AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039730.01

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MsG0780039730.01.T04 AT1G74630 23.140 242 176 4 63 300 70 305 1.77e-13 72.0
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MsG0780039730.01.T04 AT4G30700 24.916 297 202 8 53 339 262 547 2.73e-20 92.8
MsG0780039730.01.T04 AT4G30700 22.054 331 211 6 53 342 160 484 1.51e-18 87.8
MsG0780039730.01.T04 AT3G13770 38.291 316 174 6 53 355 194 501 1.48e-71 234
MsG0780039730.01.T04 AT3G13770 34.234 222 140 3 57 274 97 316 3.50e-33 130
MsG0780039730.01.T04 AT3G13770 35.172 145 82 4 38 176 281 419 4.13e-16 80.1
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MsG0780039730.01.T04 AT3G28660 25.175 143 106 1 53 194 260 402 1.26e-11 66.2
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MsG0780039730.01.T04 AT1G15510 30.303 231 148 4 51 273 133 358 6.85e-27 112
MsG0780039730.01.T04 AT1G15510 26.087 276 166 7 5 276 321 562 4.30e-16 80.1
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MsG0780039730.01.T04 AT5G55740 23.720 371 233 6 13 335 236 604 3.65e-25 107
MsG0780039730.01.T04 AT5G55740 25.000 328 191 7 57 338 117 435 5.01e-21 95.1
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MsG0780039730.01.T04 AT4G08210 27.206 272 178 9 15 274 141 404 2.82e-20 92.8
MsG0780039730.01.T04 AT4G08210 22.222 333 181 7 5 296 29 324 7.50e-19 88.6
MsG0780039730.01.T04 AT1G64310 32.899 307 198 4 53 353 248 552 4.35e-54 187
MsG0780039730.01.T04 AT1G64310 26.033 242 163 5 39 274 139 370 1.43e-19 90.5
MsG0780039730.01.T04 AT1G64310 24.231 260 150 7 57 276 50 302 4.55e-11 64.7
MsG0780039730.01.T04 AT3G26630 34.409 279 169 5 8 277 146 419 9.76e-54 184
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MsG0780039730.01.T04 AT5G52850 26.991 226 158 5 51 272 62 284 1.99e-22 99.4
MsG0780039730.01.T04 AT5G52850 23.951 405 235 14 3 350 212 600 4.13e-17 83.2
MsG0780039730.01.T04 AT5G52850 24.567 289 197 8 57 335 169 446 3.05e-16 80.9
MsG0780039730.01.T04 AT5G03800 28.763 299 203 4 66 355 471 768 4.26e-38 145
MsG0780039730.01.T04 AT5G03800 25.112 223 160 4 22 238 86 307 9.20e-20 91.3
MsG0780039730.01.T04 AT5G03800 22.321 336 246 8 8 335 312 640 9.73e-20 91.3
MsG0780039730.01.T04 AT3G26540 26.974 304 205 7 13 305 394 691 1.27e-35 137
MsG0780039730.01.T04 AT3G26540 30.924 249 157 5 15 251 297 542 4.61e-29 119
MsG0780039730.01.T04 AT3G26540 30.702 228 144 5 51 270 100 321 6.49e-25 106
MsG0780039730.01.T04 AT3G26540 23.311 296 157 7 7 266 188 449 9.96e-13 69.7
MsG0780039730.01.T04 AT5G08490 31.405 242 155 5 8 243 459 695 1.56e-35 137
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MsG0780039730.01.T04 AT5G08490 25.000 176 132 0 51 226 267 442 3.20e-15 77.4
MsG0780039730.01.T04 AT5G08490 23.551 276 196 8 8 270 13 286 1.09e-11 66.6
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MsG0780039730.01.T01 AT1G05750 38.056 360 214 5 2 354 94 451 1.72e-86 270
MsG0780039730.01.T01 AT1G05750 25.000 240 142 6 71 273 29 267 1.02e-17 84.7
MsG0780039730.01.T01 AT3G15930 38.841 345 198 4 20 356 275 614 2.89e-86 275
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MsG0780039730.01.T01 AT4G18840 40.237 338 196 2 14 346 204 540 1.03e-85 269
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MsG0780039730.01.T01 AT3G02010 22.917 240 152 2 5 243 476 683 1.29e-12 69.7
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MsG0780039730.01.T01 AT5G40410 28.659 164 108 4 121 275 34 197 2.57e-15 77.8
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MsG0780039730.01.T01 AT5G19020 30.055 366 209 10 17 340 209 569 3.25e-39 147
MsG0780039730.01.T01 AT5G19020 33.955 268 130 5 5 267 65 290 2.39e-36 139
MsG0780039730.01.T01 AT1G14470 38.780 410 177 10 1 340 121 526 2.93e-78 250
MsG0780039730.01.T01 AT1G14470 41.767 249 128 5 17 257 300 539 4.32e-64 213
MsG0780039730.01.T01 AT1G14470 26.442 208 142 3 66 273 59 255 1.09e-18 87.8
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MsG0780039730.01.T01 AT4G37170 31.900 279 173 4 6 274 110 381 6.25e-45 164
MsG0780039730.01.T01 AT5G52630 40.523 306 176 3 53 354 157 460 1.56e-72 236
MsG0780039730.01.T01 AT5G52630 26.733 303 208 7 51 345 54 350 6.43e-26 109
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MsG0780039730.01.T01 AT5G09950 39.815 324 183 7 38 352 538 858 1.11e-67 229
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MsG0780039730.01.T01 AT1G15510 30.435 230 153 5 51 276 336 562 1.33e-22 99.8
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MsG0780039730.01.T01 AT5G65570 31.163 215 142 5 51 261 205 417 7.83e-29 118
MsG0780039730.01.T01 AT5G65570 24.710 259 147 5 53 271 105 355 7.10e-22 97.4
MsG0780039730.01.T01 AT1G71420 36.735 294 174 6 67 354 324 611 4.78e-56 195
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MsG0780039730.01.T09 AT1G15510 39.227 181 106 1 3 179 560 740 1.11e-47 166
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MsG0780039730.01.T09 AT2G37310 39.779 181 104 2 4 179 430 610 2.95e-47 163
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MsG0780039730.01.T09 AT1G53600 40.659 182 103 1 1 177 499 680 3.61e-47 164
MsG0780039730.01.T09 AT3G16610 41.530 183 100 2 1 177 470 651 6.82e-47 162
