AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039470.01

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MsG0780039470.01.T01 AT3G14720 34.114 299 176 8 142 426 25 316 1.11e-43 162
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MsG0780039470.01.T01 AT1G54610 33.775 302 178 8 136 426 112 402 1.98e-40 153
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MsG0780039470.01.T01 AT1G01560 36.530 219 127 4 146 358 44 256 1.82e-39 144
MsG0780039470.01.T01 AT4G10010 36.162 271 149 11 168 426 2 260 1.37e-38 146
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MsG0780039470.01.T01 AT2G38620 37.234 188 115 3 243 429 59 244 7.39e-38 139
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MsG0780039470.01.T01 AT5G44290 31.561 301 186 9 136 426 131 421 8.87e-37 143
MsG0780039470.01.T01 AT5G44290 31.579 304 182 10 136 426 131 421 9.64e-37 143
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MsG0780039470.01.T01 AT1G18670 32.899 307 177 9 136 426 125 418 5.58e-36 142
MsG0780039470.01.T01 AT1G57700 31.420 331 201 10 108 426 114 430 1.64e-35 140
MsG0780039470.01.T01 AT4G22940 30.263 304 187 9 136 426 97 388 1.97e-35 139
MsG0780039470.01.T01 AT5G10270 30.351 313 165 9 148 426 32 325 2.01e-35 138
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MsG0780039470.01.T01 AT1G13350 30.284 317 175 12 149 426 476 785 2.95e-25 109
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MsG0780039470.01.T01 AT3G07980 28.731 268 155 11 142 387 20 273 7.23e-19 90.5
MsG0780039470.01.T01 AT1G76040 26.578 301 171 10 142 430 112 374 7.68e-19 89.7
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MsG0780039470.01.T01 AT5G40440 26.860 242 150 11 148 377 71 297 1.39e-11 67.0
MsG0780039470.01.T01 AT5G40440 26.860 242 150 11 148 377 71 297 1.39e-11 67.0
MsG0780039470.01.T01 AT1G31420 29.612 206 123 9 145 340 309 502 1.40e-11 67.0
MsG0780039470.01.T01 AT1G16130 30.275 218 116 13 141 340 415 614 1.42e-11 67.4
MsG0780039470.01.T01 AT3G24540 28.780 205 123 9 147 340 188 380 1.43e-11 67.0
MsG0780039470.01.T01 AT5G27790 24.606 317 177 14 140 433 18 295 1.59e-11 65.9
MsG0780039470.01.T01 AT1G70250 30.918 207 117 11 145 337 462 656 1.60e-11 67.4
MsG0780039470.01.T01 AT5G08590 26.165 279 163 14 148 401 10 270 1.77e-11 65.9
MsG0780039470.01.T01 AT3G17840 28.571 203 123 10 147 340 370 559 1.78e-11 67.0
MsG0780039470.01.T01 AT1G70740 29.268 205 121 9 148 340 68 260 1.79e-11 66.2
MsG0780039470.01.T01 AT4G04500 30.698 215 120 15 141 340 344 544 2.04e-11 66.6
MsG0780039470.01.T01 AT3G55550 29.665 209 122 11 145 340 349 545 2.12e-11 66.6
MsG0780039470.01.T01 AT3G59750 27.830 212 128 12 142 340 303 502 2.21e-11 66.6
MsG0780039470.01.T01 AT5G38250 27.586 261 131 14 135 380 308 525 2.21e-11 66.6
MsG0780039470.01.T01 AT1G09440 28.226 248 152 14 142 375 157 392 2.31e-11 66.2
MsG0780039470.01.T01 AT1G09440 28.226 248 152 14 142 375 157 392 2.31e-11 66.2
MsG0780039470.01.T01 AT1G16110 27.848 237 143 12 119 340 409 632 2.38e-11 66.6
