AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780041115.01

Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0780041115.01.T01 MTR_7g104360 95.550 427 19 0 1 427 1 427 0.0 859
MsG0780041115.01.T01 MTR_7g104330 60.750 400 154 2 27 425 34 431 0.0 534
MsG0780041115.01.T01 MTR_1g060360 59.375 416 166 2 11 425 10 423 0.0 530
MsG0780041115.01.T01 MTR_3g051240 61.266 395 148 4 27 419 22 413 2.15e-177 502
MsG0780041115.01.T01 MTR_5g092360 60.401 399 151 4 27 421 26 421 3.01e-172 489
MsG0780041115.01.T01 MTR_4g115670 41.990 412 210 9 30 416 40 447 1.96e-99 305
MsG0780041115.01.T01 MTR_0188s0020 41.509 424 211 12 34 423 41 461 1.53e-95 295
MsG0780041115.01.T01 MTR_4g037105 40.288 417 212 11 34 416 35 448 2.00e-89 279
MsG0780041115.01.T01 MTR_3g083810 37.131 474 205 10 32 416 56 525 1.19e-87 277
MsG0780041115.01.T01 MTR_6g013050 39.433 388 161 7 99 416 143 526 9.42e-87 276
MsG0780041115.01.T01 MTR_1g112630 39.750 400 210 11 45 416 54 450 1.05e-86 272
MsG0780041115.01.T01 MTR_3g083820 36.498 474 208 10 32 416 56 525 1.82e-86 273
MsG0780041115.01.T01 MTR_7g056403 38.601 386 165 6 99 416 143 524 3.34e-84 268
MsG0780041115.01.T01 MTR_6g013050 35.797 433 186 9 47 391 71 499 1.78e-77 250
MsG0780041115.01.T01 MTR_4g037670 27.861 402 214 12 47 385 216 604 2.16e-34 135
MsG0780041115.01.T01 MTR_1g052505 26.558 369 215 9 47 359 194 562 2.42e-33 132
MsG0780041115.01.T01 MTR_4g082930 28.261 414 217 13 47 385 144 552 2.34e-31 127
MsG0780041115.01.T01 MTR_4g082940 28.000 400 222 13 47 385 144 538 2.02e-30 124
MsG0780041115.01.T01 MTR_3g074930 26.098 410 238 13 55 405 196 599 4.21e-30 123
MsG0780041115.01.T01 MTR_3g074930 25.799 407 237 13 58 405 192 592 1.82e-29 121
MsG0780041115.01.T01 MTR_4g103520 26.225 408 234 13 58 405 196 596 4.04e-27 114
MsG0780041115.01.T01 MTR_4g103520 26.225 408 234 13 58 405 119 519 4.37e-27 114
MsG0780041115.01.T01 MTR_5g045600 25.000 416 229 13 58 405 188 588 4.41e-25 108
MsG0780041115.01.T01 MTR_3g074970 25.628 398 204 12 58 405 141 496 7.37e-25 107
MsG0780041115.01.T01 MTR_8g063080 25.424 354 208 11 102 407 238 583 4.31e-22 99.4
MsG0780041115.01.T01 MTR_5g092450 48.052 77 20 1 315 391 11 67 1.67e-14 68.9
MsG0780041115.01.T01 MTR_5g092300 50.000 54 27 0 368 421 9 62 1.41e-12 63.2
Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0780041115.01.T01 AT3G52780 63.744 422 147 5 10 426 6 426 0.0 558
MsG0780041115.01.T01 AT3G52820 61.069 393 150 2 28 419 28 418 1.39e-179 508
MsG0780041115.01.T01 AT3G20500 56.974 423 171 5 12 426 5 424 2.26e-173 492
MsG0780041115.01.T01 AT3G52810 53.052 426 189 3 11 427 7 430 2.25e-161 462
MsG0780041115.01.T01 AT3G52780 61.976 334 121 5 10 338 6 338 6.37e-149 427
MsG0780041115.01.T01 AT5G34850 40.712 393 206 8 45 412 52 442 4.13e-94 291
MsG0780041115.01.T01 AT3G07130 41.514 383 155 6 99 416 137 515 1.40e-89 281
MsG0780041115.01.T01 AT1G56360 39.356 404 210 11 45 416 48 448 1.44e-87 274
MsG0780041115.01.T01 AT2G27190 38.549 441 230 12 11 416 19 453 3.35e-87 273
MsG0780041115.01.T01 AT4G36350 38.875 409 216 11 39 416 43 448 1.24e-85 269
MsG0780041115.01.T01 AT2G16430 35.217 460 252 12 12 427 11 468 1.99e-83 264
MsG0780041115.01.T01 AT3G07130 38.221 416 155 7 99 416 137 548 8.62e-83 265
MsG0780041115.01.T01 AT2G18130 37.468 395 207 8 45 416 52 429 3.47e-81 257
MsG0780041115.01.T01 AT4G13700 38.462 377 175 7 47 370 65 437 1.02e-77 248
MsG0780041115.01.T01 AT2G16430 38.081 344 183 8 112 427 7 348 2.38e-73 234
MsG0780041115.01.T01 AT2G32770 37.692 390 166 6 99 414 146 532 6.81e-72 236
MsG0780041115.01.T01 AT2G32770 37.705 366 151 6 99 390 65 427 6.33e-65 214
MsG0780041115.01.T01 AT4G13700 36.471 340 159 7 47 333 65 400 2.02e-61 205
MsG0780041115.01.T01 AT3G46120 34.750 400 158 13 45 416 52 376 1.88e-59 199
MsG0780041115.01.T01 AT2G32770 33.590 390 153 7 99 414 146 503 3.76e-56 194
MsG0780041115.01.T01 AT1G52940 36.245 229 130 6 45 257 13 241 1.38e-35 132
MsG0780041115.01.T01 AT2G03450 27.315 432 239 13 47 407 143 570 7.83e-33 131
MsG0780041115.01.T01 AT1G13900 27.603 413 223 11 47 388 145 552 9.31e-32 128
MsG0780041115.01.T01 AT5G50400 25.852 352 205 9 102 405 165 508 2.11e-25 108
MsG0780041115.01.T01 AT5G50400 25.852 352 205 9 102 405 237 580 2.67e-25 108
MsG0780041115.01.T01 AT1G13750 24.510 408 241 12 58 405 182 582 3.35e-22 99.8
MsG0780041115.01.T01 AT4G24890 25.143 350 206 9 102 403 241 582 4.85e-22 99.0

Find 116 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 301 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AGGCTTGGCTTTCTTGATTT+TGG 0.113918 7:+86771460 MsG0780041115.01.T01:CDS
CGGATTCTTCACAATATAAA+TGG 0.234250 7:+86774696 MsG0780041115.01.T01:CDS
GAAATTCACAATGTCGTAAT+TGG 0.266816 7:+86773923 MsG0780041115.01.T01:CDS
GCTCAATTTCCTATCAAGTT+TGG 0.270262 7:+86774022 MsG0780041115.01.T01:CDS
GTTTCAACATTGAAGCATTT+AGG 0.285278 7:+86774371 MsG0780041115.01.T01:CDS
AGCCGGAGATATCACTATTC+AGG 0.296214 7:+86775413 MsG0780041115.01.T01:CDS
CGGTAGTAGTAGACTGTATT+AGG 0.300950 7:-86773956 None:intergenic
GGGATTTACAGAAGGTTAAC+AGG 0.315844 7:+86774726 MsG0780041115.01.T01:CDS
