AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780040556.01

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MsG0780040556.01.T01 AT2G22330 30.939 362 230 7 17 367 200 552 1.19e-52 184
MsG0780040556.01.T01 AT5G09970 35.740 277 161 6 69 339 239 504 4.24e-52 182
MsG0780040556.01.T01 AT1G11610 31.594 345 219 8 4 344 136 467 6.17e-52 181
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MsG0780040556.01.T01 AT3G48290 29.558 362 206 10 38 367 168 512 1.08e-49 175
MsG0780040556.01.T01 AT2G30490 31.847 314 204 4 45 355 180 486 4.09e-49 173
MsG0780040556.01.T01 AT5G05260 29.517 393 244 10 2 374 145 524 2.11e-48 172
MsG0780040556.01.T01 AT4G39950 29.101 378 248 7 1 367 159 527 6.65e-48 171
MsG0780040556.01.T01 AT3G44250 29.708 377 240 10 3 367 130 493 7.09e-48 169
MsG0780040556.01.T01 AT4G39950 29.101 378 248 7 1 367 199 567 9.70e-48 171
MsG0780040556.01.T01 AT5G24960 32.132 333 196 10 50 370 182 496 2.79e-46 165
MsG0780040556.01.T01 AT1G16410 27.949 390 256 10 2 374 149 530 1.20e-45 164
MsG0780040556.01.T01 AT1G64930 37.447 235 140 6 141 371 277 508 2.84e-45 163
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MsG0780040556.01.T01 AT3G25180 29.615 260 171 7 3 257 143 395 1.78e-24 103
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MsG0780040556.01.T01 AT5G38970 24.255 235 161 4 117 348 227 447 1.72e-15 78.2
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MsG0780040556.01.T01 AT1G13150 23.611 360 226 11 32 359 171 513 1.15e-14 75.9
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MsG0780040556.01.T01 AT2G29090 25.843 178 121 2 170 343 288 458 1.29e-14 75.5
MsG0780040556.01.T01 AT5G45340 26.214 206 138 4 146 347 248 443 1.68e-14 75.1
MsG0780040556.01.T01 AT4G19230 23.887 247 161 6 102 345 218 440 1.96e-14 75.1
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MsG0780040556.01.T01 AT4G19230 24.242 264 166 8 102 362 218 450 6.99e-14 73.2
MsG0780040556.01.T01 AT4G20235 32.374 139 79 4 206 342 206 331 9.80e-14 72.0
MsG0780040556.01.T01 AT1G05160 26.087 230 144 6 142 363 268 479 1.26e-13 72.4
MsG0780040556.01.T01 AT1G05160 26.087 230 144 6 142 363 268 479 1.26e-13 72.4
MsG0780040556.01.T01 AT3G13730 28.108 185 118 5 142 322 275 448 4.75e-13 70.5
MsG0780040556.01.T01 AT3G44970 23.162 272 188 7 76 341 195 451 9.05e-13 69.7
MsG0780040556.01.T01 AT4G36380 23.451 226 165 3 118 339 265 486 1.62e-12 69.3
MsG0780040556.01.T01 AT5G36110 23.288 219 150 5 127 340 243 448 1.69e-12 68.9
MsG0780040556.01.T01 AT2G46960 25.253 198 145 2 143 339 176 371 2.30e-12 68.2
MsG0780040556.01.T01 AT1G67110 25.620 242 167 5 103 341 252 483 2.88e-12 68.6
MsG0780040556.01.T01 AT2G46960 25.253 198 145 2 143 339 292 487 3.21e-12 68.2
MsG0780040556.01.T01 AT4G15396 23.615 343 218 15 11 342 138 447 4.61e-12 67.8
MsG0780040556.01.T01 AT4G15396 23.824 319 206 13 11 321 138 427 8.29e-12 67.0
MsG0780040556.01.T01 AT1G55940 22.041 245 172 6 110 348 243 474 1.40e-11 66.2
MsG0780040556.01.T01 AT4G15300 21.951 328 215 12 29 348 148 442 1.66e-11 65.9
MsG0780040556.01.T01 AT1G55940 23.077 234 161 6 110 337 243 463 1.67e-11 65.9
