AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880045156.01

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MsG0880045156.01.T04 AT5G37950 31.579 171 104 4 56 223 183 343 9.08e-20 88.6
MsG0880045156.01.T04 AT1G64920 35.252 139 84 2 116 248 244 382 2.00e-18 85.9
MsG0880045156.01.T04 AT4G01070 31.081 148 79 4 56 190 209 346 5.27e-14 72.0
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MsG0880045156.01.T06 AT4G34131 60.366 164 54 2 2 154 312 475 1.63e-57 186
MsG0880045156.01.T06 AT2G15490 59.494 158 53 3 1 147 308 465 4.31e-56 182
MsG0880045156.01.T06 AT2G15480 60.127 158 52 3 1 147 311 468 3.30e-55 180
MsG0880045156.01.T06 AT2G15490 57.764 161 54 3 1 147 308 468 7.38e-55 179
MsG0880045156.01.T06 AT2G15480 55.556 171 49 3 1 147 311 478 4.98e-54 177
MsG0880045156.01.T06 AT4G34135 63.057 157 47 1 2 147 313 469 9.50e-53 174
MsG0880045156.01.T06 AT3G53160 47.590 166 68 5 1 147 305 470 1.93e-41 144
MsG0880045156.01.T06 AT2G36760 48.795 166 66 6 1 147 311 476 9.23e-41 142
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MsG0880045156.01.T06 AT2G36770 48.193 166 67 5 1 147 311 476 8.84e-40 140
MsG0880045156.01.T06 AT2G36790 49.689 161 62 5 6 147 315 475 1.71e-39 139
MsG0880045156.01.T06 AT2G36750 45.783 166 71 6 1 147 306 471 1.29e-38 137
MsG0880045156.01.T06 AT3G53150 45.198 177 67 6 1 147 321 497 3.04e-38 136
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MsG0880045156.01.T03 AT1G30530 30.145 345 194 9 2 324 121 440 1.08e-33 129
MsG0880045156.01.T03 AT5G38010 29.825 342 199 9 3 322 119 441 1.68e-33 129
MsG0880045156.01.T03 AT4G15490 29.032 341 213 8 2 322 123 454 2.13e-33 129
MsG0880045156.01.T03 AT5G38040 32.530 249 148 4 76 322 207 437 9.23e-33 126
MsG0880045156.01.T03 AT4G14090 30.321 343 196 12 1 321 121 442 2.26e-32 125
MsG0880045156.01.T03 AT3G46720 31.321 265 158 5 58 322 188 428 2.49e-32 125
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MsG0880045156.01.T03 AT2G30140 30.818 318 175 11 18 322 154 439 6.88e-32 124
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MsG0880045156.01.T03 AT2G30150 32.841 271 144 7 60 322 200 440 2.02e-31 123
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MsG0880045156.01.T03 AT2G16890 31.795 195 89 8 5 171 130 308 2.82e-14 72.8
MsG0880045156.01.T03 AT4G01070 32.450 151 73 6 76 210 209 346 8.55e-14 71.6
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MsG0880045156.01.T02 AT1G22370 32.426 404 219 15 4 370 74 460 8.52e-41 150
MsG0880045156.01.T02 AT2G31750 31.579 380 223 13 19 375 77 442 1.27e-40 150
MsG0880045156.01.T02 AT2G23260 31.373 357 216 11 38 375 95 441 1.35e-40 149
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MsG0880045156.01.T02 AT3G46680 29.213 356 211 8 42 375 101 437 6.69e-40 147
MsG0880045156.01.T02 AT3G21800 36.466 266 136 9 129 375 212 463 9.67e-40 147
MsG0880045156.01.T02 AT2G26480 29.310 348 206 10 50 375 104 433 1.66e-39 146
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MsG0880045156.01.T02 AT5G59590 28.409 352 203 7 49 375 110 437 3.73e-39 145
MsG0880045156.01.T02 AT3G46700 28.333 360 218 9 38 375 91 432 4.42e-39 145
MsG0880045156.01.T02 AT3G46660 31.025 361 204 12 40 375 103 443 5.73e-39 145
MsG0880045156.01.T02 AT5G05880 29.508 366 212 12 32 375 95 436 6.96e-39 144
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MsG0880045156.01.T02 AT1G30530 29.723 397 230 11 4 377 70 440 2.62e-38 143
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MsG0880045156.01.T02 AT2G16890 35.246 244 121 8 6 224 77 308 3.12e-26 107
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MsG0880045156.01.T08 AT4G15280 40.909 176 77 7 1 157 294 461 1.64e-30 115
