AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380012602.01

Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g025260 96.899 129 4 0 1 129 1 129 2.71e-86 261
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g025230 82.946 129 22 0 1 129 1 129 2.23e-64 204
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g024520 82.946 129 22 0 1 129 1 129 2.56e-64 204
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g109470 66.667 129 42 1 1 129 1 128 1.91e-49 165
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g436390 54.808 104 47 0 26 129 30 133 1.07e-36 131
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g436540 47.581 124 65 0 6 129 14 137 2.91e-35 127
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g057860 44.355 124 65 1 10 129 11 134 2.33e-34 125
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g020940 45.385 130 67 1 4 133 12 137 1.50e-33 123
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g057800 52.041 98 47 0 32 129 36 133 3.05e-33 122
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g091690 44.800 125 67 1 5 129 3 125 2.07e-31 117
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g073250 45.528 123 64 2 10 129 15 137 1.17e-30 115
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g057980 46.667 135 65 4 1 129 1 134 1.84e-30 114
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g057970 45.802 131 69 2 1 129 1 131 2.69e-30 114
MsG0380012602.01.T01 MTR_6g084770 45.902 122 63 1 11 129 13 134 4.93e-30 113
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g104080 51.546 97 47 0 33 129 37 133 7.02e-30 109
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g057910 46.296 108 58 0 26 133 32 139 9.73e-30 112
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g057900 48.148 135 63 5 1 129 1 134 1.10e-29 112
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g019010 39.706 136 77 2 1 133 5 138 2.62e-29 111
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g023700 49.180 122 58 3 21 140 24 143 3.10e-29 111
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g070690 42.063 126 72 1 5 129 7 132 3.20e-29 111
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g070800 42.063 126 72 1 5 129 7 132 3.20e-29 111
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g020950 43.846 130 72 1 4 133 11 139 6.59e-29 110
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g073230 46.610 118 60 2 14 129 23 139 6.75e-29 110
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g023730 50.000 110 52 2 21 129 23 130 1.03e-28 109
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g070980 39.695 131 71 1 7 129 4 134 1.25e-28 105
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g073240 40.323 124 71 2 9 129 58 181 1.43e-28 103
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g094540 42.969 128 70 2 5 129 10 137 1.56e-28 109
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g020960 41.270 126 72 1 4 129 11 134 1.67e-28 109
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g023720 52.336 107 49 2 24 129 25 130 1.92e-28 108
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g058390 41.538 130 75 1 1 129 4 133 2.43e-28 108
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g018990 42.105 133 71 3 1 129 5 135 4.10e-28 108
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g070700 36.986 146 81 2 7 141 4 149 4.84e-28 107
MsG0380012602.01.T01 MTR_7g092620 39.370 127 69 2 3 129 13 131 5.29e-28 107
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g070710 42.105 133 73 1 1 129 1 133 1.09e-27 107
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g094535 42.969 128 69 3 6 129 10 137 1.34e-27 102
MsG0380012602.01.T01 MTR_0554s0020 39.552 134 78 2 3 133 6 139 1.68e-27 106
MsG0380012602.01.T01 MTR_2g065360 50.000 98 49 0 32 129 7 104 1.74e-27 106
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g076560 41.600 125 71 1 5 129 26 148 2.19e-27 106
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g094840 40.909 132 72 2 4 129 11 142 4.00e-27 105
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g076530 44.538 119 66 0 11 129 19 137 4.47e-27 105
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g058210 41.935 124 70 2 8 129 12 135 5.14e-27 105
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g058250 41.406 128 74 1 3 129 6 133 5.71e-27 104
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g070920 40.458 131 70 1 7 129 4 134 1.10e-26 103
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g070850 38.298 141 76 2 12 141 9 149 1.18e-26 103
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g058060 40.411 146 80 4 5 143 9 154 1.96e-26 103
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g094550 39.844 128 74 2 5 129 10 137 3.08e-26 102
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g471620 33.582 134 86 1 11 141 16 149 3.47e-26 98.2
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g058220 41.463 123 71 1 8 129 12 134 3.76e-26 102
