AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480018198.01

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MsG0480018198.01.T01 AT3G62890 25.442 283 193 9 12 282 103 379 4.88e-17 85.1
MsG0480018198.01.T01 AT2G02980 34.647 482 307 5 120 595 37 516 6.12e-91 293
MsG0480018198.01.T01 AT2G02980 29.810 369 237 7 15 370 35 394 6.16e-47 174
MsG0480018198.01.T01 AT5G44230 35.881 471 263 6 163 595 5 474 6.16e-91 291
MsG0480018198.01.T01 AT5G44230 24.599 374 232 8 61 393 11 375 5.46e-27 115
MsG0480018198.01.T01 AT1G03540 31.522 552 352 9 15 552 67 606 1.75e-90 291
MsG0480018198.01.T01 AT1G03540 30.127 395 262 7 106 495 60 445 1.07e-45 171
MsG0480018198.01.T01 AT5G65570 32.437 595 376 9 15 595 71 653 2.96e-90 295
MsG0480018198.01.T01 AT1G25360 31.749 589 329 7 78 595 117 703 6.61e-90 295
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MsG0480018198.01.T01 AT3G53360 33.535 331 215 3 93 418 50 380 2.17e-54 197
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MsG0480018198.01.T01 AT2G37310 26.012 346 212 4 128 429 41 386 1.45e-36 145
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MsG0480018198.01.T01 AT5G39350 26.884 491 344 7 12 493 21 505 6.08e-49 181
MsG0480018198.01.T01 AT5G39350 26.727 333 238 2 102 429 8 339 1.68e-40 157
MsG0480018198.01.T01 AT2G33760 37.093 399 239 6 195 584 92 487 7.74e-85 276
MsG0480018198.01.T01 AT2G33760 31.761 318 208 4 75 383 73 390 5.89e-47 174
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MsG0480018198.01.T01 AT2G21090 25.784 287 142 5 210 429 49 331 3.84e-20 94.7
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MsG0480018198.01.T01 AT2G36980 28.529 340 175 5 158 429 18 357 3.04e-34 138
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MsG0480018198.01.T01 AT2G36980 28.529 340 175 5 158 429 9 348 3.85e-34 137
MsG0480018198.01.T01 AT3G61170 32.136 501 298 5 80 575 198 661 7.64e-79 265
MsG0480018198.01.T01 AT3G61170 32.014 278 185 2 143 416 58 335 3.50e-36 145
MsG0480018198.01.T01 AT2G17210 32.465 499 321 9 78 566 215 707 8.09e-79 264
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MsG0480018198.01.T01 AT1G22830 28.286 601 372 9 20 573 97 685 3.52e-72 245
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MsG0480018198.01.T01 AT5G43790 35.393 356 220 5 203 552 108 459 7.62e-72 238
MsG0480018198.01.T01 AT5G43790 26.368 402 276 9 13 397 13 411 7.70e-38 146
MsG0480018198.01.T01 AT2G35030 32.353 442 286 6 148 584 175 608 2.12e-71 241
MsG0480018198.01.T01 AT2G35030 27.869 305 169 9 158 426 60 349 2.19e-29 123
MsG0480018198.01.T01 AT2G35030 25.792 221 145 6 254 473 58 260 1.01e-17 87.4
MsG0480018198.01.T01 AT2G35030 28.105 153 104 3 80 226 301 453 6.73e-14 75.1
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MsG0480018198.01.T01 AT1G16480 25.306 490 357 5 22 507 75 559 2.96e-45 172
MsG0480018198.01.T01 AT1G16480 26.374 273 197 2 153 421 1 273 1.75e-30 127
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MsG0480018198.01.T01 AT5G52850 28.298 470 283 10 117 536 25 490 1.06e-39 155
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MsG0480018198.01.T01 AT3G56550 32.653 441 291 3 155 590 50 489 4.20e-70 237
MsG0480018198.01.T01 AT3G56550 27.273 418 293 7 11 418 7 423 6.21e-44 166
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MsG0480018198.01.T01 AT1G33350 32.370 346 229 3 240 581 191 535 9.50e-68 229
MsG0480018198.01.T01 AT1G33350 26.526 426 252 12 16 389 31 447 7.96e-37 144
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MsG0480018198.01.T01 AT3G26630 22.868 258 161 4 204 429 20 271 9.43e-12 67.8
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MsG0480018198.01.T01 AT3G49740 24.727 275 173 7 246 488 127 399 2.65e-15 79.7
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MsG0480018198.01.T01 AT5G03800 30.563 373 209 9 148 477 118 483 3.74e-39 154
MsG0480018198.01.T01 AT5G03800 26.209 393 243 8 80 428 151 540 6.07e-29 123
MsG0480018198.01.T01 AT5G03800 20.984 305 215 7 210 501 83 374 2.37e-13 73.9
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MsG0480018198.01.T01 AT5G42450 25.413 303 185 11 21 282 108 410 3.15e-13 72.8
MsG0480018198.01.T01 AT1G10330 34.217 415 233 7 178 553 54 467 2.42e-60 208
MsG0480018198.01.T01 AT5G66500 32.112 464 283 12 107 551 80 530 9.15e-60 208
MsG0480018198.01.T01 AT5G66500 28.479 309 194 8 118 419 3 291 9.36e-27 114
MsG0480018198.01.T01 AT5G66500 27.746 346 227 10 26 360 104 437 2.23e-24 107
MsG0480018198.01.T01 AT1G43980 29.752 484 324 7 110 586 151 625 1.59e-59 209
MsG0480018198.01.T01 AT1G43980 26.184 359 248 9 22 370 161 512 1.67e-22 102
MsG0480018198.01.T01 AT1G43980 29.057 265 171 7 163 418 101 357 5.79e-22 100
MsG0480018198.01.T01 AT1G43980 26.178 191 137 3 240 429 80 267 4.10e-15 79.0
MsG0480018198.01.T01 AT1G32415 30.442 565 293 13 108 587 199 748 2.65e-59 211
MsG0480018198.01.T01 AT1G32415 27.195 353 190 12 158 495 183 483 1.98e-19 93.2
MsG0480018198.01.T01 AT1G32415 25.649 308 143 9 171 478 73 294 2.39e-17 86.3
MsG0480018198.01.T01 AT1G03510 31.655 417 247 7 171 550 8 423 3.09e-59 204
