AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180000917.01

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MsG0180000917.01.T01 AT1G66930 35.179 614 352 16 38 629 257 846 9.34e-103 333
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MsG0180000917.01.T01 AT5G24080 44.737 304 155 7 331 627 517 814 1.66e-76 263
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MsG0180000917.01.T01 AT1G56145 35.958 381 204 9 285 634 631 1002 2.10e-63 228
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MsG0180000917.01.T01 AT4G23130 32.164 342 221 5 298 630 293 632 2.39e-55 200
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MsG0180000917.01.T01 AT1G11350 35.806 310 193 4 348 653 516 823 4.07e-55 202
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MsG0180000917.01.T01 AT5G18500 38.488 291 168 7 334 617 154 440 2.16e-54 194
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MsG0180000917.01.T01 AT1G61430 34.084 311 195 5 346 649 468 775 2.00e-53 197
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MsG0180000917.01.T01 AT1G09440 38.435 294 164 8 334 617 145 431 3.28e-52 187
MsG0180000917.01.T01 AT4G11470 32.448 339 223 3 296 630 296 632 3.51e-52 191
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MsG0180000917.01.T01 AT5G42440 38.889 288 165 8 335 615 70 353 5.30e-52 184
MsG0180000917.01.T01 AT4G21410 34.385 317 197 6 347 654 235 549 5.79e-52 189
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MsG0180000917.01.T01 AT1G61400 35.540 287 179 4 346 629 502 785 3.31e-51 191
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MsG0180000917.01.T01 AT2G28970 36.770 291 169 5 332 615 467 749 8.97e-51 189
MsG0180000917.01.T01 AT1G11410 34.807 362 211 6 300 656 494 835 1.03e-50 189
MsG0180000917.01.T01 AT4G11460 33.544 316 196 6 327 630 324 637 1.07e-50 188
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MsG0180000917.01.T01 AT2G43700 35.435 333 203 9 292 619 261 586 1.16e-50 187
MsG0180000917.01.T01 AT5G03140 34.181 354 208 10 287 624 313 657 1.18e-50 188
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MsG0180000917.01.T01 AT1G11410 34.807 362 211 6 300 656 501 842 1.29e-50 189
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MsG0180000917.01.T01 AT1G56720 37.415 294 167 9 334 617 167 453 1.68e-50 183
MsG0180000917.01.T01 AT1G56720 37.415 294 167 9 334 617 167 453 1.68e-50 183
MsG0180000917.01.T01 AT2G43700 35.435 333 203 9 292 619 285 610 1.70e-50 186
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MsG0180000917.01.T01 AT5G35960 35.016 317 191 7 334 644 122 429 6.54e-50 180
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MsG0180000917.01.T01 AT3G46400 30.728 371 227 8 257 611 486 842 1.79e-49 186
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MsG0180000917.01.T01 AT1G48210 36.071 280 167 4 345 615 69 345 2.62e-49 176
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MsG0180000917.01.T01 AT2G42960 38.462 273 159 6 350 617 189 457 3.90e-49 179
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MsG0180000917.01.T01 AT1G55200 38.047 297 168 10 331 618 364 653 2.31e-48 181
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MsG0180000917.01.T01 AT2G28990 36.111 288 175 5 332 615 565 847 2.53e-48 182
MsG0180000917.01.T01 AT2G28990 36.111 288 175 5 332 615 565 847 2.53e-48 182
MsG0180000917.01.T01 AT1G70460 38.411 302 165 10 334 621 341 635 2.60e-48 181
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MsG0180000917.01.T01 AT1G61360 34.277 318 194 7 348 655 421 733 3.38e-48 181
MsG0180000917.01.T01 AT1G61360 34.277 318 194 7 348 655 421 733 3.38e-48 181
MsG0180000917.01.T01 AT1G61440 32.153 339 191 7 346 656 485 812 4.07e-48 182
MsG0180000917.01.T01 AT1G61360 34.277 318 194 7 348 655 502 814 4.12e-48 182
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MsG0180000917.01.T01 AT2G18470 36.949 295 170 8 334 618 272 560 5.08e-48 179
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MsG0180000917.01.T01 AT4G23210 38.865 229 133 4 321 544 332 558 1.53e-45 172
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MsG0180000917.01.T01 AT5G60300 32.095 377 225 13 259 625 268 623 1.69e-45 174
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MsG0180000917.01.T01 AT4G29990 33.430 344 211 8 284 618 512 846 2.19e-45 174
MsG0180000917.01.T01 AT1G31420 35.505 307 181 9 334 634 294 589 2.27e-45 171
MsG0180000917.01.T01 AT3G19700 32.759 348 201 9 295 615 623 964 2.33e-45 174
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MsG0180000917.01.T01 AT3G13690 36.949 295 174 8 331 618 396 685 2.41e-45 173
MsG0180000917.01.T01 AT3G13690 36.949 295 174 8 331 618 396 685 2.41e-45 173
MsG0180000917.01.T01 AT5G02800 35.517 290 175 8 334 614 61 347 2.64e-45 166
