AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680033777.01

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MsG0680033777.01.T01 AT2G35130 25.862 290 174 5 258 541 165 419 3.05e-20 94.7
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MsG0680033777.01.T01 AT1G77360 26.277 274 200 2 268 541 98 369 6.92e-28 117
MsG0680033777.01.T01 AT1G77360 22.520 373 284 4 160 530 129 498 4.15e-31 127
MsG0680033777.01.T01 AT1G77360 25.352 355 229 4 34 388 178 496 4.74e-31 127
MsG0680033777.01.T01 AT1G77360 24.620 329 246 2 130 458 170 496 1.07e-30 125
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MsG0680033777.01.T01 AT1G77360 24.194 372 270 5 60 425 133 498 3.94e-28 118
MsG0680033777.01.T01 AT1G77360 28.053 303 215 3 233 535 134 433 4.21e-28 118
MsG0680033777.01.T01 AT1G77360 26.277 274 200 2 268 541 134 405 7.15e-28 117
MsG0680033777.01.T01 AT3G04130 28.239 301 209 5 245 540 130 428 4.51e-31 127
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MsG0680033777.01.T01 AT3G23020 21.322 469 347 9 40 493 381 842 1.49e-20 96.3
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MsG0680033777.01.T01 AT1G18900 27.189 217 158 0 296 512 357 573 3.30e-20 95.1
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MsG0680033777.01.T01 AT2G44880 22.481 516 301 12 66 540 52 509 2.31e-25 110
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MsG0680033777.01.T01 AT3G53170 21.728 382 258 7 68 439 115 465 2.67e-13 72.8
MsG0680033777.01.T01 AT2G36980 24.419 430 296 10 92 515 34 440 3.39e-20 94.7
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MsG0680033777.01.T01 AT5G39680 25.828 302 200 9 144 440 253 535 6.39e-17 84.7
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MsG0680033777.01.T01 AT1G60770 21.324 408 300 6 143 541 42 437 1.65e-16 82.8
MsG0680033777.01.T01 AT3G13770 22.018 327 240 8 183 504 103 419 6.91e-17 84.3
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MsG0680033777.01.T01 AT4G37170 21.463 410 262 11 118 522 75 429 2.22e-14 76.6
MsG0680033777.01.T01 AT1G68980 23.614 415 297 11 65 465 158 566 1.57e-15 80.1
MsG0680033777.01.T01 AT1G68980 22.024 336 213 7 197 487 186 517 2.13e-13 73.6
MsG0680033777.01.T01 AT3G26630 23.077 338 241 7 192 522 37 362 1.64e-15 79.3
MsG0680033777.01.T01 AT3G26630 21.450 331 245 6 125 453 116 433 2.35e-11 66.6
MsG0680033777.01.T01 AT5G65570 22.442 557 338 15 20 535 54 557 1.68e-15 80.1
MsG0680033777.01.T01 AT2G39620 18.243 444 344 7 67 504 337 767 2.04e-15 80.1
