AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180000521.01

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MsG0180000521.01.T01 AT1G76040 37.984 258 146 8 5 253 118 370 1.50e-45 164
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MsG0180000521.01.T01 AT3G51850 37.358 265 152 8 1 256 56 315 2.61e-45 162
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MsG0180000521.01.T01 AT3G51850 37.358 265 152 8 1 256 56 315 1.96e-44 162
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MsG0180000521.01.T01 AT3G45240 31.538 260 167 4 3 253 112 369 3.59e-40 147
MsG0180000521.01.T01 AT5G57565 59.091 110 42 1 59 168 19 125 8.38e-40 140
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MsG0180000521.01.T01 AT4G04695 35.556 270 154 9 1 256 30 293 6.37e-39 146
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MsG0180000521.01.T01 AT1G48490 31.461 267 155 5 3 242 832 1097 2.88e-36 141
MsG0180000521.01.T01 AT1G48490 31.461 267 155 5 3 242 833 1098 2.94e-36 141
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MsG0180000521.01.T01 AT1G30640 31.457 302 154 8 4 254 125 424 2.19e-35 137
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MsG0180000521.01.T01 AT4G14350 31.650 297 156 8 4 254 124 419 1.15e-34 135
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MsG0180000521.01.T01 AT5G57565 62.921 89 33 0 59 147 19 107 2.23e-33 122
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MsG0180000521.01.T01 AT5G14720 32.700 263 162 7 5 256 22 280 5.79e-32 128
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MsG0180000521.01.T01 AT1G54960 27.308 260 179 5 2 252 71 329 5.83e-30 122
MsG0180000521.01.T01 AT3G45780 27.636 275 160 5 3 242 667 937 1.02e-29 122
MsG0180000521.01.T01 AT3G45780 27.636 275 160 5 3 242 667 937 1.02e-29 122
MsG0180000521.01.T01 AT2G25880 27.843 255 145 5 1 253 27 244 1.09e-29 116
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MsG0180000521.01.T01 AT4G31170 29.845 258 167 7 1 250 133 384 2.47e-29 118
MsG0180000521.01.T01 AT4G31170 29.845 258 167 7 1 250 133 384 2.47e-29 118
MsG0180000521.01.T01 AT4G31170 29.845 258 167 7 1 250 133 384 2.47e-29 118
MsG0180000521.01.T01 AT4G31170 29.845 258 167 7 1 250 133 384 2.47e-29 118
MsG0180000521.01.T01 AT4G31170 29.845 258 167 7 1 250 133 384 2.47e-29 118
MsG0180000521.01.T01 AT4G31170 29.845 258 167 7 1 250 133 384 2.47e-29 118
MsG0180000521.01.T01 AT5G18700 29.779 272 176 6 4 269 9 271 3.72e-29 120
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MsG0180000521.01.T01 AT1G53570 27.574 272 187 6 2 267 217 484 4.56e-29 119
MsG0180000521.01.T01 AT2G19400 28.866 291 153 9 4 242 110 398 4.61e-29 119
MsG0180000521.01.T01 AT1G54610 31.579 285 153 8 5 253 124 402 6.57e-29 119
MsG0180000521.01.T01 AT1G54610 31.579 285 153 8 5 253 124 402 6.57e-29 119
MsG0180000521.01.T01 AT1G54610 31.579 285 153 8 5 253 124 402 6.57e-29 119
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MsG0180000521.01.T01 AT1G53570 27.574 272 187 6 2 267 217 484 9.18e-29 119
