AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680034768.01


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MsG0680034768.01.T01 AT1G74630 22.428 486 259 12 4 413 25 468 3.39e-26 114
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MsG0680034768.01.T01 AT2G33680 31.140 623 382 5 20 633 201 785 4.87e-107 343
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MsG0680034768.01.T01 AT1G53600 23.658 503 293 13 141 570 54 538 1.37e-28 122
MsG0680034768.01.T01 AT3G04750 31.707 615 392 14 21 617 51 655 3.87e-97 314
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MsG0680034768.01.T01 AT4G18840 28.226 496 311 5 116 570 50 541 6.91e-66 227
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MsG0680034768.01.T01 AT3G58590 24.895 474 248 10 141 512 53 520 9.95e-34 138
MsG0680034768.01.T01 AT3G58590 24.168 571 338 15 3 528 115 635 4.85e-30 127
MsG0680034768.01.T01 AT3G58590 27.108 166 117 2 336 499 15 178 1.66e-11 68.2
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MsG0680034768.01.T01 AT3G26630 25.000 176 125 1 58 226 207 382 1.03e-12 71.2
MsG0680034768.01.T01 AT4G32450 29.512 471 297 8 242 704 93 536 6.92e-63 219
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MsG0680034768.01.T01 AT1G71460 27.255 499 313 8 2 489 114 573 1.07e-59 214
MsG0680034768.01.T01 AT1G71460 27.455 499 302 10 52 536 65 517 6.68e-48 180
MsG0680034768.01.T01 AT1G71460 23.305 236 166 5 317 545 95 322 3.58e-15 79.7
MsG0680034768.01.T01 AT1G71460 23.200 250 171 3 19 254 436 678 1.32e-11 68.6
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MsG0680034768.01.T01 AT2G41720 20.461 347 220 7 265 592 180 489 4.70e-11 66.6
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Find 224 sgRNAs with CRISPR-Local

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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CCTCTTCCGTTAATCCGTTT+TGG 0.207249 6:-94219377 None:intergenic
TGAAATGCCATCCCGTAATT+TGG 0.223453 6:+94219218 MsG0680034768.01.T01:CDS
TCTTGGTGCTTTCTCTCAAT+TGG 0.227451 6:+94216613 MsG0680034768.01.T01:CDS
GAGAAATTGGCAGTAATATT+AGG 0.238593 6:+94219957 MsG0680034768.01.T01:CDS
ATACGATGTTAAACCTAAAA+TGG 0.247991 6:+94219431 MsG0680034768.01.T01:CDS
CAGCCACCTGCTGTTGTTCC+TGG 0.250676 6:+94221720 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR
TTTGCCGGGTGTTGGGAATT+TGG 0.251657 6:+94218651 MsG0680034768.01.T01:CDS
CATCCCGTAATTTGGTTTCT+TGG 0.255365 6:+94219226 MsG0680034768.01.T01:CDS
GAAATTGATCAAACTGAAAT+AGG 0.261887 6:+94218811 MsG0680034768.01.T01:CDS
AGGGTACACACTCTTCTTTC+TGG 0.262234 6:+94219783 MsG0680034768.01.T01:CDS
ATATGTACTTGAAATGTAAT+AGG 0.282050 6:+94218354 MsG0680034768.01.T01:CDS
TCCAAAATCTCTTTCATTTG+TGG 0.285286 6:-94219819 None:intergenic
TTCTCTCAATTGGGTTCTCT+TGG 0.293322 6:+94216623 MsG0680034768.01.T01:CDS
CGTTGAGGAGGGTGGTTGTT+GGG 0.295906 6:-94216391 None:intergenic
GTGGGAGAGAGGAGAGGATA+GGG 0.305021 6:-94216523 None:intergenic
GTTCATCATAATTTGAGTTT+AGG 0.318638 6:+94219582 MsG0680034768.01.T01:CDS
ATGGGTTTGCTTGTGTTAAT+GGG 0.320124 6:+94218294 MsG0680034768.01.T01:CDS
CTTGGTGCTTTCTCTCAATT+GGG 0.330663 6:+94216614 MsG0680034768.01.T01:CDS
TGGGAAAGACATGGAGGCTT+TGG 0.337620 6:+94218975 MsG0680034768.01.T01:CDS
GAATGATCCTCTTGGTTTGA+TGG 0.339477 6:-94221656 None:intergenic
TGCAGCACAGTCTTGGTAAT+CGG 0.348867 6:-94219888 None:intergenic
CAAAACAATTTCGTGATAAC+CGG 0.351107 6:-94219194 None:intergenic
TTTGGGTTTGGAATTGGAAT+TGG 0.352327 6:-94216254 None:intergenic
GAAGTTTAAAGCCGGAGAAT+TGG 0.361287 6:+94218903 MsG0680034768.01.T01:CDS
GAATGTTAACGTTGTTGTTA+TGG 0.367065 6:-94216293 None:intergenic
CTTACTGGGTTGTCGCGTAA+TGG 0.367110 6:+94218850 MsG0680034768.01.T01:CDS
GATTAAGCTGGGTTTGGAAT+TGG 0.367312 6:+94218711 MsG0680034768.01.T01:CDS
CACCAAGAACATGACGAAAA+TGG 0.367898 6:-94216598 None:intergenic
GTTTGGAGTGCGATGATTGC+GGG 0.370567 6:+94218428 MsG0680034768.01.T01:CDS
GATGGTGGGGTGTGGGAGAG+AGG 0.372242 6:-94216534 None:intergenic
TTACAAATGGGTGCTGAGTC+TGG 0.385553 6:+94221938 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR
TTTGCTTGTGTTAATGGGTT+TGG 0.394200 6:+94218299 MsG0680034768.01.T01:CDS
ATGTAGTTCCCGGGGTTGTC+TGG 0.394345 6:-94219639 None:intergenic
AATTCCAAGAAACCAAATTA+CGG 0.394378 6:-94219230 None:intergenic
TAATGTTGACAACAGGTTCA+TGG 0.398190 6:+94218275 MsG0680034768.01.T01:intron
AATGCCCTCTGTACCTTAGC+AGG 0.402678 6:-94221750 None:intergenic
AGCTTTGAAACCTGGTAAAC+AGG 0.404191 6:+94216703 MsG0680034768.01.T01:CDS
CGAGGGTGGTGAAGAAGATA+TGG 0.404462 6:+94221961 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR
GAGGAGAGAAGTGGTGAGTT+GGG 0.405434 6:-94216462 None:intergenic
TAATGGGTTTGGTTCGGATT+CGG 0.406806 6:+94218310 MsG0680034768.01.T01:CDS
GTGTGGTCACAGTGAGAAAT+TGG 0.411993 6:+94219944 MsG0680034768.01.T01:CDS
GTATGTGATTAAGCTGGGTT+TGG 0.412779 6:+94218705 MsG0680034768.01.T01:CDS
GTGAGAGAGATGTGATTGTT+TGG 0.415054 6:+94218411 MsG0680034768.01.T01:CDS
AGAGGATAGGGGTGAGATGT+GGG 0.415594 6:-94216511 None:intergenic
ATTCCAAGAAACCAAATTAC+GGG 0.418927 6:-94219229 None:intergenic
AATGAGAAGATGGTGGGGTG+TGG 0.422034 6:-94216542 None:intergenic
ATTGCGGGGTATTCGAGGTT+GGG 0.423728 6:+94218443 MsG0680034768.01.T01:CDS
GAGAGGATAGGGGTGAGATG+TGG 0.424003 6:-94216512 None:intergenic
AGTGCTCTTCTTGACATGTA+TGG 0.428695 6:+94218748 MsG0680034768.01.T01:CDS
TCCAACATTTATGCTTCAAA+TGG 0.435455 6:+94219669 MsG0680034768.01.T01:CDS
TGTTGGGGAGTTGAGACATT+GGG 0.435716 6:-94216375 None:intergenic
CTTGGGATAGTAACAGCATT+AGG 0.439419 6:-94219033 None:intergenic
AAAGACGGTGTTTGCTCTTG+TGG 0.441257 6:+94220125 MsG0680034768.01.T01:CDS
GGGTGAGATGTGGGAAAGGG+AGG 0.442410 6:-94216502 None:intergenic
TGTGGGAGAGAGGAGAGGAT+AGG 0.442477 6:-94216524 None:intergenic
GCGTTGAGGAGGGTGGTTGT+TGG 0.443090 6:-94216392 None:intergenic
CTAGGAAGAAGATAACTATC+AGG 0.446023 6:-94216653 None:intergenic
AGCAAACACCGTCTTTGAAA+TGG 0.446827 6:-94220118 None:intergenic
TGAGGAGAGAAGTGGTGAGT+TGG 0.447081 6:-94216463 None:intergenic
GCAGCACAGTCTTGGTAATC+GGG 0.448684 6:-94219887 None:intergenic
GGACAGAAGAATGTAGTTCC+CGG 0.449481 6:-94219649 None:intergenic
CACAAGCAGGGATCAAGCTT+GGG 0.452382 6:-94219050 None:intergenic
