AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580028022.01

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MsG0580028022.01.T01 AT3G11440 51.852 108 50 2 118 223 40 147 3.20e-30 121
MsG0580028022.01.T01 AT1G69560 36.464 181 106 3 94 269 80 256 3.30e-30 118
MsG0580028022.01.T01 AT1G69560 36.464 181 106 3 94 269 96 272 3.40e-30 118
MsG0580028022.01.T01 AT3G29020 49.123 114 55 1 113 223 57 170 5.98e-30 115
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MsG0580028022.01.T01 AT5G06100 50.000 108 52 2 118 223 31 138 2.79e-28 115
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MsG0580028022.01.T01 AT1G09540 46.789 109 55 2 119 225 12 119 7.58e-28 112
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MsG0580028022.01.T01 AT5G07700 48.113 106 54 1 117 221 10 115 8.66e-28 111
MsG0580028022.01.T01 AT1G57560 46.667 105 53 2 119 221 12 115 1.02e-27 110
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MsG0580028022.01.T01 AT5G07690 50.495 101 49 1 117 216 10 110 1.10e-27 111
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MsG0580028022.01.T01 AT5G16770 46.154 104 55 1 119 221 12 115 3.51e-27 109
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MsG0580028022.01.T01 AT5G16770 46.154 104 55 1 119 221 12 115 4.71e-27 109
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MsG0580028022.01.T01 AT4G17785 42.735 117 64 2 107 221 1 116 7.68e-25 103
MsG0580028022.01.T01 AT3G27810 43.548 124 67 2 121 243 22 143 9.11e-25 100
MsG0580028022.01.T01 AT1G06180 45.299 117 59 3 119 231 12 127 1.18e-24 101
MsG0580028022.01.T01 AT2G26950 43.119 109 53 2 117 220 14 118 1.57e-24 103
MsG0580028022.01.T01 AT1G16490 43.333 120 64 3 121 237 16 134 1.57e-24 101
MsG0580028022.01.T01 AT2G16720 42.718 103 56 2 121 221 14 115 1.58e-24 101
MsG0580028022.01.T01 AT1G34670 44.231 104 57 1 119 221 12 115 2.00e-24 102
MsG0580028022.01.T01 AT5G62320 44.737 114 55 3 119 224 13 126 2.38e-24 100
MsG0580028022.01.T01 AT5G57620 42.241 116 65 2 121 234 14 129 4.46e-24 101
MsG0580028022.01.T01 AT5G39700 39.837 123 73 1 99 220 33 155 6.56e-24 97.8
MsG0580028022.01.T01 AT2G31180 42.982 114 62 2 121 232 14 126 6.79e-24 99.0
MsG0580028022.01.T01 AT3G27920 45.361 97 52 1 121 216 16 112 6.96e-24 98.6
MsG0580028022.01.T01 AT3G30210 28.959 221 141 7 121 339 29 235 7.73e-24 99.8
MsG0580028022.01.T01 AT3G48920 41.667 120 66 2 121 239 20 136 1.04e-23 99.0
MsG0580028022.01.T01 AT1G48000 42.017 119 65 2 121 238 34 149 1.13e-23 98.6
MsG0580028022.01.T01 AT5G23000 42.735 117 64 3 107 221 1 116 1.56e-23 99.8
MsG0580028022.01.T01 AT4G25560 41.593 113 65 1 110 221 1 113 2.42e-23 98.6
MsG0580028022.01.T01 AT2G47190 42.857 112 62 2 111 221 13 123 2.85e-23 97.8
MsG0580028022.01.T01 AT1G18710 42.453 106 60 1 121 225 14 119 3.03e-23 97.8
