AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380016419.01

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MsG0380016419.01.T01 AT2G23450 38.826 443 247 11 149 579 193 623 1.75e-82 273
MsG0380016419.01.T01 AT3G53840 45.791 297 152 2 293 580 340 636 6.99e-80 264
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MsG0380016419.01.T01 AT1G25390 43.686 293 155 4 294 579 278 567 1.28e-68 234
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MsG0380016419.01.T01 AT1G61860 42.020 307 169 6 278 577 56 360 1.12e-67 225
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MsG0380016419.01.T01 AT5G18500 43.158 285 160 2 295 577 154 438 2.16e-67 227
MsG0380016419.01.T01 AT5G18500 43.158 285 160 2 295 577 154 438 2.16e-67 227
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MsG0380016419.01.T01 AT1G09440 42.657 286 160 4 295 577 145 429 4.51e-65 220
MsG0380016419.01.T01 AT1G18390 36.456 395 223 9 203 579 229 613 6.24e-65 224
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MsG0380016419.01.T01 AT5G01950 40.476 294 163 3 293 580 612 899 8.04e-64 226
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MsG0380016419.01.T01 AT1G56720 41.958 286 162 4 295 577 167 451 1.05e-62 214
MsG0380016419.01.T01 AT1G56720 41.958 286 162 4 295 577 167 451 1.05e-62 214
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MsG0380016419.01.T01 AT1G79620 43.686 293 156 4 293 580 624 912 2.53e-62 222
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MsG0380016419.01.T01 AT4G01330 40.484 289 168 4 293 578 148 435 4.79e-62 213
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MsG0380016419.01.T01 AT4G00330 40.984 305 169 6 285 579 96 399 4.93e-62 211
MsG0380016419.01.T01 AT5G01950 39.799 299 163 4 293 580 612 904 5.47e-62 221
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MsG0380016419.01.T01 AT1G07570 40.864 301 163 6 293 579 54 353 8.26e-62 210
MsG0380016419.01.T01 AT1G69910 36.316 380 206 8 229 579 250 622 1.35e-61 215
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MsG0380016419.01.T01 AT2G42960 40.909 286 165 4 295 577 171 455 1.55e-61 211
MsG0380016419.01.T01 AT2G42960 40.909 286 165 4 295 577 171 455 1.55e-61 211
MsG0380016419.01.T01 AT1G07570 40.864 301 163 6 293 579 65 364 1.56e-61 209
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MsG0380016419.01.T01 AT1G67720 38.415 328 199 2 258 584 559 884 4.72e-61 218
MsG0380016419.01.T01 AT1G26150 41.720 314 170 7 273 579 399 706 4.82e-61 216
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MsG0380016419.01.T01 AT1G68690 41.237 291 164 3 294 579 364 652 8.94e-61 214
MsG0380016419.01.T01 AT3G20530 36.538 312 192 4 278 583 53 364 1.06e-60 206
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MsG0380016419.01.T01 AT1G20650 40.138 289 169 4 293 577 64 352 1.68e-60 206
MsG0380016419.01.T01 AT5G24010 37.097 372 211 10 228 584 404 767 1.98e-60 215
MsG0380016419.01.T01 AT1G68690 42.254 284 157 3 294 572 364 645 2.65e-60 212
MsG0380016419.01.T01 AT3G51550 42.373 295 166 4 293 584 522 815 3.19e-60 215
MsG0380016419.01.T01 AT5G62710 37.008 381 221 9 204 577 181 549 3.63e-60 210
MsG0380016419.01.T01 AT1G70530 39.706 272 154 2 235 506 261 522 4.08e-60 209
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MsG0380016419.01.T01 AT3G28690 36.667 300 175 5 293 579 12 309 3.75e-58 199
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MsG0380016419.01.T01 AT2G18470 38.079 302 166 4 294 583 271 563 4.38e-58 205
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MsG0380016419.01.T01 AT1G48210 36.644 292 176 4 297 580 58 348 3.75e-56 193
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MsG0380016419.01.T01 AT5G18610 40.138 289 168 5 293 576 69 357 1.04e-55 196
MsG0380016419.01.T01 AT5G45780 38.408 289 175 3 295 580 245 533 1.10e-55 197
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MsG0380016419.01.T01 AT5G56460 38.614 303 171 8 295 584 64 364 1.13e-55 194
MsG0380016419.01.T01 AT5G62230 40.426 282 161 2 294 573 635 911 1.17e-55 203
MsG0380016419.01.T01 AT1G61370 33.431 341 218 3 234 572 284 617 1.35e-55 199
MsG0380016419.01.T01 AT2G28970 38.488 291 173 4 295 583 434 720 1.40e-55 201
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MsG0380016419.01.T01 AT5G03320 38.983 295 162 7 293 572 67 358 2.81e-55 193
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MsG0380016419.01.T01 AT1G55200 39.333 300 169 6 292 584 364 657 3.10e-54 196
MsG0380016419.01.T01 AT1G55200 39.333 300 169 6 292 584 364 657 3.10e-54 196
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MsG0380016419.01.T01 AT5G63930 41.781 292 155 6 295 576 728 1014 1.35e-53 197
MsG0380016419.01.T01 AT1G61490 33.721 344 210 5 234 572 277 607 1.38e-53 193
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MsG0380016419.01.T01 AT1G31420 41.026 273 156 3 307 577 306 575 1.42e-53 192
MsG0380016419.01.T01 AT4G30520 36.963 349 201 6 235 578 240 574 1.56e-53 193
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MsG0380016419.01.T01 AT5G63710 33.422 374 229 6 216 578 165 529 2.66e-53 191
MsG0380016419.01.T01 AT4G33430 39.384 292 166 5 295 578 324 612 2.77e-53 192
MsG0380016419.01.T01 AT5G63710 33.422 374 229 6 216 578 200 564 3.51e-53 192
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MsG0380016419.01.T01 AT3G13690 39.394 297 171 6 292 583 396 688 3.83e-53 194
