATCGAAATTGAATCATGAAT+TGG + Chr3:45433354-45433373 MsG0380013770.01.T01:intron 25.0%
! ATTGATCAAGAACATCAAAT+CGG + Chr3:45432942-45432961 MsG0380013770.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGCAAAATGAAGAACTAA+AGG + Chr3:45433802-45433821 MsG0380013770.01.T01:intron 25.0%
! CAAAAAGTCTTCAAATTACA+AGG + Chr3:45435044-45435063 MsG0380013770.01.T01:intron 25.0%
! CTATGTTTCTTATTAGGAAA+TGG + Chr3:45437910-45437929 MsG0380013770.01.T01:CDS 25.0%
! GAAGAAGATCTAATTCAAAT+GGG - Chr3:45435631-45435650 None:intergenic 25.0%
! GGAAATCGTTAATATTACAT+AGG - Chr3:45434835-45434854 None:intergenic 25.0%
! GGCATCAATTACAAAATATA+AGG - Chr3:45435009-45435028 None:intergenic 25.0%
! GTTTGACAAAATAAGTACAT+CGG - Chr3:45436881-45436900 None:intergenic 25.0%
! TACAAAAATGACAATATGAC+AGG + Chr3:45434942-45434961 MsG0380013770.01.T01:intron 25.0%
! TAGGAAACAATGAATAAGAA+AGG + Chr3:45433447-45433466 MsG0380013770.01.T01:intron 25.0%
! TATTAATTTATGCAGTATGG+CGG + Chr3:45435154-45435173 MsG0380013770.01.T01:intron 25.0%
! TCAACTTTATTAGGTATTTC+AGG + Chr3:45434127-45434146 MsG0380013770.01.T01:intron 25.0%
! TCAATTGTGGTAAAATACAT+AGG - Chr3:45437381-45437400 None:intergenic 25.0%
! TCTGTAATTTGAGAGAATTT+CGG - Chr3:45434975-45434994 None:intergenic 25.0%
! TGAGAGCTAATAAATTTGAA+GGG + Chr3:45437229-45437248 MsG0380013770.01.T01:CDS 25.0%
! TGATACCATATTATGAAACA+TGG + Chr3:45433561-45433580 MsG0380013770.01.T01:intron 25.0%
! TGATATTTGTGAAGTAAGAA+TGG - Chr3:45435681-45435700 None:intergenic 25.0%
! TTCGTATATTGTAGTTATTC+TGG + Chr3:45433916-45433935 MsG0380013770.01.T01:intron 25.0%
! TTGAGAGCTAATAAATTTGA+AGG + Chr3:45437228-45437247 MsG0380013770.01.T01:CDS 25.0%
! TTGGATCATAATAATTTCAC+AGG + Chr3:45436955-45436974 MsG0380013770.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGACAAAATAAGTACATC+GGG - Chr3:45436880-45436899 None:intergenic 25.0%
! TTTGGTTATAAGAGAGATAA+AGG - Chr3:45436456-45436475 None:intergenic 25.0%
!! AAGTAAGACTTTGAAAAAGT+AGG - Chr3:45435477-45435496 None:intergenic 25.0%
!! ACAATTGAGTTGTTTACAAA+AGG + Chr3:45437393-45437412 MsG0380013770.01.T01:CDS 25.0%
!! ATATTTTTCTTTCCTACTCT+TGG - Chr3:45434536-45434555 None:intergenic 25.0%
!! ATCAATTTTTCCCAATTCTT+AGG - Chr3:45433151-45433170 None:intergenic 25.0%
!! ATGTCTCTTTTAACCTTTTT+GGG + Chr3:45437645-45437664 MsG0380013770.01.T01:CDS 25.0%
!! CTCTGTAATTTGAAGATTTT+TGG + Chr3:45434893-45434912 MsG0380013770.01.T01:intron 25.0%
!! TAAATCTAAAGTAGAGAGTT+TGG - Chr3:45436653-45436672 None:intergenic 25.0%
!! TACAATAAAAGAGTACATCA+AGG + Chr3:45433660-45433679 MsG0380013770.01.T01:intron 25.0%
!! TCAATTTTTCCCAATTCTTA+GGG - Chr3:45433150-45433169 None:intergenic 25.0%
!! TCTCTACAACAATCATTTTA+CGG + Chr3:45435925-45435944 MsG0380013770.01.T01:CDS 25.0%
!! TTAGCAGAAAATGAATTTTC+TGG + Chr3:45437162-45437181 MsG0380013770.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTGTAAACAACTCAATTG+TGG - Chr3:45437394-45437413 None:intergenic 25.0%