MsG0580028022.01.T01 AT5G62470 41.379 116 67 1 121 236 14 128 4.86e-23 99.0
MsG0580028022.01.T01 AT3G60460 45.283 106 56 2 117 220 9 114 5.08e-23 97.8
MsG0580028022.01.T01 AT3G62610 45.098 102 55 1 121 221 14 115 7.47e-23 98.2
MsG0580028022.01.T01 AT5G14340 43.810 105 56 2 119 221 24 127 8.07e-23 96.7
MsG0580028022.01.T01 AT1G56160 41.748 103 57 2 121 221 16 117 1.11e-22 96.7
MsG0580028022.01.T01 AT1G79180 31.429 175 102 4 121 285 16 182 1.57e-22 96.3
MsG0580028022.01.T01 AT3G49690 44.545 110 57 3 121 226 14 123 1.59e-22 96.7
MsG0580028022.01.T01 AT5G49330 45.192 104 56 1 119 221 12 115 1.79e-22 97.1
MsG0580028022.01.T01 AT1G25340 44.660 103 54 2 121 221 20 121 2.97e-22 95.5
MsG0580028022.01.T01 AT3G47600 37.008 127 79 1 121 246 14 140 6.38e-22 95.5
MsG0580028022.01.T01 AT1G74650 42.241 116 65 2 107 221 1 115 9.37e-22 94.7
MsG0580028022.01.T01 AT5G49620 40.157 127 72 2 110 235 17 140 1.20e-21 94.4
MsG0580028022.01.T01 AT1G25340 42.574 101 54 1 121 221 20 116 1.27e-21 93.6
MsG0580028022.01.T01 AT5G65790 44.545 110 57 3 121 226 14 123 1.39e-21 95.1
MsG0580028022.01.T01 AT1G66370 38.017 121 74 1 114 233 3 123 1.62e-21 92.4
MsG0580028022.01.T01 AT5G62470 41.026 117 67 2 121 236 14 129 1.81e-21 94.4
MsG0580028022.01.T01 AT2G47460 43.137 102 57 1 121 221 14 115 2.55e-21 94.4
MsG0580028022.01.T01 AT1G25340 42.574 101 54 1 121 221 20 116 2.64e-21 93.2
MsG0580028022.01.T01 AT5G26660 48.611 72 37 0 154 225 17 88 2.98e-21 93.2
MsG0580028022.01.T01 AT4G37780 37.273 110 67 2 121 228 14 123 6.45e-21 92.0
MsG0580028022.01.T01 AT5G14750 33.113 151 90 3 154 297 18 164 1.07e-20 88.2
MsG0580028022.01.T01 AT1G66380 45.098 102 55 1 115 215 4 105 1.38e-20 87.0
MsG0580028022.01.T01 AT5G52260 34.868 152 71 3 121 270 14 139 1.64e-20 90.1
MsG0580028022.01.T01 AT3G28910 45.833 96 51 1 121 215 14 109 1.96e-20 90.9
MsG0580028022.01.T01 AT3G06490 40.336 119 65 3 119 235 19 133 2.04e-20 90.9
MsG0580028022.01.T01 AT1G56650 44.660 103 56 1 115 216 4 106 3.38e-20 89.0
MsG0580028022.01.T01 AT1G14350 38.938 113 68 1 124 235 28 140 6.48e-20 90.9
MsG0580028022.01.T01 AT1G14350 38.938 113 68 1 124 235 28 140 6.48e-20 90.9
MsG0580028022.01.T01 AT3G12820 39.252 107 62 2 121 225 16 121 8.15e-20 87.8
MsG0580028022.01.T01 AT5G40350 35.366 164 91 6 154 313 8 160 9.79e-20 85.5
MsG0580028022.01.T01 AT5G35550 47.368 76 40 0 154 229 53 128 1.58e-19 87.4
MsG0580028022.01.T01 AT1G08810 31.638 177 105 5 121 283 14 188 1.74e-19 87.4
MsG0580028022.01.T01 AT1G66390 45.098 102 55 1 115 215 4 105 1.79e-19 87.0
MsG0580028022.01.T01 AT3G27810 46.667 90 46 1 154 243 7 94 2.52e-19 84.7
MsG0580028022.01.T01 AT2G02820 40.741 108 63 1 124 230 33 140 3.29e-19 89.0
MsG0580028022.01.T01 AT2G02820 40.741 108 63 1 124 230 33 140 3.31e-19 89.0
MsG0580028022.01.T01 AT1G79180 31.126 151 70 2 121 237 16 166 4.75e-19 87.0
