AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680032142.01

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MsG0680032142.01.T01 AT1G74180 27.496 651 369 18 1 609 283 872 1.29e-32 137
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MsG0680032142.01.T01 AT1G34110 31.402 656 344 9 118 742 103 683 2.22e-57 214
MsG0680032142.01.T01 AT1G34110 30.372 619 345 17 12 581 101 682 1.87e-37 152
MsG0680032142.01.T01 AT1G34110 30.952 462 242 15 1 428 283 701 8.68e-29 124
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MsG0680032142.01.T01 AT1G71390 26.361 588 298 19 1 470 149 719 1.91e-24 110
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MsG0680032142.01.T01 AT1G75640 30.718 599 370 15 4 583 165 737 1.12e-44 175
MsG0680032142.01.T01 AT1G75640 28.762 525 336 12 1 497 210 724 2.53e-33 139
MsG0680032142.01.T01 AT2G25790 32.000 600 351 11 222 818 66 611 5.40e-64 233
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MsG0680032142.01.T01 AT2G25790 28.631 482 264 12 14 487 181 590 2.56e-27 120
MsG0680032142.01.T01 AT2G25790 27.964 447 273 12 1 443 192 593 9.05e-25 111
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MsG0680032142.01.T01 AT1G08590 30.181 497 286 7 335 799 84 551 3.18e-50 192
MsG0680032142.01.T01 AT1G08590 29.331 583 319 12 7 562 82 598 7.92e-40 160
MsG0680032142.01.T01 AT1G08590 32.110 327 201 4 473 799 79 384 3.26e-35 145
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MsG0680032142.01.T01 AT3G24900 27.455 550 313 16 1 489 299 823 4.85e-21 99.8
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MsG0680032142.01.T01 AT5G53890 27.044 636 334 17 150 749 84 625 1.84e-39 159
MsG0680032142.01.T01 AT5G53890 30.369 596 354 15 7 568 69 637 1.20e-38 156
MsG0680032142.01.T01 AT5G53890 29.072 485 269 13 409 822 73 553 1.83e-27 120
MsG0680032142.01.T01 AT5G53890 28.709 519 306 16 1 462 111 622 2.89e-27 120
MsG0680032142.01.T01 AT5G53890 28.674 279 157 4 541 796 61 320 8.91e-21 99.0
MsG0680032142.01.T01 AT5G53890 28.211 436 229 10 1 393 231 625 1.77e-16 85.1
MsG0680032142.01.T01 AT5G53890 29.101 378 230 12 1 370 279 626 9.99e-15 79.3
MsG0680032142.01.T01 AT5G25930 30.594 572 339 11 253 791 60 606 6.74e-52 197
MsG0680032142.01.T01 AT5G25930 32.212 565 335 15 110 641 42 591 5.21e-49 189
MsG0680032142.01.T01 AT5G25930 32.460 496 322 10 311 797 70 561 1.39e-48 187
MsG0680032142.01.T01 AT5G25930 28.711 512 311 9 104 591 109 590 1.62e-40 162
MsG0680032142.01.T01 AT5G25930 28.546 571 334 19 1 539 86 614 2.01e-29 127
MsG0680032142.01.T01 AT5G25930 28.571 378 221 6 425 798 64 396 1.88e-26 117
MsG0680032142.01.T01 AT5G49660 29.641 641 352 18 234 865 61 611 1.25e-51 196
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MsG0680032142.01.T01 AT1G09970 28.485 495 325 8 1 487 96 569 1.28e-31 134
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MsG0680032142.01.T01 AT5G01890 28.897 526 291 9 258 749 70 546 1.95e-42 168
MsG0680032142.01.T01 AT5G01890 31.178 433 259 7 377 797 69 474 5.58e-39 157
MsG0680032142.01.T01 AT5G01890 34.072 361 208 6 107 441 190 546 8.99e-35 144
MsG0680032142.01.T01 AT5G01890 31.562 320 196 6 492 798 18 327 1.47e-24 111
MsG0680032142.01.T01 AT3G51740 36.207 348 196 5 485 830 108 431 2.92e-43 170
MsG0680032142.01.T01 AT3G51740 34.139 331 192 7 329 658 95 400 5.96e-36 147
MsG0680032142.01.T01 AT3G51740 33.121 314 175 7 107 417 119 400 4.23e-30 128
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MsG0680032142.01.T01 AT5G37450 33.439 314 180 5 296 605 69 357 3.90e-28 122
MsG0680032142.01.T01 AT5G37450 29.530 298 160 8 502 797 84 333 1.44e-17 88.6
MsG0680032142.01.T01 AT5G37450 30.526 285 156 8 476 750 82 334 1.20e-15 82.4
MsG0680032142.01.T01 AT5G37450 26.897 290 164 7 536 824 69 311 1.53e-12 72.4
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MsG0680032142.01.T01 AT1G56140 31.868 273 173 4 192 462 113 374 8.97e-21 99.0
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MsG0680032142.01.T01 AT1G79620 27.301 326 196 10 100 413 91 387 2.85e-14 77.8
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MsG0680032142.01.T01 AT3G43740 41.379 87 50 1 572 658 128 213 8.34e-12 67.0
MsG0680032142.01.T01 AT3G49750 32.258 186 102 3 696 873 85 254 5.32e-13 70.9
MsG0680032142.01.T01 AT3G49750 32.903 155 79 2 512 666 65 194 1.88e-11 66.2
MsG0680032142.01.T01 AT3G24660 35.526 152 93 3 294 441 113 263 8.35e-13 72.8
MsG0680032142.01.T01 AT3G24660 34.194 155 96 4 508 658 111 263 8.53e-11 66.2
MsG0680032142.01.T01 AT5G63410 29.319 191 129 2 253 441 68 254 9.00e-13 72.8
MsG0680032142.01.T01 AT1G53730 32.973 185 111 4 221 396 52 232 9.72e-13 72.8
MsG0680032142.01.T01 AT1G53730 32.973 185 111 4 221 396 52 232 9.88e-13 72.8
MsG0680032142.01.T01 AT4G03390 35.052 194 115 5 223 416 69 251 1.38e-12 72.4
MsG0680032142.01.T01 AT4G03390 34.756 164 95 5 476 637 81 234 4.19e-12 70.9
MsG0680032142.01.T01 AT4G03390 33.058 121 79 1 316 436 86 204 2.51e-11 68.2
