AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380016420.01

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MsG0380016420.01.T01 AT1G19390 35.935 743 305 25 31 619 31 756 4.17e-113 357
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MsG0380016420.01.T01 AT2G23450 34.932 438 226 10 247 645 243 660 3.46e-61 217
MsG0380016420.01.T01 AT5G66790 32.579 442 225 12 198 593 179 593 4.48e-58 206
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MsG0380016420.01.T01 AT1G25390 35.928 334 160 9 313 600 248 573 5.15e-53 192
MsG0380016420.01.T01 AT1G18390 32.697 419 212 13 228 593 218 619 1.48e-52 192
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MsG0380016420.01.T01 AT3G59420 37.621 311 150 7 337 610 497 800 7.12e-49 184
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MsG0380016420.01.T01 AT5G28680 37.000 300 155 3 336 602 505 803 5.38e-47 178
MsG0380016420.01.T01 AT5G38210 38.328 287 135 7 337 586 345 626 6.01e-47 176
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MsG0380016420.01.T01 AT1G07570 36.513 304 143 7 337 593 53 353 6.21e-47 171
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MsG0380016420.01.T01 AT1G68690 36.593 317 154 6 328 602 353 664 6.68e-46 174
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MsG0380016420.01.T01 AT5G01950 33.887 301 156 3 337 600 611 905 1.39e-45 174
MsG0380016420.01.T01 AT5G01950 33.887 301 156 3 337 600 611 905 1.39e-45 174
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MsG0380016420.01.T01 AT2G28930 33.623 345 169 8 337 636 65 394 3.72e-45 166
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MsG0380016420.01.T01 AT5G37450 35.127 316 158 5 324 599 400 708 1.09e-44 171
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MsG0380016420.01.T01 AT5G37450 35.127 316 158 5 324 599 603 911 4.20e-44 170
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MsG0380016420.01.T01 AT5G24010 35.644 303 159 4 341 610 478 777 6.08e-44 169
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MsG0380016420.01.T01 AT5G58940 35.495 293 149 5 339 593 134 424 7.49e-44 164
MsG0380016420.01.T01 AT5G58940 35.495 293 149 5 339 593 134 424 7.49e-44 164
MsG0380016420.01.T01 AT1G11340 32.464 345 186 6 337 645 500 833 7.91e-44 169
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MsG0380016420.01.T01 AT3G57750 33.099 284 156 4 306 557 3 284 8.95e-44 160
MsG0380016420.01.T01 AT3G57750 33.099 284 156 4 306 557 3 284 8.95e-44 160
MsG0380016420.01.T01 AT5G49760 35.359 362 188 7 300 625 580 931 9.49e-44 169
MsG0380016420.01.T01 AT5G48740 34.706 340 177 10 288 591 548 878 1.12e-43 169
MsG0380016420.01.T01 AT1G52290 32.237 304 167 5 333 598 123 425 1.37e-43 164
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MsG0380016420.01.T01 AT5G18500 36.140 285 149 3 340 591 154 438 3.01e-43 162
MsG0380016420.01.T01 AT5G18500 36.140 285 149 3 340 591 154 438 3.01e-43 162
MsG0380016420.01.T01 AT5G18500 36.140 285 149 3 340 591 154 438 3.01e-43 162
MsG0380016420.01.T01 AT5G18500 36.140 285 149 3 340 591 154 438 3.01e-43 162
MsG0380016420.01.T01 AT3G24790 35.616 292 148 5 337 590 32 321 3.21e-43 159
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MsG0380016420.01.T01 AT1G23540 36.207 290 144 5 340 591 359 645 5.31e-43 165
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MsG0380016420.01.T01 AT1G61490 29.398 415 225 11 269 645 270 654 6.02e-43 164
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MsG0380016420.01.T01 AT5G18610 33.824 340 186 6 329 629 59 398 8.13e-43 162
MsG0380016420.01.T01 AT5G18610 33.824 340 186 6 329 629 59 398 8.13e-43 162
MsG0380016420.01.T01 AT5G56790 35.948 306 155 6 322 592 363 662 8.19e-43 164
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MsG0380016420.01.T01 AT1G09440 36.364 286 147 5 340 591 145 429 9.78e-43 160
MsG0380016420.01.T01 AT5G61350 36.242 298 153 3 338 598 511 808 1.00e-42 165
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MsG0380016420.01.T01 AT1G61490 29.398 415 225 11 269 645 420 804 1.27e-42 165
MsG0380016420.01.T01 AT1G61490 29.398 415 225 11 269 645 420 804 1.27e-42 165
MsG0380016420.01.T01 AT1G61490 29.398 415 225 11 269 645 420 804 1.27e-42 165
MsG0380016420.01.T01 AT3G58690 31.956 363 200 7 268 590 8 363 1.34e-42 159
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MsG0380016420.01.T01 AT3G02810 34.932 292 152 4 337 590 49 340 1.73e-42 162
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MsG0380016420.01.T01 AT2G37050 33.333 306 167 5 340 610 593 896 2.84e-42 164
MsG0380016420.01.T01 AT2G42960 36.713 286 146 5 340 591 171 455 2.94e-42 160
MsG0380016420.01.T01 AT2G42960 36.713 286 146 5 340 591 171 455 2.94e-42 160
MsG0380016420.01.T01 AT2G42960 36.713 286 146 5 340 591 171 455 2.94e-42 160
MsG0380016420.01.T01 AT2G42960 36.713 286 146 5 340 591 171 455 2.94e-42 160
MsG0380016420.01.T01 AT1G51850 31.282 390 214 9 258 603 461 840 2.95e-42 164
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MsG0380016420.01.T01 AT1G24650 37.676 284 137 7 339 583 534 816 3.57e-42 164
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MsG0380016420.01.T01 AT5G62230 32.565 347 176 7 278 587 538 863 3.72e-42 164
MsG0380016420.01.T01 AT2G28970 32.903 310 169 5 328 602 420 725 3.95e-42 163
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MsG0380016420.01.T01 AT1G70530 35.336 283 140 5 269 520 252 522 5.38e-42 160
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MsG0380016420.01.T01 AT1G56720 36.364 286 147 5 340 591 167 451 6.04e-42 159
MsG0380016420.01.T01 AT1G56720 36.364 286 147 5 340 591 167 451 6.04e-42 159
MsG0380016420.01.T01 AT2G26330 30.000 430 235 7 255 640 550 957 6.24e-42 163
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MsG0380016420.01.T01 AT1G77280 31.889 323 182 5 338 624 390 710 7.27e-42 162
MsG0380016420.01.T01 AT1G55200 35.593 295 154 5 338 598 365 657 8.51e-42 161
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MsG0380016420.01.T01 AT1G55200 35.593 295 154 5 338 598 365 657 8.51e-42 161
MsG0380016420.01.T01 AT1G55200 35.593 295 154 5 338 598 365 657 8.51e-42 161
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MsG0380016420.01.T01 AT2G39660 34.091 308 153 7 333 593 48 352 3.61e-41 154
MsG0380016420.01.T01 AT5G02800 34.021 291 156 4 336 590 57 347 3.67e-41 154
MsG0380016420.01.T01 AT2G28590 42.466 219 92 3 337 521 83 301 4.07e-41 152
MsG0380016420.01.T01 AT2G28990 34.007 297 157 5 340 602 567 858 4.11e-41 160
MsG0380016420.01.T01 AT2G28990 34.007 297 157 5 340 602 567 858 4.11e-41 160
MsG0380016420.01.T01 AT3G13690 36.644 292 143 5 338 592 397 683 5.06e-41 160
MsG0380016420.01.T01 AT3G13690 36.644 292 143 5 338 592 397 683 5.06e-41 160
MsG0380016420.01.T01 AT3G13690 36.644 292 143 5 338 592 397 683 5.06e-41 160
MsG0380016420.01.T01 AT1G52290 37.815 238 115 3 333 538 123 359 5.71e-41 154
MsG0380016420.01.T01 AT1G61480 30.435 345 188 6 337 645 481 809 7.45e-41 159
MsG0380016420.01.T01 AT2G01820 35.640 289 144 6 339 586 572 859 7.46e-41 160
MsG0380016420.01.T01 AT1G07650 31.421 401 213 10 274 635 403 780 7.83e-41 159
MsG0380016420.01.T01 AT5G45780 34.286 315 161 9 337 614 242 547 9.28e-41 157
MsG0380016420.01.T01 AT2G25220 30.854 363 202 6 284 603 21 377 1.22e-40 153
