AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180001475.01

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MsG0180001475.01.T01 AT1G62930 22.133 375 284 2 160 534 119 485 4.47e-27 116
MsG0180001475.01.T01 AT1G62930 24.872 390 226 14 73 427 265 622 1.50e-16 83.6
MsG0180001475.01.T01 AT1G62930 21.843 293 192 3 284 540 60 351 1.48e-14 77.0
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MsG0180001475.01.T01 AT3G09060 22.684 529 375 9 41 546 119 636 2.04e-34 138
MsG0180001475.01.T01 AT3G09060 21.830 481 308 8 64 542 8 422 5.55e-23 103
MsG0180001475.01.T01 AT4G19440 24.454 458 322 5 99 540 340 789 3.05e-34 138
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MsG0180001475.01.T01 AT4G19440 24.454 458 322 5 99 540 340 789 3.05e-34 138
MsG0180001475.01.T01 AT4G19440 25.100 498 345 9 64 546 101 585 1.94e-32 133
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MsG0180001475.01.T01 AT1G63080 23.000 400 298 3 145 542 52 443 2.37e-32 132
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MsG0180001475.01.T01 AT1G62720 25.634 355 249 5 194 546 72 413 3.06e-30 124
MsG0180001475.01.T01 AT1G62720 22.222 432 302 10 66 477 67 484 1.08e-22 101
MsG0180001475.01.T01 AT1G62914 24.103 390 286 3 156 543 76 457 3.54e-31 127
MsG0180001475.01.T01 AT1G62914 20.106 378 292 3 153 528 143 512 1.24e-20 95.9
MsG0180001475.01.T01 AT1G62914 21.829 339 237 5 104 424 185 513 3.51e-18 88.2
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MsG0180001475.01.T01 AT5G61400 22.581 248 192 0 295 542 190 437 6.22e-20 94.0
MsG0180001475.01.T01 AT5G61400 25.620 242 138 4 341 545 134 370 4.70e-16 82.0
MsG0180001475.01.T01 AT5G61400 20.500 400 286 6 102 481 234 621 8.67e-15 77.8
MsG0180001475.01.T01 AT5G61400 20.159 377 293 2 162 538 275 643 1.99e-12 70.5
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MsG0180001475.01.T01 AT3G04760 23.645 406 299 4 145 548 111 507 7.40e-27 115
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MsG0180001475.01.T01 AT2G32630 27.228 202 147 0 347 548 162 363 2.53e-17 85.9
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MsG0180001475.01.T01 AT4G20090 22.835 508 327 8 76 544 51 532 9.31e-31 127
MsG0180001475.01.T01 AT4G20090 20.561 535 289 11 85 498 131 650 1.52e-18 89.7
MsG0180001475.01.T01 AT1G64580 24.299 428 291 4 144 540 65 490 1.05e-30 126
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MsG0180001475.01.T01 AT5G12100 25.344 509 326 12 62 540 71 555 1.11e-29 124
MsG0180001475.01.T01 AT5G12100 23.392 342 242 6 186 523 454 779 2.92e-16 82.8
MsG0180001475.01.T01 AT5G12100 23.926 163 124 0 386 548 121 283 2.68e-11 67.0
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MsG0180001475.01.T01 AT1G63150 22.750 400 299 3 145 542 70 461 1.79e-30 126
MsG0180001475.01.T01 AT1G63150 23.176 466 321 7 98 542 149 598 6.74e-28 118
MsG0180001475.01.T01 AT1G63150 22.022 445 316 6 94 536 110 525 1.13e-24 108
MsG0180001475.01.T01 AT1G63150 19.521 292 200 1 284 540 63 354 1.11e-14 77.4
MsG0180001475.01.T01 AT1G03560 20.825 509 374 6 36 543 87 567 2.80e-30 125
MsG0180001475.01.T01 AT1G03560 27.572 243 174 2 303 544 256 497 6.57e-23 103
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MsG0180001475.01.T01 AT1G30290 21.610 472 341 5 71 540 176 620 4.30e-30 125
MsG0180001475.01.T01 AT1G30290 23.077 429 295 9 104 528 349 746 2.86e-24 107
MsG0180001475.01.T01 AT1G30290 23.864 440 299 9 99 514 376 803 9.88e-22 100
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MsG0180001475.01.T01 AT5G41170 21.390 374 286 2 172 545 53 418 5.33e-30 124
MsG0180001475.01.T01 AT5G41170 24.524 420 269 5 160 540 111 521 3.87e-29 121
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MsG0180001475.01.T01 AT1G13630 25.938 320 228 4 224 542 297 608 1.14e-29 124
MsG0180001475.01.T01 AT1G13630 21.762 386 251 5 158 542 168 503 8.62e-19 90.9
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MsG0180001475.01.T01 AT1G13630 22.059 272 201 3 271 542 137 397 5.76e-11 65.9
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MsG0180001475.01.T01 AT1G64583 23.636 385 240 6 170 544 51 391 5.63e-24 105
MsG0180001475.01.T01 AT1G64583 22.551 439 273 9 88 506 67 458 1.85e-17 85.9
MsG0180001475.01.T01 AT1G13630 21.512 516 338 8 88 542 104 613 7.59e-30 125
MsG0180001475.01.T01 AT1G13630 23.909 527 342 12 42 521 160 674 1.16e-29 124
MsG0180001475.01.T01 AT1G13630 17.980 406 282 3 161 521 415 814 6.19e-14 75.5
MsG0180001475.01.T01 AT1G64583 23.256 387 289 2 161 547 111 489 7.74e-30 123
