AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580028020.01

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MsG0580028020.01.T01 AT1G22360 28.750 480 297 18 4 452 3 468 4.57e-42 155
MsG0580028020.01.T01 AT2G15490 27.530 494 304 16 7 464 3 478 1.53e-41 154
MsG0580028020.01.T01 AT5G14860 29.175 497 286 25 13 470 10 479 2.40e-41 154
MsG0580028020.01.T01 AT5G59580 27.813 471 305 11 3 464 1 445 3.35e-41 153
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MsG0580028020.01.T01 AT1G51210 28.986 414 244 15 9 406 18 397 6.20e-40 149
MsG0580028020.01.T01 AT3G46650 27.155 464 277 14 5 454 4 420 1.23e-39 148
MsG0580028020.01.T01 AT2G36800 31.000 500 298 25 2 466 1 488 1.27e-39 149
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MsG0580028020.01.T01 AT1G22370 28.774 424 267 15 8 409 10 420 2.86e-39 148
MsG0580028020.01.T01 AT1G22340 29.638 469 283 18 8 448 10 459 4.63e-38 145
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MsG0580028020.01.T01 AT2G36750 28.942 501 303 22 2 466 1 484 6.68e-38 144
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MsG0580028020.01.T01 AT2G23260 32.646 291 156 9 183 455 174 442 1.87e-37 143
MsG0580028020.01.T01 AT5G05870 28.921 491 289 21 5 468 2 459 3.41e-37 142
MsG0580028020.01.T01 AT3G46700 26.271 472 296 14 8 463 6 441 3.53e-37 142
MsG0580028020.01.T01 AT2G16890 27.902 491 293 22 12 470 10 471 3.79e-37 142
MsG0580028020.01.T01 AT1G78270 27.812 489 301 16 8 464 10 478 4.12e-37 142
MsG0580028020.01.T01 AT4G15480 29.254 335 216 9 133 455 142 467 5.80e-37 142
MsG0580028020.01.T01 AT3G46690 27.389 471 303 15 8 466 6 449 6.30e-37 141
MsG0580028020.01.T01 AT2G36780 28.717 491 298 22 12 466 15 489 8.47e-37 142
MsG0580028020.01.T01 AT5G03490 27.743 483 291 19 4 463 12 459 1.04e-36 141
MsG0580028020.01.T01 AT2G43820 28.601 486 271 22 8 463 4 443 2.29e-36 139
MsG0580028020.01.T01 AT4G01070 30.000 360 221 10 5 348 2 346 2.96e-36 137
MsG0580028020.01.T01 AT2G23250 34.701 268 151 9 205 463 180 432 3.62e-36 139
MsG0580028020.01.T01 AT2G43840 24.845 483 295 18 7 463 3 443 7.96e-36 138
MsG0580028020.01.T01 AT2G43840 24.845 483 295 18 7 463 3 443 1.48e-35 137
MsG0580028020.01.T01 AT4G34135 26.269 453 286 17 8 431 8 441 2.55e-35 137
MsG0580028020.01.T01 AT3G53160 33.447 293 165 12 200 470 203 487 3.41e-35 137
MsG0580028020.01.T01 AT2G36760 26.531 490 310 21 12 466 15 489 4.74e-35 137
MsG0580028020.01.T01 AT2G30140 25.261 479 301 18 12 470 14 455 4.90e-35 136
MsG0580028020.01.T01 AT2G36970 25.105 474 308 15 8 455 7 459 5.80e-35 136
MsG0580028020.01.T01 AT2G31750 26.132 486 304 16 7 469 4 457 6.27e-35 136
MsG0580028020.01.T01 AT3G11340 27.721 487 277 21 5 463 2 441 1.16e-34 135
MsG0580028020.01.T01 AT2G31750 26.250 480 299 16 7 463 4 451 1.49e-34 135
MsG0580028020.01.T01 AT3G53150 26.975 519 295 22 8 468 19 511 1.80e-34 135
