AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380013807.01

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MsG0380013807.01.T01 AT3G11010 28.590 773 371 28 35 652 13 759 2.40e-41 162
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MsG0380013807.01.T01 AT3G53240 28.232 673 398 23 75 688 188 834 4.89e-40 159
MsG0380013807.01.T01 AT3G53240 28.254 630 401 19 36 642 2 603 1.50e-31 132
MsG0380013807.01.T01 AT3G53240 30.882 204 121 6 464 656 69 263 2.31e-11 67.8
MsG0380013807.01.T01 AT3G53240 28.232 673 398 23 75 688 224 870 5.13e-40 159
MsG0380013807.01.T01 AT3G53240 28.097 662 419 21 10 642 6 639 2.56e-32 135
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MsG0380013807.01.T01 AT3G11080 26.923 832 387 28 35 677 80 879 1.13e-39 157
MsG0380013807.01.T01 AT5G63930 31.679 524 309 14 168 668 154 651 1.27e-39 158
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MsG0380013807.01.T01 AT5G23400 31.418 261 153 7 441 682 120 373 2.61e-19 92.8
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MsG0380013807.01.T01 AT4G08850 28.713 606 331 19 119 663 120 685 1.37e-38 154
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MsG0380013807.01.T01 AT2G33170 29.771 524 307 15 172 641 90 606 2.36e-36 147
MsG0380013807.01.T01 AT2G33170 27.545 334 189 8 366 648 90 421 1.65e-20 97.8
MsG0380013807.01.T01 AT2G33170 29.580 524 309 14 163 668 249 730 1.28e-37 152
MsG0380013807.01.T01 AT2G33170 29.771 524 307 15 172 641 90 606 2.36e-36 147
MsG0380013807.01.T01 AT2G33170 27.545 334 189 8 366 648 90 421 1.65e-20 97.8
MsG0380013807.01.T01 AT3G24900 26.641 792 403 25 43 680 63 830 3.08e-37 150
MsG0380013807.01.T01 AT3G24900 26.641 792 403 25 43 680 94 861 6.92e-37 149
MsG0380013807.01.T01 AT5G27060 24.711 866 443 23 10 677 37 891 9.28e-37 149
MsG0380013807.01.T01 AT5G27060 24.711 866 443 23 10 677 37 891 9.28e-37 149
MsG0380013807.01.T01 AT5G27060 24.711 866 443 23 10 677 38 892 1.06e-36 149
MsG0380013807.01.T01 AT2G41820 29.314 481 267 16 242 673 65 521 1.07e-36 148
MsG0380013807.01.T01 AT2G41820 29.388 490 311 13 14 495 27 489 5.14e-29 124
MsG0380013807.01.T01 AT2G24130 28.046 517 290 10 169 648 68 539 1.38e-36 148
MsG0380013807.01.T01 AT2G24130 27.087 539 245 18 40 467 52 553 7.56e-23 105
MsG0380013807.01.T01 AT2G24130 28.046 517 290 10 169 648 83 554 1.77e-36 148
MsG0380013807.01.T01 AT2G24130 27.087 539 245 18 40 467 67 568 1.03e-22 104
MsG0380013807.01.T01 AT5G62230 29.104 536 306 14 141 662 41 516 2.21e-36 147
MsG0380013807.01.T01 AT5G62230 27.586 493 277 16 16 499 31 452 6.50e-22 102
MsG0380013807.01.T01 AT5G62230 33.200 250 145 6 72 313 269 504 3.87e-16 83.6
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MsG0380013807.01.T01 AT5G65700 29.865 519 317 11 186 668 112 619 1.15e-35 145
MsG0380013807.01.T01 AT5G65700 26.776 549 321 18 26 504 41 578 4.74e-25 112
MsG0380013807.01.T01 AT5G65700 29.688 256 133 4 433 641 73 328 6.22e-15 79.7
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MsG0380013807.01.T01 AT1G34110 29.249 506 289 12 190 661 211 681 9.68e-35 142
MsG0380013807.01.T01 AT1G34110 28.078 463 280 9 230 641 129 589 5.86e-27 118
MsG0380013807.01.T01 AT1G34110 37.423 163 101 1 163 325 448 609 2.01e-12 71.6
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MsG0380013807.01.T01 AT1G55610 23.828 789 457 27 18 702 38 786 1.99e-32 135
MsG0380013807.01.T01 AT2G33080 26.884 584 290 19 182 639 117 689 1.08e-31 132
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MsG0380013807.01.T01 AT2G27060 29.977 437 233 13 234 643 17 407 3.31e-29 125
MsG0380013807.01.T01 AT2G27060 26.585 410 236 13 242 642 2 355 2.26e-18 90.5
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MsG0380013807.01.T01 AT2G27060 29.977 437 233 13 234 643 110 500 4.07e-29 125
