AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880044652.01

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MsG0880044652.01.T01 AT4G23210 57.459 181 75 1 509 689 348 526 2.95e-61 217
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MsG0880044652.01.T01 AT5G18610 39.032 310 182 4 491 793 49 358 5.28e-56 201
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MsG0880044652.01.T01 AT2G18470 38.908 293 168 4 509 795 272 559 8.19e-55 201
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MsG0880044652.01.T01 AT4G34440 39.384 292 170 5 508 795 299 587 6.64e-54 199
MsG0880044652.01.T01 AT4G33430 39.932 293 171 4 509 797 324 615 9.29e-54 198
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MsG0880044652.01.T01 AT5G45780 40.132 304 170 6 500 794 231 531 1.77e-53 196
MsG0880044652.01.T01 AT5G37450 35.854 357 213 7 456 804 361 709 1.83e-53 199
MsG0880044652.01.T01 AT3G18810 45.540 213 114 2 509 721 325 535 1.84e-53 198
MsG0880044652.01.T01 AT3G58690 37.884 293 175 4 506 792 72 363 1.84e-53 191
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MsG0880044652.01.T01 AT4G34500 37.374 297 182 3 509 802 133 428 2.25e-53 192
MsG0880044652.01.T01 AT1G21250 35.103 339 202 6 472 794 345 681 3.22e-53 198
MsG0880044652.01.T01 AT1G21240 36.120 299 182 4 503 797 397 690 3.23e-53 198
MsG0880044652.01.T01 AT3G25490 36.897 290 174 3 503 788 90 374 3.26e-53 191
MsG0880044652.01.T01 AT3G05140 40.203 296 169 6 509 802 179 468 3.33e-53 193
MsG0880044652.01.T01 AT1G61590 37.160 331 183 6 486 793 49 377 3.38e-53 191
MsG0880044652.01.T01 AT1G21210 35.862 290 185 1 503 792 392 680 3.53e-53 198
MsG0880044652.01.T01 AT5G45780 40.132 304 170 6 500 794 274 574 4.00e-53 196
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MsG0880044652.01.T01 AT2G43700 37.201 293 178 4 509 799 300 588 4.07e-53 196
MsG0880044652.01.T01 AT2G43700 37.201 293 178 4 509 799 300 588 4.07e-53 196
MsG0880044652.01.T01 AT2G43700 37.201 293 178 4 509 799 300 588 4.07e-53 196
MsG0880044652.01.T01 AT1G16260 33.333 327 210 2 508 827 368 693 4.10e-53 197
MsG0880044652.01.T01 AT1G16260 33.333 327 210 2 508 827 377 702 4.21e-53 197
MsG0880044652.01.T01 AT1G16260 33.333 327 210 2 508 827 377 702 4.21e-53 197
MsG0880044652.01.T01 AT4G30520 42.049 283 156 5 518 797 300 577 4.31e-53 196
MsG0880044652.01.T01 AT1G72300 38.144 291 171 5 502 789 787 1071 4.35e-53 201
MsG0880044652.01.T01 AT5G02070 38.621 290 169 4 508 788 350 639 4.56e-53 196
MsG0880044652.01.T01 AT2G43700 37.201 293 178 4 509 799 324 612 4.72e-53 196
MsG0880044652.01.T01 AT3G02810 36.810 326 195 7 506 826 49 368 5.63e-53 194
MsG0880044652.01.T01 AT2G39660 38.721 297 169 5 509 793 55 350 6.08e-53 189
MsG0880044652.01.T01 AT5G18910 38.754 289 169 6 509 796 180 461 7.51e-53 192
MsG0880044652.01.T01 AT2G26290 37.966 295 173 4 506 792 73 365 7.83e-53 190
MsG0880044652.01.T01 AT2G18470 45.540 213 114 2 509 721 272 482 9.33e-53 193
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MsG0880044652.01.T01 AT2G43690 37.075 294 177 6 509 799 325 613 1.67e-52 195
MsG0880044652.01.T01 AT2G43690 37.075 294 177 6 509 799 325 613 1.67e-52 195
MsG0880044652.01.T01 AT5G37450 35.854 357 213 7 456 804 564 912 1.81e-52 198
MsG0880044652.01.T01 AT5G37450 35.854 357 213 7 456 804 588 936 2.36e-52 198
MsG0880044652.01.T01 AT3G59740 37.124 299 175 5 509 799 321 614 2.38e-52 194
MsG0880044652.01.T01 AT5G16000 36.986 365 207 9 444 797 236 588 3.73e-52 193
MsG0880044652.01.T01 AT5G15730 36.120 299 178 5 491 788 85 371 5.00e-52 188
MsG0880044652.01.T01 AT5G15730 36.120 299 178 5 491 788 85 371 5.00e-52 188
MsG0880044652.01.T01 AT4G31110 37.037 297 182 4 508 802 440 733 6.26e-52 195
MsG0880044652.01.T01 AT4G31110 37.037 297 182 4 508 802 418 711 6.27e-52 194
MsG0880044652.01.T01 AT1G52540 34.663 326 196 6 508 824 24 341 6.28e-52 185
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MsG0880044652.01.T01 AT5G62710 35.294 357 210 11 457 799 206 555 7.11e-52 191
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MsG0880044652.01.T01 AT1G16110 36.228 334 190 9 399 721 312 633 1.17e-51 192
MsG0880044652.01.T01 AT5G62710 35.294 357 210 11 457 799 240 589 1.22e-51 191
MsG0880044652.01.T01 AT3G53840 38.811 286 166 3 508 785 341 625 1.50e-51 191
MsG0880044652.01.T01 AT4G31100 36.700 297 183 4 508 802 431 724 1.60e-51 194
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MsG0880044652.01.T01 AT4G29050 36.944 360 193 12 453 799 285 623 1.98e-51 192
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MsG0880044652.01.T01 AT4G29050 36.944 360 193 12 453 799 299 637 2.65e-51 191
MsG0880044652.01.T01 AT5G35580 38.047 297 174 5 505 793 72 366 2.67e-51 188
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MsG0880044652.01.T01 AT5G53890 37.545 277 171 2 514 789 747 1022 2.90e-51 195
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MsG0880044652.01.T01 AT5G11020 37.456 283 173 2 508 789 128 407 4.18e-51 186
MsG0880044652.01.T01 AT2G23950 40.141 284 162 5 517 797 295 573 5.07e-51 190
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MsG0880044652.01.T01 AT1G21240 37.918 269 158 4 530 794 163 426 7.45e-51 186
MsG0880044652.01.T01 AT3G28690 36.709 316 178 5 506 808 111 417 8.17e-51 186
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MsG0880044652.01.T01 AT3G09830 36.254 331 191 5 505 824 68 389 8.90e-51 184
MsG0880044652.01.T01 AT3G15890 34.122 296 194 1 501 795 19 314 9.39e-51 182
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MsG0880044652.01.T01 AT5G54590 38.571 280 158 5 516 793 110 377 9.71e-51 184
MsG0880044652.01.T01 AT5G54590 38.571 280 158 5 516 793 110 377 9.71e-51 184
MsG0880044652.01.T01 AT5G48740 34.375 352 216 5 447 792 535 877 1.16e-50 192
MsG0880044652.01.T01 AT4G18250 34.688 369 214 11 450 804 291 646 1.29e-50 189
MsG0880044652.01.T01 AT1G07570 36.066 305 182 4 500 792 47 350 1.36e-50 183
MsG0880044652.01.T01 AT1G07570 36.066 305 182 4 500 792 47 350 1.36e-50 183

Find 179 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 386 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AATTGTTCTTGTACAGCTTA+TGG 0.164466 8:+46609944 MsG0880044652.01.T01:CDS
TAACTTTGAGTTTCGTTTAA+TGG 0.182714 8:-46611048 None:intergenic
TTTGGTCTGGCTCGAATATT+TGG 0.194746 8:+46611496 MsG0880044652.01.T01:CDS
TCAGAACCGGCTGCTGTTAA+TGG 0.197736 8:+46610435 MsG0880044652.01.T01:intron
GGGAAACCTTGTGTTGAAAA+TGG 0.200782 8:+46609193 MsG0880044652.01.T01:CDS
CGTAATCTTGTGAAGCTTCT+TGG 0.221000 8:+46611131 MsG0880044652.01.T01:CDS
TGGAATGGCCTTGGATTTAC+AGG 0.230077 8:+46609440 MsG0880044652.01.T01:CDS
CTGCAGAGGTGTTTCTCTAT+TGG 0.262774 8:-46609033 None:intergenic
TTGTACAGCTTATGGAAATT+TGG 0.263246 8:+46609952 MsG0880044652.01.T01:CDS
GCCACCCAAACGACGGTTAA+AGG 0.263479 8:-46609011 None:intergenic
AATTCAAGAGGTCGATATTT+AGG 0.268165 8:+46608966 MsG0880044652.01.T01:CDS
AGCTTGGACTATTTCATCTT+TGG 0.272910 8:+46611209 MsG0880044652.01.T01:CDS
AAAATTGGGGAAGGTGGATT+TGG 0.282543 8:+46610887 MsG0880044652.01.T01:CDS
