AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035450.01

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MsG0680035450.01.T01 AT4G11900 49.359 156 73 4 2 154 534 686 3.06e-37 136
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MsG0680035450.01.T01 AT1G01540 42.021 188 103 5 9 195 160 342 3.33e-37 134
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MsG0680035450.01.T01 AT1G67720 39.487 195 111 5 2 195 605 793 3.82e-37 136
MsG0680035450.01.T01 AT1G23540 40.404 198 108 6 1 195 367 557 3.91e-37 136
MsG0680035450.01.T01 AT5G38990 39.196 199 113 6 2 195 522 717 3.91e-37 136
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MsG0680035450.01.T01 AT4G21400 38.249 217 102 6 8 195 328 541 3.84e-35 130
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MsG0680035450.01.T01 AT2G43690 38.776 196 112 6 2 195 334 523 1.33e-33 126
MsG0680035450.01.T01 AT1G24030 40.099 202 107 8 2 195 59 254 1.34e-33 121
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MsG0680035450.01.T01 AT3G17410 37.696 191 112 3 9 195 75 262 1.38e-33 123
MsG0680035450.01.T01 AT1G70520 42.408 191 99 7 8 195 330 512 1.39e-33 126
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MsG0680035450.01.T01 AT2G28590 40.212 189 107 5 9 195 104 288 1.44e-33 124
MsG0680035450.01.T01 AT2G17220 42.347 196 99 6 9 195 93 283 1.47e-33 124
MsG0680035450.01.T01 AT4G04960 39.785 186 106 5 12 195 356 537 1.54e-33 125
MsG0680035450.01.T01 AT1G26150 40.102 197 108 6 2 195 427 616 1.57e-33 126
MsG0680035450.01.T01 AT5G42440 37.306 193 115 6 4 195 82 269 1.58e-33 122
MsG0680035450.01.T01 AT5G07280 41.489 188 104 5 9 195 923 1105 1.61e-33 126
MsG0680035450.01.T01 AT1G21240 40.541 185 103 5 12 195 163 341 1.69e-33 124
MsG0680035450.01.T01 AT2G25220 42.328 189 99 6 9 195 103 283 1.76e-33 123
MsG0680035450.01.T01 AT1G51850 39.286 196 113 4 1 195 556 746 1.79e-33 126
MsG0680035450.01.T01 AT2G25220 42.328 189 99 6 9 195 103 283 1.85e-33 123
MsG0680035450.01.T01 AT1G51850 39.286 196 113 4 1 195 576 766 1.89e-33 126
MsG0680035450.01.T01 AT1G51890 37.963 216 109 6 1 195 568 779 1.93e-33 126
MsG0680035450.01.T01 AT1G49730 40.404 198 107 6 2 195 326 516 2.23e-33 125
MsG0680035450.01.T01 AT5G15730 38.693 199 103 7 2 195 113 297 2.54e-33 123
MsG0680035450.01.T01 AT1G49730 40.404 198 107 6 2 195 356 546 2.72e-33 125
MsG0680035450.01.T01 AT3G08870 37.766 188 112 4 9 195 374 557 2.80e-33 125
MsG0680035450.01.T01 AT3G08870 37.766 188 112 4 9 195 395 578 2.82e-33 125
MsG0680035450.01.T01 AT2G25220 42.328 189 99 6 9 195 152 332 3.45e-33 123
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MsG0680035450.01.T01 AT2G25220 42.328 189 99 6 9 195 152 332 3.63e-33 123
MsG0680035450.01.T01 AT5G65240 40.909 198 108 6 2 195 281 473 3.69e-33 125
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MsG0680035450.01.T01 AT5G65240 40.909 198 108 6 2 195 281 473 4.08e-33 124
MsG0680035450.01.T01 AT1G24030 40.099 202 107 8 2 195 59 254 4.42e-33 121
MsG0680035450.01.T01 AT1G23540 41.566 166 90 4 1 163 367 528 5.01e-33 124
MsG0680035450.01.T01 AT2G25220 42.328 189 99 6 9 195 157 337 5.90e-33 122
MsG0680035450.01.T01 AT1G24030 40.415 193 103 7 9 195 82 268 5.99e-33 121
MsG0680035450.01.T01 AT5G61480 39.691 194 104 5 9 195 725 912 6.60e-33 124
MsG0680035450.01.T01 AT1G51830 39.594 197 111 6 1 195 384 574 6.74e-33 124
MsG0680035450.01.T01 AT3G09830 37.624 202 111 4 4 195 85 281 7.40e-33 122
MsG0680035450.01.T01 AT3G09830 37.624 202 111 4 4 195 85 281 7.40e-33 122
MsG0680035450.01.T01 AT3G09830 37.624 202 111 4 4 195 85 281 7.40e-33 122
MsG0680035450.01.T01 AT5G65700 40.000 190 105 5 9 195 700 883 7.66e-33 124
MsG0680035450.01.T01 AT5G65700 40.000 190 105 5 9 195 700 883 7.66e-33 124
MsG0680035450.01.T01 AT5G01950 38.947 190 104 5 11 194 549 732 7.98e-33 124
MsG0680035450.01.T01 AT1G51830 39.594 197 111 6 1 195 391 581 8.13e-33 124

Find 34 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 351 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TGTCCAAAGATTTCAGATTT+TGG 0.158334 6:-105938724 MsG0680035450.01.T01:CDS
TGACAAATTTATTTACAATA+AGG 0.242589 6:-105938899 MsG0680035450.01.T01:CDS
AAATGTTTATTCCACACTTC+TGG 0.253696 6:+105938625 None:intergenic
GTTAATGTTGTCACCCTTCT+TGG 0.258697 6:-105938985 MsG0680035450.01.T01:CDS
AGTCCAAAATCTGAAATCTT+TGG 0.316100 6:+105938721 None:intergenic
GAAGTGTGGAATAAACATTT+TGG 0.335584 6:-105938622 MsG0680035450.01.T01:CDS
GACAAATTTATTTACAATAA+GGG 0.337425 6:-105938898 MsG0680035450.01.T01:CDS
AAATTCTTCACCGTTTCCTT+TGG 0.361382 6:+105939044 None:intergenic
GACAATTGCATCTTTGAGTT+GGG 0.414665 6:-105938869 MsG0680035450.01.T01:CDS
