AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380016417.01

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MsG0380016417.01.T01 AT1G07570 40.728 302 162 7 316 602 54 353 1.43e-60 208
MsG0380016417.01.T01 AT1G07570 40.728 302 162 7 316 602 54 353 1.43e-60 208
MsG0380016417.01.T01 AT1G07570 40.728 302 162 7 316 602 65 364 1.67e-60 208
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MsG0380016417.01.T01 AT1G09440 38.811 286 171 4 318 600 145 429 4.51e-59 206
MsG0380016417.01.T01 AT5G39000 40.397 302 174 4 313 608 501 802 5.01e-59 213
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MsG0380016417.01.T01 AT1G68690 39.869 306 174 5 302 602 352 652 9.74e-59 210
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MsG0380016417.01.T01 AT2G42960 38.462 286 172 4 318 600 171 455 1.27e-58 205
MsG0380016417.01.T01 AT2G42960 38.462 286 172 4 318 600 171 455 1.27e-58 205
MsG0380016417.01.T01 AT2G42960 38.462 286 172 4 318 600 171 455 1.27e-58 205
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MsG0380016417.01.T01 AT5G49780 43.189 301 149 5 315 603 640 930 2.14e-58 213
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MsG0380016417.01.T01 AT1G61420 39.286 280 168 2 318 595 484 763 6.70e-57 207
MsG0380016417.01.T01 AT1G67520 35.135 296 188 3 310 601 433 728 7.81e-57 206
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MsG0380016417.01.T01 AT1G61490 38.596 285 172 3 316 597 450 734 1.24e-56 206
MsG0380016417.01.T01 AT1G11300 36.778 329 196 4 276 599 437 758 1.25e-56 206
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MsG0380016417.01.T01 AT1G61490 38.596 285 172 3 316 597 476 760 1.49e-56 206
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MsG0380016417.01.T01 AT1G61360 39.510 286 169 2 318 599 405 690 4.07e-56 204
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MsG0380016417.01.T01 AT1G61430 38.652 282 171 2 316 595 452 733 6.58e-56 203
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MsG0380016417.01.T01 AT4G23270 37.209 344 194 7 318 656 314 640 1.04e-55 201
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MsG0380016417.01.T01 AT2G07180 39.796 294 165 7 317 600 77 368 1.59e-55 196
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MsG0380016417.01.T01 AT3G57750 34.251 327 202 6 287 602 6 330 2.13e-55 192
MsG0380016417.01.T01 AT1G61390 37.847 288 175 3 317 602 339 624 2.20e-55 200
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MsG0380016417.01.T01 AT2G18470 37.582 306 172 4 317 611 271 568 5.03e-55 199
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MsG0380016417.01.T01 AT1G61610 36.770 291 181 3 312 600 507 796 7.59e-55 201
MsG0380016417.01.T01 AT1G56145 34.226 336 189 3 318 624 675 1007 8.98e-55 202
MsG0380016417.01.T01 AT4G04540 40.580 276 157 4 326 599 320 590 9.07e-55 198
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MsG0380016417.01.T01 AT3G21340 37.255 306 185 5 318 620 582 883 9.83e-55 201
MsG0380016417.01.T01 AT4G11480 38.246 285 173 3 318 599 309 593 1.04e-54 198
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MsG0380016417.01.T01 AT4G04540 40.580 276 157 4 326 599 349 619 1.13e-54 198
MsG0380016417.01.T01 AT1G61390 35.072 345 212 6 262 602 456 792 1.14e-54 201
MsG0380016417.01.T01 AT1G69790 38.079 302 170 6 312 600 66 363 1.23e-54 192
MsG0380016417.01.T01 AT1G76360 38.065 310 175 8 312 607 145 451 1.26e-54 194
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MsG0380016417.01.T01 AT1G61440 37.234 282 175 2 316 595 469 750 2.41e-54 199
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MsG0380016417.01.T01 AT2G19230 39.032 310 178 7 302 609 544 844 2.97e-54 200
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MsG0380016417.01.T01 AT4G11490 37.762 286 173 4 318 599 309 593 4.88e-54 196
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MsG0380016417.01.T01 AT1G55200 38.776 294 177 3 316 607 365 657 5.22e-54 196
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MsG0380016417.01.T01 AT3G13690 38.225 293 178 3 316 606 397 688 2.46e-53 196
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MsG0380016417.01.T01 AT4G03230 30.963 436 251 9 191 599 477 889 3.06e-53 197
MsG0380016417.01.T01 AT4G11900 35.447 347 215 4 257 599 467 808 3.51e-53 196
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MsG0380016417.01.T01 AT4G23130 39.860 286 167 5 318 599 328 612 8.86e-53 193
