AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580024551.01

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MsG0580024551.01.T01 AT1G61490 27.327 838 501 30 1 795 1 773 3.88e-64 230
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MsG0580024551.01.T01 AT1G61430 27.399 792 478 30 42 795 17 749 8.83e-59 214
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MsG0580024551.01.T01 AT5G55830 35.616 365 216 8 449 799 299 658 2.22e-56 206
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MsG0580024551.01.T01 AT3G24790 40.000 295 157 7 501 783 35 321 3.00e-56 197
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MsG0580024551.01.T01 AT3G24790 40.000 295 157 7 501 783 53 339 4.80e-56 197
MsG0580024551.01.T01 AT1G61500 28.304 802 456 35 46 798 29 760 4.89e-56 206
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MsG0580024551.01.T01 AT1G66920 39.542 306 170 8 497 793 285 584 6.61e-56 203
MsG0580024551.01.T01 AT1G70740 37.061 313 172 6 501 793 38 345 7.09e-56 198
MsG0580024551.01.T01 AT1G61500 28.304 802 456 35 46 798 47 778 7.18e-56 206
MsG0580024551.01.T01 AT1G61500 28.304 802 456 35 46 798 52 783 7.28e-56 206
MsG0580024551.01.T01 AT1G61420 31.002 529 291 19 304 795 136 627 1.07e-55 203
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MsG0580024551.01.T01 AT1G56145 37.798 336 196 7 460 789 633 961 1.12e-54 204
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MsG0580024551.01.T01 AT2G42960 39.655 290 164 4 501 784 171 455 3.01e-54 196
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MsG0580024551.01.T01 AT1G07570 39.252 321 175 10 482 786 37 353 2.18e-53 191
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MsG0580024551.01.T01 AT2G43700 34.848 330 206 4 467 791 264 589 3.29e-53 196
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MsG0580024551.01.T01 AT1G30570 38.095 294 172 5 501 789 508 796 6.08e-53 198
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MsG0580024551.01.T01 AT5G28680 37.417 302 178 6 494 789 501 797 1.47e-52 197
MsG0580024551.01.T01 AT3G55450 39.506 324 169 11 490 791 38 356 1.49e-52 188
MsG0580024551.01.T01 AT3G28690 39.535 301 168 6 496 784 9 307 1.54e-52 187
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MsG0580024551.01.T01 AT2G18470 37.742 310 173 6 491 789 262 562 1.62e-52 194
MsG0580024551.01.T01 AT2G18470 37.742 310 173 6 491 789 262 562 1.62e-52 194
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MsG0580024551.01.T01 AT5G01950 37.460 315 164 8 491 789 604 901 1.75e-52 197
MsG0580024551.01.T01 AT5G01950 37.460 315 164 8 491 789 604 901 1.75e-52 197
MsG0580024551.01.T01 AT5G01950 37.460 315 164 8 491 789 604 901 1.75e-52 197
MsG0580024551.01.T01 AT4G11480 37.805 328 183 9 482 796 293 612 1.83e-52 194
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MsG0580024551.01.T01 AT5G39030 37.026 343 184 10 473 794 454 785 5.78e-51 192
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MsG0580024551.01.T01 AT1G66930 36.392 316 164 8 501 795 545 844 2.00e-50 191
MsG0580024551.01.T01 AT4G34500 36.986 292 171 5 501 784 133 419 2.03e-50 183
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MsG0580024551.01.T01 AT5G01560 33.521 355 215 7 447 790 295 639 2.08e-50 189
MsG0580024551.01.T01 AT4G11460 36.859 312 173 8 501 796 334 637 2.25e-50 189
MsG0580024551.01.T01 AT3G59750 33.705 359 226 6 440 791 229 582 2.28e-50 187
MsG0580024551.01.T01 AT1G11410 26.643 837 462 34 42 795 15 782 2.31e-50 190
MsG0580024551.01.T01 AT1G11410 26.643 837 462 34 42 795 39 806 2.35e-50 191
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MsG0580024551.01.T01 AT4G11900 26.737 662 394 23 59 665 66 691 3.26e-49 186
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MsG0580024551.01.T01 AT1G61360 28.435 524 321 15 304 796 203 703 6.70e-49 185
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MsG0580024551.01.T01 AT2G35620 36.559 279 166 5 517 792 310 580 1.87e-48 181
MsG0580024551.01.T01 AT2G35620 36.559 279 166 5 517 792 310 580 1.87e-48 181
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MsG0580024551.01.T01 AT5G60270 34.174 357 199 11 470 802 288 632 2.94e-48 182
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MsG0580024551.01.T01 AT5G13160 38.487 304 173 7 500 794 73 371 3.24e-48 177
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MsG0580024551.01.T01 AT1G24650 38.000 300 164 8 491 776 525 816 1.08e-47 183
MsG0580024551.01.T01 AT2G14510 33.628 339 206 7 462 791 511 839 1.11e-47 182
MsG0580024551.01.T01 AT2G28990 35.417 288 175 5 501 784 567 847 1.22e-47 182
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MsG0580024551.01.T01 AT1G61390 29.885 522 308 21 305 795 139 633 1.35e-47 180
MsG0580024551.01.T01 AT2G14510 33.628 339 206 7 462 791 519 847 1.37e-47 182
MsG0580024551.01.T01 AT3G20530 42.672 232 123 5 501 724 70 299 1.76e-47 171
MsG0580024551.01.T01 AT1G51890 32.362 343 201 7 465 784 234 568 1.83e-47 179
MsG0580024551.01.T01 AT3G58690 35.238 315 186 8 495 797 69 377 1.86e-47 174