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ATATATGAATTTATGTCAAA+TGG 0.421229 6:-105938928 MsG0680035450.01.T01:CDS
GAAATAATGCTCTCGTTCCT+TGG 0.423347 6:+105938685 None:intergenic
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TTTCGATGTCAGATCAAAGA+TGG 0.463364 6:-105938666 MsG0680035450.01.T01:CDS
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CTCAAAGATGCAATTGTCTC+AGG 0.471396 6:+105938874 None:intergenic
CGGTGAAGAATTTATTAATG+AGG 0.473285 6:-105939034 MsG0680035450.01.T01:CDS
CTTCAAAACAAAATCCAAGA+AGG 0.480875 6:+105938971 None:intergenic
TTCAAAATTAAACTTAGTCA+AGG 0.482133 6:-105943629 MsG0680035450.01.T01:CDS
AATTTGTATCAAATTGCAAA+AGG 0.504479 6:-105938844 MsG0680035450.01.T01:CDS
TCAAAATTAAACTTAGTCAA+GGG 0.504650 6:-105943628 MsG0680035450.01.T01:CDS
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TCATCTAAAAGAATGTTATG+TGG 0.522792 6:+105938754 None:intergenic
ATTGCAAAAGGTATAGTTCG+TGG 0.527141 6:-105938832 MsG0680035450.01.T01:CDS
TTCAAAGGAAAGTTATTCAA+CGG 0.547275 6:-105943590 MsG0680035450.01.T01:CDS
ATTCATATATCCAAAGGAAA+CGG 0.550016 6:-105939054 MsG0680035450.01.T01:intron
GACTTGCAAAACTCTGTCCA+AGG 0.563270 6:-105938702 MsG0680035450.01.T01:CDS
GTCAGATCAAAGATGGACAA+TGG 0.567644 6:-105938659 MsG0680035450.01.T01:CDS
TTCAAAACAAAATCCAAGAA+GGG 0.577464 6:+105938972 None:intergenic
GGACTAGAGTACTTGCATAG+AGG 0.617508 6:-105938811 MsG0680035450.01.T01:CDS
AAAATTAAACTTAGTCAAGG+GGG 0.617516 6:-105943626 MsG0680035450.01.T01:CDS
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GCAGTGAAGATATTAAATGC+AGG 0.669024 6:-105943557 MsG0680035450.01.T01:intron
GGTGACAACATTAACATGTG+AGG 0.681857 6:+105938993 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!! ATATATGAATTTATGTCAAA+TGG - Chr6:105943298-105943317 MsG0680035450.01.T01:intron 15.0%
!! ATTTACTTGAAAATATTTCA+TGG - Chr6:105942388-105942407 MsG0680035450.01.T01:intron 15.0%
!! CTAAAATATATAAGTATTCT+AGG + Chr6:105942669-105942688 None:intergenic 15.0%
!! GACAAATTTATTTACAATAA+GGG - Chr6:105943328-105943347 MsG0680035450.01.T01:intron 15.0%
!! TGACAAATTTATTTACAATA+AGG - Chr6:105943327-105943346 MsG0680035450.01.T01:intron 15.0%
!!! ATAATTTTATTTACAAGAAG+AGG - Chr6:105938823-105938842 MsG0680035450.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATTTTAGTTATAGGTATTTT+TGG + Chr6:105940410-105940429 None:intergenic 15.0%
!!! TAATTTTATTTACAAGAAGA+GGG - Chr6:105938824-105938843 MsG0680035450.01.T01:CDS 15.0%
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!! AAAGGAAAAGTTATGAATTA+TGG + Chr6:105941640-105941659 None:intergenic 20.0%
!! AATATATTCTCTTTATCAAC+AGG - Chr6:105942862-105942881 MsG0680035450.01.T01:intron 20.0%
!! AATTTGTATCAAATTGCAAA+AGG - Chr6:105943382-105943401 MsG0680035450.01.T01:intron 20.0%
!! ACTTAGGTTTGAAAAAAATA+TGG + Chr6:105938975-105938994 None:intergenic 20.0%
!! AGATAACTCAACTAATAAAA+CGG + Chr6:105941322-105941341 None:intergenic 20.0%
!! ATAATATCATCCTAAAACTT+TGG + Chr6:105940901-105940920 None:intergenic 20.0%
!! ATGCTTAATTATAATACTCT+TGG + Chr6:105942751-105942770 None:intergenic 20.0%
!! ATTTAGCAATTTCACAAAAA+TGG + Chr6:105941667-105941686 None:intergenic 20.0%
!! CAATAGAGACAAAAATAAAT+TGG - Chr6:105940025-105940044 MsG0680035450.01.T01:intron 20.0%
!! CCAAAAGAATATTAATTATG+TGG + Chr6:105939567-105939586 None:intergenic 20.0%
!! CTCTATTTAAGAAAAAAGTA+TGG - Chr6:105939424-105939443 MsG0680035450.01.T01:intron 20.0%
!! GAGTATTATAATTAAGCATA+AGG - Chr6:105942752-105942771 MsG0680035450.01.T01:intron 20.0%
!! TAATATCATCCTAAAACTTT+GGG + Chr6:105940900-105940919 None:intergenic 20.0%
!! TAATTGAATTATCTTTCCAA+TGG - Chr6:105942359-105942378 MsG0680035450.01.T01:intron 20.0%
!! TATTATAATTAAGCATAAGG+AGG - Chr6:105942755-105942774 MsG0680035450.01.T01:intron 20.0%
!! TATTGAATTCATATATCCAA+AGG - Chr6:105943166-105943185 MsG0680035450.01.T01:intron 20.0%
!! TCAAAATTAAACTTAGTCAA+GGG - Chr6:105938598-105938617 MsG0680035450.01.T01:CDS 20.0%
!! TCTGTTTGTTTATTTAAACA+TGG - Chr6:105940677-105940696 MsG0680035450.01.T01:intron 20.0%
!! TTCAAAATTAAACTTAGTCA+AGG - Chr6:105938597-105938616 MsG0680035450.01.T01:CDS 20.0%
!! TTCACTGAAAACAATAATTA+TGG + Chr6:105941014-105941033 None:intergenic 20.0%
!! TTGAGAAAATCTTATGATTT+GGG - Chr6:105941974-105941993 MsG0680035450.01.T01:intron 20.0%
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!! TTTGAGAAAATCTTATGATT+TGG - Chr6:105941973-105941992 MsG0680035450.01.T01:intron 20.0%
!!! AAAACAATAATTATGGATTG+TGG + Chr6:105941007-105941026 None:intergenic 20.0%
!!! ACATATTGAACTTTGTTTAA+TGG + Chr6:105940647-105940666 None:intergenic 20.0%