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MsG0780039730.01.T09 AT3G22150 32.258 93 59 2 3 91 483 575 1.13e-11 62.8
MsG0780039730.01.T09 AT4G37380 41.622 185 100 3 2 179 321 504 1.98e-43 152
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MsG0780039730.01.T09 AT1G62260 38.333 180 106 1 3 177 472 651 2.73e-43 152
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MsG0780039730.01.T09 AT5G19020 28.161 174 109 6 4 165 400 569 1.18e-11 62.8
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MsG0780039730.01.T09 AT2G36980 42.021 188 100 3 1 179 398 585 3.36e-43 152
MsG0780039730.01.T09 AT5G59600 41.530 183 102 1 2 179 350 532 4.05e-43 150
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MsG0780039730.01.T09 AT3G13770 40.000 180 82 2 1 180 315 468 1.17e-42 150
MsG0780039730.01.T09 AT3G13770 32.039 103 66 1 1 99 214 316 2.36e-13 67.8
MsG0780039730.01.T09 AT3G13770 22.222 216 124 4 1 177 113 323 7.77e-12 63.5
MsG0780039730.01.T09 AT3G28660 38.624 189 106 3 1 179 280 468 1.48e-42 149
MsG0780039730.01.T09 AT3G28660 31.068 103 66 1 1 98 178 280 4.08e-12 63.9
MsG0780039730.01.T09 AT3G18840 41.436 181 100 2 3 177 456 636 1.54e-42 150
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MsG0780039730.01.T09 AT1G29710 28.058 139 95 1 1 134 180 318 1.28e-19 85.5
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MsG0780039730.01.T09 AT2G15690 27.143 140 97 1 1 135 297 436 2.90e-17 79.0
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MsG0780039730.01.T06 AT4G18840 31.043 393 226 8 52 439 122 474 4.37e-50 178
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MsG0780039730.01.T06 AT1G31430 26.841 421 258 9 54 432 30 442 2.58e-36 140
MsG0780039730.01.T06 AT1G31430 28.033 239 135 6 197 435 10 211 1.22e-17 85.9
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MsG0780039730.01.T06 AT1G74630 23.419 427 244 12 9 357 127 548 6.18e-20 93.2
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MsG0780039730.01.T06 AT1G53600 25.714 385 239 8 57 435 261 604 8.22e-30 122
MsG0780039730.01.T06 AT1G53600 25.407 307 213 6 131 436 49 340 3.70e-25 108
MsG0780039730.01.T06 AT3G26540 27.520 367 223 7 102 432 97 456 8.35e-40 152
MsG0780039730.01.T06 AT3G26540 28.716 296 170 6 142 437 308 562 8.32e-31 125
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MsG0780039730.01.T06 AT3G02010 25.397 252 166 7 23 260 404 647 1.62e-15 79.7
MsG0780039730.01.T06 AT3G02010 27.979 193 116 8 257 436 32 214 2.15e-14 75.9
MsG0780039730.01.T06 AT1G15510 26.442 416 214 9 57 425 182 552 9.89e-34 134
MsG0780039730.01.T06 AT1G15510 28.485 330 188 7 115 436 73 362 8.82e-29 120
MsG0780039730.01.T06 AT1G15510 22.841 359 253 9 90 438 321 665 8.10e-23 102
MsG0780039730.01.T06 AT1G15510 23.684 304 197 11 90 383 522 800 4.23e-13 72.0
MsG0780039730.01.T06 AT4G20770 26.385 379 206 5 84 425 333 675 1.29e-33 134
MsG0780039730.01.T06 AT4G20770 27.714 350 194 6 93 430 276 578 4.60e-32 129
MsG0780039730.01.T06 AT4G20770 24.745 392 230 11 92 433 32 408 6.77e-25 108
MsG0780039730.01.T06 AT4G20770 24.925 333 198 9 50 337 396 721 1.21e-22 101
MsG0780039730.01.T06 AT4G20770 29.670 182 123 3 252 432 23 200 7.74e-21 95.9
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MsG0780039730.01.T06 AT4G18520 24.930 357 244 8 41 384 255 600 2.74e-27 115
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MsG0780039730.01.T06 AT4G18520 26.408 284 171 6 153 435 102 348 1.45e-22 100
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MsG0780039730.01.T06 AT1G68930 26.525 377 200 9 98 438 176 511 1.76e-30 125
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MsG0780039730.01.T06 AT1G68930 25.357 280 171 5 90 334 268 544 4.14e-24 105
MsG0780039730.01.T06 AT1G68930 22.525 404 204 9 102 436 47 410 3.56e-23 103
MsG0780039730.01.T06 AT1G68930 27.317 205 134 5 55 249 330 529 3.04e-15 78.6
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MsG0780039730.01.T06 AT3G57430 25.604 414 230 7 67 437 93 471 3.84e-25 109
MsG0780039730.01.T06 AT3G57430 26.296 270 147 7 92 313 431 696 7.72e-23 102
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MsG0780039730.01.T06 AT3G23330 29.134 254 135 5 183 432 83 295 1.41e-26 112
MsG0780039730.01.T06 AT3G23330 24.224 322 198 6 66 349 138 451 1.87e-21 97.4
MsG0780039730.01.T06 AT3G23330 26.389 216 140 5 57 260 221 429 5.77e-14 74.3
MsG0780039730.01.T06 AT3G51320 24.103 390 274 8 4 382 23 401 2.02e-30 123
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MsG0780039730.01.T06 AT2G36730 28.571 147 95 3 105 245 251 393 4.61e-11 65.1
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MsG0780039730.01.T06 AT3G56550 26.792 265 141 8 181 436 53 273 2.20e-21 97.4
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MsG0780039730.01.T06 AT1G13040 22.072 222 151 7 89 296 278 491 2.84e-11 65.9
MsG0780039730.01.T06 AT1G13040 23.715 253 169 9 135 372 223 466 3.07e-11 65.9
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MsG0780039730.01.T06 AT3G09060 21.633 245 180 6 203 439 83 323 3.24e-11 65.9
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MsG0780039730.01.T06 AT3G53170 23.636 330 225 13 57 364 116 440 2.97e-13 71.6
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MsG0780039730.01.T06 AT1G74750 21.575 292 209 7 55 330 343 630 7.22e-11 65.1
