AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180001728.01

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MsG0180001728.01.T01 AT4G23230 55.941 202 87 2 72 272 423 623 1.14e-79 254
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MsG0180001728.01.T01 AT4G23190 55.610 205 88 2 72 273 358 562 1.89e-79 253
MsG0180001728.01.T01 AT4G23130 51.037 241 110 2 72 311 426 659 2.38e-79 254
MsG0180001728.01.T01 AT4G23130 51.037 241 110 2 72 311 430 663 3.55e-79 253
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MsG0180001728.01.T01 AT4G23270 51.271 236 107 3 72 306 412 640 4.27e-78 250
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MsG0180001728.01.T01 AT4G23320 53.431 204 94 1 72 274 269 472 2.83e-75 239
MsG0180001728.01.T01 AT4G23200 53.695 203 93 1 72 273 422 624 3.74e-75 243
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MsG0180001728.01.T01 AT4G03230 52.217 203 94 3 72 272 676 877 2.94e-62 212
MsG0180001728.01.T01 AT1G67520 47.248 218 111 3 72 286 589 805 3.27e-62 211
MsG0180001728.01.T01 AT4G03230 52.217 203 94 3 72 272 704 905 3.57e-62 212
MsG0180001728.01.T01 AT3G16030 46.860 207 107 2 72 275 634 840 3.94e-62 211
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MsG0180001728.01.T01 AT1G61370 48.020 202 102 3 72 272 587 786 7.99e-62 210
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MsG0180001728.01.T01 AT1G61490 49.010 202 100 3 72 272 426 625 6.58e-60 202
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MsG0180001728.01.T01 AT1G53420 42.553 188 104 4 72 257 710 895 3.25e-41 153
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MsG0180001728.01.T01 AT5G02800 39.378 193 105 6 70 255 160 347 2.51e-36 134
MsG0180001728.01.T01 AT1G68690 39.691 194 108 4 77 266 466 654 2.69e-36 138
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MsG0180001728.01.T01 AT5G18610 37.557 221 123 7 74 283 173 389 4.56e-36 136
MsG0180001728.01.T01 AT1G61860 40.212 189 107 5 72 255 172 359 5.23e-36 134
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MsG0180001728.01.T01 AT1G68690 41.011 178 100 3 77 250 466 642 6.19e-36 137
MsG0180001728.01.T01 AT4G20270 42.222 180 101 3 80 257 805 983 6.29e-36 137
MsG0180001728.01.T01 AT3G55550 35.638 188 118 3 72 258 433 618 6.33e-36 137
MsG0180001728.01.T01 AT1G60800 38.532 218 118 5 47 262 376 579 7.30e-36 136
MsG0180001728.01.T01 AT2G18890 37.968 187 106 3 77 258 161 342 1.08e-35 132
MsG0180001728.01.T01 AT1G07870 36.275 204 127 3 74 275 193 395 1.35e-35 135
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MsG0180001728.01.T01 AT1G23540 39.891 183 105 3 80 258 464 645 2.03e-35 135
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MsG0180001728.01.T01 AT4G13190 37.173 191 117 3 80 268 20 209 2.84e-35 128
MsG0180001728.01.T01 AT5G62710 36.139 202 120 4 77 274 366 562 3.04e-35 134
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MsG0180001728.01.T01 AT2G42960 39.247 186 108 4 76 259 274 456 5.08e-35 132
MsG0180001728.01.T01 AT2G42960 39.247 186 108 4 76 259 274 456 5.08e-35 132
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MsG0180001728.01.T01 AT5G40380 54.783 115 51 1 72 186 401 514 8.84e-35 133
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MsG0180001728.01.T01 AT5G13160 36.318 201 119 4 74 269 176 372 3.85e-34 130
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MsG0180001728.01.T01 AT4G13190 37.173 191 117 3 80 268 167 356 7.11e-34 128
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MsG0180001728.01.T01 AT1G29730 54.545 110 49 1 79 188 733 841 1.25e-33 130
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MsG0180001728.01.T01 AT5G65710 34.928 209 112 5 78 262 784 992 1.93e-33 130
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MsG0180001728.01.T01 AT4G01330 36.082 194 115 4 73 262 250 438 2.90e-33 127
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MsG0180001728.01.T01 AT2G13800 39.247 186 110 3 74 257 365 549 3.98e-33 129
MsG0180001728.01.T01 AT5G65530 39.884 173 97 3 80 250 238 405 4.34e-33 127
