AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180001046.01

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MsG0180001046.01.T01 AT1G64100 29.428 367 255 1 8 374 294 656 5.40e-50 181
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MsG0180001046.01.T01 AT1G64100 26.392 413 285 2 99 496 90 498 1.02e-48 179
MsG0180001046.01.T01 AT1G64100 31.420 331 207 1 164 494 85 395 1.54e-43 164
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MsG0180001046.01.T01 AT1G05670 29.437 462 320 1 10 471 252 707 9.27e-74 248
MsG0180001046.01.T01 AT1G05670 29.025 472 296 3 64 496 156 627 1.41e-62 217
MsG0180001046.01.T01 AT1G05670 27.621 391 275 2 8 394 314 700 2.13e-57 203
MsG0180001046.01.T01 AT1G05670 27.368 380 276 0 1 380 342 721 3.71e-57 202
MsG0180001046.01.T01 AT3G16710 33.065 372 249 0 1 372 74 445 1.71e-76 247
MsG0180001046.01.T01 AT3G16710 28.963 328 233 0 167 494 65 392 4.25e-50 177
MsG0180001046.01.T01 AT3G16710 26.975 367 268 0 114 480 82 448 1.16e-47 171
MsG0180001046.01.T01 AT3G16710 27.114 402 282 4 80 472 6 405 2.00e-47 171
MsG0180001046.01.T01 AT3G16710 27.273 297 216 0 200 496 63 359 9.87e-41 152
MsG0180001046.01.T01 AT3G16710 25.431 232 167 2 8 236 221 449 3.87e-23 102
MsG0180001046.01.T01 AT3G16710 25.000 200 150 0 1 200 249 448 9.58e-18 85.9
MsG0180001046.01.T01 AT4G11690 27.859 481 346 1 16 496 65 544 1.00e-75 249
MsG0180001046.01.T01 AT4G11690 29.114 395 280 0 10 404 163 557 6.53e-63 215
MsG0180001046.01.T01 AT4G11690 28.977 352 250 0 8 359 196 547 3.84e-48 175
MsG0180001046.01.T01 AT4G11690 28.671 286 204 0 1 286 259 544 6.45e-37 144
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MsG0180001046.01.T01 AT1G13630 26.154 195 137 2 302 496 45 232 3.57e-18 88.2
MsG0180001046.01.T01 AT1G13630 26.804 485 342 2 7 478 254 738 3.45e-58 206
MsG0180001046.01.T01 AT1G13630 25.840 476 340 2 13 475 190 665 5.77e-53 191
MsG0180001046.01.T01 AT1G13630 25.743 505 356 5 8 496 220 721 7.09e-53 191
MsG0180001046.01.T01 AT1G13630 26.942 412 300 1 82 492 189 600 4.86e-51 186
MsG0180001046.01.T01 AT1G13630 29.921 381 266 1 117 496 189 569 1.20e-50 185
MsG0180001046.01.T01 AT1G13630 28.228 333 231 2 164 495 138 463 2.49e-44 167
MsG0180001046.01.T01 AT1G13630 23.342 407 250 6 5 376 361 740 7.06e-26 112
MsG0180001046.01.T01 AT1G13630 22.884 319 234 1 1 307 424 742 3.68e-24 107
MsG0180001046.01.T01 AT1G13630 24.348 230 162 3 267 496 106 323 5.50e-19 90.9
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MsG0180001046.01.T01 AT1G13630 26.942 412 300 1 82 492 223 634 7.31e-51 186
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MsG0180001046.01.T01 AT5G14770 28.313 498 315 6 32 496 118 606 2.51e-55 199
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MsG0180001046.01.T01 AT1G30290 25.223 448 329 3 13 456 245 690 7.07e-48 177
MsG0180001046.01.T01 AT1G30290 26.042 288 195 5 217 495 206 484 1.69e-25 110
MsG0180001046.01.T01 AT1G30290 23.846 260 192 3 8 265 487 742 1.97e-21 98.6
MsG0180001046.01.T01 AT1G30290 24.597 248 185 1 8 255 522 767 1.80e-18 89.4
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MsG0180001046.01.T01 AT1G22960 24.646 495 368 2 1 494 194 684 1.02e-49 181
MsG0180001046.01.T01 AT1G22960 27.523 436 303 4 66 496 224 651 6.87e-49 179
MsG0180001046.01.T01 AT1G22960 24.850 334 238 2 163 496 155 475 1.18e-26 114
MsG0180001046.01.T01 AT1G79080 27.563 439 309 4 62 494 88 523 6.21e-53 188
MsG0180001046.01.T01 AT1G79080 26.201 458 335 2 40 494 101 558 2.95e-52 186
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MsG0180001046.01.T01 AT1G11710 23.251 443 331 3 59 496 133 571 2.65e-34 137
MsG0180001046.01.T01 AT1G11710 22.662 278 176 3 223 496 121 363 1.32e-17 86.3
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MsG0180001046.01.T01 AT5G04810 23.611 360 275 0 13 372 417 776 9.03e-35 139
MsG0180001046.01.T01 AT5G04810 21.988 332 224 1 8 339 482 778 8.39e-26 112
MsG0180001046.01.T01 AT5G04810 23.358 274 210 0 218 491 307 580 1.41e-20 95.9
MsG0180001046.01.T01 AT5G04810 23.346 257 196 1 240 496 295 550 1.56e-15 80.1
MsG0180001046.01.T01 AT5G04810 24.227 194 147 0 8 201 587 780 3.37e-13 72.8
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MsG0180001046.01.T01 AT2G41720 23.566 488 367 3 13 496 146 631 1.97e-45 170
MsG0180001046.01.T01 AT2G41720 28.571 315 223 1 152 464 145 459 3.51e-36 143
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MsG0180001046.01.T01 AT5G16420 26.446 363 255 4 128 483 133 490 2.79e-40 152
MsG0180001046.01.T01 AT5G16420 25.806 310 229 1 40 349 186 494 7.01e-39 149
MsG0180001046.01.T01 AT5G16420 23.934 305 231 1 8 312 189 492 1.46e-28 119
MsG0180001046.01.T01 AT5G16420 25.200 250 186 1 1 250 252 500 1.02e-23 104
MsG0180001046.01.T01 AT5G25630 24.505 404 299 3 93 491 7 409 8.39e-43 159
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MsG0180001046.01.T01 AT2G35130 24.823 423 314 2 73 491 148 570 2.36e-40 154
MsG0180001046.01.T01 AT2G35130 26.667 300 214 3 203 496 136 435 1.80e-32 131
MsG0180001046.01.T01 AT2G35130 20.096 418 330 2 8 421 153 570 1.97e-28 119
MsG0180001046.01.T01 AT2G35130 20.611 393 276 3 16 408 235 591 8.64e-24 105
MsG0180001046.01.T01 AT2G35130 22.368 304 228 4 168 464 136 438 3.96e-23 103
MsG0180001046.01.T01 AT1G03540 26.790 433 293 10 64 492 147 559 2.55e-39 151
MsG0180001046.01.T01 AT1G03540 20.183 436 272 8 125 496 36 459 7.43e-19 90.1
