AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580025218.01

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MsG0580025218.01.T01 AT4G28650 36.863 255 159 2 2 256 121 373 2.53e-37 149
MsG0580025218.01.T01 AT4G28650 32.973 185 120 2 72 256 73 253 3.08e-16 83.2
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MsG0580025218.01.T01 AT5G62230 31.193 218 96 5 117 282 66 281 1.80e-16 84.0
MsG0580025218.01.T01 AT1G35710 32.428 589 360 14 2 574 491 1057 4.73e-87 293
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MsG0580025218.01.T01 AT1G35710 40.249 241 139 2 16 256 100 335 1.71e-36 146
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MsG0580025218.01.T01 AT1G35710 40.465 215 125 3 66 279 98 310 1.02e-26 116
MsG0580025218.01.T01 AT5G48940 34.224 599 356 14 2 580 424 1004 1.62e-86 291
MsG0580025218.01.T01 AT5G48940 33.016 315 162 4 7 273 285 598 1.08e-41 162
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MsG0580025218.01.T01 AT5G61480 32.014 278 165 3 2 256 134 410 1.52e-30 128
MsG0580025218.01.T01 AT5G61480 34.225 187 112 2 75 256 86 266 4.19e-19 92.4
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MsG0580025218.01.T01 AT1G75820 33.096 281 161 4 2 257 173 451 3.95e-31 129
MsG0580025218.01.T01 AT1G75820 34.274 248 160 3 11 256 84 330 3.28e-27 117
MsG0580025218.01.T01 AT1G75820 34.239 184 119 2 75 256 75 258 2.65e-19 92.8
MsG0580025218.01.T01 AT1G09970 30.880 625 363 14 2 583 295 893 5.44e-77 263
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MsG0580025218.01.T01 AT1G09970 31.801 261 148 4 23 256 98 355 2.92e-24 108
MsG0580025218.01.T01 AT1G09970 37.778 135 83 1 1 135 414 547 3.22e-20 95.9
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MsG0580025218.01.T01 AT5G25930 31.051 628 358 15 1 571 286 895 5.45e-77 263
MsG0580025218.01.T01 AT5G25930 33.571 280 161 4 2 256 116 395 1.68e-30 127
MsG0580025218.01.T01 AT5G25930 34.387 253 154 7 34 279 75 322 5.73e-24 107
MsG0580025218.01.T01 AT5G25930 32.627 236 153 5 48 279 65 298 6.89e-24 107
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MsG0580025218.01.T01 AT3G51740 37.500 184 114 1 1 184 218 400 8.95e-24 106
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MsG0580025218.01.T01 AT3G28040 39.316 234 137 4 26 256 81 312 3.85e-33 136
MsG0580025218.01.T01 AT3G28040 35.019 257 163 3 2 256 153 407 9.81e-31 128
MsG0580025218.01.T01 AT3G28040 36.628 172 94 4 94 257 77 241 1.06e-16 84.7
MsG0580025218.01.T01 AT1G31420 34.498 458 258 9 148 583 79 516 2.39e-65 224
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MsG0580025218.01.T01 AT1G31420 33.058 121 79 2 51 171 79 197 1.57e-11 67.8
MsG0580025218.01.T01 AT1G31420 34.498 458 259 9 148 583 79 517 3.50e-65 224
MsG0580025218.01.T01 AT1G31420 37.615 109 68 0 27 135 79 187 2.26e-13 73.6
MsG0580025218.01.T01 AT1G31420 33.058 121 79 2 51 171 79 197 1.57e-11 67.8
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MsG0580025218.01.T01 AT2G13800 39.130 115 68 2 71 185 71 183 7.58e-11 65.5
MsG0580025218.01.T01 AT1G66830 29.928 558 326 15 75 578 71 617 5.38e-54 195
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MsG0580025218.01.T01 AT4G39270 28.864 634 357 19 11 570 95 708 1.49e-53 196
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MsG0580025218.01.T01 AT5G01560 37.676 284 153 6 298 574 302 568 1.34e-52 191
MsG0580025218.01.T01 AT1G60800 31.532 444 270 7 148 574 12 438 2.08e-52 189
MsG0580025218.01.T01 AT1G60800 35.537 121 78 0 24 144 9 129 1.75e-11 67.4
MsG0580025218.01.T01 AT5G48380 31.635 471 259 13 123 573 81 508 2.44e-51 187
MsG0580025218.01.T01 AT2G01210 28.475 590 315 17 75 575 69 640 1.69e-50 186
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MsG0580025218.01.T01 AT5G01550 36.364 297 164 7 286 574 306 585 2.29e-50 185
MsG0580025218.01.T01 AT2G16250 26.954 627 378 19 11 570 117 730 7.09e-50 186
MsG0580025218.01.T01 AT2G16250 38.462 104 63 1 154 256 114 217 1.86e-11 67.8
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MsG0580025218.01.T01 AT4G39270 28.893 578 320 17 11 514 95 655 3.96e-49 181
MsG0580025218.01.T01 AT4G39270 28.893 578 320 17 11 514 95 655 4.80e-49 181
MsG0580025218.01.T01 AT2G19210 31.865 386 222 11 196 570 418 773 7.83e-49 182
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MsG0580025218.01.T01 AT5G63710 27.664 441 263 9 147 574 61 458 1.56e-48 178
MsG0580025218.01.T01 AT5G10530 36.053 380 200 14 215 576 184 538 1.79e-48 179
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MsG0580025218.01.T01 AT5G51350 35.294 187 111 4 119 301 102 282 2.05e-17 86.7
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MsG0580025218.01.T01 AT5G42440 38.621 290 144 11 302 572 8 282 7.71e-47 168
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MsG0580025218.01.T01 AT1G56130 35.587 281 160 7 302 579 638 900 2.38e-46 176
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MsG0580025218.01.T01 AT1G56140 32.231 242 136 4 1 218 174 411 2.13e-23 105
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MsG0580025218.01.T01 AT3G46400 31.538 390 232 10 196 575 416 780 3.92e-45 172
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MsG0580025218.01.T01 AT1G51880 31.633 392 233 11 196 578 433 798 7.01e-45 171
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MsG0580025218.01.T01 AT1G56120 33.468 248 140 2 33 256 110 356 7.99e-28 119
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MsG0580025218.01.T01 AT1G56120 32.381 210 96 4 1 165 175 383 3.77e-17 85.9
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MsG0580025218.01.T01 AT5G18500 40.969 227 120 4 348 574 157 369 2.36e-44 165