MsG0780040556.01.T01 AT4G15300 21.951 328 215 12 29 348 158 452 1.68e-11 65.9
MsG0780040556.01.T01 AT4G15310 24.638 207 141 8 141 341 251 448 1.85e-11 65.9
MsG0780040556.01.T01 AT2G28860 23.509 285 190 11 98 368 223 493 2.29e-11 65.5
MsG0780040556.01.T01 AT3G50660 25.258 194 130 3 161 341 296 487 4.30e-11 64.7
MsG0780040556.01.T01 AT2G28850 22.835 254 177 8 127 368 247 493 5.31e-11 64.3
MsG0780040556.01.T01 AT5G05690 27.206 136 95 2 164 296 266 400 9.43e-11 63.5

Find 102 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 134 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GATGATTCTCTAACAATTAA+TGG 0.156359 7:-79161474 None:intergenic
GCAAAGGGTTACGGGAAATT+AGG 0.159026 7:+79160514 MsG0780040556.01.T01:CDS
AGTGGATTATCCCAATAATT+AGG 0.179564 7:-79161576 None:intergenic
TGAGTCAACTTCTTCCTTTA+AGG 0.185299 7:+79160235 MsG0780040556.01.T01:CDS
TTGGAAGGGACCCTAATTAT+TGG 0.235807 7:+79161565 MsG0780040556.01.T01:CDS
ACTTCACTAATAAACCTTTC+TGG 0.253089 7:-79161609 None:intergenic
CACAATTGTTTGTTAATATA+TGG 0.255349 7:+79161538 MsG0780040556.01.T01:CDS
GTTGTCTCTTGTCTCCTTAA+AGG 0.266538 7:-79160249 None:intergenic
CTCTGCCAATGCCCATTCTA+TGG 0.285857 7:-79161301 None:intergenic
CTCTGAAATCAAATTGAAAA+TGG 0.286199 7:+79160674 MsG0780040556.01.T01:CDS
TGGTAATGGGATTGTTAATA+TGG 0.297174 7:+79161779 MsG0780040556.01.T01:CDS
ACAAACAATTGTGTCTTTGC+TGG 0.317451 7:-79161528 None:intergenic
CAAAGGGTTACGGGAAATTA+GGG 0.320842 7:+79160515 MsG0780040556.01.T01:CDS
TTTGTTAATATATGGTCTAT+TGG 0.328761 7:+79161546 MsG0780040556.01.T01:CDS
GGGATAATCCACTTGAGTTT+AGG 0.348848 7:+79161586 MsG0780040556.01.T01:CDS
AGGGGTTTAGCAAAGGGTTA+CGG 0.359856 7:+79160505 MsG0780040556.01.T01:CDS
GAAAGGTTTATTAGTGAAGT+TGG 0.362569 7:+79161612 MsG0780040556.01.T01:CDS
GGGGTTTAGCAAAGGGTTAC+GGG 0.362732 7:+79160506 MsG0780040556.01.T01:CDS
TGGAAGGGACCCTAATTATT+GGG 0.367791 7:+79161566 MsG0780040556.01.T01:CDS
CAAGACACTGTACATCTTAC+GGG 0.384867 7:+79160432 MsG0780040556.01.T01:CDS
CTTGCTCTTTCCATCATATG+TGG 0.387829 7:-79161336 None:intergenic
GGCACAGGGACACAAATTAA+AGG 0.391065 7:-79161837 None:intergenic
GTGGATTATCCCAATAATTA+GGG 0.399936 7:-79161575 None:intergenic
ATATGCATGTCTGAACTTCT+TGG 0.403066 7:+79160201 None:intergenic
TTTCTTTGACTATTGCTTGA+AGG 0.407124 7:-79161428 None:intergenic
AAGGAAGTTGGTGGAGGAGA+AGG 0.409706 7:+79160600 MsG0780040556.01.T01:CDS
TGGCAGGACATATTTGTTGC+TGG 0.413198 7:+79161258 MsG0780040556.01.T01:intron
TGGAGGAGAAGGTCAAATTA+AGG 0.414043 7:+79160611 MsG0780040556.01.T01:CDS
TTGCTGGAATCTCATAGCCT+TGG 0.415183 7:-79161512 None:intergenic
TGGAAGGTTAAAGGTGGTAA+TGG 0.425929 7:+79161765 MsG0780040556.01.T01:CDS
TTGACTATTGCTTGAAGGTA+AGG 0.429932 7:-79161423 None:intergenic
CATGATCAAAATCACATAGA+AGG 0.432019 7:-79161876 None:intergenic
GAAAATGAGGTTATTGATGT+TGG 0.435903 7:+79160306 MsG0780040556.01.T01:CDS
CACTTGAGTTTAGGCCAGAA+AGG 0.449835 7:+79161595 MsG0780040556.01.T01:CDS
GCAAGACACTGTACATCTTA+CGG 0.452689 7:+79160431 MsG0780040556.01.T01:CDS
