AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480023100.01


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MsG0480023100.01.T01 AT4G19510 34.981 526 303 11 16 518 57 566 3.57e-75 262
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MsG0480023100.01.T01 AT5G51630 35.608 469 266 11 72 518 2 456 6.14e-67 238
MsG0480023100.01.T01 AT5G51630 35.608 469 266 11 72 518 2 456 6.44e-67 238
MsG0480023100.01.T01 AT1G72950 38.275 371 197 6 16 368 11 367 6.72e-67 224
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MsG0480023100.01.T01 AT3G04210 35.663 415 227 13 13 399 63 465 1.56e-65 224
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MsG0480023100.01.T01 AT1G66090 35.840 399 220 12 14 386 24 412 8.24e-65 220
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MsG0480023100.01.T01 AT4G19510 33.142 522 291 12 16 518 57 539 6.88e-64 229
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MsG0480023100.01.T01 AT4G16990 34.318 440 258 12 15 438 8 432 2.06e-63 222
MsG0480023100.01.T01 AT4G16990 34.318 440 258 12 15 438 8 432 2.63e-63 222
MsG0480023100.01.T01 AT4G16990 35.080 439 248 11 16 435 76 496 1.28e-62 221
MsG0480023100.01.T01 AT4G16990 34.318 440 258 12 15 438 8 432 2.25e-62 221
MsG0480023100.01.T01 AT4G16990 34.318 440 258 12 15 438 8 432 2.25e-62 221
MsG0480023100.01.T01 AT4G16990 34.318 440 258 12 15 438 8 432 2.26e-62 221
MsG0480023100.01.T01 AT4G16990 34.318 440 258 12 15 438 8 432 2.26e-62 221
MsG0480023100.01.T01 AT4G16990 34.318 440 258 12 15 438 8 432 2.26e-62 221
MsG0480023100.01.T01 AT4G16990 34.318 440 258 12 15 438 8 432 2.26e-62 221
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MsG0480023100.01.T01 AT5G45060 32.021 559 324 14 3 514 1 550 5.11e-62 224
MsG0480023100.01.T01 AT1G17615 36.544 353 198 4 16 349 15 360 1.57e-61 209
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MsG0480023100.01.T01 AT5G45200 31.734 542 315 12 16 512 19 550 1.01e-59 217
MsG0480023100.01.T01 AT3G51560 30.653 597 366 20 17 599 6 568 1.73e-59 216
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MsG0480023100.01.T01 AT1G27180 37.822 349 205 7 171 513 20 362 3.96e-59 215
MsG0480023100.01.T01 AT1G27180 37.822 349 205 7 171 513 20 362 3.96e-59 215
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MsG0480023100.01.T01 AT1G72910 36.436 376 193 8 16 374 9 355 1.42e-58 201
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MsG0480023100.01.T01 AT5G45050 30.832 493 302 13 26 514 15 472 8.27e-57 208
MsG0480023100.01.T01 AT4G16890 36.898 374 217 9 154 521 13 373 2.66e-56 206
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MsG0480023100.01.T01 AT5G40910 35.511 352 196 7 176 518 2 331 1.82e-52 194
MsG0480023100.01.T01 AT5G40910 35.511 352 196 7 176 518 2 331 1.95e-52 194
MsG0480023100.01.T01 AT5G40910 35.511 352 196 7 176 518 2 331 1.95e-52 194
MsG0480023100.01.T01 AT5G40910 35.511 352 196 7 176 518 2 331 1.95e-52 194
MsG0480023100.01.T01 AT5G40910 35.511 352 196 7 176 518 2 331 1.95e-52 194
MsG0480023100.01.T01 AT5G40910 35.511 352 196 7 176 518 2 331 1.95e-52 194
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MsG0480023100.01.T01 AT4G36140 27.113 568 354 12 28 569 447 980 2.41e-51 192
MsG0480023100.01.T01 AT4G36140 30.591 389 195 8 11 331 45 426 7.10e-39 154
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MsG0480023100.01.T01 AT2G17060 29.044 544 317 13 18 506 20 549 3.90e-48 182
MsG0480023100.01.T01 AT5G45050 34.503 342 209 7 176 514 4 333 4.63e-48 182
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MsG0480023100.01.T01 AT4G19520 29.637 496 304 13 17 494 6 474 1.70e-47 181
MsG0480023100.01.T01 AT4G19520 35.185 162 87 4 17 166 1402 1557 2.12e-19 94.0
MsG0480023100.01.T01 AT4G19520 29.637 496 304 13 17 494 6 474 2.08e-47 181
MsG0480023100.01.T01 AT4G19520 35.185 162 87 4 17 166 1402 1557 2.05e-19 94.0
MsG0480023100.01.T01 AT4G19520 29.032 496 307 11 17 494 6 474 2.09e-47 180
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MsG0480023100.01.T01 AT5G48780 37.037 189 112 3 176 364 443 624 1.83e-25 112
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MsG0480023100.01.T01 AT4G19520 37.857 140 79 3 17 154 1402 1535 9.73e-19 91.7
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MsG0480023100.01.T01 AT1G63750 34.054 370 221 9 152 512 1 356 4.72e-47 179
MsG0480023100.01.T01 AT5G45210 29.231 520 317 19 17 515 27 516 7.31e-47 176
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MsG0480023100.01.T01 AT5G45210 29.231 520 317 19 17 515 8 497 1.03e-46 176
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MsG0480023100.01.T01 AT4G19530 28.333 540 327 16 16 507 15 542 8.31e-46 175
MsG0480023100.01.T01 AT5G40060 34.421 337 196 9 196 518 11 336 9.23e-46 174
MsG0480023100.01.T01 AT5G40060 34.421 337 196 9 196 518 11 336 9.55e-46 175
MsG0480023100.01.T01 AT5G45260 31.590 459 269 15 67 515 57 480 9.85e-46 175
MsG0480023100.01.T01 AT5G45260 31.590 459 269 15 67 515 57 480 9.85e-46 175
MsG0480023100.01.T01 AT5G45260 31.590 459 269 15 67 515 57 480 1.14e-45 175
MsG0480023100.01.T01 AT4G09360 41.558 308 149 8 185 487 8 289 5.35e-45 172
MsG0480023100.01.T01 AT4G09420 29.705 441 257 9 16 412 12 443 9.43e-45 166
MsG0480023100.01.T01 AT5G17890 30.193 467 296 12 29 487 30 474 1.61e-44 172
MsG0480023100.01.T01 AT4G19500 28.723 470 290 14 70 521 106 548 1.74e-44 170