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MsG0380013807.01.T01 AT3G02130 26.418 776 430 25 12 686 44 779 2.30e-26 116
MsG0380013807.01.T01 AT3G20820 33.099 284 161 9 399 668 94 362 2.71e-26 111
MsG0380013807.01.T01 AT3G20820 29.412 323 209 10 10 325 20 330 2.77e-24 105
MsG0380013807.01.T01 AT3G12610 30.142 282 173 5 396 665 99 368 2.81e-26 112
MsG0380013807.01.T01 AT3G12610 29.141 326 191 8 10 304 27 343 7.20e-25 107
MsG0380013807.01.T01 AT5G06940 28.051 549 285 19 158 674 63 533 2.96e-26 115
MsG0380013807.01.T01 AT5G06940 25.819 519 261 18 18 468 36 498 8.05e-17 85.5
MsG0380013807.01.T01 AT3G23010 27.800 500 285 18 182 668 83 519 3.99e-26 113
MsG0380013807.01.T01 AT3G23010 29.381 388 247 16 269 641 1 376 3.60e-24 107
MsG0380013807.01.T01 AT3G23010 26.115 471 263 13 51 468 53 491 1.58e-17 87.0
MsG0380013807.01.T01 AT3G23010 25.083 303 158 8 439 684 6 296 3.98e-11 66.6
MsG0380013807.01.T01 AT2G26380 28.200 461 227 16 221 668 109 478 7.41e-26 112
MsG0380013807.01.T01 AT2G26380 26.796 515 267 23 10 491 29 466 5.38e-21 97.4
MsG0380013807.01.T01 AT2G26380 27.232 224 151 4 424 642 99 315 3.36e-14 76.3
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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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ACTTGAGCTTCTTAGTTATT+TGG 0.147598 3:+45956196 MsG0380013807.01.T01:CDS
TGTGGTCCTTGTTTCTTATT+AGG 0.170291 3:+45958139 MsG0380013807.01.T01:CDS
AAGGCCCACACTTTCCATTT+TGG 0.174943 3:+45956981 MsG0380013807.01.T01:CDS
TTTAATGCATCAAGCTATAT+TGG 0.211766 3:+45957956 MsG0380013807.01.T01:CDS
AGGTCAATAGTTCGCCTTTC+TGG 0.220179 3:-45957665 None:intergenic
GGATCTATTCCTTCAATTCT+AGG 0.231960 3:+45956767 MsG0380013807.01.T01:CDS
GTATACTTTCGGTTTATATA+TGG 0.243924 3:+45958174 MsG0380013807.01.T01:CDS
CTTTGAAGTTGTGTTCCTAT+TGG 0.249452 3:-45957932 None:intergenic
AGAGATCAAGGTGTCGAATA+TGG 0.254116 3:-45956727 None:intergenic
ATTGGCTTTAATAATTTCTT+TGG 0.260813 3:+45956818 MsG0380013807.01.T01:CDS
TAAAATATCTCAACCTTAGT+TGG 0.296547 3:+45956363 MsG0380013807.01.T01:CDS
GCATGATGACCTATTTCTTC+TGG 0.297344 3:-45956704 None:intergenic
CTTGCACACAACAAACTTTC+GGG 0.298437 3:+45957523 MsG0380013807.01.T01:CDS
GAACCCAATCCAAATCAAAT+TGG 0.310778 3:-45956916 None:intergenic
CATCGGGTATTCTTTCTATA+AGG 0.313568 3:-45957084 None:intergenic
CAGGGAATCAATGATAGTTT+TGG 0.322689 3:+45956002 MsG0380013807.01.T01:CDS
AGAGGAGCTCCACATAGTTT+AGG 0.326482 3:-45957983 None:intergenic
TTTGAAGTTGTGTTCCTATT+GGG 0.327077 3:-45957931 None:intergenic
TGAATCTAAAGTAGAGAGTT+TGG 0.331703 3:-45956864 None:intergenic
CAACAGATGGGAAGTTGTTC+AGG 0.334977 3:-45956469 None:intergenic
TATTCCAATTTGATTTGGAT+TGG 0.336058 3:+45956912 MsG0380013807.01.T01:CDS
ACATTAACCTGATGAGAAAT+AGG 0.336251 3:+45957305 MsG0380013807.01.T01:CDS
AGGAGGAACAATTTAGTGTT+AGG 0.337116 3:-45957150 None:intergenic
ATAAAAGAATCAATGTATCT+AGG 0.339999 3:+45958079 MsG0380013807.01.T01:CDS
TCATCTTCATTCTCTGTAGA+AGG 0.347723 3:-45958049 None:intergenic
CTTTCAGCCAATAGCTTGTC+TGG 0.356011 3:+45957686 MsG0380013807.01.T01:CDS
TTAATGCATCAAGCTATATT+GGG 0.357515 3:+45957957 MsG0380013807.01.T01:CDS
TTCACTATTTGAAGCCAGTT+TGG 0.359316 3:-45956404 None:intergenic
CTGATGAGAAATAGGCTATC+TGG 0.360291 3:+45957313 MsG0380013807.01.T01:CDS
ATTCCAATTTGATTTGGATT+GGG 0.360313 3:+45956913 MsG0380013807.01.T01:CDS
ATGTATCTAGGGATGGGATT+TGG 0.365504 3:+45958091 MsG0380013807.01.T01:CDS
TGGATTTGCAGTAGGTTTCT+GGG 0.366867 3:+45958111 MsG0380013807.01.T01:CDS
CCTTGCACACAACAAACTTT+CGG 0.370296 3:+45957522 MsG0380013807.01.T01:CDS
CAGATAGCCTATTTCTCATC+AGG 0.372777 3:-45957312 None:intergenic
AAGTGCCATTGGAATTGTTT+CGG 0.372808 3:+45957711 MsG0380013807.01.T01:CDS
