AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680031493.01

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MsG0680031493.01.T01 AT5G51630 34.597 211 122 7 203 407 71 271 1.06e-25 110
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MsG0680031493.01.T01 AT4G16950 33.019 212 129 8 200 407 137 339 5.19e-23 102
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MsG0680031493.01.T01 AT5G38340 35.981 214 128 5 200 407 178 388 2.94e-25 108
MsG0680031493.01.T01 AT5G38340 43.103 116 64 2 17 132 57 170 1.20e-20 95.1
MsG0680031493.01.T01 AT1G27180 31.982 222 134 5 191 398 290 508 3.06e-25 108
MsG0680031493.01.T01 AT1G27180 40.299 134 77 3 15 146 174 306 1.98e-23 103
MsG0680031493.01.T01 AT1G27180 37.097 124 69 3 17 137 17 134 8.00e-16 80.5
MsG0680031493.01.T01 AT5G44510 36.406 217 120 5 200 407 161 368 5.21e-25 108
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MsG0680031493.01.T01 AT1G72840 37.264 212 121 5 200 407 138 341 1.80e-24 106
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MsG0680031493.01.T01 AT4G16920 30.909 220 142 6 191 407 121 333 5.65e-24 105
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MsG0680031493.01.T01 AT4G16920 30.909 220 142 6 191 407 121 333 6.43e-24 105
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MsG0680031493.01.T01 AT5G46490 33.036 224 120 10 200 404 130 342 9.87e-18 85.9
MsG0680031493.01.T01 AT1G56520 41.892 148 79 4 7 151 3 146 2.03e-23 103
MsG0680031493.01.T01 AT1G56520 32.579 221 121 8 200 407 134 339 8.80e-22 98.2
MsG0680031493.01.T01 AT4G19530 26.984 378 223 11 17 391 15 342 2.04e-23 103
MsG0680031493.01.T01 AT4G16860 31.364 220 141 6 191 407 125 337 2.14e-23 103
MsG0680031493.01.T01 AT4G16860 44.828 116 62 2 17 132 13 126 2.17e-20 94.4
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MsG0680031493.01.T01 AT5G46270 39.041 146 84 2 15 160 21 161 7.84e-22 98.6
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MsG0680031493.01.T01 AT1G56520 32.174 230 128 8 191 407 125 339 1.25e-21 97.8
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MsG0680031493.01.T01 AT5G11250 41.667 108 56 3 44 146 7 112 8.08e-16 80.1
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MsG0680031493.01.T01 AT5G46490 33.032 221 118 10 203 404 173 382 4.12e-18 87.0
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MsG0680031493.01.T01 AT3G44400 40.000 125 73 2 8 132 39 161 3.14e-21 96.7
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MsG0680031493.01.T01 AT5G48780 36.090 133 80 2 267 398 455 583 2.86e-16 81.3
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MsG0680031493.01.T01 AT4G12020 28.070 228 136 8 190 404 757 969 7.95e-21 95.9