GAACACTCCCTCAACCTTCT+TGG 0.298925 8:+46611775 MsG0880044652.01.T01:CDS
ACCGAATACTCTCCCTTTGC+TGG 0.303145 8:-46609344 None:intergenic
GTCCACTTCAGGGAATTTGC+AGG 0.305559 8:+46609577 MsG0880044652.01.T01:CDS
CAGACTTTAGTTTCTGCTAA+TGG 0.306061 8:+46608909 MsG0880044652.01.T01:CDS
TCTCAACGTTCCTACATTAT+TGG 0.310764 8:+46611355 MsG0880044652.01.T01:CDS
ATGATTGACAAATTAAATAT+TGG 0.311050 8:-46610830 None:intergenic
AAATCAGATGTCTTTAGTTT+TGG 0.317093 8:+46611697 MsG0880044652.01.T01:CDS
TGAAGTGGACACAGAATAAA+TGG 0.319430 8:-46609564 None:intergenic
TGGATTTGGACCCGTTTATA+AGG 0.328853 8:+46610901 MsG0880044652.01.T01:CDS
ATTTATTCTGTGTCCACTTC+AGG 0.329962 8:+46609566 MsG0880044652.01.T01:CDS
TTTCTAGTGGAAACAAAATT+GGG 0.335420 8:+46610873 MsG0880044652.01.T01:CDS
AGAAGGTTGAGGGAGTGTTC+TGG 0.344196 8:-46611772 None:intergenic
TATGACATATTCCATTGTTC+AGG 0.346894 8:-46609758 None:intergenic
CCTTTGAGGCATTCACATCT+AGG 0.348418 8:-46609719 None:intergenic
CTTCTTGGTTGCTGTATAGA+AGG 0.352960 8:+46611146 MsG0880044652.01.T01:CDS
TTCCATCCAAGTTTCATTCC+TGG 0.356961 8:-46609269 None:intergenic
AGTGTGGGCGCAATTTCATT+TGG 0.363363 8:+46610486 MsG0880044652.01.T01:CDS
ATCACCTTTAACCGTCGTTT+GGG 0.363822 8:+46609007 MsG0880044652.01.T01:CDS
TGGTTATGTTACCTTATAAA+CGG 0.366719 8:-46610912 None:intergenic
GATATTTAGGTATGTGGTAT+AGG 0.370467 8:+46608979 MsG0880044652.01.T01:CDS
CTGACATTCGACAAGGTTCA+TGG 0.372013 8:-46609906 None:intergenic
TATCACCTTTAACCGTCGTT+TGG 0.380476 8:+46609006 MsG0880044652.01.T01:CDS
GGAAACCTTGTGTTGAAAAT+GGG 0.381885 8:+46609194 MsG0880044652.01.T01:CDS
TCCCTTCATAATAACTAGTT+GGG 0.382920 8:-46609390 None:intergenic
TGAAGCCAAAACTAAGAAAA+TGG 0.389964 8:+46611531 MsG0880044652.01.T01:CDS
GTGTGGGCGCAATTTCATTT+GGG 0.390322 8:+46610487 MsG0880044652.01.T01:CDS
TCTATGAATACATGCCTAAC+AGG 0.391570 8:+46611186 MsG0880044652.01.T01:CDS
TGACATCTGATTTGAGGATA+AGG 0.392100 8:-46612132 None:intergenic
GTCGGTTTCTTCCGTCCTCT+TGG 0.393283 8:+46608942 MsG0880044652.01.T01:CDS
ACTTAGTAACAGGTCTTAAC+CGG 0.402532 8:+46609291 MsG0880044652.01.T01:CDS
ATGGTGCAAACGAGACTATT+TGG 0.403291 8:+46609108 MsG0880044652.01.T01:CDS
TGCATCAGGTAAACCCCTTC+CGG 0.405185 8:-46612105 None:intergenic
CATCAAAACAAGAAGAAGAT+AGG 0.407003 8:+46610459 MsG0880044652.01.T01:CDS
TGTAAATCCAAGGCCATTCC+AGG 0.407993 8:-46609438 None:intergenic
TGCTAATTCTGTATGCAATA+TGG 0.411044 8:+46609685 MsG0880044652.01.T01:CDS
TGAAACAAGAAGCAAGCTCT+TGG 0.411477 8:+46611327 MsG0880044652.01.T01:CDS
TGCTCTTTCTGCCATGGAAA+TGG 0.412462 8:-46610776 None:intergenic
CTTGGATGGAACTTAGTAAC+AGG 0.414210 8:+46609281 MsG0880044652.01.T01:CDS
GTGGAAGTGGCTGTTTGCTT+TGG 0.417304 8:+46609987 MsG0880044652.01.T01:CDS
AACAATGGAATATGTCATAT+TGG 0.417333 8:+46609762 MsG0880044652.01.T01:CDS
TCCAGCAAAGGGAGAGTATT+CGG 0.417749 8:+46609343 MsG0880044652.01.T01:CDS
GGTTATGTTACCTTATAAAC+GGG 0.431389 8:-46610911 None:intergenic
ATCCCTTCATAATAACTAGT+TGG 0.431825 8:-46609391 None:intergenic
TTGCCTCAGCCGAAGATGCC+TGG 0.432193 8:+46612074 MsG0880044652.01.T01:CDS
GAAGGTTGAGGGAGTGTTCT+GGG 0.434875 8:-46611771 None:intergenic
GCCTCAAAGGTTATGTTCCT+AGG 0.436490 8:+46609732 MsG0880044652.01.T01:CDS
AGTTATTGACATCTGATTTG+AGG 0.437960 8:-46612138 None:intergenic
CATGAGGAAATTCTCTCAAT+GGG 0.440462 8:+46610027 MsG0880044652.01.T01:CDS
ATAAATTTAGAATGGGCTCC+TGG 0.442317 8:+46609420 MsG0880044652.01.T01:CDS
ATGGGCTCCTGGAATGGCCT+TGG 0.442490 8:+46609431 MsG0880044652.01.T01:CDS
TTTATTCTGTGTCCACTTCA+GGG 0.444421 8:+46609567 MsG0880044652.01.T01:CDS
ATTAATAACTGCGCAGCTGT+TGG 0.446577 8:+46609166 MsG0880044652.01.T01:CDS
AGTGGCTGTTTGCTTTGGTT+TGG 0.446591 8:+46609992 MsG0880044652.01.T01:CDS
TTCTGCTTCAATTGTTGAGT+TGG 0.447665 8:-46609467 None:intergenic
ATCTGTCAATAAATTTAGAA+TGG 0.455852 8:+46609412 MsG0880044652.01.T01:CDS
GATTCATATCGGAATCTAGT+AGG 0.458166 8:-46611459 None:intergenic
TTAACCGGTTTGTGACATCT+TGG 0.458440 8:+46609306 MsG0880044652.01.T01:CDS
GGAATTTGCAGGCTTTAGCT+TGG 0.463725 8:+46609588 MsG0880044652.01.T01:CDS
TCCCCAACTAGTTATTATGA+AGG 0.466278 8:+46609388 MsG0880044652.01.T01:CDS
GTGTAAAATCCAGGCATCTT+CGG 0.471236 8:-46612083 None:intergenic
GAGGATAAGGAAATTGCATC+AGG 0.472284 8:-46612119 None:intergenic
CCCCTTCCGGTGTAAAATCC+AGG 0.476088 8:-46612092 None:intergenic
ATCTTGAAACTCAATGCAAA+TGG 0.477931 8:+46609068 MsG0880044652.01.T01:CDS
TGATGCTTCTAGCACGGAAT+CGG 0.479341 8:+46606983 MsG0880044652.01.T01:CDS
ACATGAGGAAATTCTCTCAA+TGG 0.484516 8:+46610026 MsG0880044652.01.T01:CDS
GCTTCGGTACTAAATGAAAT+CGG 0.485080 8:+46610076 MsG0880044652.01.T01:CDS
CCATGTGATACATTATTGCC+AGG 0.495374 8:+46609251 MsG0880044652.01.T01:CDS
AACTCAAAGTTATCCGATCA+AGG 0.496415 8:+46611059 MsG0880044652.01.T01:CDS
TCTGTCAATAAATTTAGAAT+GGG 0.499278 8:+46609413 MsG0880044652.01.T01:CDS
TTGCAGTGGTTACATGCCTC+CGG 0.499286 8:+46611645 MsG0880044652.01.T01:intron
GAAACAAGAAGCAAGCTCTT+GGG 0.499372 8:+46611328 MsG0880044652.01.T01:CDS
CTTTGAGGCATTCACATCTA+GGG 0.499377 8:-46609718 None:intergenic
TGCCAGACACTTCTTCATCA+TGG 0.501384 8:+46609873 MsG0880044652.01.T01:CDS
ATTTCATTTAGTACCGAAGC+AGG 0.503642 8:-46610073 None:intergenic
TTATATCAGAGTCCCTGCTT+CGG 0.504583 8:+46610060 MsG0880044652.01.T01:CDS
CTAAAATGCTCTTTCTGCCA+TGG 0.505218 8:-46610782 None:intergenic
TATGTAGCAGTTCGAGTGAT+CGG 0.508338 8:-46611917 None:intergenic
TTATTGCCAGGAATGAAACT+TGG 0.509577 8:+46609263 MsG0880044652.01.T01:CDS
CCCCAACTAGTTATTATGAA+GGG 0.511096 8:+46609389 MsG0880044652.01.T01:CDS
TACCATGATGAAGAAGTGTC+TGG 0.511761 8:-46609875 None:intergenic
AGCCTGCAAATTCCCTGAAG+TGG 0.514909 8:-46609579 None:intergenic
AGAAGACATGTCTGGTCTAT+CGG 0.522253 8:-46612021 None:intergenic
ACCTAGGAACATAACCTTTG+AGG 0.524853 8:-46609733 None:intergenic
TTTAGAATGGGCTCCTGGAA+TGG 0.525240 8:+46609425 MsG0880044652.01.T01:CDS
ACCTTTAACCGTCGTTTGGG+TGG 0.526976 8:+46609010 MsG0880044652.01.T01:CDS
AAAGTTATCCGATCAAGGAT+TGG 0.528472 8:+46611064 MsG0880044652.01.T01:CDS
GATGTCAATAACTACATTTG+TGG 0.532466 8:+46612148 MsG0880044652.01.T01:CDS
AAATAGTCCAAGCTCCTGTT+AGG 0.535395 8:-46611200 None:intergenic
TCTCAAATTATGATCGGTGT+CGG 0.536083 8:+46606918 None:intergenic
TGCCAGGAATGAAACTTGGA+TGG 0.537055 8:+46609267 MsG0880044652.01.T01:CDS
GGAAACAAAATTGGGGAAGG+TGG 0.537303 8:+46610881 MsG0880044652.01.T01:CDS
CAACGTTCCTACATTATTGG+TGG 0.539834 8:+46611358 MsG0880044652.01.T01:CDS
GTCTTTAGATGCATACATGT+GGG 0.540507 8:+46611972 MsG0880044652.01.T01:CDS
GATGTCCGACATGGTGGAAG+TGG 0.540606 8:+46609974 MsG0880044652.01.T01:CDS
GTGAATCAGTCTATCCGAGA+TGG 0.541380 8:+46608885 MsG0880044652.01.T01:CDS
TGATGGCCATTAACAGCAGC+CGG 0.542318 8:-46610441 None:intergenic
CCTAGATGTGAATGCCTCAA+AGG 0.545122 8:+46609719 MsG0880044652.01.T01:CDS
TTACATGTCCAAGAAGGTTG+AGG 0.545410 8:-46611783 None:intergenic
GAAAGGATAGAATCTATTTG+TGG 0.545624 8:+46609806 MsG0880044652.01.T01:CDS
GACATGTCTGGTCTATCGGC+TGG 0.546102 8:-46612017 None:intergenic
GAGGTCGATATTTAGGTATG+TGG 0.548667 8:+46608973 MsG0880044652.01.T01:CDS
GGAGTTCTTGTGATTCTCAA+TGG 0.549996 8:+46609089 MsG0880044652.01.T01:CDS