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!!! ATAAGCCTATTTAACTTAAA+AGG + Chr6:105939387-105939406 None:intergenic 20.0%
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!!! GATTTTTCAATATTAGAATG+AGG - Chr6:105940620-105940639 MsG0680035450.01.T01:intron 20.0%
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!!! TGAAGAAATTTTAAGTTTGT+CGG - Chr6:105941947-105941966 MsG0680035450.01.T01:intron 20.0%
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! AAAAATTCTCTTTCTCTACA+TGG - Chr6:105940733-105940752 MsG0680035450.01.T01:intron 25.0%
! AAAATTAAACTTAGTCAAGG+GGG - Chr6:105938600-105938619 MsG0680035450.01.T01:CDS 25.0%
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! AAGTATTAGAGGTTAAATTG+AGG - Chr6:105942528-105942547 MsG0680035450.01.T01:intron 25.0%
! AAGTCTGATATTTATAGCTA+TGG - Chr6:105939740-105939759 MsG0680035450.01.T01:intron 25.0%
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! CTAACTCAACTTTACAAAAT+CGG + Chr6:105940871-105940890 None:intergenic 25.0%
! CTTCAAAACTTAAGTATTAG+AGG - Chr6:105942517-105942536 MsG0680035450.01.T01:intron 25.0%
! GGTTTAGAAATTAAACTTTC+GGG + Chr6:105942146-105942165 None:intergenic 25.0%
! GTCGAAATGTAAAATTCTAA+TGG + Chr6:105943446-105943465 None:intergenic 25.0%
! TCAAATTAAGAATTGCAATG+TGG - Chr6:105940923-105940942 MsG0680035450.01.T01:intron 25.0%
! TCATCTAAAAGAATGTTATG+TGG + Chr6:105943475-105943494 None:intergenic 25.0%
! TTCAAAACAAAATCCAAGAA+GGG + Chr6:105943257-105943276 None:intergenic 25.0%
! TTCAAAGGAAAGTTATTCAA+CGG - Chr6:105938636-105938655 MsG0680035450.01.T01:CDS 25.0%
! TTTCACAAAAATGGGTAAAA+AGG + Chr6:105941658-105941677 None:intergenic 25.0%
!! ACAAATTACGGAAATTTTGT+GGG + Chr6:105940460-105940479 None:intergenic 25.0%
!! GTATATAAGCTTAGTCTTTA+AGG - Chr6:105941440-105941459 MsG0680035450.01.T01:intron 25.0%
!! TAATCAAAATCGGGATTTTT+GGG - Chr6:105942105-105942124 MsG0680035450.01.T01:intron 25.0%
!!! ATTTTTTTCAAACCTAAGTC+TGG - Chr6:105938976-105938995 MsG0680035450.01.T01:CDS 25.0%
!!! GAAGCATTTTTAAAAGATCA+TGG - Chr6:105943006-105943025 MsG0680035450.01.T01:intron 25.0%
!!! GTCGATTTGAATATTTATTC+TGG + Chr6:105940512-105940531 None:intergenic 25.0%
!!! TATTGGTTTTAGTGTGTTTA+AGG - Chr6:105941399-105941418 MsG0680035450.01.T01:intron 25.0%
AAATGTTTATTCCACACTTC+TGG + Chr6:105943604-105943623 None:intergenic 30.0%
AATTATCTTTCCAATGGCTT+TGG - Chr6:105942365-105942384 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
ACATTGCATAATTTATGCAG+GGG + Chr6:105940206-105940225 None:intergenic 30.0%
ACCAACAATTAGTAAAGTGA+TGG - Chr6:105939889-105939908 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
ACCAATAATTAACGCACTAA+CGG + Chr6:105941386-105941405 None:intergenic 30.0%
AGACATTGCATAATTTATGC+AGG + Chr6:105940208-105940227 None:intergenic 30.0%
AGGTGAAGAATTTATTAACG+AGG - Chr6:105938689-105938708 MsG0680035450.01.T01:CDS 30.0%
AGGTTTGAAAAAAATATGGC+AGG + Chr6:105938971-105938990 None:intergenic 30.0%
ATCTATGAATTAATGCCCAA+TGG - Chr6:105938792-105938811 MsG0680035450.01.T01:CDS 30.0%
ATGATGATACTAGAAATGGT+TGG - Chr6:105939764-105939783 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
ATTAATAGTACTCTCTCTCT+TGG + Chr6:105939641-105939660 None:intergenic 30.0%
ATTGCAAAAAGGATAGCTTA+AGG - Chr6:105938890-105938909 MsG0680035450.01.T01:CDS 30.0%
CAGACCAAAACAATATTATG+TGG - Chr6:105941133-105941152 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
CGGTGAAGAATTTATTAATG+AGG - Chr6:105943192-105943211 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
CTCAAAACAAAATCCAAGTA+GGG + Chr6:105938754-105938773 None:intergenic 30.0%
CTGTGTGCGATAATTAATTA+GGG - Chr6:105941340-105941359 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
CTTCAAAACAAAATCCAAGA+AGG + Chr6:105943258-105943277 None:intergenic 30.0%
GAAACTGGAATCATTGTTTA+TGG - Chr6:105941919-105941938 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
GAATTTCTGCCCAAAAATAT+CGG - Chr6:105939591-105939610 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
GACATTGCATAATTTATGCA+GGG + Chr6:105940207-105940226 None:intergenic 30.0%
GTTAATATTGTTACCCTACT+TGG - Chr6:105938738-105938757 MsG0680035450.01.T01:CDS 30.0%
TACAAAGGAAAGTTAGTCAA+TGG - Chr6:105943123-105943142 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
TAGAACTCACACAATTAATG+TGG - Chr6:105940149-105940168 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
TATGCAAGTAATCTAACCTA+GGG + Chr6:105939508-105939527 None:intergenic 30.0%
TCCATCACTTTACTAATTGT+TGG + Chr6:105939893-105939912 None:intergenic 30.0%
TCCTGATTGGATATACAATA+AGG - Chr6:105939835-105939854 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
