AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039356.01

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MsG0780039356.01.T01 AT1G30530 24.686 478 319 13 132 603 11 453 3.01e-30 124
MsG0780039356.01.T01 AT5G66690 25.155 485 296 14 134 588 7 454 3.29e-30 124
MsG0780039356.01.T01 AT4G36770 33.476 233 127 7 360 583 233 446 3.79e-30 124
MsG0780039356.01.T01 AT5G17030 33.005 203 122 4 398 600 267 455 5.75e-29 120
MsG0780039356.01.T01 AT3G50740 29.856 278 164 8 339 599 209 472 6.24e-29 120
MsG0780039356.01.T01 AT1G01390 31.716 268 156 6 339 596 210 460 1.04e-28 120
MsG0780039356.01.T01 AT5G17040 23.739 476 323 14 132 603 3 442 1.23e-28 119
MsG0780039356.01.T01 AT2G16890 27.840 449 266 16 130 555 5 418 1.61e-28 119
MsG0780039356.01.T01 AT1G01390 31.716 268 156 6 339 596 227 477 1.62e-28 119
MsG0780039356.01.T01 AT1G07240 23.992 496 321 17 135 600 6 475 1.68e-28 119
MsG0780039356.01.T01 AT5G17040 31.553 206 127 4 398 603 149 340 3.01e-28 116
MsG0780039356.01.T01 AT1G51210 26.432 454 275 18 134 572 20 429 6.66e-28 117
MsG0780039356.01.T01 AT5G37950 29.153 295 168 10 229 515 78 339 1.08e-27 114
MsG0780039356.01.T01 AT5G37950 28.716 296 174 10 229 515 78 345 9.10e-26 109
MsG0780039356.01.T01 AT5G49690 25.490 459 293 14 134 578 10 433 1.13e-25 110
MsG0780039356.01.T01 AT3G22250 37.714 175 99 6 400 573 276 441 3.29e-24 106
MsG0780039356.01.T01 AT2G23210 31.449 283 172 12 130 409 6 269 1.50e-23 101
MsG0780039356.01.T01 AT1G06000 31.967 244 141 9 365 600 207 433 8.72e-23 102
MsG0780039356.01.T01 AT3G29630 24.516 465 291 14 129 577 1 421 1.21e-22 101
MsG0780039356.01.T01 AT5G65550 24.295 461 292 17 134 572 9 434 1.33e-22 101
MsG0780039356.01.T01 AT4G27560 23.983 467 283 17 135 577 6 424 5.26e-22 99.8
MsG0780039356.01.T01 AT5G54010 22.811 491 324 17 129 606 1 449 3.13e-21 97.4
MsG0780039356.01.T01 AT5G53990 23.632 457 304 14 129 578 1 419 5.43e-21 96.7
MsG0780039356.01.T01 AT4G27570 23.491 464 289 15 135 577 6 424 6.22e-21 96.7
MsG0780039356.01.T01 AT2G22590 34.066 182 112 5 399 578 273 448 3.02e-20 94.7
MsG0780039356.01.T01 AT3G29630 24.138 464 268 14 129 577 1 395 1.60e-19 92.0
MsG0780039356.01.T01 AT1G64910 23.992 471 285 16 129 578 1 419 4.20e-19 90.9
MsG0780039356.01.T01 AT1G64920 22.505 471 294 15 129 577 1 422 1.77e-18 89.0
MsG0780039356.01.T01 AT5G54060 31.481 216 122 7 366 576 248 442 5.10e-18 87.8
MsG0780039356.01.T01 AT1G50580 24.359 468 286 16 129 577 1 419 8.67e-18 86.7
MsG0780039356.01.T01 AT4G01070 26.586 331 198 9 130 444 4 305 1.09e-16 82.4
MsG0780039356.01.T01 AT2G22930 25.792 221 138 5 361 577 220 418 4.00e-15 78.6
MsG0780039356.01.T01 AT4G09500 28.571 175 114 3 408 578 252 419 9.93e-15 77.4
MsG0780039356.01.T01 AT4G09500 28.571 175 114 3 408 578 227 394 1.08e-14 77.0

Find 151 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 231 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CGCCAAACGTCTTATTTCTT+TGG 0.155246 7:+62659887 MsG0780039356.01.T01:CDS
GTTGATTCCATCTGCTTTCT+TGG 0.164570 7:+62660532 MsG0780039356.01.T01:CDS
GTGATGGGGAAGGGAGAAAA+AGG 0.266909 7:+62661103 MsG0780039356.01.T01:CDS
GCACGTGCCTTGTTGGATTC+TGG 0.289746 7:+62660716 MsG0780039356.01.T01:CDS
AAATAAGACGTTTGGCGAAT+TGG 0.302349 7:-62659881 None:intergenic
