AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880044669.01


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MsG0880044669.01.T01 AT4G03230 26.875 320 205 15 125 430 25 329 1.10e-18 91.7
MsG0880044669.01.T01 AT4G23230 48.876 356 141 5 442 765 279 625 2.96e-102 329
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MsG0880044669.01.T01 AT1G56145 38.462 364 180 6 439 770 625 976 2.57e-65 236
MsG0880044669.01.T01 AT1G29740 40.476 378 177 7 432 779 619 978 5.18e-65 235
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MsG0880044669.01.T01 AT1G29740 40.476 378 177 7 432 779 619 978 1.25e-64 234
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MsG0880044669.01.T01 AT2G42960 40.278 288 141 4 495 752 171 457 1.92e-57 204
MsG0880044669.01.T01 AT2G42960 40.278 288 141 4 495 752 171 457 1.92e-57 204
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MsG0880044669.01.T01 AT2G18470 37.374 297 144 7 495 756 272 561 2.79e-50 187
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MsG0880044669.01.T01 AT1G15530 37.543 293 145 7 495 754 349 636 6.49e-50 187
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MsG0880044669.01.T01 AT5G01550 32.464 345 181 8 442 752 326 652 1.86e-49 186
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MsG0880044669.01.T01 AT2G43700 33.908 348 178 10 438 752 256 584 9.63e-47 177
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MsG0880044669.01.T01 AT3G45430 35.179 307 161 5 495 770 332 631 3.89e-46 176
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MsG0880044669.01.T01 AT5G59270 32.945 343 182 8 440 749 291 618 9.95e-46 174
MsG0880044669.01.T01 AT1G24650 36.585 287 140 7 494 742 534 816 1.00e-45 177
MsG0880044669.01.T01 AT5G59270 32.945 343 182 8 440 749 294 621 1.15e-45 174
MsG0880044669.01.T01 AT2G01950 35.762 302 146 3 495 749 826 1126 1.20e-45 177
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MsG0880044669.01.T01 AT1G21210 34.483 290 160 4 489 749 392 680 1.53e-45 175
MsG0880044669.01.T01 AT5G37450 38.596 285 131 6 497 746 597 872 1.55e-45 176
MsG0880044669.01.T01 AT5G37450 38.596 285 131 6 497 746 645 920 1.66e-45 176
MsG0880044669.01.T01 AT5G37450 38.596 285 131 6 497 746 621 896 1.72e-45 176
MsG0880044669.01.T01 AT2G17220 35.714 294 151 4 491 746 70 363 1.78e-45 169
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MsG0880044669.01.T01 AT2G17220 35.714 294 151 4 491 746 71 364 2.04e-45 169
MsG0880044669.01.T01 AT3G02130 34.256 289 160 4 489 749 840 1126 2.15e-45 176
MsG0880044669.01.T01 AT4G02010 32.317 328 188 4 494 787 367 694 2.61e-45 174
MsG0880044669.01.T01 AT3G53380 36.332 289 149 5 495 749 364 651 3.15e-45 174
MsG0880044669.01.T01 AT5G59260 36.396 283 149 4 496 749 344 624 5.23e-45 172
MsG0880044669.01.T01 AT5G55830 32.213 357 197 7 432 754 299 644 5.47e-45 172
MsG0880044669.01.T01 AT2G48010 30.874 366 203 8 440 761 212 571 6.55e-45 171
MsG0880044669.01.T01 AT4G29990 32.184 348 187 7 439 749 507 842 6.69e-45 174
MsG0880044669.01.T01 AT3G53810 36.027 297 150 8 497 759 337 627 7.15e-45 172
MsG0880044669.01.T01 AT1G55610 35.417 288 153 2 495 749 847 1134 7.50e-45 175
MsG0880044669.01.T01 AT1G55610 35.417 288 153 2 495 749 847 1134 7.50e-45 175
MsG0880044669.01.T01 AT1G49270 36.066 305 154 6 495 760 324 626 7.61e-45 172
MsG0880044669.01.T01 AT4G32710 37.000 300 147 8 494 756 376 670 7.99e-45 173
MsG0880044669.01.T01 AT5G03140 33.862 378 198 11 423 761 293 657 8.29e-45 172
MsG0880044669.01.T01 AT3G53840 35.664 286 146 4 494 742 341 625 8.92e-45 171
MsG0880044669.01.T01 AT1G16260 35.125 279 151 2 500 749 374 651 9.09e-45 172
MsG0880044669.01.T01 AT1G16260 35.125 279 151 2 500 749 383 660 1.09e-44 172
MsG0880044669.01.T01 AT1G16260 35.125 279 151 2 500 749 383 660 1.09e-44 172
MsG0880044669.01.T01 AT2G02220 35.106 282 152 3 495 746 722 1002 1.14e-44 174
MsG0880044669.01.T01 AT2G07180 35.691 311 158 7 475 749 63 367 1.18e-44 167
MsG0880044669.01.T01 AT2G07180 35.691 311 158 7 475 749 63 367 1.18e-44 167
MsG0880044669.01.T01 AT1G76360 35.690 297 153 4 491 749 147 443 1.48e-44 168
MsG0880044669.01.T01 AT5G01540 33.501 397 190 11 428 780 291 657 1.76e-44 171
MsG0880044669.01.T01 AT1G14370 33.537 328 178 5 491 779 70 396 1.80e-44 166
MsG0880044669.01.T01 AT5G02070 35.172 290 150 5 494 745 350 639 1.91e-44 171
MsG0880044669.01.T01 AT1G16120 34.211 342 183 7 445 745 355 695 2.00e-44 171
MsG0880044669.01.T01 AT4G29050 38.144 291 138 10 495 749 332 616 2.69e-44 170
MsG0880044669.01.T01 AT5G60320 34.982 283 148 5 495 746 336 613 2.98e-44 170
MsG0880044669.01.T01 AT4G29050 38.144 291 138 10 495 749 346 630 3.68e-44 170
MsG0880044669.01.T01 AT1G17910 34.295 312 172 6 494 775 441 749 3.94e-44 171
MsG0880044669.01.T01 AT2G28590 32.432 333 189 6 495 795 86 414 5.86e-44 164
MsG0880044669.01.T01 AT2G13800 33.449 287 157 4 500 753 151 436 6.81e-44 166
MsG0880044669.01.T01 AT2G13800 33.449 287 157 4 500 753 151 436 6.81e-44 166
MsG0880044669.01.T01 AT1G21240 33.793 290 162 4 489 749 397 685 6.99e-44 170
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MsG0880044669.01.T01 AT2G02800 34.899 298 154 6 491 749 67 363 9.08e-44 164
MsG0880044669.01.T01 AT2G02800 34.899 298 154 6 491 749 67 363 9.08e-44 164
MsG0880044669.01.T01 AT3G46330 36.713 286 145 6 495 749 532 812 1.17e-43 170
MsG0880044669.01.T01 AT3G46330 36.713 286 145 6 495 749 556 836 1.35e-43 170
MsG0880044669.01.T01 AT5G16500 36.082 291 147 6 495 749 62 349 1.36e-43 168
MsG0880044669.01.T01 AT1G26970 35.737 319 163 9 471 749 46 362 1.67e-43 163
MsG0880044669.01.T01 AT3G28690 33.133 332 172 6 492 785 11 330 1.81e-43 162
MsG0880044669.01.T01 AT3G05140 33.225 307 172 5 495 772 131 433 1.85e-43 164
MsG0880044669.01.T01 AT1G79620 35.336 283 149 6 495 746 626 905 1.88e-43 170