MsG0180000917.01.T01 AT3G46370 35.106 282 174 4 334 611 477 753 2.65e-45 173
MsG0180000917.01.T01 AT3G46370 35.106 282 174 4 334 611 477 753 2.65e-45 173
MsG0180000917.01.T01 AT3G01300 35.235 298 173 6 334 615 124 417 2.74e-45 169
MsG0180000917.01.T01 AT3G59740 33.626 342 200 11 285 616 285 609 2.80e-45 172
MsG0180000917.01.T01 AT4G28350 33.134 335 196 11 297 615 298 620 2.88e-45 172
MsG0180000917.01.T01 AT3G25490 36.934 287 173 5 334 615 96 379 2.91e-45 167
MsG0180000917.01.T01 AT1G26150 43.636 220 117 5 334 550 418 633 3.06e-45 171
MsG0180000917.01.T01 AT1G31420 35.505 307 182 9 334 634 294 590 3.17e-45 171
MsG0180000917.01.T01 AT1G31420 35.505 307 182 9 334 634 294 590 3.17e-45 171
MsG0180000917.01.T01 AT3G59750 33.846 325 202 8 299 616 258 576 3.21e-45 171
MsG0180000917.01.T01 AT1G07870 34.602 289 179 7 334 614 91 377 3.29e-45 167
MsG0180000917.01.T01 AT3G02810 35.144 313 180 12 334 631 52 356 3.52e-45 170
MsG0180000917.01.T01 AT1G24030 35.473 296 172 9 334 615 50 340 4.24e-45 165
MsG0180000917.01.T01 AT3G49670 34.251 327 187 9 350 668 696 1002 4.31e-45 174
MsG0180000917.01.T01 AT2G28930 34.516 310 179 9 324 615 49 352 4.32e-45 166
MsG0180000917.01.T01 AT5G18610 35.395 291 174 9 334 614 71 357 4.48e-45 169
MsG0180000917.01.T01 AT5G18610 35.395 291 174 9 334 614 71 357 4.48e-45 169
MsG0180000917.01.T01 AT5G18610 35.395 291 174 9 334 614 71 357 4.48e-45 169
MsG0180000917.01.T01 AT1G07550 33.127 323 208 5 301 622 520 835 4.54e-45 173
MsG0180000917.01.T01 AT5G16900 35.172 290 179 4 335 620 378 662 4.55e-45 171
MsG0180000917.01.T01 AT1G51850 34.752 282 175 5 334 611 548 824 5.14e-45 173
MsG0180000917.01.T01 AT2G28930 34.516 310 179 9 324 615 60 363 5.45e-45 166
MsG0180000917.01.T01 AT5G02290 33.010 309 185 8 324 615 48 351 5.69e-45 165
MsG0180000917.01.T01 AT5G02290 33.010 309 185 8 324 615 48 351 5.69e-45 165
MsG0180000917.01.T01 AT1G51850 34.752 282 175 5 334 611 568 844 6.14e-45 172
MsG0180000917.01.T01 AT2G28930 34.516 310 179 9 324 615 52 355 6.21e-45 166
MsG0180000917.01.T01 AT2G18470 43.721 215 113 6 334 544 272 482 7.56e-45 168
MsG0180000917.01.T01 AT1G51870 34.520 281 174 5 335 611 522 796 7.72e-45 172
MsG0180000917.01.T01 AT2G28590 36.082 291 174 9 334 615 86 373 8.45e-45 166
MsG0180000917.01.T01 AT1G14370 34.202 307 181 9 334 624 74 375 9.07e-45 166
MsG0180000917.01.T01 AT1G70110 36.486 296 168 9 331 615 329 615 9.60e-45 170
MsG0180000917.01.T01 AT1G07870 34.602 289 179 7 334 614 91 377 9.67e-45 168
MsG0180000917.01.T01 AT3G45430 35.880 301 175 10 334 625 332 623 1.00e-44 170
MsG0180000917.01.T01 AT3G45430 35.880 301 175 10 334 625 332 623 1.00e-44 170
MsG0180000917.01.T01 AT3G45430 35.880 301 175 10 334 625 332 623 1.00e-44 170
MsG0180000917.01.T01 AT5G40380 45.161 217 112 5 334 546 303 516 1.03e-44 168
MsG0180000917.01.T01 AT1G51870 34.520 281 174 5 335 611 574 848 1.05e-44 172
MsG0180000917.01.T01 AT1G51805 35.461 282 173 4 334 611 567 843 1.15e-44 172
MsG0180000917.01.T01 AT3G18810 37.201 293 170 8 334 617 325 612 1.21e-44 170
MsG0180000917.01.T01 AT5G15730 32.867 286 173 6 334 614 104 375 1.26e-44 166
MsG0180000917.01.T01 AT5G15730 32.867 286 173 6 334 614 104 375 1.26e-44 166
MsG0180000917.01.T01 AT1G51805 35.461 282 173 4 334 611 543 819 1.27e-44 172
MsG0180000917.01.T01 AT4G35600 35.599 309 175 9 334 625 74 375 1.31e-44 165
MsG0180000917.01.T01 AT3G15890 36.552 290 170 10 334 614 27 311 1.35e-44 164
MsG0180000917.01.T01 AT5G16900 35.172 290 179 4 335 620 564 848 1.38e-44 171
MsG0180000917.01.T01 AT5G16900 35.172 290 179 4 335 620 564 848 1.38e-44 171
MsG0180000917.01.T01 AT2G20300 35.294 289 172 7 334 615 337 617 1.41e-44 171
MsG0180000917.01.T01 AT3G17410 36.786 280 165 4 345 615 70 346 1.42e-44 164
MsG0180000917.01.T01 AT3G17410 36.786 280 165 4 345 615 70 346 1.42e-44 164
MsG0180000917.01.T01 AT1G51790 33.628 339 205 10 285 615 519 845 1.42e-44 171
MsG0180000917.01.T01 AT1G51790 33.628 339 205 10 285 615 519 845 1.42e-44 171
MsG0180000917.01.T01 AT1G79620 35.517 290 173 7 334 615 652 935 1.55e-44 172
MsG0180000917.01.T01 AT4G35600 35.599 309 175 9 334 625 75 376 1.57e-44 165
MsG0180000917.01.T01 AT4G02420 32.219 329 205 9 305 625 314 632 1.67e-44 169
MsG0180000917.01.T01 AT2G28250 34.219 301 172 8 334 614 198 492 1.71e-44 168
MsG0180000917.01.T01 AT2G28250 34.219 301 172 8 334 614 198 492 1.71e-44 168
MsG0180000917.01.T01 AT2G28250 34.219 301 172 8 334 614 198 492 1.71e-44 168
MsG0180000917.01.T01 AT2G28250 34.219 301 172 8 334 614 198 492 1.71e-44 168
MsG0180000917.01.T01 AT2G28250 34.219 301 172 8 334 614 198 492 1.71e-44 168
MsG0180000917.01.T01 AT2G28250 34.219 301 172 8 334 614 198 492 1.71e-44 168

Find 141 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 179 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATATAATCATTTACTGAATT+TGG 0.119915 1:-13193212 None:intergenic
