AlfalfaGEDB | MsG0380013773.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380013773.01

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MsG0380013773.01.T01	AT2G01820	25.292	257	161	11	409	639	69	320	7.27e-11	66.2
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Find 138 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 252 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TGGATTTGCAGCAGGTTTCT+GGG	0.377822	3:+45540055	MsG0380013773.01.T01:CDS
TGATCTCTACTACAATGAAT+TGG	0.380350	3:+45538228	MsG0380013773.01.T01:CDS
TATTCCAATTTGATTTGGAT+TGG	0.386112	3:+45538857	MsG0380013773.01.T01:CDS
TTGTCTTACAACTCCTTCTC+AGG	0.391480	3:+45539186	MsG0380013773.01.T01:CDS
CAGGATCAATTCCACATAGT+TGG	0.392506	3:+45539205	MsG0380013773.01.T01:CDS
ACTTGAATTTCTCAGTTACT+TGG	0.394571	3:+45538279	MsG0380013773.01.T01:CDS
TTTCATGTCTCCAATCATCT+TGG	0.395939	3:-45539733	None:intergenic
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CTTTGTTTCTCATTAGGAAA+TGG	0.422494	3:+45540090	MsG0380013773.01.T01:CDS
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TGAATGAATTTGATGAGATA+AGG	0.440325	3:+45538311	MsG0380013773.01.T01:CDS
ATCTTCATATGGAAACCAAC+TGG	0.440547	3:+45538479	MsG0380013773.01.T01:CDS
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TTGTGAGATCCCTACTGGTA+TGG	0.441537	3:-45539355	None:intergenic
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TAGGCCACTGGTGATATGTT+TGG	0.442182	3:-45539153	None:intergenic
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ATATCCAAAATGGAAAGTTT+GGG	0.447483	3:-45538930	None:intergenic
ATTGGCTCTAATAATTTCTC+TGG	0.450199	3:+45538763	MsG0380013773.01.T01:CDS
CATCTACAACTTGACTCATA+TGG	0.450201	3:+45539506	MsG0380013773.01.T01:CDS
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CTGTGGAGTAATAGGCTGTC+TGG	0.455115	3:+45539258	MsG0380013773.01.T01:CDS
TTGTATCTTGGCATGGGAGT+TGG	0.459044	3:+45540035	MsG0380013773.01.T01:CDS
GTCAAGATGAGTGAGATCTT+TGG	0.463090	3:-45538668	None:intergenic
TCTCTCTCATTTGTTTCACT+TGG	0.463373	3:+45539443	MsG0380013773.01.T01:CDS
AGGCCACTGGTGATATGTTT+GGG	0.465947	3:-45539152	None:intergenic
ATTGGAAATCCAAAATTATG+TGG	0.467597	3:+45539918	MsG0380013773.01.T01:CDS
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TTCAAGTTCTTCCAACTATG+TGG	0.478919	3:-45539216	None:intergenic
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CTTTCAGTCAATCACTTGAC+AGG	0.493532	3:+45539630	MsG0380013773.01.T01:CDS
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ATGTGTGCTATTGTGTTGAA+TGG	0.521729	3:-45538341	None:intergenic
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AAATTGTTCCTCCTTAGCGT+TGG	0.533430	3:+45539104	MsG0380013773.01.T01:CDS
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TCAATTGTTTAAAATCAAAG+AGG	0.555723	3:-45539296	None:intergenic
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AACTAGATGTCTTGAACCTG+TGG	0.567744	3:+45539241	MsG0380013773.01.T01:CDS
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AAATTCAAATACTCAACAGA+TGG	0.589499	3:-45538571	None:intergenic
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CAGACAGCCTATTACTCCAC+AGG	0.600655	3:-45539257	None:intergenic
