AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880045213.01

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MsG0880045213.01.T01 AT4G23130 39.474 304 177 4 346 643 327 629 1.28e-69 239
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MsG0880045213.01.T01 AT1G34210 40.000 290 168 4 349 633 291 579 8.61e-66 228
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MsG0880045213.01.T01 AT3G14840 41.608 286 162 3 351 633 660 943 9.29e-66 234
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MsG0880045213.01.T01 AT1G61590 41.853 313 157 9 338 633 72 376 1.30e-65 223
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MsG0880045213.01.T01 AT4G23190 36.212 359 207 7 296 643 212 559 1.31e-65 227
MsG0880045213.01.T01 AT4G33430 40.000 290 168 4 349 633 275 563 1.32e-65 228
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MsG0880045213.01.T01 AT3G13690 42.034 295 159 8 345 633 393 681 1.68e-65 230
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MsG0880045213.01.T01 AT4G04570 49.302 215 105 3 350 561 335 548 7.75e-62 216
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MsG0880045213.01.T01 AT1G61430 38.245 319 190 5 351 666 454 768 4.24e-61 218
MsG0880045213.01.T01 AT1G61430 38.245 319 190 5 351 666 477 791 5.10e-61 218
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MsG0880045213.01.T01 AT1G11280 35.433 381 222 10 281 648 432 801 1.08e-60 218
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MsG0880045213.01.T01 AT2G28960 39.262 298 168 6 349 641 429 718 3.63e-60 215
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MsG0880045213.01.T01 AT3G09830 38.291 316 180 7 344 645 65 379 4.68e-60 207
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MsG0880045213.01.T01 AT5G65240 40.067 297 164 6 349 636 270 561 5.77e-60 212
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MsG0880045213.01.T01 AT1G61430 37.695 321 192 5 351 666 477 794 2.63e-59 214
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MsG0880045213.01.T01 AT2G25220 40.210 286 165 5 351 633 134 416 3.32e-59 206
MsG0880045213.01.T01 AT2G25220 40.210 286 165 5 351 633 139 421 3.53e-59 206
MsG0880045213.01.T01 AT2G20300 40.278 288 167 4 349 635 335 618 3.68e-59 213
MsG0880045213.01.T01 AT1G78530 34.349 361 209 10 287 635 2 346 3.77e-59 203
MsG0880045213.01.T01 AT1G51880 37.037 351 198 7 295 641 511 842 3.82e-59 214
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MsG0880045213.01.T01 AT1G51880 37.037 351 198 7 295 641 529 860 4.42e-59 214
MsG0880045213.01.T01 AT1G68690 39.024 287 169 4 351 633 365 649 4.61e-59 211
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MsG0880045213.01.T01 AT1G68690 39.024 287 169 4 351 633 365 649 4.61e-59 211
MsG0880045213.01.T01 AT1G51890 35.655 359 214 7 285 634 217 567 5.28e-59 209
MsG0880045213.01.T01 AT1G51880 37.037 351 198 7 295 641 537 868 5.31e-59 214
MsG0880045213.01.T01 AT1G79620 36.389 360 205 8 286 631 557 906 6.54e-59 214
MsG0880045213.01.T01 AT1G51870 36.828 372 212 10 283 641 446 807 6.90e-59 213
MsG0880045213.01.T01 AT1G79620 36.389 360 205 8 286 631 583 932 6.96e-59 214
MsG0880045213.01.T01 AT1G49100 36.970 330 195 6 315 641 539 858 9.53e-59 213
MsG0880045213.01.T01 AT1G51870 36.828 372 212 10 283 641 498 859 9.71e-59 213
MsG0880045213.01.T01 AT1G61440 34.336 399 227 9 295 666 420 810 1.09e-58 212
MsG0880045213.01.T01 AT3G46290 35.196 358 200 8 302 639 416 761 1.47e-58 212
MsG0880045213.01.T01 AT1G52540 37.457 291 176 4 349 636 23 310 1.53e-58 201
MsG0880045213.01.T01 AT2G05940 39.748 317 162 9 351 643 75 386 2.03e-58 204
MsG0880045213.01.T01 AT5G01950 39.661 295 163 5 346 633 524 810 2.36e-58 212
MsG0880045213.01.T01 AT4G23210 34.746 354 217 8 324 673 321 664 2.42e-58 209
MsG0880045213.01.T01 AT2G23200 33.656 413 250 9 255 646 362 771 3.13e-58 211
MsG0880045213.01.T01 AT5G03320 38.941 321 165 10 349 647 67 378 3.20e-58 202
MsG0880045213.01.T01 AT5G03320 38.941 321 165 10 349 647 67 378 3.20e-58 202
MsG0880045213.01.T01 AT5G11020 39.510 286 162 7 353 633 131 410 3.37e-58 203
MsG0880045213.01.T01 AT5G11020 39.510 286 162 7 353 633 70 349 3.42e-58 201
MsG0880045213.01.T01 AT1G51890 35.655 359 214 7 285 634 425 775 3.44e-58 211
MsG0880045213.01.T01 AT1G49730 38.080 323 175 8 278 585 234 546 3.55e-58 207
MsG0880045213.01.T01 AT1G52540 37.457 291 176 4 349 636 26 313 3.94e-58 200
MsG0880045213.01.T01 AT1G11340 39.394 297 164 6 293 576 505 798 4.10e-58 210
MsG0880045213.01.T01 AT1G51800 35.734 361 207 9 294 638 512 863 4.57e-58 211
MsG0880045213.01.T01 AT2G28990 42.069 290 153 8 350 633 566 846 5.85e-58 211
