AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035214.01

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MsG0680035214.01.T01 AT5G01110 27.410 332 239 1 192 521 174 505 1.52e-40 156
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MsG0680035214.01.T01 AT3G07290 31.445 353 241 1 169 520 155 507 1.83e-50 186
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MsG0680035214.01.T01 AT2G01740 24.451 319 231 2 31 349 235 543 9.85e-30 123
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MsG0680035214.01.T01 AT3G61520 26.357 258 184 3 31 287 478 730 6.20e-20 94.0
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MsG0680035214.01.T01 AT5G28460 27.586 464 318 8 50 498 201 661 1.14e-52 191
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MsG0680035214.01.T01 AT1G63630 26.744 258 189 0 119 376 6 263 1.36e-36 137
MsG0680035214.01.T01 AT1G63630 30.568 229 159 0 292 520 4 232 8.02e-35 132
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MsG0680035214.01.T01 AT1G63630 31.933 119 81 0 403 521 10 128 3.15e-12 67.4
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MsG0680035214.01.T01 AT5G04810 25.176 425 283 1 49 473 464 853 1.69e-44 169
MsG0680035214.01.T01 AT5G04810 27.394 376 263 2 72 437 522 897 1.49e-42 163
MsG0680035214.01.T01 AT5G04810 24.398 332 240 2 36 361 561 887 1.63e-24 108
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MsG0680035214.01.T01 AT5G38730 27.665 394 284 1 50 443 149 541 1.84e-50 182
MsG0680035214.01.T01 AT5G38730 26.044 407 300 1 114 520 143 548 1.73e-46 171
MsG0680035214.01.T01 AT5G38730 27.320 388 278 2 15 402 187 570 8.96e-46 169
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MsG0680035214.01.T01 AT2G18940 24.474 380 280 4 124 497 191 569 6.71e-37 145
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MsG0680035214.01.T01 AT2G18940 20.650 431 336 4 72 500 181 607 3.74e-33 134
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MsG0680035214.01.T01 AT2G18940 23.333 420 307 4 109 520 110 522 8.26e-27 115
MsG0680035214.01.T01 AT2G18940 28.409 176 123 1 123 298 618 790 1.36e-20 96.3
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MsG0680035214.01.T01 AT3G18020 26.265 415 298 3 111 517 61 475 1.19e-37 147
MsG0680035214.01.T01 AT3G18020 23.362 458 301 9 49 495 247 665 1.96e-34 138
MsG0680035214.01.T01 AT1G53330 29.870 308 214 2 101 407 45 351 1.51e-42 155
MsG0680035214.01.T01 AT1G53330 30.743 296 199 3 186 480 26 316 2.38e-42 155
MsG0680035214.01.T01 AT1G53330 27.778 306 219 2 173 477 47 351 1.28e-36 139
MsG0680035214.01.T01 AT1G53330 29.057 265 177 3 259 519 32 289 9.06e-30 120
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MsG0680035214.01.T01 AT1G53330 32.571 175 117 1 347 520 46 220 2.27e-23 102
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MsG0680035214.01.T01 AT5G18950 25.872 344 246 4 177 520 120 454 1.17e-33 133
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MsG0680035214.01.T01 AT5G50280 24.933 373 275 3 72 442 276 645 1.83e-35 141
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MsG0680035214.01.T01 AT5G50280 23.214 392 299 2 107 496 241 632 6.10e-33 134
MsG0680035214.01.T01 AT5G50280 25.000 344 250 4 177 515 276 616 2.37e-31 129