GCCAAACGTCTTATTTCTTT+GGG 0.311301 7:+62659888 MsG0780039356.01.T01:CDS
ATTGACGTGGGTGAAGCTTT+AGG 0.319416 7:+62658369 MsG0780039356.01.T01:CDS
GTGAAAGAAGGAGGGTCTTC+TGG 0.326002 7:+62661178 MsG0780039356.01.T01:CDS
TGAATGGGAAAATAGTAAAA+TGG 0.333670 7:+62660843 MsG0780039356.01.T01:CDS
TCTACACTCTCATACTTTCA+TGG 0.343729 7:+62660144 MsG0780039356.01.T01:CDS
GGTTTATGTGACCTTGTATT+GGG 0.347870 7:-62659851 None:intergenic
TGCTATGAAATGGAAAGATT+TGG 0.369448 7:+62661144 MsG0780039356.01.T01:CDS
ATTGAAGATGTGTGGAAGAC+TGG 0.369778 7:+62661013 MsG0780039356.01.T01:CDS
TGTGAAAATGCAATGGTACT+AGG 0.374419 7:-62659780 None:intergenic
TGAGGAAATTAGAAAGTGTT+TGG 0.376286 7:+62661075 MsG0780039356.01.T01:CDS
TCTGTGGTTTATGTTTCATT+TGG 0.382887 7:+62660653 MsG0780039356.01.T01:CDS
ATCAACAAACCAACCATTCC+CGG 0.385515 7:+62659957 MsG0780039356.01.T01:CDS
ATTCCATCTGCTTTCTTGGA+TGG 0.390798 7:+62660536 MsG0780039356.01.T01:CDS
ATCTGCTTTCTTGGATGGCA+AGG 0.390937 7:+62660541 MsG0780039356.01.T01:CDS
GAAGGTGGCGAAGGAGAGGC+CGG 0.398831 7:-62659976 None:intergenic
GAATGGTTGGTTTGTTGATA+AGG 0.402080 7:-62659953 None:intergenic
TAGGAGAAGTGTTTATATAA+TGG 0.407717 7:-62659708 None:intergenic
GGGTTTATGTGACCTTGTAT+TGG 0.410596 7:-62659852 None:intergenic
TCCCAAAGAAATAAGACGTT+TGG 0.415295 7:-62659889 None:intergenic
CTTTGGAAAGTCTAGGTTCA+GGG 0.416026 7:+62660936 MsG0780039356.01.T01:CDS
ACTTTGGAAAGTCTAGGTTC+AGG 0.419474 7:+62660935 MsG0780039356.01.T01:CDS
TGAAGCTCATGCGCCACCTT+GGG 0.422160 7:-62660170 None:intergenic
GGTCTTCTGGTAGGAATTTG+AGG 0.424537 7:+62661191 MsG0780039356.01.T01:CDS
TAAGGAGCAATGCTATGAAA+TGG 0.426419 7:+62661134 MsG0780039356.01.T01:CDS
CGTTTGGCGAATTGGAGAGC+AGG 0.434806 7:-62659873 None:intergenic
AATAGTAAAATGGTGTTGTC+AGG 0.437401 7:+62660853 MsG0780039356.01.T01:CDS
GATCCTACGGATAATTCGTT+TGG 0.439492 7:+62660563 MsG0780039356.01.T01:CDS
GGATGATTACATTGAATGGT+TGG 0.440664 7:+62660613 MsG0780039356.01.T01:CDS
TGTCATTCTCTCTTAAAAGC+TGG 0.443441 7:+62660324 MsG0780039356.01.T01:CDS
GAACTTGAGAATAATATGAA+TGG 0.443864 7:+62660827 MsG0780039356.01.T01:CDS
CAAAGGATGATTACATTGAA+TGG 0.450185 7:+62660609 MsG0780039356.01.T01:CDS
CATTGAATGGTTGGATTCGA+AGG 0.450624 7:+62660622 MsG0780039356.01.T01:CDS
TTCTCTGACGGCTACGACAA+CGG 0.458445 7:+62659996 MsG0780039356.01.T01:CDS
GTCATTCTCTCTTAAAAGCT+GGG 0.462272 7:+62660325 MsG0780039356.01.T01:CDS
GGAAATTGCACGTGCCTTGT+TGG 0.467937 7:+62660709 MsG0780039356.01.T01:CDS
TTGTGGATGGAATTCTACTT+TGG 0.469318 7:+62660919 MsG0780039356.01.T01:CDS
TTCTGTTGGCATATTTGTGT+TGG 0.469543 7:+62658314 MsG0780039356.01.T01:CDS
TCTAGGTTCAGGGGTTCCTA+TGG 0.471648 7:+62660946 MsG0780039356.01.T01:CDS
GTGTAGATTAAGCAAGTGAA+TGG 0.474492 7:-62660128 None:intergenic
TGGCATATTTGTGTTGGCTA+AGG 0.488932 7:+62658320 MsG0780039356.01.T01:CDS
AAAATGGTGTTGTCAGGTGG+AGG 0.490927 7:+62660859 MsG0780039356.01.T01:CDS
ACGGTGTTGACAAGTACTCT+TGG 0.493761 7:-62660440 None:intergenic
AACTTGAGAATAATATGAAT+GGG 0.497468 7:+62660828 MsG0780039356.01.T01:CDS
AAAGTGTTTGGAAGTGGTGA+TGG 0.499781 7:+62661087 MsG0780039356.01.T01:CDS
CGGTGTTGACAAGTACTCTT+GGG 0.500520 7:-62660439 None:intergenic
GACGATGTCTTCGTCGCCAA+AGG 0.502152 7:-62660027 None:intergenic
AAGGAGAGGCCGGGAATGGT+TGG 0.502271 7:-62659966 None:intergenic