TCCTTATTGTATATCCAATC+AGG + Chr6:105939839-105939858 None:intergenic 30.0%
TCTGTGTGCGATAATTAATT+AGG - Chr6:105941339-105941358 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
TGATGATACTAGAAATGGTT+GGG - Chr6:105939765-105939784 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
TGGAATGATGATACTAGAAA+TGG - Chr6:105939760-105939779 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
TTAATAGTACTCTCTCTCTT+GGG + Chr6:105939640-105939659 None:intergenic 30.0%
TTGAACTGTTGGTATCAATT+TGG - Chr6:105941895-105941914 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
TTGCAAAAAGGATAGCTTAA+GGG - Chr6:105938891-105938910 MsG0680035450.01.T01:CDS 30.0%
! AAAGTGATGGAAATGTTTGA+AGG - Chr6:105939902-105939921 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
! AACCCAAAATCCGATATTTT+TGG + Chr6:105939604-105939623 None:intergenic 30.0%
! ACCCAAAATCCGATATTTTT+GGG + Chr6:105939603-105939622 None:intergenic 30.0%
! AGCTTAGTCTTTAAGGATTA+TGG - Chr6:105941447-105941466 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
! AGTCCAAAATCTGAAATCTT+TGG + Chr6:105943508-105943527 None:intergenic 30.0%
! ATAATCAACACGAGGTTTTA+GGG - Chr6:105939133-105939152 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
! ATTGATGATTGTTGAACTGT+TGG - Chr6:105941884-105941903 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
! CAAATTACGGAAATTTTGTG+GGG + Chr6:105940459-105940478 None:intergenic 30.0%
! CAATAATTATGGATTGTGGA+AGG + Chr6:105941003-105941022 None:intergenic 30.0%
! CACAAATTACGGAAATTTTG+TGG + Chr6:105940461-105940480 None:intergenic 30.0%
! CCTATTTAACTTAAAAGGTC+AGG + Chr6:105939382-105939401 None:intergenic 30.0%
! GAAGTGTGGAATAAACATTT+TGG - Chr6:105943604-105943623 MsG0680035450.01.T01:CDS 30.0%
! GAGGGGTAATTAGTAATTTT+GGG - Chr6:105941264-105941283 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
! GTAATCAAAATCGGGATTTT+TGG - Chr6:105942104-105942123 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
! TAGACTTAACCCAAAGTTTT+AGG - Chr6:105940888-105940907 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
! TGAGGGGTAATTAGTAATTT+TGG - Chr6:105941263-105941282 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
! TGCTCCACATAATATTGTTT+TGG + Chr6:105941140-105941159 None:intergenic 30.0%
! TGTCCAAAGATTTCAGATTT+TGG - Chr6:105943502-105943521 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
!! GATTTAGATTTTGAAAGTGC+TGG + Chr6:105940488-105940507 None:intergenic 30.0%
!!! AGGTATTTTTGGGAAGTTTA+TGG + Chr6:105940399-105940418 None:intergenic 30.0%
!!! CACATAATATTGTTTTGGTC+TGG + Chr6:105941135-105941154 None:intergenic 30.0%
!!! CCTGACCTTTTAAGTTAAAT+AGG - Chr6:105939379-105939398 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
!!! CTACTTGGATTTTGTTTTGA+GGG - Chr6:105938753-105938772 MsG0680035450.01.T01:CDS 30.0%
!!! CTTCTTGGATTTTGTTTTGA+AGG - Chr6:105943256-105943275 MsG0680035450.01.T01:intron 30.0%
AAAACATTGCATCTCTGAGT+TGG - Chr6:105938852-105938871 MsG0680035450.01.T01:CDS 35.0%
AAAAGCCTCTTAAGCCTATT+AGG + Chr6:105939345-105939364 None:intergenic 35.0%
AAACATTGCATCTCTGAGTT+GGG - Chr6:105938853-105938872 MsG0680035450.01.T01:CDS 35.0%
AAAGGATAGCTTAAGGGTTA+AGG - Chr6:105938897-105938916 MsG0680035450.01.T01:CDS 35.0%
AAATTCTTCACCGTTTCCTT+TGG + Chr6:105943185-105943204 None:intergenic 35.0%
AAATTTCCTCAAAACCCACT+TGG + Chr6:105942438-105942457 None:intergenic 35.0%
AACAAGTTCAATACTCACCT+AGG + Chr6:105940956-105940975 None:intergenic 35.0%
AAGGATAGCTTAAGGGTTAA+GGG - Chr6:105938898-105938917 MsG0680035450.01.T01:CDS 35.0%
AAGTAATCTAACCTAGGGAT+GGG + Chr6:105939503-105939522 None:intergenic 35.0%
AATGCACCATAAACCTACAA+TGG + Chr6:105939866-105939885 None:intergenic 35.0%
AATTGTCTATTCCACACTTC+AGG + Chr6:105939704-105939723 None:intergenic 35.0%
ACACAAGAGAATGAAGTTAG+AGG - Chr6:105941497-105941516 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
ACACAATTAATGTGGAGAAG+TGG - Chr6:105940157-105940176 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
ACCGTTAGTGCGTTAATTAT+TGG - Chr6:105941382-105941401 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
AGACAATTGCATCTTTGAGT+TGG - Chr6:105943356-105943375 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
AGCAAATCATCAATACGACA+AGG - Chr6:105942946-105942965 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
AGGAAAAACATTGATGCTGA+TGG - Chr6:105939791-105939810 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
AGGTTAGATTACTTGCATAG+AGG - Chr6:105939509-105939528 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
ATAGGCTTATAAAGAAGCCT+AGG - Chr6:105939397-105939416 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
ATGACGTAAATACTCCAAGT+GGG - Chr6:105942421-105942440 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
