AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480023257.01


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MsG0480023257.01.T01 AT3G08720 27.622 286 149 9 1 268 132 377 1.16e-24 102
MsG0480023257.01.T01 AT3G08720 27.622 286 149 9 1 268 132 377 1.16e-24 102
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MsG0480023257.01.T01 AT4G21940 29.603 277 143 10 9 266 102 345 4.55e-21 92.8
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MsG0480023257.01.T01 AT4G04740 29.368 269 136 9 13 268 87 314 1.52e-20 91.3
MsG0480023257.01.T01 AT4G04740 29.368 269 136 9 13 268 87 314 1.52e-20 91.3
MsG0480023257.01.T01 AT4G04740 29.368 269 136 9 13 268 87 314 1.52e-20 91.3
MsG0480023257.01.T01 AT4G04740 29.368 269 136 9 13 268 87 314 1.52e-20 91.3
MsG0480023257.01.T01 AT4G04740 29.368 269 136 9 13 268 87 314 1.52e-20 91.3
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MsG0480023257.01.T01 AT4G38230 32.900 231 107 7 9 221 24 224 4.60e-20 89.7
MsG0480023257.01.T01 AT4G04710 31.250 240 109 10 7 222 34 241 4.72e-20 89.7
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MsG0480023257.01.T01 AT4G04710 31.250 240 109 10 7 222 34 241 5.12e-20 89.7
MsG0480023257.01.T01 AT3G50530 29.054 296 161 14 8 268 147 428 5.63e-20 89.7
MsG0480023257.01.T01 AT4G38230 32.900 231 107 7 9 221 54 254 5.79e-20 89.7
MsG0480023257.01.T01 AT3G51850 29.433 282 145 12 7 268 52 299 7.30e-20 89.0
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MsG0480023257.01.T01 AT5G66210 28.470 281 147 10 7 266 60 307 9.82e-20 88.6
MsG0480023257.01.T01 AT3G51850 29.787 282 144 13 7 268 52 299 1.36e-19 88.6
MsG0480023257.01.T01 AT5G66210 28.470 281 147 10 7 266 60 307 1.60e-19 88.2
MsG0480023257.01.T01 AT3G51850 29.787 282 144 13 7 268 52 299 1.82e-19 88.2
MsG0480023257.01.T01 AT5G66210 28.470 281 147 10 7 266 60 307 2.38e-19 87.8
MsG0480023257.01.T01 AT5G66210 28.470 281 147 10 7 266 60 307 2.45e-19 87.8
MsG0480023257.01.T01 AT5G66210 28.470 281 147 10 7 266 60 307 2.45e-19 87.8
MsG0480023257.01.T01 AT2G46700 32.489 237 106 12 8 221 142 347 3.85e-19 87.4
MsG0480023257.01.T01 AT3G45240 24.912 285 153 7 13 272 112 360 9.50e-19 85.5
MsG0480023257.01.T01 AT3G45240 24.912 285 153 7 13 272 112 360 9.50e-19 85.5
MsG0480023257.01.T01 AT4G29810 25.191 262 139 10 4 246 65 288 1.16e-18 85.1
MsG0480023257.01.T01 AT4G29810 25.191 262 139 10 4 246 74 297 1.19e-18 84.7
MsG0480023257.01.T01 AT1G48490 24.756 307 151 10 4 266 823 1093 1.22e-18 86.3
MsG0480023257.01.T01 AT1G48490 24.756 307 151 10 4 266 823 1093 1.22e-18 86.3