MsG0180001046.01.T01 AT1G03540 20.792 303 215 8 7 304 262 544 4.58e-13 72.0
MsG0180001046.01.T01 AT1G73710 25.483 518 358 7 3 496 138 651 3.32e-39 152
MsG0180001046.01.T01 AT1G73710 22.727 506 333 8 4 472 282 766 6.70e-33 133
MsG0180001046.01.T01 AT1G73710 22.426 437 299 4 25 424 355 788 3.40e-26 113
MsG0180001046.01.T01 AT1G73710 24.169 451 290 9 67 472 462 905 5.53e-25 109
MsG0180001046.01.T01 AT1G73710 22.770 527 360 8 2 491 443 959 5.50e-22 100
MsG0180001046.01.T01 AT1G73710 23.020 404 259 14 1 379 576 952 2.09e-13 73.6
MsG0180001046.01.T01 AT5G40400 26.455 378 242 1 113 454 164 541 6.37e-39 150
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MsG0180001046.01.T01 AT5G40400 23.202 431 325 3 46 472 167 595 3.17e-35 139
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MsG0180001046.01.T01 AT1G07740 25.460 326 236 1 10 335 123 441 4.96e-29 119
MsG0180001046.01.T01 AT1G07740 26.154 260 192 0 8 267 184 443 2.18e-24 106
MsG0180001046.01.T01 AT4G01030 24.510 408 263 5 102 472 105 504 1.23e-36 144
MsG0180001046.01.T01 AT4G01030 23.129 441 300 6 13 421 158 591 3.03e-32 131
MsG0180001046.01.T01 AT4G01030 22.195 410 290 8 66 456 160 559 4.98e-23 103
MsG0180001046.01.T01 AT4G01030 21.639 305 204 3 199 472 68 368 3.76e-15 79.0
MsG0180001046.01.T01 AT5G39980 25.000 436 323 1 60 495 170 601 1.44e-36 144
MsG0180001046.01.T01 AT5G39980 21.822 472 351 6 29 495 73 531 7.13e-33 132
MsG0180001046.01.T01 AT5G39980 20.833 528 371 7 8 496 153 672 2.38e-32 131
MsG0180001046.01.T01 AT5G39980 25.868 317 235 0 180 496 150 466 4.20e-26 112
MsG0180001046.01.T01 AT1G53330 27.815 302 216 2 114 414 47 347 3.30e-36 138
MsG0180001046.01.T01 AT1G53330 27.742 310 218 3 77 383 45 351 3.45e-35 135
MsG0180001046.01.T01 AT1G53330 27.333 300 210 3 183 478 46 341 3.45e-34 132
MsG0180001046.01.T01 AT1G53330 23.948 309 229 3 8 313 46 351 4.64e-28 115
MsG0180001046.01.T01 AT1G53330 26.531 245 179 1 252 495 45 289 4.89e-25 106
MsG0180001046.01.T01 AT1G53330 24.911 281 209 2 217 496 45 324 4.08e-24 103
MsG0180001046.01.T01 AT1G80550 25.061 411 264 7 91 496 56 427 6.38e-36 139
MsG0180001046.01.T01 AT1G80550 25.087 287 203 4 79 359 150 430 8.51e-25 107
MsG0180001046.01.T01 AT1G80550 20.629 286 188 3 39 323 182 429 3.14e-16 81.3
MsG0180001046.01.T01 AT1G53330 27.815 302 216 2 114 414 151 451 1.37e-35 138
MsG0180001046.01.T01 AT1G53330 24.331 411 260 8 111 478 43 445 8.70e-34 133
MsG0180001046.01.T01 AT1G53330 25.166 302 191 2 47 313 154 455 7.82e-28 116
MsG0180001046.01.T01 AT1G53330 24.679 389 282 5 116 495 7 393 2.89e-26 112
MsG0180001046.01.T01 AT1G53330 28.000 175 125 1 323 496 150 324 1.16e-16 82.8
MsG0180001046.01.T01 AT1G53330 20.221 272 174 4 1 233 178 445 9.20e-13 70.9
MsG0180001046.01.T01 AT5G50280 24.928 345 257 2 149 491 272 616 2.78e-35 140
MsG0180001046.01.T01 AT5G50280 23.114 411 314 2 13 421 276 686 2.22e-31 128
MsG0180001046.01.T01 AT5G50280 23.546 361 268 4 114 469 307 664 3.62e-30 125
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MsG0180001046.01.T01 AT5G18950 23.795 332 249 2 75 405 140 468 3.49e-32 129
MsG0180001046.01.T01 AT5G18950 24.309 362 265 4 118 479 120 472 3.01e-31 126
MsG0180001046.01.T01 AT5G18950 22.933 375 278 5 8 381 111 475 3.23e-30 123
MsG0180001046.01.T01 AT5G18950 24.684 316 201 2 216 496 141 454 1.89e-24 106
MsG0180001046.01.T01 AT5G18950 21.739 207 162 0 1 207 274 480 1.32e-18 89.0
MsG0180001046.01.T01 AT1G55630 27.331 311 220 2 188 495 155 462 1.36e-34 135
MsG0180001046.01.T01 AT1G55630 25.879 313 232 0 50 362 157 469 2.42e-29 120
MsG0180001046.01.T01 AT1G55630 23.906 297 226 0 94 390 166 462 3.36e-27 114
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MsG0180001046.01.T01 AT1G55630 27.642 246 178 0 5 250 217 462 2.55e-23 103
MsG0180001046.01.T01 AT1G55630 20.761 289 229 0 172 460 174 462 2.97e-21 97.1
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MsG0180001046.01.T01 AT1G71060 23.797 374 281 2 12 385 130 499 1.29e-26 113
MsG0180001046.01.T01 AT1G71060 22.835 254 158 3 8 261 265 480 6.66e-14 74.3
MsG0180001046.01.T01 AT1G52640 25.602 332 233 5 50 376 143 465 2.16e-34 135
MsG0180001046.01.T01 AT1G52640 27.439 328 237 1 165 491 153 480 3.21e-33 132
MsG0180001046.01.T01 AT1G52640 26.524 328 227 5 176 494 90 412 2.58e-31 127
MsG0180001046.01.T01 AT1G52640 24.510 306 223 3 8 307 171 474 8.44e-24 105
MsG0180001046.01.T01 AT1G52640 21.176 340 267 1 13 351 141 480 4.41e-22 99.8
MsG0180001046.01.T01 AT1G52640 22.881 236 181 1 1 235 234 469 1.77e-14 76.3
MsG0180001046.01.T01 AT1G52640 24.138 203 154 0 293 495 141 343 8.63e-14 73.9
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MsG0180001046.01.T01 AT4G20740 21.333 450 344 5 20 467 168 609 4.11e-30 125
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MsG0180001046.01.T01 AT4G20740 22.222 270 208 1 229 496 165 434 8.45e-20 93.2
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MsG0180001046.01.T01 AT2G37230 22.222 504 369 9 7 495 251 746 9.44e-28 117
MsG0180001046.01.T01 AT2G37230 21.267 442 302 5 99 495 133 573 1.31e-22 102
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MsG0180001046.01.T01 AT3G22670 25.994 327 234 4 167 489 220 542 2.53e-31 127
MsG0180001046.01.T01 AT3G22670 25.246 305 223 3 125 425 213 516 8.67e-31 125
MsG0180001046.01.T01 AT3G22670 27.607 326 231 3 16 337 209 533 9.96e-30 122