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MsG0180001728.01.T01 AT5G18500 38.674 181 108 3 80 259 261 439 6.71e-33 127
MsG0180001728.01.T01 AT5G18500 38.674 181 108 3 80 259 261 439 6.71e-33 127
MsG0180001728.01.T01 AT5G18500 38.674 181 108 3 80 259 261 439 6.71e-33 127
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MsG0180001728.01.T01 AT3G25560 40.000 180 104 3 80 257 405 582 1.19e-31 124
MsG0180001728.01.T01 AT5G10290 38.503 187 108 5 80 262 386 569 1.22e-31 124
MsG0180001728.01.T01 AT5G10290 38.503 187 108 5 80 262 386 569 1.22e-31 124
MsG0180001728.01.T01 AT5G59270 33.005 203 132 3 72 273 454 653 1.23e-31 125
MsG0180001728.01.T01 AT3G25560 40.000 180 104 3 80 257 404 581 1.24e-31 124
MsG0180001728.01.T01 AT5G59270 34.444 180 114 3 72 250 438 614 1.28e-31 124
MsG0180001728.01.T01 AT2G37050 38.889 180 107 2 76 253 694 872 1.30e-31 125
MsG0180001728.01.T01 AT3G18810 39.227 181 106 3 80 257 430 609 1.34e-31 124
MsG0180001728.01.T01 AT1G77280 36.898 187 112 3 82 264 500 684 1.34e-31 125
MsG0180001728.01.T01 AT1G77280 36.898 187 112 3 82 264 500 684 1.34e-31 125
MsG0180001728.01.T01 AT2G37710 36.047 172 108 2 80 250 441 611 1.35e-31 124
MsG0180001728.01.T01 AT2G37050 38.889 180 107 2 76 253 695 873 1.36e-31 125
MsG0180001728.01.T01 AT1G55610 36.111 180 112 2 80 257 956 1134 1.54e-31 125
MsG0180001728.01.T01 AT1G55610 36.111 180 112 2 80 257 956 1134 1.54e-31 125
MsG0180001728.01.T01 AT1G34300 34.254 181 115 2 80 257 577 756 1.73e-31 124
MsG0180001728.01.T01 AT3G09010 46.565 131 66 3 75 205 136 262 1.77e-31 120
MsG0180001728.01.T01 AT5G65240 37.968 187 109 5 80 262 380 563 1.90e-31 124
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MsG0180001728.01.T01 AT5G65240 37.968 187 109 5 80 262 380 563 2.09e-31 124
MsG0180001728.01.T01 AT5G07180 36.559 186 109 4 74 257 643 821 2.10e-31 124
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MsG0180001728.01.T01 AT3G02130 36.111 180 106 5 76 250 944 1119 2.32e-31 124
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MsG0180001728.01.T01 AT2G33170 36.170 188 111 4 75 257 916 1099 2.36e-31 124
MsG0180001728.01.T01 AT5G07180 36.559 186 109 4 74 257 739 917 2.37e-31 124
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MsG0180001728.01.T01 AT1G09440 38.674 181 108 3 80 259 252 430 2.77e-31 122
MsG0180001728.01.T01 AT5G57670 36.872 179 107 3 80 257 361 534 3.02e-31 123
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MsG0180001728.01.T01 AT1G56720 35.912 181 113 3 80 259 274 452 5.34e-30 119
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MsG0180001728.01.T01 AT3G13690 35.829 187 112 5 76 258 500 682 1.34e-29 119
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MsG0180001728.01.T01 AT1G55200 36.066 183 109 5 80 258 472 650 1.65e-29 119
MsG0180001728.01.T01 AT1G55200 36.066 183 109 5 80 258 472 650 1.65e-29 119
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MsG0180001728.01.T01 AT3G45430 34.673 199 123 5 80 277 437 629 2.94e-29 118
MsG0180001728.01.T01 AT3G45430 34.673 199 123 5 80 277 437 629 2.94e-29 118
MsG0180001728.01.T01 AT5G11020 39.326 178 102 4 78 253 233 406 3.04e-29 116
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MsG0180001728.01.T01 AT1G48210 35.829 187 112 3 76 258 163 345 4.10e-29 114
MsG0180001728.01.T01 AT1G48210 35.829 187 112 3 76 258 163 345 4.10e-29 114
MsG0180001728.01.T01 AT1G48210 35.829 187 112 3 76 258 163 345 4.10e-29 114
MsG0180001728.01.T01 AT3G01300 35.468 203 122 4 76 273 234 432 4.12e-29 116
MsG0180001728.01.T01 AT1G70250 36.181 199 120 4 78 270 550 747 4.24e-29 117
MsG0180001728.01.T01 AT1G01540 46.667 120 54 2 80 199 249 358 4.39e-29 115
MsG0180001728.01.T01 AT5G11020 39.326 178 102 4 78 253 199 372 4.94e-29 115
MsG0180001728.01.T01 AT5G11020 39.326 178 102 4 78 253 195 368 5.02e-29 115
MsG0180001728.01.T01 AT4G34500 35.176 199 116 6 78 272 240 429 5.25e-29 115
MsG0180001728.01.T01 AT2G18890 48.148 108 56 0 77 184 161 268 5.53e-29 112