MsG0680033777.01.T01 AT2G39620 19.647 397 304 6 43 435 383 768 1.71e-14 77.0
MsG0680033777.01.T01 AT2G39620 22.096 439 268 13 99 525 240 616 2.73e-14 76.6

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Find 103 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CAATGCAAAATCCATAAATT+AGG 0.165890 6:-73306369 None:intergenic
ATGAAAGGTTTGTGTCTTAA+TGG 0.180312 6:+73306058 MsG0680033777.01.T01:CDS
CCTTGTTAATGAAGTTAATA+AGG 0.242238 6:+73306597 MsG0680033777.01.T01:CDS
TGTTACCTACAATTCATTAA+TGG 0.245388 6:+73306564 MsG0680033777.01.T01:CDS
AGCTATAGTATCATGATTAA+TGG 0.277695 6:+73306673 MsG0680033777.01.T01:CDS
GATCAATGGATTGTGTAAAA+TGG 0.280187 6:+73306162 MsG0680033777.01.T01:CDS
GAATTATAAGTTACCGTATC+AGG 0.285079 6:-73306766 None:intergenic
ATTTGATTTGTTTCATGAAA+TGG 0.317078 6:+73306411 MsG0680033777.01.T01:CDS
AAGGCTACAATTTAACAGTT+TGG 0.326804 6:+73307070 MsG0680033777.01.T01:CDS
GAAACAAATTGAAGGGAAAA+TGG 0.327317 6:+73306213 MsG0680033777.01.T01:CDS
TGGATTCTGTAAGATTAAAA+TGG 0.330296 6:+73306693 MsG0680033777.01.T01:CDS
ATTGATGGTTTGTGCAAATC+TGG 0.338790 6:+73306793 MsG0680033777.01.T01:CDS
AAAACCAATCTTGAGAATCT+TGG 0.347964 6:-73306005 None:intergenic
ACTTATAATTCTCTAATTGA+TGG 0.356275 6:+73306778 MsG0680033777.01.T01:CDS
AATGCAAAATCCATAAATTA+GGG 0.370972 6:-73306368 None:intergenic
CACGACCATGTGTTTGCACT+TGG 0.374183 6:+73306106 MsG0680033777.01.T01:CDS
TAGAAAGGGAAATAACAGTT+TGG 0.375863 6:-73305886 None:intergenic
GATCAATGGTCTTTGTTTAG+AGG 0.379325 6:+73307107 MsG0680033777.01.T01:CDS
ATAGCATAATCAACAGTATT+GGG 0.383899 6:-73305770 None:intergenic
CATAAGTGTAGTGAAGGTTA+TGG 0.386863 6:-73306038 None:intergenic
TTCGCCAAGATTCTCAAGAT+TGG 0.398063 6:+73306001 MsG0680033777.01.T01:CDS
GTAGTGAAGGTTATGGTATC+AGG 0.411419 6:-73306031 None:intergenic
TATAATACTTAACACATGTT+TGG 0.419094 6:-73306620 None:intergenic
GGGAAATAACAGTTTGGTAA+TGG 0.423636 6:-73305880 None:intergenic
CACTTGGATCATGTTAGCTA+TGG 0.427108 6:+73306133 MsG0680033777.01.T01:CDS
TCCATCCATTAATGAATTGT+AGG 0.430371 6:-73306569 None:intergenic
GAAGAGAATAACAAGAAAAG+TGG 0.431705 6:-73305708 None:intergenic
GTTTCACAAGTTACAGCATC+AGG 0.436241 6:-73307186 None:intergenic
GGTAATGGTTCAATTTAAGA+AGG 0.441526 6:-73305865 None:intergenic
ATCAATGGTCTTTGTTTAGA+GGG 0.444096 6:+73307108 MsG0680033777.01.T01:CDS
ATACTATAGCTACGAGCATT+GGG 0.447761 6:-73306661 None:intergenic
TTTACACAATCCATTGATCA+AGG 0.450313 6:-73306158 None:intergenic