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MsG0480018198.01.T01 AT5G12100 20.957 439 310 12 177 589 146 573 2.26e-14 77.0
MsG0480018198.01.T01 AT1G09820 22.018 327 238 5 126 435 205 531 3.73e-14 75.9
MsG0480018198.01.T01 AT5G21222 20.507 434 310 10 72 472 302 733 4.68e-14 75.9
MsG0480018198.01.T01 AT5G21222 20.507 434 310 10 72 472 302 733 4.68e-14 75.9
MsG0480018198.01.T01 AT5G21222 20.507 434 310 10 72 472 302 733 4.68e-14 75.9
MsG0480018198.01.T01 AT5G21222 20.507 434 310 10 72 472 302 733 4.68e-14 75.9
MsG0480018198.01.T01 AT4G19890 21.460 452 321 10 77 504 255 696 5.39e-14 75.9
MsG0480018198.01.T01 AT4G19890 22.059 340 235 9 150 471 126 453 2.36e-11 67.4
MsG0480018198.01.T01 AT1G55890 24.786 234 163 6 248 471 115 345 6.92e-14 74.3
MsG0480018198.01.T01 AT1G73710 20.889 450 322 10 11 435 310 750 7.09e-14 75.5
MsG0480018198.01.T01 AT2G18940 23.529 425 274 13 80 472 392 797 9.87e-14 75.1
MsG0480018198.01.T01 AT4G20090 21.514 502 319 13 78 546 191 650 1.26e-13 74.3
MsG0480018198.01.T01 AT4G20090 21.514 502 319 13 78 546 191 650 1.26e-13 74.3
MsG0480018198.01.T01 AT5G61400 21.413 467 308 17 97 525 187 632 1.40e-13 74.3
MsG0480018198.01.T01 AT2G01740 20.866 508 337 16 64 531 74 556 1.46e-13 73.9
MsG0480018198.01.T01 AT2G01740 20.767 313 201 7 204 487 53 347 1.66e-12 70.9
MsG0480018198.01.T01 AT2G06000 24.026 308 218 6 177 472 105 408 1.80e-13 73.6
MsG0480018198.01.T01 AT2G06000 24.026 308 218 6 177 472 105 408 1.80e-13 73.6
MsG0480018198.01.T01 AT2G39230 21.218 476 309 14 90 506 255 723 2.39e-13 73.9
MsG0480018198.01.T01 AT1G74580 20.681 411 281 7 74 472 321 698 3.62e-13 73.2
MsG0480018198.01.T01 AT1G74580 17.540 439 283 6 80 472 187 592 1.63e-12 70.9
MsG0480018198.01.T01 AT1G74580 20.681 411 281 7 74 472 321 698 3.62e-13 73.2
MsG0480018198.01.T01 AT1G74580 17.540 439 283 6 80 472 187 592 1.63e-12 70.9
MsG0480018198.01.T01 AT1G74580 20.681 411 281 7 74 472 321 698 3.62e-13 73.2
MsG0480018198.01.T01 AT1G74580 17.540 439 283 6 80 472 187 592 1.63e-12 70.9
MsG0480018198.01.T01 AT1G12300 19.518 456 342 9 93 527 72 523 3.89e-13 72.8
MsG0480018198.01.T01 AT1G12300 24.390 246 176 5 233 472 13 254 1.24e-11 68.2
MsG0480018198.01.T01 AT1G12300 23.134 268 193 4 174 430 332 597 4.41e-11 66.2
MsG0480018198.01.T01 AT4G16390 20.504 278 207 4 229 494 162 437 5.15e-13 72.4
MsG0480018198.01.T01 AT1G19290 21.090 422 246 10 91 495 207 558 1.01e-12 71.6
MsG0480018198.01.T01 AT1G19290 19.862 579 398 12 8 530 333 901 4.79e-12 69.7
MsG0480018198.01.T01 AT1G19290 21.090 422 246 10 91 495 207 558 1.01e-12 71.6
MsG0480018198.01.T01 AT1G19290 19.862 579 398 12 8 530 333 901 4.79e-12 69.7
MsG0480018198.01.T01 AT5G16420 21.101 327 209 6 104 416 186 477 1.41e-12 70.9
MsG0480018198.01.T01 AT5G16420 21.101 327 209 6 104 416 186 477 1.41e-12 70.9
MsG0480018198.01.T01 AT5G16420 21.101 327 209 6 104 416 186 477 1.41e-12 70.9
MsG0480018198.01.T01 AT5G16420 21.101 327 209 6 104 416 186 477 1.41e-12 70.9
MsG0480018198.01.T01 AT3G13150 22.318 233 170 3 246 469 161 391 1.74e-12 70.5
MsG0480018198.01.T01 AT1G13040 24.522 314 217 9 174 472 148 456 1.79e-12 70.5
MsG0480018198.01.T01 AT1G13040 24.522 314 217 9 174 472 148 456 1.79e-12 70.5
MsG0480018198.01.T01 AT2G17525 25.641 234 170 1 243 472 218 451 2.20e-12 70.5
MsG0480018198.01.T01 AT5G38730 19.824 454 321 10 4 435 76 508 2.21e-12 70.5
MsG0480018198.01.T01 AT4G34830 19.533 471 302 13 67 501 378 807 2.25e-12 70.9
MsG0480018198.01.T01 AT1G06580 21.639 305 226 4 201 494 2 304 2.40e-12 69.3
MsG0480018198.01.T01 AT1G06580 20.052 384 290 6 104 472 3 384 9.23e-11 64.7
MsG0480018198.01.T01 AT1G06580 21.639 305 226 4 201 494 2 304 2.40e-12 69.3
MsG0480018198.01.T01 AT1G06580 20.052 384 290 6 104 472 3 384 9.23e-11 64.7
MsG0480018198.01.T01 AT2G41720 20.280 429 293 8 78 490 217 612 3.16e-12 70.1
MsG0480018198.01.T01 AT5G04810 20.798 351 216 9 242 544 484 820 3.62e-12 70.1
MsG0480018198.01.T01 AT2G41720 20.280 429 293 8 78 490 217 612 3.80e-12 69.7
MsG0480018198.01.T01 AT5G57250 22.581 279 194 6 277 543 175 443 4.04e-12 70.1
MsG0480018198.01.T01 AT5G57250 21.378 421 270 13 66 469 163 539 7.78e-12 68.9
MsG0480018198.01.T01 AT3G04760 20.531 414 275 10 77 472 127 504 4.09e-12 69.3
MsG0480018198.01.T01 AT2G41720 20.280 429 293 8 78 490 85 480 4.53e-12 69.3
MsG0480018198.01.T01 AT5G04810 20.724 304 189 7 242 497 484 783 4.63e-12 69.7
MsG0480018198.01.T01 AT1G74750 22.311 251 182 4 247 486 364 612 4.79e-12 69.7
MsG0480018198.01.T01 AT1G74750 22.311 251 182 4 247 486 364 612 4.79e-12 69.7
MsG0480018198.01.T01 AT1G74750 22.311 251 182 4 247 486 364 612 4.79e-12 69.7
MsG0480018198.01.T01 AT1G74750 22.311 251 182 4 247 486 364 612 4.79e-12 69.7
MsG0480018198.01.T01 AT1G63230 23.457 162 117 2 174 328 110 271 5.69e-12 67.8
MsG0480018198.01.T01 AT2G17140 22.796 329 232 6 246 556 151 475 2.53e-11 67.4
MsG0480018198.01.T01 AT2G17140 22.796 329 232 6 246 556 151 475 2.53e-11 67.4
MsG0480018198.01.T01 AT3G07290 23.529 272 190 5 244 501 232 499 3.91e-11 66.6
MsG0480018198.01.T01 AT1G18900 22.530 253 183 4 263 504 385 635 5.14e-11 66.2