TGGGTTGTCGCGTAATGGTT+TGG 0.454282 6:+94218855 MsG0680034768.01.T01:CDS
GATTGCGGGGTATTCGAGGT+TGG 0.455049 6:+94218442 MsG0680034768.01.T01:CDS
CTTGGTAATCGGGAGGCAAC+CGG 0.457303 6:-94219877 None:intergenic
AACATTCAACTCCAATTCTC+CGG 0.457584 6:-94218914 None:intergenic
CACGGGTATGTGATTAAGCT+GGG 0.458527 6:+94218700 MsG0680034768.01.T01:CDS
ACGCGATATGATGAAAAGTA+AGG 0.461871 6:+94219716 MsG0680034768.01.T01:CDS
GATACAATGGATTGGAACAT+TGG 0.462270 6:-94216353 None:intergenic
CCACAAGCAGGGATCAAGCT+TGG 0.462433 6:-94219051 None:intergenic
ATAGGGGTGAGATGTGGGAA+AGG 0.462663 6:-94216506 None:intergenic
GGATCATTCAGTTCATAGAT+TGG 0.463053 6:+94221670 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR
ATTACTTGAAGTGGTTGTCC+TGG 0.464598 6:-94219996 None:intergenic
TCACGGGTATGTGATTAAGC+TGG 0.464857 6:+94218699 MsG0680034768.01.T01:CDS
TGGTGAAGAGGTTGAATTTG+AGG 0.466181 6:-94216436 None:intergenic
TTTATGCTTCAAATGGTATG+TGG 0.467726 6:+94219676 MsG0680034768.01.T01:CDS
ATCAAACACCCGAGACATCT+CGG 0.468933 6:-94218788 None:intergenic
GAGGTTGGGGAATGTTGATA+AGG 0.469321 6:+94218457 MsG0680034768.01.T01:CDS
ATGCTAACTGCGGAAGAATC+CGG 0.469461 6:+94219175 MsG0680034768.01.T01:CDS
CTTGTGAAAGTAATTGAGTC+GGG 0.474327 6:-94219336 None:intergenic
TGATGTCTATGTGAATGAAC+TGG 0.475944 6:+94216193 MsG0680034768.01.T01:five_prime_UTR
CCATCATCCACTCCTTTGCT+AGG 0.477269 6:+94216570 MsG0680034768.01.T01:CDS
GACAGTCATCACAAATTCTC+AGG 0.477907 6:-94220025 None:intergenic
GTTGAGGAGGGTGGTTGTTG+GGG 0.478076 6:-94216390 None:intergenic
AGATGTGGAGGAACAGGATA+AGG 0.478237 6:+94219911 MsG0680034768.01.T01:CDS
TAGGGGTGAGATGTGGGAAA+GGG 0.479408 6:-94216505 None:intergenic
ACCAGTGTTGCTGAGGTGCT+CGG 0.481104 6:+94221792 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR
AATGTTGACAACAGGTTCAT+GGG 0.482051 6:+94218276 MsG0680034768.01.T01:intron
CTCCAGAGAAGGATTACAAA+TGG 0.483753 6:+94221925 MsG0680034768.01.T01:intron
TATCAAAGTTATAAGCGGAT+TGG 0.484241 6:+94220055 MsG0680034768.01.T01:CDS
AGTAAATACACTTGAAAGTA+GGG 0.484291 6:-94221695 None:intergenic
ATGCACCCAAAACGGATTAA+CGG 0.485232 6:+94219371 MsG0680034768.01.T01:CDS
CACATCTTGCAGCACAGTCT+TGG 0.488133 6:-94219895 None:intergenic
TTTGGAATTGGATAAATTTG+TGG 0.489495 6:+94218723 MsG0680034768.01.T01:CDS
TTAGAGATATGCAGGCTGAT+GGG 0.489963 6:+94219004 MsG0680034768.01.T01:CDS
GGATTGTACGCGCGTTGAGG+AGG 0.491525 6:-94216403 None:intergenic
TTTAGAGATATGCAGGCTGA+TGG 0.491767 6:+94219003 MsG0680034768.01.T01:CDS
CCAAAACGGATTAACGGAAG+AGG 0.492976 6:+94219377 MsG0680034768.01.T01:CDS
ACACATGCGTCTGGTTCAAA+CGG 0.493274 6:-94219531 None:intergenic
TTGTGTTAATGGGTTTGGTT+CGG 0.493464 6:+94218304 MsG0680034768.01.T01:CDS
GCTCCCCACACACATGCGTC+TGG 0.495692 6:-94219540 None:intergenic
TAGTAAATACACTTGAAAGT+AGG 0.496933 6:-94221696 None:intergenic
TGGGAGAGAGGAGAGGATAG+GGG 0.496942 6:-94216522 None:intergenic
GACAGAAGAATGTAGTTCCC+GGG 0.497543 6:-94219648 None:intergenic
GGAAGTGAGAGTAGAGAGTG+AGG 0.498067 6:-94216481 None:intergenic
AGTATTGAGATTAAGAAGTC+CGG 0.498427 6:+94219858 MsG0680034768.01.T01:CDS
ACCATTTGAAGCATAAATGT+TGG 0.502121 6:-94219670 None:intergenic
TATTCTAATACCTGTTTACC+AGG 0.502715 6:-94216713 None:intergenic
GAATGTTGATAAGGCGAAAG+AGG 0.504413 6:+94218466 MsG0680034768.01.T01:CDS
GATGTGCGCCCGAGATGTCT+CGG 0.504431 6:+94218779 MsG0680034768.01.T01:CDS
GATGCGCAGAAGCTGTTTGA+TGG 0.504810 6:+94218383 MsG0680034768.01.T01:CDS
TTGTTGGGGAGTTGAGACAT+TGG 0.505658 6:-94216376 None:intergenic
TGAGTTGGGTGTTGGTGAAG+AGG 0.506729 6:-94216448 None:intergenic
CACGAAACAGTTGACCCATC+AGG 0.507803 6:-94218625 None:intergenic
CGCGATATGATGAAAAGTAA+GGG 0.508020 6:+94219717 MsG0680034768.01.T01:CDS
CCTAGCAAAGGAGTGGATGA+TGG 0.509022 6:-94216570 None:intergenic
TAGCTAGCTGCGTACAGAAT+GGG 0.510778 6:+94218956 MsG0680034768.01.T01:CDS
ATGAGAAGATGGTGGGGTGT+GGG 0.512527 6:-94216541 None:intergenic
GCTGCAAGATGTGGAGGAAC+AGG 0.514585 6:+94219905 MsG0680034768.01.T01:CDS
ACCTTAGCAGGGTCGCATCC+AGG 0.515066 6:-94221738 None:intergenic
TCCTGGATGCGACCCTGCTA+AGG 0.516461 6:+94221737 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR
CGATGATTGCGGGGTATTCG+AGG 0.517962 6:+94218438 MsG0680034768.01.T01:CDS
AGGTTCTTGATTACTTGAAG+TGG 0.519583 6:-94220005 None:intergenic
TGATGGGGAAACAGGTTCAC+GGG 0.523354 6:+94218683 MsG0680034768.01.T01:CDS
GTGTTAAAAGCTTTGAAACC+TGG 0.524809 6:+94216695 MsG0680034768.01.T01:CDS
GAGGAGAATGAGAAGATGGT+GGG 0.529645 6:-94216548 None:intergenic
GCCGGGTGTTGGGAATTTGG+AGG 0.530385 6:+94218654 MsG0680034768.01.T01:CDS
AATGGAACATTACGCTTGCA+TGG 0.531763 6:+94219449 MsG0680034768.01.T01:CDS
GACATTGGGATACAATGGAT+TGG 0.533402 6:-94216361 None:intergenic
TCCAGAGAAGGATTACAAAT+GGG 0.534144 6:+94221926 MsG0680034768.01.T01:intron
CAGGAACAACAGCAGGTGGC+TGG 0.534383 6:-94221719 None:intergenic
TCGCATCCAGGAACAACAGC+AGG 0.535708 6:-94221726 None:intergenic
AATATTTCAGCGTTAACGCA+TGG 0.536260 6:+94219075 MsG0680034768.01.T01:CDS
ATCTCAATCCAACTACAGCC+AGG 0.537610 6:-94219753 None:intergenic
GATTGTACGCGCGTTGAGGA+GGG 0.537991 6:-94216402 None:intergenic
TTGTTATGGTGATTGTGTTG+AGG 0.539023 6:-94216279 None:intergenic
TATGAACTGAATGATCCTCT+TGG 0.539226 6:-94221664 None:intergenic
GGAATTGGAAACATAGTCGT+AGG 0.541755 6:-94216239 None:intergenic
GGTGCTGAGTCTGGCGAGGG+TGG 0.542386 6:+94221947 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR
TGTTGGAACCAGACAACCCC+GGG 0.543148 6:+94219631 MsG0680034768.01.T01:CDS
TGGGGTGTGGGAGAGAGGAG+AGG 0.544734 6:-94216529 None:intergenic
AGAAGTGGTGAGTTGGGTGT+TGG 0.547236 6:-94216456 None:intergenic
ATGCAATGCATGGAAAGGCT+AGG 0.547592 6:+94219268 MsG0680034768.01.T01:CDS
GCTGAAATATTTCCACAAGC+AGG 0.548202 6:-94219063 None:intergenic
TTATCTGCATGCACCCAAAA+CGG 0.548624 6:+94219363 MsG0680034768.01.T01:CDS
TAGAGATATGCAGGCTGATG+GGG 0.548638 6:+94219005 MsG0680034768.01.T01:CDS
TTGATGGGGAAACAGGTTCA+CGG 0.548836 6:+94218682 MsG0680034768.01.T01:CDS
ACCGAGCACCTCAGCAACAC+TGG 0.549484 6:-94221793 None:intergenic
CCTTCCTGAGAGAAAAGCAA+TGG 0.550518 6:-94219107 None:intergenic
GGCTGTAGTTGGATTGAGAT+CGG 0.550722 6:+94219756 MsG0680034768.01.T01:CDS
GGATTAATCAACACAAGTCC+AGG 0.554388 6:+94219978 MsG0680034768.01.T01:CDS