MsG0180001046.01.T01 AT3G22670 27.490 251 162 6 257 496 168 409 3.12e-21 97.4
MsG0180001046.01.T01 AT3G22670 23.611 288 216 2 8 292 271 557 6.10e-15 77.8
MsG0180001046.01.T01 AT1G16830 24.090 357 233 2 175 496 202 555 8.71e-34 135
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MsG0180001046.01.T01 AT3G18110 22.328 524 359 8 16 496 615 1133 7.27e-25 109
MsG0180001046.01.T01 AT3G18110 19.093 419 327 2 11 423 747 1159 1.48e-24 108
MsG0180001046.01.T01 AT3G18110 19.957 466 362 6 13 472 684 1144 6.94e-24 106
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MsG0180001046.01.T01 AT3G18110 26.506 249 180 2 251 496 221 469 8.18e-20 94.0
MsG0180001046.01.T01 AT3G18110 19.048 504 322 8 8 468 330 790 2.31e-14 76.6
MsG0180001046.01.T01 AT5G11310 25.445 393 273 5 110 487 130 517 1.14e-32 132
MsG0180001046.01.T01 AT5G11310 24.776 335 242 4 42 369 209 540 1.57e-31 128
MsG0180001046.01.T01 AT3G15200 25.868 317 229 3 13 327 181 493 1.62e-32 130
MsG0180001046.01.T01 AT3G15200 24.643 280 205 3 219 496 177 452 9.43e-26 110
MsG0180001046.01.T01 AT3G15200 24.922 321 235 3 44 362 177 493 4.90e-25 108
MsG0180001046.01.T01 AT3G15200 23.851 348 254 7 149 493 177 516 4.05e-24 105
MsG0180001046.01.T01 AT5G14820 24.930 357 262 4 106 460 185 537 1.83e-32 131
MsG0180001046.01.T01 AT5G14820 23.500 400 294 6 55 448 170 563 7.83e-32 129
MsG0180001046.01.T01 AT5G14820 21.875 352 273 2 13 364 197 546 1.29e-25 110
MsG0180001046.01.T01 AT5G14820 20.064 314 240 3 2 308 289 598 9.28e-18 86.7
MsG0180001046.01.T01 AT2G35030 23.059 438 272 11 65 468 31 437 5.51e-32 130
MsG0180001046.01.T01 AT2G35030 24.847 326 214 8 170 495 31 325 1.25e-28 120
MsG0180001046.01.T01 AT3G62540 27.273 264 188 2 199 460 277 538 1.22e-31 129
MsG0180001046.01.T01 AT3G62540 25.868 317 228 3 135 448 252 564 3.76e-31 127
MsG0180001046.01.T01 AT3G62540 21.875 352 273 2 13 364 198 547 1.51e-25 110
MsG0180001046.01.T01 AT3G62540 21.561 269 211 0 72 340 290 558 4.77e-23 103
MsG0180001046.01.T01 AT3G62540 20.064 314 240 3 2 308 290 599 9.80e-18 86.7
MsG0180001046.01.T01 AT3G59040 23.460 422 299 7 78 487 109 518 1.61e-31 128
MsG0180001046.01.T01 AT3G59040 23.118 372 278 3 50 417 151 518 4.37e-30 124
MsG0180001046.01.T01 AT3G59040 21.449 345 265 2 8 349 179 520 8.30e-23 102
MsG0180001046.01.T01 AT3G59040 23.460 422 299 7 78 487 102 511 2.47e-31 127
MsG0180001046.01.T01 AT3G59040 23.118 372 278 3 50 417 144 511 6.11e-30 123
MsG0180001046.01.T01 AT3G59040 21.449 345 265 2 8 349 172 513 1.39e-22 101
MsG0180001046.01.T01 AT4G01570 23.641 423 278 5 75 481 122 515 2.93e-31 128
MsG0180001046.01.T01 AT4G01570 22.727 462 324 7 67 495 234 695 2.95e-29 122
MsG0180001046.01.T01 AT4G01570 24.944 445 307 8 1 436 350 776 6.90e-29 121
MsG0180001046.01.T01 AT4G01570 26.105 475 313 9 29 471 308 776 1.40e-28 120
MsG0180001046.01.T01 AT4G01570 25.641 312 223 3 69 372 201 511 1.08e-27 117
MsG0180001046.01.T01 AT4G01570 23.587 407 283 6 110 491 87 490 4.79e-25 109
MsG0180001046.01.T01 AT4G01570 24.731 372 254 6 149 496 91 460 1.09e-24 108
MsG0180001046.01.T01 AT4G01570 26.974 152 110 1 221 372 631 781 4.61e-14 75.5
MsG0180001046.01.T01 AT3G12770 23.325 403 283 8 44 439 186 569 4.22e-31 127
MsG0180001046.01.T01 AT3G12770 20.859 489 340 7 6 460 80 555 9.38e-30 123
MsG0180001046.01.T01 AT3G12770 20.574 418 284 7 84 468 25 427 8.42e-19 90.1
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MsG0180001046.01.T01 AT5G15010 26.331 357 244 9 149 496 160 506 1.78e-29 122
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MsG0180001046.01.T01 AT1G66345 24.638 345 260 0 149 493 198 542 1.28e-26 113
MsG0180001046.01.T01 AT1G66345 21.344 253 199 0 29 281 288 540 4.71e-17 84.3
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MsG0180001046.01.T01 AT1G66345 22.314 242 188 0 1 242 295 536 5.63e-13 71.6
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MsG0180001046.01.T01 AT5G15280 20.260 538 316 10 8 441 321 849 1.49e-16 83.6
MsG0180001046.01.T01 AT5G15280 23.273 275 203 3 226 496 189 459 8.04e-16 81.3
MsG0180001046.01.T01 AT5G15280 22.569 288 218 3 13 298 912 1196 1.74e-15 80.1
MsG0180001046.01.T01 AT5G15280 21.523 302 227 5 136 433 930 1225 1.26e-13 74.3
MsG0180001046.01.T01 AT5G15280 20.979 429 267 9 97 456 200 625 3.69e-13 72.8
MsG0180001046.01.T01 AT5G15280 19.687 447 318 6 29 440 723 1163 1.49e-11 67.8
MsG0180001046.01.T01 AT1G63320 36.129 155 90 1 346 491 2 156 2.58e-27 108
MsG0180001046.01.T01 AT1G63320 29.348 184 120 2 171 345 2 184 1.18e-20 90.1
MsG0180001046.01.T01 AT1G63320 28.492 179 119 1 205 374 1 179 7.21e-19 85.1
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MsG0180001046.01.T01 AT1G63320 26.857 175 118 2 246 411 7 180 1.76e-17 80.9
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MsG0180001046.01.T01 AT1G31430 22.917 432 308 9 65 491 31 442 1.91e-26 113
MsG0180001046.01.T01 AT1G31430 20.904 354 264 6 120 470 187 527 1.84e-13 73.2
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MsG0180001046.01.T01 AT2G03880 23.666 431 271 12 79 472 25 434 1.59e-25 110
MsG0180001046.01.T01 AT2G03880 23.881 335 199 11 1 332 153 434 4.83e-13 72.0
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MsG0180001046.01.T01 AT1G77405 24.903 257 176 4 170 409 147 403 7.05e-23 101
MsG0180001046.01.T01 AT1G77405 24.809 262 180 4 20 264 137 398 1.85e-21 97.4
MsG0180001046.01.T01 AT1G77405 27.490 251 165 4 121 357 171 418 1.77e-19 91.3