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MsG0180001475.01.T01 AT1G13630 24.017 483 322 9 75 521 188 661 5.69e-29 122
MsG0180001475.01.T01 AT1G13630 21.762 386 251 5 158 542 160 495 8.79e-19 90.9
MsG0180001475.01.T01 AT1G13630 17.980 406 282 3 161 521 402 801 6.09e-14 75.5
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MsG0180001475.01.T01 AT5G38730 19.881 337 255 5 153 485 233 558 3.28e-13 72.8
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MsG0180001475.01.T01 AT5G16640 24.282 383 259 4 160 513 120 500 8.87e-28 117
MsG0180001475.01.T01 AT5G16640 21.944 319 218 4 155 444 185 501 8.68e-21 96.3
MsG0180001475.01.T01 AT5G16640 23.077 234 180 0 308 541 120 353 8.96e-19 89.7
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MsG0180001475.01.T01 AT1G63400 23.756 442 297 7 98 515 151 576 2.70e-29 122
MsG0180001475.01.T01 AT1G63400 22.269 476 308 7 100 540 118 566 3.76e-29 122
MsG0180001475.01.T01 AT1G63400 21.739 391 258 5 101 446 190 577 6.74e-21 97.1
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MsG0180001475.01.T01 AT1G62680 24.251 334 243 3 144 475 176 501 8.11e-28 117
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MsG0180001475.01.T01 AT1G62680 23.380 355 260 3 194 546 88 432 1.88e-29 122
MsG0180001475.01.T01 AT1G62680 24.251 334 243 3 144 475 176 501 8.11e-28 117
MsG0180001475.01.T01 AT1G62680 22.973 370 277 2 159 528 123 484 3.17e-27 115
MsG0180001475.01.T01 AT1G62680 21.320 394 300 3 145 536 72 457 1.85e-22 101
MsG0180001475.01.T01 AT1G13630 25.938 320 228 4 224 542 255 566 2.51e-29 123
MsG0180001475.01.T01 AT1G13630 24.017 483 322 9 75 521 154 627 5.50e-29 122
MsG0180001475.01.T01 AT1G13630 21.774 372 240 5 158 528 126 447 1.27e-18 90.1
MsG0180001475.01.T01 AT1G13630 18.622 392 264 4 161 540 368 716 1.10e-11 68.2
MsG0180001475.01.T01 AT5G41170 24.524 420 269 5 160 540 11 421 3.34e-29 120
MsG0180001475.01.T01 AT5G41170 23.860 285 211 1 261 545 40 318 3.54e-28 117
MsG0180001475.01.T01 AT5G41170 24.901 253 190 0 290 542 28 280 4.72e-24 105
MsG0180001475.01.T01 AT5G41170 22.917 384 259 9 98 457 38 408 1.13e-20 95.1
MsG0180001475.01.T01 AT5G41170 25.166 151 113 0 395 545 28 178 4.90e-12 68.6
MsG0180001475.01.T01 AT5G41170 23.153 203 156 0 334 536 2 204 5.12e-12 68.6
MsG0180001475.01.T01 AT3G16710 23.446 354 259 3 194 545 86 429 4.32e-29 120
MsG0180001475.01.T01 AT3G16710 25.080 311 225 2 184 494 146 448 1.06e-23 104
MsG0180001475.01.T01 AT4G28010 28.000 250 180 0 287 536 160 409 6.44e-29 122
MsG0180001475.01.T01 AT4G28010 21.041 442 302 6 101 496 211 651 1.26e-23 105
MsG0180001475.01.T01 AT4G28010 24.242 396 289 4 144 536 59 446 3.01e-22 101
MsG0180001475.01.T01 AT4G28010 24.303 251 190 0 290 540 93 343 1.85e-17 86.3
MsG0180001475.01.T01 AT4G28010 22.798 386 251 6 193 540 179 555 3.74e-17 85.5
MsG0180001475.01.T01 AT4G28010 19.948 381 289 5 161 536 217 586 3.19e-15 79.3
MsG0180001475.01.T01 AT5G57250 26.498 317 220 3 224 540 205 508 8.28e-29 122
MsG0180001475.01.T01 AT5G57250 20.312 448 279 5 162 540 418 856 5.42e-17 85.1
MsG0180001475.01.T01 AT5G57250 22.689 238 179 2 300 537 203 435 1.01e-16 84.3
MsG0180001475.01.T01 AT5G57250 25.692 253 150 4 334 548 129 381 1.65e-15 80.5
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MsG0180001475.01.T01 AT4G26800 23.077 325 233 3 224 542 8 321 3.35e-18 87.8
MsG0180001475.01.T01 AT3G49730 21.429 476 262 11 60 528 91 461 1.47e-22 102
MsG0180001475.01.T01 AT3G49730 21.751 354 247 8 105 438 170 513 6.98e-13 71.6
MsG0180001475.01.T01 AT3G49730 22.388 201 154 2 341 540 169 368 3.59e-12 69.7
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MsG0180001475.01.T01 AT2G17525 21.119 554 324 13 82 541 56 590 4.32e-18 88.2
MsG0180001475.01.T01 AT2G17525 19.954 431 263 6 161 521 187 605 7.43e-17 84.3
MsG0180001475.01.T01 AT1G02060 22.222 486 325 15 61 528 63 513 2.19e-22 102
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MsG0180001475.01.T01 AT1G74750 22.689 238 184 0 285 522 410 647 2.09e-17 86.3
MsG0180001475.01.T01 AT1G74750 22.222 270 207 1 279 548 372 638 1.45e-14 77.4
MsG0180001475.01.T01 AT1G74750 23.464 179 137 0 368 546 353 531 3.39e-11 66.6
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MsG0180001475.01.T01 AT3G04130 24.017 229 172 2 318 545 169 396 9.56e-20 92.8
MsG0180001475.01.T01 AT3G04130 20.726 468 304 8 81 545 100 503 5.75e-13 71.6
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MsG0180001475.01.T01 AT1G13800 20.935 492 327 9 89 546 204 667 5.15e-17 85.1
