AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580029301.01

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MsG0580029301.01.T01 AT3G58930 29.252 441 249 11 10 394 1 434 7.42e-32 127
MsG0580029301.01.T01 AT3G58930 29.252 441 249 11 10 394 1 434 7.42e-32 127
MsG0580029301.01.T01 AT3G58930 29.252 441 249 11 10 394 1 434 7.42e-32 127
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MsG0580029301.01.T01 AT5G56420 28.000 425 273 11 11 418 6 414 6.25e-31 123
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MsG0580029301.01.T01 AT1G55660 28.082 438 267 14 10 411 52 477 1.42e-30 123
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MsG0580029301.01.T01 AT3G59230 29.157 439 257 10 11 398 12 447 6.14e-28 116
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MsG0580029301.01.T01 AT1G06630 29.722 360 217 11 1 333 1 351 1.41e-27 114
MsG0580029301.01.T01 AT1G06630 29.722 360 217 11 1 333 1 351 1.41e-27 114
MsG0580029301.01.T01 AT1G06630 29.722 360 217 11 1 333 10 360 1.92e-27 113
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MsG0580029301.01.T01 AT3G03040 30.000 360 209 12 10 331 1 355 6.22e-27 112
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MsG0580029301.01.T01 AT5G27750 27.922 462 274 14 11 424 5 455 9.28e-27 112
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MsG0580029301.01.T01 AT2G29930 29.454 421 248 15 11 393 12 421 1.10e-26 112
MsG0580029301.01.T01 AT3G59190 31.081 370 210 13 2 331 3 367 1.19e-26 110
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MsG0580029301.01.T01 AT4G13960 29.128 436 252 15 10 401 1 423 2.84e-26 110
MsG0580029301.01.T01 AT3G49020 28.954 411 259 12 1 393 12 407 3.05e-26 110
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MsG0580029301.01.T01 AT4G27050 30.128 468 255 23 9 423 2 450 2.64e-25 108
MsG0580029301.01.T01 AT4G27050 30.128 468 255 23 9 423 2 450 2.64e-25 108
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MsG0580029301.01.T01 AT5G18780 25.785 446 302 14 1 424 1 439 1.05e-24 106
MsG0580029301.01.T01 AT1G52650 27.465 426 261 15 10 395 1 418 1.54e-24 105
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MsG0580029301.01.T01 AT3G58940 29.469 414 230 14 10 383 1 392 3.80e-24 105
MsG0580029301.01.T01 AT4G10420 31.071 280 167 8 124 393 28 291 3.93e-24 102
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MsG0580029301.01.T01 AT1G64540 28.221 326 193 10 13 307 7 322 1.07e-23 103
MsG0580029301.01.T01 AT4G15060 30.226 354 204 12 8 333 23 361 1.12e-23 103
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MsG0580029301.01.T01 AT3G59000 27.955 440 247 13 10 394 1 425 4.02e-23 102
MsG0580029301.01.T01 AT3G03030 27.211 441 267 13 10 402 1 435 5.62e-23 101
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MsG0580029301.01.T01 AT1G21990 29.067 461 272 17 11 423 9 462 7.42e-23 100