MsG0380016419.01.T01 AT3G13690 39.394 297 171 6 292 583 396 688 3.83e-53 194
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MsG0380016419.01.T01 AT1G70520 39.643 280 164 3 295 570 313 591 4.38e-53 192
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MsG0380016419.01.T01 AT2G47060 38.667 300 172 6 290 580 57 353 6.34e-53 185
MsG0380016419.01.T01 AT1G61480 37.234 282 175 2 293 572 482 763 7.06e-53 194
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MsG0380016419.01.T01 AT4G35600 37.700 313 177 7 282 579 60 369 7.99e-53 186
MsG0380016419.01.T01 AT1G11300 35.735 347 199 7 230 572 428 754 8.05e-53 193
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MsG0380016419.01.T01 AT1G61490 33.721 344 210 5 234 572 401 731 8.16e-53 193
MsG0380016419.01.T01 AT2G02220 41.667 288 164 4 295 579 722 1008 8.77e-53 194
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MsG0380016419.01.T01 AT1G61490 33.721 344 210 5 234 572 427 757 8.98e-53 193
MsG0380016419.01.T01 AT1G61490 33.721 344 210 5 234 572 427 757 8.98e-53 193
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MsG0380016419.01.T01 AT2G28590 43.777 233 128 3 293 522 84 316 1.11e-52 183
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MsG0380016419.01.T01 AT2G35620 38.596 285 169 3 295 577 292 572 1.59e-52 189
MsG0380016419.01.T01 AT2G35620 38.596 285 169 3 295 577 292 572 1.59e-52 189
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MsG0380016419.01.T01 AT3G20200 40.000 285 154 6 293 572 439 711 1.97e-52 191
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MsG0380016419.01.T01 AT1G61430 36.552 290 180 3 287 572 444 733 4.33e-52 191
MsG0380016419.01.T01 AT1G61430 36.552 290 180 3 287 572 467 756 4.65e-52 191
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MsG0380016419.01.T01 AT1G34210 38.356 292 169 5 295 578 293 581 7.98e-52 188
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MsG0380016419.01.T01 AT1G61360 32.440 373 216 5 217 572 333 686 2.69e-51 188
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MsG0380016419.01.T01 AT5G54590 36.207 290 175 6 295 583 103 383 3.50e-51 182
MsG0380016419.01.T01 AT1G61400 33.815 346 207 8 234 572 437 767 3.52e-51 189
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MsG0380016419.01.T01 AT3G23750 39.858 281 160 5 297 569 568 847 3.86e-51 189
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MsG0380016419.01.T01 AT1G51800 36.387 382 222 12 213 583 490 861 5.62e-51 189
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MsG0380016419.01.T01 AT1G61360 32.440 373 216 5 217 572 414 767 6.68e-51 188
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MsG0380016419.01.T01 AT1G49270 45.045 222 120 2 294 514 323 543 6.92e-51 187
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MsG0380016419.01.T01 AT5G15730 36.972 284 164 6 292 573 102 372 8.03e-51 181
MsG0380016419.01.T01 AT1G53430 38.095 294 174 5 295 583 657 947 8.10e-51 189
MsG0380016419.01.T01 AT3G59350 38.697 261 144 4 294 542 100 356 8.75e-51 179
MsG0380016419.01.T01 AT2G13800 37.671 292 171 6 295 578 263 551 9.39e-51 184
MsG0380016419.01.T01 AT2G13800 37.671 292 171 6 295 578 263 551 9.39e-51 184
MsG0380016419.01.T01 AT4G05200 33.240 358 225 4 226 581 278 623 9.59e-51 186
MsG0380016419.01.T01 AT3G26700 37.710 297 177 4 288 580 60 352 9.74e-51 179
MsG0380016419.01.T01 AT3G26700 37.710 297 177 4 288 580 60 352 9.74e-51 179
MsG0380016419.01.T01 AT3G26700 37.710 297 177 4 288 580 60 352 9.74e-51 179
MsG0380016419.01.T01 AT4G00970 31.373 357 230 4 225 576 272 618 1.00e-50 186
MsG0380016419.01.T01 AT2G25220 40.288 278 156 5 293 562 132 407 1.31e-50 181
MsG0380016419.01.T01 AT1G78530 38.078 281 168 2 302 579 70 347 1.31e-50 178
MsG0380016419.01.T01 AT3G46420 39.085 284 167 4 302 583 528 807 1.31e-50 187
MsG0380016419.01.T01 AT5G11020 37.716 289 170 4 300 583 73 356 1.44e-50 179
MsG0380016419.01.T01 AT1G56145 30.334 389 228 4 222 584 619 990 1.45e-50 188
MsG0380016419.01.T01 AT2G28960 36.644 292 177 4 295 583 431 717 1.64e-50 186
MsG0380016419.01.T01 AT4G05200 33.240 358 225 4 226 581 296 641 1.69e-50 185
MsG0380016419.01.T01 AT2G23950 36.184 304 178 4 224 525 226 515 1.81e-50 182
MsG0380016419.01.T01 AT5G15730 37.324 284 161 7 292 573 102 370 1.89e-50 180
MsG0380016419.01.T01 AT1G66150 38.947 285 164 5 294 569 575 858 2.06e-50 187
MsG0380016419.01.T01 AT4G32300 37.755 294 177 4 292 582 480 770 2.13e-50 187
MsG0380016419.01.T01 AT1G54820 39.617 313 164 9 248 542 88 393 2.15e-50 179
MsG0380016419.01.T01 AT5G11020 37.716 289 170 4 300 583 100 383 2.48e-50 179
MsG0380016419.01.T01 AT2G28960 36.644 292 177 4 295 583 563 849 2.55e-50 187
MsG0380016419.01.T01 AT5G11020 37.716 289 170 4 300 583 96 379 2.88e-50 179
MsG0380016419.01.T01 AT1G53440 37.415 294 176 5 295 583 655 945 3.10e-50 187
MsG0380016419.01.T01 AT4G23220 37.063 286 174 5 295 576 325 608 3.32e-50 184
MsG0380016419.01.T01 AT2G28250 38.538 301 166 8 295 579 198 495 3.39e-50 182
MsG0380016419.01.T01 AT2G28250 38.538 301 166 8 295 579 198 495 3.39e-50 182
MsG0380016419.01.T01 AT2G28250 38.538 301 166 8 295 579 198 495 3.39e-50 182
MsG0380016419.01.T01 AT2G28250 38.538 301 166 8 295 579 198 495 3.39e-50 182
MsG0380016419.01.T01 AT2G28250 38.538 301 166 8 295 579 198 495 3.39e-50 182
MsG0380016419.01.T01 AT2G28250 38.538 301 166 8 295 579 198 495 3.39e-50 182
MsG0380016419.01.T01 AT1G61550 38.298 282 168 3 295 572 477 756 3.57e-50 186