MsG0580024551.01.T01 AT5G18610 36.928 306 178 8 500 794 70 371 1.98e-47 177
MsG0580024551.01.T01 AT5G18610 36.928 306 178 8 500 794 70 371 1.98e-47 177
MsG0580024551.01.T01 AT5G18610 36.928 306 178 8 500 794 70 371 1.98e-47 177
MsG0580024551.01.T01 AT1G26150 37.667 300 166 6 501 788 418 708 2.03e-47 181
MsG0580024551.01.T01 AT1G51820 34.859 284 174 4 501 780 306 582 2.32e-47 179
MsG0580024551.01.T01 AT4G35600 35.938 320 187 8 490 794 63 379 2.62e-47 174
MsG0580024551.01.T01 AT4G35600 35.938 320 187 8 490 794 64 380 2.70e-47 174
MsG0580024551.01.T01 AT4G23250 35.873 315 183 8 494 796 335 642 2.91e-47 182
MsG0580024551.01.T01 AT4G13190 43.636 220 115 4 500 712 58 275 3.70e-47 170
MsG0580024551.01.T01 AT1G51880 32.022 356 225 7 443 791 515 860 3.72e-47 181
MsG0580024551.01.T01 AT1G51880 32.022 356 225 7 443 791 523 868 3.79e-47 181
MsG0580024551.01.T01 AT5G48740 37.586 290 168 7 501 784 596 878 3.81e-47 181
MsG0580024551.01.T01 AT1G55200 37.931 290 170 5 501 785 367 651 4.15e-47 179
MsG0580024551.01.T01 AT1G55200 37.931 290 170 5 501 785 367 651 4.15e-47 179
MsG0580024551.01.T01 AT1G55200 37.931 290 170 5 501 785 367 651 4.15e-47 179
MsG0580024551.01.T01 AT1G55200 37.931 290 170 5 501 785 367 651 4.15e-47 179
MsG0580024551.01.T01 AT2G01820 36.482 307 177 8 493 786 565 866 4.28e-47 181
MsG0580024551.01.T01 AT5G40380 36.023 347 207 7 461 795 258 601 4.32e-47 178
MsG0580024551.01.T01 AT1G51880 32.022 356 225 7 443 791 497 842 4.40e-47 181
MsG0580024551.01.T01 AT1G51850 34.507 284 175 4 501 780 548 824 4.40e-47 181
MsG0580024551.01.T01 AT1G51850 34.507 284 175 4 501 780 568 844 4.44e-47 181
MsG0580024551.01.T01 AT3G46330 34.591 318 191 5 473 780 499 809 4.46e-47 181
MsG0580024551.01.T01 AT3G46330 34.591 318 191 5 473 780 523 833 4.54e-47 181
MsG0580024551.01.T01 AT4G23190 31.978 369 228 7 450 798 197 562 4.76e-47 177
MsG0580024551.01.T01 AT4G23190 31.978 369 228 7 450 798 197 562 4.76e-47 177
MsG0580024551.01.T01 AT1G51820 34.859 284 174 4 501 780 568 844 5.00e-47 181
MsG0580024551.01.T01 AT1G24030 43.043 230 118 6 506 725 1 227 5.37e-47 170
MsG0580024551.01.T01 AT4G20450 35.621 306 184 6 483 784 565 861 5.50e-47 181
MsG0580024551.01.T01 AT3G46400 32.486 354 214 6 456 791 507 853 5.53e-47 181
MsG0580024551.01.T01 AT1G20650 38.435 294 166 8 500 784 65 352 5.75e-47 172
MsG0580024551.01.T01 AT4G23190 31.978 369 228 7 450 798 275 640 5.77e-47 178
MsG0580024551.01.T01 AT3G45430 36.102 313 178 10 501 802 332 633 5.91e-47 178
MsG0580024551.01.T01 AT3G45430 36.102 313 178 10 501 802 332 633 5.91e-47 178
MsG0580024551.01.T01 AT3G45430 36.102 313 178 10 501 802 332 633 5.91e-47 178
MsG0580024551.01.T01 AT1G51890 32.362 343 201 7 465 784 442 776 6.05e-47 180
MsG0580024551.01.T01 AT4G00960 36.965 257 150 6 552 799 7 260 6.42e-47 169
MsG0580024551.01.T01 AT2G29000 36.111 288 173 4 501 784 555 835 6.89e-47 180
MsG0580024551.01.T01 AT2G04300 34.507 284 175 4 501 780 531 807 7.01e-47 180
MsG0580024551.01.T01 AT5G16900 35.099 302 185 5 494 791 370 664 7.43e-47 178
MsG0580024551.01.T01 AT1G24030 40.316 253 131 7 483 725 39 281 8.27e-47 171
MsG0580024551.01.T01 AT2G28940 35.347 331 187 9 489 797 78 403 9.09e-47 174
MsG0580024551.01.T01 AT4G32000 36.486 296 176 6 500 789 117 406 9.21e-47 172
MsG0580024551.01.T01 AT1G51890 32.362 343 201 7 465 784 506 840 9.32e-47 180
MsG0580024551.01.T01 AT4G32000 36.486 296 176 6 500 789 116 405 9.37e-47 172
MsG0580024551.01.T01 AT5G63930 35.811 296 168 7 501 783 728 1014 9.74e-47 181
MsG0580024551.01.T01 AT2G04300 34.507 284 175 4 501 780 572 848 1.03e-46 180
MsG0580024551.01.T01 AT1G51860 35.017 297 177 6 501 791 430 716 1.09e-46 179
MsG0580024551.01.T01 AT3G49670 35.314 303 168 9 499 790 683 968 1.15e-46 180
MsG0580024551.01.T01 AT5G63930 35.811 296 168 7 501 783 792 1078 1.36e-46 180
MsG0580024551.01.T01 AT1G67520 35.948 306 179 8 501 794 276 576 1.37e-46 176
MsG0580024551.01.T01 AT1G67520 35.948 306 179 8 501 794 276 576 1.37e-46 176
MsG0580024551.01.T01 AT1G24030 40.316 253 131 7 483 725 53 295 1.57e-46 171
MsG0580024551.01.T01 AT5G63710 36.824 296 176 5 497 785 238 529 1.61e-46 176
MsG0580024551.01.T01 AT5G63710 36.824 296 176 5 497 785 238 529 1.61e-46 176
MsG0580024551.01.T01 AT1G67520 35.948 306 179 8 501 794 247 547 1.67e-46 176
MsG0580024551.01.T01 AT1G51860 35.017 297 177 6 501 791 574 860 1.69e-46 179
MsG0580024551.01.T01 AT4G20270 37.413 286 157 10 517 791 716 990 2.01e-46 179
MsG0580024551.01.T01 AT2G28960 35.000 300 184 5 496 791 426 718 2.04e-46 178
MsG0580024551.01.T01 AT4G32000 36.486 296 176 6 500 789 159 448 2.22e-46 172

Find 175 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 198 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTCATTGTTGGCCTCATTTC+AGG 0.081724 5:-6285464 None:intergenic
CCTAATCAATCTCTTGAATT+AGG 0.159484 5:+6283619 MsG0580024551.01.T01:CDS
AGAAACTTGGTCAAGTTAAT+TGG 0.203232 5:+6284858 MsG0580024551.01.T01:CDS