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MsG0380016417.01.T01 AT1G51890 38.333 300 177 6 316 612 286 580 1.08e-52 192
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MsG0380016417.01.T01 AT3G46370 39.365 315 176 5 318 621 477 787 1.31e-52 194
MsG0380016417.01.T01 AT4G33430 36.950 341 193 8 278 610 293 619 1.40e-52 192
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MsG0380016417.01.T01 AT1G61430 42.857 231 131 1 316 545 475 705 1.63e-52 193
MsG0380016417.01.T01 AT2G25220 38.796 299 170 5 300 591 61 353 1.63e-52 186
MsG0380016417.01.T01 AT1G61430 42.857 231 131 1 316 545 452 682 1.71e-52 192
MsG0380016417.01.T01 AT4G03230 34.097 349 217 5 263 599 456 803 1.76e-52 194
MsG0380016417.01.T01 AT1G21590 34.161 322 206 5 306 624 345 663 1.77e-52 193
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MsG0380016417.01.T01 AT5G11020 36.842 323 183 6 305 608 73 393 1.84e-52 186
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MsG0380016417.01.T01 AT5G03140 37.248 298 171 6 314 601 358 649 2.24e-52 192
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MsG0380016417.01.T01 AT2G30740 35.254 295 182 4 318 603 59 353 2.52e-52 185
MsG0380016417.01.T01 AT2G30740 35.254 295 182 4 318 603 59 353 2.52e-52 185
MsG0380016417.01.T01 AT2G30740 35.254 295 182 4 318 603 59 353 2.52e-52 185
MsG0380016417.01.T01 AT2G30740 35.254 295 182 4 318 603 59 353 2.52e-52 185
MsG0380016417.01.T01 AT2G30740 35.254 295 182 4 318 603 59 353 2.52e-52 185
MsG0380016417.01.T01 AT2G30740 35.254 295 182 4 318 603 59 353 2.52e-52 185
MsG0380016417.01.T01 AT2G30740 35.254 295 182 4 318 603 59 353 2.52e-52 185
MsG0380016417.01.T01 AT2G30740 35.254 295 182 4 318 603 59 353 2.52e-52 185
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MsG0380016417.01.T01 AT2G30740 35.254 295 182 4 318 603 59 353 2.52e-52 185
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MsG0380016417.01.T01 AT1G21590 34.161 322 206 5 306 624 385 703 3.36e-52 192
MsG0380016417.01.T01 AT4G21390 42.241 232 131 2 309 537 506 737 3.64e-52 192
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MsG0380016417.01.T01 AT5G63710 34.405 311 198 5 316 622 240 548 3.72e-52 189
MsG0380016417.01.T01 AT5G63710 34.405 311 198 5 316 622 240 548 3.72e-52 189
MsG0380016417.01.T01 AT5G63710 34.405 311 198 5 316 622 276 584 4.04e-52 190
MsG0380016417.01.T01 AT5G03320 37.742 310 167 9 309 595 52 358 4.09e-52 186
MsG0380016417.01.T01 AT5G03320 37.742 310 167 9 309 595 52 358 4.09e-52 186
MsG0380016417.01.T01 AT5G11020 36.842 323 183 6 305 608 107 427 4.19e-52 186
MsG0380016417.01.T01 AT4G04510 35.191 341 195 7 318 656 329 645 4.60e-52 191
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MsG0380016417.01.T01 AT1G34210 38.435 294 170 5 316 601 291 581 4.83e-52 190
MsG0380016417.01.T01 AT3G46400 38.488 291 173 4 318 606 566 852 4.84e-52 193
MsG0380016417.01.T01 AT5G63710 34.405 311 198 5 316 622 275 583 4.85e-52 190
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MsG0380016417.01.T01 AT4G04510 35.191 341 195 7 318 656 327 643 5.24e-52 191
MsG0380016417.01.T01 AT1G51880 38.435 294 174 5 318 609 556 844 5.62e-52 193
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MsG0380016417.01.T01 AT1G51880 38.435 294 174 5 318 609 574 862 9.16e-52 192
MsG0380016417.01.T01 AT5G16000 38.225 293 165 5 318 601 300 585 1.05e-51 189
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MsG0380016417.01.T01 AT5G65700 37.874 301 183 3 324 621 688 987 1.09e-51 193
MsG0380016417.01.T01 AT5G63930 37.700 313 175 7 318 619 728 1031 1.09e-51 193
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MsG0380016417.01.T01 AT4G30520 35.196 358 206 8 263 614 248 585 1.66e-51 189
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MsG0380016417.01.T01 AT3G09830 37.801 291 167 7 318 595 72 361 2.44e-51 184
MsG0380016417.01.T01 AT3G09830 37.801 291 167 7 318 595 72 361 2.44e-51 184
MsG0380016417.01.T01 AT2G19210 36.982 338 198 8 266 600 522 847 3.13e-51 191
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MsG0380016417.01.T01 AT2G35620 38.603 272 165 1 329 600 303 572 6.15e-51 186
MsG0380016417.01.T01 AT2G35620 38.603 272 165 1 329 600 303 572 6.15e-51 186