MsG0780039470.01.T01 AT3G22420 27.053 207 132 7 145 341 27 224 2.50e-11 66.2
MsG0780039470.01.T01 AT3G22420 27.053 207 132 7 145 341 27 224 2.54e-11 66.2
MsG0780039470.01.T01 AT5G65700 27.239 268 167 13 141 395 693 945 2.54e-11 66.6
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MsG0780039470.01.T01 AT1G70740 29.268 205 121 9 148 340 56 248 2.84e-11 65.9
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MsG0780039470.01.T01 AT1G16260 29.665 209 127 12 142 340 390 588 2.95e-11 66.2
MsG0780039470.01.T01 AT1G16260 29.665 209 127 12 142 340 381 579 3.01e-11 66.2
MsG0780039470.01.T01 AT1G69730 29.524 210 129 11 141 340 446 646 3.09e-11 66.2
MsG0780039470.01.T01 AT1G76370 25.352 284 173 14 84 340 4 275 3.31e-11 65.5
MsG0780039470.01.T01 AT4G04510 28.230 209 125 11 145 340 344 540 3.44e-11 65.9
MsG0780039470.01.T01 AT4G04510 28.230 209 125 11 145 340 342 538 3.46e-11 65.9
MsG0780039470.01.T01 AT1G70110 29.524 210 131 8 147 347 349 550 3.61e-11 65.9
MsG0780039470.01.T01 AT5G55090 27.500 200 133 9 147 344 73 262 3.94e-11 65.5
MsG0780039470.01.T01 AT3G16030 30.806 211 111 13 148 340 533 726 4.07e-11 65.9
MsG0780039470.01.T01 AT2G19230 30.986 213 116 14 145 342 573 769 4.13e-11 65.9
MsG0780039470.01.T01 AT1G66920 30.734 218 122 13 135 337 301 504 4.25e-11 65.9
MsG0780039470.01.T01 AT3G22420 27.053 207 132 7 145 341 98 295 4.95e-11 65.5
MsG0780039470.01.T01 AT3G22420 27.053 207 132 7 145 341 98 295 5.23e-11 65.5
MsG0780039470.01.T01 AT3G16030 30.806 211 111 13 148 340 410 603 5.24e-11 65.5
MsG0780039470.01.T01 AT3G16030 30.806 211 111 13 148 340 554 747 5.39e-11 65.5
MsG0780039470.01.T01 AT1G53430 28.846 208 125 9 145 340 631 827 5.46e-11 65.5
MsG0780039470.01.T01 AT4G21410 26.991 226 144 8 141 354 231 447 5.74e-11 65.1
MsG0780039470.01.T01 AT1G66920 30.734 218 122 13 135 337 293 496 6.20e-11 65.1

Find 127 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 244 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AACTTAAATTCACTGTAATT+TGG 0.156371 7:-64590093 None:intergenic
CAGTTAAAGATATGTGATTT+TGG 0.212985 7:+64589452 MsG0780039470.01.T01:CDS
AGAGCTCCTGAACTTATATT+TGG 0.218679 7:+64589620 MsG0780039470.01.T01:CDS
GAAACTCTGTAGACAGTTTC+GGG 0.220816 7:-64589018 None:intergenic
TGTCTTGGGCATTGCAAAAT+TGG 0.238771 7:+64590687 MsG0780039470.01.T01:three_prime_UTR
TTCATTTCGTGTAATTCTTT+TGG 0.256315 7:-64588179 None:intergenic
TGTCAGAACAATACCCTCTT+TGG 0.306649 7:-64588413 None:intergenic
TGAAACTCTGTAGACAGTTT+CGG 0.314849 7:-64589019 None:intergenic
TTACAGGTCATCAATTTATA+TGG 0.317516 7:-64591153 None:intergenic
CCATTCGGTAACCGGGCGTT+TGG 0.317831 7:-64590480 None:intergenic
GGCATTGCAAAATTGGTCTT+TGG 0.320674 7:+64590694 MsG0780039470.01.T01:three_prime_UTR
TATAGTTGCACATAAATTAT+AGG 0.327699 7:-64589072 None:intergenic
AAGAAACAAGAGAGAGAAAC+AGG 0.327866 7:+64586992 MsG0780039470.01.T01:five_prime_UTR
GTTCTTGTCCATTCGGTAAC+CGG 0.332388 7:-64590488 None:intergenic