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g094520 43.750 128 68 3 6 129 41 168 4.01e-26 102
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g035190 45.714 105 56 1 26 129 14 118 4.83e-26 102
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g094570 39.844 128 74 2 5 129 10 137 6.95e-26 102
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g095290 39.062 128 77 1 3 129 12 139 1.55e-25 100
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g133750 40.909 132 70 3 5 129 7 137 1.56e-25 100
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g076290 41.667 108 60 1 22 129 28 132 1.80e-25 100
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g058000 41.259 143 77 3 8 143 12 154 1.98e-25 100
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g058400 41.481 135 73 3 1 129 1 135 2.36e-25 100
MsG0380012602.01.T01 MTR_6g035100 38.760 129 75 2 5 129 7 135 3.40e-25 99.8
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g470730 40.476 126 74 1 5 129 9 134 3.41e-25 99.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g018980 42.727 110 60 1 23 129 25 134 3.82e-25 99.8
MsG0380012602.01.T01 MTR_7g087520 42.857 98 56 0 32 129 37 134 4.00e-25 99.8
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g078110 49.515 103 50 2 28 129 24 125 5.11e-25 99.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_7g103450 42.735 117 64 1 13 129 30 143 7.12e-25 99.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_0608s0010 42.609 115 64 1 17 129 17 131 7.16e-25 97.8
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g035140 40.625 128 74 2 3 129 9 135 9.80e-25 98.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g104550 43.396 106 60 0 23 128 19 124 1.15e-24 98.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g094660 44.037 109 59 1 23 129 29 137 1.20e-24 98.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g073320 43.636 110 59 1 23 129 29 138 1.28e-24 98.2
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g071710 35.294 119 77 0 11 129 16 134 1.29e-24 98.2
MsG0380012602.01.T01 MTR_6g462640 40.650 123 71 2 8 129 12 133 1.98e-24 97.8
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g031700 42.241 116 65 1 16 129 16 131 2.46e-24 97.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g046210 42.400 125 64 2 11 129 16 138 3.06e-24 97.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g058240 45.455 99 53 1 32 129 1 99 3.71e-24 97.1
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g046240 42.276 123 67 2 11 129 16 138 5.06e-24 96.7
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g095260 40.367 109 64 1 22 129 31 139 7.82e-24 96.3
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g094560 38.281 128 76 2 5 129 10 137 7.95e-24 96.3
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g442730 39.844 128 74 2 5 129 5 132 8.83e-24 95.9
MsG0380012602.01.T01 MTR_6g039630 44.348 115 59 2 32 141 34 148 1.07e-23 93.2
MsG0380012602.01.T01 MTR_0059s0170 38.462 130 77 3 3 129 6 135 1.31e-23 95.5
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g104610 40.476 126 73 1 3 128 1 124 1.44e-23 95.5
MsG0380012602.01.T01 MTR_7g012330 41.525 118 65 2 16 129 15 132 1.67e-23 95.1
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g058110 39.860 143 75 4 8 141 12 152 1.67e-23 95.1
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g466180 36.667 150 88 3 1 143 1 150 3.08e-23 94.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_7g012860 42.202 109 62 1 22 129 23 131 3.21e-23 94.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_0287s0060 42.202 109 62 1 22 129 23 131 3.21e-23 94.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_0181s0030 37.705 122 76 0 8 129 10 131 3.35e-23 94.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_2g010530 42.424 99 56 1 32 129 34 132 6.51e-23 93.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_6g034965 37.600 125 74 2 9 129 11 135 2.73e-22 91.7
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g070685 50.000 78 39 0 33 110 39 116 2.83e-22 85.5
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g103670 40.984 122 69 2 11 129 10 131 3.16e-22 91.7
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g062500 42.000 100 58 0 30 129 33 132 3.71e-22 91.3
MsG0380012602.01.T01 MTR_6g008530 39.535 129 71 4 6 129 14 140 3.84e-22 91.3
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g104660 41.322 121 67 2 11 129 25 143 4.85e-22 91.3
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g021390 41.237 97 57 0 33 129 45 141 6.16e-22 90.9
MsG0380012602.01.T01 MTR_7g075390 37.302 126 79 0 5 130 7 132 6.18e-22 90.9
MsG0380012602.01.T01 MTR_6g035115 43.434 99 55 1 32 129 37 135 6.40e-22 90.9
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g018480 41.414 99 56 1 33 129 41 139 6.54e-22 89.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g037370 44.444 108 55 3 32 135 31 137 1.17e-21 90.1