TGCAATGCATGGAAAGGCTA+GGG 0.556574 6:+94219269 MsG0680034768.01.T01:CDS
TTGCGGGGTATTCGAGGTTG+GGG 0.559374 6:+94218444 MsG0680034768.01.T01:CDS
ATGTGCGCCCGAGATGTCTC+GGG 0.560401 6:+94218780 MsG0680034768.01.T01:CDS
TCAAACACCCGAGACATCTC+GGG 0.560956 6:-94218787 None:intergenic
TTCAGCGTTAACGCATGGAA+AGG 0.561064 6:+94219080 MsG0680034768.01.T01:CDS
CCAAGCTTGATCCCTGCTTG+TGG 0.566407 6:+94219051 MsG0680034768.01.T01:CDS
TGTTTGGAGTGCGATGATTG+CGG 0.568447 6:+94218427 MsG0680034768.01.T01:CDS
TTGGATTGAGATCGGACATA+GGG 0.570802 6:+94219764 MsG0680034768.01.T01:CDS
ATAGCTAGCTGCGTACAGAA+TGG 0.571978 6:+94218955 MsG0680034768.01.T01:CDS
TCTGTTATCAAAGTTATAAG+CGG 0.572276 6:+94220050 MsG0680034768.01.T01:CDS
GGAGGAGAATGAGAAGATGG+TGG 0.573325 6:-94216549 None:intergenic
TCCTCCAAATTCCCAACACC+CGG 0.573498 6:-94218655 None:intergenic
GTTGAGACATTGGGATACAA+TGG 0.573757 6:-94216366 None:intergenic
GTTGGATTGAGATCGGACAT+AGG 0.575803 6:+94219763 MsG0680034768.01.T01:CDS
AAACTCCACCAGTGTTGCTG+AGG 0.579711 6:+94221785 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR
GTAGAGAGTGAGGAGAGAAG+TGG 0.580780 6:-94216471 None:intergenic
AAAGTTATAAGCGGATTGGA+AGG 0.582617 6:+94220059 MsG0680034768.01.T01:CDS
CGTGGATTGTACGCGCGTTG+AGG 0.584925 6:-94216406 None:intergenic
GTGTTCAAGAAGTTTAAAGC+CGG 0.585610 6:+94218895 MsG0680034768.01.T01:CDS
CTGAAATATTTCCACAAGCA+GGG 0.586802 6:-94219062 None:intergenic
ACTTGTGAAAGTAATTGAGT+CGG 0.587912 6:-94219337 None:intergenic
TGGTTTGGTTGATACTGCAT+TGG 0.589926 6:+94218870 MsG0680034768.01.T01:CDS
TGTACGCGCGTTGAGGAGGG+TGG 0.590844 6:-94216399 None:intergenic
CAAGACTGTGCTGCAAGATG+TGG 0.592245 6:+94219896 MsG0680034768.01.T01:CDS
AGATATGCAGGCTGATGGGG+TGG 0.592633 6:+94219008 MsG0680034768.01.T01:CDS
TCTTGGAATTCAATTATGAG+TGG 0.592754 6:+94219243 MsG0680034768.01.T01:CDS
GATGGAGGAGAATGAGAAGA+TGG 0.594533 6:-94216552 None:intergenic
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CAAGAACATGACGAAAATGG+TGG 0.607017 6:-94216595 None:intergenic
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CRISPR-GE

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!!! TTTTGAGAAATCAATTTTGG+GGG - Chr6:94217079-94217098 None:intergenic 25.0%
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! GAATGTTAACGTTGTTGTTA+TGG - Chr6:94216296-94216315 None:intergenic 30.0%
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!! TTACAGAGTTAAGTTGCTTT+TGG + Chr6:94217123-94217142 MsG0680034768.01.T01:intron 30.0%
!! TTTTCTAAAAAATGCCCATC+GGG - Chr6:94221458-94221477 None:intergenic 30.0%
!!! AATTTGGAGGATGTTTTGAT+GGG + Chr6:94218667-94218686 MsG0680034768.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATTTTTTGTGAGGCACTAAA+AGG - Chr6:94217871-94217890 None:intergenic 30.0%
!!! TTTTTTGTCAGAGACTGAAA+TGG + Chr6:94217967-94217986 MsG0680034768.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTTTGTGAGGCACTAAAA+GGG - Chr6:94217870-94217889 None:intergenic 30.0%
AAAATTGAGAGGGACCAAAT+TGG - Chr6:94217839-94217858 None:intergenic 35.0%
AAATTGAGAGGGACCAAATT+GGG - Chr6:94217838-94217857 None:intergenic 35.0%
AACAACAGCATTCACATCTT+TGG - Chr6:94221632-94221651 None:intergenic 35.0%
AACATTCAACTCCAATTCTC+CGG - Chr6:94218917-94218936 None:intergenic 35.0%
AAGAACATCAGGTCTTGAAA+AGG - Chr6:94220585-94220604 None:intergenic 35.0%
AAGAACATGACGAAAATGGT+GGG - Chr6:94216597-94216616 None:intergenic 35.0%
AATATTTCAGCGTTAACGCA+TGG + Chr6:94219075-94219094 MsG0680034768.01.T01:CDS 35.0%
AATGTTGACAACAGGTTCAT+GGG + Chr6:94218276-94218295 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
ACAACAGCATTCACATCTTT+GGG - Chr6:94221631-94221650 None:intergenic 35.0%
ACGCGATATGATGAAAAGTA+AGG + Chr6:94219716-94219735 MsG0680034768.01.T01:CDS 35.0%
AGGTTCTTGATTACTTGAAG+TGG - Chr6:94220008-94220027 None:intergenic 35.0%
AGTCTTTGAATGTACTCCAA+TGG - Chr6:94220679-94220698 None:intergenic 35.0%
CCAAATCCAAACAAACAACT+AGG - Chr6:94220999-94221018 None:intergenic 35.0%
CCTAGTTGTTTGTTTGGATT+TGG + Chr6:94220996-94221015 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
CGCGATATGATGAAAAGTAA+GGG + Chr6:94219717-94219736 MsG0680034768.01.T01:CDS 35.0%
CTAGGAAGAAGATAACTATC+AGG - Chr6:94216656-94216675 None:intergenic 35.0%
CTGAAATATTTCCACAAGCA+GGG - Chr6:94219065-94219084 None:intergenic 35.0%
CTTGTGAAAGTAATTGAGTC+GGG - Chr6:94219339-94219358 None:intergenic 35.0%
GAAAACGTCAGAGACTAATT+GGG - Chr6:94217897-94217916 None:intergenic 35.0%
GAAAATGTGAGCAATTTGAG+GGG + Chr6:94221473-94221492 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
GAAATTGAGAGTGACTGAAT+TGG + Chr6:94217997-94218016 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
GAATGTTGGGTTATATGATG+AGG + Chr6:94218561-94218580 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
GACTCATAATTCCGAAAATC+CGG - Chr6:94221275-94221294 None:intergenic 35.0%
GCGATATGATGAAAAGTAAG+GGG + Chr6:94219718-94219737 MsG0680034768.01.T01:CDS 35.0%
GGATCATTCAGTTCATAGAT+TGG + Chr6:94221670-94221689 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
GGCAAAATCAACTTACTAGA+CGG - Chr6:94217208-94217227 None:intergenic 35.0%
GGTTCACTAGAAAATTGAGA+GGG - Chr6:94217849-94217868 None:intergenic 35.0%
TAATGTTGACAACAGGTTCA+TGG + Chr6:94218275-94218294 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
TATATGTTCTCATCTTTCGG+TGG + Chr6:94220268-94220287 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
TATGAACTGAATGATCCTCT+TGG - Chr6:94221667-94221686 None:intergenic 35.0%
TCCAGAGAAGGATTACAAAT+GGG + Chr6:94221926-94221945 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
TGAAAACGTCAGAGACTAAT+TGG - Chr6:94217898-94217917 None:intergenic 35.0%
TGATGTCTATGTGAATGAAC+TGG + Chr6:94216193-94216212 MsG0680034768.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
TTGTTATGGTGATTGTGTTG+AGG - Chr6:94216282-94216301 None:intergenic 35.0%
TTTGCTTATATTCGAGACTG+GGG + Chr6:94220631-94220650 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
! AAACGGCATTTTCTTGATGA+TGG - Chr6:94219517-94219536 None:intergenic 35.0%
! AAGCTAGAATTTGCAGCTTT+TGG + Chr6:94217412-94217431 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
! AGAATTGATTCCGAGTGAAT+TGG + Chr6:94216964-94216983 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