GGAAGGTTAAAGGTGGTAAT+GGG 0.454202 7:+79161766 MsG0780040556.01.T01:CDS
TAATTTGTGTCCCTGTGCCT+AGG 0.456059 7:+79161841 MsG0780040556.01.T01:CDS
AATTAACAACCCACATATGA+TGG 0.457581 7:+79161326 MsG0780040556.01.T01:CDS
AGCATGCCCTGGAACCTCTC+TGG 0.458444 7:+79161692 MsG0780040556.01.T01:CDS
AACCTGGGTTAACCCTTTCA+AGG 0.460812 7:+79161808 MsG0780040556.01.T01:CDS
TGCAAAGCCAGAGAGGTTCC+AGG 0.462227 7:-79161699 None:intergenic
AGTTGGAAATTTAGATGTGA+GGG 0.465652 7:+79161629 MsG0780040556.01.T01:CDS
GTTAATATGGAAGAGAAACC+TGG 0.469257 7:+79161792 MsG0780040556.01.T01:CDS
TCAAGGAGCATCAAGAAGTA+AGG 0.480001 7:+79160568 MsG0780040556.01.T01:CDS
GCTCTTCTTCCACTCCCAAA+TGG 0.482207 7:-79161672 None:intergenic
ATGTCCAGGGGTTTAGCAAA+GGG 0.486437 7:+79160499 MsG0780040556.01.T01:CDS
TTAATATATGGTCTATTGGA+AGG 0.486694 7:+79161550 MsG0780040556.01.T01:CDS
GAAGGAAAAGGATTAATCCT+AGG 0.489442 7:-79161858 None:intergenic
CTTCAGCATTAACCATAGAA+TGG 0.490240 7:+79161289 MsG0780040556.01.T01:CDS
CAAAATCACATAGAAGGAAA+AGG 0.490402 7:-79161870 None:intergenic
AGGAAGAGAAAGGAAGTTGG+TGG 0.490818 7:+79160591 MsG0780040556.01.T01:CDS
AGGAGGAAGAGAAAGGAAGT+TGG 0.494328 7:+79160588 MsG0780040556.01.T01:CDS
TTGCTCTTTCCATCATATGT+GGG 0.496379 7:-79161335 None:intergenic
AGAAGTAAGGAGGAAGAGAA+AGG 0.497705 7:+79160581 MsG0780040556.01.T01:CDS
GAACATAAAAGCCTTCATCT+TGG 0.497903 7:+79160698 MsG0780040556.01.T01:CDS
TTCAGCATTAACCATAGAAT+GGG 0.504880 7:+79161290 MsG0780040556.01.T01:CDS
CACTTGATTCCATTTGGGAG+TGG 0.504998 7:+79161663 MsG0780040556.01.T01:CDS
AAGAGAAAGGAAGTTGGTGG+AGG 0.505167 7:+79160594 MsG0780040556.01.T01:CDS
CTTGATAATCCTCTCCATCA+TGG 0.506816 7:-79160550 None:intergenic
TGTCGAATAACGTTATTTCG+AGG 0.510767 7:+79160346 MsG0780040556.01.T01:CDS
TTAAAGGACGAGCCCTTGAA+AGG 0.511881 7:-79161821 None:intergenic
CTTGTCACTTACCAAGATGA+AGG 0.514713 7:-79160709 None:intergenic
CTAACAATTAATGGACCTGT+AGG 0.517849 7:-79161465 None:intergenic
CTATTGCTTGAAGGTAAGGA+AGG 0.525432 7:-79161419 None:intergenic
AAAGGATTAATCCTAGGCAC+AGG 0.527826 7:-79161852 None:intergenic
GTAACCCTTTGCTAAACCCC+TGG 0.529089 7:-79160503 None:intergenic
AAGTTGGAAATTTAGATGTG+AGG 0.534724 7:+79161628 MsG0780040556.01.T01:CDS
GATGTCCAGGGGTTTAGCAA+AGG 0.542497 7:+79160498 MsG0780040556.01.T01:CDS
GGACAGGTTTGATTCCATGA+TGG 0.543662 7:+79160536 MsG0780040556.01.T01:CDS
CAAGAGATTAATGATGTGGT+TGG 0.553935 7:+79161360 MsG0780040556.01.T01:CDS
TTTAAGAACTGGGATGTCCA+GGG 0.555012 7:+79160486 MsG0780040556.01.T01:CDS
CTTTCTGGCCTAAACTCAAG+TGG 0.557468 7:-79161594 None:intergenic
TCTGAAAAGTGCACAATCCA+AGG 0.560268 7:+79161495 MsG0780040556.01.T01:CDS
TAAAGGACGAGCCCTTGAAA+GGG 0.562384 7:-79161820 None:intergenic
TAATATATGGTCTATTGGAA+GGG 0.567826 7:+79161551 MsG0780040556.01.T01:CDS
CATGATGGAGAGGATTATCA+AGG 0.568087 7:+79160551 MsG0780040556.01.T01:CDS
CAAGAAAGGGAAGGAAAATG+AGG 0.571567 7:+79160293 MsG0780040556.01.T01:CDS
GGTTTGATTCCATGATGGAG+AGG 0.580656 7:+79160541 MsG0780040556.01.T01:CDS
GGTTACGGGAAATTAGGGAC+AGG 0.582692 7:+79160520 MsG0780040556.01.T01:CDS
CAATAGTCAAAGAAACACTA+AGG 0.583056 7:+79161436 MsG0780040556.01.T01:CDS