MsG0880045156.01.T08 AT2G29740 42.138 159 85 4 2 157 308 462 1.95e-30 115
MsG0880045156.01.T08 AT5G05870 37.736 159 86 3 2 157 294 442 3.56e-30 114
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MsG0880045156.01.T08 AT1G06000 39.103 156 80 3 10 157 273 421 1.28e-29 112
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MsG0880045156.01.T08 AT4G15260 39.429 175 82 7 1 157 174 342 4.97e-29 109
MsG0880045156.01.T08 AT5G14860 40.909 154 87 2 1 154 310 459 7.51e-29 110
MsG0880045156.01.T08 AT3G46670 38.750 160 85 3 1 157 287 436 8.60e-29 110
MsG0880045156.01.T08 AT1G05680 43.312 157 78 4 2 157 294 440 9.40e-29 110
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MsG0880045156.01.T08 AT1G01390 39.766 171 81 3 1 156 308 471 1.09e-28 110
MsG0880045156.01.T08 AT1G05675 43.590 156 79 3 2 157 294 440 1.15e-28 110
MsG0880045156.01.T08 AT1G07240 40.351 171 87 6 2 163 305 469 1.34e-28 110
MsG0880045156.01.T08 AT3G11340 37.107 159 87 3 2 157 284 432 1.42e-28 109
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MsG0880045156.01.T01 AT2G36790 54.622 119 48 3 112 224 357 475 1.72e-31 120
MsG0880045156.01.T01 AT2G36790 37.063 143 73 4 1 129 20 159 1.08e-23 99.0
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MsG0880045156.01.T01 AT3G53160 36.923 130 67 3 1 115 15 144 1.88e-19 87.0
MsG0880045156.01.T01 AT4G34135 41.060 151 66 4 1 131 18 165 8.02e-31 116
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MsG0880045156.01.T01 AT2G36750 39.437 142 72 3 1 128 17 158 3.13e-24 100
MsG0880045156.01.T01 AT2G36780 49.580 119 54 3 112 224 358 476 2.60e-29 114
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MsG0880045156.01.T01 AT3G22250 32.143 112 57 3 112 214 350 451 1.72e-12 66.6
MsG0880045156.01.T01 AT4G15500 32.143 112 67 2 116 224 345 450 2.80e-12 65.9
MsG0880045156.01.T01 AT3G55700 33.929 112 65 2 113 224 336 438 4.75e-12 65.1
MsG0880045156.01.T01 AT3G21560 33.945 109 69 1 116 224 355 460 5.36e-12 65.1
MsG0880045156.01.T01 AT1G51210 37.755 98 55 3 112 209 339 430 6.14e-12 64.7
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MsG0880045156.01.T05 AT5G38010 32.000 250 135 6 36 269 211 441 1.11e-27 111
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MsG0880045156.01.T05 AT3G55700 29.371 286 161 7 5 269 173 438 1.86e-26 107
MsG0880045156.01.T05 AT4G15490 28.571 280 176 7 5 269 184 454 2.79e-26 107
MsG0880045156.01.T05 AT2G30150 31.365 271 135 8 20 269 184 424 8.33e-26 105
MsG0880045156.01.T05 AT2G30150 31.365 271 135 8 20 269 200 440 1.42e-25 105
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MsG0880045156.01.T05 AT2G30140 30.104 289 149 10 7 269 177 438 3.24e-25 104
MsG0880045156.01.T05 AT3G22250 32.287 223 108 9 63 259 246 451 8.77e-25 103
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MsG0880045156.01.T05 AT1G05560 30.241 291 157 11 6 269 218 489 3.56e-22 96.3
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MsG0880045156.01.T05 AT5G54010 27.354 223 126 5 37 242 203 406 1.56e-16 79.3
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MsG0880045156.01.T07 AT3G46680 33.083 266 154 5 22 282 191 437 9.37e-38 139
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MsG0880045156.01.T07 AT1G24100 35.484 248 150 4 37 282 207 446 3.82e-37 137
MsG0880045156.01.T07 AT2G43840 34.387 253 144 7 37 282 197 434 4.81e-37 137
MsG0880045156.01.T07 AT1G22360 34.387 253 140 6 29 278 219 448 8.43e-37 136
MsG0880045156.01.T07 AT2G43840 34.387 253 144 7 37 282 197 434 9.58e-37 136
MsG0880045156.01.T07 AT2G18560 33.582 268 141 7 34 282 115 364 1.01e-36 135
