AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580025219.01

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MsG0580025219.01.T01 AT3G11080 26.667 180 118 4 221 391 482 656 2.79e-13 72.0
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MsG0580025219.01.T01 AT2G15080 30.363 303 195 4 104 393 23 322 2.57e-32 129
MsG0580025219.01.T01 AT2G15080 35.238 210 135 1 158 367 184 392 7.40e-31 125
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MsG0580025219.01.T01 AT1G17230 33.190 232 150 2 158 387 235 463 3.85e-28 117
MsG0580025219.01.T01 AT1G17230 35.897 195 123 2 158 350 499 693 4.91e-27 114
MsG0580025219.01.T01 AT1G17230 31.416 226 153 2 163 387 408 632 1.53e-25 109
MsG0580025219.01.T01 AT1G17230 31.599 269 151 4 144 388 422 681 7.98e-25 107
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MsG0580025219.01.T01 AT5G62230 33.188 229 152 1 159 387 263 490 2.03e-26 112
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MsG0580025219.01.T01 AT1G13910 29.452 146 102 1 243 388 66 210 6.05e-11 63.5
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MsG0580025219.01.T01 AT5G63930 30.909 220 151 1 168 387 347 565 4.74e-23 102
MsG0580025219.01.T01 AT5G63930 27.391 230 166 1 158 387 361 589 6.50e-19 89.7
MsG0580025219.01.T01 AT5G51560 38.028 213 126 5 116 325 29 238 5.08e-33 131
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MsG0580025219.01.T01 AT1G17750 30.040 253 152 2 159 387 173 424 9.66e-26 110
MsG0580025219.01.T01 AT1G17750 29.596 223 154 2 155 376 480 700 2.02e-23 103
MsG0580025219.01.T01 AT1G17750 27.778 234 168 1 158 391 220 452 4.89e-23 102
MsG0580025219.01.T01 AT1G33610 29.129 333 200 6 87 387 2 330 1.24e-31 125
MsG0580025219.01.T01 AT5G56040 35.398 226 145 1 163 388 270 494 1.25e-31 127
MsG0580025219.01.T01 AT5G56040 32.174 230 155 1 158 387 217 445 3.04e-28 117
MsG0580025219.01.T01 AT5G56040 33.190 232 144 4 160 387 339 563 5.26e-28 117
MsG0580025219.01.T01 AT5G56040 33.333 222 146 2 167 387 201 421 6.95e-27 113
MsG0580025219.01.T01 AT5G56040 28.873 284 150 4 159 393 362 642 2.14e-25 108
MsG0580025219.01.T01 AT5G56040 34.643 280 169 8 119 391 33 305 4.83e-25 108
MsG0580025219.01.T01 AT5G56040 32.536 209 117 4 162 347 461 668 8.43e-22 98.2
MsG0580025219.01.T01 AT5G56040 28.326 233 143 4 158 367 409 640 2.14e-19 90.9
MsG0580025219.01.T01 AT5G56040 31.677 161 103 4 141 295 505 664 3.51e-15 78.2
MsG0580025219.01.T01 AT5G07180 36.283 226 143 1 162 387 220 444 2.01e-31 127
MsG0580025219.01.T01 AT5G07180 34.934 229 148 1 159 387 169 396 1.49e-28 118
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MsG0580025219.01.T01 AT5G07180 32.157 255 141 4 163 390 6 255 1.07e-24 107
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MsG0580025219.01.T01 AT5G61240 28.804 184 116 2 220 388 87 270 2.87e-15 76.6
MsG0580025219.01.T01 AT5G61240 31.522 184 98 3 164 319 140 323 1.95e-14 74.3
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MsG0580025219.01.T01 AT5G61480 32.569 218 146 1 160 377 179 395 2.82e-26 111
MsG0580025219.01.T01 AT5G61480 28.906 256 159 3 158 390 201 456 1.64e-24 106
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MsG0580025219.01.T01 AT5G61480 26.877 253 161 2 159 388 346 597 5.52e-21 95.9
MsG0580025219.01.T01 AT5G61480 27.979 193 138 1 158 350 417 608 9.54e-17 82.8
MsG0580025219.01.T01 AT5G07280 37.000 200 125 1 188 387 586 784 1.34e-29 121
MsG0580025219.01.T01 AT5G07280 32.018 228 153 2 160 387 164 389 2.70e-28 117
MsG0580025219.01.T01 AT5G07280 28.859 298 191 5 92 388 531 808 8.68e-26 110
MsG0580025219.01.T01 AT5G07280 32.231 242 142 5 162 387 405 640 6.95e-25 107
MsG0580025219.01.T01 AT5G07280 28.346 254 157 3 163 393 263 514 4.72e-21 95.9
MsG0580025219.01.T01 AT5G07280 35.455 110 71 0 268 377 79 188 2.10e-11 66.2
MsG0580025219.01.T01 AT5G49660 32.314 229 153 2 160 387 221 448 1.35e-29 121
MsG0580025219.01.T01 AT5G49660 33.478 230 152 1 158 387 268 496 1.75e-29 121
MsG0580025219.01.T01 AT5G49660 34.906 212 136 2 178 388 191 401 2.64e-27 114
MsG0580025219.01.T01 AT5G49660 29.333 300 167 10 124 387 38 328 2.29e-21 97.1
MsG0580025219.01.T01 AT5G49660 27.273 242 150 2 163 380 321 560 3.39e-21 96.3