MsG0780039730.01.T06 AT1G74750 21.575 292 209 7 55 330 343 630 7.22e-11 65.1
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MsG0780039730.01.T03 AT4G02750 30.473 338 183 10 1 307 121 437 8.44e-34 132
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MsG0780039730.01.T03 AT2G44880 31.868 182 110 4 32 206 42 216 3.75e-19 89.4
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MsG0780039730.01.T03 AT5G37570 33.333 138 91 1 64 201 66 202 4.22e-20 92.0
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MsG0780039730.01.T03 AT1G06143 36.494 348 212 5 1 347 185 524 4.67e-72 234
MsG0780039730.01.T03 AT1G06143 27.041 196 122 7 38 231 60 236 1.13e-12 69.3
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MsG0780039730.01.T03 AT2G33680 29.201 363 189 12 45 356 221 566 4.81e-29 119
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MsG0780039730.01.T03 AT2G33680 34.367 387 216 5 3 354 348 731 1.63e-62 213
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MsG0780039730.01.T03 AT1G06140 23.962 313 223 10 41 345 39 344 6.86e-17 82.4
MsG0780039730.01.T03 AT5G43790 37.540 309 182 5 47 351 156 457 4.42e-62 206
MsG0780039730.01.T03 AT5G43790 31.579 152 102 2 40 190 250 400 4.24e-15 76.6
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MsG0780039730.01.T03 AT1G16480 29.747 316 169 9 1 274 103 407 1.27e-26 111
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MsG0780039730.01.T03 AT5G47460 27.273 242 137 9 74 298 23 242 1.68e-16 81.3
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MsG0780039730.01.T03 AT2G17210 30.837 227 138 7 51 270 92 306 1.34e-21 96.7
MsG0780039730.01.T03 AT2G17210 25.214 234 169 3 40 273 282 509 3.39e-21 95.5
MsG0780039730.01.T03 AT3G50420 31.250 320 190 6 39 357 435 725 1.01e-40 152
MsG0780039730.01.T03 AT3G50420 27.922 308 204 6 47 346 138 435 3.52e-31 125
MsG0780039730.01.T03 AT3G50420 31.148 183 120 3 40 220 233 411 1.77e-23 102
MsG0780039730.01.T03 AT3G50420 25.074 339 193 7 3 290 262 590 6.21e-23 100
MsG0780039730.01.T03 AT3G50420 23.457 243 160 6 47 273 28 260 2.30e-15 77.8
MsG0780039730.01.T03 AT5G52850 30.240 334 206 8 30 354 457 772 9.00e-38 144
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MsG0780039730.01.T03 AT5G18475 23.980 196 130 6 9 189 271 462 3.22e-11 65.1
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MsG0780039730.01.T08 AT1G56570 34.940 83 54 0 1 83 51 133 4.36e-12 64.7
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MsG0780039730.01.T08 AT1G62680 28.671 143 91 3 1 132 336 478 1.03e-11 63.5
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MsG0780039730.01.T08 AT1G62670 23.415 205 144 4 1 194 227 429 1.64e-11 63.2
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MsG0780039730.01.T08 AT1G63080 29.167 144 91 3 1 133 421 564 8.97e-12 63.9
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MsG0780039730.01.T05 AT3G13770 27.165 254 145 5 14 233 76 323 1.19e-20 90.9
MsG0780039730.01.T05 AT3G14330 44.144 222 119 3 14 233 361 579 5.19e-59 198
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MsG0780039730.01.T05 AT1G56690 42.731 227 119 4 14 235 355 575 1.68e-58 197
MsG0780039730.01.T05 AT1G56690 28.571 196 120 6 28 220 82 260 7.37e-14 70.9
MsG0780039730.01.T05 AT3G46790 41.991 231 121 4 11 235 306 529 7.14e-57 191
MsG0780039730.01.T05 AT3G46790 27.953 254 145 6 14 230 206 458 4.72e-23 97.8
MsG0780039730.01.T05 AT5G59200 41.204 216 116 3 25 235 290 499 1.04e-56 189
MsG0780039730.01.T05 AT5G59200 26.592 267 127 7 14 213 147 411 4.64e-15 74.3
MsG0780039730.01.T05 AT3G24000 42.035 226 121 3 14 235 286 505 2.31e-56 190
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MsG0780039730.01.T05 AT3G05240 37.838 222 128 2 14 230 341 557 2.57e-51 175
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MsG0780039730.01.T05 AT5G43790 40.179 224 123 3 14 232 240 457 3.13e-51 173
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MsG0780039730.01.T05 AT1G56570 36.726 226 130 5 15 233 338 557 7.51e-45 159
MsG0780039730.01.T05 AT1G56570 26.241 141 101 3 14 154 237 374 3.07e-12 66.2
MsG0780039730.01.T05 AT1G56570 31.356 118 79 2 2 119 23 138 3.22e-12 65.9
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MsG0780039730.01.T05 AT2G33680 27.041 196 121 7 29 209 53 241 3.13e-13 68.9
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MsG0780039730.01.T05 AT1G04840 24.891 229 134 7 28 220 230 456 8.09e-16 76.6
MsG0780039730.01.T05 AT3G47530 33.803 213 129 3 29 235 256 462 5.45e-37 137
MsG0780039730.01.T05 AT3G47530 30.612 98 66 1 16 111 139 236 1.33e-11 64.3
MsG0780039730.01.T05 AT3G21470 33.333 222 132 5 20 232 304 518 6.45e-37 136
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MsG0780039730.01.T05 AT3G21470 29.787 141 88 3 17 155 73 204 1.60e-14 72.8
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MsG0780039730.01.T05 AT1G22830 33.761 234 142 5 12 238 445 672 7.75e-37 137
MsG0780039730.01.T05 AT1G31430 36.364 220 126 4 24 235 313 526 9.92e-37 136
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MsG0780039730.01.T05 AT1G31430 28.125 160 109 3 16 171 204 361 4.48e-12 65.5
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MsG0780039730.01.T05 AT1G29710 28.395 162 115 1 29 190 158 318 1.67e-18 84.3