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MsG0480023100.01.T01 AT4G12020 29.944 531 314 19 10 521 662 1153 1.22e-43 169
MsG0480023100.01.T01 AT4G12020 29.944 531 314 19 10 521 662 1153 1.45e-43 169
MsG0480023100.01.T01 AT4G12020 29.944 531 314 19 10 521 595 1086 1.55e-43 169
MsG0480023100.01.T01 AT4G12020 29.944 531 314 19 10 521 662 1153 1.63e-43 169
MsG0480023100.01.T01 AT4G12020 29.944 531 314 19 10 521 662 1153 1.67e-43 169
MsG0480023100.01.T01 AT4G12020 29.944 531 314 19 10 521 662 1153 1.69e-43 169
MsG0480023100.01.T01 AT4G12020 29.944 531 314 19 10 521 662 1153 1.69e-43 169
MsG0480023100.01.T01 AT4G12020 29.944 531 314 19 10 521 662 1153 1.74e-43 169
MsG0480023100.01.T01 AT4G12020 29.944 531 314 19 10 521 662 1153 1.80e-43 169
MsG0480023100.01.T01 AT4G12020 29.944 531 314 19 10 521 662 1153 1.88e-43 168
MsG0480023100.01.T01 AT3G25510 33.739 329 204 6 195 517 17 337 2.11e-43 168
MsG0480023100.01.T01 AT3G25510 33.739 329 204 6 195 517 17 337 2.11e-43 168
MsG0480023100.01.T01 AT5G44870 32.754 345 223 6 170 512 252 589 3.92e-43 167
MsG0480023100.01.T01 AT5G44870 39.716 141 81 3 15 154 11 148 1.16e-21 100
MsG0480023100.01.T01 AT1G72920 38.222 225 120 4 16 222 9 232 8.59e-42 153
MsG0480023100.01.T01 AT1G72850 33.656 413 230 11 16 408 7 395 8.93e-42 157
MsG0480023100.01.T01 AT1G17610 30.963 436 260 13 3 420 1 413 1.29e-41 156
MsG0480023100.01.T01 AT1G17610 30.963 436 260 13 3 420 1 413 1.29e-41 156
MsG0480023100.01.T01 AT2G16870 36.653 251 151 4 269 518 6 249 1.39e-41 162
MsG0480023100.01.T01 AT2G16870 36.653 251 151 4 269 518 6 249 1.39e-41 162
MsG0480023100.01.T01 AT5G44870 32.602 319 209 4 196 512 11 325 2.13e-40 159
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MsG0480023100.01.T01 AT2G17050 28.922 204 123 7 6 203 1146 1333 2.30e-12 70.9
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MsG0480023100.01.T01 AT4G16990 30.769 286 181 8 155 438 4 274 2.86e-26 113
MsG0480023100.01.T01 AT4G16990 30.769 286 181 8 155 438 4 274 4.55e-26 114
MsG0480023100.01.T01 AT4G16990 30.769 286 181 8 155 438 4 274 4.55e-26 114
MsG0480023100.01.T01 AT4G16990 30.769 286 181 8 155 438 4 274 4.55e-26 114
MsG0480023100.01.T01 AT4G16990 30.769 286 181 8 155 438 4 274 4.55e-26 114
MsG0480023100.01.T01 AT4G16990 30.769 286 181 8 155 438 4 274 4.84e-26 113
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MsG0480023100.01.T01 AT5G45240 28.571 336 202 9 72 389 44 359 6.00e-23 104
MsG0480023100.01.T01 AT2G32140 39.394 132 78 2 18 149 23 152 1.72e-22 100
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MsG0480023100.01.T01 AT1G65390 37.879 132 80 2 18 149 24 153 5.36e-21 96.3
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MsG0480023100.01.T01 AT1G51270 32.203 177 98 4 4 160 172 346 7.74e-21 95.1
MsG0480023100.01.T01 AT1G51270 32.203 177 98 4 4 160 172 346 7.74e-21 95.1
MsG0480023100.01.T01 AT1G51270 33.333 156 99 3 4 156 173 326 1.02e-20 94.7
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MsG0480023100.01.T01 AT1G51270 31.351 185 105 4 4 168 295 477 3.15e-20 95.5
MsG0480023100.01.T01 AT1G51270 31.351 185 105 4 4 168 295 477 3.15e-20 95.5
MsG0480023100.01.T01 AT1G51270 31.351 185 105 4 4 168 295 477 3.15e-20 95.5
MsG0480023100.01.T01 AT2G20142 36.691 139 82 3 16 154 9 141 3.35e-20 92.4
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MsG0480023100.01.T01 AT1G51270 32.203 177 98 4 4 160 343 517 3.86e-20 94.7
MsG0480023100.01.T01 AT1G51270 33.333 156 99 3 4 156 343 496 6.88e-20 94.4
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MsG0480023100.01.T01 AT4G11340 39.161 143 82 2 16 154 224 365 2.64e-19 92.0
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MsG0480023100.01.T01 AT4G23515 36.111 144 78 4 18 150 11 151 9.78e-18 85.1
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MsG0480023100.01.T01 AT1G57650 33.155 187 112 4 340 517 80 262 1.29e-16 84.3
MsG0480023100.01.T01 AT1G57650 33.333 186 111 4 340 516 80 261 1.35e-16 84.0
MsG0480023100.01.T01 AT1G57650 33.155 187 112 4 340 517 80 262 1.50e-16 84.0
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MsG0480023100.01.T01 AT1G12210 29.412 272 177 7 169 430 109 375 1.76e-15 80.9
MsG0480023100.01.T01 AT5G44920 30.928 194 117 6 18 202 13 198 1.91e-15 77.0
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MsG0480023100.01.T01 AT1G12280 26.087 345 215 13 169 484 151 484 3.36e-14 76.6
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MsG0480023100.01.T01 AT5G05400 28.808 302 196 10 197 484 6 302 5.39e-14 75.9
MsG0480023100.01.T01 AT1G12290 30.588 255 150 9 194 430 172 417 8.62e-14 75.5
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MsG0480023100.01.T01 AT1G12290 30.588 255 150 9 194 430 130 375 8.69e-14 75.5
MsG0480023100.01.T01 AT1G12290 30.588 255 150 9 194 430 130 375 8.69e-14 75.5
MsG0480023100.01.T01 AT1G61190 29.502 261 145 12 194 430 170 415 4.24e-13 73.2
MsG0480023100.01.T01 AT1G61190 29.502 261 145 12 194 430 170 415 4.24e-13 73.2
MsG0480023100.01.T01 AT1G61190 29.502 261 145 12 194 430 170 415 4.27e-13 73.2
MsG0480023100.01.T01 AT1G61190 29.502 261 145 12 194 430 170 415 5.18e-13 72.8
MsG0480023100.01.T01 AT4G23510 36.000 125 77 3 18 141 12 134 7.66e-13 72.0
MsG0480023100.01.T01 AT4G23510 36.000 125 77 3 18 141 12 134 8.39e-13 72.0
MsG0480023100.01.T01 AT4G23510 36.000 125 77 3 18 141 12 134 8.67e-13 72.0
MsG0480023100.01.T01 AT1G61105 33.636 110 69 2 6 115 19 124 1.02e-12 67.8