AACAGATAACAACAAAATTT+TGG 0.192746 1:-13193133 None:intergenic
GCTATAAACATCAGCTTTAT+AGG 0.193256 1:-13193993 None:intergenic
CAATTGAAATATCATGTATT+TGG 0.206055 1:-13193739 None:intergenic
GACATATCCTACTTCATATC+TGG 0.209953 1:-13193237 None:intergenic
GAAGAAGTATTCACATATTT+AGG 0.213485 1:-13192154 None:intergenic
AAGGAAGTATTTGATCTCTT+TGG 0.238705 1:-13192300 None:intergenic
ATTCATCAGGCGTTAGTATA+TGG 0.260933 1:+13192331 MsG0180000917.01.T01:CDS
TCCTGTTTGTACAACATTAC+AGG 0.266681 1:+13193167 MsG0180000917.01.T01:CDS
AAAGCTGATGTTTATAGCTT+TGG 0.269684 1:+13193998 MsG0180000917.01.T01:CDS
GTTGAAGTAGAGGCGTAAAT+TGG 0.294214 1:-13191706 None:intergenic
ATACAGAGAAATTAAGAAAA+TGG 0.298563 1:+13193424 MsG0180000917.01.T01:CDS
TATATGGATTTGAGATTTCA+TGG 0.314753 1:+13192347 MsG0180000917.01.T01:CDS
ATTAGTGAAGTCACAACTAT+TGG 0.322756 1:+13193572 MsG0180000917.01.T01:CDS
TGTTGGTTACTCCAACTTCT+TGG 0.322961 1:+13192269 MsG0180000917.01.T01:CDS
GGACTGGTTGAAATAATAAA+AGG 0.326538 1:+13193188 MsG0180000917.01.T01:CDS
TCCCAAAGATATCTGACTTT+GGG 0.327397 1:+13193861 MsG0180000917.01.T01:CDS
TCTCTTGAAATTGTTTCATC+TGG 0.327729 1:-13194310 None:intergenic
TAGGATTGTTGGTCACTTCA+TGG 0.332336 1:-13192135 None:intergenic
AAGCTGATGTTTATAGCTTT+GGG 0.337810 1:+13193999 MsG0180000917.01.T01:CDS
AGCCCAAAGTCAGATATCTT+TGG 0.339997 1:-13193863 None:intergenic
TAGAGGTTTCAAAGACGAAT+TGG 0.354194 1:+13193448 MsG0180000917.01.T01:CDS
AATGTTGTGCATTGGTATTA+AGG 0.371460 1:-13194057 None:intergenic
AAAAGAGGAAGAAATCGATA+TGG 0.374327 1:+13194123 MsG0180000917.01.T01:CDS
ATTCACATATTTAGGATTGT+TGG 0.389863 1:-13192146 None:intergenic
GCCCAAAGTCAGATATCTTT+GGG 0.390830 1:-13193862 None:intergenic
CTATATTCTACCATCATTGT+TGG 0.394618 1:+13193268 MsG0180000917.01.T01:CDS
CAAATACATGATATTTCAAT+TGG 0.396498 1:+13193740 MsG0180000917.01.T01:CDS
ATCCCAAAGATATCTGACTT+TGG 0.400603 1:+13193860 MsG0180000917.01.T01:CDS
TGGCTGCTAGACTTCTGTTT+GGG 0.406449 1:+13193288 MsG0180000917.01.T01:CDS
TTGGCTGCTAGACTTCTGTT+TGG 0.407295 1:+13193287 MsG0180000917.01.T01:CDS
TCCTGTAATGTTGTACAAAC+AGG 0.408456 1:-13193168 None:intergenic
GAATTGGGTAAAGGAGGCTT+TGG 0.411759 1:+13193464 MsG0180000917.01.T01:CDS
TTGAATGTGGTGCAATTACT+TGG 0.412164 1:+13193608 MsG0180000917.01.T01:CDS
AAGATGATCCCATTCATTGC+GGG 0.418116 1:+13191825 MsG0180000917.01.T01:CDS
AAAGTAGTTGAAATGCTTGA+AGG 0.418823 1:+13194244 MsG0180000917.01.T01:CDS
TTCAACTACTTTACTCATTG+AGG 0.424145 1:-13194233 None:intergenic
CTCATTGAGGGGCGATCACT+CGG 0.424510 1:-13194220 None:intergenic
AGATGATCATGGTTGCTCTT+TGG 0.425179 1:+13194182 MsG0180000917.01.T01:CDS
TCCTTATGAAGTCATTCATC+AGG 0.429138 1:+13192318 MsG0180000917.01.T01:CDS
ACCGCGGCTAAAGGAACAAT+TGG 0.431752 1:+13193926 MsG0180000917.01.T01:CDS
TCTGGATACAAGGTGGGCTC+TGG 0.437151 1:-13194292 None:intergenic
CCATTCATTGCGGGGACAAA+AGG 0.437267 1:+13191834 MsG0180000917.01.T01:CDS
GGAGTAATTAAATTGGAGAC+AGG 0.439815 1:-13192176 None:intergenic
TGAAGTCACTGGATGTTGTT+TGG 0.444933 1:-13194351 None:intergenic
AGGCTTTGGAACTGTGTTCA+AGG 0.445324 1:+13193478 MsG0180000917.01.T01:CDS
GGTTACTCCAACTTCTTGGT+CGG 0.446126 1:+13192273 MsG0180000917.01.T01:CDS
GCCTGATGAATGACTTCATA+AGG 0.447781 1:-13192319 None:intergenic
TTGGGTAAGGCAAAAGGTAA+TGG 0.450273 1:+13193539 MsG0180000917.01.T01:CDS
GGATGTTGTTTGGTCTGACC+TGG 0.450755 1:-13194341 None:intergenic
GAACTTATCAAGAGATCCAT+TGG 0.451768 1:-13193678 None:intergenic
TCTTGTCCCTCTTCATCTTG+TGG 0.465277 1:+13191767 MsG0180000917.01.T01:CDS
TCAACTACTTTACTCATTGA+GGG 0.465681 1:-13194232 None:intergenic
ACAATCCGAGTGGTTGATCC+TGG 0.466573 1:+13191944 MsG0180000917.01.T01:CDS
ATGAATATCCAATGGGCATA+AGG 0.467782 1:-13193403 None:intergenic
AGAGGTTTCAAAGACGAATT+GGG 0.468393 1:+13193449 MsG0180000917.01.T01:CDS
AATTGTTTCATCTGGATACA+AGG 0.471427 1:-13194302 None:intergenic
TTTCACTGCTGATATACAAA+TGG 0.472165 1:+13193324 MsG0180000917.01.T01:CDS
GTTACTCCAACTTCTTGGTC+GGG 0.481755 1:+13192274 MsG0180000917.01.T01:CDS
TCGAAATGGATAACTTATGT+TGG 0.482379 1:-13191798 None:intergenic
ATATGTCGCTTGGCTTGGTA+TGG 0.484479 1:-13192061 None:intergenic
AAATCTTCATTTCACATCCA+TGG 0.494002 1:-13193790 None:intergenic
GTGGGTAAGAGTGATATTAC+TGG 0.494181 1:+13191676 MsG0180000917.01.T01:CDS
TGGGTAAGGCAAAAGGTAAT+GGG 0.495958 1:+13193540 MsG0180000917.01.T01:CDS
ACATATCCTACTTCATATCT+GGG 0.496542 1:-13193236 None:intergenic
AATTATATTTATGCTATGAC+TGG 0.498442 1:+13192205 MsG0180000917.01.T01:CDS
AAGATGTTGGGTAAGGCAAA+AGG 0.505076 1:+13193533 MsG0180000917.01.T01:CDS
GCCATCATCAATATGTCGCT+TGG 0.505634 1:-13192071 None:intergenic
TTATGATCAACTTAGAAAAG+AGG 0.507196 1:+13194108 MsG0180000917.01.T01:CDS
GTTACAATGCTATTCTGTGC+TGG 0.507420 1:-13193899 None:intergenic