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MsG0680035214.01.T01 AT1G79490 22.102 371 255 3 176 512 245 615 2.90e-22 101
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MsG0680035214.01.T01 AT4G20740 22.864 433 323 5 79 506 168 594 1.67e-31 129
MsG0680035214.01.T01 AT4G20740 21.694 484 326 7 3 445 203 674 2.36e-27 117
MsG0680035214.01.T01 AT4G20740 24.638 276 208 0 237 512 151 426 2.49e-24 107
MsG0680035214.01.T01 AT4G20740 22.256 328 220 3 169 496 153 445 2.04e-20 95.5
MsG0680035214.01.T01 AT4G20740 26.190 168 124 0 348 515 157 324 4.08e-16 82.0
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MsG0680035214.01.T01 AT5G14820 25.519 337 243 4 141 472 230 563 2.05e-33 134
MsG0680035214.01.T01 AT5G14820 26.498 317 232 1 72 388 231 546 1.50e-32 132
MsG0680035214.01.T01 AT5G14820 22.443 352 271 2 169 520 189 538 1.84e-30 125
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MsG0680035214.01.T01 AT3G17370 24.870 193 132 3 75 267 20 199 3.68e-16 77.8
MsG0680035214.01.T01 AT3G17370 25.806 186 125 2 336 521 1 173 4.76e-16 77.4
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MsG0680035214.01.T01 AT5G16860 22.750 400 267 8 50 445 280 641 4.96e-20 94.4
MsG0680035214.01.T01 AT5G16860 23.669 338 207 9 221 520 37 361 9.31e-15 77.8
MsG0680035214.01.T01 AT1G10330 25.131 382 241 9 83 445 31 386 1.65e-23 103
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MsG0680035214.01.T01 AT4G35130 22.903 310 217 6 188 491 43 336 1.93e-13 73.6
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MsG0680035214.01.T01 AT2G37320 21.930 342 217 7 103 440 185 480 5.30e-12 68.6
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MsG0680035214.01.T01 AT4G13650 21.647 425 281 9 128 516 109 517 9.29e-13 71.6
MsG0680035214.01.T01 AT4G13650 23.739 337 231 13 133 461 78 396 2.27e-12 70.5
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MsG0680035214.01.T01 AT1G15510 22.424 330 241 6 181 508 66 382 1.97e-15 80.1
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MsG0680035214.01.T01 AT1G17630 20.472 381 255 5 105 445 225 597 1.04e-19 93.2
MsG0680035214.01.T01 AT4G18840 24.364 275 188 7 221 491 48 306 1.18e-19 92.8
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MsG0680035214.01.T01 AT4G18840 24.364 275 188 7 221 491 48 306 1.18e-19 92.8
MsG0680035214.01.T01 AT4G18840 22.487 378 269 9 108 480 109 467 4.23e-19 90.9
MsG0680035214.01.T01 AT4G18840 22.055 399 256 11 154 517 54 432 9.70e-15 77.4
MsG0680035214.01.T01 AT4G18840 20.847 307 197 11 103 375 205 499 6.25e-11 65.5
MsG0680035214.01.T01 AT4G18840 24.364 275 188 7 221 491 48 306 1.18e-19 92.8
MsG0680035214.01.T01 AT4G18840 22.487 378 269 9 108 480 109 467 4.23e-19 90.9
MsG0680035214.01.T01 AT4G18840 22.055 399 256 11 154 517 54 432 9.70e-15 77.4
MsG0680035214.01.T01 AT4G18840 20.847 307 197 11 103 375 205 499 6.25e-11 65.5
MsG0680035214.01.T01 AT5G02830 21.602 412 264 8 126 483 289 695 1.18e-19 93.2
MsG0680035214.01.T01 AT5G02830 24.843 318 205 9 205 498 331 638 2.35e-16 82.8
MsG0680035214.01.T01 AT5G02830 23.045 243 173 6 250 484 238 474 1.13e-13 74.3
MsG0680035214.01.T01 AT5G02830 19.895 382 235 8 180 502 238 607 7.84e-12 68.6
MsG0680035214.01.T01 AT4G04370 20.273 439 327 7 45 481 22 439 1.24e-19 93.2
MsG0680035214.01.T01 AT4G04370 21.902 347 256 7 103 446 310 644 1.04e-16 84.0