ATTAAATAGGCCGACCTAAT+AGG - Chr6:105939328-105939347 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
ATTTCTTTAAGTGAGCACCA+TGG + Chr6:105941061-105941080 None:intergenic 35.0%
CAACAGTGTTTATAAGTGAG+GGG - Chr6:105940828-105940847 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
CAAGTGAATACTTTCCTGAT+TGG - Chr6:105939822-105939841 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
CAATAAGGACAATCCATTGT+AGG - Chr6:105939850-105939869 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
CCAACAGTGTTTATAAGTGA+GGG - Chr6:105940827-105940846 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
CCTCAAAACAAAATCCAAGT+AGG + Chr6:105938755-105938774 None:intergenic 35.0%
CGGTAATTAATTAGCAACCT+CGG + Chr6:105941366-105941385 None:intergenic 35.0%
CTAGTAGGAAAAGAAAGCTT+AGG + Chr6:105939977-105939996 None:intergenic 35.0%
CTATGCAAGTAATCTAACCT+AGG + Chr6:105939509-105939528 None:intergenic 35.0%
CTTATAAACACTGTTGGACT+TGG + Chr6:105940824-105940843 None:intergenic 35.0%
GAAGTGTGGAATAGACAATT+TGG - Chr6:105939704-105939723 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
GAAGTTTAGAAACCAACCAT+AGG + Chr6:105942501-105942520 None:intergenic 35.0%
GACAATCCATTGTAGGTTTA+TGG - Chr6:105939857-105939876 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
GACTCTTTCAAGGTTAAACT+TGG - Chr6:105943078-105943097 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
GATGATACTAGAAATGGTTG+GGG - Chr6:105939766-105939785 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
GCAGTGAAGATATTAAATGC+AGG - Chr6:105938669-105938688 MsG0680035450.01.T01:CDS 35.0%
GGTAACAATATTAACGTGAG+AGG + Chr6:105938733-105938752 None:intergenic 35.0%
GTCATGGCAATTTAGTCAAA+GGG + Chr6:105940082-105940101 None:intergenic 35.0%
TATGACGTAAATACTCCAAG+TGG - Chr6:105942420-105942439 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
TCAAGGTTAAACTTGGTCAA+GGG - Chr6:105943085-105943104 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
TCAAGTAAATCCAAAGCCAT+TGG + Chr6:105942378-105942397 None:intergenic 35.0%
TCAAGTTAGTCCAAAACCTA+TGG - Chr6:105942482-105942501 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
TCAGATCAAAGATGGACAAT+GGG - Chr6:105943568-105943587 MsG0680035450.01.T01:CDS 35.0%
TCATGCAGCTATTATTGTCA+TGG + Chr6:105940098-105940117 None:intergenic 35.0%
TCCAACAGTGTTTATAAGTG+AGG - Chr6:105940826-105940845 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
TGTCATGGCAATTTAGTCAA+AGG + Chr6:105940083-105940102 None:intergenic 35.0%
TTCAAGGTTAAACTTGGTCA+AGG - Chr6:105943084-105943103 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
TTCGTATGTTTGTGCTTTGA+GGG - Chr6:105941246-105941265 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
TTCTTAAATAGAGAAGGCCT+AGG + Chr6:105939417-105939436 None:intergenic 35.0%
TTTCGATGTCAGATCAAAGA+TGG - Chr6:105943560-105943579 MsG0680035450.01.T01:CDS 35.0%
TTTCGTATGTTTGTGCTTTG+AGG - Chr6:105941245-105941264 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
TTTCTTTAAGTGAGCACCAT+GGG + Chr6:105941060-105941079 None:intergenic 35.0%
TTTGACCCATAAACACTTTC+TGG - Chr6:105942061-105942080 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
! AGAAGATGAAAGCATAGGTT+TGG + Chr6:105939954-105939973 None:intergenic 35.0%
! ATGATTTGGGTGAAATGAGT+TGG - Chr6:105941987-105942006 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
! ATTGCAAAAGGTATAGTTCG+TGG - Chr6:105943394-105943413 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
! GAAGATGAAAGCATAGGTTT+GGG + Chr6:105939953-105939972 None:intergenic 35.0%
! GACAATTGCATCTTTGAGTT+GGG - Chr6:105943357-105943376 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
! GATAATCAACACGAGGTTTT+AGG - Chr6:105939132-105939151 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
! GCCCAAAAATATCGGATTTT+GGG - Chr6:105939599-105939618 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
! GTGTGGAATAAACATTTTGG+AGG - Chr6:105943607-105943626 MsG0680035450.01.T01:CDS 35.0%
! TAGAAACCAACCATAGGTTT+TGG + Chr6:105942495-105942514 None:intergenic 35.0%
! TGCCCAAAAATATCGGATTT+TGG - Chr6:105939598-105939617 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
! TGGTATCAATTTGGTGAAAC+TGG - Chr6:105941904-105941923 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
! TTAGGAGAAGATGAAAGCAT+AGG + Chr6:105939959-105939978 None:intergenic 35.0%
!! ACCTCGTGTTGATTATCAAA+AGG + Chr6:105939129-105939148 None:intergenic 35.0%
!! CCTCGTGTTGATTATCAAAA+GGG + Chr6:105939128-105939147 None:intergenic 35.0%
!! GGTGCTACTTATGGTAAATT+CGG - Chr6:105941101-105941120 MsG0680035450.01.T01:intron 35.0%