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MsG0180000521.01.T01 AT5G01850 30.741 270 156 13 1 250 20 278 1.86e-23 100
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MsG0180000521.01.T01 AT5G28290 29.167 216 140 6 46 254 50 259 2.52e-23 102
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MsG0180000521.01.T01 AT3G12690 26.875 320 164 6 5 254 191 510 2.61e-23 102
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MsG0180000521.01.T01 AT1G66880 36.000 200 112 8 3 194 350 541 1.39e-22 100
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MsG0180000521.01.T01 AT5G38210 36.041 197 112 8 5 194 376 565 1.73e-22 100
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MsG0180000521.01.T01 AT3G04810 27.570 214 146 5 46 254 50 259 7.28e-22 98.2
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MsG0180000521.01.T01 AT5G26751 29.153 295 155 12 3 255 73 355 1.14e-21 96.7
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MsG0180000521.01.T01 AT5G55090 27.046 281 175 12 2 265 71 338 3.19e-21 95.9
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MsG0180000521.01.T01 AT5G40440 27.969 261 172 10 4 255 88 341 3.80e-21 95.9
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MsG0180000521.01.T01 AT5G40440 28.077 260 171 10 5 255 71 323 4.64e-21 95.5
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MsG0180000521.01.T01 AT1G23700 28.346 254 167 8 13 257 26 273 1.14e-20 93.6
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MsG0180000521.01.T01 AT3G14720 33.990 203 118 7 4 195 30 227 1.72e-20 93.2
MsG0180000521.01.T01 AT1G23700 28.346 254 167 8 13 257 26 273 1.86e-20 93.6
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MsG0180000521.01.T01 AT4G24480 28.244 262 158 9 5 250 675 922 2.19e-20 94.4
MsG0180000521.01.T01 AT3G46930 26.923 260 170 9 2 250 204 454 2.61e-20 93.2
MsG0180000521.01.T01 AT1G23700 28.346 254 167 8 13 257 26 273 2.86e-20 93.2
MsG0180000521.01.T01 AT2G20050 27.839 273 169 7 4 254 773 1039 4.08e-20 93.6
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MsG0180000521.01.T01 AT2G20050 27.839 273 169 7 4 254 770 1036 4.71e-20 93.2
MsG0180000521.01.T01 AT4G26070 27.200 250 166 7 3 241 71 315 4.82e-20 91.3
MsG0180000521.01.T01 AT3G63260 26.642 274 162 9 1 241 85 352 4.84e-20 91.7
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MsG0180000521.01.T01 AT4G18950 29.648 199 129 5 5 199 166 357 5.15e-20 92.0
MsG0180000521.01.T01 AT3G61160 27.835 291 160 10 3 253 106 386 5.46e-20 91.7
MsG0180000521.01.T01 AT5G38280 31.086 267 154 12 2 252 334 586 5.96e-20 92.8
MsG0180000521.01.T01 AT3G54180 28.763 299 156 12 5 253 10 301 6.06e-20 90.1
MsG0180000521.01.T01 AT5G38280 31.086 267 154 12 2 252 334 586 6.19e-20 92.4
MsG0180000521.01.T01 AT3G61160 27.931 290 159 10 4 253 107 386 6.29e-20 91.7
MsG0180000521.01.T01 AT4G26070 27.200 250 166 7 3 241 72 316 6.43e-20 90.9
MsG0180000521.01.T01 AT4G26070 27.200 250 166 7 3 241 72 316 6.43e-20 90.9
