AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680033673.01

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MsG0680033673.01.T01 AT1G63230 29.747 316 218 1 249 564 1 312 1.15e-46 167
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MsG0680033673.01.T01 AT1G63230 22.353 170 130 1 47 214 143 312 1.68e-11 66.2
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MsG0680033673.01.T01 AT3G16710 30.872 298 206 0 273 570 63 360 1.21e-46 170
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MsG0680033673.01.T01 AT3G16710 29.000 200 141 1 368 567 54 252 4.49e-20 93.6
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MsG0680033673.01.T01 AT4G11690 28.384 458 284 4 56 474 102 554 1.49e-63 219
MsG0680033673.01.T01 AT4G11690 31.054 351 241 1 220 570 91 440 9.20e-57 201
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MsG0680033673.01.T01 AT1G13630 30.267 337 225 3 234 568 177 505 1.10e-43 167
MsG0680033673.01.T01 AT1G13630 27.692 195 134 2 375 569 178 365 1.41e-20 96.7
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MsG0680033673.01.T01 AT4G01570 25.874 429 287 5 145 564 84 490 2.16e-33 136
MsG0680033673.01.T01 AT4G01570 22.837 416 272 7 89 486 133 517 8.40e-30 125
MsG0680033673.01.T01 AT4G01570 22.754 501 359 7 81 568 210 695 3.14e-29 123
MsG0680033673.01.T01 AT4G01570 24.837 459 309 10 64 490 340 794 2.75e-26 114
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MsG0680033673.01.T01 AT5G50280 27.596 366 255 4 191 550 276 637 3.38e-33 135
MsG0680033673.01.T01 AT5G50280 21.853 421 288 5 105 488 264 680 2.21e-27 117
MsG0680033673.01.T01 AT5G50280 22.475 396 300 3 65 453 290 685 2.56e-27 117
MsG0680033673.01.T01 AT5G50280 21.698 318 200 6 49 319 371 686 3.42e-15 79.3
MsG0680033673.01.T01 AT5G50280 25.980 204 150 1 367 569 242 445 2.26e-14 77.0
MsG0680033673.01.T01 AT1G53330 28.931 318 188 5 200 481 26 341 7.92e-39 147
MsG0680033673.01.T01 AT1G53330 30.976 297 203 2 256 551 46 341 9.04e-38 144
MsG0680033673.01.T01 AT1G53330 27.653 311 217 3 115 421 45 351 6.04e-33 130
MsG0680033673.01.T01 AT1G53330 19.388 294 200 3 65 322 65 357 7.55e-15 77.0
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MsG0680033673.01.T01 AT1G53330 30.976 297 203 2 256 551 150 445 2.55e-37 145
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MsG0680033673.01.T01 AT3G15200 20.870 345 235 5 167 474 154 497 2.42e-19 92.0
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MsG0680033673.01.T01 AT2G17670 27.347 245 169 4 331 568 88 330 3.67e-26 110
MsG0680033673.01.T01 AT2G17670 25.381 197 146 1 112 307 153 349 7.88e-17 82.8
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MsG0680033673.01.T01 AT5G14080 22.535 426 322 4 148 569 77 498 3.50e-24 107
MsG0680033673.01.T01 AT3G49240 21.344 506 330 7 62 563 109 550 1.83e-32 132
MsG0680033673.01.T01 AT3G49240 23.841 302 218 5 274 564 111 411 1.07e-21 99.8
MsG0680033673.01.T01 AT3G49240 21.277 329 239 8 254 567 161 484 5.59e-15 78.6
MsG0680033673.01.T01 AT3G49240 21.795 234 175 4 59 285 284 516 3.53e-11 66.6
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MsG0680033673.01.T01 AT1G73710 24.937 397 290 3 153 545 305 697 7.88e-31 129
MsG0680033673.01.T01 AT1G73710 21.557 501 352 5 64 526 321 818 3.07e-29 124
MsG0680033673.01.T01 AT1G73710 18.773 538 380 9 51 545 382 905 1.11e-20 97.4
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MsG0680033673.01.T01 AT1G08070 21.739 322 209 7 91 411 100 379 4.39e-11 66.2
MsG0680033673.01.T01 AT3G17370 26.887 212 142 2 245 456 1 199 6.28e-28 112
MsG0680033673.01.T01 AT3G17370 27.404 208 138 2 280 487 1 195 1.71e-26 107
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MsG0680033673.01.T01 AT5G27270 20.777 515 358 7 86 562 261 763 3.20e-13 73.6
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MsG0680033673.01.T01 AT1G10910 26.452 310 224 3 257 564 131 438 6.34e-24 106
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MsG0680033673.01.T01 AT1G10910 26.699 206 136 4 377 575 145 342 3.83e-16 82.4
MsG0680033673.01.T01 AT5G27270 21.852 540 376 8 64 565 484 1015 2.58e-25 112
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MsG0680033673.01.T01 AT5G27270 20.654 489 338 9 119 569 469 945 4.82e-23 104
MsG0680033673.01.T01 AT5G27270 20.777 515 358 7 86 562 261 763 3.85e-13 73.2
MsG0680033673.01.T01 AT1G10910 23.834 386 293 1 87 471 170 555 2.79e-25 111
MsG0680033673.01.T01 AT1G10910 23.565 331 217 1 207 501 150 480 1.13e-24 109
MsG0680033673.01.T01 AT1G10910 26.452 310 224 3 257 564 131 438 7.26e-24 106
MsG0680033673.01.T01 AT1G10910 24.138 290 206 6 293 574 98 381 3.11e-16 82.8
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MsG0680033673.01.T01 AT1G80880 23.885 314 227 5 123 432 194 499 1.30e-21 99.4
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MsG0680033673.01.T01 AT3G62890 22.560 461 328 11 119 565 25 470 4.57e-23 103
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MsG0680033673.01.T01 AT1G06143 24.638 345 207 7 256 565 89 415 6.81e-21 97.1
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MsG0680033673.01.T01 AT4G38010 21.410 383 285 5 186 567 69 436 7.71e-17 84.3
MsG0680033673.01.T01 AT4G38010 21.445 443 328 8 59 497 47 473 1.10e-16 84.0
MsG0680033673.01.T01 AT5G52850 19.023 573 335 11 82 547 88 638 1.23e-22 103
MsG0680033673.01.T01 AT5G52850 20.729 521 350 12 67 547 209 706 3.95e-22 101
MsG0680033673.01.T01 AT5G52850 22.936 327 230 9 73 395 417 725 6.82e-14 75.5
MsG0680033673.01.T01 AT3G29230 24.938 405 253 12 100 504 134 487 1.30e-22 102
MsG0680033673.01.T01 AT3G29230 25.490 306 208 6 244 547 37 324 4.33e-21 97.8
MsG0680033673.01.T01 AT3G29230 23.150 419 261 11 164 545 29 423 2.39e-20 95.5
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MsG0680033673.01.T01 AT3G15930 18.509 389 299 6 89 475 172 544 8.71e-15 78.2
MsG0680033673.01.T01 AT2G22070 22.010 418 311 7 117 532 242 646 1.63e-20 96.7
MsG0680033673.01.T01 AT2G22070 20.504 556 348 15 79 561 76 610 2.88e-18 89.4
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MsG0680033673.01.T01 AT5G03560 26.797 153 107 3 175 326 188 336 1.28e-11 67.0