!!! AAATTGTTCCGAGTTATTTT+TGG + Chr3:45436936-45436955 MsG0380013770.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTCCAATTTGATTTGGATT+GGG + Chr3:45436699-45436718 MsG0380013770.01.T01:CDS 25.0%
!!! TATTCCAATTTGATTTGGAT+TGG + Chr3:45436698-45436717 MsG0380013770.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTTGATTTTGGATCTTCA+TGG - Chr3:45435030-45435049 None:intergenic 25.0%
AAAAATGACAATATGACAGG+GGG + Chr3:45434945-45434964 MsG0380013770.01.T01:intron 30.0%
AAAAGGTAAGAGAGTTGAAA+AGG - Chr3:45436730-45436749 None:intergenic 30.0%
AAATGCCATTGGAATTGTTT+CGG + Chr3:45437487-45437506 MsG0380013770.01.T01:CDS 30.0%
AACTTCATAAGGAAACCAAT+TGG + Chr3:45436176-45436195 MsG0380013770.01.T01:CDS 30.0%
AAGTAAAGGCTATACATTTG+TGG - Chr3:45434058-45434077 None:intergenic 30.0%
AAGTGTTAGTTACTAGTTAG+TGG - Chr3:45433701-45433720 None:intergenic 30.0%
AATCACAAACCCTAAGAATT+GGG + Chr3:45433138-45433157 MsG0380013770.01.T01:intron 30.0%
ACACTATTAACCTTCAAACA+GGG + Chr3:45435794-45435813 MsG0380013770.01.T01:CDS 30.0%
ACTAGTGGAAGTAAAGTTAA+AGG - Chr3:45434367-45434386 None:intergenic 30.0%
AGAAATCGCAAATATTACAG+GGG + Chr3:45435103-45435122 MsG0380013770.01.T01:intron 30.0%
AGAGTCATTGTATTTAGGAA+TGG + Chr3:45437848-45437867 MsG0380013770.01.T01:CDS 30.0%
AGATATTTCAAGGAAGAATG+TGG - Chr3:45436139-45436158 None:intergenic 30.0%
AGTGTGGTTATATAAGATGT+TGG - Chr3:45435581-45435600 None:intergenic 30.0%
ATAAGGAAATTAAGGATGAG+AGG - Chr3:45436582-45436601 None:intergenic 30.0%
ATATCCAAGATGGAAAGTTT+GGG - Chr3:45436774-45436793 None:intergenic 30.0%
ATCTAAACCGAATCCAAAAA+TGG + Chr3:45433391-45433410 MsG0380013770.01.T01:intron 30.0%
ATCTCATATTCCCTAATAAG+TGG - Chr3:45435345-45435364 None:intergenic 30.0%
CAAAAATGACAATATGACAG+GGG + Chr3:45434944-45434963 MsG0380013770.01.T01:intron 30.0%
CAGAAAAAGATTGTTGTGTT+TGG + Chr3:45435855-45435874 MsG0380013770.01.T01:CDS 30.0%
CAGAAATCGCAAATATTACA+GGG + Chr3:45435102-45435121 MsG0380013770.01.T01:intron 30.0%
CTCTCTTATAACCAAATACA+AGG + Chr3:45436460-45436479 MsG0380013770.01.T01:CDS 30.0%
GAAATTCTCTCAAATTACAG+AGG + Chr3:45434974-45434993 MsG0380013770.01.T01:intron 30.0%
GAGTCATTGTATTTAGGAAT+GGG + Chr3:45437849-45437868 MsG0380013770.01.T01:CDS 30.0%
GATCATAATAATTTCACAGG+AGG + Chr3:45436958-45436977 MsG0380013770.01.T01:CDS 30.0%
GATGTTCTTGATCAATTTCT+TGG - Chr3:45432938-45432957 None:intergenic 30.0%
GGATAATGATAGTTAGTAGT+TGG - Chr3:45433776-45433795 None:intergenic 30.0%
GTGAGATTAAAAAACCCATT+TGG - Chr3:45436346-45436365 None:intergenic 30.0%
GTTTGAAAAATGTACGTAAG+TGG - Chr3:45435547-45435566 None:intergenic 30.0%
TAAGAGAGATTGAATAGTTG+TGG - Chr3:45437264-45437283 None:intergenic 30.0%
TATATAAGATGTTGGCACAT+GGG - Chr3:45435573-45435592 None:intergenic 30.0%
TATATCCAAGATGGAAAGTT+TGG - Chr3:45436775-45436794 None:intergenic 30.0%
TCCTCTTAATAACTGTACAA+CGG + Chr3:45437776-45437795 MsG0380013770.01.T01:CDS 30.0%
TCCTTAATTTCCTTATCCAT+TGG + Chr3:45436586-45436605 MsG0380013770.01.T01:CDS 30.0%
TGTACAGTCAAAATTCATGA+AGG - Chr3:45434926-45434945 None:intergenic 30.0%
TGTTTCTTATTAGGAAATGG+AGG + Chr3:45437913-45437932 MsG0380013770.01.T01:CDS 30.0%