MsG0580028020.01.T01 AT4G15500 29.323 399 243 15 95 470 88 470 2.70e-34 134
MsG0580028020.01.T01 AT2G30150 25.996 477 281 19 15 463 1 433 4.74e-34 133
MsG0580028020.01.T01 AT2G36770 25.918 490 313 19 12 466 15 489 5.20e-34 134
MsG0580028020.01.T01 AT2G30150 25.367 477 290 17 12 463 14 449 5.39e-34 133
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MsG0580028020.01.T01 AT2G36790 28.310 491 300 22 12 466 14 488 9.89e-34 133
MsG0580028020.01.T01 AT3G21560 29.365 378 237 13 103 464 107 470 1.05e-33 133
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MsG0580028020.01.T01 AT3G55700 26.141 482 297 18 5 463 2 447 2.38e-32 129
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MsG0580028020.01.T01 AT1G05560 32.948 346 182 17 133 455 172 490 6.40e-32 128
MsG0580028020.01.T01 AT5G38010 26.294 483 302 17 5 466 4 453 1.09e-31 127
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MsG0580028020.01.T01 AT5G17050 31.939 263 145 9 214 467 220 457 1.24e-27 115
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MsG0580028020.01.T01 AT4G15270 32.174 230 136 7 9 225 2 224 2.22e-23 100
MsG0580028020.01.T01 AT4G15270 34.673 199 115 5 9 196 2 196 2.60e-23 98.6
MsG0580028020.01.T01 AT5G65550 33.333 174 104 6 259 431 260 422 2.14e-22 100
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MsG0580028020.01.T01 AT2G22590 31.707 205 125 8 246 444 250 445 3.48e-19 90.5
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MsG0580028020.01.T01 AT4G27570 31.405 242 148 9 204 439 188 417 5.85e-18 86.7
MsG0580028020.01.T01 AT2G22930 28.099 242 158 8 202 442 184 410 2.96e-17 84.3
MsG0580028020.01.T01 AT3G29630 33.161 193 116 7 245 435 225 406 6.18e-17 83.2
MsG0580028020.01.T01 AT1G64910 32.335 167 105 4 241 407 221 379 8.22e-17 82.8
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MsG0580028020.01.T01 AT5G54010 23.182 440 301 14 6 437 1 411 1.48e-16 82.4
MsG0580028020.01.T01 AT1G64920 27.308 260 168 9 190 443 171 415 3.31e-16 81.3
MsG0580028020.01.T01 AT5G53990 27.004 237 157 7 202 437 184 405 3.42e-16 81.3
MsG0580028020.01.T01 AT4G09500 34.320 169 100 6 276 442 226 385 3.52e-14 74.7
MsG0580028020.01.T01 AT4G09500 34.320 169 100 6 276 442 251 410 4.12e-14 74.7
MsG0580028020.01.T01 AT1G50580 32.642 193 116 7 245 435 224 404 1.08e-13 73.6

Find 86 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 112 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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GATCCTGAGTTATTGATTCC+TGG 0.286243 5:-73259246 MsG0580028020.01.T01:CDS
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AGCTGTTGTTCTGCATAAAT+AGG 0.311024 5:+73258607 None:intergenic
AAAATCCAACATTTGATGTT+AGG 0.320269 5:+73259325 None:intergenic
TAAATAGGCCATGTCAATAT+TGG 0.331068 5:+73258622 None:intergenic
TTCATTCCTTCACCAGATAT+TGG 0.335412 5:-73259717 MsG0580028020.01.T01:CDS
GTTTGAATGAGATGATAAAA+TGG 0.346372 5:+73259431 None:intergenic