Find 140 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 189 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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CATCACTCTTCTCTGTTAAT+TGG 0.176525 3:-83162341 None:intergenic
TGGCTTGTGTGGAAGTATTC+TGG 0.199926 3:-83162321 None:intergenic
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AAATTATTCTTTAGATATTA+AGG 0.219534 3:+83161101 MsG0380016417.01.T01:CDS
TTAAACATTGTTCTGCAATA+TGG 0.220072 3:-83162548 None:intergenic
TTCCATTGCCACTTCTTTCA+TGG 0.228935 3:-83162595 None:intergenic
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CTGGTTTGGGTCACTAATTT+TGG 0.259235 3:-83161902 None:intergenic
CTCGTCCTTACATGCATAAT+TGG 0.265307 3:-83160355 None:intergenic
TCTGAGCTTGCAGGCATGTT+TGG 0.268143 3:-83160323 None:intergenic
GGAAGTGATATTAATTCTTC+TGG 0.279282 3:+83162738 MsG0380016417.01.T01:CDS
GGAAAGAAAGCACTATCTTT+TGG 0.296481 3:+83162402 MsG0380016417.01.T01:CDS
CACATTTCTATGGTTGATTT+GGG 0.299512 3:-83161959 None:intergenic
AAAGATTCTTCTGAGCTTGC+AGG 0.306989 3:-83160332 None:intergenic
ATATCTTTACCACATTTCTA+TGG 0.325134 3:-83161969 None:intergenic
GCAAGGTTTCTATCAACTTC+TGG 0.325468 3:-83162429 None:intergenic
CTTTGTTTCTTCAATGAAAC+AGG 0.327048 3:+83162458 MsG0380016417.01.T01:CDS
TATGATGTCTTTCCTTGCTT+TGG 0.327675 3:-83161259 None:intergenic
TATATAGATAATACAATGTC+TGG 0.329712 3:-83160651 None:intergenic
ATGAACGGCTCGATCTGGTT+TGG 0.341747 3:-83161916 None:intergenic
TACAATTCAACTGAGAGATT+TGG 0.344789 3:+83160390 MsG0380016417.01.T01:CDS
TCCATGTAAGCTTTATAGAT+TGG 0.347702 3:-83162080 None:intergenic
TAAACATTGTTCTGCAATAT+GGG 0.349938 3:-83162547 None:intergenic
TGAACGGCTCGATCTGGTTT+GGG 0.357049 3:-83161915 None:intergenic
CTAATCAAATTGGTCTTGTC+AGG 0.366430 3:+83160523 MsG0380016417.01.T01:CDS
ACTGCAAAGGTTTCTGACTT+TGG 0.368092 3:+83162225 MsG0380016417.01.T01:CDS
CCGTCTCCGTCATATCCTGC+TGG 0.375961 3:-83161198 None:intergenic
CAAATTGGTCTTGTCAGGTT+TGG 0.384610 3:+83160528 MsG0380016417.01.T01:CDS
CCATGTAAGCTTTATAGATT+GGG 0.387965 3:-83162079 None:intergenic
ACGGGAGGGTCATATGGTTC+TGG 0.392879 3:+83160150 MsG0380016417.01.T01:CDS
TTCACATCTCTATGTATGAT+TGG 0.393983 3:-83162171 None:intergenic
TGTGGTGAGGCTAATCAAAT+TGG 0.394482 3:+83160513 MsG0380016417.01.T01:CDS
CACCAATCGATATCGAAATC+TGG 0.394514 3:-83162776 None:intergenic
AGAAATGTGGTAAAGATATT+GGG 0.405463 3:+83161973 MsG0380016417.01.T01:CDS
GTCTTTCCTTGCTTTGGTAG+TGG 0.406173 3:-83161253 None:intergenic
ATTGCCACTTCTTTCATGGT+TGG 0.408118 3:-83162591 None:intergenic
CATTGATGAACGGCTCGATC+TGG 0.410223 3:-83161921 None:intergenic
AATAAATTCATAAACAACTA+AGG 0.413600 3:-83162019 None:intergenic
TCTTTCCAATTATGCATGTA+AGG 0.429698 3:+83160350 MsG0380016417.01.T01:CDS
AGTTTCCTGTGTTGTTGGAC+TGG 0.431847 3:+83160289 MsG0380016417.01.T01:CDS
GACCCCAATGTCTGTGTTGA+GGG 0.432969 3:+83161132 MsG0380016417.01.T01:CDS
CATAAACAATGGTAGCTTCC+AGG 0.432969 3:-83161174 None:intergenic
GGCTTGTGTGGAAGTATTCT+GGG 0.442105 3:-83162320 None:intergenic
TACCTTTGCAAATGTGTTCA+TGG 0.445285 3:+83160414 MsG0380016417.01.T01:CDS
CCCAATCTATAAAGCTTACA+TGG 0.445971 3:+83162079 MsG0380016417.01.T01:CDS
GCGAGATGCATCGATGCTCC+TGG 0.450383 3:+83161156 MsG0380016417.01.T01:CDS
AGTTATTGAAGAGTGCCGTT+GGG 0.451610 3:+83162632 MsG0380016417.01.T01:CDS
TCAAATAAACACTCTAGTGC+AGG 0.459883 3:+83162278 MsG0380016417.01.T01:CDS
CTTGTTATGAATCATGTTTG+TGG 0.461151 3:+83160495 MsG0380016417.01.T01:CDS
ATGTTAACGGGAGGGTCATA+TGG 0.464189 3:+83160144 MsG0380016417.01.T01:CDS
ACTCTAGTGCAGGGAACGTT+GGG 0.467839 3:+83162288 MsG0380016417.01.T01:CDS
AAAAGAAACTGCTGGAGTCT+TGG 0.470746 3:+83162122 MsG0380016417.01.T01:CDS
GAAGGAGTTTCCTGTGTTGT+TGG 0.471882 3:+83160284 MsG0380016417.01.T01:CDS
AGTCTCATAGCACTATTGAT+TGG 0.472178 3:+83161616 MsG0380016417.01.T01:CDS
GTTTCCTGTGTTGTTGGACT+GGG 0.474105 3:+83160290 MsG0380016417.01.T01:CDS
AAATGTGTTCATGGATATCA+AGG 0.474339 3:+83160423 MsG0380016417.01.T01:CDS
TTTCTGACTTTGGAGCTTCA+AGG 0.476403 3:+83162235 MsG0380016417.01.T01:CDS
CCCCAAGGTCACATGTTAAC+GGG 0.478549 3:+83160132 None:intergenic
AACCAGATTTCGATATCGAT+TGG 0.481466 3:+83162774 MsG0380016417.01.T01:CDS
CAACAACAGATGGGGAGGTA+TGG 0.486659 3:+83161727 MsG0380016417.01.T01:CDS
TACCATTGTTTATGCCCAGC+AGG 0.489995 3:+83161183 MsG0380016417.01.T01:CDS
CACTCTAGTGCAGGGAACGT+TGG 0.490089 3:+83162287 MsG0380016417.01.T01:CDS
TGCTCATGAACAGTACCATT+GGG 0.499312 3:-83162042 None:intergenic
ACAGAACTGTAGCAATTAAG+AGG 0.499919 3:+83161878 MsG0380016417.01.T01:CDS