MsG0580028022.01.T01 AT2G02820 43.956 91 51 0 124 214 33 123 5.13e-19 87.0
MsG0580028022.01.T01 AT2G36890 40.777 103 59 2 121 221 14 116 8.48e-19 85.9
MsG0580028022.01.T01 AT2G36890 40.777 103 59 2 121 221 55 157 1.69e-18 85.9
MsG0580028022.01.T01 AT5G49620 36.170 141 72 3 110 235 17 154 2.76e-18 84.7
MsG0580028022.01.T01 AT5G59780 44.304 79 44 0 154 232 23 101 4.07e-18 82.4
MsG0580028022.01.T01 AT2G37630 29.940 167 108 2 123 280 6 172 4.33e-18 84.7
MsG0580028022.01.T01 AT3G46130 44.304 79 44 0 154 232 23 101 1.76e-17 81.3
MsG0580028022.01.T01 AT3G46130 44.304 79 44 0 154 232 13 91 1.85e-17 80.9
MsG0580028022.01.T01 AT3G47600 35.345 116 72 1 131 246 22 134 3.63e-17 81.6
MsG0580028022.01.T01 AT3G53200 48.529 68 35 0 154 221 12 79 7.91e-17 78.6
MsG0580028022.01.T01 AT3G23250 34.532 139 68 3 165 297 2 123 5.01e-16 76.6
MsG0580028022.01.T01 AT3G12820 44.444 72 40 0 154 225 2 73 6.61e-16 75.5
MsG0580028022.01.T01 AT3G18100 38.144 97 58 2 119 214 493 588 2.22e-15 77.8
MsG0580028022.01.T01 AT3G18100 36.170 94 60 0 121 214 546 639 3.77e-14 74.3
MsG0580028022.01.T01 AT3G18100 38.144 97 58 2 119 214 445 540 2.38e-15 77.8
MsG0580028022.01.T01 AT3G18100 36.170 94 60 0 121 214 498 591 3.55e-14 74.3
MsG0580028022.01.T01 AT3G18100 38.144 97 58 2 119 214 332 427 4.75e-15 77.0
MsG0580028022.01.T01 AT3G18100 36.170 94 60 0 121 214 385 478 6.84e-14 73.2
MsG0580028022.01.T01 AT3G18100 38.144 97 58 2 119 214 280 375 6.31e-15 76.3
MsG0580028022.01.T01 AT3G18100 36.170 94 60 0 121 214 333 426 8.60e-14 72.8
MsG0580028022.01.T01 AT5G14750 30.714 140 86 3 165 297 2 137 8.08e-15 71.2
MsG0580028022.01.T01 AT5G14750 30.714 140 86 3 165 297 2 137 8.08e-15 71.2
MsG0580028022.01.T01 AT1G71030 40.000 65 39 0 157 221 5 69 6.30e-14 69.7
MsG0580028022.01.T01 AT1G71030 40.000 65 39 0 157 221 19 83 7.75e-14 69.7
MsG0580028022.01.T01 AT1G22640 45.614 57 31 0 165 221 2 58 1.18e-13 69.3
MsG0580028022.01.T01 AT1G66380 47.619 63 33 0 154 216 11 73 9.94e-13 64.3
MsG0580028022.01.T01 AT1G18960 32.812 128 77 5 121 247 10 129 1.54e-11 65.1
MsG0580028022.01.T01 AT1G14350 40.000 75 44 1 162 235 23 97 4.25e-11 64.3
MsG0580028022.01.T01 AT1G14350 40.000 75 44 1 162 235 23 97 4.25e-11 64.3

Find 72 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 124 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AGCCCAACGGTTTCCAATTT+TGG 0.083397 5:-73282422 None:intergenic
AAGCTTGATTCTTGAGTATT+TGG 0.147400 5:-73280946 None:intergenic
TCCAAGTGCATGTTGTAATT+TGG 0.158793 5:-73282829 None:intergenic
TCATTTGCGTCCTGATATTA+AGG 0.222411 5:+73281441 MsG0580028022.01.T01:CDS
AGTATGTTCCCTTACTCTTA+TGG 0.253114 5:+73280901 MsG0580028022.01.T01:CDS
CTTTCATGGATAGATTCTTA+TGG 0.253266 5:+73280836 MsG0580028022.01.T01:CDS
AGCAATATGGCGAAAGAAAA+TGG 0.253903 5:+73281356 MsG0580028022.01.T01:CDS