ACACTAAGGATTCACCCTAC+AGG 0.590784 7:+79161450 MsG0780040556.01.T01:CDS
AGTGGAAGAAGAGCATGCCC+TGG 0.593817 7:+79161681 MsG0780040556.01.T01:CDS
AGGAGCATCAAGAAGTAAGG+AGG 0.596248 7:+79160571 MsG0780040556.01.T01:CDS
CAAACTTGTAGTGAAAATGA+TGG 0.602764 7:+79160381 MsG0780040556.01.T01:CDS
AAGACAAGAGATTAATGATG+TGG 0.602769 7:+79161356 MsG0780040556.01.T01:CDS
TAACAATTAATGGACCTGTA+GGG 0.603033 7:-79161464 None:intergenic
ACCTGGGTTAACCCTTTCAA+GGG 0.604916 7:+79161809 MsG0780040556.01.T01:CDS
TTTGAGTGGAAGGTTAAAGG+TGG 0.605311 7:+79161759 MsG0780040556.01.T01:CDS
TGCATGTCTGAACTTCTTGG+TGG 0.608480 7:+79160204 None:intergenic
ATTAACCATAGAATGGGCAT+TGG 0.611645 7:+79161296 MsG0780040556.01.T01:CDS
TAAGGAGACAAGAGACAACA+AGG 0.611689 7:+79160253 MsG0780040556.01.T01:CDS
AGCTGAAGAGGTGAGGAAGT+TGG 0.612302 7:+79160407 MsG0780040556.01.T01:CDS
GCCCTTGAAAGGGTTAACCC+AGG 0.613234 7:-79161810 None:intergenic
TTAAGAACTGGGATGTCCAG+GGG 0.616892 7:+79160487 MsG0780040556.01.T01:CDS
GCAAAGCCAGAGAGGTTCCA+GGG 0.618125 7:-79161698 None:intergenic
AAATGATGGTGAAGCTGAAG+AGG 0.624962 7:+79160395 MsG0780040556.01.T01:CDS
ATGGTGAAGCTGAAGAGGTG+AGG 0.625816 7:+79160400 MsG0780040556.01.T01:CDS
TTAATATGGAAGAGAAACCT+GGG 0.628993 7:+79161793 MsG0780040556.01.T01:CDS
CACAACATGCAAAGCCAGAG+AGG 0.646662 7:-79161706 None:intergenic
GTTGGAAATTTAGATGTGAG+GGG 0.647641 7:+79161630 MsG0780040556.01.T01:CDS
AAGGATTAATCCTAGGCACA+GGG 0.706548 7:-79161851 None:intergenic
AAGACACTGTACATCTTACG+GGG 0.709849 7:+79160433 MsG0780040556.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TTAATATTTCTGATTTTATT+TGG + Chr7:79160460-79160479 MsG0780040556.01.T01:CDS 10.0%
!! AAAGGAAAAAAAAAAACTTT+AGG + Chr7:79160962-79160981 MsG0780040556.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTTTTTTCCTTTTAAGTT+TGG - Chr7:79160956-79160975 None:intergenic 15.0%
!! AAACAATCTAAACTTAACTT+AGG + Chr7:79161044-79161063 MsG0780040556.01.T01:intron 20.0%
!! TAAAAGGAAAATGCAATATT+TGG - Chr7:79160918-79160937 None:intergenic 20.0%
!! TTTGTTAATATATGGTCTAT+TGG + Chr7:79161546-79161565 MsG0780040556.01.T01:CDS 20.0%
!!! CACAATTGTTTGTTAATATA+TGG + Chr7:79161538-79161557 MsG0780040556.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTTGGTTTTTTAAGAACT+GGG + Chr7:79160476-79160495 MsG0780040556.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTATTTGGTTTTTTAAGAAC+TGG + Chr7:79160475-79160494 MsG0780040556.01.T01:CDS 20.0%
! CAAGCATAAAAAGTTTAGAT+TGG - Chr7:79161163-79161182 None:intergenic 25.0%
! GATGATTCTCTAACAATTAA+TGG - Chr7:79161477-79161496 None:intergenic 25.0%
! TAATATATGGTCTATTGGAA+GGG + Chr7:79161551-79161570 MsG0780040556.01.T01:CDS 25.0%
! TTAATATATGGTCTATTGGA+AGG + Chr7:79161550-79161569 MsG0780040556.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTTCACTTGATTCCATTT+GGG + Chr7:79161658-79161677 MsG0780040556.01.T01:CDS 25.0%
!! GGATCTACTTGATATTTTAT+TGG + Chr7:79160632-79160651 MsG0780040556.01.T01:CDS 25.0%
!!! CTCTGAAATCAAATTGAAAA+TGG + Chr7:79160674-79160693 MsG0780040556.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTAGTTTTTTGCTCAAGAAA+GGG + Chr7:79160280-79160299 MsG0780040556.01.T01:CDS 25.0%