TTTAGATATTAAGGAATGCA+TGG 0.501842 3:+83161110 MsG0380016417.01.T01:CDS
CAGCAGGATATGACGGAGAC+GGG 0.503517 3:+83161199 MsG0380016417.01.T01:CDS
GTTTATGAATTTATTCCCAA+TGG 0.504075 3:+83162027 MsG0380016417.01.T01:CDS
TAGTTATTGAAGAGTGCCGT+TGG 0.504453 3:+83162631 MsG0380016417.01.T01:CDS
ACCCCAAGGTCACATGTTAA+CGG 0.508166 3:+83160131 None:intergenic
CGTCTCCGTCATATCCTGCT+GGG 0.510291 3:-83161197 None:intergenic
AATGTTCAAGATGGTATTGG+TGG 0.511082 3:+83162717 MsG0380016417.01.T01:CDS
AGAATAGCAAAAGAAACTGC+TGG 0.512260 3:+83162114 MsG0380016417.01.T01:CDS
CTTGTTGTTACAACAACAGA+TGG 0.513351 3:+83161717 MsG0380016417.01.T01:CDS
ATGCTCATGAACAGTACCAT+TGG 0.516082 3:-83162043 None:intergenic
TCTCTGTTAATTGGCTTGTG+TGG 0.522624 3:-83162332 None:intergenic
GTCTGGGCGAAGTCTAAGAT+AGG 0.524816 3:-83160634 None:intergenic
AGAACAATGTTTAAGAGTGA+AGG 0.524937 3:+83162557 MsG0380016417.01.T01:CDS
GGAAATCCTTACCTCAATCA+TGG 0.525014 3:+83160444 MsG0380016417.01.T01:CDS
ATCCTAGGCCAAGGTGGTCA+AGG 0.527255 3:+83161826 MsG0380016417.01.T01:CDS
AACTAAAGTGTTCACTATTG+AGG 0.530404 3:+83161765 MsG0380016417.01.T01:CDS
TTCCTTGACCACCTTGGCCT+AGG 0.536550 3:-83161828 None:intergenic
AGATCTCCTCGGGTTGAAGA+AGG 0.537182 3:+83160266 MsG0380016417.01.T01:CDS
TTTATTTGACTATGATCAAG+AGG 0.539193 3:-83162264 None:intergenic
GGACCCCAATGTCTGTGTTG+AGG 0.539934 3:+83161131 MsG0380016417.01.T01:CDS
AGAAGAAATGTATAATACCT+TGG 0.542030 3:-83160470 None:intergenic
TACCTTGGCAACCATGATTG+AGG 0.549185 3:-83160455 None:intergenic
AAATATTGAGCAACTGAAAG+AGG 0.549659 3:+83162521 MsG0380016417.01.T01:CDS
TTTGATGAAGACAAGATCCT+AGG 0.554309 3:+83161811 MsG0380016417.01.T01:CDS
TGGCAACCATGATTGAGGTA+AGG 0.556858 3:-83160450 None:intergenic
TTCCTGTCAGTAGCTCTGCT+AGG 0.558657 3:-83162383 None:intergenic
AACAGATGGGGAGGTATGGA+AGG 0.559366 3:+83161731 MsG0380016417.01.T01:CDS
TGACACGATCAGATCTCCTC+GGG 0.559380 3:+83160256 MsG0380016417.01.T01:CDS
TTGACACGATCAGATCTCCT+CGG 0.562457 3:+83160255 MsG0380016417.01.T01:CDS
GTCCTAGCAGAGCTACTGAC+AGG 0.563665 3:+83162381 MsG0380016417.01.T01:CDS
TACCTCAATCATGGTTGCCA+AGG 0.564300 3:+83160453 MsG0380016417.01.T01:CDS
TTTCTTCAATGAAACAGGAT+CGG 0.572932 3:+83162463 MsG0380016417.01.T01:CDS
AACCATGAAAGAAGTGGCAA+TGG 0.576620 3:+83162593 MsG0380016417.01.T01:CDS
ATAAATTCATAAACAACTAA+GGG 0.578827 3:-83162018 None:intergenic
GAACAATGTTTAAGAGTGAA+GGG 0.580089 3:+83162558 MsG0380016417.01.T01:CDS
CAAATAAACACTCTAGTGCA+GGG 0.585480 3:+83162279 MsG0380016417.01.T01:CDS
CAGATTTCGATATCGATTGG+TGG 0.585521 3:+83162777 MsG0380016417.01.T01:CDS
AGATCACAATCTCACTGCAA+AGG 0.587403 3:+83162212 MsG0380016417.01.T01:CDS
TTGTTGTTACAACAACAGAT+GGG 0.591158 3:+83161718 MsG0380016417.01.T01:CDS
CCAGCAGGATATGACGGAGA+CGG 0.591304 3:+83161198 MsG0380016417.01.T01:CDS
ATATAGATAATACAATGTCT+GGG 0.600853 3:-83160650 None:intergenic
TTATGCCCAGCAGGATATGA+CGG 0.601273 3:+83161192 MsG0380016417.01.T01:CDS
AGAAGTGGCAATGGAACTAG+AGG 0.602523 3:+83162602 MsG0380016417.01.T01:CDS
ATCCATGAACACATTTGCAA+AGG 0.603395 3:-83160416 None:intergenic
CCCCAATGTCTGTGTTGAGG+GGG 0.610846 3:+83161134 MsG0380016417.01.T01:CDS
AAACTGTTCCTTGACCACCT+TGG 0.611684 3:-83161834 None:intergenic
GTGTTGTTGGACTGGGCAGT+AGG 0.612895 3:+83160297 MsG0380016417.01.T01:CDS
CGAGCCGTTCATCAATGAAG+TGG 0.613469 3:+83161927 MsG0380016417.01.T01:CDS
CCAAATCAACCATAGAAATG+TGG 0.613579 3:+83161960 MsG0380016417.01.T01:CDS
GAAGACAAGATCCTAGGCCA+AGG 0.625764 3:+83161817 MsG0380016417.01.T01:CDS
CATTGAAGAAACAAAGTATG+CGG 0.626310 3:-83162451 None:intergenic
TATGAATCATGTTTGTGGTG+AGG 0.631781 3:+83160500 MsG0380016417.01.T01:CDS
GTTATTGAAGAGTGCCGTTG+GGG 0.633919 3:+83162633 MsG0380016417.01.T01:CDS
GGAGATCTGATCGTGTCAAG+CGG 0.635007 3:-83160251 None:intergenic
CAAAATCCACTACCAAAGCA+AGG 0.636509 3:+83161247 MsG0380016417.01.T01:CDS
ATCTGATCGTGTCAAGCGGT+AGG 0.637085 3:-83160247 None:intergenic
CAGACCAACCATGAAAGAAG+TGG 0.638379 3:+83162587 MsG0380016417.01.T01:CDS
ACCCCAATGTCTGTGTTGAG+GGG 0.640292 3:+83161133 MsG0380016417.01.T01:CDS
CAAGGTCACATGTTAACGGG+AGG 0.641654 3:+83160135 None:intergenic
ATCCTGCTGGGCATAAACAA+TGG 0.645418 3:-83161185 None:intergenic
AAGAAACAAAGTATGCGGCA+AGG 0.649440 3:-83162446 None:intergenic
TGTTACAACAACAGATGGGG+AGG 0.652458 3:+83161722 MsG0380016417.01.T01:CDS
AAGGTCACATGTTAACGGGA+GGG 0.657431 3:+83160136 None:intergenic