GTCAATGGCGTTAAAATCTT+TGG 0.273706 5:+73280787 MsG0580028022.01.T01:CDS
GTAGCTACACATGCCAAAAT+TGG 0.303292 5:+73282409 MsG0580028022.01.T01:CDS
ATCATTGGAATGCCACTAAA+AGG 0.314844 5:+73282491 MsG0580028022.01.T01:CDS
TTTCATGGATAGATTCTTAT+GGG 0.320364 5:+73280837 MsG0580028022.01.T01:CDS
CCAAGTGCATGTTGTAATTT+GGG 0.329240 5:-73282828 None:intergenic
CTTAAGGATATTCAAGGTTA+TGG 0.350445 5:+73281042 MsG0580028022.01.T01:CDS
TAAGGCACAATGTGGAAGTT+TGG 0.351661 5:-73281023 None:intergenic
GAATCAAGCTTTGTTGTTGA+TGG 0.356694 5:+73280958 MsG0580028022.01.T01:CDS
GCATGTTGTAATTTGGGTAT+TGG 0.376877 5:-73282822 None:intergenic
AACTTCCACATTGTGCCTTA+AGG 0.380633 5:+73281026 MsG0580028022.01.T01:CDS
ATAAAGTTGGTTAAGCAATA+TGG 0.389260 5:+73281343 MsG0580028022.01.T01:CDS
CAAATAGCTGAGAAGTTAGA+AGG 0.389483 5:+73281382 MsG0580028022.01.T01:CDS
AAATGTCAATGACCCTTTCA+TGG 0.400644 5:+73280822 MsG0580028022.01.T01:CDS
TTGTATGAAGTGTAATTCAT+TGG 0.411392 5:-73282728 None:intergenic
TCCATTGAAATCATGGTAAG+AGG 0.422796 5:+73280751 None:intergenic
ATATATCTAACCTTAATATC+AGG 0.434454 5:-73281451 None:intergenic
TGAGAGAGGTAAAGATCATA+AGG 0.438571 5:-73282880 None:intergenic
TTAAAGGAAACTGATAAAGT+TGG 0.449247 5:+73281330 MsG0580028022.01.T01:intron
AGCTGAGAAGTTAGAAGGAA+GGG 0.452156 5:+73281387 MsG0580028022.01.T01:CDS
GAGATAGCAAAGAAGATTCC+AGG 0.462177 5:+73282445 MsG0580028022.01.T01:CDS
ATGGTAAGAGGAGGAAATCA+TGG 0.470343 5:+73280763 MsG0580028022.01.T01:CDS
TTGTGCCTTAAGGATATTCA+AGG 0.475669 5:+73281036 MsG0580028022.01.T01:CDS
CATAACCTTGAATATCCTTA+AGG 0.482233 5:-73281041 None:intergenic
TGGTTGGAACCATAAGAGTA+AGG 0.488644 5:-73280910 None:intergenic
TGCCAAAATTGGAAACCGTT+GGG 0.495529 5:+73282420 MsG0580028022.01.T01:CDS
AAGTGTCGCATGAGAGGAAG+AGG 0.497010 5:-73282641 None:intergenic
CCCAAATTACAACATGCACT+TGG 0.498733 5:+73282828 MsG0580028022.01.T01:CDS
GCAATATGGCGAAAGAAAAT+GGG 0.501322 5:+73281357 MsG0580028022.01.T01:CDS
GTTCCAACCATGAGTTTATG+TGG 0.505567 5:+73280923 MsG0580028022.01.T01:CDS
ATGCCAAAATTGGAAACCGT+TGG 0.505828 5:+73282419 MsG0580028022.01.T01:CDS
GGAGGAAATCATGGGGTCAA+TGG 0.507214 5:+73280772 MsG0580028022.01.T01:CDS
AGAGGTAAAGATCATAAGGA+AGG 0.510605 5:-73282876 None:intergenic
AGTTATCCTTCCCACAATGT+TGG 0.513482 5:-73281073 None:intergenic
GGTGAAAACACCAACATTGT+GGG 0.515105 5:+73281063 MsG0580028022.01.T01:CDS
CATAAGAATCTATCCATGAA+AGG 0.517939 5:-73280835 None:intergenic
GAAGAATGAAACTAATTCCA+AGG 0.518190 5:+73282540 MsG0580028022.01.T01:CDS
AGGAAATTATTCATTGAGGT+AGG 0.519926 5:-73282856 None:intergenic
ATAAGAATCTATCCATGAAA+GGG 0.524626 5:-73280834 None:intergenic
TGGCCACATAAACTCATGGT+TGG 0.526915 5:-73280926 None:intergenic
TAGCTGAGAAGTTAGAAGGA+AGG 0.540309 5:+73281386 MsG0580028022.01.T01:CDS
TGGTGAAAACACCAACATTG+TGG 0.554704 5:+73281062 MsG0580028022.01.T01:CDS