MsG0880045213.01.T01 AT2G28990 42.069 290 153 8 350 633 566 846 5.85e-58 211
MsG0880045213.01.T01 AT1G70530 39.189 296 168 5 277 568 242 529 6.17e-58 205
MsG0880045213.01.T01 AT5G24010 33.871 372 216 9 295 643 410 774 6.41e-58 210
MsG0880045213.01.T01 AT5G38990 37.417 302 172 4 349 639 511 806 6.61e-58 211
MsG0880045213.01.T01 AT5G16500 38.591 298 166 5 349 635 60 351 6.80e-58 207
MsG0880045213.01.T01 AT2G28940 39.752 322 163 10 351 649 90 403 6.97e-58 203
MsG0880045213.01.T01 AT5G11020 39.510 286 162 7 353 633 97 376 7.25e-58 201
MsG0880045213.01.T01 AT5G01950 39.661 295 163 5 346 633 609 895 7.52e-58 211
MsG0880045213.01.T01 AT5G01950 39.661 295 163 5 346 633 609 895 7.52e-58 211
MsG0880045213.01.T01 AT5G01950 39.661 295 163 5 346 633 609 895 7.52e-58 211
MsG0880045213.01.T01 AT5G01950 39.661 295 163 5 346 633 609 895 7.52e-58 211
MsG0880045213.01.T01 AT4G32000 34.930 355 218 7 282 633 56 400 8.88e-58 201
MsG0880045213.01.T01 AT5G11020 39.510 286 162 7 353 633 93 372 9.76e-58 201
MsG0880045213.01.T01 AT1G24030 38.538 301 176 6 343 635 42 341 1.01e-57 199
MsG0880045213.01.T01 AT1G51890 35.655 359 214 7 285 634 489 839 1.11e-57 210
MsG0880045213.01.T01 AT3G46330 38.906 329 176 8 309 630 523 833 1.17e-57 210
MsG0880045213.01.T01 AT3G46330 38.906 329 176 8 309 630 499 809 1.36e-57 209
MsG0880045213.01.T01 AT4G17660 47.967 246 104 6 349 579 77 313 1.38e-57 200
MsG0880045213.01.T01 AT2G28970 35.405 370 225 7 272 633 350 713 1.42e-57 208
MsG0880045213.01.T01 AT3G21340 40.541 296 167 5 349 641 580 869 1.52e-57 210
MsG0880045213.01.T01 AT1G24030 43.673 245 130 5 343 580 42 285 1.57e-57 196
MsG0880045213.01.T01 AT1G24030 38.538 301 176 6 343 635 56 355 1.58e-57 199
MsG0880045213.01.T01 AT4G00340 34.400 375 225 7 268 633 376 738 1.84e-57 208
MsG0880045213.01.T01 AT2G28970 35.405 370 225 7 272 633 385 748 2.13e-57 208
MsG0880045213.01.T01 AT1G07550 37.920 327 181 7 312 634 520 828 2.30e-57 209
MsG0880045213.01.T01 AT4G32000 34.930 355 217 7 282 633 56 399 2.43e-57 200
MsG0880045213.01.T01 AT4G21390 39.032 310 162 6 281 565 426 733 2.53e-57 207
MsG0880045213.01.T01 AT5G35370 36.593 317 177 7 348 645 502 813 2.56e-57 209
MsG0880045213.01.T01 AT2G29000 35.440 364 219 7 273 633 484 834 3.77e-57 208
MsG0880045213.01.T01 AT2G07180 40.404 297 156 9 351 633 78 367 3.80e-57 200
MsG0880045213.01.T01 AT2G07180 40.404 297 156 9 351 633 78 367 3.80e-57 200
MsG0880045213.01.T01 AT5G47070 40.129 309 158 8 343 633 66 365 4.05e-57 199
MsG0880045213.01.T01 AT4G00340 35.457 361 211 8 283 633 411 759 4.28e-57 207
MsG0880045213.01.T01 AT2G11520 38.732 284 168 5 347 626 209 490 4.35e-57 202
MsG0880045213.01.T01 AT1G51860 35.433 381 224 10 273 641 346 716 4.85e-57 206
MsG0880045213.01.T01 AT2G04300 39.210 329 185 8 310 634 494 811 5.10e-57 208
MsG0880045213.01.T01 AT2G04300 39.210 329 185 8 310 634 535 852 6.68e-57 208
MsG0880045213.01.T01 AT5G48740 35.311 354 214 7 290 639 541 883 1.00e-56 207
MsG0880045213.01.T01 AT4G23300 36.304 303 182 6 350 643 340 640 1.06e-56 204

Find 144 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 173 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AGTCTTGATTCTCATTTATT+TGG 0.173248 8:-55905327 MsG0880045213.01.T01:CDS
TTGGATTAAAACTAGGAATT+TGG 0.176056 8:+55906507 None:intergenic
ATGGGAATTTAATTCCAATT+TGG 0.206035 8:-55905835 MsG0880045213.01.T01:CDS
AATGTTAAGCTTGGTGATTT+TGG 0.207740 8:-55905159 MsG0880045213.01.T01:CDS
TCTTTAGGGGTTGTATTTAT+AGG 0.236274 8:-55905756 MsG0880045213.01.T01:CDS
GTGATACTAACAGTCTCTTT+AGG 0.274984 8:-55905771 MsG0880045213.01.T01:CDS
GGCCTCTTTGGTGGAAGATT+TGG 0.276791 8:+55904739 None:intergenic
GTCTCATCCCATTCAACATT+TGG 0.280602 8:+55906137 None:intergenic
TAGATTATGTTGGCTTCATT+TGG 0.280870 8:+55906488 None:intergenic
AGAAATCTTGTGAAGCTCTT+AGG 0.281568 8:-55905405 MsG0880045213.01.T01:CDS
TGATACTAACAGTCTCTTTA+GGG 0.284288 8:-55905770 MsG0880045213.01.T01:CDS
ATAGCTCTTGGATTGGCTTC+TGG 0.286406 8:-55905267 MsG0880045213.01.T01:CDS
CAAACTCCACAAGAACAATT+TGG 0.287228 8:+55906168 None:intergenic
AGGGAATGATTGAGTGGGTT+TGG 0.287401 8:-55904939 MsG0880045213.01.T01:CDS
GAGTCAGATGTGTATAGTTT+TGG 0.290041 8:-55905030 MsG0880045213.01.T01:CDS
TCTTTGTAGGTGAACCTTCT+TGG 0.292510 8:+55905615 None:intergenic
GTAAAAGAACACCTCTTTCT+TGG 0.300411 8:-55905305 MsG0880045213.01.T01:CDS
TAACTCCTCTGGTGGCTTGA+TGG 0.303903 8:-55906231 MsG0880045213.01.T01:CDS
GAGTGGGTTTGGGATCATTA+TGG 0.306397 8:-55904928 MsG0880045213.01.T01:CDS
AATCCAATTGTAACCCATTC+AGG 0.319989 8:+55905903 None:intergenic