MsG0680032142.01.T01 AT4G03390 35.052 194 115 5 223 416 69 251 1.38e-12 72.4
MsG0680032142.01.T01 AT4G03390 34.756 164 95 5 476 637 81 234 4.19e-12 70.9
MsG0680032142.01.T01 AT4G03390 33.058 121 79 1 316 436 86 204 2.51e-11 68.2
MsG0680032142.01.T01 AT5G65830 30.645 186 103 3 696 873 92 259 1.60e-12 69.7
MsG0680032142.01.T01 AT5G65830 38.346 133 78 2 289 421 69 197 3.34e-11 65.5
MsG0680032142.01.T01 AT1G11130 32.955 176 103 5 465 640 72 232 1.79e-12 72.0
MsG0680032142.01.T01 AT1G11130 31.176 170 113 3 329 498 70 235 1.16e-11 69.3
MsG0680032142.01.T01 AT1G11130 33.520 179 111 4 239 416 75 246 2.39e-11 68.2
MsG0680032142.01.T01 AT3G42880 34.132 167 93 5 476 638 71 224 1.99e-12 71.6
MsG0680032142.01.T01 AT5G65240 36.719 128 80 1 291 418 75 201 2.52e-12 71.2
MsG0680032142.01.T01 AT1G11130 34.810 158 97 4 483 640 3 154 2.59e-12 71.2
MsG0680032142.01.T01 AT1G11130 35.220 159 96 3 258 416 17 168 3.84e-11 67.4
MsG0680032142.01.T01 AT5G65240 36.719 128 80 1 291 418 75 201 3.51e-12 70.9
MsG0680032142.01.T01 AT4G16162 30.075 133 92 1 313 445 36 167 4.11e-12 66.2
MsG0680032142.01.T01 AT4G16162 30.075 133 92 1 313 445 36 167 4.11e-12 66.2
MsG0680032142.01.T01 AT5G58300 38.400 125 73 3 321 445 105 225 5.88e-12 70.1
MsG0680032142.01.T01 AT5G58300 32.164 171 107 4 207 375 64 227 2.51e-11 68.2
MsG0680032142.01.T01 AT5G58300 38.400 125 73 3 321 445 105 225 5.88e-12 70.1
MsG0680032142.01.T01 AT5G58300 32.164 171 107 4 207 375 64 227 2.51e-11 68.2
MsG0680032142.01.T01 AT5G58300 38.400 125 73 3 321 445 105 225 5.88e-12 70.1
MsG0680032142.01.T01 AT5G58300 32.164 171 107 4 207 375 64 227 2.51e-11 68.2
MsG0680032142.01.T01 AT1G64210 30.108 186 95 4 268 447 75 231 7.07e-12 69.7
MsG0680032142.01.T01 AT1G64210 36.875 160 95 4 441 597 81 237 7.70e-12 69.7
MsG0680032142.01.T01 AT5G16590 33.113 151 96 2 281 431 64 209 7.93e-12 69.7
MsG0680032142.01.T01 AT5G16590 31.206 141 94 1 253 393 60 197 5.17e-11 67.0
MsG0680032142.01.T01 AT3G50230 38.889 126 68 3 273 395 92 211 9.66e-12 69.3
MsG0680032142.01.T01 AT4G16162 35.417 96 61 1 313 408 36 130 1.02e-11 64.3
MsG0680032142.01.T01 AT3G50230 38.889 126 68 3 273 395 104 223 1.09e-11 69.3
MsG0680032142.01.T01 AT5G35390 33.333 123 75 3 705 826 118 234 1.17e-11 68.9
MsG0680032142.01.T01 AT3G44480 32.579 221 138 6 258 477 693 903 1.26e-11 69.3
MsG0680032142.01.T01 AT3G44480 32.579 221 138 6 258 477 693 903 1.26e-11 69.3
MsG0680032142.01.T01 AT5G43020 36.719 128 78 2 272 399 92 216 1.32e-11 68.9
MsG0680032142.01.T01 AT3G44480 32.579 221 138 6 258 477 693 903 1.32e-11 69.3
MsG0680032142.01.T01 AT3G44480 32.579 221 138 6 258 477 693 903 1.32e-11 69.3
MsG0680032142.01.T01 AT5G06820 36.735 196 83 7 422 615 77 233 1.47e-11 68.9
MsG0680032142.01.T01 AT3G44480 32.579 221 138 6 258 477 693 903 1.61e-11 68.9
MsG0680032142.01.T01 AT1G60630 39.091 110 65 2 309 417 66 174 1.89e-11 68.6
MsG0680032142.01.T01 AT5G41180 32.558 172 91 4 518 676 96 255 2.27e-11 68.2
MsG0680032142.01.T01 AT4G23740 30.233 172 113 4 207 375 45 212 4.20e-11 67.4
MsG0680032142.01.T01 AT4G23740 30.233 172 113 4 207 375 45 212 4.20e-11 67.4
MsG0680032142.01.T01 AT3G19230 38.596 114 68 2 323 436 394 505 4.59e-11 67.0
MsG0680032142.01.T01 AT3G28450 34.752 141 68 3 710 826 80 220 5.73e-11 66.6
MsG0680032142.01.T01 AT1G27180 24.408 422 270 12 248 634 648 1055 5.84e-11 67.0
MsG0680032142.01.T01 AT1G27180 28.467 274 164 9 418 664 695 963 9.81e-11 66.6
MsG0680032142.01.T01 AT4G33430 32.867 143 73 3 300 419 88 230 5.88e-11 67.0
MsG0680032142.01.T01 AT1G63430 33.557 149 92 3 516 664 89 230 6.20e-11 66.6
MsG0680032142.01.T01 AT1G63430 33.557 149 92 3 516 664 89 230 6.20e-11 66.6
MsG0680032142.01.T01 AT1G63430 33.557 149 92 3 516 664 89 230 7.04e-11 66.6
MsG0680032142.01.T01 AT1G48480 28.877 187 84 2 239 425 78 215 9.85e-11 66.2
MsG0680032142.01.T01 AT2G23300 36.066 183 113 3 357 538 80 259 9.91e-11 66.2

Find 168 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 214 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTCTCTCACGGTCAACTTTC+AGG 0.111141 6:-34816432 MsG0680032142.01.T01:CDS
TTGGATTTGCTACAGGATTT+TGG 0.158837 6:-34816152 MsG0680032142.01.T01:CDS
ATGATCATCACTATGCATTT+TGG 0.181623 6:+34818450 None:intergenic
CATGATTCCATGATAGATTT+AGG 0.186604 6:+34818104 None:intergenic
TTGTACACTCTTGACCTTTC+AGG 0.190803 6:-34817155 MsG0680032142.01.T01:CDS
TTCATGTCCCCTATAGTTAT+TGG 0.198070 6:+34816474 None:intergenic
TTGTCCTACAACAATCTTTC+AGG 0.222040 6:-34816360 MsG0680032142.01.T01:CDS
CGCTGCATTGGGAACCTTAC+AGG 0.222436 6:-34816744 MsG0680032142.01.T01:CDS
CCTTTCCAACAACATGTTAA+TGG 0.231412 6:-34816778 MsG0680032142.01.T01:CDS
GCACAATTACCTAACCAAAA+TGG 0.239300 6:+34818280 None:intergenic
GAACAGATTCAAAGGTGTTT+TGG 0.240164 6:+34818161 None:intergenic
AACTGGTTTCCTTGTGGAAT+TGG 0.251304 6:+34816336 None:intergenic
GTTAGGTAATTGTGCAAAAC+TGG 0.254199 6:-34818272 MsG0680032142.01.T01:CDS