MsG0580029301.01.T01 AT4G00320 29.620 368 218 8 3 331 5 370 7.93e-23 101
MsG0580029301.01.T01 AT3G59210 29.099 433 257 12 11 398 7 434 1.03e-22 100
MsG0580029301.01.T01 AT3G59210 29.099 433 257 12 11 398 7 434 1.03e-22 100
MsG0580029301.01.T01 AT3G59210 29.099 433 257 12 11 398 7 434 1.03e-22 100
MsG0580029301.01.T01 AT3G59210 29.099 433 257 12 11 398 7 434 1.03e-22 100
MsG0580029301.01.T01 AT3G59210 29.099 433 257 12 11 398 7 434 1.03e-22 100
MsG0580029301.01.T01 AT1G32375 27.384 409 263 12 10 398 1 395 1.06e-22 100
MsG0580029301.01.T01 AT1G32375 27.384 409 263 12 10 398 1 395 1.06e-22 100
MsG0580029301.01.T01 AT5G41630 29.189 370 207 12 11 331 12 375 1.10e-22 100
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MsG0580029301.01.T01 AT3G60040 29.494 356 209 10 11 331 232 580 1.11e-22 101
MsG0580029301.01.T01 AT1G06630 29.260 311 189 9 1 288 1 303 1.15e-22 98.2
MsG0580029301.01.T01 AT3G60040 29.494 356 209 10 11 331 13 361 1.17e-22 101
MsG0580029301.01.T01 AT3G60040 29.494 356 209 10 11 331 232 580 1.34e-22 101
MsG0580029301.01.T01 AT5G22730 25.336 446 292 14 11 424 28 464 1.42e-22 100
MsG0580029301.01.T01 AT5G22730 25.336 446 292 14 11 424 28 464 1.42e-22 100
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MsG0580029301.01.T01 AT5G22730 25.070 355 233 11 11 336 28 378 6.20e-15 76.6
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MsG0580029301.01.T01 AT5G41830 31.641 256 138 9 107 331 70 319 1.28e-13 72.8
MsG0580029301.01.T01 AT5G44970 27.303 304 181 9 120 398 69 357 1.59e-13 72.4
MsG0580029301.01.T01 AT1G48400 29.323 266 162 7 11 253 10 272 1.71e-13 72.8
MsG0580029301.01.T01 AT3G56780 27.251 422 229 19 13 370 9 416 1.74e-13 72.4
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MsG0580029301.01.T01 AT1G56610 27.778 342 209 11 23 331 85 421 3.79e-13 71.6
MsG0580029301.01.T01 AT3G53550 25.333 225 134 7 202 424 47 239 4.07e-13 69.7
MsG0580029301.01.T01 AT3G44090 25.056 443 271 16 5 418 16 426 9.02e-13 70.1
MsG0580029301.01.T01 AT2G26030 27.758 281 163 9 168 419 10 279 1.09e-12 68.9
MsG0580029301.01.T01 AT1G78840 25.837 418 266 12 8 395 2 405 1.90e-12 69.3
MsG0580029301.01.T01 AT1G78840 25.837 418 266 12 8 395 2 405 1.90e-12 69.3
MsG0580029301.01.T01 AT3G10750 24.537 216 158 2 38 253 2 212 4.92e-12 67.0
MsG0580029301.01.T01 AT5G22600 26.866 335 206 14 124 429 1 325 4.99e-12 67.4
MsG0580029301.01.T01 AT5G22600 26.866 335 206 14 124 429 1 325 4.99e-12 67.4
MsG0580029301.01.T01 AT5G52460 25.225 333 189 10 98 424 5 283 9.02e-12 65.9
MsG0580029301.01.T01 AT3G56780 26.936 297 171 11 13 268 9 300 2.41e-11 65.5
MsG0580029301.01.T01 AT5G35926 28.814 236 137 6 124 331 51 283 4.55e-11 65.1
MsG0580029301.01.T01 AT5G35926 28.814 236 137 6 124 331 51 283 4.95e-11 64.7
MsG0580029301.01.T01 AT1G26890 30.263 152 102 2 12 161 39 188 8.07e-11 63.5
MsG0580029301.01.T01 AT1G26890 30.263 152 102 2 12 161 39 188 8.07e-11 63.5