MsG0180000521.01.T01 AT3G14720 33.990 203 118 6 4 195 30 227 6.63e-20 92.4
MsG0180000521.01.T01 AT1G08720 30.638 235 145 8 5 230 675 900 7.19e-20 92.8
MsG0180000521.01.T01 AT3G02810 30.380 237 145 6 4 224 69 301 7.29e-20 92.0
MsG0180000521.01.T01 AT4G12020 23.664 262 169 6 2 257 1621 1857 7.93e-20 92.8
MsG0180000521.01.T01 AT4G12020 23.664 262 169 6 2 257 1629 1865 8.23e-20 92.8
MsG0180000521.01.T01 AT1G24030 31.500 200 127 4 4 195 67 264 8.46e-20 89.4
MsG0180000521.01.T01 AT1G70110 31.683 202 127 6 4 199 349 545 8.84e-20 92.0
MsG0180000521.01.T01 AT1G09600 30.928 291 147 13 5 253 169 447 8.88e-20 92.0
MsG0180000521.01.T01 AT3G61160 27.931 290 159 10 4 253 114 393 9.02e-20 91.3
MsG0180000521.01.T01 AT3G63260 27.948 229 130 6 1 199 85 308 9.53e-20 90.1
MsG0180000521.01.T01 AT1G53700 25.168 298 162 8 3 245 97 388 9.55e-20 91.3
MsG0180000521.01.T01 AT1G51170 24.262 305 161 9 3 242 26 325 1.36e-19 90.5
MsG0180000521.01.T01 AT1G18390 31.628 215 129 7 5 207 350 558 1.54e-19 91.3
MsG0180000521.01.T01 AT2G30040 27.969 261 169 9 2 253 20 270 1.80e-19 90.5
MsG0180000521.01.T01 AT1G18390 31.481 216 128 8 5 207 344 552 1.98e-19 90.9
MsG0180000521.01.T01 AT4G14780 28.507 221 128 7 4 199 66 281 2.03e-19 89.4
MsG0180000521.01.T01 AT1G69270 33.163 196 119 6 5 194 267 456 2.05e-19 90.9
MsG0180000521.01.T01 AT5G20930 30.370 270 168 10 4 253 414 683 2.13e-19 90.9
MsG0180000521.01.T01 AT4G13020 28.065 310 168 11 5 271 10 307 2.42e-19 89.4
MsG0180000521.01.T01 AT1G18160 29.134 254 162 9 5 249 721 965 2.69e-19 90.9
MsG0180000521.01.T01 AT1G24030 31.500 200 127 4 4 195 67 264 2.71e-19 89.0
MsG0180000521.01.T01 AT1G24030 31.500 200 127 4 4 195 81 278 2.72e-19 89.4
MsG0180000521.01.T01 AT1G24030 31.500 200 127 4 4 195 13 210 2.80e-19 88.2
MsG0180000521.01.T01 AT5G40540 29.643 280 169 12 1 264 28 295 2.94e-19 89.0
MsG0180000521.01.T01 AT3G61160 28.214 280 151 10 4 243 107 376 3.03e-19 89.4
MsG0180000521.01.T01 AT1G18040 27.622 286 161 7 4 253 17 292 3.46e-19 89.0
MsG0180000521.01.T01 AT1G53510 33.498 203 119 6 4 195 30 227 3.57e-19 90.1

Find 82 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 97 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTGTTGCCATGACTTCTTTA+AGG 0.113486 1:-7356782 None:intergenic
TCTTCAGGATTTGATCTTTC+AGG 0.129380 1:+7357482 MsG0180000521.01.T01:CDS
AATCTTAAAGTCTCCGATTT+TGG 0.178673 1:+7356999 MsG0180000521.01.T01:CDS
GCAATAGTGATTCTTCTTTC+AGG 0.194112 1:-7357311 None:intergenic
TTCCATGACAAACAAGATTT+TGG 0.209787 1:-7356808 None:intergenic
GAGATTAATCTCTTTGATTC+AGG 0.238849 1:-7357269 None:intergenic
ATTCTTTATGCTTTACTTGC+TGG 0.260334 1:+7357161 MsG0180000521.01.T01:CDS
GGTAGCAAAAGGTAAATTTA+AGG 0.273095 1:+7356860 MsG0180000521.01.T01:CDS
AGGTTAAGGATTTCAAATTA+AGG 0.286060 1:+7357618 MsG0180000521.01.T01:CDS
TTTATTTCTTCTATGTCTTC+AGG 0.291978 1:+7357467 MsG0180000521.01.T01:CDS
CGGAGAAGGTGTAGCAATTA+AGG 0.295272 1:+7356662 MsG0180000521.01.T01:CDS