AGAGCAACACTTGATTATTA+TGG 0.224452 5:+6283931 MsG0580024551.01.T01:CDS
GTTTCTCCTCTTGGTAAAAT+AGG 0.242279 5:+6284456 MsG0580024551.01.T01:CDS
CCTACTTGTAAATGTCCTTA+TGG 0.255532 5:+6284111 MsG0580024551.01.T01:CDS
CACCCGCCAAATTGATTACT+TGG 0.259684 5:-6284150 None:intergenic
TGTTGTTGCTGTTAAGAAAT+TGG 0.264118 5:+6284767 MsG0580024551.01.T01:CDS
ACTCTTCGAGGTCTGCTAAT+TGG 0.270073 5:+6284525 MsG0580024551.01.T01:CDS
GAACCTTCCACTTGTGAAAT+TGG 0.271202 5:-6283671 None:intergenic
CATTGCAATATTCAATGAAA+TGG 0.272029 5:+6284038 MsG0580024551.01.T01:CDS
ACTCTTGGCTGCGGTTGTTT+TGG 0.294483 5:+6284569 MsG0580024551.01.T01:CDS
GTTGCTGTTGTTCATGTCTT+TGG 0.296343 5:-6283386 None:intergenic
ACAAGAATTCTACTATTGTT+TGG 0.296472 5:+6283563 MsG0580024551.01.T01:CDS
CCTTCTGGTGAATTCGCTTT+CGG 0.302513 5:+6283283 MsG0580024551.01.T01:CDS
AAGAATGGAAATTATGTAAT+AGG 0.304635 5:-6283173 None:intergenic
ACTTCTTCATGCTTGCAATA+TGG 0.308782 5:+6283326 MsG0580024551.01.T01:CDS
CAAGAATTCTACTATTGTTT+GGG 0.318302 5:+6283564 MsG0580024551.01.T01:CDS
GGAACATTCTTGAACCATTC+AGG 0.323310 5:-6285197 None:intergenic
AGTGGATAAAGATTGCAATT+TGG 0.336008 5:+6285426 MsG0580024551.01.T01:CDS
CAAGAGATTGATTAGGCAAA+AGG 0.339061 5:-6283612 None:intergenic
CAAAGGGTTGGATTTGCATT+GGG 0.341776 5:+6284981 MsG0580024551.01.T01:CDS
GTAAACTCATATAAATCTTC+TGG 0.343410 5:-6284231 None:intergenic
CTTCAACTTGTGTTAGCCTT+TGG 0.349175 5:+6283199 MsG0580024551.01.T01:CDS
TGCATGACCATCCTCATTGT+TGG 0.349392 5:-6285476 None:intergenic
GACATTGTTGAAGCCGAAAA+AGG 0.349471 5:+6284593 MsG0580024551.01.T01:CDS
TGACAGTCCTGTTGAGAATA+AGG 0.353639 5:-6284303 None:intergenic
TGGATTGTTGTTGTTGTTAG+TGG 0.354099 5:-6283251 None:intergenic
GTTGTCTTTCTTCAAATTAG+TGG 0.358734 5:-6284490 None:intergenic
ATTGCAATGCAAATGTTATC+AGG 0.358907 5:-6284024 None:intergenic
AGAAGTTTGTTGTGGTATTA+CGG 0.370846 5:-6283309 None:intergenic
CCATAGGAAACAATATTGTT+TGG 0.371366 5:-6283505 None:intergenic
AAAGTGGATGTTTACAGCTT+TGG 0.374429 5:+6285230 MsG0580024551.01.T01:CDS
TTGGGCTTGTGATTGTTATA+TGG 0.375270 5:+6285337 MsG0580024551.01.T01:CDS
TCAAACCTCAGGGTACAATA+TGG 0.379041 5:+6283872 MsG0580024551.01.T01:CDS
TACATGATCAAACCATTGTT+TGG 0.383435 5:+6283359 MsG0580024551.01.T01:CDS
CCTTTGATTCCAAATGGGTT+TGG 0.384932 5:-6284964 None:intergenic
ATAGATCCAAGTAATCAATT+TGG 0.385531 5:+6284144 MsG0580024551.01.T01:CDS
AAAAGATCACCTCTAGCTAA+TGG 0.387672 5:+6284390 MsG0580024551.01.T01:CDS
GGAGTCAAACTGAAGGAAAA+AGG 0.393162 5:-6285539 None:intergenic
CGGATTGGCTAAATTGTTGT+TGG 0.393749 5:+6285121 MsG0580024551.01.T01:CDS
CCAAACAATATTGTTTCCTA+TGG 0.396501 5:+6283505 MsG0580024551.01.T01:CDS
TCGGAGAAACCAAACCCATT+TGG 0.397884 5:+6284955 MsG0580024551.01.T01:CDS
CTGTTCTTACTAATGTGAAT+TGG 0.399101 5:+6284253 MsG0580024551.01.T01:CDS
TCCAACCCTTTGATTCCAAA+TGG 0.402300 5:-6284970 None:intergenic
GAACTAGGTAGAGGTTCCTT+TGG 0.404011 5:+6284702 MsG0580024551.01.T01:CDS
ATCCACAAAATGAATCCATT+TGG 0.405304 5:+6283473 MsG0580024551.01.T01:CDS
CGAGTTAACCCGACTCTTCG+AGG 0.412409 5:+6284513 MsG0580024551.01.T01:CDS
ATCCGTTCATAATCGGATAA+TGG 0.422608 5:-6284276 None:intergenic
TGTCGTAGGCGCAACTCTCT+TGG 0.426525 5:+6284617 MsG0580024551.01.T01:CDS
CCAACCCTTTGATTCCAAAT+GGG 0.429350 5:-6284969 None:intergenic
AGAGAATGATCAAGAGGCCT+TGG 0.437579 5:+6285382 MsG0580024551.01.T01:CDS
TCTTCAGTAACCAAAATTGT+TGG 0.439843 5:+6284364 MsG0580024551.01.T01:CDS
AAGACAAGAGTTTCTCCTCT+TGG 0.439949 5:+6284447 MsG0580024551.01.T01:CDS
CCCATTTGGAATCAAAGGGT+TGG 0.441937 5:+6284969 MsG0580024551.01.T01:CDS
CATCATCATTAAAATAAAGT+TGG 0.444997 5:-6283693 None:intergenic
AGTCTTGCAAATATCTTGTT+CGG 0.450313 5:+6284936 MsG0580024551.01.T01:CDS
GGAAGGGAGAATAGATGCTT+TGG 0.451812 5:+6285358 MsG0580024551.01.T01:CDS
ATTGCAATATTCAATGAAAT+GGG 0.452160 5:+6284039 MsG0580024551.01.T01:CDS
AGGCTGCATCCGTTCATAAT+CGG 0.452557 5:-6284283 None:intergenic
CTCGAAGAGTCGGGTTAACT+CGG 0.453555 5:-6284512 None:intergenic
GTCAATTTCACACTAGGTTG+TGG 0.454815 5:+6284177 MsG0580024551.01.T01:CDS
CCAAACCCATTTGGAATCAA+AGG 0.455282 5:+6284964 MsG0580024551.01.T01:CDS
CTTGACCAAGTTTCTGTGGC+AGG 0.459038 5:-6284850 None:intergenic
GATGCAGCCTTATTCTCAAC+AGG 0.463553 5:+6284296 MsG0580024551.01.T01:CDS
GGAAATTATGTAATAGGTAG+AGG 0.464426 5:-6283167 None:intergenic
CAGCTTTGGTGCCATGTTGT+TGG 0.466280 5:+6285244 MsG0580024551.01.T01:CDS
AATCCATGGCTATCACCTTC+TGG 0.469595 5:+6283268 MsG0580024551.01.T01:CDS
AAGACTGAGTTGAGAGCCAT+TGG 0.474205 5:+6284822 MsG0580024551.01.T01:CDS
TATGTGGAAACAAATAATAA+TGG 0.476691 5:+6283838 MsG0580024551.01.T01:CDS
AGTGTGGTGCTGATGGAGTC+AGG 0.477854 5:+6285287 MsG0580024551.01.T01:CDS
GTTTGGTTGTGCTGTCCAAA+TGG 0.479033 5:-6283488 None:intergenic
TCAAAGGGTTGGATTTGCAT+TGG 0.479200 5:+6284980 MsG0580024551.01.T01:CDS
TGTTCCAGTGACGGCTAAAG+TGG 0.484951 5:+6285214 MsG0580024551.01.T01:CDS
TGTTTCCACATAAATATCTC+CGG 0.486482 5:-6283827 None:intergenic
CTTTATGTCACAATGAATGA+TGG 0.487951 5:-6285048 None:intergenic
ACATCCACTTTAGCCGTCAC+TGG 0.489140 5:-6285218 None:intergenic