MsG0180001046.01.T01 AT1G77405 26.860 242 154 5 254 475 161 399 1.46e-16 82.4
MsG0180001046.01.T01 AT1G77405 28.426 197 125 3 311 491 148 344 1.62e-16 82.4
MsG0180001046.01.T01 AT3G53170 25.697 323 226 5 146 460 125 441 2.46e-25 108
MsG0180001046.01.T01 AT3G53170 22.705 414 302 5 87 495 41 441 8.47e-23 101
MsG0180001046.01.T01 AT3G53170 23.793 290 212 2 77 361 162 447 3.33e-19 90.5
MsG0180001046.01.T01 AT3G53170 22.222 387 288 7 17 395 65 446 4.01e-18 87.0
MsG0180001046.01.T01 AT3G53170 23.358 274 205 5 227 496 65 337 1.71e-14 75.9
MsG0180001046.01.T01 AT2G15980 23.592 373 232 8 97 454 149 483 3.05e-25 108
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MsG0180001046.01.T01 AT2G15980 21.983 232 166 4 261 477 167 398 9.95e-15 77.0
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MsG0180001046.01.T01 AT3G29290 22.581 248 186 3 16 262 290 532 4.53e-13 72.0
MsG0180001046.01.T01 AT3G29290 21.646 328 234 5 26 337 217 537 4.49e-11 65.5
MsG0180001046.01.T01 AT5G27110 21.640 439 294 8 16 419 148 571 3.91e-24 106
MsG0180001046.01.T01 AT5G27110 20.705 454 280 9 46 467 108 513 3.04e-17 85.5
MsG0180001046.01.T01 AT5G27110 23.986 296 205 8 184 474 38 318 5.42e-14 75.1
MsG0180001046.01.T01 AT5G06540 23.810 357 243 10 144 491 76 412 9.86e-24 105
MsG0180001046.01.T01 AT5G06540 22.596 416 305 6 44 458 81 480 1.18e-22 102
MsG0180001046.01.T01 AT5G06540 24.430 307 217 8 1 304 205 499 6.67e-13 71.6
MsG0180001046.01.T01 AT4G30825 19.964 556 341 7 29 480 333 888 1.01e-23 105
MsG0180001046.01.T01 AT4G30825 22.762 391 278 5 13 391 526 904 3.29e-19 91.7
MsG0180001046.01.T01 AT4G30825 21.687 332 258 2 84 414 562 892 1.07e-18 90.1
MsG0180001046.01.T01 AT4G30825 20.815 466 313 8 43 472 155 600 1.09e-18 90.1
MsG0180001046.01.T01 AT4G30825 20.576 486 362 9 22 496 223 695 2.84e-15 79.3
MsG0180001046.01.T01 AT5G15300 23.529 408 283 11 6 406 73 458 1.30e-23 104
MsG0180001046.01.T01 AT5G15300 21.410 383 239 8 133 472 60 423 9.61e-17 83.6
MsG0180001046.01.T01 AT5G15300 20.134 298 217 6 183 475 75 356 2.38e-12 69.7
MsG0180001046.01.T01 AT5G59600 22.308 390 258 7 15 369 87 466 1.57e-23 104
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MsG0180001046.01.T01 AT5G59600 21.612 273 165 6 230 467 32 290 1.16e-12 70.5
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MsG0180001046.01.T01 AT1G11290 20.950 358 209 4 186 477 101 450 1.60e-18 89.4
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MsG0180001046.01.T01 AT5G27270 20.714 420 326 3 72 488 180 595 6.85e-20 94.0
MsG0180001046.01.T01 AT5G27270 19.841 504 376 8 13 489 261 763 2.73e-14 76.3
MsG0180001046.01.T01 AT5G27270 22.414 174 135 0 51 224 710 883 5.03e-11 65.9
MsG0180001046.01.T01 AT5G08305 23.056 360 263 5 64 422 92 438 8.27e-22 99.0
MsG0180001046.01.T01 AT5G08305 25.000 388 241 11 115 465 42 416 3.77e-18 87.8
MsG0180001046.01.T01 AT1G28690 25.140 358 240 11 75 420 130 471 8.61e-22 99.0
MsG0180001046.01.T01 AT1G28690 24.490 294 200 7 183 468 98 377 1.05e-17 86.3
MsG0180001046.01.T01 AT5G39350 24.262 305 224 4 112 414 281 580 1.17e-21 99.0
MsG0180001046.01.T01 AT5G39350 21.514 502 325 10 14 468 49 528 7.12e-20 93.6
MsG0180001046.01.T01 AT5G39350 22.427 379 277 8 44 417 283 649 1.35e-19 92.8
MsG0180001046.01.T01 AT5G39350 21.932 383 281 6 79 456 182 551 4.94e-18 87.8
MsG0180001046.01.T01 AT4G38010 20.128 467 322 10 28 456 17 470 1.17e-21 98.6
MsG0180001046.01.T01 AT1G69350 21.739 414 309 6 44 456 166 565 1.26e-21 99.0
MsG0180001046.01.T01 AT1G69350 22.154 492 330 12 6 458 61 538 1.38e-21 99.0
MsG0180001046.01.T01 AT1G69350 21.891 402 274 8 44 414 267 659 3.95e-15 79.0
MsG0180001046.01.T01 AT2G29760 21.875 416 307 6 8 421 129 528 1.44e-21 99.0
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MsG0180001046.01.T01 AT2G29760 22.330 309 227 4 184 491 196 492 9.21e-16 80.9
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MsG0180001046.01.T01 AT2G44880 22.646 446 282 11 51 491 89 476 1.27e-20 95.5
MsG0180001046.01.T01 AT2G44880 21.705 387 268 11 10 385 145 507 1.09e-15 80.1
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MsG0180001046.01.T01 AT4G33990 19.643 504 346 12 28 496 69 548 3.61e-12 69.3
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MsG0180001046.01.T01 AT2G28050 23.077 234 168 5 47 275 212 438 3.58e-11 65.9
MsG0180001046.01.T01 AT1G74630 20.379 422 310 12 7 424 103 502 5.25e-20 94.0
MsG0180001046.01.T01 AT1G74630 19.832 358 266 6 134 485 54 396 5.00e-15 78.2
MsG0180001046.01.T01 AT3G13770 22.936 327 237 8 135 456 103 419 5.35e-20 94.0
MsG0180001046.01.T01 AT3G13770 19.547 353 230 7 44 389 117 422 1.35e-15 80.1
MsG0180001046.01.T01 AT4G15720 25.478 314 218 7 164 472 78 380 5.98e-20 93.6
MsG0180001046.01.T01 AT4G15720 20.903 421 274 11 40 417 59 463 1.14e-14 77.0
MsG0180001046.01.T01 AT1G11900 25.743 303 200 6 173 462 60 350 6.33e-20 91.7
MsG0180001046.01.T01 AT1G56570 21.094 384 289 7 44 425 177 548 6.71e-20 93.6
MsG0180001046.01.T01 AT1G56570 20.785 433 290 12 44 472 75 458 1.86e-19 92.0
MsG0180001046.01.T01 AT1G56570 19.948 381 253 10 132 476 58 422 4.88e-11 65.5
MsG0180001046.01.T01 AT1G56570 21.094 384 289 7 44 425 177 548 6.71e-20 93.6
MsG0180001046.01.T01 AT1G56570 20.785 433 290 12 44 472 75 458 1.86e-19 92.0
MsG0180001046.01.T01 AT1G56570 19.948 381 253 10 132 476 58 422 4.88e-11 65.5