MsG0480018198.01.T01 AT1G18900 22.530 253 183 4 263 504 385 635 5.14e-11 66.2
MsG0480018198.01.T01 AT1G18900 22.530 253 183 4 263 504 385 635 5.14e-11 66.2
MsG0480018198.01.T01 AT1G18900 22.530 253 183 4 263 504 385 635 5.34e-11 66.2
MsG0480018198.01.T01 AT2G15630 20.513 390 283 6 116 489 241 619 8.00e-11 65.5
MsG0480018198.01.T01 AT1G53330 23.346 257 183 5 260 504 66 320 8.96e-11 64.3
MsG0480018198.01.T01 AT5G14770 21.718 419 287 10 79 472 234 636 9.25e-11 65.5
MsG0480018198.01.T01 AT5G14770 21.718 419 287 10 79 472 234 636 9.25e-11 65.5
MsG0480018198.01.T01 AT5G14770 21.718 419 287 10 79 472 234 636 9.25e-11 65.5
MsG0480018198.01.T01 AT5G14770 21.718 419 287 10 79 472 234 636 9.25e-11 65.5
MsG0480018198.01.T01 AT5G14770 21.718 419 287 10 79 472 234 636 9.25e-11 65.5

Find 159 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 174 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTCTCTTGACATTCAAAATT+TGG 0.089914 4:-1501333 None:intergenic
ATTAAAACAATTTGGATATT+TGG 0.096964 4:+1500999 MsG0480018198.01.T01:CDS
CCTTGCAATTTGATAATTTC+TGG 0.134839 4:+1500046 MsG0480018198.01.T01:CDS
GAAATTGGGTTGTTTGAATT+TGG 0.138735 4:+1500474 MsG0480018198.01.T01:CDS
GCCTAATGAGATTACATTTC+TGG 0.149399 4:+1501038 MsG0480018198.01.T01:CDS
TCTTGGGGCATGTGGGAAAT+TGG 0.159044 4:+1500459 MsG0480018198.01.T01:CDS
TTCTATGAAATGGGTTCTTT+TGG 0.203695 4:+1499838 MsG0480018198.01.T01:CDS
TTTACAGCTTGCTGTCATTC+TGG 0.205429 4:+1501066 MsG0480018198.01.T01:CDS
CAAGAAGCATTAAAACAATT+TGG 0.211275 4:+1500991 MsG0480018198.01.T01:CDS
GCAACATTTGTTAGCATTCT+TGG 0.236542 4:+1500442 MsG0480018198.01.T01:CDS
ATAGGTGGTTTAGCAATAAA+TGG 0.253106 4:+1500961 MsG0480018198.01.T01:CDS
TTTGGTGATTGGGATGAATA+AGG 0.259050 4:+1499808 None:intergenic
AGTCTTGGGCTTCTTGATTA+TGG 0.280678 4:+1500778 MsG0480018198.01.T01:CDS
TCTTACCATCCACCGTTATA+AGG 0.284815 4:-1501470 None:intergenic
AAATTGGGTTGTTTGAATTT+GGG 0.286256 4:+1500475 MsG0480018198.01.T01:CDS
TATTGCTAAACCACCTATAT+AGG 0.288316 4:-1500956 None:intergenic
CTTGGGGCATGTGGGAAATT+GGG 0.290571 4:+1500460 MsG0480018198.01.T01:CDS
TTCTATGAAATGTTGGGTTC+AGG 0.298502 4:+1500706 MsG0480018198.01.T01:CDS
TTTGGATATTTGGTTGAATC+TGG 0.311140 4:+1501009 MsG0480018198.01.T01:CDS
CAACATTTGTTAGCATTCTT+GGG 0.330203 4:+1500443 MsG0480018198.01.T01:CDS
TTCGACATTTCCATATGTAT+TGG 0.333507 4:-1501283 None:intergenic
TAACCAGGGAGAAAGATTAT+AGG 0.335515 4:-1501136 None:intergenic
CTTTCTGCTTGTGCTAGTCT+TGG 0.336983 4:+1500763 MsG0480018198.01.T01:CDS
CTAACAAATGTTGCTGCATT+AGG 0.340733 4:-1500433 None:intergenic
GTATGGTTGATTTGCTCTGC+AGG 0.340777 4:+1501172 MsG0480018198.01.T01:CDS
CTCTGCAGGGCTGAATTGGT+GGG 0.342464 4:+1501186 MsG0480018198.01.T01:CDS
TTTGCTCTGCAGGGCTGAAT+TGG 0.345129 4:+1501182 MsG0480018198.01.T01:CDS
AGGGTAAGCATTCTATGAAA+TGG 0.350659 4:+1499828 MsG0480018198.01.T01:CDS
CTGCAATTCAGATTTATAGA+TGG 0.351239 4:+1500095 MsG0480018198.01.T01:CDS
TCTTGGACTGGTTTGATATC+CGG 0.353423 4:+1500349 MsG0480018198.01.T01:CDS
AATTTGGGGAAGGGGATTCA+TGG 0.359509 4:+1500490 MsG0480018198.01.T01:CDS
TATATGTGCTTCTCTCTAAT+TGG 0.362810 4:+1501361 MsG0480018198.01.T01:CDS
GGTATGCAAATAATAAGAAA+TGG 0.363840 4:+1501382 MsG0480018198.01.T01:CDS
GCTCTGCAGGGCTGAATTGG+TGG 0.367748 4:+1501185 MsG0480018198.01.T01:CDS
AACCAGGGAGAAAGATTATA+GGG 0.368750 4:-1501135 None:intergenic
ATAATTTCTGGCTATGGAAC+TGG 0.373850 4:+1500058 MsG0480018198.01.T01:CDS
CGTACTTGGAATGCCTATAT+AGG 0.380591 4:+1500943 MsG0480018198.01.T01:CDS
GGCTTCTTGATTATGGAAGA+TGG 0.383696 4:+1500785 MsG0480018198.01.T01:CDS
ATTTCTTGAAGCAGTTTGAT+TGG 0.393360 4:+1500008 MsG0480018198.01.T01:CDS
ACCCTCAAGGTAGCTTTGAT+TGG 0.403878 4:-1501565 None:intergenic
TTCATGTTTATAGCATTTGC+GGG 0.411593 4:+1500272 MsG0480018198.01.T01:CDS
TTGAGTGCCTCCAATACATA+TGG 0.411935 4:+1501273 MsG0480018198.01.T01:CDS
GGGGAAGGGGATTCATGGGT+TGG 0.412543 4:+1500495 MsG0480018198.01.T01:CDS
AGCTTGCTGTCATTCTGGCT+TGG 0.415727 4:+1501071 MsG0480018198.01.T01:CDS
CAAGTACGGATATTCTTAGA+AGG 0.418332 4:-1500928 None:intergenic
GCTCCTAGGATCTGCACATC+AGG 0.420938 4:-1501246 None:intergenic
ATGGAACTGGCCACTTACCT+TGG 0.421204 4:+1500071 MsG0480018198.01.T01:CDS
ATAGATGGGTTGTCGGTAAC+GGG 0.424282 4:+1500110 MsG0480018198.01.T01:CDS
CATTCTGGCTTGGTTGATGA+AGG 0.424553 4:+1501081 MsG0480018198.01.T01:CDS
TGGAACTGGCCACTTACCTT+GGG 0.425578 4:+1500072 MsG0480018198.01.T01:CDS
TTTCTGCTTGTGCTAGTCTT+GGG 0.432979 4:+1500764 MsG0480018198.01.T01:CDS
GTTCATGTTTATAGCATTTG+CGG 0.439744 4:+1500271 MsG0480018198.01.T01:CDS
GCCAGAAATGTAATCTCATT+AGG 0.443863 4:-1501039 None:intergenic
CGGTGAGAGATGTAGTCTCT+TGG 0.446133 4:+1500332 MsG0480018198.01.T01:CDS
TTGGTGATTGGGATGAATAA+GGG 0.450262 4:+1499809 None:intergenic
CTTCTAAGAATATCCGTACT+TGG 0.450318 4:+1500929 MsG0480018198.01.T01:CDS
GTTGTTTGAATTTGGGGAAG+GGG 0.450550 4:+1500482 MsG0480018198.01.T01:CDS
TGCAATTCAGATTTATAGAT+GGG 0.454959 4:+1500096 MsG0480018198.01.T01:CDS
CTTGGACTGGTTTGATATCC+GGG 0.457485 4:+1500350 MsG0480018198.01.T01:CDS
ACGTGAATATCCTCACTTTG+AGG 0.457615 4:-1501525 None:intergenic