AAGTTGGGTCAAGGTGGTTT+TGG 0.323868 8:-55905555 MsG0880045213.01.T01:CDS
CACCTACAAAGAACTTGATT+TGG 0.324947 8:-55905604 MsG0880045213.01.T01:CDS
TTGGACCTGCTCCTCTTTCA+AGG 0.327249 8:+55905634 None:intergenic
TCCATAAGCAGCTAAGAAAA+AGG 0.327753 8:+55906268 None:intergenic
TAGGTTGCAACTGGCCTCTT+TGG 0.329701 8:+55904727 None:intergenic
GGGAATGATTGAGTGGGTTT+GGG 0.338063 8:-55904938 MsG0880045213.01.T01:CDS
TGAATTGCTTGTCTAATTGA+TGG 0.339808 8:+55904787 None:intergenic
CTAGAGTGCTTGATGATTGT+TGG 0.344008 8:-55904844 MsG0880045213.01.T01:CDS
CAAAGAATTTGACTGTATCT+TGG 0.345354 8:-55905998 MsG0880045213.01.T01:CDS
CTACCTGTACTCACATATTC+TGG 0.355907 8:+55905063 None:intergenic
TCGTTTGAGGCCCAAGTTCA+TGG 0.357073 8:+55905118 None:intergenic
ATCTTGAAGGCTATTTGTTA+TGG 0.357762 8:+55904666 None:intergenic
TAAAAGAACACCTCTTTCTT+GGG 0.359516 8:-55905304 MsG0880045213.01.T01:CDS
TCTCATCCCATTCAACATTT+GGG 0.360080 8:+55906138 None:intergenic
CACCTCTTTCTTGGGGTGTA+AGG 0.363572 8:-55905296 MsG0880045213.01.T01:CDS
AAAGAATTTGACTGTATCTT+GGG 0.370893 8:-55905997 MsG0880045213.01.T01:CDS
TTTATCTCTTTAGAAATTCA+AGG 0.375847 8:-55906611 MsG0880045213.01.T01:CDS
AACTCCTCTGGTGGCTTGAT+GGG 0.378931 8:-55906230 MsG0880045213.01.T01:CDS
ATGGGCCATGTATTCCAAAA+AGG 0.387374 8:-55906393 MsG0880045213.01.T01:CDS
TTGACCCAACTTTCTATCCT+TGG 0.392654 8:+55905566 None:intergenic
AAAGAGAAGTGAAAAGCAAA+AGG 0.394219 8:-55905691 MsG0880045213.01.T01:CDS
AAATTAATGGACCATGAACT+TGG 0.397247 8:-55905129 MsG0880045213.01.T01:CDS
TGCTTTATCTACATGAAGAA+TGG 0.398175 8:-55905242 MsG0880045213.01.T01:CDS
ATTCATACCCAAATGTTGAA+TGG 0.403952 8:-55906145 MsG0880045213.01.T01:CDS
GGTTCTGCAGCACCAGTTGA+TGG 0.420954 8:-55906461 MsG0880045213.01.T01:CDS
AGAACAATTTGGTTACTTGA+TGG 0.422484 8:+55906179 None:intergenic
TTACCTGAATGGGTTACAAT+TGG 0.423284 8:-55905906 MsG0880045213.01.T01:CDS
CATGGGAAGGGTAAAGAAAC+TGG 0.431931 8:+55906580 None:intergenic
CCGGCCAGCCCTGTCGTTTG+AGG 0.433810 8:+55905105 None:intergenic
GATGGTCTTAAACTAACATC+AGG 0.436364 8:+55904805 None:intergenic
AGATGGTGTAGGAGCATGAT+AGG 0.443503 8:+55904708 None:intergenic
GCTTCATTTGGATTAAAACT+AGG 0.445734 8:+55906500 None:intergenic
ACAGGGCTGGCCGGAACATT+CGG 0.445766 8:-55905096 MsG0880045213.01.T01:CDS
ATTTGTTATGGAAGCTTCTA+CGG 0.448225 8:+55904678 None:intergenic
TGCTAGATATCCGAATGTTC+CGG 0.449462 8:+55905086 None:intergenic
TGCCAAATCAAGTTCTTTGT+AGG 0.451944 8:+55905602 None:intergenic
TCTGCTGCAACTGGTTCCAT+TGG 0.454025 8:-55905879 MsG0880045213.01.T01:CDS
AAATCAACTTCTCCATCAAC+TGG 0.456212 8:+55906449 None:intergenic
GGGGTTGTATTTATAGGAGT+GGG 0.457217 8:-55905750 MsG0880045213.01.T01:CDS
GCTTTATCTACATGAAGAAT+GGG 0.458757 8:-55905241 MsG0880045213.01.T01:CDS
ATTATGTATGTCAAGTTGGA+TGG 0.466675 8:-55906412 MsG0880045213.01.T01:CDS
GTTGCAACTGGCCTCTTTGG+TGG 0.468587 8:+55904730 None:intergenic
GCTTGATGATTGTTGGATTG+TGG 0.475395 8:-55904837 MsG0880045213.01.T01:CDS
GGAGCATGATAGGTTGCAAC+TGG 0.477039 8:+55904718 None:intergenic
TGCCTTACACCCCAAGAAAG+AGG 0.479350 8:+55905294 None:intergenic
GTAAGGCACAAAATAGCTCT+TGG 0.480107 8:-55905279 MsG0880045213.01.T01:CDS
TCAATTAACGACCATCTTGA+AGG 0.480129 8:+55904653 None:intergenic
GTTGTCTTAGAGATAACTAC+TGG 0.482496 8:-55905003 MsG0880045213.01.T01:CDS
CTCTTTAGAAATTCAAGGCA+TGG 0.483143 8:-55906606 MsG0880045213.01.T01:CDS
GAACTTGGGCCTCAAACGAC+AGG 0.484985 8:-55905114 MsG0880045213.01.T01:CDS
AAGATTATTTAGTTCTCCAA+TGG 0.487986 8:+55905863 None:intergenic
TTCATACCCAAATGTTGAAT+GGG 0.493105 8:-55906144 MsG0880045213.01.T01:CDS
TGAGAATCAAGACTACCATT+TGG 0.495212 8:+55905336 None:intergenic
ATCAAGCCACCAGAGGAGTT+AGG 0.497482 8:+55906233 None:intergenic
GAAAGCTACTGAAGTTATGA+AGG 0.502970 8:-55904977 MsG0880045213.01.T01:CDS
TTCTAAAGAGATAAATAGAA+AGG 0.504938 8:+55906619 None:intergenic
AGGGGTTGTATTTATAGGAG+TGG 0.505403 8:-55905751 MsG0880045213.01.T01:CDS
TGGGCCTCAAACGACAGGGC+TGG 0.512515 8:-55905109 MsG0880045213.01.T01:CDS
AGAACCTTGGTAGATTATGT+TGG 0.514474 8:+55906478 None:intergenic
GTGGAGACACTGCTGAGGTA+TGG 0.515557 8:-55906040 MsG0880045213.01.T01:CDS
GCACAAAATAGCTCTTGGAT+TGG 0.517186 8:-55905274 MsG0880045213.01.T01:CDS
GTTTATGAGTTCATGCCAAA+TGG 0.517338 8:-55905351 MsG0880045213.01.T01:CDS
ATGAATGATGACCTTGAAAG+AGG 0.517790 8:-55905645 MsG0880045213.01.T01:CDS
GATGACCTTGAAAGAGGAGC+AGG 0.519897 8:-55905639 MsG0880045213.01.T01:CDS
AAGTGAAAAGCAAAAGGAAG+AGG 0.520473 8:-55905685 MsG0880045213.01.T01:CDS
ACACTGCTGAGGTATGGATT+AGG 0.521458 8:-55906034 MsG0880045213.01.T01:CDS
GAAATCCCACCTAACTCCTC+TGG 0.521493 8:-55906242 MsG0880045213.01.T01:CDS