MsG0680033673.01.T01 AT3G02010 20.404 446 294 10 142 547 37 461 5.18e-18 88.6
MsG0680033673.01.T01 AT3G48250 24.460 278 203 4 258 530 263 538 6.13e-18 88.2
MsG0680033673.01.T01 AT3G48250 26.068 234 163 5 212 443 359 584 9.13e-17 84.3
MsG0680033673.01.T01 AT3G48250 21.569 306 229 4 270 564 232 537 6.99e-15 78.2
MsG0680033673.01.T01 AT3G48250 27.053 207 149 1 365 569 265 471 4.09e-13 72.8
MsG0680033673.01.T01 AT2G18520 23.022 278 204 4 290 562 96 368 7.07e-18 86.7
MsG0680033673.01.T01 AT2G18520 23.311 296 216 5 40 330 91 380 5.90e-17 84.0
MsG0680033673.01.T01 AT2G18520 23.235 439 252 17 48 450 28 417 1.28e-16 82.8
MsG0680033673.01.T01 AT2G20540 22.475 396 248 9 107 497 36 377 7.52e-18 87.4
MsG0680033673.01.T01 AT2G20540 23.967 242 167 5 83 319 145 374 2.04e-14 76.6
MsG0680033673.01.T01 AT5G61370 24.696 247 177 3 257 495 172 417 7.92e-18 87.0
MsG0680033673.01.T01 AT5G61370 23.721 215 157 2 362 569 137 351 1.12e-15 80.5
MsG0680033673.01.T01 AT5G61370 23.143 350 219 6 85 423 105 415 1.71e-15 79.7
MsG0680033673.01.T01 AT5G61370 22.222 279 210 1 295 566 140 418 1.85e-14 76.6
MsG0680033673.01.T01 AT5G61370 23.618 199 145 1 60 251 220 418 8.70e-11 65.1
MsG0680033673.01.T01 AT2G29760 20.961 458 342 8 111 564 87 528 8.44e-18 87.8
MsG0680033673.01.T01 AT2G21090 22.772 404 248 13 150 545 141 488 9.53e-18 87.4
MsG0680033673.01.T01 AT3G14730 23.095 433 268 10 176 564 83 494 9.99e-18 87.4
MsG0680033673.01.T01 AT3G14730 20.497 322 203 7 111 424 218 494 3.55e-15 79.3
MsG0680033673.01.T01 AT2G13600 23.768 345 232 8 223 561 55 374 1.00e-17 87.4
MsG0680033673.01.T01 AT2G13600 25.108 231 161 4 317 547 44 262 1.15e-15 80.9
MsG0680033673.01.T01 AT2G13600 19.954 431 270 11 150 547 114 502 4.21e-15 79.3
MsG0680033673.01.T01 AT4G21170 22.488 418 274 9 66 440 171 581 1.11e-17 87.0
MsG0680033673.01.T01 AT4G21170 21.244 386 256 7 226 569 191 570 2.36e-11 67.0
MsG0680033673.01.T01 AT4G21170 20.144 417 318 9 137 545 172 581 4.12e-11 66.2
MsG0680033673.01.T01 AT3G13880 18.786 527 368 9 79 561 109 619 1.16e-17 87.4
MsG0680033673.01.T01 AT3G13880 20.165 486 323 15 128 569 92 556 5.76e-15 79.0
MsG0680033673.01.T01 AT3G13880 22.581 248 172 5 115 359 421 651 6.12e-12 69.3
MsG0680033673.01.T01 AT5G13270 19.796 490 329 14 104 549 98 567 1.29e-17 87.4
MsG0680033673.01.T01 AT5G59200 25.321 312 201 7 242 547 80 365 1.65e-17 86.3
MsG0680033673.01.T01 AT5G59200 20.721 444 315 13 62 498 75 488 3.46e-15 79.0
MsG0680033673.01.T01 AT2G39620 17.117 444 356 4 88 530 336 768 1.65e-17 87.0
MsG0680033673.01.T01 AT2G39620 18.786 527 326 11 118 567 233 734 1.51e-14 77.4
MsG0680033673.01.T01 AT2G39620 27.835 194 125 5 229 413 29 216 2.65e-13 73.6
MsG0680033673.01.T01 AT5G08510 22.368 380 277 8 119 495 48 412 1.72e-17 86.3
MsG0680033673.01.T01 AT5G08510 24.918 305 217 4 261 564 50 343 6.49e-17 84.3
MsG0680033673.01.T01 AT1G22830 21.991 432 300 10 117 533 249 658 1.99e-17 86.7
MsG0680033673.01.T01 AT1G22830 21.134 388 285 8 166 547 162 534 2.40e-12 70.5
MsG0680033673.01.T01 AT1G22830 21.991 432 300 10 117 533 249 658 1.99e-17 86.7
MsG0680033673.01.T01 AT1G22830 21.134 388 285 8 166 547 162 534 2.40e-12 70.5
MsG0680033673.01.T01 AT3G06430 24.189 339 204 9 273 567 106 435 2.36e-17 85.5
MsG0680033673.01.T01 AT3G06430 22.936 327 244 6 242 563 143 466 4.72e-17 84.7
MsG0680033673.01.T01 AT3G06430 21.829 339 257 4 149 482 120 455 4.70e-16 81.6
MsG0680033673.01.T01 AT1G77010 20.487 493 327 12 109 564 113 577 2.47e-17 86.3
MsG0680033673.01.T01 AT1G77010 19.708 548 358 16 79 565 120 646 2.65e-15 79.7
MsG0680033673.01.T01 AT3G49142 21.235 405 262 8 184 547 31 419 3.28e-17 85.9
MsG0680033673.01.T01 AT3G49142 20.854 398 298 7 111 504 97 481 3.81e-15 79.3
MsG0680033673.01.T01 AT3G47840 19.101 445 338 8 64 505 159 584 4.15e-17 85.5
MsG0680033673.01.T01 AT2G36980 21.031 485 317 14 64 541 7 432 4.45e-17 85.1
MsG0680033673.01.T01 AT2G36980 18.868 424 315 9 152 569 25 425 3.80e-14 75.9
MsG0680033673.01.T01 AT4G37380 27.667 300 195 9 252 547 89 370 4.46e-17 85.5
MsG0680033673.01.T01 AT4G37380 23.342 377 235 11 114 487 91 416 3.15e-13 73.2
MsG0680033673.01.T01 AT5G19020 19.922 512 333 9 117 564 106 604 5.11e-17 85.1
MsG0680033673.01.T01 AT5G19020 19.347 429 293 9 79 504 235 613 2.00e-15 80.1
MsG0680033673.01.T01 AT5G19020 22.603 292 203 8 282 569 64 336 3.07e-13 73.2
MsG0680033673.01.T01 AT3G57430 21.412 425 309 10 147 564 91 497 5.66e-17 85.5
MsG0680033673.01.T01 AT3G57430 21.458 480 307 12 120 547 166 627 6.67e-16 82.0
MsG0680033673.01.T01 AT3G57430 23.373 338 228 8 144 465 431 753 4.01e-12 69.7
MsG0680033673.01.T01 AT5G66520 21.760 409 252 11 117 481 114 498 6.15e-17 84.7
MsG0680033673.01.T01 AT5G66520 19.951 411 308 9 140 547 33 425 1.14e-16 84.0
MsG0680033673.01.T01 AT5G66520 20.513 390 263 6 115 504 77 419 3.19e-16 82.4
MsG0680033673.01.T01 AT4G25270 21.614 347 230 9 242 558 146 480 6.16e-17 84.3
MsG0680033673.01.T01 AT4G25270 21.671 383 241 13 226 569 163 525 9.76e-13 71.2
MsG0680033673.01.T01 AT4G25270 20.157 382 285 9 119 498 161 524 2.24e-12 70.1
MsG0680033673.01.T01 AT2G36980 21.206 481 313 14 68 541 20 441 7.01e-17 84.7
MsG0680033673.01.T01 AT2G36980 18.868 424 315 9 152 569 34 434 5.32e-14 75.5
MsG0680033673.01.T01 AT3G22690 21.415 509 349 15 53 547 8 479 7.23e-17 85.1
MsG0680033673.01.T01 AT3G22690 22.454 383 273 9 137 512 321 686 1.70e-11 67.8
MsG0680033673.01.T01 AT5G47460 23.202 431 239 11 148 541 50 425 8.40e-17 84.3
MsG0680033673.01.T01 AT5G47460 21.833 371 252 10 51 405 81 429 6.07e-15 78.6
MsG0680033673.01.T01 AT3G05240 22.099 543 346 14 66 584 17 506 9.25e-17 84.0
MsG0680033673.01.T01 AT2G40720 20.804 423 317 7 86 504 341 749 9.93e-17 84.7
MsG0680033673.01.T01 AT2G40720 22.374 438 322 5 112 547 266 687 1.38e-12 71.2
MsG0680033673.01.T01 AT2G33680 23.624 436 274 11 117 547 227 608 1.06e-16 84.3
MsG0680033673.01.T01 AT2G33680 21.362 426 311 8 64 483 275 682 4.27e-16 82.4
MsG0680033673.01.T01 AT2G33680 23.355 471 289 13 117 580 216 621 1.13e-16 84.3