TTTGGAAGTGGTGATGGGGA+AGG 0.504289 7:+62661093 MsG0780039356.01.T01:CDS
GGCGAAGGAGAGGCCGGGAA+TGG 0.504331 7:-62659970 None:intergenic
TGAATTTGCTCTTTGAGAGA+TGG 0.505507 7:-62660395 None:intergenic
CTACACTCTCATACTTTCAT+GGG 0.505946 7:+62660145 MsG0780039356.01.T01:CDS
AGATGCATGTATGGATGGAT+AGG 0.507112 7:-62659727 None:intergenic
GTGAAGCTCATGCGCCACCT+TGG 0.507202 7:-62660171 None:intergenic
GATGGAACGCGATGAGGAAG+GGG 0.508443 7:+62661042 MsG0780039356.01.T01:CDS
ACATGTTCAATATCATTGCC+AGG 0.510796 7:+62660299 MsG0780039356.01.T01:CDS
CATACTTTCATGGGCTCCCA+AGG 0.514035 7:+62660154 MsG0780039356.01.T01:CDS
CTATGGTTGCATTTCCTCAG+TGG 0.517244 7:+62660963 MsG0780039356.01.T01:CDS
AATTAGAAAGTGTTTGGAAG+TGG 0.518170 7:+62661081 MsG0780039356.01.T01:CDS
CTTGGATGGCAAGGATCCTA+CGG 0.519016 7:+62660550 MsG0780039356.01.T01:CDS
GTGAAAATGCAATGGTACTA+GGG 0.519890 7:-62659779 None:intergenic
TGTGACAAGAGATGCATGTA+TGG 0.521309 7:-62659736 None:intergenic
TTGAAGATGTGTGGAAGACT+GGG 0.522155 7:+62661014 MsG0780039356.01.T01:CDS
TTGGAAGTGGTGATGGGGAA+GGG 0.526340 7:+62661094 MsG0780039356.01.T01:CDS
GGATGGAACGCGATGAGGAA+GGG 0.526683 7:+62661041 MsG0780039356.01.T01:CDS
TTAAGAGAGAATGACAATCC+TGG 0.527271 7:-62660317 None:intergenic
TGAAATGGAAAGATTTGGCT+AGG 0.528911 7:+62661149 MsG0780039356.01.T01:CDS
AATGCAATGGTACTAGGGAA+TGG 0.532360 7:-62659774 None:intergenic
TGTCAATGCATGTGCGGTTG+AGG 0.537258 7:-62658278 None:intergenic
ATCTGTATTCGTGATTCTGT+TGG 0.541737 7:+62658300 MsG0780039356.01.T01:CDS
CAGAGAAGGTGGCGAAGGAG+AGG 0.542729 7:-62659980 None:intergenic
AGGATGGAACGCGATGAGGA+AGG 0.543074 7:+62661040 MsG0780039356.01.T01:CDS
CCTACGGATAATTCGTTTGG+CGG 0.544712 7:+62660566 MsG0780039356.01.T01:CDS
GGTATGTAATAATGAGGAAG+TGG 0.544838 7:-62659830 None:intergenic
GCTAGGGCAGCTGTGAAAGA+AGG 0.545401 7:+62661166 MsG0780039356.01.T01:CDS
AAGTGTTTGGAAGTGGTGAT+GGG 0.545845 7:+62661088 MsG0780039356.01.T01:CDS
GTGGAAGACTGGGGTGAGGA+TGG 0.548727 7:+62661024 MsG0780039356.01.T01:CDS
GCCGTCAGAGAAGGTGGCGA+AGG 0.550129 7:-62659985 None:intergenic
AATGGTGGTGGTGACGTTTG+CGG 0.550703 7:-62659690 None:intergenic
AGATGGAATCAACGGTCCGA+TGG 0.551510 7:-62660522 None:intergenic
TGATAAGGCGGCTGTATAAG+TGG 0.553403 7:-62659938 None:intergenic
TGAGCCGTGGCGCGTAAACT+CGG 0.555970 7:-62660060 None:intergenic
TGATAGTGTCGACTTCGAAA+CGG 0.560444 7:+62658431 MsG0780039356.01.T01:CDS
AATTCTACTTTGGAAAGTCT+AGG 0.564070 7:+62660929 MsG0780039356.01.T01:CDS
ACCTCCCATCAGCAATGCTG+TGG 0.564929 7:+62660192 MsG0780039356.01.T01:CDS
TTGCCATCCAAGAAAGCAGA+TGG 0.568984 7:-62660539 None:intergenic
TCCTTCGCCACCTTCTCTGA+CGG 0.573633 7:+62659984 MsG0780039356.01.T01:CDS
AGTAAAATGGTGTTGTCAGG+TGG 0.575448 7:+62660856 MsG0780039356.01.T01:CDS
GCGGCTGTATAAGTGGATAG+TGG 0.575660 7:-62659931 None:intergenic
ATGTAATAATGAGGAAGTGG+TGG 0.576043 7:-62659827 None:intergenic
GTTTGGCGAATTGGAGAGCA+GGG 0.584389 7:-62659872 None:intergenic
TTTGGAAAGTCTAGGTTCAG+GGG 0.584468 7:+62660937 MsG0780039356.01.T01:CDS
GAGAAGTGTTTATATAATGG+TGG 0.589469 7:-62659705 None:intergenic
CATTGTCCGTGTTGACTCAA+AGG 0.592237 7:+62660592 MsG0780039356.01.T01:CDS
AGGGCAGCTGTGAAAGAAGG+AGG 0.595155 7:+62661169 MsG0780039356.01.T01:CDS