MsG0580025218.01.T01 AT5G18500 40.969 227 120 4 348 574 157 369 2.36e-44 165
MsG0580025218.01.T01 AT5G18500 40.969 227 120 4 348 574 157 369 2.36e-44 165
MsG0580025218.01.T01 AT5G18500 40.969 227 120 4 348 574 157 369 2.36e-44 165
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MsG0580025218.01.T01 AT5G06740 34.708 291 169 8 299 582 278 554 3.64e-44 167
MsG0580025218.01.T01 AT4G20450 33.333 381 225 11 203 578 442 798 3.97e-44 169
MsG0580025218.01.T01 AT5G03140 37.455 275 149 8 303 572 316 572 4.37e-44 167
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MsG0580025218.01.T01 AT1G09440 40.969 227 120 5 348 574 148 360 4.50e-44 164
MsG0580025218.01.T01 AT4G29050 36.071 280 158 7 301 576 300 562 4.54e-44 167
MsG0580025218.01.T01 AT3G55550 36.765 272 153 6 307 574 293 549 6.29e-44 167
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MsG0580025218.01.T01 AT1G56720 40.529 227 121 5 348 574 170 382 6.72e-44 164
MsG0580025218.01.T01 AT1G56720 40.529 227 121 5 348 574 170 382 6.72e-44 164
MsG0580025218.01.T01 AT1G56720 40.529 227 121 5 348 574 170 382 6.72e-44 164
MsG0580025218.01.T01 AT1G01540 38.889 234 129 5 348 581 145 364 7.47e-44 161
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MsG0580025218.01.T01 AT4G28350 36.429 280 156 6 302 575 291 554 8.41e-44 166
MsG0580025218.01.T01 AT4G02630 40.088 227 123 4 348 574 153 366 8.71e-44 163
MsG0580025218.01.T01 AT1G70130 34.182 275 164 5 303 576 280 538 2.46e-43 165
MsG0580025218.01.T01 AT4G01330 40.171 234 126 5 348 581 153 372 2.50e-43 162
MsG0580025218.01.T01 AT4G01330 40.171 234 126 5 348 581 153 372 2.88e-43 162
MsG0580025218.01.T01 AT4G39270 28.444 559 309 17 11 495 95 636 3.29e-43 164
MsG0580025218.01.T01 AT4G39270 28.444 559 309 17 11 495 95 636 3.29e-43 164
MsG0580025218.01.T01 AT4G39270 28.444 559 309 17 11 495 95 636 3.29e-43 164
MsG0580025218.01.T01 AT4G39270 28.444 559 309 17 11 495 95 636 3.29e-43 164
MsG0580025218.01.T01 AT4G39270 28.444 559 309 17 11 495 95 636 3.29e-43 164
MsG0580025218.01.T01 AT1G51820 32.090 402 231 12 196 578 145 523 3.33e-43 164
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MsG0580025218.01.T01 AT5G48740 33.755 474 264 20 110 572 374 808 5.04e-43 166
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MsG0580025218.01.T01 AT1G49730 34.426 305 163 9 293 575 243 532 1.28e-42 162
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MsG0580025218.01.T01 AT5G37450 33.654 208 133 5 2 208 82 285 4.64e-18 89.0
MsG0580025218.01.T01 AT5G37450 27.010 622 367 20 2 572 274 859 2.73e-42 164
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MsG0580025218.01.T01 AT5G01890 31.792 346 177 6 2 290 242 585 6.89e-42 162
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MsG0580025218.01.T01 AT5G59270 35.461 282 154 7 299 574 295 554 1.23e-41 160
MsG0580025218.01.T01 AT5G59270 35.461 282 154 7 299 574 311 570 1.28e-41 160
MsG0580025218.01.T01 AT3G09010 36.546 249 144 6 331 579 20 254 1.59e-41 155
MsG0580025218.01.T01 AT3G08870 33.718 347 202 10 235 574 268 593 1.65e-41 160
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MsG0580025218.01.T01 AT3G45430 37.631 287 155 11 293 574 277 544 1.94e-41 159
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MsG0580025218.01.T01 AT1G56145 32.746 284 170 7 303 581 525 792 3.11e-41 160
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MsG0580025218.01.T01 AT4G04960 33.448 290 178 6 288 575 277 553 3.93e-41 159
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MsG0580025218.01.T01 AT2G28990 31.280 422 212 13 172 570 410 776 7.43e-41 159
MsG0580025218.01.T01 AT5G37450 33.922 283 163 5 303 572 564 835 7.59e-41 159
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MsG0580025218.01.T01 AT5G16900 32.713 376 230 8 196 570 419 772 1.10e-40 158
MsG0580025218.01.T01 AT2G43700 36.170 282 157 7 302 576 250 515 1.19e-40 157
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MsG0580025218.01.T01 AT2G43700 36.170 282 157 7 302 576 250 515 1.19e-40 157
MsG0580025218.01.T01 AT2G43700 36.170 282 157 7 302 576 250 515 1.19e-40 157
MsG0580025218.01.T01 AT2G43700 36.170 282 157 7 302 576 274 539 1.77e-40 156
MsG0580025218.01.T01 AT1G51790 30.729 384 232 13 196 570 416 774 2.00e-40 158
MsG0580025218.01.T01 AT1G51790 30.729 384 232 13 196 570 416 774 2.00e-40 158
MsG0580025218.01.T01 AT1G51870 31.218 394 224 10 196 570 416 781 2.11e-40 157
MsG0580025218.01.T01 AT1G26150 38.696 230 125 5 345 574 418 631 2.27e-40 156
MsG0580025218.01.T01 AT4G23220 36.162 271 155 6 302 570 281 535 2.36e-40 156
MsG0580025218.01.T01 AT2G42960 40.088 227 122 6 348 574 174 386 2.48e-40 154
MsG0580025218.01.T01 AT2G42960 40.088 227 122 6 348 574 174 386 2.48e-40 154
MsG0580025218.01.T01 AT2G42960 40.088 227 122 6 348 574 174 386 2.48e-40 154
MsG0580025218.01.T01 AT2G42960 40.088 227 122 6 348 574 174 386 2.48e-40 154
MsG0580025218.01.T01 AT5G59260 35.315 286 161 8 294 574 291 557 2.61e-40 156
MsG0580025218.01.T01 AT1G26150 38.696 230 125 5 345 574 418 631 2.76e-40 157
MsG0580025218.01.T01 AT3G28450 30.180 444 266 9 148 569 83 504 2.79e-40 155
MsG0580025218.01.T01 AT5G38560 36.327 245 139 6 332 574 313 542 2.89e-40 156
MsG0580025218.01.T01 AT3G58690 32.776 299 174 7 302 583 15 303 3.06e-40 151
MsG0580025218.01.T01 AT1G51890 30.653 398 213 13 196 570 347 704 3.07e-40 157
MsG0580025218.01.T01 AT3G19300 40.000 240 125 7 344 583 315 535 3.30e-40 155
MsG0580025218.01.T01 AT4G00970 33.213 277 166 6 302 571 282 546 4.44e-40 154
MsG0580025218.01.T01 AT1G51890 30.653 398 213 13 196 570 411 768 4.62e-40 157
MsG0580025218.01.T01 AT1G61420 33.007 306 168 9 299 586 271 557 6.36e-40 155