AAACTCATCCAATCCTTGAT+CGG 0.550532 8:-46611072 None:intergenic
TTCCTAGGTTTCCTGAACAA+TGG 0.551536 8:+46609747 MsG0880044652.01.T01:CDS
CTCTTGAATTTCCAAGAGGA+CGG 0.554160 8:-46608953 None:intergenic
ATACATGCCTAACAGGAGCT+TGG 0.554791 8:+46611193 MsG0880044652.01.T01:CDS
CAAGAAGCAAGCTCTTGGGC+TGG 0.555721 8:+46611332 MsG0880044652.01.T01:CDS
TACATGTCCAAGAAGGTTGA+GGG 0.556064 8:-46611782 None:intergenic
AACTGCGCAGCTGTTGGACA+CGG 0.557296 8:+46609172 MsG0880044652.01.T01:CDS
AATCCAGGCATCTTCGGCTG+AGG 0.559630 8:-46612077 None:intergenic
ATCATCTCGCACCATTTCCA+TGG 0.562002 8:+46610765 MsG0880044652.01.T01:CDS
ATTATTGGTGGCATTGCTAG+AGG 0.565498 8:+46611370 MsG0880044652.01.T01:CDS
TAGATTGATACAGGAAGACA+TGG 0.565601 8:+46610802 MsG0880044652.01.T01:CDS
CGTCCTCTTGGAAATTCAAG+AGG 0.567916 8:+46608954 MsG0880044652.01.T01:CDS
AAACTAAAGTCTGCCCATCT+CGG 0.572624 8:-46608899 None:intergenic
TACACTGACAGATGGAAAAG+AGG 0.574649 8:+46611022 MsG0880044652.01.T01:CDS
CCTGGCAATAATGTATCACA+TGG 0.575803 8:-46609251 None:intergenic
GAATCTATTTGTGGAGACAA+TGG 0.577183 8:+46609815 MsG0880044652.01.T01:CDS
TTTCAGGGTACACTGACAGA+TGG 0.579863 8:+46611014 MsG0880044652.01.T01:intron
GCCAAAACTAAGAAAATGGT+CGG 0.585698 8:+46611535 MsG0880044652.01.T01:CDS
GCGGCTGTGTTTGTGTTGAA+AGG 0.586278 8:+46609789 MsG0880044652.01.T01:CDS
TAATTCTCAATCTTGAGTCA+TGG 0.587578 8:-46611408 None:intergenic
TGAATCAGTCTATCCGAGAT+GGG 0.587668 8:+46608886 MsG0880044652.01.T01:CDS
AGCAATGCCACCAATAATGT+AGG 0.589417 8:-46611365 None:intergenic
TAATTCTGTATGCAATATGG+AGG 0.589473 8:+46609688 MsG0880044652.01.T01:CDS
AGTGCAGATGATCCAGCAAA+GGG 0.591111 8:+46609332 MsG0880044652.01.T01:CDS
TCTGTCATTCTTATGCTGAA+CGG 0.592019 8:+46612041 MsG0880044652.01.T01:CDS
CTGCGCTTACATGTCCAAGA+AGG 0.597830 8:-46611789 None:intergenic
CAATAGAATAGTTATCTACA+CGG 0.602165 8:+46609625 MsG0880044652.01.T01:CDS
AGTTATCTACACGGGTGGAG+AGG 0.604143 8:+46609634 MsG0880044652.01.T01:CDS
TTAATAATACTTAGAAAGCG+AGG 0.605177 8:+46610528 MsG0880044652.01.T01:CDS
TGGTTGCTGTATAGAAGGAG+AGG 0.606133 8:+46611151 MsG0880044652.01.T01:CDS
AGAATGACAGAAGACATGTC+TGG 0.606190 8:-46612029 None:intergenic
CCCTTCATAATAACTAGTTG+GGG 0.609778 8:-46609389 None:intergenic
CCTCCGGAGTATGCTGTGCA+TGG 0.613556 8:+46611661 MsG0880044652.01.T01:CDS
TTGGATATCCTGTAAATCCA+AGG 0.613745 8:-46609448 None:intergenic
TGGCCATGCACAGCATACTC+CGG 0.613767 8:-46611664 None:intergenic
TTCCATTGTTCAGGAAACCT+AGG 0.617907 8:-46609749 None:intergenic
AAGTGCAGATGATCCAGCAA+AGG 0.618621 8:+46609331 MsG0880044652.01.T01:CDS
TAGTACTAGAGATAATCAGC+GGG 0.621079 8:+46611725 MsG0880044652.01.T01:CDS
GAAACCTTGTGTTGAAAATG+GGG 0.622576 8:+46609195 MsG0880044652.01.T01:CDS
TTTCATTTAGTACCGAAGCA+GGG 0.624377 8:-46610072 None:intergenic
AACAGCCACTTCCACCATGT+CGG 0.628347 8:-46609979 None:intergenic
AGTCTTTAGATGCATACATG+TGG 0.628931 8:+46611971 MsG0880044652.01.T01:CDS
TTCTAGTGGAAACAAAATTG+GGG 0.636579 8:+46610874 MsG0880044652.01.T01:CDS
ACTGCGCAGCTGTTGGACAC+GGG 0.636969 8:+46609173 MsG0880044652.01.T01:CDS
TGAGTATGATGCTTCTAGCA+CGG 0.638506 8:+46606977 MsG0880044652.01.T01:CDS
AGAATAGTTATCTACACGGG+TGG 0.640519 8:+46609629 MsG0880044652.01.T01:CDS
TCTATTGGCCACCCAAACGA+CGG 0.640627 8:-46609018 None:intergenic
CGACCTCTTGAATTTCCAAG+AGG 0.640631 8:-46608957 None:intergenic
GGAAATTTGGATGTCCGACA+TGG 0.642863 8:+46609965 MsG0880044652.01.T01:CDS
GTCGTCTAACATGTCAAACA+AGG 0.646094 8:+46609130 MsG0880044652.01.T01:CDS
AGTGGAAACAAAATTGGGGA+AGG 0.647107 8:+46610878 MsG0880044652.01.T01:CDS
AATAGAATAGTTATCTACAC+GGG 0.648656 8:+46609626 MsG0880044652.01.T01:CDS
TCAATCTTGAGTCATGGTGA+AGG 0.650213 8:-46611402 None:intergenic
AATTCTGTATGCAATATGGA+GGG 0.653720 8:+46609689 MsG0880044652.01.T01:CDS
AATATGTCATATTGGTCTAG+CGG 0.659842 8:+46609770 MsG0880044652.01.T01:CDS
TTGGTGATCTAGTTGACATG+AGG 0.683306 8:+46610011 MsG0880044652.01.T01:CDS
AATTTGGATGTCCGACATGG+TGG 0.684330 8:+46609968 MsG0880044652.01.T01:CDS
AAGAAGATAGGAATCAGTGT+GGG 0.685166 8:+46610471 MsG0880044652.01.T01:CDS
CCATGCACAGCATACTCCGG+AGG 0.690892 8:-46611661 None:intergenic
ATGACTTCTGACATTCGACA+AGG 0.694175 8:-46609913 None:intergenic
TTAGTACTAGAGATAATCAG+CGG 0.694299 8:+46611724 MsG0880044652.01.T01:CDS
TGTGATAATTACGCTATGTG+TGG 0.701494 8:+46609662 MsG0880044652.01.T01:CDS
GAAGAAGATAGGAATCAGTG+TGG 0.712092 8:+46610470 MsG0880044652.01.T01:CDS
ATGAGGAAATTCTCTCAATG+GGG 0.717359 8:+46610028 MsG0880044652.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAAATAGTTATACTAATAT+GGG - Chr8:46610153-46610172 None:intergenic 10.0%
!! ATAATCTACTATATTAAATT+TGG + Chr8:46607948-46607967 MsG0880044652.01.T01:intron 10.0%
!! TAATCTACTATATTAAATTT+GGG + Chr8:46607949-46607968 MsG0880044652.01.T01:intron 10.0%
!!! AAAAATAAGTTTTAAAACAA+AGG - Chr8:46610299-46610318 None:intergenic 10.0%
!!! ATATTAATATTTTGTTTAAG+TGG + Chr8:46608143-46608162 MsG0880044652.01.T01:intron 10.0%
!! AGTTATAAATTAATGTTAGT+TGG - Chr8:46607409-46607428 None:intergenic 15.0%
!! ATGATTGACAAATTAAATAT+TGG - Chr8:46610833-46610852 None:intergenic 15.0%
!! ATTATATTCGCTATTAATTA+TGG - Chr8:46608414-46608433 None:intergenic 15.0%
!! GAAAAATAGTTATACTAATA+TGG - Chr8:46610154-46610173 None:intergenic 15.0%
!! GTTATAAATTAATGTTAGTT+GGG - Chr8:46607408-46607427 None:intergenic 15.0%
!! TTATAAATTAATGTTAGTTG+GGG - Chr8:46607407-46607426 None:intergenic 15.0%
!! TTATATTCGCTATTAATTAT+GGG - Chr8:46608413-46608432 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTTGCATTAAAAATTGTA+CGG - Chr8:46608069-46608088 None:intergenic 15.0%
!! AAAAAAAAAGAAGCAAAGAA+CGG + Chr8:46607743-46607762 MsG0880044652.01.T01:intron 20.0%
!! AAATATTAACCGGTATTAAA+GGG - Chr8:46608390-46608409 None:intergenic 20.0%
!! AATATAATAATTTGAGAGTG+GGG + Chr8:46608426-46608445 MsG0880044652.01.T01:intron 20.0%
!! ACAAAAAATAAAATATGCGT+CGG - Chr8:46607846-46607865 None:intergenic 20.0%
!! AGGATAATAAAAAGCAAAAA+AGG - Chr8:46608830-46608849 None:intergenic 20.0%
!! ATAAACATCTTCATTGTATA+TGG - Chr8:46610935-46610954 None:intergenic 20.0%
!! ATCTGTCAATAAATTTAGAA+TGG + Chr8:46609412-46609431 MsG0880044652.01.T01:CDS 20.0%
!! CTTGTTAAAGAATTAAATGA+TGG + Chr8:46607047-46607066 MsG0880044652.01.T01:intron 20.0%
!! GAATATAATAATTTGAGAGT+GGG + Chr8:46608425-46608444 MsG0880044652.01.T01:intron 20.0%
!! TAATTATGGGAAATATTAAC+CGG - Chr8:46608400-46608419 None:intergenic 20.0%
!! TATCTAATTAACCACATTAA+GGG + Chr8:46611272-46611291 MsG0880044652.01.T01:intron 20.0%
!! TATGATTAATTTATCCAGTA+AGG - Chr8:46610560-46610579 None:intergenic 20.0%
!! TTATCTAATTAACCACATTA+AGG + Chr8:46611271-46611290 MsG0880044652.01.T01:intron 20.0%
!!! AACTTTCATAAGAGTTTTAA+CGG + Chr8:46607531-46607550 MsG0880044652.01.T01:intron 20.0%
!!! AAGACATAGTTTCTTTTTTT+GGG - Chr8:46608012-46608031 None:intergenic 20.0%
!!! ATATTTATCTAGTCTTTGTT+TGG + Chr8:46607627-46607646 MsG0880044652.01.T01:intron 20.0%
!!! CTATTTTAAAACTAGTTGAA+CGG + Chr8:46611819-46611838 MsG0880044652.01.T01:intron 20.0%