CTCGTCAAGCAAGATATTGT+GGG 0.507979 1:-13193831 None:intergenic
CAAAACAACCTTATGCCCAT+TGG 0.509154 1:+13193395 MsG0180000917.01.T01:CDS
TGGAAACCCGACCAAGAAGT+TGG 0.510972 1:-13192280 None:intergenic
ATTTATGAATTCATGCCCAA+TGG 0.511857 1:+13193662 MsG0180000917.01.T01:CDS
ATTGTTGAAGACTTTCAAGT+TGG 0.512794 1:+13192235 MsG0180000917.01.T01:CDS
AAGTTGATCATAAATCCAAA+AGG 0.514693 1:-13194098 None:intergenic
TTCTCTGTATGAATATCCAA+TGG 0.516340 1:-13193411 None:intergenic
TTCAAAGACGAATTGGGTAA+AGG 0.516399 1:+13193455 MsG0180000917.01.T01:CDS
TTTGTACAACATTACAGGAC+TGG 0.520110 1:+13193172 MsG0180000917.01.T01:CDS
CAAGAAGTATTCTCTAATAG+AGG 0.520416 1:-13194409 None:intergenic
GCCAAGCGACATATTGATGA+TGG 0.521028 1:+13192070 MsG0180000917.01.T01:CDS
CATCAATATGTCGCTTGGCT+TGG 0.522135 1:-13192066 None:intergenic
TATGAAGTAGGATATGTCAT+TGG 0.528987 1:+13193242 MsG0180000917.01.T01:CDS
GTAACAATGACCGCGGCTAA+AGG 0.532780 1:+13193917 MsG0180000917.01.T01:CDS
TCTCGTCAAGCAAGATATTG+TGG 0.533050 1:-13193832 None:intergenic
GCTGGAACTAATGAAGTCAC+TGG 0.533211 1:-13194362 None:intergenic
CATTAGTTCCAGCAATTCGA+GGG 0.536688 1:+13194372 MsG0180000917.01.T01:CDS
AGTTGGTTGTCATGTGATGT+TGG 0.538284 1:+13192252 MsG0180000917.01.T01:CDS
CAATTAGATTGCTGAACACC+AGG 0.541171 1:-13191962 None:intergenic
GATTGTGACAAGAAATAGAG+AGG 0.541243 1:-13191995 None:intergenic
TTCAAGGGAAACCTACGTAG+TGG 0.542537 1:+13193494 MsG0180000917.01.T01:CDS
GGATACAAGGTGGGCTCTGG+AGG 0.542944 1:-13194289 None:intergenic
TCATTAGTTCCAGCAATTCG+AGG 0.544933 1:+13194371 MsG0180000917.01.T01:CDS
AAAGATATCTGACTTTGGGC+TGG 0.545899 1:+13193865 MsG0180000917.01.T01:CDS
TCCAAAAGGGAAAATATACC+TGG 0.547013 1:-13194084 None:intergenic
GGCTTTGGAACTGTGTTCAA+GGG 0.549166 1:+13193479 MsG0180000917.01.T01:CDS
AACATCTTGATTGCCACACA+AGG 0.553530 1:-13193518 None:intergenic
GGCAATCAAGATGTTGGGTA+AGG 0.556942 1:+13193526 MsG0180000917.01.T01:CDS
AACTTATCAAGAGATCCATT+GGG 0.557762 1:-13193677 None:intergenic
AGTTGATCATAAATCCAAAA+GGG 0.562411 1:-13194097 None:intergenic
AGTCTAGCAGCCAACAATGA+TGG 0.562558 1:-13193278 None:intergenic
GCAGTCTCGCCTCCATGTGG+TGG 0.564214 1:+13191657 None:intergenic
TTGTGTGGCAATCAAGATGT+TGG 0.564999 1:+13193520 MsG0180000917.01.T01:CDS
TCTCTGTATGAATATCCAAT+GGG 0.570658 1:-13193410 None:intergenic
TATATTCCCAGATATGAAGT+AGG 0.572443 1:+13193230 MsG0180000917.01.T01:CDS
AACAGCTTTAAATTTGTACT+CGG 0.574577 1:+13191883 MsG0180000917.01.T01:CDS
CTGATACCTTGTTGAAGTAG+AGG 0.575371 1:-13191716 None:intergenic
GTTTCATCTGGATACAAGGT+GGG 0.579650 1:-13194298 None:intergenic
TAAGGCAAAAGGTAATGGGC+AGG 0.581090 1:+13193544 MsG0180000917.01.T01:CDS
TGTGTGGCAATCAAGATGTT+GGG 0.583002 1:+13193521 MsG0180000917.01.T01:CDS
TTTCTGTGATATCGAGGACA+TGG 0.585114 1:+13192021 MsG0180000917.01.T01:CDS
TCCAATTGTTCCTTTAGCCG+CGG 0.588454 1:-13193927 None:intergenic
CTGGCTTGAATGTTGTGCAT+TGG 0.591794 1:-13194065 None:intergenic
TAAAGGAACAATTGGATACA+TGG 0.595237 1:+13193934 MsG0180000917.01.T01:CDS
CAACTACTTTACTCATTGAG+GGG 0.596013 1:-13194231 None:intergenic
ATCTAATTTCTGTGATATCG+AGG 0.598493 1:+13192015 MsG0180000917.01.T01:CDS
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AAAGACGAATTGGGTAAAGG+AGG 0.609732 1:+13193458 MsG0180000917.01.T01:CDS
CAATGCACAACATTCAAGCC+AGG 0.616281 1:+13194066 MsG0180000917.01.T01:CDS
AAAGATGATCCCATTCATTG+CGG 0.618685 1:+13191824 MsG0180000917.01.T01:CDS
CAGTCTCGCCTCCATGTGGT+GGG 0.619304 1:+13191658 None:intergenic
ATTTCAATTGGAGTAGCTCG+AGG 0.624519 1:+13193752 MsG0180000917.01.T01:CDS
AATTGTAAAGAAGATGATCA+TGG 0.626493 1:+13194171 MsG0180000917.01.T01:CDS
GAAATTAAGAAAATGGCTAG+AGG 0.626513 1:+13193431 MsG0180000917.01.T01:CDS
GGACATGGATCAAAATTGCA+CGG 0.633268 1:+13192036 MsG0180000917.01.T01:CDS
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GGAATTGCTTATCTCCACCA+TGG 0.642225 1:+13193773 MsG0180000917.01.T01:CDS
TGTTTCATCTGGATACAAGG+TGG 0.645255 1:-13194299 None:intergenic
TCGTCAAGCAAGATATTGTG+GGG 0.647982 1:-13193830 None:intergenic
CCACACAAGGCCCACTACGT+AGG 0.648868 1:-13193505 None:intergenic
AGATGATCCCATTCATTGCG+GGG 0.650194 1:+13191826 MsG0180000917.01.T01:CDS
TATGGAAAATATCTCAGAGG+AGG 0.652603 1:+13194141 MsG0180000917.01.T01:CDS
GAACACCAGGATCAACCACT+CGG 0.658675 1:-13191949 None:intergenic
TATCACTCTTACCCACCACA+TGG 0.660794 1:-13191669 None:intergenic
TCTTCATTTCACATCCATGG+TGG 0.661756 1:-13193787 None:intergenic
TTTACGCCTCTACTTCAACA+AGG 0.673411 1:+13191710 MsG0180000917.01.T01:CDS
AAGAATACATCATTTGAATG+TGG 0.676541 1:+13193595 MsG0180000917.01.T01:CDS
TTTCAAGAGATGAAACAACC+AGG 0.696993 1:+13194323 MsG0180000917.01.T01:CDS
CAACAATTTCACAATCCGAG+TGG 0.699194 1:+13191934 MsG0180000917.01.T01:CDS
CGATATGGAAAATATCTCAG+AGG 0.707927 1:+13194138 MsG0180000917.01.T01:CDS