TTTAGGTTGGTGAAGGAATT+GGG 0.352487 5:-73258577 MsG0580028020.01.T01:CDS
GATTGATCTAACTTAGAGTT+AGG 0.363217 5:+73258997 None:intergenic
GGGTCTTCTTTCATTTCTGT+TGG 0.366581 5:-73258400 MsG0580028020.01.T01:CDS
GGTATTAACAATAATTCCTT+TGG 0.371432 5:+73259122 None:intergenic
TCTCCGAGCAAGGTTGTAAT+AGG 0.375634 5:+73259155 None:intergenic
TTGAGAGTGGATTATAGAAT+AGG 0.376468 5:-73258541 MsG0580028020.01.T01:CDS
ATTCCTCCTATCTATGCTAT+TGG 0.384342 5:-73259045 MsG0580028020.01.T01:CDS
GGAAGCATGGGAGTTAGCTT+TGG 0.385426 5:-73258907 MsG0580028020.01.T01:CDS
GAAAGGGTTGAAGCATTTGA+TGG 0.386348 5:-73258485 MsG0580028020.01.T01:CDS
GGTCTTCTTTCATTTCTGTT+GGG 0.394891 5:-73258399 MsG0580028020.01.T01:CDS
CAAATCAGAGAAATAGCATT+AGG 0.404631 5:-73258877 MsG0580028020.01.T01:CDS
GAAACTAAGTGACCAATATC+TGG 0.405151 5:+73259705 None:intergenic
TCTCATTCAAACCAAGTTGT+TGG 0.419774 5:-73259420 MsG0580028020.01.T01:CDS
AATATGATCTTATATTGAAA+TGG 0.421066 5:-73258972 MsG0580028020.01.T01:CDS
TTAGAATGGATGGAATTAGA+AGG 0.431299 5:-73258763 MsG0580028020.01.T01:CDS
TTGAAAGACAAAATAAATCT+AGG 0.431416 5:+73259391 None:intergenic
GCTAGGAACGCTGTTCTTTG+TGG 0.442272 5:-73258424 MsG0580028020.01.T01:CDS
ATGGCTGAGGAGATTGAGAA+AGG 0.457096 5:-73258502 MsG0580028020.01.T01:CDS
GAAGGAATTGGGATTGGCGG+TGG 0.458392 5:-73258566 MsG0580028020.01.T01:CDS
ATGGATGGAATTAGAAGGTA+AGG 0.460474 5:-73258758 MsG0580028020.01.T01:CDS
GCCCCAAAATCTCAACTTGT+GGG 0.462646 5:+73258716 None:intergenic
TCTCTACTATAAGCAGCATT+TGG 0.463429 5:+73259192 None:intergenic
GCATTTGGTAAAACACTAGA+AGG 0.464367 5:+73259207 None:intergenic
TCATAATTGTTAGTTCTTGG+TGG 0.464406 5:+73258811 None:intergenic
AGGTAGTAAAGAACTTGTTA+TGG 0.474178 5:-73258521 MsG0580028020.01.T01:CDS
AAAGGACCAATAGCATAGAT+AGG 0.476247 5:+73259039 None:intergenic
GATGTTAGGAACAAATAAGA+AGG 0.478461 5:+73259339 None:intergenic
GCTATTTCTCTGATTTGAGA+TGG 0.485959 5:+73258883 None:intergenic
TTTGGTGGTGATTCTACTTG+AGG 0.488260 5:+73259534 None:intergenic
AGGAACGCTGTTCTTTGTGG+TGG 0.491754 5:-73258421 MsG0580028020.01.T01:CDS
GGTGAAGGAATTGGGATTGG+CGG 0.496331 5:-73258569 MsG0580028020.01.T01:CDS
AGAAAATTCAAGAGATGGCT+AGG 0.497558 5:-73258441 MsG0580028020.01.T01:CDS
ATTGGCGGTGGAGTTGAGAG+TGG 0.499734 5:-73258554 MsG0580028020.01.T01:CDS
TAGTAGAGATGGTGGTTATG+AGG 0.505843 5:-73259178 MsG0580028020.01.T01:CDS
TGATAAAATGGTTTGAATGG+TGG 0.507211 5:+73259443 None:intergenic
GCTTAAGAAAATTCAAGAGA+TGG 0.510362 5:-73258446 MsG0580028020.01.T01:CDS
TGTCTTTCAATGATTGATGT+TGG 0.510434 5:-73259378 MsG0580028020.01.T01:CDS
TTGGGGCATAAGGCTATTGG+TGG 0.512227 5:-73258700 MsG0580028020.01.T01:CDS
GGTGGATTTGTTTCACATTG+TGG 0.516267 5:-73258682 MsG0580028020.01.T01:CDS
GTAAGGGAATGATATGTGAA+TGG 0.516461 5:-73258741 MsG0580028020.01.T01:CDS
GTTGGTGAAGGAATTGGGAT+TGG 0.518715 5:-73258572 MsG0580028020.01.T01:CDS