MsG0680033673.01.T01 AT2G33680 21.362 426 311 8 64 483 264 671 4.38e-16 82.4
MsG0680033673.01.T01 AT2G33680 23.355 471 289 13 117 580 216 621 1.13e-16 84.3
MsG0680033673.01.T01 AT2G33680 21.362 426 311 8 64 483 264 671 4.38e-16 82.4

Find 117 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 379 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GATCAATGGTCTTTGTTTAA+AGG 0.133527 6:-70835046 MsG0680033673.01.T01:CDS
ATAACCCATCTTGAGAATTT+TGG 0.140394 6:+70836148 None:intergenic
ATGAAAGGTTTGTGTCTTAA+TGG 0.180312 6:-70836095 MsG0680033673.01.T01:CDS
AGCTACAATATCATTATTAA+TGG 0.202684 6:-70835480 MsG0680033673.01.T01:CDS
TATTTCCCTTTCTCACAAAT+TGG 0.207055 6:-70836267 MsG0680033673.01.T01:CDS
ATCAATGGACTGTGCAAAAT+TGG 0.218850 6:-70835990 MsG0680033673.01.T01:CDS
AATTGGAATTCAATGAAATT+AGG 0.243491 6:-70836250 MsG0680033673.01.T01:CDS
TTCGGTTCCTCTTATTAATA+TGG 0.246650 6:+70839217 None:intergenic
TGTTACATATAATACATTAA+TGG 0.273502 6:-70835589 MsG0680033673.01.T01:CDS
CCTAGCTAATGAAGTGAATA+AGG 0.285527 6:-70835556 MsG0680033673.01.T01:CDS
ATCAATGGTCTTTGTTTAAA+GGG 0.291889 6:-70835045 MsG0680033673.01.T01:CDS
ATGTTGTATGTGGTCATATT+TGG 0.300761 6:+70835177 None:intergenic
GAGAAAGATTGATGGTAAAT+TGG 0.321847 6:-70835940 MsG0680033673.01.T01:CDS
AAGGCTATAATTTAACTGTT+TGG 0.327400 6:-70835083 MsG0680033673.01.T01:CDS
TGGCTTATGTAAGATTAAAA+TGG 0.329393 6:-70835460 MsG0680033673.01.T01:CDS
AAACATGTATTCAACATCAT+AGG 0.335413 6:-70835531 MsG0680033673.01.T01:CDS
CAATTAGATCAAGTTAGTTA+TGG 0.343097 6:-70836020 MsG0680033673.01.T01:CDS
CATAAGTGTAGTCAAGGTTA+TGG 0.360101 6:+70836115 None:intergenic
TGAATTCCAATTTGTGAGAA+AGG 0.362980 6:+70836261 None:intergenic
GTTTCATAAGTTACAACATC+TGG 0.363192 6:+70834967 None:intergenic
ATATTAAAAGTATAAACATT+TGG 0.371253 6:+70835702 None:intergenic
ACTTACAATTCTCTCATTGA+TGG 0.378731 6:-70835375 MsG0680033673.01.T01:CDS
TCGGTTCCTCTTATTAATAT+GGG 0.379618 6:+70839218 None:intergenic
TCATATTTGGTTGAATTCCT+TGG 0.389426 6:+70835190 None:intergenic
ATTTGGTTTGTTCCATCAAA+TGG 0.391410 6:-70835742 MsG0680033673.01.T01:CDS
ATAGCATTATCAACAGTATT+GGG 0.407266 6:+70836392 None:intergenic
AATAGCATTATCAACAGTAT+TGG 0.419239 6:+70836391 None:intergenic
TGTCTTCCATCTTTGACAGC+AGG 0.419826 6:+70835001 None:intergenic
CCTCTCATTCCGATGTGATT+CGG 0.420366 6:+70839199 None:intergenic
GAATTGTAAGTTACCTCATC+AGG 0.421044 6:+70835387 None:intergenic
TGTTGACAAGGCAATTGAAT+TGG 0.423838 6:-70835229 MsG0680033673.01.T01:CDS
GGTCAACTGAAAGAAGCATT+TGG 0.434255 6:-70835759 MsG0680033673.01.T01:CDS
TCAATGGACTGTGCAAAATT+GGG 0.435585 6:-70835989 MsG0680033673.01.T01:CDS
CAGATAGTGCCCGTTCCAAC+TGG 0.438966 6:+70839251 None:intergenic
ATTGGTCGATGCTCTTTGTA+AGG 0.442342 6:-70835679 MsG0680033673.01.T01:CDS
ATGATTTCAAATTAAAACTA+AGG 0.446243 6:+70834707 None:intergenic
GCACTAAAAGTGACAACATC+AGG 0.449764 6:+70835807 None:intergenic
CCGAATCACATCGGAATGAG+AGG 0.451887 6:-70839199 MsG0680033673.01.T01:CDS
CACGACCATGTGGTGGCAAA+GGG 0.452263 6:-70836047 MsG0680033673.01.T01:CDS
GGGAAATAACAGTGGGGTAA+TGG 0.455888 6:+70836282 None:intergenic
ATTGGCCAAAATTCTCAAGA+TGG 0.464596 6:-70836153 MsG0680033673.01.T01:CDS
TTTGCACAGTCCATTGATCA+AGG 0.466529 6:+70835995 None:intergenic
AGATTCCCGCCAGTTGGAAC+GGG 0.467856 6:-70839260 MsG0680033673.01.T01:CDS
CCTTATTCACTTCATTAGCT+AGG 0.469067 6:+70835556 None:intergenic
TTTACATAAAGCATGTAAGA+AGG 0.474082 6:+70835260 None:intergenic
AGTTATGGAACCTTGATCAA+TGG 0.476010 6:-70836005 MsG0680033673.01.T01:CDS
CAAATGTTGAGAAAGATTGA+TGG 0.476762 6:-70835948 MsG0680033673.01.T01:CDS
GTCGATGCTCTTTGTAAGGA+TGG 0.484400 6:-70835675 MsG0680033673.01.T01:CDS
GTAGTCAAGGTTATGGTATC+GGG 0.487266 6:+70836122 None:intergenic
CTGTAAGTGATTACATTGGC+AGG 0.487788 6:+70835285 None:intergenic
GAATTCCAATTTGTGAGAAA+GGG 0.487872 6:+70836262 None:intergenic
GATGACCCCATATTAATAAG+AGG 0.488653 6:-70839224 MsG0680033673.01.T01:CDS
CATTTCAGAATATAACTCAT+AGG 0.490638 6:+70835848 None:intergenic
AATCTTTCTCAACATTTGCA+AGG 0.493291 6:+70835953 None:intergenic
GGGAATCTTTCGTATCCAAC+TGG 0.493633 6:+70839275 None:intergenic
ACAGTAGCAATTAATTAAGA+TGG 0.495218 6:+70836208 None:intergenic
GCCAATATAGAAAAGGCAAA+AGG 0.496352 6:+70836170 None:intergenic
TGTAGTCAAGGTTATGGTAT+CGG 0.497160 6:+70836121 None:intergenic
ACATATAATACATTAATGGA+TGG 0.504936 6:-70835585 MsG0680033673.01.T01:CDS
TATTCAACATCATAGGGAAA+AGG 0.508671 6:-70835524 MsG0680033673.01.T01:CDS
GTCTTCCATCTTTGACAGCA+GGG 0.508745 6:+70835002 None:intergenic
AAGATTCCCGCCAGTTGGAA+CGG 0.512793 6:-70839261 MsG0680033673.01.T01:CDS
TCACGACCATGTGGTGGCAA+AGG 0.516020 6:-70836048 MsG0680033673.01.T01:CDS
AGGTTTGTGTCTTAATGGTA+AGG 0.517066 6:-70836090 MsG0680033673.01.T01:CDS
AACATGTATTCAACATCATA+GGG 0.518579 6:-70835530 MsG0680033673.01.T01:CDS
TCTCATACCTACACGGCCTC+CGG 0.519687 6:+70839173 None:intergenic
ATCGATGGACTATGCAAAGA+AGG 0.523361 6:-70835150 MsG0680033673.01.T01:CDS
TCTTCATTCAATCACATGAT+CGG 0.526554 6:-70836368 MsG0680033673.01.T01:CDS
ATATTGTAGCTGTGAACATC+AGG 0.527233 6:+70835492 None:intergenic
CAGAGAGAATCTCTCATGCA+TGG 0.528390 6:-70835341 MsG0680033673.01.T01:CDS
TTGGCCAAAATTCTCAAGAT+GGG 0.528637 6:-70836152 MsG0680033673.01.T01:CDS
ATCTTTCGTATCCAACTGGC+GGG 0.530975 6:+70839279 None:intergenic
TTTAATGAAATGTGTTGCAA+AGG 0.531764 6:-70835417 MsG0680033673.01.T01:CDS
ACATATAATATCATGATCAA+TGG 0.532469 6:-70835060 MsG0680033673.01.T01:CDS
TACGAAAGATTCCCGCCAGT+TGG 0.532792 6:-70839266 MsG0680033673.01.T01:CDS
ACCTTGACTACACTTATGAA+AGG 0.536414 6:-70836110 MsG0680033673.01.T01:CDS
ACATCGGAATGAGAGGGATC+CGG 0.538560 6:-70839192 MsG0680033673.01.T01:CDS
GCTTTCGATATCCCGCCAGT+TGG 0.540877 6:-70839290 MsG0680033673.01.T01:CDS
TAGTGCCCGTTCCAACTGGC+GGG 0.541597 6:+70839255 None:intergenic
CGGTTCCTCTTATTAATATG+GGG 0.544382 6:+70839219 None:intergenic
ACCTTTCATAAGTGTAGTCA+AGG 0.546930 6:+70836109 None:intergenic
TGGAACGGGCACTATCTGTA+AGG 0.549868 6:-70839246 MsG0680033673.01.T01:CDS
TGTGACCCTGCTGTCAAAGA+TGG 0.552892 6:-70835007 MsG0680033673.01.T01:CDS
CTTGATCAGATGCATGATAG+AGG 0.554315 6:-70835312 MsG0680033673.01.T01:CDS
