AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380015136.01

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MsG0380015136.01.T01 AT1G01390 23.892 406 259 13 2 371 4 395 9.49e-20 90.9
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MsG0380015136.01.T07 AT4G15280 42.222 90 42 3 3 85 291 377 1.59e-11 59.3
MsG0380015136.01.T07 AT3G53150 39.535 86 44 2 3 85 318 398 1.98e-11 59.3
MsG0380015136.01.T07 AT1G30530 37.805 82 41 2 4 85 292 363 2.22e-11 58.9
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MsG0380015136.01.T03 AT4G15280 24.165 389 250 9 6 367 36 406 2.97e-25 107
MsG0380015136.01.T03 AT1G51210 27.604 384 232 16 6 374 20 372 3.17e-25 106
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MsG0380015136.01.T03 AT2G15480 26.355 406 241 17 1 371 5 387 6.33e-24 103
MsG0380015136.01.T03 AT5G66690 24.691 405 230 10 6 370 7 376 7.29e-24 103
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MsG0380015136.01.T03 AT2G18570 26.835 395 235 12 6 371 5 374 1.39e-23 102
MsG0380015136.01.T03 AT2G15490 26.566 399 242 16 6 371 7 387 1.66e-23 102
MsG0380015136.01.T03 AT2G15490 27.020 396 241 17 6 371 7 384 2.57e-23 101
MsG0380015136.01.T03 AT4G34131 26.942 412 218 16 6 370 10 385 3.32e-23 101
MsG0380015136.01.T03 AT4G15260 29.104 268 153 9 121 370 9 257 3.51e-23 99.8
MsG0380015136.01.T03 AT3G55710 26.923 390 231 14 6 370 8 368 5.19e-23 100
MsG0380015136.01.T03 AT3G21780 28.467 274 150 9 121 370 121 372 7.48e-23 100
MsG0380015136.01.T03 AT2G18560 37.705 183 76 6 211 371 118 284 8.81e-23 99.0
MsG0380015136.01.T03 AT3G53150 26.303 403 241 17 2 370 18 398 1.70e-22 99.4
MsG0380015136.01.T03 AT5G03490 27.320 388 233 16 6 374 19 376 2.93e-22 98.6
MsG0380015136.01.T03 AT1G01420 27.204 397 230 14 6 370 8 377 3.05e-22 98.6
MsG0380015136.01.T03 AT1G01420 27.204 397 230 14 6 370 11 380 4.04e-22 98.2
MsG0380015136.01.T03 AT5G14860 25.693 397 250 13 1 370 3 381 6.90e-22 97.4
MsG0380015136.01.T03 AT2G16890 26.463 393 241 14 2 370 5 373 1.35e-21 96.3
MsG0380015136.01.T03 AT5G12890 28.117 409 230 18 2 370 4 388 2.06e-21 96.3
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MsG0380015136.01.T03 AT2G16890 26.463 393 241 14 2 370 5 373 3.62e-21 95.5
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MsG0380015136.01.T03 AT1G01390 24.337 415 260 13 2 385 21 412 1.90e-20 93.2
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MsG0380015136.01.T05 AT1G05560 46.736 383 172 11 6 381 55 412 7.05e-99 304
MsG0380015136.01.T05 AT4G15490 34.761 397 216 13 2 381 4 374 1.14e-66 219
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MsG0380015136.01.T05 AT2G23250 33.854 384 203 16 9 381 1 344 1.11e-52 182
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MsG0380015136.01.T05 AT2G23210 31.930 285 168 13 2 281 6 269 1.04e-26 108
MsG0380015136.01.T05 AT3G11340 24.935 385 235 14 8 378 11 355 1.49e-26 110
MsG0380015136.01.T05 AT3G21790 31.000 300 167 11 98 381 106 381 3.06e-26 110
MsG0380015136.01.T05 AT1G22370 34.906 212 123 5 173 381 19 218 3.91e-26 107
MsG0380015136.01.T05 AT3G46720 26.221 389 239 13 2 381 5 354 5.06e-26 109
MsG0380015136.01.T05 AT3G16520 30.738 244 144 9 143 381 149 372 6.62e-26 109
MsG0380015136.01.T05 AT2G29710 27.318 399 239 16 3 381 2 369 6.97e-26 109
MsG0380015136.01.T05 AT2G36790 27.833 406 233 18 6 382 13 387 7.30e-26 109
MsG0380015136.01.T05 AT3G16520 30.738 244 144 9 143 381 149 372 7.67e-26 108
MsG0380015136.01.T05 AT3G16520 30.738 244 144 9 143 381 149 372 9.28e-26 108
MsG0380015136.01.T05 AT4G34135 26.790 433 217 16 1 381 1 385 1.12e-25 108
MsG0380015136.01.T05 AT5G05890 26.764 411 253 15 1 391 1 383 2.14e-25 107
MsG0380015136.01.T05 AT1G73880 26.829 410 229 18 6 385 14 382 2.22e-25 107
MsG0380015136.01.T05 AT3G53160 28.000 400 238 19 6 381 8 381 2.92e-25 107
MsG0380015136.01.T05 AT2G15480 26.634 413 242 18 1 382 5 387 4.19e-25 107
MsG0380015136.01.T05 AT2G15480 26.634 413 242 18 1 382 5 387 4.74e-25 107
MsG0380015136.01.T05 AT5G05880 26.485 404 243 12 8 391 10 379 5.15e-25 106
MsG0380015136.01.T05 AT4G15280 23.907 389 262 8 6 378 4 374 6.00e-25 106
MsG0380015136.01.T05 AT4G15280 24.872 390 257 10 6 378 36 406 8.13e-25 106
MsG0380015136.01.T05 AT4G15260 30.258 271 157 9 121 381 9 257 8.34e-25 104
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MsG0380015136.01.T05 AT1G01420 27.204 397 241 14 6 381 8 377 7.61e-23 100
MsG0380015136.01.T05 AT2G15490 26.617 402 249 17 6 382 7 387 7.74e-23 100
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MsG0380015136.01.T05 AT2G16890 26.799 403 238 16 2 381 5 373 6.18e-21 94.7