Find 61 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 154 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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TATGTGATAATGAAATTAAA+TGG 0.259010 5:+94954180 MsG0580029301.01.T01:CDS
TGAAGTTCTTGAGATTATTA+AGG 0.278787 5:+94954047 MsG0580029301.01.T01:CDS
TTTCCAACATTTAACAATTT+GGG 0.302932 5:+94953949 MsG0580029301.01.T01:CDS
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AATAAATTGTAGTCCTCTTA+AGG 0.368681 5:-94954325 None:intergenic
TCTCAAGAACTTCAAGATTA+GGG 0.370837 5:-94954038 None:intergenic
TGAACAAAGTTATTTCTTGT+TGG 0.370885 5:-94953165 None:intergenic
ATGAAGAGTTCAAACTTATA+AGG 0.370905 5:+94954279 MsG0580029301.01.T01:CDS
ATCTCAAGAACTTCAAGATT+AGG 0.374650 5:-94954039 None:intergenic
CAATTTATTTCGGAAGTAGC+TGG 0.401362 5:+94954339 MsG0580029301.01.T01:CDS
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TATTCAAGTTCCTCAAGAAC+TGG 0.435692 5:-94953528 None:intergenic
CGACCCAAATTGTTAAATGT+TGG 0.436071 5:-94953952 None:intergenic
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CTATGGTTGTCCAGTTCTTG+AGG 0.465853 5:+94953518 MsG0580029301.01.T01:CDS
ATGTGATAATGAAATTAAAT+GGG 0.476893 5:+94954181 MsG0580029301.01.T01:CDS
AATATATCGAATCTCTTCGA+TGG 0.485215 5:+94953780 MsG0580029301.01.T01:CDS
AACTAGAAGAACAAGTTGAT+AGG 0.491730 5:+94953001 MsG0580029301.01.T01:CDS
GTGGGATATAACAGTTATTG+TGG 0.495270 5:-94953251 None:intergenic
CCTTGTACTTGAAGAAACTA+AGG 0.497254 5:+94953668 MsG0580029301.01.T01:CDS
CTCTGAATATAAAAGTAGTA+AGG 0.497266 5:-94954241 None:intergenic
TTGTTTGTACAGTTCTGGTA+TGG 0.497877 5:+94955728 MsG0580029301.01.T01:intron
AGACAGCTAGGAACTATTGT+TGG 0.508350 5:-94954209 None:intergenic
TTTATATTCAGAGATTATGA+AGG 0.511985 5:+94954251 MsG0580029301.01.T01:CDS
TCAAATTGTGAAAAGTGTCT+TGG 0.516406 5:+94953185 MsG0580029301.01.T01:CDS
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AATTTATTTCGGAAGTAGCT+GGG 0.527785 5:+94954340 MsG0580029301.01.T01:CDS
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CATATCTAAGCAAAGAAACC+TGG 0.553057 5:-94953814 None:intergenic
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ACTATTGAACTAACCAAGTG+TGG 0.564280 5:-94953270 None:intergenic
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ATATATCGAATCTCTTCGAT+GGG 0.574911 5:+94953781 MsG0580029301.01.T01:CDS
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AAATGCAAAATCTTCAACAA+AGG 0.580978 5:-94953447 None:intergenic
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ACAGCGTCACTAGCCTCACT+TGG 0.603894 5:-94954365 None:intergenic
AGTACAAGGTACTCGAGAAG+AGG 0.610748 5:-94953654 None:intergenic
AAGTAGCTGGGAACCAAGTG+AGG 0.622750 5:+94954352 MsG0580029301.01.T01:CDS
CTATTGAACTAACCAAGTGT+GGG 0.634513 5:-94953269 None:intergenic
CAACAAAGGAAGATGAACAT+GGG 0.649715 5:-94953433 None:intergenic