MsG0380016420.01.T01 AT5G13160 33.762 311 170 5 316 590 50 360 1.26e-40 154
MsG0380016420.01.T01 AT1G61420 29.565 345 191 6 337 645 329 657 1.28e-40 158
MsG0380016420.01.T01 AT1G49730 32.534 292 152 6 333 586 340 624 1.31e-40 158
MsG0380016420.01.T01 AT1G61420 29.565 345 191 6 337 645 331 659 1.32e-40 157
MsG0380016420.01.T01 AT5G45780 34.286 315 161 9 337 614 285 590 1.34e-40 157
MsG0380016420.01.T01 AT1G07650 31.017 403 212 10 274 635 616 993 1.39e-40 159
MsG0380016420.01.T01 AT1G07650 31.421 401 213 10 274 635 590 967 1.52e-40 159
MsG0380016420.01.T01 AT4G34440 34.459 296 154 6 340 598 300 592 1.58e-40 157
MsG0380016420.01.T01 AT4G34440 34.459 296 154 6 340 598 300 592 1.58e-40 157
MsG0380016420.01.T01 AT1G69790 33.968 315 155 8 334 602 66 373 1.59e-40 152
MsG0380016420.01.T01 AT1G69790 33.968 315 155 8 334 602 55 362 1.83e-40 152
MsG0380016420.01.T01 AT5G38990 33.861 316 165 6 334 608 507 819 1.86e-40 159
MsG0380016420.01.T01 AT5G40380 41.509 212 93 1 340 520 303 514 1.86e-40 156
MsG0380016420.01.T01 AT1G07650 31.017 403 212 10 274 635 622 999 1.88e-40 159
MsG0380016420.01.T01 AT3G16030 32.313 294 158 4 337 592 512 802 1.89e-40 159
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MsG0380016420.01.T01 AT3G17420 33.564 289 151 6 340 591 142 426 2.22e-40 154
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MsG0380016420.01.T01 AT1G11280 30.814 344 188 6 284 586 440 774 2.57e-40 158
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MsG0380016420.01.T01 AT1G11300 29.765 383 209 8 303 645 458 820 2.90e-40 158
MsG0380016420.01.T01 AT5G02290 32.039 309 160 7 337 598 53 358 3.00e-40 152
MsG0380016420.01.T01 AT5G02290 32.039 309 160 7 337 598 53 358 3.00e-40 152
MsG0380016420.01.T01 AT3G16030 32.313 294 158 4 337 592 533 823 3.08e-40 158
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MsG0380016420.01.T01 AT1G61500 30.145 345 189 6 337 645 481 809 3.57e-40 157
MsG0380016420.01.T01 AT1G61420 29.565 345 191 6 337 645 481 809 4.13e-40 157
MsG0380016420.01.T01 AT1G61420 29.565 345 191 6 337 645 481 809 4.13e-40 157
MsG0380016420.01.T01 AT1G61500 30.145 345 189 6 337 645 458 786 4.17e-40 157
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MsG0380016420.01.T01 AT1G11280 29.532 342 185 6 284 587 450 773 1.20e-39 156
MsG0380016420.01.T01 AT1G53420 33.438 320 177 6 317 601 588 906 1.21e-39 156
MsG0380016420.01.T01 AT1G11410 32.667 300 165 4 325 590 497 793 1.22e-39 156
MsG0380016420.01.T01 AT1G11410 32.667 300 165 4 325 590 504 800 1.48e-39 156
MsG0380016420.01.T01 AT1G51805 31.218 394 203 11 260 603 460 835 1.51e-39 156
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MsG0380016420.01.T01 AT2G30740 32.215 298 162 4 337 594 56 353 1.63e-39 149
MsG0380016420.01.T01 AT2G30740 32.215 298 162 4 337 594 56 353 1.63e-39 149
MsG0380016420.01.T01 AT2G30740 32.215 298 162 4 337 594 56 353 1.63e-39 149
MsG0380016420.01.T01 AT2G30740 32.215 298 162 4 337 594 56 353 1.63e-39 149
MsG0380016420.01.T01 AT2G30740 32.215 298 162 4 337 594 56 353 1.63e-39 149
MsG0380016420.01.T01 AT2G30740 32.215 298 162 4 337 594 56 353 1.63e-39 149
MsG0380016420.01.T01 AT2G30740 32.215 298 162 4 337 594 56 353 1.63e-39 149
MsG0380016420.01.T01 AT2G30740 32.215 298 162 4 337 594 56 353 1.63e-39 149
MsG0380016420.01.T01 AT2G30740 32.215 298 162 4 337 594 56 353 1.63e-39 149
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MsG0380016420.01.T01 AT2G30740 32.215 298 162 4 337 594 56 353 1.63e-39 149
MsG0380016420.01.T01 AT2G30740 32.215 298 162 4 337 594 56 353 1.63e-39 149
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MsG0380016420.01.T01 AT2G30740 32.215 298 162 4 337 594 56 353 1.63e-39 149
MsG0380016420.01.T01 AT2G30740 32.215 298 162 4 337 594 56 353 1.63e-39 149
MsG0380016420.01.T01 AT1G51805 31.218 394 203 11 260 603 484 859 1.69e-39 156
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MsG0380016420.01.T01 AT1G11410 32.667 300 165 4 325 590 473 769 1.79e-39 155
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MsG0380016420.01.T01 AT1G34210 35.254 295 149 7 337 592 290 581 2.78e-39 153
MsG0380016420.01.T01 AT3G01300 33.333 294 150 6 337 586 121 412 2.93e-39 151
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MsG0380016420.01.T01 AT2G18470 34.237 295 144 6 340 592 272 558 3.32e-39 153
MsG0380016420.01.T01 AT5G03140 33.553 304 152 8 333 592 352 649 3.43e-39 154
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MsG0380016420.01.T01 AT1G51830 30.964 394 207 12 258 603 299 675 3.82e-39 154
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MsG0380016420.01.T01 AT5G10290 34.114 299 147 7 337 592 275 566 3.86e-39 153
MsG0380016420.01.T01 AT1G11330 27.654 405 239 7 284 645 449 842 4.00e-39 154
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MsG0380016420.01.T01 AT1G61430 31.594 345 185 7 337 645 451 780 4.84e-39 154
MsG0380016420.01.T01 AT1G11303 30.699 329 184 5 303 595 458 778 6.19e-39 154
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MsG0380016420.01.T01 AT1G29730 34.615 312 165 4 323 598 611 919 9.97e-39 154
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MsG0380016420.01.T01 AT2G02800 32.515 326 170 7 333 612 64 385 1.08e-38 148
MsG0380016420.01.T01 AT4G01330 33.564 289 157 5 338 592 148 435 1.08e-38 149
MsG0380016420.01.T01 AT2G02220 37.241 290 147 5 338 593 720 1008 1.08e-38 154
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MsG0380016420.01.T01 AT1G61360 35.565 239 122 1 337 543 402 640 1.23e-38 152
MsG0380016420.01.T01 AT1G61360 35.565 239 122 1 337 543 402 640 1.23e-38 152
MsG0380016420.01.T01 AT1G61360 35.565 239 122 1 337 543 483 721 1.52e-38 153
MsG0380016420.01.T01 AT4G13190 38.494 239 112 4 337 541 56 293 1.56e-38 144
MsG0380016420.01.T01 AT1G11050 34.783 345 161 9 340 622 283 625 1.56e-38 151
MsG0380016420.01.T01 AT1G70520 34.035 285 150 3 340 586 313 597 1.73e-38 151
MsG0380016420.01.T01 AT5G48940 31.629 313 161 6 340 607 776 1080 1.82e-38 153
MsG0380016420.01.T01 AT5G10530 31.487 343 185 8 283 586 272 603 1.85e-38 151
MsG0380016420.01.T01 AT5G59670 33.106 293 159 4 338 597 552 840 1.87e-38 152
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MsG0380016420.01.T01 AT2G28960 33.223 301 160 5 337 602 428 722 2.06e-38 152
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MsG0380016420.01.T01 AT1G06700 31.410 312 170 5 327 594 39 350 2.16e-38 146
MsG0380016420.01.T01 AT2G04300 33.784 296 159 4 340 602 531 822 2.19e-38 152
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MsG0380016420.01.T01 AT3G23750 34.471 293 148 7 330 583 560 847 7.15e-37 148
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MsG0380016420.01.T01 AT1G48210 30.201 298 166 5 337 594 53 348 7.18e-37 142
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MsG0380016420.01.T01 AT4G35030 30.420 286 160 4 338 586 90 373 1.51e-36 142
MsG0380016420.01.T01 AT4G35030 30.420 286 160 4 338 586 90 373 1.51e-36 142
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MsG0380016420.01.T01 AT1G07570 38.298 235 105 6 396 593 6 237 1.70e-36 139
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MsG0380016420.01.T01 AT3G46370 35.052 291 152 4 340 597 477 763 1.74e-36 146