TGAACACGTCGTTGACTCGA+CGG 0.519265 5:+73259277 None:intergenic
GGAACGCTGTTCTTTGTGGT+GGG 0.520412 5:-73258420 MsG0580028020.01.T01:CDS
GATTTGTTTCACATTGTGGA+TGG 0.524177 5:-73258678 MsG0580028020.01.T01:CDS
AGATGATAAAATGGTTTGAA+TGG 0.524180 5:+73259440 None:intergenic
ATATTGTTCCAAACCTGAAA+AGG 0.525009 5:+73259101 None:intergenic
AGGCCTATTACAACCTTGCT+CGG 0.526960 5:-73259158 MsG0580028020.01.T01:CDS
TGGCTGAGGAGATTGAGAAA+GGG 0.538297 5:-73258501 MsG0580028020.01.T01:CDS
ATTGATGTTGGAAATGAACT+TGG 0.540616 5:-73259366 MsG0580028020.01.T01:CDS
CTAGGACTAAACCAACAACT+TGG 0.542160 5:+73259409 None:intergenic
TAAGGGAATGATATGTGAAT+GGG 0.542556 5:-73258740 MsG0580028020.01.T01:CDS
AAGAGAAAAGATTACCAGAA+GGG 0.545254 5:-73258789 MsG0580028020.01.T01:CDS
TGCCCCAAAATCTCAACTTG+TGG 0.545535 5:+73258715 None:intergenic
TGTCGTTGATTCTCCGAGCA+AGG 0.546114 5:+73259145 None:intergenic
TTGTTCCTAACATCAAATGT+TGG 0.550677 5:-73259330 MsG0580028020.01.T01:CDS
GGTACTAAATTTGCGAAACC+AGG 0.555883 5:+73259228 None:intergenic
GAATCAGAAAATGCTGTATG+TGG 0.556615 5:+73259609 None:intergenic
ATGTTAGGAACAAATAAGAA+GGG 0.556728 5:+73259340 None:intergenic
GCATTAGGACTTAAGCATAG+TGG 0.558018 5:-73258862 MsG0580028020.01.T01:CDS
TAAAGAACTTGTTATGGCTG+AGG 0.561283 5:-73258515 MsG0580028020.01.T01:CDS
GGTCCTTTGTTAGATCTCAA+AGG 0.569953 5:-73259024 MsG0580028020.01.T01:CDS
AATGCTGCTTATAGTAGAGA+TGG 0.575056 5:-73259189 MsG0580028020.01.T01:CDS
TATGTGGAAATTTGATGCAA+AGG 0.585937 5:+73259625 None:intergenic
AGATCAATGAGTTTGATTTG+TGG 0.588494 5:+73259558 None:intergenic
GAAGAGAAAAGATTACCAGA+AGG 0.592323 5:-73258790 MsG0580028020.01.T01:CDS
AAGTGACCAATATCTGGTGA+AGG 0.600326 5:+73259711 None:intergenic
GGACCAATAGCATAGATAGG+AGG 0.601494 5:+73259042 None:intergenic
AAACCAGGAATCAATAACTC+AGG 0.608516 5:+73259243 None:intergenic
CGGAGAATCAACGACACCAA+AGG 0.621774 5:-73259138 MsG0580028020.01.T01:CDS
TTTGATGCAAAGGACTGTGA+TGG 0.630914 5:+73259635 None:intergenic
TTGGTGTGCCAATATTGACA+TGG 0.631956 5:-73258630 MsG0580028020.01.T01:CDS
GCTGCTTATAGTAGAGATGG+TGG 0.643553 5:-73259186 MsG0580028020.01.T01:CDS
CCCCAAAATCTCAACTTGTG+GGG 0.644624 5:+73258717 None:intergenic
TGGATGGAATTAGAAGGTAA+GGG 0.658594 5:-73258757 MsG0580028020.01.T01:CDS
ATGAGTGCTTTGATGTAGCA+AGG 0.662481 5:+73259492 None:intergenic
TGACCTTTGAGATCTAACAA+AGG 0.729571 5:+73259021 None:intergenic
AGTGCTTTGATGTAGCAAGG+TGG 0.838610 5:+73259495 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATATGATCTTATATTGAAA+TGG - Chr5:73259150-73259169 MsG0580028020.01.T01:CDS 15.0%
!! TTGAAAGACAAAATAAATCT+AGG + Chr5:73258734-73258753 None:intergenic 20.0%
!!! AGAAAAACAACTGATTTATT+TGG + Chr5:73259188-73259207 None:intergenic 20.0%
!!! ATTATTGTTAATACCTTTTC+AGG - Chr5:73259008-73259027 MsG0580028020.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTCTATTTTAGAAAGTTTG+TGG - Chr5:73259468-73259487 MsG0580028020.01.T01:CDS 20.0%