MsG0580025218.01.T01 AT4G02010 35.032 314 171 10 294 586 298 599 7.00e-40 155
MsG0580025218.01.T01 AT1G16110 33.442 308 172 6 287 576 346 638 7.10e-40 154
MsG0580025218.01.T01 AT1G61420 33.115 305 167 9 299 585 421 706 8.92e-40 155
MsG0580025218.01.T01 AT5G60320 41.453 234 118 8 344 576 335 550 1.01e-39 154
MsG0580025218.01.T01 AT3G53590 35.690 297 169 7 302 588 558 842 1.14e-39 155
MsG0580025218.01.T01 AT3G53590 34.173 278 173 6 7 279 69 341 7.94e-32 132
MsG0580025218.01.T01 AT3G53590 30.909 330 217 8 8 336 97 416 7.22e-29 122
MsG0580025218.01.T01 AT3G53590 34.914 232 148 3 1 232 114 342 1.29e-28 122
MsG0580025218.01.T01 AT3G53590 34.199 231 143 6 5 230 142 368 2.23e-24 108
MsG0580025218.01.T01 AT3G53590 32.692 208 87 8 2 158 163 368 8.17e-14 75.5
MsG0580025218.01.T01 AT4G00970 33.213 277 166 6 302 571 282 546 1.21e-39 154
MsG0580025218.01.T01 AT3G24660 28.060 531 306 18 82 589 111 588 1.30e-39 154
MsG0580025218.01.T01 AT3G24660 33.548 155 97 4 34 184 111 263 4.25e-13 72.8
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MsG0580025218.01.T01 AT3G02810 38.710 248 135 7 345 588 52 286 1.77e-39 152
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MsG0580025218.01.T01 AT1G70530 34.173 278 158 6 302 571 262 522 2.33e-39 153
MsG0580025218.01.T01 AT4G11530 35.317 252 145 5 324 571 315 552 2.46e-39 153
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MsG0580025218.01.T01 AT5G03320 36.694 248 142 6 340 582 64 301 3.18e-39 149
MsG0580025218.01.T01 AT3G46370 30.534 393 244 8 196 581 327 697 3.20e-39 154
MsG0580025218.01.T01 AT3G46370 30.534 393 244 8 196 581 327 697 3.20e-39 154
MsG0580025218.01.T01 AT1G56145 31.373 306 172 8 303 581 628 922 3.70e-39 154
MsG0580025218.01.T01 AT1G56145 33.725 255 165 3 2 256 123 373 6.73e-27 116
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MsG0580025218.01.T01 AT1G56145 33.014 209 94 4 2 165 171 378 4.75e-18 89.0
MsG0580025218.01.T01 AT3G46330 32.113 355 206 11 230 579 427 751 3.72e-39 154
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MsG0580025218.01.T01 AT1G06840 34.686 271 169 7 12 279 73 338 1.35e-25 112
MsG0580025218.01.T01 AT1G06840 30.915 317 178 9 2 281 88 400 1.41e-21 100
MsG0580025218.01.T01 AT1G51890 29.976 417 213 14 196 570 411 790 4.19e-39 154
MsG0580025218.01.T01 AT3G20530 36.145 249 137 6 345 587 70 302 4.30e-39 148
MsG0580025218.01.T01 AT1G16160 37.647 255 143 7 332 585 407 646 4.94e-39 153
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MsG0580025218.01.T01 AT3G09830 36.508 252 145 7 336 582 63 304 5.23e-39 148
MsG0580025218.01.T01 AT3G09830 36.508 252 145 7 336 582 63 304 5.23e-39 148
MsG0580025218.01.T01 AT3G20530 35.887 248 137 6 345 586 70 301 5.77e-39 145
MsG0580025218.01.T01 AT3G07070 36.330 267 155 6 325 588 45 299 5.91e-39 148
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MsG0580025218.01.T01 AT4G20450 32.283 381 214 12 203 578 442 783 6.63e-39 153
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MsG0580025218.01.T01 AT1G67520 37.500 248 136 5 324 571 260 488 8.74e-39 151
MsG0580025218.01.T01 AT5G60300 35.125 279 155 9 305 578 291 548 8.87e-39 152
MsG0580025218.01.T01 AT5G60300 35.125 279 155 9 305 578 291 548 8.87e-39 152
MsG0580025218.01.T01 AT1G61360 34.314 306 167 11 301 587 344 634 9.15e-39 152
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MsG0580025218.01.T01 AT1G61360 34.314 306 167 11 301 587 344 634 9.15e-39 152
MsG0580025218.01.T01 AT4G00340 37.828 267 145 8 307 571 412 659 9.33e-39 152
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MsG0580025218.01.T01 AT2G43690 33.910 289 165 9 306 585 242 513 1.00e-38 151
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MsG0580025218.01.T01 AT2G43690 33.910 289 165 9 306 585 278 549 1.10e-38 151
MsG0580025218.01.T01 AT1G52290 35.931 231 132 6 345 575 131 345 1.15e-38 147
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MsG0580025218.01.T01 AT1G61420 32.131 305 172 8 299 585 421 708 1.35e-38 152
MsG0580025218.01.T01 AT3G17410 36.626 243 141 6 342 582 54 285 1.37e-38 146
MsG0580025218.01.T01 AT3G17410 36.626 243 141 6 342 582 54 285 1.37e-38 146
MsG0580025218.01.T01 AT1G16120 35.161 310 169 9 293 585 349 643 1.55e-38 151
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MsG0580025218.01.T01 AT1G67520 37.500 248 136 5 324 571 475 703 2.37e-38 151
MsG0580025218.01.T01 AT1G11340 32.542 295 158 8 301 571 438 715 2.49e-38 151
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MsG0580025218.01.T01 AT3G24790 36.842 247 137 6 345 587 35 266 7.11e-38 144
MsG0580025218.01.T01 AT2G47060 36.179 246 143 7 345 587 61 295 7.12e-38 144
MsG0580025218.01.T01 AT2G47060 36.179 246 143 7 345 587 61 295 7.12e-38 144
MsG0580025218.01.T01 AT1G11330 31.329 316 179 6 296 587 440 741 7.32e-38 150
MsG0580025218.01.T01 AT1G11330 30.818 318 182 6 296 589 440 743 7.56e-38 149
MsG0580025218.01.T01 AT1G05700 30.469 384 228 10 196 570 414 767 7.83e-38 150
MsG0580025218.01.T01 AT5G60280 41.202 233 115 9 344 574 326 538 8.33e-38 149
MsG0580025218.01.T01 AT1G61860 37.551 245 140 4 345 588 73 305 8.93e-38 144
MsG0580025218.01.T01 AT1G69730 32.845 341 192 11 262 587 343 661 9.07e-38 149
MsG0580025218.01.T01 AT5G02800 36.863 255 140 6 340 588 54 293 9.57e-38 144
MsG0580025218.01.T01 AT4G00960 35.965 228 134 6 344 571 43 258 1.02e-37 144
MsG0580025218.01.T01 AT2G47060 36.179 246 143 7 345 587 61 295 1.09e-37 144
MsG0580025218.01.T01 AT1G61380 33.700 273 164 7 302 571 283 541 1.12e-37 148
MsG0580025218.01.T01 AT1G20650 37.143 245 140 5 345 588 66 297 1.19e-37 144
MsG0580025218.01.T01 AT1G51800 29.398 432 236 12 168 578 409 792 1.20e-37 149