MsG0480023257.01.T01 AT1G48490 24.756 307 151 10 4 266 823 1093 1.22e-18 86.3
MsG0480023257.01.T01 AT1G48490 24.756 307 151 10 4 266 824 1094 1.22e-18 86.3
MsG0480023257.01.T01 AT4G29810 25.191 262 139 10 4 246 74 297 1.47e-18 84.7
MsG0480023257.01.T01 AT3G45240 24.823 282 154 7 13 272 112 357 1.53e-18 84.7
MsG0480023257.01.T01 AT1G14000 32.328 232 107 8 15 225 168 370 1.58e-17 82.0
MsG0480023257.01.T01 AT3G17850 23.718 312 152 10 5 266 878 1153 1.87e-17 82.8
MsG0480023257.01.T01 AT3G49370 32.203 236 108 11 8 221 141 346 3.64e-17 81.6
MsG0480023257.01.T01 AT3G63280 27.848 237 118 8 6 222 55 258 4.57e-17 81.3
MsG0480023257.01.T01 AT3G63280 27.004 237 120 8 6 222 1 204 9.58e-17 80.1
MsG0480023257.01.T01 AT3G63280 27.004 237 120 8 6 222 1 204 9.58e-17 80.1
MsG0480023257.01.T01 AT3G63280 27.004 237 120 8 6 222 1 204 9.58e-17 80.1
MsG0480023257.01.T01 AT5G28290 28.384 229 111 9 6 214 1 196 3.70e-16 78.6
MsG0480023257.01.T01 AT5G28290 28.384 229 111 9 6 214 1 196 3.70e-16 78.6
MsG0480023257.01.T01 AT5G28290 28.384 229 111 9 6 214 1 196 3.94e-16 78.6
MsG0480023257.01.T01 AT1G63700 25.540 278 153 9 8 266 399 641 5.30e-16 78.2
MsG0480023257.01.T01 AT1G63700 25.540 278 153 9 8 266 399 641 5.30e-16 78.2
MsG0480023257.01.T01 AT4G04710 28.017 232 109 9 53 266 72 263 3.37e-15 75.5
MsG0480023257.01.T01 AT1G51660 27.876 226 110 7 15 221 85 276 8.04e-15 73.9
MsG0480023257.01.T01 AT4G08470 24.731 279 148 14 15 271 309 547 2.08e-14 73.2
MsG0480023257.01.T01 AT4G08470 24.710 259 140 11 32 271 243 465 2.30e-14 73.2
MsG0480023257.01.T01 AT4G08500 26.259 278 145 14 15 271 339 577 6.35e-14 72.0
MsG0480023257.01.T01 AT3G48750 27.365 296 148 14 6 269 1 261 1.48e-13 69.7
MsG0480023257.01.T01 AT4G19110 28.899 218 122 8 6 215 1 193 1.85e-13 70.5
MsG0480023257.01.T01 AT4G19110 28.899 218 122 8 6 215 1 193 1.91e-13 70.1
MsG0480023257.01.T01 AT4G26890 28.095 210 103 8 31 226 26 201 2.18e-13 70.1
MsG0480023257.01.T01 AT1G07150 30.603 232 104 11 15 223 29 226 3.12e-13 69.7
MsG0480023257.01.T01 AT1G07150 30.603 232 104 11 15 223 15 212 3.67e-13 69.3
MsG0480023257.01.T01 AT5G11850 29.487 234 115 11 7 222 607 808 3.97e-13 69.7
MsG0480023257.01.T01 AT3G44200 29.386 228 110 9 6 214 5 200 6.99e-13 68.9
MsG0480023257.01.T01 AT3G44200 29.386 228 110 9 6 214 5 200 6.99e-13 68.9
MsG0480023257.01.T01 AT5G18700 27.826 230 120 7 6 221 1 198 7.69e-13 68.9
MsG0480023257.01.T01 AT4G08480 25.912 274 145 13 18 271 510 745 1.25e-12 68.2
MsG0480023257.01.T01 AT3G20860 27.046 281 148 11 6 267 1 243 3.86e-11 63.2