TATTATTACTTTCATGAACA+CGG 0.595546 7:+62660245 MsG0780039356.01.T01:CDS
TGAATCCACAGCATTGCTGA+TGG 0.597952 7:-62660197 None:intergenic
GATGGAATCAACGGTCCGAT+GGG 0.598230 7:-62660521 None:intergenic
GAATCCACAGCATTGCTGAT+GGG 0.599319 7:-62660196 None:intergenic
CAAAGTTAATTGAAGATGTG+TGG 0.600584 7:+62661005 MsG0780039356.01.T01:CDS
GTCGTAGCCGTCAGAGAAGG+TGG 0.601211 7:-62659991 None:intergenic
CTACATCACAAACAAATCAA+AGG 0.601504 7:+62660271 MsG0780039356.01.T01:CDS
TTGTGAGAAATTCTGAGCCG+TGG 0.603283 7:-62660073 None:intergenic
TTCACAAGCCACCACTACCA+TGG 0.604119 7:+62659797 MsG0780039356.01.T01:CDS
GCGCGTAAACTCGGACATGT+AGG 0.604173 7:-62660051 None:intergenic
ACAAGAGATGCATGTATGGA+TGG 0.605666 7:-62659732 None:intergenic
AAGGTGGCGAAGGAGAGGCC+GGG 0.606277 7:-62659975 None:intergenic
ATGTGTGGAAGACTGGGGTG+AGG 0.610628 7:+62661020 MsG0780039356.01.T01:CDS
GAAATGGAAAGATTTGGCTA+GGG 0.610996 7:+62661150 MsG0780039356.01.T01:CDS
AAGAAGGAGGGTCTTCTGGT+AGG 0.612081 7:+62661182 MsG0780039356.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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ATGTAATAATGAGGAAGTGG+TGG - Chr7:62659830-62659849 None:intergenic 35.0%
CCCAAGCTAAAATCCAATAA+TGG + Chr7:62659638-62659657 MsG0780039356.01.T01:intron 35.0%
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TTCTGTTGGCATATTTGTGT+TGG + Chr7:62658314-62658333 MsG0780039356.01.T01:CDS 35.0%
TTGTGGATGGAATTCTACTT+TGG + Chr7:62660919-62660938 MsG0780039356.01.T01:CDS 35.0%
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! TATTTTTCTAATTTCGCCGC+AGG - Chr7:62658837-62658856 None:intergenic 35.0%
! TGAATTTGCTCTTTGAGAGA+TGG - Chr7:62660398-62660417 None:intergenic 35.0%
!! GAATGGTTGGTTTGTTGATA+AGG - Chr7:62659956-62659975 None:intergenic 35.0%
!! GCCAAACGTCTTATTTCTTT+GGG + Chr7:62659888-62659907 MsG0780039356.01.T01:CDS 35.0%
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AAGTGTTTGGAAGTGGTGAT+GGG + Chr7:62661088-62661107 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
AATGCAATGGTACTAGGGAA+TGG - Chr7:62659777-62659796 None:intergenic 40.0%
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AGTCAAGGCTACACAAAGAA+AGG + Chr7:62659520-62659539 MsG0780039356.01.T01:intron 40.0%
ATCAACAAACCAACCATTCC+CGG + Chr7:62659957-62659976 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
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ATTCCATCTGCTTTCTTGGA+TGG + Chr7:62660536-62660555 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
ATTGAAGATGTGTGGAAGAC+TGG + Chr7:62661013-62661032 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
CATTGAATGGTTGGATTCGA+AGG + Chr7:62660622-62660641 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
GACAACGGTCAAAAATCCTT+TGG + Chr7:62660011-62660030 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
GAGAAAAAGGAGAGGAACTA+AGG + Chr7:62661116-62661135 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
GATCCTACGGATAATTCGTT+TGG + Chr7:62660563-62660582 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
GGGTTTATGTGACCTTGTAT+TGG - Chr7:62659855-62659874 None:intergenic 40.0%
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TTGAAGATGTGTGGAAGACT+GGG + Chr7:62661014-62661033 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