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AACTAAGGCGAGTAATTACG+TGG 0.699425 5:+94953683 MsG0580029301.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!! TAATTAAGGTTAATTTATTA+GGG + Chr5:94954944-94954963 MsG0580029301.01.T01:intron 10.0%
!! TTAATTAAGGTTAATTTATT+AGG + Chr5:94954943-94954962 MsG0580029301.01.T01:intron 10.0%
!!! TAATTTTCATATATCATAAT+CGG - Chr5:94955351-94955370 None:intergenic 10.0%
!! AACAATGAAAATTAACATAT+AGG - Chr5:94954704-94954723 None:intergenic 15.0%
!!! AATTTTCATTGTTTTGAATT+GGG + Chr5:94954711-94954730 MsG0580029301.01.T01:intron 15.0%
!!! ATGTGATAATGAAATTAAAT+GGG + Chr5:94954181-94954200 MsG0580029301.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATGTGTAAAATTTAAGATAA+TGG + Chr5:94954911-94954930 MsG0580029301.01.T01:intron 15.0%
!!! ATTTTTAAGGTTGATTTATT+AGG + Chr5:94954969-94954988 MsG0580029301.01.T01:intron 15.0%
!!! TAATTTTCATTGTTTTGAAT+TGG + Chr5:94954710-94954729 MsG0580029301.01.T01:intron 15.0%
!!! TATGTGATAATGAAATTAAA+TGG + Chr5:94954180-94954199 MsG0580029301.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTTTAAGGTTGATTTATTA+GGG + Chr5:94954970-94954989 MsG0580029301.01.T01:intron 15.0%
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!! ATTTCCAACATTTAACAATT+TGG + Chr5:94953948-94953967 MsG0580029301.01.T01:CDS 20.0%
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!!! AATAGCGCTATTTTTAATAT+AGG + Chr5:94953854-94953873 MsG0580029301.01.T01:intron 20.0%
!!! ATGGATTAGTATGTTAATTA+AGG + Chr5:94954930-94954949 MsG0580029301.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTTATTAGGGTGATTTTTA+AGG + Chr5:94954956-94954975 MsG0580029301.01.T01:intron 20.0%
!!! CTTTTATTTCTTTTGAGAAA+TGG + Chr5:94955312-94955331 MsG0580029301.01.T01:intron 20.0%
!!! GTTAATGATTTTGATTATGA+TGG + Chr5:94955193-94955212 MsG0580029301.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTAAGTTAGATGATTGATT+AGG + Chr5:94955064-94955083 MsG0580029301.01.T01:intron 20.0%
! AAATGCAAAATCTTCAACAA+AGG - Chr5:94953450-94953469 None:intergenic 25.0%
! AACTGTTGTAAAAATTGCTA+TGG + Chr5:94954599-94954618 MsG0580029301.01.T01:intron 25.0%
! AAGAGGACTACAATTTATTT+CGG + Chr5:94954329-94954348 MsG0580029301.01.T01:CDS 25.0%
! AATAAATTGTAGTCCTCTTA+AGG - Chr5:94954328-94954347 None:intergenic 25.0%
! ACTGTTGTAAAAATTGCTAT+GGG + Chr5:94954600-94954619 MsG0580029301.01.T01:intron 25.0%
! ATGAAGAGTTCAAACTTATA+AGG + Chr5:94954279-94954298 MsG0580029301.01.T01:CDS 25.0%
! CAAAAAACTTCAAATGTCAT+TGG - Chr5:94955669-94955688 None:intergenic 25.0%
! CTCTGAATATAAAAGTAGTA+AGG - Chr5:94954244-94954263 None:intergenic 25.0%
! TAAGTGTCTAAAAATAGAGA+AGG - Chr5:94954474-94954493 None:intergenic 25.0%
! TAGAGATAGATACACATATT+TGG - Chr5:94955283-94955302 None:intergenic 25.0%
! TATTTATGATGAAGATATGC+TGG + Chr5:94955483-94955502 MsG0580029301.01.T01:intron 25.0%
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! TGTTAATCAACTAAATGGTT+CGG + Chr5:94955025-94955044 MsG0580029301.01.T01:intron 25.0%