CCTTGTTTCTTATTAGGAAA+TGG 0.375831 3:+45958145 MsG0380013807.01.T01:CDS
AAGCCAGTGTTGATATGTTT+GGG 0.377683 3:-45957207 None:intergenic
GACACTCTTGACCTTCAAAC+AGG 0.381184 3:+45955983 MsG0380013807.01.T01:CDS
GATTGGAGGCATGATAAATA+TGG 0.382426 3:+45957796 MsG0380013807.01.T01:CDS
ATCATTGATTCCCTGTTTGA+AGG 0.386845 3:-45955994 None:intergenic
CAGGATCAATTCCACATAGT+TGG 0.392506 3:+45957260 MsG0380013807.01.T01:CDS
CTTTCACAGAGTAATATATA+TGG 0.396820 3:+45956602 MsG0380013807.01.T01:CDS
AATGGAGGCATGTATACTTT+CGG 0.397599 3:+45958163 MsG0380013807.01.T01:CDS
CTCTAGGACACCTCTCTGAT+TGG 0.398874 3:+45957341 MsG0380013807.01.T01:CDS
TAAGCCAGTGTTGATATGTT+TGG 0.400276 3:-45957208 None:intergenic
CAAGCTCTATGTTGCTTTGA+CGG 0.401588 3:+45958206 MsG0380013807.01.T01:CDS
CCTCTCTGATTGGAGACAAT+TGG 0.403914 3:+45957351 MsG0380013807.01.T01:CDS
GTAAAGATAAATGAGATCTT+TGG 0.410185 3:-45956579 None:intergenic
GGATCAATTCCAGAAGAAAT+AGG 0.410628 3:+45956695 MsG0380013807.01.T01:CDS
CCACTATCGATAATCTTGAT+TGG 0.413159 3:+45956321 MsG0380013807.01.T01:CDS
TTGTCTTACAACTCATTCTC+AGG 0.416025 3:+45957241 MsG0380013807.01.T01:CDS
TACTTAAATTACTTATCCAT+TGG 0.433814 3:+45956800 MsG0380013807.01.T01:CDS
AAAAGGGAAGAGAGTTGAAA+AGG 0.438587 3:-45956941 None:intergenic
CTGGAATTGATCCTTGTAGT+TGG 0.449169 3:-45956685 None:intergenic
TTTATGGTACAATTATTAAG+AGG 0.450758 3:-45958001 None:intergenic
TTATCTCACAATAATTTGAC+TGG 0.451746 3:+45957758 MsG0380013807.01.T01:CDS
CACTTCTCCAGACAAGCTAT+TGG 0.455862 3:-45957693 None:intergenic
CCAATCAAGATTATCGATAG+TGG 0.456175 3:-45956321 None:intergenic
ATCATGCCTCCAATCGTCTT+CGG 0.456286 3:-45957788 None:intergenic
GTCAAGGTAGACAAGTTTAG+AGG 0.459397 3:-45956282 None:intergenic
GTTGGTTATAAGAGAGATCA+AGG 0.465934 3:-45956667 None:intergenic
GAGAGGTTTCCTAGAATTGA+AGG 0.467407 3:-45956776 None:intergenic
TAAAAGAATCAATGTATCTA+GGG 0.467783 3:+45958080 MsG0380013807.01.T01:CDS
TTGTGACATCTTGATTGGTA+TGG 0.475261 3:-45957410 None:intergenic
ACAATTGGAAATCATGAACT+TGG 0.477531 3:+45957366 MsG0380013807.01.T01:CDS
TTCACCTCTCATTTACCTGA+TGG 0.478522 3:+45956542 MsG0380013807.01.T01:CDS
TTCAAGTTCTTCCAACTATG+TGG 0.478919 3:-45957271 None:intergenic
GACACACTTTGGCATAGAAC+CGG 0.480664 3:-45957546 None:intergenic
TGTCTACAACTTGACTCATA+TGG 0.482277 3:+45957565 MsG0380013807.01.T01:CDS
GTTTGACAAATTAAGTCCAT+CGG 0.482553 3:-45957101 None:intergenic
TGAAGGTTTAGTAAGCTTGA+AGG 0.484474 3:-45956632 None:intergenic
GTTGGTTTACAAAGAGATCA+AGG 0.486676 3:-45956739 None:intergenic
GGAATAATTCCGAAGACGAT+TGG 0.486721 3:+45957779 MsG0380013807.01.T01:CDS
AAGGAATAGATCCTTGTAGT+TGG 0.492058 3:-45956757 None:intergenic
AGGGAAGAGAGTTGAAAAGG+AGG 0.492478 3:-45956938 None:intergenic
GAGATCAAGGTGTCGAATAT+GGG 0.493215 3:-45956726 None:intergenic
TTTGACAAATTAAGTCCATC+GGG 0.494549 3:-45957100 None:intergenic
AAATTGTTCCTCCTTAGTGT+TGG 0.499283 3:+45957159 MsG0380013807.01.T01:CDS
TATGAAAATCAATCCAACTA+AGG 0.506009 3:-45956376 None:intergenic
ACAGGTTGTCCACTGAGATC+AGG 0.506233 3:-45956128 None:intergenic
AAAGATTGTTGTTCTTGGGA+AGG 0.508013 3:+45956050 MsG0380013807.01.T01:CDS
TCACCTCTCATTTACCTGAT+GGG 0.509341 3:+45956543 MsG0380013807.01.T01:CDS
CCGAAAGTTTGTTGTGTGCA+AGG 0.513733 3:-45957522 None:intergenic
AAAGAAATTATTAAAGCCAA+TGG 0.518328 3:-45956816 None:intergenic
TATATCCAAAATGGAAAGTG+TGG 0.519534 3:-45956986 None:intergenic
CAATAGTTCGCCTTTCTGGT+TGG 0.521247 3:-45957661 None:intergenic
TTGGATCACAATAATTTCAC+AGG 0.521482 3:+45957178 MsG0380013807.01.T01:CDS
ATGGGATTTGGATTTGCAGT+AGG 0.521563 3:+45958103 MsG0380013807.01.T01:CDS
AGGCTATCTGGTAAATCTCT+AGG 0.522807 3:+45957325 MsG0380013807.01.T01:CDS
GAAGGTTTAGTAAGCTTGAA+GGG 0.524936 3:-45956631 None:intergenic
CAGACAAGCTATTGGCTGAA+AGG 0.525405 3:-45957685 None:intergenic