MsG0380016420.01.T01 AT1G67520 30.612 294 163 4 337 592 273 563 1.78e-36 145
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MsG0380016420.01.T01 AT2G23950 33.106 293 153 7 337 592 284 570 1.89e-36 145
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MsG0380016420.01.T01 AT1G78940 31.879 298 155 5 340 601 436 721 1.96e-36 146
MsG0380016420.01.T01 AT1G49270 34.708 291 149 5 340 592 324 611 1.98e-36 145
MsG0380016420.01.T01 AT1G67520 30.612 294 163 4 337 592 438 728 2.35e-36 146
MsG0380016420.01.T01 AT4G31230 32.168 286 144 5 340 588 356 628 2.36e-36 145
MsG0380016420.01.T01 AT1G78940 31.879 298 155 5 340 601 436 721 2.65e-36 145
MsG0380016420.01.T01 AT4G31230 32.168 286 144 5 340 588 455 727 2.73e-36 145
MsG0380016420.01.T01 AT5G11020 28.191 376 215 8 271 603 23 386 2.77e-36 141
MsG0380016420.01.T01 AT2G39180 36.000 275 155 7 337 596 504 772 2.80e-36 145
MsG0380016420.01.T01 AT1G16670 32.203 295 157 5 337 592 26 316 2.84e-36 140
MsG0380016420.01.T01 AT1G51880 34.333 300 151 8 341 603 557 847 2.89e-36 146
MsG0380016420.01.T01 AT1G67520 30.612 294 163 4 337 592 488 778 2.94e-36 145
MsG0380016420.01.T01 AT5G11020 28.191 376 215 8 271 603 19 382 2.97e-36 140
MsG0380016420.01.T01 AT1G51880 34.333 300 151 8 341 603 575 865 3.04e-36 146
MsG0380016420.01.T01 AT5G65240 33.898 295 153 6 337 592 269 560 3.07e-36 144
MsG0380016420.01.T01 AT3G20200 34.247 292 144 6 340 595 441 720 3.07e-36 145
MsG0380016420.01.T01 AT1G67520 30.612 294 163 4 337 592 481 771 3.08e-36 145
MsG0380016420.01.T01 AT1G51880 34.333 300 151 8 341 603 583 873 3.19e-36 146
MsG0380016420.01.T01 AT3G20200 34.247 292 144 6 340 595 441 720 3.56e-36 145
MsG0380016420.01.T01 AT3G20200 34.247 292 144 6 340 595 441 720 3.56e-36 145
MsG0380016420.01.T01 AT1G78980 33.750 320 170 7 328 611 380 693 3.74e-36 145
MsG0380016420.01.T01 AT4G21380 28.852 357 189 7 337 645 511 850 3.84e-36 145
MsG0380016420.01.T01 AT5G65700 32.660 297 162 4 350 612 692 984 3.85e-36 145
MsG0380016420.01.T01 AT5G65700 32.660 297 162 4 350 612 692 984 3.85e-36 145
MsG0380016420.01.T01 AT3G20200 34.247 292 144 6 340 595 441 720 3.86e-36 145
MsG0380016420.01.T01 AT1G78530 31.742 356 188 8 275 593 10 347 4.09e-36 139
MsG0380016420.01.T01 AT5G65240 33.898 295 153 6 337 592 269 560 4.12e-36 144
MsG0380016420.01.T01 AT4G11480 33.688 282 151 4 340 586 309 589 4.24e-36 144
MsG0380016420.01.T01 AT4G11480 33.688 282 151 4 340 586 312 592 4.29e-36 144
MsG0380016420.01.T01 AT4G30520 31.339 351 174 10 285 592 248 574 4.40e-36 144
MsG0380016420.01.T01 AT5G11020 28.191 376 215 8 271 603 57 420 4.41e-36 141
MsG0380016420.01.T01 AT5G63710 30.928 291 166 4 337 592 239 529 4.64e-36 143
MsG0380016420.01.T01 AT5G63710 30.928 291 166 4 337 592 239 529 4.64e-36 143
MsG0380016420.01.T01 AT1G66460 28.804 368 208 10 320 643 100 457 5.25e-36 141
MsG0380016420.01.T01 AT5G63710 30.928 291 166 4 337 592 274 564 5.65e-36 144
MsG0380016420.01.T01 AT5G63710 30.928 291 166 4 337 592 275 565 5.97e-36 144
MsG0380016420.01.T01 AT3G09010 30.175 285 167 2 334 586 28 312 6.04e-36 140
MsG0380016420.01.T01 AT1G53440 32.990 291 152 6 340 592 655 940 6.28e-36 145
MsG0380016420.01.T01 AT5G60270 31.399 293 165 4 340 598 329 619 6.70e-36 144
MsG0380016420.01.T01 AT1G51860 33.866 313 159 8 341 617 575 875 6.84e-36 145
MsG0380016420.01.T01 AT1G51860 33.667 300 155 7 340 603 430 721 7.75e-36 144
MsG0380016420.01.T01 AT1G70740 33.110 299 152 6 338 590 36 332 7.93e-36 140
MsG0380016420.01.T01 AT1G01540 36.161 224 109 4 338 528 140 362 8.03e-36 139
MsG0380016420.01.T01 AT2G07180 34.667 300 149 8 335 591 73 368 8.04e-36 140
MsG0380016420.01.T01 AT2G07180 34.667 300 149 8 335 591 73 368 8.04e-36 140
MsG0380016420.01.T01 AT4G03230 28.079 406 234 7 237 590 397 796 8.18e-36 144
MsG0380016420.01.T01 AT4G03230 28.079 406 234 7 237 590 462 861 8.68e-36 144
MsG0380016420.01.T01 AT4G03230 28.079 406 234 7 237 590 462 861 8.68e-36 144
MsG0380016420.01.T01 AT4G03230 28.079 406 234 7 237 590 490 889 8.94e-36 144
MsG0380016420.01.T01 AT3G19700 29.263 434 218 13 217 593 565 966 9.34e-36 144
MsG0380016420.01.T01 AT4G03230 28.079 406 234 7 237 590 405 804 9.43e-36 144
MsG0380016420.01.T01 AT2G14510 34.035 285 148 6 340 590 553 831 9.79e-36 144
MsG0380016420.01.T01 AT4G32000 29.577 355 200 7 284 603 71 410 1.03e-35 140
MsG0380016420.01.T01 AT2G29000 33.779 299 157 5 340 603 555 847 1.05e-35 144
MsG0380016420.01.T01 AT4G03230 28.079 406 234 7 237 590 562 961 1.08e-35 144
MsG0380016420.01.T01 AT4G03230 28.079 406 234 7 237 590 562 961 1.08e-35 144
MsG0380016420.01.T01 AT1G26970 33.225 307 150 9 333 591 64 363 1.10e-35 139
MsG0380016420.01.T01 AT4G32000 29.577 355 199 8 284 603 71 409 1.22e-35 139
MsG0380016420.01.T01 AT1G66460 28.804 368 208 10 320 643 127 484 1.23e-35 141
MsG0380016420.01.T01 AT4G21390 35.088 228 116 1 333 528 510 737 1.24e-35 144
MsG0380016420.01.T01 AT5G57670 29.773 309 168 7 321 586 228 530 1.25e-35 142
MsG0380016420.01.T01 AT2G14510 34.035 285 148 6 340 590 561 839 1.26e-35 144
MsG0380016420.01.T01 AT1G31420 32.803 314 172 4 320 596 268 579 1.39e-35 142
MsG0380016420.01.T01 AT2G47060 32.660 297 160 4 337 594 58 353 1.42e-35 138
MsG0380016420.01.T01 AT2G47060 32.660 297 160 4 337 594 58 353 1.42e-35 138

Find 150 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 291 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTAAACACCATTCTGAAATT+AGG 0.112762 3:-83197535 None:intergenic
CATCACTCTTCTCTGTTAAT+TGG 0.176525 3:-83197328 None:intergenic
TAATTTCAGAATGGTGTTTA+AGG 0.196448 3:+83197537 MsG0380016420.01.T01:CDS
CTGGTTTGGGTCATTGATTT+TGG 0.198339 3:-83196442 None:intergenic
TCGGAATGTGGTAAAGCTTT+TGG 0.224180 3:+83196512 MsG0380016420.01.T01:CDS
TCCCATTGCCACTTCTTTCA+TGG 0.231930 3:-83197582 None:intergenic
ACCATTGAGGAAAAGATTTC+AGG 0.259282 3:+83194488 MsG0380016420.01.T01:CDS
GGAGATTGTGTTAGAGAAAA+TGG 0.262773 3:+83197689 MsG0380016420.01.T01:CDS
TAAACACCATTCTGAAATTA+GGG 0.264717 3:-83197534 None:intergenic
AGGTCGGTTACTTCATATTC+TGG 0.281383 3:+83197466 MsG0380016420.01.T01:CDS
CACTATTGAGGAGTTAAATA+AGG 0.282531 3:+83196317 MsG0380016420.01.T01:CDS
TGGCTTGTGTGGAAGTATTC+AGG 0.292810 3:-83197308 None:intergenic
AAGAGTGATGTTTATAGCTT+TGG 0.296008 3:+83197341 MsG0380016420.01.T01:CDS
ATCAAAATTCCCTTCCCATT+TGG 0.308769 3:+83194273 MsG0380016420.01.T01:CDS
TTTGAGCTTGCTCGCACATT+TGG 0.311563 3:-83194882 None:intergenic
GCAGATGCTTGGATGGATAT+CGG 0.318457 3:+83194983 MsG0380016420.01.T01:CDS
CCACATTCCGATGGTTGATC+TGG 0.319458 3:-83196500 None:intergenic
ACAATCTCCAACATTGATAA+TGG 0.341903 3:-83197675 None:intergenic
AGAGTGATGTTTATAGCTTT+GGG 0.353931 3:+83197342 MsG0380016420.01.T01:CDS
CGTAATCTGGTTCGTGCTAT+AGG 0.359829 3:-83197729 None:intergenic
GTTGTCTAGGGAGCAATCTT+TGG 0.362639 3:-83194301 None:intergenic
CATTGATGAATGGCTCAATC+TGG 0.371090 3:-83196461 None:intergenic
AGCTACTGAAGAGCAGCGTT+TGG 0.374103 3:+83197619 MsG0380016420.01.T01:CDS
AATTTCAGAATGGTGTTTAA+GGG 0.377814 3:+83197538 MsG0380016420.01.T01:CDS
TCCATGCAAGCTTTAAAGAT+TGG 0.383306 3:-83196620 None:intergenic
AATAAATTCATAAACAAGTA+AGG 0.390606 3:-83196559 None:intergenic
GAAAGAGTTTCCTGTGTTGT+TGG 0.390740 3:+83194843 MsG0380016420.01.T01:CDS