MsG0680035214.01.T01 AT4G04370 24.268 239 162 4 258 492 25 248 1.51e-14 77.0
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MsG0680035214.01.T01 AT5G42450 25.263 285 171 9 242 491 56 333 1.77e-15 79.7
MsG0680035214.01.T01 AT4G21170 22.014 427 294 11 57 464 178 584 2.08e-19 92.0
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MsG0680035214.01.T01 AT5G03800 20.083 483 322 13 41 480 225 686 8.09e-18 87.4
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MsG0680035214.01.T01 AT3G14330 22.776 281 191 5 247 518 204 467 1.00e-11 68.2
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MsG0680035214.01.T01 AT1G56570 23.030 330 205 8 98 425 242 524 3.55e-15 79.0
MsG0680035214.01.T01 AT1G56570 21.500 400 260 11 103 498 75 424 1.28e-18 89.7
MsG0680035214.01.T01 AT1G56570 21.446 401 295 9 53 448 95 480 1.29e-17 86.7
MsG0680035214.01.T01 AT1G56570 23.030 330 205 8 98 425 242 524 3.55e-15 79.0
MsG0680035214.01.T01 AT4G08210 24.324 444 297 17 50 480 189 606 1.42e-18 89.7
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MsG0680035214.01.T01 AT4G08210 23.837 344 235 8 86 424 365 686 3.51e-16 82.0
MsG0680035214.01.T01 AT4G08210 21.694 484 325 10 45 492 82 547 4.57e-16 81.6
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MsG0680035214.01.T01 AT4G21065 26.437 261 173 8 268 521 73 321 4.64e-16 81.6
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MsG0680035214.01.T01 AT3G15130 20.794 428 307 10 99 516 36 441 4.79e-18 88.2
MsG0680035214.01.T01 AT3G15130 19.809 419 253 9 103 448 71 479 2.90e-16 82.4

Find 88 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 112 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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TTTCGCAAAGATTCTCAAAA+AGG 0.214843 6:+100690648 MsG0680035214.01.T01:CDS
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ACATACACTATTCTTATTGA+TGG 0.276400 6:+100691531 MsG0680035214.01.T01:CDS
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GTTATGGAACCTTGATTAAT+GGG 0.330102 6:+100690797 MsG0680035214.01.T01:CDS
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ATCAAGGGTCACTGTCTAAA+AGG 0.338415 6:+100690706 MsG0680035214.01.T01:CDS
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CATTTAGACCAAGTTAGTTA+TGG 0.350129 6:+100690781 MsG0680035214.01.T01:CDS
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AAGAAGGAATGAAATAGAAA+TGG 0.363985 6:-100690363 None:intergenic
ATACTGTAACTGTGAATATC+AGG 0.365382 6:-100691204 None:intergenic
AGTTGTAAGTATACACATTT+GGG 0.371204 6:-100691098 None:intergenic
GTAGTGAAGGTTATTGTATT+GGG 0.378387 6:-100690679 None:intergenic
ACTTACAATTCCCTTATTGA+TGG 0.380904 6:+100691321 MsG0680035214.01.T01:CDS
ATAGTGTATGTGTACATATT+TGG 0.384139 6:-100691519 None:intergenic
ATTGATGGTTTGTGTAAATC+GGG 0.390070 6:+100691336 MsG0680035214.01.T01:CDS
GAGTTGTAAGTATACACATT+TGG 0.395380 6:-100691099 None:intergenic
ATCTTACCGAATTCGATTGC+AGG 0.408450 6:-100690472 None:intergenic
GTATTGTACATTACCACATT+AGG 0.420622 6:-100690889 None:intergenic
ACTCCACCTGCAATCGAATT+CGG 0.425765 6:+100690466 MsG0680035214.01.T01:CDS
TGTAGTGAAGGTTATTGTAT+TGG 0.428504 6:-100690680 None:intergenic
GAATTGTAAGTAATCATATC+AGG 0.431925 6:-100691414 None:intergenic
AGCATTGAACTTACATGATA+AGG 0.442922 6:+100690741 MsG0680035214.01.T01:CDS