ATCGATAAGTATGTTGTATG+TGG 0.556853 6:+70835167 None:intergenic
TTGTTAAATTGAATGATGGA+TGG 0.565024 6:+70836332 None:intergenic
TGAGAAAGGGAAATAACAGT+GGG 0.573281 6:+70836275 None:intergenic
ACATACAACATACTTATCGA+TGG 0.576873 6:-70835165 MsG0680033673.01.T01:CDS
AATTGAATGATGGATGGAGT+AGG 0.582857 6:+70836338 None:intergenic
CATATAATACATTAATGGAT+GGG 0.587385 6:-70835584 MsG0680033673.01.T01:CDS
GAAATCCCTTTGCCACCACA+TGG 0.587668 6:+70836042 None:intergenic
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CATTTCATTAAAGAGACTCA+AGG 0.597113 6:+70835428 None:intergenic
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ATAGTGCCCGTTCCAACTGG+CGG 0.622059 6:+70839254 None:intergenic
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GGAGCTGTAAGTGATTACAT+TGG 0.674058 6:+70835281 None:intergenic
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GAGAAAGGGAAATAACAGTG+GGG 0.758252 6:+70836276 None:intergenic

CRISPR-GE

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!! ATTTATTATTATTATTATAA+AGG - Chr6:70836712-70836731 MsG0680033673.01.T01:intron 0.0%
!! TAATATTATATTATAAATTA+TGG + Chr6:70835930-70835949 None:intergenic 0.0%
!! ATTAAAAAAATTATTCAATG+CGG + Chr6:70837009-70837028 None:intergenic 10.0%
!! ATTAAAATGAATGAATAATT+AGG + Chr6:70839242-70839261 None:intergenic 10.0%
!! TATTAAAGTGAATATATTAT+TGG + Chr6:70837083-70837102 None:intergenic 10.0%
!!! ATATTAAAAGTATAAACATT+TGG + Chr6:70838328-70838347 None:intergenic 10.0%
!!! TGTTTATACTTTTAATATAT+TGG - Chr6:70838330-70838349 MsG0680033673.01.T01:intron 10.0%
!! TAAAAGAAAATAAATGATGT+TGG - Chr6:70836812-70836831 MsG0680033673.01.T01:intron 15.0%
!! TAGCCAAAATAATAAATTAA+AGG + Chr6:70836574-70836593 None:intergenic 15.0%
!! TGTTACATATAATACATTAA+TGG - Chr6:70838438-70838457 MsG0680033673.01.T01:intron 15.0%
!! TTAAAAAAATTATTCAATGC+GGG + Chr6:70837008-70837027 None:intergenic 15.0%
!!! AATGGTTTTATAATTAAGAA+TGG - Chr6:70836224-70836243 MsG0680033673.01.T01:CDS 15.0%
!!! AATTTTGTTAAATTGAATGA+TGG + Chr6:70837702-70837721 None:intergenic 15.0%
!!! ATTTTTAATTTGCACAAAAA+AGG - Chr6:70836737-70836756 MsG0680033673.01.T01:intron 15.0%
!!! CAACCTTTAATTTATTATTT+TGG - Chr6:70836568-70836587 MsG0680033673.01.T01:intron 15.0%
!!! GATTTTTTTTTTTTGAAAGA+CGG - Chr6:70836683-70836702 MsG0680033673.01.T01:intron 15.0%
!!! TTGTTTTTGTCTAATAAAAA+GGG + Chr6:70836517-70836536 None:intergenic 15.0%
!!! TTTGTTTTTGTCTAATAAAA+AGG + Chr6:70836518-70836537 None:intergenic 15.0%
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!! AAATTGTGTATCTTTGAATT+AGG - Chr6:70835641-70835660 MsG0680033673.01.T01:CDS 20.0%
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!! ATGATGAATAAATAGCTAAA+CGG - Chr6:70835787-70835806 MsG0680033673.01.T01:CDS 20.0%
!! ATGGTAAAAGTAAAAATATC+TGG + Chr6:70837803-70837822 None:intergenic 20.0%
!! TAAAAAAATTATTCAATGCG+GGG + Chr6:70837007-70837026 None:intergenic 20.0%
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!! TAAAAATGATGAGAATGATA+AGG - Chr6:70839101-70839120 MsG0680033673.01.T01:intron 20.0%
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!! TAATTCATGAAATTGAAAGA+GGG + Chr6:70835132-70835151 None:intergenic 20.0%
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!! TTAATTCATGAAATTGAAAG+AGG + Chr6:70835133-70835152 None:intergenic 20.0%
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!!! AATTTTACAGTGAAATCAAA+AGG + Chr6:70835397-70835416 None:intergenic 20.0%
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!!! ATCATTTCTTGTTACTTATT+AGG - Chr6:70839185-70839204 MsG0680033673.01.T01:CDS 20.0%
!!! CATATAATACATTAATGGAT+GGG - Chr6:70838443-70838462 MsG0680033673.01.T01:intron 20.0%
!!! GTATTTTAGTGCATAATATT+GGG + Chr6:70836318-70836337 None:intergenic 20.0%
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!!! TTGTTTTTCATTCATGTATA+TGG + Chr6:70836551-70836570 None:intergenic 20.0%
!!! TTTCAAGATCTTTTGATTAA+AGG - Chr6:70838925-70838944 MsG0680033673.01.T01:intron 20.0%
! AAACATGTATTCAACATCAT+AGG - Chr6:70838496-70838515 MsG0680033673.01.T01:intron 25.0%
! AACATGTATTCAACATCATA+GGG - Chr6:70838497-70838516 MsG0680033673.01.T01:intron 25.0%
! AAGGCTATAATTTAACTGTT+TGG - Chr6:70838944-70838963 MsG0680033673.01.T01:intron 25.0%
! AAGGGAATAATAAGAAAAGA+AGG + Chr6:70837581-70837600 None:intergenic 25.0%
! AATAGCATTATCAACAGTAT+TGG + Chr6:70837639-70837658 None:intergenic 25.0%
! AATGCATTACAATATTTCTC+TGG + Chr6:70837058-70837077 None:intergenic 25.0%
! ACAATTATGTTCTCTCAAAA+TGG - Chr6:70836022-70836041 MsG0680033673.01.T01:CDS 25.0%
! ACACTAAAACTTTCATCAAT+TGG + Chr6:70835561-70835580 None:intergenic 25.0%
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! ATAGCATTATCAACAGTATT+GGG + Chr6:70837638-70837657 None:intergenic 25.0%
! ATGCATTACAATATTTCTCT+GGG + Chr6:70837057-70837076 None:intergenic 25.0%
! ATTTGATCATAATTTCTGAC+CGG + Chr6:70836402-70836421 None:intergenic 25.0%
! CAATTAGATCAAGTTAGTTA+TGG - Chr6:70838007-70838026 MsG0680033673.01.T01:intron 25.0%
! CATTTCAGAATATAACTCAT+AGG + Chr6:70838182-70838201 None:intergenic 25.0%
! GTATTATATGTAACAACAGT+AGG + Chr6:70838433-70838452 None:intergenic 25.0%
! GTTAATTATGTTGAATGTCA+TGG + Chr6:70835756-70835775 None:intergenic 25.0%
! GTTGAAAATCATATGATACA+CGG - Chr6:70835490-70835509 MsG0680033673.01.T01:CDS 25.0%
! TAGTTTGAGTAAACATACAT+TGG - Chr6:70838147-70838166 MsG0680033673.01.T01:intron 25.0%
! TGGCTTATGTAAGATTAAAA+TGG - Chr6:70838567-70838586 MsG0680033673.01.T01:intron 25.0%
! TGTAGTTAGAAATACCAAAA+TGG - Chr6:70836169-70836188 MsG0680033673.01.T01:CDS 25.0%
! TTAGAAGAAGAAGAAAAAGA+AGG + Chr6:70837557-70837576 None:intergenic 25.0%
! TTGTCTATTGTTATAACTGT+TGG + Chr6:70836006-70836025 None:intergenic 25.0%
! TTTAATGAAATGTGTTGCAA+AGG - Chr6:70838610-70838629 MsG0680033673.01.T01:intron 25.0%
! TTTACATAAAGCATGTAAGA+AGG + Chr6:70838770-70838789 None:intergenic 25.0%
!! AAAATAAATGATGTTGGTTG+CGG - Chr6:70836818-70836837 MsG0680033673.01.T01:intron 25.0%
!! ACAATTTTGTTCTCTCAAAA+TGG - Chr6:70836206-70836225 MsG0680033673.01.T01:CDS 25.0%
!! ACTTTTAGTGCTCTAATTTA+TGG - Chr6:70838232-70838251 MsG0680033673.01.T01:intron 25.0%