AACTTCTTATCTTGATCCAA+CGG + Chr7:79160844-79160863 MsG0780040556.01.T01:intron 30.0%
AAGACAAGAGATTAATGATG+TGG + Chr7:79161356-79161375 MsG0780040556.01.T01:CDS 30.0%
AAGTTGGAAATTTAGATGTG+AGG + Chr7:79161628-79161647 MsG0780040556.01.T01:CDS 30.0%
AATTAACAACCCACATATGA+TGG + Chr7:79161326-79161345 MsG0780040556.01.T01:CDS 30.0%
ACTTCACTAATAAACCTTTC+TGG - Chr7:79161612-79161631 None:intergenic 30.0%
AGTTGGAAATTTAGATGTGA+GGG + Chr7:79161629-79161648 MsG0780040556.01.T01:CDS 30.0%
ATGATATACCCTTTATGATC+TGG + Chr7:79161238-79161257 MsG0780040556.01.T01:intron 30.0%
CAAACTTGTAGTGAAAATGA+TGG + Chr7:79160381-79160400 MsG0780040556.01.T01:CDS 30.0%
CAATAGTCAAAGAAACACTA+AGG + Chr7:79161436-79161455 MsG0780040556.01.T01:CDS 30.0%
CTTAGGTACACATATTCTTT+AGG + Chr7:79161061-79161080 MsG0780040556.01.T01:intron 30.0%
GAAAATGAGGTTATTGATGT+TGG + Chr7:79160306-79160325 MsG0780040556.01.T01:CDS 30.0%
GAAAGGTTTATTAGTGAAGT+TGG + Chr7:79161612-79161631 MsG0780040556.01.T01:CDS 30.0%
GCATTGTAGAAGTGAATAAA+AGG - Chr7:79160934-79160953 None:intergenic 30.0%
TCTACAATGCCAAACTTAAA+AGG + Chr7:79160944-79160963 MsG0780040556.01.T01:intron 30.0%
TTAATATGGAAGAGAAACCT+GGG + Chr7:79161793-79161812 MsG0780040556.01.T01:CDS 30.0%
TTCAGCATTAACCATAGAAT+GGG + Chr7:79161290-79161309 MsG0780040556.01.T01:CDS 30.0%
TTTAAGCCAATCAATGATCA+CGG - Chr7:79160870-79160889 None:intergenic 30.0%
TTTCTTTGACTATTGCTTGA+AGG - Chr7:79161431-79161450 None:intergenic 30.0%
! CATCATTTTCACTACAAGTT+TGG - Chr7:79160383-79160402 None:intergenic 30.0%
! CATTTTCACTTGATTCCATT+TGG + Chr7:79161657-79161676 MsG0780040556.01.T01:CDS 30.0%
! GTGGATTATCCCAATAATTA+GGG - Chr7:79161578-79161597 None:intergenic 30.0%
! TAACAATTAATGGACCTGTA+GGG - Chr7:79161467-79161486 None:intergenic 30.0%
! TTGGAAAGTCTAGTGATTTT+AGG - Chr7:79161144-79161163 None:intergenic 30.0%
!! AGTGGATTATCCCAATAATT+AGG - Chr7:79161579-79161598 None:intergenic 30.0%
!! CTATGATTCAATGTTTTGAG+TGG + Chr7:79161745-79161764 MsG0780040556.01.T01:CDS 30.0%
!! TCTAGTGATTTTAGGAGAAA+AGG - Chr7:79161136-79161155 None:intergenic 30.0%
!! TGGTAATGGGATTGTTAATA+TGG + Chr7:79161779-79161798 MsG0780040556.01.T01:CDS 30.0%
!! TGTAGTCAATCCATTTTTGT+CGG + Chr7:79160768-79160787 MsG0780040556.01.T01:intron 30.0%
!!! GTTAGTTTTTTGCTCAAGAA+AGG + Chr7:79160279-79160298 MsG0780040556.01.T01:CDS 30.0%
ACAAACAATTGTGTCTTTGC+TGG - Chr7:79161531-79161550 None:intergenic 35.0%
ATTAACCATAGAATGGGCAT+TGG + Chr7:79161296-79161315 MsG0780040556.01.T01:CDS 35.0%
CAAGAGATTAATGATGTGGT+TGG + Chr7:79161360-79161379 MsG0780040556.01.T01:CDS 35.0%
CTTCAGCATTAACCATAGAA+TGG + Chr7:79161289-79161308 MsG0780040556.01.T01:CDS 35.0%
GAACATAAAAGCCTTCATCT+TGG + Chr7:79160698-79160717 MsG0780040556.01.T01:CDS 35.0%
GAAGGAAAAGGATTAATCCT+AGG - Chr7:79161861-79161880 None:intergenic 35.0%
GTTAATATGGAAGAGAAACC+TGG + Chr7:79161792-79161811 MsG0780040556.01.T01:CDS 35.0%
GTTGGAAATTTAGATGTGAG+GGG + Chr7:79161630-79161649 MsG0780040556.01.T01:CDS 35.0%