MsG0880045156.01.T07 AT4G15480 35.039 254 151 7 33 282 223 466 1.23e-36 136
MsG0880045156.01.T07 AT1G22370 36.882 263 145 8 23 277 211 460 1.54e-36 136
MsG0880045156.01.T07 AT5G05860 32.090 268 161 5 18 282 186 435 2.71e-36 135
MsG0880045156.01.T07 AT2G31790 35.714 252 144 8 37 282 205 444 3.25e-36 135
MsG0880045156.01.T07 AT3G21750 34.444 270 137 8 36 282 204 456 3.76e-36 135
MsG0880045156.01.T07 AT3G46690 32.463 268 159 5 18 282 189 437 1.13e-35 133
MsG0880045156.01.T07 AT2G36970 36.788 193 112 3 92 282 274 458 1.20e-35 134
MsG0880045156.01.T07 AT3G21780 34.409 279 145 11 21 282 199 456 3.44e-35 132
MsG0880045156.01.T07 AT2G23250 34.155 284 164 10 1 282 161 423 1.01e-34 130
MsG0880045156.01.T07 AT3G46650 31.599 269 161 5 18 283 173 421 1.74e-34 130
MsG0880045156.01.T07 AT5G49690 38.202 178 100 2 95 272 266 433 3.75e-34 129
MsG0880045156.01.T07 AT5G05890 32.937 252 148 4 34 282 207 440 4.26e-34 129
MsG0880045156.01.T07 AT1G30530 33.333 267 152 6 20 284 198 440 6.50e-34 128
MsG0880045156.01.T07 AT4G15500 30.496 282 179 7 5 282 182 450 2.30e-33 127
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MsG0880045156.01.T07 AT5G38010 33.600 250 144 5 36 282 211 441 6.60e-33 125
MsG0880045156.01.T07 AT3G46720 31.321 265 158 5 18 282 188 428 1.26e-32 125
MsG0880045156.01.T07 AT4G15490 30.357 280 184 6 5 282 184 454 1.36e-32 125
MsG0880045156.01.T07 AT3G55700 31.119 286 169 6 5 282 173 438 5.61e-32 123
MsG0880045156.01.T07 AT2G30150 32.841 271 144 7 20 282 184 424 5.63e-32 123
MsG0880045156.01.T07 AT4G14090 32.986 288 165 10 1 281 176 442 6.23e-32 123
MsG0880045156.01.T07 AT2G30150 32.841 271 144 7 20 282 200 440 9.34e-32 122
MsG0880045156.01.T07 AT2G30140 31.834 289 157 9 7 282 178 439 1.50e-31 122
MsG0880045156.01.T07 AT2G30140 31.834 289 157 9 7 282 177 438 1.54e-31 122
MsG0880045156.01.T07 AT3G22250 34.529 223 116 9 63 272 246 451 1.23e-30 119
MsG0880045156.01.T07 AT3G21560 29.286 280 186 7 5 282 191 460 1.95e-30 119
MsG0880045156.01.T07 AT2G28080 31.939 263 154 8 22 282 219 458 5.60e-30 118
MsG0880045156.01.T07 AT5G05900 29.961 257 156 6 27 282 202 435 1.80e-29 116
MsG0880045156.01.T07 AT3G55710 31.119 286 175 6 5 282 171 442 2.69e-29 116
MsG0880045156.01.T07 AT1G05530 30.847 295 166 11 6 282 168 442 3.39e-29 115
MsG0880045156.01.T07 AT4G15550 34.975 203 116 5 90 282 265 461 2.49e-27 110
MsG0880045156.01.T07 AT1G05560 31.615 291 166 10 6 282 168 439 2.52e-27 110
MsG0880045156.01.T07 AT1G05560 31.615 291 166 10 6 282 218 489 3.47e-27 110
MsG0880045156.01.T07 AT3G02100 33.333 246 136 10 37 281 228 446 3.81e-26 107
MsG0880045156.01.T07 AT4G27570 29.915 234 145 5 23 252 189 407 1.12e-25 105
MsG0880045156.01.T07 AT2G22590 41.860 129 72 2 95 220 273 401 2.00e-25 105
MsG0880045156.01.T07 AT5G65550 34.884 172 106 3 95 266 269 434 2.29e-24 102
MsG0880045156.01.T07 AT4G27560 28.205 234 149 5 23 252 189 407 1.19e-23 100
MsG0880045156.01.T07 AT3G29630 34.545 165 96 3 96 255 220 377 2.80e-23 99.0
MsG0880045156.01.T07 AT3G29630 34.545 165 96 3 96 255 246 403 2.87e-23 99.4
MsG0880045156.01.T07 AT5G54010 29.148 223 135 4 37 255 203 406 3.90e-23 99.0
MsG0880045156.01.T07 AT5G54060 29.333 225 136 6 36 255 219 425 5.02e-22 95.9
MsG0880045156.01.T07 AT2G22930 33.758 157 93 3 103 255 251 400 1.05e-21 94.7
MsG0880045156.01.T07 AT5G53990 36.296 135 84 1 96 228 244 378 1.34e-21 94.4
MsG0880045156.01.T07 AT1G64910 26.693 251 159 6 37 283 197 426 2.44e-21 93.6
MsG0880045156.01.T07 AT1G50580 29.577 213 134 3 18 228 181 379 1.11e-20 91.7
MsG0880045156.01.T07 AT4G09500 32.911 158 95 3 104 257 227 377 4.75e-20 89.7