MsG0180001728.01.T01 AT1G72180 39.891 183 102 6 79 258 782 959 5.58e-29 117
MsG0180001728.01.T01 AT1G51820 34.426 183 116 2 77 258 669 848 5.82e-29 117
MsG0180001728.01.T01 AT1G51820 34.426 183 116 2 77 258 407 586 6.06e-29 117
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MsG0180001728.01.T01 AT2G43700 32.447 188 122 4 72 257 397 581 6.06e-29 117
MsG0180001728.01.T01 AT2G43700 32.447 188 122 4 72 257 397 581 6.06e-29 117
MsG0180001728.01.T01 AT2G43700 32.447 188 122 4 72 257 397 581 6.06e-29 117
MsG0180001728.01.T01 AT2G43700 32.447 188 122 4 72 257 421 605 6.29e-29 117
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MsG0180001728.01.T01 AT5G02290 38.286 175 100 4 80 250 173 343 6.46e-29 114
MsG0180001728.01.T01 AT1G09970 35.106 188 113 5 75 257 769 952 6.50e-29 117
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MsG0180001728.01.T01 AT2G19130 35.912 181 111 4 80 257 588 766 6.86e-29 117
MsG0180001728.01.T01 AT3G04690 36.364 176 110 2 76 250 606 780 6.93e-29 117
MsG0180001728.01.T01 AT1G12460 34.973 183 117 2 78 259 555 736 7.00e-29 117
MsG0180001728.01.T01 AT1G06700 37.705 183 106 3 80 258 169 347 7.56e-29 114
MsG0180001728.01.T01 AT1G06700 37.705 183 106 3 80 258 169 347 7.56e-29 114
MsG0180001728.01.T01 AT1G06700 37.705 183 106 3 80 258 169 347 7.56e-29 114
MsG0180001728.01.T01 AT3G46330 37.569 181 106 4 80 257 660 836 7.57e-29 117
MsG0180001728.01.T01 AT1G12460 34.973 183 117 2 78 259 694 875 8.03e-29 117
MsG0180001728.01.T01 AT3G46330 36.464 181 108 4 80 257 636 812 8.08e-29 117
MsG0180001728.01.T01 AT2G28250 36.702 188 112 3 79 259 307 494 8.36e-29 116
MsG0180001728.01.T01 AT2G28250 36.702 188 112 3 79 259 307 494 8.36e-29 116
MsG0180001728.01.T01 AT2G28250 36.702 188 112 3 79 259 307 494 8.36e-29 116
MsG0180001728.01.T01 AT2G28250 36.702 188 112 3 79 259 307 494 8.36e-29 116
MsG0180001728.01.T01 AT2G28250 36.702 188 112 3 79 259 307 494 8.36e-29 116
MsG0180001728.01.T01 AT2G28250 36.702 188 112 3 79 259 307 494 8.36e-29 116
MsG0180001728.01.T01 AT5G65600 35.096 208 125 4 76 274 440 646 9.15e-29 116
MsG0180001728.01.T01 AT2G11520 33.158 190 124 3 70 257 309 497 9.67e-29 115
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MsG0180001728.01.T01 AT2G18470 34.807 181 114 3 80 257 377 556 1.30e-28 115
MsG0180001728.01.T01 AT2G18470 34.807 181 114 3 80 257 377 556 1.30e-28 115
MsG0180001728.01.T01 AT2G18470 34.807 181 114 3 80 257 377 556 1.30e-28 115
MsG0180001728.01.T01 AT4G28650 35.294 187 116 3 73 257 793 976 1.32e-28 116
MsG0180001728.01.T01 AT1G69270 35.135 185 99 4 77 250 351 525 1.37e-28 115
MsG0180001728.01.T01 AT4G23200 65.000 80 28 0 72 151 422 501 1.55e-28 115
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MsG0180001728.01.T01 AT1G17230 34.896 192 105 4 76 257 891 1072 1.85e-28 115
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MsG0180001728.01.T01 AT4G13190 47.664 107 56 0 80 186 167 273 2.10e-28 111
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MsG0180001728.01.T01 AT5G59260 34.078 179 116 2 72 250 441 617 3.37e-28 115
MsG0180001728.01.T01 AT5G37450 36.126 191 111 4 77 262 745 929 3.47e-28 115
MsG0180001728.01.T01 AT4G29450 33.140 172 113 2 80 250 671 841 3.83e-28 115
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MsG0180001728.01.T01 AT1G51830 32.778 180 117 2 80 258 487 663 4.06e-28 114

Find 66 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 182 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CCAATTCAATTGTGCTCTTC+TGG 0.168915 1:+26100295 None:intergenic
AATCCTAAGATATCCGATTT+TGG 0.188529 1:-26100149 MsG0180001728.01.T01:CDS
AAATCGGATGTCTTTAGTTT+TGG 0.244200 1:-26099006 MsG0180001728.01.T01:CDS
ATTGGCTTGCAGTGGATATA+TGG 0.288254 1:-26099064 MsG0180001728.01.T01:intron
AATCCAAAATCGGATATCTT+AGG 0.323871 1:+26100146 None:intergenic
CCAGAAGAGCACAATTGAAT+TGG 0.336831 1:-26100295 MsG0180001728.01.T01:CDS
GCTCTCTTTAAGACGTTTCA+TGG 0.350628 1:+26100620 None:intergenic
GAGAATTACACCCTCAAATA+TGG 0.358181 1:+26100749 None:intergenic