GTTTGGGATCATTATGGAAG+AGG 0.526435 8:-55904922 MsG0880045213.01.T01:CDS
AAGTAACCAAATTGTTCTTG+TGG 0.528135 8:-55906174 MsG0880045213.01.T01:CDS
ACTCAAGATAGACCTTCATA+TGG 0.529344 8:-55906302 MsG0880045213.01.T01:CDS
CCTCAAACGACAGGGCTGGC+CGG 0.529606 8:-55905105 MsG0880045213.01.T01:CDS
TGGCAATGGATGAGAATTTG+AGG 0.533682 8:-55904888 MsG0880045213.01.T01:CDS
CAACTGGTGCTGCAGAACCT+TGG 0.539244 8:+55906465 None:intergenic
AGGAGAACTACTTGTGGCAA+TGG 0.542626 8:-55904902 MsG0880045213.01.T01:CDS
GCACCAGAATATGTGAGTAC+AGG 0.550186 8:-55905066 MsG0880045213.01.T01:CDS
TAGCATATGTCATACTAAAG+AGG 0.552398 8:-55905719 MsG0880045213.01.T01:CDS
AAGAGAAGGGAATGATTGAG+TGG 0.552583 8:-55904945 MsG0880045213.01.T01:CDS
AGAGAAGGGAATGATTGAGT+GGG 0.553484 8:-55904944 MsG0880045213.01.T01:CDS
CTTTGGTGGAAGATTTGGCA+AGG 0.555638 8:+55904744 None:intergenic
GCAAGTCCATGGCCATATGA+AGG 0.560784 8:+55906290 None:intergenic
TCTATTTAACACAACAACAA+TGG 0.562074 8:-55906207 MsG0880045213.01.T01:CDS
ATCTTGTGAAGCTCTTAGGT+TGG 0.562739 8:-55905401 MsG0880045213.01.T01:CDS
TTATGTATGTCAAGTTGGAT+GGG 0.563319 8:-55906411 MsG0880045213.01.T01:CDS
ATTTATAGGAGTGGGAGCAT+TGG 0.575820 8:-55905742 MsG0880045213.01.T01:CDS
GGATGAGACAACACAACATG+TGG 0.579853 8:-55906123 MsG0880045213.01.T01:CDS
AATCATCGATATCAACACCT+TGG 0.582774 8:-55906079 MsG0880045213.01.T01:CDS
AAAGAGGAGCAGGTCCAAGA+AGG 0.582785 8:-55905629 MsG0880045213.01.T01:CDS
ATCTACATGAAGAATGGGAG+AGG 0.583769 8:-55905236 MsG0880045213.01.T01:CDS
CAGAATATGTGAGTACAGGT+AGG 0.587877 8:-55905062 MsG0880045213.01.T01:CDS
TGCCAAATCTTCCACCAAAG+AGG 0.588601 8:-55904741 MsG0880045213.01.T01:CDS
CTGTGTAAACTTGCATTCCA+AGG 0.590287 8:+55906062 None:intergenic
AGTGAAAGTGAAGAAAATGA+AGG 0.600826 8:+55906547 None:intergenic
GATAGACCTTCATATGGCCA+TGG 0.604127 8:-55906296 MsG0880045213.01.T01:CDS
GATACTAACAGTCTCTTTAG+GGG 0.605265 8:-55905769 MsG0880045213.01.T01:CDS
AAGGATAGAAAGTTGGGTCA+AGG 0.613679 8:-55905564 MsG0880045213.01.T01:CDS
AATGAAGGTCAAGAAGAACA+TGG 0.614066 8:+55906562 None:intergenic
AAAAGAACACCTCTTTCTTG+GGG 0.614118 8:-55905303 MsG0880045213.01.T01:CDS
AAGCCACCAGAGGAGTTAGG+TGG 0.617634 8:+55906236 None:intergenic
AGAATATGTGAGTACAGGTA+GGG 0.622807 8:-55905061 MsG0880045213.01.T01:CDS
AGGTCAAGAAGAACATGGGA+AGG 0.623320 8:+55906567 None:intergenic
GGAGAAACTCACCTTTGTCA+TGG 0.624493 8:+55905376 None:intergenic
AGCCACCAGAGGAGTTAGGT+GGG 0.625551 8:+55906237 None:intergenic
AATTAATGGACCATGAACTT+GGG 0.629205 8:-55905128 MsG0880045213.01.T01:CDS
ATGAAGGTCAAGAAGAACAT+GGG 0.634400 8:+55906563 None:intergenic
TTAGGTTGGTGCCATGACAA+AGG 0.635103 8:-55905387 MsG0880045213.01.T01:CDS
AACTTGGGCCTCAAACGACA+GGG 0.635849 8:-55905113 MsG0880045213.01.T01:CDS
ATAACAAATAGCCTTCAAGA+TGG 0.636093 8:-55904664 MsG0880045213.01.T01:CDS
ATCCCACCTAACTCCTCTGG+TGG 0.639757 8:-55906239 MsG0880045213.01.T01:CDS
GCTGTGAAGAAAATATCAAG+AGG 0.639985 8:-55905489 MsG0880045213.01.T01:CDS
ATATCAAGAGGGTCAAGACA+AGG 0.639989 8:-55905477 MsG0880045213.01.T01:CDS
ACGGAACTTACAGATGGTGT+AGG 0.642110 8:+55904697 None:intergenic
GATAGAAAGTTGGGTCAAGG+TGG 0.651144 8:-55905561 MsG0880045213.01.T01:CDS
GCTTCTACGGAACTTACAGA+TGG 0.655331 8:+55904691 None:intergenic
ATGGTCTTAAACTAACATCA+GGG 0.658606 8:+55904806 None:intergenic
TTGGCATGAACTCATAAACA+AGG 0.670509 8:+55905355 None:intergenic
TGGAAGAGGAGAACTACTTG+TGG 0.673176 8:-55904908 MsG0880045213.01.T01:CDS
GGTCAAGAAGAACATGGGAA+GGG 0.674447 8:+55906568 None:intergenic
GAAGCCAACATAATCTACCA+AGG 0.682610 8:-55906482 MsG0880045213.01.T01:CDS
CTGTGAAGAAAATATCAAGA+GGG 0.682867 8:-55905488 MsG0880045213.01.T01:CDS
TAGACCCATCAAGCCACCAG+AGG 0.690945 8:+55906226 None:intergenic
GATGAGACAACACAACATGT+GGG 0.693257 8:-55906122 MsG0880045213.01.T01:CDS
TGAAGAATGGGAGAGGTGTG+TGG 0.716369 8:-55905229 MsG0880045213.01.T01:CDS
ACACAGTGGAGACACTGCTG+AGG 0.728239 8:-55906045 MsG0880045213.01.T01:CDS
TGGAATGCAAGTTTACACAG+TGG 0.753473 8:-55906059 MsG0880045213.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAAATTATGTATGTCAAGT+TGG - Chr8:55904897-55904916 MsG0880045213.01.T01:CDS 20.0%
!!! AACTAAATAATCTTTTGTCA+TGG - Chr8:55905459-55905478 MsG0880045213.01.T01:CDS 20.0%
!!! ACTAAATAATCTTTTGTCAT+GGG - Chr8:55905460-55905479 MsG0880045213.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTCTAAAGAGATAAATAGAA+AGG + Chr8:55904697-55904716 None:intergenic 20.0%
!!! TTTATCTCTTTAGAAATTCA+AGG - Chr8:55904702-55904721 MsG0880045213.01.T01:CDS 20.0%
! AAAGAATTTGACTGTATCTT+GGG - Chr8:55905316-55905335 MsG0880045213.01.T01:CDS 25.0%