MsG0580025219.01.T01 AT5G49660 31.515 165 112 1 158 322 388 551 7.48e-15 77.0
MsG0580025219.01.T01 AT3G28040 31.541 279 184 6 117 391 36 311 1.73e-29 121
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MsG0580025219.01.T01 AT3G28040 28.696 230 163 1 158 387 223 451 2.50e-24 105
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MsG0580025219.01.T01 AT3G28890 28.909 339 198 6 88 387 14 348 1.62e-28 118
MsG0580025219.01.T01 AT3G28890 29.915 234 135 4 160 369 243 471 1.78e-18 87.8
MsG0580025219.01.T01 AT5G37450 28.488 344 182 8 101 385 16 354 1.97e-28 118
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MsG0580025219.01.T01 AT3G23120 27.313 227 159 4 147 368 313 538 1.16e-14 76.3
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MsG0580025219.01.T01 AT5G01950 31.395 258 167 5 120 370 35 289 2.26e-27 115
MsG0580025219.01.T01 AT5G01950 26.562 192 138 3 160 350 152 341 1.36e-16 82.4
MsG0580025219.01.T01 AT5G01950 31.395 258 167 5 120 370 35 289 2.26e-27 115
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MsG0580025219.01.T01 AT5G01950 31.395 258 167 5 120 370 35 289 2.86e-27 114
MsG0580025219.01.T01 AT5G01950 26.562 192 138 3 160 350 152 341 1.27e-16 82.4
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MsG0580025219.01.T01 AT1G63430 34.300 207 129 4 120 325 30 230 9.49e-27 112
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MsG0580025219.01.T01 AT1G75820 34.058 138 88 3 255 390 71 207 3.44e-13 72.0
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MsG0580025219.01.T01 AT3G05650 32.203 177 111 3 221 391 404 577 3.04e-20 93.6
MsG0580025219.01.T01 AT3G05650 32.227 211 132 6 183 387 414 619 1.03e-18 89.0
MsG0580025219.01.T01 AT3G05650 30.594 219 141 5 157 369 412 625 1.75e-18 88.2
MsG0580025219.01.T01 AT3G05650 25.431 232 149 6 158 368 537 765 1.66e-12 69.7
MsG0580025219.01.T01 AT3G02130 26.524 328 197 8 91 383 7 325 2.42e-26 112
MsG0580025219.01.T01 AT3G02130 29.091 275 136 5 158 376 196 467 1.54e-22 100
MsG0580025219.01.T01 AT3G02130 27.500 280 143 6 163 387 180 454 1.06e-19 92.0
MsG0580025219.01.T01 AT3G02130 26.524 328 197 8 91 383 24 342 2.69e-26 111
MsG0580025219.01.T01 AT3G02130 29.091 275 136 5 158 376 213 484 1.57e-22 100
MsG0580025219.01.T01 AT3G02130 27.500 280 143 6 163 387 197 471 9.94e-20 92.0
MsG0580025219.01.T01 AT1G74360 31.602 231 156 2 163 392 257 486 2.94e-26 111
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MsG0580025219.01.T01 AT3G23110 25.926 216 148 3 160 368 378 588 4.89e-14 74.3
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MsG0580025219.01.T01 AT1G56130 29.365 252 151 3 160 387 125 373 2.71e-24 105
MsG0580025219.01.T01 AT1G56130 25.540 278 168 4 139 387 60 327 8.80e-16 80.1
MsG0580025219.01.T01 AT5G62710 37.634 186 106 5 101 285 15 191 3.12e-24 105
MsG0580025219.01.T01 AT2G45340 32.057 209 135 4 121 325 30 235 3.29e-24 105
MsG0580025219.01.T01 AT2G45340 37.398 123 76 1 266 388 80 201 5.06e-13 71.2
MsG0580025219.01.T01 AT5G16000 36.810 163 100 3 120 281 44 204 3.67e-24 105
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MsG0580025219.01.T01 AT4G39400 31.102 254 146 4 160 385 318 570 3.91e-24 105
MsG0580025219.01.T01 AT4G39400 34.043 235 140 4 163 392 395 619 9.44e-22 98.2
MsG0580025219.01.T01 AT4G39400 27.338 278 175 6 135 387 177 452 5.18e-18 86.7
MsG0580025219.01.T01 AT4G39400 26.449 276 156 3 158 387 440 714 9.61e-17 82.8
MsG0580025219.01.T01 AT4G39400 29.412 170 109 2 165 323 587 756 1.46e-11 67.0
MsG0580025219.01.T01 AT2G13790 38.889 180 103 7 120 296 35 210 4.64e-24 104
MsG0580025219.01.T01 AT2G13790 31.206 141 86 2 215 345 50 189 2.00e-11 66.2
MsG0580025219.01.T01 AT5G21090 34.783 184 113 5 90 270 3 182 5.18e-24 99.4
MsG0580025219.01.T01 AT5G21090 34.109 129 79 3 242 365 82 209 7.18e-14 70.9
MsG0580025219.01.T01 AT5G21090 32.174 115 77 1 255 369 71 184 1.28e-13 70.1
MsG0580025219.01.T01 AT1G29740 32.035 231 150 4 163 392 127 351 6.03e-24 104
MsG0580025219.01.T01 AT1G29740 26.957 230 146 1 180 387 96 325 7.61e-18 86.3
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MsG0580025219.01.T01 AT5G01950 32.178 202 134 2 170 370 5 204 6.30e-24 104