TCTTGATCTACCGACAAAAA+TGG - Chr7:79160781-79160800 None:intergenic 35.0%
TGAGTCAACTTCTTCCTTTA+AGG + Chr7:79160235-79160254 MsG0780040556.01.T01:CDS 35.0%
TTGACTATTGCTTGAAGGTA+AGG - Chr7:79161426-79161445 None:intergenic 35.0%
TTGCTCTTTCCATCATATGT+GGG - Chr7:79161338-79161357 None:intergenic 35.0%
! CTAACAATTAATGGACCTGT+AGG - Chr7:79161468-79161487 None:intergenic 35.0%
! TGTCGAATAACGTTATTTCG+AGG + Chr7:79160346-79160365 MsG0780040556.01.T01:CDS 35.0%
!! GATTCAATGTTTTGAGTGGA+AGG + Chr7:79161749-79161768 MsG0780040556.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTTTTGAGTGGAAGGTTAA+AGG + Chr7:79161756-79161775 MsG0780040556.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTTTTGCTCAAGAAAGGGA+AGG + Chr7:79160284-79160303 MsG0780040556.01.T01:CDS 35.0%
AAAGGATTAATCCTAGGCAC+AGG - Chr7:79161855-79161874 None:intergenic 40.0%
AAGACACTGTACATCTTACG+GGG + Chr7:79160433-79160452 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
AAGGATTAATCCTAGGCACA+GGG - Chr7:79161854-79161873 None:intergenic 40.0%
AGAAGTAAGGAGGAAGAGAA+AGG + Chr7:79160581-79160600 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
ATGTCCTGCCAGATCATAAA+GGG - Chr7:79161249-79161268 None:intergenic 40.0%
CAAAGGGTTACGGGAAATTA+GGG + Chr7:79160515-79160534 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
CAAGAAAGGGAAGGAAAATG+AGG + Chr7:79160293-79160312 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
CAAGACACTGTACATCTTAC+GGG + Chr7:79160432-79160451 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
CTATTGCTTGAAGGTAAGGA+AGG - Chr7:79161422-79161441 None:intergenic 40.0%
CTTGCTCTTTCCATCATATG+TGG - Chr7:79161339-79161358 None:intergenic 40.0%
GCAAGACACTGTACATCTTA+CGG + Chr7:79160431-79160450 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
GGAAGGTTAAAGGTGGTAAT+GGG + Chr7:79161766-79161785 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
GGGATAATCCACTTGAGTTT+AGG + Chr7:79161586-79161605 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
GTTGTCTCTTGTCTCCTTAA+AGG - Chr7:79160252-79160271 None:intergenic 40.0%
TAAGGAGACAAGAGACAACA+AGG + Chr7:79160253-79160272 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
TATACCCTTTATGATCTGGC+AGG + Chr7:79161242-79161261 MsG0780040556.01.T01:intron 40.0%
TATGTCCTGCCAGATCATAA+AGG - Chr7:79161250-79161269 None:intergenic 40.0%
TGGAAGGGACCCTAATTATT+GGG + Chr7:79161566-79161585 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
TGGAAGGTTAAAGGTGGTAA+TGG + Chr7:79161765-79161784 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
TGGAGGAGAAGGTCAAATTA+AGG + Chr7:79160611-79160630 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
TTGGAAGGGACCCTAATTAT+TGG + Chr7:79161565-79161584 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
TTTAAGAACTGGGATGTCCA+GGG + Chr7:79160486-79160505 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
TTTGAGTGGAAGGTTAAAGG+TGG + Chr7:79161759-79161778 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
! AAATGATGGTGAAGCTGAAG+AGG + Chr7:79160395-79160414 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