MsG0480023100.01.T01 AT1G52900 29.801 151 92 4 16 161 38 179 1.28e-12 67.8
MsG0480023100.01.T01 AT3G46530 26.433 314 199 12 199 484 187 496 1.45e-12 71.2
MsG0480023100.01.T01 AT1G57850 48.148 81 38 4 49 128 32 109 1.97e-12 65.5
MsG0480023100.01.T01 AT1G12280 28.139 231 155 6 169 394 113 337 2.94e-12 70.5
MsG0480023100.01.T01 AT4G19925 31.897 116 74 2 18 128 14 129 4.21e-12 67.0
MsG0480023100.01.T01 AT4G26090 28.137 263 164 11 181 430 164 414 1.65e-11 68.2
MsG0480023100.01.T01 AT1G61310 29.502 261 145 12 194 430 171 416 1.97e-11 67.8
MsG0480023100.01.T01 AT5G04720 27.221 349 199 16 129 451 126 445 2.27e-11 67.4
MsG0480023100.01.T01 AT3G15700 28.378 222 132 8 195 401 158 367 5.56e-11 65.1
MsG0480023100.01.T01 AT3G15700 28.194 227 126 9 195 401 158 367 5.82e-11 65.1
MsG0480023100.01.T01 AT5G47280 27.500 280 172 10 194 462 6 265 8.06e-11 65.5
MsG0480023100.01.T01 AT4G19910 35.398 113 67 4 18 128 9 117 8.84e-11 63.2

Find 119 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 236 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GTAGATATGCTCCCAGTTTC+TGG 0.147096 4:+80880059 MsG0480023100.01.T01:CDS
TACTGTCTTTCCAAATAAAT+TGG 0.151021 4:-80877884 None:intergenic
GTAATAGGTTCCAATTTATT+TGG 0.159580 4:+80877874 MsG0480023100.01.T01:CDS
AGTGAAATTCAAAGCTAATT+TGG 0.215314 4:+80880120 MsG0480023100.01.T01:CDS
AACTTACTTTAAGTATCTTT+TGG 0.238308 4:-80877960 None:intergenic
ATGCTCTTCAATTGCTTACT+TGG 0.241142 4:+80877758 MsG0480023100.01.T01:CDS
CTACGCTTTCCAGGTTCTTC+TGG 0.252198 4:-80878222 None:intergenic
TAAGATCATTGACTTCATTA+AGG 0.254747 4:+80876612 MsG0480023100.01.T01:CDS
TTCTGCTAGATCAATGTTAA+AGG 0.260548 4:+80879982 MsG0480023100.01.T01:CDS
AAGAGCTTTGTAGAGATTTC+CGG 0.266350 4:-80876431 None:intergenic
AGATATGAGTACTAGTTTAT+TGG 0.281942 4:+80877184 MsG0480023100.01.T01:intron
CATGGATTCCACTGTCTATA+AGG 0.292330 4:-80880213 None:intergenic
CCATTGGCTTTGATAGTAAT+AGG 0.312930 4:+80877859 MsG0480023100.01.T01:CDS
TAACATAACATATGAATTAC+AGG 0.315360 4:+80877720 MsG0480023100.01.T01:CDS
CATAACCGACTACGCTTTCC+AGG 0.317732 4:-80878231 None:intergenic
ATCCGGTTCCATCCAGAAAC+TGG 0.319303 4:-80880071 None:intergenic
TACAAAGCTCTTATTAATAA+TGG 0.323323 4:+80876442 MsG0480023100.01.T01:CDS
CGTGCAGTAGCTTATGCTTC+TGG 0.326545 4:+80877832 MsG0480023100.01.T01:CDS
GGATTTGATTGGCTTGGTTC+TGG 0.327558 4:+80877643 MsG0480023100.01.T01:CDS
CTTCAAGACATTTAAGCAAC+TGG 0.334969 4:-80877809 None:intergenic
TTTCTGAAAGAAGAATCTTT+TGG 0.337041 4:-80877483 None:intergenic
TCCTCTTCATCGTTCAGTTA+TGG 0.338977 4:+80876352 MsG0480023100.01.T01:CDS
CTGGAAAGCGTAGTCGGTTA+TGG 0.352629 4:+80878232 MsG0480023100.01.T01:CDS
GACTCGGGACAAACATTTGT+TGG 0.358147 4:+80877684 MsG0480023100.01.T01:CDS
AGCAACGCGGTTTATGTTGT+TGG 0.358877 4:-80877227 None:intergenic
CCTTGGTTGGAGGATTTGAT+TGG 0.361932 4:+80877632 MsG0480023100.01.T01:CDS
AAGATCATTGACTTCATTAA+GGG 0.371148 4:+80876613 MsG0480023100.01.T01:CDS
TAAATTCATTTCTTGATGTT+GGG 0.372121 4:+80877299 MsG0480023100.01.T01:CDS
ACATGCAGAGGTTGGAGAAA+TGG 0.389727 4:+80876749 MsG0480023100.01.T01:CDS
AAGCTCCTCATTGTCAATAA+AGG 0.389839 4:-80876473 None:intergenic
ATAAATTCATTTCTTGATGT+TGG 0.396290 4:+80877298 MsG0480023100.01.T01:CDS
GATGATGAGGTCAACATGAT+TGG 0.396984 4:+80877325 MsG0480023100.01.T01:CDS
CACGTTGAGATTACGTATAA+TGG 0.398771 4:+80880172 MsG0480023100.01.T01:CDS
AAGTATCAAACAAGGAATTT+CGG 0.399294 4:+80877534 MsG0480023100.01.T01:CDS
ACTTGAGGCTCTAGTCCAAC+TGG 0.400294 4:-80877268 None:intergenic
GTCTGCTTTCGAACAGTAGA+AGG 0.402616 4:-80876676 None:intergenic
TTGGATGTCTTTATTAGGAA+TGG 0.403844 4:-80877941 None:intergenic
GTTGGAGGATTTGATTGGCT+TGG 0.418805 4:+80877637 MsG0480023100.01.T01:CDS
TGATAGCAATTCTAGACTCT+TGG 0.424784 4:-80876537 None:intergenic
TTGATTGCCGACCGCTTTGA+AGG 0.426025 4:+80877403 MsG0480023100.01.T01:CDS
TTATGCTTCTGGACTTCCAT+TGG 0.429812 4:+80877843 MsG0480023100.01.T01:CDS
CTTAGCCATGTCCTCTATCA+AGG 0.435585 4:-80878178 None:intergenic
TTCTTATCCCGCCGATTCCA+TGG 0.448917 4:-80877351 None:intergenic
GCTTGCATGAAATATCATAT+TGG 0.453247 4:+80878096 MsG0480023100.01.T01:CDS
CCCGTTGCTGACTACCCAGT+TGG 0.467666 4:+80877253 MsG0480023100.01.T01:CDS
CAGCTAGATGCCTTGGTTGG+AGG 0.470029 4:+80877622 MsG0480023100.01.T01:CDS
GAAATATCATATTGGAGTAT+TGG 0.475475 4:+80878104 MsG0480023100.01.T01:CDS
GAGAACTTGTAGAAAATGAA+TGG 0.480927 4:+80880146 MsG0480023100.01.T01:CDS
AACATTTGTTGGAAAGTCAT+GGG 0.481410 4:+80877695 MsG0480023100.01.T01:CDS
ATTGACTTCATTAAGGGAAA+GGG 0.488407 4:+80876619 MsG0480023100.01.T01:CDS
TCCCAGTTTCTGGATGGAAC+CGG 0.489152 4:+80880069 MsG0480023100.01.T01:CDS
GGATCTACATCGTAGAAGAT+TGG 0.491374 4:-80876655 None:intergenic
GGCTAAGGAAATTGTTCGAC+TGG 0.492436 4:+80878194 MsG0480023100.01.T01:CDS
GACTCTACATGCCTTGATAG+AGG 0.493254 4:+80878167 MsG0480023100.01.T01:CDS
GTCAACATGATTGGGATCCA+TGG 0.494565 4:+80877334 MsG0480023100.01.T01:CDS
AAACATTTGTTGGAAAGTCA+TGG 0.498319 4:+80877694 MsG0480023100.01.T01:CDS
ATGATGAGGTCAACATGATT+GGG 0.499904 4:+80877326 MsG0480023100.01.T01:CDS
CATTAAGGGAAAGGGAAGGT+TGG 0.503751 4:+80876627 MsG0480023100.01.T01:CDS
ATGATTGGGATCCATGGAAT+CGG 0.505148 4:+80877340 MsG0480023100.01.T01:CDS
GACAATGAGGAGCTTGAGAG+AGG 0.507730 4:+80876481 MsG0480023100.01.T01:CDS
AATAGAACAGCTAGATGCCT+TGG 0.511777 4:+80877615 MsG0480023100.01.T01:CDS
CATTGACTTCATTAAGGGAA+AGG 0.512241 4:+80876618 MsG0480023100.01.T01:CDS