GAGAAGTTAGAAGGAAGGGT+TGG 0.557009 5:+73281391 MsG0580028022.01.T01:CDS
AGGAAGGAAATTATTCATTG+AGG 0.563206 5:-73282860 None:intergenic
TGGTAAGAGGAGGAAATCAT+GGG 0.576546 5:+73280764 MsG0580028022.01.T01:CDS
ATGAGAGGAAGAGGGTATGT+TGG 0.586332 5:-73282632 None:intergenic
TATTTGGCCACATAAACTCA+TGG 0.590477 5:-73280930 None:intergenic
AAGAATGAAACTAATTCCAA+GGG 0.598750 5:+73282541 MsG0580028022.01.T01:CDS
ACTTCCGAGGTCTTGATCAA+AGG 0.601817 5:+73281105 MsG0580028022.01.T01:CDS
GGTTGGAACCATAAGAGTAA+GGG 0.602635 5:-73280909 None:intergenic
AGTGGACAAACGAAGAAGAC+AGG 0.603153 5:+73281130 MsG0580028022.01.T01:CDS
AAAGGAAAGTGTCGCATGAG+AGG 0.604782 5:-73282647 None:intergenic
CAAATGAAGAGGCTTTGAAG+TGG 0.621865 5:+73280989 MsG0580028022.01.T01:CDS
TCTTTGCTATCTCAGCCCAA+CGG 0.628371 5:-73282435 None:intergenic
TTCATGGATAGATTCTTATG+GGG 0.633304 5:+73280838 MsG0580028022.01.T01:CDS
ATTGAAATCATGGTAAGAGG+AGG 0.636458 5:+73280754 None:intergenic
TGGTGTCTTAGCAAATGAAG+AGG 0.638115 5:+73280978 MsG0580028022.01.T01:CDS
CTGTCCTTTGATCAAGACCT+CGG 0.642128 5:-73281109 None:intergenic
GCAAGCAGTGTAGAGAGCGA+TGG 0.650454 5:+73281413 MsG0580028022.01.T01:CDS
AAAACACCAACATTGTGGGA+AGG 0.651290 5:+73281067 MsG0580028022.01.T01:CDS
AATATCCTTAAGGCACAATG+TGG 0.654859 5:-73281031 None:intergenic
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AGTGTCGCATGAGAGGAAGA+GGG 0.721601 5:-73282640 None:intergenic
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CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!! ATTATATGAAATCAAAAAAT+GGG - Chr5:73281482-73281501 None:intergenic 10.0%
!! TAAAAATGTATGTAATTATT+TGG - Chr5:73282245-73282264 None:intergenic 10.0%
!!! TAATACTAATTATTTTACTT+GGG + Chr5:73282325-73282344 MsG0580028022.01.T01:intron 10.0%
!!! TATTTTGTAACTTTAAAAAA+AGG + Chr5:73281217-73281236 MsG0580028022.01.T01:intron 10.0%
!! GTTAAATTCATATCTTATAT+CGG + Chr5:73281152-73281171 MsG0580028022.01.T01:intron 15.0%
!! TCATAGTTCTTTATAAAAAA+TGG - Chr5:73281263-73281282 None:intergenic 15.0%
!! TTAAATTCATATCTTATATC+GGG + Chr5:73281153-73281172 MsG0580028022.01.T01:intron 15.0%
!!! AAAAAGTATCATTTATCAAA+GGG - Chr5:73281924-73281943 None:intergenic 15.0%
!!! ATTTAGATTCATATTTTTCA+AGG + Chr5:73281668-73281687 MsG0580028022.01.T01:intron 15.0%
!!! ATTTTGTGCTAAATTAATAA+TGG - Chr5:73281874-73281893 None:intergenic 15.0%
!!! GTAATACTAATTATTTTACT+TGG + Chr5:73282324-73282343 MsG0580028022.01.T01:intron 15.0%
!!! TGAAAATATGTTGTTTATTT+TGG - Chr5:73282045-73282064 None:intergenic 15.0%
!!! TTATTTGTTATGATGATTAA+AGG + Chr5:73281314-73281333 MsG0580028022.01.T01:intron 15.0%
!! AAAATGCCATAAAAAATCAT+TGG + Chr5:73282476-73282495 MsG0580028022.01.T01:CDS 20.0%
!! ATATATCTAACCTTAATATC+AGG - Chr5:73281454-73281473 None:intergenic 20.0%
!! ATGACATATTTCAAATGTTA+AGG - Chr5:73281978-73281997 None:intergenic 20.0%