GCACTAAAAGTGACAACATC+AGG 0.455811 6:-73306346 None:intergenic
ATCAATGGATTGTGTAAAAT+GGG 0.460357 6:+73306163 MsG0680033777.01.T01:CDS
ATATTAAAAGTATAAACATC+AGG 0.461066 6:-73306451 None:intergenic
CTGGGAGAATCTCCCATGCT+TGG 0.465958 6:+73306812 MsG0680033777.01.T01:CDS
AATAGCATAATCAACAGTAT+TGG 0.466023 6:-73305771 None:intergenic
TGTTTCAACATCTGCAAGGC+GGG 0.475325 6:-73306196 None:intergenic
GATACTATAGCTACGAGCAT+TGG 0.480404 6:-73306662 None:intergenic
TGGGAGAATCTCCCATGCTT+GGG 0.481570 6:+73306813 MsG0680033777.01.T01:CDS
ATGCAAACAAGGAAGGCTTA+AGG 0.493158 6:+73307014 MsG0680033777.01.T01:CDS
ACTTGGATCATGTTAGCTAT+GGG 0.494006 6:+73306134 MsG0680033777.01.T01:CDS
ACATATAATATTATGATCAA+TGG 0.498176 6:+73307093 MsG0680033777.01.T01:CDS
CCTTATTAACTTCATTAACA+AGG 0.502487 6:-73306597 None:intergenic
ATTGGTTGATGCTCTATGTA+AGG 0.504718 6:+73306474 MsG0680033777.01.T01:CDS
CAGATGTTGAAACAAATTGA+AGG 0.505288 6:+73306205 MsG0680033777.01.T01:CDS
AGCTATGGGACCTTGATCAA+TGG 0.508902 6:+73306148 MsG0680033777.01.T01:CDS
AATCTTGGCGAATATAGAAA+AGG 0.509595 6:-73305990 None:intergenic
AAGAGAATAACAAGAAAAGT+GGG 0.510299 6:-73305707 None:intergenic
GTTGATGAGATGCGTGGTAA+TGG 0.510765 6:+73306841 MsG0680033777.01.T01:CDS
GTAATGGTTCAATTTAAGAA+GGG 0.515855 6:-73305864 None:intergenic
AGGTTTGTGTCTTAATGGTA+AGG 0.517066 6:+73306063 MsG0680033777.01.T01:CDS
CAGAAGAATTGCTCCTGATA+CGG 0.522984 6:+73306753 MsG0680033777.01.T01:CDS
CATCAACAAGCTCCCAAGCA+TGG 0.524732 6:-73306825 None:intergenic
GTTTGCACTTGGATTTCACT+TGG 0.524856 6:+73306117 MsG0680033777.01.T01:CDS
ACCTTCACTACACTTATGAA+AGG 0.527454 6:+73306043 MsG0680033777.01.T01:CDS
GCGAATATAGAAAAGGCAAA+AGG 0.530469 6:-73305983 None:intergenic
TTGAAAATGATAAGAACGAA+AGG 0.536756 6:+73307226 MsG0680033777.01.T01:CDS
TTGTAAGTGATTATATCAGC+TGG 0.537245 6:-73306868 None:intergenic
CAATAGCCTTGTCAACATGA+TGG 0.537413 6:-73306918 None:intergenic
ATGGTTCAATTTAAGAAGGG+AGG 0.538476 6:-73305861 None:intergenic
ACATATCTAGTTGAATGTCT+TGG 0.543810 6:-73306963 None:intergenic
ACCTACAATTCATTAATGGA+TGG 0.551321 6:+73306568 MsG0680033777.01.T01:CDS
AATTGAATGATGGATGGCGT+AGG 0.554746 6:-73305824 None:intergenic
TGAAAATGATAAGAACGAAA+GGG 0.555864 6:+73307227 MsG0680033777.01.T01:CDS
ACCTTTCATAAGTGTAGTGA+AGG 0.556526 6:-73306044 None:intergenic
ATCAACAAGCTCCCAAGCAT+GGG 0.557652 6:-73306824 None:intergenic
ATTGAATGATGGATGGCGTA+GGG 0.558369 6:-73305823 None:intergenic
ACATATAATATACTTATCGA+TGG 0.573220 6:+73306988 MsG0680033777.01.T01:CDS