ATTCCTTCTTTGATGACCTT+CGG 0.335856 7:+64590454 MsG0780039470.01.T01:CDS
TTCCTTCTTTGATGACCTTC+GGG 0.338264 7:+64590455 MsG0780039470.01.T01:CDS
CATGCACTTTATTTCTTCTC+TGG 0.338716 7:-64590067 None:intergenic
AGGTTGAAGAGCATTGCTTC+TGG 0.350127 7:+64587157 MsG0780039470.01.T01:CDS
CTGATCAAAACCTGACTTCT+CGG 0.353580 7:-64588153 None:intergenic
GGAAGGTAGCATTGCTAGTC+TGG 0.356061 7:-64590729 None:intergenic
AACGGAAATGGAACGGAAAC+TGG 0.361591 7:+64588350 MsG0780039470.01.T01:CDS
TATTTGCAGCCGTTGTTTCC+CGG 0.368108 7:+64589888 MsG0780039470.01.T01:intron
GCTATTGATGTTTGGTCTGC+TGG 0.369858 7:+64589662 MsG0780039470.01.T01:CDS
ACAGCAGTGCAGCGTAGATT+TGG 0.372576 7:-64590302 None:intergenic
GGTGTACCTTAACTTAGTTT+TGG 0.378167 7:+64588987 MsG0780039470.01.T01:CDS
GTCGTTGGTACCGGTTCTTT+TGG 0.382709 7:+64588671 MsG0780039470.01.T01:CDS
TGAGAGGGGTGGAAATAATC+AGG 0.387221 7:+64588058 MsG0780039470.01.T01:CDS
TTGGTCTGCTGGCTGTGTTT+TGG 0.387603 7:+64589673 MsG0780039470.01.T01:CDS
GCTACCTTCCTTAACAGTTC+AGG 0.389966 7:+64590742 MsG0780039470.01.T01:three_prime_UTR
ACACAACTGCTATTGATGTT+TGG 0.391565 7:+64589654 MsG0780039470.01.T01:CDS
TAGGCTAAGTGCGTTGAAAC+TGG 0.393727 7:+64588829 MsG0780039470.01.T01:intron
GAATCATCAATCAAATGAAT+AGG 0.400686 7:+64591005 MsG0780039470.01.T01:three_prime_UTR
GGCTGAGCTTCTTCTAGGAC+AGG 0.405321 7:+64589694 MsG0780039470.01.T01:CDS
TGTGCAACTATATACATATC+AGG 0.406660 7:+64589083 MsG0780039470.01.T01:CDS
TTGCAGAAAACAACTGAAAC+AGG 0.418021 7:+64586949 MsG0780039470.01.T01:five_prime_UTR
TTCAATTTCTAAATCAAACT+TGG 0.418841 7:-64588006 None:intergenic
CTGATCAACCCCACTCTCTC+CGG 0.425941 7:-64589907 None:intergenic
GCAACTGTTGTGAACGGAAA+TGG 0.437617 7:+64588338 MsG0780039470.01.T01:CDS
GTACGATATGTTGGGTTCAC+CGG 0.438284 7:-64589579 None:intergenic
AGACGTCGACGCAACTCATC+AGG 0.439883 7:-64590634 None:intergenic
CACTTTATTTCTTCTCTGGT+AGG 0.440196 7:-64590063 None:intergenic
GTTGCACCAAATATAAGTTC+AGG 0.445423 7:-64589626 None:intergenic
CATTCGGTAACCGGGCGTTT+GGG 0.445595 7:-64590479 None:intergenic
AATCAACTCCTTGCATGCTC+AGG 0.445757 7:-64590661 None:intergenic
CGAACATATGTACGATATGT+TGG 0.450608 7:-64589588 None:intergenic
TTCTTGTCCATTCGGTAACC+GGG 0.455116 7:-64590487 None:intergenic
CCGTTGTTTCCCGGAGAGAG+TGG 0.455384 7:+64589897 MsG0780039470.01.T01:CDS
CATAAAACCTCAGAATCTAT+TGG 0.460708 7:+64589240 MsG0780039470.01.T01:CDS
AAGTTTGATTTAGAAATTGA+AGG 0.461702 7:+64588008 MsG0780039470.01.T01:CDS
CTGCAGGTCCTTTGATAAAG+AGG 0.462037 7:-64590830 None:intergenic
CGTTGTTTCCCGGAGAGAGT+GGG 0.466272 7:+64589898 MsG0780039470.01.T01:CDS
GGGCTGTGAAATCAAACAAA+GGG 0.467568 7:-64590515 None:intergenic
AGCAGAGACCTGAACTGTTA+AGG 0.473477 7:-64590750 None:intergenic
AATTATTTGCATCATGTGGT+TGG 0.484000 7:+64589202 MsG0780039470.01.T01:CDS
AACTACTAACCTTGTGCCAT+GGG 0.484175 7:-64590134 None:intergenic
CTTTGCAACCTCTTTATCAA+AGG 0.489413 7:+64590822 MsG0780039470.01.T01:three_prime_UTR
GAGTTTCAAAGCACTATGTC+AGG 0.499696 7:+64589034 MsG0780039470.01.T01:CDS