!! GTGTTCCAGAAAGTGTTTAT+GGG + Chr6:105942069-105942088 None:intergenic 35.0%
!! GTTATTCAACGGTAGTTTTG+TGG - Chr6:105938647-105938666 MsG0680035450.01.T01:CDS 35.0%
!!! CCTACTTGGATTTTGTTTTG+AGG - Chr6:105938752-105938771 MsG0680035450.01.T01:CDS 35.0%
AAGACACAAGAACGCAAAAC+AGG + Chr6:105942285-105942304 None:intergenic 40.0%
AAGGTTAAACTTGGTCAAGG+GGG - Chr6:105943087-105943106 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
AGAACAAGAACAAGGGTTAG+AGG - Chr6:105941529-105941548 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
AGAATGAAGTTAGAGGCTAG+AGG - Chr6:105941504-105941523 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
AGACACAAGAACGCAAAACA+GGG + Chr6:105942284-105942303 None:intergenic 40.0%
AGAGGAGAGAACAAGAACAA+GGG - Chr6:105941522-105941541 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
ATAAACACTGTTGGACTTGG+TGG + Chr6:105940821-105940840 None:intergenic 40.0%
ATAGCTTAAGGGTTAAGGGA+TGG - Chr6:105938902-105938921 MsG0680035450.01.T01:CDS 40.0%
ATATACTCCCTCTCCCTTAA+TGG + Chr6:105941426-105941445 None:intergenic 40.0%
ATTAAGCATAAGGAGGTCAC+TGG - Chr6:105942762-105942781 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
ATTTCCATGTCGAATGCTAG+AGG - Chr6:105939659-105939678 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
CAAGGTTAAACTTGGTCAAG+GGG - Chr6:105943086-105943105 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
CAAGTAATCTAACCTAGGGA+TGG + Chr6:105939504-105939523 None:intergenic 40.0%
CCCTCACTTATAAACACTGT+TGG + Chr6:105940830-105940849 None:intergenic 40.0%
CTCAAAGATGCAATTGTCTC+AGG + Chr6:105943355-105943374 None:intergenic 40.0%
CTGAATATGAGCTTCTGAAC+AGG + Chr6:105942207-105942226 None:intergenic 40.0%
GAAATAATGCTCTCGTTCCT+TGG + Chr6:105943544-105943563 None:intergenic 40.0%
GAAATTGATCTCTTGCCTCA+CGG - Chr6:105941076-105941095 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
GAACTTCTCGATATCCCATT+TGG - Chr6:105941031-105941050 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
GACAGCTACATGATTCTAAC+AGG - Chr6:105940253-105940272 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
GACTTGGGGTAATCAAAATC+GGG - Chr6:105942096-105942115 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
GCTATATGATTTCCGCTATC+AGG - Chr6:105940791-105940810 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
GGAAGTTTATGGTGTTTGTG+AGG + Chr6:105940388-105940407 None:intergenic 40.0%
GGACTTGGGGTAATCAAAAT+CGG - Chr6:105942095-105942114 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
GGCAATTTAGTCAAAGGGAA+GGG + Chr6:105940077-105940096 None:intergenic 40.0%
GGTGACAACATTAACATGTG+AGG + Chr6:105943236-105943255 None:intergenic 40.0%
GTCAGATCAAAGATGGACAA+TGG - Chr6:105943567-105943586 MsG0680035450.01.T01:CDS 40.0%
GTGCTGGAACACACAAATTA+CGG + Chr6:105940472-105940491 None:intergenic 40.0%
GTGTGGAATAGACAATTTGG+CGG - Chr6:105939707-105939726 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
GTTAATGTTGTCACCCTTCT+TGG - Chr6:105943241-105943260 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
GTTAGTCCAAAACCTATGGT+TGG - Chr6:105942486-105942505 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
TACCAACTGAGATAAGCTCA+CGG - Chr6:105940229-105940248 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
TAGAGGAGAGAACAAGAACA+AGG - Chr6:105941521-105941540 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
TAGAGGGGAATTCATCATCT+AGG - Chr6:105941553-105941572 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
TAGCTTAAGGGTTAAGGGAT+GGG - Chr6:105938903-105938922 MsG0680035450.01.T01:CDS 40.0%
TAGGAGCTAAAGTGAAGCTT+GGG - Chr6:105941572-105941591 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
TATACTCCCTCTCCCTTAAT+GGG + Chr6:105941425-105941444 None:intergenic 40.0%
TGAAAAAAATATGGCAGGCC+AGG + Chr6:105938966-105938985 None:intergenic 40.0%
TGCATAATTTATGCAGGGGT+CGG + Chr6:105940202-105940221 None:intergenic 40.0%
TGGCAATTTAGTCAAAGGGA+AGG + Chr6:105940078-105940097 None:intergenic 40.0%
TTATGGTGTTTGTGAGGTAG+AGG + Chr6:105940382-105940401 None:intergenic 40.0%
TTCTTTAAGTGAGCACCATG+GGG + Chr6:105941059-105941078 None:intergenic 40.0%
TTGTCTCTATTGTCAAGCAG+TGG + Chr6:105940017-105940036 None:intergenic 40.0%
TTTCCATGTCGAATGCTAGA+GGG - Chr6:105939660-105939679 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
TTTCCTACTAGATCAGTAGC+AGG - Chr6:105939986-105940005 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
! AAACTTAGTCAAGGGGGTTT+TGG - Chr6:105938606-105938625 MsG0680035450.01.T01:CDS 40.0%
! AAGCTTTTAAACAGGCTAGC+AGG + Chr6:105939023-105939042 None:intergenic 40.0%
! AGTGTGTTTAAGGCCCATTA+AGG - Chr6:105941409-105941428 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