ATGGGACTCCTTTGGTCGTT+TGG 0.324190 7:+86774460 MsG0780041115.01.T01:CDS
ACACGGGTTTATAAAGATAA+AGG 0.345618 7:+86775156 MsG0780041115.01.T01:CDS
CCTATCAAGTTTGGAGTAGT+TGG 0.351322 7:+86774031 MsG0780041115.01.T01:CDS
CATTATGCTCTTTACGAGTC+TGG 0.351625 7:+86773899 MsG0780041115.01.T01:CDS
GGCGTTCATGTTATCATGTT+GGG 0.362060 7:+86774653 MsG0780041115.01.T01:CDS
TTAAAATGTGCAGGAGATCT+TGG 0.371273 7:+86774332 MsG0780041115.01.T01:intron
TAATGTACTGTTGCTGGAGT+TGG 0.372051 7:-86773821 None:intergenic
CCAACTACTCCAAACTTGAT+AGG 0.374281 7:-86774031 None:intergenic
TAATTCTAATGAAGCTCATC+AGG 0.380523 7:+86774793 MsG0780041115.01.T01:CDS
CAAAATTTATGGGACTCCTT+TGG 0.387876 7:+86774452 MsG0780041115.01.T01:CDS
CTATTCAGGGAGGCTAGCTT+TGG 0.390382 7:+86775427 MsG0780041115.01.T01:CDS
GTCCAGTGCATATTGTCATT+GGG 0.394080 7:+86775190 MsG0780041115.01.T01:CDS
TACAGTCTACTACTACCGTT+TGG 0.396619 7:+86773961 MsG0780041115.01.T01:CDS
ATATCTCCGGCTTAGGATCT+TGG 0.405801 7:-86775402 None:intergenic
TCACAATATAAATGGCTTCA+AGG 0.411262 7:+86774704 MsG0780041115.01.T01:CDS
CATTTATATTGTGAAGAATC+CGG 0.413645 7:-86774695 None:intergenic
AATGGCTCTTTGTGGACAAC+TGG 0.417454 7:-86774548 None:intergenic
TGAAGAATCCGGGGCAAAAT+CGG 0.417615 7:-86774684 None:intergenic
CATGGACGTTGGCTTGCATA+TGG 0.419335 7:-86774488 None:intergenic
ACTCCAGCAACAGTACATTA+TGG 0.422788 7:+86773824 MsG0780041115.01.T01:CDS
AATGTACTGTTGCTGGAGTT+GGG 0.423520 7:-86773820 None:intergenic
TCTGATCCGCTTTCTTCAAA+TGG 0.424318 7:-86774599 None:intergenic
CTGTTGTTAGTGACTCTGTT+TGG 0.424993 7:+86775521 MsG0780041115.01.T01:CDS
CACAATATAAATGGCTTCAA+GGG 0.433408 7:+86774705 MsG0780041115.01.T01:CDS
GGTCCAGTGCATATTGTCAT+TGG 0.437467 7:+86775189 MsG0780041115.01.T01:CDS
GCAAACGCACTTTCTGCTAC+TGG 0.439584 7:+86773860 MsG0780041115.01.T01:CDS
TGATGACTCATCGCCACAAC+AGG 0.445818 7:+86771559 MsG0780041115.01.T01:CDS
ATGCTGTGAATGGCTCTTTG+TGG 0.445955 7:-86774556 None:intergenic
AGAAAACAAAATGAGATTCA+AGG 0.452678 7:+86771424 None:intergenic
AAGTTATTCTCATCTTGTCT+TGG 0.452713 7:-86773784 None:intergenic
GGGCCATAATGTACTGTTGC+TGG 0.453997 7:-86773827 None:intergenic
CTGGAATCTTCTCAATATCA+TGG 0.462576 7:-86774529 None:intergenic
TTATTTATTACCTTGTGGCT+AGG 0.467832 7:-86775233 None:intergenic
TGGTGTTGGTTCATGCTCCT+TGG 0.467959 7:+86774768 MsG0780041115.01.T01:CDS
ACACATCAAAAGAATAGTAT+AGG 0.472739 7:-86774628 None:intergenic
AACTCCTTGGGTAGTGGTGT+TGG 0.478876 7:+86774754 MsG0780041115.01.T01:CDS
TGGCGTTCATGTTATCATGT+TGG 0.483228 7:+86774652 MsG0780041115.01.T01:CDS
GTAGACTGTATTAGGCTTGA+GGG 0.484153 7:-86773948 None:intergenic
AATAGTGATATCTCCGGCTT+AGG 0.487856 7:-86775409 None:intergenic
ATTTATATTGTGAAGAATCC+GGG 0.492291 7:-86774694 None:intergenic
AGTGCGTTTGCTGAAGGAGA+TGG 0.500114 7:-86773848 None:intergenic
CATCACATGCACTTTGGAGT+TGG 0.502395 7:+86775476 MsG0780041115.01.T01:CDS
TGGTCGATTGTAGCAATAAA+CGG 0.502539 7:-86771501 None:intergenic
CAGACTCGTAAAGAGCATAA+TGG 0.503425 7:-86773898 None:intergenic
CAAACAGAGTCACTAACAAC+AGG 0.504537 7:-86775520 None:intergenic
AAAATCAAGAAAGCCAAGCC+TGG 0.505701 7:-86771458 None:intergenic
GTATATCAAGCTTTACAAGC+GGG 0.505973 7:-86775565 None:intergenic
GCCGGAGATATCACTATTCA+GGG 0.507404 7:+86775414 MsG0780041115.01.T01:CDS
ACAGTCTACTACTACCGTTT+GGG 0.511791 7:+86773962 MsG0780041115.01.T01:CDS
CTTGCATTGTATGCTGTGAA+TGG 0.517458 7:-86774566 None:intergenic
CATATGCAAGCCAACGTCCA+TGG 0.524535 7:+86774489 MsG0780041115.01.T01:CDS
GAAAACAAAATGAGATTCAA+GGG 0.540447 7:+86771425 None:intergenic
TCTGCGTAGGATAAGTCTCC+TGG 0.542667 7:-86774422 None:intergenic
GTGCGTTTGCTGAAGGAGAT+GGG 0.554869 7:-86773847 None:intergenic
AGCGGGGTCAGAGGAAAGGC+TGG 0.556772 7:-86775548 None:intergenic
GTGCATATTGTCATTGGGGA+TGG 0.558375 7:+86775195 MsG0780041115.01.T01:CDS
ATTTAGCATAGCACCTGTTG+TGG 0.558690 7:-86771572 None:intergenic
TTAATGCATCACATGCACTT+TGG 0.559271 7:+86775470 MsG0780041115.01.T01:CDS
CGTCCATGGATGGTCACTAC+AGG 0.563495 7:+86774503 MsG0780041115.01.T01:CDS
GCAGAAAGTGCGTTTGCTGA+AGG 0.564712 7:-86773854 None:intergenic
AGCATAATGGTAAGAAGTGG+TGG 0.564797 7:-86773885 None:intergenic
AAAGATAAAGGTGACAATTG+TGG 0.564863 7:+86775168 MsG0780041115.01.T01:CDS
GCTTCAAGGGGATTTACAGA+AGG 0.567207 7:+86774718 MsG0780041115.01.T01:CDS
AAGACAAGATGAGAATAACT+TGG 0.568409 7:+86773786 MsG0780041115.01.T01:CDS
AGTAGACTGTATTAGGCTTG+AGG 0.568422 7:-86773949 None:intergenic
TTTCCTGTAGTGACCATCCA+TGG 0.568592 7:-86774506 None:intergenic
CATATTGTCATTGGGGATGG+AGG 0.568634 7:+86775198 MsG0780041115.01.T01:CDS
TTGGCATAAGAATGATAATG+AGG 0.569656 7:+86775495 MsG0780041115.01.T01:CDS
TCCCCAATGACAATATGCAC+TGG 0.574383 7:-86775192 None:intergenic
TACAAGCGGGGTCAGAGGAA+AGG 0.576063 7:-86775552 None:intergenic
AGCTTTACAAGCGGGGTCAG+AGG 0.579456 7:-86775557 None:intergenic
TGCAAGCCAACGTCCATGGA+TGG 0.582098 7:+86774493 MsG0780041115.01.T01:CDS
TACGATATGCTATTATTACC+AGG 0.585952 7:+86774404 MsG0780041115.01.T01:CDS
TAATGAAGCTCATCAGGGTG+AGG 0.588950 7:+86774799 MsG0780041115.01.T01:CDS
AATACTTACAAAGCGTTCGT+AGG 0.596937 7:-86774906 None:intergenic
ACAATATAAATGGCTTCAAG+GGG 0.601935 7:+86774706 MsG0780041115.01.T01:CDS
