AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780037001.01

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MsG0780037001.01.T01 AT5G41170 23.607 377 244 5 19 384 83 426 2.00e-23 102
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MsG0780037001.01.T01 AT1G10910 22.769 325 210 5 111 429 163 452 1.20e-12 70.9
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MsG0780037001.01.T01 AT4G18840 24.048 420 239 13 5 352 59 470 7.70e-16 80.5
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MsG0780037001.01.T01 AT1G68930 22.849 337 202 10 100 395 160 479 1.12e-13 74.3
MsG0780037001.01.T01 AT2G35130 19.378 418 292 7 42 414 153 570 1.58e-15 79.7
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MsG0780037001.01.T01 AT2G35130 20.833 336 191 5 17 310 268 570 9.19e-14 74.3
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MsG0780037001.01.T01 AT2G38420 22.764 369 214 9 49 413 115 416 3.48e-15 78.2
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MsG0780037001.01.T01 AT3G09040 21.220 410 266 9 42 410 158 551 3.96e-15 79.0
MsG0780037001.01.T01 AT3G09040 21.106 398 295 9 19 410 267 651 6.29e-11 65.5
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MsG0780037001.01.T01 AT3G09040 21.106 398 295 9 19 410 292 676 6.07e-11 65.9
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MsG0780037001.01.T01 AT3G09040 21.106 398 295 9 19 410 292 676 6.07e-11 65.9
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MsG0780037001.01.T01 AT2G44880 20.513 468 295 14 13 430 82 522 7.01e-15 77.8
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MsG0780037001.01.T01 AT5G08310 21.330 361 270 9 77 426 437 794 3.13e-12 69.7
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MsG0780037001.01.T01 AT1G05600 21.286 451 277 17 12 395 8 447 9.38e-13 70.9
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MsG0780037001.01.T01 AT3G53360 21.630 319 239 8 31 344 323 635 2.93e-12 69.7
MsG0780037001.01.T01 AT3G03580 23.179 302 221 5 16 313 446 740 3.47e-12 69.7
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MsG0780037001.01.T01 AT4G22760 22.260 292 200 9 117 398 235 509 3.60e-12 69.3
MsG0780037001.01.T01 AT1G77405 23.431 239 133 4 77 298 198 403 3.62e-12 68.9
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MsG0780037001.01.T01 AT3G08820 20.449 401 279 11 8 391 40 417 4.60e-12 68.9
MsG0780037001.01.T01 AT5G61370 21.368 351 249 9 15 341 66 413 4.66e-12 68.6