TAGCATTGTAACAATGACCG+CGG 0.732479 1:+13193910 MsG0180000917.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AATATTTGACTTTTATTTAT+TGG + Chr1:13193006-13193025 MsG0180000917.01.T01:intron 10.0%
!!! AGCATAAATATAATTATTTT+TGG - Chr1:13192200-13192219 None:intergenic 10.0%
!! AATTGTTCTACAAAAATATT+GGG + Chr1:13193963-13193982 MsG0180000917.01.T01:CDS 15.0%
!! ATATAATCATTTACTGAATT+TGG - Chr1:13193215-13193234 None:intergenic 15.0%
!!! TATTTTTGGAGTAATTAAAT+TGG - Chr1:13192186-13192205 None:intergenic 15.0%
!! AATTATATTTATGCTATGAC+TGG + Chr1:13192205-13192224 MsG0180000917.01.T01:CDS 20.0%
!! ATACAGAGAAATTAAGAAAA+TGG + Chr1:13193424-13193443 MsG0180000917.01.T01:CDS 20.0%
!! ATTGTTCTACAAAAATATTG+GGG + Chr1:13193964-13193983 MsG0180000917.01.T01:CDS 20.0%
!! CAAATACATGATATTTCAAT+TGG + Chr1:13193740-13193759 MsG0180000917.01.T01:CDS 20.0%
!! CAATTGAAATATCATGTATT+TGG - Chr1:13193742-13193761 None:intergenic 20.0%
!! GAATTGTTCTACAAAAATAT+TGG + Chr1:13193962-13193981 MsG0180000917.01.T01:CDS 20.0%
!!! AACAGATAACAACAAAATTT+TGG - Chr1:13193136-13193155 None:intergenic 20.0%
!!! ATATTTTTGTAGAACAATTC+TGG - Chr1:13193962-13193981 None:intergenic 20.0%
!!! ATTACTCATCAATCATATTT+TGG + Chr1:13192551-13192570 MsG0180000917.01.T01:intron 20.0%
! AAGAATACATCATTTGAATG+TGG + Chr1:13193595-13193614 MsG0180000917.01.T01:CDS 25.0%
! AATTGTAAAGAAGATGATCA+TGG + Chr1:13194171-13194190 MsG0180000917.01.T01:CDS 25.0%
! AGTTGATCATAAATCCAAAA+GGG - Chr1:13194100-13194119 None:intergenic 25.0%
! ATACCTTTAGCAGATAATTT+AGG - Chr1:13192596-13192615 None:intergenic 25.0%
! TTATGATCAACTTAGAAAAG+AGG + Chr1:13194108-13194127 MsG0180000917.01.T01:CDS 25.0%
!! AAGTTGATCATAAATCCAAA+AGG - Chr1:13194101-13194120 None:intergenic 25.0%
!! ATAAATCTCTGCAAGTATTT+TGG - Chr1:13192387-13192406 None:intergenic 25.0%
!! ATTCACATATTTAGGATTGT+TGG - Chr1:13192149-13192168 None:intergenic 25.0%
!! TATATGGATTTGAGATTTCA+TGG + Chr1:13192347-13192366 MsG0180000917.01.T01:CDS 25.0%
!!! AACAGCTTTAAATTTGTACT+CGG + Chr1:13191883-13191902 MsG0180000917.01.T01:CDS 25.0%
!!! GAAGAAGTATTCACATATTT+AGG - Chr1:13192157-13192176 None:intergenic 25.0%
!!! TAAGAAACACACTCTTTTTT+GGG + Chr1:13193064-13193083 MsG0180000917.01.T01:intron 25.0%
!!! TTAAGAAACACACTCTTTTT+TGG + Chr1:13193063-13193082 MsG0180000917.01.T01:intron 25.0%
AAAAGAGGAAGAAATCGATA+TGG + Chr1:13194123-13194142 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
AAAGCTGATGTTTATAGCTT+TGG + Chr1:13193998-13194017 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
AAAGTAGTTGAAATGCTTGA+AGG + Chr1:13194244-13194263 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
AAATCTTCATTTCACATCCA+TGG - Chr1:13193793-13193812 None:intergenic 30.0%
AACTTATCAAGAGATCCATT+GGG - Chr1:13193680-13193699 None:intergenic 30.0%
AAGCTGATGTTTATAGCTTT+GGG + Chr1:13193999-13194018 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
AATTGTTTCATCTGGATACA+AGG - Chr1:13194305-13194324 None:intergenic 30.0%
ACAAATGGAGAAAAAGACAT+TGG + Chr1:13193339-13193358 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
ACATATCCTACTTCATATCT+GGG - Chr1:13193239-13193258 None:intergenic 30.0%
ATCTAATTTCTGTGATATCG+AGG + Chr1:13192015-13192034 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
ATGATCTTTACTTTACCACA+AGG - Chr1:13192493-13192512 None:intergenic 30.0%
ATTAGTGAAGTCACAACTAT+TGG + Chr1:13193572-13193591 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
ATTTATGAATTCATGCCCAA+TGG + Chr1:13193662-13193681 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
CTACCTAAATTATCTGCTAA+AGG + Chr1:13192590-13192609 MsG0180000917.01.T01:intron 30.0%
CTATATTCTACCATCATTGT+TGG + Chr1:13193268-13193287 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
GAAATTAAGAAAATGGCTAG+AGG + Chr1:13193431-13193450 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
TAAAGGAACAATTGGATACA+TGG + Chr1:13193934-13193953 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
TATATTCCCAGATATGAAGT+AGG + Chr1:13193230-13193249 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
TATGAAGTAGGATATGTCAT+TGG + Chr1:13193242-13193261 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
TCAACTACTTTACTCATTGA+GGG - Chr1:13194235-13194254 None:intergenic 30.0%
TCGAAATGGATAACTTATGT+TGG - Chr1:13191801-13191820 None:intergenic 30.0%
TCTCTGTATGAATATCCAAT+GGG - Chr1:13193413-13193432 None:intergenic 30.0%
TCTCTTGAAATTGTTTCATC+TGG - Chr1:13194313-13194332 None:intergenic 30.0%
TTCAACTACTTTACTCATTG+AGG - Chr1:13194236-13194255 None:intergenic 30.0%
TTCTCTGTATGAATATCCAA+TGG - Chr1:13193414-13193433 None:intergenic 30.0%
TTTAAACCTTGCTAACAAGA+CGG - Chr1:13192678-13192697 None:intergenic 30.0%
TTTCACTGCTGATATACAAA+TGG + Chr1:13193324-13193343 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