GTAGGTACATATATCTCAAG+TGG 0.602335 7:+86773760 MsG0780041115.01.T01:intron
AGGGAGGCTAGCTTTGGACA+TGG 0.606219 7:+86775433 MsG0780041115.01.T01:CDS
CATTCACAGCATACAATGCA+AGG 0.607221 7:+86774567 MsG0780041115.01.T01:CDS
TCCCTGAATAGTGATATCTC+CGG 0.607511 7:-86775415 None:intergenic
TGGTTCAACCAAACGACCAA+AGG 0.610386 7:-86774468 None:intergenic
TCCAGTGCATATTGTCATTG+GGG 0.611118 7:+86775191 MsG0780041115.01.T01:CDS
CTTTGGACATGGAGTACTAG+AGG 0.617779 7:+86775444 MsG0780041115.01.T01:CDS
TGTTGACATGAAGAATGCAA+TGG 0.623954 7:+86774829 MsG0780041115.01.T01:CDS
AACTTGATAGGAAATTGAGC+TGG 0.627265 7:-86774019 None:intergenic
ATCGTGAAGGCCTAGCCACA+AGG 0.627603 7:+86775223 MsG0780041115.01.T01:CDS
GGGGATGGAGGCAATCGTGA+AGG 0.629344 7:+86775210 MsG0780041115.01.T01:CDS
TGAACCAACACCACTACCCA+AGG 0.629873 7:-86774758 None:intergenic
TATATCAAGCTTTACAAGCG+GGG 0.636544 7:-86775564 None:intergenic
GGATTTACAGAAGGTTAACA+GGG 0.636624 7:+86774727 MsG0780041115.01.T01:CDS
TAGGTACCAAGATCCTAAGC+CGG 0.637082 7:+86775396 MsG0780041115.01.T01:intron
TAGGTACATATATCTCAAGT+GGG 0.637626 7:+86773761 MsG0780041115.01.T01:intron
AAGAGCATAATGGTAAGAAG+TGG 0.638792 7:-86773888 None:intergenic
GATGAGTCATCAAGATCGTG+AGG 0.640370 7:-86771548 None:intergenic
GACATGAAGAATGCAATGGA+AGG 0.648913 7:+86774833 MsG0780041115.01.T01:CDS
TTTATATTGTGAAGAATCCG+GGG 0.656506 7:-86774693 None:intergenic
AATTCTAATGAAGCTCATCA+GGG 0.664651 7:+86774794 MsG0780041115.01.T01:CDS
TAGACTGTATTAGGCTTGAG+GGG 0.673444 7:-86773947 None:intergenic
CAAATGCCATTTGAAGAAAG+CGG 0.674121 7:+86774593 MsG0780041115.01.T01:CDS
AGTATATCAAGCTTTACAAG+CGG 0.674326 7:-86775566 None:intergenic
TGGACATGGAGTACTAGAGG+TGG 0.683228 7:+86775447 MsG0780041115.01.T01:CDS
GAGATCTTGGACAAACAGAG+TGG 0.690863 7:+86774345 MsG0780041115.01.T01:CDS
ATGAGTCATCAAGATCGTGA+GGG 0.692801 7:-86771547 None:intergenic
GCTTCATTAGAATTATACCA+AGG 0.697694 7:-86774785 None:intergenic
TAGTGACCATCCATGGACGT+TGG 0.702416 7:-86774499 None:intergenic
GGAGATATCACTATTCAGGG+AGG 0.752640 7:+86775417 MsG0780041115.01.T01:CDS
TCACAGCATACAATGCAAGG+TGG 0.758498 7:+86774570 MsG0780041115.01.T01:CDS
GATTTACAGAAGGTTAACAG+GGG 0.767404 7:+86774728 MsG0780041115.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATAAAAAAGAATAATTACT+AGG - Chr7:86775129-86775148 None:intergenic 10.0%
!! TTATGTTAAAATATTGAAAA+AGG - Chr7:86773082-86773101 None:intergenic 10.0%
!!! ATTTAATGATTTTAAAGAAA+GGG - Chr7:86771856-86771875 None:intergenic 10.0%
!!! GTAATTTTTTTTATTTAGTT+TGG - Chr7:86772388-86772407 None:intergenic 10.0%
!! AAAGAATATATAATGCTATA+GGG + Chr7:86773326-86773345 MsG0780041115.01.T01:intron 15.0%
!! AAATGAAAATAATAATAGTG+TGG - Chr7:86774081-86774100 None:intergenic 15.0%
!! ACAAAACTATGAATATTTAT+AGG - Chr7:86771627-86771646 None:intergenic 15.0%
!! ACAAAATTCTGAATATTTAT+AGG + Chr7:86771812-86771831 MsG0780041115.01.T01:intron 15.0%
!! AGCTTATAATTTAGTAATTA+TGG - Chr7:86773405-86773424 None:intergenic 15.0%
!! AGTAAAAATTAAGAAAGTTT+AGG - Chr7:86775279-86775298 None:intergenic 15.0%
!! ATAAAATAACGAATGTATAT+GGG - Chr7:86773267-86773286 None:intergenic 15.0%
!! ATTTACACTAATTAAGAATA+AGG + Chr7:86772493-86772512 MsG0780041115.01.T01:intron 15.0%
!! CAAAACTATGAATATTTATA+GGG - Chr7:86771626-86771645 None:intergenic 15.0%
!! CAAAATTCTGAATATTTATA+GGG + Chr7:86771813-86771832 MsG0780041115.01.T01:intron 15.0%
!! GCTTATAATTTAGTAATTAT+GGG - Chr7:86773404-86773423 None:intergenic 15.0%
!! TAAAAATAAAAAATAACACG+TGG - Chr7:86772730-86772749 None:intergenic 15.0%
!! TAAAAATAGAAATATTGCAT+TGG - Chr7:86773020-86773039 None:intergenic 15.0%
!! TATAAAATAACGAATGTATA+TGG - Chr7:86773268-86773287 None:intergenic 15.0%
!! TGTTTATTTATTTGTCATAT+AGG + Chr7:86775060-86775079 MsG0780041115.01.T01:intron 15.0%
!! TTTATTTATTTATTACCTTG+TGG - Chr7:86775241-86775260 None:intergenic 15.0%
!!! AAGTTGTTTTTAAATGTTAT+TGG + Chr7:86773303-86773322 MsG0780041115.01.T01:intron 15.0%
!!! ACAATTTTTTTTCTTTTATC+TGG - Chr7:86772357-86772376 None:intergenic 15.0%
!!! AGATTTTGTACAAAATTTAT+GGG + Chr7:86774442-86774461 MsG0780041115.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATGTTGATGAAAAATTTTAT+AGG + Chr7:86771752-86771771 MsG0780041115.01.T01:intron 15.0%
!!! CATTTAATGATTTTAAAGAA+AGG - Chr7:86771857-86771876 None:intergenic 15.0%
!!! TGATTTTAAATAATTGTATG+TGG + Chr7:86775363-86775382 MsG0780041115.01.T01:intron 15.0%
!!! TGTTGATGAAAAATTTTATA+GGG + Chr7:86771753-86771772 MsG0780041115.01.T01:intron 15.0%
!!! TTATTTTTATTTTTTGCCTT+GGG + Chr7:86772741-86772760 MsG0780041115.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTATTTTTATTTTTTGCCT+TGG + Chr7:86772740-86772759 MsG0780041115.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTGTAGTTTTTTTTCTTA+GGG + Chr7:86772802-86772821 MsG0780041115.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTGTAGTTTTTTTTCTTA+GGG - Chr7:86772821-86772802 None:intergenic 15.0%
!! AATTTAGTAATTATGGGATT+AGG - Chr7:86773398-86773417 None:intergenic 20.0%
!! ATATTATAATCCATATACAC+TGG - Chr7:86773242-86773261 None:intergenic 20.0%
!! CATAAATATTTAATACAACG+TGG - Chr7:86773665-86773684 None:intergenic 20.0%