ATAGACAACGCCAAAAGAAC+CGG 0.501711 7:-64588681 None:intergenic
AAGAAACAAACCGTGTTGAG+AGG 0.508397 7:+64588042 MsG0780039470.01.T01:CDS
TGATTTAGAAATTGAAGGAA+AGG 0.509965 7:+64588013 MsG0780039470.01.T01:CDS
TGATCAACCCCACTCTCTCC+GGG 0.510015 7:-64589906 None:intergenic
GCAGAACGTGTCGTTGGTAC+CGG 0.510410 7:+64588662 MsG0780039470.01.T01:CDS
TTGTTTGATTTCACAGCCCA+AGG 0.513665 7:+64590519 MsG0780039470.01.T01:CDS
TCAGTTGGTAGAGATCATTA+AGG 0.513801 7:+64589926 MsG0780039470.01.T01:CDS
TCCATGAGATTGTCATCTGC+AGG 0.514679 7:-64590846 None:intergenic
AGCTCGTTTGTTCCTCAAAG+TGG 0.517222 7:+64590974 MsG0780039470.01.T01:three_prime_UTR
GAACATATGTACGATATGTT+GGG 0.517585 7:-64589587 None:intergenic
ATTCCACATAGACCACTTTG+AGG 0.518784 7:-64590986 None:intergenic
GTGGCTAAAACCGAGAAGTC+AGG 0.519786 7:+64588143 MsG0780039470.01.T01:CDS
TACGATATGTTGGGTTCACC+GGG 0.520073 7:-64589578 None:intergenic
AATTATGTACTATAGATCTT+GGG 0.521137 7:+64590036 MsG0780039470.01.T01:intron
GTCTAATTCCTGAGCATGCA+AGG 0.522362 7:+64590653 MsG0780039470.01.T01:CDS
CAAACTCCAAAACTAAGTTA+AGG 0.529487 7:-64588993 None:intergenic
CAAGTAATTACAACTTCTAT+CGG 0.534751 7:+64588374 MsG0780039470.01.T01:CDS
TATGTAGTTTAACAAAACTC+TGG 0.537677 7:-64591115 None:intergenic
ATAGTCTTGATTGTGGAGGT+TGG 0.540641 7:-64590775 None:intergenic
GAAATATGAATATGATGAGA+AGG 0.542946 7:+64587137 MsG0780039470.01.T01:exon
GTCCCGAAGGTCATCAAAGA+AGG 0.543048 7:-64590457 None:intergenic
ACTTCTATCGGTGGTCGAGA+TGG 0.543219 7:+64588386 MsG0780039470.01.T01:CDS
AGAGAGTGGGGTTGATCAGT+TGG 0.547020 7:+64589911 MsG0780039470.01.T01:CDS
ATCCATACCAATAGATTCTG+AGG 0.555281 7:-64589247 None:intergenic
ACCTTCGGGACCCAAACGCC+CGG 0.556023 7:+64590469 MsG0780039470.01.T01:CDS
TTTAAATTATTTGCATCATG+TGG 0.556879 7:+64589198 MsG0780039470.01.T01:CDS
GTTCCTCAAAGTGGTCTATG+TGG 0.558660 7:+64590983 MsG0780039470.01.T01:three_prime_UTR
ACCTGCAGATGACAATCTCA+TGG 0.558698 7:+64590845 MsG0780039470.01.T01:three_prime_UTR
TTGTAATTCTAATGTTTCTG+CGG 0.558736 7:+64588121 MsG0780039470.01.T01:CDS
TAATTCTAATGTTTCTGCGG+TGG 0.560295 7:+64588124 MsG0780039470.01.T01:CDS
AGAGGTTGCAAAGTTTCTTG+AGG 0.568445 7:-64590812 None:intergenic
GTTCAAGCATACGCATAACC+TGG 0.569102 7:-64588909 None:intergenic
ACATATCGTACATATGTTCG+CGG 0.570279 7:+64589591 MsG0780039470.01.T01:CDS
GCCTCAGATAATCTCATACA+TGG 0.576829 7:+64588640 MsG0780039470.01.T01:intron
ATCTTTAACTGATGACACAC+GGG 0.585620 7:-64589440 None:intergenic
GAGCATGCCTTCTGAAGCAG+TGG 0.586045 7:+64590250 MsG0780039470.01.T01:CDS
ACCGGGCGTTTGGGTCCCGA+AGG 0.587419 7:-64590470 None:intergenic
GACAATCTCATGGATGATGT+AGG 0.592042 7:+64590855 MsG0780039470.01.T01:three_prime_UTR
CCAAACGCCCGGTTACCGAA+TGG 0.594240 7:+64590480 MsG0780039470.01.T01:CDS
AGAAACAAACCGTGTTGAGA+GGG 0.595220 7:+64588043 MsG0780039470.01.T01:CDS
GAACTACTAACCTTGTGCCA+TGG 0.600318 7:-64590135 None:intergenic
GAGTTGTATAGTCTTGATTG+TGG 0.600432 7:-64590782 None:intergenic