MsG0480023257.01.T01 AT1G06390 27.149 221 134 10 15 226 76 278 5.44e-11 62.8
MsG0480023257.01.T01 AT1G06390 27.149 221 134 10 15 226 76 278 5.44e-11 62.8
MsG0480023257.01.T01 AT1G18160 27.897 233 118 10 7 221 713 913 9.18e-11 62.8
MsG0480023257.01.T01 AT1G18160 27.897 233 118 10 7 221 713 913 9.89e-11 62.4

Find 49 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 115 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTCTTCCAGCAACTGATTTC+TGG 0.118421 4:+82786434 MsG0480023257.01.T01:CDS
GTTCATTGAAAGAGGCTTTA+AGG 0.221535 4:+82785433 MsG0480023257.01.T01:CDS
CTCTTTAAATCTAACAATAT+TGG 0.229297 4:-82785616 None:intergenic
TTGGTGTTGCAAAGCTTATA+AGG 0.306850 4:+82785378 MsG0480023257.01.T01:CDS
TCTTTAAATCTAACAATATT+GGG 0.314393 4:-82785615 None:intergenic
TATGAGATAATTAAAGATAT+TGG 0.325687 4:+82785344 MsG0480023257.01.T01:CDS
AGGGTTCCTACAGTTGATTT+TGG 0.357104 4:-82787272 None:intergenic
GTGATTAGATTGCAGATGTT+TGG 0.368413 4:+82787455 MsG0480023257.01.T01:intron
ACTTTGTATGTTATGCTTGT+TGG 0.369809 4:+82787490 MsG0480023257.01.T01:CDS
TGAGTAATGCGAACATAGTC+TGG 0.378616 4:-82787714 None:intergenic
TTTCTAGCTTAAGATCTCTA+TGG 0.392409 4:-82786571 None:intergenic
CTAGAAAACACACTTCTAGA+TGG 0.400049 4:+82786587 MsG0480023257.01.T01:CDS
AACAATATTGGGATGCTTCA+AGG 0.402487 4:-82785604 None:intergenic
TGGTGTTGCAAAGCTTATAA+GGG 0.406779 4:+82785379 MsG0480023257.01.T01:CDS
ACCTCTGGTGCAATGTAAGC+AGG 0.419003 4:-82787292 None:intergenic
ATTTGTTGCCAACCCTGATA+AGG 0.427040 4:+82787764 MsG0480023257.01.T01:CDS
TTGCAGATGTTTGGTCTTGT+GGG 0.431939 4:+82787464 MsG0480023257.01.T01:CDS
CGACTCAAAATATGTGACTT+TGG 0.439080 4:+82786623 MsG0480023257.01.T01:CDS
GGGTCTTCTGGATCTTCAAA+AGG 0.440409 4:-82787520 None:intergenic
GATATTGGATCAGGTAACTT+TGG 0.453971 4:+82785359 MsG0480023257.01.T01:CDS
GCTGTCAAGTTCATTGAAAG+AGG 0.456433 4:+82785425 MsG0480023257.01.T01:CDS
CAATATTGTTAGATTTAAAG+AGG 0.459630 4:+82785617 MsG0480023257.01.T01:CDS
TTTGAAAGAATTTGTACTGC+TGG 0.460591 4:+82786104 MsG0480023257.01.T01:CDS
ATAATTAAAGATATTGGATC+AGG 0.462914 4:+82785350 MsG0480023257.01.T01:CDS
ATTGCAGATGTTTGGTCTTG+TGG 0.463902 4:+82787463 MsG0480023257.01.T01:CDS
TCTCTTCTTGACAATACCTC+TGG 0.488136 4:-82787307 None:intergenic
AATTATCTCATATCGTTCCA+TGG 0.489564 4:-82785333 None:intergenic
TGACTCCAGAAATCAGTTGC+TGG 0.491693 4:-82786439 None:intergenic
GATTGATGAGCACGTGCAAA+GGG 0.491741 4:+82785563 MsG0480023257.01.T01:intron
CAAGTGATGGAATATGCTGC+TGG 0.524077 4:+82786071 MsG0480023257.01.T01:CDS
CATAGTCTGGAATTGAATAG+TGG 0.524092 4:-82787701 None:intergenic