TGTTTGTAATATTGTCGCAA+AGG - Chr3:45435889-45435908 None:intergenic 30.0%
TTATATAAGATGTTGGCACA+TGG - Chr3:45435574-45435593 None:intergenic 30.0%
TTCGGTTTAGATTTCTCTAT+TGG - Chr3:45433383-45433402 None:intergenic 30.0%
TTCTGTGTATATATCCAAGA+TGG - Chr3:45436784-45436803 None:intergenic 30.0%
TTGAAAAAGTAGGAAAGACT+TGG - Chr3:45435467-45435486 None:intergenic 30.0%
TTGAATCGGAATTTGTGAAA+TGG + Chr3:45433066-45433085 MsG0380013770.01.T01:intron 30.0%
TTTACCCTGAATGTATAAAG+TGG + Chr3:45434410-45434429 MsG0380013770.01.T01:intron 30.0%
TTTGTTCAATTTCTTGTGTG+CGG - Chr3:45434175-45434194 None:intergenic 30.0%
! AAAGGTCTGTCAAATTTTGA+AGG - Chr3:45436438-45436457 None:intergenic 30.0%
! ATTCACTATTTGAAGCCAAT+TGG - Chr3:45436194-45436213 None:intergenic 30.0%
! CATGTCTCTTTTAACCTTTT+TGG + Chr3:45437644-45437663 MsG0380013770.01.T01:CDS 30.0%
! CTCTACAACAATCATTTTAC+GGG + Chr3:45435926-45435945 MsG0380013770.01.T01:CDS 30.0%
! GTCATTCTTCTTTCCATTTT+TGG - Chr3:45433407-45433426 None:intergenic 30.0%
! GTGGTTCTATGTTTCTTATT+AGG + Chr3:45437904-45437923 MsG0380013770.01.T01:CDS 30.0%
! TACTTTGTTGTCAAACACTA+AGG - Chr3:45435249-45435268 None:intergenic 30.0%
! TGGTAACTTATGTGATTTTG+TGG + Chr3:45434298-45434317 MsG0380013770.01.T01:intron 30.0%
! TTCAAGTTAGAGAAGTACAA+TGG - Chr3:45437123-45437142 None:intergenic 30.0%
! TTCATTTTCTGCTAAGTTCA+TGG - Chr3:45437157-45437176 None:intergenic 30.0%
! TTTTAACCATTCGATCACTT+TGG + Chr3:45434478-45434497 MsG0380013770.01.T01:intron 30.0%
! TTTTATCCAAAGTGATCGAA+TGG - Chr3:45434487-45434506 None:intergenic 30.0%
!! AAGTTTTGTGACATCTTGAT+TGG - Chr3:45437195-45437214 None:intergenic 30.0%
!! ATCAATTTCGCTTTTGTGTT+CGG - Chr3:45432890-45432909 None:intergenic 30.0%
!! CTTCTTTCCATTTTTGGATT+CGG - Chr3:45433401-45433420 None:intergenic 30.0%
!! TTCAAGTTTTTCCAACTATG+TGG - Chr3:45437051-45437070 None:intergenic 30.0%
!! TTCGTTTTTCCTTTGCAAAA+CGG - Chr3:45432973-45432992 None:intergenic 30.0%
!! TTTCTGTTAGTTGATAGAGT+GGG + Chr3:45437945-45437964 MsG0380013770.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTTGAAAATCCAACGAGAA+AGG + Chr3:45437427-45437446 MsG0380013770.01.T01:CDS 30.0%
!!! AGAAATGTAACTGGTTTTTG+TGG + Chr3:45434761-45434780 MsG0380013770.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTTTATAGGAGGGTAAAC+CGG - Chr3:45434856-45434875 None:intergenic 30.0%
AAACCCATTTGGTAAATGAG+AGG - Chr3:45436335-45436354 None:intergenic 35.0%
AAAGATTGTTGTGTTTGGGA+AGG + Chr3:45435860-45435879 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
AAGCATTAATTCGCTTGACT+TGG - Chr3:45434085-45434104 None:intergenic 35.0%
AAGGAATAGATCCTTGTAGT+TGG - Chr3:45436546-45436565 None:intergenic 35.0%
AATTGCGAACAGAATCGTAA+AGG + Chr3:45433189-45433208 MsG0380013770.01.T01:intron 35.0%
ACTCGGAACAATTTAGTGTA+AGG - Chr3:45436930-45436949 None:intergenic 35.0%
ACTGAGGTTGAGATATTTCA+AGG - Chr3:45436149-45436168 None:intergenic 35.0%
ACTTGAGTTTCTCAGTTACT+TGG + Chr3:45435973-45435992 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