MsG0780037001.01.T01 AT4G04370 23.988 346 236 8 47 383 14 341 4.69e-12 68.9
MsG0780037001.01.T01 AT3G11460 20.981 367 258 10 11 362 86 435 4.71e-12 68.9
MsG0780037001.01.T01 AT1G11900 26.257 179 124 3 33 206 165 340 5.20e-12 67.8
MsG0780037001.01.T01 AT4G19191 22.294 462 264 12 15 395 19 466 5.46e-12 68.6
MsG0780037001.01.T01 AT3G23330 24.701 251 146 8 183 395 97 342 5.95e-12 68.6
MsG0780037001.01.T01 AT1G71210 21.895 306 228 4 118 414 255 558 6.00e-12 68.9
MsG0780037001.01.T01 AT1G66345 22.515 342 193 8 7 307 157 467 6.05e-12 68.6
MsG0780037001.01.T01 AT1G66345 21.429 238 182 2 45 277 305 542 1.77e-11 67.0
MsG0780037001.01.T01 AT1G56570 24.378 201 148 2 42 241 311 508 7.39e-12 68.2
MsG0780037001.01.T01 AT1G56570 24.378 201 148 2 42 241 311 508 7.39e-12 68.2
MsG0780037001.01.T01 AT4G38010 20.705 454 260 13 75 490 102 493 9.61e-12 67.8
MsG0780037001.01.T01 AT5G43820 19.489 313 242 5 3 307 213 523 1.13e-11 67.4
MsG0780037001.01.T01 AT5G43820 22.353 255 184 4 171 416 104 353 1.27e-11 67.4
MsG0780037001.01.T01 AT5G43820 18.428 369 292 5 66 427 173 539 1.34e-11 67.4
MsG0780037001.01.T01 AT5G66520 22.968 283 206 7 116 395 82 355 1.52e-11 67.4
MsG0780037001.01.T01 AT1G14470 20.471 425 264 12 1 395 126 506 1.64e-11 67.0
MsG0780037001.01.T01 AT4G18520 27.391 230 124 6 78 305 419 607 1.85e-11 67.0
MsG0780037001.01.T01 AT3G15130 22.251 382 230 11 16 380 44 375 2.42e-11 66.6
MsG0780037001.01.T01 AT4G01030 22.154 325 232 11 109 423 321 634 2.87e-11 66.6
MsG0780037001.01.T01 AT5G65570 21.124 445 297 11 6 443 195 592 3.66e-11 66.2
MsG0780037001.01.T01 AT1G19520 22.344 273 205 3 77 342 347 619 3.69e-11 66.2
MsG0780037001.01.T01 AT5G36300 20.219 183 133 2 66 235 72 254 3.75e-11 64.3
MsG0780037001.01.T01 AT1G26500 20.557 287 204 7 26 307 197 464 3.83e-11 65.9
MsG0780037001.01.T01 AT1G80150 24.519 208 149 3 78 277 176 383 4.04e-11 65.1
MsG0780037001.01.T01 AT4G37170 22.711 273 199 7 77 344 216 481 4.35e-11 65.9
MsG0780037001.01.T01 AT2G37310 22.581 465 283 13 7 415 51 494 4.57e-11 65.9
MsG0780037001.01.T01 AT2G15980 21.406 313 219 6 8 293 157 469 4.59e-11 65.5
MsG0780037001.01.T01 AT3G02010 21.226 424 294 11 13 417 79 481 5.18e-11 65.9
MsG0780037001.01.T01 AT2G03880 22.284 359 203 7 14 337 97 414 5.30e-11 65.5
MsG0780037001.01.T01 AT5G15010 23.605 233 166 4 170 394 288 516 6.66e-11 65.1
MsG0780037001.01.T01 AT5G13230 24.845 322 211 12 31 337 300 605 6.71e-11 65.5
