AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035215.01

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MsG0680035215.01.T01 AT3G44630 29.412 306 173 8 15 286 92 388 8.31e-37 139
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MsG0680035215.01.T01 AT1G27180 41.353 133 73 4 156 286 15 144 2.20e-20 91.7
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MsG0680035215.01.T01 AT1G57850 38.211 123 68 5 19 137 14 132 1.27e-18 81.3
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MsG0680035215.01.T01 AT4G19920 36.842 114 69 3 19 132 52 162 2.62e-18 83.2
MsG0680035215.01.T01 AT5G44900 36.800 125 72 4 8 128 5 126 3.13e-18 82.4
MsG0680035215.01.T01 AT1G47370 38.017 121 69 4 19 136 16 133 4.93e-18 83.6
MsG0680035215.01.T01 AT2G32140 37.705 122 70 4 19 137 23 141 8.40e-18 82.8
MsG0680035215.01.T01 AT1G57830 38.532 109 64 3 19 127 23 128 2.00e-17 78.2
MsG0680035215.01.T01 AT1G56540 36.552 145 89 3 143 286 1 143 2.30e-17 82.8
MsG0680035215.01.T01 AT4G36140 34.328 134 86 2 9 142 42 173 2.31e-17 82.8
MsG0680035215.01.T01 AT4G36140 24.815 270 168 8 26 280 443 692 8.92e-15 75.1
MsG0680035215.01.T01 AT2G17060 25.000 304 166 9 2 248 3 301 2.89e-17 82.4
MsG0680035215.01.T01 AT2G17060 25.000 304 166 8 2 248 3 301 3.01e-17 82.4
MsG0680035215.01.T01 AT2G14080 32.536 209 105 8 110 286 14 218 3.64e-17 82.0
MsG0680035215.01.T01 AT1G72850 31.000 300 152 9 17 286 7 281 4.42e-17 81.3
MsG0680035215.01.T01 AT4G09420 26.364 330 189 9 6 286 1 325 8.28e-17 80.5
MsG0680035215.01.T01 AT5G45070 36.607 112 68 3 19 130 16 124 9.19e-17 79.7
MsG0680035215.01.T01 AT1G60320 38.532 109 64 3 19 127 26 131 4.49e-16 74.7
MsG0680035215.01.T01 AT5G45210 25.430 291 167 9 18 280 36 304 8.35e-16 77.8
MsG0680035215.01.T01 AT5G45210 25.430 291 167 9 18 280 36 304 8.74e-16 77.8
MsG0680035215.01.T01 AT1G52900 35.922 103 61 1 17 119 38 135 1.09e-15 74.3
MsG0680035215.01.T01 AT5G45210 25.430 291 167 9 18 280 36 304 1.32e-15 77.4
MsG0680035215.01.T01 AT5G45210 25.430 291 167 9 18 280 27 295 1.58e-15 77.0
MsG0680035215.01.T01 AT5G45210 25.430 291 167 9 18 280 8 276 1.77e-15 77.0
MsG0680035215.01.T01 AT5G45220 30.968 155 102 4 17 170 331 481 1.81e-15 76.6
MsG0680035215.01.T01 AT5G45220 32.353 136 87 4 17 151 331 462 2.31e-15 76.3
MsG0680035215.01.T01 AT5G41740 32.886 149 89 4 143 286 1 143 4.51e-15 75.9
MsG0680035215.01.T01 AT4G11340 35.714 126 71 4 17 137 224 344 4.82e-15 75.5
MsG0680035215.01.T01 AT4G36140 24.815 270 168 8 26 280 258 507 7.14e-15 75.5
MsG0680035215.01.T01 AT2G03300 36.364 110 67 3 19 128 9 115 8.37e-15 72.0
MsG0680035215.01.T01 AT5G38350 32.026 153 89 4 143 286 1 147 3.94e-14 72.8
MsG0680035215.01.T01 AT5G45000 32.192 146 94 4 1 146 1 141 5.08e-14 72.0