! AAAATCCAACATTTGATGTT+AGG + Chr5:73258800-73258819 None:intergenic 25.0%
! AGATGATAAAATGGTTTGAA+TGG + Chr5:73258685-73258704 None:intergenic 25.0%
! ATGTTAGGAACAAATAAGAA+GGG + Chr5:73258785-73258804 None:intergenic 25.0%
! GGTATTAACAATAATTCCTT+TGG + Chr5:73259003-73259022 None:intergenic 25.0%
! GTTTGAATGAGATGATAAAA+TGG + Chr5:73258694-73258713 None:intergenic 25.0%
!! ACATCAAATGTTGGATTTTT+AGG - Chr5:73258801-73258820 MsG0580028020.01.T01:CDS 25.0%
!! TAGTGGAGTTAAATTTTTGT+GGG - Chr5:73259277-73259296 MsG0580028020.01.T01:CDS 25.0%
!! TCTTCATAATTGTTAGTTCT+TGG + Chr5:73259317-73259336 None:intergenic 25.0%
!!! ATAGTGGAGTTAAATTTTTG+TGG - Chr5:73259276-73259295 MsG0580028020.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTTTAGAAAGTTTGTGGTT+TGG - Chr5:73259473-73259492 MsG0580028020.01.T01:CDS 25.0%
!!! TCAGTTGTTTTTCTATGTTT+TGG - Chr5:73259194-73259213 MsG0580028020.01.T01:CDS 25.0%
AAGAGAAAAGATTACCAGAA+GGG - Chr5:73259333-73259352 MsG0580028020.01.T01:CDS 30.0%
ATATTGTTCCAAACCTGAAA+AGG + Chr5:73259024-73259043 None:intergenic 30.0%
ATTGATGTTGGAAATGAACT+TGG - Chr5:73258756-73258775 MsG0580028020.01.T01:CDS 30.0%
CAAATCAGAGAAATAGCATT+AGG - Chr5:73259245-73259264 MsG0580028020.01.T01:CDS 30.0%
GATGTTAGGAACAAATAAGA+AGG + Chr5:73258786-73258805 None:intergenic 30.0%
GATTGATCTAACTTAGAGTT+AGG + Chr5:73259128-73259147 None:intergenic 30.0%
GCTTAAGAAAATTCAAGAGA+TGG - Chr5:73259676-73259695 MsG0580028020.01.T01:CDS 30.0%
TAAATAGGCCATGTCAATAT+TGG + Chr5:73259503-73259522 None:intergenic 30.0%
TAAGGGAATGATATGTGAAT+GGG - Chr5:73259382-73259401 MsG0580028020.01.T01:CDS 30.0%
TATGTGGAAATTTGATGCAA+AGG + Chr5:73258500-73258519 None:intergenic 30.0%
TGATAAAATGGTTTGAATGG+TGG + Chr5:73258682-73258701 None:intergenic 30.0%
TGTCTTTCAATGATTGATGT+TGG - Chr5:73258744-73258763 MsG0580028020.01.T01:CDS 30.0%
TTAGAATGGATGGAATTAGA+AGG - Chr5:73259359-73259378 MsG0580028020.01.T01:CDS 30.0%
TTGTTCCTAACATCAAATGT+TGG - Chr5:73258792-73258811 MsG0580028020.01.T01:CDS 30.0%
! AACAACAGCTTAATGCTTTT+AGG - Chr5:73259528-73259547 MsG0580028020.01.T01:CDS 30.0%
! GATATCAATAGTTCTTTTGG+TGG + Chr5:73258606-73258625 None:intergenic 30.0%
! GGTGATATCAATAGTTCTTT+TGG + Chr5:73258609-73258628 None:intergenic 30.0%
! TCATAATTGTTAGTTCTTGG+TGG + Chr5:73259314-73259333 None:intergenic 30.0%
!! AGATCAATGAGTTTGATTTG+TGG + Chr5:73258567-73258586 None:intergenic 30.0%
!! AGGTAGTAAAGAACTTGTTA+TGG - Chr5:73259601-73259620 MsG0580028020.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGAGAGTGGATTATAGAAT+AGG - Chr5:73259581-73259600 MsG0580028020.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGTTAATACCTTTTCAGGTT+TGG - Chr5:73259013-73259032 MsG0580028020.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTCTATGTTTTGGAAGCAT+GGG - Chr5:73259203-73259222 MsG0580028020.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTCTATGTTTTGGAAGCA+TGG - Chr5:73259202-73259221 MsG0580028020.01.T01:CDS 30.0%