TTAATTGGATATTGTGATGA+GGG 0.493457 5:+6284873 MsG0580024551.01.T01:CDS
TAAAACCTGCCACAGAAACT+TGG 0.500039 5:+6284845 MsG0580024551.01.T01:CDS
GCTCTATAATAATACAACTT+AGG 0.501136 5:-6283913 None:intergenic
GGAGTCAGGGGAGGAAGAAA+AGG 0.502398 5:+6285301 MsG0580024551.01.T01:CDS
CCTAATTCAAGAGATTGATT+AGG 0.505768 5:-6283619 None:intergenic
TTTATTGAAGAACTAGGTAG+AGG 0.507800 5:+6284693 MsG0580024551.01.T01:CDS
AACCTCGTACTAGCACCAAC+AGG 0.509463 5:+6283409 MsG0580024551.01.T01:CDS
ATATTCAATGAAATGGGTAG+TGG 0.511049 5:+6284045 MsG0580024551.01.T01:CDS
TACAACTAGAATCAAACCTC+AGG 0.511499 5:+6283861 MsG0580024551.01.T01:CDS
ATTGGGGATTGCAAGAGGGT+TGG 0.514296 5:+6284998 MsG0580024551.01.T01:CDS
CCGAGGAACGCGAGGATATG+TGG 0.516476 5:+6285172 MsG0580024551.01.T01:CDS
AAGAGATTGATTAGGCAAAA+GGG 0.517414 5:-6283611 None:intergenic
CCACATATCCTCGCGTTCCT+CGG 0.518693 5:-6285172 None:intergenic
CTAGGTTGTGGAGATGATAA+TGG 0.519419 5:+6284189 MsG0580024551.01.T01:CDS
CAAACCCATTTGGAATCAAA+GGG 0.519516 5:+6284965 MsG0580024551.01.T01:CDS
AGGCCTTGGATGACATTGAC+AGG 0.519831 5:+6285396 MsG0580024551.01.T01:CDS
GAAGATTTCTGACTTCGGAT+TGG 0.521378 5:+6285106 MsG0580024551.01.T01:CDS
AACAAGGATGGACTATTATG+AGG 0.522416 5:+6283995 MsG0580024551.01.T01:CDS
ATTGTTGTTGTTGTTAGTGG+TGG 0.524218 5:-6283248 None:intergenic
AATCAATCTCTTGAATTAGG+TGG 0.525333 5:+6283622 MsG0580024551.01.T01:CDS
TCAAAGACCAATTTCACAAG+TGG 0.528647 5:+6283664 MsG0580024551.01.T01:CDS
TGTCTTCAATAGCATACTCT+TGG 0.530236 5:+6284554 MsG0580024551.01.T01:CDS
GAGGATATGTGGCTCCTGAA+TGG 0.534521 5:+6285183 MsG0580024551.01.T01:CDS
ACGCGTTAAAAGAAGCTACA+TGG 0.535507 5:+6284667 MsG0580024551.01.T01:CDS
TCTATCAACGAATAACCATA+AGG 0.536964 5:-6284126 None:intergenic
TCACAGGTTCAGCTAACATC+AGG 0.538638 5:+6283433 MsG0580024551.01.T01:CDS
TGACACAATATTCTCATCCA+AGG 0.539740 5:+6283959 MsG0580024551.01.T01:CDS
ACCTTTGAAAACAATTCCAA+AGG 0.539869 5:-6284718 None:intergenic
TTAGCAGACCTCGAAGAGTC+GGG 0.540428 5:-6284521 None:intergenic
GTCTTTGGCGCTCCAAACAA+TGG 0.540627 5:-6283371 None:intergenic
CGCGTTAAAAGAAGCTACAT+GGG 0.543030 5:+6284668 MsG0580024551.01.T01:CDS
TATGGAATCATGCATGACAC+TGG 0.546625 5:+6283523 MsG0580024551.01.T01:CDS
GATCCAAGTAATCAATTTGG+CGG 0.546725 5:+6284147 MsG0580024551.01.T01:CDS
TCTTTCTTCAAATTAGTGGA+AGG 0.547617 5:-6284486 None:intergenic
GGCCATTATCCGATTATGAA+CGG 0.547937 5:+6284274 MsG0580024551.01.T01:CDS
TCTTCTCTTCCATTAGCTAG+AGG 0.550318 5:-6284399 None:intergenic
TGTCAAGTCAATTTCACACT+AGG 0.552448 5:+6284171 MsG0580024551.01.T01:CDS
ACATTGACAGGTTAGAAAAG+TGG 0.558636 5:+6285408 MsG0580024551.01.T01:CDS
ACAGCGAAGATTTCTGACTT+CGG 0.559161 5:+6285101 MsG0580024551.01.T01:CDS
CTATAATAGCTATTGTTCCA+TGG 0.559466 5:+6284077 MsG0580024551.01.T01:CDS
CAATAGCATACTCTTGGCTG+CGG 0.562061 5:+6284560 MsG0580024551.01.T01:CDS
GACACAATATTCTCATCCAA+GGG 0.563057 5:+6283960 MsG0580024551.01.T01:CDS
ATTAGCAGACCTCGAAGAGT+CGG 0.564875 5:-6284522 None:intergenic
TTTATGTCACAATGAATGAT+GGG 0.565957 5:-6285047 None:intergenic
ATCCAAGTAATCAATTTGGC+GGG 0.566714 5:+6284148 MsG0580024551.01.T01:CDS
ACTAGCACCAACAGGATCAC+AGG 0.568127 5:+6283417 MsG0580024551.01.T01:CDS
GTGGTGGAGAGTCTTGAACT+TGG 0.570049 5:-6283232 None:intergenic
AGCTGAACCTGTGATCCTGT+TGG 0.570110 5:-6283424 None:intergenic
TTCAAGAACATCCTGAAATG+AGG 0.572226 5:+6285453 MsG0580024551.01.T01:CDS
CTAACAACAACAACAATCCA+TGG 0.573166 5:+6283254 MsG0580024551.01.T01:CDS
AAAGGGTTGGATTTGCATTG+GGG 0.573569 5:+6284982 MsG0580024551.01.T01:CDS
ATGGTCATGCAAATGCTAGA+AGG 0.573747 5:+6285488 MsG0580024551.01.T01:CDS
AGACCAATTTCACAAGTGGA+AGG 0.578083 5:+6283668 MsG0580024551.01.T01:CDS
TCATGTTAAGTCCACTTGCA+TGG 0.579811 5:+6283725 MsG0580024551.01.T01:CDS
AGTGTCATGCATGATTCCAT+AGG 0.584765 5:-6283521 None:intergenic
ACACTAAAGCAAAACAAGGA+TGG 0.586253 5:+6283983 MsG0580024551.01.T01:CDS
TGAGGGAATGCATAGAATGT+TGG 0.586475 5:+6284890 MsG0580024551.01.T01:CDS
GCTTGTGATTGTTATATGGA+AGG 0.594059 5:+6285341 MsG0580024551.01.T01:CDS
TTTGCATTGGGGATTGCAAG+AGG 0.595726 5:+6284993 MsG0580024551.01.T01:CDS
TTGCATTGGGGATTGCAAGA+GGG 0.598307 5:+6284994 MsG0580024551.01.T01:CDS
CCATAAGGACATTTACAAGT+AGG 0.599238 5:-6284111 None:intergenic
TAACCTGTCAATGTCATCCA+AGG 0.600039 5:-6285399 None:intergenic
GTTAATTGGATATTGTGATG+AGG 0.602994 5:+6284872 MsG0580024551.01.T01:CDS
GTATATGAGTTCATGAGCAA+TGG 0.610700 5:+6284912 MsG0580024551.01.T01:CDS
ACAATGATCCGAGGAACGCG+AGG 0.610799 5:+6285164 MsG0580024551.01.T01:CDS
ACTTGGAGAAACGTTTCCAA+AGG 0.611342 5:-6283215 None:intergenic
TCACCAGAAGGTGATAGCCA+TGG 0.611666 5:-6283271 None:intergenic
TTAACTTGACCAAGTTTCTG+TGG 0.617201 5:-6284854 None:intergenic
TGAATCCGGAGATATTTATG+TGG 0.623568 5:+6283822 MsG0580024551.01.T01:CDS
TTGCTGTTAAGAAATTGGAT+CGG 0.623848 5:+6284772 MsG0580024551.01.T01:CDS
GTTCAAGAATGTTCCAGTGA+CGG 0.623887 5:+6285205 MsG0580024551.01.T01:CDS
CTGAAATGAGGCCAACAATG+AGG 0.624246 5:+6285465 MsG0580024551.01.T01:CDS
CTTGTGATTGTTATATGGAA+GGG 0.624428 5:+6285342 MsG0580024551.01.T01:CDS