!! CTCTTAAAATTTCATTTACA+TGG + Chr7:86771957-86771976 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
!! GAAAGAATATATAATGCTAT+AGG + Chr7:86773325-86773344 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
!! GTTATGATGATAGAATTAAT+AGG + Chr7:86773542-86773561 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
!! TATTAAATAACCAGTGTATA+TGG + Chr7:86773229-86773248 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
!! TTATCGTTACTCATATTTAT+AGG + Chr7:86773565-86773584 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
!!! AAAGTGTGATTTTATTTTGT+AGG + Chr7:86771781-86771800 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
!!! AAGTGTGATTTTATTTTGTA+GGG + Chr7:86771782-86771801 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
!!! AATGTGATATATACTCTTTT+CGG + Chr7:86773171-86773190 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
!!! ATGTTGATGGAAAATTTTAT+AGG + Chr7:86771721-86771740 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
!!! CAGATTTTGTACAAAATTTA+TGG + Chr7:86774441-86774460 MsG0780041115.01.T01:CDS 20.0%
!!! CTTTATTTTTCATTCAATCT+AGG - Chr7:86773116-86773135 None:intergenic 20.0%
!!! CTTTTTTATTTTCTTAGACA+CGG + Chr7:86775139-86775158 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
!!! GTTTTGTAGTTTTTTTTCTT+AGG + Chr7:86772801-86772820 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
!!! GTTTTGTAGTTTTTTTTCTT+AGG - Chr7:86772820-86772801 None:intergenic 20.0%
!!! TATTTTTATTTTTTGCCTTG+GGG + Chr7:86772742-86772761 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
!!! TGTTGATGGAAAATTTTATA+GGG + Chr7:86771722-86771741 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
!!! TTAAGCCTTTAAAAAAAACA+AGG + Chr7:86772870-86772889 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
!!! TTATTTTCATTTGAGAAAAG+TGG + Chr7:86774089-86774108 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
!!! TTCAACCTTGTTTTTTTTAA+AGG - Chr7:86772878-86772897 None:intergenic 20.0%
!!! TTTACATGTTGTTTTCAATT+TGG - Chr7:86772081-86772100 None:intergenic 20.0%
!!! TTTGTAGTTTTTTTTCTTAG+GGG + Chr7:86772803-86772822 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTGTAGTTTTTTTTCTTAG+GGG - Chr7:86772822-86772803 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTTACTTAACATTACCAA+AGG + Chr7:86775291-86775310 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTTTATTTTCTTAGACAC+GGG + Chr7:86775140-86775159 MsG0780041115.01.T01:intron 20.0%
! ACACATCAAAAGAATAGTAT+AGG - Chr7:86774631-86774650 None:intergenic 25.0%
! ATCATCATAACGAATAACAA+AGG - Chr7:86773533-86773552 None:intergenic 25.0%
! ATTTATATTGTGAAGAATCC+GGG - Chr7:86774697-86774716 None:intergenic 25.0%
! CATTTATATTGTGAAGAATC+CGG - Chr7:86774698-86774717 None:intergenic 25.0%
! GAAAGGGTTAATTAAGTAAA+TGG - Chr7:86771840-86771859 None:intergenic 25.0%
! GAAATATTGCATTGGAAAAA+TGG - Chr7:86773012-86773031 None:intergenic 25.0%
! GCTATGCTAAATTTCTTTAA+GGG + Chr7:86771583-86771602 MsG0780041115.01.T01:intron 25.0%
! GTGATGTATTATATTTGGAA+AGG + Chr7:86772316-86772335 MsG0780041115.01.T01:intron 25.0%
! TAAACAATTATGTGCAACTA+AGG - Chr7:86774298-86774317 None:intergenic 25.0%
! TATTTAGATTCAATGCATTC+AGG - Chr7:86774266-86774285 None:intergenic 25.0%
! TCTCCTTCAAAAAAAGAATA+AGG + Chr7:86772522-86772541 MsG0780041115.01.T01:intron 25.0%
! TGCTATGCTAAATTTCTTTA+AGG + Chr7:86771582-86771601 MsG0780041115.01.T01:intron 25.0%
!! AACAAGGTTGAATTTTCAAT+AGG + Chr7:86772886-86772905 MsG0780041115.01.T01:intron 25.0%
!! ACATTTTCCTTAAGCATTTT+AGG + Chr7:86771690-86771709 MsG0780041115.01.T01:intron 25.0%
!! AGTAATTTCTTCAATTTGCT+TGG + Chr7:86773425-86773444 MsG0780041115.01.T01:intron 25.0%
!! ATTTTTCATTCAATCTAGGA+GGG - Chr7:86773112-86773131 None:intergenic 25.0%
!! CATTTTCCTTAAGCATTTTA+GGG + Chr7:86771691-86771710 MsG0780041115.01.T01:intron 25.0%
!! TATTTTTCATTCAATCTAGG+AGG - Chr7:86773113-86773132 None:intergenic 25.0%
!!! AGTAACTGAGTTTTGTTTAA+CGG + Chr7:86772132-86772151 MsG0780041115.01.T01:intron 25.0%
!!! ATTTTTATTTTTTGCCTTGG+GGG + Chr7:86772743-86772762 MsG0780041115.01.T01:intron 25.0%
!!! CTTCCTTATTCTTTTTTTGA+AGG - Chr7:86772528-86772547 None:intergenic 25.0%
!!! GTTGTTTTCAATTTGGTAAT+TGG - Chr7:86772074-86772093 None:intergenic 25.0%
!!! TTGTAGTTTTTTTTCTTAGG+GGG + Chr7:86772804-86772823 MsG0780041115.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTAGAAATCGAATCAAAC+TGG + Chr7:86774958-86774977 MsG0780041115.01.T01:intron 25.0%
AAAGATAAAGGTGACAATTG+TGG + Chr7:86775168-86775187 MsG0780041115.01.T01:CDS 30.0%
AACGAATAACAAAGGAATGT+AGG - Chr7:86773525-86773544 None:intergenic 30.0%
AAGACAAGATGAGAATAACT+TGG + Chr7:86773786-86773805 MsG0780041115.01.T01:CDS 30.0%
AAGTTATTCTCATCTTGTCT+TGG - Chr7:86773787-86773806 None:intergenic 30.0%
AATTCTAATGAAGCTCATCA+GGG + Chr7:86774794-86774813 MsG0780041115.01.T01:CDS 30.0%
ACAATATAAATGGCTTCAAG+GGG + Chr7:86774706-86774725 MsG0780041115.01.T01:CDS 30.0%
ACACGGGTTTATAAAGATAA+AGG + Chr7:86775156-86775175 MsG0780041115.01.T01:CDS 30.0%
ACCAGGTGATGTATTATATT+TGG + Chr7:86772311-86772330 MsG0780041115.01.T01:intron 30.0%