MsG0580025218.01.T01 AT2G28960 28.571 532 297 19 84 570 279 772 1.28e-37 149
MsG0580025218.01.T01 AT1G66920 34.259 324 163 14 270 570 211 507 1.36e-37 147
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MsG0580025218.01.T01 AT1G61380 33.700 273 164 7 302 571 430 688 1.55e-37 149
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MsG0580025218.01.T01 AT2G18470 36.638 232 131 6 343 574 270 485 1.34e-36 145
MsG0580025218.01.T01 AT3G28690 36.576 257 132 7 347 590 65 303 1.51e-36 142
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MsG0580025218.01.T01 AT1G61370 33.770 305 171 9 298 587 279 567 2.17e-36 144
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MsG0580025218.01.T01 AT1G79670 39.035 228 124 6 345 572 409 621 2.26e-36 145
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MsG0580025218.01.T01 AT4G31100 39.111 225 123 6 348 572 435 645 2.73e-36 145
MsG0580025218.01.T01 AT4G31110 38.667 225 124 5 348 572 444 654 2.76e-36 145
MsG0580025218.01.T01 AT2G04300 29.440 411 245 12 172 578 420 789 3.02e-36 145
MsG0580025218.01.T01 AT1G65800 33.677 291 150 7 310 571 447 723 3.27e-36 145
MsG0580025218.01.T01 AT5G01950 35.371 229 141 3 342 569 611 833 3.39e-36 145
MsG0580025218.01.T01 AT5G01950 33.457 269 170 6 15 279 70 333 9.04e-29 122
MsG0580025218.01.T01 AT5G01950 33.460 263 164 5 1 255 106 365 5.25e-27 117
MsG0580025218.01.T01 AT1G66920 33.025 324 159 13 270 570 211 499 3.53e-36 143
MsG0580025218.01.T01 AT3G62220 36.145 249 145 7 342 587 54 291 3.75e-36 139
MsG0580025218.01.T01 AT3G62220 36.145 249 145 7 342 587 54 291 3.75e-36 139
MsG0580025218.01.T01 AT1G65790 32.686 309 164 9 292 571 426 719 3.82e-36 145
MsG0580025218.01.T01 AT3G28690 36.576 257 132 7 347 590 116 354 4.06e-36 141
MsG0580025218.01.T01 AT5G59660 28.538 431 214 12 161 577 344 694 4.09e-36 145
MsG0580025218.01.T01 AT3G14840 34.066 273 162 9 307 576 620 877 4.55e-36 145
MsG0580025218.01.T01 AT3G14840 31.636 275 161 4 23 273 88 359 1.54e-29 125
MsG0580025218.01.T01 AT3G14840 35.593 236 146 4 2 236 139 369 7.66e-28 119
MsG0580025218.01.T01 AT3G14840 35.169 236 146 3 2 235 116 346 4.19e-27 117
MsG0580025218.01.T01 AT1G66930 33.333 303 160 12 298 582 276 554 4.59e-36 144
MsG0580025218.01.T01 AT4G23200 32.700 263 158 6 313 571 289 536 5.86e-36 143
MsG0580025218.01.T01 AT4G04540 35.154 293 165 9 303 587 291 566 6.26e-36 143
MsG0580025218.01.T01 AT1G61610 31.646 316 176 6 298 587 440 741 6.84e-36 144
MsG0580025218.01.T01 AT5G11020 31.310 313 173 10 299 587 23 317 7.25e-36 139
MsG0580025218.01.T01 AT1G61610 31.818 308 170 6 298 579 440 733 7.43e-36 144
MsG0580025218.01.T01 AT5G56890 36.481 233 136 7 349 581 715 935 7.74e-36 144
MsG0580025218.01.T01 AT1G70520 35.391 243 142 5 337 579 305 532 8.29e-36 142
MsG0580025218.01.T01 AT4G23140 33.803 284 158 7 320 587 305 574 8.46e-36 143
MsG0580025218.01.T01 AT2G11520 37.131 237 126 6 345 576 213 431 8.58e-36 141
MsG0580025218.01.T01 AT5G11020 31.310 313 173 10 299 587 27 321 8.61e-36 139
MsG0580025218.01.T01 AT5G11020 31.310 313 173 10 299 587 61 355 8.63e-36 139
MsG0580025218.01.T01 AT1G61430 27.955 440 262 14 164 587 306 706 8.65e-36 144
MsG0580025218.01.T01 AT1G61430 27.955 440 262 14 164 587 283 683 8.99e-36 143
MsG0580025218.01.T01 AT1G61430 27.955 440 262 14 164 587 283 683 8.99e-36 143
MsG0580025218.01.T01 AT1G61430 27.955 440 262 14 164 587 283 683 8.99e-36 143
MsG0580025218.01.T01 AT1G52540 37.391 230 129 6 345 574 28 242 9.05e-36 137
MsG0580025218.01.T01 AT1G61390 36.820 239 134 7 350 587 345 567 9.15e-36 142
MsG0580025218.01.T01 AT5G12940 36.475 244 153 2 34 277 122 363 1.02e-35 138
MsG0580025218.01.T01 AT5G12940 36.522 230 143 3 5 234 118 344 4.23e-35 136
MsG0580025218.01.T01 AT5G12940 32.389 247 164 3 34 279 97 341 6.45e-27 113
MsG0580025218.01.T01 AT5G12940 30.244 205 137 3 69 272 88 287 2.08e-17 84.7
MsG0580025218.01.T01 AT5G12940 32.099 162 108 2 96 256 87 247 2.61e-17 84.3
MsG0580025218.01.T01 AT4G23190 32.432 296 174 9 302 587 213 492 1.13e-35 142
MsG0580025218.01.T01 AT4G23190 32.432 296 174 9 302 587 213 492 1.13e-35 142
MsG0580025218.01.T01 AT4G23190 32.107 299 177 9 302 590 291 573 1.26e-35 141
MsG0580025218.01.T01 AT5G13160 35.656 244 144 4 345 587 74 305 1.27e-35 139
MsG0580025218.01.T01 AT5G39020 36.101 277 144 11 302 570 444 695 1.29e-35 143
MsG0580025218.01.T01 AT1G61390 36.820 239 134 7 350 587 513 735 1.29e-35 143
MsG0580025218.01.T01 AT4G32300 31.461 267 155 7 319 574 446 695 1.31e-35 143
MsG0580025218.01.T01 AT5G24010 31.288 326 185 8 273 574 381 691 1.33e-35 143
MsG0580025218.01.T01 AT1G21240 33.793 290 153 8 302 571 344 614 1.39e-35 142
MsG0580025218.01.T01 AT2G05940 37.450 251 127 9 349 588 79 310 1.43e-35 139
MsG0580025218.01.T01 AT4G23190 32.432 296 174 9 302 587 291 570 1.49e-35 142
MsG0580025218.01.T01 AT1G11280 33.566 286 164 10 295 571 425 693 1.53e-35 143
MsG0580025218.01.T01 AT1G11280 33.566 286 164 10 295 571 435 703 1.56e-35 143
MsG0580025218.01.T01 AT4G04540 34.932 292 165 9 303 586 291 565 1.77e-35 141
MsG0580025218.01.T01 AT5G58940 37.607 234 126 6 345 574 135 352 1.80e-35 139
MsG0580025218.01.T01 AT5G58940 37.607 234 126 6 345 574 135 352 1.80e-35 139
MsG0580025218.01.T01 AT5G58940 37.607 234 126 6 345 574 135 352 1.80e-35 139
MsG0580025218.01.T01 AT5G58940 37.607 234 126 6 345 574 135 352 1.80e-35 139
MsG0580025218.01.T01 AT1G05700 28.288 403 243 9 196 570 414 798 1.92e-35 142
MsG0580025218.01.T01 AT1G61430 27.790 439 262 14 164 586 283 682 2.04e-35 142
MsG0580025218.01.T01 AT5G26150 37.118 229 131 4 344 572 412 627 2.06e-35 142
MsG0580025218.01.T01 AT4G29180 29.371 429 236 13 168 583 413 787 2.07e-35 142