!!! TCTGTCAATAAATTTAGAAT+GGG + Chr8:46609413-46609432 MsG0880044652.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTCTTTATTCTAACAAGT+AGG + Chr8:46610169-46610188 MsG0880044652.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTCTTTCTTTCTAACTTA+GGG - Chr8:46607709-46607728 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTTCTTTCTTTCTAACTT+AGG - Chr8:46607710-46607729 None:intergenic 20.0%
! AACAATGGAATATGTCATAT+TGG + Chr8:46609762-46609781 MsG0880044652.01.T01:CDS 25.0%
! AATAGAATAGTTATCTACAC+GGG + Chr8:46609626-46609645 MsG0880044652.01.T01:CDS 25.0%
! AATATTAACCGGTATTAAAG+GGG - Chr8:46608389-46608408 None:intergenic 25.0%
! ACAAAAAAACTTGGGTAAAA+TGG - Chr8:46607446-46607465 None:intergenic 25.0%
! ATCTAATTAACCACATTAAG+GGG + Chr8:46611273-46611292 MsG0880044652.01.T01:intron 25.0%
! CAATAGAATAGTTATCTACA+CGG + Chr8:46609625-46609644 MsG0880044652.01.T01:CDS 25.0%
! CCTAGAATAGAATTGAATTT+GGG - Chr8:46608681-46608700 None:intergenic 25.0%
! CGAATATAATAATTTGAGAG+TGG + Chr8:46608424-46608443 MsG0880044652.01.T01:intron 25.0%
! CGACTTAAACAAAAAAACTT+GGG - Chr8:46607454-46607473 None:intergenic 25.0%
! CTAGAATAGAATTGAATTTG+GGG - Chr8:46608680-46608699 None:intergenic 25.0%
! GAAATATTAACCGGTATTAA+AGG - Chr8:46608391-46608410 None:intergenic 25.0%
! GTAGATTATACGAGTATAAT+CGG - Chr8:46607937-46607956 None:intergenic 25.0%
! TAAAGAATTAAATGATGGCT+AGG + Chr8:46607052-46607071 MsG0880044652.01.T01:intron 25.0%
! TAGGTTAAATGTGAAGATAA+TGG + Chr8:46607071-46607090 MsG0880044652.01.T01:intron 25.0%
! TAGTTATACTAATATGGGAA+AGG - Chr8:46610148-46610167 None:intergenic 25.0%
! TCCTAGAATAGAATTGAATT+TGG - Chr8:46608682-46608701 None:intergenic 25.0%
! TCTTCATACGAGATTAAAAA+GGG - Chr8:46610322-46610341 None:intergenic 25.0%
! TTAATAATACTTAGAAAGCG+AGG + Chr8:46610528-46610547 MsG0880044652.01.T01:CDS 25.0%
! TTGATCCCTTAAAGAAATAA+AGG + Chr8:46608191-46608210 MsG0880044652.01.T01:intron 25.0%
!! AAAAACCATCATTTGGAATA+TGG - Chr8:46610997-46611016 None:intergenic 25.0%
!! AAAACCATCATTTGGAATAT+GGG - Chr8:46610996-46611015 None:intergenic 25.0%
!! AAGTATATCGACAAATGTTT+TGG + Chr8:46608536-46608555 MsG0880044652.01.T01:intron 25.0%
!! AGACTATAAGCAACTTTTAA+TGG + Chr8:46608580-46608599 MsG0880044652.01.T01:intron 25.0%
!! ATGTACTTTAAAGAGATTAC+AGG + Chr8:46607190-46607209 MsG0880044652.01.T01:intron 25.0%
!! CATCTGATTTTATAGAGTAA+TGG - Chr8:46611687-46611706 None:intergenic 25.0%
!! GACTATAAGCAACTTTTAAT+GGG + Chr8:46608581-46608600 MsG0880044652.01.T01:intron 25.0%
!! TAACTTTGAGTTTCGTTTAA+TGG - Chr8:46611051-46611070 None:intergenic 25.0%
!! TGTTATCTTATACTTTTCAG+TGG + Chr8:46610730-46610749 MsG0880044652.01.T01:intron 25.0%
!! TTCTATGTAGATAAGTGTTT+TGG - Chr8:46608747-46608766 None:intergenic 25.0%
!! TTTCTAGTGGAAACAAAATT+GGG + Chr8:46610873-46610892 MsG0880044652.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAATCAGATGTCTTTAGTTT+TGG + Chr8:46611697-46611716 MsG0880044652.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATATTTTGTTTAAGTGGTTG+AGG + Chr8:46608149-46608168 MsG0880044652.01.T01:intron 25.0%
!!! CAAGACATAGTTTCTTTTTT+TGG - Chr8:46608013-46608032 None:intergenic 25.0%
!!! CAAGTTTTTTTGTTTAAGTC+GGG + Chr8:46607453-46607472 MsG0880044652.01.T01:intron 25.0%
!!! CCAAGTTTTTTTGTTTAAGT+CGG + Chr8:46607452-46607471 MsG0880044652.01.T01:intron 25.0%
!!! CTTTTCTTTTCTGTTGTTTT+AGG + Chr8:46611872-46611891 MsG0880044652.01.T01:intron 25.0%
!!! TCGTTTTGTTGGATTTTAAA+GGG + Chr8:46607676-46607695 MsG0880044652.01.T01:intron 25.0%
!!! TGAAGATGTTTATTTTCTCA+AGG + Chr8:46610942-46610961 MsG0880044652.01.T01:intron 25.0%
!!! TGAGATTTTTGGATTCATAT+CGG - Chr8:46611473-46611492 None:intergenic 25.0%
!!! TTCGTTTTGTTGGATTTTAA+AGG + Chr8:46607675-46607694 MsG0880044652.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTCTAGTGGAAACAAAAT+TGG + Chr8:46610872-46610891 MsG0880044652.01.T01:CDS 25.0%
AATCCAAAAATCTCAGACTT+TGG + Chr8:46611478-46611497 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
AATTCAAGAGGTCGATATTT+AGG + Chr8:46608966-46608985 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
AATTCTGTATGCAATATGGA+GGG + Chr8:46609689-46609708 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
AATTGTTCTTGTACAGCTTA+TGG + Chr8:46609944-46609963 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
ACCCAAAAATTATCATGTTC+CGG - Chr8:46608218-46608237 None:intergenic 30.0%
AGGGATCAAAATTATAGAAC+CGG - Chr8:46608180-46608199 None:intergenic 30.0%
ATACTAATATGGGAAAGGAA+AGG - Chr8:46610143-46610162 None:intergenic 30.0%
ATCCCTTCATAATAACTAGT+TGG - Chr8:46609394-46609413 None:intergenic 30.0%
ATCTTGAAACTCAATGCAAA+TGG + Chr8:46609068-46609087 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
ATGAAGAGTAAGTAGACAAA+AGG - Chr8:46611618-46611637 None:intergenic 30.0%
CATCAAAACAAGAAGAAGAT+AGG + Chr8:46610459-46610478 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
CCCAAATTCAATTCTATTCT+AGG + Chr8:46608678-46608697 MsG0880044652.01.T01:intron 30.0%
CCGACTTAAACAAAAAAACT+TGG - Chr8:46607455-46607474 None:intergenic 30.0%
CCTTGTAGAAAAACATCAAT+TGG - Chr8:46606948-46606967 None:intergenic 30.0%
CTCTTCATACGAGATTAAAA+AGG - Chr8:46610323-46610342 None:intergenic 30.0%
GAAAGGATAGAATCTATTTG+TGG + Chr8:46609806-46609825 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
GATATTTAGGTATGTGGTAT+AGG + Chr8:46608979-46608998 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
GATGTCAATAACTACATTTG+TGG + Chr8:46612148-46612167 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
GTAAAATCGAATTAAGCCTT+GGG - Chr8:46607565-46607584 None:intergenic 30.0%
GTGATGTTAAACTGTATACT+AGG + Chr8:46608236-46608255 MsG0880044652.01.T01:intron 30.0%
TAAACCCATATTCCAAATGA+TGG + Chr8:46610989-46611008 MsG0880044652.01.T01:intron 30.0%
TAAACTGTATACTAGGATAC+CGG + Chr8:46608243-46608262 MsG0880044652.01.T01:intron 30.0%
TAATTCTCAATCTTGAGTCA+TGG - Chr8:46611411-46611430 None:intergenic 30.0%
TAATTCTGTATGCAATATGG+AGG + Chr8:46609688-46609707 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
TATAATCACTCATAACTCCA+CGG - Chr8:46607367-46607386 None:intergenic 30.0%
TATGACATATTCCATTGTTC+AGG - Chr8:46609761-46609780 None:intergenic 30.0%
TCATCTTTGGTTAGTATCTT+TGG + Chr8:46611222-46611241 MsG0880044652.01.T01:intron 30.0%
TCCACTAGAAAAATTATCAG+TGG - Chr8:46610864-46610883 None:intergenic 30.0%
TCCCTTCATAATAACTAGTT+GGG - Chr8:46609393-46609412 None:intergenic 30.0%
TCTTCATACAATATTTGCAG+TGG + Chr8:46611631-46611650 MsG0880044652.01.T01:intron 30.0%
TGAAGCCAAAACTAAGAAAA+TGG + Chr8:46611531-46611550 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
TGCTAATTCTGTATGCAATA+TGG + Chr8:46609685-46609704 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
TTAGTACTAGAGATAATCAG+CGG + Chr8:46611724-46611743 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
TTCTAGTGGAAACAAAATTG+GGG + Chr8:46610874-46610893 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
TTGTACAGCTTATGGAAATT+TGG + Chr8:46609952-46609971 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
! AATATGTCATATTGGTCTAG+CGG + Chr8:46609770-46609789 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