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MsG0780039730.01.T05 AT3G26630 23.529 238 116 4 17 189 146 382 1.50e-12 67.0
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MsG0780039730.01.T05 AT5G08490 32.979 94 57 2 31 124 608 695 4.90e-11 62.4
MsG0780039730.01.T05 AT5G08490 35.354 99 63 1 14 111 251 349 2.83e-16 78.2
MsG0780039730.01.T05 AT5G08490 32.979 94 57 2 31 124 608 695 4.90e-11 62.4
MsG0780039730.01.T05 AT1G71460 30.496 141 87 3 15 150 544 678 7.80e-16 76.6
MsG0780039730.01.T05 AT1G71460 27.397 146 95 4 14 154 340 479 2.14e-13 69.7
MsG0780039730.01.T05 AT1G71460 32.653 98 66 0 14 111 238 335 2.59e-12 66.2
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MsG0780039730.01.T02 AT4G18840 39.233 339 199 3 14 347 204 540 2.81e-80 255
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MsG0780039730.01.T02 AT1G74630 23.140 242 176 4 64 301 70 305 1.98e-13 72.0
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MsG0780039730.01.T02 AT3G24000 31.076 251 166 4 47 293 94 341 8.59e-34 132
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MsG0780039730.01.T02 AT4G19191 24.859 177 128 3 7 179 348 523 8.57e-13 70.1
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MsG0780039730.01.T02 AT2G37310 23.166 259 184 6 52 297 61 317 1.27e-14 75.5
MsG0780039730.01.T02 AT2G37310 26.606 218 146 5 5 214 390 601 3.14e-12 68.2
MsG0780039730.01.T02 AT4G30700 37.821 312 181 4 52 355 358 664 1.47e-72 240
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MsG0780039730.01.T02 AT2G17210 28.378 222 142 8 58 270 92 305 7.68e-14 73.2
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MsG0780039730.01.T02 AT3G20730 31.694 183 121 3 45 226 45 224 3.25e-22 98.2
MsG0780039730.01.T02 AT3G20730 26.190 126 89 1 146 267 43 168 4.92e-11 64.3
MsG0780039730.01.T02 AT3G50420 30.189 318 190 5 46 358 435 725 2.18e-42 157
MsG0780039730.01.T02 AT3G50420 25.667 300 215 4 54 347 138 435 2.93e-28 116
MsG0780039730.01.T02 AT3G50420 27.757 263 148 6 47 271 233 491 2.37e-21 95.9
MsG0780039730.01.T02 AT5G47460 28.011 357 243 8 7 353 214 566 9.42e-42 154
MsG0780039730.01.T02 AT5G47460 25.651 269 160 4 22 287 61 292 2.29e-22 99.0
MsG0780039730.01.T02 AT5G47460 23.478 230 155 6 81 299 23 242 4.57e-12 67.8
MsG0780039730.01.T02 AT3G61170 30.032 313 167 5 54 356 370 640 1.70e-41 155
MsG0780039730.01.T02 AT3G61170 29.104 268 172 6 20 277 32 291 9.98e-33 129
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MsG0780039730.01.T02 AT1G13040 26.744 172 114 4 79 243 325 491 4.56e-11 64.3
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MsG0780039730.01.T02 AT3G54980 21.756 262 186 7 19 265 587 844 1.80e-14 75.1
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MsG0780039730.01.T07 AT3G09040 25.600 250 148 6 4 216 720 968 4.22e-17 81.6
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MsG0780039730.01.T07 AT3G09040 26.966 267 162 7 23 274 470 718 3.79e-25 105
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MsG0780039730.01.T07 AT1G74630 32.046 259 167 6 9 265 190 441 5.38e-39 144
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MsG0780039730.01.T07 AT3G16610 34.595 185 111 4 51 230 45 224 2.73e-25 105
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MsG0780039730.01.T07 AT5G13270 27.523 218 110 7 9 184 354 565 2.26e-16 79.3
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MsG0780039730.01.T07 AT4G21300 27.244 312 171 7 9 276 207 506 4.48e-29 116
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MsG0780039730.01.T07 AT5G27270 22.260 292 202 9 5 281 187 468 5.23e-11 63.5

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sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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GAGAACTAGGTTTGGGTAAT+TGG 0.180635 7:-68200466 MsG0780039730.01.T04:intron
GCCCGATACATCTTTCTATT+TGG 0.182788 7:-68201416 MsG0780039730.01.T06:CDS
GATCCCCATGCAGGAATTTA+TGG 0.183401 7:-68200030 MsG0780039730.01.T04:CDS
CACATCCGGATTAGCATTTC+AGG 0.213040 7:-68200419 MsG0780039730.01.T04:intron
ACTCTCTTGTTTCCATTTCT+TGG 0.213763 7:+68200333 None:intergenic
ACAATGTTTGTATTGTTTAA+TGG 0.225737 7:+68201707 None:intergenic
TCCTATAACACATTGATTTC+CGG 0.231046 7:-68200309 MsG0780039730.01.T04:CDS
GCTGTCTTGACAAAATAATT+TGG 0.265314 7:+68200818 None:intergenic
CCCTGATAGCATTGCATTCC+AGG 0.265935 7:+68201021 None:intergenic
TTCAATGACATGCTTAGATT+TGG 0.280126 7:-68200959 MsG0780039730.01.T04:CDS
ACTTGGACCACCATGATTAC+TGG 0.299110 7:-68201115 MsG0780039730.01.T04:intron
GGAAAGATGGCGACAAAGTT+AGG 0.299722 7:-68199870 MsG0780039730.01.T04:CDS
TCCTGGAATGCAATGCTATC+AGG 0.303261 7:-68201022 MsG0780039730.01.T04:CDS
CCCGGAAATCAATGTGTTAT+AGG 0.303365 7:+68200308 None:intergenic
GAAGCACCACCCAATGGTTT+TGG 0.303690 7:+68201615 None:intergenic
AACAATCTTATAGTTTCTTC+TGG 0.313981 7:+68200980 None:intergenic
CCTATAACACATTGATTTCC+GGG 0.330411 7:-68200308 MsG0780039730.01.T04:CDS
ATATCTTCTTGTTCATCTCT+TGG 0.332878 7:-68200899 MsG0780039730.01.T04:CDS
AAGGTTGAGCCACATAATTC+TGG 0.335160 7:-68199937 MsG0780039730.01.T04:CDS
TCTTGCTCATGTATTGAAAT+CGG 0.336070 7:-68201356 MsG0780039730.01.T04:CDS
ATGCAGTCATGCAGGATTAT+TGG 0.336414 7:-68200181 MsG0780039730.01.T04:CDS
GATTGGAATGTGATGATATC+TGG 0.360856 7:-68201220 MsG0780039730.01.T04:intron