TTAGGCAAAAGGGTATCAGT+AGG 0.628576 5:-6283601 None:intergenic
GTTAGCGCAAGATCGCGAGA+AGG 0.635336 5:+6284794 MsG0580024551.01.T01:CDS
AATGAGGCCAACAATGAGGA+TGG 0.635945 5:+6285469 MsG0580024551.01.T01:CDS
TGTGGAGATGATAATGGTGA+AGG 0.636168 5:+6284195 MsG0580024551.01.T01:CDS
AAATTGTAACGAAATTGAGT+AGG 0.636578 5:-6283748 None:intergenic
GGTGCTGATGGAGTCAGGGG+AGG 0.640134 5:+6285292 MsG0580024551.01.T01:CDS
CAGGTTCAGCTAACATCAGG+TGG 0.642964 5:+6283436 MsG0580024551.01.T01:CDS
GTGTGGTGCTGATGGAGTCA+GGG 0.645422 5:+6285288 MsG0580024551.01.T01:CDS
TCTTTCCATATTGTACCCTG+AGG 0.646393 5:-6283877 None:intergenic
CCGAAAGCGAATTCACCAGA+AGG 0.646876 5:-6283283 None:intergenic
ACAACTAGAATCAAACCTCA+GGG 0.653153 5:+6283862 MsG0580024551.01.T01:CDS
AAGTCAAGGAGTCAAACTGA+AGG 0.653996 5:-6285546 None:intergenic
AATTGAGTAGGCCATGCAAG+TGG 0.656289 5:-6283736 None:intergenic
AAGCATGAAGAAGTTTGTTG+TGG 0.656709 5:-6283317 None:intergenic
GCTAATGGAAGAGAAGAAAG+TGG 0.656803 5:+6284405 MsG0580024551.01.T01:CDS
TTTGGTAGAGAATGATCAAG+AGG 0.660874 5:+6285376 MsG0580024551.01.T01:CDS
GTGGAGATGATAATGGTGAA+GGG 0.662047 5:+6284196 MsG0580024551.01.T01:CDS
CATGCAAATGCTAGAAGGTG+TGG 0.663425 5:+6285493 MsG0580024551.01.T01:CDS
TGTGGTGCTGATGGAGTCAG+GGG 0.670613 5:+6285289 MsG0580024551.01.T01:CDS
GAAATGGGTAGTGGAACTTG+TGG 0.682822 5:+6284054 MsG0580024551.01.T01:CDS
ATCCTGTTGGTGCTAGTACG+AGG 0.687632 5:-6283411 None:intergenic
GCAAACAATTTCCAACAACA+TGG 0.689003 5:-6285255 None:intergenic
AGGGACACTAAAGCAAAACA+AGG 0.696719 5:+6283979 MsG0580024551.01.T01:CDS
GCGTTAAAAGAAGCTACATG+GGG 0.705951 5:+6284669 MsG0580024551.01.T01:CDS
AATGGAAGAGAAGAAAGTGG+CGG 0.743733 5:+6284408 MsG0580024551.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAGAATGGAAATTATGTAAT+AGG - Chr5:6283176-6283195 None:intergenic 20.0%
!! ATTGCAATATTCAATGAAAT+GGG + Chr5:6284039-6284058 MsG0580024551.01.T01:CDS 20.0%
!! CATCATCATTAAAATAAAGT+TGG - Chr5:6283696-6283715 None:intergenic 20.0%
!! TATGTGGAAACAAATAATAA+TGG + Chr5:6283838-6283857 MsG0580024551.01.T01:CDS 20.0%
! AAATTGTAACGAAATTGAGT+AGG - Chr5:6283751-6283770 None:intergenic 25.0%
! ACAAGAATTCTACTATTGTT+TGG + Chr5:6283563-6283582 MsG0580024551.01.T01:CDS 25.0%
! ATAGATCCAAGTAATCAATT+TGG + Chr5:6284144-6284163 MsG0580024551.01.T01:CDS 25.0%
! CAAGAATTCTACTATTGTTT+GGG + Chr5:6283564-6283583 MsG0580024551.01.T01:CDS 25.0%
! CATTGCAATATTCAATGAAA+TGG + Chr5:6284038-6284057 MsG0580024551.01.T01:CDS 25.0%
! GCTCTATAATAATACAACTT+AGG - Chr5:6283916-6283935 None:intergenic 25.0%
! GTAAACTCATATAAATCTTC+TGG - Chr5:6284234-6284253 None:intergenic 25.0%
! TCAAAAACTAAACTTGAAGA+TGG - Chr5:6283802-6283821 None:intergenic 25.0%
! TTAATTGGATATTGTGATGA+GGG + Chr5:6284873-6284892 MsG0580024551.01.T01:CDS 25.0%
! TTTATGTCACAATGAATGAT+GGG - Chr5:6285050-6285069 None:intergenic 25.0%
!! ATCTTTTCTTCCAACAATTT+TGG - Chr5:6284377-6284396 None:intergenic 25.0%
!! TCATCTATGAGTATATTTTG+AGG - Chr5:6285074-6285093 None:intergenic 25.0%
!!! AGTTTAGTTTTTGATGAATC+CGG + Chr5:6283808-6283827 MsG0580024551.01.T01:CDS 25.0%
AAGAGATTGATTAGGCAAAA+GGG - Chr5:6283614-6283633 None:intergenic 30.0%
AATCAATCTCTTGAATTAGG+TGG + Chr5:6283622-6283641 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
AGAAACTTGGTCAAGTTAAT+TGG + Chr5:6284858-6284877 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
AGAGCAACACTTGATTATTA+TGG + Chr5:6283931-6283950 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
AGTCTTGCAAATATCTTGTT+CGG + Chr5:6284936-6284955 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
AGTGGATAAAGATTGCAATT+TGG + Chr5:6285426-6285445 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
ATATTCAATGAAATGGGTAG+TGG + Chr5:6284045-6284064 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
ATCCACAAAATGAATCCATT+TGG + Chr5:6283473-6283492 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
ATTGCAATGCAAATGTTATC+AGG - Chr5:6284027-6284046 None:intergenic 30.0%
CCAAACAATATTGTTTCCTA+TGG + Chr5:6283505-6283524 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
CCATAGGAAACAATATTGTT+TGG - Chr5:6283508-6283527 None:intergenic 30.0%
CCTAATCAATCTCTTGAATT+AGG + Chr5:6283619-6283638 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
CCTAATTCAAGAGATTGATT+AGG - Chr5:6283622-6283641 None:intergenic 30.0%
CTATAATAGCTATTGTTCCA+TGG + Chr5:6284077-6284096 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
CTGTTCTTACTAATGTGAAT+TGG + Chr5:6284253-6284272 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
CTTGTGATTGTTATATGGAA+GGG + Chr5:6285342-6285361 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
CTTTATGTCACAATGAATGA+TGG - Chr5:6285051-6285070 None:intergenic 30.0%
GGAAATTATGTAATAGGTAG+AGG - Chr5:6283170-6283189 None:intergenic 30.0%
GTTAATTGGATATTGTGATG+AGG + Chr5:6284872-6284891 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
GTTGTCTTTCTTCAAATTAG+TGG - Chr5:6284493-6284512 None:intergenic 30.0%
TACATGATCAAACCATTGTT+TGG + Chr5:6283359-6283378 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