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MsG0680031493.01.T01 AT4G12020 28.070 228 136 8 190 404 757 969 8.29e-21 95.9
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MsG0680031493.01.T01 AT5G46520 30.734 218 128 7 203 404 171 381 5.18e-15 77.8
MsG0680031493.01.T01 AT4G16860 33.333 180 112 5 231 407 1 175 1.10e-20 95.1
MsG0680031493.01.T01 AT4G12020 28.070 228 136 8 190 404 757 969 1.35e-20 95.1
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MsG0680031493.01.T01 AT1G09665 33.636 110 70 3 19 128 12 118 5.90e-14 69.7
MsG0680031493.01.T01 AT5G45070 33.333 129 83 3 19 147 16 141 6.73e-14 72.8
MsG0680031493.01.T01 AT1G51270 35.606 132 77 5 1 127 167 295 7.04e-14 72.8
MsG0680031493.01.T01 AT1G65390 33.987 153 94 4 19 171 24 169 8.93e-14 72.8
MsG0680031493.01.T01 AT5G45200 38.583 127 69 4 17 138 19 141 1.18e-13 73.6
MsG0680031493.01.T01 AT5G45200 32.215 149 92 2 257 399 218 363 2.17e-12 69.7
MsG0680031493.01.T01 AT5G45200 38.583 127 69 4 17 138 19 141 1.43e-13 73.2
MsG0680031493.01.T01 AT5G45200 32.215 149 92 2 257 399 218 363 2.69e-12 69.3
MsG0680031493.01.T01 AT1G60320 34.746 118 74 3 15 132 22 136 1.54e-13 68.9
MsG0680031493.01.T01 AT4G11340 29.885 174 102 5 17 176 224 391 1.81e-13 72.4
MsG0680031493.01.T01 AT5G45260 34.711 121 71 2 279 398 175 288 1.85e-13 73.2
MsG0680031493.01.T01 AT5G45260 34.711 121 71 2 279 398 175 288 1.93e-13 72.8
MsG0680031493.01.T01 AT5G45260 34.711 121 71 2 279 398 175 288 1.93e-13 72.8
MsG0680031493.01.T01 AT1G72850 29.779 272 151 9 145 398 58 307 2.54e-13 71.6
MsG0680031493.01.T01 AT2G32140 33.588 131 80 4 19 147 23 148 3.35e-13 70.9
MsG0680031493.01.T01 AT5G45230 37.931 116 66 3 19 130 13 126 4.39e-13 71.6
MsG0680031493.01.T01 AT4G23515 35.455 110 68 2 19 128 11 117 5.90e-13 69.7
MsG0680031493.01.T01 AT4G23515 35.455 110 68 2 19 128 11 117 6.31e-13 69.3
MsG0680031493.01.T01 AT1G47370 38.182 110 65 3 19 128 16 122 7.52e-13 69.7
MsG0680031493.01.T01 AT1G52900 33.981 103 63 1 17 119 38 135 8.86e-13 67.4
MsG0680031493.01.T01 AT4G19920 33.051 118 76 3 19 136 52 166 5.23e-12 66.2
MsG0680031493.01.T01 AT2G16870 51.724 58 28 0 350 407 9 66 7.72e-12 67.8
MsG0680031493.01.T01 AT2G16870 51.724 58 28 0 350 407 9 66 7.72e-12 67.8
MsG0680031493.01.T01 AT5G45210 26.961 204 135 5 195 398 147 336 1.61e-11 66.6
MsG0680031493.01.T01 AT5G45240 26.794 209 138 6 200 407 108 302 2.05e-11 66.2
MsG0680031493.01.T01 AT5G45210 26.961 204 135 5 195 398 147 336 2.06e-11 66.2
MsG0680031493.01.T01 AT5G45240 26.794 209 138 6 200 407 108 302 2.26e-11 66.2
MsG0680031493.01.T01 AT5G45210 27.094 203 134 5 196 398 148 336 2.54e-11 65.9