!! ATAAAGTAGTTTTCTGCATT+CGG - Chr6:70837197-70837216 MsG0680033673.01.T01:intron 25.0%
!! ATCAATGGTCTTTGTTTAAA+GGG - Chr6:70838982-70839001 MsG0680033673.01.T01:intron 25.0%
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!! TAATTGTCTTTTCTCTAGTT+TGG + Chr6:70835224-70835243 None:intergenic 25.0%
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!! TTTTCTCGATTTCAAAACAT+GGG + Chr6:70837280-70837299 None:intergenic 25.0%
!! TTTTTCTCGATTTCAAAACA+TGG + Chr6:70837281-70837300 None:intergenic 25.0%
!!! AATTTTGGCCAATATAGAAA+AGG + Chr6:70837867-70837886 None:intergenic 25.0%
!!! CGTATTTTAGTGCATAATAT+TGG + Chr6:70836319-70836338 None:intergenic 25.0%
!!! TGTTTTTCAATACCATTTGA+TGG + Chr6:70838300-70838319 None:intergenic 25.0%
AAAAATCAGTGAGGTTATCT+CGG + Chr6:70836670-70836689 None:intergenic 30.0%
AAAGGAGCAACTAAATCAAT+CGG + Chr6:70837115-70837134 None:intergenic 30.0%
AACATAATTAACCGTCTGAT+GGG - Chr6:70835764-70835783 MsG0680033673.01.T01:CDS 30.0%
AAGATGCATCTTGTTGATAT+GGG + Chr6:70834922-70834941 None:intergenic 30.0%
AATCTTTCTCAACATTTGCA+AGG + Chr6:70838077-70838096 None:intergenic 30.0%
ACATACAACATACTTATCGA+TGG - Chr6:70838862-70838881 MsG0680033673.01.T01:intron 30.0%
ACTGATAAGTATATGGGAAT+CGG + Chr6:70836900-70836919 None:intergenic 30.0%
ACTTACAATTCTCTCATTGA+TGG - Chr6:70838652-70838671 MsG0680033673.01.T01:intron 30.0%
ATCGATAAGTATGTTGTATG+TGG + Chr6:70838863-70838882 None:intergenic 30.0%
ATGAAAGGTTTGTGTCTTAA+TGG - Chr6:70837932-70837951 MsG0680033673.01.T01:intron 30.0%
ATGTTGTATGTGGTCATATT+TGG + Chr6:70838853-70838872 None:intergenic 30.0%
ATTTCAGCAAAAGATTGATC+AGG - Chr6:70835313-70835332 MsG0680033673.01.T01:CDS 30.0%
CAAATGTTGAGAAAGATTGA+TGG - Chr6:70838079-70838098 MsG0680033673.01.T01:intron 30.0%
CACACAAAAACAATTTATGG+AGG - Chr6:70836431-70836450 MsG0680033673.01.T01:intron 30.0%
CATATCATCAGTAACAAAGA+AGG - Chr6:70835612-70835631 MsG0680033673.01.T01:CDS 30.0%
CATTTCATTAAAGAGACTCA+AGG + Chr6:70838602-70838621 None:intergenic 30.0%
CTCTAGATCAAAATTTGGAA+CGG - Chr6:70835370-70835389 MsG0680033673.01.T01:CDS 30.0%
GAAGGGTTATAAGAATTGTT+AGG - Chr6:70834891-70834910 MsG0680033673.01.T01:CDS 30.0%
GAATTCCAATTTGTGAGAAA+GGG + Chr6:70837768-70837787 None:intergenic 30.0%
GTTGCTCCTTTAAATATCAA+TGG - Chr6:70837124-70837143 MsG0680033673.01.T01:intron 30.0%
GTTTCATAAGTTACAACATC+TGG + Chr6:70839063-70839082 None:intergenic 30.0%
TAAAAATCGTCATGTTGACA+AGG - Chr6:70838786-70838805 MsG0680033673.01.T01:intron 30.0%
TAAATTGGTCAAGATCAATG+TGG - Chr6:70838102-70838121 MsG0680033673.01.T01:intron 30.0%
TAGCCATAATCGTATCTATT+TGG - Chr6:70835527-70835546 MsG0680033673.01.T01:CDS 30.0%
TATCATGTATGAGAACTCAT+AGG + Chr6:70835285-70835304 None:intergenic 30.0%
TATGAGTTCTCATACATGAT+AGG - Chr6:70835284-70835303 MsG0680033673.01.T01:CDS 30.0%
TATTCAACATCATAGGGAAA+AGG - Chr6:70838503-70838522 MsG0680033673.01.T01:intron 30.0%
TATTTCCCTTTCTCACAAAT+TGG - Chr6:70837760-70837779 MsG0680033673.01.T01:intron 30.0%
TCATATTTGGTTGAATTCCT+TGG + Chr6:70838840-70838859 None:intergenic 30.0%
TCGGTTCCTCTTATTAATAT+GGG + Chr6:70834812-70834831 None:intergenic 30.0%
TCTTCATTCAATCACATGAT+CGG - Chr6:70837659-70837678 MsG0680033673.01.T01:intron 30.0%
TGAATTCCAATTTGTGAGAA+AGG + Chr6:70837769-70837788 None:intergenic 30.0%
TGCATTACAATATTTCTCTG+GGG + Chr6:70837056-70837075 None:intergenic 30.0%
TTAGTGCATAATATTGGGAA+GGG + Chr6:70836313-70836332 None:intergenic 30.0%
TTCGGTTCCTCTTATTAATA+TGG + Chr6:70834813-70834832 None:intergenic 30.0%
TTTAGTGCATAATATTGGGA+AGG + Chr6:70836314-70836333 None:intergenic 30.0%
! AACAAGATGCATCTTCTTTT+CGG - Chr6:70834927-70834946 MsG0680033673.01.T01:CDS 30.0%
! ATAACCCATCTTGAGAATTT+TGG + Chr6:70837882-70837901 None:intergenic 30.0%
! ATTTATGGATTTTGCGTTGT+TGG - Chr6:70838247-70838266 MsG0680033673.01.T01:intron 30.0%
! GAGAAAGATTGATGGTAAAT+TGG - Chr6:70838087-70838106 MsG0680033673.01.T01:intron 30.0%
! GAGAACTCATAGGTTTATTT+TGG + Chr6:70835275-70835294 None:intergenic 30.0%
! GATCAATGGTCTTTGTTTAA+AGG - Chr6:70838981-70839000 MsG0680033673.01.T01:intron 30.0%
! GTTGATGAATTTGAGTGATT+GGG + Chr6:70835884-70835903 None:intergenic 30.0%
! TAAAGTAGTTTTCTGCATTC+GGG - Chr6:70837198-70837217 MsG0680033673.01.T01:intron 30.0%
! TCTAGATCAAAATTTGGAAC+GGG - Chr6:70835371-70835390 MsG0680033673.01.T01:CDS 30.0%
!! AGTTGATGAATTTGAGTGAT+TGG + Chr6:70835885-70835904 None:intergenic 30.0%
!! ATCTTTGAATTAGGTTGATG+AGG - Chr6:70835650-70835669 MsG0680033673.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTTGGTTTGTTCCATCAAA+TGG - Chr6:70838285-70838304 MsG0680033673.01.T01:intron 30.0%
!! CATCATTTTTAAAGAGAGCA+CGG + Chr6:70839092-70839111 None:intergenic 30.0%
AAACGAAAACATTCGAGCAA+TGG + Chr6:70837519-70837538 None:intergenic 35.0%
AATAAATAGCTAAACGGCTG+AGG - Chr6:70835793-70835812 MsG0680033673.01.T01:CDS 35.0%
ACAGTAACAGATTTCGTTGT+TGG + Chr6:70837437-70837456 None:intergenic 35.0%
ACCTTGACTACACTTATGAA+AGG - Chr6:70837917-70837936 MsG0680033673.01.T01:intron 35.0%
ACCTTTCATAAGTGTAGTCA+AGG + Chr6:70837921-70837940 None:intergenic 35.0%
AGAGTGTAGTGTTCTTAAGA+AGG + Chr6:70837600-70837619 None:intergenic 35.0%
AGGGCAACTGATAAGTATAT+GGG + Chr6:70836906-70836925 None:intergenic 35.0%
AGGTTTGTGTCTTAATGGTA+AGG - Chr6:70837937-70837956 MsG0680033673.01.T01:intron 35.0%
AGTTATGGAACCTTGATCAA+TGG - Chr6:70838022-70838041 MsG0680033673.01.T01:intron 35.0%
ATAAATAGCTAAACGGCTGA+GGG - Chr6:70835794-70835813 MsG0680033673.01.T01:CDS 35.0%
ATATTGTAGCTGTGAACATC+AGG + Chr6:70838538-70838557 None:intergenic 35.0%
ATCTTATGATCTCTCGCTAA+TGG + Chr6:70835160-70835179 None:intergenic 35.0%
ATGGTTCAACTTAACAAGTG+AGG + Chr6:70837729-70837748 None:intergenic 35.0%
ATTGGCCAAAATTCTCAAGA+TGG - Chr6:70837874-70837893 MsG0680033673.01.T01:intron 35.0%
ATTGGGCTATTGTTACTAGA+TGG + Chr6:70835867-70835886 None:intergenic 35.0%
CAACATAATTAACCGTCTGA+TGG - Chr6:70835763-70835782 MsG0680033673.01.T01:CDS 35.0%
CAGTAACAGATTTCGTTGTT+GGG + Chr6:70837436-70837455 None:intergenic 35.0%
CATAAGTGTAGTCAAGGTTA+TGG + Chr6:70837915-70837934 None:intergenic 35.0%