! ACCGGAACATGATAATTTTT+GGG + Chr8:46608214-46608233 MsG0880044652.01.T01:intron 30.0%
! ACTTTAAAGAGATTACAGGA+GGG + Chr8:46607194-46607213 MsG0880044652.01.T01:intron 30.0%
! AGTTATTGACATCTGATTTG+AGG - Chr8:46612141-46612160 None:intergenic 30.0%
! ATTCCAAATGATGGTTTTTC+AGG + Chr8:46610998-46611017 MsG0880044652.01.T01:intron 30.0%
! CCAATTGATGTTTTTCTACA+AGG + Chr8:46606945-46606964 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
! TACTTTAAAGAGATTACAGG+AGG + Chr8:46607193-46607212 MsG0880044652.01.T01:intron 30.0%
! TGAAGAGCTTGTTCTTATAT+AGG - Chr8:46608850-46608869 None:intergenic 30.0%
! TTCCAAATGATGGTTTTTCA+GGG + Chr8:46610999-46611018 MsG0880044652.01.T01:intron 30.0%
! TTCTTCTCTAAAAACAACTG+TGG - Chr8:46608775-46608794 None:intergenic 30.0%
! TTTTGGTATGGATGAGTTTT+TGG - Chr8:46608730-46608749 None:intergenic 30.0%
!! AGAGCATTTTAGATTGATAC+AGG + Chr8:46610793-46610812 MsG0880044652.01.T01:CDS 30.0%
!! ATCATTGCAGTTCTAAAACT+TGG - Chr8:46607589-46607608 None:intergenic 30.0%
!! ATGAAAGTTTGTTGTCCATT+TGG - Chr8:46607520-46607539 None:intergenic 30.0%
!!! CTATCTTCTTCTTGTTTTGA+TGG - Chr8:46610461-46610480 None:intergenic 30.0%
!!! GATGAGTTTTTGGTTATAGA+GGG - Chr8:46608720-46608739 None:intergenic 30.0%
!!! TCATTTTTGGTATCCTTAAC+CGG - Chr8:46608265-46608284 None:intergenic 30.0%
!!! TGTAGATAAGTGTTTTGGTA+TGG - Chr8:46608742-46608761 None:intergenic 30.0%
!!! TTGGTTACATCTGTTTTTAC+CGG + Chr8:46607646-46607665 MsG0880044652.01.T01:intron 30.0%
AAAAATCTCAGACTTTGGTC+TGG + Chr8:46611483-46611502 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
AAACTCATCCAATCCTTGAT+CGG - Chr8:46611075-46611094 None:intergenic 35.0%
AAAGTTATCCGATCAAGGAT+TGG + Chr8:46611064-46611083 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
AACTCAAAGTTATCCGATCA+AGG + Chr8:46611059-46611078 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAGATAGGAATCAGTGT+GGG + Chr8:46610471-46610490 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
AATCAGCGGGAAAAAGAATA+AGG + Chr8:46611738-46611757 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
ACATGAGGAAATTCTCTCAA+TGG + Chr8:46610026-46610045 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
ACATGGGGAAAAACTAAAGA+AGG + Chr8:46607112-46607131 MsG0880044652.01.T01:intron 35.0%
ACTTAGTAACAGGTCTTAAC+CGG + Chr8:46609291-46609310 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
AGAGTAAGTAGACAAAAGGA+CGG - Chr8:46611614-46611633 None:intergenic 35.0%
AGCTTGGACTATTTCATCTT+TGG + Chr8:46611209-46611228 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
AGTCTAATGAGGATACTTCT+AGG + Chr8:46607278-46607297 MsG0880044652.01.T01:intron 35.0%
AGTCTTTAGATGCATACATG+TGG + Chr8:46611971-46611990 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
ATCAGCGGGAAAAAGAATAA+GGG + Chr8:46611739-46611758 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
ATGAGGAAATTCTCTCAATG+GGG + Chr8:46610028-46610047 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
ATGCTTAAACAATGCCCTTA+GGG + Chr8:46608101-46608120 MsG0880044652.01.T01:intron 35.0%
ATTTATTCTGTGTCCACTTC+AGG + Chr8:46609566-46609585 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
CATGAGGAAATTCTCTCAAT+GGG + Chr8:46610027-46610046 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
CCAACAAAACGAAACAAATC+CGG - Chr8:46607668-46607687 None:intergenic 35.0%
CCCCAACTAGTTATTATGAA+GGG + Chr8:46609389-46609408 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
CCCTTAAAGAAATAAAGGAC+CGG + Chr8:46608196-46608215 MsG0880044652.01.T01:intron 35.0%
CCCTTCATAATAACTAGTTG+GGG - Chr8:46609392-46609411 None:intergenic 35.0%
CGTAAAATCGAATTAAGCCT+TGG - Chr8:46607566-46607585 None:intergenic 35.0%
CTGAAACTTACACGAAGATA+TGG - Chr8:46610368-46610387 None:intergenic 35.0%
GAAACCTTGTGTTGAAAATG+GGG + Chr8:46609195-46609214 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
GAATCTATTTGTGGAGACAA+TGG + Chr8:46609815-46609834 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
GACAATTGCGATGATGTTAT+GGG + Chr8:46607163-46607182 MsG0880044652.01.T01:intron 35.0%
GACTTTCTGTGTTTGTTTCA+TGG - Chr8:46608612-46608631 None:intergenic 35.0%
GATTCATATCGGAATCTAGT+AGG - Chr8:46611462-46611481 None:intergenic 35.0%
GCCAAAACTAAGAAAATGGT+CGG + Chr8:46611535-46611554 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
GCTTCGGTACTAAATGAAAT+CGG + Chr8:46610076-46610095 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
GGAAACCTTGTGTTGAAAAT+GGG + Chr8:46609194-46609213 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
GTCTAATGAGGATACTTCTA+GGG + Chr8:46607279-46607298 MsG0880044652.01.T01:intron 35.0%
GTCTTTAGATGCATACATGT+GGG + Chr8:46611972-46611991 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
GTGGAGTTATGAGTGATTAT+AGG + Chr8:46607366-46607385 MsG0880044652.01.T01:intron 35.0%
TACCCTGAAAAACCATCATT+TGG - Chr8:46611004-46611023 None:intergenic 35.0%
TAGATTGATACAGGAAGACA+TGG + Chr8:46610802-46610821 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
TAGTACTAGAGATAATCAGC+GGG + Chr8:46611725-46611744 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
TCCCCAACTAGTTATTATGA+AGG + Chr8:46609388-46609407 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
TCGGTAAAAATTGACAAGAG+AGG + Chr8:46609362-46609381 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
TCTAACAAGTAGGAAGAATG+AGG + Chr8:46610179-46610198 MsG0880044652.01.T01:intron 35.0%
TCTATGAATACATGCCTAAC+AGG + Chr8:46611186-46611205 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
TCTCAACGTTCCTACATTAT+TGG + Chr8:46611355-46611374 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
TCTGTCATTCTTATGCTGAA+CGG + Chr8:46612041-46612060 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
TGAAGTGGACACAGAATAAA+TGG - Chr8:46609567-46609586 None:intergenic 35.0%
TGTGATAATTACGCTATGTG+TGG + Chr8:46609662-46609681 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
TTATTGCCAGGAATGAAACT+TGG + Chr8:46609263-46609282 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
TTCTGCTTCAATTGTTGAGT+TGG - Chr8:46609470-46609489 None:intergenic 35.0%
TTGGATATCCTGTAAATCCA+AGG - Chr8:46609451-46609470 None:intergenic 35.0%
TTTATTCTGTGTCCACTTCA+GGG + Chr8:46609567-46609586 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
! ACGATTCAGAACAAGTTTTG+TGG - Chr8:46607238-46607257 None:intergenic 35.0%
! ACTAAAGAAGGTATGTAGAG+TGG + Chr8:46607124-46607143 MsG0880044652.01.T01:intron 35.0%
! ATAAATTTAGAATGGGCTCC+TGG + Chr8:46609420-46609439 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
! ATTCCTGAATTTTTCTGCAG+AGG - Chr8:46609050-46609069 None:intergenic 35.0%
! ATTTCATTTAGTACCGAAGC+AGG - Chr8:46610076-46610095 None:intergenic 35.0%
! CAGACTTTAGTTTCTGCTAA+TGG + Chr8:46608909-46608928 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
! CCGGTCCTTTATTTCTTTAA+GGG - Chr8:46608199-46608218 None:intergenic 35.0%
! GACCGGAACATGATAATTTT+TGG + Chr8:46608213-46608232 MsG0880044652.01.T01:intron 35.0%
! GATGTTTTTCTACAAGGTGA+AGG + Chr8:46606951-46606970 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