MsG0380016419.01.T01 AT1G61430 36.177 293 180 4 287 572 467 759 3.61e-50 186
MsG0380016419.01.T01 AT3G09010 40.278 216 128 1 293 507 32 247 4.16e-50 176
MsG0380016419.01.T01 AT1G72540 37.542 301 176 6 294 584 71 369 4.21e-50 179
MsG0380016419.01.T01 AT5G11020 37.716 289 170 4 300 583 134 417 4.22e-50 179
MsG0380016419.01.T01 AT1G65800 37.413 286 171 5 298 576 514 798 4.27e-50 186
MsG0380016419.01.T01 AT1G35710 33.241 361 206 7 225 573 779 1116 4.38e-50 187
MsG0380016419.01.T01 AT1G29730 41.453 234 137 0 278 511 611 844 5.32e-50 186
MsG0380016419.01.T01 AT3G53380 35.690 297 181 4 290 578 359 653 5.32e-50 184
MsG0380016419.01.T01 AT2G29000 38.776 294 172 4 293 583 553 841 5.51e-50 186
MsG0380016419.01.T01 AT1G17540 32.000 375 226 7 205 574 319 669 5.90e-50 184
MsG0380016419.01.T01 AT4G21390 36.667 300 180 5 283 577 506 800 5.98e-50 186
MsG0380016419.01.T01 AT4G29990 34.615 364 207 9 223 577 502 843 7.14e-50 186
MsG0380016419.01.T01 AT3G46370 39.249 293 172 4 293 583 475 763 7.16e-50 185
MsG0380016419.01.T01 AT3G46370 39.249 293 172 4 293 583 475 763 7.16e-50 185
MsG0380016419.01.T01 AT2G07020 37.829 304 169 7 288 584 400 690 7.55e-50 184
MsG0380016419.01.T01 AT4G04570 32.782 363 217 8 226 581 279 621 7.99e-50 183
MsG0380016419.01.T01 AT4G29450 36.808 307 173 6 293 583 554 855 8.00e-50 185
MsG0380016419.01.T01 AT1G61390 35.764 288 181 3 294 579 339 624 9.30e-50 183
MsG0380016419.01.T01 AT1G48210 40.343 233 131 3 297 522 58 289 1.01e-49 174
MsG0380016419.01.T01 AT1G48210 40.343 233 131 3 297 522 58 289 1.01e-49 174
MsG0380016419.01.T01 AT1G48210 40.343 233 131 3 297 522 58 289 1.01e-49 174
MsG0380016419.01.T01 AT1G61430 39.749 239 141 2 287 522 444 682 1.09e-49 183
MsG0380016419.01.T01 AT3G55550 35.764 288 183 2 292 577 331 618 1.11e-49 183
MsG0380016419.01.T01 AT5G65700 39.273 275 163 3 301 572 688 961 1.28e-49 185
MsG0380016419.01.T01 AT5G65700 39.273 275 163 3 301 572 688 961 1.28e-49 185
MsG0380016419.01.T01 AT1G61430 39.749 239 141 2 287 522 467 705 1.49e-49 183
MsG0380016419.01.T01 AT1G61430 39.749 239 141 2 287 522 467 705 1.49e-49 183
MsG0380016419.01.T01 AT5G26150 37.847 288 157 7 293 572 411 684 1.63e-49 183

Find 143 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 200 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TAGAAATGTGGTAAGAATTT+TGG 0.086234 3:+83191287 MsG0380016419.01.T01:CDS
ATGATATCTTTCCTTGATTT+TGG 0.098045 3:-83190670 None:intergenic
CGTCTCCCTCATGTCCTTTC+GGG 0.139048 3:-83190621 None:intergenic
TGGAAGCAATTATGCTTATT+TGG 0.148046 3:+83190951 MsG0380016419.01.T01:CDS
AACCAACCGATCTTCTTTAA+TGG 0.208473 3:-83191784 None:intergenic
TTTGATGAAGGAAATATTAT+AGG 0.235549 3:+83191126 MsG0380016419.01.T01:CDS
CCGTCTCCCTCATGTCCTTT+CGG 0.237752 3:-83190622 None:intergenic
CAAATGCTTTGATGGATATA+GGG 0.239152 3:+83189833 MsG0380016419.01.T01:CDS
TAATTGCAGAAAGGTGTTTA+AGG 0.239883 3:+83191865 MsG0380016419.01.T01:CDS
AGATCGGTTGGTTCATATTC+TGG 0.255946 3:+83191794 MsG0380016419.01.T01:CDS
ATTGCAAAGGTTTCTGATTT+CGG 0.265780 3:+83191540 MsG0380016419.01.T01:CDS
GCAAATGCTTTGATGGATAT+AGG 0.276255 3:+83189832 MsG0380016419.01.T01:CDS
GCAAGGGACATTGGGGTATC+TGG 0.281057 3:+83191611 MsG0380016419.01.T01:CDS
ACGCTAGTTTGCAAGTATTC+TGG 0.287342 3:-83191636 None:intergenic
CAACTACACCTCTGGATGTT+TGG 0.298006 3:+83189440 MsG0380016419.01.T01:CDS
TAAACACCTTTCTGCAATTA+CGG 0.304071 3:-83191862 None:intergenic
TCCCATAGCGACTTCTTTCA+TGG 0.307498 3:-83191910 None:intergenic
AAATTCTTACCACATTTCTA+TGG 0.325134 3:-83191284 None:intergenic
TTCCGTTAACACACGACCTT+GGG 0.336393 3:-83189538 None:intergenic
AAGTTCTTCTTCTTTAGCTT+GGG 0.340831 3:-83189675 None:intergenic
GCAACATGCGACAATCTTCC+TGG 0.342562 3:+83190580 MsG0380016419.01.T01:CDS
TCTGAGCTTGCTGACAGGTT+TGG 0.343746 3:-83189728 None:intergenic
CGCTAGTTTGCAAGTATTCT+GGG 0.351964 3:-83191635 None:intergenic
TCCTGGTTGTTGCCAGATTT+CGG 0.352665 3:+83189512 MsG0380016419.01.T01:CDS
GTTGCCAATGAGTCTTGTTC+TGG 0.357107 3:+83189489 MsG0380016419.01.T01:CDS
TACCTTTGCAAATGCTTTGA+TGG 0.360003 3:+83189825 MsG0380016419.01.T01:CDS
TTTATATCTCTATGAATGAT+TGG 0.360828 3:-83191486 None:intergenic
TTGCAATGAAATTGCCATCT+AGG 0.362109 3:-83191524 None:intergenic
GACCTTGGGGTACCGAAATC+TGG 0.364999 3:-83189524 None:intergenic
CATTGATGAATGGCTCAATC+TGG 0.371090 3:-83191236 None:intergenic
GAAGAACTTTCCTGTGTTGT+TGG 0.372506 3:+83189689 MsG0380016419.01.T01:CDS
TGAATGGCTCAATCTGGTTT+TGG 0.373177 3:-83191230 None:intergenic
TTACTGTTGCAACAAAAGAT+AGG 0.377356 3:+83191033 MsG0380016419.01.T01:CDS
AAGAGTGATGTCTATAGCTT+TGG 0.380724 3:+83191669 MsG0380016419.01.T01:CDS
GCAAAGGTAACCAGATTTGA+TGG 0.382174 3:-83189811 None:intergenic
ATTTCCTTCATCAAAATTGT+TGG 0.384912 3:-83191118 None:intergenic
TTCAAGTAATTATGCTTGTA+AGG 0.385476 3:+83189758 MsG0380016419.01.T01:CDS
AGAGTGATGTCTATAGCTTT+GGG 0.388078 3:+83191670 MsG0380016419.01.T01:CDS
TCCATGTCAGCTTTATAGAT+TGG 0.390516 3:-83191395 None:intergenic
GGAAATCCTTACCTCATTCA+TGG 0.392367 3:+83189855 MsG0380016419.01.T01:CDS
CTTGCAAACTAGCGTGTTAA+CGG 0.393315 3:+83191644 MsG0380016419.01.T01:CDS
CTTTCCTGTGTTGTTGGACT+GGG 0.393500 3:+83189695 MsG0380016419.01.T01:CDS
ACTCTAGTGCAAGGGACATT+GGG 0.398023 3:+83191603 MsG0380016419.01.T01:CDS
AATTGCAGAAAGGTGTTTAA+GGG 0.410147 3:+83191866 MsG0380016419.01.T01:CDS
TATTATAGGCAAAGGTGCTC+AGG 0.414923 3:+83191140 MsG0380016419.01.T01:CDS