ATGCTTAAGGAAAATGTCTT+AGG - Chr7:86771687-86771706 None:intergenic 30.0%
ATTTAATCGTATGTATGTGC+TGG + Chr7:86771934-86771953 MsG0780041115.01.T01:intron 30.0%
CACAATATAAATGGCTTCAA+GGG + Chr7:86774705-86774724 MsG0780041115.01.T01:CDS 30.0%
CGGATTCTTCACAATATAAA+TGG + Chr7:86774696-86774715 MsG0780041115.01.T01:CDS 30.0%
GAAATTCACAATGTCGTAAT+TGG + Chr7:86773923-86773942 MsG0780041115.01.T01:CDS 30.0%
GCTTCATTAGAATTATACCA+AGG - Chr7:86774788-86774807 None:intergenic 30.0%
GGTACTGTACATATATTGTT+GGG + Chr7:86772011-86772030 MsG0780041115.01.T01:intron 30.0%
GTACTGTACATATATTGTTG+GGG + Chr7:86772012-86772031 MsG0780041115.01.T01:intron 30.0%
TAATTCTAATGAAGCTCATC+AGG + Chr7:86774793-86774812 MsG0780041115.01.T01:CDS 30.0%
TACGATATGCTATTATTACC+AGG + Chr7:86774404-86774423 MsG0780041115.01.T01:CDS 30.0%
TAGGTACATATATCTCAAGT+GGG + Chr7:86773761-86773780 MsG0780041115.01.T01:intron 30.0%
TCACAATATAAATGGCTTCA+AGG + Chr7:86774704-86774723 MsG0780041115.01.T01:CDS 30.0%
TCCAAATATAATACATCACC+TGG - Chr7:86772315-86772334 None:intergenic 30.0%
TCTAAGTAATAGACACTCAT+AGG - Chr7:86773638-86773657 None:intergenic 30.0%
TGAATTGTTCGATCAATATG+TGG + Chr7:86774196-86774215 MsG0780041115.01.T01:intron 30.0%
TGGTACTGTACATATATTGT+TGG + Chr7:86772010-86772029 MsG0780041115.01.T01:intron 30.0%
TTAATTGTATCATAGTGACC+AGG + Chr7:86772294-86772313 MsG0780041115.01.T01:intron 30.0%
TTAGGGACTAAAAATGTTGA+TGG + Chr7:86771708-86771727 MsG0780041115.01.T01:intron 30.0%
TTATGCTAACAAGTACTCTT+AGG + Chr7:86772910-86772929 MsG0780041115.01.T01:intron 30.0%
TTATTTATTACCTTGTGGCT+AGG - Chr7:86775236-86775255 None:intergenic 30.0%
TTCAGTTATTGTAGTGTCTT+TGG + Chr7:86773483-86773502 MsG0780041115.01.T01:intron 30.0%
TTGAGATATATGTACCTACA+TGG - Chr7:86773759-86773778 None:intergenic 30.0%
TTTAGTCCCTAAAATGCTTA+AGG - Chr7:86771700-86771719 None:intergenic 30.0%
TTTATATTGTGAAGAATCCG+GGG - Chr7:86774696-86774715 None:intergenic 30.0%
! ATCACAACTTTGGAAAAGTT+AGG - Chr7:86772588-86772607 None:intergenic 30.0%
! ATTTTGTACAAAATCTGCGT+AGG - Chr7:86774438-86774457 None:intergenic 30.0%
! CTTCAATTTGCTTGGAATAA+GGG + Chr7:86773433-86773452 MsG0780041115.01.T01:intron 30.0%
! GTTTCAACATTGAAGCATTT+AGG + Chr7:86774371-86774390 MsG0780041115.01.T01:CDS 30.0%
! TACTATTCTTTTGATGTGTC+TGG + Chr7:86774632-86774651 MsG0780041115.01.T01:CDS 30.0%
! TCACAACTTTGGAAAAGTTA+GGG - Chr7:86772587-86772606 None:intergenic 30.0%
! TCTTCAATTTGCTTGGAATA+AGG + Chr7:86773432-86773451 MsG0780041115.01.T01:intron 30.0%
! TTGGCATAAGAATGATAATG+AGG + Chr7:86775495-86775514 MsG0780041115.01.T01:CDS 30.0%
!! CACTTGTTATATGTTTGCAT+TGG + Chr7:86772934-86772953 MsG0780041115.01.T01:intron 30.0%
!! TTCTTGATTTTGGTATGCTT+AGG + Chr7:86771470-86771489 MsG0780041115.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTAACTGAGTTTTGTTTAAC+GGG + Chr7:86772133-86772152 MsG0780041115.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTTATTTTTTGCCTTGGG+GGG + Chr7:86772744-86772763 MsG0780041115.01.T01:intron 30.0%
AAAGAGTGACATTGATGCAT+TGG - Chr7:86773052-86773071 None:intergenic 35.0%
AACTTGATAGGAAATTGAGC+TGG - Chr7:86774022-86774041 None:intergenic 35.0%
AATAACTGAATCAGACTCAG+GGG - Chr7:86773473-86773492 None:intergenic 35.0%
ACAATAACTGAATCAGACTC+AGG - Chr7:86773475-86773494 None:intergenic 35.0%
AGAAATCGAATCAAACTGGT+CGG + Chr7:86774962-86774981 MsG0780041115.01.T01:intron 35.0%
CAAAATTTATGGGACTCCTT+TGG + Chr7:86774452-86774471 MsG0780041115.01.T01:CDS 35.0%
CAATAACTGAATCAGACTCA+GGG - Chr7:86773474-86773493 None:intergenic 35.0%
CACGACAAAAAACTGTTCAA+TGG + Chr7:86771889-86771908 MsG0780041115.01.T01:intron 35.0%
CTGGAATCTTCTCAATATCA+TGG - Chr7:86774532-86774551 None:intergenic 35.0%
GAAAACAACATGTAAACCGT+CGG + Chr7:86772085-86772104 MsG0780041115.01.T01:intron 35.0%
GAATAACAAAGGAATGTAGG+AGG - Chr7:86773522-86773541 None:intergenic 35.0%
GATTTACAGAAGGTTAACAG+GGG + Chr7:86774728-86774747 MsG0780041115.01.T01:CDS 35.0%
GCTCAATTTCCTATCAAGTT+TGG + Chr7:86774022-86774041 MsG0780041115.01.T01:CDS 35.0%
GGATTTACAGAAGGTTAACA+GGG + Chr7:86774727-86774746 MsG0780041115.01.T01:CDS 35.0%
GTAGGTACATATATCTCAAG+TGG + Chr7:86773760-86773779 MsG0780041115.01.T01:intron 35.0%
GTTATTGTAGTGTCTTTGGT+TGG + Chr7:86773487-86773506 MsG0780041115.01.T01:intron 35.0%
TATGTGCACCGTGATTTAAT+CGG - Chr7:86775101-86775120 None:intergenic 35.0%
TCGTGAACTAGTCAATTATC+TGG - Chr7:86773599-86773618 None:intergenic 35.0%
TGCCTATACTTAAAATGTGC+AGG + Chr7:86774323-86774342 MsG0780041115.01.T01:intron 35.0%
TGCTACAGTTGCAAAACTTA+GGG + Chr7:86772774-86772793 MsG0780041115.01.T01:intron 35.0%
TGGATCAAGAACAAAGAATG+TGG - Chr7:86774227-86774246 None:intergenic 35.0%
TGGTCGATTGTAGCAATAAA+CGG - Chr7:86771504-86771523 None:intergenic 35.0%
TGGTTGAACCGATTAAATCA+CGG + Chr7:86775090-86775109 MsG0780041115.01.T01:intron 35.0%
TGTACATATATTGTTGGGGT+CGG + Chr7:86772016-86772035 MsG0780041115.01.T01:intron 35.0%
TGTTGACATGAAGAATGCAA+TGG + Chr7:86774829-86774848 MsG0780041115.01.T01:CDS 35.0%
TTAAAATGTGCAGGAGATCT+TGG + Chr7:86774332-86774351 MsG0780041115.01.T01:intron 35.0%
TTAATGCATCACATGCACTT+TGG + Chr7:86775470-86775489 MsG0780041115.01.T01:CDS 35.0%