MsG0680035215.01.T01 AT4G12020 26.102 295 173 13 8 281 659 929 1.20e-13 71.6
MsG0680035215.01.T01 AT4G12020 26.102 295 173 13 8 281 659 929 1.20e-13 71.6
MsG0680035215.01.T01 AT5G45080 31.973 147 88 5 19 159 17 157 1.22e-13 70.9
MsG0680035215.01.T01 AT4G12020 26.102 295 173 13 8 281 659 929 1.26e-13 71.6
MsG0680035215.01.T01 AT4G12020 26.102 295 173 13 8 281 659 929 1.28e-13 71.6
MsG0680035215.01.T01 AT4G12020 26.102 295 173 13 8 281 659 929 1.31e-13 71.6
MsG0680035215.01.T01 AT4G12020 26.102 295 173 13 8 281 659 929 1.31e-13 71.6
MsG0680035215.01.T01 AT4G12020 26.102 295 173 13 8 281 659 929 1.32e-13 71.6
MsG0680035215.01.T01 AT4G12020 26.102 295 173 13 8 281 592 862 1.37e-13 71.6
MsG0680035215.01.T01 AT4G12020 26.102 295 173 13 8 281 659 929 1.41e-13 71.6
MsG0680035215.01.T01 AT4G12020 26.102 295 173 13 8 281 659 929 1.46e-13 71.2
MsG0680035215.01.T01 AT4G12020 26.102 295 173 13 8 281 659 929 1.48e-13 71.2
MsG0680035215.01.T01 AT1G65850 25.792 221 123 6 101 286 5 219 1.58e-13 71.2
MsG0680035215.01.T01 AT1G72870 33.607 122 77 2 17 137 10 128 1.59e-13 70.9
MsG0680035215.01.T01 AT1G61105 38.235 102 58 2 18 119 30 126 3.86e-13 67.0
MsG0680035215.01.T01 AT5G17890 25.843 267 164 11 31 280 31 280 5.40e-13 69.7
MsG0680035215.01.T01 AT1G51270 28.652 178 112 6 17 193 358 521 6.15e-13 69.3
MsG0680035215.01.T01 AT1G51270 30.435 138 91 4 17 153 187 320 7.25e-13 68.6
MsG0680035215.01.T01 AT1G51270 30.435 138 91 4 17 153 187 320 7.25e-13 68.6
MsG0680035215.01.T01 AT1G51270 30.435 138 91 4 17 153 187 320 7.25e-13 68.6
MsG0680035215.01.T01 AT1G51270 30.435 138 91 4 17 153 187 320 7.25e-13 68.6
MsG0680035215.01.T01 AT1G51270 30.435 138 91 4 17 153 188 321 8.23e-13 68.2
MsG0680035215.01.T01 AT4G16860 34.965 143 81 6 143 281 1 135 8.60e-13 68.9
MsG0680035215.01.T01 AT1G51270 30.435 138 91 4 17 153 187 320 1.25e-12 68.2
MsG0680035215.01.T01 AT1G51270 30.435 138 91 4 17 153 358 491 1.28e-12 68.2
MsG0680035215.01.T01 AT1G51270 30.435 138 91 4 17 153 358 491 1.28e-12 68.2
MsG0680035215.01.T01 AT2G03030 37.273 110 66 3 19 128 9 115 1.33e-12 65.9
MsG0680035215.01.T01 AT1G51270 28.750 160 100 5 17 175 310 456 1.43e-12 68.2
MsG0680035215.01.T01 AT1G51270 28.750 160 100 5 17 175 310 456 1.43e-12 68.2
MsG0680035215.01.T01 AT1G51270 28.750 160 100 5 17 175 310 456 1.43e-12 68.2
MsG0680035215.01.T01 AT1G51270 28.750 160 100 5 17 175 310 456 1.43e-12 68.2
MsG0680035215.01.T01 AT1G51270 28.750 160 100 5 17 175 358 504 1.50e-12 68.2
MsG0680035215.01.T01 AT1G51270 30.435 138 91 4 17 153 118 251 1.50e-12 67.8
MsG0680035215.01.T01 AT1G65390 32.727 110 71 2 19 128 24 130 2.19e-12 66.2