ATTAATGGGTTGTGTAAAGT+TGG 0.452436 6:+100690811 MsG0680035214.01.T01:CDS
TTTACACAACCCATTAATCA+AGG 0.456779 6:-100690806 None:intergenic
TTTACACAAACCATCAATAA+GGG 0.457291 6:-100691331 None:intergenic
AGAAGGAATGAAATAGAAAT+GGG 0.458105 6:-100690362 None:intergenic
ATTGACAGAAAGAATTGATA+AGG 0.465661 6:-100690597 None:intergenic
TATATTCAACACTATGGCTC+AGG 0.467418 6:+100691170 MsG0680035214.01.T01:CDS
TCAAGGTTCCATAACTAACT+TGG 0.480942 6:-100690789 None:intergenic
ATGTACAATACGATTATTGA+TGG 0.481901 6:+100690901 MsG0680035214.01.T01:CDS
ACATATACCGTTATGATCCA+TGG 0.485344 6:+100691636 MsG0680035214.01.T01:CDS
AACCTTCACTACACTCATCA+AGG 0.486997 6:+100690690 MsG0680035214.01.T01:CDS
GGGCTTGTTTGATGAAGCAT+TGG 0.489653 6:+100691671 MsG0680035214.01.T01:CDS
TATTCTGAAATGGTTTCTAA+GGG 0.495088 6:+100690964 MsG0680035214.01.T01:CDS
TGATAACAATGAAAATGATA+AGG 0.496244 6:+100691770 MsG0680035214.01.T01:CDS
GAATTGTAAGTTACCACATC+AGG 0.497337 6:-100691309 None:intergenic
CAACACGTCTCAGCAATTCA+AGG 0.497738 6:-100690849 None:intergenic
GAAGAGTATATTCAACACTA+TGG 0.501861 6:+100691164 MsG0680035214.01.T01:CDS
ACTTACAACTCTTTAATGGA+TGG 0.505201 6:+100691111 MsG0680035214.01.T01:CDS
CTTATTGATGGATTGTGTAA+AGG 0.509350 6:+100691543 MsG0680035214.01.T01:CDS
GAATTGCTGAGACGTGTTGA+TGG 0.513527 6:+100690853 MsG0680035214.01.T01:CDS
CATGATAAGGTGATTGCGAT+GGG 0.527519 6:+100690754 MsG0680035214.01.T01:CDS
CATTGTTATCAAACAGAGAA+CGG 0.531340 6:-100691758 None:intergenic
AATTCGATTGCAGGTGGAGT+GGG 0.537316 6:-100690463 None:intergenic
GTGTTATTCAGAAATTGAAA+AGG 0.540812 6:-100690340 None:intergenic
CATATACCGTTATGATCCAT+GGG 0.544376 6:+100691637 MsG0680035214.01.T01:CDS
CTTCTTCTTCGATGTTGCAG+AGG 0.552977 6:+100690284 MsG0680035214.01.T01:CDS
GTCGATGAGATGCATGATAG+AGG 0.558821 6:+100691384 MsG0680035214.01.T01:CDS
CAGGTGGAGTGGGATTCTTA+CGG 0.560801 6:-100690453 None:intergenic
ACATGATAAGGTGATTGCGA+TGG 0.561677 6:+100690753 MsG0680035214.01.T01:CDS
CAATCGCCCTGTCAACCTGA+TGG 0.567536 6:-100691461 None:intergenic
CTTTGTGAAATGATTACAAG+AGG 0.567889 6:+100691804 MsG0680035214.01.T01:CDS
ATTATTGATGGTATGTGCAA+AGG 0.582280 6:+100690913 MsG0680035214.01.T01:CDS
AATTGCTGAGACGTGTTGAT+GGG 0.586300 6:+100690854 MsG0680035214.01.T01:CDS
ATATTCAACACTATGGCTCA+GGG 0.590971 6:+100691171 MsG0680035214.01.T01:CDS
ATTAACAAAATTGAAAGACC+AGG 0.592313 6:+100691488 MsG0680035214.01.T01:CDS
ACAAAACCCATGGATCATAA+CGG 0.595085 6:-100691643 None:intergenic
GTGTAAAGGTGGAAGACTAG+AGG 0.597752 6:+100691557 MsG0680035214.01.T01:CDS
ATTCAACACTATGGCTCAGG+GGG 0.598664 6:+100691173 MsG0680035214.01.T01:CDS
ATTGATGGATTGTGTAAAGG+TGG 0.599049 6:+100691546 MsG0680035214.01.T01:CDS
GAATTCGATTGCAGGTGGAG+TGG 0.607967 6:-100690464 None:intergenic
ACCTTCACTACACTCATCAA+GGG 0.608014 6:+100690691 MsG0680035214.01.T01:CDS
AGCCCTTGTTACAAAACCCA+TGG 0.608793 6:-100691653 None:intergenic
ACATATTTGGTCGAATACCC+TGG 0.610365 6:-100691506 None:intergenic
TTGATGGTTTGTGTAAATCG+GGG 0.611570 6:+100691337 MsG0680035214.01.T01:CDS
TTACCGAATTCGATTGCAGG+TGG 0.615189 6:-100690469 None:intergenic
TTAACAAAATTGAAAGACCA+GGG 0.615614 6:+100691489 MsG0680035214.01.T01:CDS
AACACGTCTCAGCAATTCAA+GGG 0.621865 6:-100690848 None:intergenic
ACCCTTGATGAGTGTAGTGA+AGG 0.640911 6:-100690692 None:intergenic