! GCCACTGATAATTTTTCTAG+TGG + Chr8:46610860-46610879 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
! TCCGACCATTTTCTTAGTTT+TGG - Chr8:46611539-46611558 None:intergenic 35.0%
! TCCGGTCCTTTATTTCTTTA+AGG - Chr8:46608200-46608219 None:intergenic 35.0%
! TGACATCTGATTTGAGGATA+AGG - Chr8:46612135-46612154 None:intergenic 35.0%
! TGGGGAAAGATGATATTTTG+TGG + Chr8:46609213-46609232 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
! TTTCATTTAGTACCGAAGCA+GGG - Chr8:46610075-46610094 None:intergenic 35.0%
! TTTTCCAAGATGTCACAAAC+CGG - Chr8:46609313-46609332 None:intergenic 35.0%
!! AGACCAAAGTCTGAGATTTT+TGG - Chr8:46611484-46611503 None:intergenic 35.0%
!! GTGAAGATAATGGACACAAA+GGG + Chr8:46607081-46607100 MsG0880044652.01.T01:intron 35.0%
!! TGAAGATAATGGACACAAAG+GGG + Chr8:46607082-46607101 MsG0880044652.01.T01:intron 35.0%
!! TGTGAAGATAATGGACACAA+AGG + Chr8:46607080-46607099 MsG0880044652.01.T01:intron 35.0%
!! TTTTGTTTAAGTCGGGTATC+CGG + Chr8:46607460-46607479 MsG0880044652.01.T01:intron 35.0%
!!! AGTTTTTGGTTATAGAGGGT+AGG - Chr8:46608716-46608735 None:intergenic 35.0%
!!! CTTTTCTGTTGTTTTAGGCA+TGG + Chr8:46611877-46611896 MsG0880044652.01.T01:intron 35.0%
!!! GCTAATGGAACTTTTGAAGT+CGG + Chr8:46608924-46608943 MsG0880044652.01.T01:CDS 35.0%
!!! GGATGAGTTTTTGGTTATAG+AGG - Chr8:46608721-46608740 None:intergenic 35.0%
!!! GTTTTAGAACTGCAATGATG+CGG + Chr8:46607590-46607609 MsG0880044652.01.T01:intron 35.0%
!!! GTTTTTGGTTATAGAGGGTA+GGG - Chr8:46608715-46608734 None:intergenic 35.0%
AAACTAAAGTCTGCCCATCT+CGG - Chr8:46608902-46608921 None:intergenic 40.0%
AAATAGTCCAAGCTCCTGTT+AGG - Chr8:46611203-46611222 None:intergenic 40.0%
AACAAGTGCCCCTTTAATAC+CGG + Chr8:46608378-46608397 MsG0880044652.01.T01:intron 40.0%
AATTGCGATGATGTTATGGG+TGG + Chr8:46607166-46607185 MsG0880044652.01.T01:intron 40.0%
ACAAAGGGGTTGTCTTACAT+GGG + Chr8:46607096-46607115 MsG0880044652.01.T01:intron 40.0%
ACACCTCTGCAGAAAAATTC+AGG + Chr8:46609044-46609063 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
ACCTAGGAACATAACCTTTG+AGG - Chr8:46609736-46609755 None:intergenic 40.0%
ACTCAAGTCGCAAGTCATTT+GGG - Chr8:46607337-46607356 None:intergenic 40.0%
AGAAGACATGTCTGGTCTAT+CGG - Chr8:46612024-46612043 None:intergenic 40.0%
AGAATAGTTATCTACACGGG+TGG + Chr8:46609629-46609648 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
AGAATGACAGAAGACATGTC+TGG - Chr8:46612032-46612051 None:intergenic 40.0%
AGCAATGCCACCAATAATGT+AGG - Chr8:46611368-46611387 None:intergenic 40.0%
AGTGGAAACAAAATTGGGGA+AGG + Chr8:46610878-46610897 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
ATCACCTTTAACCGTCGTTT+GGG + Chr8:46609007-46609026 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
ATGACTTCTGACATTCGACA+AGG - Chr8:46609916-46609935 None:intergenic 40.0%
ATGGTGCAAACGAGACTATT+TGG + Chr8:46609108-46609127 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
ATTAATAACTGCGCAGCTGT+TGG + Chr8:46609166-46609185 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
CAACGTTCCTACATTATTGG+TGG + Chr8:46611358-46611377 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
CCATGTGATACATTATTGCC+AGG + Chr8:46609251-46609270 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
CCATTTGGTCACAAGTTTGA+GGG - Chr8:46607505-46607524 None:intergenic 40.0%
CCTGGCAATAATGTATCACA+TGG - Chr8:46609254-46609273 None:intergenic 40.0%
CGTAATCTTGTGAAGCTTCT+TGG + Chr8:46611131-46611150 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
CTAAAATGCTCTTTCTGCCA+TGG - Chr8:46610785-46610804 None:intergenic 40.0%
CTCTTGAATTTCCAAGAGGA+CGG - Chr8:46608956-46608975 None:intergenic 40.0%
CTTCTTGGTTGCTGTATAGA+AGG + Chr8:46611146-46611165 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
CTTGGATGGAACTTAGTAAC+AGG + Chr8:46609281-46609300 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
GAAACAAGAAGCAAGCTCTT+GGG + Chr8:46611328-46611347 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
GAAGAAGATAGGAATCAGTG+TGG + Chr8:46610470-46610489 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
GAGGATAAGGAAATTGCATC+AGG - Chr8:46612122-46612141 None:intergenic 40.0%
GAGGTCGATATTTAGGTATG+TGG + Chr8:46608973-46608992 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
GATGCTTAAACAATGCCCTT+AGG + Chr8:46608100-46608119 MsG0880044652.01.T01:intron 40.0%
GGAAAATGCTAATGCCCTAA+GGG - Chr8:46608118-46608137 None:intergenic 40.0%
GGACAATTGCGATGATGTTA+TGG + Chr8:46607162-46607181 MsG0880044652.01.T01:intron 40.0%
GGAGTTCTTGTGATTCTCAA+TGG + Chr8:46609089-46609108 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
GGGAAACCTTGTGTTGAAAA+TGG + Chr8:46609193-46609212 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
GTCGTCTAACATGTCAAACA+AGG + Chr8:46609130-46609149 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
GTGTAAAATCCAGGCATCTT+CGG - Chr8:46612086-46612105 None:intergenic 40.0%
GTTCCTTAAACAATGCCCTT+AGG - Chr8:46607990-46608009 None:intergenic 40.0%
TACACTGACAGATGGAAAAG+AGG + Chr8:46611022-46611041 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
TACATGTCCAAGAAGGTTGA+GGG - Chr8:46611785-46611804 None:intergenic 40.0%
TATCACCTTTAACCGTCGTT+TGG + Chr8:46609006-46609025 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
TATGTAGCAGTTCGAGTGAT+CGG - Chr8:46611920-46611939 None:intergenic 40.0%
TATTGCTTACCGTCCATGTT+TGG + Chr8:46607794-46607813 MsG0880044652.01.T01:intron 40.0%
TCAATCTTGAGTCATGGTGA+AGG - Chr8:46611405-46611424 None:intergenic 40.0%
TCAGCGGGAAAAAGAATAAG+GGG + Chr8:46611740-46611759 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
TCCATTTGGTCACAAGTTTG+AGG - Chr8:46607506-46607525 None:intergenic 40.0%
TGAAACAAGAAGCAAGCTCT+TGG + Chr8:46611327-46611346 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
TGAATCAGTCTATCCGAGAT+GGG + Chr8:46608886-46608905 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
TGAGTATGATGCTTCTAGCA+CGG + Chr8:46606977-46606996 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
TGGAAAATGCTAATGCCCTA+AGG - Chr8:46608119-46608138 None:intergenic 40.0%
TGGATTTGGACCCGTTTATA+AGG + Chr8:46610901-46610920 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
TTACATGTCCAAGAAGGTTG+AGG - Chr8:46611786-46611805 None:intergenic 40.0%
TTATATCAGAGTCCCTGCTT+CGG + Chr8:46610060-46610079 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
TTCCATCCAAGTTTCATTCC+TGG - Chr8:46609272-46609291 None:intergenic 40.0%
TTCCATTGTTCAGGAAACCT+AGG - Chr8:46609752-46609771 None:intergenic 40.0%
TTCCTAGGTTTCCTGAACAA+TGG + Chr8:46609747-46609766 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
! AAAATTGGGGAAGGTGGATT+TGG + Chr8:46610887-46610906 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
! AAAGCTCATTTTGTCCTGAG+TGG - Chr8:46607878-46607897 None:intergenic 40.0%
! AAGATGCCTGGATTTTACAC+CGG + Chr8:46612086-46612105 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
! AGGATACTTCTAGGGAGTTT+GGG + Chr8:46607287-46607306 MsG0880044652.01.T01:intron 40.0%
! ATTATTGGTGGCATTGCTAG+AGG + Chr8:46611370-46611389 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
! CTTGTTCTGAATCGTCTAAC+AGG + Chr8:46607243-46607262 MsG0880044652.01.T01:intron 40.0%