CACACAACAAACTTTCGGGC+CGG 0.526819 3:+45957527 MsG0380013807.01.T01:CDS
GGATTTGCAGTAGGTTTCTG+GGG 0.527748 3:+45958112 MsG0380013807.01.T01:CDS
CATAGTTGGAAGAACTTGAA+AGG 0.533523 3:+45957274 MsG0380013807.01.T01:CDS
AGAATCAATGTATCTAGGGA+TGG 0.539671 3:+45958084 MsG0380013807.01.T01:CDS
TTTCGGTTTATATATGGAGT+GGG 0.540269 3:+45958180 MsG0380013807.01.T01:CDS
CTTTCGGTTTATATATGGAG+TGG 0.542165 3:+45958179 MsG0380013807.01.T01:CDS
CTCTCTTATAACCAACTACA+AGG 0.544062 3:+45956674 MsG0380013807.01.T01:CDS
CTTGTCTGGAGAAGTGCCAT+TGG 0.549586 3:+45957700 MsG0380013807.01.T01:CDS
CTGAGTTGTGCGACAAGTCA+AGG 0.549647 3:-45956298 None:intergenic
CATGTGCAGCAATCACATAC+TGG 0.549994 3:+45955935 None:intergenic
TGGTGAAATTCCTCAGAGCA+TGG 0.552180 3:+45957850 MsG0380013807.01.T01:CDS
ATCGAGCTCGGGAATTTCGT+TGG 0.553479 3:+45957039 MsG0380013807.01.T01:CDS
GAATCAATGTATCTAGGGAT+GGG 0.556017 3:+45958085 MsG0380013807.01.T01:CDS
AAATTCAAATACTCAACAGA+TGG 0.559127 3:-45956482 None:intergenic
GTTCTCGACTTATCGAGCTC+GGG 0.559385 3:+45957028 MsG0380013807.01.T01:CDS
AGTTCTCGACTTATCGAGCT+CGG 0.561915 3:+45957027 MsG0380013807.01.T01:CDS
CATATATATTACTCTGTGAA+AGG 0.566474 3:-45956601 None:intergenic
CTCTTTGTAAACCAACTACA+AGG 0.568044 3:+45956746 MsG0380013807.01.T01:CDS
ATAAGTAATTTAAGTATGAG+AGG 0.569788 3:-45956793 None:intergenic
ATAATTCCGAAGACGATTGG+AGG 0.573907 3:+45957782 MsG0380013807.01.T01:CDS
GTCAAGTTGTAGACACACTT+TGG 0.574830 3:-45957557 None:intergenic
ATTATTGTGATCCAACACTA+AGG 0.577114 3:-45957170 None:intergenic
TCAGTGGACAACCTGTGCAA+TGG 0.578614 3:+45956135 MsG0380013807.01.T01:CDS
ATTGGGAATCCTAAACTATG+TGG 0.580446 3:+45957974 MsG0380013807.01.T01:CDS
GATTTGCAGTAGGTTTCTGG+GGG 0.580506 3:+45958113 MsG0380013807.01.T01:CDS
CGTAATCTTGACCTTCTGAA+AGG 0.580723 3:-45957628 None:intergenic
AAGTGTAATTCTAATAGAGA+AGG 0.581694 3:-45956434 None:intergenic
GTGATGTTGTGTTGAACAGA+TGG 0.588645 3:-45956254 None:intergenic
TGTTTCTTATTAGGAAATGG+AGG 0.594389 3:+45958148 MsG0380013807.01.T01:CDS
CAGTATGTGATTGCTGCACA+TGG 0.594627 3:-45955934 None:intergenic
TTTCAGAAATCCAACCAGAA+AGG 0.598296 3:+45957651 MsG0380013807.01.T01:CDS
GATGTCACAAAACTTACAAG+TGG 0.603585 3:+45957423 MsG0380013807.01.T01:CDS
GATCACAATAATTTCACAGG+AGG 0.605546 3:+45957181 MsG0380013807.01.T01:CDS
ACCACAATTGACCTTTCAGA+AGG 0.607056 3:+45957617 MsG0380013807.01.T01:CDS
CAATTGGAAATCATGAACTT+GGG 0.607728 3:+45957367 MsG0380013807.01.T01:CDS
CCATTTCCTAATAAGAAACA+AGG 0.608772 3:-45958145 None:intergenic
ACCTTCTGAAAGGTCAATTG+TGG 0.611726 3:-45957618 None:intergenic
ATCACAATAATTTCACAGGA+GGG 0.612666 3:+45957182 MsG0380013807.01.T01:CDS
AATTCAAATACTCAACAGAT+GGG 0.615335 3:-45956481 None:intergenic
ATATCCAAAATGGAAAGTGT+GGG 0.622062 3:-45956985 None:intergenic
ACACTCTTGACCTTCAAACA+GGG 0.645017 3:+45955984 MsG0380013807.01.T01:CDS
ACAAGCCGAAACAATTCCAA+TGG 0.649017 3:-45957716 None:intergenic
GCTCCCAAACATATCAACAC+TGG 0.652676 3:+45957204 MsG0380013807.01.T01:CDS
AAACCCATCAGGTAAATGAG+AGG 0.655264 3:-45956546 None:intergenic
GTTACAGAAATTGATCTCAG+TGG 0.657205 3:+45956101 MsG0380013807.01.T01:CDS
TTTAAGAGAGCCATGCTCTG+AGG 0.664532 3:-45957860 None:intergenic
ATTGTGATCCAACACTAAGG+AGG 0.666413 3:-45957167 None:intergenic
TTCTTGTAATGTTGTCACAG+TGG 0.678296 3:-45956076 None:intergenic
CCAATTGTCTCCAATCAGAG+AGG 0.679145 3:-45957351 None:intergenic
CTTATAGAAAGAATACCCGA+TGG 0.698785 3:+45957085 MsG0380013807.01.T01:CDS
AGTGGACGACCTGATCTCAG+TGG 0.707062 3:+45956119 MsG0380013807.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TTATCTTACAATAATTTTGA+CGG + Chr3:45957902-45957921 MsG0380013807.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTTTTATTCCAATTTGATT+TGG + Chr3:45956907-45956926 MsG0380013807.01.T01:CDS 15.0%