TCTTTAAGGTTGACGATGTT+TGG 0.324117 1:-7356768 None:intergenic
TACTACTGCAAATGATGATT+TGG 0.326642 1:+7357385 MsG0180000521.01.T01:CDS
TTCTCCGGTTGAAATTTCTT+TGG 0.332075 1:-7356646 None:intergenic
TGAAGGGAGAAAAGGGAAAT+TGG 0.353458 1:+7357655 MsG0180000521.01.T01:CDS
CCCGTCCTGACGAAGGTGTT+CGG 0.365634 1:-7357036 None:intergenic
CTGCTCTCAAAGACATTGTT+TGG 0.369767 1:+7357789 MsG0180000521.01.T01:CDS
CCGTCCTGACGAAGGTGTTC+GGG 0.384323 1:-7357035 None:intergenic
GTTTAAGGTTAAGAAGGTTA+AGG 0.386802 1:+7357604 MsG0180000521.01.T01:CDS
AGTTGTTTGAAGAAGATGTT+AGG 0.407524 1:+7357765 MsG0180000521.01.T01:CDS
CTTAATTGCTACACCTTCTC+CGG 0.408527 1:-7356661 None:intergenic
TTTAAGGTTTAAGGTTAAGA+AGG 0.409540 1:+7357598 MsG0180000521.01.T01:CDS
CGGTGCCACCTCGTATATTT+CGG 0.414346 1:-7357687 None:intergenic
GACCAAAATCTTGTTTGTCA+TGG 0.426475 1:+7356806 MsG0180000521.01.T01:CDS
CAAAGCAGAGAGACCAAAAT+CGG 0.426671 1:-7357012 None:intergenic
AACGTGAAATTTCAGTTATG+AGG 0.432671 1:+7356733 MsG0180000521.01.T01:CDS
CATAAACCTTTCTGAAACCA+TGG 0.445538 1:-7357350 None:intergenic
TTTGAAAACTTTATTATACA+TGG 0.446290 1:-7357216 None:intergenic
TCATCAAGTAATAAATTCTC+CGG 0.447624 1:-7356969 None:intergenic
GGGTTGATTGAAGGGAGAAA+AGG 0.448570 1:+7357647 MsG0180000521.01.T01:CDS
AAGAATATCAATTTCCACCT+TGG 0.459693 1:+7357240 MsG0180000521.01.T01:CDS
TTCTCATCGCGATTTAAAAC+CGG 0.460676 1:+7356950 MsG0180000521.01.T01:CDS
GGTTGATTGAAGGGAGAAAA+GGG 0.463308 1:+7357648 MsG0180000521.01.T01:CDS
GATTTCAAATTAAGGTTACA+AGG 0.468236 1:+7357626 MsG0180000521.01.T01:CDS
ACCTCGGGTGCCACGTAAGC+AGG 0.470842 1:-7357083 None:intergenic
GGTTACAAGGGTTGATTGAA+GGG 0.473790 1:+7357639 MsG0180000521.01.T01:CDS
CCGAACACCTTCGTCAGGAC+GGG 0.474788 1:+7357036 MsG0180000521.01.T01:CDS
AGGTTACAAGGGTTGATTGA+AGG 0.474826 1:+7357638 MsG0180000521.01.T01:CDS
CTTCAATCATGAATGTTCCA+TGG 0.490881 1:+7357333 MsG0180000521.01.T01:CDS
CTACGGCACTTATAAGCTGT+TGG 0.491349 1:-7356905 None:intergenic
AATTCAACCACCGCAAGCTC+CGG 0.495619 1:-7357707 None:intergenic
TTTGCCCGAACACCTTCGTC+AGG 0.504949 1:+7357031 MsG0180000521.01.T01:CDS
TATGCCAAAGAAATTTCAAC+CGG 0.516464 1:+7356642 MsG0180000521.01.T01:CDS
ACATTGTTTGGTCATGGCAA+GGG 0.517493 1:+7357801 MsG0180000521.01.T01:CDS
AAAAGGGAAATTGGCGGTGA+CGG 0.521587 1:+7357664 MsG0180000521.01.T01:CDS
AATGTTCCATGGTTTCAGAA+AGG 0.521854 1:+7357344 MsG0180000521.01.T01:CDS
CCCGAACACCTTCGTCAGGA+CGG 0.522393 1:+7357035 MsG0180000521.01.T01:CDS
TCAAAGACATTGTTTGGTCA+TGG 0.525871 1:+7357795 MsG0180000521.01.T01:CDS
TGCAAATGATGATTTGGAGT+TGG 0.527061 1:+7357391 MsG0180000521.01.T01:CDS
GACATTGTTTGGTCATGGCA+AGG 0.527457 1:+7357800 MsG0180000521.01.T01:CDS
AGTGATTCTTCTTTCAGGAT+CGG 0.530398 1:-7357306 None:intergenic
AAAGCTGATACTTGGTCTTG+TGG 0.532427 1:+7357134 MsG0180000521.01.T01:CDS
TACGAGATGGGAAGAGTACT+AGG 0.533375 1:+7356594 None:intergenic
GACATATTCAAAAGTATCAC+CGG 0.539078 1:-7357741 None:intergenic
AAAGAAATTTCAACCGGAGA+AGG 0.541927 1:+7356648 MsG0180000521.01.T01:CDS