MsG0680031493.01.T01 AT5G45210 27.094 203 134 5 196 398 139 327 2.81e-11 65.9
MsG0680031493.01.T01 AT5G45210 27.094 203 134 5 196 398 120 308 3.31e-11 65.5
MsG0680031493.01.T01 AT1G61105 29.464 112 74 1 8 119 20 126 3.60e-11 62.4
MsG0680031493.01.T01 AT5G44870 30.328 122 84 1 279 399 15 136 4.03e-11 65.5

Find 82 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 94 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TATAAAGCTCTTTGTGAAAA+TGG 0.197981 6:+21160320 MsG0680031493.01.T01:CDS
GTAATCTTCCTTATTGTATT+GGG 0.222257 6:-21160771 None:intergenic
AAATACGAGCACGAGATTAT+TGG 0.266297 6:+21160989 MsG0680031493.01.T01:CDS
TGTCACAGCCTCTAAAATTT+AGG 0.275587 6:-21160271 None:intergenic
CTATGAGAATAGAAAATAAA+TGG 0.296144 6:-21160698 None:intergenic
TACGAGAAGGAAGAGGAATT+TGG 0.301802 6:-21160227 None:intergenic
TGTAATCTTCCTTATTGTAT+TGG 0.327853 6:-21160772 None:intergenic
ATTGGATTGAATATTAAGTT+AGG 0.332847 6:+21161313 MsG0680031493.01.T01:CDS
TCTCAAGTTCGACGTCAAAC+TGG 0.337952 6:+21160560 MsG0680031493.01.T01:CDS
AAATGGAAGTATGGAAAGTA+TGG 0.345369 6:-21160681 None:intergenic
AATACGAGCACGAGATTATT+GGG 0.370807 6:+21160990 MsG0680031493.01.T01:CDS
GTTTGCATGGTCGGGGTGTA+TGG 0.373201 6:+21161139 MsG0680031493.01.T01:CDS
ATAGAAAATAAATGGAAGTA+TGG 0.379329 6:-21160690 None:intergenic
AATAGAACGATTGATCTTGT+TGG 0.380743 6:-21161032 None:intergenic
CGAGAAGTTGCTAACTTGTC+TGG 0.382337 6:+21160839 MsG0680031493.01.T01:CDS
TTTGTGAGAGGAGCTTCTCT+TGG 0.387777 6:-21161288 None:intergenic
ATCTGAGGCTCAAGTTCAAT+GGG 0.390887 6:-21161073 None:intergenic
TGAACTTGAGCCTCAGATAA+TGG 0.391371 6:+21161078 MsG0680031493.01.T01:CDS
ACATCGAAAGAAGGTTCTAT+TGG 0.399700 6:+21161375 MsG0680031493.01.T01:CDS
GTGAGAGGAGCTTCTCTTGG+AGG 0.400647 6:-21161285 None:intergenic
CATGGAAAGGATGATGTAGA+TGG 0.401987 6:-21160654 None:intergenic
AGGATCAAGTTTGCATGGTC+GGG 0.403120 6:+21161131 MsG0680031493.01.T01:CDS
AAGCTCCTCTCACAAACAAT+TGG 0.407871 6:+21161295 MsG0680031493.01.T01:CDS
TGTCCTTCCCCAATACAATA+AGG 0.410375 6:+21160763 MsG0680031493.01.T01:CDS
AAGCAACTGCAATTCATTGC+TGG 0.410432 6:+21161421 MsG0680031493.01.T01:CDS
AGAGGCTGTGACACTCGCTT+TGG 0.411061 6:+21160281 MsG0680031493.01.T01:CDS
ATCTGGAGCTGTGAATGATA+TGG 0.413954 6:-21160490 None:intergenic
TATCTGAGGCTCAAGTTCAA+TGG 0.431804 6:-21161074 None:intergenic
AATTCCTCTTCCTTCTCGTA+TGG 0.441448 6:+21160230 MsG0680031493.01.T01:CDS
CTAACTTGTCTGGCTACCAT+TGG 0.445651 6:+21160849 MsG0680031493.01.T01:CDS
ACATGGAGAGGGTGCATGAA+TGG 0.451946 6:+21160804 MsG0680031493.01.T01:CDS
ATCTATATACTATACATTTG+AGG 0.452220 6:+21161520 MsG0680031493.01.T01:CDS
GCTGGAGGACTTGATTGGTT+TGG 0.456269 6:+21161439 MsG0680031493.01.T01:CDS