MsG0780037001.01.T01 AT3G13880 22.323 439 302 17 9 426 179 599 6.71e-11 65.5
MsG0780037001.01.T01 AT3G13770 24.026 308 177 9 82 379 55 315 6.86e-11 65.1
MsG0780037001.01.T01 AT2G01390 26.619 139 99 1 81 216 124 262 7.07e-11 65.1
MsG0780037001.01.T01 AT5G52850 24.552 391 262 12 6 384 355 724 7.31e-11 65.5
MsG0780037001.01.T01 AT3G13770 24.026 308 177 9 82 379 55 315 7.69e-11 65.1
MsG0780037001.01.T01 AT3G49240 20.492 366 241 7 76 426 162 492 7.70e-11 65.1
MsG0780037001.01.T01 AT3G21470 21.543 376 264 12 69 439 71 420 7.92e-11 64.7

Find 70 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 78 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTCGCAACGTTGAACTAATT+TGG 0.124027 7:+17976255 None:intergenic
GATTCATCAGTTCTGTAAAT+TGG 0.153576 7:-17976602 MsG0780037001.01.T01:CDS
TCCATTACTGCCTTAATTAA+AGG 0.168838 7:+17976502 None:intergenic
ATATTAAATGTCTGAAAATT+AGG 0.191676 7:+17975806 None:intergenic
CTTTGCTTCAAATTTACTTA+TGG 0.205150 7:-17976923 MsG0780037001.01.T01:CDS
TCGGCAAGTTTATCAGATTT+TGG 0.214896 7:-17976677 MsG0780037001.01.T01:CDS
TTGGGTTTAATGATTGGTTT+AGG 0.222409 7:-17976658 MsG0780037001.01.T01:CDS
GAAGTAAATGTATACTTATC+AGG 0.292947 7:+17976322 None:intergenic
TACTTATACGCCTTTAATTA+AGG 0.307103 7:-17976512 MsG0780037001.01.T01:CDS
TGCGTAAATTTCAATGCAAT+TGG 0.310753 7:-17975676 MsG0780037001.01.T01:CDS
CCAGACCATTGTTCTTCATC+TGG 0.312749 7:+17975831 None:intergenic
TTCCAAGGTGATGAGAGATT+TGG 0.316999 7:-17975615 MsG0780037001.01.T01:CDS
TCGCAACGTTGAACTAATTT+GGG 0.345034 7:+17976256 None:intergenic
TGGGTTTAATGATTGGTTTA+GGG 0.351839 7:-17976657 MsG0780037001.01.T01:CDS
TCCAAGGTGATGAGAGATTT+GGG 0.355461 7:-17975614 MsG0780037001.01.T01:CDS
ATATTATAAAACACTAAATC+AGG 0.358328 7:+17976418 None:intergenic
TTGACTGAGATGAGAGATTT+GGG 0.360915 7:-17975647 MsG0780037001.01.T01:CDS
AGGAGGCAATTAGAGTATTT+CGG 0.365610 7:-17976360 MsG0780037001.01.T01:CDS
ATGTTGAAAGTAAGGAAATT+AGG 0.368765 7:+17976838 None:intergenic
GTTGACTGAGATGAGAGATT+TGG 0.371480 7:-17975648 MsG0780037001.01.T01:CDS
GATATCGAATGAGCTTAAAA+AGG 0.373317 7:-17975993 MsG0780037001.01.T01:CDS
GGCGTATAAGTAACAGAATT+CGG 0.385737 7:+17976523 None:intergenic
TTGAATTGTCTGTTAATGTT+TGG 0.390042 7:-17976633 MsG0780037001.01.T01:CDS
CATCTGGTCATACAATGTTC+TGG 0.391070 7:+17975847 None:intergenic
ATTCATCAGTTCTGTAAATT+GGG 0.391427 7:-17976601 MsG0780037001.01.T01:CDS