AAAGTTCTTCTTCTTTAGCT+TGG 0.415124 3:-83189676 None:intergenic
AATGAGTCTTGTTCTGGTCC+TGG 0.415271 3:+83189495 MsG0380016419.01.T01:CDS
GTTTATGAATTCATTCCAAA+TGG 0.420220 3:+83191342 MsG0380016419.01.T01:CDS
TCTACAAACATCCTCCTAGA+TGG 0.428951 3:+83191510 MsG0380016419.01.T01:CDS
TGATCATAAACAGTTCCATT+TGG 0.429633 3:-83191357 None:intergenic
CATAAACAATGGTAGCTTCC+AGG 0.432969 3:-83190598 None:intergenic
AATATTAGTTATTGAAGAGT+AGG 0.437463 3:+83191941 MsG0380016419.01.T01:CDS
GATGTTTGGCTTGGTGCAAC+AGG 0.439111 3:+83189454 MsG0380016419.01.T01:CDS
GCAAGGCTTCTTTCTACCAT+TGG 0.442913 3:-83191744 None:intergenic
CACTCTAGTGCAAGGGACAT+TGG 0.446030 3:+83191602 MsG0380016419.01.T01:CDS
ACCCCAAGGTCGTGTGTTAA+CGG 0.448142 3:+83189536 MsG0380016419.01.T01:CDS
GATGCAGAAACCATCAAATC+TGG 0.449131 3:+83189801 MsG0380016419.01.T01:CDS
CGTAGGCCTCGTAGCACTAC+TGG 0.450174 3:+83190927 MsG0380016419.01.T01:CDS
ACTTTCCTGTGTTGTTGGAC+TGG 0.454055 3:+83189694 MsG0380016419.01.T01:CDS
GCAGTTGGCTGTGATACATC+TGG 0.460522 3:+83189387 MsG0380016419.01.T01:CDS
AAAAGAAACTGCTGGAGTCC+TGG 0.464775 3:+83191437 MsG0380016419.01.T01:CDS
ATTCTGGACAGCAACATTGA+TGG 0.478162 3:+83191810 MsG0380016419.01.T01:CDS
GAAGGAAACAACTACACCTC+TGG 0.489309 3:+83189432 MsG0380016419.01.T01:CDS
GAAAGAAGTCGCTATGGGAC+TGG 0.501086 3:+83191914 MsG0380016419.01.T01:CDS
ACACCTCTGGATGTTTGGCT+TGG 0.501598 3:+83189445 MsG0380016419.01.T01:CDS
AAAAGATAGGGAGGCATGGA+AGG 0.502830 3:+83191046 MsG0380016419.01.T01:CDS
TTTCTTCCATTAAAGAAGAT+CGG 0.506992 3:+83191778 MsG0380016419.01.T01:CDS
ATCCTTCTGAGCTTGCTGAC+AGG 0.509702 3:-83189733 None:intergenic
AGTCCTGGCATACTTACATT+CGG 0.509902 3:+83191452 MsG0380016419.01.T01:CDS
CTTCCGTTAACACACGACCT+TGG 0.510580 3:-83189539 None:intergenic
AGGACCAGAACAAGACTCAT+TGG 0.511623 3:-83189493 None:intergenic
AGAATAGCAAAAGAAACTGC+TGG 0.512260 3:+83191429 MsG0380016419.01.T01:CDS
AGTTCTTCTTCTTTAGCTTG+GGG 0.513822 3:-83189674 None:intergenic
CAGCCGAATGTAAGTATGCC+AGG 0.515392 3:-83191455 None:intergenic
CAAAATGCAGTCCAAAATCA+AGG 0.516060 3:+83190659 MsG0380016419.01.T01:CDS
CTTTAGCTTGGGGAGGTCTG+TGG 0.519944 3:-83189664 None:intergenic
TTCCATTAAAGAAGATCGGT+TGG 0.522830 3:+83191782 MsG0380016419.01.T01:CDS
TTATGTCCAGGTGTCTGCGT+AGG 0.530572 3:+83190910 MsG0380016419.01.T01:intron
AGATGGCAATTTCATTGCAA+AGG 0.534378 3:+83191527 MsG0380016419.01.T01:CDS
ATAGCGACTTCTTTCATGGA+TGG 0.535297 3:-83191906 None:intergenic
ATGAATTCATAAACAAGCAA+TGG 0.536509 3:-83191333 None:intergenic
TCTTCTTCTTTAGCTTGGGG+AGG 0.538684 3:-83189671 None:intergenic
ATCCATGAAAGAAGTCGCTA+TGG 0.539623 3:+83191908 MsG0380016419.01.T01:CDS
GAGTGACTCGACGAGCTAAG+AGG 0.539798 3:-83189573 None:intergenic
TTTAGATATTAATGAATGCA+CGG 0.547808 3:+83190534 MsG0380016419.01.T01:intron
CGAAACAAGTTGGTAGCAGT+TGG 0.551119 3:+83189372 MsG0380016419.01.T01:CDS
GAGGGAGACGGAAAGATGAA+TGG 0.551507 3:+83190634 MsG0380016419.01.T01:CDS
TACTGTTGCAACAAAAGATA+GGG 0.551722 3:+83191034 MsG0380016419.01.T01:CDS
TACCTCATTCATGGTTGCGA+AGG 0.554218 3:+83189864 MsG0380016419.01.T01:CDS
AGGAAATGTTGAGCATCTAA+AGG 0.561940 3:+83191833 MsG0380016419.01.T01:CDS
AACCTGTCAGCAAGCTCAGA+AGG 0.562157 3:+83189731 MsG0380016419.01.T01:CDS
CTCTCCCACTCGAAACAAGT+TGG 0.562914 3:+83189362 MsG0380016419.01.T01:CDS
TGCTACCAACTTGTTTCGAG+TGG 0.563645 3:-83189367 None:intergenic
GTCCTAGCAGAGCTACTGAC+AGG 0.564525 3:+83191696 MsG0380016419.01.T01:CDS
ATTATAGGCAAAGGTGCTCA+GGG 0.568556 3:+83191141 MsG0380016419.01.T01:CDS
ACGACCACTTCATTGATGAA+TGG 0.568957 3:-83191246 None:intergenic
AAATGCTTTGATGGATATAG+GGG 0.569660 3:+83189834 MsG0380016419.01.T01:CDS
TTCCTGTCAGTAGCTCTGCT+AGG 0.571501 3:-83191698 None:intergenic
TGCCAGATTTCGGTACCCCA+AGG 0.574755 3:+83189522 MsG0380016419.01.T01:CDS
ACCTAGAGTGTTCACTGTTG+AGG 0.575076 3:+83191080 MsG0380016419.01.T01:CDS
CTCGGAGTAATTGATTCTGA+AGG 0.579517 3:+83189414 MsG0380016419.01.T01:CDS
TACCTTCGCAACCATGAATG+AGG 0.580760 3:-83189866 None:intergenic
ACCAATCTATAAAGCTGACA+TGG 0.582561 3:+83191394 MsG0380016419.01.T01:CDS
TACCATTGTTTATGCCCGAA+AGG 0.584046 3:+83190607 MsG0380016419.01.T01:CDS
TCGCAACCATGAATGAGGTA+AGG 0.589860 3:-83189861 None:intergenic
GTCTAATGACTGTGTTCAAG+AGG 0.589902 3:+83190558 MsG0380016419.01.T01:CDS
CAATGTCCCTTGCACTAGAG+TGG 0.590189 3:-83191601 None:intergenic
CTGATAACCACTCTAGTGCA+AGG 0.590398 3:+83191594 MsG0380016419.01.T01:CDS
TGTGATACATCTGGAATACT+CGG 0.593473 3:+83189396 MsG0380016419.01.T01:CDS
TCCATGAAAGAAGTCGCTAT+GGG 0.594150 3:+83191909 MsG0380016419.01.T01:CDS
GAAGGAAATATTATAGGCAA+AGG 0.595300 3:+83191132 MsG0380016419.01.T01:CDS
TGAGCCATTCATCAATGAAG+TGG 0.597831 3:+83191242 MsG0380016419.01.T01:CDS
ACCGAAATCTGGCAACAACC+AGG 0.598982 3:-83189513 None:intergenic
GTTATCAGACTGTGATCAAG+AGG 0.604428 3:-83191579 None:intergenic
CCGAAAGGACATGAGGGAGA+CGG 0.604509 3:+83190622 MsG0380016419.01.T01:CDS
GAAGTCGCTATGGGACTGGA+AGG 0.604620 3:+83191918 MsG0380016419.01.T01:CDS
TCCTCAACAGTGAACACTCT+AGG 0.605357 3:-83191081 None:intergenic
TAAAGCTGACATGGAAAACA+AGG 0.606541 3:+83191403 MsG0380016419.01.T01:CDS
CAACAAAAGATAGGGAGGCA+TGG 0.607830 3:+83191042 MsG0380016419.01.T01:CDS
ATCCATCAAAGCATTTGCAA+AGG 0.609973 3:-83189827 None:intergenic
GCTACCAACTTGTTTCGAGT+GGG 0.611167 3:-83189366 None:intergenic
GGCCTCGTAGCACTACTGGT+TGG 0.611500 3:+83190931 MsG0380016419.01.T01:CDS
TTTATGCCCGAAAGGACATG+AGG 0.611591 3:+83190615 MsG0380016419.01.T01:CDS