CGAAATATACGAGGTGGCAC+CGG 0.543038 1:+7357688 MsG0180000521.01.T01:CDS
ATGGGAAGAGTACTAGGTAA+AGG 0.549869 1:+7356600 MsG0180000521.01.T01:CDS
TTTGGTCACAATTTCTGAGA+CGG 0.551897 1:-7357555 None:intergenic
CAAACAATGTCTTTGAGAGC+AGG 0.558243 1:-7357788 None:intergenic
TCCTGCTTACGTGGCACCCG+AGG 0.564231 1:+7357082 MsG0180000521.01.T01:CDS
ATGTGGAACTCCTGCTTACG+TGG 0.564717 1:+7357073 MsG0180000521.01.T01:CDS
CATTGTTTGGTCATGGCAAG+GGG 0.566534 1:+7357802 MsG0180000521.01.T01:CDS
TTATTCGAGAAGGTAGCAAA+AGG 0.570060 1:+7356849 MsG0180000521.01.T01:CDS
CGAGGTGGCACCGGAGCTTG+CGG 0.572914 1:+7357697 MsG0180000521.01.T01:CDS
TCTACTGTGGCAATAATCTA+CGG 0.579359 1:-7356922 None:intergenic
AGGGAGAAAAGGGAAATTGG+CGG 0.580399 1:+7357658 MsG0180000521.01.T01:CDS
CGTCAACCTTAAAGAAGTCA+TGG 0.584832 1:+7356776 MsG0180000521.01.T01:CDS
TGATTTGGAGTTGGAATCAA+AGG 0.587656 1:+7357400 MsG0180000521.01.T01:CDS
ATTTCAAATTAAGGTTACAA+GGG 0.606119 1:+7357627 MsG0180000521.01.T01:CDS
ATTAATCTCAAAGATTCTTG+TGG 0.606329 1:+7357283 MsG0180000521.01.T01:CDS
GTAAAAGCCCGTCCTGACGA+AGG 0.619611 1:-7357043 None:intergenic
TGGCGGCGAATTATTCGAGA+AGG 0.635448 1:+7356839 MsG0180000521.01.T01:CDS
GTAGATTATTGCCACAGTAG+AGG 0.638331 1:+7356924 MsG0180000521.01.T01:CDS
GGTGGCACCGGAGCTTGCGG+TGG 0.639983 1:+7357700 MsG0180000521.01.T01:CDS
AGAAGGTGTAGCAATTAAGG+TGG 0.669423 1:+7356665 MsG0180000521.01.T01:CDS
TTTGATTCAGGTGAAAACCA+AGG 0.674175 1:-7357257 None:intergenic
GATTCAGGTGAAAACCAAGG+TGG 0.685462 1:-7357254 None:intergenic
GATGAGAAACACCTCTACTG+TGG 0.689941 1:-7356935 None:intergenic
GACGGCCGAAATATACGAGG+TGG 0.698502 1:+7357682 MsG0180000521.01.T01:CDS
GTCATGGAATATGCACGTGG+CGG 0.706930 1:+7356822 MsG0180000521.01.T01:CDS
TTTGTCATGGAATATGCACG+TGG 0.728583 1:+7356819 MsG0180000521.01.T01:CDS
GGTGACGGCCGAAATATACG+AGG 0.782830 1:+7357679 MsG0180000521.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTTGAAAACTTTATTATACA+TGG - Chr1:7357219-7357238 None:intergenic 15.0%
!!! ATTAAATTTTCATGTTGAAA+AGG - Chr1:7357194-7357213 None:intergenic 15.0%
!! ATTTCAAATTAAGGTTACAA+GGG + Chr1:7357627-7357646 MsG0180000521.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTGAAGAAAAGAAAAAAAG+AGG + Chr1:7357509-7357528 MsG0180000521.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGCAAAAAATTTAAGGTTTA+AGG + Chr1:7357589-7357608 MsG0180000521.01.T01:CDS 20.0%
! AAAGACAAAGTGAAAAAAGA+AGG + Chr1:7356693-7356712 MsG0180000521.01.T01:CDS 25.0%
! AGAAAAGAAAAAAAGAGGTT+CGG + Chr1:7357514-7357533 MsG0180000521.01.T01:CDS 25.0%
! AGGTTAAGGATTTCAAATTA+AGG + Chr1:7357618-7357637 MsG0180000521.01.T01:CDS 25.0%
! ATTAATCTCAAAGATTCTTG+TGG + Chr1:7357283-7357302 MsG0180000521.01.T01:CDS 25.0%
! GATTTCAAATTAAGGTTACA+AGG + Chr1:7357626-7357645 MsG0180000521.01.T01:CDS 25.0%
! GTTAGAAAAAGAGGTTATAA+CGG + Chr1:7357107-7357126 MsG0180000521.01.T01:CDS 25.0%
! TCATCAAGTAATAAATTCTC+CGG - Chr1:7356972-7356991 None:intergenic 25.0%