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MsG0580025219.01.T01 AT5G39390 42.742 124 55 1 102 225 17 124 1.68e-22 99.4
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MsG0580025219.01.T01 AT4G33970 29.936 157 108 2 160 316 208 362 2.82e-12 68.9
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MsG0580025219.01.T01 AT4G04220 33.891 239 149 6 159 391 224 459 2.46e-22 99.8
MsG0580025219.01.T01 AT4G04220 30.667 225 151 4 163 387 354 573 2.58e-22 99.8
MsG0580025219.01.T01 AT4G04220 26.837 313 172 5 136 391 53 365 3.07e-20 93.6
MsG0580025219.01.T01 AT4G04220 27.027 259 152 7 163 387 471 726 2.57e-15 78.2
MsG0580025219.01.T01 AT4G04220 44.762 105 57 1 161 265 645 748 1.42e-13 72.8
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MsG0580025219.01.T01 AT2G35620 37.576 165 100 3 117 280 32 194 3.12e-18 87.0
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MsG0580025219.01.T01 AT5G49290 26.198 313 186 11 115 383 15 326 1.80e-17 85.1
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MsG0580025219.01.T01 AT1G34210 30.921 152 91 3 208 345 36 187 7.35e-13 70.5
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MsG0580025219.01.T01 AT1G07650 28.889 225 134 5 187 387 95 317 2.17e-12 69.3
MsG0580025219.01.T01 AT1G07650 27.059 255 158 6 163 393 125 375 9.05e-17 82.8
MsG0580025219.01.T01 AT1G07650 28.700 223 133 5 189 387 103 323 5.15e-12 68.2
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MsG0580025219.01.T01 AT4G13810 26.295 251 132 5 163 387 164 387 1.12e-15 79.3
MsG0580025219.01.T01 AT4G13810 27.500 240 148 6 156 370 299 537 3.38e-15 77.8
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MsG0580025219.01.T01 AT1G58190 28.415 183 108 3 165 326 507 687 5.14e-16 80.5
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MsG0580025219.01.T01 AT5G58300 28.287 251 131 9 91 340 32 234 4.12e-14 74.3
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Find 81 sgRNAs with CRISPR-Local

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TTTAGCAAGAATGAATATAA+TGG 0.317737 5:-15413698 MsG0580025219.01.T01:intron
GAACAACTTGTCAAGTTTGT+AGG 0.317795 5:+15410378 None:intergenic
CTTAAAGTCTTGCACTTAGT+TGG 0.324075 5:-15410351 MsG0580025219.01.T01:CDS
TTGAAAATATTTGACATTAG+TGG 0.324574 5:-15409916 MsG0580025219.01.T01:CDS
CTCGACAATAACTTGTTTGA+AGG 0.334566 5:-15410408 MsG0580025219.01.T01:CDS
GTTGCTCCTTCTTCATCTCT+AGG 0.357383 5:+15413795 None:intergenic
GTAGCAGAGGCCTTGGCATT+AGG 0.364864 5:-15410729 MsG0580025219.01.T01:CDS
GAGCCACTAAATCGATTATC+TGG 0.370682 5:+15410045 None:intergenic
ATAGGAGGGAATCAAATCTT+AGG 0.379104 5:-15409973 MsG0580025219.01.T01:CDS
CTTCTATCCACTTCTGCAAC+TGG 0.392906 5:-15410623 MsG0580025219.01.T01:CDS
ACACCAGATAATCGATTTAG+TGG 0.406602 5:-15410048 MsG0580025219.01.T01:CDS
TGTAGCAGTAGCAGAGGCCT+TGG 0.409149 5:-15410736 MsG0580025219.01.T01:CDS
TCCTTTCTTTCAACTTAACT+TGG 0.410601 5:-15410782 MsG0580025219.01.T01:CDS
GGTTGTTTACAATAAGTTAG+AGG 0.412335 5:-15410193 MsG0580025219.01.T01:CDS
CATTAGTGGAAACCATTTGT+TGG 0.412352 5:-15409902 MsG0580025219.01.T01:CDS
GGAGGAATCTCGCCATTCAT+AGG 0.413702 5:-15410243 MsG0580025219.01.T01:CDS
CTTATATTAGAAATGGTTAC+GGG 0.418345 5:-15413924 None:intergenic
GTGACTGACAACAAACTATC+AGG 0.418997 5:-15410120 MsG0580025219.01.T01:CDS
AGAGTTTGGAACATATTTGA+TGG 0.423891 5:+15410018 None:intergenic
TCTTATATTAGAAATGGTTA+CGG 0.432392 5:-15413925 None:intergenic
TTAGTTGGAAACAAGCTAAC+TGG 0.433505 5:-15410336 MsG0580025219.01.T01:CDS
TAAGACTCCATTTGGGTCAC+TGG 0.438102 5:+15410659 None:intergenic
CTTGGAACTTGTCCAACAAA+TGG 0.440564 5:+15409890 None:intergenic
AAAATGCAACCTCAAACTAA+TGG 0.444300 5:-15411414 MsG0580025219.01.T01:intron
AAGCATTAACAATGGAGGTT+GGG 0.451520 5:+15409944 None:intergenic
GTTGGACAAGTTCCAAGTCT+AGG 0.451746 5:-15409884 None:intergenic
TCATCTCTAGGTACAATATG+TGG 0.452888 5:+15413807 None:intergenic
TTTGTAACTCTTTGATGCAT+GGG 0.456559 5:+15410582 None:intergenic
TTTACCATACCATTAGTTTG+AGG 0.460547 5:+15411405 None:intergenic
CGAGAGAGATTGCCAATGTA+AGG 0.472081 5:+15410519 None:intergenic
CTTTGTAACTCTTTGATGCA+TGG 0.475758 5:+15410581 None:intergenic
GCAATGCTAGATGATCAGTT+TGG 0.478180 5:+15410703 None:intergenic
ACAGATGAAATGTTCATAGA+TGG 0.479041 5:-15413891 MsG0580025219.01.T01:CDS