CCAACTGGGTAGTCAGCAAC+GGG 0.515693 4:-80877253 None:intergenic
CGAGGTCTAGACACTCGCTA+TGG 0.516341 4:+80876403 MsG0480023100.01.T01:CDS
ATTCTTCTTTCAGAAACACT+TGG 0.519200 4:+80877490 MsG0480023100.01.T01:CDS
TAGCCATTGATGATCACATT+GGG 0.520268 4:-80880019 None:intergenic
GAATTTATTTCTAGCACTTG+AGG 0.521020 4:-80877283 None:intergenic
CGAAAGCAGACAGGATCTTA+CGG 0.523235 4:+80876688 MsG0480023100.01.T01:CDS
TGGGAGCATATCTACAATCA+AGG 0.525640 4:-80880051 None:intergenic
GACACTCGCTATGGTTTCAC+CGG 0.527573 4:+80876412 MsG0480023100.01.T01:CDS
CTGGAATCACCAGAAGAACC+TGG 0.538272 4:+80878213 MsG0480023100.01.T01:CDS
ACACCCAATGTGATCATCAA+TGG 0.541557 4:+80880016 MsG0480023100.01.T01:CDS
CAAAGGAACAAATGATACAT+TGG 0.542067 4:+80878038 MsG0480023100.01.T01:CDS
AAATTCAAAGCTAATTTGGA+TGG 0.542314 4:+80880124 MsG0480023100.01.T01:CDS
CAAGAATAACATGCAGAGGT+TGG 0.546362 4:+80876741 MsG0480023100.01.T01:CDS
GACATTGCTTGTTTCTACAA+AGG 0.546598 4:+80878021 MsG0480023100.01.T01:CDS
TCTACTGTTCGAAAGCAGAC+AGG 0.552917 4:+80876679 MsG0480023100.01.T01:CDS
TGGATTGCTTGAAGAAGTGA+TGG 0.556820 4:-80876517 None:intergenic
CCTATTACTATCAAAGCCAA+TGG 0.560517 4:-80877859 None:intergenic
CTGATAAAGATTAGTTCGCA+TGG 0.564717 4:+80878138 MsG0480023100.01.T01:CDS
GAACAGCTAGATGCCTTGGT+TGG 0.565751 4:+80877619 MsG0480023100.01.T01:CDS
TCCATAACTGAACGATGAAG+AGG 0.571842 4:-80876353 None:intergenic
TCCAACTGGGTAGTCAGCAA+CGG 0.571874 4:-80877254 None:intergenic
TTGGAAAGACAGTACAAGAG+TGG 0.575179 4:+80877893 MsG0480023100.01.T01:CDS
CAGAGTTATTATTACGACTC+GGG 0.576480 4:+80877669 MsG0480023100.01.T01:CDS
TGTCTAGACCTCGAAAGCTA+AGG 0.578025 4:-80876393 None:intergenic
TTCAAGACATTTAAGCAACT+GGG 0.578675 4:-80877808 None:intergenic
TTGGGATCCATGGAATCGGC+GGG 0.587336 4:+80877344 MsG0480023100.01.T01:CDS
CTTGATAGAGGACATGGCTA+AGG 0.589476 4:+80878179 MsG0480023100.01.T01:CDS
CCAATCAAATCCTCCAACCA+AGG 0.589788 4:-80877632 None:intergenic
TCCGGTTCCATCCAGAAACT+GGG 0.590997 4:-80880070 None:intergenic
ACAATGAGGAGCTTGAGAGA+GGG 0.591812 4:+80876482 MsG0480023100.01.T01:CDS
CCACACCTTTATTGACAATG+AGG 0.594282 4:+80876468 MsG0480023100.01.T01:CDS
GCAGAGTTATTATTACGACT+CGG 0.594575 4:+80877668 MsG0480023100.01.T01:CDS
TGGAAAGACAGTACAAGAGT+GGG 0.595290 4:+80877894 MsG0480023100.01.T01:CDS
ATTCAAACAAAAGAGTTGCA+TGG 0.595396 4:+80880237 MsG0480023100.01.T01:CDS
ATATGCTCCCAGTTTCTGGA+TGG 0.597668 4:+80880063 MsG0480023100.01.T01:CDS
ACATAAACCTTCAAAGCGGT+CGG 0.600051 4:-80877410 None:intergenic
AAGAACCTGGAAAGCGTAGT+CGG 0.612579 4:+80878226 MsG0480023100.01.T01:CDS
TGATGTTGGGTCAGATGATG+AGG 0.615063 4:+80877312 MsG0480023100.01.T01:CDS
AACTCAATCCTTATAGACAG+TGG 0.621590 4:+80880205 MsG0480023100.01.T01:CDS
CTTGAGGCTCTAGTCCAACT+GGG 0.622927 4:-80877267 None:intergenic
ACATGCCTTGATAGAGGACA+TGG 0.624550 4:+80878173 MsG0480023100.01.T01:CDS
ACATTTGTTGGAAAGTCATG+GGG 0.629674 4:+80877696 MsG0480023100.01.T01:CDS
ATAGCCATTGATGATCACAT+TGG 0.632762 4:-80880020 None:intergenic
CCTCATTGTCAATAAAGGTG+TGG 0.634249 4:-80876468 None:intergenic
ATTGGGATCCATGGAATCGG+CGG 0.634600 4:+80877343 MsG0480023100.01.T01:CDS
ACTTCATTAAGGGAAAGGGA+AGG 0.635810 4:+80876623 MsG0480023100.01.T01:CDS
GATTCAAGAATAACATGCAG+AGG 0.642608 4:+80876737 MsG0480023100.01.T01:CDS
AAAGCTAAGGAAAACATCGT+AGG 0.647172 4:-80876380 None:intergenic
GAGAAAGTTCAGACAAACAC+GGG 0.660587 4:+80877449 MsG0480023100.01.T01:CDS
CAAACAAAAGAGTTGCATGG+AGG 0.698453 4:+80880240 MsG0480023100.01.T01:CDS
CATTATACGTAATCTCAACG+TGG 0.701917 4:-80880171 None:intergenic
AAGTTAACAAGTATCAAACA+AGG 0.703215 4:+80877526 MsG0480023100.01.T01:CDS
AGAGAAAGTTCAGACAAACA+CGG 0.705219 4:+80877448 MsG0480023100.01.T01:CDS
GAAAACATAAACCTTCAAAG+CGG 0.726508 4:-80877414 None:intergenic
AGTGGGAATCTGCATTACAG+CGG 0.740379 4:+80877911 MsG0480023100.01.T01:CDS
AGAAGCTTTAGCTACACACG+AGG 0.759119 4:+80876711 MsG0480023100.01.T01:CDS
CAGCAACGGGTAAAGCAACG+CGG 0.760018 4:-80877240 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AGTTTAAAAAGAACAATTTA+AGG - Chr4:80878338-80878357 None:intergenic 15.0%
!! ATTATGGAAAATATATAAGA+AGG - Chr4:80876835-80876854 None:intergenic 15.0%
!! GTTATAAAAATAATGATGAT+TGG - Chr4:80879704-80879723 None:intergenic 15.0%
!! TAAAAAATATATGTATGATC+CGG - Chr4:80880091-80880110 None:intergenic 15.0%
!! TCAAACTATATTATAATAGA+AGG - Chr4:80879777-80879796 None:intergenic 15.0%
!! ATAAATTCATTTCTTGATGT+TGG + Chr4:80877298-80877317 MsG0480023100.01.T01:CDS 20.0%
!! ATTCGTTCTTTATGTTAAAA+GGG + Chr4:80878452-80878471 MsG0480023100.01.T01:intron 20.0%
!! CATAAATGTACATAATGTAT+AGG - Chr4:80878396-80878415 None:intergenic 20.0%
!! TAAATTCATTTCTTGATGTT+GGG + Chr4:80877299-80877318 MsG0480023100.01.T01:CDS 20.0%
!! TAACATAACATATGAATTAC+AGG + Chr4:80877720-80877739 MsG0480023100.01.T01:CDS 20.0%
!! TACAAAGCTCTTATTAATAA+TGG + Chr4:80876442-80876461 MsG0480023100.01.T01:CDS 20.0%
!! TTATCATAGAATGATTAAGA+TGG + Chr4:80876951-80876970 MsG0480023100.01.T01:intron 20.0%
!! TTTCTTGGATGAAAATAATA+TGG - Chr4:80878664-80878683 None:intergenic 20.0%
!!! AAATTTCAATTGTTTTGGTA+GGG + Chr4:80877159-80877178 MsG0480023100.01.T01:intron 20.0%
!!! AACTTACTTTAAGTATCTTT+TGG - Chr4:80877963-80877982 None:intergenic 20.0%
!!! CATACAAATTTCAATTGTTT+TGG + Chr4:80877154-80877173 MsG0480023100.01.T01:intron 20.0%
!!! TAATTTTATCTTTCTGTACA+AGG - Chr4:80880284-80880303 None:intergenic 20.0%
!!! TCTTACAATTTTCAAATGAA+CGG - Chr4:80878947-80878966 None:intergenic 20.0%