MsG0880045156.01.T07 AT4G09500 32.911 158 95 3 104 257 252 402 5.66e-20 89.7
MsG0880045156.01.T07 AT5G37950 31.579 171 104 4 36 203 177 337 8.62e-20 88.2
MsG0880045156.01.T07 AT5G37950 31.579 171 104 4 36 203 183 343 1.04e-19 88.2
MsG0880045156.01.T07 AT1G64920 35.252 139 84 2 96 228 244 382 1.46e-18 85.5
MsG0880045156.01.T07 AT4G01070 32.450 151 73 6 36 170 209 346 6.07e-14 71.6

Find 112 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 132 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ACTGATTCTGCTGCAAAATT+TGG 0.112841 8:-55011830 MsG0880045156.01.T01:CDS
CTTAATTTCCTCAAATAATT+TGG 0.120980 8:+55011607 None:intergenic
CAAATTATTTGAGGAAATTA+AGG 0.200681 8:-55011606 MsG0880045156.01.T01:intron
TTTGGCAAAGCTTTCGCTTA+TGG 0.206670 8:+55011625 None:intergenic
CTCAATTCACAATAGAAATA+AGG 0.223742 8:-55011468 MsG0880045156.01.T01:intron
GAATATCTATGTTGTTAAAA+TGG 0.233658 8:+55012040 None:intergenic
TATGTTGTTAAAATGGATTT+TGG 0.260473 8:+55012047 None:intergenic
TTGGCAAAGCTTTCGCTTAT+GGG 0.304747 8:+55011626 None:intergenic
TATTTGCTTCAAAAGGTGTT+AGG 0.306204 8:-55012128 MsG0880045156.01.T01:CDS
TCAATTCACAATAGAAATAA+GGG 0.330516 8:-55011467 MsG0880045156.01.T01:intron
CTTCCTTAACTCTCAGCTTA+AGG 0.344679 8:-55011324 MsG0880045156.01.T01:intron
GGGAGGTTTGTTGAGGGGTG+TGG 0.345533 8:+55012092 None:intergenic
ATTCTTGAACATGAAGCAAT+TGG 0.358659 8:-55011149 MsG0880045156.01.T01:CDS
TATGATACCTACCATTGATA+TGG 0.366217 8:-55012157 MsG0880045156.01.T01:CDS
TTTGAGATTACCAATCTTCC+CGG 0.366588 8:-55011701 MsG0880045156.01.T01:intron
GTTGAGGGGTGTGGTGACTA+TGG 0.368985 8:+55012101 None:intergenic
TGAGATGGGAGGTTTGTTGA+GGG 0.380305 8:+55012086 None:intergenic
TTTGATATTACCGGGAAGAT+TGG 0.385875 8:+55011691 None:intergenic
GAAGGCTGTGAAGAGGGTTA+TGG 0.392509 8:-55010928 MsG0880045156.01.T01:CDS
TCAGTTGTTTACGTGTGTTT+TGG 0.394263 8:-55011359 MsG0880045156.01.T01:intron
GTTCTTTCCTCGAATCCTTC+AGG 0.399860 8:+55011218 None:intergenic
TTCTTGAACATGAAGCAATT+GGG 0.403743 8:-55011148 MsG0880045156.01.T01:CDS
AAGCTTTGCCAAATTATTTG+AGG 0.408089 8:-55011615 MsG0880045156.01.T01:intron
GGATGGAATTCGGTATTAGA+AGG 0.415260 8:-55011107 MsG0880045156.01.T01:CDS
CTGGAGTACCTATGATTACT+TGG 0.416440 8:-55011076 MsG0880045156.01.T01:CDS
TCAACATTCTCACATCCTTC+AGG 0.420188 8:+55011983 None:intergenic
GTCAATGAGGTGCTTAAAAC+TGG 0.424684 8:-55011017 MsG0880045156.01.T01:CDS
GCTAAACTATTTGCTTCAAA+AGG 0.424931 8:-55012135 MsG0880045156.01.T01:CDS
CTGCAAAATTTGGAATTCCT+AGG 0.430170 8:-55011820 MsG0880045156.01.T01:CDS
CTAGTAGCAGCAAAGAATTT+CGG 0.434605 8:+55011935 None:intergenic
TTGAGATGGGAGGTTTGTTG+AGG 0.439792 8:+55012085 None:intergenic
GAAGATTGGTAATCTCAAAT+AGG 0.443996 8:+55011705 None:intergenic
ATTTGCTTCAAAAGGTGTTA+GGG 0.445221 8:-55012127 MsG0880045156.01.T01:CDS
TGTGAAGAGGGTTATGGAAG+GGG 0.446955 8:-55010922 MsG0880045156.01.T01:CDS
TTTCCTTAAGCTGAGAGTTA+AGG 0.447873 8:+55011321 None:intergenic
TATCAATGGTAGGTATCATA+TGG 0.461201 8:+55012160 None:intergenic
GAATGTTGATTCAATCCCTT+CGG 0.462171 8:-55011969 MsG0880045156.01.T01:CDS
CTGAAGCAATAGTTCTTCAA+AGG 0.462369 8:+55011898 None:intergenic
GACGCATTGTGGATGGAATT+CGG 0.466361 8:-55011117 MsG0880045156.01.T01:CDS
GGTTGGGGATAATGTTCAAT+GGG 0.475813 8:-55010961 MsG0880045156.01.T01:CDS
GGAATAAAAGAATGGCATAT+AGG 0.476323 8:-55011497 MsG0880045156.01.T01:intron
GCTATGGGACTCGAAGCATC+AGG 0.476966 8:-55011296 MsG0880045156.01.T01:intron
TAAAATTGCTCGGCTGCGAC+AGG 0.479195 8:+55011053 None:intergenic
GTATTAGAAGGAGTGGTAGC+TGG 0.482586 8:-55011095 MsG0880045156.01.T01:CDS
GGAAAAGGACTAATTATAAG+AGG 0.482802 8:-55011191 MsG0880045156.01.T01:intron
GCTTGCAGAAATGGCAAAGA+AGG 0.487592 8:-55010865 MsG0880045156.01.T01:CDS