! AATGTTGTGCATTGGTATTA+AGG - Chr1:13194060-13194079 None:intergenic 30.0%
! ATTACTTGGATTTTGTATCG+AGG + Chr1:13193622-13193641 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
! ATTGTTGAAGACTTTCAAGT+TGG + Chr1:13192235-13192254 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
! GCTATAAACATCAGCTTTAT+AGG - Chr1:13193996-13194015 None:intergenic 30.0%
! GGATCATCTTTTAATCGAAA+TGG - Chr1:13191815-13191834 None:intergenic 30.0%
! TTACTTGGATTTTGTATCGA+GGG + Chr1:13193623-13193642 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTGTTGCAGATACTATCA+AGG + Chr1:13192844-13192863 MsG0180000917.01.T01:intron 30.0%
!! AAGGAAGTATTTGATCTCTT+TGG - Chr1:13192303-13192322 None:intergenic 30.0%
!! CAAGAAGTATTCTCTAATAG+AGG - Chr1:13194412-13194431 None:intergenic 30.0%
!! GGACTGGTTGAAATAATAAA+AGG + Chr1:13193188-13193207 MsG0180000917.01.T01:CDS 30.0%
AAAGATGATCCCATTCATTG+CGG + Chr1:13191824-13191843 MsG0180000917.01.T01:CDS 35.0%
ACTATCAAGGCTATTTGGAA+AGG + Chr1:13192857-13192876 MsG0180000917.01.T01:intron 35.0%
AGAGGTTTCAAAGACGAATT+GGG + Chr1:13193449-13193468 MsG0180000917.01.T01:CDS 35.0%
ATCCCAAAGATATCTGACTT+TGG + Chr1:13193860-13193879 MsG0180000917.01.T01:CDS 35.0%
ATGAATATCCAATGGGCATA+AGG - Chr1:13193406-13193425 None:intergenic 35.0%
ATTCATCAGGCGTTAGTATA+TGG + Chr1:13192331-13192350 MsG0180000917.01.T01:CDS 35.0%
CAACTACTTTACTCATTGAG+GGG - Chr1:13194234-13194253 None:intergenic 35.0%
CAGATACTATCAAGGCTATT+TGG + Chr1:13192852-13192871 MsG0180000917.01.T01:intron 35.0%
CGATATGGAAAATATCTCAG+AGG + Chr1:13194138-13194157 MsG0180000917.01.T01:CDS 35.0%
GAACTTATCAAGAGATCCAT+TGG - Chr1:13193681-13193700 None:intergenic 35.0%
GACATATCCTACTTCATATC+TGG - Chr1:13193240-13193259 None:intergenic 35.0%
GATTGTGACAAGAAATAGAG+AGG - Chr1:13191998-13192017 None:intergenic 35.0%
GGAGTAATTAAATTGGAGAC+AGG - Chr1:13192179-13192198 None:intergenic 35.0%
TACTTTACCACAAGGAATAG+TGG - Chr1:13192485-13192504 None:intergenic 35.0%
TAGAGGTTTCAAAGACGAAT+TGG + Chr1:13193448-13193467 MsG0180000917.01.T01:CDS 35.0%
TATGGAAAATATCTCAGAGG+AGG + Chr1:13194141-13194160 MsG0180000917.01.T01:CDS 35.0%
TCCAAAAGGGAAAATATACC+TGG - Chr1:13194087-13194106 None:intergenic 35.0%
TCCCAAAGATATCTGACTTT+GGG + Chr1:13193861-13193880 MsG0180000917.01.T01:CDS 35.0%
TCCTGTAATGTTGTACAAAC+AGG - Chr1:13193171-13193190 None:intergenic 35.0%
TCCTGTTTGTACAACATTAC+AGG + Chr1:13193167-13193186 MsG0180000917.01.T01:CDS 35.0%
TCCTTATGAAGTCATTCATC+AGG + Chr1:13192318-13192337 MsG0180000917.01.T01:CDS 35.0%
TTCAAAGACGAATTGGGTAA+AGG + Chr1:13193455-13193474 MsG0180000917.01.T01:CDS 35.0%
TTGAATGTGGTGCAATTACT+TGG + Chr1:13193608-13193627 MsG0180000917.01.T01:CDS 35.0%
TTTCAAGAGATGAAACAACC+AGG + Chr1:13194323-13194342 MsG0180000917.01.T01:CDS 35.0%
TTTGTACAACATTACAGGAC+TGG + Chr1:13193172-13193191 MsG0180000917.01.T01:CDS 35.0%
! AATTTTGCCACAAGATGAAG+AGG - Chr1:13191777-13191796 None:intergenic 35.0%
! ATTTTGCCACAAGATGAAGA+GGG - Chr1:13191776-13191795 None:intergenic 35.0%
!! TTGAGAGCATTGAATTAGCT+CGG - Chr1:13192434-13192453 None:intergenic 35.0%
AAAGACGAATTGGGTAAAGG+AGG + Chr1:13193458-13193477 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
AAAGATATCTGACTTTGGGC+TGG + Chr1:13193865-13193884 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
AACATCTTGATTGCCACACA+AGG - Chr1:13193521-13193540 None:intergenic 40.0%
AAGATGATCCCATTCATTGC+GGG + Chr1:13191825-13191844 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
AAGATGTTGGGTAAGGCAAA+AGG + Chr1:13193533-13193552 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
AGATGATCATGGTTGCTCTT+TGG + Chr1:13194182-13194201 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
AGCCCAAAGTCAGATATCTT+TGG - Chr1:13193866-13193885 None:intergenic 40.0%
AGTTGGTTGTCATGTGATGT+TGG + Chr1:13192252-13192271 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
ATTTCAATTGGAGTAGCTCG+AGG + Chr1:13193752-13193771 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
CAAAACAACCTTATGCCCAT+TGG + Chr1:13193395-13193414 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
CAACAATTTCACAATCCGAG+TGG + Chr1:13191934-13191953 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
CAATTAGATTGCTGAACACC+AGG - Chr1:13191965-13191984 None:intergenic 40.0%
CATTAGTTCCAGCAATTCGA+GGG + Chr1:13194372-13194391 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
CTCGTCAAGCAAGATATTGT+GGG - Chr1:13193834-13193853 None:intergenic 40.0%
CTGATACCTTGTTGAAGTAG+AGG - Chr1:13191719-13191738 None:intergenic 40.0%
GCCCAAAGTCAGATATCTTT+GGG - Chr1:13193865-13193884 None:intergenic 40.0%
GCCTGATGAATGACTTCATA+AGG - Chr1:13192322-13192341 None:intergenic 40.0%
GGACATGGATCAAAATTGCA+CGG + Chr1:13192036-13192055 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
GTGGGTAAGAGTGATATTAC+TGG + Chr1:13191676-13191695 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