TGGATCTATTCCAAACTCTT+TGG 0.258134 6:-34817768 MsG0680032142.01.T01:CDS
CAGATAATTTGTTGGATGAT+AGG 0.267849 6:+34817069 None:intergenic
GTAAAATTCCAATAACTATA+GGG 0.271127 6:-34816482 MsG0680032142.01.T01:CDS
TGGATATGATTTAGAGGAAT+TGG 0.272927 6:-34817957 MsG0680032142.01.T01:CDS
GGTTCAGATCTGAATGCTTT+TGG 0.274725 6:-34818361 MsG0680032142.01.T01:CDS
GTATCACTTCAGTTCCATTT+TGG 0.275042 6:-34818294 MsG0680032142.01.T01:CDS
TACACTCTGATGACATCTAT+TGG 0.284439 6:-34818603 MsG0680032142.01.T01:CDS
GGTAAAATTCCAATAACTAT+AGG 0.294158 6:-34816483 MsG0680032142.01.T01:CDS
AATCTATCTCACCTGCTTCT+TGG 0.297768 6:-34817230 MsG0680032142.01.T01:CDS
AGACTTGTCCCTCAACAATT+TGG 0.298234 6:-34817360 MsG0680032142.01.T01:CDS
TATCCAATAACAACTTGTTT+GGG 0.307068 6:-34817715 MsG0680032142.01.T01:CDS
CTATCATCCAACAAATTATC+TGG 0.307434 6:-34817068 MsG0680032142.01.T01:CDS
CATGAAGTCACTCGAATCTT+TGG 0.309352 6:-34816457 MsG0680032142.01.T01:CDS
CTTGCAAATAATCAACTTGA+TGG 0.312414 6:-34818382 MsG0680032142.01.T01:CDS
TAAATGTGACATTTGGAATA+GGG 0.316923 6:-34816050 MsG0680032142.01.T01:CDS
ATATCCAATAACAACTTGTT+TGG 0.326318 6:-34817716 MsG0680032142.01.T01:CDS
ATAAATGTGACATTTGGAAT+AGG 0.327395 6:-34816051 MsG0680032142.01.T01:CDS
GGATCTATTCCAAACTCTTT+GGG 0.328728 6:-34817767 MsG0680032142.01.T01:CDS
CAATTGTTAATCTTAGATAT+TGG 0.331167 6:-34816942 MsG0680032142.01.T01:CDS
GATTGTTGTAGGACAAGTTT+AGG 0.335118 6:+34816367 None:intergenic
CGGAAAGTGACCCAGTGATA+TGG 0.337169 6:+34817276 None:intergenic
GGTTCTCTAACAACAATTAT+AGG 0.338408 6:-34818067 MsG0680032142.01.T01:CDS
ATCATGTTTCATTAATCAAT+AGG 0.342127 6:+34815994 None:intergenic
TTGAATAATAACAGTCTTCA+TGG 0.343924 6:-34816996 MsG0680032142.01.T01:CDS
TGAGTTAAATTCCAACAATC+AGG 0.345894 6:+34817110 None:intergenic
TCATGTTTCATTAATCAATA+GGG 0.348501 6:+34815995 None:intergenic
GTGACTTAGAAAAGTTAAAC+TGG 0.366370 6:+34816389 None:intergenic
ACACTCTGATGACATCTATT+GGG 0.368421 6:-34818602 MsG0680032142.01.T01:CDS
TGTCAGGAACTATACCTTCT+TGG 0.371264 6:-34816908 MsG0680032142.01.T01:CDS
ATGATGATGGTAAACATGAT+AGG 0.372508 6:-34816209 MsG0680032142.01.T01:CDS
AAGAAGCAGGTGAGATAGAT+TGG 0.378742 6:+34817232 None:intergenic
CTTTCCAACAACATGTTAAT+GGG 0.380865 6:-34816777 MsG0680032142.01.T01:CDS
GGCTCAATCCCTCGCTGCAT+TGG 0.382342 6:-34816756 MsG0680032142.01.T01:CDS
AAACTGGGTTATCTTGATCT+TGG 0.391238 6:-34818256 MsG0680032142.01.T01:CDS
CTGATCATTGAAATTGTTGT+TGG 0.392123 6:+34817928 None:intergenic
GGTACAATCCCACAAAATAT+TGG 0.394529 6:-34817479 MsG0680032142.01.T01:CDS
AATTTGCAATCTGGATGTAT+TGG 0.398698 6:-34817977 MsG0680032142.01.T01:CDS
TTCCTTGAATCATTCCTGTA+AGG 0.401186 6:+34816730 None:intergenic
GAATCTGTTCCGTTGTGGTT+AGG 0.405742 6:-34818148 MsG0680032142.01.T01:CDS
TTGGGATCATGCCACTCAAA+TGG 0.406253 6:+34818683 None:intergenic
GATGTCAGCGAGATCATTAA+AGG 0.408517 6:-34816648 MsG0680032142.01.T01:CDS
AAAAGTCGACCAAAACTATA+AGG 0.409598 6:+34817398 None:intergenic
AGAGTTATTCCTCTAGGAAT+AGG 0.411584 6:+34816552 None:intergenic
TGACCCAGTGATATGGTTAT+TGG 0.412334 6:+34817283 None:intergenic
TTGTTGCCAACATAAATAGA+TGG 0.416287 6:+34816297 None:intergenic
TTGGCAGCATTCCTGATTGT+TGG 0.420378 6:-34817121 MsG0680032142.01.T01:CDS
GTTGCGGCAACTTGAAAATC+TGG 0.422243 6:-34817894 MsG0680032142.01.T01:CDS
TGGTCCTGAAAGATTGTTGT+AGG 0.424469 6:+34816356 None:intergenic
GTCACCTTTCCACTCTGGTA+TGG 0.424540 6:-34817025 MsG0680032142.01.T01:CDS
TCTCTCACGGTCAACTTTCA+GGG 0.427283 6:-34816431 MsG0680032142.01.T01:CDS
ATGTATTGGATATGATTTAG+AGG 0.427654 6:-34817963 MsG0680032142.01.T01:CDS
GGGTCTCTTCCTAATTGTAT+TGG 0.427947 6:-34817623 MsG0680032142.01.T01:CDS
CTCGTCGGTAATTTGCAATC+TGG 0.430612 6:-34817986 MsG0680032142.01.T01:CDS
TTATACAAGAAATCTGAAAC+TGG 0.431063 6:-34816613 MsG0680032142.01.T01:CDS
TTTGGGAAAATTGTCAAACT+TGG 0.432194 6:-34817822 MsG0680032142.01.T01:CDS
TTGGAATGGAATCATTTATG+AGG 0.432385 6:+34817201 None:intergenic
GCTCAATCCCTCGCTGCATT+GGG 0.435439 6:-34816755 MsG0680032142.01.T01:CDS
ATTTCTATTTCTAACAAAGA+AGG 0.437042 6:+34818490 None:intergenic
TCTCAGTAATGCAAATTCTC+AGG 0.439375 6:-34816872 MsG0680032142.01.T01:CDS
ACTGAGAAATCTAATATCCT+TGG 0.442121 6:-34817741 MsG0680032142.01.T01:CDS
TCTTCGGAAGCTATAGAAAC+TGG 0.443762 6:+34816699 None:intergenic
TGAGCCCATTAACATGTTGT+TGG 0.445664 6:+34816773 None:intergenic
CTGAACAATAATAATTTGAC+GGG 0.446587 6:-34817644 MsG0680032142.01.T01:CDS
GGAGTTATTCCGAGCTCGTT+TGG 0.449176 6:-34817047 MsG0680032142.01.T01:CDS
GTTAAACTGGACATGGTGTA+TGG 0.451663 6:+34816402 None:intergenic
CAACTAATTTGTTGCCTGAA+AGG 0.452197 6:+34817141 None:intergenic
CTTTCAGGCAACAAATTAGT+TGG 0.457958 6:-34817140 MsG0680032142.01.T01:CDS
CTTGCTAACAATCACTTGAA+TGG 0.458571 6:-34817788 MsG0680032142.01.T01:CDS
ATGATAGGGTTGAGAAATTG+TGG 0.460994 6:-34816194 MsG0680032142.01.T01:CDS
GTAGCATTTGGATTTGCTAC+AGG 0.464934 6:-34816159 MsG0680032142.01.T01:CDS
AATAACTCCAGATAATTTGT+TGG 0.465275 6:+34817061 None:intergenic