CTTTCAGAGAGTCATATACA+TGG	0.601106	3:+45538691	MsG0380013773.01.T01:CDS
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AACTGTGTGATTGCTACACA+TGG	0.640389	3:-45538050	None:intergenic
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TTCCTGTAATGTTGTCACAG+TGG	0.716510	3:-45538192	None:intergenic
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GTCAAGTTGTAGATGCAGTG+TGG	0.786075	3:-45539498	None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
!!!	AGTTTTCTTTTTTTTTTTTT+TGG	+	Chr3:45537473-45537492	MsG0380013773.01.T01:intron	10.0%
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!!	TTATTTCAAAAATTTGGATA+TGG	+	Chr3:45536799-45536818	MsG0380013773.01.T01:intron	15.0%
!!!	AAAAGAAAACTTTTATTTAC+TGG	-	Chr3:45537464-45537483	None:intergenic	15.0%
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!!!	TTTTATATTCCAATTTGATT+TGG	+	Chr3:45538852-45538871	MsG0380013773.01.T01:CDS	15.0%
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!!!	TTTTGTGTATATATCCAAAA+TGG	-	Chr3:45538943-45538962	None:intergenic	20.0%
!	AAATTCAAATACTCAACAGA+TGG	-	Chr3:45538574-45538593	None:intergenic	25.0%
!	AACTGATGGTAATTAAACAA+AGG	+	Chr3:45537000-45537019	MsG0380013773.01.T01:intron	25.0%
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!	AATTTATGGAGAGAAAAGAT+AGG	+	Chr3:45536710-45536729	MsG0380013773.01.T01:intron	25.0%
!	ATATCCAAAATGGAAAGTTT+GGG	-	Chr3:45538933-45538952	None:intergenic	25.0%
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!	TTATCTCACAATAATTTGAC+TGG	+	Chr3:45539702-45539721	MsG0380013773.01.T01:CDS	25.0%
!	TTTACTGGGAGTAAAAATAA+AGG	-	Chr3:45537449-45537468	None:intergenic	25.0%
!!	CTCTCTAACAATAAGTTTTT+AGG	+	Chr3:45539774-45539793	MsG0380013773.01.T01:CDS	25.0%
!!!	AGATATTTTAAGGAAGAAAG+TGG	-	Chr3:45538442-45538461	None:intergenic	25.0%
!!!	ATTCCAATTTGATTTGGATT+GGG	+	Chr3:45538858-45538877	MsG0380013773.01.T01:CDS	25.0%
!!!	TATTCCAATTTGATTTGGAT+TGG	+	Chr3:45538857-45538876	MsG0380013773.01.T01:CDS	25.0%
!!!	TTTGAATTTGAGTTGCTATT+GGG	-	Chr3:45539878-45539897	None:intergenic	25.0%
	AAGGAAAAGGGTTTATTTGT+TGG	+	Chr3:45536833-45536852	MsG0380013773.01.T01:intron	30.0%
	AAGGAAGAAAATGAAACTGA+TGG	+	Chr3:45536986-45537005	MsG0380013773.01.T01:intron	30.0%
	AAGTTCCATTGGAATTGTTT+CGG	+	Chr3:45539655-45539674	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
	ACAATTGAACACCATGAATT+TGG	+	Chr3:45539311-45539330	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
	ACAGTTTCAATTCATGCAAA+TGG	-	Chr3:45537825-45537844	None:intergenic	30.0%
	ACATTGTTAACCTTCAAACA+GGG	+	Chr3:45538100-45538119	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
	ACTTGAATTTCTCAGTTACT+TGG	+	Chr3:45538279-45538298	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
	AGATTATTCATGTGCAGAAT+AGG	-	Chr3:45538406-45538425	None:intergenic	30.0%
	AGTTTCAATTCATGCAAATG+GGG	-	Chr3:45537823-45537842	None:intergenic	30.0%
	ATACACATAATCTTGACCTT+TGG	-	Chr3:45539580-45539599	None:intergenic	30.0%
	ATAGATAAGTTAAGGATGAG+AGG	-	Chr3:45538741-45538760	None:intergenic	30.0%
	CAATTGAACACCATGAATTT+GGG	+	Chr3:45539312-45539331	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