!!! TTTAACCATCAATTCATTTT+TGG + Chr4:80878780-80878799 MsG0480023100.01.T01:intron 20.0%
! AAAGGATAAAAACAAATGTG+AGG - Chr4:80878373-80878392 None:intergenic 25.0%
! AAATTCAAAGCTAATTTGGA+TGG + Chr4:80880124-80880143 MsG0480023100.01.T01:CDS 25.0%
! AAGTATCAAACAAGGAATTT+CGG + Chr4:80877534-80877553 MsG0480023100.01.T01:CDS 25.0%
! AAGTTAACAAGTATCAAACA+AGG + Chr4:80877526-80877545 MsG0480023100.01.T01:CDS 25.0%
! ACAATTGCACAACAAAATTA+TGG - Chr4:80876851-80876870 None:intergenic 25.0%
! AGTGAAATTCAAAGCTAATT+TGG + Chr4:80880120-80880139 MsG0480023100.01.T01:CDS 25.0%
! ATAAAGAAATGAGAACCAAA+TGG - Chr4:80878811-80878830 None:intergenic 25.0%
! ATAAGCCAAAAATGAATTGA+TGG - Chr4:80878788-80878807 None:intergenic 25.0%
! ATAATATGGCAATATTCTGA+AGG - Chr4:80878650-80878669 None:intergenic 25.0%
! ATACGAATAATTTACACTGT+TGG + Chr4:80879735-80879754 MsG0480023100.01.T01:intron 25.0%
! ATAGAAGGATTTAACTGATT+AGG - Chr4:80879762-80879781 None:intergenic 25.0%
! ATGTACATAATGTATAGGAA+AGG - Chr4:80878391-80878410 None:intergenic 25.0%
! CAATGCATCAAAATTAAACT+TGG - Chr4:80879649-80879668 None:intergenic 25.0%
! CATTCGTTCTTTATGTTAAA+AGG + Chr4:80878451-80878470 MsG0480023100.01.T01:intron 25.0%
! GAAATATCATATTGGAGTAT+TGG + Chr4:80878104-80878123 MsG0480023100.01.T01:CDS 25.0%
! GTAATAGGTTCCAATTTATT+TGG + Chr4:80877874-80877893 MsG0480023100.01.T01:CDS 25.0%
! TAAACTATTTGGAAGATGTT+TGG - Chr4:80878603-80878622 None:intergenic 25.0%
! TAATATGGCAATATTCTGAA+GGG - Chr4:80878649-80878668 None:intergenic 25.0%
! TACTGTCTTTCCAAATAAAT+TGG - Chr4:80877887-80877906 None:intergenic 25.0%
! TGGAAAATATATAAGAAGGT+AGG - Chr4:80876831-80876850 None:intergenic 25.0%
! TTGGAAAAAAGTCATATGAT+AGG - Chr4:80879394-80879413 None:intergenic 25.0%
!! AGATATGAGTACTAGTTTAT+TGG + Chr4:80877184-80877203 MsG0480023100.01.T01:intron 25.0%
!! ATCTTTTGGATGTCTTTATT+AGG - Chr4:80877949-80877968 None:intergenic 25.0%
!! GAACATGGAAATTCTTTTAT+TGG - Chr4:80879170-80879189 None:intergenic 25.0%
!! TATTTGTTAACAGAATTGCA+TGG + Chr4:80879840-80879859 MsG0480023100.01.T01:intron 25.0%
!!! AACTCTTTTGTTTGAATACA+TGG - Chr4:80880234-80880253 None:intergenic 25.0%
!!! AAGATCATTGACTTCATTAA+GGG + Chr4:80876613-80876632 MsG0480023100.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTTTGTTGTGCAATTGTTA+CGG + Chr4:80876853-80876872 MsG0480023100.01.T01:intron 25.0%
!!! CAAATTTCAATTGTTTTGGT+AGG + Chr4:80877158-80877177 MsG0480023100.01.T01:intron 25.0%
!!! GTAAGATTTTGAAATGAACA+TGG - Chr4:80879185-80879204 None:intergenic 25.0%
!!! TAAGATCATTGACTTCATTA+AGG + Chr4:80876612-80876631 MsG0480023100.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTCTGAAAGAAGAATCTTT+TGG - Chr4:80877486-80877505 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTTGACGGATCTAAATT+TGG + Chr4:80879501-80879520 MsG0480023100.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTTTTCTCTTCTCTTTCA+TGG - Chr4:80876895-80876914 None:intergenic 25.0%
AACTTGAATATGGAGTTTCT+TGG - Chr4:80878679-80878698 None:intergenic 30.0%
AGCAGTAATGTTAACCAAAT+TGG - Chr4:80879270-80879289 None:intergenic 30.0%
ATAGTTTAAGAGTGGTTGAA+TGG + Chr4:80878615-80878634 MsG0480023100.01.T01:intron 30.0%
ATGAGGTAGAATTGATGAAA+TGG + Chr4:80878513-80878532 MsG0480023100.01.T01:intron 30.0%
ATGGAAATATAACAGAGCTT+GGG + Chr4:80879134-80879153 MsG0480023100.01.T01:intron 30.0%
ATGGTTAAATTGCATACCAA+GGG - Chr4:80878769-80878788 None:intergenic 30.0%
ATTCAAACAAAAGAGTTGCA+TGG + Chr4:80880237-80880256 MsG0480023100.01.T01:CDS 30.0%
ATTCTTCTTTCAGAAACACT+TGG + Chr4:80877490-80877509 MsG0480023100.01.T01:CDS 30.0%
ATTTGGTTAACATTACTGCT+TGG + Chr4:80879270-80879289 MsG0480023100.01.T01:intron 30.0%
CAAAGGAACAAATGATACAT+TGG + Chr4:80878038-80878057 MsG0480023100.01.T01:CDS 30.0%
CAATATCTTCAAGAAGTTAG+AGG + Chr4:80879532-80879551 MsG0480023100.01.T01:intron 30.0%
CAATTTGACTGAGTTATTGA+AGG + Chr4:80878722-80878741 MsG0480023100.01.T01:intron 30.0%
CTCTAACTTCTTGAAGATAT+TGG - Chr4:80879534-80879553 None:intergenic 30.0%
GAAAACATAAACCTTCAAAG+CGG - Chr4:80877417-80877436 None:intergenic 30.0%
GAGAACTTGTAGAAAATGAA+TGG + Chr4:80880146-80880165 MsG0480023100.01.T01:CDS 30.0%
GCTTGCATGAAATATCATAT+TGG + Chr4:80878096-80878115 MsG0480023100.01.T01:CDS 30.0%
GGCATCATGAAAATGTTATT+TGG - Chr4:80879249-80879268 None:intergenic 30.0%
TAACATTGAACTACGTATTG+TGG + Chr4:80879211-80879230 MsG0480023100.01.T01:intron 30.0%
TCAACCACTCTTAAACTATT+TGG - Chr4:80878614-80878633 None:intergenic 30.0%
TCAAGGGATATCAATTTGAT+AGG - Chr4:80879057-80879076 None:intergenic 30.0%
TCTTCCAAATAGTTTAAGAG+TGG + Chr4:80878607-80878626 MsG0480023100.01.T01:intron 30.0%
TTCAAGACATTTAAGCAACT+GGG - Chr4:80877811-80877830 None:intergenic 30.0%
TTCCACAATATTATGGAAGA+TGG + Chr4:80879115-80879134 MsG0480023100.01.T01:intron 30.0%
TTCCATCTTCCATAATATTG+TGG - Chr4:80879120-80879139 None:intergenic 30.0%
TTCTGCTAGATCAATGTTAA+AGG + Chr4:80879982-80880001 MsG0480023100.01.T01:CDS 30.0%
TTGGATGTCTTTATTAGGAA+TGG - Chr4:80877944-80877963 None:intergenic 30.0%
! AAACATTTGTTGGAAAGTCA+TGG + Chr4:80877694-80877713 MsG0480023100.01.T01:CDS 30.0%
! AACATTTGTTGGAAAGTCAT+GGG + Chr4:80877695-80877714 MsG0480023100.01.T01:CDS 30.0%
! AATGAAAGATTAGTTGCTCA+AGG - Chr4:80879074-80879093 None:intergenic 30.0%
! ACATTTTCATGATGCCAATT+TGG + Chr4:80879253-80879272 MsG0480023100.01.T01:intron 30.0%
! ACTTCTTGGTAACTTGAATA+TGG - Chr4:80878689-80878708 None:intergenic 30.0%