GTTGTGGTTAGGAGGGTTAG+AGG 0.465860 6:-34818137 MsG0680032142.01.T01:CDS
TTTAAATTCCTCAAGAGTGA+TGG 0.469736 6:+34816966 None:intergenic
GTCAAATTTCGAAGTGGTGA+TGG 0.470786 6:+34818208 None:intergenic
TGAGGTTGTTTCCAAGAAGC+AGG 0.471560 6:+34817219 None:intergenic
AAGTTAAAGAAAATATGTAT+AGG 0.472149 6:-34816021 MsG0680032142.01.T01:CDS
TTCAAAATACCTCTCATCTT+CGG 0.475844 6:+34816683 None:intergenic
TGGGATCATGCCACTCAAAT+GGG 0.479636 6:+34818684 None:intergenic
CTGTCACACAATCATCTGTC+TGG 0.479867 6:-34816504 MsG0680032142.01.T01:CDS
AATGATCCATCTATTTATGT+TGG 0.480317 6:-34816303 MsG0680032142.01.T01:CDS
CATTCAAGTGATTGTTAGCA+AGG 0.482674 6:+34817789 None:intergenic
AATGGGAATCAGATATCAAA+AGG 0.483050 6:+34818701 None:intergenic
TGAATAATAACAGTCTTCAT+GGG 0.486968 6:-34816995 MsG0680032142.01.T01:CDS
ATTCACATAGGCTAGTAACT+TGG 0.487850 6:+34817310 None:intergenic
CTCACCAATAACCATATCAC+TGG 0.491584 6:-34817287 MsG0680032142.01.T01:CDS
TCTGAACAATAATAATTTGA+CGG 0.494575 6:-34817645 MsG0680032142.01.T01:CDS
CTTGGAAGCAATTCTCTCAA+TGG 0.497216 6:-34818238 MsG0680032142.01.T01:CDS
ATTGAAACTGAGATCAAGAA+AGG 0.497927 6:+34818633 None:intergenic
TTTGCACAATGAATTTGGAA+TGG 0.498976 6:+34817187 None:intergenic
GAATCATGTAAATCATATTG+AGG 0.506195 6:-34818089 MsG0680032142.01.T01:CDS
ATCAGCTGCCAACATGGTTG+CGG 0.507410 6:-34817910 MsG0680032142.01.T01:CDS
TCTGTTCCGTTGTGGTTAGG+AGG 0.508939 6:-34818145 MsG0680032142.01.T01:CDS
CATAGTGATGATCATCAACT+TGG 0.511876 6:-34818442 MsG0680032142.01.T01:CDS
GTTAGAAGAGTTATTCCTCT+AGG 0.513848 6:+34816546 None:intergenic
CATGCCTTCCAAATTGTTGA+GGG 0.517672 6:+34817352 None:intergenic
TTAAATTCCTCAAGAGTGAT+GGG 0.521382 6:+34816967 None:intergenic
ATTGGAGAGAATCAAATGTC+AGG 0.521686 6:-34816924 MsG0680032142.01.T01:CDS
AACCTTACAGGAATGATTCA+AGG 0.522281 6:-34816732 MsG0680032142.01.T01:CDS
GTTTGGTCACCTTTCCACTC+TGG 0.523051 6:-34817030 MsG0680032142.01.T01:CDS
GTTGATGATAGAGTTGAAAG+TGG 0.523442 6:-34816237 MsG0680032142.01.T01:CDS
GTTGGCAACAAATACCTTTG+TGG 0.528622 6:-34816285 MsG0680032142.01.T01:CDS
AGAAGCAGGTGAGATAGATT+GGG 0.536598 6:+34817233 None:intergenic
CTGTTCCGTTGTGGTTAGGA+GGG 0.539929 6:-34818144 MsG0680032142.01.T01:CDS
GAGAGTTTGCAAAGTTGTGA+TGG 0.539970 6:+34816819 None:intergenic
AATCATGTAAATCATATTGA+GGG 0.543637 6:-34818088 MsG0680032142.01.T01:CDS
TTCACATAGGCTAGTAACTT+GGG 0.551552 6:+34817311 None:intergenic
ATTATTAGAAGAAATAATCA+AGG 0.552591 6:+34817580 None:intergenic
CCATTAACATGTTGTTGGAA+AGG 0.554919 6:+34816778 None:intergenic
ACAAGTGTTGTTATACTACA+AGG 0.557665 6:+34817686 None:intergenic
GTTGTTATTGGATATATCCA+AGG 0.561347 6:+34817724 None:intergenic
ACATGCCTTCCAAATTGTTG+AGG 0.561954 6:+34817351 None:intergenic
CCACAACGGAACAGATTCAA+AGG 0.563577 6:+34818153 None:intergenic
ACTCTTCTAACATATTTACA+TGG 0.565347 6:-34816534 MsG0680032142.01.T01:CDS
GAATCTTTGGACTTCTCTCA+CGG 0.567423 6:-34816444 MsG0680032142.01.T01:CDS
GGAACTATACCTTCTTGGAT+AGG 0.568203 6:-34816903 MsG0680032142.01.T01:CDS
GTTATTGGTGAGATTCACAT+AGG 0.575980 6:+34817298 None:intergenic
GAAAGGTGACCAAACGAGCT+CGG 0.576333 6:+34817038 None:intergenic
TTAGGTAATTGTGCAAAACT+GGG 0.577684 6:-34818271 MsG0680032142.01.T01:CDS
CCTTTGAATCTGTTCCGTTG+TGG 0.578028 6:-34818153 MsG0680032142.01.T01:CDS
TTAAGACAAAATAAGTTCCA+AGG 0.578822 6:-34816849 MsG0680032142.01.T01:CDS
ATATCTGATTCCCATTTGAG+TGG 0.579639 6:-34818694 MsG0680032142.01.T01:CDS
TTGTCCCTCAACAATTTGGA+AGG 0.581139 6:-34817356 MsG0680032142.01.T01:CDS
CTATAGCTTCCGAAGATGAG+AGG 0.583695 6:-34816692 MsG0680032142.01.T01:CDS
AAAATGTCACCTATCCAAGA+AGG 0.585793 6:+34816894 None:intergenic
TTGTGGTTAGGAGGGTTAGA+GGG 0.589573 6:-34818136 MsG0680032142.01.T01:CDS
TAAAATTCCAATAACTATAG+GGG 0.590474 6:-34816481 MsG0680032142.01.T01:CDS
TCCAATAACAACTTGTTTGG+GGG 0.593966 6:-34817713 MsG0680032142.01.T01:CDS
TCTGAAACTGGTGGCCAATG+TGG 0.594039 6:-34816601 MsG0680032142.01.T01:CDS
GGGAGTTCCCATCACTCTTG+AGG 0.596569 6:-34816974 MsG0680032142.01.T01:CDS
ATCCAATAACAACTTGTTTG+GGG 0.598332 6:-34817714 MsG0680032142.01.T01:CDS
TAAGGTTCCCAATGCAGCGA+GGG 0.599049 6:+34816748 None:intergenic
TGATGATGGTAAACATGATA+GGG 0.600935 6:-34816208 MsG0680032142.01.T01:CDS
ACTAGTTTCACAATAGTCAC+AGG 0.604765 6:+34817542 None:intergenic
GTTGTGATGGAATGTTACCT+TGG 0.610520 6:+34816832 None:intergenic
CTTTCAGGACCAATTCCACA+AGG 0.614843 6:-34816345 MsG0680032142.01.T01:CDS
TCAAGTTGCCGCAACCATGT+TGG 0.616192 6:+34817902 None:intergenic
TCAATGATCAGCTGCCAACA+TGG 0.617081 6:-34817916 MsG0680032142.01.T01:CDS
AAAGAAGTCAAATTTCGAAG+TGG 0.618414 6:+34818202 None:intergenic
GGGACAAGTCTAAATAGCGC+AGG 0.622112 6:+34817372 None:intergenic
GAAAGTGGAGACGATGATGA+TGG 0.629057 6:-34816222 MsG0680032142.01.T01:CDS
GAATAATAACAGTCTTCATG+GGG 0.648322 6:-34816994 MsG0680032142.01.T01:CDS
TACAAGAAATCTGAAACTGG+TGG 0.648835 6:-34816610 MsG0680032142.01.T01:CDS
GCAACCATACCAGAGTGGAA+AGG 0.650419 6:+34817021 None:intergenic