GCACATGATTTCAAAACTGC+TGG 0.459478 4:-1500157 None:intergenic
CTCCCTGGTTAGAGCACTAC+GGG 0.460294 4:+1501148 MsG0480018198.01.T01:CDS
GGGTAAGCATTCTATGAAAT+GGG 0.460789 4:+1499829 MsG0480018198.01.T01:CDS
CAGATTTATAGATGGGTTGT+CGG 0.464967 4:+1500103 MsG0480018198.01.T01:CDS
TTCCCTTGTTGACAATGACT+TGG 0.466238 4:+1499925 MsG0480018198.01.T01:CDS
TTGATCATAGCCGTATCAAA+TGG 0.472958 4:+1500821 MsG0480018198.01.T01:CDS
TGATTTGTTCTATGAAATGT+TGG 0.473433 4:+1500699 MsG0480018198.01.T01:CDS
AATTTGATAATTTCTGGCTA+TGG 0.474103 4:+1500052 MsG0480018198.01.T01:CDS
TGTTCACATAGGAACATCAT+TGG 0.476921 4:+1500846 MsG0480018198.01.T01:CDS
GGACACAGTTGGTGCTAGTA+AGG 0.477761 4:+1500294 MsG0480018198.01.T01:CDS
GTATGCAAATAATAAGAAAT+GGG 0.478817 4:+1501383 MsG0480018198.01.T01:CDS
CTGGTTAGTATAATCCTGTC+AGG 0.480824 4:-1500736 None:intergenic
AAGGCTAGAACCTGGAGCCT+TGG 0.482819 4:-1501451 None:intergenic
GCTTCTTGATTATGGAAGAT+GGG 0.486628 4:+1500786 MsG0480018198.01.T01:CDS
CCACCTGATGTGCAGATCCT+AGG 0.488825 4:+1501243 MsG0480018198.01.T01:CDS
TCTGCAGGGCTGAATTGGTG+GGG 0.489654 4:+1501187 MsG0480018198.01.T01:CDS
GACATTTCCATATGTATTGG+AGG 0.491701 4:-1501280 None:intergenic
GGTGGTGAGCAATACTTTGA+TGG 0.492771 4:+1500546 MsG0480018198.01.T01:CDS
GGGCTGAAGTAAGAAGCATT+AGG 0.492819 4:+1501403 MsG0480018198.01.T01:CDS
TATAGATGGGTTGTCGGTAA+CGG 0.496791 4:+1500109 MsG0480018198.01.T01:CDS
CTGCAGGGCTGAATTGGTGG+GGG 0.497646 4:+1501188 MsG0480018198.01.T01:CDS
TTGTGCATGGATTTGTTTGA+AGG 0.499447 4:-1499891 None:intergenic
AGGAGATTGATGAAGGAGAA+AGG 0.503676 4:+1501423 MsG0480018198.01.T01:CDS
AAGAGTCATAAATTCGTAGT+TGG 0.504106 4:+1501489 MsG0480018198.01.T01:CDS
GTTAGCATTCTTGGGGCATG+TGG 0.506253 4:+1500451 MsG0480018198.01.T01:CDS
GCCAATCAAAGCTACCTTGA+GGG 0.506436 4:+1501564 MsG0480018198.01.T01:CDS
GTTAGAGCACTACGGGTGTA+TGG 0.507318 4:+1501155 MsG0480018198.01.T01:CDS
AAGCATTAGGAGATTGATGA+AGG 0.507646 4:+1501416 MsG0480018198.01.T01:CDS
TAGGTGGTTTAGCAATAAAT+GGG 0.514997 4:+1500962 MsG0480018198.01.T01:CDS
CTATATAGGCATTCCAAGTA+CGG 0.516174 4:-1500942 None:intergenic
TCTTGGACTAGTATGATAAG+TGG 0.516433 4:+1500643 MsG0480018198.01.T01:CDS
AACTGCTTCAAGAAATTGCA+AGG 0.519146 4:-1500001 None:intergenic
ATTTGGGGAAGGGGATTCAT+GGG 0.524283 4:+1500491 MsG0480018198.01.T01:CDS
ACACCCGTAGTGCTCTAACC+AGG 0.528381 4:-1501151 None:intergenic
CAACCAAGTCATTGTCAACA+AGG 0.529565 4:-1499928 None:intergenic
TCTCCCTGGTTAGAGCACTA+CGG 0.532569 4:+1501147 MsG0480018198.01.T01:CDS
TATGGTTGATTTGCTCTGCA+GGG 0.533611 4:+1501173 MsG0480018198.01.T01:CDS
TGATCATAGCCGTATCAAAT+GGG 0.534117 4:+1500822 MsG0480018198.01.T01:CDS
GATTTGTTCTATGAAATGTT+GGG 0.536147 4:+1500700 MsG0480018198.01.T01:CDS
CCAGAAATTATCAAATTGCA+AGG 0.539508 4:-1500046 None:intergenic
GCTGGGACAGTGTACACATC+AGG 0.541731 4:-1500139 None:intergenic
AACATTTGTTAGCATTCTTG+GGG 0.549352 4:+1500444 MsG0480018198.01.T01:CDS
GGGTTGTTTGAATTTGGGGA+AGG 0.551108 4:+1500480 MsG0480018198.01.T01:CDS
GGTTTAGCAATAAATGGGCA+TGG 0.552903 4:+1500967 MsG0480018198.01.T01:CDS
GAATTGCAGCCCAAGGTAAG+TGG 0.553797 4:-1500081 None:intergenic
ATATCCGGGTATATGAAGGC+AGG 0.556399 4:+1500364 MsG0480018198.01.T01:CDS
AGAGATGTAGTCTCTTGGAC+TGG 0.557749 4:+1500337 MsG0480018198.01.T01:CDS
TGTGAACATCCCATTTGATA+CGG 0.560558 4:-1500831 None:intergenic
GGTTGTTTGAATTTGGGGAA+GGG 0.561089 4:+1500481 MsG0480018198.01.T01:CDS
TCCAGGTTCTAGCCTTATAA+CGG 0.561616 4:+1501458 MsG0480018198.01.T01:CDS
CACATGATTTCAAAACTGCT+GGG 0.565838 4:-1500156 None:intergenic
CAAGGTAGCTTTGATTGGCA+AGG 0.567125 4:-1501560 None:intergenic
TTTGATATCCGGGTATATGA+AGG 0.567184 4:+1500360 MsG0480018198.01.T01:CDS
AGCATTTGCGGGGACACAGT+TGG 0.569032 4:+1500283 MsG0480018198.01.T01:CDS
ATTTGGTTGAATCTGGTACA+AGG 0.571427 4:+1501016 MsG0480018198.01.T01:CDS
AAAGGAATATCCAAGGCTCC+AGG 0.572991 4:+1501441 MsG0480018198.01.T01:CDS
CATGGCTGTTTGGTCATGAA+AGG 0.576660 4:-1501599 None:intergenic
AATTGGGTTGTTTGAATTTG+GGG 0.581087 4:+1500476 MsG0480018198.01.T01:CDS
ACCGTTATAAGGCTAGAACC+TGG 0.582034 4:-1501459 None:intergenic
AGGCACTCAAAAGAGCTCCT+AGG 0.585235 4:-1501260 None:intergenic
ATCTGCACATCAGGTGGCAT+AGG 0.585263 4:-1501237 None:intergenic
TTCTAAATATCCGCATGGAA+AGG 0.585481 4:+1500519 MsG0480018198.01.T01:CDS
TATCCTCACTTTGAGGATGG+TGG 0.586126 4:-1501518 None:intergenic
ACTTGGAATGCCTATATAGG+TGG 0.589597 4:+1500946 MsG0480018198.01.T01:CDS
TCCGCATGGAAAGGAGTTGG+TGG 0.589770 4:+1500528 MsG0480018198.01.T01:CDS
GGTTAAACAAATTCATACGT+TGG 0.592041 4:+1500201 MsG0480018198.01.T01:CDS
GGCAGGTTTGTTCAATGATG+CGG 0.594339 4:+1500381 MsG0480018198.01.T01:CDS
CAAGTGATTCTTGTGGACAC+TGG 0.595704 4:-1500678 None:intergenic
AAGATCTCAAAAGTTGTGCA+TGG 0.596590 4:-1499904 None:intergenic
GTTTAGCAATAAATGGGCAT+GGG 0.597816 4:+1500968 MsG0480018198.01.T01:CDS
TCTAGCCTTATAACGGTGGA+TGG 0.601317 4:+1501465 MsG0480018198.01.T01:CDS
CAAACCTGCCTTCATATACC+CGG 0.606721 4:-1500368 None:intergenic
AACAAATCAAGTGATTCTTG+TGG 0.608126 4:-1500685 None:intergenic
CACCCGTAGTGCTCTAACCA+GGG 0.608605 4:-1501150 None:intergenic
CAGAAATTATCAAATTGCAA+GGG 0.609767 4:-1500045 None:intergenic