ACCAAGTTAAGTTGAAAGAA+AGG 0.481030 5:+15410781 None:intergenic
AAGAATCTAAGACTCCATTT+GGG 0.497993 5:+15410652 None:intergenic
TTCCATGCCAGTTGCAGAAG+TGG 0.503028 5:+15410616 None:intergenic
TGAAGAGAACCAATTTCAGC+TGG 0.503190 5:+15410306 None:intergenic
TCTTGTAGCTTCCCTAGACT+TGG 0.504278 5:+15409872 None:intergenic
AACAACCCCAAAACTTATCA+AGG 0.506862 5:+15410209 None:intergenic
GAAGCATTAACAATGGAGGT+TGG 0.507216 5:+15409943 None:intergenic
TTTAGGCGGCATATTTCTTG+TGG 0.508401 5:+15410162 None:intergenic
TTGGACAAGTTCCAAGTCTA+GGG 0.510608 5:-15409883 None:intergenic
CAAAACTTATCAAGGAAGAA+AGG 0.516344 5:+15410217 None:intergenic
GTTGTTTACAATAAGTTAGA+GGG 0.518784 5:-15410192 MsG0580025219.01.T01:CDS
GAAGAAAGGTTACCTATGAA+TGG 0.519230 5:+15410231 None:intergenic
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ATCTATGAACATTTCATCTG+TGG 0.542910 5:+15413893 None:intergenic
AATCAGAAACACTTTCTCAC+TGG 0.562427 5:-15413653 MsG0580025219.01.T01:intron
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CAAAGTAGAAGCATTAACAA+TGG 0.582399 5:+15409936 None:intergenic
TCTATGAACATTTCATCTGT+GGG 0.584066 5:+15413894 None:intergenic
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ATTGCCAATGTAAGGTGACA+TGG 0.603723 5:+15410527 None:intergenic
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TTGTAACTCTTTGATGCATG+GGG 0.609910 5:+15410583 None:intergenic
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GATGACATATTGTAGAGACA+AGG 0.704837 5:+15410087 None:intergenic

CRISPR-GE

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!! AAACAGTATAATAAAATCTT+AGG + Chr5:15410887-15410906 None:intergenic 15.0%
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!! AATACCAATATGTATAATAA+TGG + Chr5:15412648-15412667 None:intergenic 15.0%
!! AATGAAATTATTTATGATTC+TGG - Chr5:15411049-15411068 MsG0580025219.01.T01:intron 15.0%
!! ATGAAATTATTTATGATTCT+GGG - Chr5:15411050-15411069 MsG0580025219.01.T01:intron 15.0%
!!! AAACTATTTTTTATTAGTCT+TGG + Chr5:15412673-15412692 None:intergenic 15.0%
!!! CACTTTTTATTATAGTATAT+CGG + Chr5:15411462-15411481 None:intergenic 15.0%
!!! GAGAATTTATTTTATGTTTT+TGG + Chr5:15410614-15410633 None:intergenic 15.0%
!!! TTATTATTCTCAAGTTTTTT+AGG + Chr5:15413655-15413674 None:intergenic 15.0%
!!! TTTCTAATGGATTTAAATAT+TGG + Chr5:15412845-15412864 None:intergenic 15.0%
!! AAAATACGATGCTTATAATT+AGG - Chr5:15412017-15412036 MsG0580025219.01.T01:intron 20.0%
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!! AAACTTATTATAGTGAACAT+TGG - Chr5:15413515-15413534 MsG0580025219.01.T01:intron 20.0%
!! AAATACGATGCTTATAATTA+GGG - Chr5:15412018-15412037 MsG0580025219.01.T01:intron 20.0%
!! AATTTCAACATGTATGATAA+TGG + Chr5:15412529-15412548 None:intergenic 20.0%
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!! ATAATCATGAGAAATTATCA+TGG - Chr5:15410768-15410787 MsG0580025219.01.T01:CDS 20.0%
!! ATTACTGCAGAAATATATTT+CGG + Chr5:15410358-15410377 None:intergenic 20.0%
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!!! AAACTAAAGGAGAAAATTTT+AGG + Chr5:15411693-15411712 None:intergenic 20.0%
!!! AACTAAAGGAGAAAATTTTA+GGG + Chr5:15411692-15411711 None:intergenic 20.0%
!!! AATCTCCAATATTTTGAAAT+AGG - Chr5:15413806-15413825 MsG0580025219.01.T01:CDS 20.0%
!!! CAATGAAGTTATTGTTTTTA+AGG + Chr5:15413319-15413338 None:intergenic 20.0%
!!! CTTTCTTTTTACCTATATTT+TGG - Chr5:15412964-15412983 MsG0580025219.01.T01:intron 20.0%
!!! TAAGAAACTTTTCACTTTTT+TGG - Chr5:15410220-15410239 MsG0580025219.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAAGAAACTTTTCACTTTTT+TGG + Chr5:15410239-15410220 None:intergenic 20.0%
!!! TAAGTTTAGAATCATCTTTA+GGG - Chr5:15410695-15410714 MsG0580025219.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAATAATGTTATGCAGATTT+TGG - Chr5:15409965-15409984 MsG0580025219.01.T01:CDS 20.0%
!!! TCTTAATTTTCCAAGAATAT+TGG - Chr5:15410999-15411018 MsG0580025219.01.T01:intron 20.0%
!!! TCTTGTAATATTTTGTGTTT+GGG + Chr5:15411992-15412011 None:intergenic 20.0%
!!! TTAAGTTTAGAATCATCTTT+AGG - Chr5:15410694-15410713 MsG0580025219.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTCTTGTAATATTTTGTGTT+TGG + Chr5:15411993-15412012 None:intergenic 20.0%