GAGTTATGGGCTGGCAATAT+AGG 0.370627 1:-26098239 MsG0180001728.01.T01:CDS
TTCAATTGTGCTCTTCTGGC+TGG 0.370726 1:+26100299 None:intergenic
CCTACAGGACATGGAGTTAT+GGG 0.372422 1:-26098252 MsG0180001728.01.T01:CDS
CATCTACCGAAGTTGTTACT+AGG 0.385046 1:+26100579 None:intergenic
AGTCTACCTTGCACAACTTT+GGG 0.391262 1:-26100648 MsG0180001728.01.T01:CDS
TAGTCTACCTTGCACAACTT+TGG 0.404728 1:-26100649 MsG0180001728.01.T01:CDS
GTAGCTGGGCTTGTTTATCC+TGG 0.405331 1:-26100687 MsG0180001728.01.T01:CDS
CATGGAAATGCTGGAGGGAG+GGG 0.407077 1:-26098481 MsG0180001728.01.T01:CDS
CAATCTCGCCAATCCAAAAT+CGG 0.423738 1:+26100136 None:intergenic
GCCTACAGGACATGGAGTTA+TGG 0.427238 1:-26098253 MsG0180001728.01.T01:CDS
AAATAGTACAAACATTGGTC+AGG 0.430681 1:-26098950 MsG0180001728.01.T01:CDS
GCTGAAATGTTGTTTAATGC+TGG 0.434206 1:+26098437 None:intergenic
TATTGCAGGCATGGAAATGC+TGG 0.440640 1:-26098490 MsG0180001728.01.T01:intron
AAAAGCGCTATGATATCATA+AGG 0.452109 1:-26100271 MsG0180001728.01.T01:CDS
GTTAATCGAACAGTTGTAGC+TGG 0.455198 1:-26100702 MsG0180001728.01.T01:CDS
CAGAAGAGCACAATTGAATT+GGG 0.462116 1:-26100294 MsG0180001728.01.T01:CDS
GGAAATACAAGTAAAATTGT+TGG 0.474475 1:-26100092 MsG0180001728.01.T01:CDS
TGGTCTTAGTACCATATTTG+AGG 0.481193 1:-26100760 MsG0180001728.01.T01:CDS
GCATGGAAATGCTGGAGGGA+GGG 0.488582 1:-26098482 MsG0180001728.01.T01:CDS
TGTTTATCCTGGAGGTGGCA+TGG 0.499017 1:-26100676 MsG0180001728.01.T01:CDS
AAAGCGCTATGATATCATAA+GGG 0.501624 1:-26100270 MsG0180001728.01.T01:CDS
GGGCTTGTTTATCCTGGAGG+TGG 0.502813 1:-26100681 MsG0180001728.01.T01:CDS
GGTCTTAGTACCATATTTGA+GGG 0.505981 1:-26100759 MsG0180001728.01.T01:CDS
AATATAGGTTCAACAACATC+GGG 0.514375 1:-26098224 MsG0180001728.01.T01:CDS
TATTGCTAGCTTTGAGATCA+CGG 0.520478 1:+26100192 None:intergenic
ATAGATCAGTATTTGAAGCC+TGG 0.520685 1:+26098189 None:intergenic
GGCATGGAAATGCTGGAGGG+AGG 0.523479 1:-26098483 MsG0180001728.01.T01:CDS
TTTGTTATCGATCAAAGTGA+AGG 0.528309 1:-26100113 MsG0180001728.01.T01:CDS
AATTAGAAGCCTACAGGACA+TGG 0.531628 1:-26098261 MsG0180001728.01.T01:CDS
CCCATAACTCCATGTCCTGT+AGG 0.549524 1:+26098252 None:intergenic
CTATCAACCATGCCACCTCC+AGG 0.549733 1:+26100669 None:intergenic
AAGTGGAATTAGAAGCCTAC+AGG 0.562228 1:-26098267 MsG0180001728.01.T01:CDS
CAATATAGGTTCAACAACAT+CGG 0.565784 1:-26098225 MsG0180001728.01.T01:CDS
CAGGACATGGAGTTATGGGC+TGG 0.566982 1:-26098248 MsG0180001728.01.T01:CDS
TTAATCGAACAGTTGTAGCT+GGG 0.571395 1:-26100701 MsG0180001728.01.T01:CDS
AATAGTACAAACATTGGTCA+GGG 0.575188 1:-26098949 MsG0180001728.01.T01:CDS
ATGGTTTCAATATTAAAGAG+TGG 0.590452 1:-26100780 MsG0180001728.01.T01:CDS
TGTCCATGCATTGCATACTC+AGG 0.598834 1:+26099039 None:intergenic
GCTGGGCTTGTTTATCCTGG+AGG 0.621866 1:-26100684 MsG0180001728.01.T01:CDS
GCACCTGAGTATGCAATGCA+TGG 0.625811 1:-26099042 MsG0180001728.01.T01:CDS
TGCAGGCATGGAAATGCTGG+AGG 0.627308 1:-26098487 MsG0180001728.01.T01:intron
ATATGAACGAAATTTATCGA+GGG 0.627714 1:+26098165 None:intergenic
TGTAGTTGACAGACCAACCA+TGG 0.629219 1:-26098363 MsG0180001728.01.T01:CDS
AGTGCAACAACAACCATGGT+TGG 0.629415 1:+26098350 None:intergenic
TATATGAACGAAATTTATCG+AGG 0.631975 1:+26098164 None:intergenic
ATCGGGTGAATCGATTAACC+AGG 0.635046 1:-26098207 MsG0180001728.01.T01:CDS
AGGTCTTATTTATCTGCACG+AGG 0.644965 1:-26100237 MsG0180001728.01.T01:CDS
AAGCGCTATGATATCATAAG+GGG 0.648643 1:-26100269 MsG0180001728.01.T01:CDS
ATCATAAGGGGTATTGTCCG+AGG 0.648864 1:-26100257 MsG0180001728.01.T01:CDS
GCACTACCCAAAGTTGTGCA+AGG 0.648979 1:+26100642 None:intergenic
ACGTCTTAAAGAGAGCGACT+TGG 0.651880 1:-26100613 MsG0180001728.01.T01:CDS
CGTGCAGATAAATAAGACCT+CGG 0.656070 1:+26100240 None:intergenic
TGAGATCACGGTGTATAATG+CGG 0.664323 1:+26100204 None:intergenic
GCAGGCATGGAAATGCTGGA+GGG 0.667409 1:-26098486 MsG0180001728.01.T01:intron
TAGCAATATTCGCTTAGACG+AGG 0.682869 1:-26100177 MsG0180001728.01.T01:CDS
CATGAGTGCAACAACAACCA+TGG 0.689777 1:+26098346 None:intergenic
ACTCAACCTAGTAACAACTT+CGG 0.694836 1:-26100585 MsG0180001728.01.T01:intron