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MsG0180001475.01.T01 AT2G26790 23.571 280 179 3 293 540 173 449 4.12e-12 69.7
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MsG0180001475.01.T01 AT2G41720 21.013 395 283 2 175 540 232 626 4.37e-14 75.9
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MsG0180001475.01.T01 AT5G27270 21.538 455 335 7 94 540 365 805 5.73e-16 82.0
MsG0180001475.01.T01 AT3G49240 22.794 408 286 10 149 540 121 515 1.79e-15 80.1
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MsG0180001475.01.T01 AT1G53330 21.875 256 197 3 278 531 161 415 2.86e-12 69.3
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MsG0180001475.01.T01 AT1G53330 23.839 323 225 6 182 498 40 347 1.44e-14 75.9
MsG0180001475.01.T01 AT1G53330 21.875 256 197 3 278 531 57 311 8.35e-12 67.4
MsG0180001475.01.T01 AT1G63630 25.828 151 103 1 394 544 4 145 2.39e-14 71.2
MsG0180001475.01.T01 AT1G63630 22.283 184 100 2 217 400 1 141 1.37e-11 63.2
MsG0180001475.01.T01 AT1G63320 26.923 182 107 2 361 542 3 158 2.98e-14 72.0
MsG0180001475.01.T01 AT1G63320 24.171 211 133 2 324 534 1 184 2.97e-12 66.2
MsG0180001475.01.T01 AT1G63320 20.994 181 117 1 291 471 3 157 7.27e-12 65.1
MsG0180001475.01.T01 AT1G61870 25.114 219 163 1 319 536 166 384 3.43e-14 75.1
MsG0180001475.01.T01 AT1G77405 25.571 219 146 4 317 518 175 393 8.07e-14 74.3
MsG0180001475.01.T01 AT1G77405 23.824 340 221 10 225 535 126 456 8.43e-13 71.2
MsG0180001475.01.T01 AT1G77405 23.423 222 164 3 224 439 198 419 5.71e-11 65.5
MsG0180001475.01.T01 AT2G35130 20.104 383 262 6 194 540 158 532 8.43e-14 74.7
MsG0180001475.01.T01 AT1G80150 25.926 216 159 1 319 533 156 371 8.75e-14 73.9
MsG0180001475.01.T01 AT1G20230 22.671 322 223 7 224 540 79 379 9.91e-14 74.7
MsG0180001475.01.T01 AT4G36680 19.377 289 221 5 157 443 103 381 1.04e-13 73.6
MsG0180001475.01.T01 AT5G39980 21.756 262 205 0 281 542 202 463 1.12e-13 74.3
MsG0180001475.01.T01 AT5G39980 20.344 349 264 4 183 528 147 484 4.89e-13 72.4
MsG0180001475.01.T01 AT5G39980 20.000 355 264 5 160 510 334 672 1.54e-11 67.4
MsG0180001475.01.T01 AT3G13150 22.414 232 179 1 306 536 159 390 1.17e-13 73.9
MsG0180001475.01.T01 AT3G13150 23.810 189 143 1 353 540 136 324 2.11e-12 70.1
MsG0180001475.01.T01 AT5G46580 20.408 245 194 1 303 546 220 464 3.21e-13 73.2
MsG0180001475.01.T01 AT1G16830 20.705 227 173 2 299 522 138 360 3.40e-13 72.8
MsG0180001475.01.T01 AT1G16830 20.632 475 314 12 78 536 49 476 2.44e-12 70.1
MsG0180001475.01.T01 AT1G16830 22.857 280 201 6 162 439 288 554 5.08e-12 68.9
MsG0180001475.01.T01 AT3G14580 19.023 389 253 5 71 458 64 391 3.79e-13 72.0
MsG0180001475.01.T01 AT3G14580 22.043 186 145 0 303 488 201 386 1.74e-12 69.7
MsG0180001475.01.T01 AT3G14580 21.930 228 178 0 304 531 167 394 4.52e-11 65.5
MsG0180001475.01.T01 AT1G55890 19.741 309 201 3 162 466 115 380 3.96e-13 71.6
MsG0180001475.01.T01 AT2G28050 20.899 378 262 6 98 442 80 453 1.13e-12 70.9
MsG0180001475.01.T01 AT5G03560 26.490 151 107 2 391 540 182 329 1.56e-12 69.7
MsG0180001475.01.T01 AT5G03560 26.490 151 107 2 391 540 182 329 1.56e-12 69.7
MsG0180001475.01.T01 AT5G03560 26.490 151 107 2 391 540 182 329 1.56e-12 69.7
MsG0180001475.01.T01 AT5G25630 19.690 452 290 10 100 526 43 446 2.15e-12 70.1
MsG0180001475.01.T01 AT5G25630 20.833 288 217 4 258 540 75 356 3.96e-12 69.3
MsG0180001475.01.T01 AT5G25630 21.231 325 200 9 153 435 185 495 5.92e-11 65.5
MsG0180001475.01.T01 AT5G25630 20.833 288 217 4 258 540 24 305 2.24e-12 70.1
MsG0180001475.01.T01 AT5G25630 20.690 377 242 8 159 526 67 395 5.52e-12 68.6
MsG0180001475.01.T01 AT5G25630 21.231 325 200 9 153 435 134 444 5.10e-11 65.5
MsG0180001475.01.T01 AT5G52850 23.454 388 227 14 195 542 364 721 2.41e-12 70.5
MsG0180001475.01.T01 AT5G61370 22.634 243 173 3 291 522 125 363 3.38e-12 69.3
MsG0180001475.01.T01 AT1G80880 23.256 215 161 1 306 520 296 506 3.95e-12 69.3
MsG0180001475.01.T01 AT1G80880 23.256 215 161 1 306 520 296 506 3.95e-12 69.3
MsG0180001475.01.T01 AT1G80880 23.256 215 161 1 306 520 296 506 3.95e-12 69.3
MsG0180001475.01.T01 AT4G30825 23.232 297 185 4 283 540 572 864 6.89e-12 68.9
MsG0180001475.01.T01 AT5G14080 22.264 265 181 5 240 503 322 562 7.82e-12 68.6
MsG0180001475.01.T01 AT5G14080 21.830 481 340 7 64 540 45 493 3.12e-11 66.6
MsG0180001475.01.T01 AT1G05750 24.079 353 242 9 196 546 114 442 8.75e-12 68.2
MsG0180001475.01.T01 AT1G05750 24.079 353 242 9 196 546 114 442 8.75e-12 68.2