! AGCGTCAAAAGTGATTTTAG+AGG + Chr6:94216859-94216878 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
! ATGGGTTTGCTTGTGTTAAT+GGG + Chr6:94218294-94218313 MsG0680034768.01.T01:CDS 35.0%
! ATTGAGTACACTCTTGTTTC+TGG + Chr6:94217488-94217507 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
! CAAGCGTAATGTTCCATTTT+AGG - Chr6:94219447-94219466 None:intergenic 35.0%
! CAGCGCTTAGTCTAATATTT+TGG + Chr6:94217725-94217744 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
! CCTGATTAAGAGTATGAAGA+GGG + Chr6:94220388-94220407 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
! CGTTTTCACCATTTCAAAGA+CGG + Chr6:94220110-94220129 MsG0680034768.01.T01:CDS 35.0%
! CTCAAGTAGAATCATTTTGG+AGG - Chr6:94217229-94217248 None:intergenic 35.0%
! CTGATTAAGAGTATGAAGAG+GGG + Chr6:94220389-94220408 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
! GTGATTGTGTTGAGGTTTTT+GGG - Chr6:94216274-94216293 None:intergenic 35.0%
! GTGTTCAAGAAGTTTAAAGC+CGG + Chr6:94218895-94218914 MsG0680034768.01.T01:CDS 35.0%
! TGCAGCTAATTAGTTCTCAA+TGG + Chr6:94220293-94220312 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
! TTAATGGATCGTGAGTTTGA+GGG + Chr6:94217646-94217665 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
! TTAGTTCTCAATGGCCAATA+TGG + Chr6:94220302-94220321 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
! TTTGGGTTTGGAATTGGAAT+TGG - Chr6:94216257-94216276 None:intergenic 35.0%
! TTTTAGTGAGATGAGAAGGA+GGG + Chr6:94218490-94218509 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
! TTTTGTGAGTAAAATCGAGC+GGG + Chr6:94221424-94221443 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
!! AAAGTTATAAGCGGATTGGA+AGG + Chr6:94220059-94220078 MsG0680034768.01.T01:CDS 35.0%
!! AAATCCATTGCTTTTCTCTC+AGG + Chr6:94219103-94219122 MsG0680034768.01.T01:CDS 35.0%
!! CAAATTTGGTGTCATGGAAT+GGG + Chr6:94218521-94218540 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
!! CTTATCAGTATCGGATTTTG+AGG + Chr6:94221184-94221203 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
!! GAATTTGGAGGATGTTTTGA+TGG + Chr6:94218666-94218685 MsG0680034768.01.T01:CDS 35.0%
!! GATACAATGGATTGGAACAT+TGG - Chr6:94216356-94216375 None:intergenic 35.0%
!! GATTTCTGGTAACTTTCTCA+TGG + Chr6:94220149-94220168 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
!! GATTTTAGAGGCTGTAGAAT+TGG + Chr6:94216871-94216890 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
!! GTGTTAAAAGCTTTGAAACC+TGG + Chr6:94216695-94216714 MsG0680034768.01.T01:CDS 35.0%
!! TGCATATGTTTGGTTCTTCT+TGG + Chr6:94216938-94216957 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
!! TTGTGTTAATGGGTTTGGTT+CGG + Chr6:94218304-94218323 MsG0680034768.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTGCTTGTGTTAATGGGTT+TGG + Chr6:94218299-94218318 MsG0680034768.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTTAGTGAGATGAGAAGG+AGG + Chr6:94218489-94218508 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
!!! AGGTTTTTAGTGAGATGAGA+AGG + Chr6:94218486-94218505 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
!!! ATTTCTGGTATTTTCCTCTC+TGG + Chr6:94220744-94220763 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
!!! ATTTGGAGGATGTTTTGATG+GGG + Chr6:94218668-94218687 MsG0680034768.01.T01:CDS 35.0%
!!! GGATTTTGAGGTTTCTGATA+TGG + Chr6:94221196-94221215 MsG0680034768.01.T01:intron 35.0%
AAGGGGTTAAAGAAAAACCC+TGG + Chr6:94219735-94219754 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
AAGTAATTGAGTCGGGTTTC+TGG - Chr6:94219332-94219351 None:intergenic 40.0%
AATACCATTACCAGTCTACC+AGG - Chr6:94217540-94217559 None:intergenic 40.0%
AATGGAACATTACGCTTGCA+TGG + Chr6:94219449-94219468 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
ACAGAATGGAGTGAAGAGAA+AGG - Chr6:94220344-94220363 None:intergenic 40.0%
ACCCATTTGTAATCCTTCTC+TGG - Chr6:94221930-94221949 None:intergenic 40.0%
ACTCCATTCTGTTCTTGCAA+TGG + Chr6:94220352-94220371 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
AGAATTTACTGAAGCTCGTC+AGG + Chr6:94221893-94221912 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
AGTGAACGATTCAGCAACAA+AGG - Chr6:94220944-94220963 None:intergenic 40.0%
AGTGCTCTTCTTGACATGTA+TGG + Chr6:94218748-94218767 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
ATGAGTGGTTATGCAATGCA+TGG + Chr6:94219258-94219277 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
ATTACTTGAAGTGGTTGTCC+TGG - Chr6:94219999-94220018 None:intergenic 40.0%
CAAACACTCACCAAGTAGAA+TGG + Chr6:94217046-94217065 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
CAAGAAACCAAATTACGGGA+TGG - Chr6:94219228-94219247 None:intergenic 40.0%
CAAGAACATGACGAAAATGG+TGG - Chr6:94216598-94216617 None:intergenic 40.0%
CACCAAGAACATGACGAAAA+TGG - Chr6:94216601-94216620 None:intergenic 40.0%
CAGTCACTCTCAATTTCTCA+TGG - Chr6:94217994-94218013 None:intergenic 40.0%
CCATTCCATGACACCAAATT+TGG - Chr6:94218523-94218542 None:intergenic 40.0%
CCCTCTTCATACTCTTAATC+AGG - Chr6:94220391-94220410 None:intergenic 40.0%
CCTAACAGCCTCAAAATTTC+TGG + Chr6:94220729-94220748 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
CTCCAGAGAAGGATTACAAA+TGG + Chr6:94221925-94221944 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
CTTACTAGACGGCAACAAAA+CGG - Chr6:94217197-94217216 None:intergenic 40.0%
CTTGACATGTATGGAAGATG+TGG + Chr6:94218757-94218776 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
CTTGGGATAGTAACAGCATT+AGG - Chr6:94219036-94219055 None:intergenic 40.0%
CTTGTACGCTTGTGAATTTC+TGG + Chr6:94220857-94220876 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
GAATCAGTGTTATCGAACTG+CGG + Chr6:94221142-94221161 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
GACAGTCATCACAAATTCTC+AGG - Chr6:94220028-94220047 None:intergenic 40.0%
GACATTGGGATACAATGGAT+TGG - Chr6:94216364-94216383 None:intergenic 40.0%
GACATTTGCTTTAACGCCAT+TGG + Chr6:94220660-94220679 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
GATAAGGAGCAGATATTGTG+TGG + Chr6:94219927-94219946 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
GCTGAAATATTTCCACAAGC+AGG - Chr6:94219066-94219085 None:intergenic 40.0%
GGAATTGGAAACATAGTCGT+AGG - Chr6:94216242-94216261 None:intergenic 40.0%