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g102310 41.379 116 68 0 14 129 21 136 1.74e-21 89.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g094460 38.519 135 77 4 12 140 7 141 1.97e-21 88.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g103680 34.375 128 83 1 2 129 6 132 1.98e-21 89.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g048580 36.290 124 76 2 9 129 14 137 2.40e-21 89.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g020780 34.375 128 80 2 2 129 9 132 3.25e-21 88.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_0638s0020 49.412 85 43 0 32 116 7 91 4.94e-21 87.8
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g097240 40.909 132 69 5 13 140 12 138 6.39e-21 87.8
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g016410 37.692 130 74 1 9 131 2 131 6.65e-21 87.8
MsG0380012602.01.T01 MTR_2g073440 37.209 129 76 1 1 129 7 130 9.39e-21 87.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g007460 42.857 98 56 0 32 129 9 106 1.01e-20 87.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_7g075610 37.795 127 77 1 3 129 7 131 1.15e-20 87.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_7g056103 40.833 120 67 2 11 129 15 131 1.17e-20 87.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_2g073420 39.130 115 67 1 25 136 37 151 2.40e-20 86.3
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g089025 38.060 134 79 2 3 132 20 153 2.45e-20 86.3
MsG0380012602.01.T01 MTR_0171s0010 43.000 100 53 2 33 129 36 134 2.55e-20 86.3
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g026070 38.333 120 73 1 11 129 8 127 3.55e-20 84.3
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g089030 38.931 131 70 3 8 128 14 144 5.07e-20 85.5
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g057880 43.750 80 44 1 11 89 39 118 8.25e-20 79.7
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g089055 42.268 97 56 0 32 128 52 148 9.73e-20 84.7
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g465300 31.061 132 87 2 4 132 20 150 1.05e-19 84.3
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g095050 39.831 118 70 1 12 129 12 128 1.66e-19 84.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g016440 39.167 120 70 2 10 129 12 128 2.31e-19 83.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g089020 41.509 106 62 0 23 128 21 126 3.42e-19 82.8
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g094772 42.424 99 56 1 32 129 33 131 4.65e-19 82.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g025980 40.000 110 63 2 23 129 19 128 5.35e-19 82.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g026050 38.760 129 74 3 2 129 3 127 6.07e-19 82.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_6g008430 35.156 128 77 3 6 129 13 138 6.94e-19 82.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_0155s0010 43.158 95 54 0 35 129 20 114 6.99e-19 77.8
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g072980 42.424 99 56 1 32 129 33 131 7.03e-19 82.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g072930 42.424 99 56 1 32 129 33 131 7.03e-19 82.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g007550 36.641 131 80 2 1 129 10 139 7.77e-19 82.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g104640 41.818 110 59 2 22 129 41 147 1.08e-18 81.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_0022s0290 35.433 127 80 2 3 128 12 137 1.10e-18 81.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g088425 35.537 121 75 2 26 143 33 153 1.16e-18 81.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_7g027960 35.385 130 81 3 1 129 1 128 1.41e-18 81.3
MsG0380012602.01.T01 MTR_7g028020 35.385 130 81 3 1 129 1 128 1.56e-18 81.3
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g007450 37.190 121 73 2 11 129 20 139 1.74e-18 80.9
MsG0380012602.01.T01 MTR_2g450040 32.331 133 82 3 4 129 7 138 1.83e-18 80.9
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g055325 37.143 105 66 0 25 129 47 151 3.30e-18 80.1
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g023680 40.000 100 59 1 31 129 4 103 3.78e-18 80.1
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g467220 32.308 130 81 3 3 128 18 144 5.44e-18 79.7
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g025950 38.679 106 64 1 25 129 22 127 7.85e-18 78.2
MsG0380012602.01.T01 MTR_6g008500 34.848 132 80 4 1 129 8 136 8.00e-18 79.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g088400 36.449 107 66 1 25 129 39 145 8.82e-18 79.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_0171s0020 35.714 98 62 1 33 129 37 134 1.07e-17 78.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g073020 43.434 99 55 1 32 129 33 131 1.13e-17 78.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_6g008620 34.167 120 74 3 13 129 23 140 1.17e-17 78.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g077460 38.776 98 60 0 32 129 7 104 1.93e-17 77.8
MsG0380012602.01.T01 MTR_7g092600 38.095 105 62 1 41 142 48 152 2.03e-17 77.8