MsG0680035215.01.T01 AT5G45240 26.522 230 131 7 75 280 46 261 4.01e-12 67.0
MsG0680035215.01.T01 AT5G45240 26.522 230 131 7 75 280 46 261 4.13e-12 67.0
MsG0680035215.01.T01 AT5G40910 33.333 120 73 3 167 286 2 114 4.53e-12 66.6
MsG0680035215.01.T01 AT5G40910 33.333 120 73 3 167 286 2 114 4.53e-12 66.6
MsG0680035215.01.T01 AT5G40910 33.333 120 73 3 167 286 2 114 4.77e-12 66.6
MsG0680035215.01.T01 AT5G40910 33.333 120 73 3 167 286 2 114 4.77e-12 66.6
MsG0680035215.01.T01 AT5G40910 33.333 120 73 3 167 286 2 114 4.77e-12 66.6
MsG0680035215.01.T01 AT5G40910 33.333 120 73 3 167 286 2 114 4.77e-12 66.6
MsG0680035215.01.T01 AT5G40910 33.333 120 73 3 167 286 2 114 4.77e-12 66.6
MsG0680035215.01.T01 AT5G45230 32.759 116 72 3 19 130 13 126 4.80e-12 66.6
MsG0680035215.01.T01 AT1G65390 31.579 114 75 2 19 132 24 134 6.69e-12 65.1
MsG0680035215.01.T01 AT1G65390 31.579 114 75 2 19 132 24 134 1.45e-11 64.7
MsG0680035215.01.T01 AT5G38340 31.169 154 89 5 143 286 1 147 2.75e-11 64.3
MsG0680035215.01.T01 AT4G16890 31.724 145 89 4 140 281 12 149 2.89e-11 64.3
MsG0680035215.01.T01 AT1G63750 33.103 145 94 3 143 286 1 143 6.51e-11 63.2
MsG0680035215.01.T01 AT1G63750 33.103 145 94 3 143 286 1 143 6.51e-11 63.2

Find 47 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 80 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AAGAAAAGGGTAGGTTAATT+TGG 0.202817 6:-100696362 MsG0680035215.01.T01:CDS
CGAAATGTACTGTCGCTTAT+TGG 0.250359 6:-100695843 MsG0680035215.01.T01:CDS
CTCCAGCAGTTGCTTATAAT+TGG 0.281259 6:+100695511 None:intergenic
ACTCTAACAGCACTGTCTTT+TGG 0.288046 6:+100695652 None:intergenic
AAGATCACAGATGAGGTTTC+CGG 0.304072 6:-100695927 MsG0680035215.01.T01:CDS
GTCAACATGCTTGGAATTCA+TGG 0.323967 6:-100695801 MsG0680035215.01.T01:CDS
TTGACTTTGTTATCAAAATC+AGG 0.330992 6:+100695819 None:intergenic
CAGTGCTGTTAGAGTTAGTT+GGG 0.340858 6:-100695644 MsG0680035215.01.T01:CDS
TGGAGAAGCATTGGCAGAAC+AGG 0.405307 6:-100696286 MsG0680035215.01.T01:CDS
ATTCATGGGATTGGTGGAAT+AGG 0.409946 6:-100695786 MsG0680035215.01.T01:CDS
AAGAGGTCGATTAAGCTTAC+CGG 0.410179 6:+100695908 None:intergenic
TGGGGAGAGAAGTATCAAGT+TGG 0.436283 6:-100695625 MsG0680035215.01.T01:CDS
AAGGGGTGTGTTGACTTTCA+TGG 0.439506 6:-100696538 MsG0680035215.01.T01:CDS
TTGATAGCAGAACAATTTGA+AGG 0.442663 6:-100695732 MsG0680035215.01.T01:CDS
CGCGGTGAAGATACTCGTAC+TGG 0.444940 6:-100696594 MsG0680035215.01.T01:CDS
GATAACAAAGTCAACATGCT+TGG 0.449480 6:-100695810 MsG0680035215.01.T01:CDS
CTTTGATGTCTTAGTTCCGA+TGG 0.449517 6:+100696318 None:intergenic
TGCTGATTATCCTGTGGGAT+TGG 0.463671 6:-100695877 MsG0680035215.01.T01:CDS
TTTATAGTGCATTGAGTCAA+AGG 0.470592 6:-100696557 MsG0680035215.01.T01:CDS
ACAGTGCTGTTAGAGTTAGT+TGG 0.471053 6:-100695645 MsG0680035215.01.T01:CDS