ACATGACATTGATTTGACAA+TGG 0.651304 6:+34816258 None:intergenic
GAAATTTGACTTCTTTGACG+TGG 0.652500 6:-34818195 MsG0680032142.01.T01:CDS
TAGAAAAGTTAAACTGGACA+TGG 0.652945 6:+34816395 None:intergenic
TTGAGTGGACCTATTCCTAG+AGG 0.656565 6:-34816561 MsG0680032142.01.T01:CDS
CTTCAAGGAGATGCACTCGT+CGG 0.662661 6:-34818001 MsG0680032142.01.T01:CDS
TTGACAATGGTGCACCACAA+AGG 0.666636 6:+34816271 None:intergenic
TCACCAATAACCATATCACT+GGG 0.674603 6:-34817286 MsG0680032142.01.T01:CDS
TCGGAAGCTATAGAAACTGG+CGG 0.687392 6:+34816702 None:intergenic
CAAATGCAACCATACCAGAG+TGG 0.724103 6:+34817016 None:intergenic
TCTAACCCTCCTAACCACAA+CGG 0.730411 6:+34818139 None:intergenic
GTAAGGTTCCCAATGCAGCG+AGG 0.730520 6:+34816747 None:intergenic
TGAACAATAATAATTTGACG+GGG 0.744547 6:-34817643 MsG0680032142.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AATTATTTTTACTAAGATAT+AGG + Chr6:34817291-34817310 None:intergenic 10.0%
!!! ATTATTTTTACTAAGATATA+GGG + Chr6:34817290-34817309 None:intergenic 10.0%
!!! ATTTCTTCTAATAATTTTTA+TGG - Chr6:34817151-34817170 MsG0680032142.01.T01:CDS 10.0%
!! AAGTTAAAGAAAATATGTAT+AGG - Chr6:34818702-34818721 MsG0680032142.01.T01:CDS 15.0%
!! ATTATTAGAAGAAATAATCA+AGG + Chr6:34817146-34817165 None:intergenic 15.0%
!! AATCATGTAAATCATATTGA+GGG - Chr6:34816635-34816654 MsG0680032142.01.T01:CDS 20.0%
!! CAAAAAATAAATGTGACATT+TGG - Chr6:34818666-34818685 MsG0680032142.01.T01:CDS 20.0%
!! CAATTGTTAATCTTAGATAT+TGG - Chr6:34817781-34817800 MsG0680032142.01.T01:CDS 20.0%
!! GTAAAATTCCAATAACTATA+GGG - Chr6:34818241-34818260 MsG0680032142.01.T01:CDS 20.0%
!! TAAAATTCCAATAACTATAG+GGG - Chr6:34818242-34818261 MsG0680032142.01.T01:CDS 20.0%
!! TCTGAACAATAATAATTTGA+CGG - Chr6:34817078-34817097 MsG0680032142.01.T01:CDS 20.0%
!!! ACAAATTTTCCAATACAATT+AGG + Chr6:34817112-34817131 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTCTATTTCTAACAAAGA+AGG + Chr6:34816236-34816255 None:intergenic 20.0%
!!! GAAAAATTTCCTTATAGTTT+TGG - Chr6:34817316-34817335 MsG0680032142.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTATTTTGCACAATGAATT+TGG + Chr6:34817544-34817563 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTCAAACAATAATTTGAG+TGG - Chr6:34818147-34818166 MsG0680032142.01.T01:CDS 20.0%
! AATGATCCATCTATTTATGT+TGG - Chr6:34818420-34818439 MsG0680032142.01.T01:CDS 25.0%
! ACTCTTCTAACATATTTACA+TGG - Chr6:34818189-34818208 MsG0680032142.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTATTGGATATGATTTAG+AGG - Chr6:34816760-34816779 MsG0680032142.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGTTTGAAAAATCCACAT+TGG + Chr6:34818139-34818158 None:intergenic 25.0%
! CTGAACAATAATAATTTGAC+GGG - Chr6:34817079-34817098 MsG0680032142.01.T01:CDS 25.0%
! GAATCATGTAAATCATATTG+AGG - Chr6:34816634-34816653 MsG0680032142.01.T01:CDS 25.0%
! GATCATTAAGTGTTAAAAAC+TGG + Chr6:34818407-34818426 None:intergenic 25.0%
! GGTAAAATTCCAATAACTAT+AGG - Chr6:34818240-34818259 MsG0680032142.01.T01:CDS 25.0%
! TGAACAATAATAATTTGACG+GGG - Chr6:34817080-34817099 MsG0680032142.01.T01:CDS 25.0%
! TGAATAATAACAGTCTTCAT+GGG - Chr6:34817728-34817747 MsG0680032142.01.T01:CDS 25.0%
! TTAAGACAAAATAAGTTCCA+AGG - Chr6:34817874-34817893 MsG0680032142.01.T01:CDS 25.0%
! TTGAATAATAACAGTCTTCA+TGG - Chr6:34817727-34817746 MsG0680032142.01.T01:CDS 25.0%
!! AAAGTTGACCAATATTTTGT+GGG + Chr6:34817255-34817274 None:intergenic 25.0%
!! AATAACTCCAGATAATTTGT+TGG + Chr6:34817665-34817684 None:intergenic 25.0%
!! ATAAATGTGACATTTGGAAT+AGG - Chr6:34818672-34818691 MsG0680032142.01.T01:CDS 25.0%
!! ATATCCAATAACAACTTGTT+TGG - Chr6:34817007-34817026 MsG0680032142.01.T01:CDS 25.0%
!! CAATTTGTGAGCAATATTTT+CGG + Chr6:34817470-34817489 None:intergenic 25.0%
!! GACAATTTTCCCAAAAAATT+TGG + Chr6:34816896-34816915 None:intergenic 25.0%
!! TAAATGTGACATTTGGAATA+GGG - Chr6:34818673-34818692 MsG0680032142.01.T01:CDS 25.0%
!! TATCCAATAACAACTTGTTT+GGG - Chr6:34817008-34817027 MsG0680032142.01.T01:CDS 25.0%
!! TTATACAAGAAATCTGAAAC+TGG - Chr6:34818110-34818129 MsG0680032142.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTCCCAAAAAATTTGGAAT+AGG + Chr6:34816890-34816909 None:intergenic 25.0%
!! TTTTGTACCTAAATCTATCA+TGG - Chr6:34816612-34816631 MsG0680032142.01.T01:CDS 25.0%
AAAAACTTGAATGAAGTGTG+AGG + Chr6:34816859-34816878 None:intergenic 30.0%
AAAAGTCGACCAAAACTATA+AGG + Chr6:34817328-34817347 None:intergenic 30.0%
AAAGAAGTCAAATTTCGAAG+TGG + Chr6:34816524-34816543 None:intergenic 30.0%
AATGGGAATCAGATATCAAA+AGG + Chr6:34816025-34816044 None:intergenic 30.0%
AATTTGCAATCTGGATGTAT+TGG - Chr6:34816746-34816765 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
ACTGAGAAATCTAATATCCT+TGG - Chr6:34816982-34817001 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
ATTGAAACTGAGATCAAGAA+AGG + Chr6:34816093-34816112 None:intergenic 30.0%
CATGATTCCATGATAGATTT+AGG + Chr6:34816622-34816641 None:intergenic 30.0%