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g091680 54.688 64 29 0 43 106 39 102 3.12e-17 77.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g091010 33.058 121 79 1 11 129 10 130 3.50e-17 77.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_6g008600 34.375 128 78 4 6 129 14 139 4.25e-17 77.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_6g042610 33.871 124 77 3 8 129 13 133 4.53e-17 77.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g025970 40.816 98 57 1 33 129 30 127 4.54e-17 77.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g467290 30.769 130 84 2 3 129 24 150 4.84e-17 77.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g469300 39.744 78 47 0 52 129 55 132 7.16e-17 76.3
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g045770 39.796 98 58 1 33 129 30 127 8.04e-17 76.3
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g062530 40.449 89 52 1 41 129 44 131 1.05e-16 75.9
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g094775 36.220 127 80 1 3 129 4 129 1.33e-16 75.5
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g035330 39.167 120 65 3 11 129 16 128 1.43e-16 75.5
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g018800 32.787 122 77 3 11 129 19 138 1.96e-16 75.1
MsG0380012602.01.T01 MTR_6g042540 32.258 124 79 3 8 129 13 133 3.26e-16 74.3
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g094670 34.677 124 59 4 9 129 14 118 3.29e-16 73.2
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g091023 33.607 122 78 2 11 129 10 131 9.02e-16 73.2
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g095220 35.398 113 53 3 22 129 14 111 9.26e-16 73.2
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g102280 45.349 86 47 0 44 129 56 141 9.43e-16 73.2
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g088415 37.500 104 63 1 28 129 40 143 1.04e-15 72.8
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g014880 35.115 131 79 4 2 129 11 138 1.12e-15 72.8
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g062510 36.782 87 55 0 43 129 48 134 1.68e-15 72.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g026200 40.404 99 56 2 33 129 30 127 1.70e-15 72.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g116890 38.235 102 58 3 32 129 34 134 2.03e-15 72.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g107295 35.632 87 56 0 43 129 49 135 2.26e-15 72.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g073950 31.579 133 81 4 2 129 13 140 2.54e-15 72.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g091003 32.787 122 79 1 11 129 10 131 2.59e-15 72.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g107305 35.632 87 56 0 43 129 49 135 1.07e-14 69.7
MsG0380012602.01.T01 MTR_6g008640 34.211 114 70 3 18 129 28 138 1.25e-14 70.1
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g088160 37.736 106 62 4 30 132 32 136 2.84e-14 68.9
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g073960 28.467 137 84 4 2 129 13 144 3.63e-14 68.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g111240 36.697 109 61 3 41 141 74 182 4.13e-14 68.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_1g492820 31.496 127 82 3 10 132 24 149 4.34e-14 68.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_6g008650 33.333 117 73 3 15 129 25 138 4.62e-14 68.2
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g075450 33.333 105 69 1 26 129 27 131 5.19e-14 68.2
MsG0380012602.01.T01 MTR_6g008630 31.068 103 67 2 11 111 22 122 9.91e-14 67.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_2g437840 35.200 125 81 0 5 129 4 128 1.23e-13 67.0
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g088195 34.906 106 65 4 30 132 32 136 6.95e-13 65.1
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g034900 35.556 135 82 3 1 131 1 134 8.58e-13 64.7
MsG0380012602.01.T01 MTR_4g088170 34.906 106 65 4 30 132 32 136 9.75e-13 64.7
MsG0380012602.01.T01 MTR_7g075580 41.406 128 69 3 5 129 7 131 1.15e-12 64.3
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g012585 40.845 71 42 0 59 129 1 71 1.29e-12 64.3
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g058230 42.857 63 36 0 67 129 1 63 2.19e-12 63.5
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g036185 38.202 89 54 1 42 129 44 132 2.93e-12 63.2
MsG0380012602.01.T01 MTR_3g467200 31.776 107 68 2 41 142 59 165 3.40e-12 63.2
MsG0380012602.01.T01 MTR_7g075540 41.732 127 72 1 3 129 7 131 5.19e-12 62.4
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g012590 27.826 115 81 1 17 129 23 137 1.07e-11 61.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_2g010290 32.090 134 85 3 4 133 47 178 1.13e-11 61.6
MsG0380012602.01.T01 MTR_5g094520 44.444 63 35 0 67 129 1 63 1.20e-11 61.2
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g080520 35.052 97 58 3 35 129 70 163 1.36e-11 61.2
MsG0380012602.01.T01 MTR_7g075600 39.844 128 75 1 3 130 7 132 1.63e-11 60.8
MsG0380012602.01.T01 MTR_8g468780 41.270 63 37 0 67 129 1 63 1.87e-11 60.8
Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0380012602.01.T01 AT5G07990 59.375 128 52 0 2 129 3 130 7.97e-52 172
MsG0380012602.01.T01 AT3G26300 43.750 128 70 2 2 129 3 128 1.31e-29 112
MsG0380012602.01.T01 AT5G25130 44.615 130 67 2 1 129 1 126 7.60e-29 110
MsG0380012602.01.T01 AT3G26330 50.515 97 48 0 33 129 32 128 1.13e-27 107
MsG0380012602.01.T01 AT2G02580 45.312 128 68 2 2 129 3 128 2.19e-27 105
MsG0380012602.01.T01 AT3G26310 41.406 128 70 3 3 129 4 127 2.72e-27 105
MsG0380012602.01.T01 AT5G25120 43.846 130 68 2 1 129 1 126 3.16e-27 105
MsG0380012602.01.T01 AT5G25180 41.860 129 72 1 1 129 1 126 3.63e-27 105
MsG0380012602.01.T01 AT3G26180 41.791 134 72 2 1 132 1 130 1.10e-26 103
MsG0380012602.01.T01 AT5G25140 43.077 130 69 2 1 129 1 126 2.42e-26 103
MsG0380012602.01.T01 AT3G53280 47.959 98 51 0 32 129 28 125 3.39e-26 102
MsG0380012602.01.T01 AT1G13090 45.918 98 53 0 32 129 28 125 3.70e-26 100
MsG0380012602.01.T01 AT3G48320 43.307 127 71 1 2 128 3 128 8.33e-26 101
MsG0380012602.01.T01 AT3G26170 40.152 132 72 1 1 132 6 130 1.46e-25 100
MsG0380012602.01.T01 AT3G26320 47.423 97 51 0 33 129 32 128 2.73e-25 100
MsG0380012602.01.T01 AT1G13090 44.231 104 58 0 26 129 22 125 4.34e-25 99.8
MsG0380012602.01.T01 AT5G42590 44.000 125 64 3 1 125 7 125 1.07e-24 98.6
MsG0380012602.01.T01 AT3G48290 44.954 109 60 0 20 128 21 129 2.01e-24 97.8
MsG0380012602.01.T01 AT1G13110 42.735 117 62 1 13 129 18 129 2.11e-24 97.8
MsG0380012602.01.T01 AT3G48290 44.954 109 60 0 20 128 21 129 2.73e-24 97.4
MsG0380012602.01.T01 AT2G45560 41.463 123 69 2 10 129 14 136 3.38e-24 94.0
MsG0380012602.01.T01 AT5G57260 45.361 97 53 0 33 129 31 127 6.71e-24 96.3
MsG0380012602.01.T01 AT5G04330 41.739 115 64 1 31 142 31 145 8.49e-24 96.3
MsG0380012602.01.T01 AT3G26190 43.878 98 55 0 32 129 28 125 9.20e-24 95.9
MsG0380012602.01.T01 AT4G13770 38.983 118 71 1 13 129 11 128 1.34e-23 95.5
MsG0380012602.01.T01 AT3G26150 40.164 122 73 0 11 132 9 130 1.66e-23 95.1
MsG0380012602.01.T01 AT2G45560 41.463 123 69 2 10 129 14 136 1.71e-23 93.6
MsG0380012602.01.T01 AT3G44250 44.898 98 54 0 32 129 28 125 1.73e-23 95.1
MsG0380012602.01.T01 AT2G30750 42.593 108 61 1 22 128 22 129 3.17e-23 94.4
MsG0380012602.01.T01 AT3G48280 38.281 128 76 1 1 128 2 126 3.63e-23 94.4
MsG0380012602.01.T01 AT1G11610 45.361 97 53 0 32 128 33 129 4.17e-23 94.0
MsG0380012602.01.T01 AT5G06900 40.000 100 60 0 30 129 32 131 4.42e-23 94.0
MsG0380012602.01.T01 AT1G11610 45.361 97 53 0 32 128 33 129 5.08e-23 94.0
MsG0380012602.01.T01 AT3G48270 43.636 110 59 1 19 128 21 127 5.42e-23 93.6
MsG0380012602.01.T01 AT2G45560 40.625 128 73 2 5 129 9 136 6.89e-23 93.6
MsG0380012602.01.T01 AT4G20240 42.157 102 59 0 27 128 28 129 8.48e-23 93.2
MsG0380012602.01.T01 AT3G26280 43.269 104 59 0 26 129 26 129 9.07e-23 93.2
MsG0380012602.01.T01 AT3G26280 43.269 104 59 0 26 129 43 146 9.15e-23 93.2
MsG0380012602.01.T01 AT3G26160 40.164 122 73 0 11 132 9 130 1.21e-22 92.8
MsG0380012602.01.T01 AT3G26200 45.918 98 53 0 32 129 28 125 1.25e-22 92.8
MsG0380012602.01.T01 AT3G52970 40.678 118 69 1 13 129 17 134 1.30e-22 92.8
MsG0380012602.01.T01 AT1G13080 41.085 129 75 1 1 129 1 128 1.61e-22 92.4
MsG0380012602.01.T01 AT4G12320 44.068 118 62 1 12 129 26 139 2.15e-22 92.0
MsG0380012602.01.T01 AT3G52970 40.678 118 69 1 13 129 17 134 2.20e-22 92.0
MsG0380012602.01.T01 AT5G24960 43.269 104 59 0 25 128 26 129 2.24e-22 92.0
MsG0380012602.01.T01 AT4G20240 42.157 102 59 0 27 128 28 129 3.17e-22 90.9
MsG0380012602.01.T01 AT4G36220 39.669 121 73 0 9 129 17 137 3.36e-22 91.7
MsG0380012602.01.T01 AT3G26290 45.000 100 52 1 30 129 45 141 3.55e-22 91.7
MsG0380012602.01.T01 AT3G26180 41.880 117 62 2 1 115 1 113 3.99e-22 90.5
MsG0380012602.01.T01 AT3G26290 45.000 100 52 1 30 129 32 128 4.63e-22 91.3
MsG0380012602.01.T01 AT2G30770 44.330 97 54 0 32 128 33 129 4.78e-22 91.3
MsG0380012602.01.T01 AT3G48310 45.833 96 52 0 33 128 33 128 4.89e-22 91.3
MsG0380012602.01.T01 AT3G26210 46.067 89 48 0 41 129 40 128 9.59e-22 90.1
MsG0380012602.01.T01 AT3G26830 39.535 129 74 2 1 129 1 125 1.03e-21 90.1
MsG0380012602.01.T01 AT4G12300 41.270 126 70 1 4 129 18 139 1.04e-21 90.1
MsG0380012602.01.T01 AT5G24960 43.269 104 59 0 25 128 26 129 1.51e-21 89.4
MsG0380012602.01.T01 AT1G01280 40.984 122 71 1 8 129 9 129 2.20e-21 89.4
MsG0380012602.01.T01 AT2G45550 36.029 136 81 3 10 139 14 149 5.46e-21 88.2
MsG0380012602.01.T01 AT3G26270 39.423 104 63 0 26 129 26 129 7.42e-21 87.8
MsG0380012602.01.T01 AT3G48300 45.263 95 52 0 34 128 31 125 9.41e-21 87.4
MsG0380012602.01.T01 AT3G48300 45.263 95 52 0 34 128 33 127 9.45e-21 87.4
MsG0380012602.01.T01 AT3G26220 37.705 122 72 1 8 129 9 126 1.40e-20 87.0
MsG0380012602.01.T01 AT5G24950 43.299 97 55 0 32 128 32 128 3.28e-20 85.9
MsG0380012602.01.T01 AT5G57220 36.441 118 73 2 13 129 12 128 1.71e-19 84.0
MsG0380012602.01.T01 AT4G13310 41.346 104 61 0 25 128 25 128 2.45e-19 83.6