MsG0880044669.01.T01 AT1G79620 35.336 283 149 6 495 746 652 931 2.17e-43 170
MsG0880044669.01.T01 AT3G05140 33.225 307 172 5 495 772 179 481 2.99e-43 164
MsG0880044669.01.T01 AT1G72540 34.576 295 158 5 490 749 67 361 3.02e-43 163
MsG0880044669.01.T01 AT5G18910 33.692 279 152 4 502 752 187 460 3.30e-43 164
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MsG0880044669.01.T01 AT2G13800 32.258 310 170 5 500 770 268 576 3.43e-43 166
MsG0880044669.01.T01 AT5G15730 34.276 283 143 7 492 745 101 369 3.85e-43 162
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MsG0880044669.01.T01 AT3G46760 35.740 277 146 5 495 746 38 307 4.47e-43 160
MsG0880044669.01.T01 AT1G70110 34.828 290 159 4 495 755 332 620 7.26e-43 166
MsG0880044669.01.T01 AT3G28690 33.133 332 172 6 492 785 60 379 7.96e-43 161
MsG0880044669.01.T01 AT5G15730 34.035 285 143 7 492 745 101 371 8.34e-43 162
MsG0880044669.01.T01 AT5G15730 34.035 285 143 7 492 745 101 371 8.34e-43 162
MsG0880044669.01.T01 AT3G45330 34.219 301 166 5 496 766 337 635 8.48e-43 166
MsG0880044669.01.T01 AT5G15080 34.812 293 153 3 495 749 130 422 8.49e-43 163
MsG0880044669.01.T01 AT3G25490 32.667 300 169 4 475 745 79 374 1.09e-42 161
MsG0880044669.01.T01 AT5G01020 35.052 291 152 6 495 749 57 346 1.37e-42 160
MsG0880044669.01.T01 AT5G47070 35.738 305 149 7 487 749 66 365 1.46e-42 160
MsG0880044669.01.T01 AT4G13190 37.600 250 125 3 481 699 45 294 1.55e-42 157
MsG0880044669.01.T01 AT5G54380 32.975 279 157 3 497 746 500 777 1.58e-42 167
MsG0880044669.01.T01 AT4G39110 34.286 280 155 3 495 746 514 792 2.10e-42 166
MsG0880044669.01.T01 AT3G28690 33.133 332 172 6 492 785 111 430 2.16e-42 161
MsG0880044669.01.T01 AT1G24030 30.625 320 180 7 462 742 30 346 2.29e-42 159
MsG0880044669.01.T01 AT1G06840 34.311 341 164 10 442 746 575 891 2.35e-42 167
MsG0880044669.01.T01 AT1G21250 33.103 290 164 3 489 749 391 679 2.49e-42 165

Find 165 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 266 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTACTTCGTCTCTTTGTTTA+AGG 0.064891 8:+47070540 None:intergenic
CTATTATGTGAATGCTTATC+AGG 0.149449 8:-47069921 MsG0880044669.01.T01:CDS
CACTTTAGGCATGGAGTTTA+TGG 0.159699 8:-47067306 MsG0880044669.01.T01:intron
AACCCGAAAATATCAGATTT+TGG 0.168010 8:-47067698 MsG0880044669.01.T01:CDS
CGAATGGATGCTTCAGAATT+AGG 0.194493 8:-47069579 MsG0880044669.01.T01:CDS
GAATCCAGTTGCACAACTTT+TGG 0.232177 8:-47070486 MsG0880044669.01.T01:CDS
AAGATTGGTGAAGGCGGTTT+TGG 0.236974 8:-47068321 MsG0880044669.01.T01:CDS
ACAAAAGTTACTTGGGGATT+TGG 0.248997 8:-47070670 MsG0880044669.01.T01:CDS
TGACAAACAATAGCTTAAAT+TGG 0.249196 8:-47068013 MsG0880044669.01.T01:CDS
AGAAATCTTGTTAAGCTTCT+TGG 0.256107 8:-47068080 MsG0880044669.01.T01:CDS
TTGGTGATTTAATTGATATT+AGG 0.262878 8:-47069635 MsG0880044669.01.T01:CDS
TAAGGTGATAGTCATCTTAT+TGG 0.264898 8:+47067030 None:intergenic
CTCTGCCACAAATAGACTTC+TGG 0.265332 8:+47070422 None:intergenic
ACAAAGAAATTTGTTAGAAT+TGG 0.268640 8:-47070227 MsG0880044669.01.T01:CDS
CATCACCAGGAGACTTATAT+TGG 0.301006 8:-47070295 MsG0880044669.01.T01:CDS
TGGTGATTTAATTGATATTA+GGG 0.302857 8:-47069634 MsG0880044669.01.T01:CDS
CCCTTCTGATACAATACTTC+CGG 0.309242 8:-47070390 MsG0880044669.01.T01:CDS
AAATCTGATGTATTCAGTTT+TGG 0.316712 8:-47067482 MsG0880044669.01.T01:CDS
GTTGTTTAGTGTTAGGATTC+CGG 0.320617 8:+47070577 None:intergenic
ACATAGTAACCAGGCTCTTT+CGG 0.323612 8:+47067109 None:intergenic
TTCCAGTACAAACAGTTGTT+TGG 0.332683 8:-47070637 MsG0880044669.01.T01:CDS
AACTTTGAAGAGAGACATAA+TGG 0.332989 8:-47069433 MsG0880044669.01.T01:intron
TACAATTTAACGGTTTATTT+CGG 0.337253 8:+47069841 None:intergenic
GCCTTCTGTGATTCTAATGC+TGG 0.340019 8:-47067155 MsG0880044669.01.T01:CDS
TAATAGTCACACCTGTCTTT+TGG 0.340458 8:+47069987 None:intergenic
GCTAGCATCATTATAGCATC+TGG 0.360975 8:-47069382 MsG0880044669.01.T01:CDS
TGCCAGTGTTGTTTAGTGTT+AGG 0.361103 8:+47070570 None:intergenic
TCCAGTACAAACAGTTGTTT+GGG 0.366369 8:-47070636 MsG0880044669.01.T01:CDS
AACAAAGAGACGAAGTAGTT+TGG 0.368568 8:-47070535 MsG0880044669.01.T01:CDS
ATACTTCCGGGGATGAAGTT+AGG 0.374615 8:-47070377 MsG0880044669.01.T01:CDS
ATACTGTGGCACAGAATAAC+TGG 0.379724 8:-47069331 MsG0880044669.01.T01:intron
ATCACCAGGAGACTTATATT+GGG 0.387870 8:-47070294 MsG0880044669.01.T01:CDS
TTGTAAGCGTAAACATTGTT+AGG 0.388593 8:+47070161 None:intergenic
GCCTATCCTCTGGAAATTGC+TGG 0.395981 8:+47067185 None:intergenic
GAATCCAAAAGTTGTGCAAC+TGG 0.403148 8:+47070482 None:intergenic
TACTTAATTACCTTGTATAC+AGG 0.403856 8:+47068297 None:intergenic
CCTTCTGATACAATACTTCC+GGG 0.407086 8:-47070389 MsG0880044669.01.T01:CDS
TATACTAATTCTAACATAAC+AGG 0.407830 8:-47069684 MsG0880044669.01.T01:CDS
ATCTCCCAATCCTTCACTAA+TGG 0.418779 8:-47070755 MsG0880044669.01.T01:CDS
GAATTCCAACAAAAGTTACT+TGG 0.420874 8:-47070678 MsG0880044669.01.T01:CDS
TCAGAAATTATTGAACTAGA+AGG 0.421324 8:-47068438 MsG0880044669.01.T01:CDS
TTCCAGATTGTACACATACT+TGG 0.423197 8:-47069773 MsG0880044669.01.T01:CDS
GCCCTAGGTCTCCAGCTGCT+TGG 0.423608 8:-47069893 MsG0880044669.01.T01:CDS
GTTCCAACTTTGTTGATCTT+CGG 0.427595 8:+47070025 None:intergenic
CCTTTCATAAGATATTGTTC+AGG 0.430615 8:+47070251 None:intergenic
CTGCTTGGAACTCGTCTGAT+TGG 0.433661 8:-47069878 MsG0880044669.01.T01:CDS
GCAAAACATTGCTTGGTTTG+AGG 0.435744 8:+47067735 None:intergenic
CTTACATAAGTGACAAGGTT+AGG 0.436059 8:+47067395 None:intergenic
CTTGAATAATTGTTCTTGTA+CGG 0.436163 8:-47069709 MsG0880044669.01.T01:CDS
TCCGGAGGAGGAATCATTGA+TGG 0.438180 8:+47070595 None:intergenic
TCATGCCATTAGTGAAGGAT+TGG 0.442554 8:+47070750 None:intergenic
GGAGTTTGAAAATGATGGTC+AGG 0.444491 8:-47069613 MsG0880044669.01.T01:CDS
TCATCAAGCAAAACATTGCT+TGG 0.446602 8:+47067728 None:intergenic
ATTAGGGAGTTTGAAAATGA+TGG 0.448765 8:-47069618 MsG0880044669.01.T01:CDS