GAAATTGGTTCAGCCTAATG+TGG 0.644291 6:+100690876 MsG0680035214.01.T01:CDS
TAACAATGAAAATGATAAGG+CGG 0.647849 6:+100691773 MsG0680035214.01.T01:CDS
GGTAATGTTTGGATTTGACA+AGG 0.657021 6:-100690504 None:intergenic
ATTCTGAAATGGTTTCTAAG+GGG 0.657961 6:+100690965 MsG0680035214.01.T01:CDS
GTAATGTTTGGATTTGACAA+GGG 0.676865 6:-100690503 None:intergenic
TATTCAACACTATGGCTCAG+GGG 0.724957 6:+100691172 MsG0680035214.01.T01:CDS
GAGAAACAGAAACAACAGTG+TGG 0.747404 6:-100690525 None:intergenic
TTCAACACTATGGCTCAGGG+GGG 0.753017 6:+100691174 MsG0680035214.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TTTTGATTTATATTCTGAAA+TGG + Chr6:100690954-100690973 MsG0680035214.01.T01:CDS 15.0%
!! GATTACTTACAATTCTATAT+TGG + Chr6:100691422-100691441 MsG0680035214.01.T01:CDS 20.0%
!! TGATAACAATGAAAATGATA+AGG + Chr6:100691770-100691789 MsG0680035214.01.T01:CDS 20.0%
!!! GATGATTATTTTGTAAGTAA+CGG - Chr6:100691739-100691758 None:intergenic 20.0%
!!! GTTTTGTAAGATTAAAATGA+TGG + Chr6:100691239-100691258 MsG0680035214.01.T01:CDS 20.0%
! AAGAAGGAATGAAATAGAAA+TGG - Chr6:100690366-100690385 None:intergenic 25.0%
! ACATACACTATTCTTATTGA+TGG + Chr6:100691531-100691550 MsG0680035214.01.T01:CDS 25.0%
! AGAAGGAATGAAATAGAAAT+GGG - Chr6:100690365-100690384 None:intergenic 25.0%
! AGTTACAGTATCTTGATTAA+TGG + Chr6:100691216-100691235 MsG0680035214.01.T01:CDS 25.0%
! AGTTGTAAGTATACACATTT+GGG - Chr6:100691101-100691120 None:intergenic 25.0%
! ATAGTGTATGTGTACATATT+TGG - Chr6:100691522-100691541 None:intergenic 25.0%
! ATCAATTCTTTCTGTCAATT+GGG + Chr6:100690601-100690620 MsG0680035214.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTACAATACGATTATTGA+TGG + Chr6:100690901-100690920 MsG0680035214.01.T01:CDS 25.0%
! ATTAACAAAATTGAAAGACC+AGG + Chr6:100691488-100691507 MsG0680035214.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGACAGAAAGAATTGATA+AGG - Chr6:100690600-100690619 None:intergenic 25.0%
! ATTTACACAAACCATCAATA+AGG - Chr6:100691335-100691354 None:intergenic 25.0%
! GAAGAATAAAAGCAAAAAGA+AGG - Chr6:100690382-100690401 None:intergenic 25.0%
! GAATTGTAAGTAATCATATC+AGG - Chr6:100691417-100691436 None:intergenic 25.0%
! GTATACTTACAACTCTTTAA+TGG + Chr6:100691107-100691126 MsG0680035214.01.T01:CDS 25.0%
! GTTACAGTATCTTGATTAAT+GGG + Chr6:100691217-100691236 MsG0680035214.01.T01:CDS 25.0%
! TAACAATGAAAATGATAAGG+CGG + Chr6:100691773-100691792 MsG0680035214.01.T01:CDS 25.0%
! TATCAATTCTTTCTGTCAAT+TGG + Chr6:100690600-100690619 MsG0680035214.01.T01:CDS 25.0%
! TCTCAAAAAATGGAATTTGA+GGG + Chr6:100690544-100690563 MsG0680035214.01.T01:CDS 25.0%
! TTAACAAAATTGAAAGACCA+GGG + Chr6:100691489-100691508 MsG0680035214.01.T01:CDS 25.0%
! TTCTCAAAAAATGGAATTTG+AGG + Chr6:100690543-100690562 MsG0680035214.01.T01:CDS 25.0%
! TTTACACAAACCATCAATAA+GGG - Chr6:100691334-100691353 None:intergenic 25.0%
!! GTGTTATTCAGAAATTGAAA+AGG - Chr6:100690343-100690362 None:intergenic 25.0%
!! TATTGATGGTTTGTGTAAAT+CGG + Chr6:100691335-100691354 MsG0680035214.01.T01:CDS 25.0%
!! TGTTTCTGTTTCTCAAAAAA+TGG + Chr6:100690534-100690553 MsG0680035214.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATATTCTGAAATGGTTTCTA+AGG + Chr6:100690963-100690982 MsG0680035214.01.T01:CDS 25.0%