TAGAAGTGGAAGAACTTTAG+AGG 0.391431 7:-17975870 MsG0780037001.01.T01:CDS
AGGATATTTCTTAACTGCTT+CGG 0.399973 7:+17975934 None:intergenic
GCAACTGTTTAACCATTTGA+AGG 0.408678 7:+17975753 None:intergenic
AAAATCTTAAAAGCGTTCTT+CGG 0.408785 7:+17976877 None:intergenic
AATTGCCTCCTCATGCATTC+CGG 0.408915 7:+17976372 None:intergenic
TTAATCTCCTATGTTAAGGC+TGG 0.425425 7:-17976196 MsG0780037001.01.T01:CDS
ATTGATTGTCTTTCAAAGTC+CGG 0.428188 7:-17976391 MsG0780037001.01.T01:CDS
ATCTGACATATCTTCAGAAC+TGG 0.438436 7:+17975508 None:intergenic
GGCTACATGGTTGAATTTCA+CGG 0.445731 7:-17976967 None:intergenic
GCCTTTAATTAAGGCAGTAA+TGG 0.454896 7:-17976503 MsG0780037001.01.T01:CDS
GCTCATTCGATATCACAGTA+TGG 0.457388 7:+17976002 None:intergenic
CCGGATAAATATACTTTCGC+TGG 0.459524 7:-17976118 MsG0780037001.01.T01:CDS
TGTAACTCGTGTCTTACGTT+TGG 0.460858 7:-17976470 MsG0780037001.01.T01:CDS
AAAGCGCAATGTTGAAAGTA+AGG 0.461606 7:+17976830 None:intergenic
GCACTAAAAGTTGACGCGTT+AGG 0.464340 7:+17976733 None:intergenic
CATAAGTAAATTTGAAGCAA+AGG 0.464527 7:+17976924 None:intergenic
CCAGCGAAAGTATATTTATC+CGG 0.464863 7:+17976118 None:intergenic
CCTCTTGACAGTATAGCATA+TGG 0.465574 7:-17975914 MsG0780037001.01.T01:CDS
AAAGGCTGGTCAGTATGAAC+AGG 0.477594 7:-17975975 MsG0780037001.01.T01:CDS
TGAAAGATATGATTGATTCA+AGG 0.486213 7:-17975730 MsG0780037001.01.T01:CDS
CAATGTCATTGATATTAGAA+AGG 0.493267 7:+17976803 None:intergenic
TAAGACACGAGTTACATCAT+TGG 0.499312 7:+17976477 None:intergenic
TGAAGTAAAAGACCTTCAAA+TGG 0.503544 7:-17975765 MsG0780037001.01.T01:CDS
TTTGGGTTTATTATCTTCCA+AGG 0.506246 7:-17975597 MsG0780037001.01.T01:CDS
TTTGTAAGTTGAATGCGTTT+CGG 0.512438 7:-17976696 MsG0780037001.01.T01:CDS
TTTGGGTTTATTATCTTCCA+AGG 0.513682 7:-17975630 MsG0780037001.01.T01:CDS
CCAGATGAAGAACAATGGTC+TGG 0.524362 7:-17975831 MsG0780037001.01.T01:CDS
TAATCTCCTATGTTAAGGCT+GGG 0.527436 7:-17976195 MsG0780037001.01.T01:CDS
AGTGTATCGTGCTGTTATGA+TGG 0.534352 7:-17976047 MsG0780037001.01.T01:CDS
CATTATTGTCTGCAATCTGT+CGG 0.538873 7:-17976300 MsG0780037001.01.T01:CDS
CGGATAAATATACTTTCGCT+GGG 0.546418 7:-17976117 MsG0780037001.01.T01:CDS
ACCCAAATCTCTCATCACCT+TGG 0.551073 7:+17975613 None:intergenic
TATGATCGTATGATTTCTGA+AGG 0.552454 7:-17976148 MsG0780037001.01.T01:CDS
AATCTCCTATGTTAAGGCTG+GGG 0.556729 7:-17976194 MsG0780037001.01.T01:CDS
TTCGACAAAATGATTCAAAG+TGG 0.557376 7:-17976553 MsG0780037001.01.T01:CDS
GACAGTATAGCATATGGTGT+TGG 0.561213 7:-17975908 MsG0780037001.01.T01:CDS