GACAAGATCCTAGGCCAAGG+TGG 0.659029 3:+83161820 MsG0380016417.01.T01:CDS
ATGTTTAAGAGTGAAGGGCG+AGG 0.661115 3:+83162563 MsG0380016417.01.T01:CDS
ACGACCACTTCATTGATGAA+CGG 0.662827 3:-83161931 None:intergenic
ACTGCCCAGTCCAACAACAC+AGG 0.662885 3:-83160294 None:intergenic
TGTTGTTACAACAACAGATG+GGG 0.663184 3:+83161719 MsG0380016417.01.T01:CDS
ACAAATAGTCACTTCCCCAA+CGG 0.670179 3:-83162647 None:intergenic
GAAACTCCTTCTTCAACCCG+AGG 0.677940 3:-83160272 None:intergenic
GGTCAAGGAACAGTTTACAA+AGG 0.690023 3:+83161841 MsG0380016417.01.T01:CDS
GTACATGACTTCAATCCATG+TGG 0.699082 3:+83160198 MsG0380016417.01.T01:CDS
GAAGTGGCAATGGAACTAGA+GGG 0.737221 3:+83162603 MsG0380016417.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAATTATTAAAGTTGAAAT+TGG + Chr3:83160884-83160903 MsG0380016417.01.T01:intron 10.0%
!! AAATTATTCTTTAGATATTA+AGG + Chr3:83161101-83161120 MsG0380016417.01.T01:CDS 10.0%
!! AATAAATTCATAAACAACTA+AGG - Chr3:83162022-83162041 None:intergenic 15.0%
!! ATAAATTCATAAACAACTAA+GGG - Chr3:83162021-83162040 None:intergenic 15.0%
!! TAAAAACATACTAAGTAATT+TGG - Chr3:83160914-83160933 None:intergenic 15.0%
!! AAAATGCTACAAAAAACATT+TGG - Chr3:83160961-83160980 None:intergenic 20.0%
!! ATATAGATAATACAATGTCT+GGG - Chr3:83160653-83160672 None:intergenic 20.0%
!! CAAAACAACAATTTATAACA+TGG - Chr3:83161431-83161450 None:intergenic 20.0%
!! TATATAGATAATACAATGTC+TGG - Chr3:83160654-83160673 None:intergenic 20.0%
!! TTTCAATGAAATATATGGAT+GGG + Chr3:83160692-83160711 MsG0380016417.01.T01:intron 20.0%
!!! ATACGAAAACAACATTTTTA+GGG + Chr3:83160721-83160740 MsG0380016417.01.T01:intron 20.0%
!!! GATAATAAAATTTGTTGACA+TGG - Chr3:83161351-83161370 None:intergenic 20.0%
!!! TATACGAAAACAACATTTTT+AGG + Chr3:83160720-83160739 MsG0380016417.01.T01:intron 20.0%
!!! TTACTTAGTATGTTTTTACT+TGG + Chr3:83160916-83160935 MsG0380016417.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTGAGTGATTGTTAAATA+TGG - Chr3:83160178-83160197 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTTACATTGAAAACTCAT+TGG + Chr3:83161017-83161036 MsG0380016417.01.T01:intron 20.0%
! AAAAATGTTCAAGATGGTAT+TGG + Chr3:83162714-83162733 MsG0380016417.01.T01:CDS 25.0%
! AACAAAACGAAAAATAACAC+TGG - Chr3:83160568-83160587 None:intergenic 25.0%
! AGAAATGTGGTAAAGATATT+GGG + Chr3:83161973-83161992 MsG0380016417.01.T01:CDS 25.0%
! AGAAGAAATGTATAATACCT+TGG - Chr3:83160473-83160492 None:intergenic 25.0%
! ATATCTTTACCACATTTCTA+TGG - Chr3:83161972-83161991 None:intergenic 25.0%
! ATTGAAAACTCATTGGTAAA+AGG + Chr3:83161024-83161043 MsG0380016417.01.T01:intron 25.0%
! GACAGTTTCAATGAAATATA+TGG + Chr3:83160687-83160706 MsG0380016417.01.T01:intron 25.0%
! GTTTATGAATTTATTCCCAA+TGG + Chr3:83162027-83162046 MsG0380016417.01.T01:CDS 25.0%
! GTTTCAATGAAATATATGGA+TGG + Chr3:83160691-83160710 MsG0380016417.01.T01:intron 25.0%
! TAAACATTGTTCTGCAATAT+GGG - Chr3:83162550-83162569 None:intergenic 25.0%
! TAGAAATGTGGTAAAGATAT+TGG + Chr3:83161972-83161991 MsG0380016417.01.T01:CDS 25.0%
! TTAAACATTGTTCTGCAATA+TGG - Chr3:83162551-83162570 None:intergenic 25.0%
! TTGTACAAATATCAAGTTTC+TGG + Chr3:83160982-83161001 MsG0380016417.01.T01:intron 25.0%
! TTTAGATATTAAGGAATGCA+TGG + Chr3:83161110-83161129 MsG0380016417.01.T01:CDS 25.0%
! TTTATTTGACTATGATCAAG+AGG - Chr3:83162267-83162286 None:intergenic 25.0%
! TTTGGACAAAAATATAGATG+AGG + Chr3:83162497-83162516 MsG0380016417.01.T01:CDS 25.0%
!! AAGAGTGATGTTTATAGTTT+TGG + Chr3:83162354-83162373 MsG0380016417.01.T01:CDS 25.0%
!! AGAGTGATGTTTATAGTTTT+GGG + Chr3:83162355-83162374 MsG0380016417.01.T01:CDS 25.0%
!! ATAACATGGATTAACATTGT+TGG - Chr3:83161417-83161436 None:intergenic 25.0%
!!! ACCATCTTGAACATTTTTTA+CGG - Chr3:83162712-83162731 None:intergenic 25.0%
!!! GAACATTTTTTTCAACGAAA+CGG + Chr3:83161691-83161710 MsG0380016417.01.T01:CDS 25.0%
AAACGAAAAATAACACTGGA+TGG - Chr3:83160564-83160583 None:intergenic 30.0%
AAATATTGAGCAACTGAAAG+AGG + Chr3:83162521-83162540 MsG0380016417.01.T01:CDS 30.0%
AAATGTGTTCATGGATATCA+AGG + Chr3:83160423-83160442 MsG0380016417.01.T01:CDS 30.0%
AGAACAATGTTTAAGAGTGA+AGG + Chr3:83162557-83162576 MsG0380016417.01.T01:CDS 30.0%
CATTGAAGAAACAAAGTATG+CGG - Chr3:83162454-83162473 None:intergenic 30.0%
GAACAATGTTTAAGAGTGAA+GGG + Chr3:83162558-83162577 MsG0380016417.01.T01:CDS 30.0%
GGAAGTGATATTAATTCTTC+TGG + Chr3:83162738-83162757 MsG0380016417.01.T01:CDS 30.0%