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!! CTTGAGATTTGGTTAATTAT+CGG + Chr5:94954080-94954099 MsG0580029301.01.T01:intron 25.0%
!! TTAGGGTGATTTTCAAATTA+GGG + Chr5:94954987-94955006 MsG0580029301.01.T01:intron 25.0%
!!! TAGTTCTATTTTTATCCACT+CGG + Chr5:94954536-94954555 MsG0580029301.01.T01:intron 25.0%
!!! TGAACAAAGTTATTTCTTGT+TGG - Chr5:94953168-94953187 None:intergenic 25.0%
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AGTTGATTAACACACTCTAA+GGG - Chr5:94955017-94955036 None:intergenic 30.0%
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ATTGTTGCATTGTTAATTGC+AGG + Chr5:94955585-94955604 MsG0580029301.01.T01:intron 30.0%
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GAATCTTGATAGAACAAGAT+AGG + Chr5:94955511-94955530 MsG0580029301.01.T01:intron 30.0%
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TCAGACTCAGTTAATCTATT+AGG + Chr5:94955103-94955122 MsG0580029301.01.T01:intron 30.0%
TCTCAAGAACTTCAAGATTA+GGG - Chr5:94954041-94954060 None:intergenic 30.0%
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! AAATTGAAAGAAGCACGTAT+TGG + Chr5:94953720-94953739 MsG0580029301.01.T01:CDS 30.0%
! CATAATCCTGTTAACTTTTG+AGG - Chr5:94954417-94954436 None:intergenic 30.0%
! CTTATGATGAAGCTTTTCTA+TGG + Chr5:94953501-94953520 MsG0580029301.01.T01:CDS 30.0%
! GTTAGTTTACTCTTGAGATT+TGG + Chr5:94954069-94954088 MsG0580029301.01.T01:intron 30.0%
! TAGGGTGATTTTCAAATTAG+GGG + Chr5:94954988-94955007 MsG0580029301.01.T01:intron 30.0%
! TGATTAGGATGATGATGAAA+TGG + Chr5:94955079-94955098 MsG0580029301.01.T01:intron 30.0%
! TTCTTGTTGGACAATTTTCA+GGG - Chr5:94953155-94953174 None:intergenic 30.0%
! TTTCTTGTTGGACAATTTTC+AGG - Chr5:94953156-94953175 None:intergenic 30.0%
!! AACTAGAAGAACAAGTTGAT+AGG + Chr5:94953001-94953020 MsG0580029301.01.T01:CDS 30.0%
!! ATAAGGTACATTTTGAAGAG+TGG + Chr5:94954296-94954315 MsG0580029301.01.T01:CDS 30.0%
!! TATTTTTATCCACTCGGATA+GGG + Chr5:94954542-94954561 MsG0580029301.01.T01:intron 30.0%
!! TCAAATTGTGAAAAGTGTCT+TGG + Chr5:94953185-94953204 MsG0580029301.01.T01:CDS 30.0%
AAGACTAATTGTGAGTGGAT+TGG + Chr5:94954875-94954894 MsG0580029301.01.T01:intron 35.0%
ACACGTAACCTCTTTAATGT+AGG - Chr5:94953600-94953619 None:intergenic 35.0%
ACTATTGAACTAACCAAGTG+TGG - Chr5:94953273-94953292 None:intergenic 35.0%
AGTATCATCCGTCACATATA+TGG + Chr5:94955397-94955416 MsG0580029301.01.T01:intron 35.0%
ATTCAGAGATTATGAAGGCA+CGG + Chr5:94954256-94954275 MsG0580029301.01.T01:CDS 35.0%
CAACAAAGGAAGATGAACAT+GGG - Chr5:94953436-94953455 None:intergenic 35.0%
CAAGATAGGAATGATGACTA+TGG + Chr5:94955525-94955544 MsG0580029301.01.T01:intron 35.0%
CAATTTATTTCGGAAGTAGC+TGG + Chr5:94954339-94954358 MsG0580029301.01.T01:CDS 35.0%
CAGGTTTCTTTGCTTAGATA+TGG + Chr5:94953815-94953834 MsG0580029301.01.T01:CDS 35.0%