AGAGAAATTATTAGCGCCAA+TGG - Chr3:45436605-45436624 None:intergenic 35.0%
ATATCTAGACTTATCGAGCT+CGG + Chr3:45436813-45436832 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
ATGTGTGATGTTGTGTTGAA+TGG - Chr3:45436038-45436057 None:intergenic 35.0%
ATTATGAAACATGGCATCCA+TGG + Chr3:45433570-45433589 MsG0380013770.01.T01:intron 35.0%
ATTATTAGCGCCAATGGATA+AGG - Chr3:45436599-45436618 None:intergenic 35.0%
ATTGGCAATCCTAAACTATG+TGG + Chr3:45437750-45437769 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
ATTGGCGCTAATAATTTCTC+TGG + Chr3:45436604-45436623 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
ATTGTATTTAGGAATGGGAG+TGG + Chr3:45437854-45437873 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
CAAACGAACGTAACTGATAT+AGG + Chr3:45433428-45433447 MsG0380013770.01.T01:intron 35.0%
CACAATTGAAATTGACGGTT+TGG - Chr3:45433043-45433062 None:intergenic 35.0%
CAGTGGAATTGAACTTCATA+AGG + Chr3:45436165-45436184 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
CATAATATGGTATCAGAGAC+TGG - Chr3:45433556-45433575 None:intergenic 35.0%
CCAGAAATCGCAAATATTAC+AGG + Chr3:45435101-45435120 MsG0380013770.01.T01:intron 35.0%
CCTGTAATATTTGCGATTTC+TGG - Chr3:45435104-45435123 None:intergenic 35.0%
CTACGACAAACTACACATAA+CGG + Chr3:45435435-45435454 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
CTGTATGCTATCTAATCCTA+TGG - Chr3:45433896-45433915 None:intergenic 35.0%
CTTGCACATAACAAACTTTC+CGG + Chr3:45437300-45437319 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
GAACCCAATCCAAATCAAAT+TGG - Chr3:45436705-45436724 None:intergenic 35.0%
GAATCACAAACCCTAAGAAT+TGG + Chr3:45433137-45433156 MsG0380013770.01.T01:intron 35.0%
GACACTATTAACCTTCAAAC+AGG + Chr3:45435793-45435812 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
GATGTCACAAAACTTACAAG+TGG + Chr3:45437200-45437219 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
GCCAATGGATAAGGAAATTA+AGG - Chr3:45436590-45436609 None:intergenic 35.0%
GGATGCCATGTTTCATAATA+TGG - Chr3:45433569-45433588 None:intergenic 35.0%
GTACATCAAGGCCTATTTAT+AGG + Chr3:45433672-45433691 MsG0380013770.01.T01:intron 35.0%
TAAGAAAGGAAGGACAGAAA+AGG + Chr3:45433461-45433480 MsG0380013770.01.T01:intron 35.0%
TATGAAGTTCAATTCCACTG+AGG - Chr3:45436165-45436184 None:intergenic 35.0%
TATTTCTCTCATTCCTTCCA+TGG - Chr3:45433590-45433609 None:intergenic 35.0%
TCACCTCTCATTTACCAAAT+GGG + Chr3:45436329-45436348 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
TCCGTTGTACAGTTATTAAG+AGG - Chr3:45437780-45437799 None:intergenic 35.0%
TGCAAAGGAAAAACGAATCA+CGG + Chr3:45432976-45432995 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
TGGAGAGCTTCATAATTCAA+TGG - Chr3:45434516-45434535 None:intergenic 35.0%
TGGTCCACTTTATACATTCA+GGG - Chr3:45434417-45434436 None:intergenic 35.0%
TGTCTACAACTTGACTGATA+TGG + Chr3:45437338-45437357 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
TTAAGAGATTCTTGCTAGTG+TGG - Chr3:45435597-45435616 None:intergenic 35.0%
TTACGATTCTGTTCGCAATT+TGG - Chr3:45433189-45433208 None:intergenic 35.0%