TTAAAACTGGTGTACCTGTA+GGG 0.490558 8:-55011004 MsG0880045156.01.T01:CDS
TCAGCTTAAGGAAATTGCTA+TGG 0.495499 8:-55011312 MsG0880045156.01.T01:intron
GCGACAGGCCAAGTAATCAT+AGG 0.496554 8:+55011068 None:intergenic
CAAATTCCCTGTGTAGAGGC+AGG 0.496996 8:-55012010 MsG0880045156.01.T01:intron
GAGGAAAGAACGGAAGGAAA+AGG 0.498531 8:-55011206 MsG0880045156.01.T01:intron
CTTCTCATTGTAAAATTGCT+CGG 0.508540 8:+55011043 None:intergenic
GATTCAGAGGTGAAGAGTTA+CGG 0.508870 8:-55011584 MsG0880045156.01.T01:intron
AAAATGGGTTATAAAGGTTG+GGG 0.509064 8:-55010976 MsG0880045156.01.T01:CDS
ACAGTTGAATGCTTTAATTG+AGG 0.511433 8:-55010816 None:intergenic
AAGAAGGCTGTGGAAGAAGA+TGG 0.513431 8:-55010849 MsG0880045156.01.T01:CDS
GATTATTATAGAGAGGTACT+TGG 0.514207 8:-55011518 MsG0880045156.01.T01:intron
AAGGACTAATTATAAGAGGT+TGG 0.519090 8:-55011187 MsG0880045156.01.T01:intron
AGGTTGGGGATAATGTTCAA+TGG 0.519842 8:-55010962 MsG0880045156.01.T01:CDS
TTGCTGATATGTTCTTTCCA+TGG 0.520382 8:-55011856 MsG0880045156.01.T01:CDS
GAGATGGGAGGTTTGTTGAG+GGG 0.530260 8:+55012087 None:intergenic
ATGGCTACCTGAAGGATTCG+AGG 0.539632 8:-55011225 MsG0880045156.01.T01:intron
CTTAAAACTGGTGTACCTGT+AGG 0.540289 8:-55011005 MsG0880045156.01.T01:CDS
TTTCTATTGTGAATTGAGAG+TGG 0.544488 8:+55011473 None:intergenic
CATTTGTGACGCATTGTGGA+TGG 0.545828 8:-55011124 MsG0880045156.01.T01:CDS
CAGCTTAAGGAAATTGCTAT+GGG 0.546742 8:-55011311 MsG0880045156.01.T01:intron
GCAGCAGAATCAGTTGTCCA+TGG 0.546745 8:+55011839 None:intergenic
CAATGAGAAGTTGGTCAATG+AGG 0.546945 8:-55011030 MsG0880045156.01.T01:CDS
TTCGGAACCACGGAAACCGA+AGG 0.555691 8:+55011953 None:intergenic
GTGCCATGGAACACAATCCT+AGG 0.556336 8:+55011803 None:intergenic
TTCAATCCCTTCGGTTTCCG+TGG 0.558058 8:-55011960 MsG0880045156.01.T01:CDS
AGGTAAACCTGCCTCTACAC+AGG 0.559754 8:+55012003 None:intergenic
AGGTACTTGGAATAAAAGAA+TGG 0.561241 8:-55011505 MsG0880045156.01.T01:intron
AGAAAGAAGACGGAGAAGAA+TGG 0.561867 8:-55011244 MsG0880045156.01.T01:intron
TGAGGAAATTAAGGATTCAG+AGG 0.562139 8:-55011597 MsG0880045156.01.T01:intron
CTGTGAAGAGGGTTATGGAA+GGG 0.564496 8:-55010923 MsG0880045156.01.T01:CDS
AAATAGTTTAGCCATATCAA+TGG 0.566599 8:+55012146 None:intergenic
TGTTCAAGAATCAACACTTG+TGG 0.567739 8:+55011161 None:intergenic
AAGAAAACAAACTAGTGCCA+TGG 0.573437 8:+55011789 None:intergenic
TGAAGCAATAGTTCTTCAAA+GGG 0.574231 8:+55011899 None:intergenic
GCTGTGAAGAGGGTTATGGA+AGG 0.574438 8:-55010924 MsG0880045156.01.T01:CDS
TCTTGAACATGAAGCAATTG+GGG 0.576135 8:-55011147 MsG0880045156.01.T01:CDS
TCGGAACCACGGAAACCGAA+GGG 0.576526 8:+55011954 None:intergenic
GGGAAGAAGCTTATGAAATG+AGG 0.577196 8:-55010902 MsG0880045156.01.T01:CDS
TGAAGGATTCGAGGAAAGAA+CGG 0.580126 8:-55011216 MsG0880045156.01.T01:intron
ATTCCTAGGATTGTGTTCCA+TGG 0.583408 8:-55011806 MsG0880045156.01.T01:intron
AGTTTAGCCATATCAATGGT+AGG 0.588257 8:+55012150 None:intergenic
ACAAACACGAGTGTCTAAAG+TGG 0.589360 8:-55011403 MsG0880045156.01.T01:intron
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GAATTCGGTATTAGAAGGAG+TGG 0.597561 8:-55011102 MsG0880045156.01.T01:CDS
CCATCAAATTCCCTGTGTAG+AGG 0.601196 8:-55012014 MsG0880045156.01.T01:intron
TAATGTTCAATGGGATGCGG+TGG 0.605044 8:-55010952 MsG0880045156.01.T01:CDS
AGCAAAGAATTTCGGAACCA+CGG 0.608601 8:+55011943 None:intergenic
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CGGTGGAGAAGGCTGTGAAG+AGG 0.620089 8:-55010935 MsG0880045156.01.T01:CDS
GGTAAACCTGCCTCTACACA+GGG 0.621024 8:+55012004 None:intergenic
CAATTCACAATAGAAATAAG+GGG 0.626068 8:-55011466 MsG0880045156.01.T01:intron
TTATGCAGATTATTATAGAG+AGG 0.627612 8:-55011525 MsG0880045156.01.T01:intron