! CATGATGGAGAGGATTATCA+AGG + Chr7:79160551-79160570 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
! CTTGATAATCCTCTCCATCA+TGG - Chr7:79160553-79160572 None:intergenic 40.0%
! CTTGTCACTTACCAAGATGA+AGG - Chr7:79160712-79160731 None:intergenic 40.0%
! GGCACAGGTGATCTAAAATT+TGG - Chr7:79161115-79161134 None:intergenic 40.0%
! TCTGAAAAGTGCACAATCCA+AGG + Chr7:79161495-79161514 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
!! GATTTTAGGAGAAAAGGCAC+AGG - Chr7:79161130-79161149 None:intergenic 40.0%
!! TCAAGGAGCATCAAGAAGTA+AGG + Chr7:79160568-79160587 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTTAAGAACTGGGATGTCC+AGG + Chr7:79160485-79160504 MsG0780040556.01.T01:CDS 40.0%
AACCTGGGTTAACCCTTTCA+AGG + Chr7:79161808-79161827 MsG0780040556.01.T01:CDS 45.0%
ACACTAAGGATTCACCCTAC+AGG + Chr7:79161450-79161469 MsG0780040556.01.T01:CDS 45.0%
ACCTGGGTTAACCCTTTCAA+GGG + Chr7:79161809-79161828 MsG0780040556.01.T01:CDS 45.0%
AGGAAGAGAAAGGAAGTTGG+TGG + Chr7:79160591-79160610 MsG0780040556.01.T01:CDS 45.0%
AGGAGGAAGAGAAAGGAAGT+TGG + Chr7:79160588-79160607 MsG0780040556.01.T01:CDS 45.0%
AGGGGTTTAGCAAAGGGTTA+CGG + Chr7:79160505-79160524 MsG0780040556.01.T01:CDS 45.0%
ATGTCCAGGGGTTTAGCAAA+GGG + Chr7:79160499-79160518 MsG0780040556.01.T01:CDS 45.0%
CACTTGAGTTTAGGCCAGAA+AGG + Chr7:79161595-79161614 MsG0780040556.01.T01:CDS 45.0%
CACTTGATTCCATTTGGGAG+TGG + Chr7:79161663-79161682 MsG0780040556.01.T01:CDS 45.0%
GCAAAGGGTTACGGGAAATT+AGG + Chr7:79160514-79160533 MsG0780040556.01.T01:CDS 45.0%
GGACAGGTTTGATTCCATGA+TGG + Chr7:79160536-79160555 MsG0780040556.01.T01:CDS 45.0%
GGCACAGGGACACAAATTAA+AGG - Chr7:79161840-79161859 None:intergenic 45.0%
TAAAGGACGAGCCCTTGAAA+GGG - Chr7:79161823-79161842 None:intergenic 45.0%
TTAAAGGACGAGCCCTTGAA+AGG - Chr7:79161824-79161843 None:intergenic 45.0%
TTAAGAACTGGGATGTCCAG+GGG + Chr7:79160487-79160506 MsG0780040556.01.T01:CDS 45.0%
TTGCTGGAATCTCATAGCCT+TGG - Chr7:79161515-79161534 None:intergenic 45.0%
! CTTTCTGGCCTAAACTCAAG+TGG - Chr7:79161597-79161616 None:intergenic 45.0%
! GGTTTGATTCCATGATGGAG+AGG + Chr7:79160541-79160560 MsG0780040556.01.T01:CDS 45.0%
! TAATTTGTGTCCCTGTGCCT+AGG + Chr7:79161841-79161860 MsG0780040556.01.T01:CDS 45.0%
! TGGCAGGACATATTTGTTGC+TGG + Chr7:79161258-79161277 MsG0780040556.01.T01:intron 45.0%
!! AAGAGAAAGGAAGTTGGTGG+AGG + Chr7:79160594-79160613 MsG0780040556.01.T01:CDS 45.0%
!! AGGAGCATCAAGAAGTAAGG+AGG + Chr7:79160571-79160590 MsG0780040556.01.T01:CDS 45.0%
AGCTGAAGAGGTGAGGAAGT+TGG + Chr7:79160407-79160426 MsG0780040556.01.T01:CDS 50.0%
ATGGTGAAGCTGAAGAGGTG+AGG + Chr7:79160400-79160419 MsG0780040556.01.T01:CDS 50.0%
CAACGGCCGTGATCATTGAT+TGG + Chr7:79160861-79160880 MsG0780040556.01.T01:intron 50.0%
CAATCAATGATCACGGCCGT+TGG - Chr7:79160863-79160882 None:intergenic 50.0%
CACAACATGCAAAGCCAGAG+AGG - Chr7:79161709-79161728 None:intergenic 50.0%
CTCTGCCAATGCCCATTCTA+TGG - Chr7:79161304-79161323 None:intergenic 50.0%
GATGTCCAGGGGTTTAGCAA+AGG + Chr7:79160498-79160517 MsG0780040556.01.T01:CDS 50.0%
GCTCTTCTTCCACTCCCAAA+TGG - Chr7:79161675-79161694 None:intergenic 50.0%