Find 110 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 142 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GATAAATTGCCCACGGAATT+TGG 0.179218 5:+15409713 None:intergenic
AGTTTAGATGCTAATAATTT+TGG 0.184072 5:-15409746 MsG0580025218.01.T01:CDS
ATGCATTCACCAATTGTTAT+TGG 0.192104 5:+15409203 None:intergenic
GGAATTATTCCAGCTACTTT+TGG 0.217151 5:-15409575 MsG0580025218.01.T01:CDS
ACTAGTACAACTACATTATC+AGG 0.224904 5:-15408171 MsG0580025218.01.T01:CDS
GTTGCTCACGTGGGTGATTT+TGG 0.251817 5:-15408240 MsG0580025218.01.T01:CDS
AAGATACATTGAAGTATTCT+AGG 0.257956 5:+15409033 None:intergenic
CAGTTCCATGATGTAGTTCT+TGG 0.259475 5:+15408712 None:intergenic
AGATAAAGTTGTTGCTATAA+AGG 0.260370 5:-15408616 MsG0580025218.01.T01:CDS
TTTAGAATACCTTCACTTAC+AGG 0.262454 5:-15409177 MsG0580025218.01.T01:CDS
AAATATTAGACATCGAAATT+TGG 0.278262 5:-15408532 MsG0580025218.01.T01:CDS
TGAACAAGGTTCAATGTTCT+AGG 0.283474 5:+15408381 None:intergenic
TTGATTGGATCAGGAAGTTT+TGG 0.287241 5:-15408669 MsG0580025218.01.T01:CDS
GAAATATTCCTTTGAGTATA+GGG 0.289699 5:-15409430 MsG0580025218.01.T01:CDS
AATCTAACCTTTGCATGCTT+TGG 0.326246 5:+15409546 None:intergenic
CTCATGCTGGAAATGATTAC+TGG 0.340855 5:-15407953 MsG0580025218.01.T01:CDS
GGTTTAGATACTGCAACTTT+TGG 0.342852 5:+15409402 None:intergenic
GGAAATATTCCTTTGAGTAT+AGG 0.353891 5:-15409431 MsG0580025218.01.T01:CDS
TTGCGTCAGAACAAGTTATC+AGG 0.360603 5:-15409524 MsG0580025218.01.T01:CDS
TATGGTGACATGTATAGCTT+TGG 0.394233 5:-15407980 MsG0580025218.01.T01:CDS
TTCTCAGATAGAAATTTGAT+TGG 0.400045 5:-15408684 MsG0580025218.01.T01:CDS
AACTTAGTGAACTATACCTT+GGG 0.406731 5:-15409685 MsG0580025218.01.T01:CDS
GATAGAAATTTGATTGGATC+AGG 0.406868 5:-15408678 MsG0580025218.01.T01:CDS
TGTTCTAGTATTGATTATAA+AGG 0.408995 5:-15408492 MsG0580025218.01.T01:CDS
TCATGTACTGTGTGAGGAAA+AGG 0.419599 5:-15408791 MsG0580025218.01.T01:CDS
ATGGAAGAAAACATGTTAGA+AGG 0.420897 5:-15409452 MsG0580025218.01.T01:CDS
GTCTCTGAAAATCACTTGTC+AGG 0.422462 5:-15409233 MsG0580025218.01.T01:CDS
TTGTCTAGAAATCAGTTGTC+TGG 0.433027 5:-15409089 MsG0580025218.01.T01:CDS
TGGAACTTTCCAAAAGTAGC+TGG 0.433208 5:+15409566 None:intergenic
GTCCTATGCTCAAGAGAGTT+AGG 0.440905 5:+15409612 None:intergenic
GGAGATATACCATCTTTCAT+AGG 0.454130 5:-15409503 MsG0580025218.01.T01:CDS
CAAGTCCAATCCATTTGTTA+AGG 0.455024 5:+15409325 None:intergenic
CTTATGAGAGGTACCGTCAA+TGG 0.456781 5:+15408197 None:intergenic
CAAGGTATAGTTCACTAAGT+TGG 0.457348 5:+15409687 None:intergenic
ACTGTGTGAGGAAAAGGAAT+AGG 0.461830 5:-15408785 MsG0580025218.01.T01:CDS
CGGAACCATACCTTCCACTT+TGG 0.465697 5:-15409141 MsG0580025218.01.T01:CDS
TTTAGCAAACCCACTTCAGC+AGG 0.466371 5:+15409275 None:intergenic
TTTATAAAGTTGACAGGGCA+CGG 0.467733 5:+15408897 None:intergenic
GGTGACATTCCAATAACAAT+TGG 0.480950 5:-15409212 MsG0580025218.01.T01:CDS
TCTAGTATTGATTATAAAGG+TGG 0.483541 5:-15408489 MsG0580025218.01.T01:CDS
CAATGTATCTTTCAACATGT+TGG 0.485096 5:-15409021 MsG0580025218.01.T01:CDS
CTCGAAGGTTGTTTAGTGAA+AGG 0.486554 5:+15409381 None:intergenic
ACCTACAGATGAAAGATTTG+AGG 0.487267 5:-15407924 MsG0580025218.01.T01:CDS
CAACTTAGTGAACTATACCT+TGG 0.488214 5:-15409686 MsG0580025218.01.T01:CDS
AATTGCCCACGGAATTTGGC+AGG 0.491003 5:+15409717 None:intergenic
CATTGACGGTACCTCTCATA+AGG 0.491580 5:-15408196 MsG0580025218.01.T01:CDS
GGTATGAAATCTTAGTTATG+TGG 0.493307 5:+15408733 None:intergenic
TCATCGAGAAGGACGTTGCT+TGG 0.495994 5:+15408270 None:intergenic
TAGCTTTGGGATGCTCATGC+TGG 0.497190 5:-15407966 MsG0580025218.01.T01:CDS
TCATTGTGAATGTGAGCAAT+TGG 0.498000 5:-15408313 MsG0580025218.01.T01:CDS
ACTAGATTTCCTAACTCTTG+TGG 0.506291 5:+15409638 None:intergenic
ATAGGACATAACCACTTTGA+AGG 0.511893 5:-15409596 MsG0580025218.01.T01:CDS
AGGTTGCCTGCCAAATTCCG+TGG 0.513347 5:-15409723 MsG0580025218.01.T01:CDS
ATACTCTGAATCCACTGTCC+CGG 0.514015 5:+15408404 None:intergenic
TGGTAGTTTACCTGCTGAAG+TGG 0.522998 5:-15409285 MsG0580025218.01.T01:CDS
GGTTCTGAAGCATCAACATA+TGG 0.523831 5:-15407998 MsG0580025218.01.T01:CDS
TACTCTGAATCCACTGTCCC+GGG 0.524333 5:+15408405 None:intergenic
GAAGGTGAGGTTCCAATCAA+TGG 0.524677 5:-15408999 MsG0580025218.01.T01:CDS
TAGAACAGTGGCTTCATCCC+GGG 0.525720 5:-15408422 MsG0580025218.01.T01:CDS
TAATGCAGAAGCAATATCAA+TGG 0.526673 5:+15408344 None:intergenic
AGATGCCAAAGTGGAAGGTA+TGG 0.529854 5:+15409136 None:intergenic
CTTTCACTAAACAACCTTCG+AGG 0.530974 5:-15409380 MsG0580025218.01.T01:CDS
TTAGAATACCTTCACTTACA+GGG 0.536966 5:-15409176 MsG0580025218.01.T01:CDS
TGGCATTCCCCTATACTCAA+AGG 0.537880 5:+15409422 None:intergenic
AGACTTATCTCAGCCATTGA+CGG 0.542888 5:-15408210 MsG0580025218.01.T01:CDS
TTTCAACATGTTGGAAGGTG+AGG 0.543616 5:-15409012 MsG0580025218.01.T01:CDS
TTACAGGGGAACTCTCTTCA+CGG 0.545196 5:-15409161 MsG0580025218.01.T01:CDS
GAATAAACATCAGTATAAGA+AGG 0.547695 5:+15408817 None:intergenic
TTCTAATCATGTACTGTGTG+AGG 0.549389 5:-15408797 MsG0580025218.01.T01:CDS
CGTCCTTCTCGATGATAACA+TGG 0.550305 5:-15408262 MsG0580025218.01.T01:CDS
TTAGAACAGTGGCTTCATCC+CGG 0.551630 5:-15408423 MsG0580025218.01.T01:CDS
GGTAGTTTACCTGCTGAAGT+GGG 0.556447 5:-15409284 MsG0580025218.01.T01:CDS
GAAAGTTCCAAAGCATGCAA+AGG 0.561404 5:-15409553 MsG0580025218.01.T01:CDS
TCAGTTGTATGATTTGCGTA+TGG 0.564756 5:-15409471 MsG0580025218.01.T01:CDS
CTGCTATCAACCTAAAATTG+TGG 0.566560 5:+15408862 None:intergenic
TCCTCAAATCTTTCATCTGT+AGG 0.567982 5:+15407923 None:intergenic
GTATCTTTCAACATGTTGGA+AGG 0.570251 5:-15409017 MsG0580025218.01.T01:CDS
TGTACTAGTTTCCTTATGAG+AGG 0.570260 5:+15408185 None:intergenic
TGATAACATGGTTGCTCACG+TGG 0.572619 5:-15408250 MsG0580025218.01.T01:CDS
CTGAGGTTGCCTATGAAAGA+TGG 0.572837 5:+15409494 None:intergenic