! CTTTCCCCATTTTCAACACA+AGG - Chr8:46609202-46609221 None:intergenic 40.0%
! GTATACTAGGATACCGGTTA+AGG + Chr8:46608249-46608268 MsG0880044652.01.T01:intron 40.0%
! TTGGTGATCTAGTTGACATG+AGG + Chr8:46610011-46610030 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
! TTTGGTCTGGCTCGAATATT+TGG + Chr8:46611496-46611515 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
!! CCATTGATTCACACCATCAA+CGG - Chr8:46607769-46607788 None:intergenic 40.0%
!! CCGGATTTGTTTCGTTTTGT+TGG + Chr8:46607665-46607684 MsG0880044652.01.T01:intron 40.0%
!! CTTTGAGGCATTCACATCTA+GGG - Chr8:46609721-46609740 None:intergenic 40.0%
!! TACCATGATGAAGAAGTGTC+TGG - Chr8:46609878-46609897 None:intergenic 40.0%
!! TTAACCGGTTTGTGACATCT+TGG + Chr8:46609306-46609325 MsG0880044652.01.T01:CDS 40.0%
AAGCGAGGTAACTTCCTTAC+TGG + Chr8:46610543-46610562 MsG0880044652.01.T01:intron 45.0%
AAGTGCAGATGATCCAGCAA+AGG + Chr8:46609331-46609350 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
AATTTGGATGTCCGACATGG+TGG + Chr8:46609968-46609987 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
AGTGCAGATGATCCAGCAAA+GGG + Chr8:46609332-46609351 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
AGTGGCTGTTTGCTTTGGTT+TGG + Chr8:46609992-46610011 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
AGTGTGGGCGCAATTTCATT+TGG + Chr8:46610486-46610505 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
ATACATGCCTAACAGGAGCT+TGG + Chr8:46611193-46611212 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
ATCATCTCGCACCATTTCCA+TGG + Chr8:46610765-46610784 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
CAAAGGGGTTGTCTTACATG+GGG + Chr8:46607097-46607116 MsG0880044652.01.T01:intron 45.0%
CACAAAGGGGTTGTCTTACA+TGG + Chr8:46607095-46607114 MsG0880044652.01.T01:intron 45.0%
CACTCAAGTCGCAAGTCATT+TGG - Chr8:46607338-46607357 None:intergenic 45.0%
CATTAGCGCAGAGTCTAATG+AGG + Chr8:46607267-46607286 MsG0880044652.01.T01:intron 45.0%
CCCTCAAACTTGTGACCAAA+TGG + Chr8:46607502-46607521 MsG0880044652.01.T01:intron 45.0%
CCTAGATGTGAATGCCTCAA+AGG + Chr8:46609719-46609738 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
CGACCTCTTGAATTTCCAAG+AGG - Chr8:46608960-46608979 None:intergenic 45.0%
CGTCCTCTTGGAAATTCAAG+AGG + Chr8:46608954-46608973 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
CTCATTAGACTCTGCGCTAA+TGG - Chr8:46607269-46607288 None:intergenic 45.0%
CTGACATTCGACAAGGTTCA+TGG - Chr8:46609909-46609928 None:intergenic 45.0%
GCCTCAAAGGTTATGTTCCT+AGG + Chr8:46609732-46609751 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
GGAAACAAAATTGGGGAAGG+TGG + Chr8:46610881-46610900 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
GGAAATTTGGATGTCCGACA+TGG + Chr8:46609965-46609984 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
GGTTATAGAGGGTAGGGTAA+GGG - Chr8:46608709-46608728 None:intergenic 45.0%
GTGAATCAGTCTATCCGAGA+TGG + Chr8:46608885-46608904 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
GTGTGGGCGCAATTTCATTT+GGG + Chr8:46610487-46610506 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
GTTTAGCACACCCCTTAATG+TGG - Chr8:46611286-46611305 None:intergenic 45.0%
TCTCGCTAACAAGTGCCTAA+GGG + Chr8:46607972-46607991 MsG0880044652.01.T01:intron 45.0%
TGATGCTTCTAGCACGGAAT+CGG + Chr8:46606983-46607002 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
TGCCAGACACTTCTTCATCA+TGG + Chr8:46609873-46609892 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
TGCCAGGAATGAAACTTGGA+TGG + Chr8:46609267-46609286 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
TGCTCTTTCTGCCATGGAAA+TGG - Chr8:46610779-46610798 None:intergenic 45.0%
TGCTTTGCGTCTTTCAGAAC+CGG + Chr8:46610422-46610441 MsG0880044652.01.T01:intron 45.0%
TGGTTATAGAGGGTAGGGTA+AGG - Chr8:46608710-46608729 None:intergenic 45.0%
TGGTTGCTGTATAGAAGGAG+AGG + Chr8:46611151-46611170 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
TGTAAATCCAAGGCCATTCC+AGG - Chr8:46609441-46609460 None:intergenic 45.0%
TTTCAGGGTACACTGACAGA+TGG + Chr8:46611014-46611033 MsG0880044652.01.T01:intron 45.0%
! AGAAGGTATGTAGAGTGGTG+AGG + Chr8:46607129-46607148 MsG0880044652.01.T01:intron 45.0%
! ATTAGTCTCCACAAATGCGC+CGG - Chr8:46607482-46607501 None:intergenic 45.0%
! CTTTTTGTAGCCGCCAAACA+TGG - Chr8:46607810-46607829 None:intergenic 45.0%
! GAGGATACTTCTAGGGAGTT+TGG + Chr8:46607286-46607305 MsG0880044652.01.T01:intron 45.0%
! GGAATTTGCAGGCTTTAGCT+TGG + Chr8:46609588-46609607 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
! TGGAATGGCCTTGGATTTAC+AGG + Chr8:46609440-46609459 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
! TTAAGTGGTTGAGGAAGTGC+CGG + Chr8:46608158-46608177 MsG0880044652.01.T01:intron 45.0%
! TTTAGAATGGGCTCCTGGAA+TGG + Chr8:46609425-46609444 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
!! CCGTTGATGGTGTGAATCAA+TGG + Chr8:46607766-46607785 MsG0880044652.01.T01:intron 45.0%
!! CCTTTGAGGCATTCACATCT+AGG - Chr8:46609722-46609741 None:intergenic 45.0%
!! CTGCAGAGGTGTTTCTCTAT+TGG - Chr8:46609036-46609055 None:intergenic 45.0%
!! GTGCCTAAGGGCATTGTTTA+AGG + Chr8:46607984-46608003 MsG0880044652.01.T01:intron 45.0%
!! TCCAGCAAAGGGAGAGTATT+CGG + Chr8:46609343-46609362 MsG0880044652.01.T01:CDS 45.0%
!! TGTTTTAGGCATGGAGACTC+TGG + Chr8:46611886-46611905 MsG0880044652.01.T01:intron 45.0%
!! TTTGTTGTTCGCTACCACTC+AGG + Chr8:46607861-46607880 MsG0880044652.01.T01:intron 45.0%
!! AAATGAAATTATTATTAAAA+AGG + Chr8:46608279-46608298 MsG0880044652.01.T01:intron 5.0%
!! AACAAAATATTAATATTTAA+TGG - Chr8:46608139-46608158 None:intergenic 5.0%
!!! TTTAATAATAATTTCATTTT+TGG - Chr8:46608278-46608297 None:intergenic 5.0%
AACAGCCACTTCCACCATGT+CGG - Chr8:46609982-46610001 None:intergenic 50.0%
AAGCAAAGAACGGCCGTTGA+TGG + Chr8:46607753-46607772 MsG0880044652.01.T01:intron 50.0%
ACCGAATACTCTCCCTTTGC+TGG - Chr8:46609347-46609366 None:intergenic 50.0%
ACCTTTAACCGTCGTTTGGG+TGG + Chr8:46609010-46609029 MsG0880044652.01.T01:CDS 50.0%
ACGGAATCGGATGATGCGTA+AGG + Chr8:46606996-46607015 MsG0880044652.01.T01:intron 50.0%
AGCCTGCAAATTCCCTGAAG+TGG - Chr8:46609582-46609601 None:intergenic 50.0%
AGGTATGTAGAGTGGTGAGG+TGG + Chr8:46607132-46607151 MsG0880044652.01.T01:intron 50.0%
AGTTATCTACACGGGTGGAG+AGG + Chr8:46609634-46609653 MsG0880044652.01.T01:CDS 50.0%
ATTACAGGAGGGTGATGCGA+GGG + Chr8:46607205-46607224 MsG0880044652.01.T01:intron 50.0%
CAAGTCGCAAGTCATTTGGG+TGG - Chr8:46607334-46607353 None:intergenic 50.0%
CTGCGCTTACATGTCCAAGA+AGG - Chr8:46611792-46611811 None:intergenic 50.0%
GAACACTCCCTCAACCTTCT+TGG + Chr8:46611775-46611794 MsG0880044652.01.T01:CDS 50.0%
GCGGCTGTGTTTGTGTTGAA+AGG + Chr8:46609789-46609808 MsG0880044652.01.T01:CDS 50.0%
GTCCACTTCAGGGAATTTGC+AGG + Chr8:46609577-46609596 MsG0880044652.01.T01:CDS 50.0%
GTCTCGCTAACAAGTGCCTA+AGG + Chr8:46607971-46607990 MsG0880044652.01.T01:intron 50.0%
GTGGAAGTGGCTGTTTGCTT+TGG + Chr8:46609987-46610006 MsG0880044652.01.T01:CDS 50.0%
TCAGAACCGGCTGCTGTTAA+TGG + Chr8:46610435-46610454 MsG0880044652.01.T01:intron 50.0%
TCTATTGGCCACCCAAACGA+CGG - Chr8:46609021-46609040 None:intergenic 50.0%