CAGATGCTTGGATGGATATC+GGG 0.391618 3:+83194984 MsG0380016420.01.T01:CDS
TTCACATCTCTATGTATGAT+TGG 0.393983 3:-83196711 None:intergenic
ATGAATGGCTCAATCTGGTT+TGG 0.398594 3:-83196456 None:intergenic
CACTCCGACTTCAGAAATAT+AGG 0.402077 3:-83194719 None:intergenic
CAATCTTTGGTGATTCCAAA+TGG 0.404944 3:-83194288 None:intergenic
ACTCTAGTGAAGGGGACATT+GGG 0.407937 3:+83197275 MsG0380016420.01.T01:CDS
ATTGCCACTTCTTTCATGGT+TGG 0.408118 3:-83197578 None:intergenic
CTTTCCTTCATCGAAGTTGT+TGG 0.418373 3:-83196343 None:intergenic
TCTTTCAAGTTATGCATGTA+AGG 0.421975 3:+83194909 MsG0380016420.01.T01:CDS
TCTGGACAACAATATTTATG+AGG 0.425372 3:+83197484 MsG0380016420.01.T01:CDS
CAATCGTTGACATCGTAATC+TGG 0.425424 3:-83197742 None:intergenic
GCAGTTGGCTGTGGGACAAT+TGG 0.430000 3:+83194555 MsG0380016420.01.T01:CDS
CCACACTTTGCTGTACAGTT+TGG 0.438268 3:-83194246 None:intergenic
CTTGTAGCAATTGATTCTAA+AGG 0.448912 3:+83194582 MsG0380016420.01.T01:CDS
CACTCTAGTGAAGGGGACAT+TGG 0.451206 3:+83197274 MsG0380016420.01.T01:CDS
AGTTAAAATCTTCACTATTG+AGG 0.451797 3:+83196305 MsG0380016420.01.T01:CDS
TGAATGGCTCAATCTGGTTT+GGG 0.453356 3:-83196455 None:intergenic
GCTACTGAAGAGCAGCGTTT+GGG 0.453459 3:+83197620 MsG0380016420.01.T01:CDS
TGATGAGGAAAGTGTTGTCT+AGG 0.462303 3:-83194314 None:intergenic
AAAAGAAACTGCTGGAGTCC+TGG 0.464775 3:+83196662 MsG0380016420.01.T01:CDS
TGGTTACCTTTGCAGATGCT+TGG 0.474410 3:+83194972 MsG0380016420.01.T01:CDS
AAAGCAGGGACCGACAAATC+TGG 0.479678 3:+83194952 MsG0380016420.01.T01:CDS
ACCAATCTTTAAAGCTTGCA+TGG 0.480470 3:+83196619 MsG0380016420.01.T01:CDS
GCATAGCAATCACTGGCTAC+TGG 0.483441 3:-83194453 None:intergenic
AGTTTCCTGTGTTGTTGGAC+TGG 0.487070 3:+83194848 MsG0380016420.01.T01:CDS
TTTGTTTCTTCAGTGAAAGA+AGG 0.488324 3:+83197446 MsG0380016420.01.T01:CDS
GGTGTCAGCGTAAGCCTCCT+AGG 0.489387 3:+83196144 MsG0380016420.01.T01:CDS
ACGGTGAACTGCACGTTGGA+TGG 0.495476 3:+83194430 MsG0380016420.01.T01:CDS
GTTTCCATTTGTGTATGTCC+AGG 0.497122 3:+83196123 MsG0380016420.01.T01:CDS
TTCAAAACAGTTGCTTCTCA+TGG 0.503732 3:+83194173 MsG0380016420.01.T01:CDS
GCAAGATTTCTATCAACCTC+AGG 0.504739 3:-83197416 None:intergenic
AAAAGTAAATGTTACAAAGC+AGG 0.505881 3:+83194937 MsG0380016420.01.T01:CDS
ATGATCATAAACAGTACCAT+TGG 0.505994 3:-83196583 None:intergenic
AAGTTGGTAGCAGTTGGCTG+TGG 0.506779 3:+83194546 MsG0380016420.01.T01:CDS
GACACCTGGACATACACAAA+TGG 0.509606 3:-83196127 None:intergenic
CAGCGGAATGTAAGTATGCC+AGG 0.515392 3:-83196680 None:intergenic
GCACCATCCATTATCAATGT+TGG 0.517696 3:+83197668 MsG0380016420.01.T01:CDS
AGAATAGCAAAAGAAACTGC+TGG 0.521896 3:+83196654 MsG0380016420.01.T01:CDS
TCTCTGTTAATTGGCTTGTG+TGG 0.522624 3:-83197319 None:intergenic
GTTTATGAATTTATTCCCAA+TGG 0.522682 3:+83196567 MsG0380016420.01.T01:CDS
TACCTTTGCAGATGCTTGGA+TGG 0.523516 3:+83194976 MsG0380016420.01.T01:CDS
GGAAAATATTGAGCATCTAA+AGG 0.523667 3:+83197505 MsG0380016420.01.T01:CDS
CACATTCCGATGGTTGATCT+GGG 0.525197 3:-83196499 None:intergenic
TGATCATAAACAGTACCATT+GGG 0.527063 3:-83196582 None:intergenic
ACCATGAAAGAAGTGGCAAT+GGG 0.527246 3:+83197581 MsG0380016420.01.T01:CDS
TATTCATACCTTGGCAACCA+TGG 0.531035 3:-83195023 None:intergenic
AATCTTTGGTGATTCCAAAT+GGG 0.533514 3:-83194287 None:intergenic
ACAATCACTTCATTGATGAA+TGG 0.535294 3:-83196471 None:intergenic
AGAAAGCGCTATCTGTTGGC+AGG 0.536340 3:+83197393 MsG0380016420.01.T01:CDS
TACCTCATCCATGGTTGCCA+AGG 0.537362 3:+83195015 MsG0380016420.01.T01:CDS
TACCTTGGCAACCATGGATG+AGG 0.538641 3:-83195017 None:intergenic
GGAAAGAAAGCGCTATCTGT+TGG 0.540418 3:+83197389 MsG0380016420.01.T01:CDS
GCAACCAACAACTTCGATGA+AGG 0.540604 3:+83196339 MsG0380016420.01.T01:CDS
AAGTTTCCCTAATTTCAGAA+TGG 0.542706 3:+83197528 MsG0380016420.01.T01:CDS
CTTTCTTCTTCAACTTGCCG+AGG 0.545879 3:-83194825 None:intergenic
GCAAAGGTAACCAGATTTGT+CGG 0.547106 3:-83194962 None:intergenic
AGGAGGCTTACGCTGACACC+TGG 0.551597 3:-83196141 None:intergenic
ATCCTAGGCGAAGGTGGTCA+AGG 0.551621 3:+83196366 MsG0380016420.01.T01:CDS
ATGGATTGAAGTCATATACT+AGG 0.551919 3:-83194750 None:intergenic
AAAGTAAATGTTACAAAGCA+GGG 0.552213 3:+83194938 MsG0380016420.01.T01:CDS
TTTATGCGCATTGGGCATTG+AGG 0.556049 3:+83196184 MsG0380016420.01.T01:CDS
TTTGGTGATTCCAAATGGGA+AGG 0.557833 3:-83194283 None:intergenic
CAAAACAAGTTGGTAGCAGT+TGG 0.560629 3:+83194540 MsG0380016420.01.T01:CDS
GTAACCTATATTTCTGAAGT+CGG 0.563403 3:+83194715 MsG0380016420.01.T01:CDS
GTCCTAGCAGAGCTACTGAC+AGG 0.564525 3:+83197368 MsG0380016420.01.T01:CDS
AGCTTCCCACAAGTACTCCT+AGG 0.565121 3:-83196161 None:intergenic
TTCCTTGACCACCTTCGCCT+AGG 0.567949 3:-83196368 None:intergenic
TGGCAACCATGGATGAGGTA+AGG 0.569264 3:-83195012 None:intergenic
AACCATGAAAGAAGTGGCAA+TGG 0.570272 3:+83197580 MsG0380016420.01.T01:CDS
TTCCTGTCAGTAGCTCTGCT+AGG 0.571501 3:-83197370 None:intergenic
CAACAACAGCTAGCGAAGCA+TGG 0.573647 3:+83196267 MsG0380016420.01.T01:CDS
TCAGATAACCACTCTAGTGA+AGG 0.575329 3:+83197265 MsG0380016420.01.T01:intron
TGTTGTTGGACTGGAAAGTA+AGG 0.576880 3:+83194857 MsG0380016420.01.T01:CDS
TGCTTTCCCAGATCAACCAT+CGG 0.578130 3:+83196493 MsG0380016420.01.T01:CDS
AACAGCTAGCGAAGCATGGA+GGG 0.579900 3:+83196271 MsG0380016420.01.T01:CDS
TTCGATGAAGGAAAGATCCT+AGG 0.580070 3:+83196351 MsG0380016420.01.T01:CDS
GTGTTTAAGGGTGAAGAGCG+AGG 0.585232 3:+83197550 MsG0380016420.01.T01:CDS
GGAAAGATCCTAGGCGAAGG+TGG 0.586347 3:+83196360 MsG0380016420.01.T01:CDS
AAAGGAAATACATCCACCAC+TGG 0.586799 3:+83194600 MsG0380016420.01.T01:CDS
ATAAATTCATAAACAAGTAA+GGG 0.587456 3:-83196558 None:intergenic
TCTCCAACATTGATAATGGA+TGG 0.587706 3:-83197671 None:intergenic
TTGGTGATTCCAAATGGGAA+GGG 0.588676 3:-83194282 None:intergenic
TTTCTTCAGTGAAAGAAGGT+CGG 0.591196 3:+83197450 MsG0380016420.01.T01:CDS
CAGATAACCACTCTAGTGAA+GGG 0.591552 3:+83197266 MsG0380016420.01.T01:intron
AGCAAGTTAAGCCATGGCTG+TGG 0.592486 3:+83194146 None:intergenic
GGAAATCCTTACCTCATCCA+TGG 0.593147 3:+83195006 MsG0380016420.01.T01:CDS
AAAACAGTTGCTTCTCATGG+TGG 0.595893 3:+83194176 MsG0380016420.01.T01:CDS
GATGAGGAAAGTGTTGTCTA+GGG 0.599183 3:-83194313 None:intergenic
CAGATTACGATGTCAACGAT+TGG 0.599538 3:+83197743 MsG0380016420.01.T01:CDS
GAGTGATGTTTATAGCTTTG+GGG 0.600472 3:+83197343 MsG0380016420.01.T01:CDS
AGAAGTGGCAATGGGACTAG+AGG 0.602523 3:+83197589 MsG0380016420.01.T01:CDS
GTTCTAAATATCTCACTCAA+CGG 0.605914 3:+83194411 MsG0380016420.01.T01:CDS
ACTGAAGAGCAGCGTTTGGG+AGG 0.608885 3:+83197623 MsG0380016420.01.T01:CDS
AGCTTTGCAATCACAGACCT+CGG 0.609169 3:+83194808 MsG0380016420.01.T01:CDS
GTCTGTGATTGCAAAGCTGT+AGG 0.609681 3:-83194803 None:intergenic
CAATGTCCCCTTCACTAGAG+TGG 0.613982 3:-83197273 None:intergenic
AGCCTCCTAGGAGTACTTGT+GGG 0.618695 3:+83196156 MsG0380016420.01.T01:CDS
AAAGCTTTACCACATTCCGA+TGG 0.621964 3:-83196509 None:intergenic
AAGCCTCCTAGGAGTACTTG+TGG 0.623093 3:+83196155 MsG0380016420.01.T01:CDS
TGACAATCTGTCTTCAGAAG+AGG 0.624210 3:+83197646 MsG0380016420.01.T01:CDS
ACTTTCCAGTCCAACAACAC+AGG 0.625807 3:-83194853 None:intergenic
GAAGTGGCAATGGGACTAGA+GGG 0.626292 3:+83197590 MsG0380016420.01.T01:CDS
CTCAACGGTGAACTGCACGT+TGG 0.629704 3:+83194426 MsG0380016420.01.T01:CDS
CCAGATCAACCATCGGAATG+TGG 0.629881 3:+83196500 MsG0380016420.01.T01:CDS
AAGACCAACCATGAAAGAAG+TGG 0.631305 3:+83197574 MsG0380016420.01.T01:CDS