TTGAGAGATGCCAAAGTGGA+AGG 0.577691 5:+15409131 None:intergenic
ACTACATTATCAGGGACCAT+TGG 0.579181 5:-15408162 MsG0580025218.01.T01:CDS
AAATATTCCTTTGAGTATAG+GGG 0.581111 5:-15409429 MsG0580025218.01.T01:CDS
CTGGAATAATTCCTTCAAAG+TGG 0.581625 5:+15409585 None:intergenic
ATGGTGACATGTATAGCTTT+GGG 0.585510 5:-15407979 MsG0580025218.01.T01:CDS
GCAAGCGGTTTATCAGTGAC+TGG 0.587051 5:-15408963 MsG0580025218.01.T01:CDS
TAGACATCGAAATTTGGTCA+AGG 0.595583 5:-15408526 MsG0580025218.01.T01:CDS
GTGGCTTCATCCCGGGACAG+TGG 0.604239 5:-15408415 MsG0580025218.01.T01:CDS
TAGAATACCTTCACTTACAG+GGG 0.604329 5:-15409175 MsG0580025218.01.T01:CDS
TCATACCAAGAACTACATCA+TGG 0.605617 5:-15408717 MsG0580025218.01.T01:CDS
TTGTCACAAAATTCGTTGAG+TGG 0.609242 5:-15409305 MsG0580025218.01.T01:CDS
TTGTCTGGATCAATTCCTGA+AGG 0.611959 5:-15409074 MsG0580025218.01.T01:CDS
TACTTTGAGAGATGCCAAAG+TGG 0.614413 5:+15409127 None:intergenic
GTATAGTTCACTAAGTTGGA+AGG 0.615776 5:+15409691 None:intergenic
GGAAACAACAAGCTCTGTGG+AGG 0.617544 5:-15408942 MsG0580025218.01.T01:CDS
GGTTGCCTGCCAAATTCCGT+GGG 0.621305 5:-15409722 MsG0580025218.01.T01:CDS
GAGAGTTCCCCTGTAAGTGA+AGG 0.622323 5:+15409168 None:intergenic
TACCTAACTCTCTTGAGCAT+AGG 0.622842 5:-15409614 MsG0580025218.01.T01:CDS
CTAGTACAACTACATTATCA+GGG 0.627551 5:-15408170 MsG0580025218.01.T01:CDS
CAACCATGTTATCATCGAGA+AGG 0.627663 5:+15408259 None:intergenic
CTAAGGGTATGGCTCCTCGA+AGG 0.645385 5:+15409366 None:intergenic
AGATATTTAATCTTTGAACA+AGG 0.646041 5:+15408367 None:intergenic
TTGGAAGGATAAATTGCCCA+CGG 0.656076 5:+15409706 None:intergenic
ACAGATGAAAGATTTGAGGA+TGG 0.663585 5:-15407920 MsG0580025218.01.T01:CDS
ACTGGAAACAACAAGCTCTG+TGG 0.666754 5:-15408945 MsG0580025218.01.T01:CDS
AAAATGGAAGCTTAGAACAG+TGG 0.674217 5:-15408434 MsG0580025218.01.T01:CDS
GCAAATCATACAACTGACTG+AGG 0.688142 5:+15409477 None:intergenic
CTTAGTGAACTATACCTTGG+GGG 0.695219 5:-15409683 MsG0580025218.01.T01:CDS
ACTTAGTGAACTATACCTTG+GGG 0.698782 5:-15409684 MsG0580025218.01.T01:CDS
GATAACATGGTTGCTCACGT+GGG 0.789582 5:-15408249 MsG0580025218.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AAAAATTCTAAAAAGTTCTA+AGG + Chr5:15408292-15408311 None:intergenic 15.0%
!!! AAAATTCTAAAAAGTTCTAA+GGG + Chr5:15408291-15408310 None:intergenic 15.0%
!! AAATATTAGACATCGAAATT+TGG - Chr5:15409106-15409125 MsG0580025218.01.T01:CDS 20.0%
!! AGATATTTAATCTTTGAACA+AGG + Chr5:15409274-15409293 None:intergenic 20.0%
!! ATTAGTGTAGATCAAAATAT+AGG + Chr5:15409559-15409578 None:intergenic 20.0%
!!! AGAATTTTTACCTTAACAAA+TGG - Chr5:15408303-15408322 MsG0580025218.01.T01:CDS 20.0%
!!! AGTTTAGATGCTAATAATTT+TGG - Chr5:15407892-15407911 MsG0580025218.01.T01:CDS 20.0%
!!! GTTTTTGATTACATGAAAAA+TGG - Chr5:15409188-15409207 MsG0580025218.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGTTCTAGTATTGATTATAA+AGG - Chr5:15409146-15409165 MsG0580025218.01.T01:CDS 20.0%
! AAATATTCCTTTGAGTATAG+GGG - Chr5:15408209-15408228 MsG0580025218.01.T01:CDS 25.0%
! AAGAATTCATAATATACCTG+GGG + Chr5:15409510-15409529 None:intergenic 25.0%
! AGATAAAGTTGTTGCTATAA+AGG - Chr5:15409022-15409041 MsG0580025218.01.T01:CDS 25.0%
! CAAGAATTCATAATATACCT+GGG + Chr5:15409511-15409530 None:intergenic 25.0%
! GAAATATTCCTTTGAGTATA+GGG - Chr5:15408208-15408227 MsG0580025218.01.T01:CDS 25.0%
! GAATAAACATCAGTATAAGA+AGG + Chr5:15408824-15408843 None:intergenic 25.0%
! TCAAAATATAGGAGAATTCA+AGG + Chr5:15409548-15409567 None:intergenic 25.0%
! TCAAGAATTCATAATATACC+TGG + Chr5:15409512-15409531 None:intergenic 25.0%
! TTCTCAGATAGAAATTTGAT+TGG - Chr5:15408954-15408973 MsG0580025218.01.T01:CDS 25.0%
!! AAGATACATTGAAGTATTCT+AGG + Chr5:15408608-15408627 None:intergenic 25.0%
!! TTAGATGCTAATAATTTTGG+AGG - Chr5:15407895-15407914 MsG0580025218.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTACCTTAACAAATGGAT+TGG - Chr5:15408308-15408327 MsG0580025218.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAATGTTTTAGAGTATGGAA+TGG - Chr5:15409618-15409637 MsG0580025218.01.T01:CDS 25.0%
!!! AATGTTTTAGAGTATGGAAT+GGG - Chr5:15409619-15409638 MsG0580025218.01.T01:CDS 25.0%
!!! GTAACAAATGTTTTAGAGTA+TGG - Chr5:15409613-15409632 MsG0580025218.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAGGTTTTATAAAGTTGACA+GGG + Chr5:15408749-15408768 None:intergenic 25.0%
!!! TCTAGTATTGATTATAAAGG+TGG - Chr5:15409149-15409168 MsG0580025218.01.T01:CDS 25.0%
AACTTAGTGAACTATACCTT+GGG - Chr5:15407953-15407972 MsG0580025218.01.T01:CDS 30.0%
ACTAGTACAACTACATTATC+AGG - Chr5:15409467-15409486 MsG0580025218.01.T01:CDS 30.0%
AGAATTCATAATATACCTGG+GGG + Chr5:15409509-15409528 None:intergenic 30.0%
ATGCATTCACCAATTGTTAT+TGG + Chr5:15408438-15408457 None:intergenic 30.0%
ATGGAAGAAAACATGTTAGA+AGG - Chr5:15408186-15408205 MsG0580025218.01.T01:CDS 30.0%
CAATGTATCTTTCAACATGT+TGG - Chr5:15408617-15408636 MsG0580025218.01.T01:CDS 30.0%
CTAGTACAACTACATTATCA+GGG - Chr5:15409468-15409487 MsG0580025218.01.T01:CDS 30.0%
GATAGAAATTTGATTGGATC+AGG - Chr5:15408960-15408979 MsG0580025218.01.T01:CDS 30.0%
GGAAATATTCCTTTGAGTAT+AGG - Chr5:15408207-15408226 MsG0580025218.01.T01:CDS 30.0%
GGTATGAAATCTTAGTTATG+TGG + Chr5:15408908-15408927 None:intergenic 30.0%
TAATGCAGAAGCAATATCAA+TGG + Chr5:15409297-15409316 None:intergenic 30.0%
TTAGAATACCTTCACTTACA+GGG - Chr5:15408462-15408481 MsG0580025218.01.T01:CDS 30.0%
! CTACAAAACTCCACAATTTT+AGG - Chr5:15408766-15408785 MsG0580025218.01.T01:CDS 30.0%
! TTTAGAATACCTTCACTTAC+AGG - Chr5:15408461-15408480 MsG0580025218.01.T01:CDS 30.0%
!! AGTTTTGGTACTGTATACAA+AGG - Chr5:15408984-15409003 MsG0580025218.01.T01:CDS 30.0%
!! CTAAAATTGTGGAGTTTTGT+AGG + Chr5:15408768-15408787 None:intergenic 30.0%