!! GTTGAATTTTCTAAATGTTC+CGG + Chr1:7357722-7357741 MsG0180000521.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTAAGGTTTAAGGTTAAGA+AGG + Chr1:7357598-7357617 MsG0180000521.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTATTTCTTCTATGTCTTC+AGG + Chr1:7357467-7357486 MsG0180000521.01.T01:CDS 25.0%
AACGTGAAATTTCAGTTATG+AGG + Chr1:7356733-7356752 MsG0180000521.01.T01:CDS 30.0%
AAGAATATCAATTTCCACCT+TGG + Chr1:7357240-7357259 MsG0180000521.01.T01:CDS 30.0%
AGTTGTTTGAAGAAGATGTT+AGG + Chr1:7357765-7357784 MsG0180000521.01.T01:CDS 30.0%
ATTCTTTATGCTTTACTTGC+TGG + Chr1:7357161-7357180 MsG0180000521.01.T01:CDS 30.0%
GAGATTAATCTCTTTGATTC+AGG - Chr1:7357272-7357291 None:intergenic 30.0%
GGTAGCAAAAGGTAAATTTA+AGG + Chr1:7356860-7356879 MsG0180000521.01.T01:CDS 30.0%
TACTACTGCAAATGATGATT+TGG + Chr1:7357385-7357404 MsG0180000521.01.T01:CDS 30.0%
TATGCCAAAGAAATTTCAAC+CGG + Chr1:7356642-7356661 MsG0180000521.01.T01:CDS 30.0%
! AATCTTAAAGTCTCCGATTT+TGG + Chr1:7356999-7357018 MsG0180000521.01.T01:CDS 30.0%
! GTTTAAGGTTAAGAAGGTTA+AGG + Chr1:7357604-7357623 MsG0180000521.01.T01:CDS 30.0%
! TTCCATGACAAACAAGATTT+TGG - Chr1:7356811-7356830 None:intergenic 30.0%
!! AAAGCGCTGCAAAAAATTTA+AGG + Chr1:7357582-7357601 MsG0180000521.01.T01:CDS 30.0%
!! GACATATTCAAAAGTATCAC+CGG - Chr1:7357744-7357763 None:intergenic 30.0%
AAAGAAATTTCAACCGGAGA+AGG + Chr1:7356648-7356667 MsG0180000521.01.T01:CDS 35.0%
AATGTTCCATGGTTTCAGAA+AGG + Chr1:7357344-7357363 MsG0180000521.01.T01:CDS 35.0%
AGTGATTCTTCTTTCAGGAT+CGG - Chr1:7357309-7357328 None:intergenic 35.0%
CTTCAATCATGAATGTTCCA+TGG + Chr1:7357333-7357352 MsG0180000521.01.T01:CDS 35.0%
GCAATAGTGATTCTTCTTTC+AGG - Chr1:7357314-7357333 None:intergenic 35.0%
TCAAAGACATTGTTTGGTCA+TGG + Chr1:7357795-7357814 MsG0180000521.01.T01:CDS 35.0%
TCGAACGCATTGAAAAATTG+CGG - Chr1:7357446-7357465 None:intergenic 35.0%
TCTACTGTGGCAATAATCTA+CGG - Chr1:7356925-7356944 None:intergenic 35.0%
TCTTCAGGATTTGATCTTTC+AGG + Chr1:7357482-7357501 MsG0180000521.01.T01:CDS 35.0%
TTATTCGAGAAGGTAGCAAA+AGG + Chr1:7356849-7356868 MsG0180000521.01.T01:CDS 35.0%
TTCTCCGGTTGAAATTTCTT+TGG - Chr1:7356649-7356668 None:intergenic 35.0%
TTGTTGCCATGACTTCTTTA+AGG - Chr1:7356785-7356804 None:intergenic 35.0%
TTTGATTCAGGTGAAAACCA+AGG - Chr1:7357260-7357279 None:intergenic 35.0%
! ACCTCTTTTTCTAACTACCT+CGG - Chr1:7357102-7357121 None:intergenic 35.0%
! AGTGAAAAAAGAAGGCATGA+TGG + Chr1:7356701-7356720 MsG0180000521.01.T01:CDS 35.0%
! GACCAAAATCTTGTTTGTCA+TGG + Chr1:7356806-7356825 MsG0180000521.01.T01:CDS 35.0%
! TGATTTGGAGTTGGAATCAA+AGG + Chr1:7357400-7357419 MsG0180000521.01.T01:CDS 35.0%
! TGCAAATGATGATTTGGAGT+TGG + Chr1:7357391-7357410 MsG0180000521.01.T01:CDS 35.0%
! TTCTCATCGCGATTTAAAAC+CGG + Chr1:7356950-7356969 MsG0180000521.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGGTCACAATTTCTGAGA+CGG - Chr1:7357558-7357577 None:intergenic 35.0%
! TTTTGCAGCGCTTTCAATTT+TGG - Chr1:7357576-7357595 None:intergenic 35.0%
!! CATAAACCTTTCTGAAACCA+TGG - Chr1:7357353-7357372 None:intergenic 35.0%