GGATCGACATCATAGAAAAC+AGG 0.460550 6:-21160536 None:intergenic
ATGGTCGGGGTGTATGGAAT+TGG 0.467349 6:+21161145 MsG0680031493.01.T01:CDS
TCATTGCTGGAGGACTTGAT+TGG 0.468308 6:+21161434 MsG0680031493.01.T01:CDS
TCTATATACTATACATTTGA+GGG 0.471036 6:+21161521 MsG0680031493.01.T01:CDS
GTGTATGGAATTGGAGGCTT+GGG 0.472091 6:+21161154 MsG0680031493.01.T01:CDS
ATGATGATGACTATTTGATC+TGG 0.487787 6:-21160507 None:intergenic
CTCAAGTTCGACGTCAAACT+GGG 0.490248 6:+21160561 MsG0680031493.01.T01:CDS
TATGGAAAGTATGGAAAGCA+TGG 0.495036 6:-21160672 None:intergenic
CTTCCTTATTGTATTGGGGA+AGG 0.506438 6:-21160766 None:intergenic
TTCAATTCAACCTGCTCCAA+TGG 0.513673 6:-21160865 None:intergenic
TGTCTGGCTACCATTGGAGC+AGG 0.513835 6:+21160855 MsG0680031493.01.T01:CDS
CGACGTCAAACTGGGAGCTA+TGG 0.513845 6:+21160569 MsG0680031493.01.T01:CDS
ATGGAAAGGATGATGTAGAT+GGG 0.516785 6:-21160653 None:intergenic
GGACTTGATTGGTTTGGTAG+TGG 0.525043 6:+21161445 MsG0680031493.01.T01:CDS
AAGAAGCATAGTTGATAGAG+AGG 0.525348 6:-21160442 None:intergenic
GGTGTATGGAATTGGAGGCT+TGG 0.526010 6:+21161153 MsG0680031493.01.T01:CDS
GTCGGGGTGTATGGAATTGG+AGG 0.531863 6:+21161148 MsG0680031493.01.T01:CDS
GAGGATCAAGTTTGCATGGT+CGG 0.544291 6:+21161130 MsG0680031493.01.T01:CDS
TCGATTGCCTTGACAAGTGA+TGG 0.547113 6:-21160395 None:intergenic
TCAATCCAATTGTTTGTGAG+AGG 0.551040 6:-21161300 None:intergenic
AAGTTAGGAGATGTGGATGA+AGG 0.554283 6:+21161328 MsG0680031493.01.T01:CDS
AAAGAGGCTACATCGAAAGA+AGG 0.557400 6:+21161366 MsG0680031493.01.T01:CDS
GCATAGTTGATAGAGAGGAC+TGG 0.563218 6:-21160437 None:intergenic
TAGTGAGGATCAAGTTTGCA+TGG 0.563772 6:+21161126 MsG0680031493.01.T01:CDS
AGATTACACTGATTATTACA+TGG 0.569825 6:+21160787 MsG0680031493.01.T01:CDS
GAATATTAAGTTAGGAGATG+TGG 0.573741 6:+21161321 MsG0680031493.01.T01:CDS
GAATCCATACGAGAAGGAAG+AGG 0.584305 6:-21160234 None:intergenic
GGATCAAGTTTGCATGGTCG+GGG 0.585130 6:+21161132 MsG0680031493.01.T01:CDS
AGAGAAAATTCCGCTAAGCA+TGG 0.587131 6:+21161253 MsG0680031493.01.T01:CDS
TAATCTTCCTTATTGTATTG+GGG 0.591077 6:-21160770 None:intergenic
CACTGATTATTACATGGAGA+GGG 0.592757 6:+21160793 MsG0680031493.01.T01:CDS
GATGATACACAGCTTCATAG+AGG 0.595967 6:+21160359 MsG0680031493.01.T01:CDS
AAAATTTAGGAAAACATCGT+AGG 0.597337 6:-21160258 None:intergenic
GTTTGACGTCGAACTTGAGA+AGG 0.601272 6:-21160557 None:intergenic
AATCTCACCATCACTTGTCA+AGG 0.602170 6:+21160388 MsG0680031493.01.T01:CDS
CGATGTACTTCCATTATCTG+AGG 0.611474 6:-21161088 None:intergenic
ACACTGATTATTACATGGAG+AGG 0.613101 6:+21160792 MsG0680031493.01.T01:CDS
GAAGAGGAATTTGGTTGCAG+CGG 0.624307 6:-21160218 None:intergenic
AAGCTGTGTATCATCAATGA+AGG 0.633397 6:-21160351 None:intergenic