! AAAAATGCTTCATTTGGTTA+AGG + Chr5:15412944-15412963 None:intergenic 25.0%
! AAAAGATAAGAAAGAAGAGA+AGG - Chr5:15411366-15411385 MsG0580025219.01.T01:intron 25.0%
! AAATTAAATATTACTCCCTC+CGG + Chr5:15410323-15410342 None:intergenic 25.0%
! AGAAAGAAAAATGCTTCATT+TGG + Chr5:15412950-15412969 None:intergenic 25.0%
! AGGTATACATACCAAAATAT+AGG + Chr5:15412978-15412997 None:intergenic 25.0%
! ATTGGACAAAACAATTTAAC+AGG - Chr5:15413533-15413552 MsG0580025219.01.T01:intron 25.0%
! CAAAATCAGTTGGTTAATTA+TGG + Chr5:15411091-15411110 None:intergenic 25.0%
! CAACAAAATATGGAAGTAAT+TGG - Chr5:15410021-15410040 MsG0580025219.01.T01:CDS 25.0%
! CAACCTAAACAAAGATATTT+GGG + Chr5:15412340-15412359 None:intergenic 25.0%
! CATTCAATAAATGATGTATG+TGG - Chr5:15410245-15410264 MsG0580025219.01.T01:CDS 25.0%
! GATAATTTCTCATGATTATG+TGG + Chr5:15410767-15410786 None:intergenic 25.0%
! GGATCCATTATTATACATAT+TGG - Chr5:15412641-15412660 MsG0580025219.01.T01:intron 25.0%
! GTTGTTTACAATAAGTTAGA+GGG - Chr5:15413605-15413624 MsG0580025219.01.T01:intron 25.0%
! TTGTTGTGAAAGTAGATAAA+AGG - Chr5:15411142-15411161 MsG0580025219.01.T01:intron 25.0%
!! CTTGTAATATTTTGTGTTTG+GGG + Chr5:15411991-15412010 None:intergenic 25.0%
!! TTGTAATATTTTGTGTTTGG+GGG + Chr5:15411990-15412009 None:intergenic 25.0%
!! TTTCTTCCTTGATAAGTTTT+GGG - Chr5:15413582-15413601 MsG0580025219.01.T01:intron 25.0%
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!!! ATTACATGAATGATGGATAA+TGG + Chr5:15410496-15410515 None:intergenic 25.0%
!!! ATTCTTCACTTTTTTTGAGA+GGG + Chr5:15411738-15411757 None:intergenic 25.0%
!!! TCCAATATTTTGAAATAGGA+GGG - Chr5:15413810-15413829 MsG0580025219.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGGATATTGATTCTTTGAAT+TGG + Chr5:15413121-15413140 None:intergenic 25.0%
!!! TTATTCTCAAGTTTTTTAGG+CGG + Chr5:15413652-15413671 None:intergenic 25.0%
AAAATGCAACCTCAAACTAA+TGG - Chr5:15412383-15412402 MsG0580025219.01.T01:intron 30.0%
ACAGATGAAATGTTCATAGA+TGG - Chr5:15409906-15409925 MsG0580025219.01.T01:CDS 30.0%
AGAATAACCAAAACAGTCTT+GGG + Chr5:15412317-15412336 None:intergenic 30.0%
ATAGAAGCTACCAATATTCT+TGG + Chr5:15411012-15411031 None:intergenic 30.0%
ATCCAAAGAGAAAACACTAA+AGG - Chr5:15411574-15411593 MsG0580025219.01.T01:intron 30.0%
ATCCACTAACTTAATTTCCA+TGG + Chr5:15412491-15412510 None:intergenic 30.0%
ATCTATGAACATTTCATCTG+TGG + Chr5:15409907-15409926 None:intergenic 30.0%
CAAAACTTATCAAGGAAGAA+AGG + Chr5:15413583-15413602 None:intergenic 30.0%
CACATCGGTCATAATTATAA+GGG + Chr5:15412052-15412071 None:intergenic 30.0%
CATTCAAATGGTAAAACAAG+AGG + Chr5:15410466-15410485 None:intergenic 30.0%
CCAACCTAAACAAAGATATT+TGG + Chr5:15412341-15412360 None:intergenic 30.0%
CCAATACTGTTTACATAGTT+CGG - Chr5:15411400-15411419 MsG0580025219.01.T01:intron 30.0%
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GATTATGTGGTATATCAAAG+TGG + Chr5:15410754-15410773 None:intergenic 30.0%
GCTTGATATTACATGAATGA+TGG + Chr5:15410503-15410522 None:intergenic 30.0%
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! AAGAATCTAAGACTCCATTT+GGG + Chr5:15413148-15413167 None:intergenic 30.0%
! AAGTTTCTTACATTTGAGAC+CGG - Chr5:15410301-15410320 MsG0580025219.01.T01:CDS 30.0%
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! AGAGTTTGGAACATATTTGA+TGG + Chr5:15413782-15413801 None:intergenic 30.0%
! CCAAATATCTTTGTTTAGGT+TGG - Chr5:15412338-15412357 MsG0580025219.01.T01:intron 30.0%
! CTTTCTTCCTTGATAAGTTT+TGG - Chr5:15413581-15413600 MsG0580025219.01.T01:intron 30.0%
! GGATAAATTTGGCTCAAAAT+TGG + Chr5:15411969-15411988 None:intergenic 30.0%
! TCTCCCAAATATCTTTGTTT+AGG - Chr5:15412334-15412353 MsG0580025219.01.T01:intron 30.0%
! TGTTTTGCTTATACTTAGGT+AGG + Chr5:15412899-15412918 None:intergenic 30.0%
! TTCCTTTAGTGTTTTCTCTT+TGG + Chr5:15411579-15411598 None:intergenic 30.0%
! TTCTTCCTTGATAAGTTTTG+GGG - Chr5:15413583-15413602 MsG0580025219.01.T01:intron 30.0%
! TTTACCATACCATTAGTTTG+AGG + Chr5:15412395-15412414 None:intergenic 30.0%
!! AATGGATTGATGCATTCAAA+TGG + Chr5:15410478-15410497 None:intergenic 30.0%
!! ACCAAGTTAAGTTGAAAGAA+AGG + Chr5:15413019-15413038 None:intergenic 30.0%
!! CAAAGTAGAAGCATTAACAA+TGG + Chr5:15413864-15413883 None:intergenic 30.0%