TGGTAGATTCAGCGAGGACG+AGG 0.540351 4:+82786124 MsG0480023257.01.T01:CDS
AAGAAGAGAATATGATGGAA+AGG 0.550931 4:+82787321 MsG0480023257.01.T01:CDS
CCCTGCTTACATTGCACCAG+AGG 0.551749 4:+82787291 MsG0480023257.01.T01:CDS
AGTCAGCTATTGCCATTCAA+TGG 0.556822 4:+82786457 MsG0480023257.01.T01:CDS
ACAACAGTGATACCATTGAA+TGG 0.566933 4:-82786469 None:intergenic
CCAACTCATTTAGCAAGTGA+TGG 0.569774 4:+82786058 MsG0480023257.01.T01:intron
TTGTCAAGAAGAGAATATGA+TGG 0.570242 4:+82787316 MsG0480023257.01.T01:CDS
ATGTGACTTTGGTTACTCAA+AGG 0.571210 4:+82786634 MsG0480023257.01.T01:CDS
AGATTGATGAGCACGTGCAA+AGG 0.587475 4:+82785562 MsG0480023257.01.T01:intron
AAAGGGAGATTATAAATCAT+AGG 0.591024 4:+82785580 MsG0480023257.01.T01:CDS
CCTCTGGTGCAATGTAAGCA+GGG 0.619971 4:-82787291 None:intergenic
AAGTGATGGAATATGCTGCT+GGG 0.621174 4:+82786072 MsG0480023257.01.T01:CDS
TGCAGATGTTTGGTCTTGTG+GGG 0.631552 4:+82787465 MsG0480023257.01.T01:CDS
ATAGAGTTCAAGCTTAACCA+TGG 0.645750 4:+82785316 None:intergenic
AGTGATGGAATATGCTGCTG+GGG 0.651298 4:+82786073 MsG0480023257.01.T01:CDS
TCCCAGCCAAAATCAACTGT+AGG 0.671408 4:+82787266 MsG0480023257.01.T01:intron
TACTGCTGGTAGATTCAGCG+AGG 0.692521 4:+82786118 MsG0480023257.01.T01:CDS
GTGATGGAATATGCTGCTGG+GGG 0.738711 4:+82786074 MsG0480023257.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAATTAATATATTACGTAT+TGG - Chr4:82787649-82787668 None:intergenic 10.0%
!! ATTAAATTAAACATCATAAA+TGG - Chr4:82785527-82785546 None:intergenic 10.0%
!!! ATTTTTGTTTTATCAATTAT+TGG - Chr4:82786960-82786979 None:intergenic 10.0%
!! AAAAAAATGGAGTTAAAAAA+AGG - Chr4:82785460-82785479 None:intergenic 15.0%
!! TATGAGATAATTAAAGATAT+TGG + Chr4:82785344-82785363 MsG0480023257.01.T01:CDS 15.0%
!! TCTTTAAATCTAACAATATT+GGG - Chr4:82785618-82785637 None:intergenic 15.0%
!!! AAAAACATTTTAAATGAGTT+AGG + Chr4:82785653-82785672 MsG0480023257.01.T01:intron 15.0%
!!! ATGTTTAATTTAATTCCATT+TGG + Chr4:82785533-82785552 MsG0480023257.01.T01:intron 15.0%
!!! ATTTAACAATTCTTTTTCAT+TGG + Chr4:82787186-82787205 MsG0480023257.01.T01:intron 15.0%
!!! CATTATTACTTTTATAAAGT+TGG - Chr4:82785832-82785851 None:intergenic 15.0%
!!! CGTAATATATTAATTTTTTC+TGG + Chr4:82787652-82787671 MsG0480023257.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTTTTAACTCCATTTTTT+TGG + Chr4:82785459-82785478 MsG0480023257.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTTTTTCTTCTTTCATAT+AGG + Chr4:82786403-82786422 MsG0480023257.01.T01:intron 15.0%
!! ATAATTAAAGATATTGGATC+AGG + Chr4:82785350-82785369 MsG0480023257.01.T01:CDS 20.0%