AGTTGGTAGCAGTTGGCTGT+GGG 0.632303 3:+83194547 MsG0380016420.01.T01:CDS
CTCGCCGACTCAAAACAAGT+TGG 0.634609 3:+83194530 MsG0380016420.01.T01:CDS
ATCCATCCAAGCATCTGCAA+AGG 0.636483 3:-83194978 None:intergenic
GCTATCTGTTGGCAGGCCTG+AGG 0.636936 3:+83197400 MsG0380016420.01.T01:CDS
GAAGGAAAGATCCTAGGCGA+AGG 0.640711 3:+83196357 MsG0380016420.01.T01:CDS
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TATGATTGGTGTAGAAGCAG+CGG 0.643247 3:-83196697 None:intergenic
AGATGCTTGGATGGATATCG+GGG 0.644648 3:+83194985 MsG0380016420.01.T01:CDS
CAAAGCCACACATCCAGTGG+TGG 0.644884 3:-83194613 None:intergenic
GCACAAAGCCACACATCCAG+TGG 0.652031 3:-83194616 None:intergenic
AGATAACCACTCTAGTGAAG+GGG 0.659431 3:+83197267 MsG0380016420.01.T01:intron
CAACAGCTAGCGAAGCATGG+AGG 0.660516 3:+83196270 MsG0380016420.01.T01:CDS
TTCCCACAAGTACTCCTAGG+AGG 0.660648 3:-83196158 None:intergenic
GGTCAAGGAACAGTTTACAA+AGG 0.660665 3:+83196381 MsG0380016420.01.T01:CDS
CTCTAGTGAAGGGGACATTG+GGG 0.669048 3:+83197276 MsG0380016420.01.T01:CDS
GTACAGTTTGGTAGTGACAT+CGG 0.671348 3:-83194234 None:intergenic
CCAAACTGTACAGCAAAGTG+TGG 0.680216 3:+83194246 MsG0380016420.01.T01:CDS
GTATATGACTTCAATCCATG+TGG 0.683462 3:+83194754 MsG0380016420.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTTCATTGTTATAATAAAAT+TGG - Chr3:83195713-83195732 None:intergenic 10.0%
!!! AAAATTTTTCTAGATTTTTT+TGG + Chr3:83195335-83195354 MsG0380016420.01.T01:intron 10.0%
!!! AAATATGATATTTTTATAGT+AGG + Chr3:83196081-83196100 MsG0380016420.01.T01:intron 10.0%
!!! AATATGATATTTTTATAGTA+GGG + Chr3:83196082-83196101 MsG0380016420.01.T01:intron 10.0%
!!! TTTTATTATAACAATGAAAA+TGG + Chr3:83195714-83195733 MsG0380016420.01.T01:intron 10.0%
!! AAATTAATTTCAAACATTCT+TGG - Chr3:83196012-83196031 None:intergenic 15.0%
!! AATAAATTCATAAACAAGTA+AGG - Chr3:83196562-83196581 None:intergenic 15.0%
!! ATAAATTCATAAACAAGTAA+GGG - Chr3:83196561-83196580 None:intergenic 15.0%
!! CTAAAATTCAATATAAAATC+AGG + Chr3:83196781-83196800 MsG0380016420.01.T01:intron 15.0%
!!! GTTTGAAATTAATTTACTTA+TGG + Chr3:83196017-83196036 MsG0380016420.01.T01:intron 15.0%
!! AATATTTCTTATCTCTTGTT+TGG + Chr3:83195047-83195066 MsG0380016420.01.T01:intron 20.0%
!! GAAATATTATATTCATACCT+TGG - Chr3:83195035-83195054 None:intergenic 20.0%
!!! AAAATTTTAGCATTTTTCCT+TGG - Chr3:83195260-83195279 None:intergenic 20.0%
!!! AAAGTATATTTTGTCAGTTT+CGG - Chr3:83195467-83195486 None:intergenic 20.0%
!!! GAAAAAAATTTTCGACAAAA+TGG + Chr3:83196231-83196250 MsG0380016420.01.T01:CDS 20.0%
! AAAAAAAGAGATTGTGATCT+AGG - Chr3:83196752-83196771 None:intergenic 25.0%
! AAAAGTAAATGTTACAAAGC+AGG + Chr3:83194937-83194956 MsG0380016420.01.T01:CDS 25.0%
! AAAGTAAATGTTACAAAGCA+GGG + Chr3:83194938-83194957 MsG0380016420.01.T01:CDS 25.0%
! AATTTCAGAATGGTGTTTAA+GGG + Chr3:83197538-83197557 MsG0380016420.01.T01:CDS 25.0%
! ACCTTATGATCTCAAATAAA+TGG + Chr3:83195986-83196005 MsG0380016420.01.T01:intron 25.0%
! AGCAGAAAGAAAATGAATTT+AGG + Chr3:83195925-83195944 MsG0380016420.01.T01:intron 25.0%
! AGTTAAAATCTTCACTATTG+AGG + Chr3:83196305-83196324 MsG0380016420.01.T01:CDS 25.0%
! ATTAGTCAAAAATCCCAAAA+TGG - Chr3:83195858-83195877 None:intergenic 25.0%
! ATTCAATATAAAATCAGGAG+AGG + Chr3:83196786-83196805 MsG0380016420.01.T01:intron 25.0%
! CAAAAAATAACAAACCATTG+AGG + Chr3:83194475-83194494 MsG0380016420.01.T01:CDS 25.0%
! CAGAACAACAATTTATAACA+AGG - Chr3:83195786-83195805 None:intergenic 25.0%
! GTTTATGAATTTATTCCCAA+TGG + Chr3:83196567-83196586 MsG0380016420.01.T01:CDS 25.0%
! TAATTTCAGAATGGTGTTTA+AGG + Chr3:83197537-83197556 MsG0380016420.01.T01:CDS 25.0%
! TTCTAGATAAATTTGTACCA+AGG + Chr3:83195240-83195259 MsG0380016420.01.T01:intron 25.0%
! TTCTGGATAAAGATAGTTTA+GGG - Chr3:83196919-83196938 None:intergenic 25.0%
! TTTCTGGATAAAGATAGTTT+AGG - Chr3:83196920-83196939 None:intergenic 25.0%
!! AAAAATTTTCGACAAAATGG+TGG + Chr3:83196234-83196253 MsG0380016420.01.T01:CDS 25.0%
!! AATGCTTTTAATAAGGATGT+TGG - Chr3:83197127-83197146 None:intergenic 25.0%
!! AGTGGTTAATGCTTTTAATA+AGG - Chr3:83197134-83197153 None:intergenic 25.0%
!! ATATTTTCTTGCAATTGATG+AGG - Chr3:83194332-83194351 None:intergenic 25.0%
!! ATGCTTTTAATAAGGATGTT+GGG - Chr3:83197126-83197145 None:intergenic 25.0%
!! TCAAATGTTGTTTAGCTAAA+AGG + Chr3:83195366-83195385 MsG0380016420.01.T01:intron 25.0%
!! TGAATTTTGTGCTTTAATGA+TGG - Chr3:83197218-83197237 None:intergenic 25.0%
!!! AATCCAATTACTGTTTTAAG+GGG + Chr3:83195507-83195526 MsG0380016420.01.T01:intron 25.0%
!!! GAATCCAATTACTGTTTTAA+GGG + Chr3:83195506-83195525 MsG0380016420.01.T01:intron 25.0%
!!! TAAACACCATTCTGAAATTA+GGG - Chr3:83197537-83197556 None:intergenic 25.0%
!!! TTAAACACCATTCTGAAATT+AGG - Chr3:83197538-83197557 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTTTTCTCCCTTTTGTA+GGG - Chr3:83196863-83196882 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTTTTTCTCCCTTTTGT+AGG - Chr3:83196864-83196883 None:intergenic 25.0%
AAAGTGATTTACTTACCAAC+CGG + Chr3:83195130-83195149 MsG0380016420.01.T01:intron 30.0%
AAGAGTGATGTTTATAGCTT+TGG + Chr3:83197341-83197360 MsG0380016420.01.T01:CDS 30.0%
AAGTTCATAGCCAAAGAAAT+TGG + Chr3:83195811-83195830 MsG0380016420.01.T01:intron 30.0%
AAGTTTCCCTAATTTCAGAA+TGG + Chr3:83197528-83197547 MsG0380016420.01.T01:CDS 30.0%
ACAATCACTTCATTGATGAA+TGG - Chr3:83196474-83196493 None:intergenic 30.0%
ACAATCTCCAACATTGATAA+TGG - Chr3:83197678-83197697 None:intergenic 30.0%
AGAGTGATGTTTATAGCTTT+GGG + Chr3:83197342-83197361 MsG0380016420.01.T01:CDS 30.0%
ATCATATCCAATCTAGATGA+AGG + Chr3:83196890-83196909 MsG0380016420.01.T01:intron 30.0%
ATGATCATAAACAGTACCAT+TGG - Chr3:83196586-83196605 None:intergenic 30.0%
CACTATTGAGGAGTTAAATA+AGG + Chr3:83196317-83196336 MsG0380016420.01.T01:CDS 30.0%
CATTTCCATTGCTTTATCAA+TGG + Chr3:83197192-83197211 MsG0380016420.01.T01:intron 30.0%
CTACTCATATCTTCTGTAAT+GGG - Chr3:83196818-83196837 None:intergenic 30.0%
CTTGCCAAAAACTAATCAAA+GGG + Chr3:83194389-83194408 MsG0380016420.01.T01:CDS 30.0%
GGAAAATATTGAGCATCTAA+AGG + Chr3:83197505-83197524 MsG0380016420.01.T01:CDS 30.0%
TAATTACTCGCAGATGAATT+TGG + Chr3:83195171-83195190 MsG0380016420.01.T01:intron 30.0%
TCTGGACAACAATATTTATG+AGG + Chr3:83197484-83197503 MsG0380016420.01.T01:CDS 30.0%
TCTTGCCAAAAACTAATCAA+AGG + Chr3:83194388-83194407 MsG0380016420.01.T01:CDS 30.0%
TGATCATAAACAGTACCATT+GGG - Chr3:83196585-83196604 None:intergenic 30.0%
TTCACATCTCTATGTATGAT+TGG - Chr3:83196714-83196733 None:intergenic 30.0%
TTTGATACAATTGTACCATC+TGG + Chr3:83197081-83197100 MsG0380016420.01.T01:intron 30.0%
! AATCTTTGGTGATTCCAAAT+GGG - Chr3:83194290-83194309 None:intergenic 30.0%
! ATGGATTGAAGTCATATACT+AGG - Chr3:83194753-83194772 None:intergenic 30.0%
! CTTGTAGCAATTGATTCTAA+AGG + Chr3:83194582-83194601 MsG0380016420.01.T01:CDS 30.0%
! GCCATTTATTTGAGATCATA+AGG - Chr3:83195990-83196009 None:intergenic 30.0%
! GGAATCCAATTACTGTTTTA+AGG + Chr3:83195505-83195524 MsG0380016420.01.T01:intron 30.0%
! GTTCTAAATATCTCACTCAA+CGG + Chr3:83194411-83194430 MsG0380016420.01.T01:CDS 30.0%
! TCTTGAAGTACCAATTTCTT+TGG - Chr3:83195824-83195843 None:intergenic 30.0%
! TGCTTTTAATAAGGATGTTG+GGG - Chr3:83197125-83197144 None:intergenic 30.0%
! TTCTTATCTCTTGTTTGGAT+CGG + Chr3:83195052-83195071 MsG0380016420.01.T01:intron 30.0%