CTATCATCCAACAAATTATC+TGG - Chr6:34817655-34817674 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
CTGATCATTGAAATTGTTGT+TGG + Chr6:34816798-34816817 None:intergenic 30.0%
CTTGCAAATAATCAACTTGA+TGG - Chr6:34816341-34816360 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
CTTTCCAACAACATGTTAAT+GGG - Chr6:34817946-34817965 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
GAATAATAACAGTCTTCATG+GGG - Chr6:34817729-34817748 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
GGTTCTCTAACAACAATTAT+AGG - Chr6:34816656-34816675 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
GTGACTTAGAAAAGTTAAAC+TGG + Chr6:34818337-34818356 None:intergenic 30.0%
TAGAAAAGTTAAACTGGACA+TGG + Chr6:34818331-34818350 None:intergenic 30.0%
TGAGTTAAATTCCAACAATC+AGG + Chr6:34817616-34817635 None:intergenic 30.0%
TGGATATGATTTAGAGGAAT+TGG - Chr6:34816766-34816785 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
TTAAATTCCTCAAGAGTGAT+GGG + Chr6:34817759-34817778 None:intergenic 30.0%
TTAGGTAATTGTGCAAAACT+GGG - Chr6:34816452-34816471 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
TTCAAAATACCTCTCATCTT+CGG + Chr6:34818043-34818062 None:intergenic 30.0%
TTGGAATGGAATCATTTATG+AGG + Chr6:34817525-34817544 None:intergenic 30.0%
TTGTTGCCAACATAAATAGA+TGG + Chr6:34818429-34818448 None:intergenic 30.0%
TTTAAATTCCTCAAGAGTGA+TGG + Chr6:34817760-34817779 None:intergenic 30.0%
TTTGCACAATGAATTTGGAA+TGG + Chr6:34817539-34817558 None:intergenic 30.0%
TTTGGGAAAATTGTCAAACT+TGG - Chr6:34816901-34816920 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
! AAAAATTTGGAATAGGACCA+TGG + Chr6:34816883-34816902 None:intergenic 30.0%
! ACAAGTGTTGTTATACTACA+AGG + Chr6:34817040-34817059 None:intergenic 30.0%
! ACAATTTTGTGAGGTTTTCA+AGG + Chr6:34816070-34816089 None:intergenic 30.0%
! ATCCAATAACAACTTGTTTG+GGG - Chr6:34817009-34817028 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
! ATGATCATCACTATGCATTT+TGG + Chr6:34816276-34816295 None:intergenic 30.0%
! CTTTTGTCACTAGATTTTTC+TGG - Chr6:34816692-34816711 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
! GAAAGTTGACCAATATTTTG+TGG + Chr6:34817256-34817275 None:intergenic 30.0%
! GTTGTTATTGGATATATCCA+AGG + Chr6:34817002-34817021 None:intergenic 30.0%
! TTTTACTTTGTGGTAGCATT+TGG - Chr6:34818552-34818571 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
!! ACATGACATTGATTTGACAA+TGG + Chr6:34818468-34818487 None:intergenic 30.0%
!! ATGATGATGGTAAACATGAT+AGG - Chr6:34818514-34818533 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
!! CAGATAATTTGTTGGATGAT+AGG + Chr6:34817657-34817676 None:intergenic 30.0%
!! GAAATTGTGGTTTTACTTTG+TGG - Chr6:34818542-34818561 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
!! TGATGATGGTAAACATGATA+GGG - Chr6:34818515-34818534 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTTCTGGAAATAGACTTCA+AGG - Chr6:34816707-34816726 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
!!! AACAGATTCAAAGGTGTTTT+GGG + Chr6:34816564-34816583 None:intergenic 30.0%
!!! AAGATGAGAGGTATTTTGAA+TGG - Chr6:34818043-34818062 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
!!! CTTCATTCAAGTTTTTTCCA+TGG - Chr6:34816863-34816882 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
!!! GGTCCTATTCCAAATTTTTT+GGG - Chr6:34816884-34816903 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGGTCCTATTCCAAATTTTT+TGG - Chr6:34816883-34816902 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTTACTGGAGTTTTGTTG+TGG - Chr6:34818595-34818614 MsG0680032142.01.T01:CDS 30.0%
AAAATGTCACCTATCCAAGA+AGG + Chr6:34817832-34817851 None:intergenic 35.0%
AAACTGGGTTATCTTGATCT+TGG - Chr6:34816467-34816486 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
AACCTTACAGGAATGATTCA+AGG - Chr6:34817991-34818010 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
ACACTCTGATGACATCTATT+GGG - Chr6:34816121-34816140 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
ATATCTGATTCCCATTTGAG+TGG - Chr6:34816029-34816048 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
ATGATAGGGTTGAGAAATTG+TGG - Chr6:34818529-34818548 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
ATTCACATAGGCTAGTAACT+TGG + Chr6:34817416-34817435 None:intergenic 35.0%
ATTGGAGAGAATCAAATGTC+AGG - Chr6:34817799-34817818 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
CATAGTGATGATCATCAACT+TGG - Chr6:34816281-34816300 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
CATTCAAGTGATTGTTAGCA+AGG + Chr6:34816937-34816956 None:intergenic 35.0%
CCATTAACATGTTGTTGGAA+AGG + Chr6:34817948-34817967 None:intergenic 35.0%
CCTTTCCAACAACATGTTAA+TGG - Chr6:34817945-34817964 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
CTTGCTAACAATCACTTGAA+TGG - Chr6:34816935-34816954 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
CTTTCAGGCAACAAATTAGT+TGG - Chr6:34817583-34817602 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
GATTGTTGTAGGACAAGTTT+AGG + Chr6:34818359-34818378 None:intergenic 35.0%