GATGATGATGGTCTAAGAAA+AGG 0.474805 6:-100696516 MsG0680035215.01.T01:CDS
TTATAGTGCATTGAGTCAAA+GGG 0.483760 6:-100696556 MsG0680035215.01.T01:CDS
TCAATGCAATACAGAAATCA+AGG 0.487477 6:-100696470 MsG0680035215.01.T01:CDS
AAAGCAGAATAATATAGTAT+TGG 0.503745 6:+100696654 None:intergenic
TCAACATGCTTGGAATTCAT+GGG 0.518997 6:-100695800 MsG0680035215.01.T01:CDS
ATGCTTGGAATTCATGGGAT+TGG 0.520249 6:-100695795 MsG0680035215.01.T01:CDS
AGACATCAAAGAGGAAGCTA+TGG 0.522467 6:-100696306 MsG0680035215.01.T01:CDS
TTGACTTTCATGGATGATGA+TGG 0.529773 6:-100696528 MsG0680035215.01.T01:CDS
TGTATTGCATTGAGAAGTGA+AGG 0.530405 6:+100696480 None:intergenic
CTTGGAATTCATGGGATTGG+TGG 0.531135 6:-100695792 MsG0680035215.01.T01:CDS
AGGAAGCTATGGAGAAGCAT+TGG 0.545567 6:-100696295 MsG0680035215.01.T01:CDS
GATTATCCTGTGGGATTGGA+AGG 0.547945 6:-100695873 MsG0680035215.01.T01:CDS
AAAATTGCTGATTATCCTGT+GGG 0.555297 6:-100695882 MsG0680035215.01.T01:CDS
GCCAATGTTAGAGAAAAGTC+AGG 0.557566 6:-100695696 MsG0680035215.01.T01:CDS
ATGTTAGAGAAAAGTCAGGC+AGG 0.593565 6:-100695692 MsG0680035215.01.T01:CDS
TTCATTCAAACAAAATGTGG+AGG 0.597023 6:+100696413 None:intergenic
AAGTTCATTCAAACAAAATG+TGG 0.597939 6:+100696410 None:intergenic
TGGAAGATGATGTGAACCAA+GGG 0.600657 6:-100695605 MsG0680035215.01.T01:CDS
TGCAATACAGAAATCAAGGA+TGG 0.601686 6:-100696466 MsG0680035215.01.T01:CDS
ATTCTACCTTCCAATCCCAC+AGG 0.622103 6:+100695867 None:intergenic
GAAAATTGCTGATTATCCTG+TGG 0.629123 6:-100695883 MsG0680035215.01.T01:CDS
TTGGAAGATGATGTGAACCA+AGG 0.637612 6:-100695606 MsG0680035215.01.T01:CDS
AAGATCGTAAGTGTATGTGA+TGG 0.638034 6:+100696629 None:intergenic
AGTGCTGTTAGAGTTAGTTG+GGG 0.641534 6:-100695643 MsG0680035215.01.T01:CDS
GCATTGGCAGAACAGGAGCA+TGG 0.657482 6:-100696279 MsG0680035215.01.T01:intron
TATAGTGCATTGAGTCAAAG+GGG 0.672052 6:-100696555 MsG0680035215.01.T01:CDS
TCGGAACTAAGACATCAAAG+AGG 0.696989 6:-100696315 MsG0680035215.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATTAAATACATCAAATTCA+TGG + Chr6:100696201-100696220 None:intergenic 15.0%
!!! TTTGATGTATTTAATTTCAA+TGG - Chr6:100696205-100696224 MsG0680035215.01.T01:intron 15.0%
!! AAAGCAGAATAATATAGTAT+TGG + Chr6:100695536-100695555 None:intergenic 20.0%
!! TAACAACTAGCATATTTATT+TGG + Chr6:100696159-100696178 None:intergenic 20.0%
!!! GATTGTTTTACAAAAGAAAA+GGG - Chr6:100695812-100695831 MsG0680035215.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAAGATTCTATATTTTCATG+TGG - Chr6:100696129-100696148 MsG0680035215.01.T01:intron 20.0%
!!! TGATTGTTTTACAAAAGAAA+AGG - Chr6:100695811-100695830 MsG0680035215.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTCTTTTGTAAAACAATCA+AGG + Chr6:100695811-100695830 None:intergenic 20.0%