MsG0180001046.01.T01 AT3G22690 19.101 534 346 11 32 496 51 567 6.79e-20 93.6
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MsG0180001046.01.T01 AT3G53170 23.499 383 267 6 87 456 91 460 6.89e-20 92.8
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MsG0180001046.01.T01 AT3G46610 20.707 396 279 7 133 496 167 559 2.31e-14 76.3
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MsG0180001046.01.T01 AT3G22150 20.892 493 343 10 34 491 168 648 1.64e-17 86.3
MsG0180001046.01.T01 AT4G30700 21.459 466 326 12 44 492 286 728 1.76e-19 92.4
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MsG0180001046.01.T01 AT4G20770 19.512 492 368 9 8 487 203 678 1.59e-18 89.4
MsG0180001046.01.T01 AT4G20770 18.945 417 302 8 71 474 32 425 8.40e-11 65.1
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MsG0180001046.01.T01 AT5G43790 23.182 220 161 3 44 262 180 392 2.86e-11 65.9
MsG0180001046.01.T01 AT2G40720 21.117 412 310 6 13 421 341 740 1.66e-18 89.4
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MsG0180001046.01.T01 AT5G08490 21.142 473 339 12 29 491 282 730 1.77e-18 89.4
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MsG0180001046.01.T01 AT5G08490 21.142 473 339 12 29 491 282 730 1.77e-18 89.4
MsG0180001046.01.T01 AT4G08210 22.500 400 248 11 139 496 60 439 1.99e-18 89.0
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MsG0180001046.01.T01 AT5G37570 22.928 362 243 11 123 478 123 454 4.25e-16 81.3
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MsG0180001046.01.T01 AT3G06430 21.262 301 198 5 76 338 120 419 1.38e-14 76.6
MsG0180001046.01.T01 AT3G06430 20.563 355 208 7 200 482 106 458 7.34e-14 74.3
MsG0180001046.01.T01 AT3G06430 21.457 247 192 2 252 496 121 367 4.37e-12 68.6
MsG0180001046.01.T01 AT3G49142 19.843 509 307 10 44 467 104 596 2.64e-17 85.5
MsG0180001046.01.T01 AT3G49142 18.079 354 249 4 139 459 94 439 4.85e-11 65.9
MsG0180001046.01.T01 AT3G02330 22.030 404 277 10 67 461 470 844 2.71e-17 85.9
MsG0180001046.01.T01 AT3G02330 19.132 507 377 7 6 496 110 599 5.58e-15 78.6
MsG0180001046.01.T01 AT3G02330 19.517 497 335 9 6 468 242 707 3.73e-12 69.3
MsG0180001046.01.T01 AT3G60040 36.752 117 74 0 379 495 709 825 3.39e-17 85.5
MsG0180001046.01.T01 AT3G60040 33.333 132 85 2 234 362 701 832 5.99e-16 81.3
MsG0180001046.01.T01 AT3G60040 36.441 118 75 0 133 250 708 825 4.09e-15 79.0
MsG0180001046.01.T01 AT3G60040 29.839 124 87 0 309 432 709 832 9.19e-13 71.2
MsG0180001046.01.T01 AT3G60040 29.915 117 82 0 274 390 709 825 6.87e-12 68.6
MsG0180001046.01.T01 AT3G60040 36.752 117 74 0 379 495 708 824 3.42e-17 85.5
MsG0180001046.01.T01 AT3G60040 33.333 132 85 2 234 362 700 831 6.09e-16 81.3
MsG0180001046.01.T01 AT3G60040 36.441 118 75 0 133 250 707 824 4.31e-15 78.6
MsG0180001046.01.T01 AT3G60040 29.839 124 87 0 309 432 708 831 9.26e-13 71.2
MsG0180001046.01.T01 AT3G60040 29.915 117 82 0 274 390 708 824 6.93e-12 68.6
MsG0180001046.01.T01 AT3G60040 36.752 117 74 0 379 495 489 605 3.46e-17 85.1
MsG0180001046.01.T01 AT3G60040 33.333 132 85 2 234 362 481 612 4.23e-16 81.6
MsG0180001046.01.T01 AT3G60040 36.441 118 75 0 133 250 488 605 3.75e-15 78.6
MsG0180001046.01.T01 AT3G60040 29.839 124 87 0 309 432 489 612 7.26e-13 71.2
MsG0180001046.01.T01 AT3G60040 29.915 117 82 0 274 390 489 605 4.19e-12 68.9
MsG0180001046.01.T01 AT4G21065 23.035 369 235 10 44 409 84 406 3.62e-17 84.7
MsG0180001046.01.T01 AT1G30610 22.843 394 260 8 121 495 475 843 3.84e-17 85.1
MsG0180001046.01.T01 AT3G25970 22.043 372 258 10 79 438 65 416 4.30e-17 84.7
MsG0180001046.01.T01 AT3G16610 26.104 249 171 4 149 395 342 579 4.43e-17 84.7
MsG0180001046.01.T01 AT3G16610 21.789 436 242 11 142 495 121 539 2.31e-15 79.3
MsG0180001046.01.T01 AT5G03560 28.467 137 97 1 331 466 203 339 4.50e-17 83.2
MsG0180001046.01.T01 AT5G03560 25.362 138 102 1 156 292 203 340 1.80e-16 81.3
MsG0180001046.01.T01 AT5G03560 30.519 154 102 3 102 254 188 337 4.46e-15 77.0
MsG0180001046.01.T01 AT5G03560 31.061 132 90 1 366 496 203 334 4.59e-15 77.0

Find 88 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 104 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATCCCACCCATCTTCCATTT+TGG 0.157873 1:+15190769 MsG0180001046.01.T01:CDS
GATCAATTGTTTCTGTCATT+TGG 0.214146 1:+15190903 MsG0180001046.01.T01:CDS
AGTTATAGCATCATGATTAA+TGG 0.233268 1:+15191624 MsG0180001046.01.T01:CDS
ACTTTAACTACACTCATTAA+AGG 0.245982 1:+15190994 MsG0180001046.01.T01:CDS
ATTAAAGGTCTCTGTCTTAA+AGG 0.248678 1:+15191009 MsG0180001046.01.T01:CDS
CGTGAAAGTGCAATGCTTTA+CGG 0.251969 1:-15191038 None:intergenic
ATCAATTGTTTCTGTCATTT+GGG 0.256972 1:+15190904 MsG0180001046.01.T01:CDS
GAATTGTATGTAATTATATT+AGG 0.264155 1:-15191822 None:intergenic
AGTTATGGAACCTTGGTTAA+TGG 0.269717 1:+15191099 MsG0180001046.01.T01:CDS
CGGTTTGATATTGTTAGTTA+TGG 0.273428 1:+15191084 MsG0180001046.01.T01:CDS
TGTTTATACCATGAGTATAT+TGG 0.291968 1:+15191407 MsG0180001046.01.T01:CDS
GAACTATAAGTTATCGTATC+AGG 0.303929 1:-15191717 None:intergenic
ACTTATAGTTCTCTTATTGA+TGG 0.308991 1:+15191729 MsG0180001046.01.T01:CDS
TTTGTTACATAAAATGATAT+TGG 0.311345 1:+15191368 MsG0180001046.01.T01:CDS
ATTGATGGCTTGGGCAAATC+AGG 0.311368 1:+15191744 MsG0180001046.01.T01:CDS
AATTACATACAATTCTATAT+TGG 0.320386 1:+15191830 MsG0180001046.01.T01:CDS
ATACTCATGGTATAAACATT+TGG 0.324491 1:-15191402 None:intergenic
GAACTATAAGTAACAACATT+AGG 0.326404 1:-15191507 None:intergenic