GCACAATTACCTAACCAAAA+TGG + Chr6:34816446-34816465 None:intergenic 35.0%
GGATCTATTCCAAACTCTTT+GGG - Chr6:34816956-34816975 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
GGTACAATCCCACAAAATAT+TGG - Chr6:34817244-34817263 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
GTGTCAAAAAACTCTCTGAA+TGG - Chr6:34817223-34817242 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
GTTAGAAGAGTTATTCCTCT+AGG + Chr6:34818180-34818199 None:intergenic 35.0%
GTTAGGTAATTGTGCAAAAC+TGG - Chr6:34816451-34816470 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
GTTATTGGTGAGATTCACAT+AGG + Chr6:34817428-34817447 None:intergenic 35.0%
TACACTCTGATGACATCTAT+TGG - Chr6:34816120-34816139 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
TCACCAATAACCATATCACT+GGG - Chr6:34817437-34817456 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
TCTCAGTAATGCAAATTCTC+AGG - Chr6:34817851-34817870 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
TGGATCTATTCCAAACTCTT+TGG - Chr6:34816955-34816974 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
TTCACATAGGCTAGTAACTT+GGG + Chr6:34817415-34817434 None:intergenic 35.0%
TTCATGTCCCCTATAGTTAT+TGG + Chr6:34818252-34818271 None:intergenic 35.0%
TTCCTTGAATCATTCCTGTA+AGG + Chr6:34817996-34818015 None:intergenic 35.0%
TTGTCCTACAACAATCTTTC+AGG - Chr6:34818363-34818382 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
! ACTAGTTTCACAATAGTCAC+AGG + Chr6:34817184-34817203 None:intergenic 35.0%
! AGAGTTATTCCTCTAGGAAT+AGG + Chr6:34818174-34818193 None:intergenic 35.0%
! CAAGAAAGGACAATTTTGTG+AGG + Chr6:34816079-34816098 None:intergenic 35.0%
! GAAATTTGACTTCTTTGACG+TGG - Chr6:34816528-34816547 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
! GTATCACTTCAGTTCCATTT+TGG - Chr6:34816429-34816448 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
! GTTAAAAACTGGTTTCCTTG+TGG + Chr6:34818396-34818415 None:intergenic 35.0%
! GTTCAGATCTGAATGCTTTT+GGG - Chr6:34816363-34816382 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
! TACAAGAAATCTGAAACTGG+TGG - Chr6:34818113-34818132 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
! TCCAATAACAACTTGTTTGG+GGG - Chr6:34817010-34817029 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
!! CAACTAATTTGTTGCCTGAA+AGG + Chr6:34817585-34817604 None:intergenic 35.0%
!! GTTGATGATAGAGTTGAAAG+TGG - Chr6:34818486-34818505 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
!! TGAGGTTTTCAAGGTTGTTT+GGG + Chr6:34816061-34816080 None:intergenic 35.0%
!! TTTTGTTGTGGAAAAAGGGT+TGG - Chr6:34818607-34818626 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACAGGATTTTGGGTTTTTAC+TGG - Chr6:34818582-34818601 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACTTCAGTTCCATTTTGGTT+AGG - Chr6:34816434-34816453 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
!!! ATTCAAAGGTGTTTTGGGAA+AGG + Chr6:34816559-34816578 None:intergenic 35.0%
!!! GAACAGATTCAAAGGTGTTT+TGG + Chr6:34816565-34816584 None:intergenic 35.0%
!!! GGAGTTTTGTTGTGGAAAAA+GGG - Chr6:34818603-34818622 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGGAGTTTTGTTGTGGAAAA+AGG - Chr6:34818602-34818621 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGGATTTGCTACAGGATTTT+GGG - Chr6:34818572-34818591 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTGGATTTGCTACAGGATTT+TGG - Chr6:34818571-34818590 MsG0680032142.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAGCAGGTGAGATAGAT+TGG + Chr6:34817494-34817513 None:intergenic 40.0%
AATCTATCTCACCTGCTTCT+TGG - Chr6:34817493-34817512 MsG0680032142.01.T01:CDS 40.0%
ACATGCCTTCCAAATTGTTG+AGG + Chr6:34817375-34817394 None:intergenic 40.0%
ACCCCCAAACAAGTTGTTAT+TGG + Chr6:34817014-34817033 None:intergenic 40.0%
AGAAGCAGGTGAGATAGATT+GGG + Chr6:34817493-34817512 None:intergenic 40.0%
AGACTTGTCCCTCAACAATT+TGG - Chr6:34817363-34817382 MsG0680032142.01.T01:CDS 40.0%
CATGAAGTCACTCGAATCTT+TGG - Chr6:34818266-34818285 MsG0680032142.01.T01:CDS 40.0%
CATGCCTTCCAAATTGTTGA+GGG + Chr6:34817374-34817393 None:intergenic 40.0%
CTCACCAATAACCATATCAC+TGG - Chr6:34817436-34817455 MsG0680032142.01.T01:CDS 40.0%
CTTGGAAGCAATTCTCTCAA+TGG - Chr6:34816485-34816504 MsG0680032142.01.T01:CDS 40.0%
GAATCTTTGGACTTCTCTCA+CGG - Chr6:34818279-34818298 MsG0680032142.01.T01:CDS 40.0%
GAGAGTTTGCAAAGTTGTGA+TGG + Chr6:34817907-34817926 None:intergenic 40.0%
GATGTCAGCGAGATCATTAA+AGG - Chr6:34818075-34818094 MsG0680032142.01.T01:CDS 40.0%
GGAACTATACCTTCTTGGAT+AGG - Chr6:34817820-34817839 MsG0680032142.01.T01:CDS 40.0%
GGGTCTCTTCCTAATTGTAT+TGG - Chr6:34817100-34817119 MsG0680032142.01.T01:CDS 40.0%
GTCAAATTTCGAAGTGGTGA+TGG + Chr6:34816518-34816537 None:intergenic 40.0%
GTTAAACTGGACATGGTGTA+TGG + Chr6:34818324-34818343 None:intergenic 40.0%
GTTGGCAACAAATACCTTTG+TGG - Chr6:34818438-34818457 MsG0680032142.01.T01:CDS 40.0%
TCTTCGGAAGCTATAGAAAC+TGG + Chr6:34818027-34818046 None:intergenic 40.0%