GATCACGGTGTATAATGCGG+AGG 0.702899 1:+26100207 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATATTATAGAAATTAATTGA+TGG - Chr1:26100409-26100428 MsG0180001728.01.T01:intron 10.0%
!! ATTAATTTCTATAATATTGT+TGG + Chr1:26100406-26100425 None:intergenic 10.0%
!! TATTATAGAAATTAATTGAT+GGG - Chr1:26100410-26100429 MsG0180001728.01.T01:intron 10.0%
!! TTAATTTCTATAATATTGTT+GGG + Chr1:26100405-26100424 None:intergenic 10.0%
!! AAATAGAATGAAATAATCAT+TGG + Chr1:26100316-26100335 None:intergenic 15.0%
!! ATAGATAATATAAAACGTTT+AGG - Chr1:26099050-26099069 MsG0180001728.01.T01:CDS 15.0%
!! GAAAAAAATTAAAGTTGTAT+TGG + Chr1:26100189-26100208 None:intergenic 15.0%
!! TTAATAAGCTCATAAATATT+TGG + Chr1:26098906-26098925 None:intergenic 15.0%
!!! AAAAAATAGTATTGCTTTTT+AGG + Chr1:26099394-26099413 None:intergenic 15.0%
!!! AAACAATTTTGAAATTCATA+TGG - Chr1:26098616-26098635 MsG0180001728.01.T01:intron 15.0%
!!! AAAGCAATACTATTTTTTAT+TGG - Chr1:26099396-26099415 MsG0180001728.01.T01:intron 15.0%
!!! ATTAATTTCATTTTGTTACT+TGG - Chr1:26099526-26099545 MsG0180001728.01.T01:intron 15.0%
!! ATGAAATTAATATCTTACTC+AGG + Chr1:26099517-26099536 None:intergenic 20.0%
!! CATAAAAATAGTACAAACAT+TGG - Chr1:26100003-26100022 MsG0180001728.01.T01:intron 20.0%
!! GAAATTCAAATTTAACAGTT+TGG - Chr1:26098412-26098431 MsG0180001728.01.T01:CDS 20.0%
!! TAAATATTTGGAAACTTACT+AGG + Chr1:26098894-26098913 None:intergenic 20.0%
!! TAAGCTTTCTCTATATTAAT+TGG - Chr1:26099876-26099895 MsG0180001728.01.T01:intron 20.0%
!! TGAAATTAATATCTTACTCA+GGG + Chr1:26099516-26099535 None:intergenic 20.0%
!! TGGGTATAAAAAAAAAATTG+AGG - Chr1:26099434-26099453 MsG0180001728.01.T01:intron 20.0%
!!! AACAATTTTTTTTGCTAAAG+CGG + Chr1:26100141-26100160 None:intergenic 20.0%
!!! GTCTTTTTCTTATAAAGTAA+GGG - Chr1:26100268-26100287 MsG0180001728.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGTCTTTTTCTTATAAAGTA+AGG - Chr1:26100267-26100286 MsG0180001728.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTGAAATTCATATGGTAT+TGG - Chr1:26098622-26098641 MsG0180001728.01.T01:intron 20.0%
! AAAAACTATGAACTTCCTAA+TGG - Chr1:26099265-26099284 MsG0180001728.01.T01:intron 25.0%
! AACATTAAACACATTTACAC+TGG - Chr1:26099647-26099666 MsG0180001728.01.T01:intron 25.0%
! AACTCTTCGTATTGTATATT+TGG - Chr1:26099152-26099171 MsG0180001728.01.T01:intron 25.0%
! AATGGACAAGTTATCATAAT+TGG - Chr1:26099283-26099302 MsG0180001728.01.T01:intron 25.0%
! AGACATGTAAGATTATTAAG+AGG - Chr1:26099182-26099201 MsG0180001728.01.T01:intron 25.0%
! AGATTATTAAGAGGTCAATT+TGG - Chr1:26099191-26099210 MsG0180001728.01.T01:intron 25.0%
! AGTCTTGATTACTTCATATT+CGG - Chr1:26098547-26098566 MsG0180001728.01.T01:intron 25.0%
! ATGGACAAGTTATCATAATT+GGG - Chr1:26099284-26099303 MsG0180001728.01.T01:intron 25.0%
! ATGGTTTCAATATTAAAGAG+TGG - Chr1:26098178-26098197 MsG0180001728.01.T01:CDS 25.0%
! CAAAATGATATGTGCTTAAA+AGG + Chr1:26099737-26099756 None:intergenic 25.0%
! GAAATTAATATCTTACTCAG+GGG + Chr1:26099515-26099534 None:intergenic 25.0%
! GGAAATACAAGTAAAATTGT+TGG - Chr1:26098866-26098885 MsG0180001728.01.T01:intron 25.0%
! TATAATTGAATCGCTACATA+CGG + Chr1:26099816-26099835 None:intergenic 25.0%
!! ATTATCTAGAGTAGATAATG+TGG - Chr1:26099219-26099238 MsG0180001728.01.T01:intron 25.0%
!! ATTATGATAACTTGTCCATT+AGG + Chr1:26099283-26099302 None:intergenic 25.0%
!!! TAAAAATAAGCAGGTTTTGA+AGG + Chr1:26100668-26100687 None:intergenic 25.0%
!!! TCAAAACCTGCTTATTTTTA+TGG - Chr1:26100668-26100687 MsG0180001728.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGTCTTTAGTTTTGGATTAT+TGG - Chr1:26099960-26099979 MsG0180001728.01.T01:intron 25.0%
AAACATGAGCAAATTATTGC+AGG - Chr1:26100454-26100473 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
AAATAGTACAAACATTGGTC+AGG - Chr1:26100008-26100027 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
AAATTGTGTGAGAGAAAAGT+TGG + Chr1:26100229-26100248 None:intergenic 30.0%
AATAGTACAAACATTGGTCA+GGG - Chr1:26100009-26100028 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
AATATAGGTTCAACAACATC+GGG - Chr1:26100734-26100753 MsG0180001728.01.T01:CDS 30.0%