CAATCTGCAACGGCTCTATC+AGG 0.361362 7:+68201238 None:intergenic
TTTATGCTTCGGCTGGTAGA+TGG 0.363490 7:-68199891 MsG0780039730.01.T04:CDS
TAGGGATACAATGAGAAAAC+AGG 0.367065 7:-68199851 MsG0780039730.01.T04:CDS
TGCATTAATATTCCAAGAAA+TGG 0.382123 7:-68200345 MsG0780039730.01.T04:intron
ATGATCATGATCATTATGTT+TGG 0.388441 7:-68201330 MsG0780039730.01.T04:CDS
CTGTCTTGACAAAATAATTT+GGG 0.392856 7:+68200819 None:intergenic
TGCTGCAGCTAAACTGTTCA+AGG 0.394159 7:-68199956 MsG0780039730.01.T04:CDS
AGAACTAGGTTTGGGTAATT+GGG 0.398631 7:-68200465 MsG0780039730.01.T04:intron
ATTGCCGGTTATACTCAAAA+TGG 0.400517 7:-68200596 MsG0780039730.01.T04:intron
GCTCTCTAACATTTATGCTT+CGG 0.402596 7:-68199902 MsG0780039730.01.T04:CDS
CTTGCTCATGTATTGAAATC+GGG 0.414977 7:-68201355 MsG0780039730.01.T04:CDS
GTTACCCATGTTGTTTCGTC+AGG 0.418729 7:+68200926 None:intergenic
CAGGGAGTGAAGAAAATAAC+TGG 0.422920 7:-68199832 MsG0780039730.01.T04:CDS
CACCTTGGAGAACTAGGTTT+GGG 0.424363 7:-68200473 MsG0780039730.01.T04:intron
ATGTGATGATATCTGGATAC+TGG 0.430165 7:-68201213 MsG0780039730.01.T04:intron
TGCTTGTATGATTGATATGT+TGG 0.431132 7:-68200106 MsG0780039730.01.T04:CDS
TTTGGTGGTGCAGGGAGTGG+TGG 0.434436 7:+68201633 None:intergenic
GATTACTGGGTATGCAAAGA+TGG 0.437819 7:-68201101 MsG0780039730.01.T04:intron
TGTGGACACCTTGGAGAACT+AGG 0.439103 7:-68200479 MsG0780039730.01.T04:intron
CTCACCATAGCCACCTCATC+TGG 0.446019 7:+68200515 None:intergenic
AATTGGGTGTGTGTAAGTAT+AGG 0.454383 7:-68200736 MsG0780039730.01.T04:intron
CCCTGCACCACCAAAACCAT+TGG 0.458452 7:-68201625 MsG0780039730.01.T06:CDS
TATGTAGGAATGTTATTACT+TGG 0.462348 7:-68201132 MsG0780039730.01.T04:intron
CAGAAAGAAGTGTGGTATCC+TGG 0.462894 7:-68201039 MsG0780039730.01.T04:CDS
TTCATAAACAAGTGGAACTC+GGG 0.464146 7:-68199984 MsG0780039730.01.T04:CDS
TTTCCATGTGATGGGTGAGC+AGG 0.466620 7:-68201158 MsG0780039730.01.T04:intron
TCATGGAATTCGATGATTGC+CGG 0.467055 7:-68200611 MsG0780039730.01.T04:intron
CTGATAGAGCCGTTGCAGAT+TGG 0.470016 7:-68201237 MsG0780039730.01.T04:CDS
GTTGGGTCGAGCTGGTAGAT+TGG 0.475631 7:-68200088 MsG0780039730.01.T04:CDS
GCAATATAAGTTATGCGGTC+TGG 0.477121 7:+68200216 None:intergenic
TGTATCCTGAAATGCTAATC+CGG 0.479112 7:+68200414 None:intergenic
CAAGGCGATCAAGCTGTTTG+AGG 0.481403 7:-68200564 MsG0780039730.01.T04:intron
ACACCTTGGAGAACTAGGTT+TGG 0.484290 7:-68200474 MsG0780039730.01.T04:intron
GCTTGTATGATTGATATGTT+GGG 0.484767 7:-68200105 MsG0780039730.01.T04:CDS
AGCCAAATAGAAAGATGTAT+CGG 0.487392 7:+68201414 None:intergenic
TCCTCAAAGAAAATCACATC+CGG 0.490081 7:-68200433 MsG0780039730.01.T04:intron
TTGTCTCAGACGATGGAGAT+TGG 0.490095 7:+68201673 None:intergenic
CTTGGACCACCATGATTACT+GGG 0.491011 7:-68201114 MsG0780039730.01.T04:intron
CCCATGTTGTTTCGTCAGGT+TGG 0.491101 7:+68200930 None:intergenic
ATGCCCATGCTCTGCAAACC+CGG 0.492197 7:+68200290 None:intergenic
GAGGGTGCAAGGAGTGCATT+GGG 0.492907 7:+68201586 None:intergenic
TCAAAATGGCGAGTCATTCA+AGG 0.493336 7:-68200582 MsG0780039730.01.T04:intron
CAAGCATAGTGGTCTACATC+AGG 0.498502 7:+68200123 None:intergenic
TGCAAGGAGTGCATTGGGTA+AGG 0.501415 7:+68201591 None:intergenic
ATTTCTGCATATGCAAGAGC+AGG 0.503937 7:-68200689 MsG0780039730.01.T04:intron
ATTCCTGCATGGGGATCCAT+TGG 0.504721 7:+68200036 None:intergenic
TTGGCTATGATGAAATCTGC+TGG 0.509590 7:-68201397 MsG0780039730.01.T06:CDS
TCTAACATTTATGCTTCGGC+TGG 0.511251 7:-68199898 MsG0780039730.01.T04:CDS
CATGATCATTATGTTTGGAA+TGG 0.517582 7:-68201325 MsG0780039730.01.T04:CDS
CTTTGCATACCCAGTAATCA+TGG 0.521468 7:+68201105 None:intergenic
GCCAAATAGAAAGATGTATC+GGG 0.522164 7:+68201415 None:intergenic
AAGCTCGATAGGTCCGTACT+TGG 0.523763 7:+68201285 None:intergenic
GAAAGATGGCGACAAAGTTA+GGG 0.524508 7:-68199869 MsG0780039730.01.T04:CDS
TGAGGGTGCAAGGAGTGCAT+TGG 0.524881 7:+68201585 None:intergenic
ACGGACCTATCGAGCTTGCT+AGG 0.528287 7:-68201279 MsG0780039730.01.T04:CDS
ATTACTGGGTATGCAAAGAT+GGG 0.528752 7:-68201100 MsG0780039730.01.T04:intron
ATTTCCGGGTTTGCAGAGCA+TGG 0.529477 7:-68200294 MsG0780039730.01.T04:CDS
TTTCCGGGTTTGCAGAGCAT+GGG 0.530985 7:-68200293 MsG0780039730.01.T04:CDS
ACGTAATTTCCAGAATTATG+TGG 0.532767 7:+68199928 None:intergenic
GGGTTTGCAGAGCATGGGCA+TGG 0.535259 7:-68200288 MsG0780039730.01.T04:CDS
AAAACCAGATGAGGTGGCTA+TGG 0.535473 7:-68200519 MsG0780039730.01.T04:intron
CATGGAGTTGTCTCAGACGA+TGG 0.535647 7:+68201666 None:intergenic
GCAGAAATCATGGCATTCCA+TGG 0.540687 7:+68200704 None:intergenic
CTAACTGCATGCAGTCATGC+AGG 0.541676 7:-68200189 MsG0780039730.01.T04:CDS
CCTGGAATGCAATGCTATCA+GGG 0.542295 7:-68201021 MsG0780039730.01.T04:CDS
CCTGCACCACCAAAACCATT+GGG 0.544799 7:-68201624 MsG0780039730.01.T06:CDS
TCTTGCATATGCAGAAATCA+TGG 0.546459 7:+68200694 None:intergenic
AGTATAGGAGTTCTGTTCCA+TGG 0.547288 7:-68200721 MsG0780039730.01.T04:intron
ATTTACATGTACTCAAGATG+TGG 0.547465 7:-68200383 MsG0780039730.01.T04:intron
TGCTATCAGGGTATGCTCAA+GGG 0.548190 7:-68201009 MsG0780039730.01.T04:CDS
AGAAAATAACTGGCTTGAGC+TGG 0.549951 7:-68199822 MsG0780039730.01.T04:CDS
TATCTGGATACTGGAAATGC+GGG 0.551679 7:-68201204 MsG0780039730.01.T04:intron
ATTCATAAACAAGTGGAACT+CGG 0.554917 7:-68199985 MsG0780039730.01.T04:CDS
TGCAGAGCATGGGCATGGAA+TGG 0.556678 7:-68200283 MsG0780039730.01.T04:CDS
ATTGATTCAAAGCATACCAA+TGG 0.558071 7:-68200052 MsG0780039730.01.T04:CDS