	CAGTTTCAATTCATGCAAAT+GGG	-	Chr3:45537824-45537843	None:intergenic	30.0%
	GAGAGATTTAATAGTTGTTG+TGG	-	Chr3:45539429-45539448	None:intergenic	30.0%
	GATTGGAGACATGAAAAATA+TGG	+	Chr3:45539740-45539759	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
	GATTTGTATTTCGCAATGAA+AGG	-	Chr3:45538906-45538925	None:intergenic	30.0%
	GCATACTTTCGGTTTATATA+TGG	+	Chr3:45540119-45540138	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
	GCCAATAGATAGATAAGTTA+AGG	-	Chr3:45538749-45538768	None:intergenic	30.0%
	GCCTTATAGAAAGAATAACT+GGG	+	Chr3:45539028-45539047	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
	GTAAGACAAATCAACATGAT+AGG	-	Chr3:45539175-45539194	None:intergenic	30.0%
	GTATATAAAGGGGAATTCTT+GGG	-	Chr3:45537179-45537198	None:intergenic	30.0%
	TATGTGGACAACATTCAAAT+GGG	-	Chr3:45537784-45537803	None:intergenic	30.0%
	TCATTGCGAAATACAAATCA+AGG	+	Chr3:45538907-45538926	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
	TCCTCTTAAAAATTGTACCA+AGG	+	Chr3:45539944-45539963	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
	TGAATCTAAACTAGAGAGTT+TGG	-	Chr3:45538812-45538831	None:intergenic	30.0%
	TGACATTTGTGAAGTAAGAA+TGG	-	Chr3:45537987-45538006	None:intergenic	30.0%
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	TGATCTCTACTACAATGAAT+TGG	+	Chr3:45538228-45538247	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
	TGCACATGAATAATCTTGAT+TGG	+	Chr3:45538410-45538429	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
	TGTATATAAAGGGGAATTCT+TGG	-	Chr3:45537180-45537199	None:intergenic	30.0%
	TTATGTGTATGATGTTAACC+GGG	+	Chr3:45539590-45539609	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
	TTATTAATAAGTGGCCCATT+AGG	-	Chr3:45537255-45537274	None:intergenic	30.0%
	TTGAGAGCCAATAAATTTGA+AGG	+	Chr3:45539396-45539415	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
	TTGGATCACAATAATTTCAC+AGG	+	Chr3:45539123-45539142	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
	TTTCGGTTTATATATGGAGT+GGG	+	Chr3:45540125-45540144	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
	TTTGGTAAACAACTCAATTG+TGG	-	Chr3:45539562-45539581	None:intergenic	30.0%
!	AACTAATGATAAGGGTATGA+TGG	-	Chr3:45537393-45537412	None:intergenic	30.0%
!	ACAATTGAGTTGTTTACCAA+AGG	+	Chr3:45539561-45539580	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
!	ACTAATGATAAGGGTATGAT+GGG	-	Chr3:45537392-45537411	None:intergenic	30.0%
!	AGCCTTATAGAAAGAATAAC+TGG	+	Chr3:45539027-45539046	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
!	ATCAGTTTCATTTTCTTCCT+TGG	-	Chr3:45536987-45537006	None:intergenic	30.0%
!	ATTCACTATTTGAAACCAGT+TGG	-	Chr3:45538497-45538516	None:intergenic	30.0%
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!	TCTGATTGTAAGAAAGTATG+TGG	-	Chr3:45537800-45537819	None:intergenic	30.0%
!	TTCATTTTCTCCCAAATTCA+TGG	-	Chr3:45539325-45539344	None:intergenic	30.0%
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!!	AAGGTTGATAAGAAAGTATG+TGG	-	Chr3:45537851-45537870	None:intergenic	30.0%
!!	ATTGGCTCTAATAATTTCTC+TGG	+	Chr3:45538763-45538782	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