CCTAGCTAATGAAGTGAATA+AGG - Chr6:70838471-70838490 MsG0680033673.01.T01:intron 35.0%
CCTTATTCACTTCATTAGCT+AGG + Chr6:70838474-70838493 None:intergenic 35.0%
CGATTTCAAAACATGGGTAT+GGG + Chr6:70837274-70837293 None:intergenic 35.0%
CGGTTCCTCTTATTAATATG+GGG + Chr6:70834811-70834830 None:intergenic 35.0%
CTGATAAGTATATGGGAATC+GGG + Chr6:70836899-70836918 None:intergenic 35.0%
GAAGATGCATCTTGTTGATA+TGG + Chr6:70834923-70834942 None:intergenic 35.0%
GAATTGTAAGTTACCTCATC+AGG + Chr6:70838643-70838662 None:intergenic 35.0%
GAGCCAAATAGATACGATTA+TGG + Chr6:70835533-70835552 None:intergenic 35.0%
GAGTGTAGTGTTCTTAAGAA+GGG + Chr6:70837599-70837618 None:intergenic 35.0%
GATGACCCCATATTAATAAG+AGG - Chr6:70834803-70834822 MsG0680033673.01.T01:intron 35.0%
GCATTACAATATTTCTCTGG+GGG + Chr6:70837055-70837074 None:intergenic 35.0%
GCCAATATAGAAAAGGCAAA+AGG + Chr6:70837860-70837879 None:intergenic 35.0%
TAGGGCAACTGATAAGTATA+TGG + Chr6:70836907-70836926 None:intergenic 35.0%
TCGATTTCAAAACATGGGTA+TGG + Chr6:70837275-70837294 None:intergenic 35.0%
TCTCATTGGGCTTATCTAAA+TGG - Chr6:70835825-70835844 MsG0680033673.01.T01:CDS 35.0%
TGAGAAAGGGAAATAACAGT+GGG + Chr6:70837755-70837774 None:intergenic 35.0%
TGTAGTCAAGGTTATGGTAT+CGG + Chr6:70837909-70837928 None:intergenic 35.0%
TGTTGACAAGGCAATTGAAT+TGG - Chr6:70838798-70838817 MsG0680033673.01.T01:intron 35.0%
TTATTCATCATCCCATCAGA+CGG + Chr6:70835778-70835797 None:intergenic 35.0%
TTCATTTGGCTGAAAAAAGC+CGG - Chr6:70836380-70836399 MsG0680033673.01.T01:CDS 35.0%
TTGGCCAAAATTCTCAAGAT+GGG - Chr6:70837875-70837894 MsG0680033673.01.T01:intron 35.0%
! CCATTGTCATAACACCATTT+TGG + Chr6:70836186-70836205 None:intergenic 35.0%
! GCCTTTTGCCTTTTCTATAT+TGG - Chr6:70837856-70837875 MsG0680033673.01.T01:intron 35.0%
! TGTTTTCGTTTTCATGCTTC+AGG - Chr6:70837528-70837547 MsG0680033673.01.T01:intron 35.0%
! TTAGCTGTGATGATGAAAGA+AGG - Chr6:70838400-70838419 MsG0680033673.01.T01:intron 35.0%
!! AATTGAATGATGGATGGAGT+AGG + Chr6:70837692-70837711 None:intergenic 35.0%
!! ATCAATGGACTGTGCAAAAT+TGG - Chr6:70838037-70838056 MsG0680033673.01.T01:intron 35.0%
!! CCAAAATGGTGTTATGACAA+TGG - Chr6:70836183-70836202 MsG0680033673.01.T01:CDS 35.0%
!! TCAATGGACTGTGCAAAATT+GGG - Chr6:70838038-70838057 MsG0680033673.01.T01:intron 35.0%
AAATTATTCAATGCGGGGAC+AGG + Chr6:70837002-70837021 None:intergenic 40.0%
AAGTATATGGGAATCGGGTA+TGG + Chr6:70836894-70836913 None:intergenic 40.0%
AATCTTTCGTATCCAACTGG+CGG + Chr6:70834752-70834771 None:intergenic 40.0%
AATTATTCAATGCGGGGACA+GGG + Chr6:70837001-70837020 None:intergenic 40.0%
AGACTACATGGTTGAAGGAA+GGG - Chr6:70834874-70834893 MsG0680033673.01.T01:intron 40.0%
AGAGAGAATCTCTCATGCAT+GGG - Chr6:70838687-70838706 MsG0680033673.01.T01:intron 40.0%
AGTATATGGGAATCGGGTAT+GGG + Chr6:70836893-70836912 None:intergenic 40.0%
ATGCATCTTGTTGATATGGG+TGG + Chr6:70834919-70834938 None:intergenic 40.0%
ATTGGTCGATGCTCTTTGTA+AGG - Chr6:70838348-70838367 MsG0680033673.01.T01:intron 40.0%
CAAAGGAATTACTCCTGATG+AGG - Chr6:70838627-70838646 MsG0680033673.01.T01:intron 40.0%
CATGTAGTCTCATACCTACA+CGG + Chr6:70834864-70834883 None:intergenic 40.0%
CTCAATCGAAATCGAGATGA+AGG - Chr6:70836460-70836479 MsG0680033673.01.T01:intron 40.0%
CTGTAAGTGATTACATTGGC+AGG + Chr6:70838745-70838764 None:intergenic 40.0%
CTGTCAAAGATGGAAGACAA+TGG - Chr6:70839030-70839049 MsG0680033673.01.T01:intron 40.0%
CTTGATCAGATGCATGATAG+AGG - Chr6:70838715-70838734 MsG0680033673.01.T01:intron 40.0%
GAGAAAGGGAAATAACAGTG+GGG + Chr6:70837754-70837773 None:intergenic 40.0%
GCACTAAAAGTGACAACATC+AGG + Chr6:70838223-70838242 None:intergenic 40.0%
GCTTAACTGTGGAGTTCTTA+CGG + Chr6:70834962-70834981 None:intergenic 40.0%
GGAGCTGTAAGTGATTACAT+TGG + Chr6:70838749-70838768 None:intergenic 40.0%
GGCAACAAAATCCATACATG+TGG + Chr6:70837374-70837393 None:intergenic 40.0%
GTAGTCAAGGTTATGGTATC+GGG + Chr6:70837908-70837927 None:intergenic 40.0%
GTATGAGACTACATGGTTGA+AGG - Chr6:70834869-70834888 MsG0680033673.01.T01:intron 40.0%
GTCAAGAAGATCAAAGACCA+AGG - Chr6:70838820-70838839 MsG0680033673.01.T01:intron 40.0%
GTGAGAAAGGGAAATAACAG+TGG + Chr6:70837756-70837775 None:intergenic 40.0%
GTTATCCCTCTCATAGTTGT+CGG + Chr6:70835702-70835721 None:intergenic 40.0%
TAAGAGGAACCGAATCACAT+CGG - Chr6:70834819-70834838 MsG0680033673.01.T01:intron 40.0%
TCGTTGTTGGGTTTATGTGA+AGG + Chr6:70837424-70837443 None:intergenic 40.0%
TTCAAAACATGGGTATGGGA+CGG + Chr6:70837270-70837289 None:intergenic 40.0%
TTCAATTTCTCAACCCCGTT+GGG + Chr6:70836936-70836955 None:intergenic 40.0%
TTTGCACAGTCCATTGATCA+AGG + Chr6:70838035-70838054 None:intergenic 40.0%
TTTGTTGCCATTCCAAGTTG+CGG - Chr6:70837385-70837404 MsG0680033673.01.T01:intron 40.0%
! AAATGATGTTGGTTGCGGTT+AGG - Chr6:70836823-70836842 MsG0680033673.01.T01:intron 40.0%
! CTAGTTTGGCTTAATCGTTC+TGG + Chr6:70835210-70835229 None:intergenic 40.0%
! TGTGATGATGAAAGAAGGTG+TGG - Chr6:70838405-70838424 MsG0680033673.01.T01:intron 40.0%
!! AAAAGACTCGTGTTGGTTTG+TGG - Chr6:70835065-70835084 MsG0680033673.01.T01:CDS 40.0%
!! AAAGACTCGTGTTGGTTTGT+GGG - Chr6:70835066-70835085 MsG0680033673.01.T01:CDS 40.0%
!! ATCGATGGACTATGCAAAGA+AGG - Chr6:70838877-70838896 MsG0680033673.01.T01:intron 40.0%
!! CAATGGACTGTGCAAAATTG+GGG - Chr6:70838039-70838058 MsG0680033673.01.T01:intron 40.0%
!! CGGTTGATAGGTACATTACA+GGG + Chr6:70836650-70836669 None:intergenic 40.0%
!! GGTCAACTGAAAGAAGCATT+TGG - Chr6:70838268-70838287 MsG0680033673.01.T01:intron 40.0%
!! GGTTGATAGGTACATTACAG+GGG + Chr6:70836649-70836668 None:intergenic 40.0%
!! TAGGTTGATGAGGTTGATGA+AGG - Chr6:70835660-70835679 MsG0680033673.01.T01:CDS 40.0%
!! TCGGTTGATAGGTACATTAC+AGG + Chr6:70836651-70836670 None:intergenic 40.0%
!!! ACTTGGAGCAATTTTGGGAT+GGG - Chr6:70834989-70835008 MsG0680033673.01.T01:CDS 40.0%
!!! GCTTGACTTGGAGCAATTTT+GGG - Chr6:70834984-70835003 MsG0680033673.01.T01:CDS 40.0%
!!! TGCTTGACTTGGAGCAATTT+TGG - Chr6:70834983-70835002 MsG0680033673.01.T01:CDS 40.0%
AAAACCCGTCAAATCGGGTT+CGG - Chr6:70837335-70837354 MsG0680033673.01.T01:intron 45.0%