GTTACAATGCTATTCTGTGC+TGG - Chr1:13193902-13193921 None:intergenic 40.0%
GTTTCATCTGGATACAAGGT+GGG - Chr1:13194301-13194320 None:intergenic 40.0%
TAGCATTGTAACAATGACCG+CGG + Chr1:13193910-13193929 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
TAGGATTGTTGGTCACTTCA+TGG - Chr1:13192138-13192157 None:intergenic 40.0%
TCATTAGTTCCAGCAATTCG+AGG + Chr1:13194371-13194390 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
TCGTCAAGCAAGATATTGTG+GGG - Chr1:13193833-13193852 None:intergenic 40.0%
TCTCGTCAAGCAAGATATTG+TGG - Chr1:13193835-13193854 None:intergenic 40.0%
TCTTCATTTCACATCCATGG+TGG - Chr1:13193790-13193809 None:intergenic 40.0%
TCTTCCATCACAATGCAGTA+GGG - Chr1:13192457-13192476 None:intergenic 40.0%
TGAAGTCACTGGATGTTGTT+TGG - Chr1:13194354-13194373 None:intergenic 40.0%
TGGGTAAGGCAAAAGGTAAT+GGG + Chr1:13193540-13193559 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
TGTGTGGCAATCAAGATGTT+GGG + Chr1:13193521-13193540 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
TGTTTCATCTGGATACAAGG+TGG - Chr1:13194302-13194321 None:intergenic 40.0%
TTCTTCCATCACAATGCAGT+AGG - Chr1:13192458-13192477 None:intergenic 40.0%
TTGGGTAAGGCAAAAGGTAA+TGG + Chr1:13193539-13193558 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
TTGTGTGGCAATCAAGATGT+TGG + Chr1:13193520-13193539 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
TTTACGCCTCTACTTCAACA+AGG + Chr1:13191710-13191729 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
TTTCTGTGATATCGAGGACA+TGG + Chr1:13192021-13192040 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
! AATGAACCGTCTTGTTAGCA+AGG + Chr1:13192669-13192688 MsG0180000917.01.T01:intron 40.0%
! GCCAGGTATATTTTCCCTTT+TGG + Chr1:13194083-13194102 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
! GTTGAAGTAGAGGCGTAAAT+TGG - Chr1:13191709-13191728 None:intergenic 40.0%
! TGTTGGTTACTCCAACTTCT+TGG + Chr1:13192269-13192288 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
!!! TAGCTTTGGGATGCTTTTGA+TGG + Chr1:13194012-13194031 MsG0180000917.01.T01:CDS 40.0%
AGATGATCCCATTCATTGCG+GGG + Chr1:13191826-13191845 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
AGTCTAGCAGCCAACAATGA+TGG - Chr1:13193281-13193300 None:intergenic 45.0%
CAATGCACAACATTCAAGCC+AGG + Chr1:13194066-13194085 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
GAACAGACCACTATTCCTTG+TGG + Chr1:13192475-13192494 MsG0180000917.01.T01:intron 45.0%
GAATTGGGTAAAGGAGGCTT+TGG + Chr1:13193464-13193483 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
GCCAAGCGACATATTGATGA+TGG + Chr1:13192070-13192089 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
GCCATCATCAATATGTCGCT+TGG - Chr1:13192074-13192093 None:intergenic 45.0%
GCTGGAACTAATGAAGTCAC+TGG - Chr1:13194365-13194384 None:intergenic 45.0%
GGAATTGCTTATCTCCACCA+TGG + Chr1:13193773-13193792 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
GGCAATCAAGATGTTGGGTA+AGG + Chr1:13193526-13193545 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
GGTTACTCCAACTTCTTGGT+CGG + Chr1:13192273-13192292 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
GTTACTCCAACTTCTTGGTC+GGG + Chr1:13192274-13192293 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
TCAACCCTACTGCATTGTGA+TGG + Chr1:13192450-13192469 MsG0180000917.01.T01:intron 45.0%
TCAAGGGAAACCTACGTAGT+GGG + Chr1:13193495-13193514 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
TCCAATTGTTCCTTTAGCCG+CGG - Chr1:13193930-13193949 None:intergenic 45.0%
TCTTGTCCCTCTTCATCTTG+TGG + Chr1:13191767-13191786 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
TGGCTGCTAGACTTCTGTTT+GGG + Chr1:13193288-13193307 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
TTCAAGGGAAACCTACGTAG+TGG + Chr1:13193494-13193513 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
TTGGCTGCTAGACTTCTGTT+TGG + Chr1:13193287-13193306 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
! ATGCTTTTGATGGAGATGGC+AGG + Chr1:13194022-13194041 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
! CATCAATATGTCGCTTGGCT+TGG - Chr1:13192069-13192088 None:intergenic 45.0%
! CATGTTTTCCCTCGAATTGC+TGG - Chr1:13194383-13194402 None:intergenic 45.0%
! CTGGCTTGAATGTTGTGCAT+TGG - Chr1:13194068-13194087 None:intergenic 45.0%
! CTTTTGTCCCCGCAATGAAT+GGG - Chr1:13191836-13191855 None:intergenic 45.0%
! TGGGATGCTTTTGATGGAGA+TGG + Chr1:13194018-13194037 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
!! AGAGCATTGAATTAGCTCGG+TGG - Chr1:13192431-13192450 None:intergenic 45.0%
!! AGGCTTTGGAACTGTGTTCA+AGG + Chr1:13193478-13193497 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
!! ATATGTCGCTTGGCTTGGTA+TGG - Chr1:13192064-13192083 None:intergenic 45.0%
!! GGCTTTGGAACTGTGTTCAA+GGG + Chr1:13193479-13193498 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