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MsG0380015136.01.T02 AT1G05560 46.214 383 164 11 6 371 55 412 3.49e-99 304
MsG0380015136.01.T02 AT4G15490 34.872 390 215 12 2 371 4 374 8.49e-68 222
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MsG0380015136.01.T02 AT2G31750 35.958 381 203 15 6 371 8 362 5.31e-55 189
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MsG0380015136.01.T02 AT1G22400 28.780 410 253 11 2 382 9 408 5.68e-46 164
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MsG0380015136.01.T02 AT3G46670 28.084 381 236 12 4 371 7 362 2.16e-30 121
MsG0380015136.01.T02 AT3G55700 28.424 387 232 16 3 371 5 364 3.51e-30 121
MsG0380015136.01.T02 AT5G05900 27.806 392 242 12 8 381 10 378 4.52e-30 120
MsG0380015136.01.T02 AT5G38010 27.692 390 232 14 3 371 7 367 6.29e-30 120
MsG0380015136.01.T02 AT4G01070 28.148 405 227 12 2 372 4 378 6.80e-30 120
MsG0380015136.01.T02 AT2G36760 26.357 387 251 12 6 371 14 387 8.47e-30 120
MsG0380015136.01.T02 AT3G46660 27.632 380 233 15 8 371 16 369 1.07e-29 119
MsG0380015136.01.T02 AT5G37950 28.904 301 166 10 84 371 68 333 1.45e-29 117
MsG0380015136.01.T02 AT2G30150 28.198 383 225 13 10 377 1 348 1.90e-29 119
MsG0380015136.01.T02 AT2G36750 25.964 389 249 15 6 371 10 382 2.77e-29 119
MsG0380015136.01.T02 AT1G07250 26.683 401 237 14 1 368 1 377 3.26e-29 118
MsG0380015136.01.T02 AT2G36800 27.179 390 247 14 6 372 12 387 4.03e-29 118
MsG0380015136.01.T02 AT2G29750 27.889 398 238 12 3 371 5 382 4.41e-29 118
MsG0380015136.01.T02 AT5G38040 28.000 375 222 13 15 371 19 363 6.27e-29 117
MsG0380015136.01.T02 AT5G05870 28.756 386 234 11 4 371 6 368 1.53e-28 116
MsG0380015136.01.T02 AT5G37950 28.477 302 172 10 84 371 68 339 9.75e-28 112
MsG0380015136.01.T02 AT3G11340 25.132 378 233 13 8 368 11 355 1.11e-27 114
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MsG0380015136.01.T02 AT5G05860 29.211 380 224 13 8 371 11 361 7.07e-27 111
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MsG0380015136.01.T02 AT3G21790 30.303 297 163 12 98 371 106 381 4.56e-25 107
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MsG0380015136.01.T02 AT4G15280 24.165 389 251 9 6 368 36 406 1.47e-24 105
MsG0380015136.01.T02 AT3G16520 29.339 242 140 9 143 371 149 372 1.88e-24 104
MsG0380015136.01.T02 AT3G16520 29.339 242 140 9 143 371 149 372 1.88e-24 104
MsG0380015136.01.T02 AT3G16520 29.339 242 140 9 143 371 149 372 2.30e-24 104
MsG0380015136.01.T02 AT1G51210 26.873 387 232 17 6 375 20 372 2.33e-24 104
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MsG0380015136.01.T02 AT2G15480 26.355 406 242 17 1 372 5 387 1.41e-23 102
MsG0380015136.01.T02 AT4G15260 29.478 268 153 9 121 371 9 257 2.46e-23 100
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MsG0380015136.01.T02 AT2G15490 26.768 396 243 16 6 372 7 384 8.92e-23 100
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MsG0380015136.01.T02 AT1G01420 26.952 397 232 14 6 371 11 380 8.59e-22 97.4
MsG0380015136.01.T02 AT5G03490 26.478 389 236 15 6 375 19 376 1.56e-21 96.3
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MsG0380015136.01.T02 AT2G16890 25.823 395 242 15 2 371 5 373 1.14e-20 94.0
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MsG0380015136.01.T02 AT1G01390 24.578 415 260 14 2 386 21 412 2.03e-20 93.2
MsG0380015136.01.T02 AT3G21750 24.427 393 240 14 6 368 4 369 3.59e-20 92.4
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MsG0380015136.01.T04 AT1G05560 46.959 296 129 7 8 291 139 418 3.35e-75 239
MsG0380015136.01.T04 AT4G14090 43.667 300 145 7 1 291 86 370 2.34e-73 233
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MsG0380015136.01.T04 AT3G21560 34.708 291 164 7 8 285 103 380 7.88e-50 172
MsG0380015136.01.T04 AT4G15480 35.640 289 164 8 8 285 109 386 8.98e-47 164
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MsG0380015136.01.T04 AT2G23260 31.457 302 167 8 1 285 84 362 1.48e-43 155
MsG0380015136.01.T04 AT1G05675 36.332 289 154 8 12 285 89 362 7.49e-42 150
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MsG0380015136.01.T04 AT1G24100 34.437 302 159 8 4 285 85 367 2.89e-40 146
MsG0380015136.01.T04 AT2G43840 33.333 303 157 11 1 285 80 355 7.96e-40 145
MsG0380015136.01.T04 AT2G31790 33.333 303 169 8 1 285 79 366 3.87e-39 143
MsG0380015136.01.T04 AT2G31750 36.462 277 129 12 27 285 115 362 1.52e-35 133
MsG0380015136.01.T04 AT2G31750 36.462 277 129 12 27 285 115 362 3.02e-35 133
MsG0380015136.01.T04 AT2G30140 33.813 278 154 10 23 291 107 363 1.66e-34 130
MsG0380015136.01.T04 AT1G22370 30.903 288 170 7 17 285 111 388 1.33e-33 128