AATCAACCATAAGTAAGATC+AGG - Chr1:26098940-26098959 MsG0180001728.01.T01:CDS 30.0%
AATCCAAAATCGGATATCTT+AGG + Chr1:26098815-26098834 None:intergenic 30.0%
ATCAACCATAAGTAAGATCA+GGG - Chr1:26098941-26098960 MsG0180001728.01.T01:CDS 30.0%
ATTGGAGATACTATTACTAC+TGG - Chr1:26099414-26099433 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
CAATATAGGTTCAACAACAT+CGG - Chr1:26100733-26100752 MsG0180001728.01.T01:CDS 30.0%
GTATGTAGCGATTCAATTAT+AGG - Chr1:26099815-26099834 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
TAAGTTTCGATGTTGAAGTT+TGG + Chr1:26098458-26098477 None:intergenic 30.0%
TACTTGGTTTCAGTTTAGAA+GGG - Chr1:26098485-26098504 MsG0180001728.01.T01:CDS 30.0%
TGATATGTGCTTAAAAGGTT+TGG + Chr1:26099732-26099751 None:intergenic 30.0%
TGGACAAGTTATCATAATTG+GGG - Chr1:26099285-26099304 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
TTCAACATCGAAACTTAGTT+AGG - Chr1:26098461-26098480 MsG0180001728.01.T01:CDS 30.0%
TTGGAGATACTATTACTACT+GGG - Chr1:26099415-26099434 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
! AAAGCGCTATGATATCATAA+GGG - Chr1:26098688-26098707 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
! AATCCTAAGATATCCGATTT+TGG - Chr1:26098809-26098828 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
! ATTTTCTTGAACACAGAGTA+AGG + Chr1:26100576-26100595 None:intergenic 30.0%
! CTTTTAAGCACATATCACTT+TGG - Chr1:26099611-26099630 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
! TAAGATATCCGATTTTGGAT+TGG - Chr1:26098814-26098833 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
! TGGACAATTTTCGGTAAAAT+CGG - Chr1:26099936-26099955 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
! TTCGTATTGTATATTTGGTG+AGG - Chr1:26099157-26099176 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
! TTTGTTATCGATCAAAGTGA+AGG - Chr1:26098845-26098864 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
!! AAAAGCGCTATGATATCATA+AGG - Chr1:26098687-26098706 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
!! AAATCGGATGTCTTTAGTTT+TGG - Chr1:26099952-26099971 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
!! TGGTTCTTGAGATTTTAAGT+GGG - Chr1:26099980-26099999 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
!! TTGGTTCTTGAGATTTTAAG+TGG - Chr1:26099979-26099998 MsG0180001728.01.T01:intron 30.0%
AAGCGCTATGATATCATAAG+GGG - Chr1:26098689-26098708 MsG0180001728.01.T01:intron 35.0%
ACTCAACCTAGTAACAACTT+CGG - Chr1:26098373-26098392 MsG0180001728.01.T01:CDS 35.0%
ACTTCCATTCCAATCATAGA+TGG + Chr1:26099346-26099365 None:intergenic 35.0%
CAATCATAGATGGCTGTAAA+AGG + Chr1:26099336-26099355 None:intergenic 35.0%
CCACTTCCATAAAAATAAGC+AGG + Chr1:26100677-26100696 None:intergenic 35.0%
CTACTTGGTTTCAGTTTAGA+AGG - Chr1:26098484-26098503 MsG0180001728.01.T01:CDS 35.0%
CTTCGGTAGATGATAGAATT+TGG - Chr1:26098390-26098409 MsG0180001728.01.T01:CDS 35.0%
GAGAATTACACCCTCAAATA+TGG + Chr1:26098212-26098231 None:intergenic 35.0%
GGTCTTAGTACCATATTTGA+GGG - Chr1:26098199-26098218 MsG0180001728.01.T01:CDS 35.0%
TGCTGGAATGGAGATATTAA+GGG - Chr1:26099366-26099385 MsG0180001728.01.T01:intron 35.0%
TTAATCGAACAGTTGTAGCT+GGG - Chr1:26098257-26098276 MsG0180001728.01.T01:CDS 35.0%
TTGCTGGAATGGAGATATTA+AGG - Chr1:26099365-26099384 MsG0180001728.01.T01:intron 35.0%
TTGCTTCAGTAAATACACGT+AGG + Chr1:26099121-26099140 None:intergenic 35.0%
! ATAGATCAGTATTTGAAGCC+TGG + Chr1:26100772-26100791 None:intergenic 35.0%
! CAGAAGAGCACAATTGAATT+GGG - Chr1:26098664-26098683 MsG0180001728.01.T01:intron 35.0%
! CGAATGAAGACTCTTTTTGA+AGG + Chr1:26099082-26099101 None:intergenic 35.0%
! CTTTTACAGCCATCTATGAT+TGG - Chr1:26099334-26099353 MsG0180001728.01.T01:intron 35.0%
! GCTGAAATGTTGTTTAATGC+TGG + Chr1:26100524-26100543 None:intergenic 35.0%
! TGCAATGCATGGACAATTTT+CGG - Chr1:26099927-26099946 MsG0180001728.01.T01:intron 35.0%
! TGGTCTTAGTACCATATTTG+AGG - Chr1:26098198-26098217 MsG0180001728.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGCGACACTCATTTTGAAA+CGG - Chr1:26100359-26100378 MsG0180001728.01.T01:intron 35.0%