!! CAAGTAATATATTAACAAGT+GGG + Chr4:82786198-82786217 MsG0480023257.01.T01:intron 20.0%
!! CAATATTGTTAGATTTAAAG+AGG + Chr4:82785617-82785636 MsG0480023257.01.T01:CDS 20.0%
!! CTCTTTAAATCTAACAATAT+TGG - Chr4:82785619-82785638 None:intergenic 20.0%
!!! AAAAGTTTTCCAAAGATTTT+TGG - Chr4:82785986-82786005 None:intergenic 20.0%
!!! AAAATTGTTTTTACCTTATC+AGG - Chr4:82787780-82787799 None:intergenic 20.0%
!!! AAATTGTTTTTACCTTATCA+GGG - Chr4:82787779-82787798 None:intergenic 20.0%
!!! AAGTGTTTTTTTGAAGTTTT+TGG - Chr4:82787545-82787564 None:intergenic 20.0%
!!! AGTGTTTTTTTGAAGTTTTT+GGG - Chr4:82787544-82787563 None:intergenic 20.0%
!!! ATTATTTTTTTTTGCAGTCA+TGG + Chr4:82787235-82787254 MsG0480023257.01.T01:intron 20.0%
!!! TAAAACTTTAAGTTTATCTC+CGG - Chr4:82785692-82785711 None:intergenic 20.0%
!!! TTTGTTTTATCAATTATTGG+CGG - Chr4:82786957-82786976 None:intergenic 20.0%
! AAACTTCAAAAAAACACTTC+AGG + Chr4:82787546-82787565 MsG0480023257.01.T01:CDS 25.0%
! AAAGGAATTCCAAAAATCTT+TGG + Chr4:82785974-82785993 MsG0480023257.01.T01:intron 25.0%
! AAAGGGAGATTATAAATCAT+AGG + Chr4:82785580-82785599 MsG0480023257.01.T01:CDS 25.0%
! AATGGACATTTCATATGTAT+TGG - Chr4:82786018-82786037 None:intergenic 25.0%
! ACATAGAAAGACCAAAAAAA+TGG - Chr4:82785473-82785492 None:intergenic 25.0%
! GCAAGTAATATATTAACAAG+TGG + Chr4:82786197-82786216 MsG0480023257.01.T01:intron 25.0%
!! ATTTTAAATGAGTTAGGTTC+CGG + Chr4:82785659-82785678 MsG0480023257.01.T01:intron 25.0%
!! GATTCTAGAAAACAGTAATT+AGG + Chr4:82786167-82786186 MsG0480023257.01.T01:intron 25.0%
!!! GTGTTTTTTTGAAGTTTTTG+GGG - Chr4:82787543-82787562 None:intergenic 25.0%
!!! TGATTTGTCAAACTGTTTTA+GGG + Chr4:82786824-82786843 MsG0480023257.01.T01:intron 25.0%
!!! TTGATTTGTCAAACTGTTTT+AGG + Chr4:82786823-82786842 MsG0480023257.01.T01:intron 25.0%
AATTATCTCATATCGTTCCA+TGG - Chr4:82785336-82785355 None:intergenic 30.0%
ACTTTGTATGTTATGCTTGT+TGG + Chr4:82787490-82787509 MsG0480023257.01.T01:CDS 30.0%
AGAAAAAAAATGTAAGCGTG+TGG + Chr4:82787381-82787400 MsG0480023257.01.T01:intron 30.0%
AGCTCAAAGAAAATAACACA+TGG - Chr4:82785756-82785775 None:intergenic 30.0%
CAAAGCTTATAAGGGAAAAA+TGG + Chr4:82785387-82785406 MsG0480023257.01.T01:CDS 30.0%
CATATGAAAAAGACGATGAA+AGG - Chr4:82787132-82787151 None:intergenic 30.0%
CATCAATCTACAAAACCAAA+TGG - Chr4:82785551-82785570 None:intergenic 30.0%
TTATTGTGCATTTGATCGAT+CGG + Chr4:82786756-82786775 MsG0480023257.01.T01:intron 30.0%
TTGTCAAGAAGAGAATATGA+TGG + Chr4:82787316-82787335 MsG0480023257.01.T01:CDS 30.0%
TTTGAAAGAATTTGTACTGC+TGG + Chr4:82786104-82786123 MsG0480023257.01.T01:CDS 30.0%