MsG0180001475.01.T01 AT4G21880 25.664 226 156 6 175 400 412 625 1.08e-11 68.2
MsG0180001475.01.T01 AT2G35130 19.689 386 263 7 194 540 180 557 1.17e-11 67.8
MsG0180001475.01.T01 AT2G35130 21.533 274 205 3 255 524 169 436 6.49e-11 65.5
MsG0180001475.01.T01 AT2G35130 19.689 386 263 7 194 540 158 535 1.22e-11 67.8
MsG0180001475.01.T01 AT4G21880 25.664 226 156 6 175 400 368 581 1.38e-11 67.8
MsG0180001475.01.T01 AT1G19520 20.325 246 195 1 291 535 406 651 1.58e-11 67.8
MsG0180001475.01.T01 AT3G53170 19.200 375 274 6 83 455 125 472 1.92e-11 67.0
MsG0180001475.01.T01 AT3G53170 19.200 375 274 6 83 455 125 472 1.92e-11 67.0
MsG0180001475.01.T01 AT3G53170 19.200 375 274 6 83 455 75 422 1.99e-11 66.6
MsG0180001475.01.T01 AT1G08070 19.894 377 274 7 155 528 133 484 2.32e-11 67.0
MsG0180001475.01.T01 AT3G48250 23.902 205 155 1 319 522 350 554 2.72e-11 66.6
MsG0180001475.01.T01 AT1G53600 23.364 321 205 11 225 536 238 526 3.36e-11 66.6
MsG0180001475.01.T01 AT1G53600 23.364 321 205 11 225 536 238 526 3.36e-11 66.6
MsG0180001475.01.T01 AT2G35030 20.000 300 204 9 225 523 76 340 3.44e-11 66.2
MsG0180001475.01.T01 AT2G01390 22.685 216 167 0 333 548 116 331 3.65e-11 66.2
MsG0180001475.01.T01 AT1G10910 22.137 262 197 4 283 540 180 438 3.76e-11 66.2
MsG0180001475.01.T01 AT1G10910 22.137 262 197 4 283 540 180 438 3.89e-11 66.2
MsG0180001475.01.T01 AT5G36300 24.638 207 143 3 328 521 104 310 3.92e-11 65.1
MsG0180001475.01.T01 AT4G16835 20.084 239 174 5 303 540 154 376 3.93e-11 66.2
MsG0180001475.01.T01 AT5G13770 23.607 305 196 5 272 539 214 518 4.04e-11 66.2
MsG0180001475.01.T01 AT3G15200 25.701 214 154 3 303 514 281 491 4.21e-11 65.9
MsG0180001475.01.T01 AT5G27270 23.390 295 212 4 258 548 183 467 5.44e-11 65.9
MsG0180001475.01.T01 AT2G27800 24.000 225 166 3 232 452 213 436 5.86e-11 65.1
MsG0180001475.01.T01 AT5G06540 19.685 381 247 7 159 538 120 442 6.39e-11 65.5
MsG0180001475.01.T01 AT4G01030 22.603 292 185 6 276 536 102 383 7.16e-11 65.5
MsG0180001475.01.T01 AT5G27270 23.390 295 212 4 258 548 183 467 7.20e-11 65.5
MsG0180001475.01.T01 AT1G08070 19.894 377 274 7 155 528 29 380 7.27e-11 65.5

Find 108 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 121 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATCCTAATGTTGTTACTTTC+AGG 0.166187 1:+21953527 MsG0180001475.01.T01:CDS
ATGATGCAGAGAAGTATTTA+AGG 0.182900 1:+21954346 MsG0180001475.01.T01:CDS
GAAACTGTTTGGGAGGTTTA+TGG 0.189347 1:+21953481 MsG0180001475.01.T01:CDS
GGGAAAGGGTTAAGGGTTTA+TGG 0.203088 1:+21953958 MsG0180001475.01.T01:CDS
ATTCGTTATATAGATGAATT+AGG 0.239463 1:+21953394 MsG0180001475.01.T01:CDS
TAAAGTTAGGTTAGGAGATT+TGG 0.255209 1:+21953798 MsG0180001475.01.T01:CDS
TGCGAGAAAGGACGAGGTTC+AGG 0.297248 1:+21954221 MsG0180001475.01.T01:CDS
ACTTATTCTCATTTGATAGA+TGG 0.297297 1:+21954195 MsG0180001475.01.T01:CDS
CATTCAGAACAAAACAAAAC+TGG 0.301481 1:+21952993 MsG0180001475.01.T01:CDS
TTGTTGTTCATCGTTTAATA+AGG 0.323339 1:+21954080 MsG0180001475.01.T01:CDS
TTGACTGTGTTGTTAGATAA+AGG 0.327261 1:+21954153 MsG0180001475.01.T01:CDS
ATTGGATATTGAAGTGATTA+TGG 0.328047 1:-21952969 None:intergenic
TATAGTTGGATGTGCGGATT+CGG 0.345110 1:+21953999 MsG0180001475.01.T01:CDS
ATAGTTGGATGTGCGGATTC+GGG 0.346275 1:+21954000 MsG0180001475.01.T01:CDS
AAATGGAAGGGAAAGGGTTA+AGG 0.355266 1:+21953950 MsG0180001475.01.T01:CDS
TAATCGATTTGAAACTGTTT+GGG 0.355484 1:+21953471 MsG0180001475.01.T01:CDS
GTAATCGATTTGAAACTGTT+TGG 0.375661 1:+21953470 MsG0180001475.01.T01:CDS
TGATTGTTCATGTTAAAGTT+AGG 0.376391 1:+21953785 MsG0180001475.01.T01:CDS
ATTGATGCTCTTTGTAAAGA+AGG 0.386788 1:+21953556 MsG0180001475.01.T01:CDS
AATGGAAGGGAAAGGGTTAA+GGG 0.416180 1:+21953951 MsG0180001475.01.T01:CDS
GAGTAAGAGATTGATGATAA+TGG 0.418376 1:-21953176 None:intergenic
GCGGAGAAGCTTTGTGAGAA+TGG 0.418578 1:+21954105 MsG0180001475.01.T01:CDS
GTTCATGTTAAAGTTAGGTT+AGG 0.421182 1:+21953790 MsG0180001475.01.T01:CDS
TTTGAGGAAATGCTGAGTGC+TGG 0.421957 1:+21954048 MsG0180001475.01.T01:CDS
CGGAGAAGCTTTGTGAGAAT+GGG 0.425323 1:+21954106 MsG0180001475.01.T01:CDS
ATCCTGAAAGTAACAACATT+AGG 0.426899 1:-21953529 None:intergenic
TCGCAATGAAATGGCCTCAT+TGG 0.427699 1:+21954467 MsG0180001475.01.T01:CDS
TTTAGCGTCAGTTAATAGAT+TGG 0.431416 1:-21953203 None:intergenic
GAAGAATTTGATTGGTGATT+CGG 0.439302 1:+21953750 MsG0180001475.01.T01:CDS
GAGAAATTCACATTCGCCTT+CGG 0.441780 1:+21953624 MsG0180001475.01.T01:CDS
TCTTCAGCTTCGCAATGAAA+TGG 0.446803 1:+21954458 MsG0180001475.01.T01:CDS
GATCGCTGGTCACATGCATA+AGG 0.447551 1:+21954419 MsG0180001475.01.T01:CDS