TAAATCTGAATTGCAGCCCA+AGG 0.610329 4:-1500088 None:intergenic
ATATCCGCATGGAAAGGAGT+TGG 0.610816 4:+1500525 MsG0480018198.01.T01:CDS
GAATATCCTCACTTTGAGGA+TGG 0.612808 4:-1501521 None:intergenic
TTGGTTTCTAAATATCCGCA+TGG 0.613127 4:+1500514 MsG0480018198.01.T01:CDS
GAAGGAGAAAGGAATATCCA+AGG 0.616131 4:+1501434 MsG0480018198.01.T01:CDS
GGGTATCAATATGACCCTCA+AGG 0.621773 4:-1501578 None:intergenic
CCTAGGATCTGCACATCAGG+TGG 0.621964 4:-1501243 None:intergenic
TTAGCATTCTTGGGGCATGT+GGG 0.625883 4:+1500452 MsG0480018198.01.T01:CDS
TAAATGCGGCTGTATAGAGA+TGG 0.635250 4:+1500882 MsG0480018198.01.T01:CDS
ATGGCTGTTTGGTCATGAAA+GGG 0.641111 4:-1501598 None:intergenic
AACCAAGTCATTGTCAACAA+GGG 0.649322 4:-1499927 None:intergenic
TGCCAATCAAAGCTACCTTG+AGG 0.656895 4:+1501563 MsG0480018198.01.T01:CDS
TAACCACCATCCTCAAAGTG+AGG 0.658714 4:+1501515 MsG0480018198.01.T01:CDS
CCAGGGAGAAAGATTATAGG+GGG 0.669825 4:-1501133 None:intergenic
ACTGCTTCAAGAAATTGCAA+GGG 0.673892 4:-1500000 None:intergenic
AGGTTCTAGCCTTATAACGG+TGG 0.674788 4:+1501461 MsG0480018198.01.T01:CDS
ATCAAATGGGATGTTCACAT+AGG 0.674899 4:+1500835 MsG0480018198.01.T01:CDS
TCATGTTTATAGCATTTGCG+GGG 0.675849 4:+1500273 MsG0480018198.01.T01:CDS
ACCAGGGAGAAAGATTATAG+GGG 0.690796 4:-1501134 None:intergenic
AGCACAAGCAGAAAGCACAC+TGG 0.696826 4:-1500755 None:intergenic
ACCACCAACTCCTTTCCATG+CGG 0.697121 4:-1500529 None:intergenic
TGGCTGTTAAGACTGACTTG+TGG 0.732158 4:+1500221 MsG0480018198.01.T01:CDS
GTTGACATGTATGCTAAATG+CGG 0.741074 4:+1500868 MsG0480018198.01.T01:CDS
CAGGGAGAAAGATTATAGGG+GGG 0.766702 4:-1501132 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATTAAAACAATTTGGATATT+TGG + Chr4:1500999-1501018 MsG0480018198.01.T01:CDS 15.0%
!!! CAACAAATTAAAAATTTGTT+GGG - Chr4:1500908-1500927 None:intergenic 15.0%
!! GCAACAAATTAAAAATTTGT+TGG - Chr4:1500909-1500928 None:intergenic 20.0%
!! GTATGCAAATAATAAGAAAT+GGG + Chr4:1501383-1501402 MsG0480018198.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAAGGTATTTGATTTTATGT+CGG + Chr4:1500312-1500331 MsG0480018198.01.T01:CDS 20.0%
! CAGAAATTATCAAATTGCAA+GGG - Chr4:1500048-1500067 None:intergenic 25.0%
! GGTATGCAAATAATAAGAAA+TGG + Chr4:1501382-1501401 MsG0480018198.01.T01:CDS 25.0%
! TGCAATTCAGATTTATAGAT+GGG + Chr4:1500096-1500115 MsG0480018198.01.T01:CDS 25.0%
!! AAATTGGGTTGTTTGAATTT+GGG + Chr4:1500475-1500494 MsG0480018198.01.T01:CDS 25.0%
!! GATTTGTTCTATGAAATGTT+GGG + Chr4:1500700-1500719 MsG0480018198.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAGAAACAATGTCTTTTTCA+GGG - Chr4:1500627-1500646 None:intergenic 25.0%
!!! AATTTGATAATTTCTGGCTA+TGG + Chr4:1500052-1500071 MsG0480018198.01.T01:CDS 25.0%
!!! CAAGAAGCATTAAAACAATT+TGG + Chr4:1500991-1501010 MsG0480018198.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGATTTGTTCTATGAAATGT+TGG + Chr4:1500699-1500718 MsG0480018198.01.T01:CDS 25.0%
AACAAATCAAGTGATTCTTG+TGG - Chr4:1500688-1500707 None:intergenic 30.0%
AAGAGTCATAAATTCGTAGT+TGG + Chr4:1501489-1501508 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
ATAGGTGGTTTAGCAATAAA+TGG + Chr4:1500961-1500980 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
ATTTCTTGAAGCAGTTTGAT+TGG + Chr4:1500008-1500027 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
CCAGAAATTATCAAATTGCA+AGG - Chr4:1500049-1500068 None:intergenic 30.0%
CTCTCTTGACATTCAAAATT+TGG - Chr4:1501336-1501355 None:intergenic 30.0%
CTGCAATTCAGATTTATAGA+TGG + Chr4:1500095-1500114 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
GGTTAAACAAATTCATACGT+TGG + Chr4:1500201-1500220 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
GTTCATGTTTATAGCATTTG+CGG + Chr4:1500271-1500290 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
TAGGTGGTTTAGCAATAAAT+GGG + Chr4:1500962-1500981 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
TATATGTGCTTCTCTCTAAT+TGG + Chr4:1501361-1501380 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
TATTGCTAAACCACCTATAT+AGG - Chr4:1500959-1500978 None:intergenic 30.0%
TTCATGTTTATAGCATTTGC+GGG + Chr4:1500272-1500291 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
TTCGACATTTCCATATGTAT+TGG - Chr4:1501286-1501305 None:intergenic 30.0%
TTTGGATATTTGGTTGAATC+TGG + Chr4:1501009-1501028 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
! AACATTTGTTAGCATTCTTG+GGG + Chr4:1500444-1500463 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
! AATTGGGTTGTTTGAATTTG+GGG + Chr4:1500476-1500495 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
! AATTTTGAATGTCAAGAGAG+TGG + Chr4:1501336-1501355 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
! CAACATTTGTTAGCATTCTT+GGG + Chr4:1500443-1500462 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
! CAAGAAACAATGTCTTTTTC+AGG - Chr4:1500628-1500647 None:intergenic 30.0%
! CCTTGCAATTTGATAATTTC+TGG + Chr4:1500046-1500065 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
! CTGAAAAAGACATTGTTTCT+TGG + Chr4:1500626-1500645 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
! GAAATTGGGTTGTTTGAATT+TGG + Chr4:1500474-1500493 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