!! AAGCGGCACTCATTTTAAAA+CGG + Chr1:26100124-26100143 None:intergenic 35.0%
!! CTATATTAATTGGCTTGCAG+TGG - Chr1:26099886-26099905 MsG0180001728.01.T01:intron 35.0%
!! TATTGCTAGCTTTGAGATCA+CGG + Chr1:26098769-26098788 None:intergenic 35.0%
!! TTCAAAATGAGTGTCGCTTT+AGG + Chr1:26100179-26100160 None:intergenic 35.0%
!!! AGTTTGGCTACTGTTGTTTT+TGG + Chr1:26098442-26098461 None:intergenic 35.0%
!!! CCTGCTTATTTTTATGGAAG+TGG - Chr1:26100674-26100693 MsG0180001728.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTGATGGGCTAATTGCATTT+TGG - Chr1:26100425-26100444 MsG0180001728.01.T01:intron 35.0%
AAAGTTGGAGAGGGTAAAGT+TGG + Chr1:26100214-26100233 None:intergenic 40.0%
AAGTGGAATTAGAAGCCTAC+AGG - Chr1:26100691-26100710 MsG0180001728.01.T01:CDS 40.0%
AATTAGAAGCCTACAGGACA+TGG - Chr1:26100697-26100716 MsG0180001728.01.T01:CDS 40.0%
ACAGCCATCTATGATTGGAA+TGG - Chr1:26099339-26099358 MsG0180001728.01.T01:intron 40.0%
AGTCTACCTTGCACAACTTT+GGG - Chr1:26098310-26098329 MsG0180001728.01.T01:CDS 40.0%
ATGATTGGAATGGAAGTTGC+TGG - Chr1:26099349-26099368 MsG0180001728.01.T01:intron 40.0%
ATGGCTGTAAAAGGACTTCT+AGG + Chr1:26099327-26099346 None:intergenic 40.0%
CAATCTCGCCAATCCAAAAT+CGG + Chr1:26098825-26098844 None:intergenic 40.0%
CATCTACCGAAGTTGTTACT+AGG + Chr1:26098382-26098401 None:intergenic 40.0%
CCAATTCAATTGTGCTCTTC+TGG + Chr1:26098666-26098685 None:intergenic 40.0%
CGAAACTTAGTTAGGCTACT+TGG - Chr1:26098469-26098488 MsG0180001728.01.T01:CDS 40.0%
CGTGCAGATAAATAAGACCT+CGG + Chr1:26098721-26098740 None:intergenic 40.0%
CTGGAATGGAGATATTAAGG+GGG - Chr1:26099368-26099387 MsG0180001728.01.T01:intron 40.0%
GCTGGAATGGAGATATTAAG+GGG - Chr1:26099367-26099386 MsG0180001728.01.T01:intron 40.0%
GTAAAAGGACTTCTAGGCAA+CGG + Chr1:26099321-26099340 None:intergenic 40.0%
GTTAATCGAACAGTTGTAGC+TGG - Chr1:26098256-26098275 MsG0180001728.01.T01:CDS 40.0%
TAGCAATATTCGCTTAGACG+AGG - Chr1:26098781-26098800 MsG0180001728.01.T01:intron 40.0%
TAGTCTACCTTGCACAACTT+TGG - Chr1:26098309-26098328 MsG0180001728.01.T01:CDS 40.0%
TGAGATCACGGTGTATAATG+CGG + Chr1:26098757-26098776 None:intergenic 40.0%
TGAGCAAATTATTGCAGGCA+TGG - Chr1:26100459-26100478 MsG0180001728.01.T01:intron 40.0%
TGTGAGAGAAAAGTTGGAGA+GGG + Chr1:26100223-26100242 None:intergenic 40.0%
TTATCATAATTGGGGCTGAG+AGG - Chr1:26099293-26099312 MsG0180001728.01.T01:intron 40.0%
! CCAGAAGAGCACAATTGAAT+TGG - Chr1:26098663-26098682 MsG0180001728.01.T01:intron 40.0%
!! AGGTCTTATTTATCTGCACG+AGG - Chr1:26098721-26098740 MsG0180001728.01.T01:intron 40.0%
!! ATTGGCTTGCAGTGGATATA+TGG - Chr1:26099894-26099913 MsG0180001728.01.T01:intron 40.0%
!! GCTCTCTTTAAGACGTTTCA+TGG + Chr1:26098341-26098360 None:intergenic 40.0%
!!! GACACTCATTTTGAAACGGA+GGG - Chr1:26100363-26100382 MsG0180001728.01.T01:intron 40.0%
!!! GGCACTCATTTTAAAACGGA+GGG + Chr1:26100120-26100139 None:intergenic 40.0%
AAAATTGAGGCCCATCCTTG+AGG - Chr1:26099447-26099466 MsG0180001728.01.T01:intron 45.0%
AAATTGAGGCCCATCCTTGA+GGG - Chr1:26099448-26099467 MsG0180001728.01.T01:intron 45.0%
ACGTCTTAAAGAGAGCGACT+TGG - Chr1:26098345-26098364 MsG0180001728.01.T01:CDS 45.0%
AGTGCAACAACAACCATGGT+TGG + Chr1:26100611-26100630 None:intergenic 45.0%
ATCGGGTGAATCGATTAACC+AGG - Chr1:26100751-26100770 MsG0180001728.01.T01:CDS 45.0%
CATGAGTGCAACAACAACCA+TGG + Chr1:26100615-26100634 None:intergenic 45.0%
CCTACAGGACATGGAGTTAT+GGG - Chr1:26100706-26100725 MsG0180001728.01.T01:CDS 45.0%
GTGTGAGAGAAAAGTTGGAG+AGG + Chr1:26100224-26100243 None:intergenic 45.0%
TATTGCAGGCATGGAAATGC+TGG - Chr1:26100468-26100487 MsG0180001728.01.T01:intron 45.0%
TGGAATGGAAGTTGCTGGAA+TGG - Chr1:26099354-26099373 MsG0180001728.01.T01:intron 45.0%
TGTAGTTGACAGACCAACCA+TGG - Chr1:26100595-26100614 MsG0180001728.01.T01:CDS 45.0%
TGTCCATGCATTGCATACTC+AGG + Chr1:26099922-26099941 None:intergenic 45.0%
TTCAATTGTGCTCTTCTGGC+TGG + Chr1:26098662-26098681 None:intergenic 45.0%
!! ATCATAAGGGGTATTGTCCG+AGG - Chr1:26098701-26098720 MsG0180001728.01.T01:intron 45.0%
!! ATGAGTGTCGCTTTAGGCTT+TGG + Chr1:26100352-26100371 None:intergenic 45.0%