CATATCTAAGCAAAGAAACC+TGG - Chr5:94953817-94953836 None:intergenic 35.0%
CATTAAAGAGGTTACGTGTT+AGG + Chr5:94953601-94953620 MsG0580029301.01.T01:CDS 35.0%
CCTTAGTTTCTTCAAGTACA+AGG - Chr5:94953671-94953690 None:intergenic 35.0%
CCTTGTACTTGAAGAAACTA+AGG + Chr5:94953668-94953687 MsG0580029301.01.T01:CDS 35.0%
CGACCCAAATTGTTAAATGT+TGG - Chr5:94953955-94953974 None:intergenic 35.0%
CTATTGAACTAACCAAGTGT+GGG - Chr5:94953272-94953291 None:intergenic 35.0%
GAGTTAAGACTAATTGTGAG+TGG + Chr5:94954870-94954889 MsG0580029301.01.T01:intron 35.0%
GTATCATCCGTCACATATAT+GGG + Chr5:94955398-94955417 MsG0580029301.01.T01:intron 35.0%
GTGGGATATAACAGTTATTG+TGG - Chr5:94953254-94953273 None:intergenic 35.0%
GTTACGAGATTGTCTCTTTA+TGG + Chr5:94954643-94954662 MsG0580029301.01.T01:intron 35.0%
TAACTGTTATATCCCACACT+TGG + Chr5:94953257-94953276 MsG0580029301.01.T01:CDS 35.0%
TATCATCCGTCACATATATG+GGG + Chr5:94955399-94955418 MsG0580029301.01.T01:intron 35.0%
TATGAGGAAGTAGAGTTCAA+AGG + Chr5:94953549-94953568 MsG0580029301.01.T01:CDS 35.0%
TATGTGTGCCTACATTAAAG+AGG + Chr5:94953589-94953608 MsG0580029301.01.T01:CDS 35.0%
TCAACAAAGGAAGATGAACA+TGG - Chr5:94953437-94953456 None:intergenic 35.0%
TCTTGAGGAACTTGAATATG+AGG + Chr5:94953533-94953552 MsG0580029301.01.T01:CDS 35.0%
TTAACAAGTTTAACCTTGCG+TGG + Chr5:94954491-94954510 MsG0580029301.01.T01:intron 35.0%
TTATGATGAAGATATGCTGG+AGG + Chr5:94955486-94955505 MsG0580029301.01.T01:intron 35.0%
TTGTATTTGCTTTGCTGATC+AGG + Chr5:94954778-94954797 MsG0580029301.01.T01:intron 35.0%
! AAAAAGCAGCAGAAAAGTAC+AGG - Chr5:94955710-94955729 None:intergenic 35.0%
! CAATAGCTTCTTTTGTTGGT+AGG - Chr5:94953071-94953090 None:intergenic 35.0%
! GGTTAGTTCAATAGTTTGCA+TGG + Chr5:94953278-94953297 MsG0580029301.01.T01:CDS 35.0%
! GTGATTTTTATCCATGTTGC+AGG + Chr5:94953903-94953922 MsG0580029301.01.T01:intron 35.0%
! GTTGCAATAGCTTCTTTTGT+TGG - Chr5:94953075-94953094 None:intergenic 35.0%
! TATTCAAGTTCCTCAAGAAC+TGG - Chr5:94953531-94953550 None:intergenic 35.0%
! TTGTTTGTACAGTTCTGGTA+TGG + Chr5:94955728-94955747 MsG0580029301.01.T01:intron 35.0%
!! CTTTTGTTGGTAGGAATGAA+AGG - Chr5:94953062-94953081 None:intergenic 35.0%
!! GCTTTTTGTTTGTACAGTTC+TGG + Chr5:94955723-94955742 MsG0580029301.01.T01:intron 35.0%
!! GTACATTTTGAAGAGTGGAA+AGG + Chr5:94954301-94954320 MsG0580029301.01.T01:CDS 35.0%
!! TCATCGTAAGTTGATTGATC+AGG + Chr5:94954807-94954826 MsG0580029301.01.T01:intron 35.0%
!!! AACACTCGTTGTTTTGAAGT+TGG + Chr5:94953383-94953402 MsG0580029301.01.T01:CDS 35.0%
!!! CTATTTTTATCCACTCGGAT+AGG + Chr5:94954541-94954560 MsG0580029301.01.T01:intron 35.0%
!!! TCGTTGTTTTGAAGTTGGTT+GGG + Chr5:94953388-94953407 MsG0580029301.01.T01:CDS 35.0%
AAAGGAAGATGAACATGGGA+AGG - Chr5:94953432-94953451 None:intergenic 40.0%
AACTAAGGCGAGTAATTACG+TGG + Chr5:94953683-94953702 MsG0580029301.01.T01:CDS 40.0%
AGACAGCTAGGAACTATTGT+TGG - Chr5:94954212-94954231 None:intergenic 40.0%