GTCTCATATAGACTCGCATT+TGG 0.452891 1:-21954393 None:intergenic
TGTTGTCGATTCACTCATAA+AGG 0.455773 1:+21953279 MsG0180001475.01.T01:CDS
GAGTTTGATATTGAGAATGA+TGG 0.461764 1:+21953660 MsG0180001475.01.T01:CDS
GATAGATGGTTATGCGAGAA+AGG 0.461992 1:+21954209 MsG0180001475.01.T01:CDS
TGACTGTGTTGTTAGATAAA+GGG 0.467170 1:+21954154 MsG0180001475.01.T01:CDS
GTTGTTTGAGGAGTTGTTGA+AGG 0.470380 1:-21952942 None:intergenic
TTAATTAACAGATCAAGAAC+CGG 0.471907 1:-21953328 None:intergenic
ATTCAGTGTTTCTGCCGTCT+TGG 0.475014 1:+21954315 MsG0180001475.01.T01:CDS
CGACAACAGCACGAACCGTA+TGG 0.478006 1:-21953264 None:intergenic
TGTCTCCGGTTCGAACCCTC+CGG 0.482555 1:+21953309 MsG0180001475.01.T01:CDS
TGAGGGAAATGGAAGGGAAA+GGG 0.483007 1:+21953944 MsG0180001475.01.T01:CDS
AAGGAGGGAGCAGAAGAAGA+AGG 0.484788 1:+21953685 MsG0180001475.01.T01:CDS
GTGTTGAAAACGGTGCGTTT+TGG 0.487680 1:-21953137 None:intergenic
ACGCATTAAGTTTCTTCCAC+TGG 0.488444 1:+21953110 MsG0180001475.01.T01:CDS
GATATTGAGAATGATGGAAA+AGG 0.488833 1:+21953666 MsG0180001475.01.T01:CDS
ACTTATGAATGTGTTATAGT+TGG 0.489964 1:+21953985 MsG0180001475.01.T01:CDS
TTGAGGAAATGCTGAGTGCT+GGG 0.492323 1:+21954049 MsG0180001475.01.T01:CDS
AAGTATAAGTCTATGTGTCC+TGG 0.504594 1:+21954270 MsG0180001475.01.T01:CDS
GGTTGGATTGATGAGGGAAA+TGG 0.509075 1:+21953933 MsG0180001475.01.T01:CDS
ATTGAGAATGATGGAAAAGG+AGG 0.511063 1:+21953669 MsG0180001475.01.T01:CDS
TTGTTCATCGTTTAATAAGG+TGG 0.514631 1:+21954083 MsG0180001475.01.T01:CDS
AATTAACCTCGCTTTCGCAT+AGG 0.516046 1:-21953353 None:intergenic
AAGAACCGGAGGGTTCGAAC+CGG 0.518387 1:-21953314 None:intergenic
GGACGGATTGAAGAGGCGGT+TGG 0.519932 1:+21953916 MsG0180001475.01.T01:CDS
TTGTTGCAGAAGAATTTGAT+TGG 0.523742 1:+21953742 MsG0180001475.01.T01:CDS
GATAATGTCGATCGGATTGT+TGG 0.528578 1:+21953598 MsG0180001475.01.T01:CDS
TTGTTGTATGTGAGTGTAAG+TGG 0.529346 1:-21952919 None:intergenic
GCGAGAAAGGACGAGGTTCA+GGG 0.529833 1:+21954222 MsG0180001475.01.T01:CDS
AAGAGGCGGTTGGATTGATG+AGG 0.531949 1:+21953926 MsG0180001475.01.T01:CDS
AGATTTGTTCAGCTAGTGAA+GGG 0.532674 1:-21953054 None:intergenic
GATTATGGTATTGTTGTTTG+AGG 0.543726 1:-21952954 None:intergenic
ATAAAGGACTCTGTTGTCTC+CGG 0.547178 1:+21953295 MsG0180001475.01.T01:CDS
ATCGCTGGTCACATGCATAA+GGG 0.554107 1:+21954420 MsG0180001475.01.T01:CDS
TGAGAATGGGGAAGTCGAGA+AGG 0.554539 1:+21954119 MsG0180001475.01.T01:CDS
CTATATGAGACGTTGATCGC+TGG 0.555549 1:+21954405 MsG0180001475.01.T01:CDS
GCATAAGGGAAATGACGAAA+GGG 0.557097 1:+21954434 MsG0180001475.01.T01:CDS
CGTCAGTTAATAGATTGGAA+TGG 0.560542 1:-21953198 None:intergenic
AGAGGCGGTTGGATTGATGA+GGG 0.561629 1:+21953927 MsG0180001475.01.T01:CDS
CTTTGCTTCATGTTGCTCAG+AGG 0.561782 1:+21953446 MsG0180001475.01.T01:CDS
GATTATGAAAGGTCGATCGC+TGG 0.566000 1:+21954368 MsG0180001475.01.T01:CDS
GTAAAGAAGGATTGTTACAG+AGG 0.566255 1:+21953569 MsG0180001475.01.T01:CDS
GACAACAGCACGAACCGTAT+GGG 0.566530 1:-21953263 None:intergenic
AAGATTTGTTCAGCTAGTGA+AGG 0.567026 1:-21953055 None:intergenic
ATGAGGGAAATGGAAGGGAA+AGG 0.570228 1:+21953943 MsG0180001475.01.T01:CDS
TTGGATGTGCGGATTCGGGA+CGG 0.572671 1:+21954004 MsG0180001475.01.T01:CDS
CGGGACGGTTGAAAGAGTGT+TGG 0.573094 1:+21954019 MsG0180001475.01.T01:CDS
AAGTATTTAAGGATTATGAA+AGG 0.578535 1:+21954357 MsG0180001475.01.T01:CDS
TAGTGAAGGGGTTATTTCGA+TGG 0.578631 1:-21953041 None:intergenic
AATGAAGAGTGTGTTGAAAA+CGG 0.580128 1:-21953147 None:intergenic
TCGATTTGAAACTGTTTGGG+AGG 0.582784 1:+21953474 MsG0180001475.01.T01:CDS
TGGTTATGCGAGAAAGGACG+AGG 0.592223 1:+21954215 MsG0180001475.01.T01:CDS
TGCATAAGGGAAATGACGAA+AGG 0.595372 1:+21954433 MsG0180001475.01.T01:CDS
TTCATCGTTTAATAAGGTGG+CGG 0.597484 1:+21954086 MsG0180001475.01.T01:CDS
TTGAGAATGATGGAAAAGGA+GGG 0.597789 1:+21953670 MsG0180001475.01.T01:CDS
TGAGAAGGGACGGATTGAAG+AGG 0.602869 1:+21953909 MsG0180001475.01.T01:CDS
TGAGAATAAGTAACATCACT+CGG 0.615983 1:-21954183 None:intergenic
TTAAAACCTATGCGAAAGCG+AGG 0.620198 1:+21953347 MsG0180001475.01.T01:CDS
ATTCAGAACAAAACAAAACT+GGG 0.625071 1:+21952994 MsG0180001475.01.T01:CDS
GACGAATAAACAGACAATCC+AGG 0.626392 1:-21954288 None:intergenic
GGATTGATGAGGGAAATGGA+AGG 0.626810 1:+21953937 MsG0180001475.01.T01:CDS
TATCATGAGATGGTGAGAAG+AGG 0.629962 1:+21953838 MsG0180001475.01.T01:CDS
TTTGGAGATGTATCATGAGA+TGG 0.631222 1:+21953828 MsG0180001475.01.T01:CDS
GAAGGGACGGATTGAAGAGG+CGG 0.633792 1:+21953912 MsG0180001475.01.T01:CDS
GATTGATGAGGGAAATGGAA+GGG 0.637041 1:+21953938 MsG0180001475.01.T01:CDS
CATCATCAATCTTACCAAGA+CGG 0.647332 1:-21954329 None:intergenic