! AAAAGCTATCATTTTCTTGC+AGG + Chr4:82786541-82786560 MsG0480023257.01.T01:CDS 30.0%
! AAGAAGAGAATATGATGGAA+AGG + Chr4:82787321-82787340 MsG0480023257.01.T01:CDS 30.0%
! TCACTCTTAGAATTTGCTTT+AGG - Chr4:82787046-82787065 None:intergenic 30.0%
! TGTAACAATTTGTTTCGTCA+TGG + Chr4:82786309-82786328 MsG0480023257.01.T01:intron 30.0%
!! TTTCTAGCTTAAGATCTCTA+TGG - Chr4:82786574-82786593 None:intergenic 30.0%
!!! GATTTTTGGAATTCCTTTCA+AGG - Chr4:82785972-82785991 None:intergenic 30.0%
!!! TGTTTTGTTTTCTCCTTGAA+AGG + Chr4:82785956-82785975 MsG0480023257.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTAATTTGCTATGTACCC+TGG + Chr4:82787609-82787628 MsG0480023257.01.T01:intron 30.0%
AACAATATTGGGATGCTTCA+AGG - Chr4:82785607-82785626 None:intergenic 35.0%
ACAACAGTGATACCATTGAA+TGG - Chr4:82786472-82786491 None:intergenic 35.0%
ATGAAATGTCCATTCATTGC+AGG + Chr4:82786024-82786043 MsG0480023257.01.T01:intron 35.0%
ATGTGACTTTGGTTACTCAA+AGG + Chr4:82786634-82786653 MsG0480023257.01.T01:CDS 35.0%
CGACTCAAAATATGTGACTT+TGG + Chr4:82786623-82786642 MsG0480023257.01.T01:CDS 35.0%
CTAGAAAACACACTTCTAGA+TGG + Chr4:82786587-82786606 MsG0480023257.01.T01:CDS 35.0%
CTTATAAGGGAAAAATGGAG+TGG + Chr4:82785392-82785411 MsG0480023257.01.T01:CDS 35.0%
GATATTGGATCAGGTAACTT+TGG + Chr4:82785359-82785378 MsG0480023257.01.T01:CDS 35.0%
GTGATTAGATTGCAGATGTT+TGG + Chr4:82787455-82787474 MsG0480023257.01.T01:intron 35.0%
GTTCATTGAAAGAGGCTTTA+AGG + Chr4:82785433-82785452 MsG0480023257.01.T01:CDS 35.0%
TGAGATAAAAGGTTGTGTTG+CGG - Chr4:82786899-82786918 None:intergenic 35.0%
TGGTTATGTATGTTACACCA+GGG - Chr4:82787629-82787648 None:intergenic 35.0%
TTGGTTATGTATGTTACACC+AGG - Chr4:82787630-82787649 None:intergenic 35.0%
! CATAGTCTGGAATTGAATAG+TGG - Chr4:82787704-82787723 None:intergenic 35.0%
! TTTGCTTTAGGCCTCAAAAT+TGG - Chr4:82787034-82787053 None:intergenic 35.0%
!! AAGTCACATATTTTGAGTCG+TGG - Chr4:82786623-82786642 None:intergenic 35.0%
!! TGGTGTTGCAAAGCTTATAA+GGG + Chr4:82785379-82785398 MsG0480023257.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTTTTTACCTTATCAGGGT+TGG - Chr4:82787775-82787794 None:intergenic 35.0%
!! TTGGTGTTGCAAAGCTTATA+AGG + Chr4:82785378-82785397 MsG0480023257.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTGTCAAACTGTTTTAGGGA+CGG + Chr4:82786828-82786847 MsG0480023257.01.T01:intron 35.0%
AGTCAGCTATTGCCATTCAA+TGG + Chr4:82786457-82786476 MsG0480023257.01.T01:CDS 40.0%
CCAACTCATTTAGCAAGTGA+TGG + Chr4:82786058-82786077 MsG0480023257.01.T01:intron 40.0%