!!! TATTCTGAAATGGTTTCTAA+GGG + Chr6:100690964-100690983 MsG0680035214.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTGAGGATCTTTTAGTTAA+AGG + Chr6:100691594-100691613 MsG0680035214.01.T01:CDS 25.0%
ACTTACAACTCTTTAATGGA+TGG + Chr6:100691111-100691130 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
ACTTACAATTCCCTTATTGA+TGG + Chr6:100691321-100691340 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
ACTTACAGTGCTTTAATTAG+TGG + Chr6:100691006-100691025 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
AGTTATGGAACCTTGATTAA+TGG + Chr6:100690796-100690815 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
ATACTGTAACTGTGAATATC+AGG - Chr6:100691207-100691226 None:intergenic 30.0%
CAGAAAAATTATTCCTGATG+TGG + Chr6:100691296-100691315 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
CATTGTTATCAAACAGAGAA+CGG - Chr6:100691761-100691780 None:intergenic 30.0%
CATTTAGACCAAGTTAGTTA+TGG + Chr6:100690781-100690800 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
CATTTCTTCAAAGAGATTCA+TGG - Chr6:100691271-100691290 None:intergenic 30.0%
CCTAGTTAAAAAAGTGAACA+AGG + Chr6:100691140-100691159 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
CGAAAACAGAAAAAGCAAAA+GGG - Chr6:100690633-100690652 None:intergenic 30.0%
CTTTGTGAAATGATTACAAG+AGG + Chr6:100691804-100691823 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
GAGTTGTAAGTATACACATT+TGG - Chr6:100691102-100691121 None:intergenic 30.0%
GTAATGTTTGGATTTGACAA+GGG - Chr6:100690506-100690525 None:intergenic 30.0%
GTAGTGAAGGTTATTGTATT+GGG - Chr6:100690682-100690701 None:intergenic 30.0%
GTATTGTACATTACCACATT+AGG - Chr6:100690892-100690911 None:intergenic 30.0%
GTTATGGAACCTTGATTAAT+GGG + Chr6:100690797-100690816 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
TGTAGTGAAGGTTATTGTAT+TGG - Chr6:100690683-100690702 None:intergenic 30.0%
TTCGCAAAGATTCTCAAAAA+GGG + Chr6:100690649-100690668 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
TTTACACAACCCATTAATCA+AGG - Chr6:100690809-100690828 None:intergenic 30.0%
TTTCGCAAAGATTCTCAAAA+AGG + Chr6:100690648-100690667 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
! AGCATTGAACTTACATGATA+AGG + Chr6:100690741-100690760 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
! ATCGAATTCGGTAAGATTTT+AGG + Chr6:100690478-100690497 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
! ATTATTGATGGTATGTGCAA+AGG + Chr6:100690913-100690932 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
! ATTGATGGTTTGTGTAAATC+GGG + Chr6:100691336-100691355 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
! GAAGAGTATATTCAACACTA+TGG + Chr6:100691164-100691183 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTAATGGGTTGTGTAAAGT+TGG + Chr6:100690811-100690830 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTCTGAAATGGTTTCTAAG+GGG + Chr6:100690965-100690984 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
!! CTTATTGATGGATTGTGTAA+AGG + Chr6:100691543-100691562 MsG0680035214.01.T01:CDS 30.0%
!!! CCTTGTTCACTTTTTTAACT+AGG - Chr6:100691143-100691162 None:intergenic 30.0%
!!! GGATGAAACTTTTTTGAAAC+AGG - Chr6:100690322-100690341 None:intergenic 30.0%
ACAAAACCCATGGATCATAA+CGG - Chr6:100691646-100691665 None:intergenic 35.0%
ACATATACCGTTATGATCCA+TGG + Chr6:100691636-100691655 MsG0680035214.01.T01:CDS 35.0%
ATATTCAACACTATGGCTCA+GGG + Chr6:100691171-100691190 MsG0680035214.01.T01:CDS 35.0%