AAGTCAAGCACGCTTAACTG+TGG + Chr6:70834973-70834992 None:intergenic 45.0%
ACAACTCCGACAACTATGAG+AGG - Chr6:70835693-70835712 MsG0680033673.01.T01:CDS 45.0%
ACAGTTAAGCGTGCTTGACT+TGG - Chr6:70834972-70834991 MsG0680033673.01.T01:CDS 45.0%
ACGAGGAAAACCCGTCAAAT+CGG - Chr6:70837329-70837348 MsG0680033673.01.T01:intron 45.0%
ACTGGGTTTGGGTATGAGTT+TGG + Chr6:70837305-70837324 None:intergenic 45.0%
ATCTTTCGTATCCAACTGGC+GGG + Chr6:70834751-70834770 None:intergenic 45.0%
CAACTCCGACAACTATGAGA+GGG - Chr6:70835694-70835713 MsG0680033673.01.T01:CDS 45.0%
CACACTGAAAAGACTCGTGT+TGG - Chr6:70835058-70835077 MsG0680033673.01.T01:CDS 45.0%
CAGAGAGAATCTCTCATGCA+TGG - Chr6:70838686-70838705 MsG0680033673.01.T01:intron 45.0%
CCTCTCATTCCGATGTGATT+CGG + Chr6:70834831-70834850 None:intergenic 45.0%
CGAATCACATCGGAATGAGA+GGG - Chr6:70834829-70834848 MsG0680033673.01.T01:intron 45.0%
CGTGTAGGTATGAGACTACA+TGG - Chr6:70834862-70834881 MsG0680033673.01.T01:intron 45.0%
CTAAATGGTCCAACCCATCA+CGG - Chr6:70835840-70835859 MsG0680033673.01.T01:CDS 45.0%
CTACGTGAAATGATTGCTCG+AGG - Chr6:70839135-70839154 MsG0680033673.01.T01:intron 45.0%
CTGGGTTTGGGTATGAGTTT+GGG + Chr6:70837304-70837323 None:intergenic 45.0%
GAGACTACATGGTTGAAGGA+AGG - Chr6:70834873-70834892 MsG0680033673.01.T01:intron 45.0%
GGAAGGGAATGATGACATGT+AGG + Chr6:70836297-70836316 None:intergenic 45.0%
GGGAAATAACAGTGGGGTAA+TGG + Chr6:70837748-70837767 None:intergenic 45.0%
GGGAATCTTTCGTATCCAAC+TGG + Chr6:70834755-70834774 None:intergenic 45.0%
GGTGAAAACCTAGAGCTAGA+CGG + Chr6:70835735-70835754 None:intergenic 45.0%
GTATATGGGAATCGGGTATG+GGG + Chr6:70836892-70836911 None:intergenic 45.0%
GTCGATGCTCTTTGTAAGGA+TGG - Chr6:70838352-70838371 MsG0680033673.01.T01:intron 45.0%
GTCTTCCATCTTTGACAGCA+GGG + Chr6:70839028-70839047 None:intergenic 45.0%
GTGAGGTTATCTCGGTTGAT+AGG + Chr6:70836662-70836681 None:intergenic 45.0%
GTTACTAGATGGACCGTGAT+GGG + Chr6:70835856-70835875 None:intergenic 45.0%
GTTCAATTTCTCAACCCCGT+TGG + Chr6:70836937-70836956 None:intergenic 45.0%
TAACATCCCAGACTGCTTTC+AGG + Chr6:70835105-70835124 None:intergenic 45.0%
TAGGTACATTACAGGGGCTA+AGG + Chr6:70836643-70836662 None:intergenic 45.0%
TCAAAACATGGGTATGGGAC+GGG + Chr6:70837269-70837288 None:intergenic 45.0%
TCTACACTTTCACGACCATG+TGG - Chr6:70837970-70837989 MsG0680033673.01.T01:intron 45.0%
TGTCTTCCATCTTTGACAGC+AGG + Chr6:70839029-70839048 None:intergenic 45.0%
TGTTACTAGATGGACCGTGA+TGG + Chr6:70835857-70835876 None:intergenic 45.0%
! GTAGTTTTCTGCATTCGGGA+CGG - Chr6:70837202-70837221 MsG0680033673.01.T01:intron 45.0%
! TAGTTTTCTGCATTCGGGAC+GGG - Chr6:70837203-70837222 MsG0680033673.01.T01:intron 45.0%
!! AAGACTCGTGTTGGTTTGTG+GGG - Chr6:70835067-70835086 MsG0680033673.01.T01:CDS 45.0%
!! GACTTGGAGCAATTTTGGGA+TGG - Chr6:70834988-70835007 MsG0680033673.01.T01:CDS 45.0%
!! TGTTGGTTTGTGGGGTTAGT+CGG - Chr6:70835075-70835094 MsG0680033673.01.T01:CDS 45.0%
!!! GGGTTTTCCTCGTTTTGACT+GGG + Chr6:70837322-70837341 None:intergenic 45.0%
!!! TCCTCGTTTTGACTGGGTTT+GGG + Chr6:70837316-70837335 None:intergenic 45.0%
!!! TTCCTCGTTTTGACTGGGTT+TGG + Chr6:70837317-70837336 None:intergenic 45.0%
!! AATGTAAAAAAAAATAAATA+AGG - Chr6:70836123-70836142 MsG0680033673.01.T01:CDS 5.0%
!! ATGTAAAAAAAAATAAATAA+GGG - Chr6:70836124-70836143 MsG0680033673.01.T01:CDS 5.0%
!! ATTATTTAATTAATCAATTA+TGG + Chr6:70835979-70835998 None:intergenic 5.0%
!! CAATTAAAAATAATAATAAT+TGG - Chr6:70835238-70835257 MsG0680033673.01.T01:CDS 5.0%
AAGATTCCCGCCAGTTGGAA+CGG - Chr6:70834766-70834785 MsG0680033673.01.T01:intron 50.0%
ACACTTTCACGACCATGTGG+TGG - Chr6:70837973-70837992 MsG0680033673.01.T01:intron 50.0%
ACATCGGAATGAGAGGGATC+CGG - Chr6:70834835-70834854 MsG0680033673.01.T01:intron 50.0%
ACCCAAACCCAGTCAAAACG+AGG - Chr6:70837312-70837331 MsG0680033673.01.T01:intron 50.0%
ACCTAGAGCTAGACGGAATG+AGG + Chr6:70835728-70835747 None:intergenic 50.0%
ACGCTTACCGGAAAACTTCC+CGG + Chr6:70835022-70835041 None:intergenic 50.0%
ACGGGTTTGGGTATGGATTC+GGG - Chr6:70837221-70837240 MsG0680033673.01.T01:intron 50.0%
AGTACCACCGCAACTTGGAA+TGG + Chr6:70837395-70837414 None:intergenic 50.0%
AGTTCGTCTACGAAGAAGCG+AGG + Chr6:70837474-70837493 None:intergenic 50.0%
ATACCCAAACCTGTTGGGGA+AGG + Chr6:70836967-70836986 None:intergenic 50.0%
CCGAATCACATCGGAATGAG+AGG - Chr6:70834828-70834847 MsG0680033673.01.T01:intron 50.0%
CCTAGAGCTAGACGGAATGA+GGG + Chr6:70835727-70835746 None:intergenic 50.0%
CGAGGAAAACCCGTCAAATC+GGG - Chr6:70837330-70837349 MsG0680033673.01.T01:intron 50.0%
GAAATCCCTTTGCCACCACA+TGG + Chr6:70837988-70838007 None:intergenic 50.0%
GATATCGAAAGCCACGTCGT+GGG + Chr6:70834729-70834748 None:intergenic 50.0%
GGCAATCCTGAAAGCAGTCT+GGG - Chr6:70835096-70835115 MsG0680033673.01.T01:CDS 50.0%
GTCTACGAAGAAGCGAGGAT+TGG + Chr6:70837469-70837488 None:intergenic 50.0%
TACCCAAACCTGTTGGGGAA+GGG + Chr6:70836966-70836985 None:intergenic 50.0%
TACGAAAGATTCCCGCCAGT+TGG - Chr6:70834761-70834780 MsG0680033673.01.T01:intron 50.0%
TCGCTTCTTCGTAGACGAAC+TGG - Chr6:70837473-70837492 MsG0680033673.01.T01:intron 50.0%
TGGAACGGGCACTATCTGTA+AGG - Chr6:70834781-70834800 MsG0680033673.01.T01:intron 50.0%
TGTGACCCTGCTGTCAAAGA+TGG - Chr6:70839020-70839039 MsG0680033673.01.T01:intron 50.0%
TTACCGGAAAACTTCCCGGT+AGG + Chr6:70835018-70835037 None:intergenic 50.0%
TTCTCAACCCCGTTGGGTAT+GGG + Chr6:70836930-70836949 None:intergenic 50.0%
TTGCGGTTAGGCATGGCAAT+GGG - Chr6:70836835-70836854 MsG0680033673.01.T01:intron 50.0%
TTTCTCAACCCCGTTGGGTA+TGG + Chr6:70836931-70836950 None:intergenic 50.0%
TTTGGGTATGGATTCGGGGT+GGG - Chr6:70837226-70837245 MsG0680033673.01.T01:intron 50.0%
! ATGTTGGTTGCGGTTAGGCA+TGG - Chr6:70836828-70836847 MsG0680033673.01.T01:intron 50.0%
! GACGGGTTTGGGTATGGATT+CGG - Chr6:70837220-70837239 MsG0680033673.01.T01:intron 50.0%
!! CGGGTTTTCCTCGTTTTGAC+TGG + Chr6:70837323-70837342 None:intergenic 50.0%
AACCCCGTTGGGTATGGGTA+GGG + Chr6:70836925-70836944 None:intergenic 55.0%
ACCCAAACCTGTTGGGGAAG+GGG + Chr6:70836965-70836984 None:intergenic 55.0%
AGATTCCCGCCAGTTGGAAC+GGG - Chr6:70834767-70834786 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