GTTGATGCTCTATGTAAGGA+AGG 0.575458 6:+73306478 MsG0680033777.01.T01:CDS
AGATGTTGAAACAAATTGAA+GGG 0.577703 6:+73306206 MsG0680033777.01.T01:CDS
TTGATGGTTTGTGCAAATCT+GGG 0.583643 6:+73306794 MsG0680033777.01.T01:CDS
TTGTTAAATTGAATGATGGA+TGG 0.585468 6:-73305830 None:intergenic
TGAAATGATAAGAGAAGACT+AGG 0.587368 6:+73307266 MsG0680033777.01.T01:CDS
ATGGACTATGCAAACAAGGA+AGG 0.597610 6:+73307007 MsG0680033777.01.T01:CDS
GGGTTTGCTTGATGAAGCTG+AGG 0.598755 6:+73307128 MsG0680033777.01.T01:CDS
AGAAGAAGAATAAAACCTGA+AGG 0.609630 6:-73305678 None:intergenic
AATTTGTTTCAACATCTGCA+AGG 0.613566 6:-73306200 None:intergenic
GAAATCCAAGTGCAAACACA+TGG 0.614816 6:-73306111 None:intergenic
TATTAAAAGTATAAACATCA+GGG 0.616067 6:-73306450 None:intergenic
TATTATATCTCGAATGAGAG+TGG 0.628230 6:+73306636 MsG0680033777.01.T01:CDS
ATCGATGGACTATGCAAACA+AGG 0.634978 6:+73307003 MsG0680033777.01.T01:CDS
CATTTCATAAAAGAGACTCA+AGG 0.636638 6:-73306725 None:intergenic
TGTGTTGTACATTACCACAT+TGG 0.648894 6:-73306242 None:intergenic
TGGATGGCGTAGGGTTCAAG+CGG 0.662472 6:-73305814 None:intergenic
TTGTTTCAACATCTGCAAGG+CGG 0.662596 6:-73306197 None:intergenic
ATAGCTGTGATGATGAAAGA+AGG 0.663939 6:+73306526 MsG0680033777.01.T01:CDS
GAAAATGGTCGACACCAATG+TGG 0.698888 6:+73306228 MsG0680033777.01.T01:CDS
GAGCTTGTTGATGAGATGCG+TGG 0.732577 6:+73306835 MsG0680033777.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TGTTTATACTTTTAATATAT+TGG + Chr6:73306456-73306475 MsG0680033777.01.T01:CDS 10.0%
!! ACATATAATATTATGATCAA+TGG + Chr6:73307093-73307112 MsG0680033777.01.T01:CDS 15.0%
!!! AATTTCCAATTTTTTAGAAA+GGG - Chr6:73305903-73305922 None:intergenic 15.0%
!!! AATTTTGTTAAATTGAATGA+TGG - Chr6:73305837-73305856 None:intergenic 15.0%
!!! ATATTAAAAGTATAAACATC+AGG - Chr6:73306454-73306473 None:intergenic 15.0%
!!! TAATTTCCAATTTTTTAGAA+AGG - Chr6:73305904-73305923 None:intergenic 15.0%
!!! TATTAAAAGTATAAACATCA+GGG - Chr6:73306453-73306472 None:intergenic 15.0%
!!! TTTCTAAAAAATTGGAAATT+AGG + Chr6:73305903-73305922 MsG0680033777.01.T01:CDS 15.0%
!! AATGCAAAATCCATAAATTA+GGG - Chr6:73306371-73306390 None:intergenic 20.0%
!! ACATATAATATACTTATCGA+TGG + Chr6:73306988-73307007 MsG0680033777.01.T01:CDS 20.0%
!! ACTTATAATTCTCTAATTGA+TGG + Chr6:73306778-73306797 MsG0680033777.01.T01:CDS 20.0%
!! TATAATACTTAACACATGTT+TGG - Chr6:73306623-73306642 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTGATTTGTTTCATGAAA+TGG + Chr6:73306411-73306430 MsG0680033777.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTTCCCTTTCTAAAAAAT+TGG + Chr6:73305895-73305914 MsG0680033777.01.T01:CDS 20.0%