! ATGAAAGATTAGTTGCTCAA+GGG - Chr4:80879073-80879092 None:intergenic 30.0%
! ATTGACTTCATTAAGGGAAA+GGG + Chr4:80876619-80876638 MsG0480023100.01.T01:CDS 30.0%
! GAGAGTTTTCCACAATATTA+TGG + Chr4:80879108-80879127 MsG0480023100.01.T01:intron 30.0%
! TGGTGTAAGAAATTTTACAC+TGG - Chr4:80879672-80879691 None:intergenic 30.0%
!! AGTAAGTTTTGATGCTTTAG+AGG + Chr4:80877975-80877994 MsG0480023100.01.T01:CDS 30.0%
!! GAATTTATTTCTAGCACTTG+AGG - Chr4:80877286-80877305 None:intergenic 30.0%
!!! CCAAGAATGTCATTTTTTGA+CGG + Chr4:80879489-80879508 MsG0480023100.01.T01:intron 30.0%
!!! TCATATGACTTTTTTCCAAC+AGG + Chr4:80879395-80879414 MsG0480023100.01.T01:intron 30.0%
!!! TCATTTTTGGCTTATCCATT+TGG + Chr4:80878793-80878812 MsG0480023100.01.T01:intron 30.0%
AAACATCTTATCACATCCGA+TGG + Chr4:80878558-80878577 MsG0480023100.01.T01:intron 35.0%
AAAGCTAAGGAAAACATCGT+AGG - Chr4:80876383-80876402 None:intergenic 35.0%
AACTCAATCCTTATAGACAG+TGG + Chr4:80880205-80880224 MsG0480023100.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAAAACAACACTTGCTC+TGG + Chr4:80877369-80877388 MsG0480023100.01.T01:CDS 35.0%
AAGCTCCTCATTGTCAATAA+AGG - Chr4:80876476-80876495 None:intergenic 35.0%
AGAGAAAGTTCAGACAAACA+CGG + Chr4:80877448-80877467 MsG0480023100.01.T01:CDS 35.0%
ATCTTCACACATCAGGTATA+TGG - Chr4:80878495-80878514 None:intergenic 35.0%
ATGACATTCTTGGATGCATT+CGG - Chr4:80879482-80879501 None:intergenic 35.0%
ATGATGAGGTCAACATGATT+GGG + Chr4:80877326-80877345 MsG0480023100.01.T01:CDS 35.0%
ATGCTCTTCAATTGCTTACT+TGG + Chr4:80877758-80877777 MsG0480023100.01.T01:CDS 35.0%
ATTACAATTCACGAGTCAGT+TGG + Chr4:80878972-80878991 MsG0480023100.01.T01:intron 35.0%
CAAGTGATTACATGTCAGAT+AGG + Chr4:80876985-80877004 MsG0480023100.01.T01:intron 35.0%
CACGTTGAGATTACGTATAA+TGG + Chr4:80880172-80880191 MsG0480023100.01.T01:CDS 35.0%
CAGAGTTATTATTACGACTC+GGG + Chr4:80877669-80877688 MsG0480023100.01.T01:CDS 35.0%
CATTATACGTAATCTCAACG+TGG - Chr4:80880174-80880193 None:intergenic 35.0%
CCGTCAAAAAATGACATTCT+TGG - Chr4:80879492-80879511 None:intergenic 35.0%
CCTATTACTATCAAAGCCAA+TGG - Chr4:80877862-80877881 None:intergenic 35.0%
CTGGCTGACATTTCAAAATA+GGG + Chr4:80876803-80876822 MsG0480023100.01.T01:intron 35.0%
CTTCAAGACATTTAAGCAAC+TGG - Chr4:80877812-80877831 None:intergenic 35.0%
GAAACGTGAAAGAATAAGCT+TGG + Chr4:80879432-80879451 MsG0480023100.01.T01:intron 35.0%
GATGGAAATATAACAGAGCT+TGG + Chr4:80879133-80879152 MsG0480023100.01.T01:intron 35.0%
GATGGTTAAATTGCATACCA+AGG - Chr4:80878770-80878789 None:intergenic 35.0%
GATTCAAGAATAACATGCAG+AGG + Chr4:80876737-80876756 MsG0480023100.01.T01:CDS 35.0%
GCAGAGTTATTATTACGACT+CGG + Chr4:80877668-80877687 MsG0480023100.01.T01:CDS 35.0%
GCGGAAAAAATTTCCAAGTT+TGG - Chr4:80879565-80879584 None:intergenic 35.0%
TACAAGTCCAAGAATTGCAA+TGG - Chr4:80879591-80879610 None:intergenic 35.0%
TACAGACATGTTACTGAATC+AGG + Chr4:80879609-80879628 MsG0480023100.01.T01:intron 35.0%
TACAGTGAGTATGATTGATG+TGG + Chr4:80878290-80878309 MsG0480023100.01.T01:intron 35.0%
TCTGGCTGACATTTCAAAAT+AGG + Chr4:80876802-80876821 MsG0480023100.01.T01:intron 35.0%
TGATAGCAATTCTAGACTCT+TGG - Chr4:80876540-80876559 None:intergenic 35.0%
TGGTTTGAACATCGTATTAG+TGG + Chr4:80879906-80879925 MsG0480023100.01.T01:intron 35.0%
TTCTAAGCTTACTGCAACTT+TGG - Chr4:80879027-80879046 None:intergenic 35.0%
TTGAACATCGTATTAGTGGA+CGG + Chr4:80879910-80879929 MsG0480023100.01.T01:intron 35.0%
TTTAAGAGACAAGACACATC+AGG - Chr4:80878916-80878935 None:intergenic 35.0%
! AAGAGCTTTGTAGAGATTTC+CGG - Chr4:80876434-80876453 None:intergenic 35.0%
! ACATTTGTTGGAAAGTCATG+GGG + Chr4:80877696-80877715 MsG0480023100.01.T01:CDS 35.0%
! ATAGCCATTGATGATCACAT+TGG - Chr4:80880023-80880042 None:intergenic 35.0%
! ATGATGATTGGTGATTGTGA+TGG - Chr4:80879692-80879711 None:intergenic 35.0%
! ATGTTTGGTCCTTTGGAAAA+AGG - Chr4:80878588-80878607 None:intergenic 35.0%
! CAACAAGTATCTAACTTGTC+TGG + Chr4:80876784-80876803 MsG0480023100.01.T01:intron 35.0%
! CTGATAAAGATTAGTTCGCA+TGG + Chr4:80878138-80878157 MsG0480023100.01.T01:CDS 35.0%
! TAGCCATTGATGATCACATT+GGG - Chr4:80880022-80880041 None:intergenic 35.0%
! TGTTTGGTCCTTTGGAAAAA+GGG - Chr4:80878587-80878606 None:intergenic 35.0%
! TTTTTCCAACAGGACTAACA+TGG + Chr4:80879405-80879424 MsG0480023100.01.T01:intron 35.0%
!! CATTGACTTCATTAAGGGAA+AGG + Chr4:80876618-80876637 MsG0480023100.01.T01:CDS 35.0%
!! CCATTGGCTTTGATAGTAAT+AGG + Chr4:80877859-80877878 MsG0480023100.01.T01:CDS 35.0%
!! GACATTGCTTGTTTCTACAA+AGG + Chr4:80878021-80878040 MsG0480023100.01.T01:CDS 35.0%
AATAGAACAGCTAGATGCCT+TGG + Chr4:80877615-80877634 MsG0480023100.01.T01:CDS 40.0%
ACACCCAATGTGATCATCAA+TGG + Chr4:80880016-80880035 MsG0480023100.01.T01:CDS 40.0%
ACATAAACCTTCAAAGCGGT+CGG - Chr4:80877413-80877432 None:intergenic 40.0%
ACTACGTATTGTGGACGTTT+AGG + Chr4:80879220-80879239 MsG0480023100.01.T01:intron 40.0%
ACTTCATTAAGGGAAAGGGA+AGG + Chr4:80876623-80876642 MsG0480023100.01.T01:CDS 40.0%
ATACCTGATGTGTGAAGATG+AGG + Chr4:80878496-80878515 MsG0480023100.01.T01:intron 40.0%
ATGATTGGGATCCATGGAAT+CGG + Chr4:80877340-80877359 MsG0480023100.01.T01:CDS 40.0%
ATTACTGCTTGGAAGTCACA+AGG + Chr4:80879281-80879300 MsG0480023100.01.T01:intron 40.0%
CAAACAAAAGAGTTGCATGG+AGG + Chr4:80880240-80880259 MsG0480023100.01.T01:CDS 40.0%
CAAGAATAACATGCAGAGGT+TGG + Chr4:80876741-80876760 MsG0480023100.01.T01:CDS 40.0%
CATGGATTCCACTGTCTATA+AGG - Chr4:80880216-80880235 None:intergenic 40.0%