AAATAACTGGCTTGAGCTGG+TGG 0.558438 7:-68199819 MsG0780039730.01.T04:CDS
ATGCTATCAGGGTATGCTCA+AGG 0.559533 7:-68201010 MsG0780039730.01.T04:CDS
ATACCAATGGATCCCCATGC+AGG 0.561666 7:-68200039 MsG0780039730.01.T04:CDS
AGATCCATAAATTCCTGCAT+GGG 0.563944 7:+68200026 None:intergenic
CTGCCTGCTCACCCATCACA+TGG 0.564940 7:+68201155 None:intergenic
GAGATCCATAAATTCCTGCA+TGG 0.566317 7:+68200025 None:intergenic
TCCAACCTGACGAAACAACA+TGG 0.566640 7:-68200931 MsG0780039730.01.T04:CDS
AAATCTTGAGTGCTGCCTCA+AGG 0.573173 7:+68200765 None:intergenic
AGTTTCCTAGCAAGCTCGAT+AGG 0.573506 7:+68201274 None:intergenic
TTGGGCATATATGCCAAGTA+CGG 0.575037 7:-68201298 MsG0780039730.01.T04:CDS
CATGCAGGATTATTGGAAGA+AGG 0.577698 7:-68200174 MsG0780039730.01.T04:CDS
GCTATCAGGGTATGCTCAAG+GGG 0.578174 7:-68201008 MsG0780039730.01.T04:CDS
CTTGATATGCATGCGAAATG+TGG 0.585440 7:-68200791 MsG0780039730.01.T04:CDS
TCGGCTGGTAGATGGAAAGA+TGG 0.585465 7:-68199883 MsG0780039730.01.T04:CDS
ATTGATATGTTGGGTCGAGC+TGG 0.586109 7:-68200096 MsG0780039730.01.T04:CDS
CTGGAAATGCGGGAATGAAG+AGG 0.590033 7:-68201194 MsG0780039730.01.T04:intron
TTTACATGTACTCAAGATGT+GGG 0.591710 7:-68200382 MsG0780039730.01.T04:intron
CAGAAAGCTAGACGACAGAG+TGG 0.594242 7:-68200849 MsG0780039730.01.T04:CDS
AGTGGTGGACCAACTGTGCA+TGG 0.606538 7:+68201648 None:intergenic
TTGATATGCATGCGAAATGT+GGG 0.607997 7:-68200790 MsG0780039730.01.T04:CDS
ATATCTGGATACTGGAAATG+CGG 0.609710 7:-68201205 MsG0780039730.01.T04:intron
TGAAGATTCAAAACCAGATG+AGG 0.612897 7:-68200528 MsG0780039730.01.T04:intron
TGGGTGAGCAGGCAGTATGT+AGG 0.619514 7:-68201147 MsG0780039730.01.T04:intron
GCACCACCAAAACCATTGGG+TGG 0.625705 7:-68201621 MsG0780039730.01.T06:CDS
CACAGCGAGATACTGTCTCA+TGG 0.626960 7:-68200628 MsG0780039730.01.T04:intron
GATCCATAAATTCCTGCATG+GGG 0.631220 7:+68200027 None:intergenic
CATCACATTCCAATCTGCAA+CGG 0.631968 7:+68201228 None:intergenic
TCTTGACAAAATAATTTGGG+CGG 0.635619 7:+68200822 None:intergenic
AGATTCAAAACCAGATGAGG+TGG 0.635678 7:-68200525 MsG0780039730.01.T04:intron
TTTCTGCATATGCAAGAGCA+GGG 0.635904 7:-68200688 MsG0780039730.01.T04:intron
TGGGGAATTTGAAGACCGCA+AGG 0.635982 7:-68201081 MsG0780039730.01.T04:CDS
TACTAGCATTCATAAACAAG+TGG 0.636014 7:-68199992 MsG0780039730.01.T04:CDS
TTCTGCATATGCAAGAGCAG+GGG 0.639093 7:-68200687 MsG0780039730.01.T04:intron
TATCAATCATACAAGCATAG+TGG 0.639567 7:+68200112 None:intergenic
TACCCAAACCTAGTTCTCCA+AGG 0.640418 7:+68200471 None:intergenic
TAAGGAGAAGCACCACCCAA+TGG 0.641040 7:+68201609 None:intergenic
AATAACTGGCTTGAGCTGGT+GGG 0.646437 7:-68199818 MsG0780039730.01.T04:CDS
GAGACAACTCCATGCACAGT+TGG 0.648518 7:-68201657 MsG0780039730.01.T06:CDS
ACTAGGTTTGGGTAATTGGG+CGG 0.652415 7:-68200462 MsG0780039730.01.T04:intron
AGGGATACAATGAGAAAACA+GGG 0.660978 7:-68199850 MsG0780039730.01.T04:CDS
TCATAAACAAGTGGAACTCG+GGG 0.662325 7:-68199983 MsG0780039730.01.T04:CDS
ACAATCGACACTGAAAGACA+AGG 0.666560 7:+68200872 None:intergenic
CCAACCTGACGAAACAACAT+GGG 0.674246 7:-68200930 MsG0780039730.01.T04:CDS
GCTGTGGCATCTTATCAAAG+AGG 0.675353 7:+68200645 None:intergenic
CAAAATGCCAGAAAGAAGTG+TGG 0.676476 7:-68201047 MsG0780039730.01.T04:CDS
CAATCGACACTGAAAGACAA+GGG 0.679895 7:+68200873 None:intergenic
GTATAGCAATATAAGTTATG+CGG 0.681912 7:+68200211 None:intergenic
TTACTGGGTATGCAAAGATG+GGG 0.697935 7:-68201099 MsG0780039730.01.T04:intron
AGAAAGCTAGACGACAGAGT+GGG 0.702973 7:-68200848 MsG0780039730.01.T04:CDS
CATGAGACAGTATCTCGCTG+TGG 0.718326 7:+68200629 None:intergenic
TGCATACCCAGTAATCATGG+TGG 0.721201 7:+68201108 None:intergenic
TGCGAAATGTGGGAACCTTG+AGG 0.728181 7:-68200780 MsG0780039730.01.T04:CDS
TTTGTCAAAATACATCCTTG+CGG 0.737033 7:+68201066 None:intergenic
CTATCAGGGTATGCTCAAGG+GGG 0.764505 7:-68201007 MsG0780039730.01.T04:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ACAATGTTTGTATTGTTTAA+TGG + Chr7:68199813-68199832 None:intergenic 20.0%
!! CTCAAATATTATTCTCAAAT+TGG - Chr7:68200018-68200037 MsG0780039730.01.T04:CDS 20.0%
! AACAATCTTATAGTTTCTTC+TGG + Chr7:68200540-68200559 None:intergenic 25.0%
! ATGATCATGATCATTATGTT+TGG - Chr7:68200187-68200206 MsG0780039730.01.T04:CDS 25.0%
! CTGTCTTGACAAAATAATTT+GGG + Chr7:68200701-68200720 None:intergenic 25.0%
! GTATAGCAATATAAGTTATG+CGG + Chr7:68201309-68201328 None:intergenic 25.0%
! TATGTAGGAATGTTATTACT+TGG - Chr7:68200385-68200404 MsG0780039730.01.T04:intron 25.0%
! TGCATTAATATTCCAAGAAA+TGG - Chr7:68201172-68201191 MsG0780039730.01.T04:intron 25.0%
! TTGTCAAAAATGAAAGAAGA+CGG - Chr7:68201271-68201290 MsG0780039730.01.T04:CDS 25.0%
!!! TATGTTTGGAATGGAATTTT+GGG - Chr7:68200201-68200220 MsG0780039730.01.T04:CDS 25.0%
!!! TTATGTTTGGAATGGAATTT+TGG - Chr7:68200200-68200219 MsG0780039730.01.T04:CDS 25.0%
ACGTAATTTCCAGAATTATG+TGG + Chr7:68201592-68201611 None:intergenic 30.0%
AGAATAATATTTGAGCATGC+AGG + Chr7:68200013-68200032 None:intergenic 30.0%
AGCCAAATAGAAAGATGTAT+CGG + Chr7:68200106-68200125 None:intergenic 30.0%
ATATCTTCTTGTTCATCTCT+TGG - Chr7:68200618-68200637 MsG0780039730.01.T04:intron 30.0%
ATTCATAAACAAGTGGAACT+CGG - Chr7:68201532-68201551 MsG0780039730.01.T06:intron 30.0%
ATTTACATGTACTCAAGATG+TGG - Chr7:68201134-68201153 MsG0780039730.01.T04:intron 30.0%
CATGATCATTATGTTTGGAA+TGG - Chr7:68200192-68200211 MsG0780039730.01.T04:CDS 30.0%