GTGTTGTTGGACTGGGCAGT+AGG 0.612895 3:+83189702 MsG0380016419.01.T01:CDS
GTCCTTTCGGGCATAAACAA+TGG 0.619185 3:-83190609 None:intergenic
CAATGAAATTGCCATCTAGG+AGG 0.622528 3:-83191521 None:intergenic
TCAAATCAACCATAGAAATG+TGG 0.625988 3:+83191275 MsG0380016419.01.T01:CDS
AAGTTGCCGTAATTGCAGAA+AGG 0.635894 3:+83191856 MsG0380016419.01.T01:CDS
AAGAAACAAAGTACATCGCA+AGG 0.636092 3:-83191761 None:intergenic
CTGGACAGCAACATTGATGG+AGG 0.640700 3:+83191813 MsG0380016419.01.T01:CDS
CTCTAGTGCAAGGGACATTG+GGG 0.642281 3:+83191604 MsG0380016419.01.T01:CDS
GAGTGATGTCTATAGCTTTG+GGG 0.645283 3:+83191671 MsG0380016419.01.T01:CDS
TGATAACCACTCTAGTGCAA+GGG 0.651337 3:+83191595 MsG0380016419.01.T01:CDS
ACTGCCCAGTCCAACAACAC+AGG 0.662885 3:-83189699 None:intergenic
ACTGTGTTATAGCAGACCAA+TGG 0.664779 3:+83191728 MsG0380016419.01.T01:CDS
TGTTGCAACAAAAGATAGGG+AGG 0.668634 3:+83191037 MsG0380016419.01.T01:CDS
TCCGTTAACACACGACCTTG+GGG 0.674163 3:-83189537 None:intergenic
GCACCAAGCCAAACATCCAG+AGG 0.674396 3:-83189448 None:intergenic
GCTCAGGGAACAGTTTACAA+AGG 0.690023 3:+83191156 MsG0380016419.01.T01:CDS
GTGTTTAAGGGTGAACAGTG+AGG 0.693272 3:+83191878 MsG0380016419.01.T01:CDS
TTATGCCCGAAAGGACATGA+GGG 0.700275 3:+83190616 MsG0380016419.01.T01:CDS
TTCCAACCAGTAGTGCTACG+AGG 0.702148 3:-83190933 None:intergenic
GTATATGACTTCAATCCGTG+TGG 0.712761 3:+83189600 MsG0380016419.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TAAATTTGTTAAATCAGTTT+TGG - Chr3:83190115-83190134 None:intergenic 15.0%
!!! TATGTTTTTATTGTTGAAAA+TGG + Chr3:83189624-83189643 MsG0380016419.01.T01:CDS 15.0%
!! ACGATATAGTATTTAGATTT+AGG + Chr3:83190058-83190077 MsG0380016419.01.T01:intron 20.0%
!! CTAAAAATACAAAAAACAGT+AGG - Chr3:83190310-83190329 None:intergenic 20.0%
!! TGATTTAACAAATTTACTGA+GGG + Chr3:83190119-83190138 MsG0380016419.01.T01:intron 20.0%
!! TTTAGATATTAATGAATGCA+CGG + Chr3:83190534-83190553 MsG0380016419.01.T01:intron 20.0%
!! TTTATATCTCTATGAATGAT+TGG - Chr3:83191489-83191508 None:intergenic 20.0%
!! TTTGATGAAGGAAATATTAT+AGG + Chr3:83191126-83191145 MsG0380016419.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATTCTGTTACATTTGTTAA+TGG + Chr3:83190089-83190108 MsG0380016419.01.T01:intron 20.0%
!!! GAACAATTTTTTCAACAAAA+TGG + Chr3:83191006-83191025 MsG0380016419.01.T01:CDS 20.0%
!!! GTTCTTTTTTTTTTATTTCC+CGG + Chr3:83189967-83189986 MsG0380016419.01.T01:intron 20.0%
! AAATTCTTACCACATTTCTA+TGG - Chr3:83191287-83191306 None:intergenic 25.0%
! ACAATAAAAACATAACCACA+CGG - Chr3:83189618-83189637 None:intergenic 25.0%
! ATGAAAAAATCCAATTTAGC+CGG - Chr3:83189989-83190008 None:intergenic 25.0%
! ATGAATTCATAAACAAGCAA+TGG - Chr3:83191336-83191355 None:intergenic 25.0%
! ATTTCCTTCATCAAAATTGT+TGG - Chr3:83191121-83191140 None:intergenic 25.0%
! ATTTGTACGATTCTTCTTTA+AGG + Chr3:83189932-83189951 MsG0380016419.01.T01:intron 25.0%
! CTGATTTAACAAATTTACTG+AGG + Chr3:83190118-83190137 MsG0380016419.01.T01:intron 25.0%
! CTTTATGTCTCAAACAAATT+CGG + Chr3:83190443-83190462 MsG0380016419.01.T01:intron 25.0%
! GTTTATGAATTCATTCCAAA+TGG + Chr3:83191342-83191361 MsG0380016419.01.T01:CDS 25.0%
! TTCAAGTAATTATGCTTGTA+AGG + Chr3:83189758-83189777 MsG0380016419.01.T01:CDS 25.0%
! TTTATGTCTCAAACAAATTC+GGG + Chr3:83190444-83190463 MsG0380016419.01.T01:intron 25.0%
! TTTCTTCCATTAAAGAAGAT+CGG + Chr3:83191778-83191797 MsG0380016419.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGTACGATTCTTCTTTAA+GGG + Chr3:83189933-83189952 MsG0380016419.01.T01:intron 25.0%
!! AGAAATGTGGTAAGAATTTT+GGG + Chr3:83191288-83191307 MsG0380016419.01.T01:CDS 25.0%
!! ATGATATCTTTCCTTGATTT+TGG - Chr3:83190673-83190692 None:intergenic 25.0%
!! TAGAAATGTGGTAAGAATTT+TGG + Chr3:83191287-83191306 MsG0380016419.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTGAGTCAATGCAAATTTT+TGG + Chr3:83190484-83190503 MsG0380016419.01.T01:intron 25.0%
!!! CAATTTTTTCAACAAAATGG+TGG + Chr3:83191009-83191028 MsG0380016419.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTATAGATTGGTTTTGATCA+TGG - Chr3:83191386-83191405 None:intergenic 25.0%
AAAGTTCTTCTTCTTTAGCT+TGG - Chr3:83189679-83189698 None:intergenic 30.0%
ACACTTGAAAAACACTTCAT+TGG + Chr3:83190799-83190818 MsG0380016419.01.T01:intron 30.0%
ATTGCAAAGGTTTCTGATTT+CGG + Chr3:83191540-83191559 MsG0380016419.01.T01:CDS 30.0%
CCTGAAAAACTTAATGCAAA+AGG - Chr3:83190415-83190434 None:intergenic 30.0%
GAAGGAAATATTATAGGCAA+AGG + Chr3:83191132-83191151 MsG0380016419.01.T01:CDS 30.0%
TAAACACCTTTCTGCAATTA+CGG - Chr3:83191865-83191884 None:intergenic 30.0%
TAATGCAAAAGGCAAATCAA+AGG - Chr3:83190404-83190423 None:intergenic 30.0%
TACTGTTGCAACAAAAGATA+GGG + Chr3:83191034-83191053 MsG0380016419.01.T01:CDS 30.0%
TCAAATCAACCATAGAAATG+TGG + Chr3:83191275-83191294 MsG0380016419.01.T01:CDS 30.0%
TGAAAAAATCCAATTTAGCC+GGG - Chr3:83189988-83190007 None:intergenic 30.0%
TGATCATAAACAGTTCCATT+TGG - Chr3:83191360-83191379 None:intergenic 30.0%
TGGAAGCAATTATGCTTATT+TGG + Chr3:83190951-83190970 MsG0380016419.01.T01:CDS 30.0%
TTACTGTTGCAACAAAAGAT+AGG + Chr3:83191033-83191052 MsG0380016419.01.T01:CDS 30.0%
TTTACTGAGGGAATTTATCT+AGG + Chr3:83190131-83190150 MsG0380016419.01.T01:intron 30.0%
TTTCTGCTTTAATGAAGTGA+GGG + Chr3:83190365-83190384 MsG0380016419.01.T01:intron 30.0%
! AAATGCTTTGATGGATATAG+GGG + Chr3:83189834-83189853 MsG0380016419.01.T01:CDS 30.0%
! AAGTTCTTCTTCTTTAGCTT+GGG - Chr3:83189678-83189697 None:intergenic 30.0%