! AGTCTTGATTCTCATTTATT+TGG - Chr8:55905986-55906005 MsG0880045213.01.T01:CDS 25.0%
! ATGGGAATTTAATTCCAATT+TGG - Chr8:55905478-55905497 MsG0880045213.01.T01:CDS 25.0%
! TCTATCCTTGGAAAAATTAT+TGG + Chr8:55905738-55905757 None:intergenic 25.0%
! TCTATTTAACACAACAACAA+TGG - Chr8:55905106-55905125 MsG0880045213.01.T01:CDS 25.0%
! TTGGATTAAAACTAGGAATT+TGG + Chr8:55904809-55904828 None:intergenic 25.0%
!! AATTCAAGTGCTTAATTTTG+AGG - Chr8:55906543-55906562 MsG0880045213.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAGATTATTTAGTTCTCCAA+TGG + Chr8:55905453-55905472 None:intergenic 25.0%
!!! ATCATCACTTTTTTCCAAAT+TGG + Chr8:55905495-55905514 None:intergenic 25.0%
!!! ATTCCAAAAAGGTATTACTT+TGG - Chr8:55904931-55904950 MsG0880045213.01.T01:CDS 25.0%
!!! GAAAGATTAGTTTTTTCTTG+AGG + Chr8:55905362-55905381 None:intergenic 25.0%
!!! TAATACCTTTTTGGAATACA+TGG + Chr8:55904928-55904947 None:intergenic 25.0%
!!! TCAAGTTTTAATGTTAAGCT+TGG - Chr8:55906145-55906164 MsG0880045213.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTCCAAAAAGGTATTACTTT+GGG - Chr8:55904932-55904951 MsG0880045213.01.T01:CDS 25.0%
AAAGAGAAGTGAAAAGCAAA+AGG - Chr8:55905622-55905641 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
AAGGAAAAAGATGAAGAGAA+GGG - Chr8:55906355-55906374 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
AAGTAACCAAATTGTTCTTG+TGG - Chr8:55905139-55905158 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
AGAACAATTTGGTTACTTGA+TGG + Chr8:55905137-55905156 None:intergenic 30.0%
AGTGAAAGTGAAGAAAATGA+AGG + Chr8:55904769-55904788 None:intergenic 30.0%
ATAACAAATAGCCTTCAAGA+TGG - Chr8:55906649-55906668 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
ATTCATACCCAAATGTTGAA+TGG - Chr8:55905168-55905187 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
CAAAGAATTTGACTGTATCT+TGG - Chr8:55905315-55905334 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
CTGTGAAGAAAATATCAAGA+GGG - Chr8:55905825-55905844 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
GCTTCATTTGGATTAAAACT+AGG + Chr8:55904816-55904835 None:intergenic 30.0%
GCTTTATCTACATGAAGAAT+GGG - Chr8:55906072-55906091 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
TAAAAGAACACCTCTTTCTT+GGG - Chr8:55906009-55906028 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
TAGCATATGTCATACTAAAG+AGG - Chr8:55905594-55905613 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
TGAATTGCTTGTCTAATTGA+TGG + Chr8:55906529-55906548 None:intergenic 30.0%
TGATACTAACAGTCTCTTTA+GGG - Chr8:55905543-55905562 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
TGCTTTATCTACATGAAGAA+TGG - Chr8:55906071-55906090 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
TTCATACCCAAATGTTGAAT+GGG - Chr8:55905169-55905188 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
! AAATTAATGGACCATGAACT+TGG - Chr8:55906184-55906203 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
! AATTAATGGACCATGAACTT+GGG - Chr8:55906185-55906204 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
! AGTCAGATGTGTATAGTTTT+GGG - Chr8:55906284-55906303 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
! ATCTTGAAGGCTATTTGTTA+TGG + Chr8:55906650-55906669 None:intergenic 30.0%
! ATGGTCTTAAACTAACATCA+GGG + Chr8:55906510-55906529 None:intergenic 30.0%
! GATGAAAGTTTTACCTGAAT+GGG - Chr8:55905397-55905416 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
! TCTTTAGGGGTTGTATTTAT+AGG - Chr8:55905557-55905576 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
! TGATGAAAGTTTTACCTGAA+TGG - Chr8:55905396-55905415 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTCCAAGGATAGAAAGTT+GGG - Chr8:55905743-55905762 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTTCCAAGGATAGAAAGT+TGG - Chr8:55905742-55905761 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
!! AATGTTAAGCTTGGTGATTT+TGG - Chr8:55906154-55906173 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
!! ATGTTAAGCTTGGTGATTTT+GGG - Chr8:55906155-55906174 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTATGTATGTCAAGTTGGA+TGG - Chr8:55904901-55904920 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTTGTTATGGAAGCTTCTA+CGG + Chr8:55906638-55906657 None:intergenic 30.0%
!! TAGATTATGTTGGCTTCATT+TGG + Chr8:55904828-55904847 None:intergenic 30.0%
!! TTATGTATGTCAAGTTGGAT+GGG - Chr8:55904902-55904921 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTGGGTTGGCTAAATTAA+TGG - Chr8:55906171-55906190 MsG0880045213.01.T01:CDS 30.0%
AAAAGAACACCTCTTTCTTG+GGG - Chr8:55906010-55906029 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
AAATCAACTTCTCCATCAAC+TGG + Chr8:55904867-55904886 None:intergenic 35.0%