! AAGAGCATAATGGTAAGAAG+TGG - Chr7:86773891-86773910 None:intergenic 35.0%
! AATACTTACAAAGCGTTCGT+AGG - Chr7:86774909-86774928 None:intergenic 35.0%
! ACAACTTTGGAAAAGTTAGG+GGG - Chr7:86772585-86772604 None:intergenic 35.0%
! CAAATGCCATTTGAAGAAAG+CGG + Chr7:86774593-86774612 MsG0780041115.01.T01:CDS 35.0%
! CACAACTTTGGAAAAGTTAG+GGG - Chr7:86772586-86772605 None:intergenic 35.0%
! CAGGTAATCACACTATTTTG+TGG - Chr7:86774247-86774266 None:intergenic 35.0%
! TGATTTAATCGGTTCAACCA+CGG - Chr7:86775090-86775109 None:intergenic 35.0%
!! ACAAAAATGGTTTTACGAGG+CGG - Chr7:86771527-86771546 None:intergenic 35.0%
!! ACATTGATGCATTGGTTAAG+AGG - Chr7:86773044-86773063 None:intergenic 35.0%
!! CTCCTGCACATTTTAAGTAT+AGG - Chr7:86774328-86774347 None:intergenic 35.0%
!!! GCGTTGATGTTGTTTTTACA+GGG + Chr7:86774873-86774892 MsG0780041115.01.T01:CDS 35.0%
AAAATCAAGAAAGCCAAGCC+TGG - Chr7:86771461-86771480 None:intergenic 40.0%
AAGATCGTGAGGGACAAAAA+TGG - Chr7:86771540-86771559 None:intergenic 40.0%
AATAGTGATATCTCCGGCTT+AGG - Chr7:86775412-86775431 None:intergenic 40.0%
AATGTACTGTTGCTGGAGTT+GGG - Chr7:86773823-86773842 None:intergenic 40.0%
ACAGTCTACTACTACCGTTT+GGG + Chr7:86773962-86773981 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
ACTCCAGCAACAGTACATTA+TGG + Chr7:86773824-86773843 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
ACTTAACATTACCAAAGGCG+AGG + Chr7:86775296-86775315 MsG0780041115.01.T01:intron 40.0%
AGCATAATGGTAAGAAGTGG+TGG - Chr7:86773888-86773907 None:intergenic 40.0%
AGGGGCTAAAATCACAACTT+TGG - Chr7:86772598-86772617 None:intergenic 40.0%
AGTAGACTGTATTAGGCTTG+AGG - Chr7:86773952-86773971 None:intergenic 40.0%
ATGAGTCATCAAGATCGTGA+GGG - Chr7:86771550-86771569 None:intergenic 40.0%
ATTTAGCATAGCACCTGTTG+TGG - Chr7:86771575-86771594 None:intergenic 40.0%
CAAACAGAGTCACTAACAAC+AGG - Chr7:86775523-86775542 None:intergenic 40.0%
CATTATGCTCTTTACGAGTC+TGG + Chr7:86773899-86773918 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
CATTCACAGCATACAATGCA+AGG + Chr7:86774567-86774586 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
CCAACTACTCCAAACTTGAT+AGG - Chr7:86774034-86774053 None:intergenic 40.0%
CGGTAGTAGTAGACTGTATT+AGG - Chr7:86773959-86773978 None:intergenic 40.0%
CTACAGTTGCAAAACTTAGG+GGG + Chr7:86772776-86772795 MsG0780041115.01.T01:intron 40.0%
CTGCTACAGTTGCAAAACTT+AGG + Chr7:86772773-86772792 MsG0780041115.01.T01:intron 40.0%
CTGTTGTTAGTGACTCTGTT+TGG + Chr7:86775521-86775540 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
CTTGCATTGTATGCTGTGAA+TGG - Chr7:86774569-86774588 None:intergenic 40.0%
GACATGAAGAATGCAATGGA+AGG + Chr7:86774833-86774852 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
GCTACAGTTGCAAAACTTAG+GGG + Chr7:86772775-86772794 MsG0780041115.01.T01:intron 40.0%
GGCGTTCATGTTATCATGTT+GGG + Chr7:86774653-86774672 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
GGGATTTACAGAAGGTTAAC+AGG + Chr7:86774726-86774745 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
GTAGACTGTATTAGGCTTGA+GGG - Chr7:86773951-86773970 None:intergenic 40.0%
GTCCAGTGCATATTGTCATT+GGG + Chr7:86775190-86775209 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
TAACAGGGGAAAAACTCCTT+GGG + Chr7:86774742-86774761 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
TAAGATTGTGTGAGCCATGT+AGG + Chr7:86773742-86773761 MsG0780041115.01.T01:intron 40.0%
TAATGTACTGTTGCTGGAGT+TGG - Chr7:86773824-86773843 None:intergenic 40.0%
TACAGTCTACTACTACCGTT+TGG + Chr7:86773961-86773980 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
TACTATATACACCTCGCCTT+TGG - Chr7:86775310-86775329 None:intergenic 40.0%
TAGACTGTATTAGGCTTGAG+GGG - Chr7:86773950-86773969 None:intergenic 40.0%
TCCAGTGCATATTGTCATTG+GGG + Chr7:86775191-86775210 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
TCCCTGAATAGTGATATCTC+CGG - Chr7:86775418-86775437 None:intergenic 40.0%
TCTGATCCGCTTTCTTCAAA+TGG - Chr7:86774602-86774621 None:intergenic 40.0%
TGGCGTTCATGTTATCATGT+TGG + Chr7:86774652-86774671 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
TGTAGTGTCTTTGGTTGGAA+GGG + Chr7:86773492-86773511 MsG0780041115.01.T01:intron 40.0%
TGTATGTGGTGTGTGATGAT+AGG + Chr7:86775377-86775396 MsG0780041115.01.T01:intron 40.0%
TGTCACAGGTGCAAAACTTA+GGG - Chr7:86772645-86772664 None:intergenic 40.0%
TTAACAGGGGAAAAACTCCT+TGG + Chr7:86774741-86774760 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
TTGTAGTGTCTTTGGTTGGA+AGG + Chr7:86773491-86773510 MsG0780041115.01.T01:intron 40.0%
TTTGTCATATAGGTCAACCG+TGG + Chr7:86775070-86775089 MsG0780041115.01.T01:intron 40.0%
! CAGACTCGTAAAGAGCATAA+TGG - Chr7:86773901-86773920 None:intergenic 40.0%
! CCTATCAAGTTTGGAGTAGT+TGG + Chr7:86774031-86774050 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
! TTCAAGGGAACACATTTTCC+AGG + Chr7:86771440-86771459 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
! TTTTGCACCTGTGACAGTTT+TGG + Chr7:86772649-86772668 MsG0780041115.01.T01:intron 40.0%
! TTTTTGCTGAGTCACCCAAA+CGG - Chr7:86773979-86773998 None:intergenic 40.0%