AAACCAGGAATCAATAACTC+AGG + Chr5:73258882-73258901 None:intergenic 35.0%
AAAGGACCAATAGCATAGAT+AGG + Chr5:73259086-73259105 None:intergenic 35.0%
AGAAAATTCAAGAGATGGCT+AGG - Chr5:73259681-73259700 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
AGCTGTTGTTCTGCATAAAT+AGG + Chr5:73259518-73259537 None:intergenic 35.0%
ATGGATGGAATTAGAAGGTA+AGG - Chr5:73259364-73259383 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
ATTCCTCCTATCTATGCTAT+TGG - Chr5:73259077-73259096 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
GAAACTAAGTGACCAATATC+TGG + Chr5:73258420-73258439 None:intergenic 35.0%
GAAGAGAAAAGATTACCAGA+AGG - Chr5:73259332-73259351 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
GAATCAGAAAATGCTGTATG+TGG + Chr5:73258516-73258535 None:intergenic 35.0%
GCATTTGGTAAAACACTAGA+AGG + Chr5:73258918-73258937 None:intergenic 35.0%
GGTCTTCTTTCATTTCTGTT+GGG - Chr5:73259723-73259742 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
GTAAGGGAATGATATGTGAA+TGG - Chr5:73259381-73259400 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
TCTCATTCAAACCAAGTTGT+TGG - Chr5:73258702-73258721 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
TCTCTACTATAAGCAGCATT+TGG + Chr5:73258933-73258952 None:intergenic 35.0%
TGGATGGAATTAGAAGGTAA+GGG - Chr5:73259365-73259384 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
TTCATTCCTTCACCAGATAT+TGG - Chr5:73258405-73258424 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
! AATGCTGCTTATAGTAGAGA+TGG - Chr5:73258933-73258952 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
! ATCCATTCTAAAAACCCTTC+TGG + Chr5:73259350-73259369 None:intergenic 35.0%
! GATTTGTTTCACATTGTGGA+TGG - Chr5:73259444-73259463 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
!! ACAGCTTAATGCTTTTAGGT+TGG - Chr5:73259532-73259551 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
!! GCTATTTCTCTGATTTGAGA+TGG + Chr5:73259242-73259261 None:intergenic 35.0%
!! TAAAGAACTTGTTATGGCTG+AGG - Chr5:73259607-73259626 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
!! TACCAGAAGGGTTTTTAGAA+TGG - Chr5:73259345-73259364 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
!! TGACCTTTGAGATCTAACAA+AGG + Chr5:73259104-73259123 None:intergenic 35.0%
!! TTTAGGTTGGTGAAGGAATT+GGG - Chr5:73259545-73259564 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
!!! AGAAGGGTTTTTAGAATGGA+TGG - Chr5:73259349-73259368 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
!!! TAATGCTTTTAGGTTGGTGA+AGG - Chr5:73259538-73259557 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGAATGGTGGATTTTACATG+AGG + Chr5:73258669-73258688 None:intergenic 35.0%
!!! TTTTAGGTTGGTGAAGGAAT+TGG - Chr5:73259544-73259563 MsG0580028020.01.T01:CDS 35.0%
AAGTGACCAATATCTGGTGA+AGG + Chr5:73258414-73258433 None:intergenic 40.0%