!! CGATTAAAAAAGAATATAAG+AGG - Chr5:73281187-73281206 None:intergenic 20.0%
!!! ACTTTGAAATATGTTGTTTA+TGG - Chr5:73282081-73282100 None:intergenic 20.0%
!!! CAAAAAGTATCATTTATCAA+AGG - Chr5:73281925-73281944 None:intergenic 20.0%
!!! CCAGATTTTAAACATTTTTA+AGG + Chr5:73282134-73282153 MsG0580028022.01.T01:intron 20.0%
!!! CCTTAAAAATGTTTAAAATC+TGG - Chr5:73282137-73282156 None:intergenic 20.0%
!!! TGAAATATGTCATTTTTGAT+TGG + Chr5:73281985-73282004 MsG0580028022.01.T01:intron 20.0%
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! ATAAATCATCAATCTTGATG+TGG + Chr5:73281841-73281860 MsG0580028022.01.T01:intron 25.0%
! ATAAGAATCTATCCATGAAA+GGG - Chr5:73280837-73280856 None:intergenic 25.0%
! ATGTATGTAATTATTTGGAG+AGG - Chr5:73282240-73282259 None:intergenic 25.0%
! GAAGGTAATTCATTGAAAAA+AGG - Chr5:73282697-73282716 None:intergenic 25.0%
! TAAATCATCAATCTTGATGT+GGG + Chr5:73281842-73281861 MsG0580028022.01.T01:intron 25.0%
! TGAATCTAAATCTAGATCAT+CGG - Chr5:73281659-73281678 None:intergenic 25.0%
! TTAAAGGAAACTGATAAAGT+TGG + Chr5:73281330-73281349 MsG0580028022.01.T01:intron 25.0%
! TTGTATGAAGTGTAATTCAT+TGG - Chr5:73282731-73282750 None:intergenic 25.0%
! TTTCATGGATAGATTCTTAT+GGG + Chr5:73280837-73280856 MsG0580028022.01.T01:CDS 25.0%
!! AAATATAAGTATTGCATGTG+AGG - Chr5:73282204-73282223 None:intergenic 25.0%
!! ATAAAGTTGGTTAAGCAATA+TGG + Chr5:73281343-73281362 MsG0580028022.01.T01:CDS 25.0%
!! CTTCATACAACAAATTTTGA+TGG + Chr5:73282741-73282760 MsG0580028022.01.T01:CDS 25.0%
!! TATTTTCACAGAAAGATAGT+TGG + Chr5:73282362-73282381 MsG0580028022.01.T01:intron 25.0%
!!! GATATAGTTTTCAAGTATGT+AGG - Chr5:73282581-73282600 None:intergenic 25.0%
!!! GATTTGATTGATTTTCTTCA+TGG - Chr5:73282675-73282694 None:intergenic 25.0%
AAGCTTGATTCTTGAGTATT+TGG - Chr5:73280949-73280968 None:intergenic 30.0%
ACATATTCAACAATTGAGAG+AGG - Chr5:73282897-73282916 None:intergenic 30.0%
AGGAAATTATTCATTGAGGT+AGG - Chr5:73282859-73282878 None:intergenic 30.0%
AGGAAGGAAATTATTCATTG+AGG - Chr5:73282863-73282882 None:intergenic 30.0%
ATCTAGATCATCGGATAAAT+AGG - Chr5:73281650-73281669 None:intergenic 30.0%
CATAACCTTGAATATCCTTA+AGG - Chr5:73281044-73281063 None:intergenic 30.0%
CATAAGAATCTATCCATGAA+AGG - Chr5:73280838-73280857 None:intergenic 30.0%
CTTAAGGATATTCAAGGTTA+TGG + Chr5:73281042-73281061 MsG0580028022.01.T01:CDS 30.0%
CTTTCATGGATAGATTCTTA+TGG + Chr5:73280836-73280855 MsG0580028022.01.T01:CDS 30.0%
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TCATTGGAAAAAGATTCAGA+AGG - Chr5:73282715-73282734 None:intergenic 30.0%
TTCATGGATAGATTCTTATG+GGG + Chr5:73280838-73280857 MsG0580028022.01.T01:CDS 30.0%
! TGAATTTTGTCTCCTTTTAG+TGG - Chr5:73282506-73282525 None:intergenic 30.0%
! TTGATTTTCTTCATGGCTAA+AGG - Chr5:73282668-73282687 None:intergenic 30.0%