ACAAGATCCACTGCTTCAGA+AGG 0.602215 7:-64590257 None:intergenic
TTGTATAGTCTTGATTGTGG+AGG 0.605582 7:-64590779 None:intergenic
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CRISPR-GE

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GCATCTCCCAAAATAGAATA+TGG - Chr7:64589375-64589394 None:intergenic 35.0%
GTAATTACAACTTCTATCGG+TGG + Chr7:64588377-64588396 MsG0780039470.01.T01:CDS 35.0%
GTTGCACCAAATATAAGTTC+AGG - Chr7:64589629-64589648 None:intergenic 35.0%
GTTGTGTCTAAGTTCTTGAT+TGG + Chr7:64587752-64587771 MsG0780039470.01.T01:intron 35.0%
GTTTATCAGCATGTTTACCT+TGG - Chr7:64590539-64590558 None:intergenic 35.0%
TGAAACTCTGTAGACAGTTT+CGG - Chr7:64589022-64589041 None:intergenic 35.0%
TTGCAGAAAACAACTGAAAC+AGG + Chr7:64586949-64586968 MsG0780039470.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
! ATTCCTTCTTTGATGACCTT+CGG + Chr7:64590454-64590473 MsG0780039470.01.T01:CDS 35.0%
! CACTTTATTTCTTCTCTGGT+AGG - Chr7:64590066-64590085 None:intergenic 35.0%
! CATGCACTTTATTTCTTCTC+TGG - Chr7:64590070-64590089 None:intergenic 35.0%
! CTTTCTAAAAAATGGGTGAC+AGG - Chr7:64586844-64586863 None:intergenic 35.0%
! GAGTTGTATAGTCTTGATTG+TGG - Chr7:64590785-64590804 None:intergenic 35.0%
! GGTGTACCTTAACTTAGTTT+TGG + Chr7:64588987-64589006 MsG0780039470.01.T01:CDS 35.0%
! TAATTCTAATGTTTCTGCGG+TGG + Chr7:64588124-64588143 MsG0780039470.01.T01:CDS 35.0%
! TTGTATAGTCTTGATTGTGG+AGG - Chr7:64590782-64590801 None:intergenic 35.0%
!! CTAATTGATTTGTTGTGTGC+AGG + Chr7:64588307-64588326 MsG0780039470.01.T01:intron 35.0%
!! TCAGTTGGTAGAGATCATTA+AGG + Chr7:64589926-64589945 MsG0780039470.01.T01:CDS 35.0%
!!! AAATGTTACTTTTCAGGGAG+GGG + Chr7:64587965-64587984 MsG0780039470.01.T01:intron 35.0%
!!! GATTCTGAGGTTTTATGTCA+CGG - Chr7:64589237-64589256 None:intergenic 35.0%
AACTACTAACCTTGTGCCAT+GGG - Chr7:64590137-64590156 None:intergenic 40.0%
AAGAAACAAACCGTGTTGAG+AGG + Chr7:64588042-64588061 MsG0780039470.01.T01:CDS 40.0%
AATTCGTCTATGGGAACTTG+TGG + Chr7:64587459-64587478 MsG0780039470.01.T01:intron 40.0%
AGAAACAAACCGTGTTGAGA+GGG + Chr7:64588043-64588062 MsG0780039470.01.T01:CDS 40.0%
AGAGGTTGCAAAGTTTCTTG+AGG - Chr7:64590815-64590834 None:intergenic 40.0%
ATAGACAACGCCAAAAGAAC+CGG - Chr7:64588684-64588703 None:intergenic 40.0%
ATTCCACATAGACCACTTTG+AGG - Chr7:64590989-64591008 None:intergenic 40.0%
CAGAAAACAACTGAAACAGG+AGG + Chr7:64586952-64586971 MsG0780039470.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
CCATTGTGGATAAGCAAAGT+CGG - Chr7:64588796-64588815 None:intergenic 40.0%
CCTGATAAAGCAAAAGGACA+CGG - Chr7:64589965-64589984 None:intergenic 40.0%
CTGATCAAAACCTGACTTCT+CGG - Chr7:64588156-64588175 None:intergenic 40.0%
GAAACTCTGTAGACAGTTTC+GGG - Chr7:64589021-64589040 None:intergenic 40.0%
GACAATCTCATGGATGATGT+AGG + Chr7:64590855-64590874 MsG0780039470.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
GCCATGTATGAGATTATCTG+AGG - Chr7:64588644-64588663 None:intergenic 40.0%
GCCTCAGATAATCTCATACA+TGG + Chr7:64588640-64588659 MsG0780039470.01.T01:intron 40.0%