! TTCTTTTGGATTTCATTCAG+AGG + Chr4:1499852-1499871 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
!! TTCTATGAAATGGGTTCTTT+TGG + Chr4:1499838-1499857 MsG0480018198.01.T01:CDS 30.0%
!!! GGAAGTGTTTTTAACAATTC+TGG - Chr4:1501315-1501334 None:intergenic 30.0%
AACCAAGTCATTGTCAACAA+GGG - Chr4:1499930-1499949 None:intergenic 35.0%
AACCAGGGAGAAAGATTATA+GGG - Chr4:1501138-1501157 None:intergenic 35.0%
AACTGCTTCAAGAAATTGCA+AGG - Chr4:1500004-1500023 None:intergenic 35.0%
AAGATCTCAAAAGTTGTGCA+TGG - Chr4:1499907-1499926 None:intergenic 35.0%
AAGCATTAGGAGATTGATGA+AGG + Chr4:1501416-1501435 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
ACTGCTTCAAGAAATTGCAA+GGG - Chr4:1500003-1500022 None:intergenic 35.0%
AGGGTAAGCATTCTATGAAA+TGG + Chr4:1499828-1499847 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
ATCAAATGGGATGTTCACAT+AGG + Chr4:1500835-1500854 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
ATTTGGTTGAATCTGGTACA+AGG + Chr4:1501016-1501035 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
CAAGTACGGATATTCTTAGA+AGG - Chr4:1500931-1500950 None:intergenic 35.0%
CACATGATTTCAAAACTGCT+GGG - Chr4:1500159-1500178 None:intergenic 35.0%
CTAACAAATGTTGCTGCATT+AGG - Chr4:1500436-1500455 None:intergenic 35.0%
CTATATAGGCATTCCAAGTA+CGG - Chr4:1500945-1500964 None:intergenic 35.0%
GACATTTCCATATGTATTGG+AGG - Chr4:1501283-1501302 None:intergenic 35.0%
GCCAGAAATGTAATCTCATT+AGG - Chr4:1501042-1501061 None:intergenic 35.0%
GCCTAATGAGATTACATTTC+TGG + Chr4:1501038-1501057 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
GCTTCTTGATTATGGAAGAT+GGG + Chr4:1500786-1500805 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
GGGTAAGCATTCTATGAAAT+GGG + Chr4:1499829-1499848 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
GTTGACATGTATGCTAAATG+CGG + Chr4:1500868-1500887 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
GTTTAGCAATAAATGGGCAT+GGG + Chr4:1500968-1500987 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
TAACCAGGGAGAAAGATTAT+AGG - Chr4:1501139-1501158 None:intergenic 35.0%
TCATGTTTATAGCATTTGCG+GGG + Chr4:1500273-1500292 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
TGATCATAGCCGTATCAAAT+GGG + Chr4:1500822-1500841 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
TGTGAACATCCCATTTGATA+CGG - Chr4:1500834-1500853 None:intergenic 35.0%
TGTTCACATAGGAACATCAT+TGG + Chr4:1500846-1500865 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
TTCTAAATATCCGCATGGAA+AGG + Chr4:1500519-1500538 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
TTCTATGAAATGTTGGGTTC+AGG + Chr4:1500706-1500725 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
TTGATCATAGCCGTATCAAA+TGG + Chr4:1500821-1500840 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
TTGGTTTCTAAATATCCGCA+TGG + Chr4:1500514-1500533 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
TTTGATATCCGGGTATATGA+AGG + Chr4:1500360-1500379 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
! AAATCATGTGCTAGGTTTTC+TGG + Chr4:1500169-1500188 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
! CTTCTAAGAATATCCGTACT+TGG + Chr4:1500929-1500948 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
! GCAACATTTGTTAGCATTCT+TGG + Chr4:1500442-1500461 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
! TTGTGCATGGATTTGTTTGA+AGG - Chr4:1499894-1499913 None:intergenic 35.0%
!! ATAATTTCTGGCTATGGAAC+TGG + Chr4:1500058-1500077 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
!! CAGATTTATAGATGGGTTGT+CGG + Chr4:1500103-1500122 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
!! TCTTGGACTAGTATGATAAG+TGG + Chr4:1500643-1500662 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACCAAAGCTGCAAACTTTTT+TGG + Chr4:1499953-1499972 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
!!! CAGTTTTGAAATCATGTGCT+AGG + Chr4:1500161-1500180 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
!!! CCAAAGCTGCAAACTTTTTT+GGG + Chr4:1499954-1499973 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
!!! GGTTGCATTGTTTTTGAGAA+TGG + Chr4:1500402-1500421 MsG0480018198.01.T01:CDS 35.0%
ACCAGGGAGAAAGATTATAG+GGG - Chr4:1501137-1501156 None:intergenic 40.0%
ACGTGAATATCCTCACTTTG+AGG - Chr4:1501528-1501547 None:intergenic 40.0%
ACTTGGAATGCCTATATAGG+TGG + Chr4:1500946-1500965 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
AGGAGATTGATGAAGGAGAA+AGG + Chr4:1501423-1501442 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
AGTCTTGGGCTTCTTGATTA+TGG + Chr4:1500778-1500797 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
CAACCAAGTCATTGTCAACA+AGG - Chr4:1499931-1499950 None:intergenic 40.0%
CCCAAAAAAGTTTGCAGCTT+TGG - Chr4:1499957-1499976 None:intergenic 40.0%
CGTACTTGGAATGCCTATAT+AGG + Chr4:1500943-1500962 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
CTGGTTAGTATAATCCTGTC+AGG - Chr4:1500739-1500758 None:intergenic 40.0%
GAAGGAGAAAGGAATATCCA+AGG + Chr4:1501434-1501453 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
GCACATGATTTCAAAACTGC+TGG - Chr4:1500160-1500179 None:intergenic 40.0%
GGCTTCTTGATTATGGAAGA+TGG + Chr4:1500785-1500804 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