AGAATCCCCAGCCTTAACAT+AGG 0.582678 7:+17976189 None:intergenic
ATGTTCTTAGAGAAATGTTG+AGG 0.595919 7:-17976768 MsG0780037001.01.T01:CDS
TATTATAAAACACTAAATCA+GGG 0.597036 7:+17976419 None:intergenic
ATCGATGCACATCTTAGAAG+TGG 0.607520 7:-17975884 MsG0780037001.01.T01:CDS
CCATATGCTATACTGTCAAG+AGG 0.611690 7:+17975914 None:intergenic
TGCTGTTATGATGGATCACA+TGG 0.620249 7:-17976038 MsG0780037001.01.T01:CDS
TTCAAAGTCCGGAATGCATG+AGG 0.626324 7:-17976380 MsG0780037001.01.T01:CDS
AAAGTCCGGAATGCATGAGG+AGG 0.670823 7:-17976377 MsG0780037001.01.T01:CDS
TATGACCAGATGAAGAACAA+TGG 0.690570 7:-17975836 MsG0780037001.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATATTAAATGTCTGAAAATT+AGG + Chr7:17976645-17976664 None:intergenic 15.0%
!! ATATTATAAAACACTAAATC+AGG + Chr7:17976033-17976052 None:intergenic 15.0%
!! TATTATAAAACACTAAATCA+GGG + Chr7:17976032-17976051 None:intergenic 15.0%
! ATGTTGAAAGTAAGGAAATT+AGG + Chr7:17975613-17975632 None:intergenic 25.0%
! ATTCATCAGTTCTGTAAATT+GGG - Chr7:17975847-17975866 MsG0780037001.01.T01:CDS 25.0%
! CAATGTCATTGATATTAGAA+AGG + Chr7:17975648-17975667 None:intergenic 25.0%
! CTTTGCTTCAAATTTACTTA+TGG - Chr7:17975525-17975544 MsG0780037001.01.T01:CDS 25.0%
! GAAGTAAATGTATACTTATC+AGG + Chr7:17976129-17976148 None:intergenic 25.0%
! TACTTATACGCCTTTAATTA+AGG - Chr7:17975936-17975955 MsG0780037001.01.T01:CDS 25.0%
! TTGAATTGTCTGTTAATGTT+TGG - Chr7:17975815-17975834 MsG0780037001.01.T01:CDS 25.0%
!! CATAAGTAAATTTGAAGCAA+AGG + Chr7:17975527-17975546 None:intergenic 25.0%
!! TCTTTTAATCTCCTATGTTA+AGG - Chr7:17976248-17976267 MsG0780037001.01.T01:CDS 25.0%
!! TGAAAGATATGATTGATTCA+AGG - Chr7:17976718-17976737 MsG0780037001.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAAATCTTAAAAGCGTTCTT+CGG + Chr7:17975574-17975593 None:intergenic 25.0%
!!! AAGAACGCTTTTAAGATTTT+CGG - Chr7:17975574-17975593 MsG0780037001.01.T01:CDS 25.0%
AGGATATTTCTTAACTGCTT+CGG + Chr7:17976517-17976536 None:intergenic 30.0%
ATGTTCTTAGAGAAATGTTG+AGG - Chr7:17975680-17975699 MsG0780037001.01.T01:CDS 30.0%
ATTGATTGTCTTTCAAAGTC+CGG - Chr7:17976057-17976076 MsG0780037001.01.T01:CDS 30.0%
GATATCGAATGAGCTTAAAA+AGG - Chr7:17976455-17976474 MsG0780037001.01.T01:CDS 30.0%
GATTCATCAGTTCTGTAAAT+TGG - Chr7:17975846-17975865 MsG0780037001.01.T01:CDS 30.0%
TATGATCGTATGATTTCTGA+AGG - Chr7:17976300-17976319 MsG0780037001.01.T01:CDS 30.0%