!! GTAGGTTTTATAAAGTTGAC+AGG + Chr5:15408750-15408769 None:intergenic 30.0%
!! TCTAAAAAGTTCTAAGGGTA+TGG + Chr5:15408286-15408305 None:intergenic 30.0%
!! TTTTTAAAGACGCCATTGAT+TGG + Chr5:15408654-15408673 None:intergenic 30.0%
AAAATGGAAGCTTAGAACAG+TGG - Chr5:15409204-15409223 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
AATCTAACCTTTGCATGCTT+TGG + Chr5:15408095-15408114 None:intergenic 35.0%
ACAGATGAAAGATTTGAGGA+TGG - Chr5:15409718-15409737 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
ACCTACAGATGAAAGATTTG+AGG - Chr5:15409714-15409733 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
ACTAGATTTCCTAACTCTTG+TGG + Chr5:15408003-15408022 None:intergenic 35.0%
ACTTAGTGAACTATACCTTG+GGG - Chr5:15407954-15407973 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
ATAGGACATAACCACTTTGA+AGG - Chr5:15408042-15408061 MsG0580025218.01.T01:intron 35.0%
ATGGTGACATGTATAGCTTT+GGG - Chr5:15409659-15409678 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
CAACTTAGTGAACTATACCT+TGG - Chr5:15407952-15407971 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
CAAGGTATAGTTCACTAAGT+TGG + Chr5:15407954-15407973 None:intergenic 35.0%
CTGCTATCAACCTAAAATTG+TGG + Chr5:15408779-15408798 None:intergenic 35.0%
CTGGAATAATTCCTTCAAAG+TGG + Chr5:15408056-15408075 None:intergenic 35.0%
GGAAAAATTCCACAAGAGTT+AGG - Chr5:15407991-15408010 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
GGAGATATACCATCTTTCAT+AGG - Chr5:15408135-15408154 MsG0580025218.01.T01:intron 35.0%
GGTGACATTCCAATAACAAT+TGG - Chr5:15408426-15408445 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
GTATCTTTCAACATGTTGGA+AGG - Chr5:15408621-15408640 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
TAGAATACCTTCACTTACAG+GGG - Chr5:15408463-15408482 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
TAGACATCGAAATTTGGTCA+AGG - Chr5:15409112-15409131 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
TATGGTGACATGTATAGCTT+TGG - Chr5:15409658-15409677 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
TCATACCAAGAACTACATCA+TGG - Chr5:15408921-15408940 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
TCATTGTGAATGTGAGCAAT+TGG - Chr5:15409325-15409344 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
TCCTCAAATCTTTCATCTGT+AGG + Chr5:15409718-15409737 None:intergenic 35.0%
TGAACAAGGTTCAATGTTCT+AGG + Chr5:15409260-15409279 None:intergenic 35.0%
TTCTAATCATGTACTGTGTG+AGG - Chr5:15408841-15408860 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
TTGTCACAAAATTCGTTGAG+TGG - Chr5:15408333-15408352 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
TTGTCTAGAAATCAGTTGTC+TGG - Chr5:15408549-15408568 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
TTTATAAAGTTGACAGGGCA+CGG + Chr5:15408744-15408763 None:intergenic 35.0%
! ACAATATTTTGCAGACCTTC+AGG + Chr5:15408582-15408601 None:intergenic 35.0%
! CAAGTCCAATCCATTTGTTA+AGG + Chr5:15408316-15408335 None:intergenic 35.0%
! GGTTTAGATACTGCAACTTT+TGG + Chr5:15408239-15408258 None:intergenic 35.0%
! GTATAGTTCACTAAGTTGGA+AGG + Chr5:15407950-15407969 None:intergenic 35.0%
! GTTCTGAACCTCAAAAAGAA+GGG - Chr5:15409044-15409063 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
! TCAGTTGTATGATTTGCGTA+TGG - Chr5:15408167-15408186 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
! TGTACTAGTTTCCTTATGAG+AGG + Chr5:15409456-15409475 None:intergenic 35.0%
! TTGATTGGATCAGGAAGTTT+TGG - Chr5:15408969-15408988 MsG0580025218.01.T01:CDS 35.0%
!! GGAATTATTCCAGCTACTTT+TGG - Chr5:15408063-15408082 MsG0580025218.01.T01:intron 35.0%
ACTACATTATCAGGGACCAT+TGG - Chr5:15409476-15409495 MsG0580025218.01.T01:CDS 40.0%
ACTGTGTGAGGAAAAGGAAT+AGG - Chr5:15408853-15408872 MsG0580025218.01.T01:CDS 40.0%
AGACTTATCTCAGCCATTGA+CGG - Chr5:15409428-15409447 MsG0580025218.01.T01:CDS 40.0%
CAACCATGTTATCATCGAGA+AGG + Chr5:15409382-15409401 None:intergenic 40.0%
CAGTTCCATGATGTAGTTCT+TGG + Chr5:15408929-15408948 None:intergenic 40.0%
CTCATGCTGGAAATGATTAC+TGG - Chr5:15409685-15409704 MsG0580025218.01.T01:CDS 40.0%
CTCGAAGGTTGTTTAGTGAA+AGG + Chr5:15408260-15408279 None:intergenic 40.0%
CTTAGTGAACTATACCTTGG+GGG - Chr5:15407955-15407974 MsG0580025218.01.T01:CDS 40.0%
CTTTCACTAAACAACCTTCG+AGG - Chr5:15408258-15408277 MsG0580025218.01.T01:CDS 40.0%
GAAAGTTCCAAAGCATGCAA+AGG - Chr5:15408085-15408104 MsG0580025218.01.T01:intron 40.0%
GATAAATTGCCCACGGAATT+TGG + Chr5:15407928-15407947 None:intergenic 40.0%
GCAAATCATACAACTGACTG+AGG + Chr5:15408164-15408183 None:intergenic 40.0%
TACCTAACTCTCTTGAGCAT+AGG - Chr5:15408024-15408043 MsG0580025218.01.T01:intron 40.0%
TCATGTACTGTGTGAGGAAA+AGG - Chr5:15408847-15408866 MsG0580025218.01.T01:CDS 40.0%
TGGAACTTTCCAAAAGTAGC+TGG + Chr5:15408075-15408094 None:intergenic 40.0%
TTGCGTCAGAACAAGTTATC+AGG - Chr5:15408114-15408133 MsG0580025218.01.T01:intron 40.0%
TTGGAAGGATAAATTGCCCA+CGG + Chr5:15407935-15407954 None:intergenic 40.0%
TTGTCTGGATCAATTCCTGA+AGG - Chr5:15408564-15408583 MsG0580025218.01.T01:CDS 40.0%
TTTCAACATGTTGGAAGGTG+AGG - Chr5:15408626-15408645 MsG0580025218.01.T01:CDS 40.0%
! GGCGTCTTTAAAAATGCAAG+CGG - Chr5:15408660-15408679 MsG0580025218.01.T01:CDS 40.0%
! GTCTCTGAAAATCACTTGTC+AGG - Chr5:15408405-15408424 MsG0580025218.01.T01:CDS 40.0%
! TACTTTGAGAGATGCCAAAG+TGG + Chr5:15408514-15408533 None:intergenic 40.0%
! TATGAGCTCCCTTCTTTTTG+AGG + Chr5:15409055-15409074 None:intergenic 40.0%
!! GGTTCTGAACCTCAAAAAGA+AGG - Chr5:15409043-15409062 MsG0580025218.01.T01:CDS 40.0%
!! GGTTCTGAAGCATCAACATA+TGG - Chr5:15409640-15409659 MsG0580025218.01.T01:CDS 40.0%
ACTGGAAACAACAAGCTCTG+TGG - Chr5:15408693-15408712 MsG0580025218.01.T01:CDS 45.0%
AGATGCCAAAGTGGAAGGTA+TGG + Chr5:15408505-15408524 None:intergenic 45.0%