GGTTGTTTGAATTTGGGGAA+GGG + Chr4:1500481-1500500 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
GGTTTAGCAATAAATGGGCA+TGG + Chr4:1500967-1500986 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
GTTGTTTGAATTTGGGGAAG+GGG + Chr4:1500482-1500501 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
TAAATCTGAATTGCAGCCCA+AGG - Chr4:1500091-1500110 None:intergenic 40.0%
TAAATGCGGCTGTATAGAGA+TGG + Chr4:1500882-1500901 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
TCTTACCATCCACCGTTATA+AGG - Chr4:1501473-1501492 None:intergenic 40.0%
TTCCCTTGTTGACAATGACT+TGG + Chr4:1499925-1499944 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
TTGAGTGCCTCCAATACATA+TGG + Chr4:1501273-1501292 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
! GAATATCCTCACTTTGAGGA+TGG - Chr4:1501524-1501543 None:intergenic 40.0%
!! TAGGTTTTCTGGTATTGCAG+AGG + Chr4:1500180-1500199 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
!! TATAGATGGGTTGTCGGTAA+CGG + Chr4:1500109-1500128 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
!! TATGGTTGATTTGCTCTGCA+GGG + Chr4:1501173-1501192 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
!! TCCAGGTTCTAGCCTTATAA+CGG + Chr4:1501458-1501477 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
!! TCTTGGACTGGTTTGATATC+CGG + Chr4:1500349-1500368 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTACAGCTTGCTGTCATTC+TGG + Chr4:1501066-1501085 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTCTGCTTGTGCTAGTCTT+GGG + Chr4:1500764-1500783 MsG0480018198.01.T01:CDS 40.0%
AAAGGAATATCCAAGGCTCC+AGG + Chr4:1501441-1501460 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
AATTTGGGGAAGGGGATTCA+TGG + Chr4:1500490-1500509 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
ACCGTTATAAGGCTAGAACC+TGG - Chr4:1501462-1501481 None:intergenic 45.0%
AGAGATGTAGTCTCTTGGAC+TGG + Chr4:1500337-1500356 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
ATATCCGCATGGAAAGGAGT+TGG + Chr4:1500525-1500544 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
ATATCCGGGTATATGAAGGC+AGG + Chr4:1500364-1500383 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
ATTTGGGGAAGGGGATTCAT+GGG + Chr4:1500491-1500510 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
CAAACCTGCCTTCATATACC+CGG - Chr4:1500371-1500390 None:intergenic 45.0%
CAAGTGATTCTTGTGGACAC+TGG - Chr4:1500681-1500700 None:intergenic 45.0%
CAGGGAGAAAGATTATAGGG+GGG - Chr4:1501135-1501154 None:intergenic 45.0%
CCAGGGAGAAAGATTATAGG+GGG - Chr4:1501136-1501155 None:intergenic 45.0%
GCCAATCAAAGCTACCTTGA+GGG + Chr4:1501564-1501583 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
GGGTATCAATATGACCCTCA+AGG - Chr4:1501581-1501600 None:intergenic 45.0%
GGGTTGTTTGAATTTGGGGA+AGG + Chr4:1500480-1500499 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
GGTGGTGAGCAATACTTTGA+TGG + Chr4:1500546-1500565 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
TAACCACCATCCTCAAAGTG+AGG + Chr4:1501515-1501534 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
TGCCAATCAAAGCTACCTTG+AGG + Chr4:1501563-1501582 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
TTAGCATTCTTGGGGCATGT+GGG + Chr4:1500452-1500471 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
! CTTTCTGCTTGTGCTAGTCT+TGG + Chr4:1500763-1500782 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
! GGCAGGTTTGTTCAATGATG+CGG + Chr4:1500381-1500400 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
! TATCCTCACTTTGAGGATGG+TGG - Chr4:1501521-1501540 None:intergenic 45.0%
!! ACCCTCAAGGTAGCTTTGAT+TGG - Chr4:1501568-1501587 None:intergenic 45.0%
!! AGGTTCTAGCCTTATAACGG+TGG + Chr4:1501461-1501480 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
!! ATAGATGGGTTGTCGGTAAC+GGG + Chr4:1500110-1500129 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
!! CAAGGTAGCTTTGATTGGCA+AGG - Chr4:1501563-1501582 None:intergenic 45.0%
!! CATTCTGGCTTGGTTGATGA+AGG + Chr4:1501081-1501100 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
!! CTTGGACTGGTTTGATATCC+GGG + Chr4:1500350-1500369 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
!! GGGCTGAAGTAAGAAGCATT+AGG + Chr4:1501403-1501422 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
!! GTATGGTTGATTTGCTCTGC+AGG + Chr4:1501172-1501191 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
!! TCTAGCCTTATAACGGTGGA+TGG + Chr4:1501465-1501484 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
!! TGGCTGTTAAGACTGACTTG+TGG + Chr4:1500221-1500240 MsG0480018198.01.T01:CDS 45.0%
ACCACCAACTCCTTTCCATG+CGG - Chr4:1500532-1500551 None:intergenic 50.0%
AGGCACTCAAAAGAGCTCCT+AGG - Chr4:1501263-1501282 None:intergenic 50.0%
ATCTGCACATCAGGTGGCAT+AGG - Chr4:1501240-1501259 None:intergenic 50.0%
ATGGAACTGGCCACTTACCT+TGG + Chr4:1500071-1500090 MsG0480018198.01.T01:CDS 50.0%
CCCCCTATAATCTTTCTCCC+TGG + Chr4:1501133-1501152 MsG0480018198.01.T01:CDS 50.0%
CGGTGAGAGATGTAGTCTCT+TGG + Chr4:1500332-1500351 MsG0480018198.01.T01:CDS 50.0%
CTTGGGGCATGTGGGAAATT+GGG + Chr4:1500460-1500479 MsG0480018198.01.T01:CDS 50.0%
GAATTGCAGCCCAAGGTAAG+TGG - Chr4:1500084-1500103 None:intergenic 50.0%