CATATACCGTTATGATCCAT+GGG + Chr6:100691637-100691656 MsG0680035214.01.T01:CDS 35.0%
GAATTGTAAGTTACCACATC+AGG - Chr6:100691312-100691331 None:intergenic 35.0%
GCGAAAACAGAAAAAGCAAA+AGG - Chr6:100690634-100690653 None:intergenic 35.0%
GGTAATGTTTGGATTTGACA+AGG - Chr6:100690507-100690526 None:intergenic 35.0%
TATATTCAACACTATGGCTC+AGG + Chr6:100691170-100691189 MsG0680035214.01.T01:CDS 35.0%
TCAAGGTTCCATAACTAACT+TGG - Chr6:100690792-100690811 None:intergenic 35.0%
! AACAACAGTGTGGTAATGTT+TGG - Chr6:100690518-100690537 None:intergenic 35.0%
! ATTAGTGGCTTTTGCATTGT+TGG + Chr6:100691021-100691040 MsG0680035214.01.T01:CDS 35.0%
! TTGATGGTTTGTGTAAATCG+GGG + Chr6:100691337-100691356 MsG0680035214.01.T01:CDS 35.0%
!! ATCCATGGGTTTTGTAACAA+GGG + Chr6:100691651-100691670 MsG0680035214.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTGATGGATTGTGTAAAGG+TGG + Chr6:100691546-100691565 MsG0680035214.01.T01:CDS 35.0%
AACACGTCTCAGCAATTCAA+GGG - Chr6:100690851-100690870 None:intergenic 40.0%
AACCTTCACTACACTCATCA+AGG + Chr6:100690690-100690709 MsG0680035214.01.T01:CDS 40.0%
ACATATTTGGTCGAATACCC+TGG - Chr6:100691509-100691528 None:intergenic 40.0%
ACATGATAAGGTGATTGCGA+TGG + Chr6:100690753-100690772 MsG0680035214.01.T01:CDS 40.0%
ACCTTCACTACACTCATCAA+GGG + Chr6:100690691-100690710 MsG0680035214.01.T01:CDS 40.0%
ATCAAGGGTCACTGTCTAAA+AGG + Chr6:100690706-100690725 MsG0680035214.01.T01:CDS 40.0%
ATCTTACCGAATTCGATTGC+AGG - Chr6:100690475-100690494 None:intergenic 40.0%
CATGATAAGGTGATTGCGAT+GGG + Chr6:100690754-100690773 MsG0680035214.01.T01:CDS 40.0%
GAGAAACAGAAACAACAGTG+TGG - Chr6:100690528-100690547 None:intergenic 40.0%
TATTCAACACTATGGCTCAG+GGG + Chr6:100691172-100691191 MsG0680035214.01.T01:CDS 40.0%
TGCTTTGTGCAAAAACCATC+AGG + Chr6:100691446-100691465 MsG0680035214.01.T01:CDS 40.0%
! AATTGCTGAGACGTGTTGAT+GGG + Chr6:100690854-100690873 MsG0680035214.01.T01:CDS 40.0%
! ATTTTGTAAGTAACGGCGTC+TGG - Chr6:100691732-100691751 None:intergenic 40.0%
! GAAATTGGTTCAGCCTAATG+TGG + Chr6:100690876-100690895 MsG0680035214.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAAAACCATCAGGTTGACA+GGG + Chr6:100691455-100691474 MsG0680035214.01.T01:CDS 40.0%
!! GATCCATGGGTTTTGTAACA+AGG + Chr6:100691650-100691669 MsG0680035214.01.T01:CDS 40.0%
!! GGATGCACGAAATGTTTTTG+AGG + Chr6:100691578-100691597 MsG0680035214.01.T01:CDS 40.0%
AATTCGATTGCAGGTGGAGT+GGG - Chr6:100690466-100690485 None:intergenic 45.0%
ACCCTTGATGAGTGTAGTGA+AGG - Chr6:100690695-100690714 None:intergenic 45.0%
ACTCCACCTGCAATCGAATT+CGG + Chr6:100690466-100690485 MsG0680035214.01.T01:CDS 45.0%
AGCCCTTGTTACAAAACCCA+TGG - Chr6:100691656-100691675 None:intergenic 45.0%
ATTCAACACTATGGCTCAGG+GGG + Chr6:100691173-100691192 MsG0680035214.01.T01:CDS 45.0%
CAACACGTCTCAGCAATTCA+AGG - Chr6:100690852-100690871 None:intergenic 45.0%
CTTCTTCTTCGATGTTGCAG+AGG + Chr6:100690284-100690303 MsG0680035214.01.T01:CDS 45.0%
GAATTGCTGAGACGTGTTGA+TGG + Chr6:100690853-100690872 MsG0680035214.01.T01:CDS 45.0%
GTCGATGAGATGCATGATAG+AGG + Chr6:100691384-100691403 MsG0680035214.01.T01:CDS 45.0%
GTGTAAAGGTGGAAGACTAG+AGG + Chr6:100691557-100691576 MsG0680035214.01.T01:CDS 45.0%
TTACCGAATTCGATTGCAGG+TGG - Chr6:100690472-100690491 None:intergenic 45.0%