MsG0380015136.01.T04 AT2G30140 33.452 281 150 10 23 291 107 362 2.00e-33 127
MsG0380015136.01.T04 AT1G22340 29.693 293 173 8 17 285 111 394 2.89e-33 127
MsG0380015136.01.T04 AT1G22400 30.033 303 168 9 25 296 119 408 7.75e-33 126
MsG0380015136.01.T04 AT2G28080 30.970 268 156 9 29 282 130 382 1.64e-32 125
MsG0380015136.01.T04 AT2G36970 32.517 286 157 11 19 286 116 383 2.51e-32 125
MsG0380015136.01.T04 AT5G59590 30.375 293 176 9 2 285 90 363 2.70e-32 124
MsG0380015136.01.T04 AT1G78270 30.421 309 180 10 2 285 95 393 4.76e-32 124
MsG0380015136.01.T04 AT1G22360 29.252 294 172 8 17 285 108 390 4.81e-32 124
MsG0380015136.01.T04 AT1G22360 29.252 294 172 8 17 285 108 390 6.11e-32 124
MsG0380015136.01.T04 AT5G37950 30.169 295 164 10 4 285 68 333 1.74e-31 120
MsG0380015136.01.T04 AT1G07260 33.984 256 143 9 40 282 134 376 5.70e-31 121
MsG0380015136.01.T04 AT1G22380 28.669 293 175 8 17 285 111 393 2.06e-30 120
MsG0380015136.01.T04 AT3G46700 31.449 283 157 8 20 285 96 358 2.06e-30 119
MsG0380015136.01.T04 AT5G59580 31.186 295 170 10 2 285 89 361 3.53e-30 119
MsG0380015136.01.T04 AT3G21790 32.258 279 169 9 18 282 106 378 8.89e-30 118
MsG0380015136.01.T04 AT3G16520 32.328 232 140 8 63 285 149 372 9.68e-30 117
MsG0380015136.01.T04 AT3G16520 32.328 232 140 8 63 285 149 372 1.04e-29 117
MsG0380015136.01.T04 AT2G29740 33.333 255 148 9 41 285 140 382 1.24e-29 117
MsG0380015136.01.T04 AT5G37950 29.730 296 170 10 4 285 68 339 1.24e-29 115
MsG0380015136.01.T04 AT3G16520 32.328 232 140 8 63 285 149 372 1.38e-29 117
MsG0380015136.01.T04 AT3G21760 32.567 261 147 10 41 282 131 381 3.76e-29 116
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MsG0380015136.01.T04 AT3G46690 31.959 291 174 11 19 298 100 377 5.38e-29 115
MsG0380015136.01.T04 AT5G38010 31.273 275 156 10 26 285 111 367 3.02e-28 113
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MsG0380015136.01.T04 AT2G30150 30.634 284 156 8 23 291 91 348 7.27e-28 112
MsG0380015136.01.T04 AT3G46680 30.182 275 168 9 21 285 103 363 1.61e-27 111
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MsG0380015136.01.T04 AT5G38040 29.749 279 163 8 22 285 103 363 3.13e-27 110
MsG0380015136.01.T04 AT1G22370 34.615 208 113 4 93 285 19 218 3.73e-27 108
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MsG0380015136.01.T04 AT3G21780 30.233 258 155 8 41 282 121 369 6.65e-27 110
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MsG0380015136.01.T04 AT2G18570 38.323 167 92 3 131 286 208 374 1.04e-25 106
MsG0380015136.01.T04 AT3G55700 33.465 254 145 10 41 285 126 364 1.14e-25 106
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MsG0380015136.01.T04 AT4G15280 27.941 272 178 6 23 282 141 406 2.02e-25 105
MsG0380015136.01.T04 AT2G36750 30.142 282 159 11 24 285 119 382 5.33e-24 102
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MsG0380015136.01.T04 AT3G21750 27.402 281 182 8 17 282 96 369 7.47e-24 101
MsG0380015136.01.T04 AT5G05900 28.803 309 188 10 2 295 87 378 1.34e-23 100
MsG0380015136.01.T04 AT5G05870 39.506 162 87 5 131 285 211 368 2.22e-23 100
MsG0380015136.01.T04 AT1G73880 35.099 151 82 3 148 289 239 382 2.41e-23 99.8
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MsG0380015136.01.T04 AT5G05860 32.203 295 169 11 2 285 87 361 2.60e-23 99.8
MsG0380015136.01.T04 AT1G01420 29.412 289 181 11 12 285 100 380 2.61e-23 99.8
MsG0380015136.01.T04 AT3G21800 30.350 257 158 10 41 282 125 375 3.72e-23 99.4
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MsG0380015136.01.T04 AT2G36770 28.125 288 174 9 17 286 116 388 3.79e-22 96.7
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MsG0380015136.01.T04 AT2G36780 36.628 172 86 4 131 286 224 388 2.20e-21 94.4
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MsG0380015136.01.T04 AT1G01390 28.682 258 165 8 41 285 143 394 2.69e-21 94.0
MsG0380015136.01.T04 AT5G12890 30.070 286 180 10 10 285 113 388 3.21e-21 94.0
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MsG0380015136.01.T04 AT4G34138 39.655 116 60 2 174 286 279 387 9.04e-20 89.7
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MsG0380015136.01.T04 AT2G36800 28.114 281 170 9 24 286 121 387 1.21e-19 89.4
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MsG0380015136.01.T04 AT2G36760 26.351 296 181 9 11 285 108 387 3.67e-19 87.8
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MsG0380015136.01.T04 AT2G16890 44.167 120 54 5 169 285 264 373 2.37e-18 85.5
MsG0380015136.01.T04 AT3G53150 27.336 289 170 12 20 285 127 398 3.15e-18 85.1