!! TAAGGCAAAAGGTAATGGGC+AGG + Chr1:13193544-13193563 MsG0180000917.01.T01:CDS 45.0%
ACAATCCGAGTGGTTGATCC+TGG + Chr1:13191944-13191963 MsG0180000917.01.T01:CDS 50.0%
ACCGCGGCTAAAGGAACAAT+TGG + Chr1:13193926-13193945 MsG0180000917.01.T01:CDS 50.0%
CCATTCATTGCGGGGACAAA+AGG + Chr1:13191834-13191853 MsG0180000917.01.T01:CDS 50.0%
GAACACCAGGATCAACCACT+CGG - Chr1:13191952-13191971 None:intergenic 50.0%
GTAACAATGACCGCGGCTAA+AGG + Chr1:13193917-13193936 MsG0180000917.01.T01:CDS 50.0%
TGGAAACCCGACCAAGAAGT+TGG - Chr1:13192283-13192302 None:intergenic 50.0%
! CCTTTTGTCCCCGCAATGAA+TGG - Chr1:13191837-13191856 None:intergenic 50.0%
! GGATGTTGTTTGGTCTGACC+TGG - Chr1:13194344-13194363 None:intergenic 50.0%
!! TAGCTCGGTGGAAGTGTTGA+AGG - Chr1:13192419-13192438 None:intergenic 50.0%
CTCATTGAGGGGCGATCACT+CGG - Chr1:13194223-13194242 None:intergenic 55.0%
! TCTGGATACAAGGTGGGCTC+TGG - Chr1:13194295-13194314 None:intergenic 55.0%
!! GGTGGAAGTGTTGAAGGAGC+AGG - Chr1:13192413-13192432 None:intergenic 55.0%
CCACACAAGGCCCACTACGT+AGG - Chr1:13193508-13193527 None:intergenic 60.0%
! GGATACAAGGTGGGCTCTGG+AGG - Chr1:13194292-13194311 None:intergenic 60.0%
!! CCTACGTAGTGGGCCTTGTG+TGG + Chr1:13193505-13193524 MsG0180000917.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 13191671 13194432 13191671 ID=MsG0180000917.01;Name=MsG0180000917.01
Chr1 mRNA 13191671 13194432 13191671 ID=MsG0180000917.01.T01;Parent=MsG0180000917.01;Name=MsG0180000917.01.T01;_AED=0.25;_eAED=0.25;_QI=0|0|0|1|0|0|2|0|670
Chr1 exon 13191671 13192380 13191671 ID=MsG0180000917.01.T01:exon:9280;Parent=MsG0180000917.01.T01
Chr1 exon 13193130 13194432 13193130 ID=MsG0180000917.01.T01:exon:9281;Parent=MsG0180000917.01.T01
Chr1 CDS 13191671 13192380 13191671 ID=MsG0180000917.01.T01:cds;Parent=MsG0180000917.01.T01
Chr1 CDS 13193130 13194432 13193130 ID=MsG0180000917.01.T01:cds;Parent=MsG0180000917.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180000917.01.T01

ATGTGGTGGGTAAGAGTGATATTACTGGTCTTGTTCCAATTTACGCCTCTACTTCAACAAGGTATCAGCACTAATCTTTCTATTGAACAAGAACATTCTTGTCCCTCTTCATCTTGTGGCAAAATTTCCAACATAAGTTATCCATTTCGATTAAAAGATGATCCCATTCATTGCGGGGACAAAAGGTATGAGCTATCTTGTGAAAATAATGTAACAGCTTTAAATTTGTACTCGGACAAATATTATGTGCAATCTATCAACTACAACAATTTCACAATCCGAGTGGTTGATCCTGGTGTTCAGCAATCTAATTGCTCTTCACTTCCTCTCTATTTCTTGTCACAATCTAATTTCTGTGATATCGAGGACATGGATCAAAATTGCACGGATCCATACCAAGCCAAGCGACATATTGATGATGGCTATGCTCTTCTTTTTAAGCATATAGTATACTTGAATTGTAGCCATGAAGTGACCAACAATCCTAAATATGTGAATACTTCTTCCTGTCTCCAATTTAATTACTCCAAAAATAATTATATTTATGCTATGACTGGTGATTTAATTGTTGAAGACTTTCAAGTTGGTTGTCATGTGATGTTGGTTACTCCAACTTCTTGGTCGGGTTTCCAAAGAGATCAAATACTTCCTTATGAAGTCATTCATCAGGCGTTAGTATATGGATTTGAGATTTCATGGTTGCGTCTTAAATGCCAAAATTTTGTTGTTATCTGTTATCAATATTTATCCTGTTTGTACAACATTACAGGACTGGTTGAAATAATAAAAGGACCAAATTCAGTAAATGATTATATTCCCAGATATGAAGTAGGATATGTCATTGGACACTATATTCTACCATCATTGTTGGCTGCTAGACTTCTGTTTGGGATAATATTCTTCATTTCACTGCTGATATACAAATGGAGAAAAAGACATTGGTCAATGTATGAATGCGTTGAAATATATCTACAACAAAACAACCTTATGCCCATTGGATATTCATACAGAGAAATTAAGAAAATGGCTAGAGGTTTCAAAGACGAATTGGGTAAAGGAGGCTTTGGAACTGTGTTCAAGGGAAACCTACGTAGTGGGCCTTGTGTGGCAATCAAGATGTTGGGTAAGGCAAAAGGTAATGGGCAGGACTTTATTAGTGAAGTCACAACTATTGGAAGAATACATCATTTGAATGTGGTGCAATTACTTGGATTTTGTATCGAGGGATCGAAACGCGCTCTTATTTATGAATTCATGCCCAATGGATCTCTTGATAAGTTCATTTTCTCTAAAGAAGCGAGTAAAAAATTAAGCTGCAGCCAAATACATGATATTTCAATTGGAGTAGCTCGAGGAATTGCTTATCTCCACCATGGATGTGAAATGAAGATTTTGCATTTTGACATCAAGCCCCACAATATCTTGCTTGACGAGAACTTTATCCCAAAGATATCTGACTTTGGGCTGGCAAAGCTATATCCAGCACAGAATAGCATTGTAACAATGACCGCGGCTAAAGGAACAATTGGATACATGGCACCAGAATTGTTCTACAAAAATATTGGGGCAGTGTCCTATAAAGCTGATGTTTATAGCTTTGGGATGCTTTTGATGGAGATGGCAGGTAAGAGAAAAAACCTTAATACCAATGCACAACATTCAAGCCAGGTATATTTTCCCTTTTGGATTTATGATCAACTTAGAAAAGAGGAAGAAATCGATATGGAAAATATCTCAGAGGAGGATATGAAAATTGTAAAGAAGATGATCATGGTTGCTCTTTGGTGTATACAACTGAAGCCGAGTGATCGCCCCTCAATGAGTAAAGTAGTTGAAATGCTTGAAGGAGATATTGAAAGCATAGAAATGCCTCCAGAGCCCACCTTGTATCCAGATGAAACAATTTCAAGAGATGAAACAACCAGGTCAGACCAAACAACATCCAGTGACTTCATTAGTTCCAGCAATTCGAGGGAAAACATGACTAATCCTCTATTAGAGAATACTTCTTGA
Protein sequence

>MsG0180000917.01.T01

MWWVRVILLVLFQFTPLLQQGISTNLSIEQEHSCPSSSCGKISNISYPFRLKDDPIHCGDKRYELSCENNVTALNLYSDKYYVQSINYNNFTIRVVDPGVQQSNCSSLPLYFLSQSNFCDIEDMDQNCTDPYQAKRHIDDGYALLFKHIVYLNCSHEVTNNPKYVNTSSCLQFNYSKNNYIYAMTGDLIVEDFQVGCHVMLVTPTSWSGFQRDQILPYEVIHQALVYGFEISWLRLKCQNFVVICYQYLSCLYNITGLVEIIKGPNSVNDYIPRYEVGYVIGHYILPSLLAARLLFGIIFFISLLIYKWRKRHWSMYECVEIYLQQNNLMPIGYSYREIKKMARGFKDELGKGGFGTVFKGNLRSGPCVAIKMLGKAKGNGQDFISEVTTIGRIHHLNVVQLLGFCIEGSKRALIYEFMPNGSLDKFIFSKEASKKLSCSQIHDISIGVARGIAYLHHGCEMKILHFDIKPHNILLDENFIPKISDFGLAKLYPAQNSIVTMTAAKGTIGYMAPELFYKNIGAVSYKADVYSFGMLLMEMAGKRKNLNTNAQHSSQVYFPFWIYDQLRKEEEIDMENISEEDMKIVKKMIMVALWCIQLKPSDRPSMSKVVEMLEGDIESIEMPPEPTLYPDETISRDETTRSDQTTSSDFISSSNSRENMTNPLLENTS*