TACAATTCAACTGAGAGATT+TGG + Chr3:83160390-83160409 MsG0380016417.01.T01:CDS 30.0%
TCCGTAAAAAATGTTCAAGA+TGG + Chr3:83162708-83162727 MsG0380016417.01.T01:CDS 30.0%
TCTTTCCAATTATGCATGTA+AGG + Chr3:83160350-83160369 MsG0380016417.01.T01:CDS 30.0%
TTCACATCTCTATGTATGAT+TGG - Chr3:83162174-83162193 None:intergenic 30.0%
TTGAAATGAAACTCATACCA+AGG + Chr3:83161448-83161467 MsG0380016417.01.T01:intron 30.0%
TTTCTTCAATGAAACAGGAT+CGG + Chr3:83162463-83162482 MsG0380016417.01.T01:CDS 30.0%
! AACTAAAGTGTTCACTATTG+AGG + Chr3:83161765-83161784 MsG0380016417.01.T01:CDS 30.0%
! CACATTTCTATGGTTGATTT+GGG - Chr3:83161962-83161981 None:intergenic 30.0%
! CCATGTAAGCTTTATAGATT+GGG - Chr3:83162082-83162101 None:intergenic 30.0%
! CTTGTTATGAATCATGTTTG+TGG + Chr3:83160495-83160514 MsG0380016417.01.T01:CDS 30.0%
! CTTTGTTTCTTCAATGAAAC+AGG + Chr3:83162458-83162477 MsG0380016417.01.T01:CDS 30.0%
! TCCATGTAAGCTTTATAGAT+TGG - Chr3:83162083-83162102 None:intergenic 30.0%
! TGGAAGCTTTTATGCATATT+TGG + Chr3:83161636-83161655 MsG0380016417.01.T01:CDS 30.0%
! TTGTTGTTACAACAACAGAT+GGG + Chr3:83161718-83161737 MsG0380016417.01.T01:CDS 30.0%
!! GAGTGATGTTTATAGTTTTG+GGG + Chr3:83162356-83162375 MsG0380016417.01.T01:CDS 30.0%
!!! TATGCTTTTTTGGCTGAAAA+TGG + Chr3:83160222-83160241 MsG0380016417.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTACTTGGTGCTTAATCA+TGG + Chr3:83160929-83160948 MsG0380016417.01.T01:intron 30.0%
AACCAGATTTCGATATCGAT+TGG + Chr3:83162774-83162793 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
ACAGAACTGTAGCAATTAAG+AGG + Chr3:83161878-83161897 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
AGAATAGCAAAAGAAACTGC+TGG + Chr3:83162114-83162133 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
AGTCTCATAGCACTATTGAT+TGG + Chr3:83161616-83161635 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
ATCCATGAACACATTTGCAA+AGG - Chr3:83160419-83160438 None:intergenic 35.0%
CAAATAAACACTCTAGTGCA+GGG + Chr3:83162279-83162298 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
CATCACTCTTCTCTGTTAAT+TGG - Chr3:83162344-83162363 None:intergenic 35.0%
CCAAATCAACCATAGAAATG+TGG + Chr3:83161960-83161979 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
CCACATTTCTATGGTTGATT+TGG - Chr3:83161963-83161982 None:intergenic 35.0%
CCCAATCTATAAAGCTTACA+TGG + Chr3:83162079-83162098 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
CTCTGTTGTGAAAACAGAAA+TGG + Chr3:83161070-83161089 MsG0380016417.01.T01:intron 35.0%
GAAAAATAACACTGGATGGA+AGG - Chr3:83160560-83160579 None:intergenic 35.0%
GTTTCCATTTGTTTATGTCC+AGG + Chr3:83161583-83161602 MsG0380016417.01.T01:intron 35.0%
TACCTTTGCAAATGTGTTCA+TGG + Chr3:83160414-83160433 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
TATGAATCATGTTTGTGGTG+AGG + Chr3:83160500-83160519 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
TATGATGTCTTTCCTTGCTT+TGG - Chr3:83161262-83161281 None:intergenic 35.0%
TCAAATAAACACTCTAGTGC+AGG + Chr3:83162278-83162297 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
TGTTGTTACAACAACAGATG+GGG + Chr3:83161719-83161738 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
TTTGATGAAGACAAGATCCT+AGG + Chr3:83161811-83161830 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
! AATGTTCAAGATGGTATTGG+TGG + Chr3:83162717-83162736 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
! GGATCGGTTACTTCATATTT+TGG + Chr3:83162479-83162498 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
!! CTAATCAAATTGGTCTTGTC+AGG + Chr3:83160523-83160542 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTGTTGTTACAACAACAGA+TGG + Chr3:83161717-83161736 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
!!! AACATTTTTAGGGTGTGAAG+CGG + Chr3:83160731-83160750 MsG0380016417.01.T01:intron 35.0%
!!! CATTTTTTTCAACGAAACGG+TGG + Chr3:83161694-83161713 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
!!! GGAAAGAAAGCACTATCTTT+TGG + Chr3:83162402-83162421 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
!!! TCCATGTGGTTATGCTTTTT+TGG + Chr3:83160212-83160231 MsG0380016417.01.T01:CDS 35.0%
AAAAGAAACTGCTGGAGTCT+TGG + Chr3:83162122-83162141 MsG0380016417.01.T01:CDS 40.0%
AAAGATTCTTCTGAGCTTGC+AGG - Chr3:83160335-83160354 None:intergenic 40.0%
AACCATGAAAGAAGTGGCAA+TGG + Chr3:83162593-83162612 MsG0380016417.01.T01:CDS 40.0%
AAGAAACAAAGTATGCGGCA+AGG - Chr3:83162449-83162468 None:intergenic 40.0%