GGATTAATCAACACAAGTCC+AGG + Chr6:94219978-94219997 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
GGGATAAAAGCCATTCTACT+TGG - Chr6:94217059-94217078 None:intergenic 40.0%
GGGTTCACTAGAAAATTGAG+AGG - Chr6:94217850-94217869 None:intergenic 40.0%
GTATCCAGTGTTATCTATGG+CGG - Chr6:94221316-94221335 None:intergenic 40.0%
GTATGTGATTAAGCTGGGTT+TGG + Chr6:94218705-94218724 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
GTGAGAGAGATGTGATTGTT+TGG + Chr6:94218411-94218430 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
GTTGAGACATTGGGATACAA+TGG - Chr6:94216369-94216388 None:intergenic 40.0%
TATTCTAATACATGCCGACC+AGG - Chr6:94217440-94217459 None:intergenic 40.0%
TCACAAAAAAAGCTGATCGG+AGG - Chr6:94221412-94221431 None:intergenic 40.0%
TCTCCATTGCAAGAACAGAA+TGG - Chr6:94220358-94220377 None:intergenic 40.0%
TGAAATGCCATCCCGTAATT+TGG + Chr6:94219218-94219237 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
TGATCCGATGCTTCTGTTAA+TGG + Chr6:94217630-94217649 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
TGGAGTTGAATGTTGTGACA+TGG + Chr6:94218923-94218942 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
TGGTGAAGAGGTTGAATTTG+AGG - Chr6:94216439-94216458 None:intergenic 40.0%
TGGTTATGCAATGCATGGAA+AGG + Chr6:94219263-94219282 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
TTACTAGACGGCAACAAAAC+GGG - Chr6:94217196-94217215 None:intergenic 40.0%
TTAGAGATATGCAGGCTGAT+GGG + Chr6:94219004-94219023 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
TTATCGAACTGCGGTCATAT+CGG + Chr6:94221151-94221170 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
TTATCTGCATGCACCCAAAA+CGG + Chr6:94219363-94219382 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
TTCTCTCAATTGGGTTCTCT+TGG + Chr6:94216623-94216642 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
TTCTTGCAATGGAGACTTAC+AGG + Chr6:94220363-94220382 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
TTGCTTATATTCGAGACTGG+GGG + Chr6:94220632-94220651 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
TTGGATTGAGATCGGACATA+GGG + Chr6:94219764-94219783 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
TTTAGAGATATGCAGGCTGA+TGG + Chr6:94219003-94219022 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
TTTGCTCTTGTGGAGATTTC+TGG + Chr6:94220135-94220154 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
! AACTGTTTCGTGTGTTTTGC+CGG + Chr6:94218636-94218655 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
! AGCAAACACCGTCTTTGAAA+TGG - Chr6:94220121-94220140 None:intergenic 40.0%
! AGTCTCTGACGTTTTCATGT+TGG + Chr6:94217901-94217920 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
! CACCATTTTCGTCATGTTCT+TGG + Chr6:94216596-94216615 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
! CATCCCGTAATTTGGTTTCT+TGG + Chr6:94219226-94219245 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
! CATGGGTTTGCTTGTGTTAA+TGG + Chr6:94218293-94218312 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
! CGATCCATTAACAGAAGCAT+CGG - Chr6:94217637-94217656 None:intergenic 40.0%
! CTCTTCCGTTAATCCGTTTT+GGG - Chr6:94219379-94219398 None:intergenic 40.0%
! CTTTGGGAACAACATTAGCA+TGG - Chr6:94221615-94221634 None:intergenic 40.0%
! GAAGTTTAAAGCCGGAGAAT+TGG + Chr6:94218903-94218922 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
! GAATGATCCTCTTGGTTTGA+TGG - Chr6:94221659-94221678 None:intergenic 40.0%
! GAATGTTGATAAGGCGAAAG+AGG + Chr6:94218466-94218485 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
! GATTAAGCTGGGTTTGGAAT+TGG + Chr6:94218711-94218730 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
! GCACAAGCTTTAATAGCACT+AGG - Chr6:94216674-94216693 None:intergenic 40.0%
! GCCTGATTAAGAGTATGAAG+AGG + Chr6:94220387-94220406 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
! GGTGATTGTGTTGAGGTTTT+TGG - Chr6:94216275-94216294 None:intergenic 40.0%
! GTTAATGGATCGTGAGTTTG+AGG + Chr6:94217645-94217664 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
! TAATGGATCGTGAGTTTGAG+GGG + Chr6:94217647-94217666 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
! TTTGTAATCCTTCTCTGGAG+TGG - Chr6:94221925-94221944 None:intergenic 40.0%
!! AGCTTTGAAACCTGGTAAAC+AGG + Chr6:94216703-94216722 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
!! ATGCACCCAAAACGGATTAA+CGG + Chr6:94219371-94219390 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTTTGGATTAGGGGCTGTT+TGG + Chr6:94217741-94217760 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
!! CAAAACGGATTAACGGAAGA+GGG + Chr6:94219378-94219397 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
!! CATTGCTTTTCTCTCAGGAA+GGG + Chr6:94219108-94219127 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
!! CCAAATTTGGTGTCATGGAA+TGG + Chr6:94218520-94218539 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
!! CTTGGTGCTTTCTCTCAATT+GGG + Chr6:94216614-94216633 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
!! GGAGCTTTTTAGAGATATGC+AGG + Chr6:94218996-94219015 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGAGGTTGTTTTGTGAGA+TGG + Chr6:94218585-94218604 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
!! GTTGTTTTGTGAGATGGTGT+CGG + Chr6:94218591-94218610 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
!! TAATGGGTTTGGTTCGGATT+CGG + Chr6:94218310-94218329 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
!! TCTTGGTGCTTTCTCTCAAT+TGG + Chr6:94216613-94216632 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
!! TGGTTTGGTTGATACTGCAT+TGG + Chr6:94218870-94218889 MsG0680034768.01.T01:CDS 40.0%
!! TTAATTTGTGGTGGGTGTGA+GGG + Chr6:94218092-94218111 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
!!! AATTTGCAGCTTTTGGAACC+TGG + Chr6:94217419-94217438 MsG0680034768.01.T01:intron 40.0%
!!! CCAGAAATTTTGAGGCTGTT+AGG - Chr6:94220732-94220751 None:intergenic 40.0%
!!! GAGGTTTTTGGGTTTGGAAT+TGG - Chr6:94216263-94216282 None:intergenic 40.0%
!!! TGTGTTGAGGTTTTTGGGTT+TGG - Chr6:94216269-94216288 None:intergenic 40.0%
AAAGACGGTGTTTGCTCTTG+TGG + Chr6:94220125-94220144 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
AATGGGATGATTGCTGGGTT+TGG + Chr6:94218538-94218557 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