! CAAATGCTTTGATGGATATA+GGG + Chr3:83189833-83189852 MsG0380016419.01.T01:CDS 30.0%
! CCTTTTGCATTAAGTTTTTC+AGG + Chr3:83190412-83190431 MsG0380016419.01.T01:intron 30.0%
!! AATTGCAGAAAGGTGTTTAA+GGG + Chr3:83191866-83191885 MsG0380016419.01.T01:CDS 30.0%
!! TAATTGCAGAAAGGTGTTTA+AGG + Chr3:83191865-83191884 MsG0380016419.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTTTATTTCCCGGCTAAAT+TGG + Chr3:83189976-83189995 MsG0380016419.01.T01:intron 30.0%
!!! TGTTTCCATTTTTTATGTCC+AGG + Chr3:83190898-83190917 MsG0380016419.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTGTATTTTTAGAGCTCCT+TGG + Chr3:83190317-83190336 MsG0380016419.01.T01:intron 30.0%
AACCAACCGATCTTCTTTAA+TGG - Chr3:83191787-83191806 None:intergenic 35.0%
AAGAAACAAAGTACATCGCA+AGG - Chr3:83191764-83191783 None:intergenic 35.0%
AAGAGTGATGTCTATAGCTT+TGG + Chr3:83191669-83191688 MsG0380016419.01.T01:CDS 35.0%
ACCAATCTATAAAGCTGACA+TGG + Chr3:83191394-83191413 MsG0380016419.01.T01:CDS 35.0%
AGAATAGCAAAAGAAACTGC+TGG + Chr3:83191429-83191448 MsG0380016419.01.T01:CDS 35.0%
AGACACCTGGACATAAAAAA+TGG - Chr3:83190906-83190925 None:intergenic 35.0%
AGAGTGATGTCTATAGCTTT+GGG + Chr3:83191670-83191689 MsG0380016419.01.T01:CDS 35.0%
AGATGGCAATTTCATTGCAA+AGG + Chr3:83191527-83191546 MsG0380016419.01.T01:CDS 35.0%
AGGAAATGTTGAGCATCTAA+AGG + Chr3:83191833-83191852 MsG0380016419.01.T01:CDS 35.0%
CAAAATGCAGTCCAAAATCA+AGG + Chr3:83190659-83190678 MsG0380016419.01.T01:CDS 35.0%
GTTTCTGCTTTAATGAAGTG+AGG + Chr3:83190364-83190383 MsG0380016419.01.T01:intron 35.0%
TAAAGCTGACATGGAAAACA+AGG + Chr3:83191403-83191422 MsG0380016419.01.T01:CDS 35.0%
TACCTTTGCAAATGCTTTGA+TGG + Chr3:83189825-83189844 MsG0380016419.01.T01:CDS 35.0%
TCAACAAGTTTACTTCCACA+AGG + Chr3:83190766-83190785 MsG0380016419.01.T01:intron 35.0%
TTCCATTAAAGAAGATCGGT+TGG + Chr3:83191782-83191801 MsG0380016419.01.T01:CDS 35.0%
TTCTGCTTTAATGAAGTGAG+GGG + Chr3:83190366-83190385 MsG0380016419.01.T01:intron 35.0%
TTGCAATGAAATTGCCATCT+AGG - Chr3:83191527-83191546 None:intergenic 35.0%
! AGTGTCAACAATTTTCCTTG+TGG - Chr3:83190784-83190803 None:intergenic 35.0%
! ATCCATCAAAGCATTTGCAA+AGG - Chr3:83189830-83189849 None:intergenic 35.0%
! GCAAATGCTTTGATGGATAT+AGG + Chr3:83189832-83189851 MsG0380016419.01.T01:CDS 35.0%
! TCCATGTCAGCTTTATAGAT+TGG - Chr3:83191398-83191417 None:intergenic 35.0%
! TGTGATACATCTGGAATACT+CGG + Chr3:83189396-83189415 MsG0380016419.01.T01:CDS 35.0%
! TTGTTCTGTTGCTTACAAGA+TGG + Chr3:83190255-83190274 MsG0380016419.01.T01:intron 35.0%
!! AGTTCTTCTTCTTTAGCTTG+GGG - Chr3:83189677-83189696 None:intergenic 35.0%
!! GCAACCAACAATTTTGATGA+AGG + Chr3:83191114-83191133 MsG0380016419.01.T01:CDS 35.0%
!!! CTCCTTGGTTTGTTGTTTTT+GGG + Chr3:83190332-83190351 MsG0380016419.01.T01:intron 35.0%
!!! CTGGTTTTGGTCATTGATTT+TGG - Chr3:83191220-83191239 None:intergenic 35.0%
!!! GATTTTTGGTCCTTTGTTTG+AGG + Chr3:83190186-83190205 MsG0380016419.01.T01:intron 35.0%
!!! TGGTTTGTTGCTGAGTTTTT+TGG + Chr3:83190275-83190294 MsG0380016419.01.T01:intron 35.0%
!!! TTGCATTAAGTTTTTCAGGC+TGG + Chr3:83190416-83190435 MsG0380016419.01.T01:intron 35.0%
AAGTTGCCGTAATTGCAGAA+AGG + Chr3:83191856-83191875 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
ACGACCACTTCATTGATGAA+TGG - Chr3:83191249-83191268 None:intergenic 40.0%
ACTGTGTTATAGCAGACCAA+TGG + Chr3:83191728-83191747 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
AGTCCTGGCATACTTACATT+CGG + Chr3:83191452-83191471 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
ATAGCGACTTCTTTCATGGA+TGG - Chr3:83191909-83191928 None:intergenic 40.0%
ATCCATGAAAGAAGTCGCTA+TGG + Chr3:83191908-83191927 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
ATTCTGGACAGCAACATTGA+TGG + Chr3:83191810-83191829 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
CAACACAATGCCTCAAACAA+AGG - Chr3:83190199-83190218 None:intergenic 40.0%
CAATGAAATTGCCATCTAGG+AGG - Chr3:83191524-83191543 None:intergenic 40.0%
CATAAACAATGGTAGCTTCC+AGG - Chr3:83190601-83190620 None:intergenic 40.0%
CATTGATGAATGGCTCAATC+TGG - Chr3:83191239-83191258 None:intergenic 40.0%
CTTGCAAACTAGCGTGTTAA+CGG + Chr3:83191644-83191663 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
GAAGAACTTTCCTGTGTTGT+TGG + Chr3:83189689-83189708 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
GACCCAAAAACAACAAACCA+AGG - Chr3:83190337-83190356 None:intergenic 40.0%
GATGCAGAAACCATCAAATC+TGG + Chr3:83189801-83189820 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
GCAAAGGTAACCAGATTTGA+TGG - Chr3:83189814-83189833 None:intergenic 40.0%
GGAAATCCTTACCTCATTCA+TGG + Chr3:83189855-83189874 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
GTATATGACTTCAATCCGTG+TGG + Chr3:83189600-83189619 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
GTCTAATGACTGTGTTCAAG+AGG + Chr3:83190558-83190577 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
GTTATCAGACTGTGATCAAG+AGG - Chr3:83191582-83191601 None:intergenic 40.0%
TACCATTGTTTATGCCCGAA+AGG + Chr3:83190607-83190626 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
TCCATGAAAGAAGTCGCTAT+GGG + Chr3:83191909-83191928 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
TCTACAAACATCCTCCTAGA+TGG + Chr3:83191510-83191529 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
TGAGCCATTCATCAATGAAG+TGG + Chr3:83191242-83191261 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