GTGAGGACACAGAAAGAAGA+CGG 0.628699 8:-55011254 MsG0880045156.01.T01:intron
GGATTCGAGGAAAGAACGGA+AGG 0.629284 8:-55011212 MsG0880045156.01.T01:intron
GTAGAGGCAGGTTTACCTGA+AGG 0.630395 8:-55011998 MsG0880045156.01.T01:intron
TGGTAGGTATCATATGGCCA+TGG 0.632531 8:+55012166 None:intergenic
CTATGGGACTCGAAGCATCA+GGG 0.632797 8:-55011295 MsG0880045156.01.T01:intron
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GGAGAAGAATGGCTACCTGA+AGG 0.641725 8:-55011233 MsG0880045156.01.T01:intron
GGATAATGTTCAATGGGATG+CGG 0.644697 8:-55010955 MsG0880045156.01.T01:CDS
CCGGTAATATCAAAATGACA+AGG 0.646923 8:-55011682 MsG0880045156.01.T01:intron
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ATATCAGCAACAATACAATG+TGG 0.750304 8:+55011869 None:intergenic
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CRISPR-GE

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!! CTTAATTTCCTCAAATAATT+TGG + Chr8:55011385-55011404 None:intergenic 20.0%
!! GAATATCTATGTTGTTAAAA+TGG + Chr8:55010952-55010971 None:intergenic 20.0%
!! TCAATTCACAATAGAAATAA+GGG - Chr8:55011522-55011541 MsG0880045156.01.T01:intron 20.0%
!!! TATGTTGTTAAAATGGATTT+TGG + Chr8:55010945-55010964 None:intergenic 20.0%
! AAATAGTTTAGCCATATCAA+TGG + Chr8:55010846-55010865 None:intergenic 25.0%
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! CAATTCACAATAGAAATAAG+GGG - Chr8:55011523-55011542 MsG0880045156.01.T01:intron 25.0%
! CTCAATTCACAATAGAAATA+AGG - Chr8:55011521-55011540 MsG0880045156.01.T01:intron 25.0%
! TTATGCAGATTATTATAGAG+AGG - Chr8:55011464-55011483 MsG0880045156.01.T01:intron 25.0%
!! TCAGAAGAAACATTTTTGTA+AGG + Chr8:55011258-55011277 None:intergenic 25.0%
!!! AAAAAATGGGTTATAAAGGT+TGG - Chr8:55012011-55012030 MsG0880045156.01.T01:intron 25.0%
!!! AAAAATGGGTTATAAAGGTT+GGG - Chr8:55012012-55012031 MsG0880045156.01.T01:intron 25.0%
!!! GGTTAAAAAATGGGTTATAA+AGG - Chr8:55012007-55012026 MsG0880045156.01.T01:intron 25.0%
AAGCTTTGCCAAATTATTTG+AGG - Chr8:55011374-55011393 MsG0880045156.01.T01:intron 30.0%
AAGGACTAATTATAAGAGGT+TGG - Chr8:55011802-55011821 MsG0880045156.01.T01:intron 30.0%
AGGTACTTGGAATAAAAGAA+TGG - Chr8:55011484-55011503 MsG0880045156.01.T01:intron 30.0%
ATATCAGCAACAATACAATG+TGG + Chr8:55011123-55011142 None:intergenic 30.0%
ATTCTTGAACATGAAGCAAT+TGG - Chr8:55011840-55011859 MsG0880045156.01.T01:CDS 30.0%
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GGAAAAGGACTAATTATAAG+AGG - Chr8:55011798-55011817 MsG0880045156.01.T01:intron 30.0%
GGAATAAAAGAATGGCATAT+AGG - Chr8:55011492-55011511 MsG0880045156.01.T01:intron 30.0%
TATCAATGGTAGGTATCATA+TGG + Chr8:55010832-55010851 None:intergenic 30.0%
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TTCTTGAACATGAAGCAATT+GGG - Chr8:55011841-55011860 MsG0880045156.01.T01:CDS 30.0%
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! ATGGATTTTGGATTGTTCTA+AGG + Chr8:55010933-55010952 None:intergenic 30.0%
! GAAGATTGGTAATCTCAAAT+AGG + Chr8:55011287-55011306 None:intergenic 30.0%
! GCAATTTTACAATGAGAAGT+TGG - Chr8:55011950-55011969 MsG0880045156.01.T01:CDS 30.0%
!! AAAATGGGTTATAAAGGTTG+GGG - Chr8:55012013-55012032 MsG0880045156.01.T01:intron 30.0%
!! ATTTGCTTCAAAAGGTGTTA+GGG - Chr8:55010862-55010881 MsG0880045156.01.T01:CDS 30.0%
!! GATTATTATAGAGAGGTACT+TGG - Chr8:55011471-55011490 MsG0880045156.01.T01:intron 30.0%
!! TATTTGCTTCAAAAGGTGTT+AGG - Chr8:55010861-55010880 MsG0880045156.01.T01:CDS 30.0%
!!! CCTTGTCATTTTGATATTAC+CGG + Chr8:55011310-55011329 None:intergenic 30.0%
!!! CTTGTCATTTTGATATTACC+GGG + Chr8:55011309-55011328 None:intergenic 30.0%
AAGAAAACAAACTAGTGCCA+TGG + Chr8:55011203-55011222 None:intergenic 35.0%