AGGCGGTAGCGCATGGATTT+CGG 0.334746 1:+15191064 MsG0180001046.01.T01:CDS
AACCTAAAATCATTCCAAAA+TGG 0.351432 1:-15190783 None:intergenic
TAGTTCTCTTATTGATGGCT+TGG 0.371902 1:+15191734 MsG0180001046.01.T01:CDS
TACTCATGGTATAAACATTT+GGG 0.375854 1:-15191401 None:intergenic
ACTTATAGTTCTTTACTAGA+TGG 0.377935 1:+15191519 MsG0180001046.01.T01:CDS
ACTTATAGTAGTTTGATTAG+TGG 0.389315 1:+15191309 MsG0180001046.01.T01:CDS
GTGTTATACATTACCACATT+AGG 0.392052 1:-15191192 None:intergenic
GTTAATGGATTATGTAAAGT+TGG 0.399078 1:+15191114 MsG0180001046.01.T01:CDS
ATAGTATATGTACATAAATC+TGG 0.403422 1:-15191927 None:intergenic
TCATATGCTTGGCAACTTGT+AGG 0.407639 1:+15191774 MsG0180001046.01.T01:CDS
ATTTGCTAAGATTCTTAAGA+TGG 0.408887 1:+15190951 MsG0180001046.01.T01:CDS
ATCAGCAATCACTCCACTTT+GGG 0.415755 1:-15191595 None:intergenic
AGTTCTCTTATTGATGGCTT+GGG 0.424672 1:+15191735 MsG0180001046.01.T01:CDS
TGGAGAAACAAGAGCTGCCT+TGG 0.435530 1:+15191134 MsG0180001046.01.T01:CDS
CTTAAGAATCTTAGCAAATA+CGG 0.441432 1:-15190947 None:intergenic
AATCATTCCAAAATGGAAGA+TGG 0.441559 1:-15190776 None:intergenic
ATGTCTGAATGGAAGGCTTA+AGG 0.442559 1:+15191965 MsG0180001046.01.T01:CDS
GTAGTTAAAGTTATAGCATC+TGG 0.448706 1:-15190982 None:intergenic
ATCCAAGGATTCTGTTACAA+GGG 0.449245 1:+15192059 MsG0180001046.01.T01:CDS
AGCCCTTGTAACAGAATCCT+TGG 0.451500 1:-15192061 None:intergenic
CGAGGTTATATTCAACACTA+TGG 0.458322 1:+15191572 MsG0180001046.01.T01:CDS
CTACTATAAGTGACAACATC+AGG 0.460873 1:-15191297 None:intergenic
ATGTATAACACGATCATTGA+TGG 0.465820 1:+15191204 MsG0180001046.01.T01:CDS
TACATATACTATTCTTATGA+AGG 0.475279 1:+15191938 MsG0180001046.01.T01:CDS
GAGACGAGTTGATGGGAAAC+TGG 0.483641 1:+15191164 MsG0180001046.01.T01:CDS
AATCTTAGCAAATACGGAAA+AGG 0.484126 1:-15190941 None:intergenic
GAATTGCTGAGACGAGTTGA+TGG 0.484367 1:+15191156 MsG0180001046.01.T01:CDS
CATCAGCAATCACTCCACTT+TGG 0.488132 1:-15191596 None:intergenic
TTTCAAGTTCTTCTAATGAA+AGG 0.488809 1:+15192002 MsG0180001046.01.T01:CDS
AAATGGAAGATGGGTGGGAT+AGG 0.506722 1:-15190766 None:intergenic
CACGACAAGGCGGTAGCGCA+TGG 0.513383 1:+15191057 MsG0180001046.01.T01:CDS
ATCATTCCAAAATGGAAGAT+GGG 0.515309 1:-15190775 None:intergenic
CAGGGAGAATCTCATATGCT+TGG 0.516773 1:+15191763 MsG0180001046.01.T01:CDS
TATTGTTAGTTATGGAACCT+TGG 0.520110 1:+15191092 MsG0180001046.01.T01:CDS
ATAAATCTGGTTGAATACCT+TGG 0.521997 1:-15191914 None:intergenic
TTTGCTAAGATTCTTAAGAT+GGG 0.525609 1:+15190952 MsG0180001046.01.T01:CDS
GGGCTTATTTGATGAAGCGC+TGG 0.526924 1:+15192079 MsG0180001046.01.T01:CDS
GATCCAAGGATTCTGTTACA+AGG 0.527234 1:+15192058 MsG0180001046.01.T01:CDS
ATGCGATTGCTTCGTCAACA+TGG 0.536173 1:-15191872 None:intergenic
ATGAAGGGACTATGTCTGAA+TGG 0.551908 1:+15191954 MsG0180001046.01.T01:CDS
TTCCAAAATGGAAGATGGGT+GGG 0.553832 1:-15190771 None:intergenic
AGGGACTATGTCTGAATGGA+AGG 0.554645 1:+15191958 MsG0180001046.01.T01:CDS
GTGAAACAGCAGTGGTGTAA+TGG 0.556126 1:-15190822 None:intergenic
TATACATTACCACATTAGGC+TGG 0.558125 1:-15191188 None:intergenic
ACGTATACTGTTATGATCCA+AGG 0.569972 1:+15192044 MsG0180001046.01.T01:CDS
TTGATGGCTTGGGCAAATCA+GGG 0.576821 1:+15191745 MsG0180001046.01.T01:CDS
AGCATCAACCAATATACTCA+TGG 0.580416 1:-15191415 None:intergenic
TAAACAAGTGAACAAGGCCG+AGG 0.580653 1:+15191554 MsG0180001046.01.T01:CDS
GTAGGTGAGATGCATGATAG+AGG 0.586327 1:+15191792 MsG0180001046.01.T01:CDS
AAAAGATGAAAATGATATGG+CGG 0.592436 1:+15192181 MsG0180001046.01.T01:CDS
TTAAAGTTATAGCATCTGGC+TGG 0.592920 1:-15190978 None:intergenic
AACTCGTCTCAGCAATTCCA+AGG 0.594286 1:-15191151 None:intergenic
ATTCCAAAATGGAAGATGGG+TGG 0.598898 1:-15190772 None:intergenic
AATTGCTGAGACGAGTTGAT+GGG 0.613083 1:+15191157 MsG0180001046.01.T01:CDS
TTTACATAATCCATTAACCA+AGG 0.613421 1:-15191109 None:intergenic
AAGGCTTAAGGATGCACAAG+AGG 0.613910 1:+15191977 MsG0180001046.01.T01:CDS
AGGTCTCTGTCTTAAAGGTG+AGG 0.626182 1:+15191014 MsG0180001046.01.T01:CDS
TTCAACACTATGGCCCAAAG+TGG 0.626972 1:+15191582 MsG0180001046.01.T01:CDS
TGTAATGGTTGGCCTTGACA+AGG 0.629864 1:-15190807 None:intergenic
TCGATGAAGTGAAACAGCAG+TGG 0.630028 1:-15190830 None:intergenic
TCTTGTTAAACAAGTGAACA+AGG 0.632910 1:+15191548 MsG0180001046.01.T01:CDS
AGCATTGCACTTTCACGACA+AGG 0.637525 1:+15191044 MsG0180001046.01.T01:CDS
ACATATACTATTCTTATGAA+GGG 0.637630 1:+15191939 MsG0180001046.01.T01:CDS
CATAGTGTTGAATATAACCT+CGG 0.638796 1:-15191571 None:intergenic
ATCGAAAGAAGCTAAAGCAG+TGG 0.644375 1:+15191455 MsG0180001046.01.T01:CDS
GAAACTGGTCCAGCCTAATG+TGG 0.649671 1:+15191179 MsG0180001046.01.T01:CDS
AACAGCAGTGGTGTAATGGT+TGG 0.658727 1:-15190818 None:intergenic
CTTCGTGAGATGATTACGAG+AGG 0.686158 1:+15192212 MsG0180001046.01.T01:CDS
GTAATGGTTGGCCTTGACAA+GGG 0.717790 1:-15190806 None:intergenic
ATTGCACTTTCACGACAAGG+CGG 0.748270 1:+15191047 MsG0180001046.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATTACATACAATTCTATAT+TGG + Chr1:15191830-15191849 MsG0180001046.01.T01:CDS 15.0%
!! GAATTGTATGTAATTATATT+AGG - Chr1:15191825-15191844 None:intergenic 15.0%
!! TTAAGAAAATTTAAAAACCA+AGG + Chr1:15191897-15191916 MsG0180001046.01.T01:CDS 15.0%
!! TTTGTTACATAAAATGATAT+TGG + Chr1:15191368-15191387 MsG0180001046.01.T01:CDS 15.0%
!! ACATATACTATTCTTATGAA+GGG + Chr1:15191939-15191958 MsG0180001046.01.T01:CDS 20.0%
!! AGAAAAAGATGAAAATGATA+TGG + Chr1:15192178-15192197 MsG0180001046.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAGTATATGTACATAAATC+TGG - Chr1:15191930-15191949 None:intergenic 20.0%