! TTTAGATGTTGATGAATGCA+AGG + Chr3:83195484-83195503 MsG0380016420.01.T01:intron 30.0%
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!!! ATCTGGTTTTCATTTTCCAA+GGG + Chr3:83197098-83197117 MsG0380016420.01.T01:intron 30.0%
!!! ATTTTTTGCATAGCAATCAC+TGG - Chr3:83194463-83194482 None:intergenic 30.0%
!!! TATGCGTTTTTGGTAGAAAA+TGG + Chr3:83194778-83194797 MsG0380016420.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGATTAGTTTTTGGCAAGAA+AGG - Chr3:83194387-83194406 None:intergenic 30.0%
!!! TTCGGTCTTTGTTTTCAAAA+TGG - Chr3:83195449-83195468 None:intergenic 30.0%
!!! TTTTTTTCTCCCTTTTGTAG+GGG - Chr3:83196862-83196881 None:intergenic 30.0%
AAATTCAGCTTCAATAGGAG+AGG + Chr3:83197231-83197250 MsG0380016420.01.T01:intron 35.0%
ACCAAGGAAAGAGTTCATAT+TGG + Chr3:83195625-83195644 MsG0380016420.01.T01:intron 35.0%
ACCAATATGAACTCTTTCCT+TGG - Chr3:83195629-83195648 None:intergenic 35.0%
ACCATTGAGGAAAAGATTTC+AGG + Chr3:83194488-83194507 MsG0380016420.01.T01:CDS 35.0%
AGAATAGCAAAAGAAACTGC+TGG + Chr3:83196654-83196673 MsG0380016420.01.T01:CDS 35.0%
ATCAAAATTCCCTTCCCATT+TGG + Chr3:83194273-83194292 MsG0380016420.01.T01:CDS 35.0%
ATCTGCGAGTAATTATGACT+TGG - Chr3:83195166-83195185 None:intergenic 35.0%
CATCACTCTTCTCTGTTAAT+TGG - Chr3:83197331-83197350 None:intergenic 35.0%
CTTGGAAAATGAAAACCAGA+TGG - Chr3:83197099-83197118 None:intergenic 35.0%
GAGTTTGAGTAACATCTGTT+TGG - Chr3:83197173-83197192 None:intergenic 35.0%
GCACAAAATTCAGCTTCAAT+AGG + Chr3:83197226-83197245 MsG0380016420.01.T01:intron 35.0%
GCTACTCATATCTTCTGTAA+TGG - Chr3:83196819-83196838 None:intergenic 35.0%
GGAGATTGTGTTAGAGAAAA+TGG + Chr3:83197689-83197708 MsG0380016420.01.T01:CDS 35.0%
GTATATGACTTCAATCCATG+TGG + Chr3:83194754-83194773 MsG0380016420.01.T01:CDS 35.0%
GTCATAATTACTAGCAGATG+AGG + Chr3:83195290-83195309 MsG0380016420.01.T01:intron 35.0%
TATGAACTCTTTCCTTGGTT+TGG - Chr3:83195624-83195643 None:intergenic 35.0%
TGTGAGATTTCAATACCCAA+AGG + Chr3:83194676-83194695 MsG0380016420.01.T01:intron 35.0%
TTCAAAACAGTTGCTTCTCA+TGG + Chr3:83194173-83194192 MsG0380016420.01.T01:CDS 35.0%
TTTCTTCAGTGAAAGAAGGT+CGG + Chr3:83197450-83197469 MsG0380016420.01.T01:CDS 35.0%
TTTCTTTGGCTATGAACTTC+AGG - Chr3:83195810-83195829 None:intergenic 35.0%
! AAATGGGAAGGGAATTTTGA+TGG - Chr3:83194274-83194293 None:intergenic 35.0%
! ACACTCATTGATTAGAGATC+AGG - Chr3:83196057-83196076 None:intergenic 35.0%
! CAATCTTTGGTGATTCCAAA+TGG - Chr3:83194291-83194310 None:intergenic 35.0%
! CATTGGCTAAAAATGGACAA+GGG - Chr3:83196997-83197016 None:intergenic 35.0%
! GAGTGATGTTTATAGCTTTG+GGG + Chr3:83197343-83197362 MsG0380016420.01.T01:CDS 35.0%
! GGTCTTTGTATTTTGTTGCT+TGG + Chr3:83195192-83195211 MsG0380016420.01.T01:intron 35.0%
! TCCTGAAATCTTTTCCTCAA+TGG - Chr3:83194492-83194511 None:intergenic 35.0%
!! ACCAATCTTTAAAGCTTGCA+TGG + Chr3:83196619-83196638 MsG0380016420.01.T01:CDS 35.0%
!! ATATCTTCTGTAATGGGTTC+AGG - Chr3:83196812-83196831 None:intergenic 35.0%
!! ATCCAGAAAGTGTTGAATGA+AGG + Chr3:83196931-83196950 MsG0380016420.01.T01:intron 35.0%
!! TCCAGAAAGTGTTGAATGAA+GGG + Chr3:83196932-83196951 MsG0380016420.01.T01:intron 35.0%
!! TCCATGCAAGCTTTAAAGAT+TGG - Chr3:83196623-83196642 None:intergenic 35.0%
!! TCTCCAACATTGATAATGGA+TGG - Chr3:83197674-83197693 None:intergenic 35.0%
!!! CATCTGGTTTTCATTTTCCA+AGG + Chr3:83197097-83197116 MsG0380016420.01.T01:intron 35.0%
!!! GAGTTGCTGCTTTTGTATAA+AGG - Chr3:83194212-83194231 None:intergenic 35.0%
!!! TCTCTTTGTTTTCTTCCCAA+TGG - Chr3:83196973-83196992 None:intergenic 35.0%
!!! TTCTTTTGCTATTCTCAGTC+TGG - Chr3:83196649-83196668 None:intergenic 35.0%
AAAACAGTTGCTTCTCATGG+TGG + Chr3:83194176-83194195 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
AAACACAACTCCCCTACAAA+AGG + Chr3:83196849-83196868 MsG0380016420.01.T01:intron 40.0%
AAAGCTTTACCACATTCCGA+TGG - Chr3:83196512-83196531 None:intergenic 40.0%
AAAGGAAATACATCCACCAC+TGG + Chr3:83194600-83194619 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
AACACAACTCCCCTACAAAA+GGG + Chr3:83196850-83196869 MsG0380016420.01.T01:intron 40.0%
AACCATGAAAGAAGTGGCAA+TGG + Chr3:83197580-83197599 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
AAGACCAACCATGAAAGAAG+TGG + Chr3:83197574-83197593 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
ACCAAAAACGCATAACCACA+TGG - Chr3:83194772-83194791 None:intergenic 40.0%
ACCATGAAAGAAGTGGCAAT+GGG + Chr3:83197581-83197600 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
ACCCTTCATTCAACACTTTC+TGG - Chr3:83196936-83196955 None:intergenic 40.0%
AGATAACCACTCTAGTGAAG+GGG + Chr3:83197267-83197286 MsG0380016420.01.T01:intron 40.0%
AGGTCGGTTACTTCATATTC+TGG + Chr3:83197466-83197485 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
ATGAATGGCTCAATCTGGTT+TGG - Chr3:83196459-83196478 None:intergenic 40.0%
ATTACGATGTCAACGATTGG+TGG + Chr3:83197746-83197765 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
CAAAATCCTGTACCAAACCA+AGG + Chr3:83195609-83195628 MsG0380016420.01.T01:intron 40.0%
CAATCGTTGACATCGTAATC+TGG - Chr3:83197745-83197764 None:intergenic 40.0%
CACTCCGACTTCAGAAATAT+AGG - Chr3:83194722-83194741 None:intergenic 40.0%
CAGATAACCACTCTAGTGAA+GGG + Chr3:83197266-83197285 MsG0380016420.01.T01:intron 40.0%
CAGATTACGATGTCAACGAT+TGG + Chr3:83197743-83197762 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
CATTGATGAATGGCTCAATC+TGG - Chr3:83196464-83196483 None:intergenic 40.0%
CTAGAGTGGTTATCTGACAT+TGG - Chr3:83197262-83197281 None:intergenic 40.0%
CTCTTGTGTGCATACTCTTA+GGG - Chr3:83197041-83197060 None:intergenic 40.0%
CTTTCCTTCATCGAAGTTGT+TGG - Chr3:83196346-83196365 None:intergenic 40.0%
GAAAGAGTTTCCTGTGTTGT+TGG + Chr3:83194843-83194862 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
GATGGCCATTGATAAAGCAA+TGG - Chr3:83197200-83197219 None:intergenic 40.0%
GCAAAGGTAACCAGATTTGT+CGG - Chr3:83194965-83194984 None:intergenic 40.0%
GCAAGATTTCTATCAACCTC+AGG - Chr3:83197419-83197438 None:intergenic 40.0%
GCACCATCCATTATCAATGT+TGG + Chr3:83197668-83197687 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
GGTCAAGGAACAGTTTACAA+AGG + Chr3:83196381-83196400 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
GTTTCCATTTGTGTATGTCC+AGG + Chr3:83196123-83196142 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
TACTCTTAGGGAAGGTAACT+TGG - Chr3:83197029-83197048 None:intergenic 40.0%
TATGATTGGTGTAGAAGCAG+CGG - Chr3:83196700-83196719 None:intergenic 40.0%
TATTCATACCTTGGCAACCA+TGG - Chr3:83195026-83195045 None:intergenic 40.0%
TCAGATAACCACTCTAGTGA+AGG + Chr3:83197265-83197284 MsG0380016420.01.T01:intron 40.0%
TCTGTAAACACGTGACCTTT+GGG - Chr3:83194694-83194713 None:intergenic 40.0%
TCTGTGATGCAGTTACAACA+GGG - Chr3:83195953-83195972 None:intergenic 40.0%
TGACAATCTGTCTTCAGAAG+AGG + Chr3:83197646-83197665 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
TTCGATGAAGGAAAGATCCT+AGG + Chr3:83196351-83196370 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
TTCTGTAAACACGTGACCTT+TGG - Chr3:83194695-83194714 None:intergenic 40.0%
TTGAAATCTCACAACAACCC+AGG - Chr3:83194669-83194688 None:intergenic 40.0%
! ATCCCAAAATGGCACTTTTC+TGG - Chr3:83195847-83195866 None:intergenic 40.0%
! ATTGCCACTTCTTTCATGGT+TGG - Chr3:83197581-83197600 None:intergenic 40.0%