GATGATGAGTAGGAGGGTGA+TGG 0.640646 6:-21160726 None:intergenic
GTAGGTGAATCCATACGAGA+AGG 0.641059 6:-21160240 None:intergenic
GATGATGATGATGAGTAGGA+GGG 0.641459 6:-21160732 None:intergenic
CAACTGCAATTCATTGCTGG+AGG 0.642215 6:+21161424 MsG0680031493.01.T01:CDS
AAAGTATGGAAAGCATGGAA+AGG 0.650597 6:-21160667 None:intergenic
AAAAGAGGTTCCAAAATACA+CGG 0.655740 6:+21160612 MsG0680031493.01.T01:CDS
TGGAAAGGATGATGTAGATG+GGG 0.658239 6:-21160652 None:intergenic
TACACAGCTTCATAGAGGCG+AGG 0.680586 6:+21160364 MsG0680031493.01.T01:CDS
GAGGGTGCATGAATGGAACA+TGG 0.700605 6:+21160811 MsG0680031493.01.T01:CDS
TCTGAGGCTCAAGTTCAATG+GGG 0.761669 6:-21161072 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATTATTAAATTATGAATACA+TGG + Chr6:21160901-21160920 MsG0680031493.01.T01:intron 10.0%
!!! TATTCAAACTTTTTTTGAAT+GGG + Chr6:21160953-21160972 MsG0680031493.01.T01:intron 15.0%
!!! TTATTCAAACTTTTTTTGAA+TGG + Chr6:21160952-21160971 MsG0680031493.01.T01:intron 15.0%
!! ATAGAAAATAAATGGAAGTA+TGG - Chr6:21160693-21160712 None:intergenic 20.0%
!! ATTGGATTGAATATTAAGTT+AGG + Chr6:21161313-21161332 MsG0680031493.01.T01:CDS 20.0%
!! CTATGAGAATAGAAAATAAA+TGG - Chr6:21160701-21160720 None:intergenic 20.0%
!! GAATTACAATCATAAAAAAG+AGG + Chr6:21161350-21161369 MsG0680031493.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTGAATAAATCTGTTAGTA+TGG - Chr6:21160941-21160960 None:intergenic 20.0%
! AAAATTTAGGAAAACATCGT+AGG - Chr6:21160261-21160280 None:intergenic 25.0%
! GTAATCTTCCTTATTGTATT+GGG - Chr6:21160774-21160793 None:intergenic 25.0%
! TAATCTTCCTTATTGTATTG+GGG - Chr6:21160773-21160792 None:intergenic 25.0%
! TATAAAGCTCTTTGTGAAAA+TGG + Chr6:21160320-21160339 MsG0680031493.01.T01:CDS 25.0%
! TGTAATCTTCCTTATTGTAT+TGG - Chr6:21160775-21160794 None:intergenic 25.0%
!! AGATTACACTGATTATTACA+TGG + Chr6:21160787-21160806 MsG0680031493.01.T01:CDS 25.0%
!! GATGTTTTCCTAAATTTTAG+AGG + Chr6:21160263-21160282 MsG0680031493.01.T01:CDS 25.0%
!!! TATACTTTTTCCGTGTATTT+TGG - Chr6:21160625-21160644 None:intergenic 25.0%
!!! TGCTTCTTCTTTATTTTGTT+TGG + Chr6:21160457-21160476 MsG0680031493.01.T01:CDS 25.0%
AAAAGAGGTTCCAAAATACA+CGG + Chr6:21160612-21160631 MsG0680031493.01.T01:CDS 30.0%
AATAGAACGATTGATCTTGT+TGG - Chr6:21161035-21161054 None:intergenic 30.0%
CTATAGCTAAGCATAAAAAG+AGG + Chr6:21160597-21160616 MsG0680031493.01.T01:CDS 30.0%
GAATATTAAGTTAGGAGATG+TGG + Chr6:21161321-21161340 MsG0680031493.01.T01:CDS 30.0%
! AAATGGAAGTATGGAAAGTA+TGG - Chr6:21160684-21160703 None:intergenic 30.0%
! ATGATGATGACTATTTGATC+TGG - Chr6:21160510-21160529 None:intergenic 30.0%
AAATACGAGCACGAGATTAT+TGG + Chr6:21160989-21161008 MsG0680031493.01.T01:CDS 35.0%