! AAGTTCATTCAAACAAAATG+TGG + Chr6:100695780-100695799 None:intergenic 25.0%
! GGATCTACATCATAAAAAAT+AGG + Chr6:100695851-100695870 None:intergenic 25.0%
! TATACAAACAATAACTTCCT+TGG + Chr6:100696111-100696130 None:intergenic 25.0%
!! ATGTATTTAATTTCAATGGC+AGG - Chr6:100696209-100696228 MsG0680035215.01.T01:intron 25.0%
!! TAATCAGCAATTTTCAAAAG+AGG + Chr6:100696299-100696318 None:intergenic 25.0%
!! TGTATTTAATTTCAATGGCA+GGG - Chr6:100696210-100696229 MsG0680035215.01.T01:intron 25.0%
!! TTGACTTTGTTATCAAAATC+AGG + Chr6:100696371-100696390 None:intergenic 25.0%
!! TTTTTATGATGTAGATCCAT+CGG - Chr6:100695853-100695872 MsG0680035215.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGAAGTCTTGCTTTTAATAT+TGG + Chr6:100696611-100696630 None:intergenic 25.0%
AAGAAAAGGGTAGGTTAATT+TGG - Chr6:100695825-100695844 MsG0680035215.01.T01:CDS 30.0%
GCATATCATGTATGATTAAG+TGG - Chr6:100696065-100696084 MsG0680035215.01.T01:intron 30.0%
TCAATGCAATACAGAAATCA+AGG - Chr6:100695717-100695736 MsG0680035215.01.T01:CDS 30.0%
TTATAGTGCATTGAGTCAAA+GGG - Chr6:100695631-100695650 MsG0680035215.01.T01:CDS 30.0%
TTCATTCAAACAAAATGTGG+AGG + Chr6:100695777-100695796 None:intergenic 30.0%
TTTATAGTGCATTGAGTCAA+AGG - Chr6:100695630-100695649 MsG0680035215.01.T01:CDS 30.0%
! AAAATTGCTGATTATCCTGT+GGG - Chr6:100696305-100696324 MsG0680035215.01.T01:CDS 30.0%
! CTTTTAATATTGGAATCCCT+TGG + Chr6:100696601-100696620 None:intergenic 30.0%
! GTATTTAATTTCAATGGCAG+GGG - Chr6:100696211-100696230 MsG0680035215.01.T01:intron 30.0%
! GTTTTACAAAAGAAAAGGGT+AGG - Chr6:100695816-100695835 MsG0680035215.01.T01:CDS 30.0%
! TTGATAGCAGAACAATTTGA+AGG - Chr6:100696455-100696474 MsG0680035215.01.T01:CDS 30.0%
!! GATCTTTTTCTTAGTTTTCG+CGG - Chr6:100695575-100695594 MsG0680035215.01.T01:CDS 30.0%
AAGATCGTAAGTGTATGTGA+TGG + Chr6:100695561-100695580 None:intergenic 35.0%
ACAACAATAGTTGTCAACCA+AGG - Chr6:100696091-100696110 MsG0680035215.01.T01:intron 35.0%
CATCAAAAAGATCACAGATG+AGG - Chr6:100696253-100696272 MsG0680035215.01.T01:intron 35.0%
GATAACAAAGTCAACATGCT+TGG - Chr6:100696377-100696396 MsG0680035215.01.T01:CDS 35.0%
TATAGTGCATTGAGTCAAAG+GGG - Chr6:100695632-100695651 MsG0680035215.01.T01:CDS 35.0%
TCAACATGCTTGGAATTCAT+GGG - Chr6:100696387-100696406 MsG0680035215.01.T01:CDS 35.0%
TGCAATACAGAAATCAAGGA+TGG - Chr6:100695721-100695740 MsG0680035215.01.T01:CDS 35.0%
TGTATTGCATTGAGAAGTGA+AGG + Chr6:100695710-100695729 None:intergenic 35.0%
TTGACTTTCATGGATGATGA+TGG - Chr6:100695659-100695678 MsG0680035215.01.T01:CDS 35.0%
! GAAAATTGCTGATTATCCTG+TGG - Chr6:100696304-100696323 MsG0680035215.01.T01:CDS 35.0%
! GTTTGTTACCCATGTTTGAA+AGG + Chr6:100695984-100696003 None:intergenic 35.0%