!! AAAGAAATTATTAAAGCCAA+TGG - Chr3:45956819-45956838 None:intergenic 20.0%
!! ATAAAAGAATCAATGTATCT+AGG + Chr3:45958079-45958098 MsG0380013807.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAAGTAATTTAAGTATGAG+AGG - Chr3:45956796-45956815 None:intergenic 20.0%
!! ATTTGTATTTCCCAAAAAAA+GGG - Chr3:45956960-45956979 None:intergenic 20.0%
!! TAAAAGAATCAATGTATCTA+GGG + Chr3:45958080-45958099 MsG0380013807.01.T01:CDS 20.0%
!! TACTTAAATTACTTATCCAT+TGG + Chr3:45956800-45956819 MsG0380013807.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTATGGTACAATTATTAAG+AGG - Chr3:45958004-45958023 None:intergenic 20.0%
!!! ATTGGCTTTAATAATTTCTT+TGG + Chr3:45956818-45956837 MsG0380013807.01.T01:CDS 20.0%
!!! CAAGGTATTTTAAATTTTGA+AGG - Chr3:45956652-45956671 None:intergenic 20.0%
!!! CTCTCTAATAATAAGTTTTT+TGG + Chr3:45957830-45957849 MsG0380013807.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTAGGATTTTCTTCTTTTA+TGG - Chr3:45958020-45958039 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTGTGTATATATCCAAAA+TGG - Chr3:45956998-45957017 None:intergenic 20.0%
! AAATTCAAATACTCAACAGA+TGG - Chr3:45956485-45956504 None:intergenic 25.0%
! AAGTGTAATTCTAATAGAGA+AGG - Chr3:45956437-45956456 None:intergenic 25.0%
! AATTCAAATACTCAACAGAT+GGG - Chr3:45956484-45956503 None:intergenic 25.0%
! CATATATATTACTCTGTGAA+AGG - Chr3:45956604-45956623 None:intergenic 25.0%
! CTTTCACAGAGTAATATATA+TGG + Chr3:45956602-45956621 MsG0380013807.01.T01:CDS 25.0%
! GATTTGTATTTCCCAAAAAA+AGG - Chr3:45956961-45956980 None:intergenic 25.0%
! GTAAAGATAAATGAGATCTT+TGG - Chr3:45956582-45956601 None:intergenic 25.0%
! GTATACTTTCGGTTTATATA+TGG + Chr3:45958174-45958193 MsG0380013807.01.T01:CDS 25.0%
! TAAAATATCTCAACCTTAGT+TGG + Chr3:45956363-45956382 MsG0380013807.01.T01:CDS 25.0%
! TATGAAAATCAATCCAACTA+AGG - Chr3:45956379-45956398 None:intergenic 25.0%
! TTAATGCATCAAGCTATATT+GGG + Chr3:45957957-45957976 MsG0380013807.01.T01:CDS 25.0%
! TTATCTCACAATAATTTGAC+TGG + Chr3:45957758-45957777 MsG0380013807.01.T01:CDS 25.0%
! TTTAATGCATCAAGCTATAT+TGG + Chr3:45957956-45957975 MsG0380013807.01.T01:CDS 25.0%
!! ACTAAGGTTGAGATATTTTA+AGG - Chr3:45956363-45956382 None:intergenic 25.0%
!! TGAAAAAGATTGTTGTTCTT+GGG + Chr3:45956046-45956065 MsG0380013807.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTCCAATTTGATTTGGATT+GGG + Chr3:45956913-45956932 MsG0380013807.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAGTTGGATTGATTTTCATA+AGG + Chr3:45956379-45956398 MsG0380013807.01.T01:CDS 25.0%
!!! TATTCCAATTTGATTTGGAT+TGG + Chr3:45956912-45956931 MsG0380013807.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTTGGGAAATACAAATCA+AGG + Chr3:45956962-45956981 MsG0380013807.01.T01:CDS 25.0%
ACAATTGGAAATCATGAACT+TGG + Chr3:45957366-45957385 MsG0380013807.01.T01:CDS 30.0%
ACATTAACCTGATGAGAAAT+AGG + Chr3:45957305-45957324 MsG0380013807.01.T01:CDS 30.0%
ACTTGAGCTTCTTAGTTATT+TGG + Chr3:45956196-45956215 MsG0380013807.01.T01:CDS 30.0%
ATCACAATAATTTCACAGGA+GGG + Chr3:45957182-45957201 MsG0380013807.01.T01:CDS 30.0%
ATTATTGTGATCCAACACTA+AGG - Chr3:45957173-45957192 None:intergenic 30.0%
CAATTGGAAATCATGAACTT+GGG + Chr3:45957367-45957386 MsG0380013807.01.T01:CDS 30.0%
CCATTTCCTAATAAGAAACA+AGG - Chr3:45958148-45958167 None:intergenic 30.0%
GTTTGACAAATTAAGTCCAT+CGG - Chr3:45957104-45957123 None:intergenic 30.0%
TATATCCAAAATGGAAAGTG+TGG - Chr3:45956989-45957008 None:intergenic 30.0%
TGAGAGATAACCAATTTGAA+GGG + Chr3:45957452-45957471 MsG0380013807.01.T01:intron 30.0%
TGTTTCTTATTAGGAAATGG+AGG + Chr3:45958148-45958167 MsG0380013807.01.T01:CDS 30.0%
TTCAAAAAATTCCATTGCAC+AGG - Chr3:45956149-45956168 None:intergenic 30.0%
TTGAGAGATAACCAATTTGA+AGG + Chr3:45957451-45957470 MsG0380013807.01.T01:intron 30.0%