TCTGCCACAAATAGACTTCT+GGG 0.449697 8:+47070423 None:intergenic
GCATGGAGTTTATGGAAAGA+GGG 0.451768 8:-47067298 MsG0880044669.01.T01:CDS
CGATTCTGTAATATCAAGAA+TGG 0.456471 8:-47070090 MsG0880044669.01.T01:CDS
AGTTTGTTAGTACAATTTAA+CGG 0.458283 8:+47069831 None:intergenic
GGCATGGAGTTTATGGAAAG+AGG 0.460341 8:-47067299 MsG0880044669.01.T01:CDS
CCCATCAATGATTCCTCCTC+CGG 0.460863 8:-47070596 MsG0880044669.01.T01:CDS
GGAAATACAAGCCGAGTTGT+TGG 0.462426 8:-47067641 MsG0880044669.01.T01:CDS
CGTCTCTTTGTTTAAGGACA+AGG 0.463155 8:+47070546 None:intergenic
TAGTGTTAGGATTCCGGAGG+AGG 0.469423 8:+47070583 None:intergenic
GTTATCAGTGGCAGTAACTA+AGG 0.474650 8:+47068359 None:intergenic
AATTCCAACAAAAGTTACTT+GGG 0.475072 8:-47070677 MsG0880044669.01.T01:CDS
AGAATCACAGAAGGCATACC+AGG 0.475227 8:+47067163 None:intergenic
ACCCAAACAACTGTTTGTAC+TGG 0.477831 8:+47070635 None:intergenic
TTCTCAATAAAGAACAAGAT+TGG 0.481984 8:-47068336 MsG0880044669.01.T01:CDS
TCTCCTGGTGATGGATCGTC+AGG 0.482996 8:+47070305 None:intergenic
TGTATGTTGCAGCGGCTACA+TGG 0.483134 8:-47067540 MsG0880044669.01.T01:intron
ACTTGGGTAGATCAAACAAT+AGG 0.484422 8:-47069756 MsG0880044669.01.T01:CDS
TGGAATGGATTGCACTTTAG+TGG 0.486122 8:-47070200 MsG0880044669.01.T01:CDS
TGTTATTATGTAGGGAAGAC+TGG 0.487704 8:-47068204 MsG0880044669.01.T01:intron
CAATATAAGTCTCCTGGTGA+TGG 0.488071 8:+47070296 None:intergenic
AGTGGCTGTGTCATGTGGTT+TGG 0.492022 8:-47069654 MsG0880044669.01.T01:CDS
AAGTTGTGCAACTGGATTCA+CGG 0.494295 8:+47070490 None:intergenic
CTACTGCTATGGAAAATTTG+AGG 0.495425 8:+47070789 None:intergenic
ACCCAAGTATGTGTACAATC+TGG 0.497266 8:+47069771 None:intergenic
AAGAATGGAATTGAATCAAA+CGG 0.500170 8:-47070075 MsG0880044669.01.T01:CDS
TTTGCTAAGCCGAAAGAGCC+TGG 0.501501 8:-47067118 MsG0880044669.01.T01:CDS
CCTTCTGTGATTCTAATGCT+GGG 0.501915 8:-47067154 MsG0880044669.01.T01:CDS
GCTTATCAGGGTTTAGCCCT+AGG 0.502158 8:-47069908 MsG0880044669.01.T01:CDS
GGCATACCAGGCCTATCCTC+TGG 0.503358 8:+47067175 None:intergenic
AAGAGGCTTTCAAGTGACTC+TGG 0.504905 8:-47068158 MsG0880044669.01.T01:CDS
TGGCAGAGGTAGTGAAGATG+AGG 0.511087 8:-47068415 MsG0880044669.01.T01:CDS
CAAACCCAGAAGTCTATTTG+TGG 0.511503 8:-47070427 MsG0880044669.01.T01:CDS
CTTCACTAATGGCATGACCT+TGG 0.515131 8:-47070744 MsG0880044669.01.T01:CDS
TTCCGGGGATGAAGTTAGGT+TGG 0.517503 8:-47070373 MsG0880044669.01.T01:CDS
AGTCCTGACGATCCATCACC+AGG 0.518389 8:-47070308 MsG0880044669.01.T01:CDS
GCTATGGAAAATTTGAGGTA+AGG 0.518710 8:+47070794 None:intergenic
CATGCCATTAGTGAAGGATT+GGG 0.520376 8:+47070751 None:intergenic
TATAGAAAATGTGGAGTCTA+CGG 0.520648 8:-47069966 MsG0880044669.01.T01:CDS
CCGGAGGAGGAATCATTGAT+GGG 0.521747 8:+47070596 None:intergenic
GTTAGAATTGGACCATGGAA+TGG 0.524471 8:-47070215 MsG0880044669.01.T01:CDS
ACAGTTGTTTGGGTTGCAAA+TGG 0.527497 8:-47070626 MsG0880044669.01.T01:CDS
GAGACATAATGGGCTGAAGA+AGG 0.528039 8:-47069422 MsG0880044669.01.T01:CDS
AACTCGTCTGATTGGTCTCA+AGG 0.528871 8:-47069870 MsG0880044669.01.T01:CDS
TTTGGATTAGATCAGACTCA+TGG 0.530833 8:-47067662 MsG0880044669.01.T01:CDS
TTCCAAGCAGCTGGAGACCT+AGG 0.536799 8:+47069891 None:intergenic
TATTATGTGAATGCTTATCA+GGG 0.538748 8:-47069920 MsG0880044669.01.T01:CDS
TCAGACGAGTTCCAAGCAGC+TGG 0.539784 8:+47069882 None:intergenic
CCCGGAAGTATTGTATCAGA+AGG 0.543618 8:+47070389 None:intergenic
TACGGCACTTGCACAATCAC+AGG 0.543828 8:-47069948 MsG0880044669.01.T01:CDS
CAAGTTATTATCGATACGTA+TGG 0.545361 8:-47070049 MsG0880044669.01.T01:CDS
GGTCCGAAGATCAACAAAGT+TGG 0.546110 8:-47070028 MsG0880044669.01.T01:CDS
ACTAAGAGTATCTACTGCTA+TGG 0.547606 8:+47070778 None:intergenic
ACTTTGAAGAGAGACATAAT+GGG 0.548363 8:-47069432 MsG0880044669.01.T01:intron
AGTCCATCTGCAGCATACTC+TGG 0.550272 8:+47067515 None:intergenic
CTTACTAAGTTCCAACAACT+CGG 0.556400 8:+47067630 None:intergenic
TCCAGATTGTACACATACTT+GGG 0.558211 8:-47069772 MsG0880044669.01.T01:CDS
TTCCAACCTAACTTCATCCC+CGG 0.558370 8:+47070371 None:intergenic
CCTGAACAATATCTTATGAA+AGG 0.561192 8:-47070251 MsG0880044669.01.T01:CDS
TGTGACTATTATAGAAAATG+TGG 0.563604 8:-47069975 MsG0880044669.01.T01:CDS
TTGGAATCTTAGAACTCGTA+CGG 0.565995 8:-47070354 MsG0880044669.01.T01:CDS
TTGATGTTGGAGATCATATG+TGG 0.566007 8:-47067455 MsG0880044669.01.T01:CDS
TGAAATCACTACCAAAAGAC+AGG 0.569388 8:-47069998 MsG0880044669.01.T01:CDS
CAATTTCCAGAGGATAGGCC+TGG 0.569849 8:-47067181 MsG0880044669.01.T01:CDS
CGGAAAGGAGAATGACGTCT+TGG 0.574052 8:-47070334 MsG0880044669.01.T01:CDS
ATTCTAATGCTGGGGAGTGA+TGG 0.574451 8:-47067145 MsG0880044669.01.T01:CDS
GAACCCCAATATAAGTCTCC+TGG 0.577621 8:+47070290 None:intergenic
GCACCAGAGTATGCTGCAGA+TGG 0.578467 8:-47067518 MsG0880044669.01.T01:CDS
CTTTCAAGTGACTCTGGACA+AGG 0.580490 8:-47068152 MsG0880044669.01.T01:CDS
CTAGCATCATTATAGCATCT+GGG 0.580769 8:-47069381 MsG0880044669.01.T01:CDS
TCTTGTGATACGAGACGAGA+AGG 0.580972 8:-47070453 MsG0880044669.01.T01:CDS
GAGTTTATGGAAAGAGGGAA+GGG 0.582828 8:-47067293 MsG0880044669.01.T01:CDS
GACAAGAAATTGCTGTGAAG+AGG 0.583216 8:-47068175 MsG0880044669.01.T01:CDS
TGTACTAACAAACTCAGTGA+TGG 0.588235 8:-47069822 MsG0880044669.01.T01:CDS
GGAGTTTATGGAAAGAGGGA+AGG 0.589775 8:-47067294 MsG0880044669.01.T01:CDS
CAAGGTCATGCCATTAGTGA+AGG 0.589828 8:+47070745 None:intergenic
ATCTTAGAACTCGTACGGAA+AGG 0.590584 8:-47070349 MsG0880044669.01.T01:CDS
TCCAAGCAGCTGGAGACCTA+GGG 0.593969 8:+47069892 None:intergenic
AATTCTAACATAACAGGAGA+AGG 0.594132 8:-47069678 MsG0880044669.01.T01:CDS
ATAAAGAACAAGATTGGTGA+AGG 0.595858 8:-47068330 MsG0880044669.01.T01:CDS
ACATGTAAGATTTATCAAGA+AGG 0.596917 8:+47070829 None:intergenic
GAAATTATTGAACTAGAAGG+TGG 0.597067 8:-47068435 MsG0880044669.01.T01:CDS
TCCTTGTTTACATAGTAACC+AGG 0.597528 8:+47067100 None:intergenic
GGATTCTTGTGTTAAATCAG+AGG 0.599508 8:-47067242 MsG0880044669.01.T01:CDS
AAGGTTGAATATGTAAGCAG+TGG 0.601607 8:+47068378 None:intergenic