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TTTGTTAGGCGACAAGCTAA+CGG + Chr7:62658573-62658592 MsG0780039356.01.T01:intron 40.0%
! AAAGTGTTTGGAAGTGGTGA+TGG + Chr7:62661087-62661106 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
! ACTTTGGAAAGTCTAGGTTC+AGG + Chr7:62660935-62660954 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
! CGAAACGGATTCTAAACTGA+CGG + Chr7:62658446-62658465 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
! CTTTGGAAAGTCTAGGTTCA+GGG + Chr7:62660936-62660955 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
! GTTGATTCCATCTGCTTTCT+TGG + Chr7:62660532-62660551 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
! GTTTTATCGCACCGTTCTTT+GGG + Chr7:62660881-62660900 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
! GTTTTGTGACACATTGTGGA+TGG + Chr7:62660906-62660925 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
!! AGTAAAATGGTGTTGTCAGG+TGG + Chr7:62660856-62660875 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
!! CGCCAAACGTCTTATTTCTT+TGG + Chr7:62659887-62659906 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
!! GGTTGTTTTGTGACACATTG+TGG + Chr7:62660902-62660921 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
!! TGATAGTGTCGACTTCGAAA+CGG + Chr7:62658431-62658450 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
!! TGGCATATTTGTGTTGGCTA+AGG + Chr7:62658320-62658339 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
!! TGGTTGGTTTGTTGATAAGG+CGG - Chr7:62659953-62659972 None:intergenic 40.0%
!!! GGACCTTCCCTCTTTTTTAT+TGG + Chr7:62660346-62660365 MsG0780039356.01.T01:CDS 40.0%
AATCAGAGTGGTGATACCAG+GGG - Chr7:62659551-62659570 None:intergenic 45.0%
ACGTCAATAGAAACGCAGCA+CGG - Chr7:62658357-62658376 None:intergenic 45.0%
AGGAATGACACGTCCGAATT+TGG + Chr7:62658489-62658508 MsG0780039356.01.T01:intron 45.0%
AGTACTTGTCAACACCGTTG+AGG + Chr7:62660445-62660464 MsG0780039356.01.T01:CDS 45.0%
ATCTGCTTTCTTGGATGGCA+AGG + Chr7:62660541-62660560 MsG0780039356.01.T01:CDS 45.0%
ATTGACGTGGGTGAAGCTTT+AGG + Chr7:62658369-62658388 MsG0780039356.01.T01:CDS 45.0%
CAATCAGAGTGGTGATACCA+GGG - Chr7:62659552-62659571 None:intergenic 45.0%
CACTGAGGAAATGCAACCAT+AGG - Chr7:62660965-62660984 None:intergenic 45.0%
CCTACGGATAATTCGTTTGG+CGG + Chr7:62660566-62660585 MsG0780039356.01.T01:CDS 45.0%
CTATGGTTGCATTTCCTCAG+TGG + Chr7:62660963-62660982 MsG0780039356.01.T01:CDS 45.0%
GAATCCACAGCATTGCTGAT+GGG - Chr7:62660199-62660218 None:intergenic 45.0%
GAGATGTGTGTCACGTATGA+TGG + Chr7:62658799-62658818 MsG0780039356.01.T01:intron 45.0%
GGTCTTCTGGTAGGAATTTG+AGG + Chr7:62661191-62661210 MsG0780039356.01.T01:CDS 45.0%
GTAGTTTGATCTGTCCACTG+AGG - Chr7:62660980-62660999 None:intergenic 45.0%
TCAATCAGAGTGGTGATACC+AGG - Chr7:62659553-62659572 None:intergenic 45.0%
TGAAGATGTGTGGAAGACTG+GGG + Chr7:62661015-62661034 MsG0780039356.01.T01:CDS 45.0%
TGAATCCACAGCATTGCTGA+TGG - Chr7:62660200-62660219 None:intergenic 45.0%
TGATAAGGCGGCTGTATAAG+TGG - Chr7:62659941-62659960 None:intergenic 45.0%
TGATGAGCTGAGTTGTAGAG+AGG + Chr7:62660805-62660824 MsG0780039356.01.T01:CDS 45.0%
TGCTGCGTTTCTATTGACGT+GGG + Chr7:62658357-62658376 MsG0780039356.01.T01:CDS 45.0%
TTCGAAGGATGAATCGTCTG+TGG + Chr7:62660637-62660656 MsG0780039356.01.T01:CDS 45.0%