!!	CTGTGTTACTGTTATTTCTT+TGG	-	Chr3:45536964-45536983	None:intergenic	30.0%
!!	GTTACTGTTATTTCTTTGGT+AGG	-	Chr3:45536960-45536979	None:intergenic	30.0%
!!	GTTGCTGTTTGAGAAAAAAT+AGG	+	Chr3:45536769-45536788	MsG0380013773.01.T01:intron	30.0%
!!	GTTTGAATTTGAGTTGCTAT+TGG	-	Chr3:45539879-45539898	None:intergenic	30.0%
!!	TCCTTGGTACAATTTTTAAG+AGG	-	Chr3:45539948-45539967	None:intergenic	30.0%
!!	TCTGTTGGTTCTTATCAAAT+TGG	-	Chr3:45536936-45536955	None:intergenic	30.0%
!!	TTTAGGATTTTCTTCTTCCT+TGG	-	Chr3:45539964-45539983	None:intergenic	30.0%
!!!	GCTTTTAGTTTTGTAGTTTG+CGG	+	Chr3:45536732-45536751	MsG0380013773.01.T01:intron	30.0%
!!!	TACTGATCATGAAGCTTTTT+TGG	+	Chr3:45539530-45539549	MsG0380013773.01.T01:CDS	30.0%
!!!	TTTATTTTGCCAAATCTGTG+CGG	+	Chr3:45537706-45537725	MsG0380013773.01.T01:intron	30.0%
	AAACCCATCAGGTATATGAA+AGG	-	Chr3:45538638-45538657	None:intergenic	35.0%
	AAATAACAGTAACACAGCCA+AGG	+	Chr3:45536967-45536986	MsG0380013773.01.T01:intron	35.0%
	AATTGCTTGAATCAGAGAAC+AGG	-	Chr3:45537950-45537969	None:intergenic	35.0%
	ACAGATTGAGCTTTCTGTTT+AGG	-	Chr3:45537142-45537161	None:intergenic	35.0%
	AGAATCATTGTATCTTGGCA+TGG	+	Chr3:45540028-45540047	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	AGGAGGAACAATTTAGTGTT+AGG	-	Chr3:45539098-45539117	None:intergenic	35.0%
	AGTAAGGTTAAGAAGACTAG+TGG	-	Chr3:45537341-45537360	None:intergenic	35.0%
	AGTGGTTAAGTTTACTAGTG+AGG	-	Chr3:45537323-45537342	None:intergenic	35.0%
	ATAAAGGTGAAGTCTGTGAT+AGG	-	Chr3:45537433-45537452	None:intergenic	35.0%
	ATCTTCATATGGAAACCAAC+TGG	+	Chr3:45538479-45538498	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	ATGTGGACAACATTCAAATG+GGG	-	Chr3:45537783-45537802	None:intergenic	35.0%
	ATTATTGTGATCCAACGCTA+AGG	-	Chr3:45539118-45539137	None:intergenic	35.0%
	ATTTCTTTGGTAGGATCTGT+TGG	-	Chr3:45536951-45536970	None:intergenic	35.0%
	CAGACTCTATGTAACTTTGA+TGG	+	Chr3:45540151-45540170	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	CAGATTGAGCTTTCTGTTTA+GGG	-	Chr3:45537141-45537160	None:intergenic	35.0%
	CATCTACAACTTGACTCATA+TGG	+	Chr3:45539506-45539525	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	CATGTATATGACTCTCTGAA+AGG	-	Chr3:45538693-45538712	None:intergenic	35.0%
	CTCTACTACAATGAATTGGA+AGG	+	Chr3:45538232-45538251	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	CTTGCACATAACAAACTTTC+CGG	+	Chr3:45539468-45539487	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	CTTTCAGAGAGTCATATACA+TGG	+	Chr3:45538691-45538710	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	CTTTCGGTTTATATATGGAG+TGG	+	Chr3:45540124-45540143	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	GAAAGGTAAGAGAGTTGAAA+AGG	-	Chr3:45538889-45538908	None:intergenic	35.0%
	GAATCATTGTATCTTGGCAT+GGG	+	Chr3:45540029-45540048	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	GACATTGTTAACCTTCAAAC+AGG	+	Chr3:45538099-45538118	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	GAGAAGGCAACTAATGATAA+GGG	-	Chr3:45537401-45537420	None:intergenic	35.0%
	GATAGTTGTAGGATAAGCTA+AGG	-	Chr3:45538384-45538403	None:intergenic	35.0%