! CGGAATGTGGTAAAGCTTTT+GGG + Chr3:83196513-83196532 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
! GGAAACTGACTCAATCATAG+TGG - Chr3:83197152-83197171 None:intergenic 40.0%
! TCCATGTGGTTATGCGTTTT+TGG + Chr3:83194768-83194787 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
! TCGGAATGTGGTAAAGCTTT+TGG + Chr3:83196512-83196531 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
! TGAATGGCTCAATCTGGTTT+GGG - Chr3:83196458-83196477 None:intergenic 40.0%
! TGCGAGTAATTATGACTTGG+AGG - Chr3:83195163-83195182 None:intergenic 40.0%
! TGTTGTTGGACTGGAAAGTA+AGG + Chr3:83194857-83194876 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
! TTGGTGATTCCAAATGGGAA+GGG - Chr3:83194285-83194304 None:intergenic 40.0%
! TTTGGTGATTCCAAATGGGA+AGG - Chr3:83194286-83194305 None:intergenic 40.0%
!! AGAAAGTGTTGAATGAAGGG+TGG + Chr3:83196935-83196954 MsG0380016420.01.T01:intron 40.0%
!! CAAAACAAGTTGGTAGCAGT+TGG + Chr3:83194540-83194559 MsG0380016420.01.T01:CDS 40.0%
!! GATGAGGAAAGTGTTGTCTA+GGG - Chr3:83194316-83194335 None:intergenic 40.0%
!! GCAGATGCATTGGCTAAAAA+TGG - Chr3:83197004-83197023 None:intergenic 40.0%
!! GCATTGGCTAAAAATGGACA+AGG - Chr3:83196998-83197017 None:intergenic 40.0%
!! GTACAGTTTGGTAGTGACAT+CGG - Chr3:83194237-83194256 None:intergenic 40.0%
!! TCTCTGTTAATTGGCTTGTG+TGG - Chr3:83197322-83197341 None:intergenic 40.0%
!! TGATGAGGAAAGTGTTGTCT+AGG - Chr3:83194317-83194336 None:intergenic 40.0%
!!! AGACCAGAAAAGTGCCATTT+TGG + Chr3:83195841-83195860 MsG0380016420.01.T01:intron 40.0%
!!! CTGGTTTGGGTCATTGATTT+TGG - Chr3:83196445-83196464 None:intergenic 40.0%
!!! CTTGGTTTGGTACAGGATTT+TGG - Chr3:83195611-83195630 None:intergenic 40.0%
!!! CTTTGTTTTCTTCCCAATGG+TGG - Chr3:83196970-83196989 None:intergenic 40.0%
!!! GACCAGAAAAGTGCCATTTT+GGG + Chr3:83195842-83195861 MsG0380016420.01.T01:intron 40.0%
!!! GCTACCAACTTGTTTTGAGT+CGG - Chr3:83194537-83194556 None:intergenic 40.0%
AAAAGAAACTGCTGGAGTCC+TGG + Chr3:83196662-83196681 MsG0380016420.01.T01:CDS 45.0%
AATGAATCTTGTTCCGGCCT+GGG + Chr3:83194649-83194668 MsG0380016420.01.T01:intron 45.0%
ACTCTAGTGAAGGGGACATT+GGG + Chr3:83197275-83197294 MsG0380016420.01.T01:CDS 45.0%
ACTTTCCAGTCCAACAACAC+AGG - Chr3:83194856-83194875 None:intergenic 45.0%
AGATGCTTGGATGGATATCG+GGG + Chr3:83194985-83195004 MsG0380016420.01.T01:CDS 45.0%
AGCTTTGCAATCACAGACCT+CGG + Chr3:83194808-83194827 MsG0380016420.01.T01:CDS 45.0%
AGGGCTTCCTTCATCTAGAT+TGG - Chr3:83196900-83196919 None:intergenic 45.0%
ATCCATCCAAGCATCTGCAA+AGG - Chr3:83194981-83195000 None:intergenic 45.0%
ATCCTTCTGGGCAGAAACAA+TGG - Chr3:83195562-83195581 None:intergenic 45.0%
CACATTCCGATGGTTGATCT+GGG - Chr3:83196502-83196521 None:intergenic 45.0%
CAGAAACAATGGTAGCTTCC+AGG - Chr3:83195551-83195570 None:intergenic 45.0%
CAGATGCTTGGATGGATATC+GGG + Chr3:83194984-83195003 MsG0380016420.01.T01:CDS 45.0%
CCAAACTGTACAGCAAAGTG+TGG + Chr3:83194246-83194265 MsG0380016420.01.T01:CDS 45.0%
CCAGAAGGATATGAAGGAGA+CGG + Chr3:83195572-83195591 MsG0380016420.01.T01:intron 45.0%
CGCCCCCTTAAAACAGTAAT+TGG - Chr3:83195513-83195532 None:intergenic 45.0%
CGTCTCCTTCATATCCTTCT+GGG - Chr3:83195574-83195593 None:intergenic 45.0%
CTCTGTGATGCAGTTACAAC+AGG - Chr3:83195954-83195973 None:intergenic 45.0%
CTTTCTTCTTCAACTTGCCG+AGG - Chr3:83194828-83194847 None:intergenic 45.0%
GACACCTGGACATACACAAA+TGG - Chr3:83196130-83196149 None:intergenic 45.0%
GCAACCAACAACTTCGATGA+AGG + Chr3:83196339-83196358 MsG0380016420.01.T01:CDS 45.0%
GCAGATGCTTGGATGGATAT+CGG + Chr3:83194983-83195002 MsG0380016420.01.T01:CDS 45.0%
GCTCTTGTGTGCATACTCTT+AGG - Chr3:83197042-83197061 None:intergenic 45.0%
GGAAATCCTTACCTCATCCA+TGG + Chr3:83195006-83195025 MsG0380016420.01.T01:CDS 45.0%
GTCTGTGATTGCAAAGCTGT+AGG - Chr3:83194806-83194825 None:intergenic 45.0%
GTGGCCAATGAATCTTGTTC+CGG + Chr3:83194643-83194662 MsG0380016420.01.T01:intron 45.0%
GTTGTCTAGGGAGCAATCTT+TGG - Chr3:83194304-83194323 None:intergenic 45.0%
TACCTTTGCAGATGCTTGGA+TGG + Chr3:83194976-83194995 MsG0380016420.01.T01:CDS 45.0%
TCTTAGGGAAGGTAACTTGG+TGG - Chr3:83197026-83197045 None:intergenic 45.0%
TGCTTTCCCAGATCAACCAT+CGG + Chr3:83196493-83196512 MsG0380016420.01.T01:CDS 45.0%
TGGTTACCTTTGCAGATGCT+TGG + Chr3:83194972-83194991 MsG0380016420.01.T01:CDS 45.0%
TGTGTGCATACTCTTAGGGA+AGG - Chr3:83197037-83197056 None:intergenic 45.0%
TTCTGCCCAGAAGGATATGA+AGG + Chr3:83195566-83195585 MsG0380016420.01.T01:intron 45.0%
! AAGAGTATGCACACAAGAGC+AGG + Chr3:83197042-83197061 MsG0380016420.01.T01:intron 45.0%
! AGTTTCCTGTGTTGTTGGAC+TGG + Chr3:83194848-83194867 MsG0380016420.01.T01:CDS 45.0%
! ATGACTTGGAGGATAGCAAC+CGG - Chr3:83195152-83195171 None:intergenic 45.0%
! CCACACTTTGCTGTACAGTT+TGG - Chr3:83194249-83194268 None:intergenic 45.0%
! CGTAATCTGGTTCGTGCTAT+AGG - Chr3:83197732-83197751 None:intergenic 45.0%
! GGGAAGCTTTTATGCGCATT+GGG + Chr3:83196176-83196195 MsG0380016420.01.T01:CDS 45.0%
! TAACTTGGTGGCAGATGCAT+TGG - Chr3:83197014-83197033 None:intergenic 45.0%
! TCCCATTGCCACTTCTTTCA+TGG - Chr3:83197585-83197604 None:intergenic 45.0%
! TGGGAAGCTTTTATGCGCAT+TGG + Chr3:83196175-83196194 MsG0380016420.01.T01:CDS 45.0%
! TTTATGCGCATTGGGCATTG+AGG + Chr3:83196184-83196203 MsG0380016420.01.T01:CDS 45.0%
! TTTGAGCTTGCTCGCACATT+TGG - Chr3:83194885-83194904 None:intergenic 45.0%
!! AAGTGTTGAATGAAGGGTGG+TGG + Chr3:83196938-83196957 MsG0380016420.01.T01:intron 45.0%
!! CTCTTTCCTTGGTTTGGTAC+AGG - Chr3:83195618-83195637 None:intergenic 45.0%
!! GGAAAGAAAGCGCTATCTGT+TGG + Chr3:83197389-83197408 MsG0380016420.01.T01:CDS 45.0%
!! TACCATTGTTTCTGCCCAGA+AGG + Chr3:83195557-83195576 MsG0380016420.01.T01:intron 45.0%
!! TGGCTTGTGTGGAAGTATTC+AGG - Chr3:83197311-83197330 None:intergenic 45.0%
!! TGTGTGGCTTTGTGCTATTG+TGG + Chr3:83194624-83194643 MsG0380016420.01.T01:intron 45.0%
!!! AAATTTTAATGATAAAAAAA+TGG - Chr3:83195221-83195240 None:intergenic 5.0%
!!! AATTTTAATGATAAAAAAAA+TGG - Chr3:83195220-83195239 None:intergenic 5.0%
AAAGCAGGGACCGACAAATC+TGG + Chr3:83194952-83194971 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
AACAGCTAGCGAAGCATGGA+GGG + Chr3:83196271-83196290 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
AATCTCACAACAACCCAGGC+CGG - Chr3:83194665-83194684 None:intergenic 50.0%
AGAAGTGGCAATGGGACTAG+AGG + Chr3:83197589-83197608 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
AGCTACTGAAGAGCAGCGTT+TGG + Chr3:83197619-83197638 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
AGCTTCCCACAAGTACTCCT+AGG - Chr3:83196164-83196183 None:intergenic 50.0%
ATAAGGATGTTGGGGTCCCT+TGG - Chr3:83197117-83197136 None:intergenic 50.0%
CAACAACAGCTAGCGAAGCA+TGG + Chr3:83196267-83196286 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
CAATGAATCTTGTTCCGGCC+TGG + Chr3:83194648-83194667 MsG0380016420.01.T01:intron 50.0%
CAATGTCCCCTTCACTAGAG+TGG - Chr3:83197276-83197295 None:intergenic 50.0%
CACTCTAGTGAAGGGGACAT+TGG + Chr3:83197274-83197293 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
CAGCGGAATGTAAGTATGCC+AGG - Chr3:83196683-83196702 None:intergenic 50.0%
CAGGCCGGAACAAGATTCAT+TGG - Chr3:83194650-83194669 None:intergenic 50.0%
CCACATTCCGATGGTTGATC+TGG - Chr3:83196503-83196522 None:intergenic 50.0%