GGGGTTTAGCAAAGGGTTAC+GGG + Chr7:79160506-79160525 MsG0780040556.01.T01:CDS 50.0%
GGTTACGGGAAATTAGGGAC+AGG + Chr7:79160520-79160539 MsG0780040556.01.T01:CDS 50.0%
GTAACCCTTTGCTAAACCCC+TGG - Chr7:79160506-79160525 None:intergenic 50.0%
!! AAGGAAGTTGGTGGAGGAGA+AGG + Chr7:79160600-79160619 MsG0780040556.01.T01:CDS 50.0%
GCAAAGCCAGAGAGGTTCCA+GGG - Chr7:79161701-79161720 None:intergenic 55.0%
GCCCTTGAAAGGGTTAACCC+AGG - Chr7:79161813-79161832 None:intergenic 55.0%
TGCAAAGCCAGAGAGGTTCC+AGG - Chr7:79161702-79161721 None:intergenic 55.0%
! AGTGGAAGAAGAGCATGCCC+TGG + Chr7:79161681-79161700 MsG0780040556.01.T01:CDS 55.0%
AGCATGCCCTGGAACCTCTC+TGG + Chr7:79161692-79161711 MsG0780040556.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 79160207 79161887 79160207 ID=MsG0780040556.01;Name=MsG0780040556.01
Chr7 mRNA 79160207 79161887 79160207 ID=MsG0780040556.01.T01;Parent=MsG0780040556.01;Name=MsG0780040556.01.T01;_AED=0.35;_eAED=0.35;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|378
Chr7 exon 79160207 79160719 79160207 ID=MsG0780040556.01.T01:exon:464;Parent=MsG0780040556.01.T01
Chr7 exon 79161264 79161887 79161264 ID=MsG0780040556.01.T01:exon:465;Parent=MsG0780040556.01.T01
Chr7 CDS 79160207 79160719 79160207 ID=MsG0780040556.01.T01:cds;Parent=MsG0780040556.01.T01
Chr7 CDS 79161264 79161887 79161264 ID=MsG0780040556.01.T01:cds;Parent=MsG0780040556.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780040556.01.T01

ATGTCTGAACTTCTTGGTGGTAACACATTGAGTCAACTTCTTCCTTTAAGGAGACAAGAGACAACAAGGTTTGTTAGTTTTTTGCTCAAGAAAGGGAAGGAAAATGAGGTTATTGATGTTGGAAGAGAGCTTTTGAAGTTGTCGAATAACGTTATTTCGAGGATGATTATGAGCCAAACTTGTAGTGAAAATGATGGTGAAGCTGAAGAGGTGAGGAAGTTGGTGCAAGACACTGTACATCTTACGGGGAAGTTTAATATTTCTGATTTTATTTGGTTTTTTAAGAACTGGGATGTCCAGGGGTTTAGCAAAGGGTTACGGGAAATTAGGGACAGGTTTGATTCCATGATGGAGAGGATTATCAAGGAGCATCAAGAAGTAAGGAGGAAGAGAAAGGAAGTTGGTGGAGGAGAAGGTCAAATTAAGGATCTACTTGATATTTTATTGGATATTCTTGAAGATGAGAGCTCTGAAATCAAATTGAAAATGGAGAACATAAAAGCCTTCATCTTGGACATATTTGTTGCTGGAACAGACACTTCAGCATTAACCATAGAATGGGCATTGGCAGAGCTAATTAACAACCCACATATGATGGAAAGAGCAAGACAAGAGATTAATGATGTGGTTGGTAACAACAGAATAGTAGAAGAATCAGACATTATCAACCTTCCTTACCTTCAAGCAATAGTCAAAGAAACACTAAGGATTCACCCTACAGGTCCATTAATTGTTAGAGAATCATCTGAAAAGTGCACAATCCAAGGCTATGAGATTCCAGCAAAGACACAATTGTTTGTTAATATATGGTCTATTGGAAGGGACCCTAATTATTGGGATAATCCACTTGAGTTTAGGCCAGAAAGGTTTATTAGTGAAGTTGGAAATTTAGATGTGAGGGGTCAACATTTTCACTTGATTCCATTTGGGAGTGGAAGAAGAGCATGCCCTGGAACCTCTCTGGCTTTGCATGTTGTGCAAACAAATCTTGCTGCTATGATTCAATGTTTTGAGTGGAAGGTTAAAGGTGGTAATGGGATTGTTAATATGGAAGAGAAACCTGGGTTAACCCTTTCAAGGGCTCGTCCTTTAATTTGTGTCCCTGTGCCTAGGATTAATCCTTTTCCTTCTATGTGA
Protein sequence

>MsG0780040556.01.T01

MSELLGGNTLSQLLPLRRQETTRFVSFLLKKGKENEVIDVGRELLKLSNNVISRMIMSQTCSENDGEAEEVRKLVQDTVHLTGKFNISDFIWFFKNWDVQGFSKGLREIRDRFDSMMERIIKEHQEVRRKRKEVGGGEGQIKDLLDILLDILEDESSEIKLKMENIKAFILDIFVAGTDTSALTIEWALAELINNPHMMERARQEINDVVGNNRIVEESDIINLPYLQAIVKETLRIHPTGPLIVRESSEKCTIQGYEIPAKTQLFVNIWSIGRDPNYWDNPLEFRPERFISEVGNLDVRGQHFHLIPFGSGRRACPGTSLALHVVQTNLAAMIQCFEWKVKGGNGIVNMEEKPGLTLSRARPLICVPVPRINPFPSM*