GTTAGCATTCTTGGGGCATG+TGG + Chr4:1500451-1500470 MsG0480018198.01.T01:CDS 50.0%
TCTTGGGGCATGTGGGAAAT+TGG + Chr4:1500459-1500478 MsG0480018198.01.T01:CDS 50.0%
TGAATTGGTGGGGGAAGCTA+TGG + Chr4:1501197-1501216 MsG0480018198.01.T01:CDS 50.0%
TGGAACTGGCCACTTACCTT+GGG + Chr4:1500072-1500091 MsG0480018198.01.T01:CDS 50.0%
TTTGCTCTGCAGGGCTGAAT+TGG + Chr4:1501182-1501201 MsG0480018198.01.T01:CDS 50.0%
! AGCACAAGCAGAAAGCACAC+TGG - Chr4:1500758-1500777 None:intergenic 50.0%
! GTTAGAGCACTACGGGTGTA+TGG + Chr4:1501155-1501174 MsG0480018198.01.T01:CDS 50.0%
! TCTCCCTGGTTAGAGCACTA+CGG + Chr4:1501147-1501166 MsG0480018198.01.T01:CDS 50.0%
!! AGCTTGCTGTCATTCTGGCT+TGG + Chr4:1501071-1501090 MsG0480018198.01.T01:CDS 50.0%
!! GGACACAGTTGGTGCTAGTA+AGG + Chr4:1500294-1500313 MsG0480018198.01.T01:CDS 50.0%
!!! GTTCAGGTTTTGAGCCTGAC+AGG + Chr4:1500722-1500741 MsG0480018198.01.T01:CDS 50.0%
AAGGCTAGAACCTGGAGCCT+TGG - Chr4:1501454-1501473 None:intergenic 55.0%
ACACCCGTAGTGCTCTAACC+AGG - Chr4:1501154-1501173 None:intergenic 55.0%
AGCATTTGCGGGGACACAGT+TGG + Chr4:1500283-1500302 MsG0480018198.01.T01:CDS 55.0%
CACCCGTAGTGCTCTAACCA+GGG - Chr4:1501153-1501172 None:intergenic 55.0%
CCACCTGATGTGCAGATCCT+AGG + Chr4:1501243-1501262 MsG0480018198.01.T01:CDS 55.0%
CCTAGGATCTGCACATCAGG+TGG - Chr4:1501246-1501265 None:intergenic 55.0%
CTCTGCAGGGCTGAATTGGT+GGG + Chr4:1501186-1501205 MsG0480018198.01.T01:CDS 55.0%
GCTCCTAGGATCTGCACATC+AGG - Chr4:1501249-1501268 None:intergenic 55.0%
GCTGGGACAGTGTACACATC+AGG - Chr4:1500142-1500161 None:intergenic 55.0%
TCCGCATGGAAAGGAGTTGG+TGG + Chr4:1500528-1500547 MsG0480018198.01.T01:CDS 55.0%
TCTGCAGGGCTGAATTGGTG+GGG + Chr4:1501187-1501206 MsG0480018198.01.T01:CDS 55.0%
! CTCCCTGGTTAGAGCACTAC+GGG + Chr4:1501148-1501167 MsG0480018198.01.T01:CDS 55.0%
CTGCAGGGCTGAATTGGTGG+GGG + Chr4:1501188-1501207 MsG0480018198.01.T01:CDS 60.0%
GCTCTGCAGGGCTGAATTGG+TGG + Chr4:1501185-1501204 MsG0480018198.01.T01:CDS 60.0%
GGGGAAGGGGATTCATGGGT+TGG + Chr4:1500495-1500514 MsG0480018198.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 1499821 1501608 1499821 ID=MsG0480018198.01;Name=MsG0480018198.01
Chr4 mRNA 1499821 1501608 1499821 ID=MsG0480018198.01.T01;Parent=MsG0480018198.01;Name=MsG0480018198.01.T01;_AED=0.06;_eAED=0.06;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|595
Chr4 exon 1499821 1501608 1499821 ID=MsG0480018198.01.T01:exon:522;Parent=MsG0480018198.01.T01
Chr4 CDS 1499821 1501608 1499821 ID=MsG0480018198.01.T01:cds;Parent=MsG0480018198.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480018198.01.T01

ATGAATAAGGGTAAGCATTCTATGAAATGGGTTCTTTTGGATTTCATTCAGAGGTGCAATGATTTGAGATCCTTCAAACAAATCCATGCACAACTTTTGAGATCTTCCCTTGTTGACAATGACTTGGTTGTAACCAAAGCTGCAAACTTTTTTGGGAAACATGTCACTGATATTCGTTACCCTTGCAATTTCTTGAAGCAGTTTGATTGGAGCTTGAGCTCTTTCCCTTGCAATTTGATAATTTCTGGCTATGGAACTGGCCACTTACCTTGGGCTGCAATTCAGATTTATAGATGGGTTGTCGGTAACGGGTTTGTGCCTGATGTGTACACTGTCCCAGCAGTTTTGAAATCATGTGCTAGGTTTTCTGGTATTGCAGAGGTTAAACAAATTCATACGTTGGCTGTTAAGACTGACTTGTGGTGTGACATGTTTGTGCAAAACTCTTTCGTTCATGTTTATAGCATTTGCGGGGACACAGTTGGTGCTAGTAAGGTATTTGATTTTATGTCGGTGAGAGATGTAGTCTCTTGGACTGGTTTGATATCCGGGTATATGAAGGCAGGTTTGTTCAATGATGCGGTTGCATTGTTTTTGAGAATGGATGTGACGCCTAATGCAGCAACATTTGTTAGCATTCTTGGGGCATGTGGGAAATTGGGTTGTTTGAATTTGGGGAAGGGGATTCATGGGTTGGTTTCTAAATATCCGCATGGAAAGGAGTTGGTGGTGAGCAATACTTTGATGGATATGTATGTGAAATGTGAGTCTGTGACTGATGCGAAGAGATTGTTTGATGAGATCCCTGAAAAAGACATTGTTTCTTGGACTAGTATGATAAGTGGATTAGTGCAATACCAGTGTCCACAAGAATCACTTGATTTGTTCTATGAAATGTTGGGTTCAGGTTTTGAGCCTGACAGGATTATACTAACCAGTGTGCTTTCTGCTTGTGCTAGTCTTGGGCTTCTTGATTATGGAAGATGGGTTCATGAATACATTGATCATAGCCGTATCAAATGGGATGTTCACATAGGAACATCATTGGTTGACATGTATGCTAAATGCGGCTGTATAGAGATGGCCCAACAAATTTTTAATTTGTTGCCTTCTAAGAATATCCGTACTTGGAATGCCTATATAGGTGGTTTAGCAATAAATGGGCATGGGCAAGAAGCATTAAAACAATTTGGATATTTGGTTGAATCTGGTACAAGGCCTAATGAGATTACATTTCTGGCTGTTTTTACAGCTTGCTGTCATTCTGGCTTGGTTGATGAAGGTCGTAGCTATTTCAAACAGATGACAAGTCCCCCCTATAATCTTTCTCCCTGGTTAGAGCACTACGGGTGTATGGTTGATTTGCTCTGCAGGGCTGAATTGGTGGGGGAAGCTATGGAGTTGATAAATAAAATGCCTATGCCACCTGATGTGCAGATCCTAGGAGCTCTTTTGAGTGCCTCCAATACATATGGAAATGTCGAATTAACTCCAGAATTGTTAAAAACACTTCCAAATTTTGAATGTCAAGAGAGTGGCGTATATGTGCTTCTCTCTAATTGGTATGCAAATAATAAGAAATGGGCTGAAGTAAGAAGCATTAGGAGATTGATGAAGGAGAAAGGAATATCCAAGGCTCCAGGTTCTAGCCTTATAACGGTGGATGGTAAGAGTCATAAATTCGTAGTTGGAGATAACCACCATCCTCAAAGTGAGGATATTCACGTTTTATTAAACATCCTTGCCAATCAAAGCTACCTTGAGGGTCATATTGATACCCTTTCATGA
Protein sequence

>MsG0480018198.01.T01

MNKGKHSMKWVLLDFIQRCNDLRSFKQIHAQLLRSSLVDNDLVVTKAANFFGKHVTDIRYPCNFLKQFDWSLSSFPCNLIISGYGTGHLPWAAIQIYRWVVGNGFVPDVYTVPAVLKSCARFSGIAEVKQIHTLAVKTDLWCDMFVQNSFVHVYSICGDTVGASKVFDFMSVRDVVSWTGLISGYMKAGLFNDAVALFLRMDVTPNAATFVSILGACGKLGCLNLGKGIHGLVSKYPHGKELVVSNTLMDMYVKCESVTDAKRLFDEIPEKDIVSWTSMISGLVQYQCPQESLDLFYEMLGSGFEPDRIILTSVLSACASLGLLDYGRWVHEYIDHSRIKWDVHIGTSLVDMYAKCGCIEMAQQIFNLLPSKNIRTWNAYIGGLAINGHGQEALKQFGYLVESGTRPNEITFLAVFTACCHSGLVDEGRSYFKQMTSPPYNLSPWLEHYGCMVDLLCRAELVGEAMELINKMPMPPDVQILGALLSASNTYGNVELTPELLKTLPNFECQESGVYVLLSNWYANNKKWAEVRSIRRLMKEKGISKAPGSSLITVDGKSHKFVVGDNHHPQSEDIHVLLNILANQSYLEGHIDTLS*