ACCTGTAGGGGTTAAAAAAT+GGG - Chr8:55011998-55012017 MsG0880045156.01.T01:intron 35.0%
AGCAAAAATGCTTGCAGAAA+TGG - Chr8:55012115-55012134 MsG0880045156.01.T01:CDS 35.0%
AGTTTAGCCATATCAATGGT+AGG + Chr8:55010842-55010861 None:intergenic 35.0%
CAGCTTAAGGAAATTGCTAT+GGG - Chr8:55011678-55011697 MsG0880045156.01.T01:intron 35.0%
CCGGTAATATCAAAATGACA+AGG - Chr8:55011307-55011326 MsG0880045156.01.T01:intron 35.0%
CTAGTAGCAGCAAAGAATTT+CGG + Chr8:55011057-55011076 None:intergenic 35.0%
CTGAAGCAATAGTTCTTCAA+AGG + Chr8:55011094-55011113 None:intergenic 35.0%
TACCTGTAGGGGTTAAAAAA+TGG - Chr8:55011997-55012016 MsG0880045156.01.T01:intron 35.0%
TCAGCTTAAGGAAATTGCTA+TGG - Chr8:55011677-55011696 MsG0880045156.01.T01:intron 35.0%
TCTTGAACATGAAGCAATTG+GGG - Chr8:55011842-55011861 MsG0880045156.01.T01:CDS 35.0%
TGAGGAAATTAAGGATTCAG+AGG - Chr8:55011392-55011411 MsG0880045156.01.T01:intron 35.0%
TGTTCAAGAATCAACACTTG+TGG + Chr8:55011831-55011850 None:intergenic 35.0%
TTAAAACTGGTGTACCTGTA+GGG - Chr8:55011985-55012004 MsG0880045156.01.T01:CDS 35.0%
TTGCTGATATGTTCTTTCCA+TGG - Chr8:55011133-55011152 MsG0880045156.01.T01:CDS 35.0%
TTTCCTTAAGCTGAGAGTTA+AGG + Chr8:55011671-55011690 None:intergenic 35.0%
TTTGATATTACCGGGAAGAT+TGG + Chr8:55011301-55011320 None:intergenic 35.0%
! ACTGATTCTGCTGCAAAATT+TGG - Chr8:55011159-55011178 MsG0880045156.01.T01:intron 35.0%
! ATCAGGGCATGATTTTATCT+GGG - Chr8:55011710-55011729 MsG0880045156.01.T01:intron 35.0%
! ATGATTTTATCTGGGTTGTG+AGG - Chr8:55011718-55011737 MsG0880045156.01.T01:intron 35.0%
! CAATAGATGCTTCTTTTCCT+CGG + Chr8:55011566-55011585 None:intergenic 35.0%
! CTGCAAAATTTGGAATTCCT+AGG - Chr8:55011169-55011188 MsG0880045156.01.T01:intron 35.0%
! TCAGTTGTTTACGTGTGTTT+TGG - Chr8:55011630-55011649 MsG0880045156.01.T01:intron 35.0%
! TCGTTTTCTGTGAGTGTATT+TGG + Chr8:55011342-55011361 None:intergenic 35.0%
! TTTGAGATTACCAATCTTCC+CGG - Chr8:55011288-55011307 MsG0880045156.01.T01:intron 35.0%
!! GAATGTTGATTCAATCCCTT+CGG - Chr8:55011020-55011039 MsG0880045156.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGTTCTAAGGCTTTTGAGAT+GGG + Chr8:55010920-55010939 None:intergenic 35.0%
!!! TTGTTCTAAGGCTTTTGAGA+TGG + Chr8:55010921-55010940 None:intergenic 35.0%
ACAAACACGAGTGTCTAAAG+TGG - Chr8:55011586-55011605 MsG0880045156.01.T01:intron 40.0%
AGAAAGAAGACGGAGAAGAA+TGG - Chr8:55011745-55011764 MsG0880045156.01.T01:intron 40.0%
AGCAAAGAATTTCGGAACCA+CGG + Chr8:55011049-55011068 None:intergenic 40.0%
AGGTTGGGGATAATGTTCAA+TGG - Chr8:55012027-55012046 MsG0880045156.01.T01:intron 40.0%
ATTCCTAGGATTGTGTTCCA+TGG - Chr8:55011183-55011202 MsG0880045156.01.T01:intron 40.0%
CTTAAAACTGGTGTACCTGT+AGG - Chr8:55011984-55012003 MsG0880045156.01.T01:CDS 40.0%
CTTCCTTAACTCTCAGCTTA+AGG - Chr8:55011665-55011684 MsG0880045156.01.T01:intron 40.0%
GAATTCGGTATTAGAAGGAG+TGG - Chr8:55011887-55011906 MsG0880045156.01.T01:CDS 40.0%
GATTCAGAGGTGAAGAGTTA+CGG - Chr8:55011405-55011424 MsG0880045156.01.T01:intron 40.0%
GGATAATGTTCAATGGGATG+CGG - Chr8:55012034-55012053 MsG0880045156.01.T01:intron 40.0%
GGATGGAATTCGGTATTAGA+AGG - Chr8:55011882-55011901 MsG0880045156.01.T01:CDS 40.0%
GGGAAGAAGCTTATGAAATG+AGG - Chr8:55012087-55012106 MsG0880045156.01.T01:CDS 40.0%
GGTTGGGGATAATGTTCAAT+GGG - Chr8:55012028-55012047 MsG0880045156.01.T01:intron 40.0%
TAAAACTGGTGTACCTGTAG+GGG - Chr8:55011986-55012005 MsG0880045156.01.T01:CDS 40.0%
TCAACATTCTCACATCCTTC+AGG + Chr8:55011009-55011028 None:intergenic 40.0%
TGAAGGATTCGAGGAAAGAA+CGG - Chr8:55011773-55011792 MsG0880045156.01.T01:intron 40.0%
TTGGCAAAGCTTTCGCTTAT+GGG + Chr8:55011366-55011385 None:intergenic 40.0%