!! TCTTTAAGGTTGACGATGTT+TGG - Chr1:7356771-7356790 None:intergenic 35.0%
!!! ACGGTTTTAAAGCTGATACT+TGG + Chr1:7357126-7357145 MsG0180000521.01.T01:CDS 35.0%
ACATTGTTTGGTCATGGCAA+GGG + Chr1:7357801-7357820 MsG0180000521.01.T01:CDS 40.0%
CAAAGCAGAGAGACCAAAAT+CGG - Chr1:7357015-7357034 None:intergenic 40.0%
CGTCAACCTTAAAGAAGTCA+TGG + Chr1:7356776-7356795 MsG0180000521.01.T01:CDS 40.0%
CTGCTCTCAAAGACATTGTT+TGG + Chr1:7357789-7357808 MsG0180000521.01.T01:CDS 40.0%
CTTAATTGCTACACCTTCTC+CGG - Chr1:7356664-7356683 None:intergenic 40.0%
GGTTGATTGAAGGGAGAAAA+GGG + Chr1:7357648-7357667 MsG0180000521.01.T01:CDS 40.0%
GTAGATTATTGCCACAGTAG+AGG + Chr1:7356924-7356943 MsG0180000521.01.T01:CDS 40.0%
TGAAGGGAGAAAAGGGAAAT+TGG + Chr1:7357655-7357674 MsG0180000521.01.T01:CDS 40.0%
TTTGTCATGGAATATGCACG+TGG + Chr1:7356819-7356838 MsG0180000521.01.T01:CDS 40.0%
! AGAAGGTGTAGCAATTAAGG+TGG + Chr1:7356665-7356684 MsG0180000521.01.T01:CDS 40.0%
! AGGTTACAAGGGTTGATTGA+AGG + Chr1:7357638-7357657 MsG0180000521.01.T01:CDS 40.0%
! CAAACAATGTCTTTGAGAGC+AGG - Chr1:7357791-7357810 None:intergenic 40.0%
! CCTCTTTTTCTAACTACCTC+GGG - Chr1:7357101-7357120 None:intergenic 40.0%
! GGGCTTTTACATACTCAATG+TGG + Chr1:7357056-7357075 MsG0180000521.01.T01:CDS 40.0%
! GGTTACAAGGGTTGATTGAA+GGG + Chr1:7357639-7357658 MsG0180000521.01.T01:CDS 40.0%
!! AAAGCTGATACTTGGTCTTG+TGG + Chr1:7357134-7357153 MsG0180000521.01.T01:CDS 40.0%
!! ATGGGAAGAGTACTAGGTAA+AGG + Chr1:7356600-7356619 MsG0180000521.01.T01:CDS 40.0%
AAAAGGGAAATTGGCGGTGA+CGG + Chr1:7357664-7357683 MsG0180000521.01.T01:CDS 45.0%
AGGGAGAAAAGGGAAATTGG+CGG + Chr1:7357658-7357677 MsG0180000521.01.T01:CDS 45.0%
CATTGTTTGGTCATGGCAAG+GGG + Chr1:7357802-7357821 MsG0180000521.01.T01:CDS 45.0%
CCCGAGGTAGTTAGAAAAAG+AGG + Chr1:7357098-7357117 MsG0180000521.01.T01:CDS 45.0%
CTACGGCACTTATAAGCTGT+TGG - Chr1:7356908-7356927 None:intergenic 45.0%
GACATTGTTTGGTCATGGCA+AGG + Chr1:7357800-7357819 MsG0180000521.01.T01:CDS 45.0%
GATGAGAAACACCTCTACTG+TGG - Chr1:7356938-7356957 None:intergenic 45.0%
GATTCAGGTGAAAACCAAGG+TGG - Chr1:7357257-7357276 None:intergenic 45.0%
! CGGAGAAGGTGTAGCAATTA+AGG + Chr1:7356662-7356681 MsG0180000521.01.T01:CDS 45.0%
! GGGTTGATTGAAGGGAGAAA+AGG + Chr1:7357647-7357666 MsG0180000521.01.T01:CDS 45.0%
AATTCAACCACCGCAAGCTC+CGG - Chr1:7357710-7357729 None:intergenic 50.0%
ATGTGGAACTCCTGCTTACG+TGG + Chr1:7357073-7357092 MsG0180000521.01.T01:CDS 50.0%
CGAAATATACGAGGTGGCAC+CGG + Chr1:7357688-7357707 MsG0180000521.01.T01:CDS 50.0%
GTCATGGAATATGCACGTGG+CGG + Chr1:7356822-7356841 MsG0180000521.01.T01:CDS 50.0%
TGGCGGCGAATTATTCGAGA+AGG + Chr1:7356839-7356858 MsG0180000521.01.T01:CDS 50.0%
!! CGGTGCCACCTCGTATATTT+CGG - Chr1:7357690-7357709 None:intergenic 50.0%
GACGGCCGAAATATACGAGG+TGG + Chr1:7357682-7357701 MsG0180000521.01.T01:CDS 55.0%
GTAAAAGCCCGTCCTGACGA+AGG - Chr1:7357046-7357065 None:intergenic 55.0%
TTTGCCCGAACACCTTCGTC+AGG + Chr1:7357031-7357050 MsG0180000521.01.T01:CDS 55.0%