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MsG0380015136.01.T04 AT2G36790 39.516 124 64 2 167 286 271 387 2.49e-17 82.4
MsG0380015136.01.T04 AT1G30530 24.643 280 192 9 11 285 98 363 4.12e-17 81.6
MsG0380015136.01.T04 AT5G17030 30.723 166 96 5 129 285 213 368 1.44e-15 77.0
MsG0380015136.01.T04 AT2G23210 31.633 196 105 10 6 185 87 269 7.62e-15 73.9
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MsG0380015136.01.T04 AT5G54060 33.835 133 75 4 158 284 248 373 1.28e-13 71.2
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MsG0380015136.01.T04 AT5G53990 31.818 154 84 6 153 296 220 362 3.13e-13 70.1
MsG0380015136.01.T04 AT3G29630 24.809 262 144 8 29 284 110 324 5.34e-13 69.3
MsG0380015136.01.T04 AT4G27560 30.496 141 77 5 153 284 226 354 3.32e-12 67.0
MsG0380015136.01.T04 AT4G27570 29.787 141 78 5 153 284 226 354 4.69e-12 66.6
MsG0380015136.01.T04 AT1G64910 28.000 150 95 4 153 296 220 362 1.04e-11 65.5
MsG0380015136.01.T06 AT1G05560 57.576 99 37 3 12 107 363 459 9.53e-30 110
MsG0380015136.01.T06 AT1G05560 57.576 99 37 3 12 107 413 509 1.06e-29 110
MsG0380015136.01.T06 AT4G14090 53.191 94 43 1 8 100 361 454 2.05e-27 104
MsG0380015136.01.T06 AT1G05530 53.846 91 39 2 12 101 366 454 1.00e-26 102
MsG0380015136.01.T06 AT4G15550 56.383 94 34 4 12 100 381 472 3.47e-26 100
MsG0380015136.01.T06 AT1G05680 51.685 89 41 2 12 99 363 450 9.12e-26 99.8
MsG0380015136.01.T06 AT2G43820 50.000 96 45 3 10 103 354 448 1.77e-25 99.0
MsG0380015136.01.T06 AT2G31790 54.545 88 38 2 12 98 367 453 3.93e-25 97.8
MsG0380015136.01.T06 AT2G43840 52.174 92 41 3 12 101 356 446 5.19e-25 97.4
MsG0380015136.01.T06 AT2G43840 52.174 92 41 3 12 101 356 446 5.56e-25 97.4
MsG0380015136.01.T06 AT1G05675 48.864 88 45 0 12 99 363 450 9.31e-25 97.1
MsG0380015136.01.T06 AT1G24100 49.462 93 44 3 12 102 368 459 3.68e-22 89.7
MsG0380015136.01.T06 AT3G21560 51.579 95 42 3 12 103 381 474 5.76e-21 86.7
MsG0380015136.01.T06 AT2G31750 43.478 92 50 2 12 101 363 454 2.08e-20 84.7
MsG0380015136.01.T06 AT2G31750 43.478 92 50 2 12 101 363 454 2.23e-20 84.7
MsG0380015136.01.T06 AT4G15500 42.268 97 50 3 12 104 371 465 3.33e-18 78.6
MsG0380015136.01.T06 AT4G15480 50.000 96 42 4 12 103 387 480 3.84e-18 78.6
MsG0380015136.01.T06 AT2G23260 42.857 91 51 1 12 101 363 453 4.67e-18 78.2
MsG0380015136.01.T06 AT4G15490 46.875 96 45 4 12 103 375 468 4.75e-18 78.2
MsG0380015136.01.T06 AT2G23250 40.659 91 53 1 12 101 345 435 2.68e-17 75.9
MsG0380015136.01.T06 AT2G30140 37.500 96 56 3 12 103 357 452 6.85e-13 63.5
MsG0380015136.01.T06 AT2G30140 37.500 96 56 3 12 103 358 453 7.56e-13 63.5
MsG0380015136.01.T06 AT3G02100 38.043 92 55 1 12 103 372 461 1.23e-12 62.8
MsG0380015136.01.T06 AT2G30150 35.052 97 59 3 12 104 359 455 3.25e-12 61.6
MsG0380015136.01.T06 AT2G30150 35.052 97 59 3 12 104 343 439 4.25e-12 61.2
MsG0380015136.01.T06 AT5G05860 33.333 90 56 1 12 101 362 447 2.90e-11 58.9

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GTTGATTCCATCTGCTTTCT+TGG 0.163724 3:+65733880 MsG0380015136.01.T05:CDS
CGCCAAGCGTCTCATTTCTT+TGG 0.182545 3:+65733235 MsG0380015136.01.T05:CDS
GAACTTGAGAGGAATGTTAA+TGG 0.297084 3:+65734175 MsG0380015136.01.T05:CDS
GCACGTGCATTGTTGGATTC+TGG 0.303779 3:+65734064 MsG0380015136.01.T05:CDS
GCCAAGCGTCTCATTTCTTT+GGG 0.317837 3:+65733236 MsG0380015136.01.T05:CDS
TCTACACTCTCATACTTTCA+TGG 0.343729 3:+65733492 MsG0380015136.01.T05:CDS
AAATGAGACGCTTGGCGAAT+TGG 0.344551 3:-65733229 None:intergenic
CTTTGGAAAGTTTGAGTTCA+GGG 0.347586 3:+65734284 MsG0380015136.01.T05:CDS
GGTTTATGTGACCTTGTATT+GGG 0.347870 3:-65733199 None:intergenic
TCTGTTGTTTATGTTTCCTT+TGG 0.362252 3:+65734001 MsG0380015136.01.T05:CDS
AACATGTTCAATATCTTTAC+CGG 0.365722 3:+65733646 MsG0380015136.01.T05:CDS
ATTGAAGATGTGTGGAAGAC+TGG 0.369778 3:+65734360 MsG0380015136.01.T06:CDS
TGAGGAAATTAGAAAGTGTT+TGG 0.376286 3:+65734422 MsG0380015136.01.T06:CDS
ATCAACAAACCAACCATTCC+CGG 0.385515 3:+65733305 MsG0380015136.01.T05:CDS
CCACACATCTTCAATTAACT+TGG 0.389712 3:-65734352 None:intergenic
GAAGGTGGCGAAGGAGAGGC+CGG 0.398831 3:-65733324 None:intergenic
TGCTAAGAAATGGAAAGATT+TGG 0.401099 3:+65734488 MsG0380015136.01.T06:CDS
GAATGGTTGGTTTGTTGATA+AGG 0.402080 3:-65733301 None:intergenic
CATTGAATGGTTGGATTCAA+AGG 0.402466 3:+65733970 MsG0380015136.01.T05:CDS
GATAGTGAAATGGTGTAGTC+AGG 0.409431 3:+65734201 MsG0380015136.01.T05:CDS
ACTTTGGAAAGTTTGAGTTC+AGG 0.410228 3:+65734283 MsG0380015136.01.T05:CDS
GGGTTTATGTGACCTTGTAT+TGG 0.410596 3:-65733200 None:intergenic
CACCGTTGAGGAGTTTGAAC+TGG 0.417216 3:+65733805 MsG0380015136.01.T05:CDS
TGAAGCTCATGCGCCACCTT+GGG 0.422160 3:-65733518 None:intergenic