CCACACCTTTATTGACAATG+AGG + Chr4:80876468-80876487 MsG0480023100.01.T01:CDS 40.0%
CCTCATTGTCAATAAAGGTG+TGG - Chr4:80876471-80876490 None:intergenic 40.0%
CTAAACCATGTTAGTCCTGT+TGG - Chr4:80879413-80879432 None:intergenic 40.0%
GAGAAAGTTCAGACAAACAC+GGG + Chr4:80877449-80877468 MsG0480023100.01.T01:CDS 40.0%
GATGATGAGGTCAACATGAT+TGG + Chr4:80877325-80877344 MsG0480023100.01.T01:CDS 40.0%
GGATCTACATCGTAGAAGAT+TGG - Chr4:80876658-80876677 None:intergenic 40.0%
GTTTAAGAGTGGTTGAATGG+TGG + Chr4:80878618-80878637 MsG0480023100.01.T01:intron 40.0%
TAGAGGAATTGCACCAAACT+TGG + Chr4:80879549-80879568 MsG0480023100.01.T01:intron 40.0%
TCCATAACTGAACGATGAAG+AGG - Chr4:80876356-80876375 None:intergenic 40.0%
TCCTCTTCATCGTTCAGTTA+TGG + Chr4:80876352-80876371 MsG0480023100.01.T01:CDS 40.0%
TGACATTCTTGGATGCATTC+GGG - Chr4:80879481-80879500 None:intergenic 40.0%
TGGAAAGACAGTACAAGAGT+GGG + Chr4:80877894-80877913 MsG0480023100.01.T01:CDS 40.0%
TGGATTGCTTGAAGAAGTGA+TGG - Chr4:80876520-80876539 None:intergenic 40.0%
TTACTGCTTGGAAGTCACAA+GGG + Chr4:80879282-80879301 MsG0480023100.01.T01:intron 40.0%
TTATGCTTCTGGACTTCCAT+TGG + Chr4:80877843-80877862 MsG0480023100.01.T01:CDS 40.0%
TTGGAAAGACAGTACAAGAG+TGG + Chr4:80877893-80877912 MsG0480023100.01.T01:CDS 40.0%
TTGGAAGATGTTTGGTCCTT+TGG - Chr4:80878595-80878614 None:intergenic 40.0%
! AGTGGACGGTCATTTCTTTT+TGG + Chr4:80879924-80879943 MsG0480023100.01.T01:intron 40.0%
! TGGGAGCATATCTACAATCA+AGG - Chr4:80880054-80880073 None:intergenic 40.0%
!! GATGTTTTCCTTAGCTTTCG+AGG + Chr4:80876385-80876404 MsG0480023100.01.T01:CDS 40.0%
AAGGGTGGATATTGCCGAAA+CGG + Chr4:80879300-80879319 MsG0480023100.01.T01:intron 45.0%
ACAATGAGGAGCTTGAGAGA+GGG + Chr4:80876482-80876501 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
ACAATGTGATCACGACGAGT+AGG - Chr4:80879814-80879833 None:intergenic 45.0%
ACATGCAGAGGTTGGAGAAA+TGG + Chr4:80876749-80876768 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
ACATGCCTTGATAGAGGACA+TGG + Chr4:80878173-80878192 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
AGCAACGCGGTTTATGTTGT+TGG - Chr4:80877230-80877249 None:intergenic 45.0%
AGTGGGAATCTGCATTACAG+CGG + Chr4:80877911-80877930 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
AGTGTAATCTTCGTTGCCCT+TGG + Chr4:80878750-80878769 MsG0480023100.01.T01:intron 45.0%
CATCTTATCACATCCGATGG+TGG + Chr4:80878561-80878580 MsG0480023100.01.T01:intron 45.0%
CATTAAGGGAAAGGGAAGGT+TGG + Chr4:80876627-80876646 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
CCAAGAATTGCAATGGCTAG+CGG - Chr4:80879584-80879603 None:intergenic 45.0%
CCAATCAAATCCTCCAACCA+AGG - Chr4:80877635-80877654 None:intergenic 45.0%
CCAATTCGAGATACTTGCTC+TGG - Chr4:80879889-80879908 None:intergenic 45.0%
CCAGAGCAAGTATCTCGAAT+TGG + Chr4:80879886-80879905 MsG0480023100.01.T01:intron 45.0%
CCTTGGTTGGAGGATTTGAT+TGG + Chr4:80877632-80877651 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
CGAAAGCAGACAGGATCTTA+CGG + Chr4:80876688-80876707 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
CTACCTCATCTTCACACATC+AGG - Chr4:80878502-80878521 None:intergenic 45.0%
CTTAGCCATGTCCTCTATCA+AGG - Chr4:80878181-80878200 None:intergenic 45.0%
CTTGATAGAGGACATGGCTA+AGG + Chr4:80878179-80878198 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
GAAAGACAGAGAGCTATAGC+TGG - Chr4:80879965-80879984 None:intergenic 45.0%
GACTCGGGACAAACATTTGT+TGG + Chr4:80877684-80877703 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
GACTCTACATGCCTTGATAG+AGG + Chr4:80878167-80878186 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
GCGTGATTGTAGCAACTTCT+TGG - Chr4:80878703-80878722 None:intergenic 45.0%
GGCTAAGGAAATTGTTCGAC+TGG + Chr4:80878194-80878213 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
GTAGATATGCTCCCAGTTTC+TGG + Chr4:80880059-80880078 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
GTCAACATGATTGGGATCCA+TGG + Chr4:80877334-80877353 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
GTCTGCTTTCGAACAGTAGA+AGG - Chr4:80876679-80876698 None:intergenic 45.0%
TCTACTGTTCGAAAGCAGAC+AGG + Chr4:80876679-80876698 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
TGATGTTGGGTCAGATGATG+AGG + Chr4:80877312-80877331 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
TGTCTAGACCTCGAAAGCTA+AGG - Chr4:80876396-80876415 None:intergenic 45.0%
TTTGGAAAAAGGGCCACCAT+CGG - Chr4:80878577-80878596 None:intergenic 45.0%
! AAGAACCTGGAAAGCGTAGT+CGG + Chr4:80878226-80878245 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
! AGAAGCTTTAGCTACACACG+AGG + Chr4:80876711-80876730 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
! ATATGCTCCCAGTTTCTGGA+TGG + Chr4:80880063-80880082 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
! GTTGGAGGATTTGATTGGCT+TGG + Chr4:80877637-80877656 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
!! GGATTTGATTGGCTTGGTTC+TGG + Chr4:80877643-80877662 MsG0480023100.01.T01:CDS 45.0%
ATCCGGTTCCATCCAGAAAC+TGG - Chr4:80880074-80880093 None:intergenic 50.0%
ATTGGGATCCATGGAATCGG+CGG + Chr4:80877343-80877362 MsG0480023100.01.T01:CDS 50.0%
CATAACCGACTACGCTTTCC+AGG - Chr4:80878234-80878253 None:intergenic 50.0%
CCGCTAGCCATTGCAATTCT+TGG + Chr4:80879581-80879600 MsG0480023100.01.T01:intron 50.0%
CGTGCAGTAGCTTATGCTTC+TGG + Chr4:80877832-80877851 MsG0480023100.01.T01:CDS 50.0%
CTACGCTTTCCAGGTTCTTC+TGG - Chr4:80878225-80878244 None:intergenic 50.0%