MsG0380012602.01.T01 AT4G37430 37.398 123 73 2 11 129 4 126 2.63e-19 83.2
MsG0380012602.01.T01 AT3G26230 38.583 127 70 2 3 129 5 123 3.35e-19 83.2
MsG0380012602.01.T01 AT4G13310 41.346 104 61 0 25 128 25 128 3.40e-19 82.8
MsG0380012602.01.T01 AT5G06905 33.607 122 78 1 8 129 10 128 4.97e-19 82.8
MsG0380012602.01.T01 AT5G10610 34.884 129 82 2 2 129 3 130 5.01e-19 82.4
MsG0380012602.01.T01 AT4G31500 40.187 107 63 1 24 129 21 127 6.57e-19 82.4
MsG0380012602.01.T01 AT4G13290 41.346 104 61 0 25 128 26 129 6.95e-19 82.0
MsG0380012602.01.T01 AT4G31940 35.714 126 75 2 10 129 7 132 1.19e-18 81.6
MsG0380012602.01.T01 AT2G25160 34.899 149 87 5 1 143 5 149 1.22e-18 81.6
MsG0380012602.01.T01 AT1G13100 43.182 88 47 1 42 129 38 122 1.33e-18 81.3
MsG0380012602.01.T01 AT2G25160 34.459 148 89 4 1 143 5 149 2.12e-18 80.5
MsG0380012602.01.T01 AT1G33720 39.200 125 67 4 11 129 15 136 2.31e-18 80.9
MsG0380012602.01.T01 AT2G24180 41.837 98 57 0 32 129 36 133 2.52e-18 80.5
MsG0380012602.01.T01 AT2G40890 32.558 129 82 2 1 129 1 124 5.84e-18 79.7
MsG0380012602.01.T01 AT5G10600 32.558 129 82 2 2 129 20 144 8.83e-18 79.0
MsG0380012602.01.T01 AT4G31970 34.127 126 77 2 10 129 7 132 1.51e-17 78.6
MsG0380012602.01.T01 AT3G53300 39.796 98 59 0 32 129 28 125 1.87e-17 78.2
MsG0380012602.01.T01 AT2G45580 38.835 103 62 1 42 143 48 150 3.98e-17 77.0
MsG0380012602.01.T01 AT2G45580 38.835 103 62 1 42 143 48 150 4.12e-17 77.0
MsG0380012602.01.T01 AT5G04630 31.852 135 86 3 3 132 9 142 4.99e-17 77.0
MsG0380012602.01.T01 AT4G37320 34.848 132 82 3 1 129 1 131 7.64e-17 76.3
MsG0380012602.01.T01 AT2G45570 39.844 128 74 2 5 129 9 136 1.02e-16 75.9
MsG0380012602.01.T01 AT5G36220 35.606 132 74 4 5 129 10 137 1.08e-16 75.9
MsG0380012602.01.T01 AT2G42250 36.975 119 75 0 11 129 20 138 1.51e-16 75.5
MsG0380012602.01.T01 AT4G12310 42.697 89 51 0 41 129 53 141 2.55e-16 74.7
MsG0380012602.01.T01 AT3G20940 37.374 99 61 1 32 129 42 140 4.15e-16 74.3
MsG0380012602.01.T01 AT3G10560 35.211 142 82 4 1 132 9 150 8.29e-16 73.6
MsG0380012602.01.T01 AT5G67310 42.000 100 56 2 32 129 42 141 9.64e-16 73.2
MsG0380012602.01.T01 AT4G37410 35.938 128 77 4 13 136 12 138 2.10e-15 72.4
MsG0380012602.01.T01 AT4G37330 35.606 132 81 3 1 129 1 131 2.13e-15 72.0
MsG0380012602.01.T01 AT4G15330 33.913 115 75 1 16 129 22 136 2.16e-15 72.0
MsG0380012602.01.T01 AT5G44620 39.326 89 54 0 41 129 55 143 4.69e-15 71.2
MsG0380012602.01.T01 AT3G20110 37.121 132 72 5 10 132 11 140 4.95e-15 71.2
MsG0380012602.01.T01 AT2G23190 34.545 110 69 2 23 129 66 175 6.15e-15 70.9
MsG0380012602.01.T01 AT1G64940 35.036 137 82 4 1 131 1 136 7.96e-15 70.5
MsG0380012602.01.T01 AT3G20090 37.805 82 51 0 48 129 60 141 8.48e-15 70.5
MsG0380012602.01.T01 AT3G61040 37.113 97 61 0 33 129 34 130 1.74e-14 69.3
MsG0380012602.01.T01 AT5G05260 32.710 107 68 1 27 129 35 141 2.76e-14 68.9
MsG0380012602.01.T01 AT5G05260 32.710 107 68 1 27 129 35 141 2.86e-14 68.9
MsG0380012602.01.T01 AT4G15360 30.597 134 84 2 5 129 5 138 3.10e-14 68.9
MsG0380012602.01.T01 AT3G61040 37.113 97 61 0 33 129 34 130 3.34e-14 68.9
MsG0380012602.01.T01 AT3G20140 35.000 120 65 4 20 132 30 143 1.88e-13 66.6
MsG0380012602.01.T01 AT4G37370 33.607 122 75 3 11 129 12 130 2.37e-13 66.2
MsG0380012602.01.T01 AT2G23220 35.455 110 68 2 23 129 37 146 4.84e-13 65.5
MsG0380012602.01.T01 AT1G74540 37.755 98 58 1 32 129 27 121 5.19e-13 65.5
MsG0380012602.01.T01 AT5G35917 30.275 109 72 1 25 129 35 143 7.76e-13 64.7
MsG0380012602.01.T01 AT4G37310 33.884 121 76 4 12 129 11 130 8.57e-13 64.7
MsG0380012602.01.T01 AT4G22710 38.889 90 54 1 41 129 62 151 9.02e-13 64.7
MsG0380012602.01.T01 AT4G37400 37.778 90 55 1 41 129 40 129 9.74e-13 64.7
MsG0380012602.01.T01 AT2G12190 36.697 109 65 2 27 131 27 135 1.08e-12 64.3
MsG0380012602.01.T01 AT2G05180 36.585 82 52 0 48 129 58 139 1.17e-12 64.3
MsG0380012602.01.T01 AT3G25180 28.788 132 85 2 6 129 8 138 1.50e-12 63.9
MsG0380012602.01.T01 AT1G74550 31.008 129 81 2 1 129 1 121 1.52e-12 63.9
MsG0380012602.01.T01 AT3G25180 30.534 131 87 2 1 129 10 138 1.67e-12 63.9
MsG0380012602.01.T01 AT3G32047 36.782 87 51 2 48 132 59 143 2.03e-12 63.5
MsG0380012602.01.T01 AT1G64950 36.697 109 65 2 27 131 27 135 3.05e-12 63.2
MsG0380012602.01.T01 AT4G22690 37.778 90 55 1 41 129 93 182 3.23e-12 63.2
MsG0380012602.01.T01 AT4G12330 34.831 89 58 0 41 129 55 143 3.34e-12 63.2
MsG0380012602.01.T01 AT3G20130 36.364 77 49 0 53 129 64 140 3.71e-12 62.8
MsG0380012602.01.T01 AT1G58260 27.273 143 98 3 2 140 9 149 3.92e-12 62.8
MsG0380012602.01.T01 AT3G20950 33.083 133 84 2 2 129 12 144 4.52e-12 62.8
MsG0380012602.01.T01 AT4G37340 36.275 102 60 3 32 129 30 130 6.15e-12 62.4
MsG0380012602.01.T01 AT3G28740 37.383 107 64 2 26 129 33 139 6.73e-12 62.0
MsG0380012602.01.T01 AT2G14100 34.940 83 50 2 52 132 64 144 7.44e-12 62.0
MsG0380012602.01.T01 AT4G39950 28.244 131 90 2 5 132 30 159 7.65e-12 62.0
MsG0380012602.01.T01 AT4G39950 28.244 131 90 2 5 132 70 199 9.76e-12 61.6