CGCTTGGCGAATTGGAGAGC+AGG 0.427310 3:-65733221 None:intergenic
TCGTTTGGTGGTGACGTTGT+CGG 0.435311 3:+65733926 MsG0380015136.01.T05:CDS
GGATGATTACATTGAATGGT+TGG 0.440664 3:+65733961 MsG0380015136.01.T05:CDS
GTTTGAGTTCAGGGTTCCTA+TGG 0.442274 3:+65734293 MsG0380015136.01.T05:CDS
GATCCTACGGATAATTCGTT+TGG 0.445604 3:+65733911 MsG0380015136.01.T05:CDS
AACTTAGAGATGCTAAGAAA+TGG 0.447711 3:+65734478 MsG0380015136.01.T06:CDS
CAAAGGATGATTACATTGAA+TGG 0.450185 3:+65733957 MsG0380015136.01.T05:CDS
GGAAATTGCACGTGCATTGT+TGG 0.452995 3:+65734057 MsG0380015136.01.T05:CDS
ATTCCATCTGCTTTCTTGGA+CGG 0.455850 3:+65733884 MsG0380015136.01.T05:CDS
ATCTGCTTTCTTGGACGGCA+AGG 0.459759 3:+65733889 MsG0380015136.01.T05:CDS
AACTTGAGAGGAATGTTAAT+GGG 0.460083 3:+65734176 MsG0380015136.01.T05:CDS
AGGATTGAACGTGATGAGGA+AGG 0.479586 3:+65734387 MsG0380015136.01.T06:CDS
AAGAAGGAGGGTCTTCTGAT+AGG 0.488757 3:+65734526 MsG0380015136.01.T06:CDS
TTGTGGATGGAATTCGACTT+TGG 0.489315 3:+65734267 MsG0380015136.01.T05:CDS
ACCTCCCATCAGCACTGCTA+TGG 0.490280 3:+65733540 MsG0380015136.01.T05:CDS
ACGGTGTTGACAAGTACTCT+TGG 0.493761 3:-65733788 None:intergenic
CGGTGTTGACAAGTACTCTT+GGG 0.500520 3:-65733787 None:intergenic
GACGATGTCTTCGTCGCCAA+AGG 0.502152 3:-65733375 None:intergenic
AAGGAGAGGCCGGGAATGGT+TGG 0.502271 3:-65733314 None:intergenic
GGCGAAGGAGAGGCCGGGAA+TGG 0.504331 3:-65733318 None:intergenic
TGAATTTGCTCTTTGAGAGA+TGG 0.505507 3:-65733743 None:intergenic
CTACACTCTCATACTTTCAT+GGG 0.505946 3:+65733493 MsG0380015136.01.T05:CDS
GTGAAGCTCATGCGCCACCT+TGG 0.507202 3:-65733519 None:intergenic
CACTGAGAGAAGTTGATGTT+GGG 0.507926 3:+65733831 MsG0380015136.01.T05:CDS
CATACTTTCATGGGCTCCCA+AGG 0.514035 3:+65733502 MsG0380015136.01.T05:CDS
CTATGGTTGCATTTCCTCAG+TGG 0.517244 3:+65734310 MsG0380015136.01.T05:CDS
AATTAGAAAGTGTTTGGAAG+TGG 0.518170 3:+65734428 MsG0380015136.01.T06:CDS
CTTGGACGGCAAGGATCCTA+CGG 0.520478 3:+65733898 MsG0380015136.01.T05:CDS
TTGAAGATGTGTGGAAGACT+GGG 0.522155 3:+65734361 MsG0380015136.01.T06:CDS
AGAAATGGAAAGATTTGGCT+AGG 0.524530 3:+65734493 MsG0380015136.01.T06:CDS
CCTACGGATAATTCGTTTGG+TGG 0.524790 3:+65733914 MsG0380015136.01.T05:CDS
AAGATCAAAATGATACCAAT+CGG 0.530858 3:+65733854 MsG0380015136.01.T05:CDS
CAGAGAAGGTGGCGAAGGAG+AGG 0.542729 3:-65733328 None:intergenic
GGTATGTAATAATGAGGAAG+TGG 0.544838 3:-65733178 None:intergenic
GCTAGGGCAGCTGTGAAAGA+AGG 0.545401 3:+65734510 MsG0380015136.01.T06:CDS
TGAGCCGCAGCGCGTAAACT+CGG 0.549126 3:-65733408 None:intergenic
GGATTGAACGTGATGAGGAA+GGG 0.549274 3:+65734388 MsG0380015136.01.T06:CDS
TCCTTCGCCACCTTCTCTGA+CGG 0.551100 3:+65733332 MsG0380015136.01.T05:CDS
GATTGAACGTGATGAGGAAG+GGG 0.553105 3:+65734389 MsG0380015136.01.T06:CDS
TGATAAGGCGGCTGTATAAG+TGG 0.553403 3:-65733286 None:intergenic
GCCCAAAGAAATGAGACGCT+TGG 0.558163 3:-65733237 None:intergenic
TTTGGAAGTGGTGATGAGGA+AGG 0.561440 3:+65734440 MsG0380015136.01.T06:CDS
TTAATGGGAAGATAGTGAAA+TGG 0.562694 3:+65734191 MsG0380015136.01.T05:CDS
GATGGAATCAACGGTCCGAT+TGG 0.563475 3:-65733869 None:intergenic
AGTGAAATGGTGTAGTCAGG+TGG 0.563587 3:+65734204 MsG0380015136.01.T05:CDS
GTTGTAGAGAGGAACTTGAG+AGG 0.564031 3:+65734164 MsG0380015136.01.T05:CDS
GCACTGAGAGAAGTTGATGT+TGG 0.567281 3:+65733830 MsG0380015136.01.T05:CDS
TTGCCGTCCAAGAAAGCAGA+TGG 0.569394 3:-65733887 None:intergenic
CGTTGTCGGTGTTGACTCAA+AGG 0.569542 3:+65733940 MsG0380015136.01.T05:CDS
GAAATGGTGTAGTCAGGTGG+AGG 0.574825 3:+65734207 MsG0380015136.01.T05:CDS
GCGGCTGTATAAGTGGATAG+TGG 0.575660 3:-65733279 None:intergenic
TGAATCCATAGCAGTGCTGA+TGG 0.575954 3:-65733545 None:intergenic
ATGTAATAATGAGGAAGTGG+TGG 0.576043 3:-65733175 None:intergenic
GCTTGGCGAATTGGAGAGCA+GGG 0.584389 3:-65733220 None:intergenic
CAAAACAGCAAGAGTACCAA+AGG 0.586098 3:-65734017 None:intergenic
TGAACGTGATGAGGAAGGGG+TGG 0.587333 3:+65734392 MsG0380015136.01.T06:CDS
AGTGTTTGGAAGTGGTGATG+AGG 0.587476 3:+65734436 MsG0380015136.01.T06:CDS
ACATGTTCAATATCTTTACC+GGG 0.591277 3:+65733647 MsG0380015136.01.T05:CDS
AGGGCAGCTGTGAAAGAAGG+AGG 0.595155 3:+65734513 MsG0380015136.01.T06:CDS
GCGCGTAAACTCGGACATGT+AGG 0.596013 3:-65733399 None:intergenic
TCCGTCAGAGAAGGTGGCGA+AGG 0.597385 3:-65733333 None:intergenic
GAATCCATAGCAGTGCTGAT+GGG 0.598467 3:-65733544 None:intergenic
TTAAGAGAGAATGACAATCC+CGG 0.599994 3:-65733665 None:intergenic
CTACATCACAAACAAATCAA+AGG 0.601094 3:+65733619 MsG0380015136.01.T05:CDS
GAAATGGAAAGATTTGGCTA+GGG 0.604434 3:+65734494 MsG0380015136.01.T06:CDS
AAGGTGGCGAAGGAGAGGCC+GGG 0.606277 3:-65733323 None:intergenic
TCATAAAACAACCCAAAGAA+CGG 0.608235 3:-65734240 None:intergenic