	GATCACAATAATTTCACAGG+AGG	+	Chr3:45539126-45539145	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	GATCTCACAAAACTTACAAG+TGG	+	Chr3:45539368-45539387	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	GCCCAGTTATTCTTTCTATA+AGG	-	Chr3:45539032-45539051	None:intergenic	35.0%
	GTATGTGGACAACATTCAAA+TGG	-	Chr3:45537785-45537804	None:intergenic	35.0%
	GTGAGATTAAAAAACCCATC+AGG	-	Chr3:45538649-45538668	None:intergenic	35.0%
	TAAAATATCTCGACCTTACC+TGG	+	Chr3:45538452-45538471	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	TACCTGGATTGATCTTCATA+TGG	+	Chr3:45538468-45538487	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	TATGAAGATCAATCCAGGTA+AGG	-	Chr3:45538468-45538487	None:intergenic	35.0%
	TCACCTTTCATATACCTGAT+GGG	+	Chr3:45538632-45538651	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	TCTCTCTCATTTGTTTCACT+TGG	+	Chr3:45539443-45539462	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	TGAGAAGGCAACTAATGATA+AGG	-	Chr3:45537402-45537421	None:intergenic	35.0%
	TGTTTCTCATTAGGAAATGG+AGG	+	Chr3:45540093-45540112	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	TTCACCTTTCATATACCTGA+TGG	+	Chr3:45538631-45538650	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
	TTCATGTCTCCAATCATCTT+GGG	-	Chr3:45539735-45539754	None:intergenic	35.0%
	TTCCATATGAAGATCAATCC+AGG	-	Chr3:45538473-45538492	None:intergenic	35.0%
	TTTCATGTCTCCAATCATCT+TGG	-	Chr3:45539736-45539755	None:intergenic	35.0%
	TTTGATGCATCAAGCTTCAT+TGG	+	Chr3:45539900-45539919	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
!	AGATGCACATTGCTATTCTT+TGG	-	Chr3:45537547-45537566	None:intergenic	35.0%
!	ATGTGTGCTATTGTGTTGAA+TGG	-	Chr3:45538344-45538363	None:intergenic	35.0%
!	CCAAGCACAACAATCTTTTT+CGG	-	Chr3:45538164-45538183	None:intergenic	35.0%
!	GGTAAGGTCGAGATATTTTA+AGG	-	Chr3:45538452-45538471	None:intergenic	35.0%
!	GTGGTTCTTTGTTTCTCATT+AGG	+	Chr3:45540084-45540103	MsG0380013773.01.T01:CDS	35.0%
!	TTCAAGTTCTTCCAACTATG+TGG	-	Chr3:45539219-45539238	None:intergenic	35.0%
!!	AAGGGTTTATTTGTTGGCTT+AGG	+	Chr3:45536839-45536858	MsG0380013773.01.T01:intron	35.0%
!!	GTTCTGAGATCTTGAGTTAT+GGG	-	Chr3:45537901-45537920	None:intergenic	35.0%
!!	TGTTCTGAGATCTTGAGTTA+TGG	-	Chr3:45537902-45537921	None:intergenic	35.0%
!!!	TCTGACTGGTTTTGATTCTT+GGG	+	Chr3:45536864-45536883	MsG0380013773.01.T01:intron	35.0%
!!!	TTAGTTTTGTAGTTTGCGGA+AGG	+	Chr3:45536736-45536755	MsG0380013773.01.T01:intron	35.0%
!!!	TTCTGACTGGTTTTGATTCT+TGG	+	Chr3:45536863-45536882	MsG0380013773.01.T01:intron	35.0%
	AAAGATTGTTGTGCTTGGAG+AGG	+	Chr3:45538166-45538185	MsG0380013773.01.T01:CDS	40.0%
	AAATCAACATGATAGGCCAC+TGG	-	Chr3:45539168-45539187	None:intergenic	40.0%
	AAATTGTTCCTCCTTAGCGT+TGG	+	Chr3:45539104-45539123	MsG0380013773.01.T01:CDS	40.0%
	AACTAGATGTCTTGAACCTG+TGG	+	Chr3:45539241-45539260	MsG0380013773.01.T01:CDS	40.0%
	AACTGTGTGATTGCTACACA+TGG	-	Chr3:45538053-45538072	None:intergenic	40.0%
	AATTCTCGACTTATCGAGCT+CGG	+	Chr3:45538972-45538991	MsG0380013773.01.T01:CDS	40.0%
	ACAAGCCGAAACAATTCCAA+TGG	-	Chr3:45539663-45539682	None:intergenic	40.0%
	AGACAGCGATATTGAAGATC+CGG	+	Chr3:45536901-45536920	MsG0380013773.01.T01:intron	40.0%
	AGGTAAGAGAGTTGAAAAGG+AGG	-	Chr3:45538886-45538905	None:intergenic	40.0%