TCCATTACTGCCTTAATTAA+AGG + Chr7:17975949-17975968 None:intergenic 30.0%
TGAAGTAAAAGACCTTCAAA+TGG - Chr7:17976683-17976702 MsG0780037001.01.T01:CDS 30.0%
TGCGTAAATTTCAATGCAAT+TGG - Chr7:17976772-17976791 MsG0780037001.01.T01:CDS 30.0%
TGCTTCGGATATAAAAACAT+CGG + Chr7:17976502-17976521 None:intergenic 30.0%
TTCGACAAAATGATTCAAAG+TGG - Chr7:17975895-17975914 MsG0780037001.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGGGTTTATTATCTTCCA+AGG - Chr7:17976818-17976837 MsG0780037001.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGTAAGTTGAATGCGTTT+CGG - Chr7:17975752-17975771 MsG0780037001.01.T01:CDS 30.0%
!! TGGGTTTAATGATTGGTTTA+GGG - Chr7:17975791-17975810 MsG0780037001.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGGGTTTAATGATTGGTTT+AGG - Chr7:17975790-17975809 MsG0780037001.01.T01:CDS 30.0%
!!! CAGATTTTGGGTTTAATGAT+TGG - Chr7:17975784-17975803 MsG0780037001.01.T01:CDS 30.0%
AAAGCGCAATGTTGAAAGTA+AGG + Chr7:17975621-17975640 None:intergenic 35.0%
ATCTGACATATCTTCAGAAC+TGG + Chr7:17976943-17976962 None:intergenic 35.0%
CATTATTGTCTGCAATCTGT+CGG - Chr7:17976148-17976167 MsG0780037001.01.T01:CDS 35.0%
CGGATAAATATACTTTCGCT+GGG - Chr7:17976331-17976350 MsG0780037001.01.T01:CDS 35.0%
GAGCAAAAAATGAACTCTGT+TGG - Chr7:17976000-17976019 MsG0780037001.01.T01:CDS 35.0%
GCAACTGTTTAACCATTTGA+AGG + Chr7:17976698-17976717 None:intergenic 35.0%
GCCTTTAATTAAGGCAGTAA+TGG - Chr7:17975945-17975964 MsG0780037001.01.T01:CDS 35.0%
GGCGTATAAGTAACAGAATT+CGG + Chr7:17975928-17975947 None:intergenic 35.0%
TAAGACACGAGTTACATCAT+TGG + Chr7:17975974-17975993 None:intergenic 35.0%
TAATCTCCTATGTTAAGGCT+GGG - Chr7:17976253-17976272 MsG0780037001.01.T01:CDS 35.0%
TAGAAGTGGAAGAACTTTAG+AGG - Chr7:17976578-17976597 MsG0780037001.01.T01:CDS 35.0%
TATGACCAGATGAAGAACAA+TGG - Chr7:17976612-17976631 MsG0780037001.01.T01:CDS 35.0%
TCGCAACGTTGAACTAATTT+GGG + Chr7:17976195-17976214 None:intergenic 35.0%
TTAATCTCCTATGTTAAGGC+TGG - Chr7:17976252-17976271 MsG0780037001.01.T01:CDS 35.0%
TTCGCAACGTTGAACTAATT+TGG + Chr7:17976196-17976215 None:intergenic 35.0%
TTGACTGAGATGAGAGATTT+GGG - Chr7:17976801-17976820 MsG0780037001.01.T01:CDS 35.0%
! AGGAGGCAATTAGAGTATTT+CGG - Chr7:17976088-17976107 MsG0780037001.01.T01:CDS 35.0%
! CCAGCGAAAGTATATTTATC+CGG + Chr7:17976333-17976352 None:intergenic 35.0%
! CGGCAAGTTTATCAGATTTT+GGG - Chr7:17975772-17975791 MsG0780037001.01.T01:CDS 35.0%