!! AGGCTTGGCTTTCTTGATTT+TGG + Chr7:86771460-86771479 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
!! GGGACAAAAATGGTTTTACG+AGG - Chr7:86771530-86771549 None:intergenic 40.0%
!!! AGTTTTGTTTAACGGGATGC+TGG + Chr7:86772140-86772159 MsG0780041115.01.T01:intron 40.0%
!!! CGCGTTGATGTTGTTTTTAC+AGG + Chr7:86774872-86774891 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
!!! TTCTTATACCGATTTTGCCC+CGG + Chr7:86774676-86774695 MsG0780041115.01.T01:CDS 40.0%
AAACCGTCGGCAGTTAAGAA+TGG + Chr7:86772098-86772117 MsG0780041115.01.T01:intron 45.0%
AACCGTCGGCAGTTAAGAAT+GGG + Chr7:86772099-86772118 MsG0780041115.01.T01:intron 45.0%
AACTAGACTACGGAGTAACC+AGG - Chr7:86775008-86775027 None:intergenic 45.0%
AACTGGTCGGATCAATCAGT+TGG + Chr7:86774975-86774994 MsG0780041115.01.T01:intron 45.0%
AATGGCTCTTTGTGGACAAC+TGG - Chr7:86774551-86774570 None:intergenic 45.0%
ACTAGACTACGGAGTAACCA+GGG - Chr7:86775007-86775026 None:intergenic 45.0%
AGCCGGAGATATCACTATTC+AGG + Chr7:86775413-86775432 MsG0780041115.01.T01:CDS 45.0%
AGCGTAGACCGAGTCAAAAT+TGG - Chr7:86772684-86772703 None:intergenic 45.0%
AGGTGGAGAAGACAACAACA+TGG + Chr7:86772044-86772063 MsG0780041115.01.T01:intron 45.0%
ATATCTCCGGCTTAGGATCT+TGG - Chr7:86775405-86775424 None:intergenic 45.0%
ATGCTGTGAATGGCTCTTTG+TGG - Chr7:86774559-86774578 None:intergenic 45.0%
CAATCAGTTGGATTTGACCC+TGG + Chr7:86774987-86775006 MsG0780041115.01.T01:intron 45.0%
CATATTGTCATTGGGGATGG+AGG + Chr7:86775198-86775217 MsG0780041115.01.T01:CDS 45.0%
CCAGCACTTCAACTAGACTA+CGG - Chr7:86775018-86775037 None:intergenic 45.0%
CGCAACTTCGTGAGAGTTAA+GGG + Chr7:86772834-86772853 MsG0780041115.01.T01:intron 45.0%
CTGTCACAGGTGCAAAACTT+AGG - Chr7:86772646-86772665 None:intergenic 45.0%
GAGATCTTGGACAAACAGAG+TGG + Chr7:86774345-86774364 MsG0780041115.01.T01:CDS 45.0%
GATGAGTCATCAAGATCGTG+AGG - Chr7:86771551-86771570 None:intergenic 45.0%
GCAACTTCGTGAGAGTTAAG+GGG + Chr7:86772835-86772854 MsG0780041115.01.T01:intron 45.0%
GCCGGAGATATCACTATTCA+GGG + Chr7:86775414-86775433 MsG0780041115.01.T01:CDS 45.0%
GCTTCAAGGGGATTTACAGA+AGG + Chr7:86774718-86774737 MsG0780041115.01.T01:CDS 45.0%
GGAGATATCACTATTCAGGG+AGG + Chr7:86775417-86775436 MsG0780041115.01.T01:CDS 45.0%
GGCAGTTAAGAATGGGAAGT+GGG + Chr7:86772106-86772125 MsG0780041115.01.T01:intron 45.0%
GGTCCAGTGCATATTGTCAT+TGG + Chr7:86775189-86775208 MsG0780041115.01.T01:CDS 45.0%
GTCACAGGTGCAAAACTTAG+GGG - Chr7:86772644-86772663 None:intergenic 45.0%
GTGCATATTGTCATTGGGGA+TGG + Chr7:86775195-86775214 MsG0780041115.01.T01:CDS 45.0%
TAATGAAGCTCATCAGGGTG+AGG + Chr7:86774799-86774818 MsG0780041115.01.T01:CDS 45.0%
TAGGTACCAAGATCCTAAGC+CGG + Chr7:86775396-86775415 MsG0780041115.01.T01:intron 45.0%
TATTGTTGGGGTCGGTGAAT+AGG + Chr7:86772024-86772043 MsG0780041115.01.T01:intron 45.0%
TCACAGCATACAATGCAAGG+TGG + Chr7:86774570-86774589 MsG0780041115.01.T01:CDS 45.0%
TCACAGGTGCAAAACTTAGG+GGG - Chr7:86772643-86772662 None:intergenic 45.0%
TCCCCAATGACAATATGCAC+TGG - Chr7:86775195-86775214 None:intergenic 45.0%
TCGCAACTTCGTGAGAGTTA+AGG + Chr7:86772833-86772852 MsG0780041115.01.T01:intron 45.0%
TGAAGAATCCGGGGCAAAAT+CGG - Chr7:86774687-86774706 None:intergenic 45.0%
TGGTTCAACCAAACGACCAA+AGG - Chr7:86774471-86774490 None:intergenic 45.0%
TTCCCATTCTTAACTGCCGA+CGG - Chr7:86772104-86772123 None:intergenic 45.0%
TTTCCTGTAGTGACCATCCA+TGG - Chr7:86774509-86774528 None:intergenic 45.0%
! CTTTGGACATGGAGTACTAG+AGG + Chr7:86775444-86775463 MsG0780041115.01.T01:CDS 45.0%
! TCACATGCGTTGATGTTACG+TGG + Chr7:86771990-86772009 MsG0780041115.01.T01:intron 45.0%
!! AAAATGGTTTTACGAGGCGG+TGG - Chr7:86771524-86771543 None:intergenic 45.0%
!! ACCGAGTCAAAATTGGCCTT+GGG - Chr7:86772677-86772696 None:intergenic 45.0%
!! CATCACATGCACTTTGGAGT+TGG + Chr7:86775476-86775495 MsG0780041115.01.T01:CDS 45.0%
AACACGTGGCACCTCACTTA+GGG - Chr7:86772716-86772735 None:intergenic 50.0%
ATGGGACTCCTTTGGTCGTT+TGG + Chr7:86774460-86774479 MsG0780041115.01.T01:CDS 50.0%
CAGTTGCAAAACTTAGGGGG+CGG + Chr7:86772779-86772798 MsG0780041115.01.T01:intron 50.0%
CATATGCAAGCCAACGTCCA+TGG + Chr7:86774489-86774508 MsG0780041115.01.T01:CDS 50.0%
CCGTAGTCTAGTTGAAGTGC+TGG + Chr7:86775015-86775034 MsG0780041115.01.T01:intron 50.0%
CGGCAGTTAAGAATGGGAAG+TGG + Chr7:86772105-86772124 MsG0780041115.01.T01:intron 50.0%
GCAAACGCACTTTCTGCTAC+TGG + Chr7:86773860-86773879 MsG0780041115.01.T01:CDS 50.0%
GGGAAAAACTCCTTGGGTAG+TGG + Chr7:86774748-86774767 MsG0780041115.01.T01:CDS 50.0%
GGGCCATAATGTACTGTTGC+TGG - Chr7:86773830-86773849 None:intergenic 50.0%
TAACACGTGGCACCTCACTT+AGG - Chr7:86772717-86772736 None:intergenic 50.0%
TAGTGACCATCCATGGACGT+TGG - Chr7:86774502-86774521 None:intergenic 50.0%
TCTGCGTAGGATAAGTCTCC+TGG - Chr7:86774425-86774444 None:intergenic 50.0%
TGAACCAACACCACTACCCA+AGG - Chr7:86774761-86774780 None:intergenic 50.0%
TGATGACTCATCGCCACAAC+AGG + Chr7:86771559-86771578 MsG0780041115.01.T01:CDS 50.0%
! AACTCCTTGGGTAGTGGTGT+TGG + Chr7:86774754-86774773 MsG0780041115.01.T01:CDS 50.0%
! AGTGCGTTTGCTGAAGGAGA+TGG - Chr7:86773851-86773870 None:intergenic 50.0%
! GACCGAGTCAAAATTGGCCT+TGG - Chr7:86772678-86772697 None:intergenic 50.0%