ACAGAAGAATGTAGTTCCCG+GGG - Chr6:94219650-94219669 None:intergenic 45.0%
ACAGAATGGGAAAGACATGG+AGG + Chr6:94218969-94218988 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
AGAAAAACCCTGGCTGTAGT+TGG + Chr6:94219745-94219764 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
AGATGTGGAGGAACAGGATA+AGG + Chr6:94219911-94219930 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
AGGAGAATGAGAAGATGGTG+GGG - Chr6:94216550-94216569 None:intergenic 45.0%
AGGGTACACACTCTTCTTTC+TGG + Chr6:94219783-94219802 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
ATAGCTAGCTGCGTACAGAA+TGG + Chr6:94218955-94218974 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
ATCAAACACCCGAGACATCT+CGG - Chr6:94218791-94218810 None:intergenic 45.0%
ATCTCAATCCAACTACAGCC+AGG - Chr6:94219756-94219775 None:intergenic 45.0%
ATGCAATGCATGGAAAGGCT+AGG + Chr6:94219268-94219287 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
ATGCTAACTGCGGAAGAATC+CGG + Chr6:94219175-94219194 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
ATGGGATGATTGCTGGGTTT+GGG + Chr6:94218539-94218558 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
ATTGCTGGGTTTGGGAATGT+TGG + Chr6:94218547-94218566 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
CACGGGTATGTGATTAAGCT+GGG + Chr6:94218700-94218719 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
CATGGAATGGGATGATTGCT+GGG + Chr6:94218533-94218552 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
CCTCAAATTGCTCAACCGAT+CGG + Chr6:94221380-94221399 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
CCTTCCTGAGAGAAAAGCAA+TGG - Chr6:94219110-94219129 None:intergenic 45.0%
CGATCGGTTGAGCAATTTGA+GGG - Chr6:94221382-94221401 None:intergenic 45.0%
CGTACAGAATGGGAAAGACA+TGG + Chr6:94218966-94218985 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
GAAACCTGGTAGACTGGTAA+TGG + Chr6:94217533-94217552 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
GACAGAAGAATGTAGTTCCC+GGG - Chr6:94219651-94219670 None:intergenic 45.0%
GAGGAGAATGAGAAGATGGT+GGG - Chr6:94216551-94216570 None:intergenic 45.0%
GAGGTTGGGGAATGTTGATA+AGG + Chr6:94218457-94218476 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
GAGGTTTCTGATATGGTGAG+TGG + Chr6:94221203-94221222 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
GATCGGTTGAGCAATTTGAG+GGG - Chr6:94221381-94221400 None:intergenic 45.0%
GATGGAGGAGAATGAGAAGA+TGG - Chr6:94216555-94216574 None:intergenic 45.0%
GCTATGGCGCTTATCAGTAT+CGG + Chr6:94221175-94221194 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
GGACAGAAGAATGTAGTTCC+CGG - Chr6:94219652-94219671 None:intergenic 45.0%
GGCTGTAGTTGGATTGAGAT+CGG + Chr6:94219756-94219775 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
GTGTGGTCACAGTGAGAAAT+TGG + Chr6:94219944-94219963 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
GTTACACTTCTCAGTCGTGT+AGG + Chr6:94219471-94219490 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
GTTGGATTGAGATCGGACAT+AGG + Chr6:94219763-94219782 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
GTTTCTGATATGGTGAGTGG+TGG + Chr6:94221206-94221225 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
TACCAGTCTACCAGGTTTCA+AGG - Chr6:94217532-94217551 None:intergenic 45.0%
TAGAGATATGCAGGCTGATG+GGG + Chr6:94219005-94219024 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
TAGCTAGCTGCGTACAGAAT+GGG + Chr6:94218956-94218975 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
TCACGGGTATGTGATTAAGC+TGG + Chr6:94218699-94218718 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
TCATGGAATGGGATGATTGC+TGG + Chr6:94218532-94218551 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
TCTCAATCCAACTACAGCCA+GGG - Chr6:94219755-94219774 None:intergenic 45.0%
TGCAATGCATGGAAAGGCTA+GGG + Chr6:94219269-94219288 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
TGTTGGGGAGTTGAGACATT+GGG - Chr6:94216378-94216397 None:intergenic 45.0%
TTCAGCGTTAACGCATGGAA+AGG + Chr6:94219080-94219099 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
TTGATGGGGAAACAGGTTCA+CGG + Chr6:94218682-94218701 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
TTGCTGGGTTTGGGAATGTT+GGG + Chr6:94218548-94218567 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
TTGTTGGGGAGTTGAGACAT+TGG - Chr6:94216379-94216398 None:intergenic 45.0%
! AAAATGGTGGGACCTAGCAA+AGG - Chr6:94216585-94216604 None:intergenic 45.0%
! AAAGTAAACTGGGGTACCTG+AGG + Chr6:94220553-94220572 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
! AAGTAAACTGGGGTACCTGA+GGG + Chr6:94220554-94220573 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
! ACACATGCGTCTGGTTCAAA+CGG - Chr6:94219534-94219553 None:intergenic 45.0%
! ACTGTTTCGTGTGTTTTGCC+GGG + Chr6:94218637-94218656 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
! CCTCTTCCGTTAATCCGTTT+TGG - Chr6:94219380-94219399 None:intergenic 45.0%
! CGGAAGGGTTTTTACCTGAT+GGG + Chr6:94218611-94218630 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
! TCGGAAGGGTTTTTACCTGA+TGG + Chr6:94218610-94218629 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
! TGAATTTGAGGAAGTGTGCG+TGG - Chr6:94216427-94216446 None:intergenic 45.0%
! TGATCCTCTTGGTTTGATGG+TGG - Chr6:94221656-94221675 None:intergenic 45.0%
! TGCAGAGAAGCTTTTCGTGT+TGG + Chr6:94219614-94219633 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
! TGCAGCACAGTCTTGGTAAT+CGG - Chr6:94219891-94219910 None:intergenic 45.0%
! TGTTTGGAGTGCGATGATTG+CGG + Chr6:94218427-94218446 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
! TTTGTGAGATGGTGTCGGAA+GGG + Chr6:94218596-94218615 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
!! CCAAAACGGATTAACGGAAG+AGG + Chr6:94219377-94219396 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
!! CCATTGCTTTTCTCTCAGGA+AGG + Chr6:94219107-94219126 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
!! GGTTATATGATGAGGCGTTG+AGG + Chr6:94218569-94218588 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
!! GTTAATTTGTGGTGGGTGTG+AGG + Chr6:94218091-94218110 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
!! TAATTTGTGGTGGGTGTGAG+GGG + Chr6:94218093-94218112 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
!! TGGAGCCAAATTTGGTGTCA+TGG + Chr6:94218515-94218534 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