GATTTGTTCAGCTAGTGAAG+GGG 0.647562 1:-21953053 None:intergenic
ATTAACAGATCAAGAACCGG+AGG 0.649029 1:-21953325 None:intergenic
GGAATGTTGATAATGTCGAT+CGG 0.652945 1:+21953590 MsG0180001475.01.T01:CDS
GGAGAAGCTTTGTGAGAATG+GGG 0.657621 1:+21954107 MsG0180001475.01.T01:CDS
CTCGAATTAACAACAACCGA+AGG 0.658164 1:-21953640 None:intergenic
TTAACAGATCAAGAACCGGA+GGG 0.662986 1:-21953324 None:intergenic
ACTACACTGCAACTCCAATG+AGG 0.669546 1:-21954481 None:intergenic
ATGTGTTATAGTTGGATGTG+CGG 0.693090 1:+21953993 MsG0180001475.01.T01:CDS
GTGAGTGTAAGTGGAGCTTG+TGG 0.694335 1:-21952910 None:intergenic
TTATTAAACGATGAACAACA+AGG 0.701157 1:-21954078 None:intergenic
ACAAAACGCTTGTATAAACG+AGG 0.717342 1:-21953887 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAGTATTTAAGGATTATGAA+AGG + Chr1:21954357-21954376 MsG0180001475.01.T01:CDS 20.0%
!! ATTCGTTATATAGATGAATT+AGG + Chr1:21953394-21953413 MsG0180001475.01.T01:CDS 20.0%
! ACTTATGAATGTGTTATAGT+TGG + Chr1:21953985-21954004 MsG0180001475.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTATTCTCATTTGATAGA+TGG + Chr1:21954195-21954214 MsG0180001475.01.T01:CDS 25.0%
! ATTCAGAACAAAACAAAACT+GGG + Chr1:21952994-21953013 MsG0180001475.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGGATATTGAAGTGATTA+TGG - Chr1:21952972-21952991 None:intergenic 25.0%
! TAAAAATACACAAACCCATA+CGG + Chr1:21953249-21953268 MsG0180001475.01.T01:CDS 25.0%
! TGATTGTTCATGTTAAAGTT+AGG + Chr1:21953785-21953804 MsG0180001475.01.T01:CDS 25.0%
! TTAATTAACAGATCAAGAAC+CGG - Chr1:21953331-21953350 None:intergenic 25.0%
! TTATTAAACGATGAACAACA+AGG - Chr1:21954081-21954100 None:intergenic 25.0%
!! GATGAATTAGGATTTTGTAT+TGG + Chr1:21953406-21953425 MsG0180001475.01.T01:CDS 25.0%
!! TTGTTGTTCATCGTTTAATA+AGG + Chr1:21954080-21954099 MsG0180001475.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAATCGATTTGAAACTGTTT+GGG + Chr1:21953471-21953490 MsG0180001475.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTGTTTTGTTCTGAATGAAT+TGG - Chr1:21952990-21953009 None:intergenic 25.0%
ATCCTGAAAGTAACAACATT+AGG - Chr1:21953532-21953551 None:intergenic 30.0%
ATTGATGCTCTTTGTAAAGA+AGG + Chr1:21953556-21953575 MsG0180001475.01.T01:CDS 30.0%
CATTCAGAACAAAACAAAAC+TGG + Chr1:21952993-21953012 MsG0180001475.01.T01:CDS 30.0%
GAGTTTGATATTGAGAATGA+TGG + Chr1:21953660-21953679 MsG0180001475.01.T01:CDS 30.0%
GTTCATGTTAAAGTTAGGTT+AGG + Chr1:21953790-21953809 MsG0180001475.01.T01:CDS 30.0%
TAAAGTTAGGTTAGGAGATT+TGG + Chr1:21953798-21953817 MsG0180001475.01.T01:CDS 30.0%
TGAGAATAAGTAACATCACT+CGG - Chr1:21954186-21954205 None:intergenic 30.0%
TTGTTCATCGTTTAATAAGG+TGG + Chr1:21954083-21954102 MsG0180001475.01.T01:CDS 30.0%
TTGTTGCAGAAGAATTTGAT+TGG + Chr1:21953742-21953761 MsG0180001475.01.T01:CDS 30.0%
TTTAGCGTCAGTTAATAGAT+TGG - Chr1:21953206-21953225 None:intergenic 30.0%
! AATGAAGAGTGTGTTGAAAA+CGG - Chr1:21953150-21953169 None:intergenic 30.0%
! GAAGAATTTGATTGGTGATT+CGG + Chr1:21953750-21953769 MsG0180001475.01.T01:CDS 30.0%
! GAGTAAGAGATTGATGATAA+TGG - Chr1:21953179-21953198 None:intergenic 30.0%
! GATATTGAGAATGATGGAAA+AGG + Chr1:21953666-21953685 MsG0180001475.01.T01:CDS 30.0%
! TGACTGTGTTGTTAGATAAA+GGG + Chr1:21954154-21954173 MsG0180001475.01.T01:CDS 30.0%
! TTGACTGTGTTGTTAGATAA+AGG + Chr1:21954153-21954172 MsG0180001475.01.T01:CDS 30.0%
!! ATCCTAATGTTGTTACTTTC+AGG + Chr1:21953527-21953546 MsG0180001475.01.T01:CDS 30.0%
!! ATGATGCAGAGAAGTATTTA+AGG + Chr1:21954346-21954365 MsG0180001475.01.T01:CDS 30.0%
!! GATTATGGTATTGTTGTTTG+AGG - Chr1:21952957-21952976 None:intergenic 30.0%
!! GTAATCGATTTGAAACTGTT+TGG + Chr1:21953470-21953489 MsG0180001475.01.T01:CDS 30.0%
!!! ACTTAATGCGTTTTTTGCAT+CGG - Chr1:21953101-21953120 None:intergenic 30.0%
AAGTATAAGTCTATGTGTCC+TGG + Chr1:21954270-21954289 MsG0180001475.01.T01:CDS 35.0%
ACAAAACGCTTGTATAAACG+AGG - Chr1:21953890-21953909 None:intergenic 35.0%
ATGTGTTATAGTTGGATGTG+CGG + Chr1:21953993-21954012 MsG0180001475.01.T01:CDS 35.0%
CATCATCAATCTTACCAAGA+CGG - Chr1:21954332-21954351 None:intergenic 35.0%
CGTCAGTTAATAGATTGGAA+TGG - Chr1:21953201-21953220 None:intergenic 35.0%
GTAAAGAAGGATTGTTACAG+AGG + Chr1:21953569-21953588 MsG0180001475.01.T01:CDS 35.0%
TTCATCGTTTAATAAGGTGG+CGG + Chr1:21954086-21954105 MsG0180001475.01.T01:CDS 35.0%
TTGTTGTATGTGAGTGTAAG+TGG - Chr1:21952922-21952941 None:intergenic 35.0%
TTTGGAGATGTATCATGAGA+TGG + Chr1:21953828-21953847 MsG0180001475.01.T01:CDS 35.0%
! AAGATTTGTTCAGCTAGTGA+AGG - Chr1:21953058-21953077 None:intergenic 35.0%