ATAGCTAAACGGCTGAGGGC+AGG - Chr6:70835798-70835817 MsG0680033673.01.T01:CDS 55.0%
ATAGTGCCCGTTCCAACTGG+CGG + Chr6:70834776-70834795 None:intergenic 55.0%
ATCCCCTTCCCCAACAGGTT+TGG - Chr6:70836960-70836979 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
ATGGGAATCGGGTATGGGGA+CGG + Chr6:70836888-70836907 None:intergenic 55.0%
ATGGGTATGGGACGGGTAAC+GGG + Chr6:70837262-70837281 None:intergenic 55.0%
ATTCAATGCGGGGACAGGGA+TGG + Chr6:70836997-70837016 None:intergenic 55.0%
CACGACCATGTGGTGGCAAA+GGG - Chr6:70837980-70837999 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
CAGATAGTGCCCGTTCCAAC+TGG + Chr6:70834779-70834798 None:intergenic 55.0%
CATGGGTATGGGACGGGTAA+CGG + Chr6:70837263-70837282 None:intergenic 55.0%
CGGCAATCCTGAAAGCAGTC+TGG - Chr6:70835095-70835114 MsG0680033673.01.T01:CDS 55.0%
CGGGGATACCCAAACCTGTT+GGG + Chr6:70836972-70836991 None:intergenic 55.0%
CGGGTGGGTAACCACATGTA+TGG - Chr6:70837360-70837379 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
CGGGTTTGGGTATGGATTCG+GGG - Chr6:70837222-70837241 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
GAGGGCAGGGACTTCTCATT+GGG - Chr6:70835812-70835831 MsG0680033673.01.T01:CDS 55.0%
GCATCAGTACCACCGCAACT+TGG + Chr6:70837400-70837419 None:intergenic 55.0%
GCTTTCGATATCCCGCCAGT+TGG - Chr6:70834737-70834756 MsG0680033673.01.T01:CDS 55.0%
GGATATCGAAAGCCACGTCG+TGG + Chr6:70834730-70834749 None:intergenic 55.0%
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GTTGCCATTCCAAGTTGCGG+TGG - Chr6:70837388-70837407 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
GTTGCCCTACCCATACCCAA+CGG - Chr6:70836918-70836937 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
GTTGCGGTTAGGCATGGCAA+TGG - Chr6:70836834-70836853 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
GTTTGGGTATGGATTCGGGG+TGG - Chr6:70837225-70837244 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
TAGCTAAACGGCTGAGGGCA+GGG - Chr6:70835799-70835818 MsG0680033673.01.T01:CDS 55.0%
TCACGACCATGTGGTGGCAA+AGG - Chr6:70837979-70837998 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
TCCCCTTCCCCAACAGGTTT+GGG - Chr6:70836961-70836980 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
TCTCATACCTACACGGCCTC+CGG + Chr6:70834857-70834876 None:intergenic 55.0%
TGAGGGCAGGGACTTCTCAT+TGG - Chr6:70835811-70835830 MsG0680033673.01.T01:CDS 55.0%
TGCGGTTAGGCATGGCAATG+GGG - Chr6:70836836-70836855 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
TTCAATGCGGGGACAGGGAT+GGG + Chr6:70836996-70837015 None:intergenic 55.0%
TTGCCCTACCCATACCCAAC+GGG - Chr6:70836919-70836938 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
! ATTCGGGACGGGTTTGGGTA+TGG - Chr6:70837214-70837233 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
! CCGAACCGAACCCGATTTGA+CGG + Chr6:70837343-70837362 None:intergenic 55.0%
! CCGTCAAATCGGGTTCGGTT+CGG - Chr6:70837340-70837359 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
! CGAACCGAACCCGATTTGAC+GGG + Chr6:70837342-70837361 None:intergenic 55.0%
! CGACCTACCGGGAAGTTTTC+CGG - Chr6:70835012-70835031 MsG0680033673.01.T01:CDS 55.0%
! CGTCAAATCGGGTTCGGTTC+GGG - Chr6:70837341-70837360 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
! TCTGCATTCGGGACGGGTTT+GGG - Chr6:70837209-70837228 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
! TTCTGCATTCGGGACGGGTT+TGG - Chr6:70837208-70837227 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
!! AAATCGGGTTCGGTTCGGGT+GGG - Chr6:70837345-70837364 MsG0680033673.01.T01:intron 55.0%
!! CCCTCATTCCGTCTAGCTCT+AGG - Chr6:70835724-70835743 MsG0680033673.01.T01:CDS 55.0%
!! CTAGATGGACCGTGATGGGT+TGG + Chr6:70835852-70835871 None:intergenic 55.0%
!! GGGACGGGTAACGGGTATAT+AGG + Chr6:70837254-70837273 None:intergenic 55.0%
!!! TTTTGGGATGGGCGACCTAC+CGG - Chr6:70835000-70835019 MsG0680033673.01.T01:CDS 55.0%
ACCTCATCCCCTTCCCCAAC+AGG - Chr6:70836955-70836974 MsG0680033673.01.T01:intron 60.0%
ACCTGTTGGGGAAGGGGATG+AGG + Chr6:70836959-70836978 None:intergenic 60.0%
CAACCCCGTTGGGTATGGGT+AGG + Chr6:70836926-70836945 None:intergenic 60.0%
GCGGGGATACCCAAACCTGT+TGG + Chr6:70836973-70836992 None:intergenic 60.0%
GCTCTGTAACACCCACGACG+TGG - Chr6:70834715-70834734 MsG0680033673.01.T01:CDS 60.0%
GGTTAGGCATGGCAATGGGG+CGG - Chr6:70836839-70836858 MsG0680033673.01.T01:intron 60.0%
GTCCTCACTCGCACGCTTAC+CGG + Chr6:70835034-70835053 None:intergenic 60.0%
GTTAGGCATGGCAATGGGGC+GGG - Chr6:70836840-70836859 MsG0680033673.01.T01:intron 60.0%
TAGTGCCCGTTCCAACTGGC+GGG + Chr6:70834775-70834794 None:intergenic 60.0%
TCAATGCGGGGACAGGGATG+GGG + Chr6:70836995-70837014 None:intergenic 60.0%
TCGGAATGAGAGGGATCCGG+AGG - Chr6:70834838-70834857 MsG0680033673.01.T01:intron 60.0%
TGCCCTACCCATACCCAACG+GGG - Chr6:70836920-70836939 MsG0680033673.01.T01:intron 60.0%
TGGGAATCGGGTATGGGGAC+GGG + Chr6:70836887-70836906 None:intergenic 60.0%
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TTCCGGTAAGCGTGCGAGTG+AGG - Chr6:70835029-70835048 MsG0680033673.01.T01:CDS 60.0%
! TTTGGGATGGGCGACCTACC+GGG - Chr6:70835001-70835020 MsG0680033673.01.T01:CDS 60.0%
!! CAAATCGGGTTCGGTTCGGG+TGG - Chr6:70837344-70837363 MsG0680033673.01.T01:intron 60.0%
ATGCGGGGACAGGGATGGGG+CGG + Chr6:70836992-70837011 None:intergenic 70.0%
CATGGCAATGGGGCGGGGTG+GGG - Chr6:70836846-70836865 MsG0680033673.01.T01:intron 70.0%
GAGGGATCCGGAGGCCGTGT+AGG - Chr6:70834847-70834866 MsG0680033673.01.T01:intron 70.0%
GCATGGCAATGGGGCGGGGT+GGG - Chr6:70836845-70836864 MsG0680033673.01.T01:intron 70.0%
CAATGGGGCGGGGTGGGGAC+GGG - Chr6:70836851-70836870 MsG0680033673.01.T01:intron 75.0%
GCAATGGGGCGGGGTGGGGA+CGG - Chr6:70836850-70836869 MsG0680033673.01.T01:intron 75.0%
GGCATGGCAATGGGGCGGGG+TGG - Chr6:70836844-70836863 MsG0680033673.01.T01:intron 75.0%
TGCGGGGACAGGGATGGGGC+GGG + Chr6:70836991-70837010 None:intergenic 75.0%
! GCGGGGACAGGGATGGGGCG+GGG + Chr6:70836990-70837009 None:intergenic 80.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 70834713 70839336 70834713 ID=MsG0680033673.01;Name=MsG0680033673.01
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