TTGGATCACAATAATTTCAC+AGG + Chr3:45957178-45957197 MsG0380013807.01.T01:CDS 30.0%
TTTCGGTTTATATATGGAGT+GGG + Chr3:45958180-45958199 MsG0380013807.01.T01:CDS 30.0%
TTTGACAAATTAAGTCCATC+GGG - Chr3:45957103-45957122 None:intergenic 30.0%
! ATATCCAAAATGGAAAGTGT+GGG - Chr3:45956988-45957007 None:intergenic 30.0%
! ATTTTCATAAGGAACCAAAC+TGG + Chr3:45956390-45956409 MsG0380013807.01.T01:CDS 30.0%
! CCTTGTTTCTTATTAGGAAA+TGG + Chr3:45958145-45958164 MsG0380013807.01.T01:CDS 30.0%
! CTGAAAAAGATTGTTGTTCT+TGG + Chr3:45956045-45956064 MsG0380013807.01.T01:CDS 30.0%
! TGAATCTAAAGTAGAGAGTT+TGG - Chr3:45956867-45956886 None:intergenic 30.0%
! TTGGGAGAAAATGAATTTTC+TGG + Chr3:45957385-45957404 MsG0380013807.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGAAGTTGTGTTCCTATT+GGG - Chr3:45957934-45957953 None:intergenic 30.0%
!! AAGTTTTGTGACATCTTGAT+TGG - Chr3:45957418-45957437 None:intergenic 30.0%
!! AGATATTTTAAGGAAGACAG+TGG - Chr3:45956353-45956372 None:intergenic 30.0%
!! GTTTTGGTATGATTTCATTG+TGG + Chr3:45956018-45956037 MsG0380013807.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTGCAATGGAATTTTTTGAA+AGG + Chr3:45956149-45956168 MsG0380013807.01.T01:CDS 30.0%
AAAAGGGAAGAGAGTTGAAA+AGG - Chr3:45956944-45956963 None:intergenic 35.0%
AAATTGTTCCTCCTTAGTGT+TGG + Chr3:45957159-45957178 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
AAGGAATAGATCCTTGTAGT+TGG - Chr3:45956760-45956779 None:intergenic 35.0%
AGAATCAATGTATCTAGGGA+TGG + Chr3:45958084-45958103 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
AGGAGGAACAATTTAGTGTT+AGG - Chr3:45957153-45957172 None:intergenic 35.0%
ATTGGGAATCCTAAACTATG+TGG + Chr3:45957974-45957993 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
CATAGTTGGAAGAACTTGAA+AGG + Chr3:45957274-45957293 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
CATCGGGTATTCTTTCTATA+AGG - Chr3:45957087-45957106 None:intergenic 35.0%
CCAATCAAGATTATCGATAG+TGG - Chr3:45956324-45956343 None:intergenic 35.0%
CCACTATCGATAATCTTGAT+TGG + Chr3:45956321-45956340 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
CTCTCTTATAACCAACTACA+AGG + Chr3:45956674-45956693 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
CTCTTTGTAAACCAACTACA+AGG + Chr3:45956746-45956765 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
CTTATAGAAAGAATACCCGA+TGG + Chr3:45957085-45957104 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
CTTTCGGTTTATATATGGAG+TGG + Chr3:45958179-45958198 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
GAACCCAATCCAAATCAAAT+TGG - Chr3:45956919-45956938 None:intergenic 35.0%
GAAGGTTTAGTAAGCTTGAA+GGG - Chr3:45956634-45956653 None:intergenic 35.0%
GAATCAATGTATCTAGGGAT+GGG + Chr3:45958085-45958104 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
GAGAGATTGAATAGTTGTTG+CGG - Chr3:45957484-45957503 None:intergenic 35.0%
GATCACAATAATTTCACAGG+AGG + Chr3:45957181-45957200 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
GATGTCACAAAACTTACAAG+TGG + Chr3:45957423-45957442 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
GGATCAATTCCAGAAGAAAT+AGG + Chr3:45956695-45956714 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
GGATCTATTCCTTCAATTCT+AGG + Chr3:45956767-45956786 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
GTGATATTGAAAAACCCATC+AGG - Chr3:45956560-45956579 None:intergenic 35.0%
GTTACAGAAATTGATCTCAG+TGG + Chr3:45956101-45956120 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
GTTGGTTATAAGAGAGATCA+AGG - Chr3:45956670-45956689 None:intergenic 35.0%
TCATCTTCATTCTCTGTAGA+AGG - Chr3:45958052-45958071 None:intergenic 35.0%
TGAAGGTTTAGTAAGCTTGA+AGG - Chr3:45956635-45956654 None:intergenic 35.0%
TGTCTACAACTTGACTCATA+TGG + Chr3:45957565-45957584 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