ATAAGTAAGCACCTGCAACA+TGG - Chr5:94953917-94953936 None:intergenic 40.0%
ATCATCCGTCACATATATGG+GGG + Chr5:94955400-94955419 MsG0580029301.01.T01:intron 40.0%
CAAGAGCCTCAAAAGTTAAC+AGG + Chr5:94954408-94954427 MsG0580029301.01.T01:CDS 40.0%
CTTAGATATGGATTCCACAG+AGG + Chr5:94953827-94953846 MsG0580029301.01.T01:CDS 40.0%
GGCAAGTAAGCAAAAAGTTG+AGG + Chr5:94953299-94953318 MsG0580029301.01.T01:CDS 40.0%
GGGTGAATTTCTGTTGATGT+TGG + Chr5:94954731-94954750 MsG0580029301.01.T01:intron 40.0%
GTGCGACATCTAGAAATCTT+GGG - Chr5:94954572-94954591 None:intergenic 40.0%
TCGATGGGATTCATAAAACC+AGG + Chr5:94953796-94953815 MsG0580029301.01.T01:CDS 40.0%
! CAACTAGTGTTTTGTCTCGT+AGG + Chr5:94953091-94953110 MsG0580029301.01.T01:CDS 40.0%
! GTGTTGTGATCTCTTTTGAC+AGG + Chr5:94954148-94954167 MsG0580029301.01.T01:intron 40.0%
! TAGTGTTTTGTCTCGTAGGT+GGG + Chr5:94953095-94953114 MsG0580029301.01.T01:CDS 40.0%
!! TCGAAGTTGACTTGATGGTA+TGG + Chr5:94954441-94954460 MsG0580029301.01.T01:intron 40.0%
!!! CTCGTTGTTTTGAAGTTGGT+TGG + Chr5:94953387-94953406 MsG0580029301.01.T01:CDS 40.0%
!!! CTGTTAACTTTTGAGGCTCT+TGG - Chr5:94954410-94954429 None:intergenic 40.0%
AGAGTGGAAAGGTCCTTAAG+AGG + Chr5:94954312-94954331 MsG0580029301.01.T01:CDS 45.0%
AGGAATGATGACTATGGCCT+TGG + Chr5:94955531-94955550 MsG0580029301.01.T01:intron 45.0%
AGGTGTGATGAAAGACAGCT+AGG - Chr5:94954224-94954243 None:intergenic 45.0%
CAAAGTGTATTTGCCTTGCG+AGG + Chr5:94953347-94953366 MsG0580029301.01.T01:CDS 45.0%
CGTGCGACATCTAGAAATCT+TGG - Chr5:94954573-94954592 None:intergenic 45.0%
CTATGGTTGTCCAGTTCTTG+AGG + Chr5:94953518-94953537 MsG0580029301.01.T01:CDS 45.0%
GAACATGGGAAGGAAGATTC+AGG - Chr5:94953422-94953441 None:intergenic 45.0%
TACATATACCGTCTCGACCA+AGG - Chr5:94955551-94955570 None:intergenic 45.0%
! AGTACAAGGTACTCGAGAAG+AGG - Chr5:94953657-94953676 None:intergenic 45.0%
! CTAGTGTTTTGTCTCGTAGG+TGG + Chr5:94953094-94953113 MsG0580029301.01.T01:CDS 45.0%
!! GTGCTTCGAAGTTGACTTGA+TGG + Chr5:94954436-94954455 MsG0580029301.01.T01:CDS 45.0%
!!! AACTTTTGAGGCTCTTGGCA+AGG - Chr5:94954405-94954424 None:intergenic 45.0%
AAGTAGCTGGGAACCAAGTG+AGG + Chr5:94954352-94954371 MsG0580029301.01.T01:CDS 50.0%
ACACGCATTAAGTCCACGCA+AGG - Chr5:94954507-94954526 None:intergenic 50.0%
ATCCGTCACATATATGGGGG+AGG + Chr5:94955403-94955422 MsG0580029301.01.T01:intron 50.0%
CACCTCCCCCATATATGTGA+CGG - Chr5:94955408-94955427 None:intergenic 50.0%
TAGCGCTATTCGTACCTCTG+TGG - Chr5:94953844-94953863 None:intergenic 50.0%
! CTCGTAGGTGGGTTTCTCTT+TGG + Chr5:94953106-94953125 MsG0580029301.01.T01:CDS 50.0%
AACCATGCTGCAGACGAGCA+CGG - Chr5:94955625-94955644 None:intergenic 55.0%
TCGCAAGCGAAAACCTCGCA+AGG - Chr5:94953363-94953382 None:intergenic 55.0%
TGAGGCTAGTGACGCTGTGA+CGG + Chr5:94954370-94954389 MsG0580029301.01.T01:CDS 55.0%
TTGGGACATCCCTATCCGAG+TGG - Chr5:94954554-94954573 None:intergenic 55.0%