!! TTACAAATGGGTGCTGAGTC+TGG + Chr6:94221938-94221957 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
!! TTTTGTGAGATGGTGTCGGA+AGG + Chr6:94218595-94218614 MsG0680034768.01.T01:intron 45.0%
!!! GGATGTTTTGATGGGGAAAC+AGG + Chr6:94218675-94218694 MsG0680034768.01.T01:CDS 45.0%
!! AAAAAAATTATATTAAGATT+TGG + Chr6:94221340-94221359 MsG0680034768.01.T01:intron 5.0%
!! AAAAAATTATATTAAGATTT+GGG + Chr6:94221341-94221360 MsG0680034768.01.T01:intron 5.0%
AATGCCCTCTGTACCTTAGC+AGG - Chr6:94221753-94221772 None:intergenic 50.0%
ACTCTCGATGCCTTGAAACC+TGG + Chr6:94217519-94217538 MsG0680034768.01.T01:intron 50.0%
AGAGGATAGGGGTGAGATGT+GGG - Chr6:94216514-94216533 None:intergenic 50.0%
ATAGGGGTGAGATGTGGGAA+AGG - Chr6:94216509-94216528 None:intergenic 50.0%
ATGCCCTCTGTACCTTAGCA+GGG - Chr6:94221752-94221771 None:intergenic 50.0%
CAAGACTGTGCTGCAAGATG+TGG + Chr6:94219896-94219915 MsG0680034768.01.T01:CDS 50.0%
CACAAGCAGGGATCAAGCTT+GGG - Chr6:94219053-94219072 None:intergenic 50.0%
CACATCTTGCAGCACAGTCT+TGG - Chr6:94219898-94219917 None:intergenic 50.0%
CACGAAACAGTTGACCCATC+AGG - Chr6:94218628-94218647 None:intergenic 50.0%
CCATCATCCACTCCTTTGCT+AGG + Chr6:94216570-94216589 MsG0680034768.01.T01:CDS 50.0%
CCATCCGCCATAGATAACAC+TGG + Chr6:94221309-94221328 MsG0680034768.01.T01:intron 50.0%
CCGATCGGTTGAGCAATTTG+AGG - Chr6:94221383-94221402 None:intergenic 50.0%
CCTAGCAAAGGAGTGGATGA+TGG - Chr6:94216573-94216592 None:intergenic 50.0%
CGAGGGTGGTGAAGAAGATA+TGG + Chr6:94221961-94221980 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
CTTACTGGGTTGTCGCGTAA+TGG + Chr6:94218850-94218869 MsG0680034768.01.T01:CDS 50.0%
GAGGAGAGAAGTGGTGAGTT+GGG - Chr6:94216465-94216484 None:intergenic 50.0%
GATCGGAGGTTACATCCGAT+CGG - Chr6:94221398-94221417 None:intergenic 50.0%
GATGCGCAGAAGCTGTTTGA+TGG + Chr6:94218383-94218402 MsG0680034768.01.T01:CDS 50.0%
GCATTTGTCCACTGGTACGT+AGG + Chr6:94221855-94221874 MsG0680034768.01.T01:intron 50.0%
GGAAGTGAGAGTAGAGAGTG+AGG - Chr6:94216484-94216503 None:intergenic 50.0%
GGAGGAGAATGAGAAGATGG+TGG - Chr6:94216552-94216571 None:intergenic 50.0%
GGAGTGAAGATAGCTGAGCT+AGG - Chr6:94220479-94220498 None:intergenic 50.0%
GGATTAGGGGCTGTTTGGAT+TGG + Chr6:94217746-94217765 MsG0680034768.01.T01:intron 50.0%
GTAGAGAGTGAGGAGAGAAG+TGG - Chr6:94216474-94216493 None:intergenic 50.0%
GTTGCCACCATCAAACCAAG+AGG + Chr6:94221649-94221668 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
TAGGGGTGAGATGTGGGAAA+GGG - Chr6:94216508-94216527 None:intergenic 50.0%
TCAAACACCCGAGACATCTC+GGG - Chr6:94218790-94218809 None:intergenic 50.0%
TCCTCCAAATTCCCAACACC+CGG - Chr6:94218658-94218677 None:intergenic 50.0%
TGAACCAGACGCATGTGTGT+GGG + Chr6:94219536-94219555 MsG0680034768.01.T01:CDS 50.0%
TGAGGAGAGAAGTGGTGAGT+TGG - Chr6:94216466-94216485 None:intergenic 50.0%
TGATGGGGAAACAGGTTCAC+GGG + Chr6:94218683-94218702 MsG0680034768.01.T01:CDS 50.0%
TGCCTTGAAACCTGGTAGAC+TGG + Chr6:94217527-94217546 MsG0680034768.01.T01:intron 50.0%
TGGGAAAGACATGGAGGCTT+TGG + Chr6:94218975-94218994 MsG0680034768.01.T01:CDS 50.0%
TGGGTTGTCGCGTAATGGTT+TGG + Chr6:94218855-94218874 MsG0680034768.01.T01:CDS 50.0%
TTGAACCAGACGCATGTGTG+TGG + Chr6:94219535-94219554 MsG0680034768.01.T01:CDS 50.0%
TTTCTCATGGCTCCTTGCAG+TGG + Chr6:94220162-94220181 MsG0680034768.01.T01:intron 50.0%
! AAACTCCACCAGTGTTGCTG+AGG + Chr6:94221785-94221804 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
! ACGGATTAACGGAAGAGGGA+TGG + Chr6:94219382-94219401 MsG0680034768.01.T01:CDS 50.0%
! AGAAGTGGTGAGTTGGGTGT+TGG - Chr6:94216459-94216478 None:intergenic 50.0%
! AGCAAAGGAGTGGATGATGG+AGG - Chr6:94216570-94216589 None:intergenic 50.0%
! AGTAAACTGGGGTACCTGAG+GGG + Chr6:94220555-94220574 MsG0680034768.01.T01:intron 50.0%
! ATTGCGGGGTATTCGAGGTT+GGG + Chr6:94218443-94218462 MsG0680034768.01.T01:CDS 50.0%
! CCAGTGTTATCTATGGCGGA+TGG - Chr6:94221312-94221331 None:intergenic 50.0%
! GCAGCACAGTCTTGGTAATC+GGG - Chr6:94219890-94219909 None:intergenic 50.0%
! GTTTGGAGTGCGATGATTGC+GGG + Chr6:94218428-94218447 MsG0680034768.01.T01:CDS 50.0%
! TTTGGAGTGCGATGATTGCG+GGG + Chr6:94218429-94218448 MsG0680034768.01.T01:CDS 50.0%
!! AATGAGAAGATGGTGGGGTG+TGG - Chr6:94216545-94216564 None:intergenic 50.0%
!! ATACATGGCTTGCTCCAGAG+AGG - Chr6:94220761-94220780 None:intergenic 50.0%
!! ATGAGAAGATGGTGGGGTGT+GGG - Chr6:94216544-94216563 None:intergenic 50.0%
!! GTGTTATCTATGGCGGATGG+CGG - Chr6:94221309-94221328 None:intergenic 50.0%
!! TGAGTTGGGTGTTGGTGAAG+AGG - Chr6:94216451-94216470 None:intergenic 50.0%
!! TTTGCCGGGTGTTGGGAATT+TGG + Chr6:94218651-94218670 MsG0680034768.01.T01:CDS 50.0%
!!! TGCAGCTTTTGGAACCTGGT+CGG + Chr6:94217423-94217442 MsG0680034768.01.T01:intron 50.0%
ACCACAACAGCACCCTAAGG+CGG + Chr6:94221249-94221268 MsG0680034768.01.T01:intron 55.0%
AGATATGCAGGCTGATGGGG+TGG + Chr6:94219008-94219027 MsG0680034768.01.T01:CDS 55.0%
ATGTAGTTCCCGGGGTTGTC+TGG - Chr6:94219642-94219661 None:intergenic 55.0%
CATCCAGGAACAACAGCAGG+TGG - Chr6:94221726-94221745 None:intergenic 55.0%
CCAAGCTTGATCCCTGCTTG+TGG + Chr6:94219051-94219070 MsG0680034768.01.T01:CDS 55.0%
CCACAAGCAGGGATCAAGCT+TGG - Chr6:94219054-94219073 None:intergenic 55.0%
CGACCCTGCTAAGGTACAGA+GGG + Chr6:94221746-94221765 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
CGTTGAGGAGGGTGGTTGTT+GGG - Chr6:94216394-94216413 None:intergenic 55.0%
CTGGTACGTAGGTGAGGGTA+TGG + Chr6:94221866-94221885 MsG0680034768.01.T01:intron 55.0%
CTTGAAAAGGACAGCCCCTC+AGG - Chr6:94220572-94220591 None:intergenic 55.0%
GAACCAGACGCATGTGTGTG+GGG + Chr6:94219537-94219556 MsG0680034768.01.T01:CDS 55.0%
GACTGTGCTGCAAGATGTGG+AGG + Chr6:94219899-94219918 MsG0680034768.01.T01:CDS 55.0%
GAGAGGATAGGGGTGAGATG+TGG - Chr6:94216515-94216534 None:intergenic 55.0%
GATTGTACGCGCGTTGAGGA+GGG - Chr6:94216405-94216424 None:intergenic 55.0%
GCATGCGTGCATTTGTCCAC+TGG + Chr6:94221847-94221866 MsG0680034768.01.T01:intron 55.0%
GCTGCAAGATGTGGAGGAAC+AGG + Chr6:94219905-94219924 MsG0680034768.01.T01:CDS 55.0%
GGATCTTGCCACTCCAGAGA+AGG + Chr6:94221914-94221933 MsG0680034768.01.T01:intron 55.0%