GTCGTATCCGTCAGAGAAGG+TGG 0.609227 3:-65733339 None:intergenic
CCAAGTTAATTGAAGATGTG+TGG 0.610455 3:+65734352 MsG0380015136.01.T06:CDS
ATGTGTGGAAGACTGGGGTG+AGG 0.610628 3:+65734367 MsG0380015136.01.T06:CDS
AAGAAAGCAGATGGAATCAA+CGG 0.625801 3:-65733878 None:intergenic
GTATTGGGTATGTAATAATG+AGG 0.626764 3:-65733184 None:intergenic
TGGTTGGTTTGTTGATAAGG+CGG 0.628498 3:-65733298 None:intergenic
GTGTAGATTAAGCAAGTGAA+CGG 0.630520 3:-65733476 None:intergenic
TGACGAGTTAAGTTGTAGAG+AGG 0.634725 3:+65734153 MsG0380015136.01.T05:CDS
ATTATTACATACCCAATACA+AGG 0.638229 3:+65733188 MsG0380015136.01.T05:CDS
TTTGTCTAAGAAACAAATGG+AGG 0.642318 3:+65734036 MsG0380015136.01.T05:CDS
GCTATGGATTCAAGCAGCAA+CGG 0.646576 3:+65733556 MsG0380015136.01.T05:CDS
CACTGAGGAAATGCAACCAT+AGG 0.648040 3:-65734309 None:intergenic
ATCCAGTTCAAACTCCTCAA+CGG 0.651039 3:-65733807 None:intergenic
GTCGTCGTATCCGTCAGAGA+AGG 0.652797 3:-65733342 None:intergenic
ACTTTCATGGGCTCCCAAGG+TGG 0.653029 3:+65733505 MsG0380015136.01.T05:CDS
TTGGAAGTGGTGATGAGGAA+GGG 0.653716 3:+65734441 MsG0380015136.01.T06:CDS
TTCTCTGACGGATACGACGA+CGG 0.654563 3:+65733344 MsG0380015136.01.T05:CDS
GGAAGGGGTGGTGAAAGCTG+AGG 0.658149 3:+65734404 MsG0380015136.01.T06:CDS
GGGCAGCTGTGAAAGAAGGA+GGG 0.665123 3:+65734514 MsG0380015136.01.T06:CDS
AGTACTTGTCAACACCGTTG+AGG 0.668318 3:+65733793 MsG0380015136.01.T05:CDS
GGTGAGGATTGAACGTGATG+AGG 0.675489 3:+65734383 MsG0380015136.01.T06:CDS
CCACCAAACGAATTATCCGT+AGG 0.682144 3:-65733914 None:intergenic
TCCATAGCAGTGCTGATGGG+AGG 0.702039 3:-65733541 None:intergenic
TGAAGATGTGTGGAAGACTG+GGG 0.704933 3:+65734362 MsG0380015136.01.T06:CDS
ATGTCCGAGTTTACGCGCTG+CGG 0.726479 3:+65733404 MsG0380015136.01.T05:CDS
GTAGTTTGATCTGTCCACTG+AGG 0.733415 3:-65734324 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
! AACATGTTCAATATCTTTAC+CGG + Chr3:65733646-65733665 MsG0380015136.01.T05:CDS 25.0%
! AAGATCAAAATGATACCAAT+CGG + Chr3:65733854-65733873 MsG0380015136.01.T05:CDS 25.0%
! ATTATTACATACCCAATACA+AGG + Chr3:65733188-65733207 MsG0380015136.01.T05:CDS 25.0%
!! ATTTGAAGCCAATAAAAAAG+AGG - Chr3:65733705-65733724 None:intergenic 25.0%
!! TGTTTTGTCTAAGAAACAAA+TGG + Chr3:65734033-65734052 MsG0380015136.01.T05:CDS 25.0%
!! TTTGAAGCCAATAAAAAAGA+GGG - Chr3:65733704-65733723 None:intergenic 25.0%
AACTTAGAGATGCTAAGAAA+TGG + Chr3:65734478-65734497 MsG0380015136.01.T06:CDS 30.0%
AACTTGAGAGGAATGTTAAT+GGG + Chr3:65734176-65734195 MsG0380015136.01.T05:CDS 30.0%
ACATGTTCAATATCTTTACC+GGG + Chr3:65733647-65733666 MsG0380015136.01.T05:CDS 30.0%
CAAAGGATGATTACATTGAA+TGG + Chr3:65733957-65733976 MsG0380015136.01.T05:CDS 30.0%
CTACATCACAAACAAATCAA+AGG + Chr3:65733619-65733638 MsG0380015136.01.T05:CDS 30.0%
GTATTGGGTATGTAATAATG+AGG - Chr3:65733187-65733206 None:intergenic 30.0%
TCATAAAACAACCCAAAGAA+CGG - Chr3:65734243-65734262 None:intergenic 30.0%
TGCTAAGAAATGGAAAGATT+TGG + Chr3:65734488-65734507 MsG0380015136.01.T06:CDS 30.0%
TTAATGGGAAGATAGTGAAA+TGG + Chr3:65734191-65734210 MsG0380015136.01.T05:CDS 30.0%
TTTGTCTAAGAAACAAATGG+AGG + Chr3:65734036-65734055 MsG0380015136.01.T05:CDS 30.0%
! AGTTTTGCAACAAAAAGAAG+AGG + Chr3:65734120-65734139 MsG0380015136.01.T05:CDS 30.0%
! ATTCTGGATTTTCTTTCTTG+TGG + Chr3:65734080-65734099 MsG0380015136.01.T05:CDS 30.0%
! TCTGTTGTTTATGTTTCCTT+TGG + Chr3:65734001-65734020 MsG0380015136.01.T05:CDS 30.0%
! TTCTGGATTTTCTTTCTTGT+GGG + Chr3:65734081-65734100 MsG0380015136.01.T05:CDS 30.0%
!! AATTAGAAAGTGTTTGGAAG+TGG + Chr3:65734428-65734447 MsG0380015136.01.T06:CDS 30.0%
!! TGAGGAAATTAGAAAGTGTT+TGG + Chr3:65734422-65734441 MsG0380015136.01.T06:CDS 30.0%
AAGAAAGCAGATGGAATCAA+CGG - Chr3:65733881-65733900 None:intergenic 35.0%
AAGCCAATAAAAAAGAGGGA+AGG - Chr3:65733700-65733719 None:intergenic 35.0%
AGAAATGGAAAGATTTGGCT+AGG + Chr3:65734493-65734512 MsG0380015136.01.T06:CDS 35.0%
ATGTAATAATGAGGAAGTGG+TGG - Chr3:65733178-65733197 None:intergenic 35.0%
CATTGAATGGTTGGATTCAA+AGG + Chr3:65733970-65733989 MsG0380015136.01.T05:CDS 35.0%
CCAAGTTAATTGAAGATGTG+TGG + Chr3:65734352-65734371 MsG0380015136.01.T06:CDS 35.0%
CCACACATCTTCAATTAACT+TGG - Chr3:65734355-65734374 None:intergenic 35.0%
CTACACTCTCATACTTTCAT+GGG + Chr3:65733493-65733512 MsG0380015136.01.T05:CDS 35.0%
GAAATGGAAAGATTTGGCTA+GGG + Chr3:65734494-65734513 MsG0380015136.01.T06:CDS 35.0%
GAACTTGAGAGGAATGTTAA+TGG + Chr3:65734175-65734194 MsG0380015136.01.T05:CDS 35.0%
GGATGATTACATTGAATGGT+TGG + Chr3:65733961-65733980 MsG0380015136.01.T05:CDS 35.0%
GGTATGTAATAATGAGGAAG+TGG - Chr3:65733181-65733200 None:intergenic 35.0%