ACAAATAGTCACTTCCCCAA+CGG - Chr3:83162650-83162669 None:intergenic 40.0%
ACGACCACTTCATTGATGAA+CGG - Chr3:83161934-83161953 None:intergenic 40.0%
ACTGCAAAGGTTTCTGACTT+TGG + Chr3:83162225-83162244 MsG0380016417.01.T01:CDS 40.0%
AGATCACAATCTCACTGCAA+AGG + Chr3:83162212-83162231 MsG0380016417.01.T01:CDS 40.0%
ATAAGACACGTACGTGTCTT+TGG - Chr3:83160819-83160838 None:intergenic 40.0%
ATGCTCATGAACAGTACCAT+TGG - Chr3:83162046-83162065 None:intergenic 40.0%
CAAAATCCACTACCAAAGCA+AGG + Chr3:83161247-83161266 MsG0380016417.01.T01:CDS 40.0%
CACCAATCGATATCGAAATC+TGG - Chr3:83162779-83162798 None:intergenic 40.0%
CATAAACAATGGTAGCTTCC+AGG - Chr3:83161177-83161196 None:intergenic 40.0%
CTCGTCCTTACATGCATAAT+TGG - Chr3:83160358-83160377 None:intergenic 40.0%
GACACCTGGACATAAACAAA+TGG - Chr3:83161590-83161609 None:intergenic 40.0%
GACGGGAAAAATAAAGGAAC+AGG + Chr3:83161216-83161235 MsG0380016417.01.T01:CDS 40.0%
GCAACAATGAACTCTGTAGA+AGG + Chr3:83160754-83160773 MsG0380016417.01.T01:intron 40.0%
GCAAGGTTTCTATCAACTTC+TGG - Chr3:83162432-83162451 None:intergenic 40.0%
GGAAATCCTTACCTCAATCA+TGG + Chr3:83160444-83160463 MsG0380016417.01.T01:CDS 40.0%
GGTCAAGGAACAGTTTACAA+AGG + Chr3:83161841-83161860 MsG0380016417.01.T01:CDS 40.0%
GTACATGACTTCAATCCATG+TGG + Chr3:83160198-83160217 MsG0380016417.01.T01:CDS 40.0%
TGCTCATGAACAGTACCATT+GGG - Chr3:83162045-83162064 None:intergenic 40.0%
TGTGGTGAGGCTAATCAAAT+TGG + Chr3:83160513-83160532 MsG0380016417.01.T01:CDS 40.0%
! ATTGCCACTTCTTTCATGGT+TGG - Chr3:83162594-83162613 None:intergenic 40.0%
! CAGATTTCGATATCGATTGG+TGG + Chr3:83162777-83162796 MsG0380016417.01.T01:CDS 40.0%
! GCCAAAAAAGCATAACCACA+TGG - Chr3:83160216-83160235 None:intergenic 40.0%
! TCTGTTTTCACAACAGAGAG+CGG - Chr3:83161068-83161087 None:intergenic 40.0%
! TTCCATTGCCACTTCTTTCA+TGG - Chr3:83162598-83162617 None:intergenic 40.0%
!! AGTTATTGAAGAGTGCCGTT+GGG + Chr3:83162632-83162651 MsG0380016417.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAATTGGTCTTGTCAGGTT+TGG + Chr3:83160528-83160547 MsG0380016417.01.T01:CDS 40.0%
!! TAGTTATTGAAGAGTGCCGT+TGG + Chr3:83162631-83162650 MsG0380016417.01.T01:CDS 40.0%
!! TCTCTGTTAATTGGCTTGTG+TGG - Chr3:83162335-83162354 None:intergenic 40.0%
!! TTTCTGACTTTGGAGCTTCA+AGG + Chr3:83162235-83162254 MsG0380016417.01.T01:CDS 40.0%
!!! ACATTTTTAGGGTGTGAAGC+GGG + Chr3:83160732-83160751 MsG0380016417.01.T01:intron 40.0%
!!! AGAAAGCACTATCTTTTGGC+AGG + Chr3:83162406-83162425 MsG0380016417.01.T01:CDS 40.0%
!!! CTGGTTTGGGTCACTAATTT+TGG - Chr3:83161905-83161924 None:intergenic 40.0%
!!! CTTGCTTTGGTAGTGGATTT+TGG - Chr3:83161249-83161268 None:intergenic 40.0%
AAACTGTTCCTTGACCACCT+TGG - Chr3:83161837-83161856 None:intergenic 45.0%
AAATGCCACTGCTCTGATCT+TGG - Chr3:83161485-83161504 None:intergenic 45.0%
AGAAGTGGCAATGGAACTAG+AGG + Chr3:83162602-83162621 MsG0380016417.01.T01:CDS 45.0%
ATCCTGCTGGGCATAAACAA+TGG - Chr3:83161188-83161207 None:intergenic 45.0%
ATGTTAACGGGAGGGTCATA+TGG + Chr3:83160144-83160163 MsG0380016417.01.T01:CDS 45.0%
ATGTTTAAGAGTGAAGGGCG+AGG + Chr3:83162563-83162582 MsG0380016417.01.T01:CDS 45.0%
CAGACCAACCATGAAAGAAG+TGG + Chr3:83162587-83162606 MsG0380016417.01.T01:CDS 45.0%
GAAGGAGTTTCCTGTGTTGT+TGG + Chr3:83160284-83160303 MsG0380016417.01.T01:CDS 45.0%
GAAGTGGCAATGGAACTAGA+GGG + Chr3:83162603-83162622 MsG0380016417.01.T01:CDS 45.0%
GACGGAGACGGGAAAAATAA+AGG + Chr3:83161210-83161229 MsG0380016417.01.T01:CDS 45.0%
GTCTTTCCTTGCTTTGGTAG+TGG - Chr3:83161256-83161275 None:intergenic 45.0%
TACCATTGTTTATGCCCAGC+AGG + Chr3:83161183-83161202 MsG0380016417.01.T01:CDS 45.0%
TACCTCAATCATGGTTGCCA+AGG + Chr3:83160453-83160472 MsG0380016417.01.T01:CDS 45.0%
TACCTTGGCAACCATGATTG+AGG - Chr3:83160458-83160477 None:intergenic 45.0%
TCTTGGTGGGATGAATACCT+TGG - Chr3:83161468-83161487 None:intergenic 45.0%
TGGCAACCATGATTGAGGTA+AGG - Chr3:83160453-83160472 None:intergenic 45.0%
TGTTACAACAACAGATGGGG+AGG + Chr3:83161722-83161741 MsG0380016417.01.T01:CDS 45.0%
TTATGCCCAGCAGGATATGA+CGG + Chr3:83161192-83161211 MsG0380016417.01.T01:CDS 45.0%
TTGACACGATCAGATCTCCT+CGG + Chr3:83160255-83160274 MsG0380016417.01.T01:CDS 45.0%
! AGTTTCCTGTGTTGTTGGAC+TGG + Chr3:83160289-83160308 MsG0380016417.01.T01:CDS 45.0%
! GTTTCCTGTGTTGTTGGACT+GGG + Chr3:83160290-83160309 MsG0380016417.01.T01:CDS 45.0%
!! GGCTTGTGTGGAAGTATTCT+GGG - Chr3:83162323-83162342 None:intergenic 45.0%