! GCAGAAAGTGCGTTTGCTGA+AGG - Chr7:86773857-86773876 None:intergenic 50.0%
! GGGAACACATTTTCCAGGCT+TGG + Chr7:86771445-86771464 MsG0780041115.01.T01:CDS 50.0%
! GTGCGTTTGCTGAAGGAGAT+GGG - Chr7:86773850-86773869 None:intergenic 50.0%
! TGGACATGGAGTACTAGAGG+TGG + Chr7:86775447-86775466 MsG0780041115.01.T01:CDS 50.0%
!! CATGGACGTTGGCTTGCATA+TGG - Chr7:86774491-86774510 None:intergenic 50.0%
!! CCGAGTCAAAATTGGCCTTG+GGG - Chr7:86772676-86772695 None:intergenic 50.0%
!! CGAGTCAAAATTGGCCTTGG+GGG - Chr7:86772675-86772694 None:intergenic 50.0%
!! CTATTCAGGGAGGCTAGCTT+TGG + Chr7:86775427-86775446 MsG0780041115.01.T01:CDS 50.0%
!! TGGTGTTGGTTCATGCTCCT+TGG + Chr7:86774768-86774787 MsG0780041115.01.T01:CDS 50.0%
!!! CCCCAAGGCCAATTTTGACT+CGG + Chr7:86772673-86772692 MsG0780041115.01.T01:intron 50.0%
AGCTTTACAAGCGGGGTCAG+AGG - Chr7:86775560-86775579 None:intergenic 55.0%
ATCGTGAAGGCCTAGCCACA+AGG + Chr7:86775223-86775242 MsG0780041115.01.T01:CDS 55.0%
CAGGTGCAAAACTTAGGGGG+TGG - Chr7:86772640-86772659 None:intergenic 55.0%
CGTCCATGGATGGTCACTAC+AGG + Chr7:86774503-86774522 MsG0780041115.01.T01:CDS 55.0%
TACAAGCGGGGTCAGAGGAA+AGG - Chr7:86775555-86775574 None:intergenic 55.0%
TGCAAGCCAACGTCCATGGA+TGG + Chr7:86774493-86774512 MsG0780041115.01.T01:CDS 55.0%
TGTTGGGGTCGGTGAATAGG+TGG + Chr7:86772027-86772046 MsG0780041115.01.T01:intron 55.0%
TTGGGGGCCAAAACTGTCAC+AGG - Chr7:86772659-86772678 None:intergenic 55.0%
!! AGGGAGGCTAGCTTTGGACA+TGG + Chr7:86775433-86775452 MsG0780041115.01.T01:CDS 55.0%
!! GTAGCAGTTTTAGCCCCCCA+AGG - Chr7:86772760-86772779 None:intergenic 55.0%
!! TGTGACAGTTTTGGCCCCCA+AGG + Chr7:86772658-86772677 MsG0780041115.01.T01:intron 55.0%
CTGACGTGGCACCCTAAGTG+AGG + Chr7:86772702-86772721 MsG0780041115.01.T01:intron 60.0%
GGGGATGGAGGCAATCGTGA+AGG + Chr7:86775210-86775229 MsG0780041115.01.T01:CDS 60.0%
!! TGACTCGGTCTACGCTGACG+TGG + Chr7:86772688-86772707 MsG0780041115.01.T01:intron 60.0%
AGCGGGGTCAGAGGAAAGGC+TGG - Chr7:86775551-86775570 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 86771434 86775582 86771434 ID=MsG0780041115.01;Name=MsG0780041115.01
Chr7 mRNA 86771434 86775582 86771434 ID=MsG0780041115.01.T01;Parent=MsG0780041115.01;Name=MsG0780041115.01.T01;_AED=0.36;_eAED=0.38;_QI=0|0|0|1|1|1|5|0|427
Chr7 exon 86771434 86771580 86771434 ID=MsG0780041115.01.T01:exon:20323;Parent=MsG0780041115.01.T01
Chr7 exon 86773764 86774052 86773764 ID=MsG0780041115.01.T01:exon:20324;Parent=MsG0780041115.01.T01
Chr7 exon 86774345 86774919 86774345 ID=MsG0780041115.01.T01:exon:20325;Parent=MsG0780041115.01.T01
Chr7 exon 86775156 86775244 86775156 ID=MsG0780041115.01.T01:exon:20326;Parent=MsG0780041115.01.T01
Chr7 exon 86775399 86775582 86775399 ID=MsG0780041115.01.T01:exon:20327;Parent=MsG0780041115.01.T01
Chr7 CDS 86771434 86771580 86771434 ID=MsG0780041115.01.T01:cds;Parent=MsG0780041115.01.T01
Chr7 CDS 86773764 86774052 86773764 ID=MsG0780041115.01.T01:cds;Parent=MsG0780041115.01.T01
Chr7 CDS 86774345 86774919 86774345 ID=MsG0780041115.01.T01:cds;Parent=MsG0780041115.01.T01
Chr7 CDS 86775156 86775244 86775156 ID=MsG0780041115.01.T01:cds;Parent=MsG0780041115.01.T01
Chr7 CDS 86775399 86775582 86775399 ID=MsG0780041115.01.T01:cds;Parent=MsG0780041115.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780041115.01.T01

ATGAGATTCAAGGGAACACATTTTCCAGGCTTGGCTTTCTTGATTTTGGTATGCTTAGGATTTGACGCCGTTTATTGCTACAATCGACCACCGCCTCGTAAAACCATTTTTGTCCCTCACGATCTTGATGACTCATCGCCACAACAGGTACATATATCTCAAGTGGGCCAAGACAAGATGAGAATAACTTGGATAACTGAAAGCCCAACTCCAGCAACAGTACATTATGGCCCATCTCCTTCAGCAAACGCACTTTCTGCTACTGGAACCACCACTTCTTACCATTATGCTCTTTACGAGTCTGGTGAAATTCACAATGTCGTAATTGGTCCCCTCAAGCCTAATACAGTCTACTACTACCGTTTGGGTGACTCAGCAAAAACATACAATTTTAAGACTACACCAGCTCAATTTCCTATCAAGTTTGGAGTAGTTGGAGATCTTGGACAAACAGAGTGGACAGTTTCAACATTGAAGCATTTAGGTGACTCAAATTACGATATGCTATTATTACCAGGAGACTTATCCTACGCAGATTTTGTACAAAATTTATGGGACTCCTTTGGTCGTTTGGTTGAACCATATGCAAGCCAACGTCCATGGATGGTCACTACAGGAAACCATGATATTGAGAAGATTCCAGTTGTCCACAAAGAGCCATTCACAGCATACAATGCAAGGTGGCAAATGCCATTTGAAGAAAGCGGATCAGATTCTAACCTATACTATTCTTTTGATGTGTCTGGCGTTCATGTTATCATGTTGGGTTCTTATACCGATTTTGCCCCGGATTCTTCACAATATAAATGGCTTCAAGGGGATTTACAGAAGGTTAACAGGGGAAAAACTCCTTGGGTAGTGGTGTTGGTTCATGCTCCTTGGTATAATTCTAATGAAGCTCATCAGGGTGAGGCTGAATCTGTTGACATGAAGAATGCAATGGAAGGTTTGCTCTATAATGCTCGCGTTGATGTTGTTTTTACAGGGCATGTTCATGCCTACGAACGCTTTACACGGGTTTATAAAGATAAAGGTGACAATTGTGGTCCAGTGCATATTGTCATTGGGGATGGAGGCAATCGTGAAGGCCTAGCCACAAGGTACCAAGATCCTAAGCCGGAGATATCACTATTCAGGGAGGCTAGCTTTGGACATGGAGTACTAGAGGTGGTTAATGCATCACATGCACTTTGGAGTTGGCATAAGAATGATAATGAGGAACCTGTTGTTAGTGACTCTGTTTGGCTAACCAGCCTTTCCTCTGACCCCGCTTGTAAAGCTTGA
Protein sequence

>MsG0780041115.01.T01

MRFKGTHFPGLAFLILVCLGFDAVYCYNRPPPRKTIFVPHDLDDSSPQQVHISQVGQDKMRITWITESPTPATVHYGPSPSANALSATGTTTSYHYALYESGEIHNVVIGPLKPNTVYYYRLGDSAKTYNFKTTPAQFPIKFGVVGDLGQTEWTVSTLKHLGDSNYDMLLLPGDLSYADFVQNLWDSFGRLVEPYASQRPWMVTTGNHDIEKIPVVHKEPFTAYNARWQMPFEESGSDSNLYYSFDVSGVHVIMLGSYTDFAPDSSQYKWLQGDLQKVNRGKTPWVVVLVHAPWYNSNEAHQGEAESVDMKNAMEGLLYNARVDVVFTGHVHAYERFTRVYKDKGDNCGPVHIVIGDGGNREGLATRYQDPKPEISLFREASFGHGVLEVVNASHALWSWHKNDNEEPVVSDSVWLTSLSSDPACKA*