AAGCTGTGTATCATCAATGA+AGG - Chr6:21160354-21160373 None:intergenic 35.0%
AATACGAGCACGAGATTATT+GGG + Chr6:21160990-21161009 MsG0680031493.01.T01:CDS 35.0%
ACATCGAAAGAAGGTTCTAT+TGG + Chr6:21161375-21161394 MsG0680031493.01.T01:CDS 35.0%
ATGGAAAGGATGATGTAGAT+GGG - Chr6:21160656-21160675 None:intergenic 35.0%
TCAATCCAATTGTTTGTGAG+AGG - Chr6:21161303-21161322 None:intergenic 35.0%
! AAAGTATGGAAAGCATGGAA+AGG - Chr6:21160670-21160689 None:intergenic 35.0%
! ACACTGATTATTACATGGAG+AGG + Chr6:21160792-21160811 MsG0680031493.01.T01:CDS 35.0%
! ACTTCTCAGATCTTTTAGTG+AGG + Chr6:21161111-21161130 MsG0680031493.01.T01:CDS 35.0%
! CACTGATTATTACATGGAGA+GGG + Chr6:21160793-21160812 MsG0680031493.01.T01:CDS 35.0%
! GTTTTCTAAACCATGCTTAG+CGG - Chr6:21161266-21161285 None:intergenic 35.0%
! TATGGAAAGTATGGAAAGCA+TGG - Chr6:21160675-21160694 None:intergenic 35.0%
! TGATGATGATGATGATGAGT+AGG - Chr6:21160739-21160758 None:intergenic 35.0%
!! AAGAAGCATAGTTGATAGAG+AGG - Chr6:21160445-21160464 None:intergenic 35.0%
!! TGTCACAGCCTCTAAAATTT+AGG - Chr6:21160274-21160293 None:intergenic 35.0%
AAAGAGGCTACATCGAAAGA+AGG + Chr6:21161366-21161385 MsG0680031493.01.T01:CDS 40.0%
AAGCAACTGCAATTCATTGC+TGG + Chr6:21161421-21161440 MsG0680031493.01.T01:CDS 40.0%
AAGCTCCTCTCACAAACAAT+TGG + Chr6:21161295-21161314 MsG0680031493.01.T01:CDS 40.0%
AAGTTAGGAGATGTGGATGA+AGG + Chr6:21161328-21161347 MsG0680031493.01.T01:CDS 40.0%
AATCTCACCATCACTTGTCA+AGG + Chr6:21160388-21160407 MsG0680031493.01.T01:CDS 40.0%
AATTCCTCTTCCTTCTCGTA+TGG + Chr6:21160230-21160249 MsG0680031493.01.T01:CDS 40.0%
AGAGAAAATTCCGCTAAGCA+TGG + Chr6:21161253-21161272 MsG0680031493.01.T01:CDS 40.0%
CATGGAAAGGATGATGTAGA+TGG - Chr6:21160657-21160676 None:intergenic 40.0%
CGATGTACTTCCATTATCTG+AGG - Chr6:21161091-21161110 None:intergenic 40.0%
CTTCCTTATTGTATTGGGGA+AGG - Chr6:21160769-21160788 None:intergenic 40.0%
GATGATACACAGCTTCATAG+AGG + Chr6:21160359-21160378 MsG0680031493.01.T01:CDS 40.0%
GGATCGACATCATAGAAAAC+AGG - Chr6:21160539-21160558 None:intergenic 40.0%
TACGAGAAGGAAGAGGAATT+TGG - Chr6:21160230-21160249 None:intergenic 40.0%
TAGTGAGGATCAAGTTTGCA+TGG + Chr6:21161126-21161145 MsG0680031493.01.T01:CDS 40.0%
TGAACTTGAGCCTCAGATAA+TGG + Chr6:21161078-21161097 MsG0680031493.01.T01:CDS 40.0%
TGGAAAGGATGATGTAGATG+GGG - Chr6:21160655-21160674 None:intergenic 40.0%
TGTCCTTCCCCAATACAATA+AGG + Chr6:21160763-21160782 MsG0680031493.01.T01:CDS 40.0%
TTCAATTCAACCTGCTCCAA+TGG - Chr6:21160868-21160887 None:intergenic 40.0%
! ATCTGAGGCTCAAGTTCAAT+GGG - Chr6:21161076-21161095 None:intergenic 40.0%
! ATCTGGAGCTGTGAATGATA+TGG - Chr6:21160493-21160512 None:intergenic 40.0%