! AAGAGAATAACAAGAAAAGT+GGG - Chr6:73305710-73305729 None:intergenic 25.0%
! AATAGCATAATCAACAGTAT+TGG - Chr6:73305774-73305793 None:intergenic 25.0%
! AGATGTTGAAACAAATTGAA+GGG + Chr6:73306206-73306225 MsG0680033777.01.T01:CDS 25.0%
! AGCTATAGTATCATGATTAA+TGG + Chr6:73306673-73306692 MsG0680033777.01.T01:CDS 25.0%
! ATAGCATAATCAACAGTATT+GGG - Chr6:73305773-73305792 None:intergenic 25.0%
! CAATGCAAAATCCATAAATT+AGG - Chr6:73306372-73306391 None:intergenic 25.0%
! CCTTATTAACTTCATTAACA+AGG - Chr6:73306600-73306619 None:intergenic 25.0%
! CCTTGTTAATGAAGTTAATA+AGG + Chr6:73306597-73306616 MsG0680033777.01.T01:CDS 25.0%
! GTAATGGTTCAATTTAAGAA+GGG - Chr6:73305867-73305886 None:intergenic 25.0%
! TGAAAATGATAAGAACGAAA+GGG + Chr6:73307227-73307246 MsG0680033777.01.T01:CDS 25.0%
! TGGATTCTGTAAGATTAAAA+TGG + Chr6:73306693-73306712 MsG0680033777.01.T01:CDS 25.0%
! TGTTACCTACAATTCATTAA+TGG + Chr6:73306564-73306583 MsG0680033777.01.T01:CDS 25.0%
! TTGAAAATGATAAGAACGAA+AGG + Chr6:73307226-73307245 MsG0680033777.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTATGGATTTTGCATTGT+TGG + Chr6:73306373-73306392 MsG0680033777.01.T01:CDS 25.0%
!! TTGTTAAATTGAATGATGGA+TGG - Chr6:73305833-73305852 None:intergenic 25.0%
!!! ATCAATGGATTGTGTAAAAT+GGG + Chr6:73306163-73306182 MsG0680033777.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTCAGGATCTTTTGATTAA+AGG + Chr6:73307051-73307070 MsG0680033777.01.T01:CDS 25.0%
AAAACCAATCTTGAGAATCT+TGG - Chr6:73306008-73306027 None:intergenic 30.0%
AAGGCTACAATTTAACAGTT+TGG + Chr6:73307070-73307089 MsG0680033777.01.T01:CDS 30.0%
AATCTTGGCGAATATAGAAA+AGG - Chr6:73305993-73306012 None:intergenic 30.0%
ACATATCTAGTTGAATGTCT+TGG - Chr6:73306966-73306985 None:intergenic 30.0%
ACCTACAATTCATTAATGGA+TGG + Chr6:73306568-73306587 MsG0680033777.01.T01:CDS 30.0%
AGAAGAAGAATAAAACCTGA+AGG - Chr6:73305681-73305700 None:intergenic 30.0%
ATGAAAGGTTTGTGTCTTAA+TGG + Chr6:73306058-73306077 MsG0680033777.01.T01:CDS 30.0%
CAGATGTTGAAACAAATTGA+AGG + Chr6:73306205-73306224 MsG0680033777.01.T01:CDS 30.0%
CATTTCATAAAAGAGACTCA+AGG - Chr6:73306728-73306747 None:intergenic 30.0%
GAAACAAATTGAAGGGAAAA+TGG + Chr6:73306213-73306232 MsG0680033777.01.T01:CDS 30.0%
GAAGAGAATAACAAGAAAAG+TGG - Chr6:73305711-73305730 None:intergenic 30.0%
GAATTATAAGTTACCGTATC+AGG - Chr6:73306769-73306788 None:intergenic 30.0%