! AGATTTGTTCAGCTAGTGAA+GGG - Chr1:21953057-21953076 None:intergenic 35.0%
! AGGAGATTTGGATTTTGCTT+TGG + Chr1:21953810-21953829 MsG0180001475.01.T01:CDS 35.0%
! ATACAAGCGTTTTGTGAGAA+GGG + Chr1:21953895-21953914 MsG0180001475.01.T01:CDS 35.0%
! ATTGAGAATGATGGAAAAGG+AGG + Chr1:21953669-21953688 MsG0180001475.01.T01:CDS 35.0%
! TATACAAGCGTTTTGTGAGA+AGG + Chr1:21953894-21953913 MsG0180001475.01.T01:CDS 35.0%
! TTGAGAATGATGGAAAAGGA+GGG + Chr1:21953670-21953689 MsG0180001475.01.T01:CDS 35.0%
!! GGAATGTTGATAATGTCGAT+CGG + Chr1:21953590-21953609 MsG0180001475.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTTGTCGATTCACTCATAA+AGG + Chr1:21953279-21953298 MsG0180001475.01.T01:CDS 35.0%
AAATGGAAGGGAAAGGGTTA+AGG + Chr1:21953950-21953969 MsG0180001475.01.T01:CDS 40.0%
AATGGAAGGGAAAGGGTTAA+GGG + Chr1:21953951-21953970 MsG0180001475.01.T01:CDS 40.0%
AATTAACCTCGCTTTCGCAT+AGG - Chr1:21953356-21953375 None:intergenic 40.0%
ACGCATTAAGTTTCTTCCAC+TGG + Chr1:21953110-21953129 MsG0180001475.01.T01:CDS 40.0%
ATAAAGGACTCTGTTGTCTC+CGG + Chr1:21953295-21953314 MsG0180001475.01.T01:CDS 40.0%
ATTAACAGATCAAGAACCGG+AGG - Chr1:21953328-21953347 None:intergenic 40.0%
CTCGAATTAACAACAACCGA+AGG - Chr1:21953643-21953662 None:intergenic 40.0%
GAAACTGTTTGGGAGGTTTA+TGG + Chr1:21953481-21953500 MsG0180001475.01.T01:CDS 40.0%
GACGAATAAACAGACAATCC+AGG - Chr1:21954291-21954310 None:intergenic 40.0%
GAGAAATTCACATTCGCCTT+CGG + Chr1:21953624-21953643 MsG0180001475.01.T01:CDS 40.0%
GATAATGTCGATCGGATTGT+TGG + Chr1:21953598-21953617 MsG0180001475.01.T01:CDS 40.0%
GATAGATGGTTATGCGAGAA+AGG + Chr1:21954209-21954228 MsG0180001475.01.T01:CDS 40.0%
GATTGATGAGGGAAATGGAA+GGG + Chr1:21953938-21953957 MsG0180001475.01.T01:CDS 40.0%
GCATAAGGGAAATGACGAAA+GGG + Chr1:21954434-21954453 MsG0180001475.01.T01:CDS 40.0%
GTCTCATATAGACTCGCATT+TGG - Chr1:21954396-21954415 None:intergenic 40.0%
GTTGTTTGAGGAGTTGTTGA+AGG - Chr1:21952945-21952964 None:intergenic 40.0%
TATAGTTGGATGTGCGGATT+CGG + Chr1:21953999-21954018 MsG0180001475.01.T01:CDS 40.0%
TATCATGAGATGGTGAGAAG+AGG + Chr1:21953838-21953857 MsG0180001475.01.T01:CDS 40.0%
TCTTCAGCTTCGCAATGAAA+TGG + Chr1:21954458-21954477 MsG0180001475.01.T01:CDS 40.0%
TGCATAAGGGAAATGACGAA+AGG + Chr1:21954433-21954452 MsG0180001475.01.T01:CDS 40.0%
TTAAAACCTATGCGAAAGCG+AGG + Chr1:21953347-21953366 MsG0180001475.01.T01:CDS 40.0%
TTAACAGATCAAGAACCGGA+GGG - Chr1:21953327-21953346 None:intergenic 40.0%
! GATTTGTTCAGCTAGTGAAG+GGG - Chr1:21953056-21953075 None:intergenic 40.0%
! TAGTGAAGGGGTTATTTCGA+TGG - Chr1:21953044-21953063 None:intergenic 40.0%
! TCGATTTGAAACTGTTTGGG+AGG + Chr1:21953474-21953493 MsG0180001475.01.T01:CDS 40.0%
!!! AATGCGTTTTTTGCATCGGT+TGG - Chr1:21953097-21953116 None:intergenic 40.0%
!!! AGAGTGTTGGAGTGTTTTTG+AGG + Chr1:21954032-21954051 MsG0180001475.01.T01:CDS 40.0%
!!! ATGCGTTTTTTGCATCGGTT+GGG - Chr1:21953096-21953115 None:intergenic 40.0%
ACTACACTGCAACTCCAATG+AGG - Chr1:21954484-21954503 None:intergenic 45.0%
ATAGTTGGATGTGCGGATTC+GGG + Chr1:21954000-21954019 MsG0180001475.01.T01:CDS 45.0%
ATCGCTGGTCACATGCATAA+GGG + Chr1:21954420-21954439 MsG0180001475.01.T01:CDS 45.0%
ATGAGGGAAATGGAAGGGAA+AGG + Chr1:21953943-21953962 MsG0180001475.01.T01:CDS 45.0%
CTATATGAGACGTTGATCGC+TGG + Chr1:21954405-21954424 MsG0180001475.01.T01:CDS 45.0%
CTTTGCTTCATGTTGCTCAG+AGG + Chr1:21953446-21953465 MsG0180001475.01.T01:CDS 45.0%
GATTATGAAAGGTCGATCGC+TGG + Chr1:21954368-21954387 MsG0180001475.01.T01:CDS 45.0%
GGATTGATGAGGGAAATGGA+AGG + Chr1:21953937-21953956 MsG0180001475.01.T01:CDS 45.0%
GGGAAAGGGTTAAGGGTTTA+TGG + Chr1:21953958-21953977 MsG0180001475.01.T01:CDS 45.0%
GGTTGGATTGATGAGGGAAA+TGG + Chr1:21953933-21953952 MsG0180001475.01.T01:CDS 45.0%
TCGCAATGAAATGGCCTCAT+TGG + Chr1:21954467-21954486 MsG0180001475.01.T01:CDS 45.0%
TGAGGGAAATGGAAGGGAAA+GGG + Chr1:21953944-21953963 MsG0180001475.01.T01:CDS 45.0%
TTGAGGAAATGCTGAGTGCT+GGG + Chr1:21954049-21954068 MsG0180001475.01.T01:CDS 45.0%
TTTGAGGAAATGCTGAGTGC+TGG + Chr1:21954048-21954067 MsG0180001475.01.T01:CDS 45.0%
! AAGCGTTTTGTGAGAAGGGA+CGG + Chr1:21953899-21953918 MsG0180001475.01.T01:CDS 45.0%
! ATTCAGTGTTTCTGCCGTCT+TGG + Chr1:21954315-21954334 MsG0180001475.01.T01:CDS 45.0%
! CGGAGAAGCTTTGTGAGAAT+GGG + Chr1:21954106-21954125 MsG0180001475.01.T01:CDS 45.0%
! GGAGAAGCTTTGTGAGAATG+GGG + Chr1:21954107-21954126 MsG0180001475.01.T01:CDS 45.0%
! GTGTTGAAAACGGTGCGTTT+TGG - Chr1:21953140-21953159 None:intergenic 45.0%