ATTGAACTAGAAGGTGGCAG+AGG 0.606132 8:-47068429 MsG0880044669.01.T01:CDS
CTAAAGTGCAATCCATTCCA+TGG 0.606403 8:+47070203 None:intergenic
TCAGGATCTATATATTCGAA+TGG 0.609821 8:-47069595 MsG0880044669.01.T01:CDS
ATCCTAACACTAAACAACAC+TGG 0.612175 8:-47070572 MsG0880044669.01.T01:CDS
AACATAACAGGAGAAGGCAG+TGG 0.614023 8:-47069672 MsG0880044669.01.T01:CDS
ATTCCAACAAAAGTTACTTG+GGG 0.614116 8:-47070676 MsG0880044669.01.T01:CDS
AGGTTGAATATGTAAGCAGT+GGG 0.614387 8:+47068379 None:intergenic
GGCATGACCTTGGTTTCACA+AGG 0.614976 8:-47070734 MsG0880044669.01.T01:CDS
AAGGCAGTGGCTGTGTCATG+TGG 0.622689 8:-47069659 MsG0880044669.01.T01:CDS
GCCTGGTTACTATGTAAACA+AGG 0.622859 8:-47067101 MsG0880044669.01.T01:CDS
TCACCAGGAGACTTATATTG+GGG 0.629570 8:-47070293 MsG0880044669.01.T01:CDS
CCGGAAGTATTGTATCAGAA+GGG 0.631846 8:+47070390 None:intergenic
CTTCTGTGATTCTAATGCTG+GGG 0.633831 8:-47067153 MsG0880044669.01.T01:CDS
GATGCTTCAGAATTAGGCAA+AGG 0.637069 8:-47069573 MsG0880044669.01.T01:intron
TTCATCAAGATTCGAGACTG+AGG 0.640191 8:-47067772 MsG0880044669.01.T01:intron
CTTTATTGAGAAGTTATCAG+TGG 0.641015 8:+47068347 None:intergenic
CCCAGCATTAGAATCACAGA+AGG 0.641415 8:+47067154 None:intergenic
TCCAGCAATTTCCAGAGGAT+AGG 0.644012 8:-47067186 MsG0880044669.01.T01:CDS
AATTTGTTAGAATTGGACCA+TGG 0.650908 8:-47070220 MsG0880044669.01.T01:CDS
AAGAACAAGATTGGTGAAGG+CGG 0.655802 8:-47068327 MsG0880044669.01.T01:CDS
GTGTGTCCAGCAATTTCCAG+AGG 0.660578 8:-47067191 MsG0880044669.01.T01:CDS
GTTTAGTGTTAGGATTCCGG+AGG 0.664450 8:+47070580 None:intergenic
CTTCTGATACAATACTTCCG+GGG 0.685283 8:-47070388 MsG0880044669.01.T01:CDS
ATGTAGGGAAGACTGGCAAG+TGG 0.686590 8:-47068197 MsG0880044669.01.T01:intron
GCTTCTTGGTTGTTGCATCG+AGG 0.695010 8:-47068066 MsG0880044669.01.T01:CDS
GATATCGTCTCTACATACTG+TGG 0.708829 8:-47069345 MsG0880044669.01.T01:CDS
AAATACTTACATAAGTGACA+AGG 0.722114 8:+47067390 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! CAAAAACAAAAAAGTTAAAA+CGG + Chr8:47070296-47070315 None:intergenic 15.0%
!! TATGGAAAATATAGATAAAA+AGG + Chr8:47068565-47068584 None:intergenic 15.0%
!!! ACTTTTATATGTTATTATGT+AGG - Chr8:47069650-47069669 MsG0880044669.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATATATAATTTGTGATTCTT+TGG - Chr8:47069167-47069186 MsG0880044669.01.T01:intron 15.0%
!!! CTTTTATATGTTATTATGTA+GGG - Chr8:47069651-47069670 MsG0880044669.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTATCTATATTTTCCATAAA+TGG - Chr8:47068567-47068586 MsG0880044669.01.T01:intron 15.0%
!! ACTAATTGACAAAAACATAA+AGG - Chr8:47070600-47070619 MsG0880044669.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAATCTCCAAAATTGATAT+TGG + Chr8:47069936-47069955 None:intergenic 20.0%
!! CTTACAGTCAAATTTAATTA+GGG - Chr8:47068708-47068727 MsG0880044669.01.T01:intron 20.0%
!! TACAATTTAACGGTTTATTT+CGG + Chr8:47068025-47068044 None:intergenic 20.0%
!! TATACTAATTCTAACATAAC+AGG - Chr8:47068179-47068198 MsG0880044669.01.T01:CDS 20.0%
!! TCTTACAGTCAAATTTAATT+AGG - Chr8:47068707-47068726 MsG0880044669.01.T01:intron 20.0%
!! TGGTGATTTAATTGATATTA+GGG - Chr8:47068229-47068248 MsG0880044669.01.T01:intron 20.0%
!! TTTCAAACATTCTTATACAT+TGG - Chr8:47069892-47069911 MsG0880044669.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATGATTCCAATATCAATTT+TGG - Chr8:47069926-47069945 MsG0880044669.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATTGCTTGATTTGTATAAT+TGG - Chr8:47069238-47069257 MsG0880044669.01.T01:intron 20.0%
!!! ACAAAGAAATTTGTTAGAAT+TGG - Chr8:47067636-47067655 MsG0880044669.01.T01:CDS 20.0%
!!! AGTTTGTTAGTACAATTTAA+CGG + Chr8:47068035-47068054 None:intergenic 20.0%
!!! TTACAATTTTGTGTCTAATA+AGG - Chr8:47067719-47067738 MsG0880044669.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTGGTGATTTAATTGATATT+AGG - Chr8:47068228-47068247 MsG0880044669.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTATGATTTTTTTTCCCA+TGG - Chr8:47068325-47068344 MsG0880044669.01.T01:CDS 20.0%
! AAATACTTACATAAGTGACA+AGG + Chr8:47070476-47070495 None:intergenic 25.0%
! AAGAATGGAATTGAATCAAA+CGG - Chr8:47067788-47067807 MsG0880044669.01.T01:intron 25.0%
! AATTAAATTAGCGAATGAGA+TGG - Chr8:47068673-47068692 MsG0880044669.01.T01:intron 25.0%
! AATTCCAACAAAAGTTACTT+GGG - Chr8:47067186-47067205 MsG0880044669.01.T01:CDS 25.0%
! ACATGTAAGATTTATCAAGA+AGG + Chr8:47067037-47067056 None:intergenic 25.0%
! AGTAGATTTATTGACCTATT+TGG + Chr8:47069983-47070002 None:intergenic 25.0%
! ATGTCATAATAATGCACATT+AGG + Chr8:47068797-47068816 None:intergenic 25.0%
! CTTGAATAATTGTTCTTGTA+CGG - Chr8:47068154-47068173 MsG0880044669.01.T01:CDS 25.0%
! GTAGATTTATTGACCTATTT+GGG + Chr8:47069982-47070001 None:intergenic 25.0%
! TACCAAACTAAATACATTTG+AGG - Chr8:47068744-47068763 MsG0880044669.01.T01:intron 25.0%
! TACTTAATTACCTTGTATAC+AGG + Chr8:47069569-47069588 None:intergenic 25.0%
! TATTATGTGAATGCTTATCA+GGG - Chr8:47067943-47067962 MsG0880044669.01.T01:intron 25.0%
! TCAGAAATTATTGAACTAGA+AGG - Chr8:47069425-47069444 MsG0880044669.01.T01:CDS 25.0%
! TGACAAACAATAGCTTAAAT+TGG - Chr8:47069850-47069869 MsG0880044669.01.T01:CDS 25.0%
! TGACATCTTAACAAAAGTAA+AGG - Chr8:47068811-47068830 MsG0880044669.01.T01:intron 25.0%
! TGATAAATCATCAACTTTGT+AGG + Chr8:47069381-47069400 None:intergenic 25.0%
! TGTGACTATTATAGAAAATG+TGG - Chr8:47067888-47067907 MsG0880044669.01.T01:intron 25.0%
! TGTTGAGACTAAATTGTATT+AGG - Chr8:47069190-47069209 MsG0880044669.01.T01:intron 25.0%
! TTCATTGAAGTTTACAGTTA+CGG - Chr8:47069102-47069121 MsG0880044669.01.T01:intron 25.0%
! TTCTCAATAAAGAACAAGAT+TGG - Chr8:47069527-47069546 MsG0880044669.01.T01:intron 25.0%
!! AAATCTGATGTATTCAGTTT+TGG - Chr8:47070381-47070400 MsG0880044669.01.T01:CDS 25.0%
!! ATATATATTTGATGGTTCCA+TGG + Chr8:47068345-47068364 None:intergenic 25.0%