TTCACCTCTCATTTACCAAA+TGG + Chr3:45436328-45436347 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
TTGAAATATCTCAACCTCAG+TGG + Chr3:45436148-45436167 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
TTGTATTTAGGAATGGGAGT+GGG + Chr3:45437855-45437874 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
TTGTGACATCTTGATTGGTA+TGG - Chr3:45437190-45437209 None:intergenic 35.0%
TTGTTCAATTTCTTGTGTGC+GGG - Chr3:45434174-45434193 None:intergenic 35.0%
TTGTTGTAACTAACTGCCAT+AGG + Chr3:45433877-45433896 MsG0380013770.01.T01:intron 35.0%
TTTAATGCATCGAGCTACAT+TGG + Chr3:45437732-45437751 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
! AAGCCATTGGTGATATGTTT+GGG - Chr3:45436987-45437006 None:intergenic 35.0%
! AATTGAAATTGACGGTTTGG+TGG - Chr3:45433040-45433059 None:intergenic 35.0%
! ACATTTTGTAATGTGGATGC+AGG + Chr3:45435372-45435391 MsG0380013770.01.T01:intron 35.0%
! ATTTTCTCGAGAAAATGCAG+CGG + Chr3:45433506-45433525 MsG0380013770.01.T01:intron 35.0%
! GATTGGAGGCATGAAAAATA+TGG + Chr3:45437572-45437591 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
! GTGATTTTGTGGTTTCCATT+TGG + Chr3:45434309-45434328 MsG0380013770.01.T01:intron 35.0%
! GTTAGTGGATGCCTATAAAT+AGG - Chr3:45433686-45433705 None:intergenic 35.0%
!! AGAGATCAAGGTGTTGAATA+TGG - Chr3:45436516-45436535 None:intergenic 35.0%
!! CTTGACTTGGTCAAAAGTAA+AGG - Chr3:45434072-45434091 None:intergenic 35.0%
!! CTTTCTGTTAGTTGATAGAG+TGG + Chr3:45437944-45437963 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
!! GAGATCAAGGTGTTGAATAT+GGG - Chr3:45436515-45436534 None:intergenic 35.0%
!! GTTTTGGTCTGATATCAACA+TGG + Chr3:45435828-45435847 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
!!! GTTTTTTGGTGAAATTCCTC+AGG + Chr3:45437620-45437639 MsG0380013770.01.T01:CDS 35.0%
AAAACGAATCACGGTGAAAC+AGG + Chr3:45432985-45433004 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
AAATCAACCCAAGAAGCCAT+TGG - Chr3:45437000-45437019 None:intergenic 40.0%
AACCAAGATTATCCATGTGC+AGG - Chr3:45436108-45436127 None:intergenic 40.0%
ACAACGGAAGAAGAAAATCC+TGG + Chr3:45437792-45437811 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
ACAAGCCGAAACAATTCCAA+TGG - Chr3:45437495-45437514 None:intergenic 40.0%
ACAATACCGAACAAGATTGG+AGG + Chr3:45437558-45437577 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
ACATATCACCAATGGCTTCT+TGG + Chr3:45436989-45437008 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
ACCAAGATTATCCATGTGCA+GGG - Chr3:45436107-45436126 None:intergenic 40.0%
ACTCCCAAACATATCACCAA+TGG + Chr3:45436981-45437000 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
AGGAAGGACAGAAAAGGAAA+CGG + Chr3:45433467-45433486 MsG0380013770.01.T01:intron 40.0%
AGGTAAGAGAGTTGAAAAGG+AGG - Chr3:45436727-45436746 None:intergenic 40.0%
ATATGGTATCAGAGACTGGT+TGG - Chr3:45433552-45433571 None:intergenic 40.0%
ATCATTGATGCCCTGTTTGA+AGG - Chr3:45435807-45435826 None:intergenic 40.0%
ATCTCACCTATCTTGACCTT+CGG + Chr3:45436371-45436390 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
ATGTGGAATTGATCCTGAGA+AGG - Chr3:45437034-45437053 None:intergenic 40.0%