! GTGTGTTTAAGGCCCATTAA+GGG - Chr6:105941410-105941429 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
! TAAACACTGTTGGACTTGGT+GGG + Chr6:105940820-105940839 None:intergenic 40.0%
! TAAAGTGAAGCTTGGGTTAG+AGG - Chr6:105941579-105941598 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
! TCGTATGTTTGTGCTTTGAG+GGG - Chr6:105941247-105941266 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
! TGTTTGTGAGGTAGAGGTAT+AGG + Chr6:105940376-105940395 None:intergenic 40.0%
!! AATACTCCAAGTGGGTTTTG+AGG - Chr6:105942429-105942448 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
!! CAAAATCGGCTTGTAAGATG+CGG + Chr6:105940857-105940876 None:intergenic 40.0%
!! CCCTTTTGATAATCAACACG+AGG - Chr6:105939125-105939144 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
!! CGTGTTCCAGAAAGTGTTTA+TGG + Chr6:105942070-105942089 None:intergenic 40.0%
!! TCAAAATCGGGATTTTTGGG+TGG - Chr6:105942108-105942127 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
!! TCTTGGTGTTAGAGGTAAGA+GGG - Chr6:105941603-105941622 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
!! TTAGAGGTTCTTGGTGTTAG+AGG - Chr6:105941595-105941614 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
!! TTCTTGGTGTTAGAGGTAAG+AGG - Chr6:105941602-105941621 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
!!! ACACTTTCTGGAACACGTTT+TGG - Chr6:105942073-105942092 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
!!! CACTTTCTGGAACACGTTTT+GGG - Chr6:105942074-105942093 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
!!! GGTTTTGGTGTTGTGTACAA+AGG - Chr6:105943108-105943127 MsG0680035450.01.T01:intron 40.0%
!!! GGTTTTGGTGTTGTGTTCAA+AGG - Chr6:105938621-105938640 MsG0680035450.01.T01:CDS 40.0%
AACAAGGGTTAGAGGCTAGA+GGG - Chr6:105941537-105941556 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
AACTTAAAAGGTCAGGCCAC+AGG + Chr6:105939375-105939394 None:intergenic 45.0%
AAGGGTTAAGGGATGGGAAT+AGG - Chr6:105938909-105938928 MsG0680035450.01.T01:CDS 45.0%
ACCAACTGAGATAAGCTCAC+GGG - Chr6:105940230-105940249 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
AGGTTTGGGTGGTATTTGGA+GGG + Chr6:105939939-105939958 None:intergenic 45.0%
CATAATTTATGCAGGGGTCG+GGG + Chr6:105940200-105940219 None:intergenic 45.0%
CGAATGCTAGAGGGACAATA+GGG - Chr6:105939669-105939688 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
CTAGGAGCTAAAGTGAAGCT+TGG - Chr6:105941571-105941590 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
GACTTGCAAAACTCTGTCCA+AGG - Chr6:105943524-105943543 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
GATATGTAGCTCCAGAAGTG+TGG - Chr6:105943590-105943609 MsG0680035450.01.T01:CDS 45.0%
GATCCTGCTACTGATCTAGT+AGG + Chr6:105939992-105940011 None:intergenic 45.0%
GATGAGTCAACGAATCTTGG+AGG + Chr6:105940770-105940789 None:intergenic 45.0%
GCAGATGAGTCAACGAATCT+TGG + Chr6:105940773-105940792 None:intergenic 45.0%
GCATAATTTATGCAGGGGTC+GGG + Chr6:105940201-105940220 None:intergenic 45.0%
GCATAGGTTTGGGTGGTATT+TGG + Chr6:105939943-105939962 None:intergenic 45.0%
GCCTCTTAAGCCTATTAGGT+CGG + Chr6:105939341-105939360 None:intergenic 45.0%
GCGATAATTAATTAGGGCCG+AGG - Chr6:105941346-105941365 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
GCTTCTGAACGAGCTTACTT+CGG + Chr6:105942167-105942186 None:intergenic 45.0%
GGTATATAGCTCCTGAAGTG+TGG - Chr6:105939690-105939709 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
TACTAGAAATGGTTGGGGTG+AGG - Chr6:105939771-105939790 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
TAGGTTTGGGTGGTATTTGG+AGG + Chr6:105939940-105939959 None:intergenic 45.0%
TCGAATGCTAGAGGGACAAT+AGG - Chr6:105939668-105939687 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
TTAAGGCCCATTAAGGGAGA+GGG - Chr6:105941416-105941435 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
TTAAGGGATGGGAATAGGCT+AGG - Chr6:105938914-105938933 MsG0680035450.01.T01:CDS 45.0%
! AAACTTGGTCAAGGGGGTTT+TGG - Chr6:105943093-105943112 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
! AAGCTTGGGTTAGAGGTTCT+TGG - Chr6:105941586-105941605 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
! ATATCCCATTTGGAACCCCA+TGG - Chr6:105941041-105941060 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
! ATGTGGAGAAGTGGAGTGTT+CGG - Chr6:105940166-105940185 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
! GATGAAAGCATAGGTTTGGG+TGG + Chr6:105939950-105939969 None:intergenic 45.0%
! GGACTAGAGTACTTGCATAG+AGG - Chr6:105943415-105943434 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
! TACGGAAATTTTGTGGGGTG+TGG + Chr6:105940454-105940473 None:intergenic 45.0%
! TGAGGTAGAGGTATAGGTGT+CGG + Chr6:105940370-105940389 None:intergenic 45.0%