GCTGTCTTGACAAAATAATT+TGG + Chr7:68200702-68200721 None:intergenic 30.0%
GCTTGTATGATTGATATGTT+GGG - Chr7:68201412-68201431 MsG0780039730.01.T06:CDS 30.0%
TACTAGCATTCATAAACAAG+TGG - Chr7:68201525-68201544 MsG0780039730.01.T06:intron 30.0%
TATCAATCATACAAGCATAG+TGG + Chr7:68201408-68201427 None:intergenic 30.0%
TCTTGACAAAATAATTTGGG+CGG + Chr7:68200698-68200717 None:intergenic 30.0%
TCTTGCTCATGTATTGAAAT+CGG - Chr7:68200161-68200180 MsG0780039730.01.T04:CDS 30.0%
TGCTTGTATGATTGATATGT+TGG - Chr7:68201411-68201430 MsG0780039730.01.T06:CDS 30.0%
TTCAATGACATGCTTAGATT+TGG - Chr7:68200558-68200577 MsG0780039730.01.T04:intron 30.0%
TTTACATGTACTCAAGATGT+GGG - Chr7:68201135-68201154 MsG0780039730.01.T04:intron 30.0%
TTTGTCAAAATACATCCTTG+CGG + Chr7:68200454-68200473 None:intergenic 30.0%
! ATTGATTCAAAGCATACCAA+TGG - Chr7:68201465-68201484 MsG0780039730.01.T06:CDS 30.0%
!! ACTCAAGATTTTTGAGCAAT+TGG - Chr7:68200764-68200783 MsG0780039730.01.T04:CDS 30.0%
!! CTCAAGATTTTTGAGCAATT+GGG - Chr7:68200765-68200784 MsG0780039730.01.T04:CDS 30.0%
!! TCCTATAACACATTGATTTC+CGG - Chr7:68201208-68201227 MsG0780039730.01.T04:intron 30.0%
AATTGGGTGTGTGTAAGTAT+AGG - Chr7:68200781-68200800 MsG0780039730.01.T04:CDS 35.0%
AGAACTAGGTTTGGGTAATT+GGG - Chr7:68201052-68201071 MsG0780039730.01.T04:CDS 35.0%
AGATCCATAAATTCCTGCAT+GGG + Chr7:68201494-68201513 None:intergenic 35.0%
AGGGATACAATGAGAAAACA+GGG - Chr7:68201667-68201686 MsG0780039730.01.T06:CDS 35.0%
ATATCTGGATACTGGAAATG+CGG - Chr7:68200312-68200331 MsG0780039730.01.T04:CDS 35.0%
ATGTGATGATATCTGGATAC+TGG - Chr7:68200304-68200323 MsG0780039730.01.T04:CDS 35.0%
ATTACTGGGTATGCAAAGAT+GGG - Chr7:68200417-68200436 MsG0780039730.01.T04:intron 35.0%
CTTGCTCATGTATTGAAATC+GGG - Chr7:68200162-68200181 MsG0780039730.01.T04:CDS 35.0%
GATTGGAATGTGATGATATC+TGG - Chr7:68200297-68200316 MsG0780039730.01.T04:CDS 35.0%
GCCAAATAGAAAGATGTATC+GGG + Chr7:68200105-68200124 None:intergenic 35.0%
GCTCTCTAACATTTATGCTT+CGG - Chr7:68201615-68201634 MsG0780039730.01.T06:CDS 35.0%
TAGGGATACAATGAGAAAAC+AGG - Chr7:68201666-68201685 MsG0780039730.01.T06:CDS 35.0%
TCCTCAAAGAAAATCACATC+CGG - Chr7:68201084-68201103 MsG0780039730.01.T04:CDS 35.0%
TCTTGCATATGCAGAAATCA+TGG + Chr7:68200826-68200845 None:intergenic 35.0%
TGAAGATTCAAAACCAGATG+AGG - Chr7:68200989-68201008 MsG0780039730.01.T04:CDS 35.0%
TGTATCCTGAAATGCTAATC+CGG + Chr7:68201106-68201125 None:intergenic 35.0%
TTCATAAACAAGTGGAACTC+GGG - Chr7:68201533-68201552 MsG0780039730.01.T06:intron 35.0%
TTGATATGCATGCGAAATGT+GGG - Chr7:68200727-68200746 MsG0780039730.01.T04:intron 35.0%
! AAGTAAGCTTTTCCATGTGA+TGG - Chr7:68200350-68200369 MsG0780039730.01.T04:intron 35.0%
! ACTCTCTTGTTTCCATTTCT+TGG + Chr7:68201187-68201206 None:intergenic 35.0%
! AGTAAGCTTTTCCATGTGAT+GGG - Chr7:68200351-68200370 MsG0780039730.01.T04:intron 35.0%
! ATTGCCGGTTATACTCAAAA+TGG - Chr7:68200921-68200940 MsG0780039730.01.T04:CDS 35.0%
!! CCTATAACACATTGATTTCC+GGG - Chr7:68201209-68201228 MsG0780039730.01.T04:intron 35.0%
AAGGTTGAGCCACATAATTC+TGG - Chr7:68201580-68201599 MsG0780039730.01.T06:intron 40.0%
ACAATCGACACTGAAAGACA+AGG + Chr7:68200648-68200667 None:intergenic 40.0%
AGATTCAAAACCAGATGAGG+TGG - Chr7:68200992-68201011 MsG0780039730.01.T04:CDS 40.0%
AGTATAGGAGTTCTGTTCCA+TGG - Chr7:68200796-68200815 MsG0780039730.01.T04:CDS 40.0%
ATGCAGTCATGCAGGATTAT+TGG - Chr7:68201336-68201355 MsG0780039730.01.T04:CDS 40.0%
ATTTCTGCATATGCAAGAGC+AGG - Chr7:68200828-68200847 MsG0780039730.01.T04:CDS 40.0%
CAAAATGCCAGAAAGAAGTG+TGG - Chr7:68200470-68200489 MsG0780039730.01.T04:intron 40.0%
CAATCGACACTGAAAGACAA+GGG + Chr7:68200647-68200666 None:intergenic 40.0%
CAGGGAGTGAAGAAAATAAC+TGG - Chr7:68201685-68201704 MsG0780039730.01.T06:CDS 40.0%
CATCACATTCCAATCTGCAA+CGG + Chr7:68200292-68200311 None:intergenic 40.0%
CATGCAGGATTATTGGAAGA+AGG - Chr7:68201343-68201362 MsG0780039730.01.T04:CDS 40.0%
CCCGGAAATCAATGTGTTAT+AGG + Chr7:68201212-68201231 None:intergenic 40.0%
CTTGATATGCATGCGAAATG+TGG - Chr7:68200726-68200745 MsG0780039730.01.T04:intron 40.0%
CTTTGCATACCCAGTAATCA+TGG + Chr7:68200415-68200434 None:intergenic 40.0%
GAAAGATGGCGACAAAGTTA+GGG - Chr7:68201648-68201667 MsG0780039730.01.T06:CDS 40.0%
GAGAACTAGGTTTGGGTAAT+TGG - Chr7:68201051-68201070 MsG0780039730.01.T04:CDS 40.0%
GAGATCCATAAATTCCTGCA+TGG + Chr7:68201495-68201514 None:intergenic 40.0%
GATCCATAAATTCCTGCATG+GGG + Chr7:68201493-68201512 None:intergenic 40.0%
GATTACTGGGTATGCAAAGA+TGG - Chr7:68200416-68200435 MsG0780039730.01.T04:intron 40.0%
GCAATATAAGTTATGCGGTC+TGG + Chr7:68201304-68201323 None:intergenic 40.0%
GCCCGATACATCTTTCTATT+TGG - Chr7:68200101-68200120 MsG0780039730.01.T04:CDS 40.0%
GTGTTGCAGCATGAAAAATG+TGG + Chr7:68199969-68199988 None:intergenic 40.0%
TATCTGGATACTGGAAATGC+GGG - Chr7:68200313-68200332 MsG0780039730.01.T04:CDS 40.0%
TCAAAATGGCGAGTCATTCA+AGG - Chr7:68200935-68200954 MsG0780039730.01.T04:CDS 40.0%
TCATAAACAAGTGGAACTCG+GGG - Chr7:68201534-68201553 MsG0780039730.01.T06:intron 40.0%
TCATGGAATTCGATGATTGC+CGG - Chr7:68200906-68200925 MsG0780039730.01.T04:CDS 40.0%
TCTAACATTTATGCTTCGGC+TGG - Chr7:68201619-68201638 MsG0780039730.01.T06:CDS 40.0%
TTACTGGGTATGCAAAGATG+GGG - Chr7:68200418-68200437 MsG0780039730.01.T04:intron 40.0%