ATTGCGCAAGTCCACTTATT+AGG + Chr3:45435331-45435350 MsG0380013770.01.T01:intron 40.0%
CAGGATCAATTCCACATAGT+TGG + Chr3:45437037-45437056 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
CATAATAACTTTGACCCTCC+AGG + Chr3:45434021-45434040 MsG0380013770.01.T01:intron 40.0%
CATATCACCAATGGCTTCTT+GGG + Chr3:45436990-45437009 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
CATTTCTCCAGACAAGCTAT+TGG - Chr3:45437472-45437491 None:intergenic 40.0%
CTGGAACTGATCCTTGTATT+TGG - Chr3:45436474-45436493 None:intergenic 40.0%
CTGGTCCACTTTATACATTC+AGG - Chr3:45434418-45434437 None:intergenic 40.0%
GAGAGATTGAATAGTTGTGG+TGG - Chr3:45437261-45437280 None:intergenic 40.0%
GCTCTAACTAACTTCAGACT+TGG + Chr3:45433731-45433750 MsG0380013770.01.T01:intron 40.0%
GGAACAATACCGAACAAGAT+TGG + Chr3:45437555-45437574 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
GGATCAGTTCCAGTAGAAAT+AGG + Chr3:45436481-45436500 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
GGATCTATTCCTTCAACTCT+AGG + Chr3:45436553-45436572 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
GGGTTTACCATTCAACTAGA+AGG - Chr3:45434154-45434173 None:intergenic 40.0%
GTACTCTAGATGACTCACAA+AGG + Chr3:45434437-45434456 MsG0380013770.01.T01:intron 40.0%
GTCAAACACTAAGGCACAAT+TGG - Chr3:45435240-45435259 None:intergenic 40.0%
GTCAAGATAGGTGAGATCTT+TGG - Chr3:45436368-45436387 None:intergenic 40.0%
GTGATGTTGTGTTGAATGGA+TGG - Chr3:45436034-45436053 None:intergenic 40.0%
GTTAAAAGAGACATGTCCTG+AGG - Chr3:45437639-45437658 None:intergenic 40.0%
TATCTAGACTTATCGAGCTC+GGG + Chr3:45436814-45436833 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
TCTGGCGTAATAGGTTGTAT+GGG + Chr3:45437091-45437110 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
TCTTCATTCTCTGCATTTCC+AGG - Chr3:45437813-45437832 None:intergenic 40.0%
TGAAGGTTTAGCAAGCTTGA+AGG - Chr3:45436421-45436440 None:intergenic 40.0%
TGCACATGGATAATCTTGGT+TGG + Chr3:45436107-45436126 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
TTATGAAGCTCTCCAAGAGT+AGG + Chr3:45434521-45434540 MsG0380013770.01.T01:intron 40.0%
TTCATGCCTCCAATCTTGTT+CGG - Chr3:45437567-45437586 None:intergenic 40.0%
TTGCGCAAGTCCACTTATTA+GGG + Chr3:45435332-45435351 MsG0380013770.01.T01:intron 40.0%
TTGTAATGTGGATGCAGGAA+TGG + Chr3:45435377-45435396 MsG0380013770.01.T01:intron 40.0%
TTGTCTTACAACTCCTTCTC+AGG + Chr3:45437018-45437037 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
! AGTATTGGAACCACCAGTTT+GGG + Chr3:45435405-45435424 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
! CGTTATGTGTAGTTTGTCGT+AGG - Chr3:45435437-45435456 None:intergenic 40.0%
! CTCTCTGAAAACCAACTACA+AGG + Chr3:45436532-45436551 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
! GAAGCCATTGGTGATATGTT+TGG - Chr3:45436988-45437007 None:intergenic 40.0%
! GTCAAGTTGTAGACACACTT+TGG - Chr3:45437333-45437352 None:intergenic 40.0%
! TCGGATAATCCGTTTTGCAA+AGG + Chr3:45432961-45432980 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
! TTCAGGTCCTTCTAGTTGAA+TGG + Chr3:45434144-45434163 MsG0380013770.01.T01:intron 40.0%