!! TACATATACTATTCTTATGA+AGG + Chr1:15191938-15191957 MsG0180001046.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTCATAAGTTTTAGCATT+TGG - Chr1:15192140-15192159 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTTGTAAGATTAATATGG+TGG + Chr1:15191647-15191666 MsG0180001046.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGGATTTTGTAAGATTAATA+TGG + Chr1:15191644-15191663 MsG0180001046.01.T01:CDS 20.0%
! AAAAGATGAAAATGATATGG+CGG + Chr1:15192181-15192200 MsG0180001046.01.T01:CDS 25.0%
! AACCTAAAATCATTCCAAAA+TGG - Chr1:15190786-15190805 None:intergenic 25.0%
! ACTTATAGTAGTTTGATTAG+TGG + Chr1:15191309-15191328 MsG0180001046.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTATAGTTCTCTTATTGA+TGG + Chr1:15191729-15191748 MsG0180001046.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTATAGTTCTTTACTAGA+TGG + Chr1:15191519-15191538 MsG0180001046.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTTAACTACACTCATTAA+AGG + Chr1:15190994-15191013 MsG0180001046.01.T01:CDS 25.0%
! AGTTATAGCATCATGATTAA+TGG + Chr1:15191624-15191643 MsG0180001046.01.T01:CDS 25.0%
! ATACTCATGGTATAAACATT+TGG - Chr1:15191405-15191424 None:intergenic 25.0%
! CATCGAAAAATGGAATTAAA+CGG + Chr1:15190847-15190866 MsG0180001046.01.T01:CDS 25.0%
! CTTAAGAATCTTAGCAAATA+CGG - Chr1:15190950-15190969 None:intergenic 25.0%
! GAACTATAAGTAACAACATT+AGG - Chr1:15191510-15191529 None:intergenic 25.0%
! TACTCATGGTATAAACATTT+GGG - Chr1:15191404-15191423 None:intergenic 25.0%
! TGTTTATACCATGAGTATAT+TGG + Chr1:15191407-15191426 MsG0180001046.01.T01:CDS 25.0%
! TTTACATAATCCATTAACCA+AGG - Chr1:15191112-15191131 None:intergenic 25.0%
! TTTGCTAAGATTCTTAAGAT+GGG + Chr1:15190952-15190971 MsG0180001046.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTGCTAAGATTCTTAAGA+TGG + Chr1:15190951-15190970 MsG0180001046.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATCAATTGTTTCTGTCATTT+GGG + Chr1:15190904-15190923 MsG0180001046.01.T01:CDS 25.0%
!!! GTTAATGGATTATGTAAAGT+TGG + Chr1:15191114-15191133 MsG0180001046.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTCCATTTTGGAATGATTTT+AGG + Chr1:15190781-15190800 MsG0180001046.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTCAAGTTCTTCTAATGAA+AGG + Chr1:15192002-15192021 MsG0180001046.01.T01:CDS 25.0%
AATCATTCCAAAATGGAAGA+TGG - Chr1:15190779-15190798 None:intergenic 30.0%
AATCTTAGCAAATACGGAAA+AGG - Chr1:15190944-15190963 None:intergenic 30.0%
ATAAATCTGGTTGAATACCT+TGG - Chr1:15191917-15191936 None:intergenic 30.0%
ATCATTCCAAAATGGAAGAT+GGG - Chr1:15190778-15190797 None:intergenic 30.0%
ATGTATAACACGATCATTGA+TGG + Chr1:15191204-15191223 MsG0180001046.01.T01:CDS 30.0%
ATTAAAGGTCTCTGTCTTAA+AGG + Chr1:15191009-15191028 MsG0180001046.01.T01:CDS 30.0%
CGGTTTGATATTGTTAGTTA+TGG + Chr1:15191084-15191103 MsG0180001046.01.T01:CDS 30.0%
CTGTCAAAAATGAAAGACAA+TGG + Chr1:15192107-15192126 MsG0180001046.01.T01:CDS 30.0%
GAACTATAAGTTATCGTATC+AGG - Chr1:15191720-15191739 None:intergenic 30.0%
GTAGTTAAAGTTATAGCATC+TGG - Chr1:15190985-15191004 None:intergenic 30.0%
GTGTTATACATTACCACATT+AGG - Chr1:15191195-15191214 None:intergenic 30.0%
TATTGTTAGTTATGGAACCT+TGG + Chr1:15191092-15191111 MsG0180001046.01.T01:CDS 30.0%
TCTTGTTAAACAAGTGAACA+AGG + Chr1:15191548-15191567 MsG0180001046.01.T01:CDS 30.0%
TGTTTCACTTCATCGAAAAA+TGG + Chr1:15190837-15190856 MsG0180001046.01.T01:CDS 30.0%
! CATAGTGTTGAATATAACCT+CGG - Chr1:15191574-15191593 None:intergenic 30.0%
!! ATTGGTTGATGCTTTTTGTA+AGG + Chr1:15191425-15191444 MsG0180001046.01.T01:CDS 30.0%
!! GATCAATTGTTTCTGTCATT+TGG + Chr1:15190903-15190922 MsG0180001046.01.T01:CDS 30.0%
!!! TACGCCTTTTTTCATCAAAA+CGG - Chr1:15191484-15191503 None:intergenic 30.0%
ACGTATACTGTTATGATCCA+AGG + Chr1:15192044-15192063 MsG0180001046.01.T01:CDS 35.0%
AGCATCAACCAATATACTCA+TGG - Chr1:15191418-15191437 None:intergenic 35.0%
AGTTATGGAACCTTGGTTAA+TGG + Chr1:15191099-15191118 MsG0180001046.01.T01:CDS 35.0%
ATCCAAGGATTCTGTTACAA+GGG + Chr1:15192059-15192078 MsG0180001046.01.T01:CDS 35.0%
CGAGGTTATATTCAACACTA+TGG + Chr1:15191572-15191591 MsG0180001046.01.T01:CDS 35.0%
CTACTATAAGTGACAACATC+AGG - Chr1:15191300-15191319 None:intergenic 35.0%
TATACATTACCACATTAGGC+TGG - Chr1:15191191-15191210 None:intergenic 35.0%
TTAAAGTTATAGCATCTGGC+TGG - Chr1:15190981-15191000 None:intergenic 35.0%
! AGTTCTCTTATTGATGGCTT+GGG + Chr1:15191735-15191754 MsG0180001046.01.T01:CDS 35.0%
! ATTAGTGGCTTTTGCATTGT+GGG + Chr1:15191324-15191343 MsG0180001046.01.T01:CDS 35.0%
! TAGTTCTCTTATTGATGGCT+TGG + Chr1:15191734-15191753 MsG0180001046.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTGATGCTTTTTGTAAGGA+AGG + Chr1:15191429-15191448 MsG0180001046.01.T01:CDS 35.0%
!!! GTTGCCGTTTTGATGAAAAA+AGG + Chr1:15191477-15191496 MsG0180001046.01.T01:CDS 35.0%
ATCAGCAATCACTCCACTTT+GGG - Chr1:15191598-15191617 None:intergenic 40.0%
ATCGAAAGAAGCTAAAGCAG+TGG + Chr1:15191455-15191474 MsG0180001046.01.T01:CDS 40.0%
ATGAAGGGACTATGTCTGAA+TGG + Chr1:15191954-15191973 MsG0180001046.01.T01:CDS 40.0%
ATGTCTGAATGGAAGGCTTA+AGG + Chr1:15191965-15191984 MsG0180001046.01.T01:CDS 40.0%
ATTCCAAAATGGAAGATGGG+TGG - Chr1:15190775-15190794 None:intergenic 40.0%
GATCCAAGGATTCTGTTACA+AGG + Chr1:15192058-15192077 MsG0180001046.01.T01:CDS 40.0%
TCATATGCTTGGCAACTTGT+AGG + Chr1:15191774-15191793 MsG0180001046.01.T01:CDS 40.0%