!! GAGTTATGGGCTGGCAATAT+AGG - Chr1:26100719-26100738 MsG0180001728.01.T01:CDS 45.0%
!!! CGACACTCATTTTGAAACGG+AGG - Chr1:26100362-26100381 MsG0180001728.01.T01:intron 45.0%
!!! CGGCACTCATTTTAAAACGG+AGG + Chr1:26100121-26100140 None:intergenic 45.0%
CCCATAACTCCATGTCCTGT+AGG + Chr1:26100709-26100728 None:intergenic 50.0%
GACGGCCCTGATCTTACTTA+TGG + Chr1:26098949-26098968 None:intergenic 50.0%
GATCACGGTGTATAATGCGG+AGG + Chr1:26098754-26098773 None:intergenic 50.0%
GCAAACAGCTCAAACGAGCT+GGG + Chr1:26099477-26099496 None:intergenic 50.0%
GCACCTGAGTATGCAATGCA+TGG - Chr1:26099916-26099935 MsG0180001728.01.T01:intron 50.0%
GCACTACCCAAAGTTGTGCA+AGG + Chr1:26098319-26098338 None:intergenic 50.0%
GCCTACAGGACATGGAGTTA+TGG - Chr1:26100705-26100724 MsG0180001728.01.T01:CDS 50.0%
TCGGCTCAGGGAATGAAAAG+AGG - Chr1:26098986-26099005 MsG0180001728.01.T01:CDS 50.0%
TGCAAACAGCTCAAACGAGC+TGG + Chr1:26099478-26099497 None:intergenic 50.0%
TGTTTATCCTGGAGGTGGCA+TGG - Chr1:26098282-26098301 MsG0180001728.01.T01:CDS 50.0%
! GTAGCTGGGCTTGTTTATCC+TGG - Chr1:26098271-26098290 MsG0180001728.01.T01:CDS 50.0%
AGCCTCCGAATTCTCAGGGA+CGG + Chr1:26098967-26098986 None:intergenic 55.0%
CAGGACATGGAGTTATGGGC+TGG - Chr1:26100710-26100729 MsG0180001728.01.T01:CDS 55.0%
CATGGAAATGCTGGAGGGAG+GGG - Chr1:26100477-26100496 MsG0180001728.01.T01:intron 55.0%
CTATCAACCATGCCACCTCC+AGG + Chr1:26098292-26098311 None:intergenic 55.0%
GCAGGCATGGAAATGCTGGA+GGG - Chr1:26100472-26100491 MsG0180001728.01.T01:intron 55.0%
GCATGGAAATGCTGGAGGGA+GGG - Chr1:26100476-26100495 MsG0180001728.01.T01:intron 55.0%
TCCCTGAGAATTCGGAGGCT+CGG - Chr1:26098967-26098986 MsG0180001728.01.T01:CDS 55.0%
TGCAGGCATGGAAATGCTGG+AGG - Chr1:26100471-26100490 MsG0180001728.01.T01:intron 55.0%
! GCTGGGCTTGTTTATCCTGG+AGG - Chr1:26098274-26098293 MsG0180001728.01.T01:CDS 55.0%
! GGGCTTGTTTATCCTGGAGG+TGG - Chr1:26098277-26098296 MsG0180001728.01.T01:CDS 55.0%
AGAATTCGGAGGCTCGGCTC+AGG - Chr1:26098973-26098992 MsG0180001728.01.T01:CDS 60.0%
AGCCGAGCCTCCGAATTCTC+AGG + Chr1:26098972-26098991 None:intergenic 60.0%
CAGGGCCGTCCCTGAGAATT+CGG - Chr1:26098959-26098978 MsG0180001728.01.T01:CDS 60.0%
GAATTCGGAGGCTCGGCTCA+GGG - Chr1:26098974-26098993 MsG0180001728.01.T01:CDS 60.0%
GAGCTGTTTGCACCCCCTCA+GGG - Chr1:26099486-26099505 MsG0180001728.01.T01:intron 60.0%
GCCGAGCCTCCGAATTCTCA+GGG + Chr1:26098971-26098990 None:intergenic 60.0%
GGCATGGAAATGCTGGAGGG+AGG - Chr1:26100475-26100494 MsG0180001728.01.T01:intron 60.0%
TGAGCTGTTTGCACCCCCTC+AGG - Chr1:26099485-26099504 MsG0180001728.01.T01:intron 60.0%
TTGAGGCCCATCCTTGAGGG+AGG - Chr1:26099451-26099470 MsG0180001728.01.T01:intron 60.0%
!! TTACTCAGGGGCGTCCCTGA+GGG + Chr1:26099503-26099522 None:intergenic 60.0%
AACGAGCTGGGCCTCCCTCA+AGG + Chr1:26099465-26099484 None:intergenic 65.0%
AGCTGGGCCTCCCTCAAGGA+TGG + Chr1:26099461-26099480 None:intergenic 65.0%
GCTGGGCCTCCCTCAAGGAT+GGG + Chr1:26099460-26099479 None:intergenic 65.0%
GGCCGTCCCTGAGAATTCGG+AGG - Chr1:26098962-26098981 MsG0180001728.01.T01:CDS 65.0%
!! CTTACTCAGGGGCGTCCCTG+AGG + Chr1:26099504-26099523 None:intergenic 65.0%
!! TACTCAGGGGCGTCCCTGAG+GGG + Chr1:26099502-26099521 None:intergenic 65.0%
!! ACTCAGGGGCGTCCCTGAGG+GGG + Chr1:26099501-26099520 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 26098178 26100802 26098178 ID=MsG0180001728.01;Name=MsG0180001728.01
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Chr1 exon 26098921 26099074 26098921 ID=MsG0180001728.01.T01:exon:41024;Parent=MsG0180001728.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0180001728.01.T01

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Protein sequence

>MsG0180001728.01.T01

MVSILKSGLSTIFEGVILERFFYSAVVNRTVVAGLVYPGGGMVDSLPCTTLGSAMKRLKESDLVVTQPSNNFDPARRAQLNWEKRYDIIRGIVRGLIYLHEDSCLRIIHRDLKASNIRLDEEMNPKISDFGLARLFVIDQSEGNTSKIVGTYGYMAPEYAMHGQFSVKSDVFSFGLLVLEILSGHKNSTNIGQGNDVDYLLSYAWKCWREGKAQNMIDPALNNISANEIMRCIHIALLCVQENVVDRPTMVVVALMLNSYSLTLSIPSKPAYFYGSGIRSLQDMELWAGNIGSTTSGESINQASNTDLYPR*