!! TACTTGCATTGTTTTGTTGA+TGG - Chr5:73280885-73280904 None:intergenic 30.0%
!! TGTTTGTTATCTGCATACAT+AGG + Chr5:73281716-73281735 MsG0580028022.01.T01:intron 30.0%
!!! CATTGTTTTGTTGATGGTTA+GGG - Chr5:73280879-73280898 None:intergenic 30.0%
!!! GGCATTCCAATGATTTTTTA+TGG - Chr5:73282485-73282504 None:intergenic 30.0%
!!! GTTGGTAATTTTTGTAGTGA+TGG - Chr5:73282617-73282636 None:intergenic 30.0%
!!! TTTTCAAGTATGTAGGACTT+TGG - Chr5:73282574-73282593 None:intergenic 30.0%
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AATATCCTTAAGGCACAATG+TGG - Chr5:73281034-73281053 None:intergenic 35.0%
AGAGGTAAAGATCATAAGGA+AGG - Chr5:73282879-73282898 None:intergenic 35.0%
AGCAATATGGCGAAAGAAAA+TGG + Chr5:73281356-73281375 MsG0580028022.01.T01:CDS 35.0%
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CAAATAGCTGAGAAGTTAGA+AGG + Chr5:73281382-73281401 MsG0580028022.01.T01:CDS 35.0%
CCAAGTGCATGTTGTAATTT+GGG - Chr5:73282831-73282850 None:intergenic 35.0%
GCAATATGGCGAAAGAAAAT+GGG + Chr5:73281357-73281376 MsG0580028022.01.T01:CDS 35.0%
GCATGTTGTAATTTGGGTAT+TGG - Chr5:73282825-73282844 None:intergenic 35.0%
GTCAATGGCGTTAAAATCTT+TGG + Chr5:73280787-73280806 MsG0580028022.01.T01:CDS 35.0%
TATTTGGCCACATAAACTCA+TGG - Chr5:73280933-73280952 None:intergenic 35.0%
TCATTTGCGTCCTGATATTA+AGG + Chr5:73281441-73281460 MsG0580028022.01.T01:CDS 35.0%
TCCAAGTGCATGTTGTAATT+TGG - Chr5:73282832-73282851 None:intergenic 35.0%
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! GGTAATTTTTGTAGTGATGG+AGG - Chr5:73282614-73282633 None:intergenic 35.0%
! TCAAGGATCTGTGTCTTTTA+GGG + Chr5:73281685-73281704 MsG0580028022.01.T01:intron 35.0%
! TGTGCTACTATATCATCCTA+GGG - Chr5:73281535-73281554 None:intergenic 35.0%
! TTCAAGGATCTGTGTCTTTT+AGG + Chr5:73281684-73281703 MsG0580028022.01.T01:intron 35.0%
! TTGTGCTACTATATCATCCT+AGG - Chr5:73281536-73281555 None:intergenic 35.0%
!! AACCTTACAGCTTTAGAACT+TGG + Chr5:73282171-73282190 MsG0580028022.01.T01:intron 35.0%
!! GAATCAAGCTTTGTTGTTGA+TGG + Chr5:73280958-73280977 MsG0580028022.01.T01:CDS 35.0%
!!! GCATTGTTTTGTTGATGGTT+AGG - Chr5:73280880-73280899 None:intergenic 35.0%
AAAACACCAACATTGTGGGA+AGG + Chr5:73281067-73281086 MsG0580028022.01.T01:CDS 40.0%
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AACTTCCACATTGTGCCTTA+AGG + Chr5:73281026-73281045 MsG0580028022.01.T01:CDS 40.0%
AGCTGAGAAGTTAGAAGGAA+GGG + Chr5:73281387-73281406 MsG0580028022.01.T01:CDS 40.0%
AGTTATCCTTCCCACAATGT+TGG - Chr5:73281076-73281095 None:intergenic 40.0%
ATGCCAAAATTGGAAACCGT+TGG + Chr5:73282419-73282438 MsG0580028022.01.T01:CDS 40.0%
ATGGTAAGAGGAGGAAATCA+TGG + Chr5:73280763-73280782 MsG0580028022.01.T01:CDS 40.0%
CCCAAATTACAACATGCACT+TGG + Chr5:73282828-73282847 MsG0580028022.01.T01:CDS 40.0%
GAGATAGCAAAGAAGATTCC+AGG + Chr5:73282445-73282464 MsG0580028022.01.T01:CDS 40.0%