CTGCAATCTAATCACTCTCA+AGG - Chr4:82787450-82787469 None:intergenic 40.0%
GCTGTCAAGTTCATTGAAAG+AGG + Chr4:82785425-82785444 MsG0480023257.01.T01:CDS 40.0%
TCTCTTCTTGACAATACCTC+TGG - Chr4:82787310-82787329 None:intergenic 40.0%
TGAGTAATGCGAACATAGTC+TGG - Chr4:82787717-82787736 None:intergenic 40.0%
! AAGTGATGGAATATGCTGCT+GGG + Chr4:82786072-82786091 MsG0480023257.01.T01:CDS 40.0%
! ATTTGTTGCCAACCCTGATA+AGG + Chr4:82787764-82787783 MsG0480023257.01.T01:CDS 40.0%
! CCATCACTTGCTAAATGAGT+TGG - Chr4:82786061-82786080 None:intergenic 40.0%
! TTCTTCCAGCAACTGATTTC+TGG + Chr4:82786434-82786453 MsG0480023257.01.T01:CDS 40.0%
!! AGGGTTCCTACAGTTGATTT+TGG - Chr4:82787275-82787294 None:intergenic 40.0%
!! ATTGCAGATGTTTGGTCTTG+TGG + Chr4:82787463-82787482 MsG0480023257.01.T01:CDS 40.0%
!! TTCCTACAGTTGATTTTGGC+TGG - Chr4:82787271-82787290 None:intergenic 40.0%
!! TTGCAGATGTTTGGTCTTGT+GGG + Chr4:82787464-82787483 MsG0480023257.01.T01:CDS 40.0%
!!! TCCTACAGTTGATTTTGGCT+GGG - Chr4:82787270-82787289 None:intergenic 40.0%
!!! TGTCAAACTGTTTTAGGGAC+GGG + Chr4:82786829-82786848 MsG0480023257.01.T01:intron 40.0%
!!! TTGAAGTTTTTGGGGTCTTC+TGG - Chr4:82787535-82787554 None:intergenic 40.0%
AGATTGATGAGCACGTGCAA+AGG + Chr4:82785562-82785581 MsG0480023257.01.T01:intron 45.0%
CAACTCGCACGTGAGATAAA+AGG - Chr4:82786910-82786929 None:intergenic 45.0%
CGGGATAAACTAGAGACAAG+AGG + Chr4:82786848-82786867 MsG0480023257.01.T01:intron 45.0%
GATTGATGAGCACGTGCAAA+GGG + Chr4:82785563-82785582 MsG0480023257.01.T01:intron 45.0%
GGCCTCAAAATTGGTTGAGA+CGG - Chr4:82787025-82787044 None:intergenic 45.0%
GGGTCTTCTGGATCTTCAAA+AGG - Chr4:82787523-82787542 None:intergenic 45.0%
GTGAAGCACATACACGACAT+AGG + Chr4:82786701-82786720 MsG0480023257.01.T01:intron 45.0%
TCAGCAACACCTGCAATGAA+TGG - Chr4:82786036-82786055 None:intergenic 45.0%
TCCCAGCCAAAATCAACTGT+AGG + Chr4:82787266-82787285 MsG0480023257.01.T01:intron 45.0%
TGACTCCAGAAATCAGTTGC+TGG - Chr4:82786442-82786461 None:intergenic 45.0%
! AGTGATGGAATATGCTGCTG+GGG + Chr4:82786073-82786092 MsG0480023257.01.T01:CDS 45.0%
! CAAGTGATGGAATATGCTGC+TGG + Chr4:82786071-82786090 MsG0480023257.01.T01:CDS 45.0%
! GTCCGTCTCAACCAATTTTG+AGG + Chr4:82787020-82787039 MsG0480023257.01.T01:intron 45.0%
!! TGCAGATGTTTGGTCTTGTG+GGG + Chr4:82787465-82787484 MsG0480023257.01.T01:CDS 45.0%
!! ACATAAAAATATTAAAATTA+TGG - Chr4:82786292-82786311 None:intergenic 5.0%
ACCTCTGGTGCAATGTAAGC+AGG - Chr4:82787295-82787314 None:intergenic 50.0%
CCTCTGGTGCAATGTAAGCA+GGG - Chr4:82787294-82787313 None:intergenic 50.0%