TCTATCAACGAATAACCATA+AGG - Chr5:6284129-6284148 None:intergenic 30.0%
TCTTCAGTAACCAAAATTGT+TGG + Chr5:6284364-6284383 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
TCTTTCTTCAAATTAGTGGA+AGG - Chr5:6284489-6284508 None:intergenic 30.0%
TGTTTCCACATAAATATCTC+CGG - Chr5:6283830-6283849 None:intergenic 30.0%
TTTATTGAAGAACTAGGTAG+AGG + Chr5:6284693-6284712 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
! ACCTTTGAAAACAATTCCAA+AGG - Chr5:6284721-6284740 None:intergenic 30.0%
! CACAAGTTGAAGAAAAAGAA+TGG - Chr5:6283191-6283210 None:intergenic 30.0%
! TGTTGTTGCTGTTAAGAAAT+TGG + Chr5:6284767-6284786 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
! TTGCTGTTAAGAAATTGGAT+CGG + Chr5:6284772-6284791 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
!! AAAAGGCAATTTTGACAGAT+TGG + Chr5:6285318-6285337 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
!! AAAGGCAATTTTGACAGATT+GGG + Chr5:6285319-6285338 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
!! AGAAGTTTGTTGTGGTATTA+CGG - Chr5:6283312-6283331 None:intergenic 30.0%
!!! TCCTTTGGAATTGTTTTCAA+AGG + Chr5:6284717-6284736 MsG0580024551.01.T01:CDS 30.0%
AAAAGATCACCTCTAGCTAA+TGG + Chr5:6284390-6284409 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
AAAGTGGATGTTTACAGCTT+TGG + Chr5:6285230-6285249 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
ACAACTAGAATCAAACCTCA+GGG + Chr5:6283862-6283881 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
ACACTAAAGCAAAACAAGGA+TGG + Chr5:6283983-6284002 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
ACATTGACAGGTTAGAAAAG+TGG + Chr5:6285408-6285427 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
ACTTCTTCATGCTTGCAATA+TGG + Chr5:6283326-6283345 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
AGAACAAAAACAATGATCCG+AGG + Chr5:6285155-6285174 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
ATCCAAGTAATCAATTTGGC+GGG + Chr5:6284148-6284167 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
ATCCGTTCATAATCGGATAA+TGG - Chr5:6284279-6284298 None:intergenic 35.0%
CAAGAGATTGATTAGGCAAA+AGG - Chr5:6283615-6283634 None:intergenic 35.0%
CCATAAGGACATTTACAAGT+AGG - Chr5:6284114-6284133 None:intergenic 35.0%
CCTACTTGTAAATGTCCTTA+TGG + Chr5:6284111-6284130 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
CTAACAACAACAACAATCCA+TGG + Chr5:6283254-6283273 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
GACACAATATTCTCATCCAA+GGG + Chr5:6283960-6283979 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
GATCCAAGTAATCAATTTGG+CGG + Chr5:6284147-6284166 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
GCAAACAATTTCCAACAACA+TGG - Chr5:6285258-6285277 None:intergenic 35.0%
GCTTGTGATTGTTATATGGA+AGG + Chr5:6285341-6285360 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
GTATATGAGTTCATGAGCAA+TGG + Chr5:6284912-6284931 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
GTTTCTCCTCTTGGTAAAAT+AGG + Chr5:6284456-6284475 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
TACAACTAGAATCAAACCTC+AGG + Chr5:6283861-6283880 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
TCAAAGACCAATTTCACAAG+TGG + Chr5:6283664-6283683 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
TGAATCCGGAGATATTTATG+TGG + Chr5:6283822-6283841 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
TGACACAATATTCTCATCCA+AGG + Chr5:6283959-6283978 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
TGTCAAGTCAATTTCACACT+AGG + Chr5:6284171-6284190 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
TGTCTTCAATAGCATACTCT+TGG + Chr5:6284554-6284573 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
TTCAAGAACATCCTGAAATG+AGG + Chr5:6285453-6285472 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
TTGGGCTTGTGATTGTTATA+TGG + Chr5:6285337-6285356 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGTAGAGAATGATCAAG+AGG + Chr5:6285376-6285395 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
! ATTGTTGTTGTTGTTAGTGG+TGG - Chr5:6283251-6283270 None:intergenic 35.0%
! CAAACCCATTTGGAATCAAA+GGG + Chr5:6284965-6284984 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
! CTAGTACCTATTTTACCAAG+AGG - Chr5:6284465-6284484 None:intergenic 35.0%
! TGGATTGTTGTTGTTGTTAG+TGG - Chr5:6283254-6283273 None:intergenic 35.0%
! TTAACTTGACCAAGTTTCTG+TGG - Chr5:6284857-6284876 None:intergenic 35.0%
!! AACAAGGATGGACTATTATG+AGG + Chr5:6283995-6284014 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGCATGAAGAAGTTTGTTG+TGG - Chr5:6283320-6283339 None:intergenic 35.0%
!! GTCCAAATGGATTCATTTTG+TGG - Chr5:6283478-6283497 None:intergenic 35.0%
!!! TGGGGTTTTATTGAAGAACT+AGG + Chr5:6284687-6284706 MsG0580024551.01.T01:CDS 35.0%
AAACTGAAGGAAAAAGGCGA+TGG - Chr5:6285536-6285555 None:intergenic 40.0%
AAAGGGTTGGATTTGCATTG+GGG + Chr5:6284982-6285001 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
AAGACAAGAGTTTCTCCTCT+TGG + Chr5:6284447-6284466 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