! GAGACGTGTTGATGGGAAAT+TGG + Chr6:100690861-100690880 MsG0680035214.01.T01:CDS 45.0%
! GGGCTTGTTTGATGAAGCAT+TGG + Chr6:100691671-100691690 MsG0680035214.01.T01:CDS 45.0%
!! GCAAAAACCATCAGGTTGAC+AGG + Chr6:100691454-100691473 MsG0680035214.01.T01:CDS 45.0%
CAGGTGGAGTGGGATTCTTA+CGG - Chr6:100690456-100690475 None:intergenic 50.0%
GAATTCGATTGCAGGTGGAG+TGG - Chr6:100690467-100690486 None:intergenic 50.0%
TTCAACACTATGGCTCAGGG+GGG + Chr6:100691174-100691193 MsG0680035214.01.T01:CDS 50.0%
CAATCGCCCTGTCAACCTGA+TGG - Chr6:100691464-100691483 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 100690271 100691836 100690271 ID=MsG0680035214.01;Name=MsG0680035214.01
Chr6 mRNA 100690271 100691836 100690271 ID=MsG0680035214.01.T01;Parent=MsG0680035214.01;Name=MsG0680035214.01.T01;_AED=0.44;_eAED=0.44;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|521
Chr6 exon 100690271 100691836 100690271 ID=MsG0680035214.01.T01:exon:20638;Parent=MsG0680035214.01.T01
Chr6 CDS 100690271 100691836 100690271 ID=MsG0680035214.01.T01:cds;Parent=MsG0680035214.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035214.01.T01

ATGTTTCATTCTTCTTCTTCTTCGATGTTGCAGAGGTATTGTGTTGTTCCTGTTTCAAAAAAGTTTCATCCTTTTCAATTTCTGAATAACACCCATTTCTATTTCATTCCTTCTTTTTGCTTTTATTCTTCAACTTCAAACATTGATGTTGATGATGCTGTTTCATTGTTCAATCGCTTGCTCCGTAAGAATCCCACTCCACCTGCAATCGAATTCGGTAAGATTTTAGGTTCCCTTGTCAAATCCAAACATTACCACACTGTTGTTTCTGTTTCTCAAAAAATGGAATTTGAGGGAATTAAACTTGACTTAGTCAATTGCAACATCCTTATCAATTCTTTCTGTCAATTGGGTCTTATCCCTTTTGCTTTTTCTGTTTTCGCAAAGATTCTCAAAAAGGGTTATCATCCCAATACAATAACCTTCACTACACTCATCAAGGGTCACTGTCTAAAAGGTCAGATACATCAAGCATTGAACTTACATGATAAGGTGATTGCGATGGGATTTCATTTAGACCAAGTTAGTTATGGAACCTTGATTAATGGGTTGTGTAAAGTTGGTGAAACAAAAGCAGCCCTTGAATTGCTGAGACGTGTTGATGGGAAATTGGTTCAGCCTAATGTGGTAATGTACAATACGATTATTGATGGTATGTGCAAAGGTAAACATGTTAATGATGCTTTTGATTTATATTCTGAAATGGTTTCTAAGGGGATTTCTCTCGATGTTGTTACTTACAGTGCTTTAATTAGTGGCTTTTGCATTGTTGGTAAAATGAAAGATGCAATTGATTTGTTTCATAAAATGATATTAGAAAACATCAACCCAAATGTGTATACTTACAACTCTTTAATGGATGGATATTGCCTAGTTAAAAAAGTGAACAAGGCGAAGAGTATATTCAACACTATGGCTCAGGGGGGAGTGAATCCTGATATTCACAGTTACAGTATCTTGATTAATGGGTTTTGTAAGATTAAAATGATGGATGAAGCCATGAATCTCTTTGAAGAAATGCATTGCAGAAAAATTATTCCTGATGTGGTAACTTACAATTCCCTTATTGATGGTTTGTGTAAATCGGGGAAAATCTCTTATGCTTTGAAGCTAGTCGATGAGATGCATGATAGAGGTCAAGCACCTGATATGATTACTTACAATTCTATATTGGATGCTTTGTGCAAAAACCATCAGGTTGACAGGGCGATTGCATTATTAACAAAATTGAAAGACCAGGGTATTCGACCAAATATGTACACATACACTATTCTTATTGATGGATTGTGTAAAGGTGGAAGACTAGAGGATGCACGAAATGTTTTTGAGGATCTTTTAGTTAAAGGCTATAATATAACTGTCAACACATATACCGTTATGATCCATGGGTTTTGTAACAAGGGCTTGTTTGATGAAGCATTGGCTTTGTTGTCAAAAATGAAAGACAATAGTTGCATTCCAGACGCCGTTACTTACAAAATAATCATCCGTTCTCTGTTTGATAACAATGAAAATGATAAGGCGGAGAAACTTCTTTGTGAAATGATTACAAGAGGTCTATTTTAA
Protein sequence

>MsG0680035214.01.T01

MFHSSSSSMLQRYCVVPVSKKFHPFQFLNNTHFYFIPSFCFYSSTSNIDVDDAVSLFNRLLRKNPTPPAIEFGKILGSLVKSKHYHTVVSVSQKMEFEGIKLDLVNCNILINSFCQLGLIPFAFSVFAKILKKGYHPNTITFTTLIKGHCLKGQIHQALNLHDKVIAMGFHLDQVSYGTLINGLCKVGETKAALELLRRVDGKLVQPNVVMYNTIIDGMCKGKHVNDAFDLYSEMVSKGISLDVVTYSALISGFCIVGKMKDAIDLFHKMILENINPNVYTYNSLMDGYCLVKKVNKAKSIFNTMAQGGVNPDIHSYSILINGFCKIKMMDEAMNLFEEMHCRKIIPDVVTYNSLIDGLCKSGKISYALKLVDEMHDRGQAPDMITYNSILDALCKNHQVDRAIALLTKLKDQGIRPNMYTYTILIDGLCKGGRLEDARNVFEDLLVKGYNITVNTYTVMIHGFCNKGLFDEALALLSKMKDNSCIPDAVTYKIIIRSLFDNNENDKAEKLLCEMITRGLF*