GTCCACTGGTACGTAGGTGA+GGG + Chr6:94221861-94221880 MsG0680034768.01.T01:intron 55.0%
GTGAGATGAGAAGGAGGGTG+TGG + Chr6:94218495-94218514 MsG0680034768.01.T01:intron 55.0%
GTGGGAGAGAGGAGAGGATA+GGG - Chr6:94216526-94216545 None:intergenic 55.0%
GTGTTGGAACCAGACAACCC+CGG + Chr6:94219630-94219649 MsG0680034768.01.T01:CDS 55.0%
GTTGAGGAGGGTGGTTGTTG+GGG - Chr6:94216393-94216412 None:intergenic 55.0%
TACCCTCACCTACGTACCAG+TGG - Chr6:94221866-94221885 None:intergenic 55.0%
TCGCATCCAGGAACAACAGC+AGG - Chr6:94221729-94221748 None:intergenic 55.0%
TGGGAGAGAGGAGAGGATAG+GGG - Chr6:94216525-94216544 None:intergenic 55.0%
TGTCCACTGGTACGTAGGTG+AGG + Chr6:94221860-94221879 MsG0680034768.01.T01:intron 55.0%
TGTGGGAGAGAGGAGAGGAT+AGG - Chr6:94216527-94216546 None:intergenic 55.0%
TGTTGGAACCAGACAACCCC+GGG + Chr6:94219631-94219650 MsG0680034768.01.T01:CDS 55.0%
! ACCAGTGTTGCTGAGGTGCT+CGG + Chr6:94221792-94221811 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
! CGATGATTGCGGGGTATTCG+AGG + Chr6:94218438-94218457 MsG0680034768.01.T01:CDS 55.0%
! CGTGTGTTTTGCCGGGTGTT+GGG + Chr6:94218644-94218663 MsG0680034768.01.T01:CDS 55.0%
! CTTGGTAATCGGGAGGCAAC+CGG - Chr6:94219880-94219899 None:intergenic 55.0%
! GATTGCGGGGTATTCGAGGT+TGG + Chr6:94218442-94218461 MsG0680034768.01.T01:CDS 55.0%
! GCACAGTCTTGGTAATCGGG+AGG - Chr6:94219887-94219906 None:intergenic 55.0%
! GGAGGGTGTGGAGCCAAATT+TGG + Chr6:94218507-94218526 MsG0680034768.01.T01:intron 55.0%
! TCGTGTGTTTTGCCGGGTGT+TGG + Chr6:94218643-94218662 MsG0680034768.01.T01:CDS 55.0%
! TTGCGGGGTATTCGAGGTTG+GGG + Chr6:94218444-94218463 MsG0680034768.01.T01:CDS 55.0%
!! CCTTAGGGTGCTGTTGTGGT+GGG - Chr6:94221249-94221268 None:intergenic 55.0%
!! CTTAGGGTGCTGTTGTGGTG+GGG - Chr6:94221248-94221267 None:intergenic 55.0%
ACCGAGCACCTCAGCAACAC+TGG - Chr6:94221796-94221815 None:intergenic 60.0%
ACCTTAGCAGGGTCGCATCC+AGG - Chr6:94221741-94221760 None:intergenic 60.0%
ATGTGCGCCCGAGATGTCTC+GGG + Chr6:94218780-94218799 MsG0680034768.01.T01:CDS 60.0%
CAGCCACCTGCTGTTGTTCC+TGG + Chr6:94221720-94221739 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR 60.0%
CAGGAACAACAGCAGGTGGC+TGG - Chr6:94221722-94221741 None:intergenic 60.0%
CCCACCACAACAGCACCCTA+AGG + Chr6:94221246-94221265 MsG0680034768.01.T01:intron 60.0%
CCGAAAATCCGGCCGCCTTA+GGG - Chr6:94221264-94221283 None:intergenic 60.0%
CTGCGGTCATATCGGCGCTA+TGG + Chr6:94221159-94221178 MsG0680034768.01.T01:intron 60.0%
GAGCACCTCAGCAACACTGG+TGG - Chr6:94221793-94221812 None:intergenic 60.0%
GATGTGCGCCCGAGATGTCT+CGG + Chr6:94218779-94218798 MsG0680034768.01.T01:CDS 60.0%
GCGACCCTGCTAAGGTACAG+AGG + Chr6:94221745-94221764 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR 60.0%
GCGTTGAGGAGGGTGGTTGT+TGG - Chr6:94216395-94216414 None:intergenic 60.0%
GGATTGTACGCGCGTTGAGG+AGG - Chr6:94216406-94216425 None:intergenic 60.0%
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TCCGAAAATCCGGCCGCCTT+AGG - Chr6:94221265-94221284 None:intergenic 60.0%
TCCTGGATGCGACCCTGCTA+AGG + Chr6:94221737-94221756 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR 60.0%
! AGCGGGTTCGTACTCCCGAT+GGG + Chr6:94221441-94221460 MsG0680034768.01.T01:intron 60.0%
! CCCTAAGGCGGCCGGATTTT+CGG + Chr6:94221261-94221280 MsG0680034768.01.T01:intron 60.0%
! CGTGGATTGTACGCGCGTTG+AGG - Chr6:94216409-94216428 None:intergenic 60.0%
! CTGTTGTGGTGGGGTATGGC+GGG - Chr6:94221239-94221258 None:intergenic 60.0%
! GCTGTTGTGGTGGGGTATGG+CGG - Chr6:94221240-94221259 None:intergenic 60.0%
!! AATGGGTGCTGAGTCTGGCG+AGG + Chr6:94221943-94221962 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR 60.0%
!! ATGGGTGCTGAGTCTGGCGA+GGG + Chr6:94221944-94221963 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR 60.0%
!! GCCGGGTGTTGGGAATTTGG+AGG + Chr6:94218654-94218673 MsG0680034768.01.T01:CDS 60.0%
!! GCCTTAGGGTGCTGTTGTGG+TGG - Chr6:94221250-94221269 None:intergenic 60.0%
!! GGTGCTGTTGTGGTGGGGTA+TGG - Chr6:94221243-94221262 None:intergenic 60.0%
!! TTGTGGTGGGTGTGAGGGGA+GGG + Chr6:94218097-94218116 MsG0680034768.01.T01:intron 60.0%
!! TTTGTGGTGGGTGTGAGGGG+AGG + Chr6:94218096-94218115 MsG0680034768.01.T01:intron 60.0%
CAACAGCACCCTAAGGCGGC+CGG + Chr6:94221253-94221272 MsG0680034768.01.T01:intron 65.0%
GAAGAGGGGAGACGACTCGC+AGG + Chr6:94220403-94220422 MsG0680034768.01.T01:intron 65.0%
GCTCCCCACACACATGCGTC+TGG - Chr6:94219543-94219562 None:intergenic 65.0%
TGGGGTGTGGGAGAGAGGAG+AGG - Chr6:94216532-94216551 None:intergenic 65.0%
TGTACGCGCGTTGAGGAGGG+TGG - Chr6:94216402-94216421 None:intergenic 65.0%
! GAGCGGGTTCGTACTCCCGA+TGG + Chr6:94221440-94221459 MsG0680034768.01.T01:intron 65.0%
!! CTATGGCGGATGGCGGTCTG+TGG - Chr6:94221302-94221321 None:intergenic 65.0%
!! GATGGTGGGGTGTGGGAGAG+AGG - Chr6:94216537-94216556 None:intergenic 65.0%
!! GCCGCCTTAGGGTGCTGTTG+TGG - Chr6:94221253-94221272 None:intergenic 65.0%
! GGTGCTGAGTCTGGCGAGGG+TGG + Chr6:94221947-94221966 MsG0680034768.01.T01:three_prime_UTR 70.0%
! TGGCGGATGGCGGTCTGTGG+TGG - Chr6:94221299-94221318 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 94216187 94221994 94216187 ID=MsG0680034768.01;Name=MsG0680034768.01
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Chr6 exon 94218617 94220156 94218617 ID=MsG0680034768.01.T01:exon:5999;Parent=MsG0680034768.01.T01
Chr6 exon 94221635 94221841 94221635 ID=MsG0680034768.01.T01:exon:6000;Parent=MsG0680034768.01.T01
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Chr6 five_prime_UTR 94216187 94216355 94216187 ID=MsG0680034768.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0680034768.01.T01
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Chr6 CDS 94221635 94221635 94221635 ID=MsG0680034768.01.T01:cds;Parent=MsG0680034768.01.T01
Chr6 three_prime_UTR 94221636 94221841 94221636 ID=MsG0680034768.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0680034768.01.T01
Chr6 three_prime_UTR 94221931 94221994 94221931 ID=MsG0680034768.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0680034768.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680034768.01.T01

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Protein sequence

>MsG0680034768.01.T01

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