GGTTGTGTTGCGGTTTAGTG+AGG - Chr4:82786889-82786908 None:intergenic 50.0%
GTTTATCTCCGGTGAGCTTC+CGG - Chr4:82785681-82785700 None:intergenic 50.0%
TACTGCTGGTAGATTCAGCG+AGG + Chr4:82786118-82786137 MsG0480023257.01.T01:CDS 50.0%
! GTGATGGAATATGCTGCTGG+GGG + Chr4:82786074-82786093 MsG0480023257.01.T01:CDS 50.0%
CCCTGCTTACATTGCACCAG+AGG + Chr4:82787291-82787310 MsG0480023257.01.T01:CDS 55.0%
GTTAGGTTCCGGAAGCTCAC+CGG + Chr4:82785670-82785689 MsG0480023257.01.T01:intron 55.0%
TGGTAGATTCAGCGAGGACG+AGG + Chr4:82786124-82786143 MsG0480023257.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 82785320 82787803 82785320 ID=MsG0480023257.01;Name=MsG0480023257.01
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Chr4 exon 82785320 82785454 82785320 ID=MsG0480023257.01.T01:exon:5336;Parent=MsG0480023257.01.T01
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Chr4 exon 82786071 82786145 82786071 ID=MsG0480023257.01.T01:exon:5338;Parent=MsG0480023257.01.T01
Chr4 exon 82786425 82786668 82786425 ID=MsG0480023257.01.T01:exon:5339;Parent=MsG0480023257.01.T01
Chr4 exon 82787272 82787342 82787272 ID=MsG0480023257.01.T01:exon:5340;Parent=MsG0480023257.01.T01
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Chr4 exon 82787687 82787803 82787687 ID=MsG0480023257.01.T01:exon:5342;Parent=MsG0480023257.01.T01
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Chr4 CDS 82787463 82787567 82787463 ID=MsG0480023257.01.T01:cds;Parent=MsG0480023257.01.T01
Chr4 CDS 82787687 82787803 82787687 ID=MsG0480023257.01.T01:cds;Parent=MsG0480023257.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480023257.01.T01

AGTTCAAGCTTAACCATGGAACGATATGAGATAATTAAAGATATTGGATCAGGTAACTTTGGTGTTGCAAAGCTTATAAGGGAAAAATGGAGTGGCGAGTTATATGCTGTCAAGTTCATTGAAAGAGGCTTTAAGATTGATGAGCACGTGCAAAGGGAGATTATAAATCATAGGTCCTTGAAGCATCCCAATATTGTTAGATTTAAAGAGCAAGTGATGGAATATGCTGCTGGGGGAGAACTATTTGAAAGAATTTGTACTGCTGGTAGATTCAGCGAGGACGAGGCAAGATATTTCTTCCAGCAACTGATTTCTGGAGTCAGCTATTGCCATTCAATGGTATCACTGTTGTTCAATCTGATTATATTGCTGTTTCAGTCTCACAGCTTTAGCTTAAACTTAAAAGCTATCATTTTCTTGCAGGAAATTTGCCATAGAGATCTTAAGCTAGAAAACACACTTCTAGATGGAAGTTCAGCACCACGACTCAAAATATGTGACTTTGGTTACTCAAAGGCAAGAACTAATTCCAAAATCAACTGTAGGAACCCTGCTTACATTGCACCAGAGGTATTGTCAAGAAGAGAATATGATGGAAAGATTGCAGATGTTTGGTCTTGTGGGGTAACTTTGTATGTTATGCTTGTTGGTGCTTATCCTTTTGAAGATCCAGAAGACCCCAAAAACTTCAAAAAAACACTTCAGCGAATTCTTAGTGTCCACTATTCAATTCCAGACTATGTTCGCATTACTCAAGAGTGCAGACATCTTTTATCTAGAATATTTGTTGCCAACCCTGATAAGGTAAAAACAATTTTTTGA

Protein sequence

>MsG0480023257.01.T01

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