! GATGATGATGATGAGTAGGA+GGG - Chr6:21160735-21160754 None:intergenic 40.0%
! TATCTGAGGCTCAAGTTCAA+TGG - Chr6:21161077-21161096 None:intergenic 40.0%
! TGATGATGATGATGAGTAGG+AGG - Chr6:21160736-21160755 None:intergenic 40.0%
AGGATCAAGTTTGCATGGTC+GGG + Chr6:21161131-21161150 MsG0680031493.01.T01:CDS 45.0%
CAACTGCAATTCATTGCTGG+AGG + Chr6:21161424-21161443 MsG0680031493.01.T01:CDS 45.0%
CTCAAGTTCGACGTCAAACT+GGG + Chr6:21160561-21160580 MsG0680031493.01.T01:CDS 45.0%
GAAGAGGAATTTGGTTGCAG+CGG - Chr6:21160221-21160240 None:intergenic 45.0%
GAATCCATACGAGAAGGAAG+AGG - Chr6:21160237-21160256 None:intergenic 45.0%
GAGGATCAAGTTTGCATGGT+CGG + Chr6:21161130-21161149 MsG0680031493.01.T01:CDS 45.0%
GTAGGTGAATCCATACGAGA+AGG - Chr6:21160243-21160262 None:intergenic 45.0%
GTGTATGGAATTGGAGGCTT+GGG + Chr6:21161154-21161173 MsG0680031493.01.T01:CDS 45.0%
GTTTGACGTCGAACTTGAGA+AGG - Chr6:21160560-21160579 None:intergenic 45.0%
TCATTGCTGGAGGACTTGAT+TGG + Chr6:21161434-21161453 MsG0680031493.01.T01:CDS 45.0%
TCGATTGCCTTGACAAGTGA+TGG - Chr6:21160398-21160417 None:intergenic 45.0%
TCTCAAGTTCGACGTCAAAC+TGG + Chr6:21160560-21160579 MsG0680031493.01.T01:CDS 45.0%
TTTGTGAGAGGAGCTTCTCT+TGG - Chr6:21161291-21161310 None:intergenic 45.0%
! CGAGAAGTTGCTAACTTGTC+TGG + Chr6:21160839-21160858 MsG0680031493.01.T01:CDS 45.0%
! CTAACTTGTCTGGCTACCAT+TGG + Chr6:21160849-21160868 MsG0680031493.01.T01:CDS 45.0%
! TCTGAGGCTCAAGTTCAATG+GGG - Chr6:21161075-21161094 None:intergenic 45.0%
!! GCATAGTTGATAGAGAGGAC+TGG - Chr6:21160440-21160459 None:intergenic 45.0%
!! GGACTTGATTGGTTTGGTAG+TGG + Chr6:21161445-21161464 MsG0680031493.01.T01:CDS 45.0%
!!! GACACTCGCTTTGGTTTTAC+AGG + Chr6:21160290-21160309 MsG0680031493.01.T01:CDS 45.0%
ATGGTCGGGGTGTATGGAAT+TGG + Chr6:21161145-21161164 MsG0680031493.01.T01:CDS 50.0%
GATGATGAGTAGGAGGGTGA+TGG - Chr6:21160729-21160748 None:intergenic 50.0%
GGATCAAGTTTGCATGGTCG+GGG + Chr6:21161132-21161151 MsG0680031493.01.T01:CDS 50.0%
GGTGTATGGAATTGGAGGCT+TGG + Chr6:21161153-21161172 MsG0680031493.01.T01:CDS 50.0%
TACACAGCTTCATAGAGGCG+AGG + Chr6:21160364-21160383 MsG0680031493.01.T01:CDS 50.0%
! ACATGGAGAGGGTGCATGAA+TGG + Chr6:21160804-21160823 MsG0680031493.01.T01:CDS 50.0%
! GAGGGTGCATGAATGGAACA+TGG + Chr6:21160811-21160830 MsG0680031493.01.T01:CDS 50.0%
! GCTGGAGGACTTGATTGGTT+TGG + Chr6:21161439-21161458 MsG0680031493.01.T01:CDS 50.0%
AGAGGCTGTGACACTCGCTT+TGG + Chr6:21160281-21160300 MsG0680031493.01.T01:CDS 55.0%
CGACGTCAAACTGGGAGCTA+TGG + Chr6:21160569-21160588 MsG0680031493.01.T01:CDS 55.0%
GTCGGGGTGTATGGAATTGG+AGG + Chr6:21161148-21161167 MsG0680031493.01.T01:CDS 55.0%