TTCTTGTAATGTTGTCACAG+TGG - Chr3:45956079-45956098 None:intergenic 35.0%
TTGTCTTACAACTCATTCTC+AGG + Chr3:45957241-45957260 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
TTGTGACATCTTGATTGGTA+TGG - Chr3:45957413-45957432 None:intergenic 35.0%
TTTCAGAAATCCAACCAGAA+AGG + Chr3:45957651-45957670 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
TTTGACGGAAAAATCCCAAT+AGG + Chr3:45957917-45957936 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
! AAAGATTGTTGTTCTTGGGA+AGG + Chr3:45956050-45956069 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
! AAGTGCCATTGGAATTGTTT+CGG + Chr3:45957711-45957730 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
! AATGGAGGCATGTATACTTT+CGG + Chr3:45958163-45958182 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
! CAGGGAATCAATGATAGTTT+TGG + Chr3:45956002-45956021 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
! CATGGCTCTCTTAAACTTTT+TGG + Chr3:45957868-45957887 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
! GATTGGAGGCATGATAAATA+TGG + Chr3:45957796-45957815 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
! GTTGGTTTACAAAGAGATCA+AGG - Chr3:45956742-45956761 None:intergenic 35.0%
! TGTGGTCCTTGTTTCTTATT+AGG + Chr3:45958139-45958158 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
! TTCAAGTTCTTCCAACTATG+TGG - Chr3:45957274-45957293 None:intergenic 35.0%
! TTCACTATTTGAAGCCAGTT+TGG - Chr3:45956407-45956426 None:intergenic 35.0%
!! AAGCCAGTGTTGATATGTTT+GGG - Chr3:45957210-45957229 None:intergenic 35.0%
!! ATCATTGATTCCCTGTTTGA+AGG - Chr3:45955997-45956016 None:intergenic 35.0%
!! CTTTGAAGTTGTGTTCCTAT+TGG - Chr3:45957935-45957954 None:intergenic 35.0%
!! TAAGCCAGTGTTGATATGTT+TGG - Chr3:45957211-45957230 None:intergenic 35.0%
!!! CAACTCTCTTCCCTTTTTTT+GGG + Chr3:45956947-45956966 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
!!! TCAACTCTCTTCCCTTTTTT+TGG + Chr3:45956946-45956965 MsG0380013807.01.T01:CDS 35.0%
AAACCCATCAGGTAAATGAG+AGG - Chr3:45956549-45956568 None:intergenic 40.0%
ACAAGCCGAAACAATTCCAA+TGG - Chr3:45957719-45957738 None:intergenic 40.0%
ACACTCTTGACCTTCAAACA+GGG + Chr3:45955984-45956003 MsG0380013807.01.T01:CDS 40.0%
ACCACAATTGACCTTTCAGA+AGG + Chr3:45957617-45957636 MsG0380013807.01.T01:CDS 40.0%
AGGCTATCTGGTAAATCTCT+AGG + Chr3:45957325-45957344 MsG0380013807.01.T01:CDS 40.0%
ATAATTCCGAAGACGATTGG+AGG + Chr3:45957782-45957801 MsG0380013807.01.T01:CDS 40.0%
ATGGGATTTGGATTTGCAGT+AGG + Chr3:45958103-45958122 MsG0380013807.01.T01:CDS 40.0%
ATGTATCTAGGGATGGGATT+TGG + Chr3:45958091-45958110 MsG0380013807.01.T01:CDS 40.0%
ATTGTGATCCAACACTAAGG+AGG - Chr3:45957170-45957189 None:intergenic 40.0%
CAGGATCAATTCCACATAGT+TGG + Chr3:45957260-45957279 MsG0380013807.01.T01:CDS 40.0%
CCTTGCACACAACAAACTTT+CGG + Chr3:45957522-45957541 MsG0380013807.01.T01:CDS 40.0%
CGTAATCTTGACCTTCTGAA+AGG - Chr3:45957631-45957650 None:intergenic 40.0%
CTGATGAGAAATAGGCTATC+TGG + Chr3:45957313-45957332 MsG0380013807.01.T01:CDS 40.0%
CTGGAATTGATCCTTGTAGT+TGG - Chr3:45956688-45956707 None:intergenic 40.0%
CTTGCACACAACAAACTTTC+GGG + Chr3:45957523-45957542 MsG0380013807.01.T01:CDS 40.0%
GAGAGGTTTCCTAGAATTGA+AGG - Chr3:45956779-45956798 None:intergenic 40.0%
GGAATAATTCCGAAGACGAT+TGG + Chr3:45957779-45957798 MsG0380013807.01.T01:CDS 40.0%
GTCAAGGTAGACAAGTTTAG+AGG - Chr3:45956285-45956304 None:intergenic 40.0%
GTGATGTTGTGTTGAACAGA+TGG - Chr3:45956257-45956276 None:intergenic 40.0%
TCACCTCTCATTTACCTGAT+GGG + Chr3:45956543-45956562 MsG0380013807.01.T01:CDS 40.0%
TGGATTTGCAGTAGGTTTCT+GGG + Chr3:45958111-45958130 MsG0380013807.01.T01:CDS 40.0%
TTCACCTCTCATTTACCTGA+TGG + Chr3:45956542-45956561 MsG0380013807.01.T01:CDS 40.0%