GCTGTGAAATCAAACAAAGG+GGG - Chr7:64590516-64590535 None:intergenic 40.0%
GGCTGTGAAATCAAACAAAG+GGG - Chr7:64590517-64590536 None:intergenic 40.0%
GGGCTGTGAAATCAAACAAA+GGG - Chr7:64590518-64590537 None:intergenic 40.0%
TATAAGCCTCAGAGACAAGT+AGG - Chr7:64590171-64590190 None:intergenic 40.0%
TGGGCTGTGAAATCAAACAA+AGG - Chr7:64590519-64590538 None:intergenic 40.0%
TGTCAGAACAATACCCTCTT+TGG - Chr7:64588416-64588435 None:intergenic 40.0%
TGTTGTGAACGGAAATGGAA+CGG + Chr7:64588343-64588362 MsG0780039470.01.T01:CDS 40.0%
TTACTTCCTACTTGTCTCTG+AGG + Chr7:64590162-64590181 MsG0780039470.01.T01:intron 40.0%
! ATAGTCTTGATTGTGGAGGT+TGG - Chr7:64590778-64590797 None:intergenic 40.0%
! GAGTTTCAAAGCACTATGTC+AGG + Chr7:64589034-64589053 MsG0780039470.01.T01:CDS 40.0%
! TGAGGGCTTGCTTAAAAACA+AGG - Chr7:64589296-64589315 None:intergenic 40.0%
! TGTATGAGATTATCTGAGGC+AGG - Chr7:64588640-64588659 None:intergenic 40.0%
! TGTCTTGGGCATTGCAAAAT+TGG + Chr7:64590687-64590706 MsG0780039470.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
! TTCCTTCTTTGATGACCTTC+GGG + Chr7:64590455-64590474 MsG0780039470.01.T01:CDS 40.0%
! TTCTTTTGGCGTTGTCTATC+AGG + Chr7:64588685-64588704 MsG0780039470.01.T01:CDS 40.0%
! TTGTTTGATTTCACAGCCCA+AGG + Chr7:64590519-64590538 MsG0780039470.01.T01:CDS 40.0%
!! AAAGCACTGTTTCTACTCGA+CGG + Chr7:64588951-64588970 MsG0780039470.01.T01:CDS 40.0%
!! GATTTGTTGTGTGCAGGATA+TGG + Chr7:64588313-64588332 MsG0780039470.01.T01:intron 40.0%
!! GGCATTGCAAAATTGGTCTT+TGG + Chr7:64590694-64590713 MsG0780039470.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
!!! TTTTTTGAGTGTGTTGGGGT+TGG + Chr7:64587108-64587127 MsG0780039470.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
AACGGAAATGGAACGGAAAC+TGG + Chr7:64588350-64588369 MsG0780039470.01.T01:CDS 45.0%
AATCAACTCCTTGCATGCTC+AGG - Chr7:64590664-64590683 None:intergenic 45.0%
ACAAGATCCACTGCTTCAGA+AGG - Chr7:64590260-64590279 None:intergenic 45.0%
ACCTGCAGATGACAATCTCA+TGG + Chr7:64590845-64590864 MsG0780039470.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
AGCAGAGACCTGAACTGTTA+AGG - Chr7:64590753-64590772 None:intergenic 45.0%
AGCTCGTTTGTTCCTCAAAG+TGG + Chr7:64590974-64590993 MsG0780039470.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
ATGGAGGCAACTGTTGTGAA+CGG + Chr7:64588332-64588351 MsG0780039470.01.T01:CDS 45.0%
CACAGATTAAAGCTCACCCA+TGG + Chr7:64590118-64590137 MsG0780039470.01.T01:CDS 45.0%
CCGACTTTGCTTATCCACAA+TGG + Chr7:64588793-64588812 MsG0780039470.01.T01:intron 45.0%
CTGCAGGTCCTTTGATAAAG+AGG - Chr7:64590833-64590852 None:intergenic 45.0%
GAAACAAACCGTGTTGAGAG+GGG + Chr7:64588044-64588063 MsG0780039470.01.T01:CDS 45.0%
GAACTACTAACCTTGTGCCA+TGG - Chr7:64590138-64590157 None:intergenic 45.0%
GAGACCTGAACTGTTAAGGA+AGG - Chr7:64590749-64590768 None:intergenic 45.0%
GCAACTGTTGTGAACGGAAA+TGG + Chr7:64588338-64588357 MsG0780039470.01.T01:CDS 45.0%
GCATGCTCTTGTGAAAGATC+TGG - Chr7:64590238-64590257 None:intergenic 45.0%