!! ATGCCAAAATCTGATATTTT+CGG + Chr8:47070171-47070190 None:intergenic 25.0%
!! CTATATTTTCCATAAATGGA+TGG - Chr8:47068571-47068590 MsG0880044669.01.T01:intron 25.0%
!! TAACTTTTGTTGGAATTCAT+AGG + Chr8:47067183-47067202 None:intergenic 25.0%
!! TATATATTTGATGGTTCCAT+GGG + Chr8:47068344-47068363 None:intergenic 25.0%
!! TCAAGTAATCCAAATTTTGA+AGG - Chr8:47068862-47068881 MsG0880044669.01.T01:intron 25.0%
!! TTTGAAATCTAAACCCAAAT+AGG - Chr8:47069966-47069985 MsG0880044669.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTCTAATTTCAATCTCCA+TGG - Chr8:47070532-47070551 MsG0880044669.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGCTTAAATTGGTTGATTTT+TGG - Chr8:47069861-47069880 MsG0880044669.01.T01:CDS 25.0%
AAGCGCTTTAACATTATTTG+TGG - Chr8:47070045-47070064 MsG0880044669.01.T01:CDS 30.0%
AATTCTAACATAACAGGAGA+AGG - Chr8:47068185-47068204 MsG0880044669.01.T01:CDS 30.0%
AGAAATCTTGTTAAGCTTCT+TGG - Chr8:47069783-47069802 MsG0880044669.01.T01:CDS 30.0%
AGCCTCAAATGTATTTAGTT+TGG + Chr8:47068749-47068768 None:intergenic 30.0%
ATAAAGAACAAGATTGGTGA+AGG - Chr8:47069533-47069552 MsG0880044669.01.T01:intron 30.0%
ATTAGGGAGTTTGAAAATGA+TGG - Chr8:47068245-47068264 MsG0880044669.01.T01:intron 30.0%
ATTCCAACAAAAGTTACTTG+GGG - Chr8:47067187-47067206 MsG0880044669.01.T01:CDS 30.0%
CAAAATCATCAAATTCAGCT+AGG + Chr8:47070269-47070288 None:intergenic 30.0%
CAAGGTGAAAAATTTGTACT+TGG - Chr8:47067147-47067166 MsG0880044669.01.T01:CDS 30.0%
CAAGTTATTATCGATACGTA+TGG - Chr8:47067814-47067833 MsG0880044669.01.T01:intron 30.0%
CCTGAACAATATCTTATGAA+AGG - Chr8:47067612-47067631 MsG0880044669.01.T01:intron 30.0%
CCTTTCATAAGATATTGTTC+AGG + Chr8:47067615-47067634 None:intergenic 30.0%
CGATTCTGTAATATCAAGAA+TGG - Chr8:47067773-47067792 MsG0880044669.01.T01:intron 30.0%
CTATTATGTGAATGCTTATC+AGG - Chr8:47067942-47067961 MsG0880044669.01.T01:intron 30.0%
CTTTATTGAGAAGTTATCAG+TGG + Chr8:47069519-47069538 None:intergenic 30.0%
GAAATTATTGAACTAGAAGG+TGG - Chr8:47069428-47069447 MsG0880044669.01.T01:intron 30.0%
GAATTCCAACAAAAGTTACT+TGG - Chr8:47067185-47067204 MsG0880044669.01.T01:CDS 30.0%
GAGACTAAATTGTATTAGGT+TGG - Chr8:47069194-47069213 MsG0880044669.01.T01:intron 30.0%
TAAGGTGATAGTCATCTTAT+TGG + Chr8:47070836-47070855 None:intergenic 30.0%
TATAGAAAATGTGGAGTCTA+CGG - Chr8:47067897-47067916 MsG0880044669.01.T01:intron 30.0%
TCAGGATCTATATATTCGAA+TGG - Chr8:47068268-47068287 MsG0880044669.01.T01:intron 30.0%
TTGTAAGCGTAAACATTGTT+AGG + Chr8:47067705-47067724 None:intergenic 30.0%
! AACCCGAAAATATCAGATTT+TGG - Chr8:47070165-47070184 MsG0880044669.01.T01:CDS 30.0%
! AACTTTGAAGAGAGACATAA+TGG - Chr8:47068430-47068449 MsG0880044669.01.T01:CDS 30.0%
! ACTTTGAAGAGAGACATAAT+GGG - Chr8:47068431-47068450 MsG0880044669.01.T01:CDS 30.0%
! CAAATAATGTTAAAGCGCTT+AGG + Chr8:47070045-47070064 None:intergenic 30.0%
! GGTCTTTATCTAATTTGTCT+CGG - Chr8:47069123-47069142 MsG0880044669.01.T01:intron 30.0%
! TGCCAAAATCTGATATTTTC+GGG + Chr8:47070170-47070189 None:intergenic 30.0%
! TTTGGCATAGCTAGAATTTT+TGG - Chr8:47070183-47070202 MsG0880044669.01.T01:CDS 30.0%
!! AATTTGTTAGAATTGGACCA+TGG - Chr8:47067643-47067662 MsG0880044669.01.T01:CDS 30.0%
!! CTAGCTGAATTTGATGATTT+TGG - Chr8:47070267-47070286 MsG0880044669.01.T01:CDS 30.0%
!! GATGGATTTTTGAAAGTGAA+AGG - Chr8:47068059-47068078 MsG0880044669.01.T01:CDS 30.0%
!!! CAGTTTTGGAATTTTGATGT+TGG - Chr8:47070395-47070414 MsG0880044669.01.T01:CDS 30.0%
AACAAAGAGACGAAGTAGTT+TGG - Chr8:47067328-47067347 MsG0880044669.01.T01:intron 35.0%
AAGGTTGAATATGTAAGCAG+TGG + Chr8:47069488-47069507 None:intergenic 35.0%
ACAAAAGTTACTTGGGGATT+TGG - Chr8:47067193-47067212 MsG0880044669.01.T01:CDS 35.0%
ACATTGTTCCATTTGATCAG+AGG - Chr8:47069400-47069419 MsG0880044669.01.T01:CDS 35.0%
ACCATTCTACCATCCATTTA+TGG + Chr8:47068583-47068602 None:intergenic 35.0%
ACTTGGGTAGATCAAACAAT+AGG - Chr8:47068107-47068126 MsG0880044669.01.T01:CDS 35.0%
AGGTTGAATATGTAAGCAGT+GGG + Chr8:47069487-47069506 None:intergenic 35.0%
ATATGTGGAAAAAGAAGTCG+AGG - Chr8:47070423-47070442 MsG0880044669.01.T01:CDS 35.0%
ATCACCAGGAGACTTATATT+GGG - Chr8:47067569-47067588 MsG0880044669.01.T01:intron 35.0%
ATCCTAACACTAAACAACAC+TGG - Chr8:47067291-47067310 MsG0880044669.01.T01:CDS 35.0%
ATGAAGATAAAGAAGACCTC+GGG + Chr8:47070076-47070095 None:intergenic 35.0%
CAGCATACACCTTCAAAATT+TGG + Chr8:47068874-47068893 None:intergenic 35.0%
CATCAACTTTGTAGGATGAA+GGG + Chr8:47069373-47069392 None:intergenic 35.0%
CTACTGCTATGGAAAATTTG+AGG + Chr8:47067077-47067096 None:intergenic 35.0%
CTAGCATCATTATAGCATCT+GGG - Chr8:47068482-47068501 MsG0880044669.01.T01:intron 35.0%
CTCGGCTATTTAATCATGTA+CGG - Chr8:47069141-47069160 MsG0880044669.01.T01:intron 35.0%
CTTACATAAGTGACAAGGTT+AGG + Chr8:47070471-47070490 None:intergenic 35.0%
CTTACTAAGTTCCAACAACT+CGG + Chr8:47070236-47070255 None:intergenic 35.0%
GATGAAGATAAAGAAGACCT+CGG + Chr8:47070077-47070096 None:intergenic 35.0%
GGATTCTTGTGTTAAATCAG+AGG - Chr8:47070621-47070640 MsG0880044669.01.T01:CDS 35.0%
GTTCCAACTTTGTTGATCTT+CGG + Chr8:47067841-47067860 None:intergenic 35.0%
GTTGTTTAGTGTTAGGATTC+CGG + Chr8:47067289-47067308 None:intergenic 35.0%
TCATCAAATTCAGCTAGGTA+CGG + Chr8:47070264-47070283 None:intergenic 35.0%
TCATCAACTTTGTAGGATGA+AGG + Chr8:47069374-47069393 None:intergenic 35.0%
TCATCAAGCAAAACATTGCT+TGG + Chr8:47070138-47070157 None:intergenic 35.0%
TCCAGATTGTACACATACTT+GGG - Chr8:47068091-47068110 MsG0880044669.01.T01:CDS 35.0%
TCCAGTACAAACAGTTGTTT+GGG - Chr8:47067227-47067246 MsG0880044669.01.T01:CDS 35.0%
TCCATAAATGGATGGTAGAA+TGG - Chr8:47068579-47068598 MsG0880044669.01.T01:intron 35.0%
TCGGCTATTTAATCATGTAC+GGG - Chr8:47069142-47069161 MsG0880044669.01.T01:intron 35.0%
TGAAATCACTACCAAAAGAC+AGG - Chr8:47067865-47067884 MsG0880044669.01.T01:intron 35.0%