TAGAAAGGGAAATAACAGTT+TGG - Chr6:73305889-73305908 None:intergenic 30.0%
TATTATATCTCGAATGAGAG+TGG + Chr6:73306636-73306655 MsG0680033777.01.T01:CDS 30.0%
TCCATCCATTAATGAATTGT+AGG - Chr6:73306572-73306591 None:intergenic 30.0%
TTGTAAGTGATTATATCAGC+TGG - Chr6:73306871-73306890 None:intergenic 30.0%
TTGTCAAAAATGGAAGACAA+TGG + Chr6:73307156-73307175 MsG0680033777.01.T01:CDS 30.0%
TTTACACAATCCATTGATCA+AGG - Chr6:73306161-73306180 None:intergenic 30.0%
! AATTTGTTTCAACATCTGCA+AGG - Chr6:73306203-73306222 None:intergenic 30.0%
! ACTTTTAGTGCCCTAATTTA+TGG + Chr6:73306358-73306377 MsG0680033777.01.T01:CDS 30.0%
! ATCAATGGTCTTTGTTTAGA+GGG + Chr6:73307108-73307127 MsG0680033777.01.T01:CDS 30.0%
! GGTAATGGTTCAATTTAAGA+AGG - Chr6:73305868-73305887 None:intergenic 30.0%
!! GATCAATGGATTGTGTAAAA+TGG + Chr6:73306162-73306181 MsG0680033777.01.T01:CDS 30.0%
ACCTTCACTACACTTATGAA+AGG + Chr6:73306043-73306062 MsG0680033777.01.T01:CDS 35.0%
ACCTTTCATAAGTGTAGTGA+AGG - Chr6:73306047-73306066 None:intergenic 35.0%
ACTTGGATCATGTTAGCTAT+GGG + Chr6:73306134-73306153 MsG0680033777.01.T01:CDS 35.0%
AGGTTTGTGTCTTAATGGTA+AGG + Chr6:73306063-73306082 MsG0680033777.01.T01:CDS 35.0%
ATACTATAGCTACGAGCATT+GGG - Chr6:73306664-73306683 None:intergenic 35.0%
ATGGTTCAATTTAAGAAGGG+AGG - Chr6:73305864-73305883 None:intergenic 35.0%
CAAAAACCATCATGTTGACA+AGG + Chr6:73306912-73306931 MsG0680033777.01.T01:CDS 35.0%
CATAAGTGTAGTGAAGGTTA+TGG - Chr6:73306041-73306060 None:intergenic 35.0%
GCGAATATAGAAAAGGCAAA+AGG - Chr6:73305986-73306005 None:intergenic 35.0%
GGGAAATAACAGTTTGGTAA+TGG - Chr6:73305883-73305902 None:intergenic 35.0%
TGTGTTGTACATTACCACAT+TGG - Chr6:73306245-73306264 None:intergenic 35.0%
! ATAGCTGTGATGATGAAAGA+AGG + Chr6:73306526-73306545 MsG0680033777.01.T01:CDS 35.0%
! ATTGATGGTTTGTGCAAATC+TGG + Chr6:73306793-73306812 MsG0680033777.01.T01:CDS 35.0%
! ATTGGTTGATGCTCTATGTA+AGG + Chr6:73306474-73306493 MsG0680033777.01.T01:CDS 35.0%
! GATCAATGGTCTTTGTTTAG+AGG + Chr6:73307107-73307126 MsG0680033777.01.T01:CDS 35.0%
! TTGATGGTTTGTGCAAATCT+GGG + Chr6:73306794-73306813 MsG0680033777.01.T01:CDS 35.0%
!! GTCTTCCATTTTTGACAACA+AGG - Chr6:73307154-73307173 None:intergenic 35.0%
ATGCAAACAAGGAAGGCTTA+AGG + Chr6:73307014-73307033 MsG0680033777.01.T01:CDS 40.0%
CACTTGGATCATGTTAGCTA+TGG + Chr6:73306133-73306152 MsG0680033777.01.T01:CDS 40.0%
CAGAAGAATTGCTCCTGATA+CGG + Chr6:73306753-73306772 MsG0680033777.01.T01:CDS 40.0%
GAAATCCAAGTGCAAACACA+TGG - Chr6:73306114-73306133 None:intergenic 40.0%