! TCGGCAAGTTTATCAGATTT+TGG - Chr7:17975771-17975790 MsG0780037001.01.T01:CDS 35.0%
!!! GATTTCTGAAGGTTTTAAGC+CGG - Chr7:17976311-17976330 MsG0780037001.01.T01:CDS 35.0%
AATCTCCTATGTTAAGGCTG+GGG - Chr7:17976254-17976273 MsG0780037001.01.T01:CDS 40.0%
ATCGATGCACATCTTAGAAG+TGG - Chr7:17976564-17976583 MsG0780037001.01.T01:CDS 40.0%
CATCTGGTCATACAATGTTC+TGG + Chr7:17976604-17976623 None:intergenic 40.0%
CCATATGCTATACTGTCAAG+AGG + Chr7:17976537-17976556 None:intergenic 40.0%
CCGGATAAATATACTTTCGC+TGG - Chr7:17976330-17976349 MsG0780037001.01.T01:CDS 40.0%
CCTCTTGACAGTATAGCATA+TGG - Chr7:17976534-17976553 MsG0780037001.01.T01:CDS 40.0%
GACAGTATAGCATATGGTGT+TGG - Chr7:17976540-17976559 MsG0780037001.01.T01:CDS 40.0%
GCTCATTCGATATCACAGTA+TGG + Chr7:17976449-17976468 None:intergenic 40.0%
GTTGACTGAGATGAGAGATT+TGG - Chr7:17976800-17976819 MsG0780037001.01.T01:CDS 40.0%
TCCAAGGTGATGAGAGATTT+GGG - Chr7:17976834-17976853 MsG0780037001.01.T01:CDS 40.0%
TCGAATGAGCTTAAAAAGGC+TGG - Chr7:17976459-17976478 MsG0780037001.01.T01:CDS 40.0%
TGTAACTCGTGTCTTACGTT+TGG - Chr7:17975978-17975997 MsG0780037001.01.T01:CDS 40.0%
TTCCAAGGTGATGAGAGATT+TGG - Chr7:17976833-17976852 MsG0780037001.01.T01:CDS 40.0%
! ACTTTTAGCATGCAACACCT+TGG + Chr7:17976871-17976890 None:intergenic 40.0%
! AGTGTATCGTGCTGTTATGA+TGG - Chr7:17976401-17976420 MsG0780037001.01.T01:CDS 40.0%
! TAACGCGTCAACTTTTAGTG+CGG - Chr7:17975717-17975736 MsG0780037001.01.T01:CDS 40.0%
!! TGCTGTTATGATGGATCACA+TGG - Chr7:17976410-17976429 MsG0780037001.01.T01:CDS 40.0%
AATTGCCTCCTCATGCATTC+CGG + Chr7:17976079-17976098 None:intergenic 45.0%
ACCCAAATCTCTCATCACCT+TGG + Chr7:17976838-17976857 None:intergenic 45.0%
AGAATCCCCAGCCTTAACAT+AGG + Chr7:17976262-17976281 None:intergenic 45.0%
CCAGACCATTGTTCTTCATC+TGG + Chr7:17976620-17976639 None:intergenic 45.0%
CCAGATGAAGAACAATGGTC+TGG - Chr7:17976617-17976636 MsG0780037001.01.T01:CDS 45.0%
GCACTAAAAGTTGACGCGTT+AGG + Chr7:17975718-17975737 None:intergenic 45.0%
TTCAAAGTCCGGAATGCATG+AGG - Chr7:17976068-17976087 MsG0780037001.01.T01:CDS 45.0%
! AAAGGCTGGTCAGTATGAAC+AGG - Chr7:17976473-17976492 MsG0780037001.01.T01:CDS 45.0%
AAAGTCCGGAATGCATGAGG+AGG - Chr7:17976071-17976090 MsG0780037001.01.T01:CDS 50.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 17975487 17976983 17975487 ID=MsG0780037001.01;Name=MsG0780037001.01
Chr7 mRNA 17975487 17976983 17975487 ID=MsG0780037001.01.T01;Parent=MsG0780037001.01;Name=MsG0780037001.01.T01;_AED=0.34;_eAED=0.34;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|498