TGATAACCACTCTAGTGCAA+GGG + Chr3:83191595-83191614 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
TGTTGCAACAAAAGATAGGG+AGG + Chr3:83191037-83191056 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
! ACGCTAGTTTGCAAGTATTC+TGG - Chr3:83191639-83191658 None:intergenic 40.0%
! AGATCGGTTGGTTCATATTC+TGG + Chr3:83191794-83191813 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
! CGCTAGTTTGCAAGTATTCT+GGG - Chr3:83191638-83191657 None:intergenic 40.0%
! CTCGGAGTAATTGATTCTGA+AGG + Chr3:83189414-83189433 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
! GAGTGATGTCTATAGCTTTG+GGG + Chr3:83191671-83191690 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTATAGGCAAAGGTGCTCA+GGG + Chr3:83191141-83191160 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
!! TATTATAGGCAAAGGTGCTC+AGG + Chr3:83191140-83191159 MsG0380016419.01.T01:CDS 40.0%
!! TGAATGGCTCAATCTGGTTT+TGG - Chr3:83191233-83191252 None:intergenic 40.0%
!!! GCTCCTTGGTTTGTTGTTTT+TGG + Chr3:83190331-83190350 MsG0380016419.01.T01:intron 40.0%
AAAAGAAACTGCTGGAGTCC+TGG + Chr3:83191437-83191456 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
ACTCTAGTGCAAGGGACATT+GGG + Chr3:83191603-83191622 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
AGGACCAGAACAAGACTCAT+TGG - Chr3:83189496-83189515 None:intergenic 45.0%
ATTCGGGTATGTCTTGAGCT+CGG + Chr3:83190460-83190479 MsG0380016419.01.T01:intron 45.0%
CAACAAAAGATAGGGAGGCA+TGG + Chr3:83191042-83191061 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
CAACTACACCTCTGGATGTT+TGG + Chr3:83189440-83189459 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
CTGATAACCACTCTAGTGCA+AGG + Chr3:83191594-83191613 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
CTTTAATGAAGTGAGGGGTG+GGG + Chr3:83190371-83190390 MsG0380016419.01.T01:intron 45.0%
GAAGGAAACAACTACACCTC+TGG + Chr3:83189432-83189451 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
GCAAGGCTTCTTTCTACCAT+TGG - Chr3:83191747-83191766 None:intergenic 45.0%
GCTCAGGGAACAGTTTACAA+AGG + Chr3:83191156-83191175 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
GCTTTAATGAAGTGAGGGGT+GGG + Chr3:83190370-83190389 MsG0380016419.01.T01:intron 45.0%
GTCCTTTCGGGCATAAACAA+TGG - Chr3:83190612-83190631 None:intergenic 45.0%
GTGTTTAAGGGTGAACAGTG+AGG + Chr3:83191878-83191897 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
TACCTCATTCATGGTTGCGA+AGG + Chr3:83189864-83189883 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
TACCTTCGCAACCATGAATG+AGG - Chr3:83189869-83189888 None:intergenic 45.0%
TATCTAGGCCTGATGCATTG+TGG + Chr3:83190146-83190165 MsG0380016419.01.T01:intron 45.0%
TCCCATAGCGACTTCTTTCA+TGG - Chr3:83191913-83191932 None:intergenic 45.0%
TCCTCAACAGTGAACACTCT+AGG - Chr3:83191084-83191103 None:intergenic 45.0%
TCCTGGTTGTTGCCAGATTT+CGG + Chr3:83189512-83189531 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
TCGCAACCATGAATGAGGTA+AGG - Chr3:83189864-83189883 None:intergenic 45.0%
TGCTTTAATGAAGTGAGGGG+TGG + Chr3:83190369-83190388 MsG0380016419.01.T01:intron 45.0%
TTATGCCCGAAAGGACATGA+GGG + Chr3:83190616-83190635 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
TTCCGTTAACACACGACCTT+GGG - Chr3:83189541-83189560 None:intergenic 45.0%
TTTAATGAAGTGAGGGGTGG+GGG + Chr3:83190372-83190391 MsG0380016419.01.T01:intron 45.0%
TTTATGCCCGAAAGGACATG+AGG + Chr3:83190615-83190634 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
! AAAAGATAGGGAGGCATGGA+AGG + Chr3:83191046-83191065 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
! ACCTAGAGTGTTCACTGTTG+AGG + Chr3:83191080-83191099 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
! ACTTTCCTGTGTTGTTGGAC+TGG + Chr3:83189694-83189713 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
! CTTTCCTGTGTTGTTGGACT+GGG + Chr3:83189695-83189714 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
! GCTACCAACTTGTTTCGAGT+GGG - Chr3:83189369-83189388 None:intergenic 45.0%
! TGCTACCAACTTGTTTCGAG+TGG - Chr3:83189370-83189389 None:intergenic 45.0%
!! AATGAGTCTTGTTCTGGTCC+TGG + Chr3:83189495-83189514 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
!! CGAAACAAGTTGGTAGCAGT+TGG + Chr3:83189372-83189391 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
!! GTTGCCAATGAGTCTTGTTC+TGG + Chr3:83189489-83189508 MsG0380016419.01.T01:CDS 45.0%
!! TCTTCTTCTTTAGCTTGGGG+AGG - Chr3:83189674-83189693 None:intergenic 45.0%
AACCTGTCAGCAAGCTCAGA+AGG + Chr3:83189731-83189750 MsG0380016419.01.T01:CDS 50.0%
ACACCTCTGGATGTTTGGCT+TGG + Chr3:83189445-83189464 MsG0380016419.01.T01:CDS 50.0%
ACCCCAAGGTCGTGTGTTAA+CGG + Chr3:83189536-83189555 MsG0380016419.01.T01:CDS 50.0%
ACCGAAATCTGGCAACAACC+AGG - Chr3:83189516-83189535 None:intergenic 50.0%
CAATGTCCCTTGCACTAGAG+TGG - Chr3:83191604-83191623 None:intergenic 50.0%
CACTCTAGTGCAAGGGACAT+TGG + Chr3:83191602-83191621 MsG0380016419.01.T01:CDS 50.0%
CAGCCGAATGTAAGTATGCC+AGG - Chr3:83191458-83191477 None:intergenic 50.0%
CTCTAGTGCAAGGGACATTG+GGG + Chr3:83191604-83191623 MsG0380016419.01.T01:CDS 50.0%
CTCTCCCACTCGAAACAAGT+TGG + Chr3:83189362-83189381 MsG0380016419.01.T01:CDS 50.0%
CTGGACAGCAACATTGATGG+AGG + Chr3:83191813-83191832 MsG0380016419.01.T01:CDS 50.0%
CTTCCGTTAACACACGACCT+TGG - Chr3:83189542-83189561 None:intergenic 50.0%
GAAAGAAGTCGCTATGGGAC+TGG + Chr3:83191914-83191933 MsG0380016419.01.T01:CDS 50.0%
GAGGGAGACGGAAAGATGAA+TGG + Chr3:83190634-83190653 MsG0380016419.01.T01:CDS 50.0%