MsG0380012602.01.T01 AT1G64930 32.203 118 76 2 27 140 27 144 1.18e-11 61.6
MsG0380012602.01.T01 AT2G22330 27.869 122 84 2 15 132 40 161 1.56e-11 61.2
MsG0380012602.01.T01 AT2G22330 27.869 122 84 2 15 132 63 184 2.25e-11 60.8
MsG0380012602.01.T01 AT3G20100 33.333 93 61 1 41 132 50 142 2.53e-11 60.5
MsG0380012602.01.T01 AT4G37360 31.298 131 84 3 2 129 3 130 3.36e-11 60.1
MsG0380012602.01.T01 AT3G20080 35.238 105 61 4 32 132 42 143 3.49e-11 60.1
MsG0380012602.01.T01 AT3G20080 35.238 105 61 4 32 132 42 143 3.49e-11 60.1
MsG0380012602.01.T01 AT3G20960 35.211 71 46 0 59 129 69 139 5.28e-11 59.7
MsG0380012602.01.T01 AT4G15350 36.145 83 47 3 53 132 57 136 5.35e-11 59.7
MsG0380012602.01.T01 AT1G16410 28.906 128 82 3 11 129 18 145 9.15e-11 58.9

Find 53 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 55 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GACCTTGTGTTTGGTCCTTA+TGG 0.151855 3:-20652579 MsG0380012602.01.T01:CDS
CCTCTTCTCCAACCAATCTT+TGG 0.215088 3:-20652518 MsG0380012602.01.T01:CDS
CCTTTGATGCACCTCAAATT+AGG 0.249661 3:-20652726 MsG0380012602.01.T01:CDS
CCTATTACAGGCCATGGTTT+TGG 0.254692 3:+20652813 None:intergenic
CGTGGCGGAACAATTCTTAA+AGG 0.260053 3:-20652670 MsG0380012602.01.T01:CDS
CCAAAACCATGGCCTGTAAT+AGG 0.303839 3:-20652813 MsG0380012602.01.T01:CDS
TGTGGAAGGTTACCTATTAC+AGG 0.312759 3:+20652801 None:intergenic
TTCTGAGCAGTCGCCACCTT+GGG 0.353936 3:+20652556 None:intergenic
CAGCCAAGGTTGCAAGAGAT+TGG 0.367654 3:+20652760 None:intergenic
AATTATCAAGACCTTGTGTT+TGG 0.382639 3:-20652588 MsG0380012602.01.T01:CDS
TGTTTAAATCATCCAAAGAT+TGG 0.404777 3:+20652506 None:intergenic
GCAAGAGATTGGTGTGGTGC+AGG 0.410454 3:+20652771 None:intergenic
CAACACGAATCATGTCTCTA+TGG 0.411119 3:-20652929 None:intergenic
ATGTATTTAGCTCCGGCATT+GGG 0.418866 3:+20652618 None:intergenic
ACACCAATCTCTTGCAACCT+TGG 0.442018 3:-20652763 MsG0380012602.01.T01:CDS
AGTCGCCACCTTGGGCCATA+AGG 0.470098 3:+20652564 None:intergenic
TAAATCATCCAAAGATTGGT+TGG 0.479538 3:+20652510 None:intergenic
TAGCTCCGGCATTGGGTGGC+CGG 0.481188 3:+20652625 None:intergenic
CCTAATTTGAGGTGCATCAA+AGG 0.483292 3:+20652726 None:intergenic
TATGTATTTAGCTCCGGCAT+TGG 0.487638 3:+20652617 None:intergenic
ATAACCTATGTATTTAGCTC+CGG 0.488252 3:+20652611 None:intergenic
GCAACCTTGGCTGAAACCTA+TGG 0.490989 3:-20652750 MsG0380012602.01.T01:CDS
CCAAAGATTGGTTGGAGAAG+AGG 0.502451 3:+20652518 None:intergenic
AGGTTACCTATTACAGGCCA+TGG 0.510658 3:+20652807 None:intergenic
AGTAGCCGGCCACCCAATGC+CGG 0.510923 3:-20652630 MsG0380012602.01.T01:CDS
CACAAAACGGTATATTAAGA+TGG 0.520178 3:+20652878 None:intergenic
TTGTTGCAAACTTCACAAAA+CGG 0.524309 3:+20652865 None:intergenic
TTTCTGAGCAGTCGCCACCT+TGG 0.530287 3:+20652555 None:intergenic
TGTTTGGTCCTTATGGCCCA+AGG 0.533141 3:-20652572 MsG0380012602.01.T01:CDS
GAGGTGCATCAAAGGGCCAT+AGG 0.533319 3:+20652734 None:intergenic
ATAGGTAACCTTCCACAACT+TGG 0.542630 3:-20652795 MsG0380012602.01.T01:CDS
ATGATGCTAACTTTAGTAGC+CGG 0.544368 3:-20652644 MsG0380012602.01.T01:CDS
CATCCACCGAGCCTAATTTG+AGG 0.549589 3:+20652715 None:intergenic
TGTGGTGCAGGGCCAAGTTG+TGG 0.557276 3:+20652783 None:intergenic
CTAATTTGAGGTGCATCAAA+GGG 0.565094 3:+20652727 None:intergenic
TCATCACTACCACTCCCACC+TGG 0.569238 3:-20652837 MsG0380012602.01.T01:CDS
GATGCACCTCAAATTAGGCT+CGG 0.578037 3:-20652721 MsG0380012602.01.T01:CDS
TATTTAGCTCCGGCATTGGG+TGG 0.584504 3:+20652621 None:intergenic
CAAGAGATTGGTGTGGTGCA+GGG 0.599112 3:+20652772 None:intergenic
CTTTAAGAATTGTTCCGCCA+CGG 0.603525 3:+20652671 None:intergenic
GGCCATAAGGACCAAACACA+AGG 0.621215 3:+20652577 None:intergenic
AGGCTCGGTGGATGTGATCG+TGG 0.623751 3:-20652706 MsG0380012602.01.T01:CDS
TCCCACCTGGACCAAAACCA+TGG 0.625487 3:-20652824 MsG0380012602.01.T01:CDS
GGCGGCTTCAGCCTCCGTGG+CGG 0.625572 3:-20652685 MsG0380012602.01.T01:CDS
AATGCCGGAGCTAAATACAT+AGG 0.626575 3:-20652615 MsG0380012602.01.T01:CDS
AGGGCCATAGGTTTCAGCCA+AGG 0.637092 3:+20652746 None:intergenic
GTGCAGGGCCAAGTTGTGGA+AGG 0.641668 3:+20652787 None:intergenic
GCACCTCAAATTAGGCTCGG+TGG 0.648549 3:-20652718 MsG0380012602.01.T01:CDS
CGTGGCGGCTTCAGCCTCCG+TGG 0.653028 3:-20652688 MsG0380012602.01.T01:CDS
TTGGTCCTTATGGCCCAAGG+TGG 0.676148 3:-20652569 MsG0380012602.01.T01:CDS
CTCGGTGGATGTGATCGTGG+CGG 0.690634 3:-20652703 MsG0380012602.01.T01:CDS
TAAGAATTGTTCCGCCACGG+AGG 0.722603 3:+20652674 None:intergenic
AAGGTTGCAAGAGATTGGTG+TGG 0.768301 3:+20652765 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
AATTATCAAGACCTTGTGTT+TGG - Chr3:20652839-20652858 MsG0380012602.01.T01:CDS 30.0%
CACAAAACGGTATATTAAGA+TGG + Chr3:20652552-20652571 None:intergenic 30.0%
TAAATCATCCAAAGATTGGT+TGG + Chr3:20652920-20652939 None:intergenic 30.0%
TTGTTGCAAACTTCACAAAA+CGG + Chr3:20652565-20652584 None:intergenic 30.0%
! ATAACCTATGTATTTAGCTC+CGG + Chr3:20652819-20652838 None:intergenic 30.0%
ATGATGCTAACTTTAGTAGC+CGG - Chr3:20652783-20652802 MsG0380012602.01.T01:CDS 35.0%
! CTAATTTGAGGTGCATCAAA+GGG + Chr3:20652703-20652722 None:intergenic 35.0%