TGTACTAACAAACTCAGTGA+TGG - Chr8:47068041-47068060 MsG0880044669.01.T01:CDS 35.0%
TGTTATTATGTAGGGAAGAC+TGG - Chr8:47069659-47069678 MsG0880044669.01.T01:CDS 35.0%
TTCAGAATTAGGCAAAGGTA+AGG - Chr8:47068295-47068314 MsG0880044669.01.T01:intron 35.0%
TTCCAGATTGTACACATACT+TGG - Chr8:47068090-47068109 MsG0880044669.01.T01:CDS 35.0%
TTCCAGTACAAACAGTTGTT+TGG - Chr8:47067226-47067245 MsG0880044669.01.T01:CDS 35.0%
TTCTGAATCCTCTGATCAAA+TGG + Chr8:47069411-47069430 None:intergenic 35.0%
TTGATGTTGGAGATCATATG+TGG - Chr8:47070408-47070427 MsG0880044669.01.T01:CDS 35.0%
TTGGAATCTTAGAACTCGTA+CGG - Chr8:47067509-47067528 MsG0880044669.01.T01:CDS 35.0%
TTTCTTAGAGTTCATCCTAG+TGG + Chr8:47068621-47068640 None:intergenic 35.0%
! AATCCCCAAGTAACTTTTGT+TGG + Chr8:47067193-47067212 None:intergenic 35.0%
! ACATTGTTAGGCTTTTGATC+TGG + Chr8:47067693-47067712 None:intergenic 35.0%
! AGCAATTGAAGCATTCTACA+AGG + Chr8:47069225-47069244 None:intergenic 35.0%
! CTACTTCGTCTCTTTGTTTA+AGG + Chr8:47067326-47067345 None:intergenic 35.0%
! GAACTCTAAGAAAGTCACTT+GGG - Chr8:47068628-47068647 MsG0880044669.01.T01:intron 35.0%
! GCTATGGAAAATTTGAGGTA+AGG + Chr8:47067072-47067091 None:intergenic 35.0%
! TAATAGTCACACCTGTCTTT+TGG + Chr8:47067879-47067898 None:intergenic 35.0%
! TCCTTGTTTACATAGTAACC+AGG + Chr8:47070766-47070785 None:intergenic 35.0%
! TGAACTCTAAGAAAGTCACT+TGG - Chr8:47068627-47068646 MsG0880044669.01.T01:intron 35.0%
! TTGCACAACTTTTGGATTCA+GGG - Chr8:47067385-47067404 MsG0880044669.01.T01:intron 35.0%
! TTTGGATTAGATCAGACTCA+TGG - Chr8:47070201-47070220 MsG0880044669.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTTCACCTTGTGAAACCA+AGG + Chr8:47067139-47067158 None:intergenic 35.0%
! TTTTTGTTGAACTAGCCACT+AGG - Chr8:47068603-47068622 MsG0880044669.01.T01:intron 35.0%
!! ACTAAGAGTATCTACTGCTA+TGG + Chr8:47067088-47067107 None:intergenic 35.0%
!! GCTGGTTTGATAATCATGTA+TGG - Chr8:47068897-47068916 MsG0880044669.01.T01:intron 35.0%
!! TAAATTGTATTAGGTTGGCC+AGG - Chr8:47069199-47069218 MsG0880044669.01.T01:intron 35.0%
!!! CTTTTCACTTTGACTTGACT+TGG + Chr8:47070806-47070825 None:intergenic 35.0%
!!! GGAATTTTTTATCTTGCGTG+TGG - Chr8:47068977-47068996 MsG0880044669.01.T01:intron 35.0%
AACTTCAATGAAACCGAAGC+TGG + Chr8:47069094-47069113 None:intergenic 40.0%
AAGAACAAGATTGGTGAAGG+CGG - Chr8:47069536-47069555 MsG0880044669.01.T01:intron 40.0%
AAGTTGTGCAACTGGATTCA+CGG + Chr8:47067376-47067395 None:intergenic 40.0%
ACATAGTAACCAGGCTCTTT+CGG + Chr8:47070757-47070776 None:intergenic 40.0%
ACCCAAACAACTGTTTGTAC+TGG + Chr8:47067231-47067250 None:intergenic 40.0%
ACCCAAGTATGTGTACAATC+TGG + Chr8:47068095-47068114 None:intergenic 40.0%
ATACTGTGGCACAGAATAAC+TGG - Chr8:47068532-47068551 MsG0880044669.01.T01:intron 40.0%
ATCTCCCAATCCTTCACTAA+TGG - Chr8:47067108-47067127 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
ATCTTAGAACTCGTACGGAA+AGG - Chr8:47067514-47067533 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
ATTATTTGTGGAATTGCCCG+AGG - Chr8:47070057-47070076 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
CAAACCCAGAAGTCTATTTG+TGG - Chr8:47067436-47067455 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
CAATATAAGTCTCCTGGTGA+TGG + Chr8:47067570-47067589 None:intergenic 40.0%
CAATCTCCATGGTTCACTTT+AGG - Chr8:47070543-47070562 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
CACTTTAGGCATGGAGTTTA+TGG - Chr8:47070557-47070576 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
CATCACCAGGAGACTTATAT+TGG - Chr8:47067568-47067587 MsG0880044669.01.T01:intron 40.0%
CATGCCATTAGTGAAGGATT+GGG + Chr8:47067115-47067134 None:intergenic 40.0%
CCCTTCTGATACAATACTTC+CGG - Chr8:47067473-47067492 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
CCTTCTGATACAATACTTCC+GGG - Chr8:47067474-47067493 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
CCTTCTGTGATTCTAATGCT+GGG - Chr8:47070709-47070728 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
CGAATGGATGCTTCAGAATT+AGG - Chr8:47068284-47068303 MsG0880044669.01.T01:intron 40.0%
CGGCTATTTAATCATGTACG+GGG - Chr8:47069143-47069162 MsG0880044669.01.T01:intron 40.0%
CTAAAGTGCAATCCATTCCA+TGG + Chr8:47067663-47067682 None:intergenic 40.0%
CTAATGCTTCAATCCAGCTT+CGG - Chr8:47069078-47069097 MsG0880044669.01.T01:intron 40.0%
CTTCTGATACAATACTTCCG+GGG - Chr8:47067475-47067494 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
CTTCTGTGATTCTAATGCTG+GGG - Chr8:47070710-47070729 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
GAATCCAAAAGTTGTGCAAC+TGG + Chr8:47067384-47067403 None:intergenic 40.0%
GACAAGAAATTGCTGTGAAG+AGG - Chr8:47069688-47069707 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
GAGTTTATGGAAAGAGGGAA+GGG - Chr8:47070570-47070589 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
GATATCGTCTCTACATACTG+TGG - Chr8:47068518-47068537 MsG0880044669.01.T01:intron 40.0%
GATGCTTCAGAATTAGGCAA+AGG - Chr8:47068290-47068309 MsG0880044669.01.T01:intron 40.0%
GCATGGAGTTTATGGAAAGA+GGG - Chr8:47070565-47070584 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
GCCTGGTTACTATGTAAACA+AGG - Chr8:47070762-47070781 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
GCTAGCATCATTATAGCATC+TGG - Chr8:47068481-47068500 MsG0880044669.01.T01:intron 40.0%
GGAGTTTGAAAATGATGGTC+AGG - Chr8:47068250-47068269 MsG0880044669.01.T01:intron 40.0%
GTCACTTGGGCTAATTACAA+AGG - Chr8:47068641-47068660 MsG0880044669.01.T01:intron 40.0%
GTTAGAATTGGACCATGGAA+TGG - Chr8:47067648-47067667 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
GTTATCAGTGGCAGTAACTA+AGG + Chr8:47069507-47069526 None:intergenic 40.0%
GTTTCGATTGTATGTTGCAG+CGG - Chr8:47070315-47070334 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
TCACCAGGAGACTTATATTG+GGG - Chr8:47067570-47067589 MsG0880044669.01.T01:intron 40.0%
TCATGCCATTAGTGAAGGAT+TGG + Chr8:47067116-47067135 None:intergenic 40.0%