! GGTGACGGCCGAAATATACG+AGG + Chr1:7357679-7357698 MsG0180000521.01.T01:CDS 55.0%
CCCGAACACCTTCGTCAGGA+CGG + Chr1:7357035-7357054 MsG0180000521.01.T01:CDS 60.0%
CCGAACACCTTCGTCAGGAC+GGG + Chr1:7357036-7357055 MsG0180000521.01.T01:CDS 60.0%
!! CCCGTCCTGACGAAGGTGTT+CGG - Chr1:7357039-7357058 None:intergenic 60.0%
!! CCGTCCTGACGAAGGTGTTC+GGG - Chr1:7357038-7357057 None:intergenic 60.0%
TCCTGCTTACGTGGCACCCG+AGG + Chr1:7357082-7357101 MsG0180000521.01.T01:CDS 65.0%
! ACCTCGGGTGCCACGTAAGC+AGG - Chr1:7357086-7357105 None:intergenic 65.0%
! CGAGGTGGCACCGGAGCTTG+CGG + Chr1:7357697-7357716 MsG0180000521.01.T01:CDS 70.0%
! GGTGGCACCGGAGCTTGCGG+TGG + Chr1:7357700-7357719 MsG0180000521.01.T01:CDS 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 7356600 7357829 7356600 ID=MsG0180000521.01;Name=MsG0180000521.01
Chr1 mRNA 7356600 7357829 7356600 ID=MsG0180000521.01.T01;Parent=MsG0180000521.01;Name=MsG0180000521.01.T01;_AED=0.50;_eAED=0.50;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|409
Chr1 exon 7356600 7357829 7356600 ID=MsG0180000521.01.T01:exon:27744;Parent=MsG0180000521.01.T01
Chr1 CDS 7356600 7357829 7356600 ID=MsG0180000521.01.T01:cds;Parent=MsG0180000521.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180000521.01.T01

ATGGGAAGAGTACTAGGTAAAGGAACATTTGCAAAAGTGTACTATGCCAAAGAAATTTCAACCGGAGAAGGTGTAGCAATTAAGGTGGTAGACAAAGACAAAGTGAAAAAAGAAGGCATGATGGAACAAATCAAACGTGAAATTTCAGTTATGAGGTTAGTAAAACATCCAAACATCGTCAACCTTAAAGAAGTCATGGCAACAAAGACCAAAATCTTGTTTGTCATGGAATATGCACGTGGCGGCGAATTATTCGAGAAGGTAGCAAAAGGTAAATTTAAGGAAGAACTTGCAAGAAAGTACTTCCAACAGCTTATAAGTGCCGTAGATTATTGCCACAGTAGAGGTGTTTCTCATCGCGATTTAAAACCGGAGAATTTATTACTTGATGAAAACGAGAATCTTAAAGTCTCCGATTTTGGTCTCTCTGCTTTGCCCGAACACCTTCGTCAGGACGGGCTTTTACATACTCAATGTGGAACTCCTGCTTACGTGGCACCCGAGGTAGTTAGAAAAAGAGGTTATAACGGTTTTAAAGCTGATACTTGGTCTTGTGGTGTTATTCTTTATGCTTTACTTGCTGGATTTTTACCTTTTCAACATGAAAATTTAATGTCCATGTATAATAAAGTTTTCAAAGAAGAATATCAATTTCCACCTTGGTTTTCACCTGAATCAAAGAGATTAATCTCAAAGATTCTTGTGGCCGATCCTGAAAGAAGAATCACTATTGCTTCAATCATGAATGTTCCATGGTTTCAGAAAGGTTTATGTTTATCAACTACTACTACTGCAAATGATGATTTGGAGTTGGAATCAAAGGTGACTTTGATAAACTCAACGCCGCAATTTTTCAATGCGTTCGAGTTTATTTCTTCTATGTCTTCAGGATTTGATCTTTCAGGTTTGTTTGAAGAAAAGAAAAAAAGAGGTTCGGTTTTCACTTCAAAGTGTTCCGTCTCAGAAATTGTGACCAAAATTGAAAGCGCTGCAAAAAATTTAAGGTTTAAGGTTAAGAAGGTTAAGGATTTCAAATTAAGGTTACAAGGGTTGATTGAAGGGAGAAAAGGGAAATTGGCGGTGACGGCCGAAATATACGAGGTGGCACCGGAGCTTGCGGTGGTTGAATTTTCTAAATGTTCCGGTGATACTTTTGAATATGTCAAGTTGTTTGAAGAAGATGTTAGGCCTGCTCTCAAAGACATTGTTTGGTCATGGCAAGGGGAGTGA
Protein sequence

>MsG0180000521.01.T01

MGRVLGKGTFAKVYYAKEISTGEGVAIKVVDKDKVKKEGMMEQIKREISVMRLVKHPNIVNLKEVMATKTKILFVMEYARGGELFEKVAKGKFKEELARKYFQQLISAVDYCHSRGVSHRDLKPENLLLDENENLKVSDFGLSALPEHLRQDGLLHTQCGTPAYVAPEVVRKRGYNGFKADTWSCGVILYALLAGFLPFQHENLMSMYNKVFKEEYQFPPWFSPESKRLISKILVADPERRITIASIMNVPWFQKGLCLSTTTTANDDLELESKVTLINSTPQFFNAFEFISSMSSGFDLSGLFEEKKKRGSVFTSKCSVSEIVTKIESAAKNLRFKVKKVKDFKLRLQGLIEGRKGKLAVTAEIYEVAPELAVVEFSKCSGDTFEYVKLFEEDVRPALKDIVWSWQGE*