TGACCCAGTGATATGGTTAT+TGG + Chr6:34817443-34817462 None:intergenic 40.0%
TGAGCCCATTAACATGTTGT+TGG + Chr6:34817953-34817972 None:intergenic 40.0%
TGGTCCTGAAAGATTGTTGT+AGG + Chr6:34818370-34818389 None:intergenic 40.0%
TGTCAGGAACTATACCTTCT+TGG - Chr6:34817815-34817834 MsG0680032142.01.T01:CDS 40.0%
TTGTACACTCTTGACCTTTC+AGG - Chr6:34817568-34817587 MsG0680032142.01.T01:CDS 40.0%
TTGTCCCTCAACAATTTGGA+AGG - Chr6:34817367-34817386 MsG0680032142.01.T01:CDS 40.0%
! AACTGGTTTCCTTGTGGAAT+TGG + Chr6:34818390-34818409 None:intergenic 40.0%
! CTCAGTTTTCCCAAAGAGTT+TGG + Chr6:34816968-34816987 None:intergenic 40.0%
! GGTTCAGATCTGAATGCTTT+TGG - Chr6:34816362-34816381 MsG0680032142.01.T01:CDS 40.0%
! GTTGTGATGGAATGTTACCT+TGG + Chr6:34817894-34817913 None:intergenic 40.0%
!! GTAGCATTTGGATTTGCTAC+AGG - Chr6:34818564-34818583 MsG0680032142.01.T01:CDS 40.0%
!! GTGAGGTTTTCAAGGTTGTT+TGG + Chr6:34816062-34816081 None:intergenic 40.0%
CAAATGCAACCATACCAGAG+TGG + Chr6:34817710-34817729 None:intergenic 45.0%
CCACAACGGAACAGATTCAA+AGG + Chr6:34816573-34816592 None:intergenic 45.0%
CCTTTGAATCTGTTCCGTTG+TGG - Chr6:34816570-34816589 MsG0680032142.01.T01:CDS 45.0%
CTATAGCTTCCGAAGATGAG+AGG - Chr6:34818031-34818050 MsG0680032142.01.T01:CDS 45.0%
CTGTCACACAATCATCTGTC+TGG - Chr6:34818219-34818238 MsG0680032142.01.T01:CDS 45.0%
CTTTCAGGACCAATTCCACA+AGG - Chr6:34818378-34818397 MsG0680032142.01.T01:CDS 45.0%
GAAAAACGTCGCTCAGGTAA+AGG + Chr6:34816172-34816191 None:intergenic 45.0%
GAAAGTGGAGACGATGATGA+TGG - Chr6:34818501-34818520 MsG0680032142.01.T01:CDS 45.0%
GAATCTGTTCCGTTGTGGTT+AGG - Chr6:34816575-34816594 MsG0680032142.01.T01:CDS 45.0%
GTTGCGGCAACTTGAAAATC+TGG - Chr6:34816829-34816848 MsG0680032142.01.T01:CDS 45.0%
TCAATGATCAGCTGCCAACA+TGG - Chr6:34816807-34816826 MsG0680032142.01.T01:CDS 45.0%
TCGGAAGCTATAGAAACTGG+CGG + Chr6:34818024-34818043 None:intergenic 45.0%
TCTAACCCTCCTAACCACAA+CGG + Chr6:34816587-34816606 None:intergenic 45.0%
TCTCTCACGGTCAACTTTCA+GGG - Chr6:34818292-34818311 MsG0680032142.01.T01:CDS 45.0%
TGGGATCATGCCACTCAAAT+GGG + Chr6:34816042-34816061 None:intergenic 45.0%
TGTTGTGGAAAAAGGGTTGG+AGG - Chr6:34818610-34818629 MsG0680032142.01.T01:CDS 45.0%
TTCTCTCACGGTCAACTTTC+AGG - Chr6:34818291-34818310 MsG0680032142.01.T01:CDS 45.0%
TTGACAATGGTGCACCACAA+AGG + Chr6:34818455-34818474 None:intergenic 45.0%
TTGAGTGGACCTATTCCTAG+AGG - Chr6:34818162-34818181 MsG0680032142.01.T01:CDS 45.0%
TTGGCAGCATTCCTGATTGT+TGG - Chr6:34817602-34817621 MsG0680032142.01.T01:CDS 45.0%
TTGGGATCATGCCACTCAAA+TGG + Chr6:34816043-34816062 None:intergenic 45.0%
TTGTGGTTAGGAGGGTTAGA+GGG - Chr6:34816587-34816606 MsG0680032142.01.T01:CDS 45.0%
! CTCGTCGGTAATTTGCAATC+TGG - Chr6:34816737-34816756 MsG0680032142.01.T01:CDS 45.0%
! TACCTGAGCGACGTTTTTCT+CGG - Chr6:34816173-34816192 MsG0680032142.01.T01:CDS 45.0%
! TGAGGTTGTTTCCAAGAAGC+AGG + Chr6:34817507-34817526 None:intergenic 45.0%
ATCAGCTGCCAACATGGTTG+CGG - Chr6:34816813-34816832 MsG0680032142.01.T01:CDS 50.0%
CGGAAAGTGACCCAGTGATA+TGG + Chr6:34817450-34817469 None:intergenic 50.0%
CTGTTCCGTTGTGGTTAGGA+GGG - Chr6:34816579-34816598 MsG0680032142.01.T01:CDS 50.0%
CTTCAAGGAGATGCACTCGT+CGG - Chr6:34816722-34816741 MsG0680032142.01.T01:CDS 50.0%
GAAAGGTGACCAAACGAGCT+CGG + Chr6:34817688-34817707 None:intergenic 50.0%
GCAACCATACCAGAGTGGAA+AGG + Chr6:34817705-34817724 None:intergenic 50.0%
GGAGTTATTCCGAGCTCGTT+TGG - Chr6:34817676-34817695 MsG0680032142.01.T01:CDS 50.0%
GGGACAAGTCTAAATAGCGC+AGG + Chr6:34817354-34817373 None:intergenic 50.0%
GTCACCTTTCCACTCTGGTA+TGG - Chr6:34817698-34817717 MsG0680032142.01.T01:CDS 50.0%
GTTGTGGTTAGGAGGGTTAG+AGG - Chr6:34816586-34816605 MsG0680032142.01.T01:CDS 50.0%
GTTTGGTCACCTTTCCACTC+TGG - Chr6:34817693-34817712 MsG0680032142.01.T01:CDS 50.0%
TAAGGTTCCCAATGCAGCGA+GGG + Chr6:34817978-34817997 None:intergenic 50.0%
TCTGTTCCGTTGTGGTTAGG+AGG - Chr6:34816578-34816597 MsG0680032142.01.T01:CDS 50.0%
! TCAAGTTGCCGCAACCATGT+TGG + Chr6:34816824-34816843 None:intergenic 50.0%
! TCTGAAACTGGTGGCCAATG+TGG - Chr6:34818122-34818141 MsG0680032142.01.T01:CDS 50.0%
CGCTGCATTGGGAACCTTAC+AGG - Chr6:34817979-34817998 MsG0680032142.01.T01:CDS 55.0%
GCTCAATCCCTCGCTGCATT+GGG - Chr6:34817968-34817987 MsG0680032142.01.T01:CDS 55.0%
GGGAGTTCCCATCACTCTTG+AGG - Chr6:34817749-34817768 MsG0680032142.01.T01:CDS 55.0%
GTAAGGTTCCCAATGCAGCG+AGG + Chr6:34817979-34817998 None:intergenic 55.0%
TGCCGAGAAAAACGTCGCTC+AGG + Chr6:34816178-34816197 None:intergenic 55.0%
GGCTCAATCCCTCGCTGCAT+TGG - Chr6:34817967-34817986 MsG0680032142.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 34816005 34818740 34816005 ID=MsG0680032142.01;Name=MsG0680032142.01
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Gene Sequence

>MsG0680032142.01.T01

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Protein sequence

>MsG0680032142.01.T01

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