TTGCCATCCAAGAAAGCAGA+TGG - Chr7:62660542-62660561 None:intergenic 45.0%
TTGTGAGAAATTCTGAGCCG+TGG - Chr7:62660076-62660095 None:intergenic 45.0%
TTGTTAGGCGACAAGCTAAC+GGG + Chr7:62658574-62658593 MsG0780039356.01.T01:intron 45.0%
! AGTGTTTGGAAGTGGTGATG+GGG + Chr7:62661089-62661108 MsG0780039356.01.T01:CDS 45.0%
! GGTGGCTTGTGAAAATGCAA+TGG - Chr7:62659790-62659809 None:intergenic 45.0%
!! AAAATGGTGTTGTCAGGTGG+AGG + Chr7:62660859-62660878 MsG0780039356.01.T01:CDS 45.0%
!! ACGGTGTTGACAAGTACTCT+TGG - Chr7:62660443-62660462 None:intergenic 45.0%
!! ACTCTAGGGTGGAGTTTGTT+AGG + Chr7:62658559-62658578 MsG0780039356.01.T01:intron 45.0%
!! CATTGTCCGTGTTGACTCAA+AGG + Chr7:62660592-62660611 MsG0780039356.01.T01:CDS 45.0%
!! CGGTGTTGACAAGTACTCTT+GGG - Chr7:62660442-62660461 None:intergenic 45.0%
!! GCACTGAGAGAAGTTGATGT+TGG + Chr7:62660482-62660501 MsG0780039356.01.T01:CDS 45.0%
!! GGTTTTATCGCACCGTTCTT+TGG + Chr7:62660880-62660899 MsG0780039356.01.T01:CDS 45.0%
!!! AAATTATTATTTTTTATAGT+TGG - Chr7:62658872-62658891 None:intergenic 5.0%
AAGAAGGAGGGTCTTCTGGT+AGG + Chr7:62661182-62661201 MsG0780039356.01.T01:CDS 50.0%
ACAAAGAAAGGATACGCCCC+TGG + Chr7:62659532-62659551 MsG0780039356.01.T01:intron 50.0%
AGATGGAATCAACGGTCCGA+TGG - Chr7:62660525-62660544 None:intergenic 50.0%
ATGGTCAACGTATCACCCTG+CGG + Chr7:62658818-62658837 MsG0780039356.01.T01:intron 50.0%
CATACTTTCATGGGCTCCCA+AGG + Chr7:62660154-62660173 MsG0780039356.01.T01:CDS 50.0%
CCGCCAAACGAATTATCCGT+AGG - Chr7:62660569-62660588 None:intergenic 50.0%
CCTAACACTCCGTCCTACAT+TGG - Chr7:62658734-62658753 None:intergenic 50.0%
CTTGGATGGCAAGGATCCTA+CGG + Chr7:62660550-62660569 MsG0780039356.01.T01:CDS 50.0%
GATGGAATCAACGGTCCGAT+GGG - Chr7:62660524-62660543 None:intergenic 50.0%
GCGGCTGTATAAGTGGATAG+TGG - Chr7:62659934-62659953 None:intergenic 50.0%
GCTGTGGATTCAAGCAGCAA+CGG + Chr7:62660208-62660227 MsG0780039356.01.T01:CDS 50.0%
GGAAATTGCACGTGCCTTGT+TGG + Chr7:62660709-62660728 MsG0780039356.01.T01:CDS 50.0%
GTGAAAGAAGGAGGGTCTTC+TGG + Chr7:62661178-62661197 MsG0780039356.01.T01:CDS 50.0%
GTGCTGCGTTTCTATTGACG+TGG + Chr7:62658356-62658375 MsG0780039356.01.T01:CDS 50.0%
GTTTGCACTCGACGTTACAG+TGG + Chr7:62658391-62658410 MsG0780039356.01.T01:CDS 50.0%
GTTTGGCGAATTGGAGAGCA+GGG - Chr7:62659875-62659894 None:intergenic 50.0%
TACTAGGGAATGGAGTGCGA+AGG - Chr7:62659767-62659786 None:intergenic 50.0%
TCTAGGTTCAGGGGTTCCTA+TGG + Chr7:62660946-62660965 MsG0780039356.01.T01:CDS 50.0%
TGTCAATGCATGTGCGGTTG+AGG - Chr7:62658281-62658300 None:intergenic 50.0%
TGTTAGGCGACAAGCTAACG+GGG + Chr7:62658575-62658594 MsG0780039356.01.T01:intron 50.0%
TTCACAAGCCACCACTACCA+TGG + Chr7:62659797-62659816 MsG0780039356.01.T01:CDS 50.0%
TTCTCTGACGGCTACGACAA+CGG + Chr7:62659996-62660015 MsG0780039356.01.T01:CDS 50.0%
! CCAATGTAGGACGGAGTGTT+AGG + Chr7:62658731-62658750 MsG0780039356.01.T01:intron 50.0%
! GTAGGACGGAGTGTTAGGTA+GGG + Chr7:62658736-62658755 MsG0780039356.01.T01:intron 50.0%
! GTGATGGGGAAGGGAGAAAA+AGG + Chr7:62661103-62661122 MsG0780039356.01.T01:CDS 50.0%
! TGTAGGACGGAGTGTTAGGT+AGG + Chr7:62658735-62658754 MsG0780039356.01.T01:intron 50.0%
!! AATGGTGGTGGTGACGTTTG+CGG - Chr7:62659693-62659712 None:intergenic 50.0%