ATACTCTGAATCCACTGTCC+CGG + Chr5:15409237-15409256 None:intergenic 45.0%
CATTGACGGTACCTCTCATA+AGG - Chr5:15409442-15409461 MsG0580025218.01.T01:CDS 45.0%
CGTCCTTCTCGATGATAACA+TGG - Chr5:15409376-15409395 MsG0580025218.01.T01:CDS 45.0%
CTGAGGTTGCCTATGAAAGA+TGG + Chr5:15408147-15408166 None:intergenic 45.0%
CTGATATCTCATTACCCCCA+AGG + Chr5:15407972-15407991 None:intergenic 45.0%
CTTGGGGGTAATGAGATATC+AGG - Chr5:15407970-15407989 MsG0580025218.01.T01:CDS 45.0%
GAAGGTGAGGTTCCAATCAA+TGG - Chr5:15408639-15408658 MsG0580025218.01.T01:CDS 45.0%
GATAACATGGTTGCTCACGT+GGG - Chr5:15409389-15409408 MsG0580025218.01.T01:CDS 45.0%
GGTAGTTTACCTGCTGAAGT+GGG - Chr5:15408354-15408373 MsG0580025218.01.T01:CDS 45.0%
GTCCTATGCTCAAGAGAGTT+AGG + Chr5:15408029-15408048 None:intergenic 45.0%
TGATAACATGGTTGCTCACG+TGG - Chr5:15409388-15409407 MsG0580025218.01.T01:CDS 45.0%
TGGCATTCCCCTATACTCAA+AGG + Chr5:15408219-15408238 None:intergenic 45.0%
TGGTAGTTTACCTGCTGAAG+TGG - Chr5:15408353-15408372 MsG0580025218.01.T01:CDS 45.0%
TTACAGGGGAACTCTCTTCA+CGG - Chr5:15408477-15408496 MsG0580025218.01.T01:CDS 45.0%
TTAGAACAGTGGCTTCATCC+CGG - Chr5:15409215-15409234 MsG0580025218.01.T01:CDS 45.0%
TTGAGAGATGCCAAAGTGGA+AGG + Chr5:15408510-15408529 None:intergenic 45.0%
TTTAGCAAACCCACTTCAGC+AGG + Chr5:15408366-15408385 None:intergenic 45.0%
!! CTTATGAGAGGTACCGTCAA+TGG + Chr5:15409444-15409463 None:intergenic 45.0%
AATTGCCCACGGAATTTGGC+AGG + Chr5:15407924-15407943 None:intergenic 50.0%
CGGAACCATACCTTCCACTT+TGG - Chr5:15408497-15408516 MsG0580025218.01.T01:CDS 50.0%
GAGAGTTCCCCTGTAAGTGA+AGG + Chr5:15408473-15408492 None:intergenic 50.0%
GCAAGCGGTTTATCAGTGAC+TGG - Chr5:15408675-15408694 MsG0580025218.01.T01:CDS 50.0%
GGAAACAACAAGCTCTGTGG+AGG - Chr5:15408696-15408715 MsG0580025218.01.T01:CDS 50.0%
TACTCTGAATCCACTGTCCC+GGG + Chr5:15409236-15409255 None:intergenic 50.0%
TAGAACAGTGGCTTCATCCC+GGG - Chr5:15409216-15409235 MsG0580025218.01.T01:CDS 50.0%
TCATCGAGAAGGACGTTGCT+TGG + Chr5:15409371-15409390 None:intergenic 50.0%
! GTTGCTCACGTGGGTGATTT+TGG - Chr5:15409398-15409417 MsG0580025218.01.T01:CDS 50.0%
!! TAGCTTTGGGATGCTCATGC+TGG - Chr5:15409672-15409691 MsG0580025218.01.T01:CDS 50.0%
AGGTTGCCTGCCAAATTCCG+TGG - Chr5:15407915-15407934 MsG0580025218.01.T01:CDS 55.0%
GGTTGCCTGCCAAATTCCGT+GGG - Chr5:15407916-15407935 MsG0580025218.01.T01:CDS 55.0%
! CTAAGGGTATGGCTCCTCGA+AGG + Chr5:15408275-15408294 None:intergenic 55.0%
! ACCATTGGCTATGCTCCCCC+AGG - Chr5:15409491-15409510 MsG0580025218.01.T01:CDS 60.0%
! ACCTGGGGGAGCATAGCCAA+TGG + Chr5:15409495-15409514 None:intergenic 60.0%
GTGGCTTCATCCCGGGACAG+TGG - Chr5:15409223-15409242 MsG0580025218.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 15407886 15409774 15407886 ID=MsG0580025218.01;Name=MsG0580025218.01
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Chr5 exon 15407886 15408031 15407886 ID=MsG0580025218.01.T01:exon:20910;Parent=MsG0580025218.01.T01
Chr5 CDS 15408148 15409774 15408148 ID=MsG0580025218.01.T01:cds;Parent=MsG0580025218.01.T01
Chr5 CDS 15407886 15408031 15407886 ID=MsG0580025218.01.T01:cds;Parent=MsG0580025218.01.T01
Gene Sequence

>MsG0580025218.01.T01

ATGCTTAGTTTAGATGCTAATAATTTTGGAGGTTGCCTGCCAAATTCCGTGGGCAATTTATCCTTCCAACTTAGTGAACTATACCTTGGGGGTAATGAGATATCAGGAAAAATTCCACAAGAGTTAGGAAATCTAGTATACCTAACTCTCTTGAGCATAGGACATAACCACTTTGAAGGAATTATTCCAGCTACTTTTGGAAAGTTCCAAAGCATGCAAAGGTTAGATTTGCGTCAGAACAAGTTATCAGGAGATATACCATCTTTCATAGGCAACCTCAGTCAGTTGTATGATTTGCGTATGGAAGAAAACATGTTAGAAGGAAATATTCCTTTGAGTATAGGGGAATGCCAAAAGTTGCAGTATCTAAACCTTTCACTAAACAACCTTCGAGGAGCCATACCCTTAGAACTTTTTAGAATTTTTACCTTAACAAATGGATTGGACTTGTCACAAAATTCGTTGAGTGGTAGTTTACCTGCTGAAGTGGGTTTGCTAAAAAAAATAGAAAAGCTAGATGTCTCTGAAAATCACTTGTCAGGTGACATTCCAATAACAATTGGTGAATGCATAAGTTTAGAATACCTTCACTTACAGGGGAACTCTCTTCACGGAACCATACCTTCCACTTTGGCATCTCTCAAAGTACTTCAATATTTAGACTTGTCTAGAAATCAGTTGTCTGGATCAATTCCTGAAGGTCTGCAAAATATTGTTTTCCTAGAATACTTCAATGTATCTTTCAACATGTTGGAAGGTGAGGTTCCAATCAATGGCGTCTTTAAAAATGCAAGCGGTTTATCAGTGACTGGAAACAACAAGCTCTGTGGAGGAATTTTAGAGATGCATCTATCTCCGTGCCCTGTCAACTTTATAAAACCTACAAAACTCCACAATTTTAGGTTGATAGCAGTGATAATTAGTGTGATTTCTTTCCTTCTTATACTGATGTTTATTCTAATCATGTACTGTGTGAGGAAAAGGAATAGGAAATCATCTTCTGATACAACAACAATTGACCACATAACTAAGATTTCATACCAAGAACTACATCATGGAACTGATGAGTTCTCAGATAGAAATTTGATTGGATCAGGAAGTTTTGGTACTGTATACAAAGGAAATATTGTATCACAAGATAAAGTTGTTGCTATAAAGGTTCTGAACCTCAAAAAGAAGGGAGCTCATAAGAGTTTTATTGCTGAATGTAATGCACTCAAAAATATTAGACATCGAAATTTGGTCAAGGTTTTAACATGTTGTTCTAGTATTGATTATAAAGGTGGAGAATTTAAAGCTTTAGTTTTTGATTACATGAAAAATGGAAGCTTAGAACAGTGGCTTCATCCCGGGACAGTGGATTCAGAGTATCCTAGAACATTGAACCTTGTTCAAAGATTAAATATCTCCATTGATATTGCTTCTGCATTACATTATCTTCATTGTGAATGTGAGCAATTGGTCATTCATTGTGATATCAAGCCAAGCAACGTCCTTCTCGATGATAACATGGTTGCTCACGTGGGTGATTTTGGCATAGCAAGACTTATCTCAGCCATTGACGGTACCTCTCATAAGGAAACTAGTACAACTACATTATCAGGGACCATTGGCTATGCTCCCCCAGAGTATGGAATGGGTTCTGAAGCATCAACATATGGTGACATGTATAGCTTTGGGATGCTCATGCTGGAAATGATTACTGGAAGAAGACCTACAGATGAAAGATTTGAGGATGGTCAAAATCTACGTACGTTTGCTGAAATTCATTAG
Protein sequence

>MsG0580025218.01.T01

MLSLDANNFGGCLPNSVGNLSFQLSELYLGGNEISGKIPQELGNLVYLTLLSIGHNHFEGIIPATFGKFQSMQRLDLRQNKLSGDIPSFIGNLSQLYDLRMEENMLEGNIPLSIGECQKLQYLNLSLNNLRGAIPLELFRIFTLTNGLDLSQNSLSGSLPAEVGLLKKIEKLDVSENHLSGDIPITIGECISLEYLHLQGNSLHGTIPSTLASLKVLQYLDLSRNQLSGSIPEGLQNIVFLEYFNVSFNMLEGEVPINGVFKNASGLSVTGNNKLCGGILEMHLSPCPVNFIKPTKLHNFRLIAVIISVISFLLILMFILIMYCVRKRNRKSSSDTTTIDHITKISYQELHHGTDEFSDRNLIGSGSFGTVYKGNIVSQDKVVAIKVLNLKKKGAHKSFIAECNALKNIRHRNLVKVLTCCSSIDYKGGEFKALVFDYMKNGSLEQWLHPGTVDSEYPRTLNLVQRLNISIDIASALHYLHCECEQLVIHCDIKPSNVLLDDNMVAHVGDFGIARLISAIDGTSHKETSTTTLSGTIGYAPPEYGMGSEASTYGDMYSFGMLMLEMITGRRPTDERFEDGQNLRTFAEIH*