CTGGAATCACCAGAAGAACC+TGG + Chr4:80878213-80878232 MsG0480023100.01.T01:CDS 50.0%
GAACAGCTAGATGCCTTGGT+TGG + Chr4:80877619-80877638 MsG0480023100.01.T01:CDS 50.0%
GACAATGAGGAGCTTGAGAG+AGG + Chr4:80876481-80876500 MsG0480023100.01.T01:CDS 50.0%
GACACTCGCTATGGTTTCAC+CGG + Chr4:80876412-80876431 MsG0480023100.01.T01:CDS 50.0%
GATATTGCCGAAACGGACGA+GGG + Chr4:80879307-80879326 MsG0480023100.01.T01:intron 50.0%
TCCAACTGGGTAGTCAGCAA+CGG - Chr4:80877257-80877276 None:intergenic 50.0%
TCCGGTTCCATCCAGAAACT+GGG - Chr4:80880073-80880092 None:intergenic 50.0%
TTGATTGCCGACCGCTTTGA+AGG + Chr4:80877403-80877422 MsG0480023100.01.T01:CDS 50.0%
TTGTTCACCCTCGTCCGTTT+CGG - Chr4:80879317-80879336 None:intergenic 50.0%
! ACTTGAGGCTCTAGTCCAAC+TGG - Chr4:80877271-80877290 None:intergenic 50.0%
! CTGGAAAGCGTAGTCGGTTA+TGG + Chr4:80878232-80878251 MsG0480023100.01.T01:CDS 50.0%
! CTTGAGGCTCTAGTCCAACT+GGG - Chr4:80877270-80877289 None:intergenic 50.0%
! TCCCAGTTTCTGGATGGAAC+CGG + Chr4:80880069-80880088 MsG0480023100.01.T01:CDS 50.0%
!! GATGGTGGCCCTTTTTCCAA+AGG + Chr4:80878576-80878595 MsG0480023100.01.T01:intron 50.0%
!! TTCTTATCCCGCCGATTCCA+TGG - Chr4:80877354-80877373 None:intergenic 50.0%
CAGCAACGGGTAAAGCAACG+CGG - Chr4:80877243-80877262 None:intergenic 55.0%
CAGCTAGATGCCTTGGTTGG+AGG + Chr4:80877622-80877641 MsG0480023100.01.T01:CDS 55.0%
CCAACTGGGTAGTCAGCAAC+GGG - Chr4:80877256-80877275 None:intergenic 55.0%
CGAGGTCTAGACACTCGCTA+TGG + Chr4:80876403-80876422 MsG0480023100.01.T01:CDS 55.0%
CTGCTTGGAAGTCACAAGGG+TGG + Chr4:80879285-80879304 MsG0480023100.01.T01:intron 55.0%
GGATATTGCCGAAACGGACG+AGG + Chr4:80879306-80879325 MsG0480023100.01.T01:intron 55.0%
TTGGGATCCATGGAATCGGC+GGG + Chr4:80877344-80877363 MsG0480023100.01.T01:CDS 55.0%
! CCCGTTGCTGACTACCCAGT+TGG + Chr4:80877253-80877272 MsG0480023100.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 80876337 80880327 80876337 ID=MsG0480023100.01;Name=MsG0480023100.01
Chr4 mRNA 80876337 80880327 80876337 ID=MsG0480023100.01.T01;Parent=MsG0480023100.01;Name=MsG0480023100.01.T01;_AED=0.24;_eAED=0.24;_QI=0|0|0|1|1|1|3|0|637
Chr4 exon 80876337 80876789 80876337 ID=MsG0480023100.01.T01:exon:5122;Parent=MsG0480023100.01.T01
Chr4 exon 80877199 80878297 80877199 ID=MsG0480023100.01.T01:exon:5123;Parent=MsG0480023100.01.T01
Chr4 exon 80879966 80880327 80879966 ID=MsG0480023100.01.T01:exon:5124;Parent=MsG0480023100.01.T01
Chr4 CDS 80876337 80876789 80876337 ID=MsG0480023100.01.T01:cds;Parent=MsG0480023100.01.T01
Chr4 CDS 80877199 80878297 80877199 ID=MsG0480023100.01.T01:cds;Parent=MsG0480023100.01.T01
Chr4 CDS 80879966 80880327 80879966 ID=MsG0480023100.01.T01:cds;Parent=MsG0480023100.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480023100.01.T01

ATGGCTGTGTCTACATCCTCTTCATCGTTCAGTTATGGATTCACCTACGATGTTTTCCTTAGCTTTCGAGGTCTAGACACTCGCTATGGTTTCACCGGAAATCTCTACAAAGCTCTTATTAATAATGGTATCCACACCTTTATTGACAATGAGGAGCTTGAGAGAGGGCATGAAATCACACCATCACTTCTTCAAGCAATCCAAGAGTCTAGAATTGCTATCATTGTACTCTCTAAGAATTATGCATCGTCTTCATTTTGCTTAGATGAACTTGTTAAGATCATTGACTTCATTAAGGGAAAGGGAAGGTTGGTTTTGCCAATCTTCTACGATGTAGATCCTTCTACTGTTCGAAAGCAGACAGGATCTTACGGAGAAGCTTTAGCTACACACGAGGAGAGATTCAAGAATAACATGCAGAGGTTGGAGAAATGGATAACAACTCTACAACAATTTATTGGAAGTATTGTTGAACATGTTTCCAACAACATAAACCGCGTTGCTTTACCCGTTGCTGACTACCCAGTTGGACTAGAGCCTCAAGTGCTAGAAATAAATTCATTTCTTGATGTTGGGTCAGATGATGAGGTCAACATGATTGGGATCCATGGAATCGGCGGGATAAGAAAAACAACACTTGCTCTGGCTGTTTATAATTTGATTGCCGACCGCTTTGAAGGTTTATGTTTTCTTGAAAACGTGAGAGAAAGTTCAGACAAACACGGGTTACAACATCTCCAAAAGATTCTTCTTTCAGAAACACTTGGAGAGAAGAACATTAAGTTAACAAGTATCAAACAAGGAATTTCGGTGATAAAGCATAGACTGCAGCAAAAAAAAGTTCTTTTGATTCTAGATGATGTTGACAAAATAGAACAGCTAGATGCCTTGGTTGGAGGATTTGATTGGCTTGGTTCTGGCAGCAGAGTTATTATTACGACTCGGGACAAACATTTGTTGGAAAGTCATGGGGTTAACATAACATATGAATTACAGGTTTTAAATGAGAAATATGCTCTTCAATTGCTTACTTGGAAAGCTTTTAAAACAGAAAAATTTCATCCCAGTTGCTTAAATGTCTTGAAGCGTGCAGTAGCTTATGCTTCTGGACTTCCATTGGCTTTGATAGTAATAGGTTCCAATTTATTTGGAAAGACAGTACAAGAGTGGGAATCTGCATTACAGCGGTATGAAACCATTCCTAATAAAGACATCCAAAAGATACTTAAAGTAAGTTTTGATGCTTTAGAGGAAGATGAGCAAAGTGTTTTTCTTGACATTGCTTGTTTCTACAAAGGAACAAATGATACATTGGCAGATGTAGAAAATATGCTTCATGCTCATTATGATGCTTGCATGAAATATCATATTGGAGTATTGGTCGAGAAATCTCTGATAAAGATTAGTTCGCATGGTAAATTGACTCTACATGCCTTGATAGAGGACATGGCTAAGGAAATTGTTCGACTGGAATCACCAGAAGAACCTGGAAAGCGTAGTCGGTTATGGTTTCATGAAGATATAATTCAAGTTTTAGAAGAGAATACAGTGACTATAGCTCTCTGTCTTTCTGCTAGATCAATGTTAAAGGAATCAACAATCACACCCAATGTGATCATCAATGGCTATATACATTTCCTTGATTGTAGATATGCTCCCAGTTTCTGGATGGAACCGGATCATACATATATTTTTTATCTGTATAAAGTGAAATTCAAAGCTAATTTGGATGGAGAACTTGTAGAAAATGAATGGAACCACGTTGAGATTACGTATAATGGTAAAGACAAGAACTCAATCCTTATAGACAGTGGAATCCATGTATTCAAACAAAAGAGTTGCATGGAGGATATTCGTTTCACACAAACCTTGTACAGAAAGATAAAATTAAATGATGATCTCAATAGTTCATAA

Protein sequence

>MsG0480023100.01.T01

MAVSTSSSSFSYGFTYDVFLSFRGLDTRYGFTGNLYKALINNGIHTFIDNEELERGHEITPSLLQAIQESRIAIIVLSKNYASSSFCLDELVKIIDFIKGKGRLVLPIFYDVDPSTVRKQTGSYGEALATHEERFKNNMQRLEKWITTLQQFIGSIVEHVSNNINRVALPVADYPVGLEPQVLEINSFLDVGSDDEVNMIGIHGIGGIRKTTLALAVYNLIADRFEGLCFLENVRESSDKHGLQHLQKILLSETLGEKNIKLTSIKQGISVIKHRLQQKKVLLILDDVDKIEQLDALVGGFDWLGSGSRVIITTRDKHLLESHGVNITYELQVLNEKYALQLLTWKAFKTEKFHPSCLNVLKRAVAYASGLPLALIVIGSNLFGKTVQEWESALQRYETIPNKDIQKILKVSFDALEEDEQSVFLDIACFYKGTNDTLADVENMLHAHYDACMKYHIGVLVEKSLIKISSHGKLTLHALIEDMAKEIVRLESPEEPGKRSRLWFHEDIIQVLEENTVTIALCLSARSMLKESTITPNVIINGYIHFLDCRYAPSFWMEPDHTYIFYLYKVKFKANLDGELVENEWNHVEITYNGKDKNSILIDSGIHVFKQKSCMEDIRFTQTLYRKIKLNDDLNSS*