! ACAGCGTCACTAGCCTCACT+TGG - Chr5:94954368-94954387 None:intergenic 55.0%
! GACTATGGCCTTGGTCGAGA+CGG + Chr5:94955540-94955559 MsG0580029301.01.T01:intron 55.0%
CTCCGTGCTCGTCTGCAGCA+TGG + Chr5:94955620-94955639 MsG0580029301.01.T01:intron 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 94952988 94955760 94952988 ID=MsG0580029301.01;Name=MsG0580029301.01
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Chr5 exon 94952988 94953848 94952988 ID=MsG0580029301.01.T01:exon:49954;Parent=MsG0580029301.01.T01
Chr5 exon 94953925 94954068 94953925 ID=MsG0580029301.01.T01:exon:49955;Parent=MsG0580029301.01.T01
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Chr5 exon 94955740 94955760 94955740 ID=MsG0580029301.01.T01:exon:49957;Parent=MsG0580029301.01.T01
Chr5 CDS 94952988 94953848 94952988 ID=MsG0580029301.01.T01:cds;Parent=MsG0580029301.01.T01
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Chr5 CDS 94955740 94955760 94955740 ID=MsG0580029301.01.T01:cds;Parent=MsG0580029301.01.T01
Gene Sequence

>MsG0580029301.01.T01

ATGGCTAAAAGAAAACTAGAAGAACAAGTTGATAGGATCAGTAGTTTACACAATGAAGTACTTGCTAATATCCTTTCATTCCTACCAACAAAAGAAGCTATTGCAACTAGTGTTTTGTCTCGTAGGTGGGTTTCTCTTTGGACTCTTACTAATTCTCTTCATTTCCCTGAAAATTGTCCAACAAGAAATAACTTTGTTCAAATTGTGAAAAGTGTCTTGGCTCAAAGAAAATCATGTTGCATGAAAAGAGTTTCATTCTCTATCCACAATAACTGTTATATCCCACACTTGGTTAGTTCAATAGTTTGCATGGCAAGTAAGCAAAAAGTTGAGGAGATAGATCTTTCTTTATGTAGTTTCAAAGTGTATTTGCCTTGCGAGGTTTTCGCTTGCGAAACACTCGTTGTTTTGAAGTTGGTTGGGAGATTTTACCTGAATCTTCCTTCCCATGTTCATCTTCCTTTGTTGAAGATTTTGCATTTATGTATTTCGTGCATTGTTGAAGATAAAGCTCTTATGATGAAGCTTTTCTATGGTTGTCCAGTTCTTGAGGAACTTGAATATGAGGAAGTAGAGTTCAAAGGTCGTTCTTTGTTTAAAATATGTGTGCCTACATTAAAGAGGTTACGTGTTAGGAGTTTTGATGAAAAACTTCACATTAACACTCCTCTTCTCGAGTACCTTGTACTTGAAGAAACTAAGGCGAGTAATTACGTGGTTGAGAATATGAACAAATTGAAAGAAGCACGTATTGGTATCTATTTTGATCATGAAAATAAAGAAGTAAAACAAAATATATCGAATCTCTTCGATGGGATTCATAAAACCAGGTTTCTTTGCTTAGATATGGATTCCACAGAGGTGCTTACTTATGCTTGTCTAGAATTTCCAACATTTAACAATTTGGGTCGTCTACAATTATATTTAAAAACCTTTAACTCTAATTTTCTAGTTAAACTGTTACTAGAAAAATGCCCTAATCTTGAAGTTCTTGAGATTATTAAGGTTGATGAACTATGTGATAATGAAATTAAATGGGCAGAACCAACAATAGTTCCTAGCTGTCTTTCATCACACCTTACTACTTTTATATTCAGAGATTATGAAGGCACGGATGAAGAGTTCAAACTTATAAGGTACATTTTGAAGAGTGGAAAGGTCCTTAAGAGGACTACAATTTATTTCGGAAGTAGCTGGGAACCAAGTGAGGCTAGTGACGCTGTGACGGACTTATATTCCTTGCCAAGAGCCTCAAAAGTTAACAGGATTATGTGCTTCGAAGTTGACTTGATGTTCTGGTATGGTGCTTTGTAA
Protein sequence

>MsG0580029301.01.T01

MAKRKLEEQVDRISSLHNEVLANILSFLPTKEAIATSVLSRRWVSLWTLTNSLHFPENCPTRNNFVQIVKSVLAQRKSCCMKRVSFSIHNNCYIPHLVSSIVCMASKQKVEEIDLSLCSFKVYLPCEVFACETLVVLKLVGRFYLNLPSHVHLPLLKILHLCISCIVEDKALMMKLFYGCPVLEELEYEEVEFKGRSLFKICVPTLKRLRVRSFDEKLHINTPLLEYLVLEETKASNYVVENMNKLKEARIGIYFDHENKEVKQNISNLFDGIHKTRFLCLDMDSTEVLTYACLEFPTFNNLGRLQLYLKTFNSNFLVKLLLEKCPNLEVLEIIKVDELCDNEIKWAEPTIVPSCLSSHLTTFIFRDYEGTDEEFKLIRYILKSGKVLKRTTIYFGSSWEPSEASDAVTDLYSLPRASKVNRIMCFEVDLMFWYGAL*