GATACTATAGCTACGAGCAT+TGG - Chr6:73306665-73306684 None:intergenic 40.0%
GCACTAAAAGTGACAACATC+AGG - Chr6:73306349-73306368 None:intergenic 40.0%
GTAGTGAAGGTTATGGTATC+AGG - Chr6:73306034-73306053 None:intergenic 40.0%
GTTGATGCTCTATGTAAGGA+AGG + Chr6:73306478-73306497 MsG0680033777.01.T01:CDS 40.0%
GTTTCACAAGTTACAGCATC+AGG - Chr6:73307189-73307208 None:intergenic 40.0%
GTTTGCACTTGGATTTCACT+TGG + Chr6:73306117-73306136 MsG0680033777.01.T01:CDS 40.0%
TTCGCCAAGATTCTCAAGAT+TGG + Chr6:73306001-73306020 MsG0680033777.01.T01:CDS 40.0%
TTGTTTCAACATCTGCAAGG+CGG - Chr6:73306200-73306219 None:intergenic 40.0%
! ATGGACTATGCAAACAAGGA+AGG + Chr6:73307007-73307026 MsG0680033777.01.T01:CDS 40.0%
! GGATGCACAAGTGATTTTTC+AGG + Chr6:73307035-73307054 MsG0680033777.01.T01:CDS 40.0%
!! AATTGAATGATGGATGGCGT+AGG - Chr6:73305827-73305846 None:intergenic 40.0%
!! ATCGATGGACTATGCAAACA+AGG + Chr6:73307003-73307022 MsG0680033777.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTGAATGATGGATGGCGTA+GGG - Chr6:73305826-73305845 None:intergenic 40.0%
!! CAATAGCCTTGTCAACATGA+TGG - Chr6:73306921-73306940 None:intergenic 40.0%
!! TGAGGCCTTGTTGTCAAAAA+TGG + Chr6:73307146-73307165 MsG0680033777.01.T01:CDS 40.0%
AGCTATGGGACCTTGATCAA+TGG + Chr6:73306148-73306167 MsG0680033777.01.T01:CDS 45.0%
ATCAACAAGCTCCCAAGCAT+GGG - Chr6:73306827-73306846 None:intergenic 45.0%
GAAAATGGTCGACACCAATG+TGG + Chr6:73306228-73306247 MsG0680033777.01.T01:CDS 45.0%
TGTTTCAACATCTGCAAGGC+GGG - Chr6:73306199-73306218 None:intergenic 45.0%
! GTTGATGAGATGCGTGGTAA+TGG + Chr6:73306841-73306860 MsG0680033777.01.T01:CDS 45.0%
!! CGCTGTTTTCATCATCCTTC+AGG + Chr6:73305663-73305682 MsG0680033777.01.T01:CDS 45.0%
CACGACCATGTGTTTGCACT+TGG + Chr6:73306106-73306125 MsG0680033777.01.T01:CDS 50.0%
CATCAACAAGCTCCCAAGCA+TGG - Chr6:73306828-73306847 None:intergenic 50.0%
TGGGAGAATCTCCCATGCTT+GGG + Chr6:73306813-73306832 MsG0680033777.01.T01:CDS 50.0%
! GGGTTTGCTTGATGAAGCTG+AGG + Chr6:73307128-73307147 MsG0680033777.01.T01:CDS 50.0%
!! GAGCTTGTTGATGAGATGCG+TGG + Chr6:73306835-73306854 MsG0680033777.01.T01:CDS 50.0%
CTGGGAGAATCTCCCATGCT+TGG + Chr6:73306812-73306831 MsG0680033777.01.T01:CDS 55.0%
TGGATGGCGTAGGGTTCAAG+CGG - Chr6:73305817-73305836 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 73305656 73307287 73305656 ID=MsG0680033777.01;Name=MsG0680033777.01
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Chr6 exon 73305656 73307287 73305656 ID=MsG0680033777.01.T01:exon:3783;Parent=MsG0680033777.01.T01