! TTGAAAACGGTGCGTTTTGG+TGG - Chr1:21953137-21953156 None:intergenic 45.0%
AAGAGGCGGTTGGATTGATG+AGG + Chr1:21953926-21953945 MsG0180001475.01.T01:CDS 50.0%
AAGGAGGGAGCAGAAGAAGA+AGG + Chr1:21953685-21953704 MsG0180001475.01.T01:CDS 50.0%
AGAGGCGGTTGGATTGATGA+GGG + Chr1:21953927-21953946 MsG0180001475.01.T01:CDS 50.0%
GACAACAGCACGAACCGTAT+GGG - Chr1:21953266-21953285 None:intergenic 50.0%
GATCGCTGGTCACATGCATA+AGG + Chr1:21954419-21954438 MsG0180001475.01.T01:CDS 50.0%
GTGAGTGTAAGTGGAGCTTG+TGG - Chr1:21952913-21952932 None:intergenic 50.0%
TGAGAATGGGGAAGTCGAGA+AGG + Chr1:21954119-21954138 MsG0180001475.01.T01:CDS 50.0%
TGGTTATGCGAGAAAGGACG+AGG + Chr1:21954215-21954234 MsG0180001475.01.T01:CDS 50.0%
! GCGGAGAAGCTTTGTGAGAA+TGG + Chr1:21954105-21954124 MsG0180001475.01.T01:CDS 50.0%
!! TGAGAAGGGACGGATTGAAG+AGG + Chr1:21953909-21953928 MsG0180001475.01.T01:CDS 50.0%
AAGAACCGGAGGGTTCGAAC+CGG - Chr1:21953317-21953336 None:intergenic 55.0%
CGACAACAGCACGAACCGTA+TGG - Chr1:21953267-21953286 None:intergenic 55.0%
GCGAGAAAGGACGAGGTTCA+GGG + Chr1:21954222-21954241 MsG0180001475.01.T01:CDS 55.0%
TGCGAGAAAGGACGAGGTTC+AGG + Chr1:21954221-21954240 MsG0180001475.01.T01:CDS 55.0%
TTGGATGTGCGGATTCGGGA+CGG + Chr1:21954004-21954023 MsG0180001475.01.T01:CDS 55.0%
! CGGGACGGTTGAAAGAGTGT+TGG + Chr1:21954019-21954038 MsG0180001475.01.T01:CDS 55.0%
!! GAAGGGACGGATTGAAGAGG+CGG + Chr1:21953912-21953931 MsG0180001475.01.T01:CDS 55.0%
! TGTCTCCGGTTCGAACCCTC+CGG + Chr1:21953309-21953328 MsG0180001475.01.T01:CDS 60.0%
!! GGACGGATTGAAGAGGCGGT+TGG + Chr1:21953916-21953935 MsG0180001475.01.T01:CDS 60.0%
!! GGTGCGTTTTGGTGGACCAG+TGG - Chr1:21953129-21953148 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 21952860 21954506 21952860 ID=MsG0180001475.01;Name=MsG0180001475.01
Chr1 mRNA 21952860 21954506 21952860 ID=MsG0180001475.01.T01;Parent=MsG0180001475.01;Name=MsG0180001475.01.T01;_AED=0.22;_eAED=0.22;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|548
Chr1 exon 21952860 21954506 21952860 ID=MsG0180001475.01.T01:exon:13568;Parent=MsG0180001475.01.T01
Chr1 CDS 21952860 21954506 21952860 ID=MsG0180001475.01.T01:cds;Parent=MsG0180001475.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180001475.01.T01

ATGAGTTTCAGTTCGAAACACTTGAAGCTGTTAAGCAGAATCACTTTCTACCACAAGCTCCACTTACACTCACATACAACAACCTTCAACAACTCCTCAAACAACAATACCATAATCACTTCAATATCCAATTCATTCAGAACAAAACAAAACTGGGACACAATCACACACAAATTCACTTCCATCGAAATAACCCCTTCACTAGCTGAACAAATCTTACTAAATCTAAACAACCCAACCGATGCAAAAAACGCATTAAGTTTCTTCCACTGGTCCACCAAAACGCACCGTTTTCAACACACTCTTCATTCTTATTCCATTATCATCAATCTCTTACTCCATTCCAATCTATTAACTGACGCTAAAGCATTACTTGAATCACTCGCTCTTAAAAATACACAAACCCATACGGTTCGTGCTGTTGTCGATTCACTCATAAAGGACTCTGTTGTCTCCGGTTCGAACCCTCCGGTTCTTGATCTGTTAATTAAAACCTATGCGAAAGCGAGGTTAATTGACGCTGCTTTCGATGTTATTCGTTATATAGATGAATTAGGATTTTGTATTGGTTTATCGAGTTTTAATGCTTTGCTTCATGTTGCTCAGAGGTGTAATCGATTTGAAACTGTTTGGGAGGTTTATGGTTACATGATTTTGAAGAGAGTTTATCCTAATGTTGTTACTTTCAGGATTATGATTGATGCTCTTTGTAAAGAAGGATTGTTACAGAGGAATGTTGATAATGTCGATCGGATTGTTGGAAAGAGAAATTCACATTCGCCTTCGGTTGTTGTTAATTCGAGTTTGATATTGAGAATGATGGAAAAGGAGGGAGCAGAAGAAGAAGGTAAGTTAGTTAAGTTAGTTACATTGTTGAAGAGATTGTTGCAGAAGAATTTGATTGGTGATTCGGTTGCGTATTCGTTGATTGTTCATGTTAAAGTTAGGTTAGGAGATTTGGATTTTGCTTTGGAGATGTATCATGAGATGGTGAGAAGAGGTTTTAATGAGAATTCGTTTGTTTACACCTCGTTTATACAAGCGTTTTGTGAGAAGGGACGGATTGAAGAGGCGGTTGGATTGATGAGGGAAATGGAAGGGAAAGGGTTAAGGGTTTATGGTCAGACTTATGAATGTGTTATAGTTGGATGTGCGGATTCGGGACGGTTGAAAGAGTGTTGGAGTGTTTTTGAGGAAATGCTGAGTGCTGGGTTTGTTCCTTGTTGTTCATCGTTTAATAAGGTGGCGGAGAAGCTTTGTGAGAATGGGGAAGTCGAGAAGGTGAATGATATGTTGACTGTGTTGTTAGATAAAGGGTTTTTGCCGAGTGATGTTACTTATTCTCATTTGATAGATGGTTATGCGAGAAAGGACGAGGTTCAGGGAGTTCTTAAGATATATTATGAAATGAAGTATAAGTCTATGTGTCCTGGATTGTCTGTTTATTCGTCGATGATTCAGTGTTTCTGCCGTCTTGGTAAGATTGATGATGCAGAGAAGTATTTAAGGATTATGAAAGGTCGATCGCTGGCTCCAAATGCGAGTCTATATGAGACGTTGATCGCTGGTCACATGCATAAGGGAAATGACGAAAGGGCTCTTCAGCTTCGCAATGAAATGGCCTCATTGGAGTTGCAGTGTAGTTAG
Protein sequence

>MsG0180001475.01.T01

MSFSSKHLKLLSRITFYHKLHLHSHTTTFNNSSNNNTIITSISNSFRTKQNWDTITHKFTSIEITPSLAEQILLNLNNPTDAKNALSFFHWSTKTHRFQHTLHSYSIIINLLLHSNLLTDAKALLESLALKNTQTHTVRAVVDSLIKDSVVSGSNPPVLDLLIKTYAKARLIDAAFDVIRYIDELGFCIGLSSFNALLHVAQRCNRFETVWEVYGYMILKRVYPNVVTFRIMIDALCKEGLLQRNVDNVDRIVGKRNSHSPSVVVNSSLILRMMEKEGAEEEGKLVKLVTLLKRLLQKNLIGDSVAYSLIVHVKVRLGDLDFALEMYHEMVRRGFNENSFVYTSFIQAFCEKGRIEEAVGLMREMEGKGLRVYGQTYECVIVGCADSGRLKECWSVFEEMLSAGFVPCCSSFNKVAEKLCENGEVEKVNDMLTVLLDKGFLPSDVTYSHLIDGYARKDEVQGVLKIYYEMKYKSMCPGLSVYSSMIQCFCRLGKIDDAEKYLRIMKGRSLAPNASLYETLIAGHMHKGNDERALQLRNEMASLELQCS*