AATGGAAGAGAAGAAAGTGG+CGG + Chr5:6284408-6284427 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
ACAGCGAAGATTTCTGACTT+CGG + Chr5:6285101-6285120 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
ACGCGTTAAAAGAAGCTACA+TGG + Chr5:6284667-6284686 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
ACTTGGAGAAACGTTTCCAA+AGG - Chr5:6283218-6283237 None:intergenic 40.0%
AGACCAATTTCACAAGTGGA+AGG + Chr5:6283668-6283687 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
AGGGACACTAAAGCAAAACA+AGG + Chr5:6283979-6283998 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
AGTGTCATGCATGATTCCAT+AGG - Chr5:6283524-6283543 None:intergenic 40.0%
ATGGTCATGCAAATGCTAGA+AGG + Chr5:6285488-6285507 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
CAAAGGGTTGGATTTGCATT+GGG + Chr5:6284981-6285000 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
CCAACCCTTTGATTCCAAAT+GGG - Chr5:6284972-6284991 None:intergenic 40.0%
CGCGTTAAAAGAAGCTACAT+GGG + Chr5:6284668-6284687 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
CTAGGTTGTGGAGATGATAA+TGG + Chr5:6284189-6284208 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
GAACCTTCCACTTGTGAAAT+TGG - Chr5:6283674-6283693 None:intergenic 40.0%
GAAGATTTCTGACTTCGGAT+TGG + Chr5:6285106-6285125 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
GACATTGTTGAAGCCGAAAA+AGG + Chr5:6284593-6284612 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
GCGTTAAAAGAAGCTACATG+GGG + Chr5:6284669-6284688 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
GCTAATGGAAGAGAAGAAAG+TGG + Chr5:6284405-6284424 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
GGAACATTCTTGAACCATTC+AGG - Chr5:6285200-6285219 None:intergenic 40.0%
GGAGTCAAACTGAAGGAAAA+AGG - Chr5:6285542-6285561 None:intergenic 40.0%
GGCCATTATCCGATTATGAA+CGG + Chr5:6284274-6284293 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
GTCAATTTCACACTAGGTTG+TGG + Chr5:6284177-6284196 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
GTTCAAGAATGTTCCAGTGA+CGG + Chr5:6285205-6285224 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
TAAAACCTGCCACAGAAACT+TGG + Chr5:6284845-6284864 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
TAACCTGTCAATGTCATCCA+AGG - Chr5:6285402-6285421 None:intergenic 40.0%
TATGGAATCATGCATGACAC+TGG + Chr5:6283523-6283542 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
TCAAACCTCAGGGTACAATA+TGG + Chr5:6283872-6283891 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
TCAAAGGGTTGGATTTGCAT+TGG + Chr5:6284980-6284999 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
TCATGTTAAGTCCACTTGCA+TGG + Chr5:6283725-6283744 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
TCCAACCCTTTGATTCCAAA+TGG - Chr5:6284973-6284992 None:intergenic 40.0%
TCTTCTCTTCCATTAGCTAG+AGG - Chr5:6284402-6284421 None:intergenic 40.0%
TCTTTCCATATTGTACCCTG+AGG - Chr5:6283880-6283899 None:intergenic 40.0%
TGACAGTCCTGTTGAGAATA+AGG - Chr5:6284306-6284325 None:intergenic 40.0%
TGAGGGAATGCATAGAATGT+TGG + Chr5:6284890-6284909 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
! AGTAGGTCTCTGATTTTCCA+TGG - Chr5:6284097-6284116 None:intergenic 40.0%
! CCAAACCCATTTGGAATCAA+AGG + Chr5:6284964-6284983 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
! CCTTTGATTCCAAATGGGTT+TGG - Chr5:6284967-6284986 None:intergenic 40.0%
! GTTGCTGTTGTTCATGTCTT+TGG - Chr5:6283389-6283408 None:intergenic 40.0%
! TGTTTGCTGCAGAAAAAGTG+TGG + Chr5:6285271-6285290 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
! TGTTTTGCTTTAGTGTCCCT+TGG - Chr5:6283979-6283998 None:intergenic 40.0%
!! CGGATTGGCTAAATTGTTGT+TGG + Chr5:6285121-6285140 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
!! CTTCAACTTGTGTTAGCCTT+TGG + Chr5:6283199-6283218 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
!! GTGGAGATGATAATGGTGAA+GGG + Chr5:6284196-6284215 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
!! TGTGGAGATGATAATGGTGA+AGG + Chr5:6284195-6284214 MsG0580024551.01.T01:CDS 40.0%
!! TTAGGCAAAAGGGTATCAGT+AGG - Chr5:6283604-6283623 None:intergenic 40.0%
AAGCCGAAAAAGGTTGTCGT+AGG + Chr5:6284603-6284622 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
AATCCATGGCTATCACCTTC+TGG + Chr5:6283268-6283287 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
AATGAGGCCAACAATGAGGA+TGG + Chr5:6285469-6285488 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
AATTGAGTAGGCCATGCAAG+TGG - Chr5:6283739-6283758 None:intergenic 45.0%
ACTCTTCGAGGTCTGCTAAT+TGG + Chr5:6284525-6284544 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
AGAGAATGATCAAGAGGCCT+TGG + Chr5:6285382-6285401 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
AGGCTGCATCCGTTCATAAT+CGG - Chr5:6284286-6284305 None:intergenic 45.0%
ATTAGCAGACCTCGAAGAGT+CGG - Chr5:6284525-6284544 None:intergenic 45.0%
CAATAGCATACTCTTGGCTG+CGG + Chr5:6284560-6284579 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
CACCCGCCAAATTGATTACT+TGG - Chr5:6284153-6284172 None:intergenic 45.0%
CATGCAAATGCTAGAAGGTG+TGG + Chr5:6285493-6285512 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