TGATGGCCATTAACAGCAGC+CGG - Chr8:46610444-46610463 None:intergenic 50.0%
TGCATCAGGTAAACCCCTTC+CGG - Chr8:46612108-46612127 None:intergenic 50.0%
TGCTTACCGTCCATGTTTGG+CGG + Chr8:46607797-46607816 MsG0880044652.01.T01:intron 50.0%
TTGCAGTGGTTACATGCCTC+CGG + Chr8:46611645-46611664 MsG0880044652.01.T01:intron 50.0%
TTGTAGCCGCCAAACATGGA+CGG - Chr8:46607806-46607825 None:intergenic 50.0%
TTTAACGGTACTGCTGCCCA+AGG + Chr8:46607546-46607565 MsG0880044652.01.T01:intron 50.0%
! AACTGCAATGATGCGGACTG+AGG + Chr8:46607597-46607616 MsG0880044652.01.T01:intron 50.0%
! CCTGGATTTTACACCGGAAG+GGG + Chr8:46612092-46612111 MsG0880044652.01.T01:CDS 50.0%
! GCCTGGATTTTACACCGGAA+GGG + Chr8:46612091-46612110 MsG0880044652.01.T01:CDS 50.0%
! TGACTTGCGACTTGAGTGAC+CGG + Chr8:46607340-46607359 MsG0880044652.01.T01:intron 50.0%
! TGCCTGGATTTTACACCGGA+AGG + Chr8:46612090-46612109 MsG0880044652.01.T01:CDS 50.0%
!! AGAAGGTTGAGGGAGTGTTC+TGG - Chr8:46611775-46611794 None:intergenic 50.0%
!! GAAGGTTGAGGGAGTGTTCT+GGG - Chr8:46611774-46611793 None:intergenic 50.0%
AACTGCGCAGCTGTTGGACA+CGG + Chr8:46609172-46609191 MsG0880044652.01.T01:CDS 55.0%
AATCCAGGCATCTTCGGCTG+AGG - Chr8:46612080-46612099 None:intergenic 55.0%
CAAGAAGCAAGCTCTTGGGC+TGG + Chr8:46611332-46611351 MsG0880044652.01.T01:CDS 55.0%
CCCCTTCCGGTGTAAAATCC+AGG - Chr8:46612095-46612114 None:intergenic 55.0%
GACATGTCTGGTCTATCGGC+TGG - Chr8:46612020-46612039 None:intergenic 55.0%
GACTTGCGACTTGAGTGACC+GGG + Chr8:46607341-46607360 MsG0880044652.01.T01:intron 55.0%
GATTACAGGAGGGTGATGCG+AGG + Chr8:46607204-46607223 MsG0880044652.01.T01:intron 55.0%
GCCACCCAAACGACGGTTAA+AGG - Chr8:46609014-46609033 None:intergenic 55.0%
GTAGAGTGGTGAGGTGGTCA+AGG + Chr8:46607138-46607157 MsG0880044652.01.T01:intron 55.0%
TCACTCATAACTCCACGGCC+CGG - Chr8:46607362-46607381 None:intergenic 55.0%
TCGGAGAGTCAACAGCGTAC+TGG - Chr8:46607918-46607937 None:intergenic 55.0%
TGGCCATGCACAGCATACTC+CGG - Chr8:46611667-46611686 None:intergenic 55.0%
! GATGTCCGACATGGTGGAAG+TGG + Chr8:46609974-46609993 MsG0880044652.01.T01:CDS 55.0%
! GCAATGATGCGGACTGAGGT+GGG + Chr8:46607601-46607620 MsG0880044652.01.T01:intron 55.0%
! GTCGGTTTCTTCCGTCCTCT+TGG + Chr8:46608942-46608961 MsG0880044652.01.T01:CDS 55.0%
! TGCAATGATGCGGACTGAGG+TGG + Chr8:46607600-46607619 MsG0880044652.01.T01:intron 55.0%
ACTGCGCAGCTGTTGGACAC+GGG + Chr8:46609173-46609192 MsG0880044652.01.T01:CDS 60.0%
ATGGGCTCCTGGAATGGCCT+TGG + Chr8:46609431-46609450 MsG0880044652.01.T01:CDS 60.0%
CCATGCACAGCATACTCCGG+AGG - Chr8:46611664-46611683 None:intergenic 60.0%
CCTCCGGAGTATGCTGTGCA+TGG + Chr8:46611661-46611680 MsG0880044652.01.T01:CDS 60.0%
GAGTGGTGAGGTGGTCAAGG+TGG + Chr8:46607141-46607160 MsG0880044652.01.T01:intron 60.0%
TCGGGTATCCGGCGCATTTG+TGG + Chr8:46607471-46607490 MsG0880044652.01.T01:intron 60.0%
TTGCCTCAGCCGAAGATGCC+TGG + Chr8:46612074-46612093 MsG0880044652.01.T01:CDS 60.0%
ACAGGAGGGTGATGCGAGGG+TGG + Chr8:46607208-46607227 MsG0880044652.01.T01:intron 65.0%
CGACTTGAGTGACCGGGCCG+TGG + Chr8:46607347-46607366 MsG0880044652.01.T01:intron 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 46606927 46612178 46606927 ID=MsG0880044652.01;Name=MsG0880044652.01
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Chr8 exon 46606927 46607012 46606927 ID=MsG0880044652.01.T01:exon:18929;Parent=MsG0880044652.01.T01
Chr8 exon 46608857 46610097 46608857 ID=MsG0880044652.01.T01:exon:18930;Parent=MsG0880044652.01.T01
Chr8 exon 46610439 46610549 46610439 ID=MsG0880044652.01.T01:exon:18931;Parent=MsG0880044652.01.T01
Chr8 exon 46610750 46610922 46610750 ID=MsG0880044652.01.T01:exon:18932;Parent=MsG0880044652.01.T01
Chr8 exon 46611020 46611230 46611020 ID=MsG0880044652.01.T01:exon:18933;Parent=MsG0880044652.01.T01
Chr8 exon 46611326 46611563 46611326 ID=MsG0880044652.01.T01:exon:18934;Parent=MsG0880044652.01.T01
Chr8 exon 46611651 46611801 46611651 ID=MsG0880044652.01.T01:exon:18935;Parent=MsG0880044652.01.T01
Chr8 exon 46611894 46612178 46611894 ID=MsG0880044652.01.T01:exon:18936;Parent=MsG0880044652.01.T01
Chr8 CDS 46606927 46607012 46606927 ID=MsG0880044652.01.T01:cds;Parent=MsG0880044652.01.T01
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Chr8 CDS 46611894 46612178 46611894 ID=MsG0880044652.01.T01:cds;Parent=MsG0880044652.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880044652.01.T01

ATGATCGGTGTCGGTGTTCCAATTGATGTTTTTCTACAAGGTGAAGGTTCTGAGTATGATGCTTCTAGCACGGAATCGGATGATGCAACAAGCTCTTCATTAGACACTTTAGCTGTGAATCAGTCTATCCGAGATGGGCAGACTTTAGTTTCTGCTAATGGAACTTTTGAAGTCGGTTTCTTCCGTCCTCTTGGAAATTCAAGAGGTCGATATTTAGGTATGTGGTATAGGAATTTATCACCTTTAACCGTCGTTTGGGTGGCCAATAGAGAAACACCTCTGCAGAAAAATTCAGGAATCTTGAAACTCAATGCAAATGGAGTTCTTGTGATTCTCAATGGTGCAAACGAGACTATTTGGTCGTCTAACATGTCAAACAAGGCAGTGAATAATTCATTAATAACTGCGCAGCTGTTGGACACGGGAAACCTTGTGTTGAAAATGGGGAAAGATGATATTTTGTGGCAGAGTTTTGATTATCCATGTGATACATTATTGCCAGGAATGAAACTTGGATGGAACTTAGTAACAGGTCTTAACCGGTTTGTGACATCTTGGAAAAGTGCAGATGATCCAGCAAAGGGAGAGTATTCGGTAAAAATTGACAAGAGAGGATTTCCCCAACTAGTTATTATGAAGGGATCTGTCAATAAATTTAGAATGGGCTCCTGGAATGGCCTTGGATTTACAGGATATCCAACTCAACAATTGAAGCAGAAACAAAGATATAAGTTTGTCTTCAATGATAAAGAAGTTTATCATCAATATGAAGTTCTTGATAGCTCTGTTGTCTCCATTTATTCTGTGTCCACTTCAGGGAATTTGCAGGCTTTAGCTTGGACAAGTAAAAAAAGCAATAGAATAGTTATCTACACGGGTGGAGAGGATTCGTGTGATAATTACGCTATGTGTGGTGCTAATTCTGTATGCAATATGGAGGGTAATATCCCTAGATGTGAATGCCTCAAAGGTTATGTTCCTAGGTTTCCTGAACAATGGAATATGTCATATTGGTCTAGCGGCTGTGTTTGTGTTGAAAGGATAGAATCTATTTGTGGAGACAATGGTTTAAGTGATTTCTTGAAGTATAGAGAAATGAAATTGCCAGACACTTCTTCATCATGGTATAACAAGACCATGAACCTTGTCGAATGTCAGAAGTCATGTCTTAAAAATTGTTCTTGTACAGCTTATGGAAATTTGGATGTCCGACATGGTGGAAGTGGCTGTTTGCTTTGGTTTGGTGATCTAGTTGACATGAGGAAATTCTCTCAATGGGGACAAGAATTTTATATCAGAGTCCCTGCTTCGGTACTAAATGAAATCGAACCGGCTGCTGTTAATGGCCATCAAAACAAGAAGAAGATAGGAATCAGTGTGGGCGCAATTTCATTTGGGTTGATTATATGTGTCTTCTTAATAATACTTAGAAAGCGAGTGGCAGCGAGAGTATATCATCTCGCACCATTTCCATGGCAGAAAGAGCATTTTAGATTGATACAGGAAGACATGGATCTACCAATATTTAATTTGTCAATCATTGTTAAAGCCACTGATAATTTTTCTAGTGGAAACAAAATTGGGGAAGGTGGATTTGGACCCGTTTATAAGGGTACACTGACAGATGGAAAAGAGGTTGCCATTAAACGAAACTCAAAGTTATCCGATCAAGGATTGGATGAGTTTAAGAACGAAGTTTTTATGATTTCAAAACTTCAACATCGTAATCTTGTGAAGCTTCTTGGTTGCTGTATAGAAGGAGAGGAAAAAATGTTGATCTATGAATACATGCCTAACAGGAGCTTGGACTATTTCATCTTTGATGAAACAAGAAGCAAGCTCTTGGGCTGGTCTCAACGTTCCTACATTATTGGTGGCATTGCTAGAGGTCTTCTCTACCTTCACCATGACTCAAGATTGAGAATTATTCACAGAGATTTGAAAACTAGCAATATCCTACTAGATTCCGATATGAATCCAAAAATCTCAGACTTTGGTCTGGCTCGAATATTTGGAGTTGATCAAATTGAAGCCAAAACTAAGAAAATGGTCGGAACATATGGTTACATGCCTCCGGAGTATGCTGTGCATGGCCATTACTCTATAAAATCAGATGTCTTTAGTTTTGGTGTATTAGTACTAGAGATAATCAGCGGGAAAAAGAATAAGGGGTTTTCTGACCCAGAACACTCCCTCAACCTTCTTGGACATGCATGGAGACTCTGGACTGAAAACCGATCACTCGAACTGCTACATAAACACTTAGTTGATTTAAGTAATTCTTCTGAAGTCTTTAGATGCATACATGTGGGTTTGTTGTGTGTACAACAAAAACCAGCCGATAGACCAGACATGTCTTCTGTCATTCTTATGCTGAACGGTGAGAAATTATTGCCTCAGCCGAAGATGCCTGGATTTTACACCGGAAGGGGTTTACCTGATGCAATTTCCTTATCCTCAAATCAGATGTCAATAACTACATTTGTGGCAAGATAG
Protein sequence

>MsG0880044652.01.T01

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