AAGTGAAAAGCAAAAGGAAG+AGG - Chr8:55905628-55905647 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
AATCATCGATATCAACACCT+TGG - Chr8:55905234-55905253 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
AATCCAATTGTAACCCATTC+AGG + Chr8:55905413-55905432 None:intergenic 35.0%
AATGAAGGTCAAGAAGAACA+TGG + Chr8:55904754-55904773 None:intergenic 35.0%
ACTCAAGATAGACCTTCATA+TGG - Chr8:55905011-55905030 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
AGAAATCTTGTGAAGCTCTT+AGG - Chr8:55905908-55905927 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
AGAACCTTGGTAGATTATGT+TGG + Chr8:55904838-55904857 None:intergenic 35.0%
AGAATATGTGAGTACAGGTA+GGG - Chr8:55906252-55906271 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
ATGAAGGTCAAGAAGAACAT+GGG + Chr8:55904753-55904772 None:intergenic 35.0%
ATGAATGATGACCTTGAAAG+AGG - Chr8:55905668-55905687 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
CAAACTCCACAAGAACAATT+TGG + Chr8:55905148-55905167 None:intergenic 35.0%
CACCTACAAAGAACTTGATT+TGG - Chr8:55905709-55905728 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
GAAAGCTACTGAAGTTATGA+AGG - Chr8:55906336-55906355 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
GAAGGAAAAAGATGAAGAGA+AGG - Chr8:55906354-55906373 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
GATACTAACAGTCTCTTTAG+GGG - Chr8:55905544-55905563 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
GCTGTGAAGAAAATATCAAG+AGG - Chr8:55905824-55905843 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
GTAAAAGAACACCTCTTTCT+TGG - Chr8:55906008-55906027 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
GTGATACTAACAGTCTCTTT+AGG - Chr8:55905542-55905561 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
GTTGTCTTAGAGATAACTAC+TGG - Chr8:55906310-55906329 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
GTTTATGAGTTCATGCCAAA+TGG - Chr8:55905962-55905981 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
TCCATAAGCAGCTAAGAAAA+AGG + Chr8:55905048-55905067 None:intergenic 35.0%
TCTCATCCCATTCAACATTT+GGG + Chr8:55905178-55905197 None:intergenic 35.0%
TGAGAATCAAGACTACCATT+TGG + Chr8:55905980-55905999 None:intergenic 35.0%
TGCCAAATCAAGTTCTTTGT+AGG + Chr8:55905714-55905733 None:intergenic 35.0%
TTGGCATGAACTCATAAACA+AGG + Chr8:55905961-55905980 None:intergenic 35.0%
! CTCTTTAGAAATTCAAGGCA+TGG - Chr8:55904707-55904726 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
! GAGTCAGATGTGTATAGTTT+TGG - Chr8:55906283-55906302 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
! GATGGTCTTAAACTAACATC+AGG + Chr8:55906511-55906530 None:intergenic 35.0%
! GGCAACCAATAATTTTTCCA+AGG - Chr8:55905730-55905749 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
! GTCCCAAAGTAATACCTTTT+TGG + Chr8:55904937-55904956 None:intergenic 35.0%
!! TTACCTGAATGGGTTACAAT+TGG - Chr8:55905407-55905426 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
!! TTACTTTGGGACTCAAAAAC+AGG - Chr8:55904945-55904964 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
!!! AGTTTTTTCTTGAGGACTAG+AGG + Chr8:55905354-55905373 None:intergenic 35.0%
!!! GGTTTTGGAGCTGTTTATAA+AGG - Chr8:55905773-55905792 MsG0880045213.01.T01:CDS 35.0%
AAGAGAAGGGAATGATTGAG+TGG - Chr8:55906368-55906387 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
AAGGATAGAAAGTTGGGTCA+AGG - Chr8:55905749-55905768 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
AGAGAAGGGAATGATTGAGT+GGG - Chr8:55906369-55906388 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
AGGGGTTGTATTTATAGGAG+TGG - Chr8:55905562-55905581 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
ATATCAAGAGGGTCAAGACA+AGG - Chr8:55905836-55905855 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
ATCTACATGAAGAATGGGAG+AGG - Chr8:55906077-55906096 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
ATCTTGTGAAGCTCTTAGGT+TGG - Chr8:55905912-55905931 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
ATGGGCCATGTATTCCAAAA+AGG - Chr8:55904920-55904939 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
CAGAATATGTGAGTACAGGT+AGG - Chr8:55906251-55906270 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
CTAAGAAAAAGGCAAGTCCA+TGG + Chr8:55905037-55905056 None:intergenic 40.0%
CTACCTGTACTCACATATTC+TGG + Chr8:55906253-55906272 None:intergenic 40.0%
CTGTGTAAACTTGCATTCCA+AGG + Chr8:55905254-55905273 None:intergenic 40.0%
GAAGCCAACATAATCTACCA+AGG - Chr8:55904831-55904850 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
GATGAGACAACACAACATGT+GGG - Chr8:55905191-55905210 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