!! TTGGAAGTGGTGATGGGGAA+GGG + Chr7:62661094-62661113 MsG0780039356.01.T01:CDS 50.0%
!! TTTGGAAGTGGTGATGGGGA+AGG + Chr7:62661093-62661112 MsG0780039356.01.T01:CDS 50.0%
ACCTCCCATCAGCAATGCTG+TGG + Chr7:62660192-62660211 MsG0780039356.01.T01:CDS 55.0%
ACTTTCATGGGCTCCCAAGG+TGG + Chr7:62660157-62660176 MsG0780039356.01.T01:CDS 55.0%
AGGATGGAACGCGATGAGGA+AGG + Chr7:62661040-62661059 MsG0780039356.01.T01:CDS 55.0%
AGGGCAGCTGTGAAAGAAGG+AGG + Chr7:62661169-62661188 MsG0780039356.01.T01:CDS 55.0%
ATGTCCGAGTTTACGCGCCA+CGG + Chr7:62660056-62660075 MsG0780039356.01.T01:CDS 55.0%
ATGTGTGGAAGACTGGGGTG+AGG + Chr7:62661020-62661039 MsG0780039356.01.T01:CDS 55.0%
CCACGCACAAATGTGACACG+TGG - Chr7:62658771-62658790 None:intergenic 55.0%
CCACGTGTCACATTTGTGCG+TGG + Chr7:62658768-62658787 MsG0780039356.01.T01:intron 55.0%
CGTGTCACATTTGTGCGTGG+TGG + Chr7:62658771-62658790 MsG0780039356.01.T01:intron 55.0%
CGTTTGGCGAATTGGAGAGC+AGG - Chr7:62659876-62659895 None:intergenic 55.0%
GACGATGTCTTCGTCGCCAA+AGG - Chr7:62660030-62660049 None:intergenic 55.0%
GATGGAACGCGATGAGGAAG+GGG + Chr7:62661042-62661061 MsG0780039356.01.T01:CDS 55.0%
GCGCGTAAACTCGGACATGT+AGG - Chr7:62660054-62660073 None:intergenic 55.0%
GCTAGGGCAGCTGTGAAAGA+AGG + Chr7:62661166-62661185 MsG0780039356.01.T01:CDS 55.0%
GGATGGAACGCGATGAGGAA+GGG + Chr7:62661041-62661060 MsG0780039356.01.T01:CDS 55.0%
GGGCAGCTGTGAAAGAAGGA+GGG + Chr7:62661170-62661189 MsG0780039356.01.T01:CDS 55.0%
GGGGAAGGGAGAAAAAGGAG+AGG + Chr7:62661108-62661127 MsG0780039356.01.T01:CDS 55.0%
GTTGTCGTAGCCGTCAGAGA+AGG - Chr7:62659997-62660016 None:intergenic 55.0%
TCCACAGCATTGCTGATGGG+AGG - Chr7:62660196-62660215 None:intergenic 55.0%
TCCTTCGCCACCTTCTCTGA+CGG + Chr7:62659984-62660003 MsG0780039356.01.T01:CDS 55.0%
TGAAGCTCATGCGCCACCTT+GGG - Chr7:62660173-62660192 None:intergenic 55.0%
! GCACGTGCCTTGTTGGATTC+TGG + Chr7:62660716-62660735 MsG0780039356.01.T01:CDS 55.0%
!! GAAGTGGTGGTTTTGCGCCA+TGG - Chr7:62659817-62659836 None:intergenic 55.0%
!! GTGGTTTTGCGCCATGGTAG+TGG - Chr7:62659811-62659830 None:intergenic 55.0%
!!! GTTTTGCGCCATGGTAGTGG+TGG - Chr7:62659808-62659827 None:intergenic 55.0%
AAGGAGAGGCCGGGAATGGT+TGG - Chr7:62659969-62659988 None:intergenic 60.0%
CAGAGAAGGTGGCGAAGGAG+AGG - Chr7:62659983-62660002 None:intergenic 60.0%
GGAAGGGGTGGTGAAAGCTG+AGG + Chr7:62661057-62661076 MsG0780039356.01.T01:CDS 60.0%
GGTGAGGATGGAACGCGATG+AGG + Chr7:62661036-62661055 MsG0780039356.01.T01:CDS 60.0%
GTCGTAGCCGTCAGAGAAGG+TGG - Chr7:62659994-62660013 None:intergenic 60.0%
GTGAAGCTCATGCGCCACCT+TGG - Chr7:62660174-62660193 None:intergenic 60.0%
GTGGAAGACTGGGGTGAGGA+TGG + Chr7:62661024-62661043 MsG0780039356.01.T01:CDS 60.0%
TGAGCCGTGGCGCGTAAACT+CGG - Chr7:62660063-62660082 None:intergenic 60.0%
! GACGGGACTAGCGAGTAACG+TGG - Chr7:62658625-62658644 None:intergenic 60.0%
! GGACGGAGTGTTAGGTAGGG+TGG + Chr7:62658739-62658758 MsG0780039356.01.T01:intron 60.0%
AAGGTGGCGAAGGAGAGGCC+GGG - Chr7:62659978-62659997 None:intergenic 65.0%
GAAGGTGGCGAAGGAGAGGC+CGG - Chr7:62659979-62659998 None:intergenic 65.0%
GCCGTCAGAGAAGGTGGCGA+AGG - Chr7:62659988-62660007 None:intergenic 65.0%
GGAACGCGATGAGGAAGGGG+TGG + Chr7:62661045-62661064 MsG0780039356.01.T01:CDS 65.0%