TCTGCCACAAATAGACTTCT+GGG + Chr8:47067443-47067462 None:intergenic 40.0%
TGATACCAAAAGCAAACTGC+TGG - Chr8:47070014-47070033 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
TTCATCAAGATTCGAGACTG+AGG - Chr8:47070091-47070110 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
! CGTCTCTTTGTTTAAGGACA+AGG + Chr8:47067320-47067339 None:intergenic 40.0%
! CTTTTGTTAAGTGTGCTTGC+TGG - Chr8:47068956-47068975 MsG0880044669.01.T01:intron 40.0%
! GAATCCAGTTGCACAACTTT+TGG - Chr8:47067377-47067396 MsG0880044669.01.T01:intron 40.0%
! GCAAAACATTGCTTGGTTTG+AGG + Chr8:47070131-47070150 None:intergenic 40.0%
! GTTGCACAACTTTTGGATTC+AGG - Chr8:47067384-47067403 MsG0880044669.01.T01:intron 40.0%
!! ACAGTTGTTTGGGTTGCAAA+TGG - Chr8:47067237-47067256 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
!! CCGGAAGTATTGTATCAGAA+GGG + Chr8:47067476-47067495 None:intergenic 40.0%
!! TGCCAGTGTTGTTTAGTGTT+AGG + Chr8:47067296-47067315 None:intergenic 40.0%
!! TGGAATGGATTGCACTTTAG+TGG - Chr8:47067663-47067682 MsG0880044669.01.T01:CDS 40.0%
!!! GCATCTGGGATGCTATTTTT+TGG - Chr8:47068496-47068515 MsG0880044669.01.T01:intron 40.0%
AACATAACAGGAGAAGGCAG+TGG - Chr8:47068191-47068210 MsG0880044669.01.T01:CDS 45.0%
AGAGTAGTTGTGTTGGAGGT+CGG - Chr8:47069010-47069029 MsG0880044669.01.T01:intron 45.0%
ATACTTCCGGGGATGAAGTT+AGG - Chr8:47067486-47067505 MsG0880044669.01.T01:CDS 45.0%
ATTCTAATGCTGGGGAGTGA+TGG - Chr8:47070718-47070737 MsG0880044669.01.T01:CDS 45.0%
ATTGAACTAGAAGGTGGCAG+AGG - Chr8:47069434-47069453 MsG0880044669.01.T01:intron 45.0%
CAAGGTCATGCCATTAGTGA+AGG + Chr8:47067121-47067140 None:intergenic 45.0%
CATTAGGCTTCACGATACGT+TGG + Chr8:47068781-47068800 None:intergenic 45.0%
CCAAAAGCAAACTGCTGGAT+TGG - Chr8:47070019-47070038 MsG0880044669.01.T01:CDS 45.0%
CCCAGCATTAGAATCACAGA+AGG + Chr8:47070712-47070731 None:intergenic 45.0%
CTCTGCCACAAATAGACTTC+TGG + Chr8:47067444-47067463 None:intergenic 45.0%
CTTCACTAATGGCATGACCT+TGG - Chr8:47067119-47067138 MsG0880044669.01.T01:CDS 45.0%
GAACCCCAATATAAGTCTCC+TGG + Chr8:47067576-47067595 None:intergenic 45.0%
GCCTTCTGTGATTCTAATGC+TGG - Chr8:47070708-47070727 MsG0880044669.01.T01:CDS 45.0%
GGAAATACAAGCCGAGTTGT+TGG - Chr8:47070222-47070241 MsG0880044669.01.T01:CDS 45.0%
GGAGTTTATGGAAAGAGGGA+AGG - Chr8:47070569-47070588 MsG0880044669.01.T01:CDS 45.0%
GGCATGGAGTTTATGGAAAG+AGG - Chr8:47070564-47070583 MsG0880044669.01.T01:CDS 45.0%
GGTCCGAAGATCAACAAAGT+TGG - Chr8:47067835-47067854 MsG0880044669.01.T01:intron 45.0%
GTTGTGGAGAGTAGTTGTGT+TGG - Chr8:47069003-47069022 MsG0880044669.01.T01:intron 45.0%
GTTTAGTGTTAGGATTCCGG+AGG + Chr8:47067286-47067305 None:intergenic 45.0%
TCCAGCAATTTCCAGAGGAT+AGG - Chr8:47070677-47070696 MsG0880044669.01.T01:CDS 45.0%
TCCATGCCTAAAGTGAACCA+TGG + Chr8:47070552-47070571 None:intergenic 45.0%
TCCATGGTTCACTTTAGGCA+TGG - Chr8:47070548-47070567 MsG0880044669.01.T01:CDS 45.0%
TCTTGTGATACGAGACGAGA+AGG - Chr8:47067410-47067429 MsG0880044669.01.T01:CDS 45.0%
TTCCAACCTAACTTCATCCC+CGG + Chr8:47067495-47067514 None:intergenic 45.0%
! AAGAGGCTTTCAAGTGACTC+TGG - Chr8:47069705-47069724 MsG0880044669.01.T01:CDS 45.0%
! AAGATTGGTGAAGGCGGTTT+TGG - Chr8:47069542-47069561 MsG0880044669.01.T01:intron 45.0%
! AGAATCACAGAAGGCATACC+AGG + Chr8:47070703-47070722 None:intergenic 45.0%
! CTTTCAAGTGACTCTGGACA+AGG - Chr8:47069711-47069730 MsG0880044669.01.T01:CDS 45.0%
! TTGAAGCATTCTACAAGGCC+TGG + Chr8:47069220-47069239 None:intergenic 45.0%
!! AACTCGTCTGATTGGTCTCA+AGG - Chr8:47067993-47068012 MsG0880044669.01.T01:intron 45.0%
!! CCAATCCAGCAGTTTGCTTT+TGG + Chr8:47070022-47070041 None:intergenic 45.0%
!! CCCGGAAGTATTGTATCAGA+AGG + Chr8:47067477-47067496 None:intergenic 45.0%
!! GAGACATAATGGGCTGAAGA+AGG - Chr8:47068441-47068460 MsG0880044669.01.T01:CDS 45.0%
!!! CGGTTTTGGACCTGTATACA+AGG - Chr8:47069556-47069575 MsG0880044669.01.T01:intron 45.0%
!!! GGCGCTTTGAGATGGTTTTT+AGG - Chr8:47069031-47069050 MsG0880044669.01.T01:intron 45.0%
!! ATATATATATATATATTTGA+TGG + Chr8:47068353-47068372 None:intergenic 5.0%
!!! ATGTTTTATTTATTTTAATT+TGG - Chr8:47068395-47068414 MsG0880044669.01.T01:CDS 5.0%
AGTCCATCTGCAGCATACTC+TGG + Chr8:47070351-47070370 None:intergenic 50.0%
AGTGGCTGTGTCATGTGGTT+TGG - Chr8:47068209-47068228 MsG0880044669.01.T01:intron 50.0%
ATCCAAGCACAAGCTGTGCA+AGG + Chr8:47069286-47069305 None:intergenic 50.0%
ATCCTTGCACAGCTTGTGCT+TGG - Chr8:47069281-47069300 MsG0880044669.01.T01:intron 50.0%
ATGTAGGGAAGACTGGCAAG+TGG - Chr8:47069666-47069685 MsG0880044669.01.T01:CDS 50.0%
CAATTTCCAGAGGATAGGCC+TGG - Chr8:47070682-47070701 MsG0880044669.01.T01:CDS 50.0%
CCCATCAATGATTCCTCCTC+CGG - Chr8:47067267-47067286 MsG0880044669.01.T01:CDS 50.0%
CCGGAGGAGGAATCATTGAT+GGG + Chr8:47067270-47067289 None:intergenic 50.0%
CGGAAAGGAGAATGACGTCT+TGG - Chr8:47067529-47067548 MsG0880044669.01.T01:CDS 50.0%
CTGCTTGGAACTCGTCTGAT+TGG - Chr8:47067985-47068004 MsG0880044669.01.T01:intron 50.0%
GCTTATCAGGGTTTAGCCCT+AGG - Chr8:47067955-47067974 MsG0880044669.01.T01:intron 50.0%
GCTTCTTGGTTGTTGCATCG+AGG - Chr8:47069797-47069816 MsG0880044669.01.T01:CDS 50.0%
GGCATGACCTTGGTTTCACA+AGG - Chr8:47067129-47067148 MsG0880044669.01.T01:CDS 50.0%
GTGGAGAGTAGTTGTGTTGG+AGG - Chr8:47069006-47069025 MsG0880044669.01.T01:intron 50.0%
GTGTGTCCAGCAATTTCCAG+AGG - Chr8:47070672-47070691 MsG0880044669.01.T01:CDS 50.0%
TACGGCACTTGCACAATCAC+AGG - Chr8:47067915-47067934 MsG0880044669.01.T01:intron 50.0%
TAGTGTTAGGATTCCGGAGG+AGG + Chr8:47067283-47067302 None:intergenic 50.0%
TCCGGAGGAGGAATCATTGA+TGG + Chr8:47067271-47067290 None:intergenic 50.0%
TGGCAGAGGTAGTGAAGATG+AGG - Chr8:47069448-47069467 MsG0880044669.01.T01:intron 50.0%
TGTATGTTGCAGCGGCTACA+TGG - Chr8:47070323-47070342 MsG0880044669.01.T01:CDS 50.0%