!! GTTATTGAAGAGTGCCGTTG+GGG + Chr3:83162633-83162652 MsG0380016417.01.T01:CDS 45.0%
!! TGGCTTGTGTGGAAGTATTC+TGG - Chr3:83162324-83162343 None:intergenic 45.0%
ACCCCAATGTCTGTGTTGAG+GGG + Chr3:83161133-83161152 MsG0380016417.01.T01:CDS 50.0%
ACTCTAGTGCAGGGAACGTT+GGG + Chr3:83162288-83162307 MsG0380016417.01.T01:CDS 50.0%
ATCTGATCGTGTCAAGCGGT+AGG - Chr3:83160250-83160269 None:intergenic 50.0%
ATGAACGGCTCGATCTGGTT+TGG - Chr3:83161919-83161938 None:intergenic 50.0%
CAACAACAGATGGGGAGGTA+TGG + Chr3:83161727-83161746 MsG0380016417.01.T01:CDS 50.0%
CATTGATGAACGGCTCGATC+TGG - Chr3:83161924-83161943 None:intergenic 50.0%
CGAGCCGTTCATCAATGAAG+TGG + Chr3:83161927-83161946 MsG0380016417.01.T01:CDS 50.0%
GAAACTCCTTCTTCAACCCG+AGG - Chr3:83160275-83160294 None:intergenic 50.0%
GAAGACAAGATCCTAGGCCA+AGG + Chr3:83161817-83161836 MsG0380016417.01.T01:CDS 50.0%
GACCCCAATGTCTGTGTTGA+GGG + Chr3:83161132-83161151 MsG0380016417.01.T01:CDS 50.0%
GGAGATCTGATCGTGTCAAG+CGG - Chr3:83160254-83160273 None:intergenic 50.0%
TCTGAGCTTGCAGGCATGTT+TGG - Chr3:83160326-83160345 None:intergenic 50.0%
TGACACGATCAGATCTCCTC+GGG + Chr3:83160256-83160275 MsG0380016417.01.T01:CDS 50.0%
! AACAGATGGGGAGGTATGGA+AGG + Chr3:83161731-83161750 MsG0380016417.01.T01:CDS 50.0%
! GTCTGGGCGAAGTCTAAGAT+AGG - Chr3:83160637-83160656 None:intergenic 50.0%
! TGAACGGCTCGATCTGGTTT+GGG - Chr3:83161918-83161937 None:intergenic 50.0%
! TTCCTGTCAGTAGCTCTGCT+AGG - Chr3:83162386-83162405 None:intergenic 50.0%
!! AGATCTCCTCGGGTTGAAGA+AGG + Chr3:83160266-83160285 MsG0380016417.01.T01:CDS 50.0%
ACGGGAGGGTCATATGGTTC+TGG + Chr3:83160150-83160169 MsG0380016417.01.T01:CDS 55.0%
ACTGCCCAGTCCAACAACAC+AGG - Chr3:83160297-83160316 None:intergenic 55.0%
ATCCTAGGCCAAGGTGGTCA+AGG + Chr3:83161826-83161845 MsG0380016417.01.T01:CDS 55.0%
CACTCTAGTGCAGGGAACGT+TGG + Chr3:83162287-83162306 MsG0380016417.01.T01:CDS 55.0%
CCCCAATGTCTGTGTTGAGG+GGG + Chr3:83161134-83161153 MsG0380016417.01.T01:CDS 55.0%
CCCCCTCAACACAGACATTG+GGG - Chr3:83161137-83161156 None:intergenic 55.0%
CGTCTCCGTCATATCCTGCT+GGG - Chr3:83161200-83161219 None:intergenic 55.0%
GACAAGATCCTAGGCCAAGG+TGG + Chr3:83161820-83161839 MsG0380016417.01.T01:CDS 55.0%
GCCACTGCTCTGATCTTGGT+GGG - Chr3:83161481-83161500 None:intergenic 55.0%
GCCCCCTCAACACAGACATT+GGG - Chr3:83161138-83161157 None:intergenic 55.0%
GGACCCCAATGTCTGTGTTG+AGG + Chr3:83161131-83161150 MsG0380016417.01.T01:CDS 55.0%
GTCCTAGCAGAGCTACTGAC+AGG + Chr3:83162381-83162400 MsG0380016417.01.T01:CDS 55.0%
TCCCACCAAGATCAGAGCAG+TGG + Chr3:83161477-83161496 MsG0380016417.01.T01:intron 55.0%
TGCCACTGCTCTGATCTTGG+TGG - Chr3:83161482-83161501 None:intergenic 55.0%
TTCCTTGACCACCTTGGCCT+AGG - Chr3:83161831-83161850 None:intergenic 55.0%
! ATGAGACTTGCGCTGACACC+TGG - Chr3:83161604-83161623 None:intergenic 55.0%
! CAGCAGGATATGACGGAGAC+GGG + Chr3:83161199-83161218 MsG0380016417.01.T01:CDS 55.0%
! CCAGCAGGATATGACGGAGA+CGG + Chr3:83161198-83161217 MsG0380016417.01.T01:CDS 55.0%
! GTGTTGTTGGACTGGGCAGT+AGG + Chr3:83160297-83160316 MsG0380016417.01.T01:CDS 55.0%
CCGTCTCCGTCATATCCTGC+TGG - Chr3:83161201-83161220 None:intergenic 60.0%
CGCCCCCTCAACACAGACAT+TGG - Chr3:83161139-83161158 None:intergenic 60.0%
! GCGAGATGCATCGATGCTCC+TGG + Chr3:83161156-83161175 MsG0380016417.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 83160144 83162806 83160144 ID=MsG0380016417.01;Name=MsG0380016417.01
Chr3 mRNA 83160144 83162806 83160144 ID=MsG0380016417.01.T01;Parent=MsG0380016417.01;Name=MsG0380016417.01.T01;_AED=0.40;_eAED=0.40;_QI=0|0|0|1|0|0|3|0|660
Chr3 exon 83160144 83160659 83160144 ID=MsG0380016417.01.T01:exon:14048;Parent=MsG0380016417.01.T01
Chr3 exon 83161087 83161351 83161087 ID=MsG0380016417.01.T01:exon:14049;Parent=MsG0380016417.01.T01
Chr3 exon 83161605 83162806 83161605 ID=MsG0380016417.01.T01:exon:14050;Parent=MsG0380016417.01.T01
Chr3 CDS 83160144 83160659 83160144 ID=MsG0380016417.01.T01:cds;Parent=MsG0380016417.01.T01
Chr3 CDS 83161087 83161351 83161087 ID=MsG0380016417.01.T01:cds;Parent=MsG0380016417.01.T01
Chr3 CDS 83161605 83162806 83161605 ID=MsG0380016417.01.T01:cds;Parent=MsG0380016417.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380016417.01.T01

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Protein sequence

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