ATGAGTGCTTTGATGTAGCA+AGG + Chr5:73258633-73258652 None:intergenic 40.0%
CTAGGACTAAACCAACAACT+TGG + Chr5:73258716-73258735 None:intergenic 40.0%
GCATTAGGACTTAAGCATAG+TGG - Chr5:73259260-73259279 MsG0580028020.01.T01:CDS 40.0%
GGGTCTTCTTTCATTTCTGT+TGG - Chr5:73259722-73259741 MsG0580028020.01.T01:CDS 40.0%
GGTACTAAATTTGCGAAACC+AGG + Chr5:73258897-73258916 None:intergenic 40.0%
GGTCCTTTGTTAGATCTCAA+AGG - Chr5:73259098-73259117 MsG0580028020.01.T01:CDS 40.0%
TTGGTGTGCCAATATTGACA+TGG - Chr5:73259492-73259511 MsG0580028020.01.T01:CDS 40.0%
TTTGATGCAAAGGACTGTGA+TGG + Chr5:73258490-73258509 None:intergenic 40.0%
! GAAAGGGTTGAAGCATTTGA+TGG - Chr5:73259637-73259656 MsG0580028020.01.T01:CDS 40.0%
! GGTGGATTTGTTTCACATTG+TGG - Chr5:73259440-73259459 MsG0580028020.01.T01:CDS 40.0%
! TAGTAGAGATGGTGGTTATG+AGG - Chr5:73258944-73258963 MsG0580028020.01.T01:CDS 40.0%
!! GATCCTGAGTTATTGATTCC+TGG - Chr5:73258876-73258895 MsG0580028020.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTGGTGGTGATTCTACTTG+AGG + Chr5:73258591-73258610 None:intergenic 40.0%
!!! AGTTGAGATTTTGGGGCATA+AGG - Chr5:73259412-73259431 MsG0580028020.01.T01:CDS 40.0%
!!! ATTTTGGGGCATAAGGCTAT+TGG - Chr5:73259419-73259438 MsG0580028020.01.T01:CDS 40.0%
AGGCCTATTACAACCTTGCT+CGG - Chr5:73258964-73258983 MsG0580028020.01.T01:CDS 45.0%
AGTGCTTTGATGTAGCAAGG+TGG + Chr5:73258630-73258649 None:intergenic 45.0%
ATGGCTGAGGAGATTGAGAA+AGG - Chr5:73259620-73259639 MsG0580028020.01.T01:CDS 45.0%
CCCCAAAATCTCAACTTGTG+GGG + Chr5:73259408-73259427 None:intergenic 45.0%
GCCCCAAAATCTCAACTTGT+GGG + Chr5:73259409-73259428 None:intergenic 45.0%
GCTGCTTATAGTAGAGATGG+TGG - Chr5:73258936-73258955 MsG0580028020.01.T01:CDS 45.0%
GGACCAATAGCATAGATAGG+AGG + Chr5:73259083-73259102 None:intergenic 45.0%
TCTCCGAGCAAGGTTGTAAT+AGG + Chr5:73258970-73258989 None:intergenic 45.0%
TGCCCCAAAATCTCAACTTG+TGG + Chr5:73259410-73259429 None:intergenic 45.0%
TGGCTGAGGAGATTGAGAAA+GGG - Chr5:73259621-73259640 MsG0580028020.01.T01:CDS 45.0%
! GTTGGTGAAGGAATTGGGAT+TGG - Chr5:73259550-73259569 MsG0580028020.01.T01:CDS 45.0%
!! CCCCACAAGTTGAGATTTTG+GGG - Chr5:73259405-73259424 MsG0580028020.01.T01:CDS 45.0%
!! GCCCCACAAGTTGAGATTTT+GGG - Chr5:73259404-73259423 MsG0580028020.01.T01:CDS 45.0%
!!! GTTGACTCGACGGTTTTGAA+GGG + Chr5:73258838-73258857 None:intergenic 45.0%
AGGAACGCTGTTCTTTGTGG+TGG - Chr5:73259701-73259720 MsG0580028020.01.T01:CDS 50.0%
CGGAGAATCAACGACACCAA+AGG - Chr5:73258984-73259003 MsG0580028020.01.T01:CDS 50.0%
GCTAGGAACGCTGTTCTTTG+TGG - Chr5:73259698-73259717 MsG0580028020.01.T01:CDS 50.0%
GGAACGCTGTTCTTTGTGGT+GGG - Chr5:73259702-73259721 MsG0580028020.01.T01:CDS 50.0%
GGTGAAGGAATTGGGATTGG+CGG - Chr5:73259553-73259572 MsG0580028020.01.T01:CDS 50.0%
TTGGGGCATAAGGCTATTGG+TGG - Chr5:73259422-73259441 MsG0580028020.01.T01:CDS 50.0%
! GGAAGCATGGGAGTTAGCTT+TGG - Chr5:73259215-73259234 MsG0580028020.01.T01:CDS 50.0%