GGTGAAAACACCAACATTGT+GGG + Chr5:73281063-73281082 MsG0580028022.01.T01:CDS 40.0%
GGTTGGAACCATAAGAGTAA+GGG - Chr5:73280912-73280931 None:intergenic 40.0%
GTAGCTACACATGCCAAAAT+TGG + Chr5:73282409-73282428 MsG0580028022.01.T01:CDS 40.0%
GTTCCAACCATGAGTTTATG+TGG + Chr5:73280923-73280942 MsG0580028022.01.T01:CDS 40.0%
TAAGGCACAATGTGGAAGTT+TGG - Chr5:73281026-73281045 None:intergenic 40.0%
TAGCTGAGAAGTTAGAAGGA+AGG + Chr5:73281386-73281405 MsG0580028022.01.T01:CDS 40.0%
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TGGTTGGAACCATAAGAGTA+AGG - Chr5:73280913-73280932 None:intergenic 40.0%
TTGTGCTTGAATTTGACCCT+AGG + Chr5:73281516-73281535 MsG0580028022.01.T01:intron 40.0%
! ATGGCATTTTCAGTTCTTCC+TGG - Chr5:73282466-73282485 None:intergenic 40.0%
!! CAAATGAAGAGGCTTTGAAG+TGG + Chr5:73280989-73281008 MsG0580028022.01.T01:CDS 40.0%
!! TGCCAAGTTCTAAAGCTGTA+AGG - Chr5:73282176-73282195 None:intergenic 40.0%
!! TTTTGTAGTGATGGAGGTGT+TGG - Chr5:73282608-73282627 None:intergenic 40.0%
ACTTCCGAGGTCTTGATCAA+AGG + Chr5:73281105-73281124 MsG0580028022.01.T01:CDS 45.0%
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CTGTCCTTTGATCAAGACCT+CGG - Chr5:73281112-73281131 None:intergenic 45.0%
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GGTAAGAGGAGGAAATCATG+GGG + Chr5:73280765-73280784 MsG0580028022.01.T01:CDS 45.0%
TGGCCACATAAACTCATGGT+TGG - Chr5:73280929-73280948 None:intergenic 45.0%
! AGCCCAACGGTTTCCAATTT+TGG - Chr5:73282425-73282444 None:intergenic 45.0%
! ATGAGAGGAAGAGGGTATGT+TGG - Chr5:73282635-73282654 None:intergenic 45.0%
! TCTTTGCTATCTCAGCCCAA+CGG - Chr5:73282438-73282457 None:intergenic 45.0%
!! AAAGGAAAGTGTCGCATGAG+AGG - Chr5:73282650-73282669 None:intergenic 45.0%
!!! GGACTTTGGTTTTGATCCCT+TGG - Chr5:73282560-73282579 None:intergenic 45.0%
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GCAAGCAGTGTAGAGAGCGA+TGG + Chr5:73281413-73281432 MsG0580028022.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 73280763 73282918 73280763 ID=MsG0580028022.01;Name=MsG0580028022.01
Chr5 mRNA 73280763 73282918 73280763 ID=MsG0580028022.01.T01;Parent=MsG0580028022.01;Name=MsG0580028022.01.T01;_AED=0.11;_eAED=0.11;_QI=0|0|0|1|1|1|3|0|353
Chr5 exon 73280763 73281151 73280763 ID=MsG0580028022.01.T01:exon:5445;Parent=MsG0580028022.01.T01
Chr5 exon 73281336 73281462 73281336 ID=MsG0580028022.01.T01:exon:5444;Parent=MsG0580028022.01.T01
Chr5 exon 73282373 73282918 73282373 ID=MsG0580028022.01.T01:exon:5443;Parent=MsG0580028022.01.T01
Chr5 CDS 73280763 73281151 73280763 ID=MsG0580028022.01.T01:cds;Parent=MsG0580028022.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0580028022.01.T01

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Protein sequence

>MsG0580028022.01.T01

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