GCACAAAATAGCTCTTGGAT+TGG - Chr8:55906039-55906058 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
GGGGTTGTATTTATAGGAGT+GGG - Chr8:55905563-55905582 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
GTAAGGCACAAAATAGCTCT+TGG - Chr8:55906034-55906053 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
GTCTCATCCCATTCAACATT+TGG + Chr8:55905179-55905198 None:intergenic 40.0%
TCTTTGTAGGTGAACCTTCT+TGG + Chr8:55905701-55905720 None:intergenic 40.0%
TGCTAGATATCCGAATGTTC+CGG + Chr8:55906230-55906249 None:intergenic 40.0%
TGGAATGCAAGTTTACACAG+TGG - Chr8:55905254-55905273 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
TGGCAATGGATGAGAATTTG+AGG - Chr8:55906425-55906444 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
TTGACCCAACTTTCTATCCT+TGG + Chr8:55905750-55905769 None:intergenic 40.0%
! ATTGGATTTTCTGCTGCAAC+TGG - Chr8:55905425-55905444 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
! ATTTATAGGAGTGGGAGCAT+TGG - Chr8:55905571-55905590 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
! CTAGAGTGCTTGATGATTGT+TGG - Chr8:55906469-55906488 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
! GCCTTTTTCTTAGCTGCTTA+TGG - Chr8:55905044-55905063 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
! GCTTGATGATTGTTGGATTG+TGG - Chr8:55906476-55906495 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
! GTTTGGGATCATTATGGAAG+AGG - Chr8:55906391-55906410 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
! TTTTTCTTGAGGACTAGAGG+TGG + Chr8:55905351-55905370 None:intergenic 40.0%
!! TAAGCTTGGTGATTTTGGGT+TGG - Chr8:55906159-55906178 MsG0880045213.01.T01:CDS 40.0%
ACACTGCTGAGGTATGGATT+AGG - Chr8:55905279-55905298 MsG0880045213.01.T01:CDS 45.0%
ACGGAACTTACAGATGGTGT+AGG + Chr8:55906619-55906638 None:intergenic 45.0%
AGGAGAACTACTTGTGGCAA+TGG - Chr8:55906411-55906430 MsG0880045213.01.T01:CDS 45.0%
AGGTCAAGAAGAACATGGGA+AGG + Chr8:55904749-55904768 None:intergenic 45.0%
CATGGGAAGGGTAAAGAAAC+TGG + Chr8:55904736-55904755 None:intergenic 45.0%
CTTTGGTGGAAGATTTGGCA+AGG + Chr8:55906572-55906591 None:intergenic 45.0%
GATAGAAAGTTGGGTCAAGG+TGG - Chr8:55905752-55905771 MsG0880045213.01.T01:CDS 45.0%
GATAGACCTTCATATGGCCA+TGG - Chr8:55905017-55905036 MsG0880045213.01.T01:CDS 45.0%
GCACCAGAATATGTGAGTAC+AGG - Chr8:55906247-55906266 MsG0880045213.01.T01:CDS 45.0%
GCTTCTACGGAACTTACAGA+TGG + Chr8:55906625-55906644 None:intergenic 45.0%
GGAGAAACTCACCTTTGTCA+TGG + Chr8:55905940-55905959 None:intergenic 45.0%
GGATGAGACAACACAACATG+TGG - Chr8:55905190-55905209 MsG0880045213.01.T01:CDS 45.0%
GGTCAAGAAGAACATGGGAA+GGG + Chr8:55904748-55904767 None:intergenic 45.0%
TGCCAAATCTTCCACCAAAG+AGG - Chr8:55906572-55906591 MsG0880045213.01.T01:CDS 45.0%
TGGAAGAGGAGAACTACTTG+TGG - Chr8:55906405-55906424 MsG0880045213.01.T01:CDS 45.0%
! AAGTTGGGTCAAGGTGGTTT+TGG - Chr8:55905758-55905777 MsG0880045213.01.T01:CDS 45.0%
! AGATGGTGTAGGAGCATGAT+AGG + Chr8:55906608-55906627 None:intergenic 45.0%
! AGGGAATGATTGAGTGGGTT+TGG - Chr8:55906374-55906393 MsG0880045213.01.T01:CDS 45.0%
! GAGTGGGTTTGGGATCATTA+TGG - Chr8:55906385-55906404 MsG0880045213.01.T01:CDS 45.0%
! GGGAATGATTGAGTGGGTTT+GGG - Chr8:55906375-55906394 MsG0880045213.01.T01:CDS 45.0%
!! ATAGCTCTTGGATTGGCTTC+TGG - Chr8:55906046-55906065 MsG0880045213.01.T01:CDS 45.0%
!! TTAGGTTGGTGCCATGACAA+AGG - Chr8:55905926-55905945 MsG0880045213.01.T01:CDS 45.0%
AAAGAGGAGCAGGTCCAAGA+AGG - Chr8:55905684-55905703 MsG0880045213.01.T01:CDS 50.0%
AACTCCTCTGGTGGCTTGAT+GGG - Chr8:55905083-55905102 MsG0880045213.01.T01:CDS 50.0%
AACTTGGGCCTCAAACGACA+GGG - Chr8:55906200-55906219 MsG0880045213.01.T01:CDS 50.0%
ATCAAGCCACCAGAGGAGTT+AGG + Chr8:55905083-55905102 None:intergenic 50.0%
CACCTCTTTCTTGGGGTGTA+AGG - Chr8:55906017-55906036 MsG0880045213.01.T01:CDS 50.0%
GAAATCCCACCTAACTCCTC+TGG - Chr8:55905071-55905090 MsG0880045213.01.T01:CDS 50.0%
GATGACCTTGAAAGAGGAGC+AGG - Chr8:55905674-55905693 MsG0880045213.01.T01:CDS 50.0%
GCAAGTCCATGGCCATATGA+AGG + Chr8:55905026-55905045 None:intergenic 50.0%
GGAGCATGATAGGTTGCAAC+TGG + Chr8:55906598-55906617 None:intergenic 50.0%
GGCCTCTTTGGTGGAAGATT+TGG + Chr8:55906577-55906596 None:intergenic 50.0%
TAACTCCTCTGGTGGCTTGA+TGG - Chr8:55905082-55905101 MsG0880045213.01.T01:CDS 50.0%
TGCCTTACACCCCAAGAAAG+AGG + Chr8:55906022-55906041 None:intergenic 50.0%
TTGGACCTGCTCCTCTTTCA+AGG + Chr8:55905682-55905701 None:intergenic 50.0%
! TAGGTTGCAACTGGCCTCTT+TGG + Chr8:55906589-55906608 None:intergenic 50.0%
! TCGTTTGAGGCCCAAGTTCA+TGG + Chr8:55906198-55906217 None:intergenic 50.0%
! TCTGCTGCAACTGGTTCCAT+TGG - Chr8:55905434-55905453 MsG0880045213.01.T01:CDS 50.0%