GGTTTATGTGACCTTGTATT+GGG - Chr3:65733202-65733221 None:intergenic 35.0%
GTGTAGATTAAGCAAGTGAA+CGG - Chr3:65733479-65733498 None:intergenic 35.0%
TCTACACTCTCATACTTTCA+TGG + Chr3:65733492-65733511 MsG0380015136.01.T05:CDS 35.0%
TTAAGAGAGAATGACAATCC+CGG - Chr3:65733668-65733687 None:intergenic 35.0%
TTGCAACAAAAAGAAGAGGA+GGG + Chr3:65734124-65734143 MsG0380015136.01.T05:CDS 35.0%
TTTGCAACAAAAAGAAGAGG+AGG + Chr3:65734123-65734142 MsG0380015136.01.T05:CDS 35.0%
! ACTTTGGAAAGTTTGAGTTC+AGG + Chr3:65734283-65734302 MsG0380015136.01.T05:CDS 35.0%
! CTTTGGAAAGTTTGAGTTCA+GGG + Chr3:65734284-65734303 MsG0380015136.01.T05:CDS 35.0%
! TGAATTTGCTCTTTGAGAGA+TGG - Chr3:65733746-65733765 None:intergenic 35.0%
!! GAATGGTTGGTTTGTTGATA+AGG - Chr3:65733304-65733323 None:intergenic 35.0%
ATCAACAAACCAACCATTCC+CGG + Chr3:65733305-65733324 MsG0380015136.01.T05:CDS 40.0%
ATCCAGTTCAAACTCCTCAA+CGG - Chr3:65733810-65733829 None:intergenic 40.0%
ATTCCATCTGCTTTCTTGGA+CGG + Chr3:65733884-65733903 MsG0380015136.01.T05:CDS 40.0%
ATTGAAGATGTGTGGAAGAC+TGG + Chr3:65734360-65734379 MsG0380015136.01.T06:CDS 40.0%
GATAGTGAAATGGTGTAGTC+AGG + Chr3:65734201-65734220 MsG0380015136.01.T05:CDS 40.0%
GATCCTACGGATAATTCGTT+TGG + Chr3:65733911-65733930 MsG0380015136.01.T05:CDS 40.0%
GGGTTTATGTGACCTTGTAT+TGG - Chr3:65733203-65733222 None:intergenic 40.0%
TTGAAGATGTGTGGAAGACT+GGG + Chr3:65734361-65734380 MsG0380015136.01.T06:CDS 40.0%
TTGTGGATGGAATTCGACTT+TGG + Chr3:65734267-65734286 MsG0380015136.01.T05:CDS 40.0%
! GAACGGACGATTTTCTTGTT+TGG - Chr3:65733462-65733481 None:intergenic 40.0%
! GTTGATTCCATCTGCTTTCT+TGG + Chr3:65733880-65733899 MsG0380015136.01.T05:CDS 40.0%
! GTTTTATGACGCATTGTGGA+TGG + Chr3:65734254-65734273 MsG0380015136.01.T05:CDS 40.0%
! GTTTTGTCACACCGTTCTTT+GGG + Chr3:65734229-65734248 MsG0380015136.01.T05:CDS 40.0%
! TGACGAGTTAAGTTGTAGAG+AGG + Chr3:65734153-65734172 MsG0380015136.01.T05:CDS 40.0%
!! CAAAACAGCAAGAGTACCAA+AGG - Chr3:65734020-65734039 None:intergenic 40.0%
!! CACTGAGAGAAGTTGATGTT+GGG + Chr3:65733831-65733850 MsG0380015136.01.T05:CDS 40.0%
!! GGTTGTTTTATGACGCATTG+TGG + Chr3:65734250-65734269 MsG0380015136.01.T05:CDS 40.0%
!! TGGTTGGTTTGTTGATAAGG+CGG - Chr3:65733301-65733320 None:intergenic 40.0%
!!! CGACCTTCCCTCTTTTTTAT+TGG + Chr3:65733694-65733713 MsG0380015136.01.T05:CDS 40.0%
AAATGAGACGCTTGGCGAAT+TGG - Chr3:65733232-65733251 None:intergenic 45.0%
AAGAAGGAGGGTCTTCTGAT+AGG + Chr3:65734526-65734545 MsG0380015136.01.T06:CDS 45.0%
AGGATTGAACGTGATGAGGA+AGG + Chr3:65734387-65734406 MsG0380015136.01.T06:CDS 45.0%
AGTACTTGTCAACACCGTTG+AGG + Chr3:65733793-65733812 MsG0380015136.01.T05:CDS 45.0%
AGTGAAATGGTGTAGTCAGG+TGG + Chr3:65734204-65734223 MsG0380015136.01.T05:CDS 45.0%
CACTGAGGAAATGCAACCAT+AGG - Chr3:65734312-65734331 None:intergenic 45.0%
CCACCAAACGAATTATCCGT+AGG - Chr3:65733917-65733936 None:intergenic 45.0%
CCTACGGATAATTCGTTTGG+TGG + Chr3:65733914-65733933 MsG0380015136.01.T05:CDS 45.0%
CTATGGTTGCATTTCCTCAG+TGG + Chr3:65734310-65734329 MsG0380015136.01.T05:CDS 45.0%
GACGACGGTCAAAAATCCTT+TGG + Chr3:65733359-65733378 MsG0380015136.01.T05:CDS 45.0%
GAGGAAGGGTGAAAAAAGTG+AGG + Chr3:65734455-65734474 MsG0380015136.01.T06:CDS 45.0%
GATTGAACGTGATGAGGAAG+GGG + Chr3:65734389-65734408 MsG0380015136.01.T06:CDS 45.0%
GCCAAGCGTCTCATTTCTTT+GGG + Chr3:65733236-65733255 MsG0380015136.01.T05:CDS 45.0%
GCTATGGATTCAAGCAGCAA+CGG + Chr3:65733556-65733575 MsG0380015136.01.T05:CDS 45.0%
GGAAATTGCACGTGCATTGT+TGG + Chr3:65734057-65734076 MsG0380015136.01.T05:CDS 45.0%
GGATTGAACGTGATGAGGAA+GGG + Chr3:65734388-65734407 MsG0380015136.01.T06:CDS 45.0%
GTAGTTTGATCTGTCCACTG+AGG - Chr3:65734327-65734346 None:intergenic 45.0%
GTTGTAGAGAGGAACTTGAG+AGG + Chr3:65734164-65734183 MsG0380015136.01.T05:CDS 45.0%
TGAAGATGTGTGGAAGACTG+GGG + Chr3:65734362-65734381 MsG0380015136.01.T06:CDS 45.0%
TGATAAGGCGGCTGTATAAG+TGG - Chr3:65733289-65733308 None:intergenic 45.0%
! AGTGTTTGGAAGTGGTGATG+AGG + Chr3:65734436-65734455 MsG0380015136.01.T06:CDS 45.0%
! GTTTGAGTTCAGGGTTCCTA+TGG + Chr3:65734293-65734312 MsG0380015136.01.T05:CDS 45.0%
! TGAATCCATAGCAGTGCTGA+TGG - Chr3:65733548-65733567 None:intergenic 45.0%
! TTGGAAGTGGTGATGAGGAA+GGG + Chr3:65734441-65734460 MsG0380015136.01.T06:CDS 45.0%
! TTTGGAAGTGGTGATGAGGA+AGG + Chr3:65734440-65734459 MsG0380015136.01.T06:CDS 45.0%
!! ACGGTGTTGACAAGTACTCT+TGG - Chr3:65733791-65733810 None:intergenic 45.0%
!! CGGACGATTTTCTTGTTTGG+AGG - Chr3:65733459-65733478 None:intergenic 45.0%
!! CGGTGTTGACAAGTACTCTT+GGG - Chr3:65733790-65733809 None:intergenic 45.0%