CCTTCTGGTGAATTCGCTTT+CGG + Chr5:6283283-6283302 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
CTGAAATGAGGCCAACAATG+AGG + Chr5:6285465-6285484 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
GAACTAGGTAGAGGTTCCTT+TGG + Chr5:6284702-6284721 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
GGAAGGGAGAATAGATGCTT+TGG + Chr5:6285358-6285377 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
GTTTGGTTGTGCTGTCCAAA+TGG - Chr5:6283491-6283510 None:intergenic 45.0%
TCACAGGTTCAGCTAACATC+AGG + Chr5:6283433-6283452 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
TCGGAGAAACCAAACCCATT+TGG + Chr5:6284955-6284974 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
TGAAGGAAAAAGGCGATGGT+GGG - Chr5:6285532-6285551 None:intergenic 45.0%
TGCATGACCATCCTCATTGT+TGG - Chr5:6285479-6285498 None:intergenic 45.0%
TTGCATTGGGGATTGCAAGA+GGG + Chr5:6284994-6285013 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
TTTGCATTGGGGATTGCAAG+AGG + Chr5:6284993-6285012 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
! AAGACTGAGTTGAGAGCCAT+TGG + Chr5:6284822-6284841 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
! CAGAAAAAGTGTGGTGCTGA+TGG + Chr5:6285280-6285299 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
! CCCATTTGGAATCAAAGGGT+TGG + Chr5:6284969-6284988 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
! CTCATTGTTGGCCTCATTTC+AGG - Chr5:6285467-6285486 None:intergenic 45.0%
! TCTGTGGCAGGTTTTACCAA+TGG - Chr5:6284841-6284860 None:intergenic 45.0%
!! AAAAAGGCGATGGTGGGTTA+GGG - Chr5:6285526-6285545 None:intergenic 45.0%
!! GAAATGGGTAGTGGAACTTG+TGG + Chr5:6284054-6284073 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
!! GATGCAGCCTTATTCTCAAC+AGG + Chr5:6284296-6284315 MsG0580024551.01.T01:CDS 45.0%
AACCTCGTACTAGCACCAAC+AGG + Chr5:6283409-6283428 MsG0580024551.01.T01:CDS 50.0%
ACATCCACTTTAGCCGTCAC+TGG - Chr5:6285221-6285240 None:intergenic 50.0%
ACTAGCACCAACAGGATCAC+AGG + Chr5:6283417-6283436 MsG0580024551.01.T01:CDS 50.0%
AGCTGAACCTGTGATCCTGT+TGG - Chr5:6283427-6283446 None:intergenic 50.0%
AGGCCTTGGATGACATTGAC+AGG + Chr5:6285396-6285415 MsG0580024551.01.T01:CDS 50.0%
ATTGGGGATTGCAAGAGGGT+TGG + Chr5:6284998-6285017 MsG0580024551.01.T01:CDS 50.0%
CAGGTTCAGCTAACATCAGG+TGG + Chr5:6283436-6283455 MsG0580024551.01.T01:CDS 50.0%
CCGAAAGCGAATTCACCAGA+AGG - Chr5:6283286-6283305 None:intergenic 50.0%
CTCGAAGAGTCGGGTTAACT+CGG - Chr5:6284515-6284534 None:intergenic 50.0%
CTGAAGGAAAAAGGCGATGG+TGG - Chr5:6285533-6285552 None:intergenic 50.0%
CTTGACCAAGTTTCTGTGGC+AGG - Chr5:6284853-6284872 None:intergenic 50.0%
GAGGATATGTGGCTCCTGAA+TGG + Chr5:6285183-6285202 MsG0580024551.01.T01:CDS 50.0%
GTCTTTGGCGCTCCAAACAA+TGG - Chr5:6283374-6283393 None:intergenic 50.0%
TCACCAGAAGGTGATAGCCA+TGG - Chr5:6283274-6283293 None:intergenic 50.0%
TGTTCCAGTGACGGCTAAAG+TGG + Chr5:6285214-6285233 MsG0580024551.01.T01:CDS 50.0%
TTAGCAGACCTCGAAGAGTC+GGG - Chr5:6284524-6284543 None:intergenic 50.0%
! ACTCTTGGCTGCGGTTGTTT+TGG + Chr5:6284569-6284588 MsG0580024551.01.T01:CDS 50.0%
! GCGCCTACGACAACCTTTTT+CGG - Chr5:6284609-6284628 None:intergenic 50.0%
! GTGGTGGAGAGTCTTGAACT+TGG - Chr5:6283235-6283254 None:intergenic 50.0%
!! ATCCTGTTGGTGCTAGTACG+AGG - Chr5:6283414-6283433 None:intergenic 50.0%
!! CAGCTTTGGTGCCATGTTGT+TGG + Chr5:6285244-6285263 MsG0580024551.01.T01:CDS 50.0%
!! GAAAAAGGCGATGGTGGGTT+AGG - Chr5:6285527-6285546 None:intergenic 50.0%
ACAATGATCCGAGGAACGCG+AGG + Chr5:6285164-6285183 MsG0580024551.01.T01:CDS 55.0%
CCACATATCCTCGCGTTCCT+CGG - Chr5:6285175-6285194 None:intergenic 55.0%
CGAGTTAACCCGACTCTTCG+AGG + Chr5:6284513-6284532 MsG0580024551.01.T01:CDS 55.0%
GGAGTCAGGGGAGGAAGAAA+AGG + Chr5:6285301-6285320 MsG0580024551.01.T01:CDS 55.0%
GTTAGCGCAAGATCGCGAGA+AGG + Chr5:6284794-6284813 MsG0580024551.01.T01:CDS 55.0%
TGTCGTAGGCGCAACTCTCT+TGG + Chr5:6284617-6284636 MsG0580024551.01.T01:CDS 55.0%
!! AGTGTGGTGCTGATGGAGTC+AGG + Chr5:6285287-6285306 MsG0580024551.01.T01:CDS 55.0%
!! GTGTGGTGCTGATGGAGTCA+GGG + Chr5:6285288-6285307 MsG0580024551.01.T01:CDS 55.0%
!! TGTGGTGCTGATGGAGTCAG+GGG + Chr5:6285289-6285308 MsG0580024551.01.T01:CDS 55.0%
CCGAGGAACGCGAGGATATG+TGG + Chr5:6285172-6285191 MsG0580024551.01.T01:CDS 60.0%
!! GGTGCTGATGGAGTCAGGGG+AGG + Chr5:6285292-6285311 MsG0580024551.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 6283157 6285565 6283157 ID=MsG0580024551.01;Name=MsG0580024551.01
Chr5 mRNA 6283157 6285565 6283157 ID=MsG0580024551.01.T01;Parent=MsG0580024551.01;Name=MsG0580024551.01.T01;_AED=0.45;_eAED=0.45;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|802
Chr5 exon 6283157 6285565 6283157 ID=MsG0580024551.01.T01:exon:2449;Parent=MsG0580024551.01.T01
Chr5 CDS 6283157 6285565 6283157 ID=MsG0580024551.01.T01:cds;Parent=MsG0580024551.01.T01
Gene Sequence

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Protein sequence

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