TTCCAAAATGGAAGATGGGT+GGG - Chr1:15190774-15190793 None:intergenic 40.0%
! CGTGAAAGTGCAATGCTTTA+CGG - Chr1:15191041-15191060 None:intergenic 40.0%
! GATTAGTGGCTTTTGCATTG+TGG + Chr1:15191323-15191342 MsG0180001046.01.T01:CDS 40.0%
!! AATTGCTGAGACGAGTTGAT+GGG + Chr1:15191157-15191176 MsG0180001046.01.T01:CDS 40.0%
!!! GATTTTAGGTTCCCTTGTCA+AGG + Chr1:15190795-15190814 MsG0180001046.01.T01:CDS 40.0%
AAATGGAAGATGGGTGGGAT+AGG - Chr1:15190769-15190788 None:intergenic 45.0%
AACAGCAGTGGTGTAATGGT+TGG - Chr1:15190821-15190840 None:intergenic 45.0%
AACTCGTCTCAGCAATTCCA+AGG - Chr1:15191154-15191173 None:intergenic 45.0%
AAGGCTTAAGGATGCACAAG+AGG + Chr1:15191977-15191996 MsG0180001046.01.T01:CDS 45.0%
AGCATTGCACTTTCACGACA+AGG + Chr1:15191044-15191063 MsG0180001046.01.T01:CDS 45.0%
AGCCCTTGTAACAGAATCCT+TGG - Chr1:15192064-15192083 None:intergenic 45.0%
AGGGACTATGTCTGAATGGA+AGG + Chr1:15191958-15191977 MsG0180001046.01.T01:CDS 45.0%
AGGTCTCTGTCTTAAAGGTG+AGG + Chr1:15191014-15191033 MsG0180001046.01.T01:CDS 45.0%
ATGCGATTGCTTCGTCAACA+TGG - Chr1:15191875-15191894 None:intergenic 45.0%
ATTGCACTTTCACGACAAGG+CGG + Chr1:15191047-15191066 MsG0180001046.01.T01:CDS 45.0%
CAGGGAGAATCTCATATGCT+TGG + Chr1:15191763-15191782 MsG0180001046.01.T01:CDS 45.0%
CATCAGCAATCACTCCACTT+TGG - Chr1:15191599-15191618 None:intergenic 45.0%
CTTCGTGAGATGATTACGAG+AGG + Chr1:15192212-15192231 MsG0180001046.01.T01:CDS 45.0%
GTAGGTGAGATGCATGATAG+AGG + Chr1:15191792-15191811 MsG0180001046.01.T01:CDS 45.0%
GTGAAACAGCAGTGGTGTAA+TGG - Chr1:15190825-15190844 None:intergenic 45.0%
TAAACAAGTGAACAAGGCCG+AGG + Chr1:15191554-15191573 MsG0180001046.01.T01:CDS 45.0%
TCGATGAAGTGAAACAGCAG+TGG - Chr1:15190833-15190852 None:intergenic 45.0%
TTCAACACTATGGCCCAAAG+TGG + Chr1:15191582-15191601 MsG0180001046.01.T01:CDS 45.0%
! ATCCCACCCATCTTCCATTT+TGG + Chr1:15190769-15190788 MsG0180001046.01.T01:CDS 45.0%
! ATTGATGGCTTGGGCAAATC+AGG + Chr1:15191744-15191763 MsG0180001046.01.T01:CDS 45.0%
! GAATTGCTGAGACGAGTTGA+TGG + Chr1:15191156-15191175 MsG0180001046.01.T01:CDS 45.0%
! TTGATGGCTTGGGCAAATCA+GGG + Chr1:15191745-15191764 MsG0180001046.01.T01:CDS 45.0%
!! GTAATGGTTGGCCTTGACAA+GGG - Chr1:15190809-15190828 None:intergenic 45.0%
!! TGTAATGGTTGGCCTTGACA+AGG - Chr1:15190810-15190829 None:intergenic 45.0%
GAAACTGGTCCAGCCTAATG+TGG + Chr1:15191179-15191198 MsG0180001046.01.T01:CDS 50.0%
GGGCTTATTTGATGAAGCGC+TGG + Chr1:15192079-15192098 MsG0180001046.01.T01:CDS 50.0%
TGGAGAAACAAGAGCTGCCT+TGG + Chr1:15191134-15191153 MsG0180001046.01.T01:CDS 50.0%
!! GAGACGAGTTGATGGGAAAC+TGG + Chr1:15191164-15191183 MsG0180001046.01.T01:CDS 50.0%
AGGCGGTAGCGCATGGATTT+CGG + Chr1:15191064-15191083 MsG0180001046.01.T01:CDS 55.0%
CACGACAAGGCGGTAGCGCA+TGG + Chr1:15191057-15191076 MsG0180001046.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 15190751 15192241 15190751 ID=MsG0180001046.01;Name=MsG0180001046.01
Chr1 mRNA 15190751 15192241 15190751 ID=MsG0180001046.01.T01;Parent=MsG0180001046.01;Name=MsG0180001046.01.T01;_AED=0.29;_eAED=0.29;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|496
Chr1 exon 15190751 15192241 15190751 ID=MsG0180001046.01.T01:exon:30788;Parent=MsG0180001046.01.T01
Chr1 CDS 15190751 15192241 15190751 ID=MsG0180001046.01.T01:cds;Parent=MsG0180001046.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180001046.01.T01

ATGCTTCATCAAAATCCTATCCCACCCATCTTCCATTTTGGAATGATTTTAGGTTCCCTTGTCAAGGCCAACCATTACACCACTGCTGTTTCACTTCATCGAAAAATGGAATTAAACGGAGTTGCATCAAACTTAATCACTATGAGCATCTTGATCAATTGTTTCTGTCATTTGGGTCAAAACTCTTTTTCCTTTTCCGTATTTGCTAAGATTCTTAAGATGGGTTACCAGCCAGATGCTATAACTTTAACTACACTCATTAAAGGTCTCTGTCTTAAAGGTGAGGTCCGTAAAGCATTGCACTTTCACGACAAGGCGGTAGCGCATGGATTTCGGTTTGATATTGTTAGTTATGGAACCTTGGTTAATGGATTATGTAAAGTTGGAGAAACAAGAGCTGCCTTGGAATTGCTGAGACGAGTTGATGGGAAACTGGTCCAGCCTAATGTGGTAATGTATAACACGATCATTGATGGTATGTGCACAGATAAACTTGTTAATGATGCATTTGATTTATATTCTGAAATGATTGCTAAGAGAATTTCTCCTGATGTTGTCACTTATAGTAGTTTGATTAGTGGCTTTTGCATTGTGGGTCAATTGAAAGATGCAATTGATTTGTTACATAAAATGATATTGGAAAACATTAACCCAAATGTTTATACCATGAGTATATTGGTTGATGCTTTTTGTAAGGAAGGAAAATCGAAAGAAGCTAAAGCAGTGGTTGCCGTTTTGATGAAAAAAGGCGTAAAACCTAATGTTGTTACTTATAGTTCTTTACTAGATGGATATTGTCTTGTTAAACAAGTGAACAAGGCCGAGGTTATATTCAACACTATGGCCCAAAGTGGAGTGATTGCTGATGTTCAAAGTTATAGCATCATGATTAATGGATTTTGTAAGATTAATATGGTGGATGAAGCTATCAATCTCTTCAAAGAAATGCAACGCAGACAACTCATTCCTGATACGATAACTTATAGTTCTCTTATTGATGGCTTGGGCAAATCAGGGAGAATCTCATATGCTTGGCAACTTGTAGGTGAGATGCATGATAGAGGTCAACAACCTAATATAATTACATACAATTCTATATTGGATGCTTTATTGAAAAATCGCCATGTTGACGAAGCAATCGCATTGTTAAGAAAATTTAAAAACCAAGGTATTCAACCAGATTTATGTACATATACTATTCTTATGAAGGGACTATGTCTGAATGGAAGGCTTAAGGATGCACAAGAGGTTTTTCAAGTTCTTCTAATGAAAGGCTACAATCTAAATGTGTATACGTATACTGTTATGATCCAAGGATTCTGTTACAAGGGCTTATTTGATGAAGCGCTGGCTTTGCTGTCAAAAATGAAAGACAATGGCTGCATGCCAAATGCTAAAACTTATGAAATAATTATTCTTTCTTTGTTAGAAAAAGATGAAAATGATATGGCGGAAAAACTTCTTCGTGAGATGATTACGAGAGGCCTATAG
Protein sequence

>MsG0180001046.01.T01

MLHQNPIPPIFHFGMILGSLVKANHYTTAVSLHRKMELNGVASNLITMSILINCFCHLGQNSFSFSVFAKILKMGYQPDAITLTTLIKGLCLKGEVRKALHFHDKAVAHGFRFDIVSYGTLVNGLCKVGETRAALELLRRVDGKLVQPNVVMYNTIIDGMCTDKLVNDAFDLYSEMIAKRISPDVVTYSSLISGFCIVGQLKDAIDLLHKMILENINPNVYTMSILVDAFCKEGKSKEAKAVVAVLMKKGVKPNVVTYSSLLDGYCLVKQVNKAEVIFNTMAQSGVIADVQSYSIMINGFCKINMVDEAINLFKEMQRRQLIPDTITYSSLIDGLGKSGRISYAWQLVGEMHDRGQQPNIITYNSILDALLKNRHVDEAIALLRKFKNQGIQPDLCTYTILMKGLCLNGRLKDAQEVFQVLLMKGYNLNVYTYTVMIQGFCYKGLFDEALALLSKMKDNGCMPNAKTYEIIILSLLEKDENDMAEKLLREMITRGL*