AATGCCGGAGCTAAATACAT+AGG - Chr3:20652812-20652831 MsG0380012602.01.T01:CDS 40.0%
ATAGGTAACCTTCCACAACT+TGG - Chr3:20652632-20652651 MsG0380012602.01.T01:CDS 40.0%
CCTTTGATGCACCTCAAATT+AGG - Chr3:20652701-20652720 MsG0380012602.01.T01:CDS 40.0%
TGTGGAAGGTTACCTATTAC+AGG + Chr3:20652629-20652648 None:intergenic 40.0%
! ATGTATTTAGCTCCGGCATT+GGG + Chr3:20652812-20652831 None:intergenic 40.0%
! CCTAATTTGAGGTGCATCAA+AGG + Chr3:20652704-20652723 None:intergenic 40.0%
! CTTTAAGAATTGTTCCGCCA+CGG + Chr3:20652759-20652778 None:intergenic 40.0%
! TATGTATTTAGCTCCGGCAT+TGG + Chr3:20652813-20652832 None:intergenic 40.0%
AAGGTTGCAAGAGATTGGTG+TGG + Chr3:20652665-20652684 None:intergenic 45.0%
ACACCAATCTCTTGCAACCT+TGG - Chr3:20652664-20652683 MsG0380012602.01.T01:CDS 45.0%
AGGTTACCTATTACAGGCCA+TGG + Chr3:20652623-20652642 None:intergenic 45.0%
CCAAAACCATGGCCTGTAAT+AGG - Chr3:20652614-20652633 MsG0380012602.01.T01:CDS 45.0%
CCTCTTCTCCAACCAATCTT+TGG - Chr3:20652909-20652928 MsG0380012602.01.T01:CDS 45.0%
GACCTTGTGTTTGGTCCTTA+TGG - Chr3:20652848-20652867 MsG0380012602.01.T01:CDS 45.0%
GATGCACCTCAAATTAGGCT+CGG - Chr3:20652706-20652725 MsG0380012602.01.T01:CDS 45.0%
! CCAAAGATTGGTTGGAGAAG+AGG + Chr3:20652912-20652931 None:intergenic 45.0%
! CCTATTACAGGCCATGGTTT+TGG + Chr3:20652617-20652636 None:intergenic 45.0%
! CGTGGCGGAACAATTCTTAA+AGG - Chr3:20652757-20652776 MsG0380012602.01.T01:CDS 45.0%
CAAGAGATTGGTGTGGTGCA+GGG + Chr3:20652658-20652677 None:intergenic 50.0%
CAGCCAAGGTTGCAAGAGAT+TGG + Chr3:20652670-20652689 None:intergenic 50.0%
CATCCACCGAGCCTAATTTG+AGG + Chr3:20652715-20652734 None:intergenic 50.0%
GCAACCTTGGCTGAAACCTA+TGG - Chr3:20652677-20652696 MsG0380012602.01.T01:CDS 50.0%
GGCCATAAGGACCAAACACA+AGG + Chr3:20652853-20652872 None:intergenic 50.0%
TAAGAATTGTTCCGCCACGG+AGG + Chr3:20652756-20652775 None:intergenic 50.0%
TGTTTGGTCCTTATGGCCCA+AGG - Chr3:20652855-20652874 MsG0380012602.01.T01:CDS 50.0%
! TATTTAGCTCCGGCATTGGG+TGG + Chr3:20652809-20652828 None:intergenic 50.0%
AGGGCCATAGGTTTCAGCCA+AGG + Chr3:20652684-20652703 None:intergenic 55.0%
GAGGTGCATCAAAGGGCCAT+AGG + Chr3:20652696-20652715 None:intergenic 55.0%
GCAAGAGATTGGTGTGGTGC+AGG + Chr3:20652659-20652678 None:intergenic 55.0%
GCACCTCAAATTAGGCTCGG+TGG - Chr3:20652709-20652728 MsG0380012602.01.T01:CDS 55.0%
TCATCACTACCACTCCCACC+TGG - Chr3:20652590-20652609 MsG0380012602.01.T01:CDS 55.0%
TCCCACCTGGACCAAAACCA+TGG - Chr3:20652603-20652622 MsG0380012602.01.T01:CDS 55.0%
TTCTGAGCAGTCGCCACCTT+GGG + Chr3:20652874-20652893 None:intergenic 55.0%
TTGGTCCTTATGGCCCAAGG+TGG - Chr3:20652858-20652877 MsG0380012602.01.T01:CDS 55.0%
TTTCTGAGCAGTCGCCACCT+TGG + Chr3:20652875-20652894 None:intergenic 55.0%
!!! ACAGGCCATGGTTTTGGTCC+AGG + Chr3:20652611-20652630 None:intergenic 55.0%
!!! GCCATGGTTTTGGTCCAGGT+GGG + Chr3:20652607-20652626 None:intergenic 55.0%
AGTCGCCACCTTGGGCCATA+AGG + Chr3:20652866-20652885 None:intergenic 60.0%
CTCGGTGGATGTGATCGTGG+CGG - Chr3:20652724-20652743 MsG0380012602.01.T01:CDS 60.0%
GTGCAGGGCCAAGTTGTGGA+AGG + Chr3:20652643-20652662 None:intergenic 60.0%
TGTGGTGCAGGGCCAAGTTG+TGG + Chr3:20652647-20652666 None:intergenic 60.0%
!! AGGCTCGGTGGATGTGATCG+TGG - Chr3:20652721-20652740 MsG0380012602.01.T01:CDS 60.0%
!! GGTTTTGGTCCAGGTGGGAG+TGG + Chr3:20652602-20652621 None:intergenic 60.0%
!!! GGCCATGGTTTTGGTCCAGG+TGG + Chr3:20652608-20652627 None:intergenic 60.0%
AGTAGCCGGCCACCCAATGC+CGG - Chr3:20652797-20652816 MsG0380012602.01.T01:CDS 65.0%
! TAGCTCCGGCATTGGGTGGC+CGG + Chr3:20652805-20652824 None:intergenic 65.0%
CGTGGCGGCTTCAGCCTCCG+TGG - Chr3:20652739-20652758 MsG0380012602.01.T01:CDS 75.0%
GGCGGCTTCAGCCTCCGTGG+CGG - Chr3:20652742-20652761 MsG0380012602.01.T01:CDS 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 20652509 20652940 20652509 ID=MsG0380012602.01;Name=MsG0380012602.01
Chr3 mRNA 20652509 20652940 20652509 ID=MsG0380012602.01.T01;Parent=MsG0380012602.01;Name=MsG0380012602.01.T01;_AED=0.48;_eAED=0.48;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|143
Chr3 exon 20652509 20652940 20652509 ID=MsG0380012602.01.T01:exon:6999;Parent=MsG0380012602.01.T01
Chr3 CDS 20652509 20652940 20652509 ID=MsG0380012602.01.T01:cds;Parent=MsG0380012602.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380012602.01.T01

ATGTCTCTATGGCTCATTGCATTCTCTAGTTTCATATTATCCATCTTAATATACCGTTTTGTGAAGTTTGCAACAAGAACTTCATCACTACCACTCCCACCTGGACCAAAACCATGGCCTGTAATAGGTAACCTTCCACAACTTGGCCCTGCACCACACCAATCTCTTGCAACCTTGGCTGAAACCTATGGCCCTTTGATGCACCTCAAATTAGGCTCGGTGGATGTGATCGTGGCGGCTTCAGCCTCCGTGGCGGAACAATTCTTAAAGGTTCATGATGCTAACTTTAGTAGCCGGCCACCCAATGCCGGAGCTAAATACATAGGTTATAATTATCAAGACCTTGTGTTTGGTCCTTATGGCCCAAGGTGGCGACTGCTCAGAAAATCACTACTGTTCACCTCTTCTCCAACCAATCTTTGGATGATTTAA
Protein sequence

>MsG0380012602.01.T01

MSLWLIAFSSFILSILIYRFVKFATRTSSLPLPPGPKPWPVIGNLPQLGPAPHQSLATLAETYGPLMHLKLGSVDVIVAASASVAEQFLKVHDANFSSRPPNAGAKYIGYNYQDLVFGPYGPRWRLLRKSLLFTSSPTNLWMI*