GTGAGAGGAGCTTCTCTTGG+AGG - Chr6:21161288-21161307 None:intergenic 55.0%
GTTTGCATGGTCGGGGTGTA+TGG + Chr6:21161139-21161158 MsG0680031493.01.T01:CDS 55.0%
TGTCTGGCTACCATTGGAGC+AGG + Chr6:21160855-21160874 MsG0680031493.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 21160212 21161540 21160212 ID=MsG0680031493.01;Name=MsG0680031493.01
Chr6 mRNA 21160212 21161540 21160212 ID=MsG0680031493.01.T01;Parent=MsG0680031493.01;Name=MsG0680031493.01.T01;_AED=0.27;_eAED=0.29;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|408
Chr6 exon 21160212 21160876 21160212 ID=MsG0680031493.01.T01:exon:13380;Parent=MsG0680031493.01.T01
Chr6 exon 21160979 21161540 21160979 ID=MsG0680031493.01.T01:exon:13381;Parent=MsG0680031493.01.T01
Chr6 CDS 21160212 21160876 21160212 ID=MsG0680031493.01.T01:cds;Parent=MsG0680031493.01.T01
Chr6 CDS 21160979 21161540 21160979 ID=MsG0680031493.01.T01:cds;Parent=MsG0680031493.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680031493.01.T01

ATGACACCGCTGCAACCAAATTCCTCTTCCTTCTCGTATGGATTCACCTACGATGTTTTCCTAAATTTTAGAGGCTGTGACACTCGCTTTGGTTTTACAGGTCATCTCTATAAAGCTCTTTGTGAAAATGGAATTCACACCTTCATTGATGATACACAGCTTCATAGAGGCGAGGAAATCTCACCATCACTTGTCAAGGCAATCGAAGAGTCTATGATTTACATTCCAGTCCTCTCTATCAACTATGCTTCTTCTTTATTTTGTTTGGACGAACTTGTCCATATCATTCACAGCTCCAGATCAAATAGTCATCATCATATTTTGCCTGTTTTCTATGATGTCGATCCTTCTCAAGTTCGACGTCAAACTGGGAGCTATGGCAAAGCTATAGCTAAGCATAAAAAGAGGTTCCAAAATACACGGAAAAAGTATAAGCAGTACCCCATCTACATCATCCTTTCCATGCTTTCCATACTTTCCATACTTCCATTTATTTTCTATTCTCATAGTTCTACCATCACCCTCCTACTCATCATCATCATCATCATCGTTGTCCTTCCCCAATACAATAAGGAAGATTACACTGATTATTACATGGAGAGGGTGCATGAATGGAACATGGCTCTTCGAGAAGTTGCTAACTTGTCTGGCTACCATTGGAGCAGAGATGAAAATAAATACGAGCACGAGATTATTGGGATGATTGTTAAAGAAGTTTCCAACAAGATCAATCGTTCTATTTTACATGTTGCTGATTACCCCATTGAACTTGAGCCTCAGATAATGGAAGTACATCGACTTCTCAGATCTTTTAGTGAGGATCAAGTTTGCATGGTCGGGGTGTATGGAATTGGAGGCTTGGGTAAGACAACGCTTGTACGAGTAGTTTGTAATTTAATTGCATGTCAATTTGAAGCTTTTTGTTTTCTTCACAACGTGAGAGAAAATTCCGCTAAGCATGGTTTAGAAAACCTCCAAGAGAAGCTCCTCTCACAAACAATTGGATTGAATATTAAGTTAGGAGATGTGGATGAAGGAATTACAATCATAAAAAAGAGGCTACATCGAAAGAAGGTTCTATTGGTTTTAGATGATGTCGACGAATTAAAGCAACTGCAATTCATTGCTGGAGGACTTGATTGGTTTGGTAGTGGTAGTAGAGTGATCATTACTACTCAAAACAAACATTTGCTAGAAAGTCATCATATCTATATACTATACATTTGA
Protein sequence

>MsG0680031493.01.T01

MTPLQPNSSSFSYGFTYDVFLNFRGCDTRFGFTGHLYKALCENGIHTFIDDTQLHRGEEISPSLVKAIEESMIYIPVLSINYASSLFCLDELVHIIHSSRSNSHHHILPVFYDVDPSQVRRQTGSYGKAIAKHKKRFQNTRKKYKQYPIYIILSMLSILSILPFIFYSHSSTITLLLIIIIIIVVLPQYNKEDYTDYYMERVHEWNMALREVANLSGYHWSRDENKYEHEIIGMIVKEVSNKINRSILHVADYPIELEPQIMEVHRLLRSFSEDQVCMVGVYGIGGLGKTTLVRVVCNLIACQFEAFCFLHNVRENSAKHGLENLQEKLLSQTIGLNIKLGDVDEGITIIKKRLHRKKVLLVLDDVDELKQLQFIAGGLDWFGSGSRVIITTQNKHLLESHHIYILYI*