GGCGAAGGAGAGGCCGGGAA+TGG - Chr7:62659973-62659992 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 62658252 62661252 62658252 ID=MsG0780039356.01;Name=MsG0780039356.01
Chr7 mRNA 62658252 62661252 62658252 ID=MsG0780039356.01.T01;Parent=MsG0780039356.01;Name=MsG0780039356.01.T01;_AED=0.15;_eAED=0.18;_QI=0|0|0|1|0|0|2|0|606
Chr7 exon 62658252 62658499 62658252 ID=MsG0780039356.01.T01:exon:16145;Parent=MsG0780039356.01.T01
Chr7 exon 62659680 62661252 62659680 ID=MsG0780039356.01.T01:exon:16144;Parent=MsG0780039356.01.T01
Chr7 CDS 62658252 62658499 62658252 ID=MsG0780039356.01.T01:cds;Parent=MsG0780039356.01.T01
Chr7 CDS 62659680 62661252 62659680 ID=MsG0780039356.01.T01:cds;Parent=MsG0780039356.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780039356.01.T01

GAGGCTGATGCTGCTTTCTCTTCTCACCTCAACCGCACATGCATTGACATCTGTATTCGTGATTCTGTTGGCATATTTGTGTTGGCTAAGGCTGTGAGTTATCCGTGCTGCGTTTCTATTGACGTGGGTGAAGCTTTAGGTTTGCACTCGACGTTACAGTGGTTTGATGATATGCATTTTGATAGTGTCGACTTCGAAACGGATTCTAAACTGACGGCTGATGCTTTTCTGTCTAATAGGAATGACACAGATTCGTCACCGCAAACGTCACCACCACCATTATATAAACACTTCTCCTATCCATCCATACATGCATCTCTTGTCACACATTTCCTTCGCACTCCATTCCCTAGTACCATTGCATTTTCACAAGCCACCACTACCATGGCGCAAAACCACCACTTCCTCATTATTACATACCCAATACAAGGTCACATAAACCCTGCTCTCCAATTCGCCAAACGTCTTATTTCTTTGGGAGCAAAAGTCACTTTTGCTACCACTATCCACTTATACAGCCGCCTTATCAACAAACCAACCATTCCCGGCCTCTCCTTCGCCACCTTCTCTGACGGCTACGACAACGGTCAAAAATCCTTTGGCGACGAAGACATCGTCTCCTACATGTCCGAGTTTACGCGCCACGGCTCAGAATTTCTCACAAATATCATTCTCTCCTCCAAACAAGAAAATCATCCATTCACTTGCTTAATCTACACTCTCATACTTTCATGGGCTCCCAAGGTGGCGCATGAGCTTCACCTCCCATCAGCAATGCTGTGGATTCAAGCAGCAACGGTGTTTGATATATTCTATTATTACTTTCATGAACACGGTGACTACATCACAAACAAATCAAAGGATGAAACATGTTCAATATCATTGCCAGGATTGTCATTCTCTCTTAAAAGCTGGGACCTTCCCTCTTTTTTATTGGCTTCAAATACATACACTTTTGCTCTTCCATCTCTCAAAGAGCAAATTCAGTTGTTGAATGAAGAAAACAACCCAAGAGTACTTGTCAACACCGTTGAGGAGTTTGAACTCGATGCACTGAGAGAAGTTGATGTTGGTAAGATCAAAATGATACCCATCGGACCGTTGATTCCATCTGCTTTCTTGGATGGCAAGGATCCTACGGATAATTCGTTTGGCGGTGACATTGTCCGTGTTGACTCAAAGGATGATTACATTGAATGGTTGGATTCGAAGGATGAATCGTCTGTGGTTTATGTTTCATTTGGTACTCTTGCTGTTTTGTCTAAGAGACAAATGGAGGAAATTGCACGTGCCTTGTTGGATTCTGGATTTTCTTTCTTGTGGGTAATTAGAGATAAAAAAAATCAACAACAAAAAGAAGTTGATGATGATGATGATGAGCTGAGTTGTAGAGAGGAACTTGAGAATAATATGAATGGGAAAATAGTAAAATGGTGTTGTCAGGTGGAGGTTTTATCGCACCGTTCTTTGGGTTGTTTTGTGACACATTGTGGATGGAATTCTACTTTGGAAAGTCTAGGTTCAGGGGTTCCTATGGTTGCATTTCCTCAGTGGACAGATCAAACTACTAATGCAAAGTTAATTGAAGATGTGTGGAAGACTGGGGTGAGGATGGAACGCGATGAGGAAGGGGTGGTGAAAGCTGAGGAAATTAGAAAGTGTTTGGAAGTGGTGATGGGGAAGGGAGAAAAAGGAGAGGAACTAAGGAGCAATGCTATGAAATGGAAAGATTTGGCTAGGGCAGCTGTGAAAGAAGGAGGGTCTTCTGGTAGGAATTTGAGGAGTTTTCTAAATGATATTGCAAGTATAACTCAAAATTAG
Protein sequence

>MsG0780039356.01.T01

EADAAFSSHLNRTCIDICIRDSVGIFVLAKAVSYPCCVSIDVGEALGLHSTLQWFDDMHFDSVDFETDSKLTADAFLSNRNDTDSSPQTSPPPLYKHFSYPSIHASLVTHFLRTPFPSTIAFSQATTTMAQNHHFLIITYPIQGHINPALQFAKRLISLGAKVTFATTIHLYSRLINKPTIPGLSFATFSDGYDNGQKSFGDEDIVSYMSEFTRHGSEFLTNIILSSKQENHPFTCLIYTLILSWAPKVAHELHLPSAMLWIQAATVFDIFYYYFHEHGDYITNKSKDETCSISLPGLSFSLKSWDLPSFLLASNTYTFALPSLKEQIQLLNEENNPRVLVNTVEEFELDALREVDVGKIKMIPIGPLIPSAFLDGKDPTDNSFGGDIVRVDSKDDYIEWLDSKDESSVVYVSFGTLAVLSKRQMEEIARALLDSGFSFLWVIRDKKNQQQKEVDDDDDELSCREELENNMNGKIVKWCCQVEVLSHRSLGCFVTHCGWNSTLESLGSGVPMVAFPQWTDQTTNAKLIEDVWKTGVRMERDEEGVVKAEEIRKCLEVVMGKGEKGEELRSNAMKWKDLARAAVKEGGSSGRNLRSFLNDIASITQN*