GCTACCTTCCTTAACAGTTC+AGG + Chr7:64590742-64590761 MsG0780039470.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
GCTATTGATGTTTGGTCTGC+TGG + Chr7:64589662-64589681 MsG0780039470.01.T01:CDS 45.0%
GTACGATATGTTGGGTTCAC+CGG - Chr7:64589582-64589601 None:intergenic 45.0%
GTCTAATTCCTGAGCATGCA+AGG + Chr7:64590653-64590672 MsG0780039470.01.T01:CDS 45.0%
GTTCAAGCATACGCATAACC+TGG - Chr7:64588912-64588931 None:intergenic 45.0%
GTTCCTCAAAGTGGTCTATG+TGG + Chr7:64590983-64591002 MsG0780039470.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
GTTCTTGTCCATTCGGTAAC+CGG - Chr7:64590491-64590510 None:intergenic 45.0%
TACGATATGTTGGGTTCACC+GGG - Chr7:64589581-64589600 None:intergenic 45.0%
TAGGCTAAGTGCGTTGAAAC+TGG + Chr7:64588829-64588848 MsG0780039470.01.T01:intron 45.0%
TATTTCCACCCCTCTCAACA+CGG - Chr7:64588055-64588074 None:intergenic 45.0%
TCCATGAGATTGTCATCTGC+AGG - Chr7:64590849-64590868 None:intergenic 45.0%
TCGAGATGGACAACCAAAGA+GGG + Chr7:64588400-64588419 MsG0780039470.01.T01:CDS 45.0%
TGAGAGGGGTGGAAATAATC+AGG + Chr7:64588058-64588077 MsG0780039470.01.T01:CDS 45.0%
TTCTTGTCCATTCGGTAACC+GGG - Chr7:64590490-64590509 None:intergenic 45.0%
TTGTTGTGTGCAGGATATGG+AGG + Chr7:64588316-64588335 MsG0780039470.01.T01:intron 45.0%
! ACTTTGAGGAACAAACGAGC+TGG - Chr7:64590975-64590994 None:intergenic 45.0%
! CATGGGTGAGCTTTAATCTG+TGG - Chr7:64590120-64590139 None:intergenic 45.0%
! CCGTGTCCTTTTGCTTTATC+AGG + Chr7:64589962-64589981 MsG0780039470.01.T01:intron 45.0%
! TATTTGCAGCCGTTGTTTCC+CGG + Chr7:64589888-64589907 MsG0780039470.01.T01:intron 45.0%
! TTTTTCCTGCAGATATGCCG+CGG + Chr7:64589175-64589194 MsG0780039470.01.T01:intron 45.0%
!! AGGTTGAAGAGCATTGCTTC+TGG + Chr7:64587157-64587176 MsG0780039470.01.T01:CDS 45.0%
!!! GTTTTGGCTGAGCTTCTTCT+AGG + Chr7:64589689-64589708 MsG0780039470.01.T01:CDS 45.0%
AAGCAGTGGATCTTGTGTCG+AGG + Chr7:64590264-64590283 MsG0780039470.01.T01:CDS 50.0%
ACAGCAGTGCAGCGTAGATT+TGG - Chr7:64590305-64590324 None:intergenic 50.0%
ACTTCTATCGGTGGTCGAGA+TGG + Chr7:64588386-64588405 MsG0780039470.01.T01:CDS 50.0%
CTCGACGGCTGAAAAAGATG+AGG + Chr7:64588966-64588985 MsG0780039470.01.T01:CDS 50.0%
GGAAGGTAGCATTGCTAGTC+TGG - Chr7:64590732-64590751 None:intergenic 50.0%
GGGGGAAGTTCTTGTCCATT+CGG - Chr7:64590498-64590517 None:intergenic 50.0%
GTCCCGAAGGTCATCAAAGA+AGG - Chr7:64590460-64590479 None:intergenic 50.0%
GTCGAGATGGACAACCAAAG+AGG + Chr7:64588399-64588418 MsG0780039470.01.T01:CDS 50.0%
GTGGCTAAAACCGAGAAGTC+AGG + Chr7:64588143-64588162 MsG0780039470.01.T01:CDS 50.0%
TAAAGCTCACCCATGGCACA+AGG + Chr7:64590125-64590144 MsG0780039470.01.T01:CDS 50.0%
TACATGGCAGAACGTGTCGT+TGG + Chr7:64588656-64588675 MsG0780039470.01.T01:CDS 50.0%
TTAAACCGCGGCATATCTGC+AGG - Chr7:64589183-64589202 None:intergenic 50.0%
! AGAGAGTGGGGTTGATCAGT+TGG + Chr7:64589911-64589930 MsG0780039470.01.T01:CDS 50.0%
!! TTGGTCTGCTGGCTGTGTTT+TGG + Chr7:64589673-64589692 MsG0780039470.01.T01:CDS 50.0%