TTGGATTTGCAGTAGGTTTC+TGG + Chr3:45958110-45958129 MsG0380013807.01.T01:CDS 40.0%
! ACCTTCTGAAAGGTCAATTG+TGG - Chr3:45957621-45957640 None:intergenic 40.0%
! CAGATAGCCTATTTCTCATC+AGG - Chr3:45957315-45957334 None:intergenic 40.0%
! GCATGATGACCTATTTCTTC+TGG - Chr3:45956707-45956726 None:intergenic 40.0%
! GGCTCTCTTAAACTTTTTGG+AGG + Chr3:45957871-45957890 MsG0380013807.01.T01:CDS 40.0%
! GTCAAGTTGTAGACACACTT+TGG - Chr3:45957560-45957579 None:intergenic 40.0%
!! AGAGATCAAGGTGTCGAATA+TGG - Chr3:45956730-45956749 None:intergenic 40.0%
!! GAGATCAAGGTGTCGAATAT+GGG - Chr3:45956729-45956748 None:intergenic 40.0%
!!! GTAGAAGGCAGTGTTGTTTT+AGG - Chr3:45958037-45958056 None:intergenic 40.0%
AGAGGAGCTCCACATAGTTT+AGG - Chr3:45957986-45958005 None:intergenic 45.0%
AGGGAAGAGAGTTGAAAAGG+AGG - Chr3:45956941-45956960 None:intergenic 45.0%
AGGTCAATAGTTCGCCTTTC+TGG - Chr3:45957668-45957687 None:intergenic 45.0%
AGTTCTCGACTTATCGAGCT+CGG + Chr3:45957027-45957046 MsG0380013807.01.T01:CDS 45.0%
ATCATGCCTCCAATCGTCTT+CGG - Chr3:45957791-45957810 None:intergenic 45.0%
CAACAGATGGGAAGTTGTTC+AGG - Chr3:45956472-45956491 None:intergenic 45.0%
CACTTCTCCAGACAAGCTAT+TGG - Chr3:45957696-45957715 None:intergenic 45.0%
CCAATTGTCTCCAATCAGAG+AGG - Chr3:45957354-45957373 None:intergenic 45.0%
CCTCTCTGATTGGAGACAAT+TGG + Chr3:45957351-45957370 MsG0380013807.01.T01:CDS 45.0%
GACACACTTTGGCATAGAAC+CGG - Chr3:45957549-45957568 None:intergenic 45.0%
GACACTCTTGACCTTCAAAC+AGG + Chr3:45955983-45956002 MsG0380013807.01.T01:CDS 45.0%
GCGGAATAGTCCCTTCAAAT+TGG - Chr3:45957465-45957484 None:intergenic 45.0%
GCTCCCAAACATATCAACAC+TGG + Chr3:45957204-45957223 MsG0380013807.01.T01:CDS 45.0%
GGATTTGCAGTAGGTTTCTG+GGG + Chr3:45958112-45958131 MsG0380013807.01.T01:CDS 45.0%
TGGTGAAATTCCTCAGAGCA+TGG + Chr3:45957850-45957869 MsG0380013807.01.T01:CDS 45.0%
TTTAAGAGAGCCATGCTCTG+AGG - Chr3:45957863-45957882 None:intergenic 45.0%
! AAGGCCCACACTTTCCATTT+TGG + Chr3:45956981-45957000 MsG0380013807.01.T01:CDS 45.0%
! CAATAGTTCGCCTTTCTGGT+TGG - Chr3:45957664-45957683 None:intergenic 45.0%
! CAGACAAGCTATTGGCTGAA+AGG - Chr3:45957688-45957707 None:intergenic 45.0%
! CTTTCAGCCAATAGCTTGTC+TGG + Chr3:45957686-45957705 MsG0380013807.01.T01:CDS 45.0%
! GATTTGCAGTAGGTTTCTGG+GGG + Chr3:45958113-45958132 MsG0380013807.01.T01:CDS 45.0%
!! CCGAAAGTTTGTTGTGTGCA+AGG - Chr3:45957525-45957544 None:intergenic 45.0%
ACAGGTTGTCCACTGAGATC+AGG - Chr3:45956131-45956150 None:intergenic 50.0%
ATCGAGCTCGGGAATTTCGT+TGG + Chr3:45957039-45957058 MsG0380013807.01.T01:CDS 50.0%
CACACAACAAACTTTCGGGC+CGG + Chr3:45957527-45957546 MsG0380013807.01.T01:CDS 50.0%
CTGAGTTGTGCGACAAGTCA+AGG - Chr3:45956301-45956320 None:intergenic 50.0%
GTTCTCGACTTATCGAGCTC+GGG + Chr3:45957028-45957047 MsG0380013807.01.T01:CDS 50.0%
TCAGTGGACAACCTGTGCAA+TGG + Chr3:45956135-45956154 MsG0380013807.01.T01:CDS 50.0%
! GTAGGTTTCTGGGGGATTTG+TGG + Chr3:45958121-45958140 MsG0380013807.01.T01:CDS 50.0%
!! CTCTAGGACACCTCTCTGAT+TGG + Chr3:45957341-45957360 MsG0380013807.01.T01:CDS 50.0%
!! CTTGTCTGGAGAAGTGCCAT+TGG + Chr3:45957700-45957719 MsG0380013807.01.T01:CDS 50.0%
AGTGGACGACCTGATCTCAG+TGG + Chr3:45956119-45956138 MsG0380013807.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 45955936 45958225 45955936 ID=MsG0380013807.01;Name=MsG0380013807.01
Chr3 mRNA 45955936 45958225 45955936 ID=MsG0380013807.01.T01;Parent=MsG0380013807.01;Name=MsG0380013807.01.T01;_AED=0.50;_eAED=0.50;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|737
Chr3 exon 45955936 45957444 45955936 ID=MsG0380013807.01.T01:exon:6301;Parent=MsG0380013807.01.T01
Chr3 exon 45957521 45958225 45957521 ID=MsG0380013807.01.T01:exon:6302;Parent=MsG0380013807.01.T01
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