!! GATGATGATGGTCTAAGAAA+AGG - Chr6:100695671-100695690 MsG0680035215.01.T01:CDS 35.0%
AAGAGGTCGATTAAGCTTAC+CGG + Chr6:100696282-100696301 None:intergenic 40.0%
AAGATCACAGATGAGGTTTC+CGG - Chr6:100696260-100696279 MsG0680035215.01.T01:intron 40.0%
AGACATCAAAGAGGAAGCTA+TGG - Chr6:100695881-100695900 MsG0680035215.01.T01:CDS 40.0%
ATGCTTGGAATTCATGGGAT+TGG - Chr6:100696392-100696411 MsG0680035215.01.T01:CDS 40.0%
ATGTTAGAGAAAAGTCAGGC+AGG - Chr6:100696495-100696514 MsG0680035215.01.T01:CDS 40.0%
CTTTGATGTCTTAGTTCCGA+TGG + Chr6:100695872-100695891 None:intergenic 40.0%
GCCAATGTTAGAGAAAAGTC+AGG - Chr6:100696491-100696510 MsG0680035215.01.T01:CDS 40.0%
GCTAGTTGTTATGTGCATAG+AGG - Chr6:100696168-100696187 MsG0680035215.01.T01:intron 40.0%
GTCAACATGCTTGGAATTCA+TGG - Chr6:100696386-100696405 MsG0680035215.01.T01:CDS 40.0%
TCGGAACTAAGACATCAAAG+AGG - Chr6:100695872-100695891 MsG0680035215.01.T01:CDS 40.0%
TGGAAGATGATGTGAACCAA+GGG - Chr6:100696582-100696601 MsG0680035215.01.T01:CDS 40.0%
TTGGAAGATGATGTGAACCA+AGG - Chr6:100696581-100696600 MsG0680035215.01.T01:CDS 40.0%
! ACAGTGCTGTTAGAGTTAGT+TGG - Chr6:100696542-100696561 MsG0680035215.01.T01:CDS 40.0%
! ACTCTAACAGCACTGTCTTT+TGG + Chr6:100696538-100696557 None:intergenic 40.0%
! AGTGCTGTTAGAGTTAGTTG+GGG - Chr6:100696544-100696563 MsG0680035215.01.T01:CDS 40.0%
! ATTCATGGGATTGGTGGAAT+AGG - Chr6:100696401-100696420 MsG0680035215.01.T01:CDS 40.0%
! CAGTGCTGTTAGAGTTAGTT+GGG - Chr6:100696543-100696562 MsG0680035215.01.T01:CDS 40.0%
! CGAAATGTACTGTCGCTTAT+TGG - Chr6:100696344-100696363 MsG0680035215.01.T01:CDS 40.0%
! GCCTGACTTTTCTCTAACAT+TGG + Chr6:100696495-100696514 None:intergenic 40.0%
!! TTGGTTGGCCTTTCAAACAT+GGG - Chr6:100695973-100695992 MsG0680035215.01.T01:intron 40.0%
!!! GATACTCGTACTGGTTTTAC+AGG - Chr6:100695602-100695621 MsG0680035215.01.T01:CDS 40.0%
ATTCTACCTTCCAATCCCAC+AGG + Chr6:100696323-100696342 None:intergenic 45.0%
ATTGCAACAGGCAGCTGATT+TGG - Chr6:100695950-100695969 MsG0680035215.01.T01:CDS 45.0%
CTTGGAATTCATGGGATTGG+TGG - Chr6:100696395-100696414 MsG0680035215.01.T01:CDS 45.0%
GATTATCCTGTGGGATTGGA+AGG - Chr6:100696314-100696333 MsG0680035215.01.T01:CDS 45.0%
! AGGAAGCTATGGAGAAGCAT+TGG - Chr6:100695892-100695911 MsG0680035215.01.T01:CDS 45.0%
! TGCTGATTATCCTGTGGGAT+TGG - Chr6:100696310-100696329 MsG0680035215.01.T01:CDS 45.0%
!! AAGGGGTGTGTTGACTTTCA+TGG - Chr6:100695649-100695668 MsG0680035215.01.T01:CDS 45.0%
!! GTTGGTTGGCCTTTCAAACA+TGG - Chr6:100695972-100695991 MsG0680035215.01.T01:intron 45.0%
!! TGGGGAGAGAAGTATCAAGT+TGG - Chr6:100696562-100696581 MsG0680035215.01.T01:CDS 45.0%
CATGGTGCAAAAGTGGAGGT+TGG - Chr6:100695926-100695945 MsG0680035215.01.T01:CDS 50.0%