!! GGAAATTAAGTTAGTGGATT+TGG - Chr5:15412492-15412511 MsG0580025219.01.T01:intron 30.0%
!! TCGTTGTTTTGCTTATACTT+AGG + Chr5:15412903-15412922 None:intergenic 30.0%
!!! CATTCTTCACTTTTTTTGAG+AGG + Chr5:15411739-15411758 None:intergenic 30.0%
!!! CTCCAATATTTTGAAATAGG+AGG - Chr5:15413809-15413828 MsG0580025219.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTCTTCACTTTTTTTGAGAG+GGG + Chr5:15411737-15411756 None:intergenic 30.0%
AACAACCCCAAAACTTATCA+AGG + Chr5:15413591-15413610 None:intergenic 35.0%
AACTAGTGTCTAACACAATG+TGG - Chr5:15412099-15412118 MsG0580025219.01.T01:intron 35.0%
AAGCATTAACAATGGAGGTT+GGG + Chr5:15413856-15413875 None:intergenic 35.0%
AATCAGAAACACTTTCTCAC+TGG - Chr5:15410144-15410163 MsG0580025219.01.T01:CDS 35.0%
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ACCTAAGCGCTATGTATAAA+CGG + Chr5:15411765-15411784 None:intergenic 35.0%
AGGATGAAAAAGCAATGCAA+AGG + Chr5:15410867-15410886 None:intergenic 35.0%
AGTCACTGGTGTAAAATTGT+TGG - Chr5:15410431-15410450 MsG0580025219.01.T01:CDS 35.0%
AGTGGAACATGTCATATAAG+TGG + Chr5:15410736-15410755 None:intergenic 35.0%
ATAGGAGGGAATCAAATCTT+AGG - Chr5:15413824-15413843 MsG0580025219.01.T01:CDS 35.0%
ATCCACTAACTCAATTTCCA+TGG + Chr5:15412611-15412630 None:intergenic 35.0%
ATTGCACAAACACAGAAAGT+GGG + Chr5:15412783-15412802 None:intergenic 35.0%
ATTGTACCTAGAGATGAAGA+AGG - Chr5:15409996-15410015 MsG0580025219.01.T01:CDS 35.0%
CAAATGGAGTCTTAGATTCT+TGG - Chr5:15413147-15413166 MsG0580025219.01.T01:intron 35.0%
CATCTCTAGGTACAATATGT+GGG + Chr5:15409992-15410011 None:intergenic 35.0%
CATTAGTGGAAACCATTTGT+TGG - Chr5:15413895-15413914 MsG0580025219.01.T01:CDS 35.0%
CCGAACTATGTAAACAGTAT+TGG + Chr5:15411403-15411422 None:intergenic 35.0%
CGATAGAATGCAAAATCAGT+TGG + Chr5:15411101-15411120 None:intergenic 35.0%
CTTAAAGTCTTGCACTTAGT+TGG - Chr5:15413446-15413465 MsG0580025219.01.T01:intron 35.0%
CTTCATTGGAAAAATTCCAC+AGG - Chr5:15413331-15413350 MsG0580025219.01.T01:intron 35.0%
CTTTGGATTCATTGTGAGTT+TGG + Chr5:15411562-15411581 None:intergenic 35.0%
CTTTGTAACTCTTTGATGCA+TGG + Chr5:15413219-15413238 None:intergenic 35.0%
GAAACATATGTAAGCACCTT+GGG + Chr5:15411634-15411653 None:intergenic 35.0%
GAACAACTTGTCAAGTTTGT+AGG + Chr5:15413422-15413441 None:intergenic 35.0%
GAAGAAAGGTTACCTATGAA+TGG + Chr5:15413569-15413588 None:intergenic 35.0%
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GAGAATAACCAAAACAGTCT+TGG + Chr5:15412318-15412337 None:intergenic 35.0%
GATGACATATTGTAGAGACA+AGG + Chr5:15413713-15413732 None:intergenic 35.0%
GCACATCGGTCATAATTATA+AGG + Chr5:15412053-15412072 None:intergenic 35.0%
GGACAAAACAATTTAACAGG+AGG - Chr5:15413536-15413555 MsG0580025219.01.T01:intron 35.0%
GGGACTAATGATCTAATGTA+TGG - Chr5:15410840-15410859 MsG0580025219.01.T01:intron 35.0%
GTCCATGGAAATTAAGTTAG+TGG - Chr5:15412486-15412505 MsG0580025219.01.T01:intron 35.0%
GTTTGCCACTAGAAATATCA+TGG + Chr5:15411877-15411896 None:intergenic 35.0%
TAATTATGACCGATGTGCTA+CGG - Chr5:15412055-15412074 MsG0580025219.01.T01:intron 35.0%
TAGACACACACACAAATGAT+AGG + Chr5:15410910-15410929 None:intergenic 35.0%
TCATCTCTAGGTACAATATG+TGG + Chr5:15409993-15410012 None:intergenic 35.0%
TCATGAGAAATTATCATGGC+TGG - Chr5:15410772-15410791 MsG0580025219.01.T01:CDS 35.0%
TCCACACATCTATGTTTCAT+TGG + Chr5:15411251-15411270 None:intergenic 35.0%
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TGCAGAAATATATTTCGGCT+TGG + Chr5:15410353-15410372 None:intergenic 35.0%
TTACAAGGAAACAAGTTGCA+TGG - Chr5:15413245-15413264 MsG0580025219.01.T01:intron 35.0%
TTAGTTGGAAACAAGCTAAC+TGG - Chr5:15413461-15413480 MsG0580025219.01.T01:intron 35.0%
TTGAGTTTCAACCCTTTGTT+TGG + Chr5:15410809-15410828 None:intergenic 35.0%
TTGTAACTCTTTGATGCATG+GGG + Chr5:15413217-15413236 None:intergenic 35.0%
TTGTGTTTGGGGGATAAATT+TGG + Chr5:15411980-15411999 None:intergenic 35.0%
TTTCCATGGACTTTACATCT+TGG + Chr5:15412597-15412616 None:intergenic 35.0%
! ACACCAGATAATCGATTTAG+TGG - Chr5:15413749-15413768 MsG0580025219.01.T01:intron 35.0%
! CAAGAATCTAAGACTCCATT+TGG + Chr5:15413149-15413168 None:intergenic 35.0%
! TGAGGTTGCATTTTACTCTT+GGG + Chr5:15412377-15412396 None:intergenic 35.0%
! TTGAGGTTGCATTTTACTCT+TGG + Chr5:15412378-15412397 None:intergenic 35.0%