	ATATTGAAGATCCGGTAGGT+CGG	+	Chr3:45536909-45536928	MsG0380013773.01.T01:intron	40.0%
	ATCATTGATGCCCTGTTTGA+AGG	-	Chr3:45538113-45538132	None:intergenic	40.0%
	ATGTGGAATTGATCCTGAGA+AGG	-	Chr3:45539202-45539221	None:intergenic	40.0%
	CAACAGATGGAAAGTTGTTC+AGG	-	Chr3:45538561-45538580	None:intergenic	40.0%
	CAATGAATACCGCACAGATT+TGG	-	Chr3:45537718-45537737	None:intergenic	40.0%
	CAGGATCAATTCCACATAGT+TGG	+	Chr3:45539205-45539224	MsG0380013773.01.T01:CDS	40.0%
	CATTAGTTGCCTTCTCATGT+GGG	+	Chr3:45537405-45537424	MsG0380013773.01.T01:intron	40.0%
	CCGAAAAAGATTGTTGTGCT+TGG	+	Chr3:45538161-45538180	MsG0380013773.01.T01:CDS	40.0%
	CTGTCAAGTGATTGACTGAA+AGG	-	Chr3:45539632-45539651	None:intergenic	40.0%
	CTTTCAGTCAATCACTTGAC+AGG	+	Chr3:45539630-45539649	MsG0380013773.01.T01:CDS	40.0%
	GATTCCTCTCTGAGTTATGT+CGG	-	Chr3:45537109-45537128	None:intergenic	40.0%
	GCATCAATGATAGACATGGT+CGG	+	Chr3:45538122-45538141	MsG0380013773.01.T01:CDS	40.0%
	GGAACAATACCCAAGATGAT+TGG	+	Chr3:45539723-45539742	MsG0380013773.01.T01:CDS	40.0%
	GGACCCAATCCAAATCAAAT+TGG	-	Chr3:45538864-45538883	None:intergenic	40.0%
	GGCTCTCTTAAACTTTCTAG+AGG	+	Chr3:45539815-45539834	MsG0380013773.01.T01:CDS	40.0%
	GGTAAGAGAGTTGAAAAGGA+GGG	-	Chr3:45538885-45538904	None:intergenic	40.0%
	GTCAAGATGAGTGAGATCTT+TGG	-	Chr3:45538671-45538690	None:intergenic	40.0%
	GTGCAGAATAGGATAGTTGT+AGG	-	Chr3:45538395-45538414	None:intergenic	40.0%
	TCATTAGTTGCCTTCTCATG+TGG	+	Chr3:45537404-45537423	MsG0380013773.01.T01:intron	40.0%
	TCTTGAACCTGTGGAGTAAT+AGG	+	Chr3:45539250-45539269	MsG0380013773.01.T01:CDS	40.0%
	TGATTCTTGGGCAACAGAAA+AGG	+	Chr3:45536876-45536895	MsG0380013773.01.T01:intron	40.0%
	TGTATGATGTTAACCGGGAT+AGG	+	Chr3:45539595-45539614	MsG0380013773.01.T01:CDS	40.0%
	TTCCTGTAATGTTGTCACAG+TGG	-	Chr3:45538195-45538214	None:intergenic	40.0%
	TTGTCTTACAACTCCTTCTC+AGG	+	Chr3:45539186-45539205	MsG0380013773.01.T01:CDS	40.0%
!	AAGGCCCAAACTTTCCATTT+TGG	+	Chr3:45538926-45538945	MsG0380013773.01.T01:CDS	40.0%
!	AATGGAGGCATGCATACTTT+CGG	+	Chr3:45540108-45540127	MsG0380013773.01.T01:CDS	40.0%
!	AGAGGAGCTCCACATAATTT+TGG	-	Chr3:45539930-45539949	None:intergenic	40.0%
!	GTAGATAGCGTTGCAGTTTT+AGG	-	Chr3:45539981-45540000	None:intergenic	40.0%
!	GTGCTATTGTGTTGAATGGA+TGG	-	Chr3:45538340-45538359	None:intergenic	40.0%
!	TTTGTAGTTTGCGGAAGGAA+GGG	+	Chr3:45536741-45536760	MsG0380013773.01.T01:intron	40.0%
!!	AAGTTTTGTGAGATCCCTAC+TGG	-	Chr3:45539363-45539382	None:intergenic	40.0%
!!	CGGAAAGTTTGTTATGTGCA+AGG	-	Chr3:45539470-45539489	None:intergenic	40.0%
!!	GATTGCTACACATGGTTTTG+TGG	-	Chr3:45538045-45538064	None:intergenic	40.0%
!!	TTTCTGGAACCATACCAGTA+GGG	+	Chr3:45539346-45539365	MsG0380013773.01.T01:CDS	40.0%
!!	TTTTGTAGTTTGCGGAAGGA+AGG	+	Chr3:45536740-45536759	MsG0380013773.01.T01:intron	40.0%
!!!	TTTTCTGGAACCATACCAGT+AGG	+	Chr3:45539345-45539364	MsG0380013773.01.T01:CDS	40.0%
	ACTCCCAAACATATCACCAG+TGG	+	Chr3:45539149-45539168	MsG0380013773.01.T01:CDS	45.0%
	AGCGATATTGAAGATCCGGT+AGG	+	Chr3:45536905-45536924	MsG0380013773.01.T01:intron	45.0%
	AGGCCACTGGTGATATGTTT+GGG	-	Chr3:45539155-45539174	None:intergenic	45.0%