GCAACATGCGACAATCTTCC+TGG + Chr3:83190580-83190599 MsG0380016419.01.T01:CDS 50.0%
GCAGTTGGCTGTGATACATC+TGG + Chr3:83189387-83189406 MsG0380016419.01.T01:CDS 50.0%
TCCGTTAACACACGACCTTG+GGG - Chr3:83189540-83189559 None:intergenic 50.0%
TTATGTCCAGGTGTCTGCGT+AGG + Chr3:83190910-83190929 MsG0380016419.01.T01:intron 50.0%
TTCCAACCAGTAGTGCTACG+AGG - Chr3:83190936-83190955 None:intergenic 50.0%
! CTGATGCATTGTGGTGTTGG+CGG + Chr3:83190155-83190174 MsG0380016419.01.T01:intron 50.0%
! TTCCTGTCAGTAGCTCTGCT+AGG - Chr3:83191701-83191720 None:intergenic 50.0%
!! ATCCTTCTGAGCTTGCTGAC+AGG - Chr3:83189736-83189755 None:intergenic 50.0%
!! GATGTTTGGCTTGGTGCAAC+AGG + Chr3:83189454-83189473 MsG0380016419.01.T01:CDS 50.0%
!! TCTGAGCTTGCTGACAGGTT+TGG - Chr3:83189731-83189750 None:intergenic 50.0%
!! TGATGCATTGTGGTGTTGGC+GGG + Chr3:83190156-83190175 MsG0380016419.01.T01:intron 50.0%
ACTGCCCAGTCCAACAACAC+AGG - Chr3:83189702-83189721 None:intergenic 55.0%
CCGAAAGGACATGAGGGAGA+CGG + Chr3:83190622-83190641 MsG0380016419.01.T01:CDS 55.0%
CCGTCTCCCTCATGTCCTTT+CGG - Chr3:83190625-83190644 None:intergenic 55.0%
CGCCAACACCACAATGCATC+AGG - Chr3:83190157-83190176 None:intergenic 55.0%
CGTCTCCCTCATGTCCTTTC+GGG - Chr3:83190624-83190643 None:intergenic 55.0%
GAAGTCGCTATGGGACTGGA+AGG + Chr3:83191918-83191937 MsG0380016419.01.T01:CDS 55.0%
GAGTGACTCGACGAGCTAAG+AGG - Chr3:83189576-83189595 None:intergenic 55.0%
GCACCAAGCCAAACATCCAG+AGG - Chr3:83189451-83189470 None:intergenic 55.0%
GGCCTGATGCATTGTGGTGT+TGG + Chr3:83190152-83190171 MsG0380016419.01.T01:intron 55.0%
GTCCTAGCAGAGCTACTGAC+AGG + Chr3:83191696-83191715 MsG0380016419.01.T01:CDS 55.0%
TGCCAGATTTCGGTACCCCA+AGG + Chr3:83189522-83189541 MsG0380016419.01.T01:CDS 55.0%
! GCAAGGGACATTGGGGTATC+TGG + Chr3:83191611-83191630 MsG0380016419.01.T01:CDS 55.0%
! GTGTTGTTGGACTGGGCAGT+AGG + Chr3:83189702-83189721 MsG0380016419.01.T01:CDS 55.0%
!! CTTTAGCTTGGGGAGGTCTG+TGG - Chr3:83189667-83189686 None:intergenic 55.0%
!! GACCTTGGGGTACCGAAATC+TGG - Chr3:83189527-83189546 None:intergenic 55.0%
CGTAGGCCTCGTAGCACTAC+TGG + Chr3:83190927-83190946 MsG0380016419.01.T01:CDS 60.0%
GGCCTCGTAGCACTACTGGT+TGG + Chr3:83190931-83190950 MsG0380016419.01.T01:CDS 60.0%
!! CATTGTGGTGTTGGCGGGCA+GGG + Chr3:83190161-83190180 MsG0380016419.01.T01:intron 60.0%
!! TGGCGGGCAGGGCAGATTTT+TGG + Chr3:83190172-83190191 MsG0380016419.01.T01:intron 60.0%
ACGAGGCCTACGCAGACACC+TGG - Chr3:83190919-83190938 None:intergenic 65.0%
!! GCATTGTGGTGTTGGCGGGC+AGG + Chr3:83190160-83190179 MsG0380016419.01.T01:intron 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 83189345 83191962 83189345 ID=MsG0380016419.01;Name=MsG0380016419.01
Chr3 mRNA 83189345 83191962 83189345 ID=MsG0380016419.01.T01;Parent=MsG0380016419.01;Name=MsG0380016419.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.49;_QI=0|0|0|1|1|1|3|0|584
Chr3 exon 83189345 83189885 83189345 ID=MsG0380016419.01.T01:exon:14000;Parent=MsG0380016419.01.T01
Chr3 exon 83190539 83190709 83190539 ID=MsG0380016419.01.T01:exon:14001;Parent=MsG0380016419.01.T01
Chr3 exon 83190920 83191962 83190920 ID=MsG0380016419.01.T01:exon:14002;Parent=MsG0380016419.01.T01
Chr3 CDS 83189345 83189885 83189345 ID=MsG0380016419.01.T01:cds;Parent=MsG0380016419.01.T01
Chr3 CDS 83190539 83190709 83190539 ID=MsG0380016419.01.T01:cds;Parent=MsG0380016419.01.T01
Chr3 CDS 83190920 83191962 83190920 ID=MsG0380016419.01.T01:cds;Parent=MsG0380016419.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380016419.01.T01

ATGACACATTTTCACATCTCTCCCACTCGAAACAAGTTGGTAGCAGTTGGCTGTGATACATCTGGAATACTCGGAGTAATTGATTCTGAAGGAAACAACTACACCTCTGGATGTTTGGCTTGGTGCAACAGGCACGCTGATCTCGTTGCCAATGAGTCTTGTTCTGGTCCTGGTTGTTGCCAGATTTCGGTACCCCAAGGTCGTGTGTTAACGGAAGTATTCTATTTTCCTCTTAGCTCGTCGAGTCACTCAGCAGTATATGACTTCAATCCGTGTGGTTATGTTTTTATTGTTGAAAATGGAGACTACATTTTCGCAACCACAGACCTCCCCAAGCTAAAGAAGAAGAACTTTCCTGTGTTGTTGGACTGGGCAGTAGGAAACCAAACCTGTCAGCAAGCTCAGAAGGATCTTTCAAGTAATTATGCTTGTAAGGCAGACAAAAGTATATGTTACGATGCAGAAACCATCAAATCTGGTTACCTTTGCAAATGCTTTGATGGATATAGGGGAAATCCTTACCTCATTCATGGTTGCGAAGATATTAATGAATGCACGGAGTCTAATGACTGTGTTCAAGAGGCAACATGCGACAATCTTCCTGGAAGCTACCATTGTTTATGCCCGAAAGGACATGAGGGAGACGGAAAGATGAATGGCACAAAATGCAGTCCAAAATCAAGGAAAGATATCATATACATCATTGCATTGAGTGTCTGCGTAGGCCTCGTAGCACTACTGGTTGGAAGCAATTATGCTTATTTGGCATTGAAAAAAAGAAAGCTCGATAAACTTAAAGAACAATTTTTTCAACAAAATGGTGGCTTACTGTTGCAACAAAAGATAGGGAGGCATGGAAGGTCAAACGAAACACCTAGAGTGTTCACTGTTGAGGAGCTAAATGAAGCAACCAACAATTTTGATGAAGGAAATATTATAGGCAAAGGTGCTCAGGGAACAGTTTACAAAGGAGTTTTGCAAGATAAAAGTATTGTAGCAATAAAAAAGTCCAAAATCAATGACCAAAACCAGATTGAGCCATTCATCAATGAAGTGGTCGTTCTTTCTCAAATCAACCATAGAAATGTGGTAAGAATTTTGGGTTGTTGTTTAGAAACAGAAGTTCCATTGCTTGTTTATGAATTCATTCCAAATGGAACTGTTTATGATCATCTCCATGATCAAAACCAATCTATAAAGCTGACATGGAAAACAAGGTTAAGAATAGCAAAAGAAACTGCTGGAGTCCTGGCATACTTACATTCGGCTGCTTCTACTCCAATCATTCATAGAGATATAAAATCTACAAACATCCTCCTAGATGGCAATTTCATTGCAAAGGTTTCTGATTTCGGAGCTTCAAAGATTGTTCCTCTTGATCACAGTCTGATAACCACTCTAGTGCAAGGGACATTGGGGTATCTGGACCCAGAATACTTGCAAACTAGCGTGTTAACGGAGAAGAGTGATGTCTATAGCTTTGGGGTTGTCCTAGCAGAGCTACTGACAGGAAAGAAAGCACTGTGTTATAGCAGACCAATGGTAGAAAGAAGCCTTGCGATGTACTTTGTTTCTTCCATTAAAGAAGATCGGTTGGTTCATATTCTGGACAGCAACATTGATGGAGGAAATGTTGAGCATCTAAAGGAAGTTGCCGTAATTGCAGAAAGGTGTTTAAGGGTGAACAGTGAGGAACGACCATCCATGAAAGAAGTCGCTATGGGACTGGAAGGAATATTAGTTATTGAAGAGTAG
Protein sequence

>MsG0380016419.01.T01

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