! TGAAGAATGGGAGAGGTGTG+TGG - Chr8:55906084-55906103 MsG0880045213.01.T01:CDS 50.0%
AAGCCACCAGAGGAGTTAGG+TGG + Chr8:55905080-55905099 None:intergenic 55.0%
ACACAGTGGAGACACTGCTG+AGG - Chr8:55905268-55905287 MsG0880045213.01.T01:CDS 55.0%
AGCCACCAGAGGAGTTAGGT+GGG + Chr8:55905079-55905098 None:intergenic 55.0%
ATCCCACCTAACTCCTCTGG+TGG - Chr8:55905074-55905093 MsG0880045213.01.T01:CDS 55.0%
GAACTTGGGCCTCAAACGAC+AGG - Chr8:55906199-55906218 MsG0880045213.01.T01:CDS 55.0%
GGTTCTGCAGCACCAGTTGA+TGG - Chr8:55904852-55904871 MsG0880045213.01.T01:CDS 55.0%
GTGGAGACACTGCTGAGGTA+TGG - Chr8:55905273-55905292 MsG0880045213.01.T01:CDS 55.0%
TAGACCCATCAAGCCACCAG+AGG + Chr8:55905090-55905109 None:intergenic 55.0%
! GTTGCAACTGGCCTCTTTGG+TGG + Chr8:55906586-55906605 None:intergenic 55.0%
!! CAACTGGTGCTGCAGAACCT+TGG + Chr8:55904851-55904870 None:intergenic 55.0%
!! ACAGGGCTGGCCGGAACATT+CGG - Chr8:55906217-55906236 MsG0880045213.01.T01:CDS 60.0%
TGGGCCTCAAACGACAGGGC+TGG - Chr8:55906204-55906223 MsG0880045213.01.T01:CDS 65.0%
! CCTCAAACGACAGGGCTGGC+CGG - Chr8:55906208-55906227 MsG0880045213.01.T01:CDS 65.0%
! CCGGCCAGCCCTGTCGTTTG+AGG + Chr8:55906211-55906230 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 55904657 55906678 55904657 ID=MsG0880045213.01;Name=MsG0880045213.01
Chr8 mRNA 55904657 55906678 55904657 ID=MsG0880045213.01.T01;Parent=MsG0880045213.01;Name=MsG0880045213.01.T01;_AED=0.36;_eAED=0.36;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|673
Chr8 exon 55904657 55906678 55904657 ID=MsG0880045213.01.T01:exon:24106;Parent=MsG0880045213.01.T01
Chr8 CDS 55904657 55906678 55904657 ID=MsG0880045213.01.T01:cds;Parent=MsG0880045213.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880045213.01.T01

ATGTTGAAGATCGTTGATTTGTATTGTCAAAGCTCATCCTTTCTATTTATCTCTTTAGAAATTCAAGGCATGGCTTCCAGTTTCTTTACCCTTCCCATGTTCTTCTTGACCTTCATTTTCTTCACTTTCACTGCTAATTCAATTCACTTCCAAATTCCTAGTTTTAATCCAAATGAAGCCAACATAATCTACCAAGGTTCTGCAGCACCAGTTGATGGAGAAGTTGATTTTAACATCAATAAAAATTATGTATGTCAAGTTGGATGGGCCATGTATTCCAAAAAGGTATTACTTTGGGACTCAAAAACAGGTCAACTCACTGACTTCACAACTCATTACACTTTTATCATCAACACTCAAGATAGACCTTCATATGGCCATGGACTTGCCTTTTTCTTAGCTGCTTATGGATTTGAAATCCCACCTAACTCCTCTGGTGGCTTGATGGGTCTATTTAACACAACAACAATGGTTTCACCATCAAGTAACCAAATTGTTCTTGTGGAGTTTGATTCATACCCAAATGTTGAATGGGATGAGACAACACAACATGTGGGAATCAACAATAATTCAATCAAATCATCGATATCAACACCTTGGAATGCAAGTTTACACAGTGGAGACACTGCTGAGGTATGGATTAGGTACAATTCTACAACAAAGAATTTGACTGTATCTTGGGATTATAAAACCACCTCTAGTCCTCAAGAAAAAACTAATCTTTCATATCAAATTGATTTGATGAAAGTTTTACCTGAATGGGTTACAATTGGATTTTCTGCTGCAACTGGTTCCATTGGAGAACTAAATAATCTTTTGTCATGGGAATTTAATTCCAATTTGGAAAAAAGTGATGATAGTAATAGTGAAGAAACAAGATTAGTTGTGATACTAACAGTCTCTTTAGGGGTTGTATTTATAGGAGTGGGAGCATTGGTAGCATATGTCATACTAAAGAGGAAAAGAAAGAGAAGTGAAAAGCAAAAGGAAGAGGCTATGCATTTGACTTCAATGAATGATGACCTTGAAAGAGGAGCAGGTCCAAGAAGGTTCACCTACAAAGAACTTGATTTGGCAACCAATAATTTTTCCAAGGATAGAAAGTTGGGTCAAGGTGGTTTTGGAGCTGTTTATAAAGGTTACTTTATTGATTTAGATTTACAAGTTGCTGTGAAGAAAATATCAAGAGGGTCAAGACAAGGTAAGAAAGAGTATGTAACTGAAGTTAAAGTCATTAGTCAACTGAGACATAGAAATCTTGTGAAGCTCTTAGGTTGGTGCCATGACAAAGGTGAGTTTCTCCTTGTTTATGAGTTCATGCCAAATGGTAGTCTTGATTCTCATTTATTTGGTAAAAGAACACCTCTTTCTTGGGGTGTAAGGCACAAAATAGCTCTTGGATTGGCTTCTGGTTTGCTTTATCTACATGAAGAATGGGAGAGGTGTGTGGTGCATAGAGATATCAAATCAAGTAATGTCATGTTAGATTCAAGTTTTAATGTTAAGCTTGGTGATTTTGGGTTGGCTAAATTAATGGACCATGAACTTGGGCCTCAAACGACAGGGCTGGCCGGAACATTCGGATATCTAGCACCAGAATATGTGAGTACAGGTAGGGCAAGTAAAGAGTCAGATGTGTATAGTTTTGGGATAGTTGTCTTAGAGATAACTACTGGAAAGAAAGCTACTGAAGTTATGAAGGAAAAAGATGAAGAGAAGGGAATGATTGAGTGGGTTTGGGATCATTATGGAAGAGGAGAACTACTTGTGGCAATGGATGAGAATTTGAGGAAAGATTTTGATGAGAAACAACTAGAGTGCTTGATGATTGTTGGATTGTGGTGTGCTCACCCTGATGTTAGTTTAAGACCATCAATTAGACAAGCAATTCAAGTGCTTAATTTTGAGGTTTCCTTGCCAAATCTTCCACCAAAGAGGCCAGTTGCAACCTATCATGCTCCTACACCATCTGTAAGTTCCGTAGAAGCTTCCATAACAAATAGCCTTCAAGATGGTCGTTAA
Protein sequence

>MsG0880045213.01.T01

MLKIVDLYCQSSSFLFISLEIQGMASSFFTLPMFFLTFIFFTFTANSIHFQIPSFNPNEANIIYQGSAAPVDGEVDFNINKNYVCQVGWAMYSKKVLLWDSKTGQLTDFTTHYTFIINTQDRPSYGHGLAFFLAAYGFEIPPNSSGGLMGLFNTTTMVSPSSNQIVLVEFDSYPNVEWDETTQHVGINNNSIKSSISTPWNASLHSGDTAEVWIRYNSTTKNLTVSWDYKTTSSPQEKTNLSYQIDLMKVLPEWVTIGFSAATGSIGELNNLLSWEFNSNLEKSDDSNSEETRLVVILTVSLGVVFIGVGALVAYVILKRKRKRSEKQKEEAMHLTSMNDDLERGAGPRRFTYKELDLATNNFSKDRKLGQGGFGAVYKGYFIDLDLQVAVKKISRGSRQGKKEYVTEVKVISQLRHRNLVKLLGWCHDKGEFLLVYEFMPNGSLDSHLFGKRTPLSWGVRHKIALGLASGLLYLHEEWERCVVHRDIKSSNVMLDSSFNVKLGDFGLAKLMDHELGPQTTGLAGTFGYLAPEYVSTGRASKESDVYSFGIVVLEITTGKKATEVMKEKDEEKGMIEWVWDHYGRGELLVAMDENLRKDFDEKQLECLMIVGLWCAHPDVSLRPSIRQAIQVLNFEVSLPNLPPKRPVATYHAPTPSVSSVEASITNSLQDGR*