	AGGTGAAATTCCTCAGAGCA+TGG	+	Chr3:45539794-45539813	MsG0380013773.01.T01:CDS	45.0%
	ATCAAATTGGTCCGACCTAC+CGG	-	Chr3:45536923-45536942	None:intergenic	45.0%
	ATTCTCGACTTATCGAGCTC+GGG	+	Chr3:45538973-45538992	MsG0380013773.01.T01:CDS	45.0%
	ATTGTGATCCAACGCTAAGG+AGG	-	Chr3:45539115-45539134	None:intergenic	45.0%
	CTTGACAGGAGAAGTTCCAT+TGG	+	Chr3:45539644-45539663	MsG0380013773.01.T01:CDS	45.0%
	GAGAGGTTTAGCAAGCTTGA+AGG	-	Chr3:45538724-45538743	None:intergenic	45.0%
	GGGAATTCTTGGGAGTTCTA+GGG	-	Chr3:45537169-45537188	None:intergenic	45.0%
	GTCCACTGTGACAACATTAC+AGG	+	Chr3:45538190-45538209	MsG0380013773.01.T01:CDS	45.0%
	TAGGCCACTGGTGATATGTT+TGG	-	Chr3:45539156-45539175	None:intergenic	45.0%
	TGATAGGATCCCACATGAGA+AGG	-	Chr3:45537417-45537436	None:intergenic	45.0%
	TGGATTTGCAGCAGGTTTCT+GGG	+	Chr3:45540055-45540074	MsG0380013773.01.T01:CDS	45.0%
	TTATGTCGGAGCTTTGCTCT+GGG	-	Chr3:45537095-45537114	None:intergenic	45.0%
	TTGGATTTGCAGCAGGTTTC+TGG	+	Chr3:45540054-45540073	MsG0380013773.01.T01:CDS	45.0%
	TTGTAGATGCAGTGTGGCAA+AGG	-	Chr3:45539495-45539514	None:intergenic	45.0%
	TTGTATCTTGGCATGGGAGT+TGG	+	Chr3:45540035-45540054	MsG0380013773.01.T01:CDS	45.0%
	TTGTGAGATCCCTACTGGTA+TGG	-	Chr3:45539358-45539377	None:intergenic	45.0%
	TTTAAGAGAGCCATGCTCTG+AGG	-	Chr3:45539807-45539826	None:intergenic	45.0%
!	CAGGGCATCAATGATAGACA+TGG	+	Chr3:45538118-45538137	MsG0380013773.01.T01:CDS	45.0%
!	GTCAAGTTGTAGATGCAGTG+TGG	-	Chr3:45539501-45539520	None:intergenic	45.0%
!	TTGTAGTTTGCGGAAGGAAG+GGG	+	Chr3:45536742-45536761	MsG0380013773.01.T01:intron	45.0%
!	TTTCTGTTTAGGGCCAGAGT+AGG	-	Chr3:45537131-45537150	None:intergenic	45.0%
!!	TGTTGGCTTAGGTTTCTGAC+TGG	+	Chr3:45536850-45536869	MsG0380013773.01.T01:intron	45.0%
	AGCTCCGACATAACTCAGAG+AGG	+	Chr3:45537102-45537121	MsG0380013773.01.T01:intron	50.0%
	ATCGAGCTCGGGAATTTCGT+TGG	+	Chr3:45538984-45539003	MsG0380013773.01.T01:CDS	50.0%
	ATGGGAGTTGGATTTGCAGC+AGG	+	Chr3:45540047-45540066	MsG0380013773.01.T01:CDS	50.0%
	CAGACAGCCTATTACTCCAC+AGG	-	Chr3:45539260-45539279	None:intergenic	50.0%
	CTCAGAGAGGAATCCTACTC+TGG	+	Chr3:45537115-45537134	MsG0380013773.01.T01:intron	50.0%
	CTGTGGAGTAATAGGCTGTC+TGG	+	Chr3:45539258-45539277	MsG0380013773.01.T01:CDS	50.0%
	GACATGGTCGGATATCAACG+TGG	+	Chr3:45538134-45538153	MsG0380013773.01.T01:CDS	50.0%
	GCTTGCGAGCGAAAGGAAAA+GGG	+	Chr3:45536821-45536840	MsG0380013773.01.T01:intron	50.0%
	GGATTTGCAGCAGGTTTCTG+GGG	+	Chr3:45540056-45540075	MsG0380013773.01.T01:CDS	50.0%
	GGGGAATTCTTGGGAGTTCT+AGG	-	Chr3:45537170-45537189	None:intergenic	50.0%
	GGTCAATAGTTCGCCTATCC+CGG	-	Chr3:45539611-45539630	None:intergenic	50.0%
	GTTATGTCGGAGCTTTGCTC+TGG	-	Chr3:45537096-45537115	None:intergenic	50.0%
	GATGCAGTGTGGCAAAGGTC+CGG	-	Chr3:45539490-45539509	None:intergenic	55.0%
	GGCTTGCGAGCGAAAGGAAA+AGG	+	Chr3:45536820-45536839	MsG0380013773.01.T01:intron	55.0%
!	GGATATGGCTTGCGAGCGAA+AGG	+	Chr3:45536814-45536833	MsG0380013773.01.T01:intron	55.0%
!!	GCAGGTTTCTGGGGCATTTG+TGG	+	Chr3:45540065-45540084	MsG0380013773.01.T01:CDS	55.0%

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Gene Sequence