TTTGGCAAAGCTTTCGCTTA+TGG + Chr8:55011367-55011386 None:intergenic 40.0%
! CAATGAGAAGTTGGTCAATG+AGG - Chr8:55011959-55011978 MsG0880045156.01.T01:CDS 40.0%
! CATCAGGGCATGATTTTATC+TGG - Chr8:55011709-55011728 MsG0880045156.01.T01:intron 40.0%
! CTGGAGTACCTATGATTACT+TGG - Chr8:55011913-55011932 MsG0880045156.01.T01:CDS 40.0%
! GTCAATGAGGTGCTTAAAAC+TGG - Chr8:55011972-55011991 MsG0880045156.01.T01:CDS 40.0%
!!! ACCCATTTTTTAACCCCTAC+AGG + Chr8:55012002-55012021 None:intergenic 40.0%
AAGAAGGCTGTGGAAGAAGA+TGG - Chr8:55012140-55012159 MsG0880045156.01.T01:CDS 45.0%
AGAAATGGCAAAGAAGGCTG+TGG - Chr8:55012130-55012149 MsG0880045156.01.T01:CDS 45.0%
CATTTGTGACGCATTGTGGA+TGG - Chr8:55011865-55011884 MsG0880045156.01.T01:CDS 45.0%
CCATCAAATTCCCTGTGTAG+AGG - Chr8:55010975-55010994 MsG0880045156.01.T01:CDS 45.0%
CCTCTACACAGGGAATTTGA+TGG + Chr8:55010978-55010997 None:intergenic 45.0%
CTGTGAAGAGGGTTATGGAA+GGG - Chr8:55012066-55012085 MsG0880045156.01.T01:CDS 45.0%
GAAGAGATAACATCGTACCG+AGG - Chr8:55011546-55011565 MsG0880045156.01.T01:intron 45.0%
GACGCATTGTGGATGGAATT+CGG - Chr8:55011872-55011891 MsG0880045156.01.T01:CDS 45.0%
GAGGAAAGAACGGAAGGAAA+AGG - Chr8:55011783-55011802 MsG0880045156.01.T01:intron 45.0%
GCTTGCAGAAATGGCAAAGA+AGG - Chr8:55012124-55012143 MsG0880045156.01.T01:CDS 45.0%
GTATTAGAAGGAGTGGTAGC+TGG - Chr8:55011894-55011913 MsG0880045156.01.T01:CDS 45.0%
GTGAGGACACAGAAAGAAGA+CGG - Chr8:55011735-55011754 MsG0880045156.01.T01:intron 45.0%
GTTCTTTCCTCGAATCCTTC+AGG + Chr8:55011774-55011793 None:intergenic 45.0%
TAATGTTCAATGGGATGCGG+TGG - Chr8:55012037-55012056 MsG0880045156.01.T01:intron 45.0%
TGGTAGGTATCATATGGCCA+TGG + Chr8:55010826-55010845 None:intergenic 45.0%
TGTGAAGAGGGTTATGGAAG+GGG - Chr8:55012067-55012086 MsG0880045156.01.T01:CDS 45.0%
!! TGAGATGGGAGGTTTGTTGA+GGG + Chr8:55010906-55010925 None:intergenic 45.0%
!! TTGAGATGGGAGGTTTGTTG+AGG + Chr8:55010907-55010926 None:intergenic 45.0%
!!! TCTAAGGCTTTTGAGATGGG+AGG + Chr8:55010917-55010936 None:intergenic 45.0%
AGGTAAACCTGCCTCTACAC+AGG + Chr8:55010989-55011008 None:intergenic 50.0%
ATGGCTACCTGAAGGATTCG+AGG - Chr8:55011764-55011783 MsG0880045156.01.T01:intron 50.0%
CAAATTCCCTGTGTAGAGGC+AGG - Chr8:55010979-55010998 MsG0880045156.01.T01:CDS 50.0%
GAAGGCTGTGAAGAGGGTTA+TGG - Chr8:55012061-55012080 MsG0880045156.01.T01:CDS 50.0%
GCAGCAGAATCAGTTGTCCA+TGG + Chr8:55011153-55011172 None:intergenic 50.0%
GCGACAGGCCAAGTAATCAT+AGG + Chr8:55011924-55011943 None:intergenic 50.0%
GCTGTGAAGAGGGTTATGGA+AGG - Chr8:55012065-55012084 MsG0880045156.01.T01:CDS 50.0%
GGAGAAGAATGGCTACCTGA+AGG - Chr8:55011756-55011775 MsG0880045156.01.T01:intron 50.0%
GGATTCGAGGAAAGAACGGA+AGG - Chr8:55011777-55011796 MsG0880045156.01.T01:intron 50.0%
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GTAGAGGCAGGTTTACCTGA+AGG - Chr8:55010991-55011010 MsG0880045156.01.T01:CDS 50.0%
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TAAAATTGCTCGGCTGCGAC+AGG + Chr8:55011939-55011958 None:intergenic 50.0%
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!! GAGATGGGAGGTTTGTTGAG+GGG + Chr8:55010905-55010924 None:intergenic 50.0%
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! GCTATGGGACTCGAAGCATC+AGG - Chr8:55011693-55011712 MsG0880045156.01.T01:intron 55.0%
! GGGGCATTTGTGACGCATTG+TGG - Chr8:55011861-55011880 MsG0880045156.01.T01:CDS 55.0%
! GTTGAGGGGTGTGGTGACTA+TGG + Chr8:55010891-55010910 None:intergenic 55.0%
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!! GGGAGGTTTGTTGAGGGGTG+TGG + Chr8:55010900-55010919 None:intergenic 60.0%
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