!!! GTCGTTGGTACCGGTTCTTT+TGG + Chr7:64588671-64588690 MsG0780039470.01.T01:CDS 50.0%
ACAAACCGTGTTGAGAGGGG+TGG + Chr7:64588047-64588066 MsG0780039470.01.T01:CDS 55.0%
AGACGTCGACGCAACTCATC+AGG - Chr7:64590637-64590656 None:intergenic 55.0%
CATTCGGTAACCGGGCGTTT+GGG - Chr7:64590482-64590501 None:intergenic 55.0%
CCACTCTCTCCGGGAAACAA+CGG - Chr7:64589900-64589919 None:intergenic 55.0%
CTGATCAACCCCACTCTCTC+CGG - Chr7:64589910-64589929 None:intergenic 55.0%
TGATCAACCCCACTCTCTCC+GGG - Chr7:64589909-64589928 None:intergenic 55.0%
! CGTTGTTTCCCGGAGAGAGT+GGG + Chr7:64589898-64589917 MsG0780039470.01.T01:CDS 55.0%
! GCAGAACGTGTCGTTGGTAC+CGG + Chr7:64588662-64588681 MsG0780039470.01.T01:CDS 55.0%
! GTTGTTTCCCGGAGAGAGTG+GGG + Chr7:64589899-64589918 MsG0780039470.01.T01:CDS 55.0%
!! GAGCATGCCTTCTGAAGCAG+TGG + Chr7:64590250-64590269 MsG0780039470.01.T01:CDS 55.0%
!! GGCTGAGCTTCTTCTAGGAC+AGG + Chr7:64589694-64589713 MsG0780039470.01.T01:CDS 55.0%
CCAAACGCCCGGTTACCGAA+TGG + Chr7:64590480-64590499 MsG0780039470.01.T01:CDS 60.0%
CCATTCGGTAACCGGGCGTT+TGG - Chr7:64590483-64590502 None:intergenic 60.0%
! CCGTTGTTTCCCGGAGAGAG+TGG + Chr7:64589897-64589916 MsG0780039470.01.T01:CDS 60.0%
ACCTTCGGGACCCAAACGCC+CGG + Chr7:64590469-64590488 MsG0780039470.01.T01:CDS 65.0%
GGCATGCGATTGTGCGTCGC+AGG + Chr7:64589412-64589431 MsG0780039470.01.T01:intron 65.0%
ACCGGGCGTTTGGGTCCCGA+AGG - Chr7:64590473-64590492 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 64586806 64591173 64586806 ID=MsG0780039470.01;Name=MsG0780039470.01
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Chr7 exon 64586806 64587204 64586806 ID=MsG0780039470.01.T01:exon:17529;Parent=MsG0780039470.01.T01
Chr7 exon 64587981 64588238 64587981 ID=MsG0780039470.01.T01:exon:17530;Parent=MsG0780039470.01.T01
Chr7 exon 64588329 64588421 64588329 ID=MsG0780039470.01.T01:exon:17531;Parent=MsG0780039470.01.T01
Chr7 exon 64588647 64588706 64588647 ID=MsG0780039470.01.T01:exon:17532;Parent=MsG0780039470.01.T01
Chr7 exon 64588832 64589104 64588832 ID=MsG0780039470.01.T01:exon:17533;Parent=MsG0780039470.01.T01
Chr7 exon 64589187 64589261 64589187 ID=MsG0780039470.01.T01:exon:17534;Parent=MsG0780039470.01.T01
Chr7 exon 64589434 64589490 64589434 ID=MsG0780039470.01.T01:exon:17535;Parent=MsG0780039470.01.T01
Chr7 exon 64589575 64589715 64589575 ID=MsG0780039470.01.T01:exon:17536;Parent=MsG0780039470.01.T01
Chr7 exon 64589897 64589947 64589897 ID=MsG0780039470.01.T01:exon:17537;Parent=MsG0780039470.01.T01
Chr7 exon 64590051 64590146 64590051 ID=MsG0780039470.01.T01:exon:17538;Parent=MsG0780039470.01.T01
Chr7 exon 64590239 64590322 64590239 ID=MsG0780039470.01.T01:exon:17539;Parent=MsG0780039470.01.T01
Chr7 exon 64590438 64590540 64590438 ID=MsG0780039470.01.T01:exon:17540;Parent=MsG0780039470.01.T01
Chr7 exon 64590620 64591173 64590620 ID=MsG0780039470.01.T01:exon:17541;Parent=MsG0780039470.01.T01
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