Chr7 exon 17975487 17976983 17975487 ID=MsG0780037001.01.T01:exon:3328;Parent=MsG0780037001.01.T01
Chr7 CDS 17975487 17976983 17975487 ID=MsG0780037001.01.T01:cds;Parent=MsG0780037001.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780037001.01.T01

ATGGTTGAATTTCACGGTTTTCAAATTTCGAGTAAAACCTTTGCTTCAAATTTACTTATGGAGTCTCTGTTTAAAGCTTCTCAACCGAAGAACGCTTTTAAGATTTTCGGAGAAACAAGATCGCCTAATTTCCTTACTTTCAACATTGCGCTTTATCACCTTTCTAATATCAATGACATTGTTAATGTTACGTATGTTCTTAGAGAAATGTTGAGGTTGCGATATTGTCCTAACGCGTCAACTTTTAGTGCGGTTTTGAATGCGTTTTGTAAGTTGAATGCGTTTCGGCAAGTTTATCAGATTTTGGGTTTAATGATTGGTTTAGGGATTGAATTGTCTGTTAATGTTTGGACTGTACTGATTCATCAGTTCTGTAAATTGGGTAAGCTTGATGTTGCTGACGATTTGTTCGACAAAATGATTCAAAGTGGTTGTTCTCCGAATTCTGTTACTTATACGCCTTTAATTAAGGCAGTAATGGAATCCAATGATGTAACTCGTGTCTTACGTTTGGAGCAAAAAATGAACTCTGTTGGTATAGTCCCTGATTTAGTGTTTTATAATATGTTAATTGATTGTCTTTCAAAGTCCGGAATGCATGAGGAGGCAATTAGAGTATTTCGGCAAAAAAACTTTAAACCTGATAAGTATACATTTACTTCATTATTGTCTGCAATCTGTCGGTCTACACAGTTTGATCTCTTACCCAAATTAGTTCAACGTTGCGAACGTATAAGTTGTGATTTAGTGTTCTGCAATGCTCTTTTAATCTCCTATGTTAAGGCTGGGGATTCTTCTCGTGCTCTTGAACTCTATGATCGTATGATTTCTGAAGGTTTTAAGCCGGATAAATATACTTTCGCTGGGCTACTAAGTGCACTTTGTGCTGAAAACAGAAATGATGAAGCAGTTAAAGTGTATCGTGCTGTTATGATGGATCACATGGATGATGTTCACATCCATACTGTGATATCGAATGAGCTTAAAAAGGCTGGTCAGTATGAACAGGCTTCCGATGTTTTTATATCCGAAGCAGTTAAGAAATATCCTCTTGACAGTATAGCATATGGTGTTGGCATCGATGCACATCTTAGAAGTGGAAGAACTTTAGAGGCCAGAACATTGTATGACCAGATGAAGAACAATGGTCTGGAACCTAATTTTCAGACATTTAATATGATTCTTTTCAGTTCGCTTGAAGTAAAAGACCTTCAAATGGTTAAACAGTTGCTGAAAGATATGATTGATTCAAGGATCAAGTTGAGTGACAGAAATTTCTTCAACTTGCGTAAATTTCAATGCAATTGGAATTTGTTGACTGAGATGAGAGATTTGGGTTTATTATCTTCCAAGGTGATGAGAGATTTGGGTTTATTATCTTCCAAGGTGTTGCATGCTAAAAGTGTAAAAGCAAATTATAAACATTGTGCTGAAGTTGATACAGAATGCAACTCCAGTTCTGAAGATATGTCAGATGTAGCTGTGTCAGTTTGTTGA
Protein sequence

>MsG0780037001.01.T01

MVEFHGFQISSKTFASNLLMESLFKASQPKNAFKIFGETRSPNFLTFNIALYHLSNINDIVNVTYVLREMLRLRYCPNASTFSAVLNAFCKLNAFRQVYQILGLMIGLGIELSVNVWTVLIHQFCKLGKLDVADDLFDKMIQSGCSPNSVTYTPLIKAVMESNDVTRVLRLEQKMNSVGIVPDLVFYNMLIDCLSKSGMHEEAIRVFRQKNFKPDKYTFTSLLSAICRSTQFDLLPKLVQRCERISCDLVFCNALLISYVKAGDSSRALELYDRMISEGFKPDKYTFAGLLSALCAENRNDEAVKVYRAVMMDHMDDVHIHTVISNELKKAGQYEQASDVFISEAVKKYPLDSIAYGVGIDAHLRSGRTLEARTLYDQMKNNGLEPNFQTFNMILFSSLEVKDLQMVKQLLKDMIDSRIKLSDRNFFNLRKFQCNWNLLTEMRDLGLLSSKVMRDLGLLSSKVLHAKSVKANYKHCAEVDTECNSSSEDMSDVAVSVC*