!! AGTAGAAGCATTAACAATGG+AGG + Chr5:15413861-15413880 None:intergenic 35.0%
!! AGTTAGTGGATTTGGAATTG+TGG - Chr5:15412620-15412639 MsG0580025219.01.T01:intron 35.0%
!! CTCGACAATAACTTGTTTGA+AGG - Chr5:15413389-15413408 MsG0580025219.01.T01:intron 35.0%
!! GAGATAGTGCTGATAAAAAG+TGG + Chr5:15412816-15412835 None:intergenic 35.0%
!! GGAAATTGAGTTAGTGGATT+TGG - Chr5:15412612-15412631 MsG0580025219.01.T01:intron 35.0%
!! TGTCTTGTTTGGTGTCTATA+TGG - Chr5:15412184-15412203 MsG0580025219.01.T01:intron 35.0%
!! TGTTGCTTTGAATATGCTTG+TGG + Chr5:15411314-15411333 None:intergenic 35.0%
!!! ACGATTTTGGTTCATTTCCT+GGG + Chr5:15411901-15411920 None:intergenic 35.0%
!!! ATTTTAGGGTTCAGTGTCTT+TGG + Chr5:15411678-15411697 None:intergenic 35.0%
!!! CTACAGCTACAGTTTTGTTT+GGG + Chr5:15413046-15413065 None:intergenic 35.0%
!!! CTTTGGTGAGTTTTTTTCCT+GGG + Chr5:15411661-15411680 None:intergenic 35.0%
!!! TCTTTGGTGAGTTTTTTTCC+TGG + Chr5:15411662-15411681 None:intergenic 35.0%
AAAAGTGATCCGTAGCACAT+CGG + Chr5:15412067-15412086 None:intergenic 40.0%
ACAGAAAGTGGGAGAAATTG+TGG + Chr5:15412772-15412791 None:intergenic 40.0%
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AGGGAAACTTGGGAAACTAA+AGG + Chr5:15411706-15411725 None:intergenic 40.0%
AGTAGATAAAAGGTCGTGAC+TGG - Chr5:15411152-15411171 MsG0580025219.01.T01:intron 40.0%
AGTGAGATCTCATTAGAGGA+AGG + Chr5:15411610-15411629 None:intergenic 40.0%
ATTGCCAATGTAAGGTGACA+TGG + Chr5:15413273-15413292 None:intergenic 40.0%
ATTGGAGATTAGGGAGAGTT+TGG + Chr5:15413796-15413815 None:intergenic 40.0%
CAAACAAGGTCCATACGTAT+TGG - Chr5:15412565-15412584 MsG0580025219.01.T01:intron 40.0%
CAGTGTAGCTAGCATTATCA+TGG + Chr5:15412464-15412483 None:intergenic 40.0%
CTTGGAACTTGTCCAACAAA+TGG + Chr5:15413910-15413929 None:intergenic 40.0%
GACATATTGTAGAGACAAGG+TGG + Chr5:15413710-15413729 None:intergenic 40.0%
GAGAAATTGTGGTCATGCTA+TGG + Chr5:15412761-15412780 None:intergenic 40.0%
GAGCCACTAAATCGATTATC+TGG + Chr5:15413755-15413774 None:intergenic 40.0%
GATTGCACAAACACAGAAAG+TGG + Chr5:15412784-15412803 None:intergenic 40.0%
GCAACCTCAAACTAATGGTA+TGG - Chr5:15412388-15412407 MsG0580025219.01.T01:intron 40.0%
GCAATGCTAGATGATCAGTT+TGG + Chr5:15413097-15413116 None:intergenic 40.0%
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GGAAACATATGTAAGCACCT+TGG + Chr5:15411635-15411654 None:intergenic 40.0%
GGCAAAATACCAGCTGAAAT+TGG - Chr5:15413482-15413501 MsG0580025219.01.T01:intron 40.0%
GGTTCAAAGTGACCTAGTAT+GGG - Chr5:15411421-15411440 MsG0580025219.01.T01:CDS 40.0%
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GTCCATGGAAATTGAGTTAG+TGG - Chr5:15412606-15412625 MsG0580025219.01.T01:intron 40.0%
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GTTCAAAGTGACCTAGTATG+GGG - Chr5:15411422-15411441 MsG0580025219.01.T01:CDS 40.0%
TAACACCGACATGAAGACAT+TGG + Chr5:15412163-15412182 None:intergenic 40.0%
TAATGAGATCTCACTACCCA+AGG - Chr5:15411615-15411634 MsG0580025219.01.T01:intron 40.0%
TAGATAAAAGGTCGTGACTG+GGG - Chr5:15411154-15411173 MsG0580025219.01.T01:intron 40.0%
TCAATATCCAGTGACCCAAA+TGG - Chr5:15413131-15413150 MsG0580025219.01.T01:intron 40.0%
TCATTTGGTTAAGGAACGAG+AGG + Chr5:15412935-15412954 None:intergenic 40.0%
TCCACACAATCCTCCAAAAA+TGG + Chr5:15410647-15410666 None:intergenic 40.0%
TGAAGAGAACCAATTTCAGC+TGG + Chr5:15413494-15413513 None:intergenic 40.0%
TTACATATGTTTCCCAACCC+AGG - Chr5:15411641-15411660 MsG0580025219.01.T01:intron 40.0%
TTCAAAGTGACCTAGTATGG+GGG - Chr5:15411423-15411442 MsG0580025219.01.T01:CDS 40.0%
TTCAACTAGACTCAAGTCAC+TGG - Chr5:15410417-15410436 MsG0580025219.01.T01:CDS 40.0%
TTGGTCCATACCAATACGTA+TGG + Chr5:15412578-15412597 None:intergenic 40.0%
TTTAGGCGGCATATTTCTTG+TGG + Chr5:15413638-15413657 None:intergenic 40.0%
! AAGGTCCATACGTATTGGTA+TGG - Chr5:15412570-15412589 MsG0580025219.01.T01:intron 40.0%
! AGTTTGGTTTCCTAATGCCA+AGG + Chr5:15413081-15413100 None:intergenic 40.0%
! CTCAAGCTAGGATCCATTTT+TGG - Chr5:15410631-15410650 MsG0580025219.01.T01:CDS 40.0%
! GAAGCATTAACAATGGAGGT+TGG + Chr5:15413857-15413876 None:intergenic 40.0%
! GAGGTTGCATTTTACTCTTG+GGG + Chr5:15412376-15412395 None:intergenic 40.0%