! TTGTGAGTCATCTAGAGTAC+TGG - Chr3:45434437-45434456 None:intergenic 40.0%
! TTTGAAGTTGTGTTCCGATC+GGG - Chr3:45437710-45437729 None:intergenic 40.0%
!! AATTTCGCTTTTGTGTTCGG+TGG - Chr3:45432887-45432906 None:intergenic 40.0%
!! CAGGGCATCAATGATAGTTT+TGG + Chr3:45435812-45435831 MsG0380013770.01.T01:CDS 40.0%
!! CGGAAAGTTTGTTATGTGCA+AGG - Chr3:45437302-45437321 None:intergenic 40.0%
!! CTTTGAAGTTGTGTTCCGAT+CGG - Chr3:45437711-45437730 None:intergenic 40.0%
!! GATTGCTGCAAATGGTTTTG+TGG - Chr3:45435739-45435758 None:intergenic 40.0%
!!! GTTGGTTTTCAGAGAGATCA+AGG - Chr3:45436528-45436547 None:intergenic 40.0%
AACTGAGAGTCATGAACCTC+TGG + Chr3:45437073-45437092 MsG0380013770.01.T01:CDS 45.0%
AAGGCCCAAACTTTCCATCT+TGG + Chr3:45436767-45436786 MsG0380013770.01.T01:CDS 45.0%
ACCCTGCACATGGATAATCT+TGG + Chr3:45436103-45436122 MsG0380013770.01.T01:CDS 45.0%
AGAGGAGCTCCACATAGTTT+AGG - Chr3:45437762-45437781 None:intergenic 45.0%
ATGCAGCGGAAAATCCTTCA+AGG + Chr3:45433520-45433539 MsG0380013770.01.T01:intron 45.0%
ATGTACGTAAGTGGACAGCA+TGG - Chr3:45435538-45435557 None:intergenic 45.0%
CAACAGATGGGAAGTTGTTC+AGG - Chr3:45436258-45436277 None:intergenic 45.0%
CAACAGTTATACCCTGCACA+TGG + Chr3:45436093-45436112 MsG0380013770.01.T01:CDS 45.0%
CAATAGTTCGCCTTTCTCGT+TGG - Chr3:45437440-45437459 None:intergenic 45.0%
CACTGTGTGATTGCTGCAAA+TGG - Chr3:45435747-45435766 None:intergenic 45.0%
CATACAACCTATTACGCCAG+AGG - Chr3:45437092-45437111 None:intergenic 45.0%
CATGTATATTGCTTCCCCGA+AGG - Chr3:45436390-45436409 None:intergenic 45.0%
CATTTGCAGCAATCACACAG+TGG + Chr3:45435745-45435764 MsG0380013770.01.T01:intron 45.0%
CTCTGGCGTAATAGGTTGTA+TGG + Chr3:45437090-45437109 MsG0380013770.01.T01:CDS 45.0%
CTGGCGTAATAGGTTGTATG+GGG + Chr3:45437092-45437111 MsG0380013770.01.T01:CDS 45.0%
CTTCGGGGAAGCAATATACA+TGG + Chr3:45436388-45436407 MsG0380013770.01.T01:CDS 45.0%
CTTGTCTGGAGAAATGCCAT+TGG + Chr3:45437476-45437495 MsG0380013770.01.T01:CDS 45.0%
GACACACTTTGGCATAGAAC+CGG - Chr3:45437322-45437341 None:intergenic 45.0%
GAGAGGTTTCCTAGAGTTGA+AGG - Chr3:45436565-45436584 None:intergenic 45.0%
GCAGGAATGGATAGCAGTAT+TGG + Chr3:45435390-45435409 MsG0380013770.01.T01:intron 45.0%
GGATTTGCAGTAGGTTTCTG+GGG + Chr3:45437876-45437895 MsG0380013770.01.T01:CDS 45.0%
GGGATTTGCAGTAGGTTTCT+GGG + Chr3:45437875-45437894 MsG0380013770.01.T01:CDS 45.0%
GTGCAGGGTATAACTGTTGA+GGG - Chr3:45436092-45436111 None:intergenic 45.0%
TCATGAACCTCTGGCGTAAT+AGG + Chr3:45437082-45437101 MsG0380013770.01.T01:CDS 45.0%
TCTCACCTATCTTGACCTTC+GGG + Chr3:45436372-45436391 MsG0380013770.01.T01:CDS 45.0%
TGAAACATGGCATCCATGGA+AGG + Chr3:45433574-45433593 MsG0380013770.01.T01:intron 45.0%
TGCAGGGTATAACTGTTGAG+GGG - Chr3:45436091-45436110 None:intergenic 45.0%
TGGGATTTGCAGTAGGTTTC+TGG + Chr3:45437874-45437893 MsG0380013770.01.T01:CDS 45.0%
TGTACGTAAGTGGACAGCAT+GGG - Chr3:45435537-45435556 None:intergenic 45.0%
TGTGCAGGGTATAACTGTTG+AGG - Chr3:45436093-45436112 None:intergenic 45.0%