!! GAATCCATAGCAGTGCTGAT+GGG - Chr3:65733547-65733566 None:intergenic 45.0%
!! GCACTGAGAGAAGTTGATGT+TGG + Chr3:65733830-65733849 MsG0380015136.01.T05:CDS 45.0%
!! GGTTTTGTCACACCGTTCTT+TGG + Chr3:65734228-65734247 MsG0380015136.01.T05:CDS 45.0%
ATCTGCTTTCTTGGACGGCA+AGG + Chr3:65733889-65733908 MsG0380015136.01.T05:CDS 50.0%
CACCGTTGAGGAGTTTGAAC+TGG + Chr3:65733805-65733824 MsG0380015136.01.T05:CDS 50.0%
CATACTTTCATGGGCTCCCA+AGG + Chr3:65733502-65733521 MsG0380015136.01.T05:CDS 50.0%
CGCCAAGCGTCTCATTTCTT+TGG + Chr3:65733235-65733254 MsG0380015136.01.T05:CDS 50.0%
GAAATGGTGTAGTCAGGTGG+AGG + Chr3:65734207-65734226 MsG0380015136.01.T05:CDS 50.0%
GATGGAATCAACGGTCCGAT+TGG - Chr3:65733872-65733891 None:intergenic 50.0%
GCACGTGCATTGTTGGATTC+TGG + Chr3:65734064-65734083 MsG0380015136.01.T05:CDS 50.0%
GCCCAAAGAAATGAGACGCT+TGG - Chr3:65733240-65733259 None:intergenic 50.0%
GCGGCTGTATAAGTGGATAG+TGG - Chr3:65733282-65733301 None:intergenic 50.0%
GGTGAGGATTGAACGTGATG+AGG + Chr3:65734383-65734402 MsG0380015136.01.T06:CDS 50.0%
TTGCCGTCCAAGAAAGCAGA+TGG - Chr3:65733890-65733909 None:intergenic 50.0%
! TTCTCTGACGGATACGACGA+CGG + Chr3:65733344-65733363 MsG0380015136.01.T05:CDS 50.0%
!! CGTTGTCGGTGTTGACTCAA+AGG + Chr3:65733940-65733959 MsG0380015136.01.T05:CDS 50.0%
!! TCGTTTGGTGGTGACGTTGT+CGG + Chr3:65733926-65733945 MsG0380015136.01.T05:CDS 50.0%
ACCTCCCATCAGCACTGCTA+TGG + Chr3:65733540-65733559 MsG0380015136.01.T05:CDS 55.0%
ACTTTCATGGGCTCCCAAGG+TGG + Chr3:65733505-65733524 MsG0380015136.01.T05:CDS 55.0%
AGGGCAGCTGTGAAAGAAGG+AGG + Chr3:65734513-65734532 MsG0380015136.01.T06:CDS 55.0%
ATGTCCGAGTTTACGCGCTG+CGG + Chr3:65733404-65733423 MsG0380015136.01.T05:CDS 55.0%
ATGTGTGGAAGACTGGGGTG+AGG + Chr3:65734367-65734386 MsG0380015136.01.T06:CDS 55.0%
CTTGGACGGCAAGGATCCTA+CGG + Chr3:65733898-65733917 MsG0380015136.01.T05:CDS 55.0%
GACGATGTCTTCGTCGCCAA+AGG - Chr3:65733378-65733397 None:intergenic 55.0%
GCGCGTAAACTCGGACATGT+AGG - Chr3:65733402-65733421 None:intergenic 55.0%
GCTAGGGCAGCTGTGAAAGA+AGG + Chr3:65734510-65734529 MsG0380015136.01.T06:CDS 55.0%
GCTTGGCGAATTGGAGAGCA+GGG - Chr3:65733223-65733242 None:intergenic 55.0%
GGGCAGCTGTGAAAGAAGGA+GGG + Chr3:65734514-65734533 MsG0380015136.01.T06:CDS 55.0%
GTCGTATCCGTCAGAGAAGG+TGG - Chr3:65733342-65733361 None:intergenic 55.0%
GTCGTCGTATCCGTCAGAGA+AGG - Chr3:65733345-65733364 None:intergenic 55.0%
TCCTTCGCCACCTTCTCTGA+CGG + Chr3:65733332-65733351 MsG0380015136.01.T05:CDS 55.0%
TGAACGTGATGAGGAAGGGG+TGG + Chr3:65734392-65734411 MsG0380015136.01.T06:CDS 55.0%
TGAAGCTCATGCGCCACCTT+GGG - Chr3:65733521-65733540 None:intergenic 55.0%
!! TCCATAGCAGTGCTGATGGG+AGG - Chr3:65733544-65733563 None:intergenic 55.0%
AAGGAGAGGCCGGGAATGGT+TGG - Chr3:65733317-65733336 None:intergenic 60.0%
CAGAGAAGGTGGCGAAGGAG+AGG - Chr3:65733331-65733350 None:intergenic 60.0%
CGCTTGGCGAATTGGAGAGC+AGG - Chr3:65733224-65733243 None:intergenic 60.0%
GGAAGGGGTGGTGAAAGCTG+AGG + Chr3:65734404-65734423 MsG0380015136.01.T06:CDS 60.0%
GTGAAGCTCATGCGCCACCT+TGG - Chr3:65733522-65733541 None:intergenic 60.0%
TCCGTCAGAGAAGGTGGCGA+AGG - Chr3:65733336-65733355 None:intergenic 60.0%
TGAGCCGCAGCGCGTAAACT+CGG - Chr3:65733411-65733430 None:intergenic 60.0%
AAGGTGGCGAAGGAGAGGCC+GGG - Chr3:65733326-65733345 None:intergenic 65.0%
GAAGGTGGCGAAGGAGAGGC+CGG - Chr3:65733327-65733346 None:intergenic 65.0%
GGCGAAGGAGAGGCCGGGAA+TGG - Chr3:65733321-65733340 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 65733164 65734596 65733164 ID=MsG0380015136.01;Name=MsG0380015136.01
Chr3 mRNA 65733164 65734360 65733164 ID=MsG0380015136.01.T01;Parent=MsG0380015136.01;Name=MsG0380015136.01.T01;_AED=0.24;_eAED=0.24;_QI=0|0|0|1|0|0|3|0|373
Chr3 exon 65733164 65733928 65733164 ID=MsG0380015136.01.T01:exon:22792;Parent=MsG0380015136.01.T01
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Chr3 exon 65734184 65734360 65734184 ID=MsG0380015136.01.T01:exon:22794;Parent=MsG0380015136.01.T01
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Chr3 mRNA 65733164 65734360 65733164 ID=MsG0380015136.01.T02;Parent=MsG0380015136.01;Name=MsG0380015136.01.T02;_AED=0.23;_eAED=0.23;_QI=0|0|0|1|0|0|2|0|388
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Chr3 exon 65733164 65734121 65733164 ID=MsG0380015136.01.T03:exon:22797;Parent=MsG0380015136.01.T03
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Chr3 mRNA 65733404 65734360 65733404 ID=MsG0380015136.01.T04;Parent=MsG0380015136.01;Name=MsG0380015136.01.T04;_AED=0.29;_eAED=0.29;_QI=0|0|0|1|0|0|2|0|302
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