CCAGATCAACCATCGGAATG+TGG + Chr3:83196500-83196519 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
CCGTCTCCTTCATATCCTTC+TGG - Chr3:83195575-83195594 None:intergenic 50.0%
CTCTAGTGAAGGGGACATTG+GGG + Chr3:83197276-83197295 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
GAAGGAAAGATCCTAGGCGA+AGG + Chr3:83196357-83196376 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
GAAGTGGCAATGGGACTAGA+GGG + Chr3:83197590-83197609 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
GCGACATGCAACAATCTTCC+TGG + Chr3:83195530-83195549 MsG0380016420.01.T01:intron 50.0%
GCTACTGAAGAGCAGCGTTT+GGG + Chr3:83197620-83197639 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
GTGTTTAAGGGTGAAGAGCG+AGG + Chr3:83197550-83197569 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
TACATCCACCACTGGATGTG+TGG + Chr3:83194608-83194627 MsG0380016420.01.T01:intron 50.0%
TACCTCATCCATGGTTGCCA+AGG + Chr3:83195015-83195034 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
TACCTTGGCAACCATGGATG+AGG - Chr3:83195020-83195039 None:intergenic 50.0%
TGGCAACCATGGATGAGGTA+AGG - Chr3:83195015-83195034 None:intergenic 50.0%
TTCCCACAAGTACTCCTAGG+AGG - Chr3:83196161-83196180 None:intergenic 50.0%
! GCATAGCAATCACTGGCTAC+TGG - Chr3:83194456-83194475 None:intergenic 50.0%
! TTCCTGTCAGTAGCTCTGCT+AGG - Chr3:83197373-83197392 None:intergenic 50.0%
!! AAGCCTCCTAGGAGTACTTG+TGG + Chr3:83196155-83196174 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
!! AAGTTGGTAGCAGTTGGCTG+TGG + Chr3:83194546-83194565 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
!! AGAAAGCGCTATCTGTTGGC+AGG + Chr3:83197393-83197412 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
!! AGCCTCCTAGGAGTACTTGT+GGG + Chr3:83196156-83196175 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
!! AGTTGGTAGCAGTTGGCTGT+GGG + Chr3:83194547-83194566 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
!! CTCGCCGACTCAAAACAAGT+TGG + Chr3:83194530-83194549 MsG0380016420.01.T01:CDS 50.0%
ACGGTGAACTGCACGTTGGA+TGG + Chr3:83194430-83194449 MsG0380016420.01.T01:CDS 55.0%
ACTGAAGAGCAGCGTTTGGG+AGG + Chr3:83197623-83197642 MsG0380016420.01.T01:CDS 55.0%
ATCCTAGGCGAAGGTGGTCA+AGG + Chr3:83196366-83196385 MsG0380016420.01.T01:CDS 55.0%
CAAAGCCACACATCCAGTGG+TGG - Chr3:83194616-83194635 None:intergenic 55.0%
CAACAGCTAGCGAAGCATGG+AGG + Chr3:83196270-83196289 MsG0380016420.01.T01:CDS 55.0%
CTCAACGGTGAACTGCACGT+TGG + Chr3:83194426-83194445 MsG0380016420.01.T01:CDS 55.0%
CTTGGAGGATAGCAACCGGT+TGG - Chr3:83195148-83195167 None:intergenic 55.0%
GCACAAAGCCACACATCCAG+TGG - Chr3:83194619-83194638 None:intergenic 55.0%
GCAGTTGGCTGTGGGACAAT+TGG + Chr3:83194555-83194574 MsG0380016420.01.T01:CDS 55.0%
GGAAAGATCCTAGGCGAAGG+TGG + Chr3:83196360-83196379 MsG0380016420.01.T01:CDS 55.0%
GTCCTAGCAGAGCTACTGAC+AGG + Chr3:83197368-83197387 MsG0380016420.01.T01:CDS 55.0%
TTCCTTGACCACCTTCGCCT+AGG - Chr3:83196371-83196390 None:intergenic 55.0%
!! TGAATGAAGGGTGGTGGAGC+AGG + Chr3:83196944-83196963 MsG0380016420.01.T01:intron 55.0%
AGGAGGCTTACGCTGACACC+TGG - Chr3:83196144-83196163 None:intergenic 60.0%
GCTATCTGTTGGCAGGCCTG+AGG + Chr3:83197400-83197419 MsG0380016420.01.T01:CDS 60.0%
GGTGTCAGCGTAAGCCTCCT+AGG + Chr3:83196144-83196163 MsG0380016420.01.T01:CDS 60.0%
TGGTGGAGCAGGCCACCATT+GGG + Chr3:83196955-83196974 MsG0380016420.01.T01:intron 60.0%
! GTGGTGGAGCAGGCCACCAT+TGG + Chr3:83196954-83196973 MsG0380016420.01.T01:intron 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 83194159 83197775 83194159 ID=MsG0380016420.01;Name=MsG0380016420.01
Chr3 mRNA 83194159 83197775 83194159 ID=MsG0380016420.01.T01;Parent=MsG0380016420.01;Name=MsG0380016420.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.49;_QI=0|0|0|1|1|1|4|0|645
Chr3 exon 83194159 83194624 83194159 ID=MsG0380016420.01.T01:exon:14003;Parent=MsG0380016420.01.T01
Chr3 exon 83194698 83195036 83194698 ID=MsG0380016420.01.T01:exon:14004;Parent=MsG0380016420.01.T01
Chr3 exon 83196103 83196728 83196103 ID=MsG0380016420.01.T01:exon:14005;Parent=MsG0380016420.01.T01
Chr3 exon 83197269 83197775 83197269 ID=MsG0380016420.01.T01:exon:14006;Parent=MsG0380016420.01.T01
Chr3 CDS 83194159 83194624 83194159 ID=MsG0380016420.01.T01:cds;Parent=MsG0380016420.01.T01
Chr3 CDS 83194698 83195036 83194698 ID=MsG0380016420.01.T01:cds;Parent=MsG0380016420.01.T01
Chr3 CDS 83196103 83196728 83196103 ID=MsG0380016420.01.T01:cds;Parent=MsG0380016420.01.T01
Chr3 CDS 83197269 83197775 83197269 ID=MsG0380016420.01.T01:cds;Parent=MsG0380016420.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380016420.01.T01

ATGGCTGTGGAGTATTCAAAACAGTTGCTTCTCATGGTGGTTGTTGCTCTCCTTTATACAAAAGCAGCAACTCAGCCGATGTCACTACCAAACTGTACAGCAAAGTGTGGTTCCATCAAAATTCCCTTCCCATTTGGAATCACCAAAGATTGCTCCCTAGACAACACTTTCCTCATCAATTGCAAGAAAATATCTTCAACTACATCAAATTCAACAACACACATTCCTTTCTTGCCAAAAACTAATCAAAGGGTTCTAAATATCTCACTCAACGGTGAACTGCACGTTGGATGGCCAGTAGCCAGTGATTGCTATGCAAAAAATAACAAACCATTGAGGAAAAGATTTCAGGATATGACACATTTTCACATCTCGCCGACTCAAAACAAGTTGGTAGCAGTTGGCTGTGGGACAATTGGATATCTTGTAGCAATTGATTCTAAAGGAAATACATCCACCACTGGATGTCACGTGTTTACAGAAGTAACCTATATTTCTGAAGTCGGAGTGAATGATCACCTAGTATATGACTTCAATCCATGTGGTTATGCGTTTTTGGTAGAAAATGGAGCCTACAGCTTTGCAATCACAGACCTCGGCAAGTTGAAGAAGAAAGAGTTTCCTGTGTTGTTGGACTGGAAAGTAAGGAACCAAATGTGCGAGCAAGCTCAAAAAGATCTTTCAAGTTATGCATGTAAGGCAGACAAAAGTAAATGTTACAAAGCAGGGACCGACAAATCTGGTTACCTTTGCAGATGCTTGGATGGATATCGGGGAAATCCTTACCTCATCCATGGTTGCCAAGGGAATCAAGAAAACGATTATGTTTCCATTTGTGTATGTCCAGGTGTCAGCGTAAGCCTCCTAGGAGTACTTGTGGGAAGCTTTTATGCGCATTGGGCATTGAGGAAAATAAAGCTCAATAAACGTAAAGAAAAAAATTTTCGACAAAATGGTGGCTTAGTGTTACAACAACAGCTAGCGAAGCATGGAGGGTCAACTGAAATAGTTAAAATCTTCACTATTGAGGAGTTAAATAAGGCAACCAACAACTTCGATGAAGGAAAGATCCTAGGCGAAGGTGGTCAAGGAACAGTTTACAAAGGAATGTTACAAGATGAAAGAGTTGTAGCGATAAAGAAGTCCAAAATCAATGACCCAAACCAGATTGAGCCATTCATCAATGAAGTGATTGTGCTTTCCCAGATCAACCATCGGAATGTGGTAAAGCTTTTGGGATGTTGTTTAGAGATAGAAGTTCCCTTACTTGTTTATGAATTTATTCCCAATGGTACTGTTTATGATCATCTTCATCATCAAAACCAATCTTTAAAGCTTGCATGGAAAACCAGACTGAGAATAGCAAAAGAAACTGCTGGAGTCCTGGCATACTTACATTCCGCTGCTTCTACACCAATCATACATAGAGATATAACCACTCTAGTGAAGGGGACATTGGGGTATCTTGATCCTGAATACTTCCACACAAGCCAATTAACAGAGAAGAGTGATGTTTATAGCTTTGGGGTTGTCCTAGCAGAGCTACTGACAGGAAAGAAAGCGCTATCTGTTGGCAGGCCTGAGGTTGATAGAAATCTTGCAATGCACTTTGTTTCTTCAGTGAAAGAAGGTCGGTTACTTCATATTCTGGACAACAATATTTATGAGGAAAATATTGAGCATCTAAAGGAAGTTTCCCTAATTTCAGAATGGTGTTTAAGGGTGAAGAGCGAGGAAAGACCAACCATGAAAGAAGTGGCAATGGGACTAGAGGGAATATTAGCTACTGAAGAGCAGCGTTTGGGAGGTGACAATCTGTCTTCAGAAGAGGCACCATCCATTATCAATGTTGGAGATTGTGTTAGAGAAAATGGCATTAATTCGTCTGACTCCTATAGCACGAACCAGATTACGATGTCAACGATTGGTGGTAGATGA
Protein sequence

>MsG0380016420.01.T01

MAVEYSKQLLLMVVVALLYTKAATQPMSLPNCTAKCGSIKIPFPFGITKDCSLDNTFLINCKKISSTTSNSTTHIPFLPKTNQRVLNISLNGELHVGWPVASDCYAKNNKPLRKRFQDMTHFHISPTQNKLVAVGCGTIGYLVAIDSKGNTSTTGCHVFTEVTYISEVGVNDHLVYDFNPCGYAFLVENGAYSFAITDLGKLKKKEFPVLLDWKVRNQMCEQAQKDLSSYACKADKSKCYKAGTDKSGYLCRCLDGYRGNPYLIHGCQGNQENDYVSICVCPGVSVSLLGVLVGSFYAHWALRKIKLNKRKEKNFRQNGGLVLQQQLAKHGGSTEIVKIFTIEELNKATNNFDEGKILGEGGQGTVYKGMLQDERVVAIKKSKINDPNQIEPFINEVIVLSQINHRNVVKLLGCCLEIEVPLLVYEFIPNGTVYDHLHHQNQSLKLAWKTRLRIAKETAGVLAYLHSAASTPIIHRDITTLVKGTLGYLDPEYFHTSQLTEKSDVYSFGVVLAELLTGKKALSVGRPEVDRNLAMHFVSSVKEGRLLHILDNNIYEENIEHLKEVSLISEWCLRVKSEERPTMKEVAMGLEGILATEEQRLGGDNLSSEEAPSIINVGDCVRENGINSSDSYSTNQITMSTIGGR*