! ACAGGAGCATGGTGCAAAAG+TGG - Chr6:100695919-100695938 MsG0680035215.01.T01:CDS 50.0%
!! AGGCAGCTGATTTGGTTGGT+TGG - Chr6:100695958-100695977 MsG0680035215.01.T01:CDS 50.0%
!! CAACAGGCAGCTGATTTGGT+TGG - Chr6:100695954-100695973 MsG0680035215.01.T01:CDS 50.0%
!! TGGAGAAGCATTGGCAGAAC+AGG - Chr6:100695901-100695920 MsG0680035215.01.T01:CDS 50.0%
CGCGGTGAAGATACTCGTAC+TGG - Chr6:100695593-100695612 MsG0680035215.01.T01:CDS 55.0%
GGAGCATGGTGCAAAAGTGG+AGG - Chr6:100695922-100695941 MsG0680035215.01.T01:CDS 55.0%
GTGGAGGTTGGCATTGCAAC+AGG - Chr6:100695938-100695957 MsG0680035215.01.T01:CDS 55.0%
! GCATTGGCAGAACAGGAGCA+TGG - Chr6:100695908-100695927 MsG0680035215.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 100695524 100696685 100695524 ID=MsG0680035215.01;Name=MsG0680035215.01
Chr6 mRNA 100695524 100696685 100695524 ID=MsG0680035215.01.T01;Parent=MsG0680035215.01;Name=MsG0680035215.01.T01;_AED=0.16;_eAED=0.16;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|286
Chr6 exon 100696280 100696685 100696280 ID=MsG0680035215.01.T01:exon:20611;Parent=MsG0680035215.01.T01
Chr6 exon 100695524 100695978 100695524 ID=MsG0680035215.01.T01:exon:20610;Parent=MsG0680035215.01.T01
Chr6 CDS 100696280 100696685 100696280 ID=MsG0680035215.01.T01:cds;Parent=MsG0680035215.01.T01
Chr6 CDS 100695524 100695978 100695524 ID=MsG0680035215.01.T01:cds;Parent=MsG0680035215.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035215.01.T01

ATGGAGCATCCAATACTATATTATTCTGCTTTTACCATCACATACACTTACGATCTTTTTCTTAGTTTTCGCGGTGAAGATACTCGTACTGGTTTTACAGGTAATCTTTATAGTGCATTGAGTCAAAGGGGTGTGTTGACTTTCATGGATGATGATGGTCTAAGAAAAGGAGAAGATATTAAGCCTTCACTTCTCAATGCAATACAGAAATCAAGGATGGTCATCATTGTTTTCTCTAGAAACTACGCATCCTCCACATTTTGTTTGAATGAACTTGTTCAAATCCTTGATTGTTTTACAAAAGAAAAGGGTAGGTTAATTTGGCCTATTTTTTATGATGTAGATCCATCGGAACTAAGACATCAAAGAGGAAGCTATGGAGAAGCATTGGCAGAACAGGAGCATGGGGAGTTGTATGAGCATGTACTCATCAAAAAGATCACAGATGAGGTTTCCGGTAAGCTTAATCGACCTCTTTTGAAAATTGCTGATTATCCTGTGGGATTGGAAGGTAGAATTCGAAATGTACTGTCGCTTATTGGTCCTGATTTTGATAACAAAGTCAACATGCTTGGAATTCATGGGATTGGTGGAATAGGAAAGTCAACTCTTGCTCGTGCTATATACAACTTGATAGCAGAACAATTTGAAGGTTCGTGTTTTCATGCCAATGTTAGAGAAAAGTCAGGCAGGAACAGTCTAGTGCAGATCCAAAAGACAGTGCTGTTAGAGTTAGTTGGGGAGAGAAGTATCAAGTTGGAAGATGATGTGAACCAAGGGATTCCAATATTAAAAGCAAGACTTCATCGAAAGAAAGTTTTACTCGTTCTTGATGATGTCGACAAGAAAGACCAATTATAA
Protein sequence

>MsG0680035215.01.T01

MEHPILYYSAFTITYTYDLFLSFRGEDTRTGFTGNLYSALSQRGVLTFMDDDGLRKGEDIKPSLLNAIQKSRMVIIVFSRNYASSTFCLNELVQILDCFTKEKGRLIWPIFYDVDPSELRHQRGSYGEALAEQEHGELYEHVLIKKITDEVSGKLNRPLLKIADYPVGLEGRIRNVLSLIGPDFDNKVNMLGIHGIGGIGKSTLARAIYNLIAEQFEGSCFHANVREKSGRNSLVQIQKTVLLELVGERSIKLEDDVNQGIPILKARLHRKKVLLVLDDVDKKDQL*