TTTGACGGAAGAATCCCGAT+CGG + Chr3:45437693-45437712 MsG0380013770.01.T01:CDS 45.0%
TTTGTGGCATCTCAACTACC+TGG - Chr3:45434042-45434061 None:intergenic 45.0%
! CAGACAAGCTATTGGCTGAA+AGG - Chr3:45437464-45437483 None:intergenic 45.0%
! CAGTATTGGAACCACCAGTT+TGG + Chr3:45435404-45435423 MsG0380013770.01.T01:CDS 45.0%
! CTTTCAGCCAATAGCTTGTC+TGG + Chr3:45437462-45437481 MsG0380013770.01.T01:CDS 45.0%
! GATTTGCAGTAGGTTTCTGG+GGG + Chr3:45437877-45437896 MsG0380013770.01.T01:CDS 45.0%
! GGTGTTGAATATGGGCAAGT+TGG - Chr3:45436507-45436526 None:intergenic 45.0%
!! GCAAGTTGGCCTATTTCTAC+TGG - Chr3:45436493-45436512 None:intergenic 45.0%
!! ATAAATTAATATTTAAACTA+AGG - Chr3:45435145-45435164 None:intergenic 5.0%
!! TAAATTAATATTTAAACTAA+GGG - Chr3:45435144-45435163 None:intergenic 5.0%
!!! AATAAATTATGTTTTATTTT+AGG - Chr3:45434674-45434693 None:intergenic 5.0%
!!! AATCTAAATTATTTTTTTTA+CGG + Chr3:45435071-45435090 MsG0380013770.01.T01:intron 5.0%
ATGGGAGTGGGATTTGCAGT+AGG + Chr3:45437867-45437886 MsG0380013770.01.T01:CDS 50.0%
CAGCGGAAAATCCTTCAAGG+TGG + Chr3:45433523-45433542 MsG0380013770.01.T01:intron 50.0%
CAGGGTATAACTGTTGAGGG+GGG - Chr3:45436089-45436108 None:intergenic 50.0%
CTCACCTATCTTGACCTTCG+GGG + Chr3:45436373-45436392 MsG0380013770.01.T01:CDS 50.0%
GCAGGGTATAACTGTTGAGG+GGG - Chr3:45436090-45436109 None:intergenic 50.0%
GCGTAGCATAACAAAGCGAG+AGG - Chr3:45435308-45435327 None:intergenic 50.0%
GTACGTAAGTGGACAGCATG+GGG - Chr3:45435536-45435555 None:intergenic 50.0%
TGGCATCTCAACTACCTGGA+GGG - Chr3:45434038-45434057 None:intergenic 50.0%
TGTTGAGGGGGGATAAGTCA+AGG - Chr3:45436078-45436097 None:intergenic 50.0%
! CTGGTTGGTATCCACCTTGA+AGG - Chr3:45433537-45433556 None:intergenic 50.0%
GCTTCCCCGAAGGTCAAGAT+AGG - Chr3:45436380-45436399 None:intergenic 55.0%
GTGGCATCTCAACTACCTGG+AGG - Chr3:45434039-45434058 None:intergenic 55.0%
TAGGCATGCACCCAAACTGG+TGG - Chr3:45435418-45435437 None:intergenic 55.0%
TCGTAGGCATGCACCCAAAC+TGG - Chr3:45435421-45435440 None:intergenic 55.0%
! GTAGGTTTCTGGGGGATCTG+TGG + Chr3:45437885-45437904 MsG0380013770.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 45432874 45438022 45432874 ID=MsG0380013770.01;Name=MsG0380013770.01
Chr3 mRNA 45432874 45438022 45432874 ID=MsG0380013770.01.T01;Parent=MsG0380013770.01;Name=MsG0380013770.01.T01;_AED=0.50;_eAED=0.54;_QI=0|0|0|1|1|1|3|0|817
Chr3 exon 45432874 45433006 45432874 ID=MsG0380013770.01.T01:exon:4736;Parent=MsG0380013770.01.T01
Chr3 exon 45435394 45435456 45435394 ID=MsG0380013770.01.T01:exon:4737;Parent=MsG0380013770.01.T01
Chr3 exon 45435765 45438022 45435765 ID=MsG0380013770.01.T01:exon:4738;Parent=MsG0380013770.01.T01
Chr3 CDS 45432874 45433006 45432874 ID=MsG0380013770.01.T01:cds;Parent=MsG0380013770.01.T01
Chr3 CDS 45435394 45435456 45435394 ID=MsG0380013770.01.T01:cds;Parent=MsG0380013770.01.T01
Chr3 CDS 45435765 45438022 45435765 ID=MsG0380013770.01.T01:cds;Parent=MsG0380013770.01.T01
Gene Sequence

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Protein sequence

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