! TTCTTACATTTGAGACCGGA+GGG - Chr5:15410305-15410324 MsG0580025219.01.T01:CDS 40.0%
! TTCTTACATTTGAGACCGGA+GGG + Chr5:15410324-15410305 None:intergenic 40.0%
! TTTCTTACATTTGAGACCGG+AGG - Chr5:15410304-15410323 MsG0580025219.01.T01:CDS 40.0%
! TTTCTTACATTTGAGACCGG+AGG + Chr5:15410323-15410304 None:intergenic 40.0%
!! AAGCTAGGATCCATTTTTGG+AGG - Chr5:15410634-15410653 MsG0580025219.01.T01:CDS 40.0%
!! ACGTGCCATGATATTTCTAG+TGG - Chr5:15411869-15411888 MsG0580025219.01.T01:intron 40.0%
!! ATGTACGAACTTGCTAATCG+TGG + Chr5:15411802-15411821 None:intergenic 40.0%
!! GTCGGTGTTAATGTCTTGTT+TGG - Chr5:15412173-15412192 MsG0580025219.01.T01:intron 40.0%
!! GTTACAACTTGGTGCAAACA+AGG - Chr5:15412551-15412570 MsG0580025219.01.T01:intron 40.0%
!! TCCATTTTTGGAGGATTGTG+TGG - Chr5:15410643-15410662 MsG0580025219.01.T01:CDS 40.0%
!! TCTACTAGTTGAGTTGACAG+AGG - Chr5:15412280-15412299 MsG0580025219.01.T01:intron 40.0%
!!! CACGATTTTGGTTCATTTCC+TGG + Chr5:15411902-15411921 None:intergenic 40.0%
!!! GCTACAGCTACAGTTTTGTT+TGG + Chr5:15413047-15413066 None:intergenic 40.0%
!!! GTGAGTTTTTTTCCTGGGTT+GGG + Chr5:15411656-15411675 None:intergenic 40.0%
AAATTCCACAGGAACTCGGT+CGG - Chr5:15413342-15413361 MsG0580025219.01.T01:intron 45.0%
CGAGAGAGATTGCCAATGTA+AGG + Chr5:15413281-15413300 None:intergenic 45.0%
CGGTTCAAAGTGACCTAGTA+TGG - Chr5:15411420-15411439 MsG0580025219.01.T01:CDS 45.0%
CTTCTATCCACTTCTGCAAC+TGG - Chr5:15413174-15413193 MsG0580025219.01.T01:intron 45.0%
GACCACAATAGGCCAAACAA+AGG - Chr5:15410794-15410813 MsG0580025219.01.T01:intron 45.0%
GGACCAAGATGTAAAGTCCA+TGG - Chr5:15412591-15412610 MsG0580025219.01.T01:intron 45.0%
GGACTAGAAGAAGGAGATGA+AGG + Chr5:15412998-15413017 None:intergenic 45.0%
GGATCCATGTCACCTTACAT+TGG - Chr5:15413266-15413285 MsG0580025219.01.T01:intron 45.0%
GGCACGTGTGCATAAAATTG+TGG + Chr5:15411856-15411875 None:intergenic 45.0%
GGGTAGTGAGATCTCATTAG+AGG + Chr5:15411614-15411633 None:intergenic 45.0%
GTTGCTCCTTCTTCATCTCT+AGG + Chr5:15410005-15410024 None:intergenic 45.0%
TAAGACTCCATTTGGGTCAC+TGG + Chr5:15413141-15413160 None:intergenic 45.0%
TACTCTTGGGGTCAAATTGC+TGG + Chr5:15412364-15412383 None:intergenic 45.0%
TATCATGGCTGGACCACAAT+AGG - Chr5:15410783-15410802 MsG0580025219.01.T01:CDS 45.0%
! ACCCTTTGTTTGGCCTATTG+TGG + Chr5:15410799-15410818 None:intergenic 45.0%
! AGCATATCGTGGCACGATTT+TGG + Chr5:15411914-15411933 None:intergenic 45.0%
! TGCTTACAAAGTACTCCCTC+CGG - Chr5:15410188-15410207 MsG0580025219.01.T01:CDS 45.0%
!! ATTTCTAGTGGCAAACTCCC+AGG - Chr5:15411881-15411900 MsG0580025219.01.T01:intron 45.0%
!!! GGTGAGTTTTTTTCCTGGGT+TGG + Chr5:15411657-15411676 None:intergenic 45.0%
ATCCACTTCTGCAACTGGCA+TGG - Chr5:15413179-15413198 MsG0580025219.01.T01:intron 50.0%
GCTAGCTACACTGAAGTCCA+TGG - Chr5:15412471-15412490 MsG0580025219.01.T01:intron 50.0%
GGAGGAATCTCGCCATTCAT+AGG - Chr5:15413554-15413573 MsG0580025219.01.T01:intron 50.0%
GGTTCGAGAGAGGGAAACTT+GGG + Chr5:15411716-15411735 None:intergenic 50.0%
TACATAGCGCTTAGGTCTCG+AGG - Chr5:15411769-15411788 MsG0580025219.01.T01:intron 50.0%
TGTAGCTGTAGCAGTAGCAG+AGG - Chr5:15413055-15413074 MsG0580025219.01.T01:intron 50.0%
TTCCATGCCAGTTGCAGAAG+TGG + Chr5:15413184-15413203 None:intergenic 50.0%
TTTGAGAGGGGTTCGAGAGA+GGG + Chr5:15411725-15411744 None:intergenic 50.0%
!! TTTTGAGAGGGGTTCGAGAG+AGG + Chr5:15411726-15411745 None:intergenic 50.0%
AACAACCGACCGAGTTCCTG+TGG + Chr5:15413350-15413369 None:intergenic 55.0%
AGGTCGTGACTGGGGAATCT+TGG - Chr5:15411162-15411181 MsG0580025219.01.T01:intron 55.0%
GGGTTCGAGAGAGGGAAACT+TGG + Chr5:15411717-15411736 None:intergenic 55.0%
GTAGCAGAGGCCTTGGCATT+AGG - Chr5:15413068-15413087 MsG0580025219.01.T01:intron 55.0%
TGTAGCAGTAGCAGAGGCCT+TGG - Chr5:15413061-15413080 MsG0580025219.01.T01:intron 55.0%
GCTGCTCTCTCCCCCATACT+AGG + Chr5:15411436-15411455 None:intergenic 60.0%
! CGTGGCACGAGAGCATATCG+TGG + Chr5:15411925-15411944 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 15409885 15413934 15409885 ID=MsG0580025219.01;Name=MsG0580025219.01
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Gene Sequence

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Protein sequence

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