TTGGCTATGATGAAATCTGC+TGG - Chr7:68200120-68200139 MsG0780039730.01.T04:CDS 40.0%
TTGGGCATATATGCCAAGTA+CGG - Chr7:68200219-68200238 MsG0780039730.01.T04:CDS 40.0%
TTTCTGCATATGCAAGAGCA+GGG - Chr7:68200829-68200848 MsG0780039730.01.T04:CDS 40.0%
! TCCGGATGTGATTTTCTTTG+AGG + Chr7:68201088-68201107 None:intergenic 40.0%
!! AGAAAATAACTGGCTTGAGC+TGG - Chr7:68201695-68201714 MsG0780039730.01.T06:CDS 40.0%
!! CTCGCCATTTTGAGTATAAC+CGG + Chr7:68200928-68200947 None:intergenic 40.0%
AAAACCAGATGAGGTGGCTA+TGG - Chr7:68200998-68201017 MsG0780039730.01.T04:CDS 45.0%
ACACCTTGGAGAACTAGGTT+TGG - Chr7:68201043-68201062 MsG0780039730.01.T04:CDS 45.0%
ACTAGGTTTGGGTAATTGGG+CGG - Chr7:68201055-68201074 MsG0780039730.01.T04:CDS 45.0%
ACTTGGACCACCATGATTAC+TGG - Chr7:68200402-68200421 MsG0780039730.01.T04:intron 45.0%
AGAAAGCTAGACGACAGAGT+GGG - Chr7:68200669-68200688 MsG0780039730.01.T04:intron 45.0%
AGGTGAAGACACGTACATCA+GGG + Chr7:68199993-68200012 None:intergenic 45.0%
AGTTTCCTAGCAAGCTCGAT+AGG + Chr7:68200246-68200265 None:intergenic 45.0%
ATGCTATCAGGGTATGCTCA+AGG - Chr7:68200507-68200526 MsG0780039730.01.T04:intron 45.0%
ATTGATATGTTGGGTCGAGC+TGG - Chr7:68201421-68201440 MsG0780039730.01.T06:CDS 45.0%
CAAGCATAGTGGTCTACATC+AGG + Chr7:68201397-68201416 None:intergenic 45.0%
CACCTTGGAGAACTAGGTTT+GGG - Chr7:68201044-68201063 MsG0780039730.01.T04:CDS 45.0%
CAGGATACCACACTTCTTTC+TGG + Chr7:68200480-68200499 None:intergenic 45.0%
CCAACCTGACGAAACAACAT+GGG - Chr7:68200587-68200606 MsG0780039730.01.T04:intron 45.0%
CCTGGAATGCAATGCTATCA+GGG - Chr7:68200496-68200515 MsG0780039730.01.T04:intron 45.0%
CTTGGACCACCATGATTACT+GGG - Chr7:68200403-68200422 MsG0780039730.01.T04:intron 45.0%
GATCCCCATGCAGGAATTTA+TGG - Chr7:68201487-68201506 MsG0780039730.01.T06:intron 45.0%
GCAGAAATCATGGCATTCCA+TGG + Chr7:68200816-68200835 None:intergenic 45.0%
GCTGTGGCATCTTATCAAAG+AGG + Chr7:68200875-68200894 None:intergenic 45.0%
GGAAAGATGGCGACAAAGTT+AGG - Chr7:68201647-68201666 MsG0780039730.01.T06:CDS 45.0%
TCCAACCTGACGAAACAACA+TGG - Chr7:68200586-68200605 MsG0780039730.01.T04:intron 45.0%
TCCTGGAATGCAATGCTATC+AGG - Chr7:68200495-68200514 MsG0780039730.01.T04:intron 45.0%
TGCAGCATGAAAAATGTGGC+AGG + Chr7:68199965-68199984 None:intergenic 45.0%
TGCATACCCAGTAATCATGG+TGG + Chr7:68200412-68200431 None:intergenic 45.0%
TGCTATCAGGGTATGCTCAA+GGG - Chr7:68200508-68200527 MsG0780039730.01.T04:intron 45.0%
TGCTGCAGCTAAACTGTTCA+AGG - Chr7:68201561-68201580 MsG0780039730.01.T06:intron 45.0%
TTCTGCATATGCAAGAGCAG+GGG - Chr7:68200830-68200849 MsG0780039730.01.T04:CDS 45.0%
TTGTCTCAGACGATGGAGAT+TGG + Chr7:68199847-68199866 None:intergenic 45.0%
TTTATGCTTCGGCTGGTAGA+TGG - Chr7:68201626-68201645 MsG0780039730.01.T06:CDS 45.0%
! AAATCTTGAGTGCTGCCTCA+AGG + Chr7:68200755-68200774 None:intergenic 45.0%
! CAGAAAGAAGTGTGGTATCC+TGG - Chr7:68200478-68200497 MsG0780039730.01.T04:intron 45.0%
! GTGAGTGTCTTTTCTGCTTG+TGG - Chr7:68201020-68201039 MsG0780039730.01.T04:CDS 45.0%
! TACCCAAACCTAGTTCTCCA+AGG + Chr7:68201049-68201068 None:intergenic 45.0%
! TTTTCTGCTTGTGGACACCT+TGG - Chr7:68201029-68201048 MsG0780039730.01.T04:CDS 45.0%
!! AAATAACTGGCTTGAGCTGG+TGG - Chr7:68201698-68201717 MsG0780039730.01.T06:CDS 45.0%
!! AATAACTGGCTTGAGCTGGT+GGG - Chr7:68201699-68201718 MsG0780039730.01.T06:CDS 45.0%
!! CACATCCGGATTAGCATTTC+AGG - Chr7:68201098-68201117 MsG0780039730.01.T04:intron 45.0%
!! GTTACCCATGTTGTTTCGTC+AGG + Chr7:68200594-68200613 None:intergenic 45.0%
AAGCTCGATAGGTCCGTACT+TGG + Chr7:68200235-68200254 None:intergenic 50.0%
AATGTGGCAGGTGTAGCTTG+AGG + Chr7:68199953-68199972 None:intergenic 50.0%
ATACCAATGGATCCCCATGC+AGG - Chr7:68201478-68201497 MsG0780039730.01.T06:CDS 50.0%
ATGTGGCAGGTGTAGCTTGA+GGG + Chr7:68199952-68199971 None:intergenic 50.0%
ATTCCTGCATGGGGATCCAT+TGG + Chr7:68201484-68201503 None:intergenic 50.0%
ATTTCCGGGTTTGCAGAGCA+TGG - Chr7:68201223-68201242 MsG0780039730.01.T04:CDS 50.0%
CAAGGCGATCAAGCTGTTTG+AGG - Chr7:68200953-68200972 MsG0780039730.01.T04:CDS 50.0%
CAATCTGCAACGGCTCTATC+AGG + Chr7:68200282-68200301 None:intergenic 50.0%
CACAGCGAGATACTGTCTCA+TGG - Chr7:68200889-68200908 MsG0780039730.01.T04:CDS 50.0%
CAGAAAGCTAGACGACAGAG+TGG - Chr7:68200668-68200687 MsG0780039730.01.T04:intron 50.0%
CAGGTGAAGACACGTACATC+AGG + Chr7:68199994-68200013 None:intergenic 50.0%
CATGAGACAGTATCTCGCTG+TGG + Chr7:68200891-68200910 None:intergenic 50.0%
CATGGAGTTGTCTCAGACGA+TGG + Chr7:68199854-68199873 None:intergenic 50.0%
CCCTGATAGCATTGCATTCC+AGG + Chr7:68200499-68200518 None:intergenic 50.0%
CCTGCACCACCAAAACCATT+GGG - Chr7:68199893-68199912 MsG0780039730.01.T04:CDS 50.0%
CTAACTGCATGCAGTCATGC+AGG - Chr7:68201328-68201347 MsG0780039730.01.T04:CDS 50.0%
CTATCAGGGTATGCTCAAGG+GGG - Chr7:68200510-68200529 MsG0780039730.01.T04:intron 50.0%
CTGATAGAGCCGTTGCAGAT+TGG - Chr7:68200280-68200299 MsG0780039730.01.T04:CDS 50.0%
CTGGAAATGCGGGAATGAAG+AGG - Chr7:68200323-68200342 MsG0780039730.01.T04:CDS 50.0%
GAGACAACTCCATGCACAGT+TGG - Chr7:68199860-68199879 MsG0780039730.01.T04:CDS 50.0%
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!! TAAGGAGAAGCACCACCCAA+TGG + Chr7:68199911-68199930 None:intergenic 50.0%
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Protein sequence

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