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ATGGCTGATGCGCAATTATTATTCATGATGACCATTCTTACTTCACAAATGTCACTTCTTTTGCTTATACTTTTATCTATAACTACATTCCACAAAACCATGTGTAGCAATCACACAGTTGTTCAATGTAATGAGAAAGATCGAGAGACATTGTTAACCTTCAAACAGGGCATCAATGATAGACATGGTCGGATATCAACGTGGTCAACCGAAAAAGATTGTTGTGCTTGGAGAGGTGTCCACTGTGACAACATTACAGGAAGAGTTACAAAACTTGATCTCTACTACAATGAATTGGAAGGTGAGATGAATCTTTGTATTCTTGAACTTGAATTTCTCAGTTACTTGGATTTGAGTCTGAATGAATTTGATGAGATAAGGATTCCATCCATTCAACACAATAGCACACATTCATCTAAACTTGTCTACCTTAGCTTATCCTACAACTATCCTATTCTGCACATGAATAATCTTGATTGGCTTTCTCCACTTTCTTCCTTAAAATATCTCGACCTTACCTGGATTGATCTTCATATGGAAACCAACTGGTTTCAAATAGTGAATACACTTCCTTCACTATTAGAATTACATTTGCTTGAATGTTACCTGAACAACTTTCCATCTGTTGAGTATTTGAATTTGTCTTCACTTGTAACTCTTGATCTTTCAAACAACAACTTCACCTTTCATATACCTGATGGGTTTTTTAATCTCACCAAAGATCTCACTCATCTTGACCTTTCAGAGAGTCATATACATGGTGAGATACCTTCAAGCTTGCTAAACCTCTCATCCTTAACTTATCTATCTATTGGCTCTAATAATTTCTCTGGTGAAATTTCAAATTTACATTTTTCCAAACTCTCTAGTTTAGATTCACTAGACTTGAGTTATTCAAATTTTATATTCCAATTTGATTTGGATTGGGTCCCTCCTTTTCAACTCTCTTACCTTTCATTGCGAAATACAAATCAAGGCCCAAACTTTCCATTTTGGATATATACACAAAAGTCATTGCAAATTCTCGACTTATCGAGCTCGGGAATTTCGTTGGTAGATAGAAAGAAGTTCTCGAGCCTTATAGAAAGAATAACTGGGCGACTTGTTTTGTCAAACAATTCGATTGCTGAAGACATATCTAACCTAACACTAAATTGTTCCTCCTTAGCGTTGGATCACAATAATTTCACAGGAGGACTCCCAAACATATCACCAGTGGCCTATCATGTTGATTTGTCTTACAACTCCTTCTCAGGATCAATTCCACATAGTTGGAAGAACTTGAAAGAACTAGATGTCTTGAACCTGTGGAGTAATAGGCTGTCTGGTGAAGTTCCATTAAACCTCTTTGATTTTAAACAATTGAACACCATGAATTTGGGAGAAAATGAATTTTCTGGAACCATACCAGTAGGGATCTCACAAAACTTACAAGTGGTCATATTGAGAGCCAATAAATTTGAAGGGACTATTCCACAACAACTATTAAATCTCTCTCATTTGTTTCACTTGGACCTTGCACATAACAAACTTTCCGGACCTTTGCCACACTGCATCTACAACTTGACTCATATGGTTACTGATCATGAAGCTTTTTTGGATAGTACCACAATTGAGTTGTTTACCAAAGGTCAAGATTATGTGTATGATGTTAACCGGGATAGGCGAACTATTGACCTTTCAGTCAATCACTTGACAGGAGAAGTTCCATTGGAATTGTTTCGGCTTGTTCAAGTTCAAACATTAAACTTATCTCACAATAATTTGACTGGAACAATACCCAAGATGATTGGAGACATGAAAAATATGGAATCTCTCGACCTCTCTAACAATAAGTTTTTAGGTGAAATTCCTCAGAGCATGGCTCTCTTAAACTTTCTAGAGGTTTTGAATTTATCTTGCAATAATTTTAGCGGAACAATCCCAATAGCAACTCAAATTCAAACTTTTGATGCATCAAGCTTCATTGGAAATCCAAAATTATGTGGAGCTCCTCTTAAAAATTGTACCAAGGAAGAAGAAAATCCTAAAACTGCAACGCTATCTACAGAGAATGAAGATGAAGACTCTATAAAAGAATCATTGTATCTTGGCATGGGAGTTGGATTTGCAGCAGGTTTCTGGGGCATTTGTGGTTCTTTGTTTCTCATTAGGAAATGGAGGCATGCATACTTTCGGTTTATATATGGAGTGGGTAACAGACTCTATGTAACTTTGATGGTAAAGTTAAATAGCTTTCGCAGAAATTGA

Protein sequence

>MsG0380013773.01.T01

MADAQLLFMMTILTSQMSLLLLILLSITTFHKTMCSNHTVVQCNEKDRETLLTFKQGINDRHGRISTWSTEKDCCAWRGVHCDNITGRVTKLDLYYNELEGEMNLCILELEFLSYLDLSLNEFDEIRIPSIQHNSTHSSKLVYLSLSYNYPILHMNNLDWLSPLSSLKYLDLTWIDLHMETNWFQIVNTLPSLLELHLLECYLNNFPSVEYLNLSSLVTLDLSNNNFTFHIPDGFFNLTKDLTHLDLSESHIHGEIPSSLLNLSSLTYLSIGSNNFSGEISNLHFSKLSSLDSLDLSYSNFIFQFDLDWVPPFQLSYLSLRNTNQGPNFPFWIYTQKSLQILDLSSSGISLVDRKKFSSLIERITGRLVLSNNSIAEDISNLTLNCSSLALDHNNFTGGLPNISPVAYHVDLSYNSFSGSIPHSWKNLKELDVLNLWSNRLSGEVPLNLFDFKQLNTMNLGENEFSGTIPVGISQNLQVVILRANKFEGTIPQQLLNLSHLFHLDLAHNKLSGPLPHCIYNLTHMVTDHEAFLDSTTIELFTKGQDYVYDVNRDRRTIDLSVNHLTGEVPLELFRLVQVQTLNLSHNNLTGTIPKMIGDMKNMESLDLSNNKFLGEIPQSMALLNFLEVLNLSCNNFSGTIPIATQIQTFDASSFIGNPKLCGAPLKNCTKEEENPKTATLSTENEDEDSIKESLYLGMGVGFAAGFWGICGSLFLIRKWRHAYFRFIYGVGNRLYVTLMVKLNSFRRN*