! TTTAAGGCCCATTAAGGGAG+AGG - Chr6:105941415-105941434 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
!! GGCTTAAGAGGCTTTTTGAG+AGG - Chr6:105939349-105939368 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
!!! CGGGATTTTTGGGTGGAAAT+GGG - Chr6:105942115-105942134 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
!!! TCGGGATTTTTGGGTGGAAA+TGG - Chr6:105942114-105942133 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
!!! TGGAACACGTTTTGGGACTT+GGG - Chr6:105942081-105942100 MsG0680035450.01.T01:intron 45.0%
!! ATTATTCATATTAATTAAAT+AGG - Chr6:105939315-105939334 MsG0680035450.01.T01:intron 5.0%
!!! TATTTATTTATTTTAGTTAT+AGG + Chr6:105940419-105940438 None:intergenic 5.0%
AAATATGGCAGGCCAGGCTT+AGG + Chr6:105938960-105938979 None:intergenic 50.0%
ACAAGGGTTAGAGGCTAGAG+GGG - Chr6:105941538-105941557 MsG0680035450.01.T01:intron 50.0%
AGCACCATGGGGTTCCAAAT+GGG + Chr6:105941048-105941067 None:intergenic 50.0%
ATTGATCTCTTGCCTCACGG+TGG - Chr6:105941079-105941098 MsG0680035450.01.T01:intron 50.0%
CCAACTGAGATAAGCTCACG+GGG - Chr6:105940231-105940250 MsG0680035450.01.T01:intron 50.0%
GAACAAGGGTTAGAGGCTAG+AGG - Chr6:105941536-105941555 MsG0680035450.01.T01:intron 50.0%
GAACAGGTTCGCTTCTGAAC+CGG + Chr6:105942251-105942270 None:intergenic 50.0%
GCCGACCTAATAGGCTTAAG+AGG - Chr6:105939337-105939356 MsG0680035450.01.T01:intron 50.0%
GCTTTCAGAAGGCCAGACTT+AGG + Chr6:105938991-105939010 None:intergenic 50.0%
GGTTTGGGTGGTATTTGGAG+GGG + Chr6:105939938-105939957 None:intergenic 50.0%
TGCAATGTGGGAACTGACCT+AGG - Chr6:105940936-105940955 MsG0680035450.01.T01:intron 50.0%
TGTCCCTCTAGCATTCGACA+TGG + Chr6:105939666-105939685 None:intergenic 50.0%
TTGATCTCTTGCCTCACGGT+GGG - Chr6:105941080-105941099 MsG0680035450.01.T01:intron 50.0%
! GGCCTTCTGAAAGCCTGATA+CGG - Chr6:105938997-105939016 MsG0680035450.01.T01:CDS 50.0%
!!! CTGGAACACGTTTTGGGACT+TGG - Chr6:105942080-105942099 MsG0680035450.01.T01:intron 50.0%
!!! GGAACACGTTTTGGGACTTG+GGG - Chr6:105942082-105942101 MsG0680035450.01.T01:intron 50.0%
AGGCCTTGCAAAGCCTAGCT+CGG + Chr6:105938940-105938959 None:intergenic 55.0%
CATAAGTAGCACCCACCGTG+AGG + Chr6:105941094-105941113 None:intergenic 55.0%
CCCCGTGAGCTTATCTCAGT+TGG + Chr6:105940234-105940253 None:intergenic 55.0%
CCTAGGGATGGGAATAGACC+AGG + Chr6:105939492-105939511 None:intergenic 55.0%
CCTGGTCTATTCCCATCCCT+AGG - Chr6:105939489-105939508 MsG0680035450.01.T01:intron 55.0%
GAGCACCATGGGGTTCCAAA+TGG + Chr6:105941049-105941068 None:intergenic 55.0%
GGCCGTATCAGGCTTTCAGA+AGG + Chr6:105939002-105939021 None:intergenic 55.0%
! CTTGGTGGGTGACCTGATAG+CGG + Chr6:105940806-105940825 None:intergenic 55.0%
!! CTCACGGTGGGTGCTACTTA+TGG - Chr6:105941092-105941111 MsG0680035450.01.T01:intron 55.0%
!! GAGGCTTTTTGAGAGGCCTG+TGG - Chr6:105939356-105939375 MsG0680035450.01.T01:intron 55.0%
AATAGACCAGGCCGGCCTAC+AGG + Chr6:105939480-105939499 None:intergenic 60.0%
ACAGGCTAGCAGGCCGTATC+AGG + Chr6:105939013-105939032 None:intergenic 60.0%
ACAGGGCGTGCTGTCTGAAC+AGG + Chr6:105942267-105942286 None:intergenic 60.0%
AGGCCGAGCTAGGCTTTGCA+AGG - Chr6:105938934-105938953 MsG0680035450.01.T01:CDS 60.0%
ATAGACCAGGCCGGCCTACA+GGG + Chr6:105939479-105939498 None:intergenic 60.0%
GCTCGTGTTCAGAAGCGAGC+CGG - Chr6:105942229-105942248 MsG0680035450.01.T01:intron 60.0%
GGAATAGGCTAGGCCGAGCT+AGG - Chr6:105938924-105938943 MsG0680035450.01.T01:CDS 60.0%
GGCTTTGCAAGGCCTAAGCC+TGG - Chr6:105938945-105938964 MsG0680035450.01.T01:CDS 60.0%
GGGATGGGAATAGACCAGGC+CGG + Chr6:105939488-105939507 None:intergenic 60.0%
TAGACCAGGCCGGCCTACAG+GGG + Chr6:105939478-105939497 None:intergenic 65.0%
CCTACGGCCTAGCGTGCGAC+AGG + Chr6:105939455-105939474 None:intergenic 70.0%
CCTGTCGCACGCTAGGCCGT+AGG - Chr6:105939452-105939471 MsG0680035450.01.T01:intron 70.0%
GCTAGGCCGTAGGCCCCTGT+AGG - Chr6:105939462-105939481 MsG0680035450.01.T01:intron 70.0%
GGCCTAGCGTGCGACAGGTC+AGG + Chr6:105939450-105939469 None:intergenic 70.0%
GGCCTGACCTGTCGCACGCT+AGG - Chr6:105939445-105939464 MsG0680035450.01.T01:intron 70.0%
GGCCGGCCTACAGGGGCCTA+CGG + Chr6:105939471-105939490 None:intergenic 75.0%
GGCCGTAGGCCCCTGTAGGC+CGG - Chr6:105939466-105939485 MsG0680035450.01.T01:intron 75.0%
TAGGCCCCTGTAGGCCGGCC+TGG - Chr6:105939471-105939490 MsG0680035450.01.T01:intron 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 105938585 105943663 105938585 ID=MsG0680035450.01;Name=MsG0680035450.01
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Gene Sequence

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Protein sequence

>MsG0680035450.01.T01

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