TTCCGGGGATGAAGTTAGGT+TGG - Chr8:47067490-47067509 MsG0880044669.01.T01:CDS 50.0%
TTTGCTAAGCCGAAAGAGCC+TGG - Chr8:47070745-47070764 MsG0880044669.01.T01:CDS 50.0%
! ATCTTGCGTGTGGACTGTTG+TGG - Chr8:47068987-47069006 MsG0880044669.01.T01:intron 50.0%
! GCCTATCCTCTGGAAATTGC+TGG + Chr8:47070681-47070700 None:intergenic 50.0%
AAGGCAGTGGCTGTGTCATG+TGG - Chr8:47068204-47068223 MsG0880044669.01.T01:intron 55.0%
AGTCCTGACGATCCATCACC+AGG - Chr8:47067555-47067574 MsG0880044669.01.T01:intron 55.0%
GCACCAGAGTATGCTGCAGA+TGG - Chr8:47070345-47070364 MsG0880044669.01.T01:CDS 55.0%
TCAGACGAGTTCCAAGCAGC+TGG + Chr8:47067984-47068003 None:intergenic 55.0%
TCCAAGCAGCTGGAGACCTA+GGG + Chr8:47067974-47067993 None:intergenic 55.0%
TTCCAAGCAGCTGGAGACCT+AGG + Chr8:47067975-47067994 None:intergenic 55.0%
! TGAAGGTGTATGCTGCGTGC+TGG - Chr8:47068879-47068898 MsG0880044669.01.T01:intron 55.0%
!! TCTCCTGGTGATGGATCGTC+AGG + Chr8:47067561-47067580 None:intergenic 55.0%
GGCATACCAGGCCTATCCTC+TGG + Chr8:47070691-47070710 None:intergenic 60.0%
!! TGGAGGTCGGCGCTTTGAGA+TGG - Chr8:47069023-47069042 MsG0880044669.01.T01:intron 60.0%
GCCCTAGGTCTCCAGCTGCT+TGG - Chr8:47067970-47067989 MsG0880044669.01.T01:intron 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 47067015 47070870 47067015 ID=MsG0880044669.01;Name=MsG0880044669.01
Chr8 mRNA 47067015 47070870 47067015 ID=MsG0880044669.01.T01;Parent=MsG0880044669.01;Name=MsG0880044669.01.T01;_AED=0.30;_eAED=0.30;_QI=0|0|0|1|1|1|7|0|795
Chr8 exon 47069574 47070870 47069574 ID=MsG0880044669.01.T01:exon:19218;Parent=MsG0880044669.01.T01
Chr8 exon 47069332 47069445 47069332 ID=MsG0880044669.01.T01:exon:19217;Parent=MsG0880044669.01.T01
Chr8 exon 47068308 47068465 47068308 ID=MsG0880044669.01.T01:exon:19216;Parent=MsG0880044669.01.T01
Chr8 exon 47068003 47068213 47068003 ID=MsG0880044669.01.T01:exon:19215;Parent=MsG0880044669.01.T01
Chr8 exon 47067635 47067785 47067635 ID=MsG0880044669.01.T01:exon:19214;Parent=MsG0880044669.01.T01
Chr8 exon 47067400 47067550 47067400 ID=MsG0880044669.01.T01:exon:19213;Parent=MsG0880044669.01.T01
Chr8 exon 47067015 47067320 47067015 ID=MsG0880044669.01.T01:exon:19212;Parent=MsG0880044669.01.T01
Chr8 CDS 47069574 47070870 47069574 ID=MsG0880044669.01.T01:cds;Parent=MsG0880044669.01.T01
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Chr8 CDS 47067635 47067785 47067635 ID=MsG0880044669.01.T01:cds;Parent=MsG0880044669.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0880044669.01.T01

ATGAATATTGATACTATTTCCTTCTTGATAAATCTTACATGTATACTTCTTCTACCTTACCTCAAATTTTCCATAGCAGTAGATACTCTTAGTATCTCCCAATCCTTCACTAATGGCATGACCTTGGTTTCACAAGGTGAAAAATTTGTACTTGGTTTCTTCAGTCCTATGAATTCCAACAAAAGTTACTTGGGGATTTGGTATAAGAATATTCCAGTACAAACAGTTGTTTGGGTTGCAAATGGTGTCAAACCCATCAATGATTCCTCCTCCGGAATCCTAACACTAAACAACACTGGCAACCTTGTCCTTAAACAAAGAGACGAAGTAGTTTGGTATACAACATCTCAACAAGATTCCGTGAATCCAGTTGCACAACTTTTGGATTCAGGGAATCTTGTGATACGAGACGAGAAGGAAACAAACCCAGAAGTCTATTTGTGGCAGAGTTTTGATTACCCTTCTGATACAATACTTCCGGGGATGAAGTTAGGTTGGAATCTTAGAACTCGTACGGAAAGGAGAATGACGTCTTGGAAAAGTCCTGACGATCCATCACCAGGAGACTTATATTGGGGTTCGTTACTTTATAATTATCCTGAACAATATCTTATGAAAGGAACAAAGAAATTTGTTAGAATTGGACCATGGAATGGATTGCACTTTAGTGGTGTACCAGATCAAAAGCCTAACAATGTTTACGCTTACAATTTTGTGTCTAATAAGGATGAGATATACTATACATACAGTATGTTGAACGATTCTGTAATATCAAGAATGGAATTGAATCAAACGGATTCAAGTTATTATCGATACGTATGGTCCGAAGATCAACAAAGTTGGAACGTTATGAAATCACTACCAAAAGACAGGTGTGACTATTATAGAAAATGTGGAGTCTACGGCACTTGCACAATCACAGGCTCACTATTATGTGAATGCTTATCAGGGTTTAGCCCTAGGTCTCCAGCTGCTTGGAACTCGTCTGATTGGTCTCAAGGATGTGTCCGAAATAAACCGTTAAATTGTACTAACAAACTCAGTGATGGATTTTTGAAAGTGAAAGGTCTGAAAGTTCCAGATTGTACACATACTTGGGTAGATCAAACAATAGGTCTAAATGAATGTAGACTGAAATGCTTGAATAATTGTTCTTGTACGGCTTATACTAATTCTAACATAACAGGAGAAGGCAGTGGCTGTGTCATGTGGTTTGGTGATTTAATTGATATTAGGGAGTTTGAAAATGATGGTCAGGATCTATATATTCGAATGGATGCTTCAGAATTAGGCAAAGAGAGACATAATGGGCTGAAGAAGGATCTGATAAGCATTCTTGCTAGCATCATTATAGCATCTGGGATGCTATTTTTTGGATATCGTCTCTACATACTGTGGCACAGAATAACTGAGGATTCAGAAATTATTGAACTAGAAGGTGGCAGAGGTAGTGAAGATGAGGATGATCTCGATCTCCCACTGCTTACATATTCAACCTTAGTTACTGCCACTGATAACTTCTCAATAAAGAACAAGATTGGTGAAGGCGGTTTTGGACCTGTATACAAGGGAAGACTGGCAAGTGGACAAGAAATTGCTGTGAAGAGGCTTTCAAGTGACTCTGGACAAGGAATTACTGAGTTAAAGAATGAAGTAAAACTTATAGCAAAACTTCAACACAGAAATCTTGTTAAGCTTCTTGGTTGTTGCATCGAGGAAGAACATAGAATGCTAGTTTATGAGTACATGACAAACAATAGCTTAAATTGGTTGATTTTTGATTCGAGACTGAGGATAATTCATAGAGACCTCAAACCAAGCAATGTTTTGCTTGATGACAAGTTGAACCCGAAAATATCAGATTTTGGCATAGCTAGAATTTTTGGATTAGATCAGACTCATGGAAATACAAGCCGAGTTGTTGGAACTTACGGCTACATGGCACCAGAGTATGCTGCAGATGGACTTTTTTCTGTGAAATCTGATGTATTCAGTTTTGGAATTTTGATGTTGGAGATCATATGTGGAAAAAGAAGTCGAGGTTTTTATGTCGAAAACGAATCTCCTAACCTTGTCACTTATGCATGGAGTTTATGGAAAGAGGGAAGGGCTTTAGAACTAATTGACAAAAACATAAAGGATTCTTGTGTTAAATCAGAGGCATTGCGTTGCATTCATATCAGTCTCTTGTGTGTCCAGCAATTTCCAGAGGATAGGCCTGGTATGCCTTCTGTGATTCTAATGCTGGGGAGTGATGGTGAATTTGCTAAGCCGAAAGAGCCTGGTTACTATGTAAACAAGGATTCATTTGCAGAAACTTCCAAGTCAAGTCAAAGTGAAAAGAGCATAACCAATAAGATGACTATCACCTTATTAGAAGCCAGATGA

Protein sequence

>MsG0880044669.01.T01

MNIDTISFLINLTCILLLPYLKFSIAVDTLSISQSFTNGMTLVSQGEKFVLGFFSPMNSNKSYLGIWYKNIPVQTVVWVANGVKPINDSSSGILTLNNTGNLVLKQRDEVVWYTTSQQDSVNPVAQLLDSGNLVIRDEKETNPEVYLWQSFDYPSDTILPGMKLGWNLRTRTERRMTSWKSPDDPSPGDLYWGSLLYNYPEQYLMKGTKKFVRIGPWNGLHFSGVPDQKPNNVYAYNFVSNKDEIYYTYSMLNDSVISRMELNQTDSSYYRYVWSEDQQSWNVMKSLPKDRCDYYRKCGVYGTCTITGSLLCECLSGFSPRSPAAWNSSDWSQGCVRNKPLNCTNKLSDGFLKVKGLKVPDCTHTWVDQTIGLNECRLKCLNNCSCTAYTNSNITGEGSGCVMWFGDLIDIREFENDGQDLYIRMDASELGKERHNGLKKDLISILASIIIASGMLFFGYRLYILWHRITEDSEIIELEGGRGSEDEDDLDLPLLTYSTLVTATDNFSIKNKIGEGGFGPVYKGRLASGQEIAVKRLSSDSGQGITELKNEVKLIAKLQHRNLVKLLGCCIEEEHRMLVYEYMTNNSLNWLIFDSRLRIIHRDLKPSNVLLDDKLNPKISDFGIARIFGLDQTHGNTSRVVGTYGYMAPEYAADGLFSVKSDVFSFGILMLEIICGKRSRGFYVENESPNLVTYAWSLWKEGRALELIDKNIKDSCVKSEALRCIHISLLCVQQFPEDRPGMPSVILMLGSDGEFAKPKEPGYYVNKDSFAETSKSSQSEKSITNKMTITLLEAR*