Chr6 CDS 73305656 73307287 73305656 ID=MsG0680033777.01.T01:cds;Parent=MsG0680033777.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680033777.01.T01

ATGTTGTCGCTGTTTTCATCATCCTTCAGGTTTTATTCTTCTTCTACTAAACCCACTTTTCTTGTTATTCTCTTCTTAACAAGAACACGTTACTACTCTTACTCTAGATTTGTTCCCAATACTGTTGATTATGCTATTTCTTCATTTAATCACATGCTCCGCTTGAACCCTACGCCATCCATCATTCAATTTAACAAAATTTTAACCTCCCTTCTTAAATTGAACCATTACCAAACTGTTATTTCCCTTTCTAAAAAATTGGAAATTAGGCAAGATATTTTTACTTTGAACATCTTGATTAATTGCTACTGTCATGTTCGTCAAATGCCTTTTGCCTTTTCTATATTCGCCAAGATTCTCAAGATTGGTTTTCAACCTGATACCATAACCTTCACTACACTTATGAAAGGTTTGTGTCTTAATGGTAAGGTCAACGAAGCTCTACACTTTCACGACCATGTGTTTGCACTTGGATTTCACTTGGATCATGTTAGCTATGGGACCTTGATCAATGGATTGTGTAAAATGGGAGAAACAAGACCCGCCTTGCAGATGTTGAAACAAATTGAAGGGAAAATGGTCGACACCAATGTGGTAATGTACAACACAATTATCGATAGTTTGTGTAAAGATAAACTTGTAAATGATGCATATGAGTTATATTCTGAAATGATTGCAAAGAAAATTTATCCTGATGTTGTCACTTTTAGTGCCCTAATTTATGGATTTTGCATTGTTGGTCAATTGAAAGAAGTATTTGATTTGTTTCATGAAATGGTATTGAAAAACATCAACCCTGATGTTTATACTTTTAATATATTGGTTGATGCTCTATGTAAGGAAGGAAAGATCAAAGAAGCTAAAAGTGTGATAGCTGTGATGATGAAAGAAGGTGTGATGTCAGATGTTGTTACCTACAATTCATTAATGGATGGATATTGCCTTGTTAATGAAGTTAATAAGGCCAAACATGTGTTAAGTATTATATCTCGAATGAGAGTGGCTCCCAATGCTCGTAGCTATAGTATCATGATTAATGGATTCTGTAAGATTAAAATGGTCGACAAAGCCTTGAGTCTCTTTTATGAAATGCGTTGCAGAAGAATTGCTCCTGATACGGTAACTTATAATTCTCTAATTGATGGTTTGTGCAAATCTGGGAGAATCTCCCATGCTTGGGAGCTTGTTGATGAGATGCGTGGTAATGGTCAACCAGCTGATATAATCACTTACAATTCGTTAATAGATGCTTTATGCAAAAACCATCATGTTGACAAGGCTATTGTATTAGTCAAGAAAATTAAAGACCAAGACATTCAACTAGATATGTACACATATAATATACTTATCGATGGACTATGCAAACAAGGAAGGCTTAAGGATGCACAAGTGATTTTTCAGGATCTTTTGATTAAAGGCTACAATTTAACAGTTTGGACATATAATATTATGATCAATGGTCTTTGTTTAGAGGGTTTGCTTGATGAAGCTGAGGCCTTGTTGTCAAAAATGGAAGACAATGGATGTGTTCCTGATGCTGTAACTTGTGAAACAATTATTCGCGCTCTCTTTGAAAATGATAAGAACGAAAGGGCAGAGAAACTACTACTTGAAATGATAAGAGAAGACTAG
Protein sequence

>MsG0680033777.01.T01

MLSLFSSSFRFYSSSTKPTFLVILFLTRTRYYSYSRFVPNTVDYAISSFNHMLRLNPTPSIIQFNKILTSLLKLNHYQTVISLSKKLEIRQDIFTLNILINCYCHVRQMPFAFSIFAKILKIGFQPDTITFTTLMKGLCLNGKVNEALHFHDHVFALGFHLDHVSYGTLINGLCKMGETRPALQMLKQIEGKMVDTNVVMYNTIIDSLCKDKLVNDAYELYSEMIAKKIYPDVVTFSALIYGFCIVGQLKEVFDLFHEMVLKNINPDVYTFNILVDALCKEGKIKEAKSVIAVMMKEGVMSDVVTYNSLMDGYCLVNEVNKAKHVLSIISRMRVAPNARSYSIMINGFCKIKMVDKALSLFYEMRCRRIAPDTVTYNSLIDGLCKSGRISHAWELVDEMRGNGQPADIITYNSLIDALCKNHHVDKAIVLVKKIKDQDIQLDMYTYNILIDGLCKQGRLKDAQVIFQDLLIKGYNLTVWTYNIMINGLCLEGLLDEAEALLSKMEDNGCVPDAVTCETIIRALFENDKNERAEKLLLEMIRED*