!! GGCCCCACAAGTTGAGATTT+TGG - Chr5:73259403-73259422 MsG0580028020.01.T01:CDS 50.0%
!! TGAACACGTCGTTGACTCGA+CGG + Chr5:73258848-73258867 None:intergenic 50.0%
!! TGTCGTTGATTCTCCGAGCA+AGG + Chr5:73258980-73258999 None:intergenic 50.0%
!!! CGTTGACTCGACGGTTTTGA+AGG + Chr5:73258839-73258858 None:intergenic 50.0%
ATTGGCGGTGGAGTTGAGAG+TGG - Chr5:73259568-73259587 MsG0580028020.01.T01:CDS 55.0%
! GAAGGAATTGGGATTGGCGG+TGG - Chr5:73259556-73259575 MsG0580028020.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 73258366 73259778 73258366 ID=MsG0580028020.01;Name=MsG0580028020.01
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Chr5 exon 73258366 73259778 73258366 ID=MsG0580028020.01.T01:exon:45260;Parent=MsG0580028020.01.T01
Chr5 CDS 73258366 73259778 73258366 ID=MsG0580028020.01.T01:cds;Parent=MsG0580028020.01.T01
Gene Sequence

>MsG0580028020.01.T01

ATGGTTGTGAGTGAGATGAAGAAGAAAGCAGAACTAATCTTCATTCCTTCACCAGATATTGGTCACTTAGTTTCATCACTTGAATTTGCAAAACTCTTAATGAATACTCACAACAATATTTCCATCACAGTCCTTTGCATCAAATTTCCACATACAGCATTTTCTGATTCATACATCAAATCAGTTTTAAACTCACAACCACAAATCAAACTCATTGATCTTCCTCAAGTAGAATCACCACCAAAAGAACTATTGATATCACCACCTTGCTACATCAAAGCACTCATGCACACTCTCACACCTCATGTAAAATCCACCATTCAAACCATTTTATCATCTCATTCAAACCAAGTTGTTGGTTTAGTCCTAGATTTATTTTGTCTTTCAATGATTGATGTTGGAAATGAACTTGGTATCCCTTCTTATTTGTTCCTAACATCAAATGTTGGATTTTTAGGATTCATGCTTTCCCTTCAAAACCGTCGAGTCAACGACGTGTTCAATGATTCTGATCCTGAGTTATTGATTCCTGGTTTCGCAAATTTAGTACCTTCTAGTGTTTTACCAAATGCTGCTTATAGTAGAGATGGTGGTTATGAGGCCTATTACAACCTTGCTCGGAGAATCAACGACACCAAAGGAATTATTGTTAATACCTTTTCAGGTTTGGAACAATATTCTATTGATGCATTATATGATCATGATGAGAAAATTCCTCCTATCTATGCTATTGGTCCTTTGTTAGATCTCAAAGGTCAACCTAACTCTAAGTTAGATCAATCTCAATATGATCTTATATTGAAATGGCTAGATAAGCAGCCAAATAAATCAGTTGTTTTTCTATGTTTTGGAAGCATGGGAGTTAGCTTTGGTCCATCTCAAATCAGAGAAATAGCATTAGGACTTAAGCATAGTGGAGTTAAATTTTTGTGGGCTATGAAATCTCCACCAAGAACTAACAATTATGAAGAGAAAAGATTACCAGAAGGGTTTTTAGAATGGATGGAATTAGAAGGTAAGGGAATGATATGTGAATGGGCCCCACAAGTTGAGATTTTGGGGCATAAGGCTATTGGTGGATTTGTTTCACATTGTGGATGGAATTCTATTTTAGAAAGTTTGTGGTTTGGTGTGCCAATATTGACATGGCCTATTTATGCAGAACAACAGCTTAATGCTTTTAGGTTGGTGAAGGAATTGGGATTGGCGGTGGAGTTGAGAGTGGATTATAGAATAGGTAGTAAAGAACTTGTTATGGCTGAGGAGATTGAGAAAGGGTTGAAGCATTTGATGGAGAAAGATAATATTTTGCTTAAGAAAATTCAAGAGATGGCTAGGAACGCTGTTCTTTGTGGTGGGTCTTCTTTCATTTCTGTTGGGAAACTTATTGATATTATGATAGAAAGTAACTAA
Protein sequence

>MsG0580028020.01.T01

MVVSEMKKKAELIFIPSPDIGHLVSSLEFAKLLMNTHNNISITVLCIKFPHTAFSDSYIKSVLNSQPQIKLIDLPQVESPPKELLISPPCYIKALMHTLTPHVKSTIQTILSSHSNQVVGLVLDLFCLSMIDVGNELGIPSYLFLTSNVGFLGFMLSLQNRRVNDVFNDSDPELLIPGFANLVPSSVLPNAAYSRDGGYEAYYNLARRINDTKGIIVNTFSGLEQYSIDALYDHDEKIPPIYAIGPLLDLKGQPNSKLDQSQYDLILKWLDKQPNKSVVFLCFGSMGVSFGPSQIREIALGLKHSGVKFLWAMKSPPRTNNYEEKRLPEGFLEWMELEGKGMICEWAPQVEILGHKAIGGFVSHCGWNSILESLWFGVPILTWPIYAEQQLNAFRLVKELGLAVELRVDYRIGSKELVMAEEIEKGLKHLMEKDNILLKKIQEMARNAVLCGGSSFISVGKLIDIMIESN*